View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15076_low_19 (Length: 238)

Name: NF15076_low_19
Description: NF15076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15076_low_19
NF15076_low_19
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (5-234)||(29693093-29693322)
chr8 (5-237)||(39693311-39693542)
chr8 (5-234)||(24646116-24646345)
chr8 (5-233)||(17525873-17526101)
chr8 (5-234)||(17441951-17442178)
chr8 (5-234)||(43644676-43644903)
chr8 (5-225)||(12757907-12758124)
chr8 (5-237)||(25163848-25164077)
chr8 (5-234)||(17267255-17267481)
chr8 (5-234)||(18321303-18321529)
chr8 (7-234)||(20382540-20382764)
chr8 (5-234)||(16681447-16681673)
chr8 (5-231)||(16188767-16188991)
chr8 (25-235)||(20255675-20255882)
chr8 (15-234)||(33082645-33082863)
chr8 (5-234)||(17701521-17701752)
chr8 (5-230)||(18121250-18121472)
chr8 (16-234)||(19943016-19943231)
chr8 (5-195)||(21932701-21932890)
chr8 (5-234)||(18718784-18719008)
chr8 (5-237)||(19707285-19707513)
chr8 (5-234)||(18679595-18679822)
chr8 (5-234)||(16207086-16207313)
chr8 (5-230)||(15336232-15336455)
chr8 (5-230)||(15425297-15425520)
chr8 (5-230)||(15516601-15516824)
chr8 (5-230)||(30421573-30421796)
chr8 (10-234)||(23263761-23263982)
chr8 (15-234)||(19956494-19956708)
chr8 (5-230)||(6407511-6407733)
chr8 (5-230)||(45538583-45538805)
chr8 (10-167)||(45292679-45292837)
chr8 (15-230)||(43639567-43639779)
chr8 (5-230)||(40845531-40845753)
chr8 (5-230)||(13430772-13430994)
chr8 (5-230)||(14989595-14989816)
chr8 (10-229)||(22673564-22673780)
chr8 (5-230)||(17797206-17797429)
chr8 (15-167)||(1237481-1237634)
chr8 (27-234)||(18685562-18685766)
chr8 (27-234)||(18731156-18731360)
chr8 (10-154)||(23185375-23185520)
chr8 (15-179)||(24833210-24833376)
chr8 (67-216)||(26832836-26832982)
chr8 (5-179)||(33560359-33560535)
chr8 (15-230)||(9320354-9320566)
chr8 (10-230)||(36104981-36105197)
chr8 (5-99)||(17914372-17914466)
chr8 (5-230)||(1744942-1745166)
chr8 (5-69)||(19156139-19156203)
chr8 (15-230)||(22662901-22663113)
chr8 (15-144)||(21288270-21288400)
chr8 (10-226)||(24551063-24551276)
chr8 (119-234)||(19156023-19156135)
chr8 (72-234)||(22461848-22462007)
chr8 (80-179)||(43773951-43774051)
chr8 (22-144)||(21540820-21540942)
chr8 (5-227)||(18151790-18152009)
chr8 (22-144)||(28903328-28903450)
chr8 (5-144)||(45568045-45568184)
chr8 (80-144)||(21298880-21298944)
chr8 (13-146)||(23271271-23271404)
chr8 (5-64)||(602864-602923)
chr8 (5-146)||(7018440-7018580)
chr8 (73-225)||(17917036-17917180)
chr8 (12-144)||(8031902-8032034)
chr8 (12-144)||(17519209-17519341)
chr8 (13-144)||(40003097-40003228)
chr8 (15-54)||(21300980-21301019)
chr8 (73-225)||(18557812-18557959)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (5-238)||(2913755-2913988)
chr7 (5-225)||(13138042-13138262)
chr7 (5-232)||(13879888-13880115)
chr7 (5-234)||(11319190-11319416)
chr7 (5-237)||(41842420-41842649)
chr7 (4-234)||(11792692-11792919)
chr7 (5-231)||(30025693-30025916)
chr7 (5-195)||(13302633-13302821)
chr7 (5-237)||(21692070-21692298)
chr7 (5-234)||(10883320-10883546)
chr7 (5-235)||(13730822-13731051)
chr7 (5-237)||(13033989-13034215)
chr7 (8-234)||(13260765-13260988)
chr7 (6-234)||(13683380-13683605)
chr7 (5-234)||(16310054-16310280)
chr7 (15-231)||(4494365-4494578)
chr7 (5-234)||(5000969-5001198)
chr7 (5-234)||(16316704-16316930)
chr7 (5-230)||(33691859-33692081)
chr7 (26-234)||(16314708-16314913)
chr7 (5-231)||(2499825-2500049)
chr7 (8-195)||(331466-331653)
chr7 (16-234)||(13472667-13472881)
chr7 (5-230)||(16112031-16112254)
chr7 (5-234)||(39284711-39284937)
chr7 (7-234)||(12366897-12367121)
chr7 (5-231)||(44466851-44467075)
chr7 (5-223)||(13018652-13018867)
chr7 (10-230)||(48237054-48237274)
chr7 (49-231)||(15088337-15088516)
chr7 (5-230)||(9069351-9069573)
chr7 (5-163)||(21695255-21695412)
chr7 (5-234)||(24787927-24788152)
chr7 (5-234)||(28408824-28409050)
chr7 (10-230)||(30945508-30945726)
chr7 (15-230)||(23280116-23280328)
chr7 (5-231)||(21283520-21283743)
chr7 (10-230)||(28622508-28622726)
chr7 (5-229)||(4821264-4821485)
chr7 (5-230)||(30944470-30944693)
chr7 (15-230)||(15467706-15467917)
chr7 (29-237)||(9098406-9098610)
chr7 (29-237)||(9099212-9099416)
chr7 (9-234)||(29935509-29935719)
chr7 (5-230)||(35952835-35953056)
chr7 (30-234)||(19237213-19237409)
chr7 (15-167)||(21381586-21381738)
chr7 (5-230)||(48062967-48063189)
chr7 (15-230)||(2265675-2265887)
chr7 (10-231)||(9709954-9710173)
chr7 (10-231)||(33605473-33605691)
chr7 (5-230)||(8182719-8182941)
chr7 (106-234)||(22579465-22579590)
chr7 (5-230)||(27871506-27871729)
chr7 (5-230)||(14425236-14425458)
chr7 (15-227)||(12174497-12174706)
chr7 (5-230)||(14426336-14426558)
chr7 (38-226)||(2266502-2266688)
chr7 (5-230)||(1292819-1293041)
chr7 (10-230)||(32264870-32265088)
chr7 (15-230)||(15704646-15704858)
chr7 (15-154)||(19339407-19339547)
chr7 (5-179)||(24794862-24795038)
chr7 (15-179)||(48806036-48806202)
chr7 (103-231)||(14187479-14187604)
chr7 (43-230)||(16556774-16556958)
chr7 (43-230)||(16608704-16608888)
chr7 (5-179)||(19711160-19711336)
chr7 (15-131)||(16545840-16545956)
chr7 (15-131)||(16619706-16619822)
chr7 (5-144)||(4412109-4412249)
chr7 (5-60)||(13648685-13648740)
chr7 (67-225)||(7488113-7488268)
chr7 (12-144)||(8999045-8999175)
chr7 (5-110)||(14193020-14193125)
chr7 (23-144)||(11087166-11087286)
chr7 (67-224)||(13172561-13172717)
chr7 (5-146)||(29590048-29590188)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (5-234)||(29680646-29680875)
chr4 (5-234)||(19666152-19666381)
chr4 (5-237)||(3395369-3395599)
chr4 (5-234)||(37985714-37985940)
chr4 (7-235)||(19621165-19621390)
chr4 (4-233)||(14904457-14904684)
chr4 (7-234)||(16632223-16632447)
chr4 (6-232)||(23123304-23123527)
chr4 (5-233)||(23750306-23750531)
chr4 (5-234)||(55380073-55380299)
chr4 (5-231)||(12811277-12811500)
chr4 (13-233)||(12600541-12600759)
chr4 (5-234)||(6641467-6641693)
chr4 (15-230)||(22675633-22675845)
chr4 (10-237)||(37435642-37435867)
chr4 (5-231)||(14605009-14605229)
chr4 (16-234)||(45833177-45833392)
chr4 (5-230)||(17398776-17398998)
chr4 (5-226)||(40845884-40846108)
chr4 (13-231)||(56034358-56034575)
chr4 (5-237)||(19911983-19912211)
chr4 (15-225)||(17247035-17247242)
chr4 (15-230)||(8105425-8105637)
chr4 (80-230)||(3483517-3483664)
chr4 (10-230)||(10072721-10072939)
chr4 (5-230)||(3105521-3105743)
chr4 (15-227)||(54679718-54679927)
chr4 (15-230)||(412788-413000)
chr4 (87-234)||(15014571-15014715)
chr4 (10-231)||(19884488-19884706)
chr4 (15-230)||(44397638-44397850)
chr4 (5-230)||(40860454-40860676)
chr4 (5-225)||(14154096-14154314)
chr4 (5-230)||(29121156-29121379)
chr4 (10-231)||(13576221-13576440)
chr4 (5-226)||(6517276-6517494)
chr4 (5-230)||(16853290-16853512)
chr4 (5-230)||(22190633-22190855)
chr4 (22-230)||(55731632-55731837)
chr4 (29-237)||(17540179-17540381)
chr4 (5-179)||(17700867-17701043)
chr4 (27-225)||(41114893-41115087)
chr4 (5-151)||(10692714-10692860)
chr4 (5-151)||(10906480-10906626)
chr4 (15-179)||(15475255-15475421)
chr4 (10-230)||(16939803-16940020)
chr4 (5-97)||(9140829-9140921)
chr4 (58-224)||(17788199-17788361)
chr4 (5-179)||(39419836-39420012)
chr4 (5-167)||(16848393-16848556)
chr4 (27-233)||(11915485-11915688)
chr4 (5-179)||(20977292-20977466)
chr4 (5-166)||(38513725-38513887)
chr4 (67-222)||(10661330-10661482)
chr4 (67-222)||(10875475-10875627)
chr4 (15-230)||(56533173-56533385)
chr4 (15-154)||(27188751-27188891)
chr4 (58-225)||(8685597-8685760)
chr4 (5-179)||(9751642-9751818)
chr4 (60-234)||(11900973-11901143)
chr4 (12-144)||(14778501-14778632)
chr4 (15-179)||(3499764-3499930)
chr4 (15-224)||(25651215-25651415)
chr4 (80-163)||(1672238-1672322)
chr4 (80-163)||(1674713-1674797)
chr4 (12-144)||(14710837-14710968)
chr4 (5-163)||(33378261-33378420)
chr4 (12-144)||(36210167-36210299)
chr4 (12-144)||(17993852-17993982)
chr4 (12-146)||(18007118-18007251)
chr4 (25-146)||(19242115-19242235)
chr4 (137-231)||(36470605-36470696)
chr4 (72-138)||(13890704-13890770)
chr4 (73-221)||(19889166-19889309)
chr4 (102-225)||(13027571-13027689)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (5-234)||(25037350-25037579)
chr2 (5-237)||(25828911-25829143)
chr2 (5-233)||(22188193-22188421)
chr2 (5-232)||(23234790-23235016)
chr2 (5-208)||(30666795-30666998)
chr2 (9-237)||(40782257-40782482)
chr2 (5-233)||(22257985-22258210)
chr2 (5-232)||(25189183-25189407)
chr2 (5-234)||(23184395-23184620)
chr2 (5-234)||(23595658-23595883)
chr2 (5-234)||(24850757-24850983)
chr2 (5-221)||(13964069-13964282)
chr2 (5-234)||(10009841-10010068)
chr2 (5-237)||(9015459-9015688)
chr2 (5-234)||(24376887-24377110)
chr2 (5-206)||(30621024-30621225)
chr2 (5-206)||(30623645-30623846)
chr2 (9-234)||(24575818-24576040)
chr2 (5-234)||(21537339-21537567)
chr2 (5-234)||(19540199-19540425)
chr2 (7-230)||(22317380-22317600)
chr2 (5-225)||(22455081-22455296)
chr2 (5-234)||(39037733-39037959)
chr2 (5-237)||(20568841-20569070)
chr2 (5-233)||(41121810-41122034)
chr2 (5-230)||(28711789-28712012)
chr2 (15-230)||(6574226-6574439)
chr2 (5-146)||(28140710-28140851)
chr2 (102-233)||(17963454-17963584)
chr2 (15-231)||(38781184-38781397)
chr2 (5-230)||(40331874-40332096)
chr2 (5-230)||(31800978-31801200)
chr2 (19-230)||(34322041-34322249)
chr2 (5-230)||(28551009-28551231)
chr2 (5-230)||(31968134-31968356)
chr2 (5-230)||(33074013-33074235)
chr2 (5-230)||(44840221-44840443)
chr2 (15-230)||(6392421-6392633)
chr2 (15-227)||(1587133-1587342)
chr2 (5-167)||(22776379-22776542)
chr2 (5-167)||(22781757-22781920)
chr2 (15-230)||(30557421-30557633)
chr2 (29-234)||(19114867-19115069)
chr2 (5-151)||(20152117-20152263)
chr2 (17-226)||(22785758-22785963)
chr2 (29-224)||(26619215-26619406)
chr2 (15-179)||(31328066-31328232)
chr2 (15-179)||(31334787-31334953)
chr2 (15-230)||(22802248-22802460)
chr2 (5-167)||(35744091-35744254)
chr2 (29-225)||(22271925-22272118)
chr2 (15-144)||(23392769-23392898)
chr2 (5-163)||(1083864-1084023)
chr2 (66-224)||(18431091-18431245)
chr2 (5-69)||(24779288-24779352)
chr2 (85-167)||(14581358-14581441)
chr2 (102-225)||(24779166-24779286)
chr2 (22-144)||(22755337-22755459)
chr2 (5-56)||(25041457-25041508)
chr2 (22-144)||(24814691-24814813)
chr2 (58-225)||(44880961-44881124)
chr2 (60-224)||(18702533-18702693)
chr2 (10-133)||(28701325-28701448)
chr2 (12-146)||(20646657-20646790)
chr2 (22-146)||(22774404-22774527)
chr2 (73-138)||(10896596-10896661)
chr2 (151-230)||(28701449-28701526)
[»] chr1 (74 HSPs)
chr1 (5-237)||(20954539-20954771)
chr1 (5-232)||(1577654-1577881)
chr1 (7-234)||(19717309-19717536)
chr1 (5-234)||(22201802-22202028)
chr1 (5-234)||(33256417-33256643)
chr1 (5-234)||(33276589-33276815)
chr1 (5-234)||(48703989-48704218)
chr1 (7-234)||(12284211-12284435)
chr1 (5-234)||(28492470-28492695)
chr1 (9-231)||(30892884-30893102)
chr1 (5-237)||(21028579-21028807)
chr1 (13-234)||(26702203-26702421)
chr1 (15-237)||(16235372-16235591)
chr1 (5-230)||(1900137-1900359)
chr1 (15-231)||(22464885-22465098)
chr1 (46-237)||(12624663-12624850)
chr1 (5-234)||(2268319-2268545)
chr1 (5-230)||(38282359-38282581)
chr1 (5-234)||(36133977-36134204)
chr1 (5-234)||(22600248-22600474)
chr1 (5-231)||(22153648-22153871)
chr1 (5-234)||(10757211-10757435)
chr1 (12-233)||(7309608-7309827)
chr1 (10-231)||(22427428-22427647)
chr1 (15-230)||(2834481-2834693)
chr1 (5-230)||(29215588-29215811)
chr1 (5-227)||(35039962-35040180)
chr1 (15-237)||(17025039-17025257)
chr1 (5-230)||(21135226-21135448)
chr1 (5-230)||(21702606-21702828)
chr1 (15-161)||(23036605-23036751)
chr1 (5-230)||(25448632-25448854)
chr1 (10-230)||(32786008-32786226)
chr1 (10-230)||(2266881-2267098)
chr1 (5-233)||(21191931-21192156)
chr1 (5-230)||(30571989-30572211)
chr1 (5-230)||(46088781-46089003)
chr1 (15-167)||(42284479-42284632)
chr1 (15-229)||(14263528-14263741)
chr1 (15-167)||(2327516-2327669)
chr1 (5-179)||(19215450-19215626)
chr1 (15-230)||(21984387-21984599)
chr1 (5-167)||(39201058-39201218)
chr1 (5-230)||(10250778-10251000)
chr1 (15-144)||(35401683-35401812)
chr1 (5-230)||(21121130-21121352)
chr1 (5-179)||(23024626-23024802)
chr1 (5-230)||(48570297-48570519)
chr1 (66-233)||(18896723-18896886)
chr1 (15-122)||(34255592-34255700)
chr1 (29-98)||(17400897-17400966)
chr1 (67-225)||(20909206-20909359)
chr1 (5-144)||(17370917-17371056)
chr1 (80-166)||(37640862-37640948)
chr1 (83-167)||(44823906-44823991)
chr1 (5-164)||(19170400-19170560)
chr1 (5-146)||(44200886-44201025)
chr1 (12-144)||(20251651-20251781)
chr1 (67-138)||(18614782-18614853)
chr1 (12-146)||(28474101-28474234)
chr1 (12-144)||(5929580-5929710)
chr1 (12-144)||(22655352-22655484)
chr1 (12-144)||(28379871-28380002)
chr1 (67-221)||(17018381-17018531)
chr1 (12-144)||(52350759-52350889)
chr1 (124-229)||(21205058-21205160)
chr1 (112-229)||(21214850-21214964)
chr1 (22-144)||(21543904-21544026)
chr1 (12-144)||(19037882-19038014)
chr1 (112-167)||(21206806-21206862)
chr1 (73-144)||(22642770-22642841)
chr1 (15-61)||(21204998-21205044)
chr1 (12-144)||(22019211-22019343)
chr1 (22-146)||(675445-675568)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (5-232)||(18717-18944)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (5-235)||(6512554-6512784)
chr5 (5-234)||(17814749-17814979)
chr5 (5-234)||(89548-89774)
chr5 (5-234)||(21099830-21100056)
chr5 (5-234)||(6499024-6499250)
chr5 (5-234)||(12352921-12353147)
chr5 (9-233)||(23880853-23881074)
chr5 (5-171)||(21910401-21910567)
chr5 (5-237)||(21199129-21199357)
chr5 (5-234)||(26784138-26784365)
chr5 (5-234)||(23413100-23413327)
chr5 (5-225)||(7745819-7746036)
chr5 (5-194)||(9398860-9399047)
chr5 (12-237)||(642837-643057)
chr5 (9-234)||(19536431-19536650)
chr5 (15-237)||(25096961-25097182)
chr5 (15-237)||(25154931-25155152)
chr5 (5-231)||(20550682-20550906)
chr5 (74-231)||(25740911-25741065)
chr5 (15-231)||(13545648-13545861)
chr5 (29-234)||(21203796-21203997)
chr5 (5-230)||(29138532-29138754)
chr5 (10-230)||(33022456-33022670)
chr5 (43-195)||(41566693-41566845)
chr5 (15-167)||(35986368-35986520)
chr5 (5-133)||(41566560-41566688)
chr5 (5-234)||(21072366-21072590)
chr5 (5-230)||(4886811-4887033)
chr5 (15-179)||(21660047-21660213)
chr5 (5-230)||(28139396-28139618)
chr5 (5-230)||(28464465-28464686)
chr5 (15-230)||(30742770-30742982)
chr5 (5-230)||(30115963-30116184)
chr5 (5-230)||(10848562-10848784)
chr5 (5-230)||(11993677-11993899)
chr5 (5-230)||(14086665-14086886)
chr5 (15-230)||(15516758-15516971)
chr5 (5-230)||(9088758-9088980)
chr5 (5-230)||(35932132-35932354)
chr5 (15-165)||(26758999-26759151)
chr5 (15-166)||(23391740-23391892)
chr5 (5-230)||(25930282-25930503)
chr5 (5-230)||(3245567-3245789)
chr5 (15-230)||(26765287-26765500)
chr5 (5-230)||(33933057-33933278)
chr5 (73-230)||(13736326-13736481)
chr5 (5-230)||(31117666-31117888)
chr5 (126-234)||(31488033-31488138)
chr5 (60-179)||(16607350-16607469)
chr5 (15-230)||(42243470-42243682)
chr5 (119-233)||(22000297-22000408)
chr5 (22-144)||(25112021-25112143)
chr5 (22-144)||(25171112-25171234)
chr5 (5-163)||(11208111-11208270)
chr5 (73-144)||(32160638-32160709)
chr5 (12-144)||(1915290-1915421)
chr5 (12-144)||(13404989-13405120)
chr5 (5-144)||(23478241-23478380)
chr5 (73-144)||(23488387-23488458)
chr5 (12-144)||(40032899-40033030)
chr5 (12-144)||(40228532-40228663)
chr5 (12-134)||(20215249-20215371)
chr5 (72-135)||(34638337-34638400)
chr5 (67-122)||(2156463-2156518)
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (8-234)||(17668191-17668417)
chr3 (5-234)||(49642907-49643133)
chr3 (5-234)||(15902983-15903212)
chr3 (5-233)||(13780729-13780956)
chr3 (5-216)||(31303192-31303400)
chr3 (4-234)||(30000736-30000963)
chr3 (4-234)||(29951582-29951809)
chr3 (5-234)||(20645941-20646168)
chr3 (5-234)||(13948124-13948350)
chr3 (8-237)||(37467118-37467344)
chr3 (5-234)||(22804168-22804393)
chr3 (9-234)||(16658767-16658990)
chr3 (5-230)||(28581898-28582120)
chr3 (5-237)||(12963230-12963459)
chr3 (6-234)||(19889089-19889314)
chr3 (9-234)||(14393153-14393375)
chr3 (18-231)||(38177801-38178011)
chr3 (15-237)||(49553644-49553863)
chr3 (5-231)||(2560979-2561202)
chr3 (5-232)||(6090519-6090746)
chr3 (17-230)||(20627588-20627799)
chr3 (9-234)||(17239071-17239293)
chr3 (5-237)||(12389017-12389246)
chr3 (10-230)||(47405571-47405788)
chr3 (15-234)||(19249566-19249783)
chr3 (5-222)||(25398400-25398614)
chr3 (5-233)||(41494786-41495013)
chr3 (5-237)||(12726375-12726604)
chr3 (10-237)||(52920193-52920415)
chr3 (5-231)||(40799664-40799888)
chr3 (72-230)||(18142956-18143111)
chr3 (48-231)||(16812004-16812184)
chr3 (15-230)||(46350000-46350210)
chr3 (15-230)||(2784857-2785069)
chr3 (15-230)||(49666560-49666772)
chr3 (5-230)||(11868060-11868283)
chr3 (15-234)||(20724876-20725092)
chr3 (15-230)||(11223356-11223568)
chr3 (72-230)||(18121826-18121979)
chr3 (15-230)||(33583022-33583234)
chr3 (5-230)||(21605799-21606021)
chr3 (5-237)||(13823863-13824092)
chr3 (15-227)||(21640662-21640871)
chr3 (5-230)||(21636815-21637037)
chr3 (5-226)||(24775679-24775896)
chr3 (73-221)||(14969168-14969313)
chr3 (5-138)||(16032406-16032539)
