View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1504_2D_low_23 (Length: 294)

Name: NF1504_2D_low_23
Description: NF1504_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1504_2D_low_23
NF1504_2D_low_23
[»] chr4 (79 HSPs)
chr4 (25-294)||(8670482-8670751)
chr4 (34-287)||(53444122-53444375)
chr4 (17-294)||(10496332-10496610)
chr4 (15-294)||(35348304-35348583)
chr4 (34-294)||(22611180-22611440)
chr4 (34-294)||(56156494-56156754)
chr4 (15-294)||(56040479-56040758)
chr4 (34-292)||(53811027-53811284)
chr4 (16-284)||(2520786-2521054)
chr4 (15-294)||(21686075-21686353)
chr4 (15-294)||(32766511-32766790)
chr4 (15-294)||(43510194-43510472)
chr4 (15-294)||(13634112-13634391)
chr4 (15-294)||(19853345-19853624)
chr4 (15-294)||(24098902-24099179)
chr4 (36-294)||(17949178-17949436)
chr4 (36-294)||(17953030-17953288)
chr4 (15-260)||(21662468-21662713)
chr4 (15-260)||(21671232-21671477)
chr4 (15-294)||(26633504-26633783)
chr4 (100-292)||(54021859-54022051)
chr4 (15-285)||(43095634-43095904)
chr4 (35-294)||(9178350-9178609)
chr4 (96-294)||(4142666-4142867)
chr4 (15-287)||(44596668-44596935)
chr4 (37-294)||(33921048-33921308)
chr4 (36-294)||(11299864-11300103)
chr4 (97-285)||(10258811-10258999)
chr4 (22-230)||(29960789-29960997)
chr4 (38-294)||(12199550-12199805)
chr4 (34-294)||(28857396-28857658)
chr4 (27-294)||(31891132-31891406)
chr4 (76-294)||(52944305-52944526)
chr4 (30-294)||(51888059-51888326)
chr4 (34-205)||(47320264-47320435)
chr4 (27-294)||(36194699-36194972)
chr4 (17-292)||(26090745-26091026)
chr4 (69-290)||(37030262-37030483)
chr4 (15-178)||(48257465-48257628)
chr4 (73-194)||(45418609-45418730)
chr4 (27-239)||(18935834-18936046)
chr4 (35-244)||(9713959-9714166)
chr4 (34-294)||(36204231-36204500)
chr4 (37-294)||(9048659-9048918)
chr4 (41-293)||(22300844-22301100)
chr4 (28-287)||(27651941-27652206)
chr4 (32-294)||(52060773-52061035)
chr4 (35-204)||(36161798-36161967)
chr4 (34-260)||(6155072-6155304)
chr4 (98-293)||(33332485-33332685)
chr4 (175-294)||(40066048-40066167)
chr4 (34-294)||(1621363-1621620)
chr4 (173-294)||(5119336-5119456)
chr4 (98-286)||(48351102-48351291)
chr4 (99-260)||(22038719-22038880)
chr4 (79-178)||(29120276-29120375)
chr4 (48-124)||(7008855-7008931)
chr4 (34-190)||(44947511-44947669)
chr4 (35-141)||(52978894-52979000)
chr4 (34-112)||(53616482-53616560)
chr4 (37-122)||(9145746-9145831)
chr4 (196-292)||(18048879-18048978)
chr4 (34-91)||(38706542-38706599)
chr4 (36-112)||(9645358-9645434)
chr4 (98-190)||(36700377-36700469)
chr4 (64-124)||(37465649-37465709)
chr4 (227-294)||(37683884-37683954)
chr4 (34-90)||(56199297-56199353)
chr4 (15-74)||(4142597-4142656)
chr4 (34-124)||(21554642-21554732)
chr4 (34-107)||(4644042-4644115)
chr4 (213-294)||(29120394-29120475)
chr4 (34-91)||(34024270-34024327)
chr4 (34-183)||(43853551-43853700)
chr4 (146-294)||(55227972-55228123)
chr4 (64-120)||(12493464-12493520)
chr4 (35-91)||(19896476-19896532)
chr4 (35-91)||(29966526-29966582)
chr4 (27-79)||(33332435-33332487)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (15-294)||(37837291-37837570)
chr7 (15-290)||(39328627-39328898)
chr7 (15-294)||(45349632-45349911)
chr7 (35-287)||(38798767-38799019)
chr7 (16-294)||(42978589-42978867)
chr7 (16-294)||(8001380-8001658)
chr7 (15-294)||(12141140-12141420)
chr7 (22-290)||(48316652-48316920)
chr7 (15-294)||(34899440-34899719)
chr7 (15-294)||(39171423-39171702)
chr7 (77-294)||(24770225-24770442)
chr7 (37-294)||(47590290-47590547)
chr7 (23-294)||(48061401-48061672)
chr7 (37-294)||(19296849-19297106)
chr7 (22-294)||(30756659-30756931)
chr7 (43-294)||(9449998-9450249)
chr7 (35-285)||(46700023-46700272)
chr7 (15-294)||(19404590-19404869)
chr7 (15-294)||(9977043-9977318)
chr7 (64-294)||(13796811-13797044)
chr7 (110-286)||(5792783-5792959)
chr7 (15-258)||(28044589-28044832)
chr7 (15-239)||(40993191-40993415)
chr7 (65-294)||(25287069-25287298)
chr7 (49-285)||(5348459-5348695)
chr7 (34-294)||(28476199-28476465)
chr7 (35-237)||(35132983-35133185)
chr7 (27-239)||(22742978-22743190)
chr7 (35-294)||(3267070-3267324)
chr7 (35-286)||(39229002-39229251)
chr7 (37-294)||(26623644-26623902)
chr7 (27-294)||(25255206-25255473)
chr7 (30-287)||(41553283-41553542)
chr7 (15-124)||(28407751-28407860)
chr7 (78-294)||(24069290-24069509)
chr7 (146-294)||(38880542-38880693)
chr7 (161-293)||(22087297-22087429)
chr7 (27-183)||(48930797-48930953)
chr7 (115-221)||(28062156-28062262)
chr7 (34-141)||(21266527-21266635)
chr7 (32-112)||(46822182-46822262)
chr7 (38-124)||(46822599-46822684)
chr7 (34-91)||(42408525-42408582)
chr7 (34-190)||(35664987-35665143)
chr7 (154-236)||(24350811-24350891)
chr7 (153-287)||(41553750-41553887)
chr7 (150-204)||(11343879-11343933)
chr7 (34-190)||(26492452-26492610)
chr7 (35-85)||(26610633-26610683)
chr7 (34-124)||(433523-433614)
chr7 (34-124)||(32684822-32684913)
chr7 (32-190)||(35261385-35261544)
chr7 (255-294)||(40993161-40993200)
chr7 (161-287)||(41554103-41554232)
chr7 (213-294)||(25068061-25068144)
chr7 (209-289)||(969474-969557)
chr7 (34-91)||(7640607-7640664)
chr7 (27-112)||(31235609-31235694)
chr7 (161-245)||(24610149-24610233)
chr7 (260-292)||(29844844-29844876)
chr7 (165-221)||(44311775-44311831)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (15-294)||(33579856-33580135)
chr3 (22-287)||(38545782-38546047)
chr3 (15-293)||(21533642-21533920)
chr3 (15-294)||(48650567-48650846)
chr3 (15-287)||(47041881-47042154)
chr3 (15-294)||(9998443-9998722)
chr3 (15-294)||(52922950-52923229)
chr3 (17-294)||(10229452-10229729)
chr3 (22-294)||(6954536-6954808)
chr3 (15-294)||(45568278-45568557)
chr3 (17-294)||(40487301-40487578)
chr3 (15-294)||(10108212-10108491)
chr3 (15-294)||(10233046-10233325)
chr3 (37-294)||(43488445-43488702)
chr3 (22-294)||(36461277-36461543)
chr3 (64-292)||(23799792-23800020)
chr3 (15-294)||(32701469-32701746)
chr3 (15-294)||(40556688-40556957)
chr3 (17-286)||(21313020-21313289)
chr3 (34-245)||(46304372-46304583)
chr3 (15-281)||(9797367-9797633)
chr3 (64-294)||(12149666-12149896)
chr3 (15-294)||(54148967-54149246)
chr3 (21-291)||(12050487-12050757)
chr3 (34-244)||(21431639-21431849)
chr3 (15-294)||(47896128-47896406)
chr3 (50-294)||(38859980-38860232)
chr3 (17-286)||(20464805-20465074)
chr3 (35-259)||(7448767-7448991)
chr3 (35-259)||(7456909-7457133)
chr3 (15-292)||(20608736-20609009)
chr3 (16-287)||(19339159-19339429)
chr3 (111-294)||(43016831-43017014)
chr3 (76-287)||(53099773-53099983)
chr3 (15-284)||(37040755-37041023)
chr3 (100-284)||(45424785-45424968)
chr3 (27-239)||(51303488-51303700)
chr3 (146-292)||(35864896-35865042)
chr3 (27-236)||(8914746-8914955)
chr3 (100-284)||(45425578-45425762)
chr3 (27-294)||(7546583-7546859)
chr3 (112-292)||(20987729-20987909)
chr3 (43-258)||(26275680-26275895)
chr3 (15-169)||(4711583-4711737)
chr3 (15-141)||(44959806-44959932)
chr3 (22-287)||(18011003-18011268)
chr3 (27-239)||(21289659-21289871)
chr3 (34-285)||(35175386-35175640)
chr3 (34-294)||(53807710-53807972)
chr3 (27-239)||(51923758-51923970)
chr3 (34-200)||(19619784-19619949)
chr3 (34-239)||(50194187-50194392)
chr3 (34-259)||(48199788-48200017)
chr3 (34-245)||(628775-628985)
chr3 (27-194)||(42460825-42460992)
chr3 (15-241)||(46220699-46220918)
chr3 (150-294)||(29239316-29239463)
chr3 (34-294)||(14859466-14859726)
chr3 (27-199)||(16235497-16235669)
chr3 (15-139)||(43017019-43017143)
chr3 (146-294)||(31271773-31271919)
chr3 (182-294)||(36910640-36910753)
chr3 (27-124)||(27856311-27856408)
chr3 (15-151)||(20987589-20987724)
chr3 (28-199)||(27706072-27706243)
chr3 (34-260)||(44805040-44805262)
chr3 (27-292)||(53508200-53508465)
chr3 (50-294)||(4821781-4822026)
chr3 (34-190)||(3848751-3848909)
chr3 (154-294)||(12947246-12947389)
chr3 (165-294)||(1649393-1649524)
chr3 (153-245)||(26716078-26716170)
chr3 (15-107)||(35864799-35864891)
chr3 (46-183)||(3085165-3085302)
chr3 (185-294)||(44959955-44960064)
chr3 (37-121)||(9173897-9173980)
chr3 (51-259)||(29922068-29922276)
chr3 (51-259)||(29971221-29971429)
chr3 (15-83)||(31271665-31271733)
chr3 (34-137)||(49552056-49552160)
chr3 (27-294)||(41818185-41818458)
chr3 (34-112)||(32607633-32607711)
chr3 (34-112)||(36906286-36906364)
chr3 (196-292)||(4396348-4396447)
chr3 (163-239)||(7887424-7887500)
chr3 (73-124)||(7792078-7792129)
chr3 (50-121)||(12946835-12946906)
chr3 (34-124)||(39917230-39917321)
chr3 (146-204)||(27066020-27066078)
chr3 (34-84)||(51202096-51202146)
chr3 (34-91)||(38440423-38440480)
chr3 (247-292)||(46220658-46220703)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (15-294)||(18763455-18763734)
chr2 (15-287)||(1415551-1415823)
chr2 (15-282)||(33923704-33923971)
chr2 (34-294)||(43396972-43397232)
chr2 (15-294)||(37876440-37876719)
chr2 (15-294)||(4778740-4779019)
chr2 (17-294)||(7677709-7677986)
chr2 (15-294)||(1421663-1421941)
chr2 (15-294)||(31788444-31788722)
chr2 (15-294)||(36691861-36692140)
chr2 (15-294)||(7646460-7646744)
chr2 (15-294)||(27097241-27097519)
chr2 (35-294)||(38445153-38445412)
chr2 (22-292)||(31128626-31128891)
chr2 (15-294)||(5427703-5427981)
chr2 (15-294)||(36942956-36943234)
chr2 (22-292)||(8809269-8809538)
chr2 (15-288)||(25508902-25509175)
chr2 (15-221)||(12677285-12677490)
chr2 (15-273)||(33585569-33585827)
chr2 (34-294)||(19062200-19062465)
chr2 (15-294)||(4903979-4904258)
chr2 (96-294)||(31210522-31210720)
chr2 (16-294)||(9169092-9169371)
chr2 (15-292)||(29279404-29279681)
chr2 (15-294)||(11985067-11985343)
chr2 (22-290)||(19028755-19029023)
chr2 (15-294)||(4041428-4041707)
chr2 (15-294)||(30399863-30400148)
chr2 (15-294)||(35220312-35220594)
chr2 (15-294)||(29173551-29173832)
chr2 (109-294)||(7448234-7448419)
chr2 (35-274)||(17151430-17151670)
chr2 (27-236)||(10237062-10237271)
chr2 (27-239)||(3308987-3309199)
chr2 (34-294)||(10929648-10929912)
chr2 (36-294)||(12554036-12554294)
chr2 (34-294)||(17249000-17249262)
chr2 (22-206)||(4100420-4100594)
chr2 (34-294)||(37994263-37994531)
chr2 (153-294)||(42698673-42698814)
chr2 (34-266)||(28871641-28871873)
chr2 (102-286)||(39310774-39310957)
chr2 (15-271)||(17994560-17994811)
chr2 (98-286)||(4264467-4264655)
chr2 (30-294)||(32448465-32448734)
chr2 (34-254)||(24461470-24461690)
chr2 (29-282)||(18107598-18107848)
chr2 (34-266)||(33760046-33760279)
chr2 (146-294)||(29574593-29574744)
chr2 (27-239)||(14955571-14955783)
chr2 (149-279)||(11833479-11833609)
chr2 (27-287)||(6358727-6358982)
chr2 (35-124)||(28533808-28533897)
chr2 (73-224)||(41694678-41694829)
chr2 (37-102)||(280977-281042)
chr2 (213-294)||(4099090-4099171)
chr2 (35-260)||(16375960-16376185)
chr2 (162-259)||(36175477-36175574)
chr2 (165-260)||(41327524-41327619)
chr2 (34-107)||(84013-84086)
chr2 (15-84)||(31193170-31193239)
chr2 (98-294)||(34128601-34128800)
chr2 (34-124)||(8806024-8806115)
chr2 (228-294)||(12647967-12648036)
chr2 (34-112)||(31580487-31580565)
chr2 (64-122)||(41327898-41327956)
chr2 (34-91)||(22421920-22421977)
chr2 (34-239)||(14423367-14423576)
chr2 (74-285)||(23933512-23933726)
chr2 (50-124)||(7015559-7015634)
chr2 (34-124)||(9986174-9986265)
chr2 (34-105)||(27248983-27249054)
chr2 (22-85)||(39310707-39310770)
chr2 (34-104)||(40659764-40659834)
chr2 (166-279)||(6436609-6436722)
chr2 (241-294)||(36323856-36323909)
[»] chr1 (81 HSPs)
chr1 (34-290)||(34878130-34878386)
chr1 (36-294)||(7836650-7836908)
chr1 (64-290)||(23291524-23291750)
chr1 (15-294)||(1742261-1742546)
chr1 (42-294)||(14872620-14872871)
chr1 (15-294)||(35484224-35484503)
chr1 (15-294)||(45415538-45415817)
chr1 (43-294)||(5983816-5984067)
chr1 (25-294)||(10776304-10776573)
chr1 (15-294)||(7337496-7337775)
chr1 (15-294)||(21947451-21947730)
chr1 (15-289)||(44915624-44915898)
chr1 (15-284)||(3228259-3228528)
chr1 (43-292)||(27579989-27580238)
chr1 (15-258)||(29738497-29738740)
chr1 (15-294)||(32394978-32395256)
chr1 (15-292)||(31918970-31919248)
chr1 (15-191)||(16989454-16989630)
chr1 (126-290)||(21686857-21687021)
chr1 (21-292)||(13144651-13144922)
chr1 (34-294)||(47132880-47133143)
chr1 (168-292)||(27456522-27456646)
chr1 (27-294)||(36775555-36775829)
chr1 (27-294)||(48750158-48750432)
chr1 (35-259)||(31984188-31984400)
chr1 (98-292)||(8211827-8212020)
chr1 (15-244)||(35461886-35462111)
chr1 (22-220)||(49504435-49504633)
chr1 (15-220)||(39888236-39888441)
chr1 (34-294)||(44543250-44543512)
chr1 (15-178)||(4413210-4413373)
chr1 (98-282)||(51916583-51916761)
chr1 (15-141)||(11462315-11462441)
chr1 (34-285)||(24582937-24583190)
chr1 (68-200)||(45789615-45789747)
chr1 (34-285)||(49626900-49627153)
chr1 (15-205)||(15431499-15431689)
chr1 (176-294)||(940343-940460)
chr1 (26-124)||(19596304-19596402)
chr1 (35-260)||(16262875-16263100)
chr1 (39-204)||(18939389-18939555)
chr1 (35-189)||(31317821-31317975)
chr1 (15-131)||(21687521-21687637)
chr1 (27-294)||(34412937-34413209)
chr1 (37-237)||(37720004-37720204)
chr1 (185-290)||(50377312-50377417)
chr1 (34-122)||(24583298-24583386)
chr1 (36-294)||(16161811-16162066)
chr1 (22-141)||(51373698-51373817)
chr1 (196-282)||(11462462-11462548)
chr1 (34-122)||(19061061-19061149)
chr1 (34-124)||(25406116-25406207)
chr1 (200-294)||(15434893-15434987)
chr1 (34-293)||(12635148-12635410)
chr1 (50-201)||(32679009-32679160)
chr1 (27-178)||(45425891-45426044)
chr1 (146-204)||(24597288-24597346)
chr1 (30-236)||(32873713-32873918)
chr1 (175-271)||(36894262-36894359)
chr1 (32-104)||(20266481-20266553)
chr1 (161-292)||(41994406-41994540)
chr1 (15-139)||(50377458-50377582)
chr1 (27-194)||(13075501-13075667)
chr1 (34-124)||(51872021-51872112)
chr1 (34-112)||(19715727-19715805)
chr1 (34-107)||(5701435-5701508)
chr1 (34-91)||(7342914-7342971)
chr1 (32-85)||(19723511-19723564)
chr1 (127-220)||(26535403-26535496)
chr1 (35-104)||(27456654-27456723)
chr1 (32-85)||(32676965-32677018)
chr1 (192-244)||(51373819-51373871)
chr1 (34-124)||(9687037-9687128)
chr1 (34-124)||(50165931-50166022)
chr1 (34-124)||(51868477-51868568)
chr1 (146-204)||(25564068-25564126)
chr1 (207-284)||(39927547-39927627)
chr1 (34-112)||(50148541-50148619)
chr1 (147-260)||(1602104-1602216)
chr1 (34-91)||(11454129-11454186)
chr1 (149-281)||(31692434-31692568)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (15-294)||(14726294-14726573)
chr5 (17-287)||(35850782-35851050)
chr5 (15-273)||(38007355-38007612)
chr5 (15-294)||(13007205-13007484)
chr5 (15-294)||(38597773-38598052)
chr5 (15-294)||(11976768-11977047)
chr5 (15-294)||(9113558-9113837)
chr5 (15-294)||(24229617-24229896)
chr5 (15-294)||(6011971-6012250)
chr5 (15-274)||(34945389-34945648)
chr5 (25-294)||(25980134-25980402)
chr5 (17-294)||(26825406-26825683)
chr5 (22-294)||(8096338-8096609)
chr5 (15-286)||(13421917-13422188)
chr5 (15-294)||(10722737-10723016)
chr5 (16-292)||(6216877-6217152)
chr5 (43-294)||(31391614-31391865)
chr5 (64-294)||(7930153-7930383)
chr5 (64-294)||(41630478-41630708)
chr5 (146-294)||(11073864-11074012)
chr5 (35-259)||(26877962-26878185)
chr5 (27-294)||(28540751-28541025)
chr5 (45-292)||(7036197-7036443)
chr5 (27-294)||(14211196-14211470)
chr5 (37-294)||(19120886-19121145)
chr5 (34-294)||(8088064-8088326)
chr5 (15-200)||(14082229-14082414)
chr5 (27-294)||(19103312-19103586)
chr5 (185-286)||(11867652-11867753)
chr5 (27-239)||(2979151-2979363)
chr5 (34-294)||(37985965-37986225)
chr5 (15-259)||(15571497-15571741)
chr5 (15-244)||(1409524-1409755)
chr5 (34-287)||(10332399-10332656)
chr5 (27-219)||(39567321-39567513)
chr5 (34-260)||(35920848-35921074)
chr5 (156-236)||(9590945-9591025)
chr5 (34-124)||(7241940-7242031)
chr5 (34-124)||(7247115-7247206)
chr5 (226-294)||(14082417-14082485)
chr5 (34-106)||(41184272-41184344)
chr5 (34-124)||(27752081-27752172)
chr5 (34-91)||(27266691-27266748)
chr5 (64-260)||(41749336-41749532)
chr5 (34-124)||(19259644-19259735)
chr5 (34-124)||(43148883-43148974)
chr5 (34-124)||(7886771-7886861)
chr5 (174-286)||(16758521-16758636)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (15-294)||(1321-1600)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (15-288)||(25190896-25191171)
chr8 (15-287)||(45445642-45445914)
chr8 (15-294)||(7883072-7883351)
chr8 (15-294)||(23230622-23230901)
chr8 (29-294)||(10377668-10377933)
chr8 (35-294)||(37971262-37971521)
chr8 (22-292)||(7677121-7677391)
chr8 (34-259)||(33214521-33214746)
chr8 (34-294)||(3673420-3673680)
chr8 (15-266)||(31013439-31013690)
chr8 (15-221)||(16928588-16928794)
chr8 (77-294)||(20553134-20553351)
chr8 (73-294)||(16247112-16247333)
chr8 (15-288)||(27110296-27110569)
chr8 (15-294)||(17693444-17693724)
chr8 (15-198)||(30568152-30568335)
chr8 (15-289)||(40211131-40211407)
chr8 (15-292)||(14544726-14545011)
chr8 (33-292)||(28897690-28897947)
chr8 (77-287)||(20559637-20559847)
chr8 (77-287)||(20571199-20571409)
chr8 (15-286)||(9637240-9637511)
chr8 (15-286)||(24186492-24186762)
chr8 (15-294)||(40618904-40619183)
chr8 (34-274)||(33347371-33347610)
chr8 (27-237)||(18890542-18890752)
chr8 (64-288)||(36948318-36948541)
chr8 (15-294)||(28086643-28086923)
chr8 (27-220)||(42046274-42046467)
chr8 (27-235)||(14585715-14585923)
chr8 (34-294)||(1236547-1236809)
chr8 (27-204)||(43833839-43834016)
chr8 (34-285)||(15344294-15344547)
chr8 (34-285)||(15433359-15433612)
chr8 (34-285)||(15524663-15524916)
chr8 (35-286)||(29617125-29617379)
chr8 (34-239)||(41896551-41896756)
chr8 (36-204)||(29939369-29939537)
chr8 (34-192)||(7198045-7198203)
chr8 (15-285)||(27498197-27498465)
chr8 (154-294)||(5333405-5333548)
chr8 (34-294)||(471014-471276)
chr8 (64-282)||(5046744-5046962)
chr8 (35-293)||(14916039-14916299)
chr8 (34-294)||(24099106-24099368)
chr8 (70-294)||(1239283-1239509)
chr8 (34-194)||(8867884-8868047)
chr8 (147-294)||(8443474-8443624)
chr8 (96-294)||(39657426-39657631)
chr8 (146-258)||(8981178-8981290)
chr8 (98-294)||(34609809-34610011)
chr8 (30-164)||(41060109-41060243)
chr8 (34-112)||(9498431-9498509)
chr8 (36-285)||(3240365-3240617)
chr8 (17-94)||(8412355-8412432)
chr8 (34-124)||(11267169-11267260)
chr8 (34-190)||(26469000-26469152)
chr8 (34-112)||(29777393-29777471)
chr8 (34-91)||(9619189-9619246)
chr8 (32-124)||(37565709-37565802)
chr8 (37-124)||(33342595-33342683)
chr8 (34-124)||(11725841-11725932)
chr8 (166-237)||(18847121-18847192)
chr8 (34-112)||(2656044-2656122)
chr8 (34-112)||(4809138-4809216)
chr8 (224-286)||(8412443-8412505)
chr8 (34-112)||(11464345-11464423)
chr8 (34-112)||(33896260-33896338)
chr8 (200-286)||(41684412-41684498)
chr8 (34-112)||(43889956-43890034)
chr8 (180-242)||(44091749-44091811)
chr8 (34-91)||(14906755-14906812)
chr8 (30-91)||(34611999-34612060)
chr8 (99-156)||(41684499-41684556)
chr8 (165-221)||(20227262-20227318)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (15-294)||(3913407-3913686)
chr6 (15-294)||(606182-606461)
chr6 (15-294)||(33053001-33053280)
chr6 (15-294)||(23128596-23128875)
chr6 (15-294)||(32327053-32327329)
chr6 (17-294)||(29319712-29319990)
chr6 (15-288)||(29255279-29255551)
chr6 (34-294)||(7515054-7515314)
chr6 (15-266)||(12170474-12170725)
chr6 (34-294)||(127648-127905)
chr6 (22-294)||(34018538-34018810)
chr6 (17-272)||(67836-68091)
chr6 (15-274)||(30894598-30894855)
chr6 (17-287)||(30608350-30608619)
chr6 (27-236)||(14801863-14802073)
chr6 (27-239)||(546063-546276)
chr6 (97-294)||(3355095-3355292)
chr6 (15-158)||(14174904-14175047)
chr6 (15-158)||(14179440-14179583)
chr6 (34-294)||(30493507-30493770)
chr6 (27-239)||(8102759-8102971)
chr6 (27-220)||(30776715-30776908)
chr6 (140-287)||(32059894-32060031)
chr6 (34-294)||(26588324-26588587)
chr6 (15-118)||(21426519-21426622)
chr6 (100-282)||(4010430-4010611)
chr6 (34-163)||(14846071-14846202)
chr6 (34-196)||(20225927-20226089)
chr6 (34-196)||(22119911-22120073)
chr6 (15-124)||(9341484-9341593)
chr6 (174-259)||(11321461-11321546)
chr6 (145-294)||(24227695-24227844)
chr6 (34-294)||(31296795-31297058)
chr6 (27-294)||(528197-528465)
chr6 (81-204)||(32191629-32191752)
chr6 (34-290)||(28981156-28981415)
chr6 (28-141)||(32802677-32802790)
chr6 (34-118)||(8497129-8497213)
chr6 (35-289)||(1933545-1933802)
chr6 (34-124)||(4088614-4088705)
chr6 (73-239)||(1523441-1523607)
chr6 (34-200)||(7976039-7976205)
chr6 (150-286)||(6957136-6957272)
chr6 (34-294)||(34185545-34185808)
chr6 (35-202)||(9380093-9380260)
chr6 (227-294)||(13546708-13546775)
chr6 (247-294)||(20220856-20220903)
chr6 (247-294)||(22114840-22114887)
chr6 (173-286)||(22571457-22571574)
chr6 (34-190)||(16419245-16419403)
chr6 (34-112)||(17334920-17334998)
chr6 (34-190)||(35001677-35001835)
chr6 (33-141)||(13546552-13546660)
chr6 (34-124)||(8027950-8028041)
chr6 (34-124)||(23947149-23947240)
chr6 (35-190)||(27097495-27097650)
chr6 (185-260)||(31575510-31575585)
chr6 (34-124)||(679257-679346)
chr6 (34-112)||(7880934-7881012)
chr6 (34-112)||(25064403-25064481)
chr6 (34-112)||(28634945-28635023)
chr6 (34-91)||(12059605-12059662)
chr6 (34-107)||(33740410-33740483)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (23-294)||(15468-15740)
[»] scaffold0136 (2 HSPs)
scaffold0136 (22-294)||(9882-10154)
scaffold0136 (22-272)||(38052-38304)
[»] scaffold0884 (1 HSPs)
scaffold0884 (23-294)||(1814-2085)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (15-294)||(32580-32859)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (15-294)||(71703-71976)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (35-259)||(50788-51012)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (15-294)||(65875-66154)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (20-291)||(71138-71409)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (64-294)||(8489-8719)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (15-289)||(31107-31381)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (99-277)||(1736-1914)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (34-294)||(7693-7953)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (34-258)||(57940-58164)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (30-284)||(6014-6271)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (15-245)||(14704-14927)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (15-289)||(36812-37082)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (109-267)||(25294-25452)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (27-236)||(1523-1732)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (37-294)||(93080-93341)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (180-242)||(8099-8161)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (154-260)||(92468-92574)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (34-91)||(83268-83325)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (64-120)||(26957-27013)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 79)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8670751 - 8670482
Alignment:
Q  25 caaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8670751 caaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacaacagccaagttaattgcacaaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 8670652  T
Q  125 tcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaa 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8670651 tcctaagtcaccgaaattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaa 8670552  T
Q  225 ataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8670551 ataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagatgactaacaacacaacgccgcact 8670482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53444375 - 53444122
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  53444375 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggaaaaatatctacaaataatatgataaaacctaagtc 53444276  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  53444275 accgaaattcacatgcttccggatcttcaacattgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaaataaacaaa 53444176  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53444175 caccgcgacaaaacgcgaaatcaaataccgcacaagacgacgaacaacacaacg 53444122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10496610 - 10496332
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaagg-tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataa 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| |||||||    
T  10496610 atcaaatacaaatatcgctaaaaacgttaaaggatgaatctgcgaacaaactcaaagcacccaagttaatagcatacgacagcaaaatgcctacaaataa 10496511  T
Q  116 tatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattttt 215  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10496510 tatgataaaacctaactcaccgaaatacccatgcttacggatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatcttt 10496411  T
Q  216 caataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10496410 caataggaactaaacgaacactgcgacaagacgcaaaatcaaacgtcacacaagacgacgaacaacacatcgccgcact 10496332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35348583 - 35348304
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35348583 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaata 35348484  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  35348483 atatgataaaacctaagtcattgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacatccagatcattggttgaatttgtaattgactatcgccgatctt 35348384  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| || |||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35348383 tcaatagtaactaaacgaacaccacaacaagaaacgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 35348304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22611440 - 22611180
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  22611440 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaatttaataccatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtc 22611341  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||    
T  22611340 accgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaactgaacaaa 22611241  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22611240 caccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 22611180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 56156494 - 56156754
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||    
T  56156494 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaggtaaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataaattgataaaacataagtc 56156593  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||    
T  56156594 accgaaattcacatgcttccagatctgcaatgttgacgccccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgttaatctttcaagaggaactaaacgaa 56156693  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  56156694 caccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccacact 56156754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 56040479 - 56040758
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  56040479 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 56040578  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  56040579 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgccgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 56040678  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  56040679 ccaataggaactaaacaaacactgcgacaagacgcaaaattaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 56040758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53811284 - 53811027
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  53811284 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaac-aactcacaacacccaagttaatagcatacaacgccaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtc 53811186  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||    
T  53811185 accgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaactgaacaaa 53811086  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53811085 ccccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgca 53811027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2521054 - 2520786
Alignment:
Q  16 catcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataa 115  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||    
T  2521054 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 2520955  T
Q  116 tatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattttt 215  Q
    || ||||||  |||| |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  2520954 tacgataaaatctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgctttaatttgtaattgattgatgtagatcttt 2520855  T
Q  216 caataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2520854 caataggaattgaacaaacatcgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 2520786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 21686075 - 21686353
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||| ||||||    
T  21686075 acatcagatacaaacatcgctacaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaataacatacagcggcaaaatgcctacaaata 21686174  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||    
T  21686175 atatgataaaacctaaatcaccaaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaactgattgatgtagatctt 21686274  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21686275 tcaataggaactgaacaaacaccgcggcaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacac-acgccgcact 21686353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32766790 - 32766511
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||||    
T  32766790 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgcaaagggtgaatctgagaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata 32766691  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  32766690 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtagatctt 32766591  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32766590 ttaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 32766511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43510472 - 43510194
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||||    
T  43510472 acatcaaatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatgacatacaacgacaaaatgcctacaaata 43510373  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  43510372 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttcaggatctgcaacattgacgtccaaatcattagtttaatttgtaa-tgactgatgtagatctt 43510274  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  43510273 tcaagaggaattgaacaaacaccgcgacaaaacacgaaatcaaacgccgcacaagacgacaaataacacaacgccgcact 43510194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13634391 - 13634112
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  || ||||||    
T  13634391 acatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctccgaacaaattcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaataactacaaata 13634292  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||| |||||| ||||| |||| ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  13634291 ataagataaaacctaaatcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcgttgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 13634192  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13634191 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatctaacctcgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 13634112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 19853345 - 19853624
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||    
T  19853345 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaata 19853444  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  19853445 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgagtgatgtagatctt 19853544  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| || ||  ||| ||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19853545 tcaataggaactgaacaaacaccgtgataaaacgcaaaatcaaatgccacataagacgacgaacaacacaacgccgcact 19853624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 24098902 - 24099179
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  24098902 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagagtggatctgcgaacaaactcacagcacc-aagttaatagcatcaac-ggcaaaatgcctacaaata 24098999  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  24099000 atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 24099099  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  24099100 tcaataggaactgaacaaactccgcgacaagacgcgaaatcaatcgccgcacaagacgacgaacaacaaaatgccgcact 24099179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 17949178 - 17949436
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| ||   |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||     
T  17949178 aaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaagaacaaaatgcatacatataatatgataaaacctaagtcat 17949277  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
    | |||| |  || ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17949278 caaaatacccattcttccggatctgcaacgttgacgctccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaattaaacgaaca 17949377  T
Q  236 ccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17949378 ccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaacacgacaaacaacacaacgccgcact 17949436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 17953030 - 17953288
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| ||   |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||     
T  17953030 aaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaagaacaaaatgcatacatataatatgataaaacctaagtcat 17953129  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
    | |||| |  || ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17953130 caaaatacccattcttccggatctgcaacgttgacgctccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaattaaacgaaca 17953229  T
Q  236 ccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17953230 ccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaacacgacaaacaacacaacgccgcact 17953288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21662713 - 21662468
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||| ||   |||| || || ||||||    
T  21662713 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata 21662614  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  21662613 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattggatttgtaattgactgatgttgatctt 21662514  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21662513 tcaataggaactaaacgaataccgcgacaagacgcgaaatcaaaca 21662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21671477 - 21671232
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||  | |||||| ||| ||||||||| ||||| ||   |||| || || ||||||    
T  21671477 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata 21671378  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  21671377 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattggatttgtaattgactgatgttgatctt 21671278  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671277 tcaataggaactaaacgaataccgcgacaagacgcgaaatcaaaca 21671232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 26633504 - 26633783
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || | ||| |||| ||||| || || |||||||||  |  ||    
T  26633504 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagctaatagcatacaacggtaaaatgcctatattta 26633603  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  26633604 atatgataaaacctaagtcacagaaatattcatgcttccggatctgcaacattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaatcgactgatgtagatctt 26633703  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26633704 tcaataggaactgaacaaacactgcgacaagacgcgaagtccaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 26633783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 54022051 - 54021859
Alignment:
Q  100 aaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattg 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||    
T  54022051 aaatgtctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgttttcggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattcaatttgtaattg 54021952  T
Q  200 actgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54021951 actgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacacgaaatcaaacgccgcacaagacgactaacaacacaatgccgca 54021859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43095904 - 43095634
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||| ||||| ||||| ||   |||||| ||| |||||     
T  43095904 acatcagatataaacatccctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatagcatacaactacaaaatacctacaaatg 43095805  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||| ||    
T  43095804 atatgataaaatctaagtcagtgaaattctcatgcttccggatctgcactgttgacggccaaatcattgatttaacttgtaattgactgatgtcgatctt 43095705  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
     ||||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43095704 ccaataggaactaaatgaacatcgtgacaagacgcgaaatcaaacaccgtacaagacgactaacaacacaa 43095634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9178609 - 9178350
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||  ||| ||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| || |||||     
T  9178609 taaaaacataaagggtgaaactgcgaacaaactcacgtcacacaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaaccgaagtct 9178510  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    | ||||| | | ||||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  9178509 ctgaaatacttttgcttccagatctgcaacgttgatgctcaaattattgattggatttgtaattgattgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaac 9178410  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  9178409 aacgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagatgacgaacaatacaacgtcgcact 9178350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 294
Target Start/End: Original strand, 4142666 - 4142867
Alignment:
Q  96 ggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgta 195  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4142666 ggcaaaatgtctacaaataatatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgta 4142765  T
Q  196 attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaa---caccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4142766 attgactgatgtagatctttcaagaggaattgaacaaacaccgcgacaaaacacgaaatcaaacgccgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgca 4142865  T
Q  293 ct 294  Q
    ||    
T  4142866 ct 4142867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44596935 - 44596668
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  || ||||||    
T  44596935 acatcaaatacaaacatcacaaaaaatataaa-ggcgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggtaaaatagctacaaata 44596837  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   ||| ||| |||||| | |||| ||||| |||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  44596836 atatgataaaatgtaaatcatcgaaatacctatgttttcgaatcagcaacgttgacgtc--aatcattgattgaatttgtaa-tgactgatgtagatttt 44596740  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    | |||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44596739 ttaataggaactaaacgaacgctgccacaagacgc-aaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacg 44596668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33921308 - 33921048
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    ||||| |||| || |||| ||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||    | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||     
T  33921308 aaaacataaagggagaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaactatacaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcact 33921209  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgt----aattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacga 232  Q
    ||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  33921208 gaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaattattgattgaatttgtttgtaattgac-gatgtcgatctttcaataggaactaaacga 33921110  T
Q  233 acaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33921109 acactgcgacaagacgtgaaatcaaacgtcgcataagacggcgaacaacacaacgccgcact 33921048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 11299864 - 11300103
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  11299864 aaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacataaaacgccaaaatgcctacgaataatatgataaaacataagtcac 11299963  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
    ||||||||| ||                |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   || ||||||||| |||| || |||||    
T  11299964 cgaaattcacat----------------cgttgacgcccaaatcattgtttgaatttgtaatcgactgctg---atctttcaatagaaaatgaatgaaca 11300044  T
Q  236 ccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11300045 ccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 11300103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 285
Target Start/End: Original strand, 10258811 - 10258999
Alignment:
Q  97 gcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaa 196  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    |||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10258811 gcaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaagtcaccaaaatattcatgcttccgggtatgcaacgttggcgcccaaatcattgattgaatttgtaa 10258910  T
Q  197 ttgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| ||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||    
T  10258911 ttgactaatgtcgatctttcaacatgaactaaacgaacaccgcgtcaagacgcgaaatcaaacatcacataagaccactaacaacacaa 10258999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Original strand, 29960789 - 29960997
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||    
T  29960789 atacaaatatcgctaaaaacataaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaaaagcatacaacggcaaaatgcctacaaatagtatgat 29960888  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    |||  |||| ||||  ||||   |||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||     
T  29960889 aaaatctaaatcactaaaatatttatgtttccggatctgcaacgttgatgccaaaatcatcggttgaatttataattgattgatgtagatctttcaatac 29960988  T
Q  222 gaaataaac 230  Q
    ||| |||||    
T  29960989 gaactaaac 29960997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 294
Target Start/End: Original strand, 12199550 - 12199805
Alignment:
Q  38 aaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccg 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||  |||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  12199550 aaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagt-aataacatacaacagtaaaatacctacaaataatatgataaattctaagtcgcca 12199648  T
Q  138 aaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacacc 237  Q
    ||||||  |||||| || ||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |  ||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  12199649 aaattctcatgcttccgaatctgtaacgtcgacgctcaaatctttgattgaatctgtaactgactgaagttgatatttcaatatgaactaaacgaacacc 12199748  T
Q  238 gcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||| ||| ||||||||  | |||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  12199749 gcaacaagacgcaaaatcaaaagctgcacaaaacgatgaacaacacaacgccacact 12199805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28857658 - 28857396
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| ||  |||| ||    
T  28857658 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagctgccaagttaatagcatataagggcaaaatacctacaaaaaatatgatgaaatctaaatc 28857559  T
Q  134 acc-gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacga 232  Q
    ||| ||||  |||  |||| |||||||  ||||||| || |||||||||   |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||    
T  28857558 accagaaaaccat--gcttccggatctgaaacgttggcgtccaaatcatcaattgaatatgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaaacaaacga 28857461  T
Q  233 acaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  28857460 acaccgcaactagacgcggaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacgccgcact 28857396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 31891132 - 31891406
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||      
T  31891132 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatataatgaaat 31891231  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||  | |||||||||||| |||      
T  31891232 ctaaatcaccagaatactcatgcttctggatttgcaacgttgacgcccaaatcatggtttgaatttgtgattgtctgaaactgatttttcaatacgaacc 31891331  T
Q  227 aaacgaacaccg--cgacaa--gtcgcgaaatcaaacaccg---cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||  | ||||  |  ||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31891332 aaacgaacaccgcacaacaacggatgcgaaatcaaacaacgctacacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 31891406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 52944526 - 52944305
Alignment:
Q  76 ccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgccca 175  Q
    |||||||||| ||||| ||   |||||||||| |||| |||||||| ||  |||| |||||  ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  52944526 ccaagttaatagcatataactacaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtcca 52944427  T
Q  176 aatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacg 272  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||   |||||||| |||    
T  52944426 aatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaaacaaacgaacaccgcaacaagacgcaaaattaaacaacgccgcacaaaacg 52944327  T
Q  273 actaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  52944326 acgaacaacacaacgccgcact 52944305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 294
Target Start/End: Original strand, 51888059 - 51888326
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    ||||||||||| ||||| |||| || ||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||    
T  51888059 atcactaaaaatgtaaagggtggatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatgcaatggcaaaacgcctacaaataatatgataaaatcta 51888158  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaa 229  Q
    | |||||  ||| |  |||||||| ||| | ||||||| ||  | ||||||||| || ||||||| ||||| ||| |  ||| |||||||| |||  |||    
T  51888159 aatcaccagaatactcatgctttcagatatgcaacgttaacatcaaaatcattgattaaatttgtgattgattgaagttgatctttcaatatgaaccaaa 51888258  T
Q  230 cgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||    |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  51888259 cgaacaccgcaacaagatgcgaaatcaaacaacgtcgcataagacgatgaacaacacaacgccgcact 51888326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 47320264 - 47320435