chr3 (5-230)||(40850769-40850991)
chr3 (17-229)||(29855201-29855411)
chr3 (15-230)||(50300025-50300237)
chr3 (5-167)||(22140615-22140778)
chr3 (5-179)||(1728160-1728336)
chr3 (10-229)||(3238486-3238703)
chr3 (5-179)||(30054362-30054538)
chr3 (10-165)||(46796517-46796673)
chr3 (5-231)||(47207496-47207720)
chr3 (15-230)||(5213369-5213582)
chr3 (17-230)||(14955220-14955430)
chr3 (58-234)||(26417874-26418046)
chr3 (5-165)||(9700181-9700342)
chr3 (60-224)||(12968106-12968266)
chr3 (72-225)||(6253217-6253366)
chr3 (22-144)||(45861734-45861856)
chr3 (5-144)||(12752765-12752904)
chr3 (5-165)||(53056872-53057033)
chr3 (22-163)||(49990116-49990258)
chr3 (5-144)||(51340886-51341025)
chr3 (22-144)||(15833281-15833401)
chr3 (29-237)||(23538334-23538538)
chr3 (12-163)||(22151101-22151253)
chr3 (72-225)||(12396864-12397016)
chr3 (5-144)||(15850884-15851023)
chr3 (73-144)||(13148141-13148212)
chr3 (67-179)||(22766730-22766841)
chr3 (12-144)||(10529222-10529353)
chr3 (10-144)||(11909174-11909310)
chr3 (72-138)||(19198089-19198155)
chr3 (162-225)||(27374561-27374621)
chr3 (80-152)||(37412471-37412543)
chr3 (183-237)||(22128843-22128895)
chr3 (10-144)||(51989173-51989307)
chr3 (5-146)||(2246437-2246577)
chr3 (72-134)||(8729201-8729263)
chr3 (72-134)||(9081088-9081150)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (5-233)||(377655-377883)
scaffold0004 (5-234)||(220027-220253)
scaffold0004 (5-230)||(211193-211413)
scaffold0004 (29-234)||(244402-244603)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (5-233)||(12715554-12715782)
chr6 (5-232)||(18378101-18378329)
chr6 (5-233)||(19623769-19623994)
chr6 (5-233)||(19085948-19086173)
chr6 (5-233)||(13601960-13602187)
chr6 (5-234)||(15301989-15302215)
chr6 (5-234)||(15987022-15987248)
chr6 (5-230)||(24116621-24116843)
chr6 (5-234)||(20112834-20113059)
chr6 (5-195)||(23284390-23284579)
chr6 (5-234)||(25593857-25594083)
chr6 (5-225)||(32544063-32544280)
chr6 (5-230)||(9717636-9717858)
chr6 (5-230)||(29917810-29918032)
chr6 (10-231)||(18435348-18435566)
chr6 (15-230)||(15531768-15531980)
chr6 (21-234)||(21624890-21625100)
chr6 (5-230)||(26972360-26972582)
chr6 (15-231)||(14100583-14100795)
chr6 (15-234)||(19470456-19470676)
chr6 (5-230)||(16265284-16265506)
chr6 (5-230)||(33352060-33352282)
chr6 (5-167)||(20488052-20488215)
chr6 (10-230)||(20730843-20731060)
chr6 (15-195)||(21234949-21235129)
chr6 (15-227)||(21618039-21618248)
chr6 (5-230)||(16335919-16336142)
chr6 (10-229)||(17381316-17381531)
chr6 (32-230)||(16915217-16915411)
chr6 (10-179)||(17316664-17316835)
chr6 (5-159)||(26943437-26943591)
chr6 (5-167)||(19066152-19066315)
chr6 (5-231)||(19688571-19688790)
chr6 (5-230)||(15954499-15954718)
chr6 (19-230)||(19833180-19833388)
chr6 (5-230)||(22076541-22076763)
chr6 (5-166)||(19482605-19482767)
chr6 (5-164)||(12423116-12423276)
chr6 (15-231)||(22801932-22802146)
chr6 (5-225)||(14051515-14051729)
chr6 (103-227)||(16876699-16876821)
chr6 (5-144)||(20635595-20635734)
chr6 (80-179)||(26589438-26589538)
chr6 (22-144)||(17608457-17608579)
chr6 (22-225)||(14070213-14070410)
chr6 (5-144)||(7586292-7586429)
chr6 (5-144)||(21128103-21128241)
chr6 (60-222)||(19625609-19625769)
chr6 (67-179)||(25930316-25930427)
chr6 (67-144)||(30451732-30451809)
chr6 (67-134)||(32335714-32335781)
chr6 (5-110)||(16877123-16877228)
chr6 (5-144)||(22386678-22386817)
chr6 (71-138)||(23006249-23006316)
chr6 (71-138)||(23782050-23782117)
chr6 (22-124)||(11235541-11235642)
chr6 (67-138)||(16462847-16462918)
chr6 (73-144)||(19452722-19452793)
chr6 (79-138)||(19875714-19875773)
chr6 (67-138)||(23296605-23296676)
chr6 (5-123)||(25675204-25675321)
chr6 (5-123)||(25735594-25735711)
chr6 (67-179)||(7811853-7811965)
chr6 (72-138)||(17927671-17927737)
chr6 (15-60)||(13435492-13435537)
chr6 (15-146)||(11205966-11206096)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (5-237)||(59802-60031)
scaffold0026 (9-234)||(7715-7937)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (5-234)||(14437-14663)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (5-234)||(49121-49347)
scaffold0084 (5-237)||(32271-32500)
scaffold0084 (5-144)||(467-606)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (5-234)||(26071-26297)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (5-201)||(12028-12224)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (4-234)||(2087-2314)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (5-234)||(264-490)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (9-234)||(1479-1701)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (17-225)||(9705-9909)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (5-225)||(5786-6003)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (5-234)||(9744-9971)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (5-231)||(21067-21290)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (5-234)||(13360-13586)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (10-234)||(1449-1670)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (5-237)||(19568-19794)
scaffold0035 (5-230)||(99301-99523)
scaffold0035 (67-225)||(29592-29746)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (5-234)||(7614-7839)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (11-224)||(5807-6016)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (9-230)||(142890-143108)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (5-231)||(212149-212369)
scaffold0005 (12-144)||(61098-61229)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (10-237)||(9690-9913)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (5-230)||(18824-19046)
scaffold0217 (5-230)||(22227-22449)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (9-234)||(14906-15128)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (5-237)||(9755-9984)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (5-230)||(84187-84410)
scaffold0009 (67-225)||(268579-268734)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (15-195)||(7531-7710)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (10-233)||(74371-74591)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (19-234)||(103361-103572)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (15-231)||(37194-37407)
scaffold0022 (15-231)||(135254-135467)
scaffold0022 (10-98)||(158977-159065)
scaffold0022 (147-233)||(158899-158981)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (5-230)||(90151-90373)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (10-230)||(78467-78685)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (5-171)||(10204-10370)
scaffold0161 (5-171)||(14868-15034)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (15-234)||(44024-44241)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (16-229)||(215604-215814)
scaffold0012 (13-146)||(7722-7855)
scaffold0012 (5-123)||(127721-127838)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (10-230)||(1800-2017)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (15-167)||(5431-5583)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (5-231)||(27525-27748)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (5-227)||(60599-60818)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (5-230)||(17861-18083)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (80-237)||(3010-3164)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (15-230)||(926-1138)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (15-227)||(2779-2987)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (5-131)||(15682-15808)
scaffold0193 (67-219)||(16298-16444)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (5-231)||(22467-22691)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (5-230)||(5799-6021)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (5-230)||(2826-3048)
scaffold0280 (12-146)||(17909-18043)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (10-230)||(8948-9165)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (79-231)||(36904-37053)
scaffold0120 (79-231)||(41952-42101)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (20-230)||(7269-7476)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (28-234)||(40428-40631)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (15-166)||(576-728)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (29-234)||(1640-1841)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (5-230)||(65502-65723)
scaffold0011 (5-230)||(144547-144768)
scaffold0011 (67-225)||(59356-59509)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (10-230)||(3098-3314)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (5-230)||(751-973)
scaffold1359 (5-123)||(1851-1969)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (15-230)||(6846-7059)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (58-234)||(5418-5590)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (27-234)||(1107-1311)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (27-234)||(100-304)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (10-230)||(5703-5920)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (5-141)||(2787-2923)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (5-179)||(7220-7396)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (5-167)||(87696-87859)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (5-230)||(34900-35122)
scaffold0056 (5-167)||(25761-25924)
scaffold0056 (48-179)||(36321-36451)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (60-224)||(144705-144866)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (5-230)||(15835-16056)
scaffold0247 (5-230)||(25495-25716)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (15-144)||(10595-10725)
scaffold0207 (15-144)||(20496-20626)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (15-144)||(38190-38319)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (60-179)||(462-581)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (60-224)||(1945-2105)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (22-144)||(16831-16953)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (22-144)||(6635-6757)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (23-144)||(1049-1170)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (23-144)||(1242-1363)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (67-225)||(31942-32099)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (12-146)||(40416-40550)
scaffold0017 (23-146)||(58973-59096)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (74-225)||(2458-2604)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (80-167)||(12050-12138)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (22-141)||(7163-7282)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (13-144)||(4993-5124)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (73-144)||(4060-4131)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (22-144)||(1118-1238)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (73-144)||(20540-20611)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (73-144)||(156790-156861)
scaffold0002 (12-144)||(475353-475485)
scaffold0002 (12-144)||(481873-482005)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (12-144)||(61608-61740)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (73-225)||(19870-20014)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (10-144)||(1898-2034)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (73-144)||(11637-11708)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (5-146)||(40554-40694)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29693322 - 29693093
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29693322 actcagtttgtgtctctgctacaggacaaggataacaactatgcctgcaacaatgttccttcatacatggaatggatttgaaattgatccttcataggac 29693223  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29693222 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 29693123  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29693122 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 29693093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39693542 - 39693311
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39693542 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgcaacaatgttcctacatacatggaaaggatttgaaattgatccttcagaggac 39693443  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39693442 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttc-aacgactatattttgatgtgctggcaatgtgacaacatctcttttctacacct 39693344  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39693343 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 39693311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24646345 - 24646116
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24646345 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctccgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcagaggtc 24646246  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24646245 aatcaccatatcagaaaaaagatcattagtgattgatccaagcttcaaacgactcaattttgatgtgttggcaatctgacaacgtctcttttctacacct 24646146  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24646145 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 24646116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 17525873 - 17526101
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  17525873 actcagtttgtgtctctactacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatagatttgaaattgattcttcagaggac 17525972  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    || |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17525973 aacaaccatattaggaaaaagattattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaatgtgacaatgtctcttttctacacct 17526072  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  17526073 ctatataaatgagtgaagacttagagaat 17526101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 17441951 - 17442178
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17441951 actcattttgtgtctctactacaagacaaggataacagctccgtctgcaacgatgttcctacatattgggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 17442050  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17442051 aataaccatatcaggcaaacgatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaatgtgacaacgtctcttttctacacct 17442150  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||  |||||||||| ||||| | ||||||    
T  17442151 cta--taaaggagtggagacttaaagaatg 17442178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43644903 - 43644676
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  43644903 actcggtttgtgtctctgctacaggacagagataacaactatgcctgtaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 43644804  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  43644803 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttttc-acacct 43644706  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  43644705 ctgtataaatgagtgaagacttagagaatg 43644676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 12757907 - 12758124
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12757907 actcagtttgtgtctctactacaagacaaggataacagctccgcctgcaataatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 12758006  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  12758007 aataaccatatcagaaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 12758103  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  12758104 ctatataaagaagtgaagact 12758124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25164077 - 25163848
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25164077 actcaatttgtgtctctgctacaagacaagaataacagttatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 25163978  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  25163977 aataaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-ttacaatgtctcttt--cacacct 25163881  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25163880 ctatataaaggagtgacgacttagagaatgaca 25163848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17267481 - 17267255
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17267481 actcagtttttgtctctgccacaagacaaggataacagctctgcctccaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 17267382  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  17267381 aataaccttattaggtaaaagatctttagtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 17267285  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17267284 ctatataaaggagtgaagacttaaagaatg 17267255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 18321303 - 18321529
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  18321303 actcagtttgtgtctctactacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaaagttccttcatacttggaatggatttgaaattgatcctccataggac 18321402  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  18321403 aagaaccatatcaggcaaaagattattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 18321499  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  18321500 ctatataaaggagtgaagacttaaagaatg 18321529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 20382540 - 20382764
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| | |||||    