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  47320264 ctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 47320363  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgat 205  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  47320364 accagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgat 47320435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36194972 - 36194699
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  36194972 aatatcactaaaaacatataaggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 36194873  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||| ||  |||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||| ||||  ||| || ||| |||||||| |||      
T  36194872 ctaaatcaccagaatacccatgtttctggatctgcaactttgatg-tcaaatcattgattgaatttgtgattgtttgaagctgatctttcaatacgaacc 36194774  T
Q  227 aaacgaacaccg--cgacaa--gtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||  | ||||  |  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36194773 aaacgaacaccgcacaacaaaggatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 36194699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Original strand, 26090745 - 26091026
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||| | ||||||||  ||  || |||||||| |||| ||||| ||||| || | ||| ||  || ||||||||    
T  26090745 atcagatacaaacaacgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtaaacaaattcacagcatccaaattaatagcatacaacgacaatatatctgcaaataat 26090844  T
Q  117 atgataaatc----ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatt 212  Q
    ||||||||      ||||||||||||||| |  |||||| || || | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  26090845 atgataaaatatatctaagtcaccgaaataccaatgcttccgaatttgcaacgttgacgcccaaatcattagttgaatttataattgactgatgtcgatc 26090944  T
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgc--gaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| || ||| |||   ||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  26090945 tttcaagatgaactaaacgaacaccgtgataagacgcaaaaaatcaaacgccgcacaaaacggcgaacaacagaacgccgca 26091026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 69 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37030483 - 37030262
Alignment:
Q  69 acagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttg 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |  ||| |||  ||||| |||||| |    
T  37030483 acagcacccaagttaatagcatacaatggctaaatgtctacaaataatatgataatttctaagtcactgaaatacccatgtttttcgatctgcaacgtcg 37030384  T
Q  169 acgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaa 268  Q
    | | ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |  ||| |||  |||| ||  ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||  ||||    
T  37030383 atgtccaaatcattgattgaatctgtatttgattgaagttgatcttttgatagaaaccaaacgtacaccgcgacaagacatgaaatcaaacgccatacaa 37030284  T
Q  269 gacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  37030283 gacgacgaacaacacaacgccg 37030262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 48257465 - 48257628
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||    
T  48257465 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaaatccaagttaatagcatacaacggcaaaatacctacaaata 48257564  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaat 178  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |  ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  48257565 atatgataaaactcaagtcaccgaaatacccatgttttcggatctgtaacgttgacgtccaaat 48257628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45418730 - 45418609
Alignment:
Q  73 cacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgc 172  Q
    |||||| |||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  45418730 cacccatgttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatactagtgctttcggatctgcaacgttgatgc 45418631  T
Q  173 ccaaatcattgcttgaatttgt 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  45418630 ccaaatcattgattgaatttgt 45418609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18936046 - 18935834
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| |||||||| || | ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||  | || ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  18936046 aatatcgctaaaaacatatagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaataacgtacaatagcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 18935947  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||| |||| |   || |||||||| |||      
T  18935946 ctaaatcaccagaatacctatgcttttggatctgcaacgttgatgcccaaatcattaattgaatttttgattgtctgaagttaatctttcaatacgaacc 18935847  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  18935846 aaacgaacaccgc 18935834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9714166 - 9713959
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||   |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||    
T  9714166 taaaaacgtaaagggtgaacctgcgaacaaactcacaacactcaagttaacaacatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaattca 9714067  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    |   |||  ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||| || ||| || ||||| |||| ||||||||    
T  9714066 ctagaat--atacgcttccagatctgcaacgttgacgcccaaatcgttgattgaatttgtgattgtttgaagctgatcttccaatatgaaagaaacgaac 9713969  T
Q  235 accgcgacaa 244  Q
     |||| ||||    
T  9713968 tccgcaacaa 9713959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 36204231 - 36204500
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| || |||| |||||  |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||| ||    
T  36204231 ctaaaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacatccaaattaataacatataatggcaaaatatctacaaataatatgataaaatctaaatc 36204330  T
Q  134 acc-gaa-attcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat-----tgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    ||| ||| |||| | | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||     ||||||| || |||||||||||| |||      
T  36204331 accagaatattc-tct-cttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgatgtgattgactgaagctgatttttcaatatgaacc 36204428  T
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca----ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||||||||| ||||   |||||||||||||    ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  36204429 aaatgaacaccgcaacaatatgcgaaatcaaacaacgcccgtacaggacgacgaacaacacaacgccgcact 36204500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9048918 - 9048659
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| |||||||||| || ||| |  | | |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||| |    
T  9048918 aaaacgtaaagggtgaatctgtaaacaaactcacaacacccaagtttatagcacatgacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatttaaatcatc 9048819  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
      ||| |  ||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||  || |||||| || ||  ||||||||||    
T  9048818 agaatacccatgttttcagatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtgattaactgaagcttatctttcaaaagaaaccaaacgaacac 9048719  T
Q  237 cgcgacaagtcgcgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||||| | ||||||||   ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  9048718 cgcaacaagacccgaaatcagacaacgccgcacaagacgacaaacaaga-aacgccgcact 9048659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22301100 - 22300844
Alignment:
Q  41 cgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct-tcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaa 139  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| |  |||||||| ||| | ||| ||||| || ||  |||| ||||| ||    
T  22301100 cgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatagcggcaaaatacctatgaaaaaatataatgaaatctaaatcaccaaa 22301001  T
Q  140 attcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgc 239  Q
    || |  ||| |||||||||| |||||| | || ||||||||| | |||||| ||| ||||||| | || ||| |||||| | ||  ||||| ||||||||    
T  22301000 atactcatgatttcggatctgcaacgtcggcgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactaaagctgatctttcaagatgagctaaacaaacaccgc 22300901  T
Q  240 gacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcac 293  Q
     ||| | ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22300900 aacaggacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcac 22300844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27652206 - 27651941
Alignment:
Q  28 atatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcc 127  Q
    ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||  |    
T  27652206 atatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgatgaaatc 27652107  T
Q  128 taagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaata 227  Q
    |||  |||   ||| |  ||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| || | || ||| |||||||| |||  |    
T  27652106 taa-acactagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgatacccaaatcattgattgaatttgtgattgtctaaagctgatctttcaatacgaacca 27652008  T
Q  228 aacgaacaccg--cgacaa--gtcgcgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||||||||  | ||||  |  |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27652007 aacgaacaccgcacaacaaaggatgcgaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacg 27651941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 294
Target Start/End: Original strand, 52060773 - 52061035
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaag 131  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||| | ||  ||| ||||| | ||| ||   |||||||||| |||| |||||||||||| | |||    
T  52060773 cactaaaaatgtaaaatgtgaatctgcaaacaaactcataacattcaaattaatagtatacaacaacaaaatgcctacaaaaaatatgataaattcaaag 52060872  T
Q  132 tcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacg 231  Q
    |||  |||||    ||||||   ||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||||||    
T  52060873 tcattgaaatatccatgcttctagatctacaacatcaacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgactgaagttgatctttcaataggaattaaacg 52060972  T
Q  232 aacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| | ||||| | |  |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  52060973 aacacctcaacaagacacataatcaaacgccgtacaagacgacgaacatcacaatgccacact 52061035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36161967 - 36161798
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  |||| || | | |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||    
T  36161967 taaaaacgtaaagagtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacgaccaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatca 36161868  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |  |||| |  ||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  36161867 cgaaaatactcatgttttcggatctgtaacgttggcgtccaaatcattgattgaatatgtgattgactga 36161798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 6155072 - 6155304
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacag---cacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaa 130  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |  ||||    
T  6155072 ctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatagaatctaa 6155171  T
Q  131 gtcaccgaaattcata---tgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaata 227  Q
     |||||  |||   ||   ||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||| | |||||  ||| |||||||||  | ||| |||||||| |||  |    
T  6155172 atcaccagaatatctatgttgcttccggatctgcaacgtttacgtctaaatcatcgattgaacatgtgattgactgaaactgatctttcaatatgaatca 6155271  T
Q  228 aacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  6155272 aacgaacactgcgacaaaacacgaaatcaaaca 6155304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 293
Target Start/End: Original strand, 33332485 - 33332685
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat 197  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||| | |||| |  || |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||    
T  33332485 caaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatcatcaaaatgcccattcttttggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgat 33332584  T
Q  198 tgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccg--cgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    || |||| |  ||| ||||||||  ||  ||||||||||||  | |||||  |||||||||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33332585 tgtctgaagttgatctttcaataaaaacgaaacgaacaccgcacaacaagatgcgaaatcaaacaacgtcgcacaaggcgacaaacaacacaacgccgca 33332684  T
Q  293 c 293  Q
    |    
T  33332685 c 33332685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 294
Target Start/End: Original strand, 40066048 - 40066167
Alignment:
Q  175 aaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgac 274  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||| || ||||| || | |||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  40066048 aaattattgattgaatttgtaattgattaatgtcgatctttccatagaaactaaacaaatatcgcgacaagaggcgaaatcaaacgctgcataagacgac 40066147  T
Q  275 taacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||||||||||||||||    
T  40066148 gaacaacacaacgccgcact 40066167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 1621363 - 1621620
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||||| || ||||||||||||| ||  |||| ||    
T  1621363 ctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaattgcatacaacgg--aaatgtctacaaataatatgatgaaatctaaatc 1621460  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  |    |||  |||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||| || ||| |||||||| |||  |||||||    
T  1621461 accaga----atacccttctggatctgcaacgtt-acgcccaaatcattgattgaatttatgattgtttgaagctgatctttcaatacgaaccaaacgaa 1621555  T
Q  234 cac--cgcgacaa--gtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||  | | ||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  1621556 caccacacaacaaaggatgcgaaatcaaacaacgcacaagacgacggacaacacaacgtcgcact 1621620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5119456 - 5119336
Alignment:
Q  173 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacg 272  Q
    |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||| |||||     
T  5119456 ccaaatcaatgattaaatttgta-ttgattgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgataagacacaaaatcaaacgccgcaaaagaca 5119358  T
Q  273 actaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||||||||  |||||||    
T  5119357 acgaacaacacaataccgcact 5119336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 98 - 286
Target Start/End: Original strand, 48351102 - 48351291
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat 197  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| |  |||| |||||| ||| |  |||||| | ||||| |||||  |||| ||||||||| | |||||| ||| ||    
T  48351102 caaaatgcatacaaataacatgatacaatctaaatcaccgtaatactcatgcttccagatctgcaacgcggacgtccaaatcataggttgaatatgtgat 48351201  T
Q  198 tgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaac-accgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    ||||||| || ||| ||||||||  ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||    
T  48351202 tgactgaagctgatctttcaatataaaccaaacgaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaacaagcccacaagacgataaacaacacaac 48351291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 260
Target Start/End: Original strand, 22038719 - 22038880
Alignment:
Q  99 aaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaatt 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||   ||| |||||||||| || ||||||  |||||| |||| |||| | | ||||||||  |||||| ||| |||    
T  22038719 aaaatgcctacaaatattatgataaaatttaaatcaccgaaatacacatgcttctggatctgcaacattgatgtcaaaatcatttattgaatatgtgatt 22038818  T
Q  199 gactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||| |  ||| |||||||| |||  |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22038819 gactgaagtagatctttcaatatgaaccaaacgagcaccacaacaagacgcgaaatcaaaca 22038880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 178
Target Start/End: Original strand, 29120276 - 29120375
Alignment:
Q  79 agttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaat 178  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| |  |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  29120276 agttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagttaccgaaatactcatgcttccagatctgcaatgttgacgcccaaat 29120375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Original strand, 7008855 - 7008931
Alignment:
Q  48 ggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7008855 ggtgaatctacgaacgaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgtccacaaataatatgataaa 7008931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44947669 - 44947511
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||  |||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  44947669 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggcacaatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 44947570  T
Q  133 caccgaaat-tcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
     |||| ||| ||    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44947569 gaccggaatatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 44947511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 52979000 - 52978894
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||   ||| |||| ||||||  || |||||||||| |||||  ||||||||    
T  52979000 taaaaacaaaaagggtgaatctgcgacaaaactcacaccatccaagttaataaaatacaatgacaaaataactacaaataatataataaaatctaagtca 52978901  T
Q  135 ccgaaat 141  Q
    |||||||    
T  52978900 ccgaaat 52978894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 53616482 - 53616560
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  53616482 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 53616560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Original strand, 9145746 - 9145831
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||| ||  | |||||||||  ||| |||||||||    
T  9145746 aaaatgtaaaaggtgaatctgcgaacgaactcacaacacctaaattaatagcatacaaaagtaaaatgcctataaacaatatgata 9145831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18048978 - 18048879
Alignment:
Q  196 attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||||||| ||  || |||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18048978 attgactgaagcttatctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaacaacacaacaccgca 18048879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 38706542 - 38706599
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  38706542 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcata 38706599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 112
Target Start/End: Original strand, 9645358 - 9645434
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||| ||| ||||    
T  9645358 aaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatacctacaaa 9645434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36700469 - 36700377
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    |||||||| || |||||||||||||||   ||||||| |||||| |  | |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36700469 caaaatgcttttaaataatatgataaaatttaagtcatcgaaatacccacgcttccagatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaat 36700377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37465709 - 37465649
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||| | ||||||||||||||||    
T  37465709 aactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttacaaataatatgataaa 37465649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37683954 - 37683884
Alignment:
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37683954 aaacgaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacaactctacacaagacgatgaacaacacaacgccgcact 37683884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 56199353 - 56199297
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcat 90  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  56199353 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcat 56199297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 74
Target Start/End: Original strand, 4142597 - 4142656
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagca 74  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  4142597 acatcaaatacaaacattgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagca 4142656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 21554642 - 21554732
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||  ||||||  ||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21554642 ctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcattgcatccaagttaatagcaaacaagggcaaaatgcctacaaataataagataaa 21554732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4644115 - 4644042
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  4644115 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcct 4644042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Original strand, 29120394 - 29120475
Alignment:
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||  |||||| |||||||||||||  || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  29120394 tttcaataagaattaattgaacaccatgacaagacgcgaaatcaaacgtcgtacaagacgatgaacaacacagcgccgcact 29120475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 34024270 - 34024327
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  34024270 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 34024327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43853700 - 43853551
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||  |||| ||   ||||||||   ||||||||||||||||  |||| ||    
T  43853700 ctaaaaatgtaaatggttaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaatgctgacaaataatatgataaaatctaaatc 43853601  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattg 183  Q
    | |  ||| |  |||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  43853600 atcttaatacgcatgcttccgaatctgcaacgttgacgtacaaatcattg 43853551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 55228123 - 55227972
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |  |||  || |||||| || |  ||||| | ||||||||  ||||||||||||| | ||     
T  55228123 atgctttcggatatacaacgttgacgcgcaaatcattgatgaaatccgtgattgaccgaagttgatttgttaataggaatcaaacgaacaccgcaataaa 55228024  T
Q  246 tcgcgaaatcaaacacc---gcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||| ||||| |||| |   |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  55228023 acgcaaaatctaacaacgttgcacaagacgacaaacaacacaatgctgcact 55227972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12493520 - 12493464
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  12493520 aactcacagcacgcaagttaatagcatataataacaaaatggctacaaataatatga 12493464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 19896476 - 19896532
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||    
T  19896476 taaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcatatcatccaagttaatagcata 19896532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29966582 - 29966526
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  29966582 taaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 29966526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 33332435 - 33332487
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaa 79  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||    
T  33332435 aatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaa 33332487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 37837291 - 37837570
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  37837291 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaagta 37837390  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37837391 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 37837490  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37837491 tcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 37837570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 290
Target Start/End: Original strand, 39328627 - 39328898
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39328627 acatcaaatacaaacatcgctaaaa-cgtaaaaggtaaatctgcgaacaaattcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 39328725  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
       ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39328726 ---tgataaaacctaagtcaccgagattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 39328822  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39328823 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccg 39328898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 45349632 - 45349911
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45349632 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 45349731  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45349732 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgcttccagatctgcaatgttgacgccaaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccaatctt 45349831  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  45349832 tcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaaaacgacgaacaacacaacgccacact 45349911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38799019 - 38798767
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  38799019 taaaaacgtacaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataagacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtca 38798920  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  38798919 ccgaaattcacatgcttccggatcttcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaaataaacaaac 38798820  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    || |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38798819 actgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 38798767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42978867 - 42978589
Alignment:
Q  16 catcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataa 115  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||    
T  42978867 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacatataa 42978768  T
Q  116 tatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattttt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  42978767 tatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatccttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgttattgactgatgtcgatcttt 42978668  T
Q  216 caataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42978667 caataagaactaaacgaacaccgcgataaaacgagaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 42978589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 8001380 - 8001658
Alignment:
Q  16 catcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataa 115  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||    
T  8001380 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaataa 8001479  T
Q  116 tatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattttt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||| || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  8001480 tatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgattccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatcttt 8001579  T
Q  216 caataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8001580 caataggaactgaacaaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 8001658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 12141140 - 12141420
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagca-cccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaat 113  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||| | |||||    
T  12141140 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacaacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaat 12141239  T
Q  114 aatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  12141240 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatct 12141339  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12141340 tccaataggaactaaacaaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacaaacaacaaaacgccgcact 12141420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 48316652 - 48316920
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||    
T  48316652 atacaaacatcgctaaaaacctaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 48316751  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| ||||| || ||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  48316752 aaaacctaaatcgccgaaatacccatgcttccggatctgcagcgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatag 48316851  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48316852 gaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaacacaacgccg 48316920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 34899440 - 34899719
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||    
T  34899440 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata 34899539  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| || || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  34899540 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccgaatttgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 34899639  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34899640 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaaagcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 34899719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 39171423 - 39171702
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  39171423 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcatagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 39171522  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  39171523 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 39171622  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| |||| | ||| |||| || |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  39171623 tcaattggaactgaacaaacatcgtgacaagacgtaaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaacgcagcact 39171702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24770442 - 24770225
Alignment:
Q  77 caagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaa 176  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24770442 caagttaataacataaaacggcaaaatgtctaccaataatatgataaaacctaagtctccgaaattcacatgcttctggatcttcaacgttgacgcccaa 24770343  T
Q  177 atcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacta 276  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| |    
T  24770342 atcattggttgaatttgtgattgactgatgccgatctttcaataagaaataaacgaacaccgcgacaagacacgaaatcaaacgtcgcataagacgacga 24770243  T
Q  277 acaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||    
T  24770242 acaacacaacaccgcact 24770225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47590547 - 47590290
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  47590547 aaaacgtaaagggtaaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcttacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcgcc 47590448  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
    ||||| |  |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| || || |||||    
T  47590447 gaaatactcatgcttccggatgtgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgacggatgtagatctttcaataggaattatacaaacac 47590348  T
Q  237 cgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47590347 cgcggcaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 47590290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48061672 - 48061401
Alignment:
Q  23 tacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  48061672 tacaaacatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 48061573  T
Q  123 aatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatagg 222  Q
    || ||||| |||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  48061572 aaacctaaatcaccgaaatactcatgcttaaggatctgcaacgttgacgctcaaaccattggttgaatttgtaattgactaatgtagatctttcaatagg 48061473  T
Q  223 aaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  48061472 aactaaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgtcgcataagacgacgaacaacaaaatgccgcact 48061401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19297106 - 19296849
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||    
T  19297106 aaaacttaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatataacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagttacc 19297007  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
    ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| |||||    
T  19297006 gaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaagaggaactgaacaaacac 19296907  T
Q  237 cgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19296906 cgcgacaaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 19296849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 30756659 - 30756931
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||  |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  30756659 atacaaacatctctaaaaacgtaaaggctgaatctgcgaactaacttacaacacctaagttaacagcataaaacgacaaaatgcctataaataatatgat 30756758  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30756759 aaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaattattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaatag 30756858  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     || | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30756859 aaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 30756931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Original strand, 9449998 - 9450249
Alignment:
Q  43 taaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaatt 142  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||     
T  9449998 taaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacctaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcactaaaata 9450097  T
Q  143 catatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  9450098 cccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgac 9450197  T
Q  243 aagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9450198 aaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccacact 9450249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46700272 - 46700023
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  46700272 taaaaacataaagggtgaatctgcaaca-aactcacaacaccctagttaatagcatataacggcaaaatgcctataaataatatgataaaatctaagtca 46700174  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    |||||||    |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  46700173 ccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgctgatgcccaaatcattgattgaatttgtagttgactgatgtcgatatttcaataggaactaaacgaac 46700074  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    ||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  46700073 accacgacaagacgtgaaatcaaacgccgcagaagacgacgaacaacacaa 46700023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 19404590 - 19404869
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || |  || ||||||| |||| ||||||    
T  19404590 acatcagatacgaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcgtgcaacggcaaaaagcctacaaata 19404689  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| |  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | || ||    
T  19404690 atatgataaaatctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgacagatgtcaatctt 19404789  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||   |||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  19404790 tcaagaggaactaaaagaacaccgcgacaagatgcaaaatcaaacgatgcacaagacgacgaacaatagaacgccgcact 19404869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 9977043 - 9977318
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||||| ||||| || | ||||||| ||  |||||    
T  9977043 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaaaaaattcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaaaaata 9977142  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  |||| ||| | |||| || ||  || |||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  9977143 atatgataaaatctaactcatcaaaatacacataattccggat----aacgttgacgcccaaatcattgtttgaatttgtaattgactgaagtcgatctt 9977238  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  9977239 tcaataggaactaaatgagcaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccaaacaagacgacgaacaatacaacgctgcact 9977318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Original strand, 13796811 - 13797044
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |  |||||| ||||||| |||    
T  13796811 aactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtcacctaaatactcatgcttccggatctgcaa 13796910  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||    
T  13796911 cgttgacggtcaaatcattggttgactttgttattgactgatgtcgatctttcaatatgaactaaacgaacaccgagacaagacacgaaatcaaacgtcg 13797010  T
Q  264 cacaag---acgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||   || || |||||||||||||||||||    
T  13797011 cacaagatcacaacgaacaacacaacgccgcact 13797044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5792959 - 5792783
Alignment:
Q  110 aaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccg 209  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||    
T  5792959 aaataatatgataaaatataagtcatcgaaattcttatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattgatttaacttgtaattgactgatgtcg 5792860  T
Q  210 atttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  5792859 atctttcaataggaactaaacgaacactgtgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagatgactaacaacacaac 5792783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 28044589 - 28044832
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | || |||||||||| ||||| || ||||||||| ||  |||||    
T  28044589 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcataacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaaaaata 28044688  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||    
T  28044689 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcaatgcttgaatttataattgattgatatagatctt 28044788  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaa 258  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  28044789 tcaataagaactgaacaaacaccgcgacaagacgagaaatcaaa 28044832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40993415 - 40993191
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||||    
T  40993415 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacaaata 40993316  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||  | || | |||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  40993315 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctgaatatgcaacgttgaaatccaaatcttttgttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 40993216  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||    
T  40993215 tcaataggaactgaacaaacaccgc 40993191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 294
Target Start/End: Original strand, 25287069 - 25287298
Alignment:
Q  65 actcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaac 164  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||    |||||||| |||||  ||     
T  25287069 actcacaacatccgagttaatagcatacaacagcaaaatggctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgctttcagatctgtaat 25287168  T
Q  165 gttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgc 264  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||   |||    
T  25287169 attgacgctcaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcaatctttcaataagaagtaaatgaacaccgcgacaagatgtgaaatcaaatgtcgc 25287268  T
Q  265 acaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25287269 acaagacgacgaacaacacaacgccacact 25287298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 285
Target Start/End: Original strand, 5348459 - 5348695
Alignment:
Q  49 gtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatg 148  Q
    ||||| |||||||  |||| ||| || |||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||     
T  5348459 gtgaaactgcgaacaaactaacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaataatatggtaaattctaagtcactgaaatacacata 5348558  T
Q  149 ctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcg 248  Q
     ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||    
T  5348559 ttttcgaatctgcaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgattgaaattgatctttcaataggaaccaaacgaacaccgcaataagacg 5348658  T
Q  249 cgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
      |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  5348659 ataaatcaaacaccgcacaaaacaacgaacaacacaa 5348695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28476465 - 28476199
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  |||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  28476465 ctaaaaacgtaaatggtgaatctgcaaacaaactcacagcactcaagttaataacattgcacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 28476366  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||| ||| |  || |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||  |||||||    
T  28476365 accg-aatacccatacttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaacgaa 28476267  T
Q  234 caccgc----gacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||     | |||  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28476266 caccgcacaacaaaagatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 28476199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35133185 - 35132983
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||| |||    
T  35133185 taaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaataatatgatgaaatctaaatca 35133086  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    |   ||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||| |||||||| |||  ||||||||    
T  35133085 ctagaatactcatgcttttggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatctttcaatacgaaccaaacgaac 35132986  T
Q  235 acc 237  Q
    |||    
T  35132985 acc 35132983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22743190 - 22742978
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||      
T  22743190 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaaaaaactcccaacacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgccaacaaataatatgatgaaat 22743091  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  22743090 ctaaatcaccagaatactcatgcttctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtgattggctgaagctgatctttcaatacgaacc 22742991  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||| ||||    
T  22742990 aaacgaacgccgc 22742978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Original strand, 3267070 - 3267324
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    ||||||||| ||| |||||| | ||||  |||||||| |  | |||||||| ||||| |  || || ||||||  ||||| |||||||||   |||||||    
T  3267070 taaaaacgtcaaatgtgaatttacgaacaaactcacaacttctaagttaatagcatatagcggtaacatgcctaaaaatagtatgataaaatataagtca 3267169  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    |||||||    |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||     |||||||||||||||  | |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  3267170 ccgaaatctccatgctttcggatgtgcaatgttgacgcctaaatcattg-----atttgtaattgactggagtcgatctttcaatatgaattaaacgaac 3267264  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| || ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3267265 accgtgataagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 3267324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39229251 - 39229002
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |   |||||||| || |||| ||||  ||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||     
T  39229251 taaaaacgtaaacgttgaatctgcaagcaaactcacaacatccaaattaaa-gcatacaacggaaaaatgcctacaaattatatgataaattctaagtcc 39229153  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    | ||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||  ||||| ||    
T  39229152 ctgaaatacacatgcttccagatctgcaacgtcgacgcccaagtcatcggttgaatctgtaattgactgaagttgatctttcaatagaaaccaaacg-ac 39229054  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    | | | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39229053 atcacaacaagacgcgaaatctaacgccgcacaagacgacgaacaacacaac 39229002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Original strand, 26623644 - 26623902
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | | ||||||||| | ||| || | ||||||||||  || |||||||||||||  |||| ||||    
T  26623644 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacgctcaagttaatagtatagaacgacaaaatgcctaaaactaatatgataaattataagccacc 26623743  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgac-tgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
    ||||| |  |||||| ||||| | |||  |  ||||||| ||||||  |||||| || ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||  |||| ||||    
T  26623744 gaaatactcatgcttccggatttgcaatatccacgcccatatcattaattgaatatgcaattgacctgaagttgatctttcaataggaaccaaacaaaca 26623843  T
Q  236 ccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| |||||  || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26623844 ccgcaacaagatgcaaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 26623902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25255473 - 25255206
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| || | |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||| |||| |||||      
T  25255473 aatatcgctaaaaacgtaaagggtgtatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaatgatattataaact 25255374  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||||||||  |||| |  ||||||  |||||| |||| | || |||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| |  ||  |||| ||||||| |    
T  25255373 ctaagtcactaaaatgcccatgcttcaggatctgcaacatcgatgcccaaataattgattgaatctataattgattgaagttgacatttcgataggaact 25255274  T
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||||||||| || || |  |||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  25255273 aaatgaacaccgcaacgagacatgaaatcaaacgctgcacaagacggcgaataacacaacgccgcact 25255206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 287