T  20382540 tcagtttgtgtctctgcaacaagagaagaataacagctctgcctgcaagaatgttcctacatattgggaatggattttaaattgatccttcataggacaa 20382639  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||    
T  20382640 taaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaatgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctct 20382736  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||    
T  20382737 atataaaggagtgaagacttagagaatg 20382764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 16681447 - 16681673
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16681447 actcagtttgtgtctctgctacaagacatgaatgacagctctccctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 16681546  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  16681547 aataaccatatcaggcaatagatcattggtgattgattaaagcttcaatcgactatattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 16681643  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  16681644 ctatataaaggagtcaagacttagagaatg 16681673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16188991 - 16188767
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16188991 actcagtatgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaactatgttccctcttaattggaatggatttgaaattgatccttcataggac 16188892  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| | |||||||||||||   |||||    
T  16188891 aataaccatatcaggcaaaagatcgttggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgatgtgccgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 16188795  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16188794 tctatataaaggagtgaagacttagaga 16188767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 235
Target Start/End: Original strand, 20255675 - 20255882
Alignment:
Q  25 acaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||  ||||    
T  20255675 acaagacaaggataacagctcttcctgcaacaatgttcatacatacatggaatggatttgaaatttatccttcgtaggacaataaccatatgagaaaaaa 20255774  T
Q  125 tatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  20255775 tatcattggtgattgatcaaagcttgaaacgactctatcttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagac 20255871  T
Q  225 tcagagaatga 235  Q
    | |||||||||    
T  20255872 ttagagaatga 20255882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33082863 - 33082645
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  33082863 tgtctctgctacaagacaaggataacatctctgcctgcaacggtgttccctcagacttggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaa 33082764  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttc-aaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  33082763 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaagcttcaaaacgactctgttttgatgtgctggcaatttcacaacgtctcttt--cacacctctatataaa 33082666  T
Q  214 ggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  33082665 ggagtgaagacttagagaatg 33082645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17701752 - 17701521
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaac-----aatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||     ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  17701752 actcagtttgtgtctctgctacaggacaagaataacagctacgtctgcaacaatataatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcat 17701653  T
Q  100 atgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttcta 199  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||   |    
T  17701652 aggacaacaaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactatattttaatgtgatggcaat-tcacaacatctcttt--ca 17701556  T
Q  200 cacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17701555 cacctctatataaaggagtgaagactcagagaatg 17701521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 18121250 - 18121472
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  18121250 actctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 18121349  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  18121350 aataaccatatcagtcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 18121446  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  18121447 ctatataaaggagtgaagacttagag 18121472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19943231 - 19943016
Alignment:
Q  16 gtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatat 115  Q
    |||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19943231 gtctctcctacaagacaagaaaaccagctctgcctgcaacgatgttccttcacaattggaatagatttgaaattgatccttcataggacaataaccatat 19943132  T
Q  116 caggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||  ||| ||||||    
T  19943131 caggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacaccgttatataaagg 19943035  T
Q  216 agtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  19943034 agtgaagacttagagaatg 19943016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21932890 - 21932701
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21932890 actcagtgtttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 21932791  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21932790 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt 21932701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18719008 - 18718784
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  18719008 actcagtttgtgtctctgctaaaagacaagaataacagctctgcctacaacaatgtttctacatactgagaatggatttgaaattgatctttcataagac 18718909  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  18718908 aataaccatatcaggaaaaagatcattagtgattgatcaaagcttcaaacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 18718812  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||   |||||||||| ||||||||    
T  18718811 tctatataa---agtgaagacttagagaatg 18718784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19707513 - 19707285
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19707513 actcagtttgtgtctctactacaggacaagaataacaactaggcctggaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 19707414  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| | ||  |||||||||   ||||||    
T  19707413 aataaccatataagacaaaagatcattggtgattgatcaaaacttcaaacgactct-ttttgatgtgctgacaat-tcacctcgtctcttt--cacacct 19707318  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19707317 ctatataaaggagtgaagacttagagaacgaca 19707285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18679822 - 18679595
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  18679822 actcagtttgtgtctctgcttaaagacaagaataacagctttgcctgcaacaatgtttctacatagtgggaatggatttgaaattgatctttcataagac 18679723  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||    
T  18679722 aataaccatatcaggcaaaagatcattagtgattgataaaatcttcaaacgactcttattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 18679626  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  18679625 tctatataaaggactgaagacttagagaatg 18679595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16207313 - 16207086
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  16207313 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcaacgatgttccttcaca-atgtgaatggatttgaaattgatccttcgtagga 16207215  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||| ||||   ||||    
T  16207214 caataaccatatcatgcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgatttgctggcaat-tcacaacgtcacttt--cacac 16207118  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16207117 ctctatataaaggactgaagactcagagaatg 16207086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 15336232 - 15336455
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  15336232 actctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 15336331  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||    
T  15336332 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgactgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttttc-acac 15336427  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  15336428 ctttatataaaggagtgaagactcagag 15336455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 15425297 - 15425520
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  15425297 actctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 15425396  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||    
T  15425397 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgaatgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttttc-acac 15425492  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  15425493 ctttatataaaggagtgaagactcagag 15425520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 15516601 - 15516824
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  15516601 actctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 15516700  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| ||||    
T  15516701 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgactgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttttc-acac 15516796  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  15516797 ctttatataaaggagtgaagactcagag 15516824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 30421573 - 30421796
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||   |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  30421573 actctgtttttgtctctgcaacaagacaagaaaaacagctcttcctgcatagatgttccttcacaataggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 30421672  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||   |||||    
T  30421673 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 30421769  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30421770 tctatataaaggagtgaagacttagag 30421796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 23263761 - 23263982
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| ||| ||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  23263761 gtttttgtttctactacaagaaaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatccatcataggacaataa 23263860  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||     
T  23263861 cgatatcatacaaaagatcattggtgattgatcaaaacttcaaacgactctaatttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctata 23263957  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  23263958 taaaggagtgaagacttagagaatg 23263982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 19956494 - 19956708
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||   |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19956494 tgtctctgcaacaagacaagaataacagttatgcctgcaac---gttcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 19956590  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || || |||||||||| |||||||   |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  19956591 tcaggcaaaagatcattggtgatttgatc-aagtttcaaacgacacttttttgatgtgctggcaattaaacaacgtctcttt--cacacctctatataaa 19956687  T
Q  214 ggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  19956688 ggagtgaagacttagagaatg 19956708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6407733 - 6407511
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| || |  | | |||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  6407733 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactttgcctgcaacaatgtttcttctcaaagggaatacatttgaaattgatccttcataggac 6407634  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||    ||||||||||||   ||||    
T  6407633 aataaccatatcaggaaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgcgggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 6407539  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6407538 ctctatataaaggagtgaagactcagag 6407511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 45538583 - 45538805
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| |||| |||||||||||||  | |||    
T  45538583 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttaaaattgatccttcttaggac 45538682  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||     
T  45538683 agtaaccatatgaggcaaaatatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacaactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacat 45538777  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45538778 ctctatataaaggattgaagactcagag 45538805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45292837 - 45292679
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat--ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaat 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||  |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45292837 gtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtt--tactcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaat 45292740  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa-agcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45292739 aaccatatcaggcaaaagatcattggtgatagatcaagagcttcaaacgactctattttga 45292679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43639779 - 43639567
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43639779 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 43639680  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  43639679 tcaggcaaaggatgattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgaca---tttcaacgtctcttt--cacacctctatataa 43639585  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||||||||||||||    
T  43639584 agtagtgaagactcagag 43639567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 40845531 - 40845753
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| ||||  ||||||||||||||||||  | ||    
T  40845531 actctgtttttgtctctgctacaagagaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgttccttctca-atgagaatatatttgaaattgatccttcttagga 40845629  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||||   |||    
T  40845630 caataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaatcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---ccaacgtctcttt--caca 40845724  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40845725 cctctatataaaggagtgaagactcagag 40845753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 13430772 - 13430994
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  13430772 actctgtttttgtccctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataagac 13430871  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  13430872 aataaccatatcaggcaaatgatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 13430966  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13430967 ctctatataaaggagtgaagactcagag 13430994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 14989595 - 14989816
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |  |   |||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  14989595 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttctcaatgggaatacatttgaaattgatccttcataggac 14989694  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |   |||||||||||   ||||    
T  14989695 aataaccatatcaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttc-aacgactctattttgaatgtgctggcaattt---aacgtctcttt--cacac 14989788  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||    
T  14989789 ctttatataaaggagtgaagactcagag 14989816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22673780 - 22673564
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |  |   |||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  22673780 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcaacattgttccttctcaatgggaatacatttgaaattgatccttcgtaggacaataa 22673681  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||    
T  22673680 ccatatcaggcaaagaatcattgatgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctcta 22673586  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcaga 229  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  22673585 tataaaggagtgaagactcaga 22673564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17797429 - 17797206
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||| || || || |||| |||||||| || |   ||| || |||||||||||||| |||| | |||    
T  17797429 actctgtttttgtctctgctataagacaagaaaaacagctatgactacaacgatgttccttcacaatgggagtgcatttgaaattgatcattcataggac 17797330  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  17797329 aataactatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaacttcaaacgactatattttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 17797233  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17797232 tctatataaagaagtgaagactcagag 17797206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1237634 - 1237481
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| ||||    
T  1237634 tgtctctgctacaagagaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatctttcttaagacaataatcata 1237535  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1237534 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 1237481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 18685562 - 18685766
Alignment:
Q  27 aagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaata 126  Q
    |||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||  ||||| |    
T  18685562 aagacaagaataacatctatgtttgcaacgatgttcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaattaacaaatcatacaaaaga 18685661  T
Q  127 tcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||    
T  18685662 tcattggtgatttaatcaaa-cttcaaacgactctattttgatgtgttgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggggtgaagact 18685757  T
Q  226 cagagaatg 234  Q
     ||||||||    
T  18685758 tagagaatg 18685766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 18731156 - 18731360
Alignment:
Q  27 aagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaata 126  Q
    |||||||| |||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||  ||||| |    
T  18731156 aagacaagaataacatctatgtttgcaacgatgttcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaattaacaaatcatacaaaaga 18731255  T
Q  127 tcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||    
T  18731256 tcattggtgatttaatcaaa-cttcaaacgactctattttgatgtgttgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggggtgaagact 18731351  T
Q  226 cagagaatg 234  Q
     ||||||||    
T  18731352 tagagaatg 18731360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 23185375 - 23185520
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataa-caactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || || |||| |||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23185375 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctcttcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaata 23185474  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaac 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23185475 accatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaac 23185520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 24833210 - 24833376
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||  | |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  24833210 tgtctctgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttcctttacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacagtaaccata 24833309  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  24833310 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat 24833376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26832982 - 26832836
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  26832982 atacttggaatggatttgaaattgttccttcataagacaataaccatatcaggcaacaaatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactctttttt 26832884  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagga 216  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  26832883 gatgtgctggcaat-taacaacgtctcttt--cacacctctatataaagga 26832836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 33560359 - 33560535
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||  | || |    ||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  33560359 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaacaatgtttatgcacattgagaatgcatttgaaatggatccttcatagga 33560458  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  33560459 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgatttataaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 33560535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9320566 - 9320354
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||| || || |   |||||| |||||||||||||| |||  | ||||| |||||||    
T  9320566 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctgtgactgcaacaatgtttcttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaacaaccata 9320467  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  9320466 tcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaatgactctaatttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctc-tttct-cacctctatataa 9320372  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||| || ||||||    
T  9320371 aggagtgaggaatcagag 9320354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36105197 - 36104981
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||| | || | | |||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  36105197 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttctttca-ata-ggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataa 36105100  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgat--caaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||||||    
T  36105099 ccatatcaggcaaaggatcattggtgattgattaaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctct 36105005  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || | ||| |||||||||| ||||    
T  36105004 attttaagaagtgaagactgagag 36104981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17914466 - 17914372
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcag 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17914466 actcaatttgtttctctgctacaagccaatgataacaactctacctgcaataatgttcttacttacatggaatggatttgaaattgatccttcag 17914372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1745166 - 1744942
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataa-caactctgcctgca-acaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatg 102  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  |||| |   |||| | |||| ||||||||| |||| | |    
T  1745166 actctgtttctgtatctactacaagacaagaaaaaacagctctgcctgcagacaatgtttatacacattgggaacgcatttaaaattgatcattcatagg 1745067  T
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |  ||||||||||||   ||    
T  1745066 acaataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgtatgtgttgaca---tttcaacgtctcttt--cac 1744972  T
Q  201 acctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1744971 acctctatataaaggagtgaagactcagag 1744942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19156203 - 19156139
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19156203 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaattttcctacata 19156139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22663113 - 22662901
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| || || ||||||| |  |   |||||  ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  22663113 tgtctctactacaaaacaagaaaaacagctctgcctacagcattgttccttctcaatgggaatacatttgaaattgatccttcgtagaacaataaccata 22663014  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    |||  |||||||   |||||||||| |||    
T  22663013 tcaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat---tcaatatctcttt--cacacctctatataa 22662919  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22662918 aggagtgaagactcagag 22662901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21288400 - 21288270
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | || |   | || | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  21288400 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaaacaatgtttatgcacattggaaacgcatttgaaattgatccttcataggacaacaaccaa 21288301  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21288300 atcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 21288270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24551276 - 24551063
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||| || |   |||||| |||||||||||||| |||  | || |||||    
T  24551276 gtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctacaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggaaaataa 24551177  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||    
T  24551176 ccatatccgacaaaagatcatcggtgattgatcaaaaccttcaaacgactcaattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctcta 24551082  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactc 226  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  24551081 tataaaagagtgaagactc 24551063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19156135 - 19156023
Alignment:
Q  119 gcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||   |||||||||| |||||||||    
T  19156135 gcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgcttgcaat-tcacaacatctcttt--cacacctctatataaaggagt 19156039  T
Q  219 gaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||| || |||||    
T  19156038 gaagacttagggaatg 19156023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 22461848 - 22462007
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgt 170  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  22461848 tggaatgtatttgaaattgatttttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttttgatat 22461945  T
Q  171 gttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
       ||||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22461946 tgcggcaattcaacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagagaatg 22462007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43774051 - 43773951
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaa 178  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  43774051 atttgaaattgattcttcataggacaataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgatttatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaa 43773952  T
Q  179 t 179  Q
    |    
T  43773951 t 43773951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21540942 - 21540820
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  21540942 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataaatgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggca 21540843  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  21540842 aaagatcattggtgattgatcaa 21540820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 18151790 - 18152009
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataa-caactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| || |  |   |||||  |||||||||| |||||||| | ||    
T  18151790 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttctcaatgggaatacatttgaaatttatccttcatagga 18151889  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||    
T  18151890 caataaccatataaggcaatgaatcattcatgattgatcaaaagctt-taacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--caca 18151983  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18151984 cctctatataaaggagtgaagactca 18152009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28903450 - 28903328
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  28903450 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggc 28903352  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  28903351 aaaagatcattggtaattgatcaa 28903328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 45568045 - 45568184
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  |||| |||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||  || |   ||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  45568045 actctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaatgtgatccttcataggac 45568144  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45568145 aacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 45568184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21298944 - 21298880
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21298944 atttgaaattgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 21298880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 23271271 - 23271404
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    |||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  23271271 tgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaatttgatccttcataggacaacatcc 23271369  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  23271370 aaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaag 23271404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 602864 - 602923
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcct 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  602864 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataatagctctgtctgtaacaatgttcct 602923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 7018440 - 7018580
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  7018440 actctgtttgtgtctacgctacaagacaag-acaacagctttgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcatagga 7018537  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | | | ||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  7018538 ctacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaag 7018580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 17917036 - 17917180
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgt 172  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||     
T  17917036 ggaatgaatttaaaattgttccctcctaagacaataaccaaatcaagcaacatatcattgatgatt-atc-aagcttc-aacgactc--ttttgatgtgg 17917130  T
Q  173 tggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17917131 tggcaat-caacaacgtctcttt--tacacctctatataaaggagtgaagact 17917180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8032034 - 8031902
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||| ||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  8032034 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 8031936  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  8031935 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 8031902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 17519209 - 17519341
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| |||| ||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||   |    
T  17519209 ttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttc 17519307  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  17519308 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 17519341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40003228 - 40003097
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  | || ||||  | ||||| | ||    
T  40003228 tgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtaattcttcttaggacaacatcc 40003130  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40003129 aaatcagacaaaagatcattggtgattgatcaa 40003097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 21301019 - 21300980
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21301019 tgtctctgctacaagacaaggataactgctctgcctgcaa 21300980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18557959 - 18557812
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaac-tctattttgatgtg 171  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||  || ||||||||||    
T  18557959 ggaatggatttgaaattgttccctcctaagacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatt-atc-aagctt-taacaacgactcttttgatgtg 18557863  T
Q  172 ttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
     |||||||   ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18557862 ctggcaat-caacaacatctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 18557812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 238
Target Start/End: Original strand, 2913755 - 2913988
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2913755 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgatcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 2913854  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2913855 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatgtgacaacatctcttttctacacct 2913954  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgacat 238  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2913955 ctatataaaggagtgaagacttagagaattacat 2913988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 13138042 - 13138262
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  13138042 actcagtttatgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatcctacataggac 13138141  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13138142 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatatgacaacatctcttttctacacct 13138241  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
     ||| ||||| ||||||||||    
T  13138242 atatataaagaagtgaagact 13138262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13880115 - 13879888
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13880115 actcactttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctccgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 13880016  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13880015 aataaccatatcaggaaaaagattattggtgattgatcaaaacttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatgtgacagcgtctcttttctacacct 13879916  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    || | |||||||||||| ||| ||||||    
T  13879915 ctctataaaggagtgaaaacttagagaa 13879888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11319416 - 11319190
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11319416 actcagtttgtgtctctactacaagacaaggataacagtcctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaatttgatccttcatatgac 11319317  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  11319316 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 11319220  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11319219 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 11319190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 41842420 - 41842649
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  41842420 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctttatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggat 41842519  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||   || |||    