Target Start/End: Original strand, 41553283 - 41553542
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| | |  |||| ||||||||||  |||    
T  41553283 atcactaaaaacgtaaagggtgaatctaggaacaaactcacagcacc-aagttaatagcatacaacggcaaaatacgtataaatgatatgataaaatcta 41553381  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaa 229  Q
    | ||||| ||||   |||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| |||  |||    
T  41553382 aatcaccaaaatatctatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattgactgaaattgatctttcaatatgaaccaaa 41553481  T
Q  230 cgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg---cacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||| | ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41553482 cgaacaccataacaagacgcgaaatcaaataacgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 41553542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 28407751 - 28407860
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||    
T  28407751 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtaaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata 28407850  T
Q  115 atatgataaa 124  Q
    ||||||||||    
T  28407851 atatgataaa 28407860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Original strand, 24069290 - 24069509
Alignment:
Q  78 aagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaa 177  Q
    |||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||  ||| |  |||||| ||| ||| |||||||||||  ||||    
T  24069290 aagttaatagcatacaacgataaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatcctcatgcttccgggtctgcaacgttgacgttcaaa 24069389  T
Q  178 tcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatc---aaacaccgcacaagacgac 274  Q
    |||||| |||||  ||| |||||  || || ||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||   |||| ||||||||||| ||    
T  24069390 tcattgattgaacctgtgattgatcgaagctgatatttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaatacgccaaatcaaaaaacgccgcacaagacaac 24069489  T
Q  275 taacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24069490 gaacaacacaacgccgcact 24069509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Original strand, 38880542 - 38880693
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||||    
T  38880542 atgcttccagatctgcaacgttggcacccaaatcattgattgaatttgtgattgactgaagctgatctttcaataagaaccaaacgaacaccgcaacaag 38880641  T
Q  246 tcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
      || ||||||||||    || |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  38880642 atgcaaaatcaaacagcgtcgtacaagacggcaaacaacacaacgtcgcact 38880693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22087429 - 22087297
Alignment:
Q  161 caacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |  |||| ||||| || ||||| | ||||||||||||    
T  22087429 caacgttgacacccaagtcattgattgaatttgtaattgactgaagttgatctttcaataggtatcaaacaaacacagcaacaagacacgaaatcaaaca 22087330  T
Q  261 ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcac 293  Q
     || ||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  22087329 tcgtacaagacaacggacaacacaacgtcgcac 22087297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 48930953 - 48930797
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||      
T  48930953 aatatcgctaaaaacgtataggttgaatctgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccaacaaataatatgatgaaat 48930854  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattg 183  Q
    |||| |||||  ||| |  ||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48930853 ctaaatcaccagaataccaatgtttctggatctgcaacgttgacacccaaatcattg 48930797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Original strand, 28062156 - 28062262
Alignment:
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||   ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||    
T  28062156 atatgataaaacataaatcaccgaaatatctatactttcggatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttataattgattgatgtagatctt 28062255  T
Q  215 tcaatag 221  Q
    |||||||    
T  28062256 tcaatag 28062262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21266635 - 21266527
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||||||| |  ||||    
T  21266635 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagt 21266536  T
Q  133 caccgaaat 141  Q
    |||||||||    
T  21266535 caccgaaat 21266527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 46822262 - 46822182
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  46822262 cactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 46822182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 46822599 - 46822684
Alignment:
Q  38 aaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  46822599 aaacgtaaaaagtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaatgacaaaatgc-tacaaataatatgataaa 46822684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42408582 - 42408525
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42408582 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 42408525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 35664987 - 35665143
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||   |||||||||||||||  |||| ||    
T  35664987 ctaaaaacgtaaaggagaaatctgtgaacaaactcacagtacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccaaaaaataatatgataaaatctaaatc 35665086  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    ||  |||| || ||||||  || ||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  35665087 actaaaatacacatgcttatgggtctgcaacattgacgttcaaatcattgattgaat 35665143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Original strand, 24350811 - 24350891
Alignment:
Q  154 ggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || ||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  24350811 ggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg--tgaagctgatctttcaatacgaaccaaacgaacac 24350891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 287
Target Start/End: Original strand, 41553750 - 41553887
Alignment:
Q  153 cggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| |||  |||||||||||   ||||| ||||||    
T  41553750 cggatctgcaacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattgactgaaattgatctttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaa 41553849  T
Q  253 atcaaacaccg---cacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||| | ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41553850 atcaaataacgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 41553887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11343933 - 11343879
Alignment:
Q  150 tttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  11343933 tttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattaattaaatttgtaattgactga 11343879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26492610 - 26492452
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||   || ||||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  26492610 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 26492511  T
Q  133 caccgaaat-tcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
     |||| ||| ||  | || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26492510 gaccggaatatccaaggcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 26492452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 85
Target Start/End: Original strand, 26610633 - 26610683
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaat 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  26610633 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagtaccaaagttaat 26610683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 433523 - 433614
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  433523 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaa 433614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32684913 - 32684822
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  32684913 ctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 32684822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35261544 - 35261385
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaa 130  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    ||    
T  35261544 cactaaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaa 35261445  T
Q  131 gtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    || |||| ||| || |||| | ||||||| |||| |||||| | ||||| ||| ||||||    
T  35261444 gtgaccggaatacacatgcctccggatctgcaacattgacgtctaaatctttgattgaat 35261385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40993200 - 40993161
Alignment:
Q  255 caaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40993200 caaacaccgcacaagatgacgaacaacacaacgccgcact 40993161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 287
Target Start/End: Original strand, 41554103 - 41554232
Alignment:
Q  161 caacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||   ||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| |||  |||||||||||   ||||| |||||||||||| |    
T  41554103 caacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattgactgaaattgatatttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaaatcaaata 41554202  T
Q  261 ccg---cacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
     ||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41554203 acgtcacacaagacgacgaacaacacaacg 41554232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25068144 - 25068061
Alignment:
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaat---caaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || ||||    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25068144 tttcaataggaacaaaacgaacaccgcaacaagatgcaaaataaaaaaacaccgcacaag-cgacgaacaacacaacgccgcact 25068061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 289
Target Start/End: Original strand, 969474 - 969557
Alignment:
Q  209 gatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgcc 289  Q
    |||||||||||| |||  |||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  969474 gatttttcaatatgaaccaaacaaacaccgcaataagacgcaaaatcaaacaacgccgcaaaagacgacgaacaacacaacgcc 969557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 7640607 - 7640664
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  7640607 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 7640664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 112
Target Start/End: Original strand, 31235609 - 31235694
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||| || |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  31235609 aatatcgctaaaaacgtaaagaatgaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 31235694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 24610149 - 24610233
Alignment:
Q  161 caacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| ||| || ||||||  | ||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  24610149 caacgttgaaacccaaatcattgattgaatctgtgatcgactgaaactgatattttaatatgaactaaacgaacaccgcaacaag 24610233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29844876 - 29844844
Alignment:
Q  260 accgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29844876 accgcacaagacgacaaacaacacaacgccgca 29844844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 44311775 - 44311831
Alignment:
Q  165 gttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  44311775 gttgacacccaaattattgattgaatttgtaattgacttaagccgatcttttaatag 44311831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33580135 - 33579856
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33580135 acatcaaatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 33580036  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33580035 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacgtgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 33579936  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33579935 tcaatatgaaataaacgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgatgcacaagacgacgaacaacacaacgctgcact 33579856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38546047 - 38545782
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  38546047 atacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcccaccacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 38545948  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  38545947 aaaacctaagtcacctaaattcgcatgttttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcaatgg 38545848  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38545847 aaaataaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 38545782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 293
Target Start/End: Original strand, 21533642 - 21533920
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  21533642 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtaaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 21533741  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||  ||| ||    
T  21533742 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaattattggttgaatttgtagtcgactgatgtagatctt 21533841  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcac 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21533842 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaaccaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacgccgcac 21533920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 48650567 - 48650846
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  48650567 acatcagatacaaatatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 48650666  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  48650667 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcattctttcagatctgcaacgttgacgtccaaattattggttgaatttgtaattgattgatgcagatctt 48650766  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  48650767 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacaacgaacaacacaatgccgcact 48650846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 47041881 - 47042154
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||| |||||||| |  |||| |||| ||||||    
T  47041881 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcatatcacctaagttaatagcataaaacgataaaacgcctacaaata 47041980  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  47041981 atatgatgaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaaccattggttgaatttgtaactgactgatgctgatctt 47042080  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgac-aagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47042081 tcaataggaaataaatgaacaccgctacaaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 47042154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9998722 - 9998443
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  9998722 acatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 9998623  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||   ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  9998622 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgtcatcgtgcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 9998523  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9998522 tcaagaggaactaaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 9998443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 52922950 - 52923229
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||    
T  52922950 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcagccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaata 52923049  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||| ||    
T  52923050 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactaatatagatctt 52923149  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  52923150 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacagcgccacact 52923229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10229729 - 10229452
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  10229729 atcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 10229630  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    ||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  10229629 atgataaaacttaagtcaccgaaataatcatgcttttggatctgcaacgttatcgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttc 10229530  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10229529 aagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagatgacgaacaacacaacgccgcact 10229452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 6954536 - 6954808
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  6954536 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatttgat 6954635  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6954636 aaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcagcattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaatag 6954735  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| | ||| ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6954736 gaactgaacaaacaccgtgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacgccgcact 6954808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 45568278 - 45568557
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  45568278 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 45568377  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | | ||    
T  45568378 atatgataaaacctaaatcacccaaatatccatgcttccggatctgcaaagttgacgtccaaatcattgtttgaatttgtaattgattgatgtagttatt 45568477  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45568478 tcaacaggaactgaacaaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 45568557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40487578 - 40487301
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||||  |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  40487578 atcagatacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaataat 40487479  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  40487478 atgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcattggctgaatttgt-attgactgatgtagatctttc 40487380  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatc-aaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40487379 aataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 40487301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10108491 - 10108212
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  10108491 acatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 10108392  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| |  |||| |  |||||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10108391 atatgataaaacttaagtcgccgaaatactcatgcatctggatctgcaacgttatcgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 10108292  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | | | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10108291 tcaagaggaactgagcaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 10108212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10233325 - 10233046
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  10233325 acatcaaatacaaacatagataaaaacataaagggtgaatgtacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 10233226  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||| ||  |||||| |||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10233225 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttatcgtctaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 10233126  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10233125 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 10233046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Original strand, 43488445 - 43488702
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43488445 aaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaaagcctaaaaataatatgataaaacctaaatcacc 43488544  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
    ||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||| || | ||| |||||    
T  43488545 gaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgcttgaatttataattgattaatgcagatatttcaatagaaactgaacaaacac 43488644  T
Q  237 cgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43488645 cgcaacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccacact 43488702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 36461277 - 36461543
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||      ||||||| || |||||||||||||    
T  36461277 atacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgctaacaaactcacagcactcaagttaatagcata------caaaatggctacaaataatatgat 36461370  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| ||||| || ||||||| |  |||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||    
T  36461371 aaaacctaaatcgccgaaatactcatgcttccagatctgtaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaatag 36461470  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36461471 gaacagaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 36461543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 292
Target Start/End: Original strand, 23799792 - 23800020
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |  ||| |||||||||| |||    
T  23799792 aactcacaacacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcattgaaatactcatgttttcggatctgcaa 23799891  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  23799892 cgttgacgccgaaatcattgattgaatttgtaattgactggtgtcgttctttcaacaggaactaagcgaacactgcgacaagacgcgaaatcaaacgccg 23799991  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23799992 cacaagacgactaagaacacaacgccgca 23800020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32701746 - 32701469
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||| || |||    
T  32701746 acatcagatacaaacatcgctaaaaatataaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttcatagcatacaacggcaaaatgcctacagata 32701647  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||| ||    
T  32701646 atatcataaaacttaagtcgccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattggttgatgtagatctt 32701547  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  32701546 tcaataggaactgaacaaacatcgcaacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgac--acaatacaacgccgcact 32701469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40556957 - 40556688
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||  || ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  40556957 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtgcatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 40556858  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||| || |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  40556857 atatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttacaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 40556758  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||          ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40556757 tcaagaggaactgaacaaacac----------cgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 40556688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21313289 - 21313020
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  21313289 atcagatacaaacaccgctaaaaatgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatggctacaaataat 21313190  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |  ||| |||| ||| | | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21313189 atgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgatttcagatatgctacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgataccgatatttc 21313090  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||   |  |||||||||| |||||||||||    
T  21313089 aatagaaactaaacgaacaccgcgacaaaacgtgaaatcaaaagtcagacaagacgacgaacaacacaac 21313020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 46304372 - 46304583
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  46304372 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaacatgcctacatataatatgataaaacctaagtc 46304471  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  46304472 accgaaatacccatgcttccggatctgcaatgttgacgcctaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatatttcaataggaactaaacaaa 46304571  T
Q  234 caccgcgacaag 245  Q
    ||||||||||||    
T  46304572 caccgcgacaag 46304583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 281
Target Start/End: Original strand, 9797367 - 9797633
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  9797367 acatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatatacaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 9797466  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||| ||||  |||| |  |||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  9797467 atatgataaaacataaatcacttaaatacccatgcttccggatctgcaacgttaacgttcaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 9797566  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaac 281  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9797567 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaac 9797633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Original strand, 12149666 - 12149896
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| | ||| |||||||||| |  || ||| | ||||| |||    
T  12149666 aactcacagtacccaacttaatagcatacaacggcaaaatgcctacgattaatatgataaaacataattcaccgaaatacccattcttccagatctgcaa 12149765  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  12149766 cgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaagagactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacatcgcgacaagacgcgaaatcaaacgctg 12149865  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  12149866 cacaagacgatgaacaatacaacgccgcact 12149896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 54149246 - 54148967
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||| || | || ||||||| ||||||    
T  54149246 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaactaactcacatcacccaggttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata 54149147  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||  ||| ||    
T  54149146 atatgataaaatccaagtcaccgaaatagccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggtgaaatttgtaa-tgattgatgtagatctt 54149048  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcac-aagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  54149047 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaatgccgcacttagacgacgaacaacacaatgccgcact 54148967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 12050487 - 12050757
Alignment:
Q  21 aatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatga 120  Q
    |||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||  |  |||||||||  |||| || | |||||||| | ||||||||||||    
T  12050487 aatataaacatctctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacactattcaagttaataacatacaacgacaaaatgcttacaaataatatga 12050586  T
Q  121 taaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaata 220  Q
    |||| |||||||| ||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||    
T  12050587 taaaacctaagtccccgaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtaattgaccgatgtagatattccaata 12050686  T
Q  221 ggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgc 291  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12050687 ggaactaaacaaacaccgcgacaagaggagaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgc 12050757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21431849 - 21431639
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  21431849 ctaaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaatctcacagcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtc 21431750  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | ||| ||    
T  21431749 accgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcgttggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaatagaaattgaacaaa 21431650  T
Q  234 caccgcgacaa 244  Q
    |||| ||||||    
T  21431649 caccacgacaa 21431639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47896406 - 47896128
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||||| | ||||||    
T  47896406 acattaaatacaaacatccctaaaaacttaaagggagaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgc-tacaaata 47896308  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||| |||||| ||||||| | ||||||    |||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||    
T  47896307 ataagataaaacctaagttatcgaaatattcatgcttccggatatgcaacatttacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtaaatctt 47896208  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  47896207 tcaataggaactaaacaaataccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacgccacact 47896128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Original strand, 38859980 - 38860232
Alignment:
Q  50 tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaa--attcatat 147  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  || |  ||    
T  38859980 tgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccaaaatatacccat 38860079  T
Q  148 gctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgact------gatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcga 241  Q
    | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||      ||||  ||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  38860080 gttttcggatctgcaacgttgacgaccaagtcattggttgaatttgtaatcgactgatgtagatgtagatcttccaataggaactaaacaaacaccgcga 38860179  T
Q  242 caagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  38860180 caagacgcgaaatcaatcgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgtcgcact 38860232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 286
Target Start/End: Original strand, 20464805 - 20465074
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||  |  ||||||||||  |||||| | ||| ||||||||| |||||  | | ||||||||   ||||||||    
T  20464805 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagagcaaatctgcgaacaaactcatatcacacaagttaatagcatacgacgacaaaatgcacacaaataat 20464904  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    ||||||||   |||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  20464905 atgataaaatttaagtcaccgaaatactcatgctttcaaatctgcaacattgacgcccaaatcatttattgaatttgtaattgactgaaatcgatctttc 20465004  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  20465005 aataggatttaaatgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaac 20465074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 7448767 - 7448991
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||    
T  7448767 taaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaataatatgatgaaacttaagtca 7448866  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||| | ||| |||    
T  7448867 ccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttaaacaggaactgaacaaac 7448966  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  7448967 accgagacaagacgtgaaatcaaac 7448991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 7456909 - 7457133
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||    
T  7456909 taaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaataatatgatgaaacttaagtca 7457008  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||| | ||| |||    
T  7457009 ccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttaaacaggaactgaacaaac 7457108  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  7457109 accgagacaagacgtgaaatcaaac 7457133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 20608736 - 20609009
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| |||||||  || ||| ||||||||| | ||||||||| ||  |||||||| ||||    ||||| ||||| || || |||||| || ||| ||    
T  20608736 acatcagatacaaaattcgctagaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacc----ttaatagcatacaacggaaaaatgtctgcaagta 20608831  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||| |||||  |||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||  ||| ||    
T  20608832 atataataaaatctaaatcaccgaaattctcatgcttccggatctgcaactttgatgctcaaatcattgattgaacttgtaaatgactaatgttgatatt 20608931  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608932 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaatgccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 20609009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19339429 - 19339159
Alignment:
Q  16 catcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataa 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||| | || ||||||||||||  |||| || | |||||||||| || ||||    
T  19339429 catcaaatacaaagatcactacaaacgtaaaagatgaatctgagaacaaacttaaagtacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacagataa 19339330  T
Q  116 tatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattttt 215  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |  ||||||  |||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||| |||    
T  19339329 tatgataaaatctaagtcac-gaaatacccatgcttctggatctgcaacattgacacctaaatcattgattgaatttgtaattgactaaagttgatcttt 19339231  T
Q  216 caataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19339230 caataggaactaaacgaacgccacgacaagacgtgaaattaaacgccgcacaagttgacgaacaacacaacg 19339159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43017014 - 43016831
Alignment:
Q  111 aataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccga 210  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||    
T  43017014 aataatatgataacacctaagtcaccgaaatgcacatgcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactaacgtcga 43016915  T
Q  211 tttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  43016914 tctttcacaaggaactaaacaaacaccgcgacaagacacaaaatcaaacgccacacaagataacgaacaacacaacgccgcact 43016831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 76 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53099983 - 53099773
Alignment:
Q  76 ccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgccca 175  Q
    ||||||||||  |||| || | |||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  53099983 ccaagttaataacatacaacgacaaaatgc-tacaaataatatgctaaaatctaagtcactggaattcacatgcttccggatatgtaacgttgacgccca 53099885  T
Q  176 aatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgact 275  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||| ||| || |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  53099884 aatcattgattgaacttgtaattgactcatgctgatctttcaataggaactaaatgaatacggcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagatgact 53099785  T
Q  276 aacaacacaacg 287  Q
    ||||||||||||    
T  53099784 aacaacacaacg 53099773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37041023 - 37040755
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  37041023 acatcagatacaaaaatcgctagaaacgtaaagggtaaaactgcgaacaaactcacagcacccaagttaataacataaaatgacaaaatgc-tacaacta 37040925  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||| |  ||| ||   ||||  |||| || || |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| | || ||    
T  37040924 atatgattaaatctaagtcaccgaaatactcatgtttctagatcggcaacattcacacccaaatcattgattggatttataattgaccgatgtcaatctt 37040825  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  37040824 tcaatagaaactaaacgaacgccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaccaacaca 37040755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45424968 - 45424785
Alignment:
Q  100 aaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattg 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| | |  ||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45424968 aaatgcctacaaataatatgataaaatcgaagtcaccgaagtacccatgattccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 45424869  T
Q  200 actgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||    
T  45424868 accgatgtcgatttttcaataggaactaaacaaacaccgcaacaatacgcgaaatcaaac-ccacacaggacgacaaacaacaca 45424785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 51303488 - 51303700
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  51303488 aatatcactaaaaacgtatatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 51303587  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || || ||| ||||||||  ||      
T  51303588 ctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtcagaagctgatctttcaatacaaacc 51303687  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  51303688 aaacgaacaccgc 51303700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 292
Target Start/End: Original strand, 35864896 - 35865042
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  35864896 atgcttccagatctgcaatgttaacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgaaaag 35864995  T
Q  246 tcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
     ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35864996 acgcaaaatcaaacgccacacaagacgactaacaacacaacgccgca 35865042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8914955 - 8914746
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  8914955 aatatcgctaaaaacgtataaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 8914856  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| || || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||      
T  8914855 ctaaatcaccagaatacacattcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctaatctttcaatacgaacc 8914756  T
Q  227 aaacgaacac 236  Q
    ||||||||||    
T  8914755 aaacgaacac 8914746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 45425762 - 45425578
Alignment:
Q  100 aaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattg 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45425762 aaatgcctgcaaataatatgataaaatcgaagtcaccgaaatacttatggttccggatctgcaatgttgaagcccaaatcattgattgaatttgtaattg 45425663  T
Q  200 actgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    | ||||  |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||    
T  45425662 attgatttcgatctttcaatgggaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaacgccgcataggacgacggacaacaca 45425578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7546859 - 7546583
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaagg-tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaat 125  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  7546859 aatatcgctaaaaacgtataagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaa 7546760  T
Q  126 cctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaa 225  Q
     |||| |||||  ||| |  ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||  | ||| |||||||| |||     
T  7546759 tctaaatcaccagaatacccatgcttttggatcggcaacgttgacgctcaaatcattgactgaatttgtgattgtctgaaactgatctttcaatacgaac 7546660  T
Q  226 taaacgaacaccg--cgacaa---gtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||||||||||  | ||||    | |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7546659 caaacgaacaccgcacaacaaaggattgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 7546583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 292
Target Start/End: Original strand, 20987729 - 20987909
Alignment:
Q  112 ataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgat 211  Q
    |||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||| |||| ||||    
T  20987729 ataatatgataaaatctaagttactgaaattcttatgcttccagatctgtaacgttgactcccaaatcattgatgtaacttgtaattgaccgatgtcgat 20987828  T
Q  212 ttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20987829 ctttcaataggaactaaacaaacatcgcgacaagacgcgaaatcaaatgccacacaagacgactaagaacacaacaccgca 20987909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 258
Target Start/End: Original strand, 26275680 - 26275895
Alignment:
Q  43 taaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaatt 142  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||| | ||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||     
T  26275680 taaatggtgaatttgcgaataaacttaaagcgccaaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatataagtcactgaaata 26275779  T
Q  143 catatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |  ||| ||||| |||| ||||||| ||  | ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  26275780 ctcatgttttcgaatctgcaacgttaacaacaaaatcattgattgaatttgtatatgactgatgtcgatctttcactaggaactaaacgaacatcgcgac 26275879  T
Q  243 aagtcgcgaaatcaaa 258  Q
    ||| ||||||||||||    
T  26275880 aagacgcgaaatcaaa 26275895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4711737 - 4711583
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  4711737 acatcagatacaaacatcactaaaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 4711638  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttga 169  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||    
T  4711637 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttga 4711583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 44959806 - 44959932
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44959806 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaataaactcacagcatccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 44959905  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaat 141  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    
T  44959906 atatgataaaacttaagtcaccgaaat 44959932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18011268 - 18011003
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| | || |||||| ||| | ||||| ||  |||| || ||| |||||||||||||    
T  18011268 atacaaagatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaacttaaagaacccaaattagtagcatacaaccgcaagatacctacaaataatatgat 18011169  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
     |   ||||||||| |||||    ||||||  |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||| | | |||| |||||||||    
T  18011168 tatatctaagtcactgaaatattcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaagtgattgattgaaattgttattgactaaagtcgatctttcaatag 18011069  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
     || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  18011068 aaactaaacgaacaccgtgacaagatgtgaaatcaaacgccgcacaagatgatgaacaacacaacg 18011003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 21289659 - 21289871
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  21289659 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 21289758  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| | |||  |||    ||||||   ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  21289759 ctaaattaccagaatatccatgcttctagatctgcaacgttgacaccaaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaacc 21289858  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  21289859 aaacgaacaccgc 21289871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 35175640 - 35175386
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||   ||| ||    
T  35175640 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaacaatatgatgaaatataaatc 35175541  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    | |  ||| |  ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||  ||  |||||||    
T  35175540 atcagaatactcatgttttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagctgatctttcaatataaaccaaacgaa 35175441  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||   | |||||||||||  ||||||||||    
T  35175440 caccgcaacaagacatgaaatcaaacaacgctgcacaagacgatgaacaacacaa 35175386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 53807710 - 53807972
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  53807710 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 53807809  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  53807810 accagaatactcttgcttctggatatgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttgatctttcaatatg-aaccaacgaa 53807908  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| || |||||  || ||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  53807909 cacagcaacaagatgccaaatcaaacaatgccgcagaagacgacgaacaacacaaggtcgcact 53807972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 51923970 - 51923758
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  51923970 aatatcgctaaaaacgtataggatggatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 51923871  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  51923870 ctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgcgattgtctgaagctgatctttcaatacgaacc 51923771  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  51923770 aaacgaacaccgc 51923758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19619949 - 19619784
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||   |||||| | || |  ||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  19619949 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgatcaaactcaaaacatcttagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtc 19619850  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattga 200  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19619849 accgaaattctcatgc-ttcggatctacaacgttgacacctaaatcattgattgaacttgtaattga 19619784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Original strand, 50194187 - 50194392
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |   |||| ||    
T  50194187 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgatatctaaatc 50194286  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | | |||||||| |||| |||||||    
T  50194287 accagaatactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctggtctttcaatatgaaacaaacgaa 50194386  T
Q  234 caccgc 239  Q
    ||||||    
T  50194387 caccgc 50194392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48200017 - 48199788
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcaccc----aagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| | ||     || ||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  48200017 ctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacgcctgcctaaattaatagcatataaaggcaaaatgcctacagataatatgataaattcta 48199918  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaa 229  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||| | |||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||  |||    
T  48199917 agtcaccgaaatgcacatgcttctggatttgcaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatttataattgattgaagttgatctttcaataggaaccaaa 48199818  T
Q  230 cgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    |||||||| | |||||   |||||||||||    