T  41842520 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggatat-tcacaacgtctcttt--cacgcct 41842616  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41842617 ctatataaaggagtgaaaactcagagaatgaca 41842649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11792919 - 11792692
Alignment:
Q  4 cactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  11792919 cacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgcaacaatgttccttcatactttgaatggatatgaaattgatccttcatagga 11792820  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||   |||||    
T  11792819 caataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgatggaaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 11792723  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11792722 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 11792692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30025916 - 30025693
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30025916 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaattagaatggatttgaaattgatccttcagatgac 30025817  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  30025816 tataaccatatcaggcaaaagatcgttggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtactggaaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 30025720  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||    
T  30025719 ctatataaagaagtgaagacttagaga 30025693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13302821 - 13302633
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13302821 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgcaacaatgttcctacatac-tggaatggatttgaaattgatccttcataggac 13302723  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  13302722 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt 13302633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21692298 - 21692070
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21692298 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagtataacatctctgcctgcaacattgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 21692199  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||     
T  21692198 aataaccatatcaggcaaaagatcatcggtgattgatcaaagctt-gaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacca 21692103  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21692102 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 21692070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 10883320 - 10883546
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  10883320 actcagtttgcgtctctgctacaagacaagaataacagatctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaatttgatccttcataggac 10883419  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||| ||    
T  10883420 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattaataaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacaact 10883516  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  10883517 ctatataaaggagtgacgacttagagaatg 10883546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 13730822 - 13731051
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | |||    
T  13730822 actcagtttgtgtctctgttacaagacaaggataatagctctgcttgcaacgatgttcctacatactgggaatggattttaaattgatctttcataggac 13730921  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13730922 aataaccatatcaagcaaaagaccattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgtcaat-tcacaacgtctcttttctacacct 13731020  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatga 235  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  13731021 ctatataaaggagcgaaaacttagagaatga 13731051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 13033989 - 13034215
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13033989 actcagtttgtgtctctgctacatgacaagaataacagctacgcctgcaacaaagttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 13034088  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    || |||||||   ||||||    
T  13034089 aataaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaattt----acatctcttt--cacacct 13034182  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13034183 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 13034215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Original strand, 13260765 - 13260988
Alignment:
Q  8 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13260765 cagtttgtgtctctgctacaagacaagaataatgcctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaat 13260864  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||    
T  13260865 aaccatatcaggaaaaagatcattggtgaatgatcaaagcttcaaaagaatctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctcta 13260961  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||    
T  13260962 tataaaggagtgaagacttagagaatg 13260988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13683605 - 13683380
Alignment:
Q  6 ctcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgaca 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  13683605 ctcattttgtgtctctgctacaagacaaggaaaacaactctgcctgcaacaatgttcctacatactaggaatggatttgaaattgatccttcataggaca 13683506  T
Q  106 ataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctc 205  Q
    || |||||||||||||||| || |||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||   || ||||    
T  13683505 atgaccatatcaggcaaaagattattggcaattgataaaatcttcaaacgactctattttgatgtgttggaaat-tcacaacgtctcttt--cactcctc 13683409  T
Q  206 tatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13683408 tatataaaggagtgaagacttagagaatg 13683380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 16310054 - 16310280
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16310054 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacaactctgtctgcaacaatgttcccttatacttggaatggatttgaaattgatccttcttaggac 16310153  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |   ||||||    
T  16310154 aataaccatatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgatggaaat-tcacaacgtctctct--cacacct 16310250  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  16310251 ctatataaaggagtgatgacttggagaatg 16310280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4494578 - 4494365
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4494578 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgattttccttcacaattggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 4494479  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  4494478 tcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 4494382  T
Q  215 gagtgaagactcagaga 231  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  4494381 gagggaagacttagaga 4494365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 5000969 - 5001198
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  5000969 actcagtttgtgtctctactacaagacaagaataacaactttgcctgcaacaatgttcctacatactaggaatgaatttgaaattgatctttcatatgac 5001068  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgac-aacgtctcttttctaca 201  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| | || |||||||||||   |||    
T  5001069 aataatcatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcagacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaaacgtctcttt--caca 5001165  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5001166 cctctatataaaggagtgaagacttagagaatg 5001198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 16316704 - 16316930
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| |||  | |||    
T  16316704 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaacagcagctcttcctgcaacaatgttcccttatacttggaatggatttgaaattaatcattcttaggac 16316803  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |   ||||||    
T  16316804 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctctct--cacacct 16316900  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16316901 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 16316930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 33691859 - 33692081
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  33691859 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcatgggac 33691958  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  33691959 aataaccatatcaggcaaaagaccattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 33692055  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  33692056 ctatataaaggagtgaagacttagag 33692081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 16314708 - 16314913
Alignment:
Q  26 caagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaat 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||     
T  16314708 caagacaaggataacagctctgcctgcaacaatattcctacatattgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccatgtcaggcaaaag 16314807  T
Q  126 atcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||    
T  16314808 atcattggtcattgatcaaagcttaaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctataaaaaggagtgaagact 16314904  T
Q  226 cagagaatg 234  Q
     ||||||||    
T  16314905 tagagaatg 16314913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2500049 - 2499825
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  | |  |||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  2500049 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctacaacgatgttcctttacaattggaatggatttgaaattgatcatttagaggac 2499950  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   |||||    
T  2499949 aataaccatatcaggaaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacc 2499853  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2499852 tctatataaaggagtgaagacttagaga 2499825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 331653 - 331466
Alignment:
Q  8 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |   ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||      
T  331653 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggttttcaaattgatccttcataggacatc 331554  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  331553 aaccaaatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatttcacaacgtctcttt 331466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 13472667 - 13472881
Alignment:
Q  16 gtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatat 115  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| || |||||    
T  13472667 gtctctgctacaggacaaggatagcagctatgcctgcaacaatggtccttcatacttggaatggatttgaaattgatcattcataggacaacaa-catat 13472765  T
Q  116 caggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  13472766 caggcaaaagatcattggtgattgatcaaaggttcaaccgactctattttgatgtgttggc-atttcacaacgtctcttt--cacacctctatataaagg 13472862  T
Q  216 agtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13472863 agtgaagactcagagaatg 13472881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 16112031 - 16112254
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  16112031 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcataatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 16112130  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||  | |||| ||||||||   ||||||    
T  16112131 attaaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtactggaaaattcacaatgtctcttt--cacacct 16112228  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  16112229 ctatataaaggagtgaagactcagag 16112254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 39284711 - 39284937
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||    
T  39284711 actcagtttgtgtctctactacaggacaaagataacagctatgcctgcaacattgttccttcatacttggaacggatttgaaattgatccttcatagaac 39284810  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   | ||||    
T  39284811 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgataaaagtttcaaacgactgtattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--caaacct 39284907  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  39284908 ctatatataggagtgaagacttagagaatg 39284937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 12366897 - 12367121
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  12366897 tcagtctgtgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttcctacatacttggaatggatttgaaattgatcgttcataggacaa 12366996  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | ||||||||| |||   ||||||||    
T  12366997 taaccatatctggcaaaagatctttggtgattaatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtactgacaat-tcacaacgtctattt--cacacctct 12367093  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || |||| ||||||||||| | ||||||    
T  12367094 atataaaagagtgaagacttacagaatg 12367121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44467075 - 44466851
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44467075 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacgatgttccttcacaaattggaatggatttgaaattgatccttcatagga 44466976  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   | |||    
T  44466975 caataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--catacc 44466879  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  44466878 tctatataaagttgtgaagacttagaga 44466851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Original strand, 13018652 - 13018867
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13018652 actcagtttgtgtctgtgctacaggacaagaataacagctacgactgcaacaattttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 13018751  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  13018752 aataaccaaatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgtcaat-ttacaaagtctcttt--cacacct 13018848  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaaga 223  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  13018849 ctatataaaggagtgaaga 13018867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 48237054 - 48237274
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagat--gacaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  48237054 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgcatttgaaattgacccttcatataggacaat 48237153  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||    
T  48237154 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctct 48237250  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  48237251 atataaaggagtgaagactcagag 48237274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15088516 - 15088337
Alignment:
Q  49 ctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagct 148  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15088516 ctgcaacaatgttccttcacaattggaatggatttgaaattgatccttcagaggacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagct 15088417  T
Q  149 tcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||   ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  15088416 tcaaacgactctattttgatgtgctggaaat-tcacaacgtctcttt--cacaactctatataaagaagtgaagacttagaga 15088337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9069573 - 9069351
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||| | | |||    
T  9069573 actcagtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatggatttgaatttgatcctttataggac 9069474  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||   ||||||    
T  9069473 aataaccatatcaggcaaaagatcgttggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgttggcaat-tcacattgtctcttt--cacacct 9069377  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  9069376 ctatataaaggagtgaagacttagag 9069351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21695412 - 21695255
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21695412 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacattgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 21695313  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatt 163  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  21695312 aataaccatatcaggcaaaagattattggtgattgataaaagc-tcaaacgactctatt 21695255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24788152 - 24787927
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | || | |||||||| |||| |||||||  |  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  24788152 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaatagctctgcctacaacgatgttccctctaaattggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 24788053  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  24788052 aataaccatatcaggcaaaata-cattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 24787957  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24787956 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 24787927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28409050 - 28408824
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28409050 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaagcaactctgcatgcaacgatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatcctttagaggac 28408951  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  28408950 aataaccatatcagacaaaagattattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacct 28408854  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28408853 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 28408824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 30945508 - 30945726