T  48199817 cgaacaccacaacaagatacgaaatcaaac 48199788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 628775 - 628985
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  628775 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagaatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 628874  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  628875 accagaatactcttgcttctggatctacaacgttgatgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatg-aaccaacgaa 628973  T
Q  234 caccgcgacaag 245  Q
    |||||| |||||    
T  628974 caccgcaacaag 628985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42460992 - 42460825
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||      
T  42460992 aatatcgctataaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 42460893  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgt 194  Q
    |||| |||||  |||    ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42460892 ctaaatcaccagaatgttcatgcttctgtatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgt 42460825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46220918 - 46220699
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||   ||| ||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||    
T  46220918 acatcaaatacaaatatcgctaaaaatataaaagaaaaatttgcgaacaaactcgcagcacccaaattaatggcatacaacggtaaaatgcctacaaata 46220819  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattg-cttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||| |  |||||||||||||| |||||        || |||||||  ||   |||||||||||||||||  ||| |    
T  46220818 atatgataaaatctaaatcactgaaataccaatgctttcggatctgcaacg--------catatcattgattttgttttgtaattgactgatgttgatat 46220727  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcga 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46220726 ttcaataggaactaaacgaacaccgcga 46220699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29239463 - 29239316
Alignment:
Q  150 tttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgc 249  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||||| || ||| || ||||| |||  ||||||||||| | ||||| ||     
T  29239463 tttcggatctacaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatctgtgattgactgaagctgatcttccaatacgaaccaaacgaacaccacaacaagacgt 29239364  T
Q  250 gaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29239363 gaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 29239316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14859726 - 14859466
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||  | ||||||| ||||||  |||| |     
T  14859726 ctaaaaatgtatagggtgaatctgctaacaatctcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccaaccaataatacgataaaatctaaatt 14859627  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||| |||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| || ||| |||||||| |||  ||| |||    
T  14859626 accaaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattgattgaagctgatctttcaatatgaaccaaatgaa 14859527  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| |||||  || |||| |||   | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14859526 caccgcaacaagatgcaaaattaaatgtcacacaagatgacgaacaacacaacaccgcact 14859466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16235669 - 16235497
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| ||      
T  16235669 aatatcgctaaaaacgtatagggtaaatctgcgaacaaactcacaccatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaagtaatatgatgaaat 16235570  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattg 199  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16235569 ctaaatcaccagaatacccatgcttcttgatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 16235497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 43017143 - 43017019
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| || |||  |||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  43017143 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaataaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 43017044  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaa 139  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  43017043 atatgataacacctaagtcaccgaa 43017019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Original strand, 31271773 - 31271919
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| | |||| |||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||    
T  31271773 atgcttccggatctgcattgttgacgcccaaatctttgattgaatttgt--ttaactgaagtcgatctttccatatgaactaaacgaatgccgcgacaag 31271870  T
Q  246 tcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  31271871 acgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacacaaaaccgcact 31271919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 294
Target Start/End: Original strand, 36910640 - 36910753
Alignment:
Q  182 tgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcga-caagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaa 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36910640 tgcttgaatttgtaattgattgatgtacatctttcaataggaactgaacagacaccgcgaacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaa 36910739  T
Q  281 cacaacgccgcact 294  Q
    || |||||||||||    
T  36910740 caaaacgccgcact 36910753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27856408 - 27856311
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27856408 aatatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatgcaacggaaaaatgcctacaaataatatgataaa 27856311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 151
Target Start/End: Original strand, 20987589 - 20987724
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  20987589 acatcaaatacagacatcgctaaagacgtaaa-gatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaactgcaaaatgcctacaaata 20987687  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctt 151  Q
    ||||||||||  |||||| || ||||||| |||||||    
T  20987688 atatgataaaatctaagtaactgaaattcttatgctt 20987724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Original strand, 27706072 - 27706243
Alignment:
Q  28 atatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcc 127  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  27706072 atatcgctaaaaacgtatagggcgaatctgggaacaaactaacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatc 27706171  T
Q  128 taagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattg 199  Q
    ||| | |||   || |  ||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  27706172 taaataaccaggatacccatgcttgtggatatgcaacgttgacgccgaaatcattgattgaatttgtgattg 27706243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44805262 - 44805040
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||    
T  44805262 ctaaaaacttaaaaggtgaat--gcgaacaaactcacat-acccaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatc 44805166  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  ||||| |||||| | ||||||||| | |||||| |||| ||| || ||| ||||||||| |  ||| |||||||| | |  |||||||    
T  44805165 accataatacccatgctctcggatttgcaacgttga-gtccaaattattgattgcatatgtgattgactgaggatgatatttcaatatgcaccaaacgaa 44805067  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||    
T  44805066 caccgcaacaagacgtgaaattaaaca 44805040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 53508465 - 53508200
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||| || |||||||||| |||    | | |||||||||| ||||||||||||||||      
T  53508465 aatatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacatccaagttaatagca----acgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 53508370  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||  | ||| |  ||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||     ||| ||||||||||||      
T  53508369 ctaaatcattgtaatactcatgcttttggatgtgcaaagttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattaactggatttgatctttcaataggaacc 53508270  T
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtc-gcgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||||||| || ||||  | | |||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  53508269 aaacgaacactgcaacaaaacggggaaatcaaacaacatcgtacaagacgacgaacaacacaacgccgca 53508200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4822026 - 4821781
Alignment:
Q  50 tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat-aaatcctaagtcaccgaaattcatatg 148  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||| |||||  ||| |  |||    
T  4822026 tgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat--taaatcaccagaatacccatg 4821929  T
Q  149 ctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcg 248  Q
    | | ||||| |  |||||||  | ||||||||| | |||||| ||| ||||||| | || ||| |||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  4821928 cctccggatttgtaacgttggtgtccaaatcatggattgaatatgtgattgactcaagctgatctttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacg 4821829  T
Q  249 cgaaatcaaacaccg--cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | ||||||||||  |   |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4821828 caaaatcaaacaatgtcaacaagacgacgaacaatacaacaccgcact 4821781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 3848751 - 3848909
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| ||||||| |||||| ||||||||||    ||||    
T  3848751 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatatagcggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagt 3848850  T
Q  133 caccgaaattcatat-gctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    ||||| |||   ||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  3848851 caccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 3848909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 294
Target Start/End: Original strand, 12947246 - 12947389
Alignment:
Q  154 ggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaa 253  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||| | |||||| | | ||||||||| |  ||| |||||||| |||  ||||||||||| | |||||  ||||||    
T  12947246 ggatctgcaatgttggcgtccaaatcatcgattgaatctatgattgactgaagttgatatttcaatatgaaccaaacgaacaccacaacaagatgcgaaa 12947345  T
Q  254 tcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12947346 tcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaaagccgcact 12947389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1649524 - 1649393
Alignment:
Q  165 gttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatca--aacacc 262  Q
    |||||||||  |||||||| || ||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||  | ||||| ||||||||||  ||||||    
T  1649524 gttgacgccataatcattgattaaatctgtaattgtctgaagtcgatctttcaataggaactaaaagaacacatcaacaagacgcgaaatcaacaacacc 1649425  T
Q  263 gcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||| ||||    
T  1649424 gcacaagacggagaacaatacaacgccacact 1649393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 26716078 - 26716170
Alignment:
Q  153 cggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  || ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||    
T  26716078 cggatctgcaacgttgacgccaaaatcattgattgaatttatgattgactgaagctaatctttcaatagaaatcaaacgaacaccgcaacaag 26716170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Original strand, 35864799 - 35864891
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct 107  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35864799 acatcagatacaaacatctctaaaaacgtaaaaaatgaatttgcgaacaacctcacaacatccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcct 35864891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 183
Target Start/End: Original strand, 3085165 - 3085302
Alignment:
Q  46 aaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcat 145  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |  ||| |      
T  3085165 aaggtgaatctacgaacaaactcactgcacccaatttaatagcctacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaattctaaatcatcagaataccc 3085264  T
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattg 183  Q
     | |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  3085265 ctactttcgaatctgcaacgttgacgttcaaatcattg 3085302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 294
Target Start/End: Original strand, 44959955 - 44960064
Alignment:
Q  185 ttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||  || | ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| || || |||    
T  44959955 ttgaatttgtaattaactgatgtagatctttcaataaaaactgaacaaacaccacgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaataataca 44960054  T
Q  285 acgccgcact 294  Q
    || |||||||    
T  44960055 acaccgcact 44960064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9173980 - 9173897
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  9173980 aaaacgtaaagggtgaatatgcgaaa-aactcacggaacctaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 9173897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29922276 - 29922068
Alignment:
Q  51 gaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgct 150  Q
    |||||||||||  ||||||||    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||  ||     ||| |    
T  29922276 gaatctgcgaacaaactcacattttccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaccagaacaatcatgtt 29922177  T
Q  151 ttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcg 250  Q
    |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |  ||| |||||||| |||  |||   ||||||| ||||| ||||    
T  29922176 tctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattggttgaagttgatctttcaatatgaacgaaatatacaccgcaacaagacgcg 29922077  T
Q  251 aaatcaaac 259  Q
    |||||||||    
T  29922076 aaatcaaac 29922068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29971429 - 29971221
Alignment:
Q  51 gaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgct 150  Q
    |||||||||||  ||||||||    |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||  ||     ||| |    
T  29971429 gaatctgcgaacaaactcacattttccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaccagaacaatcatgtt 29971330  T
Q  151 ttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcg 250  Q
    |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |  ||| |||||||| |||  |||   ||||||| ||||| ||||    
T  29971329 tctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattggttgaagttgatctttcaatatgaacgaaatatacaccgcaacaagacgcg 29971230  T
Q  251 aaatcaaac 259  Q
    |||||||||    
T  29971229 aaatcaaac 29971221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Original strand, 31271665 - 31271733
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagtta 83  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||    
T  31271665 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacctaagtta 31271733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 137
Target Start/End: Original strand, 49552056 - 49552160
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | |||||||||| |  ||||    
T  49552056 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagt 49552155  T
Q  133 caccg 137  Q
    |||||    
T  49552156 caccg 49552160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41818458 - 41818185
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||| || ||||  |||||||| |||| | |||||| ||||  ||   |||||||||| ||||||||| ||||||      
T  41818458 aatatcgctaaaaatataaagggtgaaactacgaacaaactcacatcaccaatgttaatagcatgcaacaacaaaatgcctacaaataatacgataaaat 41818359  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgat----gccgatttttcaatagg 222  Q
    | ||  ||||  ||| |  ||| ||| |||||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    |  ||| ||||||||||    
T  41818358 caaaaccaccataataccaatgtttttggatctgcaacattgacattcaaatcattgattgaatttgtaaatgattgattgaagttgatctttcaatagg 41818259  T
Q  223 aaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  41818258 aac-aaacgaacatcacaacaagacgcgaaatcaaacaataccgcacaagacgacgaacaacacaatgtcgcact 41818185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32607711 - 32607633
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  32607711 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaggttaatagcatataatggcataatgcctacaaa 32607633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 36906364 - 36906286
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  36906364 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 36906286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Original strand, 4396348 - 4396447
Alignment:
Q  196 attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||||||| ||  || |||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4396348 attgactgaagcttatctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaacaacacaacaccgca 4396447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 239
Target Start/End: Original strand, 7887424 - 7887500
Alignment:
Q  163 acgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgc 239  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||| |||| |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7887424 acgttgacgcccaaatcattaatcgaatatgtgattgtctgaagttgatctttcaataggaactaaacgaacaccgc 7887500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Original strand, 7792078 - 7792129
Alignment:
Q  73 cacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7792078 cacctaagttaatagcttacaatggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 7792129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 121
Target Start/End: Original strand, 12946835 - 12946906
Alignment:
Q  50 tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  12946835 tgaatcttcgaacaaattcacaacacccaagttaatagcatataagggcaaaatgcctacaaaaaatatgat 12946906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 39917230 - 39917321
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  39917230 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataaaggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 39917321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27066078 - 27066020
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  27066078 atgcttccggatctacaatgttgacgctcaaataattgattgaatttgtaattaactga 27066020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Original strand, 51202096 - 51202146
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaa 84  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  51202096 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaa 51202146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 38440423 - 38440480
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  38440423 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagttaatagcata 38440480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 46220703 - 46220658
Alignment:
Q  247 cgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  46220703 cgcgaaatcaaacatcacacaagatgactaacaacacaacgtcgca 46220658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18763734 - 18763455
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18763734 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 18763635  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  18763634 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgtaacgttgacgcccaaatgattggttgaatttgtaattgattgatgccgatctt 18763535  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18763534 tcaataggaactaaacgaacaccgtgataagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 18763455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1415823 - 1415551
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  1415823 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgttaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattaaacggtaaaatgcctacaaata 1415724  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1415723 atctgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 1415624  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  1415623 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgaagaacaacacaacg 1415551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33923971 - 33923704
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  33923971 acatcagatacaaaaatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacgacaaaacgcctgcaaata 33923872  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33923871 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 33923772  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaaca 282  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33923771 tcaataggaaataaacaaacaccacgataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 33923704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 43396972 - 43397232
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  43396972 ctaaaaacgtaaagggtgaatctg-gaacaaactaacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcgtacaaataatatgataaaacctaagtc 43397070  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaa-cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacga 232  Q
    || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43397071 actgaaattcacatgcttccggatcttcaaacgttgacgcccaaatcattggttgaattcgtagttggctaatgccgatctttcaatatgaaataaacga 43397170  T
Q  233 acaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  43397171 acaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccacact 43397232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 37876440 - 37876719
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||    
T  37876440 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaatctgcgaacaaactcgcatcacccaagttaatagcatacgacggcaaaatgcctacaaata 37876539  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  37876540 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgatgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 37876639  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37876640 ccaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 37876719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4779019 - 4778740
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  4779019 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata 4778920  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  4778919 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 4778820  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||  |||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4778819 tcaagaggaattgaataaacaccgcgagaaaacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaataacacaacgccgcact 4778740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Original strand, 7677709 - 7677986
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  7677709 atcagatataaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaacttgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaataat 7677808  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  7677809 atgataaaacctaattcacggaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttc 7677908  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||| | ||| ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7677909 aataggaactgaacaaacaccgagataagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 7677986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1421941 - 1421663
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  1421941 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaa-ggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 1421843  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  1421842 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 1421743  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| || |  || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  1421742 tcaatagaaactggacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgctgcacaagacgacgaacaacataacaccgcact 1421663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31788722 - 31788444
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  31788722 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 31788623  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||    
T  31788622 atatgttaaaacctaagtcactgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctt 31788523  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  31788522 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagatgc-aaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacaaaacgtcgcact 31788444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36692140 - 36691861
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36692140 acatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacaaccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 36692041  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||    
T  36692040 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgctttaggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgaccgatgtcaatctt 36691941  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| | ||||  ||||||| |||||||||||    
T  36691940 tcagtagaaactaaacgaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaacgtcgcactaaacgatgaacaacaaaacgccgcact 36691861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7646744 - 7646460
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  7646744 acatcaaatataaagatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 7646645  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgccc-----aaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccg 209  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  7646644 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaattaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtag 7646545  T
Q  210 atttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || |||||| | ||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7646544 atctttcaaaaagaattgaacaaacaccacgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacataacgccgcact 7646460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 27097241 - 27097519
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||| ||||||    
T  27097241 acatcaaatacaaatatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagtatacaacggcaaaattcctacaaata 27097340  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  27097341 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacc-atgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 27097439  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||   | |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27097440 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaaggtgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 27097519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38445412 - 38445153
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  38445412 taaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcaccaaagttaataacatacaatggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtca 38445313  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||||||| |  | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| | ||| |||    
T  38445312 ccgaaatacccacgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaatttactgatgtagatctttcaataggaactgaacaaac 38445213  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38445212 accgcgataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgctgcact 38445153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 31128626 - 31128891
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||  |||||||| || ||||||||||     | || |||||||||||| |||||||||||||    
T  31128626 atacaaatatcactaaaaatgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaat-----ataacggcaaaatgcctacaaataatatgat 31128720  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    |||   |||||||| ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31128721 aaaatataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcctaaatcattgattgaatttgtaattgactgatatcgatttttcaatag 31128820  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128821 gaactaaacgaacaccgcgacaagaagcggaatcaaacgccacacaagacgactaacaacacaacgccgca 31128891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 5427703 - 5427981
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||| | ||||||    
T  5427703 acatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgataaaatgcttgcaaata 5427802  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  5427803 atatgataaaacctaagtcactgaaatacacatacttccggatctgcaacgttgacgcacaagtcattggttgaatttgt-attgactgatgtagatctt 5427901  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5427902 ccaatatgaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 5427981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 36942956 - 36943234
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||| ||||| |  |||| ||||||| ||||||    
T  36942956 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacatactcacagcacccagattaatagcatacac-ggcataatgcctacaaata 36943054  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||    ||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||  ||| ||    
T  36943055 atatgataaaattcaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggtggaatttgtaatcgactaatgtagatctt 36943154  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36943155 tcaattggaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 36943234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8809538 - 8809269
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || | ||||||| || | | |||||||||    
T  8809538 atacaaacatcactaaaaacgtaaaagatggatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacta-taatatgat 8809440  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    |||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8809439 aaaatctaagtcactgaaattctcatgcttccggatctgcaatgttggcgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatctttcaatag 8809340  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8809339 gaactatgcgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaattgccgcacaagacgactaacaacacgacgtcgca 8809269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 25508902 - 25509175
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  25508902 acatcatatacaaacatcggtaaaaacataaacgatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata 25509001  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||| ||||||  |||||||| |||||| |  ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  25509002 atacgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgtttccggatttgcaacgttgacgcccagatcattgattgaatttgtaattgactgatgttgatctt 25509101  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgc 288  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25509102 tcaatgggaactaaacgaacaccgcgacaagacacaaaatcaaacgtcgcacaagacgaataacaacacaacgc 25509175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 12677285 - 12677490
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  12677285 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaataaactcataatacccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacaa-ta 12677383  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12677384 atatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgacttatgccgatctt 12677483  T
Q  215 tcaatag 221  Q
    |||||||    
T  12677484 tcaatag 12677490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 33585569 - 33585827
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||    
T  33585569 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata 33585668  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  33585669 atatgataaaacttaaatcaccgaattactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgaggtagatttt 33585768  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacga 273  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  33585769 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgtaatcaaacgccacacaagacga 33585827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 19062200 - 19062465
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct-----tcaaataatatgataaatcct 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||     | ||||||||||||||| | |    
T  19062200 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaattaaataatatgataaaactt 19062299  T
Q  129 aagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataa 228  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | |    
T  19062300 aagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgaaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaacaggaattga 19062399  T
Q  229 acgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||| | |||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19062400 acaaacactgtgacaagacgtgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacgctgcact 19062465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 4903979 - 4904258
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || | ||||||| || ||||||    
T  4903979 acatcaaatataaatattgctaaaaacgtaaaggctgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata 4904078  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||    ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4904079 atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttctggatctgcaacgttgacacccaaatcatcagttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 4904178  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| |||  ||||||||||||| ||||| | | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4904179 tcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacacaaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgccacact 4904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 294
Target Start/End: Original strand, 31210522 - 31210720
Alignment:
Q  96 ggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgta 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31210522 ggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgctttctgatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgta 31210621  T
Q  196 attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31210622 attgattgatgtagatctttcaataggaactgaacaaacaccacgataagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacaacaaacaacacaacgccgcact 31210720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 9169092 - 9169371
Alignment:
Q  16 catcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggt-gaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  9169092 catcagataaaaacatcactaaaaacgtaaagggttgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 9169191  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||| ||    
T  9169192 atatgataagacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattcgttgaatttgtaattcactgatgtagatctt 9169291  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| |||||   ||| |||| |||| |||  || ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9169292 tcaagaggaaccgaacaaacatcgcggcaaaacgtgaaatcaaacgacgcacaagacaacgaacaacacaacgccgcact 9169371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 29279404 - 29279681
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29279404 acatcaaatacagacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatatgcgaacaaactcacaacaccatagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 29279503  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   |||||||||||||  |  ||| || ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||  |    
T  29279504 atatgataaaatttaagtcaccgaaaaactcatgtttccggatctgcaacattgacgcacaaatcattgattgaatttgtaatcgactgatgttgatcat 29279603  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||  |||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29279604 tcaacgggaactaaactaataccgcgacaagacacgaaatcaaatgtcgcccaagacgactaccaacacaacgccgca 29279681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 11985067 - 11985343
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||  || ||||| || |||||||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  11985067 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaattcacaacatccaagttaataggatacaacagcaaaatgcctacaaata 11985166  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  || |||  |||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||   | ||    
T  11985167 atatgataaaacctaagtcactgaaatactcattcttctggatctgcaacgttgacacctaaatcattggttgagtttgtaattgactgtcgc---tctt 11985263  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  11985264 tcaataggaactaaatgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacaacaaacaacacaaagccgcact 11985343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Original strand, 19028755 - 19029023
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||    
T  19028755 atacaaatattgttaaaaatgtaaaaggtgaatttgcgaacaatctcacaacactcaagttaatagcataaaacgaaaaaatgcctacaaatagtatgat 19028854  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    |||  |||||| ||||||||    ||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  19028855 aaaatctaagttaccgaaatatccatgcttctggatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtacttgactgaagtcgatctttcaatag 19028954  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  19028955 gaactaaatgaacaccgagacaagacgcgaaatcaaatgccgcacatgacgacgaataacacaacgccg 19029023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 4041428 - 4041707
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||  ||  |||||||| || ||||||    
T  4041428 acatcagatacaaaaatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatgcaacagcaaaatggctacaaata 4041527  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||   || ||    
T  4041528 atatgataaagcctaagttatcgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgagtttgcaattgactaatgtaaatctt 4041627  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||   ||| ||||||  ||||||  || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4041628 tcaataggaaccgaacaaacaccatgacaagatgcaaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacgacgcact 4041707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 30399863 - 30400148
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||||  ||||  | |||||||||||| ||||||    
T  30399863 acatcagatataaatatcgcaaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacacctaagttaatgacatacgacggcaaaatgcctacaaata 30399962  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatat------gctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgcc 208  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||| ||| ||      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |      
T  30399963 atatgataaaatctaagtcactaaaaatcaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgaagtt 30400062  T
Q  209 gatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  30400063 gatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgacacgatgcaaaatcaaatgccgcacaagacgaagaacaacacaatgtcgcact 30400148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35220594 - 35220312
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  35220594 acatcagatacaaagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 35220495  T
Q  115 at-atgat--aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgat 211  Q
       ||| |  ||    |||||||| ||||| |  |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  35220494 cccatgcttcaagatttaagtcacagaaatacccatgctttaagatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaatggactgatgttgat 35220395  T
Q  212 ttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  35220394 ctttcaataggaactaaatgaacaccgtgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgatgaacaacataatgccgcact 35220312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 29173551 - 29173832
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttca---a 111  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||| ||   |||||||| | ||   |    
T  29173551 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaataacatacaacaacaaaatgcatacaaata 29173650  T
Q  112 ataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgat 211  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  29173651 ataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacacccaaataattgattgaatttgtaattga-tgatgtcgag 29173749  T
Q  212 ttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |  |   | |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29173750 ctttcaataggaactaaacgaacactgcgataagacgcaaaatcacatgcaatataagacgatgaacaacacaacgccgcact 29173832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7448419 - 7448234
Alignment:
Q  109 caaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgcc 208  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||      
T  7448419 caaataatatgataaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaattattggttgaatatgtaattgactgatgta 7448320  T
Q  209 gatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| |||||| ||| | | ||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7448319 gatctttcaagaggcactgaacaaacatcgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 7448234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17151670 - 17151430
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||| ||  ||||||||| ||||| ||   |||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  17151670 taaaaacgtaaagggtgaatatgcggacaaactcacaacattcaagttaatagcatacaacaacaaaatacctactaataatatgataaattccaagtca 17151571  T
Q  135 ccgaaattcata-tgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||||||| |  | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||  |||||||    
T  17151570 ccgaaatacccaatgcttccggatctacaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattgactgaaattgatctttcaataggaatcaaacgaa 17151471  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgac 274  Q
    |||||  |||||  |||||||||||| | ||||||||||||    
T  17151470 caccgtaacaagatgcgaaatcaaacgctgcacaagacgac 17151430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 10237062 - 10237271
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||      
T  10237062 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 10237161  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| ||| |  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  10237162 ctaaatcatcagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaacc 10237261  T
Q  227 aaacgaacac 236  Q
    ||||||||||    
T  10237262 aaacgaacac 10237271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 3309199 - 3308987
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||      
T  3309199 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgactacaaataatatgatgaaat 3309100  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
     ||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||| ||||||||  ||      
T  3309099 ataaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttaacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatatttcaatacaaacc 3309000  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  3308999 aaacgaacaccgc 3308987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10929912 - 10929648
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||||  ||   ||||||||||  |||||||||||||||   ||| ||    
T  10929912 ctaaaaacataaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagcattcaacaacaaaatgcctataaataatatgataaaatttaaatc 10929813  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || |||||||||| | |||  |||||||    
T  10929812 accagaatacacatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatttttcaacatgaaccaaacgaa 10929713  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatca----aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||    |||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10929712 caccgcaacaagacgctaaatcaaaacaacgtcgtacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 10929648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 12554036 - 12554294
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12554036 aaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatatcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagttac 12554135  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
     ||||| |  |||||| |  || | ||| ||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||| |||  |||||||||    
T  12554136 tgaaatactcatgcttccaaatatgcaatgtccacacccaaatcattgattgaatctgtaattgactgaagttgatatttcaatatgaatcaaacgaaca 12554235  T
Q  236 ccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| || || | | |||| |||   ||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  12554236 ccgcaactagacacaaaattaaatgtcgcacaaggtgacggacaacacaacgccgcact 12554294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 17249000 - 17249262
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||| |  |||| ||    
T  17249000 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgatataatctaaatc 17249099  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||| |||||||| | ||  ||| ||    
T  17249100 accagaatactcttgcttatggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaaactgatctttcaatatg-aaccaacaaa 17249198  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaa---acaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| |||||  || |||| ||   || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  17249199 caccgcaacaagatgccaaataaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaaggtcgcact 17249262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4100594 - 4100420
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  4100594 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacc-aagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 4100496  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatg 206  Q
    ||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||        ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4100495 aaaacttaagtcaccgaaatac-catgcttccggatc--------tgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 4100420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37994531 - 37994263
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  37994531 ctaaaatcgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 37994432  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatt-----tgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataa 228  Q
    |||| |||     | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||     ||| ||||||||| || |||||||||||| |||  ||    
T  37994431 accggaatattctttcttccggatctgcaacgctgacgtccaaatcattcattgaatttgtgatgtgattgactgaagctgatttttcaatatgaatcaa 37994332  T
Q  229 acgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||||| || |||||  || ||||||||||   ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  37994331 atgaacactgcaacaagatgcaaaatcaaacaatgccgtacaggaagacgaacaacacaacgccgcact 37994263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 294
Target Start/End: Original strand, 42698673 - 42698814
Alignment:
Q  153 cggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaa 252  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||| ||    
T  42698673 cggatctgcaacgctgacgtccaaatcactgattgaatttgtaattcactgatgtcgatctttcaatagaaactaaacaaacattgcgacaagacgcaaa 42698772  T
Q  253 atcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42698773 atcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 42698814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 28871641 - 28871873
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||  |||| ||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||| | | | || ||||||||||  | ||||    
T  28871641 ctaaaaatataaagggtgaatccacgaacaaactcacagcatccaagttaatagtatacaacggcaaaatgcttacgattagtatgataaattttgagtc 28871740  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||  ||||  | ||| ||  | |||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||  |||||||    
T  28871741 actaaaatatacatgattctgaatctgcaacgtcgacgcctaaatcattggttgaatctgtaattgactgaagttgatctttcaataggaaccaaacgaa 28871840  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcac 266  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28871841 caccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcac 28871873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 286
Target Start/End: Original strand, 39310774 - 39310957
Alignment:
Q  102 atgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgac 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |  |||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39310774 atgcctacaaataatatgataaaatctaagtcactgaaatacccatgcct-cggatgtgcaatgttgatgcccaaatcaatgattgaatttgtaattgac 39310872  T
Q  202 tgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    ||| | |||| ||  |||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||    
T  39310873 tgaagtcgatcttcaaataggaactaaacaaataccgcgataaggcgcgaaatcaaacgctgcacaagacgaagaacaacacaac 39310957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 17994560 - 17994811
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaa----atggcaaaatgccttca 110  Q
    |||||| |||| || ||| ||| ||||||||  | ||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| |    |||||||||||||| ||    
T  17994560 acatcagatactaacatcgctacaaacgtaacggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacatacaatggcaaaatgcctaca 17994659  T
Q  111 aataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccga 210  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| | |||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||||| |||    
T  17994660 aataatatgataaaatttaagtcaccgaaatacctatggttccggatgtgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttg--------tgatgtcga 17994751  T
Q  211 tttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagac 271  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||  || ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  17994752 tctttcaatagaaactaaacgaacacc-tgaaaaggcacgaaatcaaacgccgcacaagac 17994811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4264655 - 4264467
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||| |  |||||| | ||| |  ||| ||||| || ||||||||| || ||| ||||||    
T  4264655 caaaatgcctacaaataatatgataaatttgaagtcatcgaaatacccatgcttccagatttggaacattgactcctaaatcattgattaaatctgtaat 4264556  T
Q  198 tgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    ||||||| |  ||| |||||||| |||  ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4264555 tgactgaagttgatctttcaataagaaccaaatgaacaccgcaataagacgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacgaacaacgcaac 4264467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 294
Target Start/End: Original strand, 32448465 - 32448734
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata-aatc-- 126  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||  |||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||       
T  32448465 atcactaaaaatataaatgatgaatctatgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataataat 32448564  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| | ||     
T  32448565 ctaaatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatg-aac 32448663  T
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||||||||| |||||  || ||||||||||    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  32448664 caacgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacggcgcacaagacgacgaacaacacaaggtcgcact 32448734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24461690 - 24461470
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| || | |||||| ||| |||| |||||||| ||  |||| ||    
T  24461690 ctaaaaacgtaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatataacgacaaaatacctacaaaaaatatgatgaaatctaaatc 24461591  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||| |||| |  |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||| |  ||| |||||||| |||  |||||||    
T  24461590 accaaaatactaatgcttccggatctgcaacgttggcgtccaaatcatcgattgaatctgtggttgactgaagttgatctttcaatatgaaccaaacgaa 24461491  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaat 254  Q
    |||||| ||||| ||| ||||    
T  24461490 caccgcaacaaggcgcaaaat 24461470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 18107598 - 18107848
Alignment:
Q  29 tatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcct 128  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||   |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  18107598 tatcactaaaaacgtaaagagtgaatatgcgaacaaactcacaacacgcaagttaataatataaaacgacaaaatgcctacaaataatatgattaattct 18107697  T
Q  129 aagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataa 228  Q
    |||||| |||||| || ||||||  ||||||  |   |||||||  ||||  ||  |||||| ||| ||||| ||| |   || | |||||| |||  ||    
T  18107698 aagtcatcgaaatacacatgcttctggatctgta---ttgacgcataaattgttaattgaatctgtgattgagtgaggtttatctctcaatatgaaccaa 18107794  T
Q  229 acgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaaca 282  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18107795 acgaacaccgcagcatgacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 18107848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 33760046 - 33760279
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||| ||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  33760046 ctaaaaacgtaaaggatgagtctgtaaacaaactaacagcacacaagttaatagcttacaacagcaaaatgcctacaaataatatgataagttctaagtc 33760145  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    || ||||| || ||| ||  |||||| |||| | ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| |  ||| |||||||| |||  |||||||    
T  33760146 actgaaatacacatgtttatggatctgcaacatcgacgctcaaatcattgattgagtctataattgactgaagttgatctttcaatatgaatcaaacgaa 33760245  T
Q  234 caccgcgacaagtcg-cgaaatcaaacaccgcac 266  Q
    ||| || ||||| || |||| |||||| ||||||    
T  33760246 cactgcaacaagacgacgaagtcaaacgccgcac 33760279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Original strand, 29574593 - 29574744
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  || |||||||| |||  |||| ||||| || ||||     
T  29574593 atgcttccggatctgcaacgttggcgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctaatctttcaatatgaatcaaacaaacactgcaacaaa 29574692  T
Q  246 tcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
      | |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29574693 atgtgaaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 29574744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14955783 - 14955571
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| |||||||  |||| | ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||  |||||| || ||||||||||||||||      
T  14955783 aatatcgctaaaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaataacatacaatgataaaatgtctacaaataatatgataaaat 14955684  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| ||| |  ||| || ||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||  |||| |  ||| |||||||| |||      
T  14955683 ctaaatcatcagaatacacatgtttctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttatgattatctgaagatgatatttcaatatgaacc 14955584  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  14955583 aaacgaacaccgc 14955571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11833609 - 11833479
Alignment:
Q  149 ctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcg 248  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| || || |||||||||||| ||  |||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11833609 ctttcggatctgcaacgttgatgtccagatcattgatttaacttgtaattgacttatatcgatctcttaatatgaactaaacgaacaccgcgacaagacg 11833510  T
Q  249 cgaaatcaaacaccgcacaagacgactaaca 279  Q
    ||||||||| | || || ||||| |||||||    
T  11833509 cgaaatcaatcgccacataagaccactaaca 11833479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 287
Target Start/End: Original strand, 6358727 - 6358982
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||| | | ||||||||||||||||      
T  6358727 aatatcattaaaaacgtaaatagtgaatctacgaaaaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatacgtacaaataatatgataaaat 6358826  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |||||           | |||||||||||||||||| || | |||||||||| | || |||| |  ||| |||||||| |||      
T  6358827 ctaaatcaccataatacatatt----------tgcaacgttgacgcccaaattatagattgaatttgtgactgtctgaagttgatctttcaataagaacc 6358916  T
Q  227 aaacgaacaccg--cgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||| |||||||  | |||||  |||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||    
T  6358917 aaacaaacaccgtacaacaagatgcgaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacacaacg 6358982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Original strand, 28533808 - 28533897
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28533808 taaaaacgtaaaaggtggatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaa 28533897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41694829 - 41694678
Alignment:
Q  73 cacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgc 172  Q
    |||| ||||||||  |||| || | ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |||  | ||||||  | |||| ||||||||| ||    
T  41694829 caccaaagttaataacatataacgacaaaatgcctataaataatatgataaaatctaagtcaccagaatctacatgcttctgcatctgcaacgttgatgc 41694730  T
Q  173 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaa 224  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||| || ||| |||||| |||||    
T  41694729 ccaaatcattgattgaatatgtaattggctgaagctgatctttcaacaggaa 41694678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 281042 - 280977
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaa 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  281042 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaa 280977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4099171 - 4099090
Alignment:
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4099171 tttcaataggaactgaacaaacaccacgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacgccgcact 4099090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16376185 - 16375960
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||   ||| |||    
T  16376185 taaaaatgtagacggtgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatcgcatacaacaccaaaatgactacaaataatatgataaaatttaaatca 16376086  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
     |  ||| || ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||| |   | | ||||||||||||  |||||||     
T  16376085 tcataatacacatgcttttgaatctgcaactttgacgccgaaatcattgattgaatctgtgactgactggttttggtctttcaataggaaccaaacgaat 16375986  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    ||||| ||| | |  |||||||||||    
T  16375985 accgcaacaggacatgaaatcaaaca 16375960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Original strand, 36175477 - 36175574
Alignment:
Q  162 aacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  36175477 aacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtaattgtttgatgttgatctttcaatagaaaccaaacgaacaccgcaacaagacgcggaatcaaac 36175574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41327619 - 41327524
Alignment:
Q  165 gttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||| ||||||||| ||  ||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  41327619 gttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgaaatagatctttcaatagaaaccaaacgaacaccgcaacaatacgtgaaatcaaaca 41327524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Original strand, 84013 - 84086
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  84013 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcct 84086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Original strand, 31193170 - 31193239
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaa 84  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  31193170 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaatttaa 31193239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 294
Target Start/End: Original strand, 34128601 - 34128800
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat 197  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||  | |||| | |||||| |  | | |||| ||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  34128601 caaaatgcctataaataatatgataaaatccaagtaatcgaaatacccaagatttcagatatgcaacattgacgcccaaataattgattgaatttataat 34128700  T
Q  198 tgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||| | | |||| ||| ||||||||  |||| |||||| | ||||| |||  |||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  34128701 cgactaaagtcgatcttttaataggaaccaaacaaacaccacaacaagacgcacaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacataacaccgcact 34128800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8806115 - 8806024
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  8806115 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaatatatgataaa 8806024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 294
Target Start/End: Original strand, 12647967 - 12648036
Alignment:
Q  228 aacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12647967 aacgaacaccgcaacaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 12648036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 31580487 - 31580565
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  31580487 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 31580565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41327956 - 41327898
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41327956 aactcacatcacctaagttaatagcatacaatgccaaaatgcctacaaataatatgata 41327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22421977 - 22421920
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22421977 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaattgcata 22421920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14423576 - 14423367
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaa----atggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||| | |||||||||||||  |||| |    | ||||||||||||  | |||||||||||||  |||    
T  14423576 ctaaaaacataaagggtaaatctgcgaataaactcaaaacacccaagttaataacatatatacaacggcaaaatgcctaaatataatatgataaaatcta 14423477  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaa 229  Q
    | | ||| |||| |  ||| ||   ||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | | |||| |||||||| |||  |||    
T  14423476 actaacctaaatacccatgtttctagatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattaaatctgtaattgactaaagtcgatctttcaataagaaccaaa 14423377  T
Q  230 cgaacaccgc 239  Q
    | ||||||||    
T  14423376 caaacaccgc 14423367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 285
Target Start/End: Original strand, 23933512 - 23933726
Alignment:
Q  74 acccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcc 173  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||  | |    |||||| | ||| |  |||||||||| |    
T  23933512 acccaagttaatagcttacaacggcaaaattcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagattatccatgcttccagatatgtaacgttgacgtc 23933611  T
Q  174 caaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatca---aacaccgcacaaga 270  Q
    ||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |  ||  |||||||| |||  ||||||||||||| |||||  || || |||   ||||||||||||||    
T  23933612 caaataattgattgaatctgtgattgactgaagttgaactttcaataagaaccaaacgaacaccgcaacaagatgcaaattcaaacaacaccgcacaaga 23933711  T
Q  271 cgactaacaacacaa 285  Q
    | || | ||||||||    
T  23933712 caacaaccaacacaa 23933726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 124
Target Start/End: Original strand, 7015559 - 7015634
Alignment:
Q  50 tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  7015559 tgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 7015634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 9986174 - 9986265
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || | || ||||||| |||| | ||||||||||    
T  9986174 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaa 9986265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 105
Target Start/End: Original strand, 27248983 - 27249054
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgc 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||    
T  27248983 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgc 27249054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 85
Target Start/End: Original strand, 39310707 - 39310770
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaat 85  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  39310707 atacaaacatcattaaaaacataaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaat 39310770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 40659764 - 40659834
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatg 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  40659764 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatg 40659834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6436722 - 6436609
Alignment:
Q  166 ttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgca 265  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||| || ||| ||||| || |||  | ||||||||||  |||||  || |||||||||  ||||    
T  6436722 ttgacgtccaaatcattgattgaatatttgattgactgaagctgatctttcattatgaaccagacgaacaccgtaacaagatgcaaaatcaaacgtcgca 6436623  T
Q  266 caagacgactaaca 279  Q
    ||||||||| ||||    
T  6436622 caagacgacgaaca 6436609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36323909 - 36323856
Alignment:
Q  241 acaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  36323909 acaagacgagaaatcaaacgccgcacaagacaacaaacaacacaaagccgcact 36323856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 81)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Original strand, 34878130 - 34878386
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34878130 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtc 34878229  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    || |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  34878230 actgaatatcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaaattaacaaa 34878329  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34878330 caccgcgacaaaacgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacgccg 34878386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Original strand, 7836650 - 7836908
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7836650 aaaaacataaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcac 7836749  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
    ||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||     
T  7836750 cgaaattcacatgcctccagatattcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcgataggaaataaacgaacg 7836849  T
Q  236 ccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7836850 ccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 7836908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 64 - 290
Target Start/End: Original strand, 23291524 - 23291750
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23291524 aactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatacctccaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaa 23291623  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||    
T  23291624 cgttgatgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagaagcgaaatcaaacgtcg 23291723  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||    
T  23291724 cacaagataatgaacaacacaacgccg 23291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1742546 - 1742261
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaat---tgcat-----aaaatggcaaaatgcc 106  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||   || ||     ||||  ||||||||||    
T  1742546 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaataaactcacatcacccaagttaatctgtgaatcactaaaaacagcaaaatgcc 1742447  T
Q  107 ttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatg 206  Q
    | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1742446 tacaaataatatgataaaacct--gtcaccgaaattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgattgatg 1742349  T
Q  207 ccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1742348 ccgatctttcaataggaaataaacgaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 1742261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14872871 - 14872620
Alignment:
Q  42 gtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaat 141  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14872871 gtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccaaaat 14872772  T
Q  142 tcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcga 241  Q
     |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  14872771 acccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcaata-gaactaaatgaacaccgcga 14872673  T
Q  242 caagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14872672 caagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaatgccgcact 14872620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 35484224 - 35484503
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||    
T  35484224 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggcgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcttacaaata 35484323  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  35484324 atatgataaaaccgaaatcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 35484423  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35484424 tcaataggaattgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaagcaaatgacgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 35484503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45415817 - 45415538
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||   ||| || |||||||||||| ||||||    
T  45415817 acatcatatacacatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaaattaatattatacaacggcaaaatgcctacaaata 45415718  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||    
T  45415717 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgagtttgtaattgattgatgtagatctt 45415618  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45415617 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgatgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 45415538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5984067 - 5983816
Alignment:
Q  43 taaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaatt 142  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  5984067 taaagggtgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacataagtcaccgaaata 5983968  T
Q  143 catatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5983967 cccatgcttccggatctgcagcgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaataggaactaaacaaacaccgcgac 5983868  T
Q  243 aagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5983867 aagacacgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 5983816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Original strand, 10776304 - 10776573
Alignment:
Q  25 caaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10776304 caaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaattgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagaatacaacagcaaaatgcctacaaataaaatgataaa 10776403  T
Q  125 tcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaa 224  Q
     |||||||||||||||| |  ||||||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  10776404 acctaagtcaccgaaatactcatgcttctggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgattggatttgtaattgactgatgtcgatctttcaaaaggaa 10776503  T
Q  225 ataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10776504 gtaaacgaacaccgcgacaagacgcacaatcaaacgccgcataagacgacgaacaacacaacgccgcact 10776573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 7337496 - 7337775
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  7337496 acatcagatacaaacatcgctaaaaatataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacagccaagttaatagcatgcaacagcaaaatgcctacaaata 7337595  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  7337596 atatgataaaaccaaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtgcaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 7337695  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7337696 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 7337775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 21947451 - 21947730
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||   ||| || |||||||||||| ||||||    
T  21947451 acatcatatacaaatatcgttaaaaatgtaaagggtaaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataaaatacaacggcaaaatgcctacaaata 21947550  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  21947551 atatgataaaacttaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 21947650  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  21947651 tcaataagaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgtccgagacgacgaacaacacagcgctgcact 21947730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44915898 - 44915624
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||| |||||||||  || ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  44915898 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagtcgatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 44915799  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||| |  |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  44915798 atatgataaaatctaagaaaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgttgatctt 44915699  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgcc 289  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  44915698 tcaatatgaactaaacgaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaatgccgcacaatatgactaacatcacaacgcc 44915624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3228528 - 3228259
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||| |||  || |||||||||||||  ||||| | |||||  ||| |||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  3228528 acatcaaatataaacgtcgctaaaaacgtaaagagtgaaaccgcgaacaaacacacatcacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaata 3228429  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  3228428 atatgataaaacctaaatcatcgaaatatccatgatttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgtatttgtaattgactgatatcgatctt 3228329  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3228328 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacaca 3228259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 292
Target Start/End: Original strand, 27579989 - 27580238
Alignment:
Q  43 taaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaatt 142  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  27579989 taaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcttatgaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 27580088  T
Q  143 catatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27580089 ctcatgctttcgaatctgcaatgttgacgcccaaatcatttattgaatttgtaatttactgaagtcgatctttcaataggaactaaatgaacaccgcgac 27580188  T
Q  243 aagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||| ||| ||||||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  27580189 aagacgcaaaatcaaatgccacacgatacgacgaacaacacaacgccgca 27580238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Original strand, 29738497 - 29738740
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||   |||||    
T  29738497 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggccaaatgccaataaata 29738596  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29738597 atatgataacacctaagtcactgaaatacacatgcttccggatttgcaacattgacgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 29738696  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaa 258  Q
     |||||| || ||||| |||| |||| |||| || |||||||||    
T  29738697 ccaatagaaactaaacaaacatcgcggcaagacgtgaaatcaaa 29738740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32395256 - 32394978
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||  |||||    
T  32395256 acatcaaatacaaacaccgttaaaaacgtaaagggtgaatc-gcgaacaaacttacagcacccaagttaatagcatacagcggcaaaatgcctataaata 32395158  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  32395157 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgaatgatgtagatctt 32395058  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||| ||  || ||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  32395057 tcaataggaactgaacaaacaccgcgataaaacgggaaatcaaacgttgcacaagacgatgagcaacacaacgccgcact 32394978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31919248 - 31918970
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| || || |||||||||| ||||| || | ||||||| || ||||||    
T  31919248 acatcatatacaaacttcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcgcaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata 31919149  T
Q  115 atatgataaatcc-taagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||   ||||||  |||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  31919148 atatgataaaaccctaagtcactgaaattttcatgcttctggatctgcaacgttgatgctcaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatct 31919049  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  31919048 ttcaacaggaactaaacgaacactgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaaaatggctaacaacacatcgccgca 31918970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16989630 - 16989454
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16989630 acatcatatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtaaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 16989531  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatt 191  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  16989530 atatgataaaacctaagtcactgaaattcacatgattccggatcttcaaccttgacgctcaaattattggttgaatt 16989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 126 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21687021 - 21686857
Alignment:
Q  126 cctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaa 225  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  21687021 cctaagtcaccgaatatcacatgcttccggatcttcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttttaattgagtgatgcctatctttcaataggaaa 21686922  T
Q  226 taaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21686921 ttaacaaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccg 21686857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 292
Target Start/End: Original strand, 13144651 - 13144922
Alignment:
Q  21 aatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatga 120  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13144651 aatacaaacatcgttaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaatattatga 13144750  T
Q  121 taaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaata 220  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | | || | ||||||||    
T  13144751 taaaatctaagtcactgaaatactcatgctttcagatctgcaaaattgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgattaaagtcggtctttcaata 13144850  T
Q  221 ggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
     |||  ||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13144851 tgaatcaaatgaacactacgacaagacgcgaaatcaaatgttgcacaagacaacagacaacacaacgccgca 13144922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47133143 - 47132880
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||  |||| ||    
T  47133143 ctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatc 47133044  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||  |||||||    
T  47133043 accagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatgaagcaaacgaa 47132944  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||   |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  47132943 caccgcaacaagacgcgaaattaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaacacaacgccccact 47132880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 168 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27456646 - 27456522
Alignment:
Q  168 gacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcaca 267  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  27456646 gacgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcaca 27456547  T
Q  268 agacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  27456546 agatgactaacaacacaacgccgca 27456522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 36775555 - 36775829
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  36775555 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 36775654  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| ||||||  || |  ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||| |||      
T  36775655 ctaaatcaccgggatacccatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagccgatctttcaatacgaacc 36775754  T
Q  227 aaacgaacaccgc----gacaagtcgcgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| |||||     | |||  |||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  36775755 aaacgaataccgcacaacaaaagatgcgaaatcaaacaacactgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 36775829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48750432 - 48750158
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  48750432 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 48750333  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  48750332 ctaaatcaccagaatacccatgcttatggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattaaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaatc 48750233  T
Q  227 aaacgaacaccgc----gacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||||     | |||  |||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48750232 aaacgaacaccgcacaacaaaagatgcgaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 48750158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31984400 - 31984188
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  31984400 taaaaacgtaaagggtaaatctgcgaacaaagtcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttaaaaataatatgataaaacctaagtca 31984301  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||||||| |  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||            ||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31984300 ccgaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgcccaaatcattg------------attgactgatgtcgatatttcaataggaactaaatgaac 31984213  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  31984212 accgcgacaagacacgaaatcaaac 31984188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 98 - 292
Target Start/End: Original strand, 8211827 - 8212020
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat 197  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  8211827 caaaatacctacaaataatatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgacgcc-agatcattggttgaatttgtatt 8211925  T
Q  198 tgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||||||||  ||| ||||||||| || |||| ||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8211926 tgactgatgtagatctttcaatagtaactaaatgaacatcgcgacaagacgtggaatcaaacgccgcacaagacgatgaacaacacaacgccgca 8212020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 244
Target Start/End: Original strand, 35461886 - 35462111
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaat-atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaat 113  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |     |  | |||||| |||   |||    
T  35461886 acatcaaatacaaaacatcactaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatag-----acggacaaaatacctattaat 35461980  T
Q  114 aatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||   ||| |    
T  35461981 aatatgataaaacttaagtcaccgaaatacacatgcttccggatctgcaacgttgacgtccgaatcattggtttaatttgtaattgactgatatagatct 35462080  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaa 244  Q
     |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  35462081 ctcaagaggaaatgaacaaacaccgcgacaa 35462111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 220
Target Start/End: Original strand, 49504435 - 49504633
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||||| |||| |    
T  49504435 atacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctaaaaatattatgtt 49504534  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaata 220  Q
    ||| || || |||||||||  |  |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  49504535 aaaacccaaatcaccgaaacactcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgtttgagtttgtaattgattgatgtagatctttcaata 49504633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39888441 - 39888236
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||| || | |||||||| ||||| || |  ||||||| |  ||| |    
T  39888441 acatcagatacaaacatcactcaaaacgtaaagagtgaatctgcgaataaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgataaaatgcatataaaga 39888342  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | | |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||    
T  39888341 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacctgtgcgctcggatctacaacgtggacgcccaaatcattgattgaagttgtaattgactgaagtcgatctt 39888242  T
Q  215 tcaata 220  Q
    ||||||    
T  39888241 tcaata 39888236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44543512 - 44543250
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  44543512 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 44543413  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||   ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | || ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  44543412 actagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactaaagctgatctttcaatatg-aaccaacgaa 44543314  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| | |||  || ||||||||||   ||||| || ||||| |||||||||| | ||||||    
T  44543313 caccgcaataagatgccaaatcaaacaacgccgcataatacgacgaacaacacaaagtcgcact 44543250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4413373 - 4413210
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||  || ||||||||| ||| ||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  4413373 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaattcacagcactcaatttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata 4413274  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaat 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4413273 atatgataaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 4413210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 282
Target Start/End: Original strand, 51916583 - 51916761
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat 197  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |  |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  51916583 caaaatgcatgcaaata-tatgataaaatctaagtcac-gaaatactcatgcttccgtatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtaat 51916680  T
Q  198 tgactgatgccgatt-tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaaca 282  Q
    |||||||   || || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  51916681 tgactga---cgtttctttcaataggaactaaacga--accgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgactaacaaca 51916761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 11462315 - 11462441
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||    
T  11462315 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaattcctacaaata 11462414  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaat 141  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||    
T  11462415 atatgataaaacttaagtcaccgaaat 11462441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24583190 - 24582937
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  24583190 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 24583091  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  |||     |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  24583090 accagaatattcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatg-aaccaacgaa 24582992  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||   ||||||||| |||  ||||||||||    
T  24582991 caccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaaggcgatgaacaacacaa 24582937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45789747 - 45789615
Alignment:
Q  68 cacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgtt 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| || |||||| ||||||| ||||||     
T  45789747 cacaacacccaagttaatagcatacaatgacaaaattcctacaaataatataataaattctaagtcaaagaaatgcacatgcttccggatctacaacgtc 45789648  T
Q  168 gacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattga 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45789647 gacgcccaaatcattgattgaatctgtaattga 45789615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49627153 - 49626900
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| |||||| |  |||| ||    
T  49627153 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataagatgatataatctaaatc 49627054  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    | |  ||| |   |||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  49627053 atcagaatactcttgcttctgcatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattgactgaagctgatctttcaatatg-aaccaacgaa 49626955  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| |||||  |  ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  49626954 caccgcaacaagatgtcaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 49626900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Original strand, 15431499 - 15431689
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||| ||| ||||| || |  |||||| || ||||||    
T  15431499 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtgaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata 15431598  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaat-tcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgat 205  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15431599 atatgataaaatctatgtcactgaaatatca-atgctgccagatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattggctgat 15431689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 940460 - 940343
Alignment:
Q  176 aatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgact 275  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||     
T  940460 aatcattggttga-tttgtaattgacagatgtatatatttcaataggaattaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcacaagacgaca 940362  T
Q  276 aacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  940361 aacaacacaacaccgcact 940343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Original strand, 19596304 - 19596402
Alignment:
Q  26 aaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19596304 aaatatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcgtagcatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 19596402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16263100 - 16262875
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||  |||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||  |||| |||    
T  16263100 taaacacgtcaatggtgaatctgctaacaaactcacaacactcatgttaatagcataaaacggcaaaatgcatacgaataacatgataaaatctaaatca 16263001  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
     |  ||| |  |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||||  |  |||||||||||| |||  ||||||||    
T  16263000 tcagaatactcatgcttccggatctgcaacgttgatgcacaaatcattgattgaatatgtgattgactgcagttgatttttcaatatgaatcaaacgaac 16262901  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  16262900 accacaacaagacgcgaaatcaaaca 16262875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18939555 - 18939389
Alignment:
Q  39 aacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaa-tgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||| |  | |||||||||| ||||| || | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||     
T  18939555 aacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcaaattatccaagttaatagcatacaacgacaaaaatgcctgcaaataatttgataaattctaagtcacca 18939456  T
Q  138 aaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |||| || |||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  18939455 aaatacacatgcttccagatctgcaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatctgtaattgactga 18939389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31317975 - 31317821
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||  || |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  31317975 taaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacatcacccaagttaataggatgcaacgataaaatgcctacaaataatatgataaattctaaatca 31317876  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaa 189  Q
    |||||||    |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31317875 ccgaaatatccatgcttccgggtctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 31317821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21687637 - 21687521