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||  || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  30945508 gtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccctcagaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataa 30945607  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||   ||||||||||    
T  30945608 ctatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacctctat 30945704  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  30945705 ataaaggagtgaagactcagag 30945726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 23280116 - 23280328
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23280116 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 23280215  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||| |||||    
T  23280216 tcaggcaaaagatcattgctgattgatcaaagtttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--aacacatctatataaag 23280312  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  23280313 gagtgaagacttagag 23280328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 21283520 - 21283743
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||  |  |  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  21283520 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaactatgtcccctctcaattggaatggatttgaaattgattcttcataggac 21283619  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  21283620 aataaccatatcaggcaaaagatcattggagattgatcaaagcttcaaacgactttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 21283716  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  21283717 ctatataaaagagtgaagacttagaga 21283743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 28622508 - 28622726
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  28622508 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcattcataggacaataa 28622607  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||||||   ||||||||||    
T  28622608 ccatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactctattttgaatgtgctggaaat-tcacaacatctcttt--cacacctctat 28622704  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  28622705 ataaaggagtgaagactcagag 28622726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4821485 - 4821264
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  4821485 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctacaacaatgttccttcacaatgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 4821386  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  4821385 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctatttgattgtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacct 4821289  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcaga 229  Q
    |||| || ||| |||||||||||||    
T  4821288 ctatatataggggtgaagactcaga 4821264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 30944470 - 30944693
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatgg-aatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  || | |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  30944470 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccctcaca-atggaaatgcatttgaaattgatccttcatagga 30944568  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | |||| || |||||   ||||    
T  30944569 caataactatatcaggcaaaagatcactggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgcgctggcaat-tcacaatgtatcttt--cacac 30944665  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  30944666 ctccatataaaggagtgaagactcagag 30944693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15467917 - 15467706
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||    
T  15467917 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttacctgcaacgatgttccttcaaaatgggaatggatttgaaattgagccttcataggataatgaccata 15467818  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  15467817 tcaggaaaaagatcattggtgattg-taaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtct-ttttc-acacctctatataaag 15467722  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15467721 gagtgaagacttagag 15467706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 9098406 - 9098610
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| || |||| |||    
T  9098406 gacaagaataacagctatgcctgcaacgatgttcctccatacttggaatggatttgaaattgatccttcatagtataataaccaaatcgggaaaaagatc 9098505  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9098506 attggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttttgatgtgttgggaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactta 9098600  T
Q  228 gagaatgaca 237  Q
    ||||||||||    
T  9098601 gagaatgaca 9098610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 9099212 - 9099416
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| || |||| |||    
T  9099212 gacaagaataacagctatgcctgcaacgatgttcctccatacttggaatggatttgaaattgatccttcatagtataataaccaaatcgggaaaaagatc 9099311  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9099312 attggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttttgatgtgttgggaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactta 9099406  T
Q  228 gagaatgaca 237  Q
    ||||||||||    
T  9099407 gagaatgaca 9099416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 29935509 - 29935719
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  29935509 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattaatccttcataggacaata 29935608  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||             ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||   ||||||||||    
T  29935609 ac------------tatatcattggtaattgatcaaaacttcaaacgactcttttttgaagtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacctctat 29935693  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||||| | ||||||||    
T  29935694 ataaaggagtgaagatttagagaatg 29935719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 35952835 - 35953056
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||  |||||||||||||| |||  |||||    
T  35952835 actctgtttttgtctctactacaagacaagaataacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatacatttgaaattgatcattcttatgac 35952934  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||||   |||||    
T  35952935 aataatcatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactttattttgaatgtgctggcaat---tcaatgtctcttt--cacacc 35953029  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35953030 tctatataaaggagtaaagactcagag 35953056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 19237213 - 19237409
Alignment:
Q  30 acaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatca 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19237213 acaaggataacaactatgcctgcaacgatgttcctccagacaaggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatca 19237312  T
Q  130 ttggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcaga 229  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||      ||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  19237313 -tggtgattgatc-aagctccaaacgactctattttgatgtgctggcaat----tcacgtctcttt--cacatctctatataaaggagtgaagacttaga 19237404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 21381586 - 21381738
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |   |||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||    
T  21381586 tgtctctgcaacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtctatacacattgggaatgcatttgaaattgattcttcataggataataaccata 21381685  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21381686 tcaggcaaaagatcattgttgatagatcaaagcttcaaacaactctattttga 21381738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 48062967 - 48063189
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | |||||||||| |||||||| | |||    
T  48062967 actctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattaatccttcataggac 48063066  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||   |  |||||| |||||   ||||    
T  48063067 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatggca---tttcaacgtatcttt--cacac 48063161  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48063162 ctctatataaaggagtgaagactcagag 48063189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 2265675 - 2265887
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  2265675 tgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcttaataggaatgcatttgaaattgatccttcttacgacaataaccata 2265774  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattga-tcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||     ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  2265775 tcaggcaaaggatcattggtgattgattaaaaacttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaa---ctcaacgtctcttt--cacacctctatataa 2265869  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2265870 aggagtgaagactcagag 2265887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 9709954 - 9710173
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||  | || |   |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  9709954 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgtttattcacaatgggaatgcatttgaaattcatccttcataggacaataa 9710053  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||||   ||| ||||||    
T  9710054 ccataccaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtactggcaat-tcacaacatctcttt--cacatctctat 9710150  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
     ||||| |||||||||| |||||    
T  9710151 ataaagaagtgaagacttagaga 9710173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33605691 - 33605473
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||  | |||| || || ||||||| ||||| || |  | |||||||| |||||||||||||| |||  |  | |||||    
T  33605691 gtttttgtctctgctacaagacaacaaaaacagctttgtctgcaacgatgtttcttcgca-atggaatgcatttgaaattgatcattcttagaaaaataa 33605593  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||| |||||   ||||||||||    
T  33605592 ccatatcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtactggcaat-tcacaacgtgtcttt--cacacctctat 33605496  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
     |||||||||||||||| |||||    
T  33605495 ataaaggagtgaagacttagaga 33605473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8182941 - 8182719
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| || || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  8182941 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcatgcaataatgtttcttcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 8182842  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||| |||||||    |||    
T  8182841 aataatcatatcaggcaaaggatcattggtgatttatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacatctcttt--cgcac 8182747  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8182746 ctctatataaaggagtgaagactcagag 8182719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 234
Target Start/End: Original strand, 22579465 - 22579590
Alignment:
Q  106 ataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctc 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||| |||    
T  22579465 ataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacaactc 22579561  T
Q  206 tatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  22579562 tatataaaggagtaaagacttagagaatg 22579590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27871729 - 27871506
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||||  | || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  27871729 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcaataatgtttattcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 27871630  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc--aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   |||    
T  27871629 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--caca 27871535  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27871534 cctctatataaaggagtgaagactcagag 27871506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14425458 - 14425236
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||  |  | |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  14425458 actctgtttttgtctttgcaacaagacaaggataacagctctaccngtaacaatgtttgtttacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataagac 14425359  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||    ||||||||||||   ||||    
T  14425358 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaacgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacac 14425264  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14425263 ctctatataaaggagtgaagactcagag 14425236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 12174497 - 12174706
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||| || | ||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  12174497 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgctccttcaca-atgagaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataaccat 12174595  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    || || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||    ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  12174596 attagacaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgggaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatata 12174690  T
Q  212 aaggagtgaagactca 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  12174691 aaggagtgaagactca 12174706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14426558 - 14426336
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||| | || | || |||||||||| |||||||| || |   ||||   ||||||||||| || |||  | |||    
T  14426558 actctgtttttgtctctactacaagataagaaaaatagctttgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaacacatttgaaattgttcattcctaggac 14426459  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  14426458 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactctatttgaatgtgctggaaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 14426362  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | || |||||||||||||||||||||    
T  14426361 ccatataaaggagtgaagactcagag 14426336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Original strand, 2266502 - 2266688
Alignment:
Q  38 aacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgat 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||   |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  2266502 aacagctctgcctgcaacaatgttccttcttaataggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaataaccatatcagacaaaggatcattggtgat 2266601  T
Q  138 tgat--caaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactc 226  Q
    ||||   ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2266602 tgattaaaaaacttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactc 2266688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1293041 - 1292819
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| || || |   |||| | ||||||| || |||||||| | |||    
T  1293041 actctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcattaatgtttcttcacattgggaacgcatttgaattttatccttcataggac 1292942  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  1292941 aataaccttatcagacaaaggatcattggtgattaatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 1292847  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1292846 ctctatataaaggagtgaagactcagag 1292819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 32264870 - 32265088
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataa-caactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32264870 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctctgtctgcaacaatgtttattcacattgggaacgaatttgaaattgatccttcataggacaata 32264969  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||||||    
T  32264970 accatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaaacttcaaacgactttattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacacctct 32265064  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  32265065 atataaaggagtgaagactcagag 32265088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 15704646 - 15704858
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| || || |  |   |||||  ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  15704646 tgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgaaacaatatttcttctcaatgggaatacatttgaaattgttccttcttaggacaataaccata 15704745  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  15704746 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctagcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 15704840  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15704841 aggagtaaagactcagag 15704858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 19339407 - 19339547
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||| |   |||| | |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  19339407 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctacttgcaacaatgtctatacacattgggaacgcatttgaaattgatcgttcatagcacaataaccata 19339506  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa-agcttcaaac 154  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19339507 tcaggcaaaagatcattggtgatagatcaagagcttcaaac 19339547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 24794862 - 24795038