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  21687637 acatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaaaggtgaatctgctaacaaactcacaacacccaaattaatagcataaaacgagaaaatgcctacaaata 21687538  T
Q  115 atatgataaatcctaag 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21687537 atatgataaaacctaag 21687521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 34412937 - 34413209
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  34412937 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaaccgcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 34413036  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||||||| |||| |||  || ||| ||||||||  ||      
T  34413037 ctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctacaacgttgacgtcc--attattgattgaatttgtgattgtctggagctgatctttcaatacaaatc 34413134  T
Q  227 aaacgaacaccgc----gacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||||     | |||  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  34413135 aaacgaacaccgcacaacaaaagatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaatgtcgcact 34413209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 37720004 - 37720204
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||   |  | ||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||    
T  37720004 aaaacgtaaaaggtgaatttgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacagaaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaataacc 37720103  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
      ||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||| |  ||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  37720104 agaatacccatgcttttggatctgcaacgttgacgcccaaatcattaaatgaatttgtgattgtctgaagttgatctttcaatacgaaccaaacgaacac 37720203  T
Q  237 c 237  Q
    |    
T  37720204 c 37720204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 50377417 - 50377312
Alignment:
Q  185 ttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || || ||||| |||||||||    
T  50377417 ttgactttgtaattgactgatgtcgatctttcaatagggactaaacgtacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccacaaaaaacgacgaacaacaca 50377318  T
Q  285 acgccg 290  Q
    ||||||    
T  50377317 acgccg 50377312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24583386 - 24583298
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24583386 ctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 24583298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16162066 - 16161811
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||     
T  16162066 aaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcag 16161967  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaaca 235  Q
    |  ||| |  ||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | || ||| |||||||| |||  |||||||||    
T  16161966 cagaatacccatgctt----------aacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtcttaagctgatctttcaatacgaaccaaacgaaca 16161877  T
Q  236 ccgc----gacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||     | |||  | |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16161876 ccgcacaacaaaagatgtgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 16161811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Original strand, 51373698 - 51373817
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||| |||||  | | |||||||||| |||||||||||||    
T  51373698 atacaaacatcgataaaaacgtaaagggtgaatctccaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgacgacaaaatgcctacaaataatatgat 51373797  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaat 141  Q
    |||   ||||||||||||||    
T  51373798 aaaatataagtcaccgaaat 51373817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 282
Target Start/End: Original strand, 11462462 - 11462548
Alignment:
Q  196 attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaaca 282  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11462462 attgactgatgtagatcttccaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaca 11462548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19061149 - 19061061
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19061149 ctaaaaacataaaagatgaatgtgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgata 19061061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 25406116 - 25406207
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  25406116 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 25406207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Original strand, 15434893 - 15434987
Alignment:
Q  200 actgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  15434893 actgatgtcgatctttcaagaggaattaaatgaacatcacgacaagacgcaaaatcaaacgccgcacaagacaacgaacaacagaacgccgcact 15434987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12635410 - 12635148
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||| || |||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||   ||| ||    
T  12635410 ctaaaaacataaaaggtgaatctccgaacaaactaacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccttaaaaaaatatgataaaatataaatc 12635311  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
     ||  ||| |  ||||||   ||| |  || | |||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||| | |  ||| |||||||| |||  ||| |||    
T  12635310 gccagaatacccatgcttcgtgatatgaaaggctgacgtgcaaatcattgattgaatttgtgatttactaaagttgatctttcaatatgaaccaaatgaa 12635211  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcac 293  Q
    |||| | ||||  ||  ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12635210 caccactacaaaacgtaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcac 12635148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 32679009 - 32679160
Alignment:
Q  50 tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgc 149  Q
    ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||  |||| |||||  ||| |  ||||    
T  32679009 tgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatggcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcaccataatactcatgc 32679108  T
Q  150 tttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgac 201  Q
    || ||||| | ||| |||| || ||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  32679109 ttccggatttgcaatgttggcgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgac 32679160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 178
Target Start/End: Original strand, 45425891 - 45426044
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaat 125  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || | ||||||| |||| | ||||||||||     
T  45425891 aatatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaa 45425990  T
Q  126 cctaagtcaccgaa--attcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaat 178  Q
       |||| ||||||  ||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45425991 ttaaagtgaccgaaatattcat-ggccttcggatctgcaacgttgacgctcaaat 45426044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Original strand, 24597288 - 24597346
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24597288 atgcttccggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttataattgactga 24597346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 236
Target Start/End: Original strand, 32873713 - 32873918
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  || |||||   || || ||||| ||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||  | |    
T  32873713 atcactaaaaacacaaaag-tgaatctgcgaacaaattcacaatgccaaaattaatagcatacaatgacaatatgtctacaaataatatgataaaatcaa 32873811  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaa 229  Q
    ||| | |||||| |  ||| ||  |||||| |||| |||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||| | || |  ||||||||||| ||||    
T  32873812 agtgatcgaaatacccatgtttctggatctgcaacattgacgcttaaatcattgattaaatgtgtaattgactgaagtcggtcattcaataggaactaaa 32873911  T
Q  230 cgaacac 236  Q
    |||||||    
T  32873912 cgaacac 32873918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 36894262 - 36894359
Alignment:
Q  175 aaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaac-accgcacaagac 271  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||| ||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  36894262 aaattattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaagaggaactgaacaaaccccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgcccgcacaagac 36894359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20266553 - 20266481
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatg 104  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  20266553 cactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaattgcatataacggcataatg 20266481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41994540 - 41994406
Alignment:
Q  161 caacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||  | ||| |||||||| |||  ||||||||||| | |||||   ||||||||||||    
T  41994540 caacgttgacgtccaaatcattgattaaatatttgattgactgaaactgatctttcaatatgaacgaaacgaacaccacaacaagatccgaaatcaaaca 41994441  T
Q  261 ---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
       | |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41994440 acgctgcacaagacgatgaacaacacaacgccgca 41994406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 50377582 - 50377458
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||  | || ||||||||| || | |    
T  50377582 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaaattgcgaacaaactctcagcacccaagttaataacatacgacggaaaaatgcctacagaca 50377483  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaa 139  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  50377482 atatgataaaatctaagtcaccgaa 50377458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 13075501 - 13075667
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||  |||||| || || ||||| || ||  |||||| | ||||||||||||||||      
T  13075501 aatatcgctaaaaaagtaaagggtgaatctgcgaaaaatctcacaaaacccaa-tttatagcatacaaagggtaaatgcttacaaataatatgataaaat 13075599  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgt 194  Q
    |||| ||||   ||| |  |||  ||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||    
T  13075600 ctaaatcactagaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgcctcctaaatcattgattgaatttgt 13075667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 51872112 - 51872021
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || | || ||||||| |||| | ||||||||||    
T  51872112 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaa 51872021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 19715727 - 19715805
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||    
T  19715727 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 19715805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5701508 - 5701435
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  5701508 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcct 5701435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 7342971 - 7342914
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7342971 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 7342914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19723564 - 19723511
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaat 85  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  19723564 cactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaat 19723511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26535496 - 26535403
Alignment:
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaata 220  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| | ||||  |||| ||||||||    
T  26535496 ctaagtcaccggaatactcatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaatcattgatttaaattgtaatttattgatttcgatctttcaata 26535403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27456723 - 27456654
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatg 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  27456723 taaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatg 27456654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 32676965 - 32677018
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaat 85  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  32676965 cactaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaat 32677018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Original strand, 51373819 - 51373871
Alignment:
Q  192 tgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaa 244  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  51373819 tgtaattgactgaagacgatttttcaatatgaactaaacgaataccgcgacaa 51373871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 9687037 - 9687128
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || | || ||||||| |||| | ||||||||||    
T  9687037 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaa 9687128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 50165931 - 50166022
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  50165931 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 50166022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 51868477 - 51868568
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||  |||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  51868477 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 51868568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25564126 - 25564068
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  25564126 atgcttccagatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatctgtgattgactga 25564068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Original strand, 39927547 - 39927627
Alignment:
Q  207 ccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||   || ||||||||||| |||||||||    
T  39927547 ccgatctttcaatatgaaacaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaacaca 39927627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 50148619 - 50148541
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||    
T  50148619 ctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaacaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 50148541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1602216 - 1602104
Alignment:
Q  147 tgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagt 246  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||| ||  |||||||| |||| |||||     
T  1602216 tgcttccggatatgcaacattgatgcctaaatcattgattgaaattgtaattgact-aagtcgatctttcaatagaaatcaaacgaacgccgcaacaaga 1602118  T
Q  247 cgcgaaatcaaaca 260  Q
     || ||||||||||    
T  1602117 tgcaaaatcaaaca 1602104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11454186 - 11454129
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  11454186 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 11454129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 281
Target Start/End: Original strand, 31692434 - 31692568
Alignment:
Q  149 ctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcg 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||  | ||||||||| || ||||||| ||||||| | ||  || |||||||| | ||  |||||||||||| |||||  |    
T  31692434 ctttcggatctacaacattgacatcgaaatcattgattaaatttgttattgactaaagctaatctttcaatatg-aaccaacgaacaccgcaacaagaag 31692532  T
Q  249 cgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaac 281  Q
    | ||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  31692533 caaaatcaaacaacaccgcacaagacgacaaacaac 31692568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 14726294 - 14726573
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||||||| ||||||    
T  14726294 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatattataaaacgacaaaatgcctacaaata 14726393  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  14726394 atatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtgattgactgatgccgatctt 14726493  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14726494 tcaataagaaataaactaacaccgtgacaagacgcgaaatcaaacatcgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 14726573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35851050 - 35850782
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  35851050 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatttgtgaacaaactca--gcacccaagttaatagcataaaacggcaaagtgcctgcaaataat 35850953  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35850952 atgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttctggatcttcaacgttgacgcacaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttc 35850853  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35850852 aataggaaataaacaaacaccgcgataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 35850782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 38007612 - 38007355
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38007612 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaa-ggcaaaatgcctacaaata 38007514  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38007513 atatgataaaacctaattcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgtccaaatcattggttaaatttgtaattgactgatgccgatctt 38007414  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacga 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||    
T  38007413 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaacacgaaatcaaacgccgcacaagacga 38007355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13007484 - 13007205
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  13007484 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 13007385  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  13007384 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 13007285  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13007284 tcaagaggaactaaacaaacaccgcgacaaaacacaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 13007205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38598052 - 38597773
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  38598052 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 38597953  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  38597952 atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 38597853  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38597852 tcaataggaactgaacaaacaccacgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 38597773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 11976768 - 11977047
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||    
T  11976768 acatcagatgcaaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacataaaacgggaaaatgcctacaaata 11976867  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11976868 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccagatcttcaacgttcacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctc 11976967  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  11976968 tcaatagaaaataaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgtacaagacgacgaacaatacaacgccacact 11977047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 9113558 - 9113837
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||    
T  9113558 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcagaacacccaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctacaaata 9113657  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  9113658 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 9113757  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  9113758 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacagaacgccgcact 9113837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 24229617 - 24229896
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  24229617 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 24229716  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||    |||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  24229717 atatgataaaacctaagtcacagaaatatccatgctaccggatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 24229816  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24229817 tcaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcacacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 24229896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 6011971 - 6012250
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||||||    
T  6011971 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcataaaacggtagaatgcctacaaata 6012070  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||| || | |||||||| ||||| |  |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  6012071 atatgatcaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctacaacattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 6012170  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6012171 ttaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 6012250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34945648 - 34945389
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||  |||||    
T  34945648 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctataaata 34945549  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  34945548 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 34945449  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgac 274  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34945448 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaatgccgcacaagacgac 34945389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25980402 - 25980134
Alignment:
Q  25 caaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25980402 caaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaataatatgataaa 25980303  T
Q  125 tcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaa 224  Q
     | |||||||| ||||| |  |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  25980302 acttaagtcac-gaaatacccatgcttccgaatctgcaactttgacgcccaaatcattggttgaatttgtagttgactgatgttgatctttcaataggaa 25980204  T
Q  225 ataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  25980203 ctaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaattaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaataccgcact 25980134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26825683 - 26825406
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  26825683 atcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 26825584  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    |||||||| | ||||||||||||||  | ||||||  |||||| ||||||   ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  26825583 atgataaaacttaagtcaccgaaataaacatgcttatggatctgcaacgtaatcgtacaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttc 26825484  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26825483 aagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagaagacgaacaacacaacgccgcact 26825406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 8096338 - 8096609
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8096338 atacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaataatatgat 8096437  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| ||||| |||| ||||| || |||  | ||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  8096438 aaaacctaaatcactgaaat-cacatggctccggttctgcaatgttgacgctcaaatcattggttgaaattgtaattgattgatgccaatctttcaatag 8096536  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  8096537 gaactaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgccgctcaaaacaacgaacaacacaacgccgcact 8096609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13422188 - 13421917
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||    
T  13422188 acatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacatata 13422089  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| || ||||||  | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13422088 atatgataaaatataagtcaccgaaatacacatgcttcagaatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 13421989  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13421988 tcaataggaactaaatgaacacaacgacaatacgcgaaatcaaataccgcacaagacgacgaacaacacaac 13421917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10723016 - 10722737
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||  |||| |  || ||||||||| ||||||    
T  10723016 acatcaaatacaaatatcgctaaaaatgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaataacatacagcggaaaaatgcctacaaata 10722917  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||| ||    
T  10722916 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttttggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttttaaatgactgaagtcgatctt 10722817  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  10722816 tcaataggaactaaacgaacaccgagataagacacaaaatcaaacgccgcacaagacgacaaacaggacaacgtcgcact 10722737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6217152 - 6216877
Alignment:
Q  16 catcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggca-aaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |  |||||||| ||||||    
T  6217152 catcaaatacaaacgtcactaaaaacgcaaa-ggtgaatctgcgaacaaactcacagcactcaagttaatagcatacaatgacttaaatgcctacaaata 6217054  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  6217053 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtagatctt 6216954  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||  |  ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6216953 tcaatagaaactaaacaaacactgcgacaagatg-taaatcaaatgccgcacaagacgacgaacaacataacgccgca 6216877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Original strand, 31391614 - 31391865
Alignment:
Q  43 taaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaatt 142  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||  | ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  31391614 taaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacatataatatgataaaacctaagtcaccgaaata 31391713  T
Q  143 catatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |  || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| |||||    
T  31391714 ctcatccttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctttcaataaaaactaaacaaacactgcgac 31391813  T
Q  243 aagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||  |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  31391814 aagatgcgaaatcaaatgccgcacaagacgaagaacaacacaacgtcgcact 31391865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7930383 - 7930153
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |  |||||| ||||||| |||    
T  7930383 aactcacagcatccaggttaatggtatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagaaacctaaatactcatgcttccggatctgcaa 7930284  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||  ||    
T  7930283 cattgacgctcaaatcattggttgaatttgtaattgactgacgtcgatctttccataggaactaaacaaacactgcgaccagatgcgaaatcaaacgacg 7930184  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7930183 cacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 7930153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41630708 - 41630478
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||  |||| | |||    
T  41630708 aactcacaacacctaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaagtcacggaaatacacatgcttctggatgtgcaa 41630609  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||    
T  41630608 cgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgaagtcgatcttttaataggaactaaacgaacaccgtgacaagacgcgaagtcaaacgtcg 41630509  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  41630508 tacaagatgacaaacaacaaaacaccgcact 41630478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 294
Target Start/End: Original strand, 11073864 - 11074012
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  11073864 atgctttcggatctgtaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatatttcaataggaactgaacaaacaccgcgacaag 11073963  T
Q  246 tcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  11073964 acgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaaacaacgctgcact 11074012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 26877962 - 26878185
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  26877962 taaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatag-atacaacgacaaagtgcctacaaataatatgataaaatctaagtca 26878060  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    || |||| |  ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||    
T  26878061 ccaaaatacccatgcttctggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatatctaattgactgatgtcgatctttcaagagaaattaaacgaac 26878160  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  26878161 accgcgacaagacacgaaatcaaac 26878185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 28540751 - 28541025
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| || ||||||||||||| ||      
T  28540751 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggaaaaatgtctacaaataatatgatgaaat 28540850  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| ||||| |||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||      
T  28540851 ctaaatcaccaaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctaatctttcaatacgaacc 28540950  T
Q  227 aaacgaacac--cgcgacaa--gtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||  | | ||||  |  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28540951 aaacgaacaccacacaacaaatgatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcact 28541025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7036443 - 7036197
Alignment:
Q  45 aaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattca 144  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| | || |||| ||||| ||||| ||  ||||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||  |||||| |     
T  7036443 aaaggtgaatctgcaaacaaactcaaa-caaccaatttaatagcatacaacagcaaaattcctacaaacaatatgataaaatctaagtcctcgaaatacc 7036345  T
Q  145 tatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaa 244  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||| ||| || | ||| ||||||||||||  |||||    
T  7036344 catgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcatagattcaatttgtaattgacttatgtcgatcttttaacatgaactaaacgaacaccatgacaa 7036245  T
Q  245 gtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  7036244 gacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgaccactaacaccacgccgca 7036197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14211470 - 14211196
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||| ||      
T  14211470 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 14211371  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  14211370 ctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgcatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaacc 14211271  T
Q  227 aaacgaacaccg--cgacaa--gtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||  | ||||  |  |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  14211270 aaacgaacaccgcacaacaaaggatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaatgtcgcact 14211196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19121145 - 19120886
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||  |||| ||  |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19121145 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatatcatacaagagcaaaacgtctacaaataatatgataaaacctaagtcacc 19121046  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
    |||||    ||| ||   ||||| || |||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||| || ||| || ||| |||||| |||| |||||    
T  19121045 gaaatattcatgtttctagatctgcagcgttgacgcttaagtcattgatagaatttgtaattgactgaagctgatctt-caaaaggaaacaaacaaacac 19120947  T
Q  237 cgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19120946 cgcaacaagacgcgaaatcaaacaatgcctcataagacgacgaacaacacaacgccgcact 19120886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 8088064 - 8088326
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  8088064 ctaaaaaggtaaaagatgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaaaggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 8088163  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  8088164 accagaatactcttgtttttggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcaatatg-aaccaacgaa 8088262  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| || |||||  || ||||||||||   |||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  8088263 cactgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaagacgataaacaacacaaggtcgcact 8088326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 14082229 - 14082414
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || || | |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  14082229 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcccatcatcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 14082328  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattga 200  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14082329 atatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttggttggatttgtaattga 14082414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 19103312 - 19103586
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||||  |||||||||||| ||      
T  19103312 aatatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcatagcaccaaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctataaataatatgatgaaat 19103411  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||| ||| |  ||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||  || |||| ||| |||      
T  19103412 ctaaatcaccggaatactcatgcttctggatctgcaatattgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctaatctttcgatacgaatc 19103511  T
Q  227 aaacgaacaccg--cgacaa--gtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||  | ||||  |  | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19103512 aaacgaacaccgcacaacaaatgatgtgaaatcaaacaacgccgcacaagacgactaacaacacaacgtcgcact 19103586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11867753 - 11867652
Alignment:
Q  185 ttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11867753 ttgaatttgtaattgactgatgtcgatcttttaataggaactaaacgaacaatgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgtacaagacgactaacaacaca 11867654  T
Q  285 ac 286  Q
    ||    
T  11867653 ac 11867652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 2979151 - 2979363
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| ||      
T  2979151 aatatcgctaaaaatgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcacaatgcctacaaataatatgatgaaat 2979250  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||| ||| |||| |||      
T  2979251 ctaaatcaccagaatacccgtgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatcttttaatacgaacc 2979350  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||||||||||||    
T  2979351 aaacgaacaccgc 2979363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 37985965 - 37986225
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| ||||| || | ||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  37985965 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcaaacaaactcacatcattcaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaataatgtgataaattctaagtc 37986064  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||  |||| | |||  ||  ||| ||  ||| | ||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||  | |  ||| |||||||| |||  |||||||    
T  37986065 actaaaatacctataattctggacctgtaacttcgacactcaaatcattgattgaatctgtaaatgacaaaagttgatctttcaataagaatcaaacgaa 37986164  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37986165 cgccgcaacaagatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgatgaacaacacaacgccgcact 37986225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15571741 - 15571497
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaa-tggcaaaatgccttcaaat 113  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |   ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||  ||||    
T  15571741 acatcagatataaacatcactaaaa-cgtaaaggacaaatctacgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaactggaaaaatgtctataaat 15571643  T
Q  114 aatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    |||||||||||   |||||||| ||| | |  |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| | | |||| |    
T  15571642 aatatgataaaatttaagtcactgaactactcatgcttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattgattgaatttgtagtttactaaagtcgatct 15571543  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    |||||||| || |||||||||| | ||||||| |  ||||||||||    
T  15571542 ttcaatagtaactaaacgaacatctcgacaagccatgaaatcaaac 15571497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1409755 - 1409524
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaa--gttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||  |||  || ||||| || ||||  |||||| || || || ||||||||  |||||||    
T  1409755 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaaagctgaatctatgaataaattcacaccatccaaaagttaatagcgtacaacggcaaaatatcttcaaa 1409656  T
Q  113 taatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatt 212  Q
    ||||||||| ||  |||||||||  ||||    ||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  1409655 taatatgattaaatctaagtcactaaaatattcatgttttcggatctgcaacattgacgcataaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcgatc 1409556  T
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaa 244  Q
    ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  1409555 ttttaatatgaactaaacgaacatcgcgacaa 1409524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 10332399 - 10332656
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat-aaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||| |||||||| |||||  || |    
T  10332399 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataaagacaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaaat 10332498  T
Q  133 caccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacga 232  Q
    || |  ||| |  |||||| ||||||| ||||||||  | | ||||||| | | |||| ||| |||||||||  |  || |||||||| |||  |||| |    
T  10332499 catcagaatactcatgcttccggatctgcaacgttggtgtctaaatcatcgatcgaatatgtgattgactgagcctaatctttcaatatgaatcaaacaa 10332598  T
Q  233 acaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10332599 acactgcaacaagacgcgaaatcaaacaatgccgcacaagacgacaaacaacacaacg 10332656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39567513 - 39567321
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||  |||| || | ||||||| || ||||||||||||| ||      
T  39567513 aatatcactaaaaacgtatatggtgaatctacgaacaaactcacaacacccaaggtaataacatacaacgacaaaatgtctacaaataatatgatgaaat 39567414  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaat 219  Q
    |||| |||||  ||| |  ||| ||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||    
T  39567413 ctaaatcaccagaatacccatgtttctggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaat 39567321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Original strand, 35920848 - 35921074
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||  || | ||| |||| || ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  | || ||    
T  35920848 ctaaaaacataaagtgtgaatctgcaaacaaatttacaacaccaaatttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcaaaatc 35920947  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||   |||    |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||| |||    ||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  35920948 actagaatatcgatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgattgaatctgtgattgattgaatttgatcttttaataggaaacaaatgaa 35921047  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35921048 caccgcaacaagacgcgaaatcaaaca 35921074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 236
Target Start/End: Original strand, 9590945 - 9591025
Alignment:
Q  156 atcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
    |||| ||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  9590945 atctacaacgttaacactcaaattattgattgaatttgtaattgacttatgccgatatttcaataagaactaaacgaacac 9591025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7242031 - 7241940
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  7242031 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 7241940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7247206 - 7247115
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  7247206 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 7247115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 294
Target Start/End: Original strand, 14082417 - 14082485
Alignment:
Q  226 taaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14082417 taaatgaacaccgcgacaagatacgaaatcaaacgccgtacaagacgacgaacaacacaacgccacact 14082485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 41184272 - 41184344
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcc 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  41184272 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcc 41184344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 27752172 - 27752081
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||| | ||||||||||    
T  27752172 ctaaaaacgtaaaagatgaatctacgaacatactcacagcatccaagttaatagcatataatggtataatgcctacaaaaatatatgataaa 27752081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 27266691 - 27266748
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27266691 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 27266748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41749532 - 41749336
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||  |||||||||||||  | ||| || | ||| ||||||||| || ||||  ||    
T  41749532 aactcataacacccaagttaattgcatacaatgacaaaatgtctacatttaatatgataaattatgagtgactggaatacatatgcttccgaatctagaa 41749433  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
     |  |||| | ||||||||| |||||| || |||||| ||| |  | | | ||||||||||  |||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  41749432 tgccgacgtctaaatcattgattgaatctggaattgattgaagttggtctctcaataggaatcaaacgaacactgcaacaagatgtgaaatcaaaca 41749336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 19259644 - 19259735
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    |||||||||||||   | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  19259644 ctaaaaacgtaaagaataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 19259735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43148974 - 43148883
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  43148974 ctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 43148883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 7886771 - 7886861
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| ||||| ||  | | ||||||| |||| |||||||||||    
T  7886771 ctaagaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacagaataatgcctacaaaaaatatgataaa 7886861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16758636 - 16758521
Alignment:
Q  174 caaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatca---aacaccgcacaaga 270  Q
    |||||||||| |||||| | | |||||||||  | |||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||  ||||||||||   || |||||||| ||    
T  16758636 caaatcattgattgaatctatgattgactgacacagatttttcaatatgaaccaaacgaacaccgtaacaaaacgcgaaatcaaataagaccgcacacga 16758537  T
Q  271 cgactaacaacacaac 286  Q
    |||  |||||||||||    
T  16758536 cgataaacaacacaac 16758521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1600 - 1321
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1600 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 1501  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1500 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgcttctagaactgcaacgttgacgcccaaattattggtcgaatttgtaattgactgatgccgatctt 1401  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1400 tcaataggaactaaacgaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 1321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 25190896 - 25191171
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  25190896 acatcagatacaaacattgctaaaatcgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaatagaaaaatgcctacaaata 25190995  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaa--atcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatt 212  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||     
T  25190996 atatgataaaacctaagtcatcgcaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatatcattggttgaattcataattgactgatgctgatc 25191095  T
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgc 288  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25191096 tttcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaaagcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgc 25191171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Original strand, 45445642 - 45445914
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||    
T  45445642 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaaatgcctacaaata 45445741  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45445742 atatgataaaatctaagtcaccaaaattcacatgcttccggattttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgccgatctt 45445841  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45445842 tcaataggaaataaacaaacaccgcgacaaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacg 45445914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 7883072 - 7883351
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||    
T  7883072 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaata 7883171  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||    
T  7883172 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgctgacgtccaaattattgcttgaatttgtaattgattaatgtagatctt 7883271  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7883272 tcaatatgaactgaacaaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 7883351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23230901 - 23230622
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  23230901 acatcagatacaaacatcgctaaaagtgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 23230802  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  23230801 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 23230702  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  23230701 ccaataggaactaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcgccgcact 23230622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10377933 - 10377668