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| |   |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  24794862 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcacgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcgtttgaaattgatccttcatagga 24794961  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  24794962 caataaccatatcagacaaaggatcaatgatgaattatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 24795038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 48806036 - 48806202
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||  |||| |   ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48806036 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcatgcaaacaatgtttatacacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggacaataaccat 48806135  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  48806136 atcaggcaaatgatcaatggtgaatcatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 48806202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14187604 - 14187479
Alignment:
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||   ||||    
T  14187604 acaataaccatatcagagaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactatattttgatgtgctggcaat-tcacaacatctcttt--cacac 14187508  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  14187507 ctctatataaaagagtgaagacttagaga 14187479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 16556774 - 16556958
Alignment:
Q  43 ctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc 142  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  16556774 ctctgcctgcaacgatgttccttcacaattggaatgcatttgaaattgatccttcataggaaaataactatatcaggaaaaacatcatccgtgattgatc 16556873  T
Q  143 -aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||     |||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16556874 aaaagcttcaaacgactctattttgaatgttctggcaat---taaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgtagactcagag 16556958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16608888 - 16608704
Alignment:
Q  43 ctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc 142  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  16608888 ctctgcctgcaacgatgttccttcacaattggaatgcatttgaaattgatccttcataggaaaataactatatcaggaaaaacatcatccgtgattgatc 16608789  T
Q  143 -aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||     |||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16608788 aaaagcttcaaacgactctattttgaatgttctggcaat---taaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgtagactcagag 16608704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 19711160 - 19711336
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  19711160 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaacaatgtttatgcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataaga 19711259  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  19711260 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaatcatcaaagcttcaaatgactctattttggatgtgctggcaat 19711336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 16545840 - 16545956
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  16545840 tgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataactata 16545939  T
Q  115 tcaggcaaaatatcatt 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16545940 tcaggcaaaagatcatt 16545956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16619822 - 16619706
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  16619822 tgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataactata 16619723  T
Q  115 tcaggcaaaatatcatt 131  Q
    |||||||||| ||||||    
T  16619722 tcaggcaaaagatcatt 16619706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 4412109 - 4412249
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacat--ggaatggatttgaaattgatccttcagat 101  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||  |||||  |||| | ||| ||||||||||||||| |     
T  4412109 actctgtttttgtctctactacaagacaaggaaaacagctctgcctgcaaacaatgtt--tatttacattgggaacgaattcgaaattgatccttcatag 4412206  T
Q  102 gacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4412207 gacaacaaccaaatcagacaaaagatcattggtgattgatcaa 4412249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13648740 - 13648685
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgt 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13648740 actcaatttgtgtctctgctacaagacaaggataataactctgcctggaacaatgt 13648685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 7488113 - 7488268
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaac-tctattt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||    
T  7488113 atacatggaatggatttgaaattgttccctcttaggacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttc-aacaacgactcttt 7488210  T
Q  165 tgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    ||||||| |||||||   ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7488211 tgatgtgctggcaat-caacaacatctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 7488268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 8999045 - 8999175
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |    
T  8999045 ttgtgtctacgctacaagacaat-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatc 8999142  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  8999143 caaatcaggcaaaagatcattggt-attgatcaa 8999175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14193125 - 14193020
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14193125 actctgtttttgtctctgttaaaagacaagaaaaacagctcttcctgcaaccatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 14193026  T
Q  105 aataac 110  Q
    ||||||    
T  14193025 aataac 14193020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 11087166 - 11087286
Alignment:
Q  23 ctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||  | | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  11087166 ctacaagacaag-ataacagctctgcctgcataaatgttccttta-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggca 11087263  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||  ||||||||    
T  11087264 aaagatcattggtatttgatcaa 11087286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Original strand, 13172561 - 13172717
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttca--aacaactctatt 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||| ||    
T  13172561 atacaaggaatggatttgaaattgttccctcctaggacaataaccaaatcaaacaacatatcattggtgatttgatc-aagcttcaacaacgactctttt 13172659  T
Q  164 ttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
     ||||||| ||||||| |  |||||| ||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  13172660 gtgatgtgctggcaat-ttccaacgtatctct--cacacctctatataaaggagtgaagac 13172717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29590188 - 29590048
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  29590188 actctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatgaatttgaagttgatccttcatatga 29590091  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | | | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||    
T  29590090 ctacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 29590048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 29680646 - 29680875
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  29680646 actcagtatgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttaaaattgatccttcagaggac 29680745  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29680746 aataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 29680845  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29680846 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 29680875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19666381 - 19666152
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19666381 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataatagctttgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgattcttcagaggac 19666282  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19666281 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtggtggcaacgtgacaacgtctcttttctacacct 19666182  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19666181 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 19666152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3395599 - 3395369
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3395599 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcataggac 3395500  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  3395499 aataatcatatcaggctaaggatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 3395403  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3395402 tctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 3395369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 37985714 - 37985940
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  37985714 actcagtttgtgtctctgctacaggacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 37985813  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  37985814 aataactatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 37985910  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  37985911 ctatataaaggagtgaaaacttagagaatg 37985940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 19621165 - 19621390
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19621165 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaattttcctacatactgggaatggatttgaaattgattcttcatatgacaa 19621264  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||| ||||    
T  19621265 taaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacatctct 19621361  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagagaatga 235  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19621362 atataaaggagtgaagacttagagaatga 19621390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 14904457 - 14904684
Alignment:
Q  4 cactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14904457 cactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcgtagga 14904556  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||    
T  14904557 caataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--tacac 14904653  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  14904654 ctctatttaaagaagtgaggacttagagaat 14904684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16632447 - 16632223
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16632447 tcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgtctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggacaa 16632348  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||   ||||||||    
T  16632347 taacgatattaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcagt-tcacaacgtctcttt--cacacctct 16632251  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  16632250 atataaaagagtgaagacttagagaatg 16632223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23123527 - 23123304
Alignment:
Q  6 ctcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgaca 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23123527 ctcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctcctcctacaacaatgttcctacatacatggaatgaatttgaaattgatccttcagaggaca 23123428  T
Q  106 ataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctc 205  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |   ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23123427 attaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctttttttatgtgct---aatatgacaacgtctcttttctacatctc 23123331  T
Q  206 tatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23123330 tatataaagaagtgaagacttagagaa 23123304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23750531 - 23750306
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||    
T  23750531 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgaattttaaattgatccttcataggac 23750432  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  23750431 aataaccatatcatgcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 23750335  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  23750334 ctatataaacgagtgaagacccagagaat 23750306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 55380299 - 55380073
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  55380299 actcagtttgtgtctctgctacaagacaataataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 55380200  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  55380199 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctatttttatgtgctaacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 55380103  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55380102 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 55380073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 12811277 - 12811500
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  12811277 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactcagcctgcaacaatgttcctacatacaaggaatggatttgaaattgatcattcaaaggac 12811376  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||   |||| |    
T  12811377 aataaacatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaactttcaaacgactctattttgatgtgctggaaat-tcacaacgtctcttt--cacactt 12811473  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    || | |||||||||||| ||| |||||    
T  12811474 ctttataaaggagtgaatacttagaga 12811500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12600759 - 12600541
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12600759 tgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatgctgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataacca 12600660  T
Q  113 tatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||| ||| ||    
T  12600659 tatcaggcaaaagatcattgttgattgatcaaaacttcaaacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctttatata 12600563  T
Q  212 aaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  12600562 aaggagtgaagacttagagaat 12600541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6641693 - 6641467
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||| ||||||  | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  6641693 actctgtttatgtctctgctataggacaagaataacagatatgcctgcaacgatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgattcttcataggac 6641594  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  6641593 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttttttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 6641497  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  6641496 ttatataaaggagtgaagacttcgagaatg 6641467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 22675633 - 22675845
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22675633 tgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctacaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 22675732  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  22675733 tcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 22675829  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22675830 gagtgaagacttagag 22675845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 37435642 - 37435867
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37435642 gtttttgtctctgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcaactatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataa 37435741  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||  | | |||||||||||   ||||||||||     
T  37435742 ccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgacatgctggcaaattcataacgtctcttt--cacacctctata 37435839  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37435840 taaaggagtgaagacttagagaatgaca 37435867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 14605009 - 14605229
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||   ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14605009 actctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaa---tgttccttcacaattggaatggatttgaaattgatccttcataggac 14605105  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  14605106 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 14605202  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  14605203 ctatataaaggagtgaagacttagaga 14605229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45833392 - 45833177
Alignment:
Q  16 gtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatat 115  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45833392 gtctctgctacaaaacaagaaaaacaactctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcatagaacaataaccatat 45833293  T
Q  116 caggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || || |||| | |||||||||||||   | |||||||| ||||||    
T  45833292 caggcaaaagatcattggtgattgaacaaagcttcaaatgactctattttgatatgatgacaat-tcacaacgtctcttt--cagacctctatataaagg 45833196  T
Q  216 agtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45833195 agtgaagactcagagaatg 45833177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 17398776 - 17398998
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  17398776 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 17398875  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||  ||| ||||    