Alignment:
Q  29 tatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcct 128  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  10377933 tatcgctaaaaacgtgaatggtgaatctgcgagcaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaactt 10377834  T
Q  129 aagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataa 228  Q
    ||||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||| | |    
T  10377833 aagtcgccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttataattgactgatgtagatctttcaataggaactga 10377734  T
Q  229 acgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10377733 acaaacaccacgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacggcgaacaacacaacgccgcact 10377668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37971521 - 37971262
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  37971521 taaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatgtgataaaacctaagtca 37971422  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | ||| |||    
T  37971421 ccgaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctttcaataggaactgaacaaac 37971322  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| ||| ||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37971321 accacgaaaaaaagcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 37971262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 7677121 - 7677391
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  7677121 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgtgaacaaagtcacagcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcttacaaataatatgat 7677220  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| ||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  7677221 aaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattggtcgaatctgtaattgactgatgttgatatttcagtag 7677320  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7677321 gaaccaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaatgcagcacaagacgacgaacaacacaacgccgca 7677391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 259
Target Start/End: Original strand, 33214521 - 33214746
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  33214521 ctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactaacagcaccaaagttaatagcataaaacggcaaaatgtctaaaaataatatgataaaacataagtc 33214620  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||    
T  33214621 atcgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgacgccgatctttcaataggaactaaaagaa 33214720  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  33214721 caccacgacaagacgcgaaatcaaac 33214746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3673680 - 3673420
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||    
T  3673680 ctaaaaacgtaaagggtgaaactgcaaacaaactcacagcatccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgattaaacttaagtc 3673581  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    || ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  3673580 actgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaagcattgatttgatttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaaggaa 3673481  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3673480 caccgcaacaagacacgaaatcaaacaccgcataagacgacgaacaacacaacaccgcact 3673420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Original strand, 31013439 - 31013690
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  31013439 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 31013538  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  31013539 atatgataaaacttaagtcactgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttttaattgactgatgtagatatt 31013638  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcac 266  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  31013639 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaacgccgcac 31013690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 16928588 - 16928794
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16928588 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 16928687  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16928688 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccacgctttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 16928787  T
Q  215 tcaatag 221  Q
    |||||||    
T  16928788 tcaatag 16928794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Original strand, 20553134 - 20553351
Alignment:
Q  77 caagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaa 176  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  20553134 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20553233  T
Q  177 atcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacta 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  20553234 atcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacacaaaatcaaacgccgcataagacgacga 20553333  T
Q  277 acaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| |||||||||||    
T  20553334 acaacaaaacgccgcact 20553351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 294
Target Start/End: Original strand, 16247112 - 16247333
Alignment:
Q  73 cacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgc 172  Q
    ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |  |||||| ||||||| |||| |||| ||    
T  16247112 cacccgagttaatagcatacaacggcaaaatgccttcaaataatatgatcaaatctaagtcagcgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgatgc 16247211  T
Q  173 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacg 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  16247212 ccaaatcattgattgaatttgtaattaattgatgtcgatctttccataggaactaaacgaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgtcgcacaagacg 16247311  T
Q  273 actaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  16247312 atgaacaacacaacgccgcact 16247333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 27110296 - 27110569
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || |  |||||| || ||||||    
T  27110296 acatcagatacaaacatcactaaaaatgcaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata 27110395  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||| || |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | || ||    
T  27110396 atatgataaaatctaagtcactaaaatacacatgcttccagatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtagttgtctgatgtcaatctt 27110495  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgc 288  Q
    |||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  27110496 tcaacatgaactaaacgaacactgcgacaagacgcaaaatcaaacgccacacaagacgactaccaacacaacgc 27110569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 17693444 - 17693724
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggc-aaaatgccttcaaat 113  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||| |||   |||||||| || ||||||||||  |||| ||   | ||||||||| |||||    
T  17693444 acatcaaatacaaacatcgctaaaaatgtaaagagtgaatctacgaccaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaaatgcctacaaat 17693543  T
Q  114 aatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17693544 aatatgataaaacataagtcatcgaaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 17693643  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  17693644 tttaataggaactaaacaaacaccgcgacaaaacgcaaaatcaaacgccgcacaagaagacgaacaatacaacaccgcact 17693724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 30568152 - 30568335
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30568152 acatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 30568251  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaatt 198  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30568252 acatgataaaacctaagtcatcgaaattcacatgcttcaagatcttcaacgttgacgctcaaatcattggttgaatttgtaatt 30568335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 40211131 - 40211407
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacg--taaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| ||||| || |||| ||||| | ||||    
T  40211131 acatcagatataaacatcgctaaaaacgcgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacatcacccagattaatagcatacaacggcataatgcttacaaa 40211230  T
Q  113 taatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatt 212  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||     
T  40211231 taatatgataaaatccaagtcaacgaaatactcatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattggtggaatttgtaatcgactgatgtagatc 40211330  T
Q  213 tttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgcc 289  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40211331 tttcaatagaaactaaacaaacaccgcgacaatacgcgaaatcaaacactgcataagacgacgaacaacacaacgcc 40211407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 292
Target Start/End: Original strand, 14544726 - 14545011
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaa--- 111  Q
    |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| ||  |||||||| || |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||       
T  14544726 acatcagatagaaacatcgctaaaaacgtaatggatgaatctgcaaacaaactcacaccatccaagttaatagcaaacaacggcaaaatgcctacaagac 14544825  T
Q  112 -----ataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatg 206  Q
         |||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| |||||    
T  14544826 tacaaataatatgataaaatttaagtcaccgaaattcccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaataattgatttaacttgtaattgattgatg 14544925  T
Q  207 ccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14544926 tcgatctttcaataggaactaaatgaacaccgcgacaagacgtgaaatcaaacgccacacaagacgactaacaaaacaacgccgca 14545011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28897947 - 28897690
Alignment:
Q  33 actaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  28897947 actaaaaacataaaagat--atctgcgaacaaactcacaacacccacgttaatagcatagaatgacaaaatgactacaaataatatgataaaatctaagt 28897850  T
Q  133 caccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacga 232  Q
    || |||||||   || ||| || |||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  28897849 catcgaaatttcaatacttccgtatctgcaacgtttacgcccaaatcattaattgaacttataattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaacga 28897750  T
Q  233 acaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgca 292  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  28897749 acaccacgacaagacgcgaaatcaaacgccacacacgatgactaacaacacaacgtcgca 28897690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 287
Target Start/End: Original strand, 20559637 - 20559847
Alignment:
Q  77 caagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaa 176  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  20559637 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20559736  T
Q  177 atcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacta 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||||||| |    
T  20559737 atcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgccaagacacaaaatcaaaggccgcacaagacgacga 20559836  T
Q  277 acaacacaacg 287  Q
    |||||| ||||    
T  20559837 acaacaaaacg 20559847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 287
Target Start/End: Original strand, 20571199 - 20571409
Alignment:
Q  77 caagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaa 176  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  20571199 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20571298  T
Q  177 atcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgacta 276  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||||||| |    
T  20571299 atcattgcttgaatttgtaattgattgatatagatctttcaataggaactgaacaaacaccgcgccaagacacaaaatcaaaggccgcacaagacgacga 20571398  T
Q  277 acaacacaacg 287  Q
    |||||| ||||    
T  20571399 acaacaaaacg 20571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Original strand, 9637240 - 9637511
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||| | ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||  |||||    
T  9637240 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtgaaactacgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaaaaata 9637339  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |  ||| || || |||| |||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||| |||||||  ||| ||    
T  9637340 atatgataaaacctaagttaccgaaatactcatgtttccgaatctgcaacgttgacgctcaaatcattaattgtgtttgtaattaactgatgttgatctt 9637439  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    |||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||    
T  9637440 tcaataggaactaaacgaatactgcaataagacgcgaaatcaaatgtcgtacaagacgacgaacaacacaac 9637511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 286
Target Start/End: Original strand, 24186492 - 24186762
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| | |||| |||||||| | |||  | ||||||||||||  |||||    
T  24186492 acatcatatacaaacatcgataaaaacgtaaaagatgaatctgctaacaaactcataacacctaagttaatagtatacgacggcaaaatgcctataaata 24186591  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | | | |    
T  24186592 atatgataaaatttaagtcactgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaacttataattgactgatgtc-aatct 24186690  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  24186691 tcaataggaactaaacgaacatcacgacaaaacgcgaaatcaaatgccacacaagacaactaacaacacaac 24186762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 40618904 - 40619183
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||  |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||| | || |||    
T  40618904 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaattgtagatctgcgaacaaacgcacaacccccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacacata 40619003  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||   ||||||  |||||| |  ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  40619004 atatgataaaatttaagtctgcgaaatactcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaatttgtaattgactattgtcgatctt 40619103  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40619104 tgaataagaactaaatgaacaccgcgataagacacgaaatcaaacgtcacacaagacgacaaacaacacaacgccgcact 40619183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Original strand, 33347371 - 33347610
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  33347371 ctaaaaaggtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacacctaatttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaattctgagtc 33347470  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||||||| |  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||||| |  ||| |||    
T  33347471 accgaaatacccatgctttcggatccgcaacgtcgacgcctaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttgatctttcaatagg-atcaaatgaa 33347569  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgac 274  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||| || |||||||||||    
T  33347570 caccgcaacaagacatgaaatcaaacgccacacaagacgac 33347610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 237
Target Start/End: Original strand, 18890542 - 18890752
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||      
T  18890542 aatatcgctaaaaacggatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 18890641  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| | |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  18890642 ctaaatcaccataatacctatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaacc 18890741  T
Q  227 aaacgaacacc 237  Q
    |||||||||||    
T  18890742 aaacgaacacc 18890752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 288
Target Start/End: Original strand, 36948318 - 36948541
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||  |  ||||| ||  |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |  |||||| ||||| | |||    
T  36948318 aactcacaacacccaagttaatagcctacaacagataaatgtctggaaataatatgataaaatctaag-cgccgaaatactcatgcttccggatttgcaa 36948416  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    | |||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  36948417 cattgcatcctaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtcaatttttcaataggaattaaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccg 36948516  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgc 288  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  36948517 cacaggacgacaaacaacacaacgc 36948541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 28086643 - 28086923
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | ||||| || |||  |||||| || ||  |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  28086643 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtagatgatgaatatgtgaacaaactcatagtacttaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 28086742  T
Q  115 atatgataaatcctaag-tcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    ||||||||||  ||||  |||| ||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |    
T  28086743 atatgataaaatctaaaatcactgaaataccaatgtttacggatctgcaacgttgacttccaaatcattgattgaatttgtaattaactgaagtcgatct 28086842  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| | ||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  28086843 ttcaacaagaattgaatgaacactgcgacaagacgcgaaatcaaatgctgcacaagatgacgaacaacacaacgcagcact 28086923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42046467 - 42046274
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||      
T  42046467 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgatgtcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 42046368  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaata 220  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||    
T  42046367 ctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaata 42046274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14585923 - 14585715
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| ||      
T  14585923 aatatcgctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaacgcctacaaataatatgatgaaat 14585824  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||   || |  ||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  14585823 ctaaatcaccaggatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcaatgattgaatttgtgattgtctgaagctgatatttcaatacgaacc 14585724  T
Q  227 aaacgaaca 235  Q
    |||||||||    
T  14585723 aaacgaaca 14585715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 1236547 - 1236809
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||| |  |||| ||    
T  1236547 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaatagtatgatataatctaaatc 1236646  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  1236647 accagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccagatcattgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaatatg-aaccaacgaa 1236745  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||| || |||||||||| | ||||||    
T  1236746 caccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacacaaggtcgcact 1236809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 43833839 - 43834016
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  43833839 aatatcgctaaaaaagtaaatggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaa 43833938  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||   ||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  43833939 ctaaatcaccagaatactcatgcttctagatctgcaacgttgacgtctaaatcattgattgaatttgtgattgtctga 43834016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15344547 - 15344294
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  15344547 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 15344448  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  15344447 accagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaacttgatctttcaatatg-aaccaacgaa 15344349  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaa---acaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| |||||  |  |||||||   || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15344348 caccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 15344294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15433612 - 15433359
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  15433612 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 15433513  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  15433512 accagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaacttgatctttcaatatg-aaccaacgaa 15433414  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaa---acaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| |||||  |  |||||||   || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15433413 caccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 15433359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15524916 - 15524663
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||    
T  15524916 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatc 15524817  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |   |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    ||| |||||||| | ||  ||||||    
T  15524816 accagaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaacttgatctttcaatatg-aaccaacgaa 15524718  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaa---acaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||| |||||  |  |||||||   || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15524717 caccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaacacaa 15524663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 29617125 - 29617379
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||  |||||||| ||   |||||||| ||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||    
T  29617125 taaaaacataaagggcgaatctgcgaacaaactcacaacatttaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatca 29617224  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||  |||    ||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  | | |||||||| |||  ||||||||    
T  29617225 ccagaataacaatgtttatggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgaagttggtctttcaataagaaccaaacgaac 29617324  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  29617325 accgcaacaagacgcgaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacacaac 29617379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41896756 - 41896551
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||    
T  41896756 ctaaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatc 41896657  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  ||||||   ||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||  |||||||    
T  41896656 accagaatactcatgcttctagatctgcaacgttgatgcctaaatcattaattgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaaccaaacgaa 41896557  T
Q  234 caccgc 239  Q
    ||||||    
T  41896556 caccgc 41896551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29939537 - 29939369
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcac 135  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||| || | ||||||||  |||| || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29939537 aaaaacataaaagatgaatctacgaacgaagtcacaacatctaagttaatatcatacaacggcaaaatgactacaaataatatgataaaacctaagtcac 29939438  T
Q  136 cgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
     ||||| |  ||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29939437 tgaaatactcatgcttatggatatgcaacgttaacgcccaaatcattggttgaattagtaattgactga 29939369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Original strand, 7198045 - 7198203
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  7198045 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacaacacccaaattaatagcatacaacgacaaaattcctgcaaataatatgataaaatctaaatc 7198144  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaattt 192  Q
    ||| ||||    |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  7198145 accaaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattgaattt 7198203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 285
Target Start/End: Original strand, 27498197 - 27498465
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||  | |||| | |||||||||| ||  |||| || | ||||||| ||  |||||    
T  27498197 acatcagatacaaacatcattaaaatcgtaaagggtgaatctgcaaacaagctcataacacccaagttcataacatataaagacaaaatgtctataaata 27498296  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||| |  ||| || |  |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| |  ||| ||    
T  27498297 atatgataaaatctaaatcactgaaatacc-atgtttccaaatctgcaatgttgacgcccaaatcattaattgaatttgtacta-actgaagttgatctt 27498394  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  27498395 tcaataggaattaaatgaacaccacgacaagacgcgaaatcaaatgtcgcacaagacgacgaacaacacaa 27498465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5333548 - 5333405
Alignment:
Q  154 ggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaa 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| |  ||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||| |||    
T  5333548 ggatctacaacgttgacgcccaaataattgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaataggaaccaaacgaacaccggaacaagacgcaaaa 5333449  T
Q  254 tca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5333448 tcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 5333405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 471014 - 471276
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaa--tgccttcaaataatatgataaatcctaag 131  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||  |||| |  | |||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||     
T  471014 ctaaaaacataaaatgtgaatctacgaacaaaatcacatcacccaagttaataacatacatcgacaaaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaa 471113  T
Q  132 tcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacg 231  Q
    ||| |  ||| |  |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| ||| |  ||| |||||||| |||  |||||    
T  471114 tcatcagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcacaaatcattgattgaatctatgattgagtgaagatgatctttcaataagaaccaaacg 471213  T
Q  232 aacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | |||||| ||||| | | |||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  471214 agcaccgcaacaagacacaaaatcaaacgtcgcaccagacgacgaacaacacagcgccgcact 471276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5046962 - 5046744
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    ||| ||  | |||| |||    
T  5046962 aactcacatcacccaagttaataacatacaacgataaaatgcctacaaataatatgataaattctaagtcactgaaatattcatgtttatgaatctgcaa 5046863  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    ||| |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||  ||||||| |||   |||||  | |||||||||| |||    
T  5046862 cgtcgacgtccaaattattgattgaatctgtaattgactgaatttgatttttcaataggaaccaaacgaataccaaaacaaggtgtgaaatcaaacgccg 5046763  T
Q  264 cacaagacgactaacaaca 282  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  5046762 cacaatacgacgaacaaca 5046744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 293
Target Start/End: Original strand, 14916039 - 14916299
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||    
T  14916039 taaaaacgtaaatggtgaatctgcgaaaaaactcaatgcactcaagttaatagcatacaactgcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatca 14916138  T
Q  135 ccgaa-attcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
     | || ||||  |||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||| | | ||||| ||| |  | | |||||||| |||  |||||||    
T  14916139 acaaatattc--atgcttccggatctgcaacatggacgtccaaatcattgattgaatctctgattgattgaagttggtctttcaatatgaaccaaacgaa 14916236  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcac 293  Q
    |||||| ||||| |  |||||||||||   |||||||| | |||  ||||| |||||||||||    
T  14916237 caccgcaacaagacatgaaatcaaacagtgccgcacaaaaggacggacaacgcaacgccgcac 14916299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 24099106 - 24099368
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| |||       ||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  24099106 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataatt------tgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 24099199  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaat-----tgactgatgccgatttttcaataggaaataa 228  Q
    ||| ||||     | ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||     ||||||| || |||||||||||| |||  ||    
T  24099200 accaaaatattctttcttccggatctgcaacgttgacgtacaaatcattgaatgaatttgtgatgcgattgactgaagctgatttttcaatatgaaccaa 24099299  T
Q  229 acgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgc---acaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24099300 atgaacaccgcaacaagatgcgaaatcaaacaacgcggtacaggacgacgaacaacacaacgtcgcact 24099368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 294
Target Start/End: Original strand, 1239283 - 1239509
Alignment:
Q  70 cagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttga 169  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||| ||||||| |  |||| |||||  ||| |   |||||  |||||| |||||||||    
T  1239283 cagcacccaagttaatagcatacaacgtcaaaatgcctacaaatagtatgatataatctaaatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttga 1239382  T
Q  170 cgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcac 266  Q
    || ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||| | ||  |||||||||||| |||||  || ||||||||||   ||||||    
T  1239383 cgtccagatcattgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaatatg-aaccaacgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcac 1239481  T
Q  267 aagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||    
T  1239482 aagacgatgaacaacacaaggtcgcact 1239509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8868047 - 8867884
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagtt---aattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||   |||  |||| || | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  8868047 ctaaaaacgtaaaaggtgaatttgcgaacaaactcacaccacccaagttataaataacatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaa 8867948  T
Q  131 gtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgt 194  Q
     |||||  |||    | |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8867947 atcaccagaatatccaagcttccagatcttcaactttgatgcccaaatcattgattgaatttgt 8867884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 294
Target Start/End: Original strand, 8443474 - 8443624
Alignment:
Q  147 tgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagt 246  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||| ||||||   |||  |||||||||| || |||||     
T  8443474 tgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagttgatctttcaaattgaaccaaacgaacactgcaacaaga 8443573  T
Q  247 cgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8443574 cgcggaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 8443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39657631 - 39657426
Alignment:
Q  96 ggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgta 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  39657631 ggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttatg 39657532  T
Q  196 attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgc----gacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgc 288  Q
    |||| |||| ||  || |||||||| |||  |||||||||||||     | |||  |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||     
T  39657531 attgtctgaagctaatctttcaatacgaaccaaacgaacaccgcacaacaaaagatgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaatacaacgt 39657432  T
Q  289 cgcact 294  Q
    ||||||    
T  39657431 cgcact 39657426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8981290 - 8981178
Alignment:
Q  146 atgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||| || ||| ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  8981290 atgcttccggatctgtaacgttgacgtccaaatcatcaattgaatctgtgattgactgacgctgatctttcaatatcaaacaaacgaacaccgcaacaag 8981191  T
Q  246 tcgcgaaatcaaa 258  Q
     ||||||||||||    
T  8981190 acgcgaaatcaaa 8981178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 98 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34610011 - 34609809
Alignment:
Q  98 caaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgta-- 195  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |  ||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||      
T  34610011 caaaatgcctattaataatatgataaaacctaaatcaccggaatactcatgttctcgaatctgcaacgttcacgcccaaatcattgattgcatttgtaac 34609912  T
Q  196 --attgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
      ||||||||| |  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||   |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  34609911 tgattgactgaagttgatctttcaat-ggaaacaaacgaacaccgcaacaagacacaaaatcaaataacgtcgcacaagacgaggaacaacccaacgccg 34609813  T
Q  291 cact 294  Q
    ||||    
T  34609812 cact 34609809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Original strand, 41060109 - 41060243
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||| || || ||||| ||   ||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  41060109 atcactaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaaattgatagcatacaacaacaaaatggctacaaataatatgataaaatcta 41060208  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaac 164  Q
    ||||   |||||   ||||||||||||||| ||||    
T  41060209 agtctatgaaatatctatgctttcggatctgcaac 41060243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 9498431 - 9498509
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  9498431 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataatggcataatgcctacaaa 9498509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3240617 - 3240365
Alignment:
Q  36 aaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttc--aaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || ||||||||| || |  ||| || ||||| ||| |||| ||    
T  3240617 aaaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatg-ctacaaaaaaaaaatgat-aattctaaatc 3240520  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  || |||  |||||| |||| ||| || ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||  |||| ||    
T  3240519 accagaatacccatacttctggatctgcaacattggcgtccaaatcatcgattgaatatgtgattgactgaagccgatctttcaatattaaccaaacaaa 3240420  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaa 285  Q
    |||| | ||||  ||||||||||||||    || |||||||||| ||||||||||    
T  3240419 caccacaacaacacgcgaaatcaaacaacgtcgtacaagacgacgaacaacacaa 3240365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 94
Target Start/End: Original strand, 8412355 - 8412432
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaa 94  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8412355 atcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaa 8412432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11267260 - 11267169
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  11267260 ctaaaaacgtaaaggatgaaactgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 11267169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Original strand, 26469000 - 26469152
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| | || |||||||||    | || | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  26469000 ctaaaaacgtaaatggtgaatctgtaaataaactcacaacgcctaagttaatt----ataacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatc 26469095  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    |||  ||| || |||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26469096 accagaatacacatgcattcagatgcacaacgttgacgcccaaatcattgattgaat 26469152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29777471 - 29777393
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||    
T  29777471 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctccaaa 29777393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 9619189 - 9619246
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9619189 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcata 9619246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 37565709 - 37565802
Alignment:
Q  32 cactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  37565709 cactaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaa 37565802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33342683 - 33342595
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  33342683 aaaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaatatatatgataaa 33342595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11725932 - 11725841
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  11725932 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 11725841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 237
Target Start/End: Original strand, 18847121 - 18847192
Alignment:
Q  166 ttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacacc 237  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  18847121 ttgacgctcaaatcattgattgaatctgcaattaactgatgctgacctttcaataggaaccaaacgaacacc 18847192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2656122 - 2656044
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||    
T  2656122 ctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 2656044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 4809216 - 4809138
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || | |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  4809216 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 4809138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 286
Target Start/End: Original strand, 8412443 - 8412505
Alignment:
Q  224 aataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  8412443 aataaaggaacaccgggacaagactcgaaatcaaatgtcgcacaagacgacgaacaacacaac 8412505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 11464423 - 11464345
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  11464423 ctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 11464345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 33896338 - 33896260
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||    
T  33896338 ctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaa 33896260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41684498 - 41684412
Alignment:
Q  200 actgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||   || |||||||||  |||||||||||    
T  41684498 actgatgtcggtctttcaataggaactaaatggacaccgcgacaagacgcgaattcaaatgtcgtacaagacgatgaacaacacaac 41684412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 43889956 - 43890034
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||  || |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  43889956 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaaatcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 43890034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Original strand, 44091749 - 44091811
Alignment:
Q  180 attgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  44091749 attgattgaatttgtatttgattgatgtcgatctttcaacaggaactaaacgaacaccacgac 44091811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 14906755 - 14906812
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  14906755 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcata 14906812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34612060 - 34611999
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  34612060 atcactaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 34611999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41684556 - 41684499
Alignment:
Q  99 aaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcgga 156  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  |||||||||||    
T  41684556 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgctttcgga 41684499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 221
Target Start/End: Original strand, 20227262 - 20227318
Alignment:
Q  165 gttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  20227262 gttgacacccaaattattgattgaatttgtaattgacttaagccgatcttttaatag 20227318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 3913407 - 3913686
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3913407 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgcatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 3913506  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  3913507 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtctaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 3913606  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3913607 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 3913686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 606461 - 606182
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  606461 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 606362  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||    
T  606361 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttataattgactgatgtagatctt 606262  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  606261 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaatgcgaaatcaaacgccgcacaagatgacgaacaacacaacgccgcact 606182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 33053001 - 33053280
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  33053001 acatcaaatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 33053100  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  33053101 atatgataaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctt 33053200  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33053201 tcaagaggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 33053280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23128875 - 23128596
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  23128875 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 23128776  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  23128775 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgttgatctt 23128676  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||| | ||| ||||| |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23128675 tcaataagaactgaacaaacactgcgacaaaacgcgaaatcaaacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 23128596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 32327053 - 32327329
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||||    
T  32327053 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatac---ggcaaaatgcctacaaata 32327149  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || | |  |||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  32327150 atatgataaaacctaaatcaccaaactactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtcaaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 32327249  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||| || | ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32327250 tcaatagaaattgaataaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcact 32327329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Original strand, 29319712 - 29319990
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa-taa 115  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| ||||| || || ||||||| | |||| |||    
T  29319712 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacaaccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcttacaaaataa 29319811  T
Q  116 tatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattttt 215  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| || |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  29319812 tatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatcttt 29319911  T
Q  216 caataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29319912 caatatgaagttaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcataagaggacgaacaacacaacgccgcact 29319990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Original strand, 29255279 - 29255551
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |  |||||||| ||||||    
T  29255279 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaatgggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagtgaaatgcctacaaata 29255378  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |  ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29255379 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgaagatctt 29255478  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgc 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  29255479 tcaataggaactaaacgaacaccgcgataagacac-aaatcaaacgttgcacaagacgacgaacaacacaacgc 29255551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 7515054 - 7515314
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||| |   | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7515054 ctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacagaaaccaagttaatagcatacagcagaaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtc 7515153  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||||| || || |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| || ||||||||| ||||| ||    
T  7515154 accgacatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgcctaaatcattggttgaatttgtaattgagtgatgtagatattccaataggaactaaacaaa 7515253  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7515254 caccgcgacaagacgcgaaatcaaacgtcgcccaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 7515314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12170725 - 12170474
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  12170725 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatatgcgagcaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata 12170626  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  12170625 atatgatcaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 12170526  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcac 266  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12170525 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcac 12170474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 127905 - 127648
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  127905 ctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagcaaccaagttaatagcacaac--ggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 127808  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||||||| |  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||    
T  127807 accgaaatactcatgcttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgatcgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaatgaa 127708  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||||  ||||||||||||   | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  127707 caccgcgacaa-acgcgaaatcaaatgtcacacaagacgacgaacaacacaacgctgcact 127648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34018810 - 34018538
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||| |||||||| ||||   ||| ||  | ||||||||| |||||||||||||    
T  34018810 atacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtaaatctgcagacaaactcacaacacccaagataataatatacaacagtaaaatgcctacaaataatatgat 34018711  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| | |||||||| ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  34018710 aaaacataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattagttgaatttgtaattaactgatctcgatctttcaatag 34018611  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34018610 gaactaaacgaacaccgcgacaagacatgaaatcaaacgtctcacaagacgacgaacaacacaacgccacact 34018538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 272
Target Start/End: Original strand, 67836 - 68091
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||    
T  67836 atcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaataat 67935  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    |||||||| | |||||| ||||||| |  ||| || ||||||| ||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  67936 atgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttaacgtacaaatcgttggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttc 68035  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacg 272  Q
    | |||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  68036 attaggaactgaacaaacaccacgacaaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacg 68091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30894855 - 30894598
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||| ||||||| || ||||| ||  |||||||| || ||||||    
T  30894855 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcaata-aactcacagcatccaagttgatagcatacaacagcaaaatgactacaaata 30894757  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  30894756 atatgataaaacctaattcatcgaaatacc-atgcttctggatctgtaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 30894658  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgac 274  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||    
T  30894657 tcaatatgaactaaacgaacaccgcggcaagacgcgaaatcaaacgtcgcaaaagacgac 30894598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 30608350 - 30608619
Alignment:
Q  17 atcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataat 116  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||| | ||||| ||| ||  | |||||| || |||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||    
T  30608350 atcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaatctcacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaataat 30608449  T
Q  117 atgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttc 216  Q
    ||||||||   |||||||||||||| |  ||| || | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  30608450 atgataaaatataagtcaccgaaatacccatgattccagatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtaattgacttatgtcgatctttc 30608549  T
Q  217 aataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30608550 aataggaactaaatgaacacagcgacaa-acgcaaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 30608619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14802073 - 14801863
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaag-gtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaat 125  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  14802073 aatatcgctaaaaacgtaatagagtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaa 14801974  T
Q  126 cctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaa 225  Q
     |||| ||||| |||| || || |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||     
T  14801973 tctaaatcaccaaaatacacattcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagctaatctttcaatacgaac 14801874  T
Q  226 taaacgaacac 236  Q
     ||||||||||    
T  14801873 caaacgaacac 14801863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 546276 - 546063
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||      
T  546276 aatatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaat 546177  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaa-tttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaa 225  Q
    ||||  ||||  ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||     
T  546176 ctaaaccaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaattttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaac 546077  T
Q  226 taaacgaacaccgc 239  Q
     |||||||||||||    
T  546076 caaacgaacaccgc 546063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3355292 - 3355095
Alignment:
Q  97 gcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaa 196  Q
    |||||||| || |||| |||| ||||||  ||||||||| ||||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||    
T  3355292 gcaaaatgtctccaaacaataggataaaatctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaaagttgacgtccaaatcattcattgaatttataa 3355193  T
Q  197 ttgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  3355192 ttgactgatgtcgacctttcaataggaactaaacgaacaccacaacaagacgcgaaatcaaacgtcacacaagaggacgaacaacacaacaccgcact 3355095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 14174904 - 14175047
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  14174904 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaacagcataaaacggaaaaatgcctacaaata 14175003  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatc 158  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14175004 atatgataaaacataagtcaccgaaattcacatgcttccggatc 14175047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 14179440 - 14179583
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||  |||||||| || ||||||||| ||||||    
T  14179440 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaacagcataaaacggaaaaatgcctacaaata 14179539  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatc 158  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14179540 atatgataaaacataagtcaccgaaattcacatgcttccggatc 14179583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30493770 - 30493507
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||   ||| ||    
T  30493770 ctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaattcacaacacccaggttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaacatgataaaatataaatc 30493671  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||| |||| |  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |  ||| |||||||| |||  |||||||    
T  30493670 accaaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgagattgactgaagttgatctttcaatatgaaccaaacgaa 30493571  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||   |||||   ||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30493570 caccagaacaagatacgaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 30493507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8102971 - 8102759
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  8102971 aatatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaataacattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaat 8102872  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| ||| |  |||    ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||| |||      
T  8102871 ctaaatcatcagaatattcatgtttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaatacgaacc 8102772  T
Q  227 aaacgaacaccgc 239  Q
    |||| ||||||||    
T  8102771 aaacaaacaccgc 8102759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30776908 - 30776715
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||      
T  30776908 aatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaat 30776809  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaata 220  Q
    |||| |||||  ||| |  ||||||   ||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||    
T  30776808 ctaaatcaccagaatacccatgcttctagatttgcaacgttcacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattgtctgaagctgatctttcaata 30776715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32060031 - 32059894
Alignment:
Q  140 attcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgc 239  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||         
T  32060031 attcacatgcttccggatcttcaacgttgacgatcaaatcattggttgattttgtaactgactaatgccaatatttcaataggaaataaacgaac----- 32059937  T
Q  240 gacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacg 287  Q
         | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32059936 -----gccgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacg 32059894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 26588324 - 26588587
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||  |||||||  || |||||||||  ||||| ||  |||||||| ||  |||||||||||||||  | || ||    
T  26588324 ctaaaaacttaaagggtgaagctgcaaacaaactcacgacatccaagttaagagcatacaacagcaaaatgtctaaaaataatatgataaaatcaaaatc 26588423  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||| |||| |  ||||||  |||| | ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||| |||  |||||||    
T  26588424 acccaaatactcatgcttctggatttgcaacgttgacatccaaatcattaattgaatgtgtgattgactgaagttgatctttcaatatgaaccaaacgaa 26588523  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  26588524 caccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaatcaacacaactccgcact 26588587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 21426519 - 21426622
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||    
T  21426519 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaacggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata 21426618  T
Q  115 atat 118  Q
    ||||    
T  21426619 atat 21426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 4010430 - 4010611
Alignment:
Q  100 aaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattg 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4010430 aaatgcctataaataatatgataaattctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgtcaacacccaaatcattgattgaatatgtaattg 4010529  T
Q  200 actgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaaca 282  Q
    | ||||   ||| ||||||||||||  |||| |||| ||| ||| | ||| ||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  4010530 attgat-atgatctttcaataggaatcaaacaaacatcgcaacatgacgcaaaatcaaatgatgcacaagacgacgaacaaca 4010611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 163
Target Start/End: Original strand, 14846071 - 14846202
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagc---acccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || || || ||    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14846071 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgtgacagcaccca-agttaaacccaagttaatagcataaaacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaa 14846169  T
Q  131 gtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14846170 gtcaccaaaattcacatgcttccggaccttcaa 14846202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20226089 - 20225927
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  20226089 ctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaattctaactc 20225990  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaa 196  Q
    | |||||| |  ||||||  | |||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20225989 atcgaaatactcatgcttcagaatctgcaacgtcggcgccaaaatcattgattgaatttgtaa 20225927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22120073 - 22119911
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  22120073 ctaaaaacataaatgatgaatttgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaattctaactc 22119974  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaa 196  Q
    | |||||| |  ||||||  | |||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22119973 atcgaaatactcatgcttcagaatctgcaacgtcggcgccaaaatcattgattgaatttgtaa 22119911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 9341484 - 9341593
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||| |    
T  9341484 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaaca 9341583  T
Q  115 atatgataaa 124  Q
    ||||||||||    
T  9341584 atatgataaa 9341593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 259
Target Start/End: Original strand, 11321461 - 11321546
Alignment:
Q  174 caaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  11321461 caaataattgattgaatttgtaattgactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacaccacaacaagacgtgaaatcaaac 11321546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 294
Target Start/End: Original strand, 24227695 - 24227844
Alignment:
Q  145 tatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaa 244  Q
    |||||||  ||||||  |||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||| |||||||| || ||    
T  24227695 tatgcttcaggatctggaacgttgaggttcaaatcattgattgaaattgtaattgactgaagtcgatatttcaatatgaattaaatgaacaccgtgataa 24227794  T
Q  245 gtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | || |||||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||||    
T  24227795 gacgtgaaatcaaacgccacacaacacaacaaacaacacaacgtcgcact 24227844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31297058 - 31296795
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||| | || |||| ||||| ||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||   ||| ||    
T  31297058 ctaaaaacgtaaagggtgaaaatgcgaacaaactcaaatcatccaaattaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatataaatc 31296959  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||   |||||| |   |||||||||  | |||||||||||| |||  ||| |||    
T  31296958 accagaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtctaaatcatcaattgaatattggattgactgaaactgatttttcaatatgaatcaaatgaa 31296859  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| || |||||  || ||||||||||   |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31296858 cactgcaacaagatgcaaaatcaaacaacgccgcacaagatgatgaacaacacaacgccgcact 31296795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 294
Target Start/End: Original strand, 528197 - 528465
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||| ||| |||  |  ||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||      
T  528197 aatatcactaaaaacataaaagatgaatctgtgaacaaactaacatcacata--ttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaat 528294  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| ||||   ||| | ||| |||  | |||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| ||||| || ||| |||| ||| |||      
T  528295 ctaaatcactagaatacttatacttcagaatctgcaacgttgacgcccaaataattgattaaatatgtaatttactgaagctgatctttcgataagaacg 528394  T
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||||| || ||||| | | ||||||||||   |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||    
T  528395 aaacaaacactgcaacaagacacaaaatcaaacaacgccgcacaagatgacaaataacacaacgtcgcact 528465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 204
Target Start/End: Original strand, 32191629 - 32191752
Alignment:
Q  81 ttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatca 180  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||| |||||  ||| |  |||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  32191629 ttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaattgtatgataaaatctaaatcaccagaatgctcatgctttcggatatgcaacgttggcgtccaaatca 32191728  T
Q  181 ttgcttgaatttgtaattgactga 204  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||    
T  32191729 ttgattgaatatgtgattgactga 32191752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28981415 - 28981156
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||| |||| |||||||| ||||| ||   |||||| ||| |||  |||||||||||  |||| |     
T  28981415 ctaaaaacgtaaagggtgaatatgtgaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatacaacaacaaaattcctacaagcaatatgataaaatctaaatg 28981316  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    ||| |||| |  || ||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||| |||||| ||| ||||||| |  |  || ||| |||| |||  |||||||    
T  28981315 accaaaatacccatactttcggatctgcaatgttgacgtcaagatcattgattgaatctgtgattgactaaaactaatctttgaatatgaaccaaacgaa 28981216  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatca---aacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccg 290  Q
    |||| | |||||   | ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28981215 caccacaacaagatacaaaatcaaacaacaccgcagaagacgacgaacaacacaacgccg 28981156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 32802790 - 32802677
Alignment:
Q  28 atatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcc 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||  |||| || |  ||||| ||| ||||||||||||||||       
T  32802790 atatcactgaaaacgtaaagggtgaatatgcgatcaaactcacagcacccaatttaatatcatacaacgataaaatacctacaaataatatgataaaatt 32802691  T
Q  128 taagtcaccgaaat 141  Q
    ||||||||||||||    
T  32802690 taagtcaccgaaat 32802677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 8497213 - 8497129
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatat 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  8497213 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaaatat 8497129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 1933545 - 1933802
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||||| || ||| || ||||| ||||| ||  | ||||||| |  | |||||||||||||   ||| |||    
T  1933545 taaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcatagtaccgaaattaatagcatacaacagaaaaatgcatatagataatatgataaaatataaatca 1933644  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    ||  |||    ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |  ||| |||  ||| |||  |||| |||    
T  1933645 ccagaataatcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgattgaagttgatcttttgatatgaaccaaacaaac 1933744  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgcc 289  Q
    ||||| || || | | ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1933745 accgcaaccagacacaaaatcaaacaatgccgcacaagacgactagcaacacaacgcc 1933802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4088705 - 4088614
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  4088705 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatggcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 4088614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1523607 - 1523441
Alignment:
Q  73 cacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgc 172  Q
    ||||||||||||| ||||   | | |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||  ||| |  ||||||  |||||| |||||||||||     
T  1523607 cacccaagttaatagcattccacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgt 1523508  T
Q  173 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgc 239  Q
     |||||||||| ||||| |||  |||| || | || ||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  1523507 tcaaatcattgattgaagttgagattgtctcaagctgatatttcaatacgaaccaaacgaacaccgc 1523441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 200
Target Start/End: Original strand, 7976039 - 7976205
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||   |||||||||   ||| ||    
T  7976039 ctaaaaacataaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacggtatgataaaatttaaatc 7976138  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattga 200  Q
    |||  ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||| ||| |||||    
T  7976139 accagaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaataattaattgaatctgtgattga 7976205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6957272 - 6957136
Alignment:
Q  150 tttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat-aaacgaacaccgcgacaagtcg 248  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||| | ||||| |||||| ||| |||||| || ||||| ||    
T  6957272 tttcgaatctacaacgttgatgcctaaatcattgattgaatctgttattgactgaagtcgatctatcaat-ggaaatcaaatgaacactgcaacaagacg 6957174  T
Q  249 cgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaac 286  Q
     ||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||    
T  6957173 tgaaatgaaacaccacataaaacgacgaacaacacaac 6957136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Original strand, 34185545 - 34185808
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||||| |||||||||| || | | | || | |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  34185545 ctaaaaaagtaaaaggtgaatctacgaataaagtcacatcacccaagttgatagtacataacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatc 34185644  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  ||| ||   | | | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||   |||| |  ||| |||||||| ||| |||| |||    
T  34185645 accagaatacccatgattctagttttgcaaagttgacgtccaaatcattgattgaattcgtgatcacctgaagttgatctttcaatatgaactaaaagaa 34185744  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg---cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| | ||||| ||| |||||||||| ||   ||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  34185745 caccacaacaagacgcaaaatcaaacaacgtcacacaagacgacaaacagcacaatgccgcact 34185808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9380260 - 9380093
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| || ||||| |||| | ||| || | |||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||    
T  9380260 taaaaatgtaaatggtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagataatagaatacaacgacaaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatca 9380161  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgact 202  Q
    || |||| |  ||||||  | |||| |||| ||||| | |||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  9380160 ccaaaatacccatgcttctgaatctacaacattgacacacaaatcattgattgaacatgtgattgact 9380093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 294
Target Start/End: Original strand, 13546708 - 13546775
Alignment:
Q  227 aaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||  | ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13546708 aaacgaacactacaacaaggcgcaaaatcaaacgccgcataagacgacgaacaacacaacgccgcact 13546775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20220903 - 20220856
Alignment:
Q  247 cgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20220903 cgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 20220856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22114887 - 22114840
Alignment:
Q  247 cgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22114887 cgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 22114840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22571574 - 22571457
Alignment:
Q  173 ccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccga-tttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaa 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||  ||  |||||||||||   ||||  ||| ||||||||||   ||||||||    
T  22571574 ccaaatcattggttgaatttgtaatcgactgaagctgattttttcaatattaaccaaacgaacaccataacaaaacgcaaaatcaaacaacgccgcacaa 22571475  T
Q  269 gacgactaacaacacaac 286  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22571474 gacgacgaacaacacaac 22571457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16419403 - 16419245
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||  | |||| ||||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  16419403 ctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacaatcaagttaatagcatatgacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 16419304  T
Q  133 caccgaaat-tcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    ||||| ||| ||   ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  16419303 caccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 16419245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 17334998 - 17334920
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  17334998 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 17334920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35001835 - 35001677
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  35001835 ctaaaaacgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 35001736  T
Q  133 caccgaaattcatatg-ctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    ||||| |||    ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  35001735 caccggaatattcatgaccttcggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 35001677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Original strand, 13546552 - 13546660
Alignment:
Q  33 actaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagt 132  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| ||  ||  || ||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13546552 actaaaaacgtaaagggtgattctgtgaataaactcgcaatacttaaattaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaattctaagt 13546651  T
Q  133 caccgaaat 141  Q
    |||| ||||    
T  13546652 cacctaaat 13546660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 8027950 - 8028041
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||| || | |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  8027950 ctaaaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacatcatcaaagttaatagcatataatggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 8028041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 23947149 - 23947240
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata-atatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  23947149 ctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaa 23947240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 190
Target Start/End: Original strand, 27097495 - 27097650
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||  || |||||  || ||||||||| |||||   ||| |||||||||  | |||||||||||||  |||| |||    
T  27097495 taaaaacgtaaaatgtgaatttgtgaacaaagtcacaatactcaagttaatagcatacgctggtaaaatgcctagagataatatgataaaatctaaatca 27097594  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaat 190  Q
    || ||||    ||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27097595 ccaaaatatccatgttttcggatttgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaat 27097650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 260
Target Start/End: Original strand, 31575510 - 31575585
Alignment:
Q  185 ttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca 260  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  31575510 ttgaatttgtaattgagtgaaatcgatttttcaataggaatcagacgaacatcgcaacaagacgagaaatcaaaca 31575585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 679346 - 679257
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||  | | ||||||||||||||    
T  679346 ctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaa-cgcaaaatgtttgcgaataatatgataaa 679257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 7880934 - 7881012
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  7880934 ctaaaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 7881012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 25064481 - 25064403
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| ||||| || | || ||||||| ||||    
T  25064481 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa 25064403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 28634945 - 28635023
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaa 112  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| || |||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||    
T  28634945 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatcgcatataacggcataatgcctacaaa 28635023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 12059605 - 12059662
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  12059605 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 12059662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 107
Target Start/End: Original strand, 33740410 - 33740483
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgcct 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  33740410 ctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatccaagttaatagcatataacggcataatgcct 33740483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15740 - 15468
Alignment:
Q  23 tacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15740 tacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaataatatgata 15641  T
Q  123 aatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatagg 222  Q
    || ||||||||||||||||    |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15640 aaacctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtagatctttcaatagg 15541  T
Q  223 aaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatc-aaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15540 aaatgaacaaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcact 15468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 9882 - 10154
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  9882 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagtcaatagcataaaacggaaaaatgcctacaaataatatgat 9981  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatag 221  Q
    ||| || || |||| ||||| || ||| ||  |||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  9982 aaaacccaattcactgaaatacacatgtttctggatctgcaacgttgactctcaaatcattggttgaatttgtaattgatcgatgtcgatctttcaatag 10081  T
Q  222 gaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  10082 gaattaaatgaacaccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaaaacaaagccgcact 10154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38304 - 38052
Alignment:
Q  22 atacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgat 121  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||  ||| || | ||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  38304 atacaaatatcgcaaaaaacgtaaatgatgaatctacgaacaaacccataacacccaagttaatagcatatagcg-caaaatccctacaaataatatgat 38206  T
Q  122 aaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcg---gatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaa 218  Q
    |||  ||||||||||||||| |  ||| || ||   ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | | || ||||||    
T  38205 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccgccggatcaacaatgttgacacccaaatcatcgattgaatttgtaattgactgaagtctatctttcaa 38106  T
Q  219 taggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacg 272  Q
    || ||| ||||||||||| |  ||||| |  ||||||| || ||||||||||||    
T  38105 tatgaactaaacgaacactgtaacaagacatgaaatcatacgccgcacaagacg 38052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0884 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0884
Description:

Target: scaffold0884; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 294
Target Start/End: Original strand, 1814 - 2085
Alignment:
Q  23 tacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgata 122  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1814 tacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaataacatacaacagcaaaatgcctacaaataatatgata 1913  T
Q  123 aatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaatagg 222  Q
    || ||||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  1914 aaacctaaatcaccgaaatacttatgttttcggatctgcaacgttgacgcccaaaccattggttgaatttgtaattgactaatgtagatctttcaatagg 2013  T
Q  223 aaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||| || || |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  2014 aactaaaaaaacaccgcgacaagatgcgaaatcaaacgccacataagacgacgaacaacaaaatgccgcact 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 32580 - 32859
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||| | ||| |  | |||||||||| ||||||    
T  32580 acatcagatacaaacatggctaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcacaacactcaagttaatagtatacagcgacaaaatgcctacaaata 32679  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  32680 atatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgtagatctt 32779  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32780 tcaataggaactgaacaaataccgcgacaagacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcact 32859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 71703 - 71976
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||    
T  71703 acatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 71802  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | ||||||||       |  |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  71803 atatgataaaacttaagtcaca------cccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattggttgaatttgtaattgactaatgtagatctt 71896  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  71897 tcaataggaactgaacaaacaccgcgacaaaacgtgaaatcaaactccgcacaagacaacgaacaacacaacgccgcact 71976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 51012 - 50788
Alignment:
Q  35 taaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtca 134  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  51012 taaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtca 50913  T
Q  135 ccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaac 234  Q
    |||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||| ||| || ||||||| ||| |||    
T  50912 ccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactaacgtagatcttttaagaggaaatgaacaaac 50813  T
Q  235 accgcgacaagtcgcgaaatcaaac 259  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  50812 accgcgacaaaacgcgaaatcaaac 50788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 65875 - 66154
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||    
T  65875 acatcatatacaaacatcggtaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 65974  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  65975 atatgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggcacccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatctt 66074  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
     |||| | || ||||| |||||| |||||||  || |||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  66075 ccaattgtaactaaacaaacaccacgacaagatgcaaaatcagacgccacacaagacgacgaacaacataacgctgcact 66154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 291
Target Start/End: Original strand, 71138 - 71409
Alignment:
Q  20 aaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatg 119  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| | ||  |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||| ||||||||||     
T  71138 aaatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctacaaacaaacttacaacacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatata 71237  T
Q  120 ataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaat 219  Q
    |||||  |||||||| | |||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  71238 ataaaatctaagtcatcaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacaccccaatcattgattgaatttataattgactgatgccgatctttaaat 71337  T
Q  220 aggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgc 291  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  71338 aggaactaaacgaacaccacgacaagacgcgaaatcaactgctgcacaagtcgactaacaacacaacgccgc 71409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8719 - 8489
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaa 163  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| | ||| |||||||||| |  || ||| | ||||| |||    
T  8719 aactcacagtacccaacttaatagcatacaacggcaaaatgcctacgattaatatgataaaacataattcaccgaaatacccattcttccagatctgcaa 8620  T
Q  164 cgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccg 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |    
T  8619 cgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaagagactgatgtcgatctttcaataggaactaaacgaacatcgcgacaagacgcgaaatcaaacgctg 8520  T
Q  264 cacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8519 cacaagacgatgaacaatacaacgccgcact 8489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Original strand, 31107 - 31381
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||||| | ||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||| |||   || | ||||||||||  |||||    
T  31107 acatcagatacaaacatcgcttaaaacgtaaaggatgaatcaacgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctataaata 31206  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||| |||| || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  31207 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgatgctcaaatcgttgattgaatttgtaattgagtgatgtcgatctt 31306  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgcc 289  Q
    |||||||||| |||| ||  |||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31307 tcaataggaactaaatgattaccgtgacaagacgggaaatcaaacgtcgcacaagacgactaacaacataacgcc 31381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 277
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1914
Alignment:
Q  99 aaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaatt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1736 aaaatgcctacaaataatatgataaaatataagtcatcgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggtgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 1835  T
Q  199 gactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaa 277  Q
     || |||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  1836 taccgatgtcgatcttccaatagaaattaaacgaacaccgcgacaagacgcgaaaccaaacgacgcacaagatgactaa 1914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7953 - 7693
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaagg-tgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagt 132  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |    
T  7953 ctaaaaacgtacaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaatagcaaaatccctacaaataatatgataaattataact 7854  T
Q  133 caccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacga 232  Q
    |||  | |||   |||||| ||||| | |||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| |||  |||||    
T  7853 cact-acattaccatgcttccggatatgcaacgtcgacacccaaataattgatggaatttataattgactgaagtggatctttcaatagaaaactaacga 7755  T
Q  233 acaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    |||| ||  |||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7754 acactgcatcaagacgcgaattcaaacgccacacaagacgacaaacaacacaacgccgcact 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 258
Target Start/End: Original strand, 57940 - 58164
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtc 133  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||  |||| ||    
T  57940 ctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatc 58039  T
Q  134 accgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaa 233  Q
    |||  ||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || ||| ||||| || |||| |||| ||    
T  58040 accagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattgactgaagctgatctttcagtatgaaacaaacaaa 58139  T
Q  234 caccgcgacaagtcgcgaaatcaaa 258  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  58140 caccgcaacaagacgcaaaatcaaa 58164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6271 - 6014
Alignment:
Q  30 atcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatccta 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||| || |  ||   ||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  6271 atcactaaaaatgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcttgtaacaacaaaatgtctacaaataatatgataaaatcta 6172  T
Q  130 agtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaa 229  Q
    | |||||  ||| || |||||| ||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |   |  |||||||| |||  |||    
T  6171 aatcaccagaatacacatgcttccggatctgcaacattgacatccaaatcattgattgaatatgtgattgactgaagttaacatttcaatatgaaccaaa 6072  T
Q  230 cgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacaca 284  Q
     ||||||||| ||||  ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  6071 tgaacaccgcaacaatacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaca 6014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Original strand, 14704 - 14927
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaata 114  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  |||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  14704 acatcatatacaaacatcactaaaaatataaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatataatagcaaaatgcatacaaata 14803  T
Q  115 atatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttt 214  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |  ||| || ||||||| ||| |||||  || ||||||||| ||||||      |||||||||  |||| ||    
T  14804 atatgataaat-ctaagtcatcgaaatactcatgtttccggatctgcaatgttgattcctaaatcattgattgaat------ttgactgatatcgatctt 14896  T
Q  215 tcaataggaaataaacgaacaccgcgacaag 245  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  14897 tcaatacgaactaaacgaacgtcgcgacaag 14927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37082 - 36812
Alignment:
Q  15 acatcaaatacaaatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcaccc-aagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaat 113  Q
    |||||| ||||| | ||| ||| |||| |||| | | ||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||| |||||    
T  37082 acatcagatacacacatcgctataaacttaaatgatcaatctacgaacaaactcacaacaccccaagttaatagcataaaacatcaaaatacctacaaat 36983  T
Q  114 aatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgattt 213  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||| |  |||||| | |||   |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | || |    
T  36982 aatatgataaaatctaaatcactgaaatacccatgcttccagattagcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattaactaatgtcaatat 36883  T
Q  214 ttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcacaagacgactaacaacacaacgcc 289  Q
    |||     ||| ||||  |||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36882 ttc-----gaactaaaaaaacaccgaaataaaacgcgaaatcaaacgccgcacaagacgactaccaacacaacgcc 36812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25452 - 25294
Alignment:
Q  109 caaataatatgataaatcctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgcc 208  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |  ||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |    
T  25452 caaataatatgatcaaatctaagtcacagaaatactcatgtttttggatctacaatgttgacgctcaaatcattgatttaatttgtaattaactgatgtc 25353  T
Q  209 gatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaatcaaacaccgcaca 267  Q
     || |||||| | ||| |||||| |||||||||||||  |||||| || | ||||||||    
T  25352 aatatttcaacatgaactaaacggacaccgcgacaagatgcgaaagcacaaaccgcaca 25294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 236
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1732
Alignment:
Q  27 aatatcactaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatc 126  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||||||  |||||||| || | || ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||      
T  1523 aatatcccttaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacatcatcaaaattaatagcatataacgataaaatgcctacaaataatatgataaaat 1622  T
Q  127 ctaagtcaccgaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaat 226  Q
    |||| |||||  ||| |  ||| ||  |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  ||| |||||||| |||      
T  1623 ctaaatcaccagaatacccatgtttctggatctactacgttgatacccaaatcattgattgaatttgtgattgtctgaagttgatctttcaatacgaacc 1722  T
Q  227 aaacgaacac 236  Q
    ||||||||||    
T  1723 aaacgaacac 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 93341 - 93080
Alignment:
Q  37 aaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaatcctaagtcacc 136  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |  ||| ||||||||||||||| ||| | ||   |||||||||| |||| |||||||||||   ||| |||||    
T  93341 aaaacgtaaatggtgaatctgtgaacaagttcatagcacccaagttaatagcacacaacaacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatttaaatcacc 93242  T
Q  137 gaaattcatatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacac 236  Q
      ||| |  ||  ||  |||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| ||| ||||| |||  ||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  93241 agaatacccatatttctggatctgcaacgttgacgtcctaatcattgattcaatatgtgattgagtgaaaccgatctttcaatatgaaccaaacgaacac 93142  T
Q  237 cgcgacaagtcgcgaa-atcaaaca---ccgcacaagacgactaacaacacaacgccgcact 294  Q
    | | ||||| | |||| ||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  93141 cacaacaagacacgaatatcaaacaacgccgcacaagacaacaaacaacacaacgcagcact 93080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 8099
Alignment:
Q  180 attgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgac 242  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8161 attgattgaatttgtatttgattgatgtcgatctttcaacaggaactaaacgaacaccacgac 8099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 260
Target Start/End: Original strand, 92468 - 92574
Alignment:
Q  154 ggatcttcaacgttgacgcccaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatgccgatttttcaataggaaataaacgaacaccgcgacaagtcgcgaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| ||| |    ||| |||||||| |||  ||||||||||| | ||||| || ||||    
T  92468 ggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgatttactaaaattgatctttcaatatgaaccaaacgaacaccacaacaagacgtgaaa 92567  T
Q  254 tcaaaca 260  Q
    |||||||    
T  92568 tcaaaca 92574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 83268 - 83325
Alignment:
Q  34 ctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacagcacccaagttaattgcata 91  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||    
T  83268 ctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcata 83325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 120
Target Start/End: Original strand, 26957 - 27013
Alignment:
Q  64 aactcacagcacccaagttaattgcataaaatggcaaaatgccttcaaataatatga 120  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||| || ||||||||||||    
T  26957 aactcacagcacgcaagttaatagcatataataacaaaatggctacaaataatatga 27013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University