T  17398876 aataaccatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctc--ttccacac 17398970  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17398971 ctctatataaaggagtgaagactcagag 17398998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40846108 - 40845884
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  40846108 actcagtttgtatctctgctacaagacaagaataacagctccgcctgcaacattgttccctcatacttggaatggatttgaaattgatctttcataggac 40846009  T
Q  105 aataac------catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttct 198  Q
    ||||||      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||       
T  40846008 aataacaataaccatatcaggtaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-taacaacgtctcttt--c 40845912  T
Q  199 acacctctatctaaaggagtgaagactc 226  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40845911 acacctctatataaaggaatgaagactc 40845884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 56034575 - 56034358
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacca 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |  |  |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  56034575 tgtgtctctactacaagacaaggataacagctctgcctacaactatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatctttcataggacaataacca 56034476  T
Q  113 tatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||  | |||||||||||||   |||||||||| ||    
T  56034475 tatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaaattcacaacgtctcttt--cacacctctatata 56034378  T
Q  212 aaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  56034377 aaggagtgaagacttagaga 56034358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 19911983 - 19912211
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  19911983 actcagtttgtgcctctgctacaagacaagaataacagctctacttgcaacaatgttcctatatactgggaatggatttgaaattgatcattcataggac 19912082  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| | |||   |||||    
T  19912083 aataaccatatcaggcaaaagataattggtgattgatcaaagctcc--acgactcttatttttatgtgttgacaat-tcacaacgtttattt--cacacc 19912177  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  19912178 tctatataaaggagtgaagatttagagaatgaca 19912211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17247242 - 17247035
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||| ||||  ||||| || || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17247242 tgtctctactacaaggcaagaaaaacagctctgccagcaaagatgttacttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcaaaggacaataaccata 17247143  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||| ||| |||||    
T  17247142 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctttatataaag 17247046  T
Q  215 gagtgaagact 225  Q
    |||||||||||    
T  17247045 gagtgaagact 17247035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8105637 - 8105425
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  8105637 tgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaataaccata 8105538  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||   |||||| ||| |||    
T  8105537 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctttatataa 8105443  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8105442 aggagtgaagactcagag 8105425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3483664 - 3483517
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  3483664 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgttgtcaat 3483565  T
Q  180 gtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     | ||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3483564 -tcacaacgtctattt--tacacctctatataaaggagtgaagacttagag 3483517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10072939 - 10072721
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||| | || |||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10072939 gtttttgtctctgctataagacaagaaaaacagccctacctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataa 10072840  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  10072839 ccatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgattctattttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 10072743  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  10072742 ataaaggagtgaagacttagag 10072721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 3105521 - 3105743
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  3105521 actctgtttttgtctctgctacaaggcaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcatattgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 3105620  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||| ||||| ||||    
T  3105621 aataaccatatcagacaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtct-ttttc-acac 3105715  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3105716 ctctatataaagaagtgaagactcagag 3105743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54679927 - 54679718
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  54679927 tgtctctgctaaaagacaagaaaaacaactccgtctgcaacgatgttccttcataatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataactata 54679828  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  54679827 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgcaggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 54679733  T
Q  213 aggagtgaagactca 227  Q
    |||||||||||||||    
T  54679732 aggagtgaagactca 54679718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 413000 - 412788
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||  |||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  413000 tgtctttgctacaaaacaagaaaaacagttctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcatagaacagtaaccata 412901  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  412900 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacctctatataaag 412804  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
     | |||||||| ||||    
T  412803 aaatgaagacttagag 412788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 234
Target Start/End: Original strand, 15014571 - 15014715
Alignment:
Q  87 attgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaa 186  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||    
T  15014571 attgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggaaat-tcacaa 15014669  T
Q  187 cgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15014670 cgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagagaatg 15014715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19884706 - 19884488
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19884706 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcaca-atggaaatgcatttgaaattgatccttcataggacaata 19884608  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttga-tgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||| ||| | |||||||||||||   |||||||||    
T  19884607 accatatcaggcaaag-atcattggtgattgatcaaaacttcaaacgactctattttgaatgcgctggaaat-tcacaacgtctctttc--acacctcta 19884512  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    | |||| ||||||||||| |||||    
T  19884511 tataaatgagtgaagacttagaga 19884488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44397850 - 44397638
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||  | |   |||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||||    
T  44397850 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttcctttagaatgggaatggatttgaatttaatcattcataggacaataaccata 44397751  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||| ||  |||||||||| ||| |    
T  44397750 ttaggcaaaagatcattggcgattgatcaaagcttccaacgactctattttaatgtgttggcaat-tcacaa--tctctctttcacacctctatataatg 44397654  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  44397653 gagtgaagacttagag 44397638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40860676 - 40860454
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  40860676 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgactgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcatagaac 40860577  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  40860576 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgtatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 40860482  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40860481 ctctatataaaggagtgaagactcagag 40860454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 14154096 - 14154314
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||| ||||||||| |||| | |||    
T  14154096 actctgtttttgtctctgctataagagaagaaaaatagctctgcctgcaacaatgttccttcacaacaggaatggatttcaaattgatctttcataggac 14154195  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    || |  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||| | ||||||||| |||   ||||||    
T  14154196 aacattcatatcaggcaaagaattattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgcgctgacaatttcacaacgtctattt--cacacct 14154293  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14154294 ctatataaaggagtgaagact 14154314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29121379 - 29121156
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggata-acaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatg 102  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||| |||||||||||| |||||  | |    
T  29121379 actctgtttttgtctctgttacaagacaagaaaacacaactctgcctgcaacgatgttccttcaca-atgagaatgcatttgaaattgacccttcttagg 29121281  T
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||    
T  29121280 acaataaccatatcaggcaaaagaacattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cac 29121186  T
Q  201 acctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29121185 atctctatataaaggagtgaagactcagag 29121156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 13576221 - 13576440
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||  | || |   |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  13576221 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgtttattcacaatgggaatgcatttgaaattcatccttcataggacaataa 13576320  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| | ||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13576321 ccataccaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtactggcaat-tcacaacatctcttt--cacatctctat 13576417  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
     ||||| |||||||||| |||||    
T  13576418 ataaagaagtgaagacttagaga 13576440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6517494 - 6517276
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |  |   |||||  ||||||||||||||||||  | | |    
T  6517494 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcccaatgggaatacatttgaaattgatccttcttagggc 6517395  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  6517394 aataaccatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 6517300  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactc 226  Q
    || ||| ||||| |||||||||||    
T  6517299 ctttatataaagaagtgaagactc 6517276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16853512 - 16853290
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |  |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  16853512 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacgatgttccttctcattaggaacacatttgaaattgatccttcaaaggac 16853413  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  16853412 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgttcaaaaacttcaaacgactctattttgaatatgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 16853318  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16853317 ctctatataaaagagtgaagactcagag 16853290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22190855 - 22190633
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | |||||||||||||| |||| | |||    
T  22190855 actctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatctttcataggac 22190756  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  |||||||| |||   ||||    
T  22190755 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctattt--cacac 22190661  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22190660 ctctatataaaggagtgaagactcagag 22190633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55731837 - 55731632
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | |  |   |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||    
T  55731837 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttcattctcaatgggaatgcatttgaaattgatctttcttaggacaataaccatatcatgca 55731738  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtg 219  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  55731737 aaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctcgatataaaggagtg 55731643  T
Q  220 aagactcagag 230  Q
    |||||||||||    
T  55731642 aagactcagag 55731632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17540381 - 17540179
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| || |||    
T  17540381 gacaagaacaacaactatgcctgcaccagtgttcctccatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggataataaccaaatcaggcataagatc 17540282  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||    ||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  17540281 attggtgatttgatc-aagtttcaaacgactct-ttttgatgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacacctttatataaaggagtgaagactta 17540189  T
Q  228 gagaatgaca 237  Q
    ||||||||||    
T  17540188 gagaatgaca 17540179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 17700867 - 17701043
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | |||||||| |||||||||| | ||    
T  17700867 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaagtgatccttcatagga 17700966  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17700967 caataaccatatcaggaaaaagatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 17701043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 41114893 - 41115087
Alignment:
Q  27 aagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaata 126  Q
    |||||||| | |||| || |||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |    
T  41114893 aagacaagaacaacagctatgcctgcaccagtgttcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaaga 41114992  T
Q  127 tcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41114993 tcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaat-caacaacgtctctct--cacacctatatataaaggagtgaagact 41115087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10692860 - 10692714
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   ||||   |||||||||||||| |||| | |||    
T  10692860 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaacccatttgaaattgatcattcataggac 10692761  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10692760 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttca 10692714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10906626 - 10906480
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   ||||   |||||||||||||| |||| | |||    
T  10906626 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaacccatttgaaattgatcattcataggac 10906527  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10906526 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttca 10906480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 15475255 - 15475421
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | || |   |||  ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15475255 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctacaaacaatgtttatgcacattgggataggatttgaaattgatccttcgtaggacaataaccat 15475354  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  15475355 atcaggcaaaagatcaatggtgaatcatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 15475421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16940020 - 16939803
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||| || |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| || |  | |||||| |  ||||||||||||||||||  | |||||||    
T  16940020 gtttttgtccctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgctacaatgtttcttctca-atggaaatacatttgaaattgatccttcgtaagacaata 16939922  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |   |||||||||||   ||||||||    
T  16939921 accatatcaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggaaattt---aacgtctcttt--cacacctct 16939827  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  16939826 atataaaggagtgaagactcagag 16939803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 9140921 - 9140829
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttc 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9140921 actcagtttgtgtctctgctataagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttctacatactgggaatgaatttgaaattgatccttc 9140829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 224
Target Start/End: Original strand, 17788199 - 17788361
Alignment:
Q  58 tgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaa 156  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  17788199 tgttcctccatacttggagtggatttgaaattgatccttcatacgacaataacaaaatcaggcaaaagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacga 17788297  T
Q  157 ctctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |   |||||||| |||||||||||||||    
T  17788298 ctct-ttttgatgtgttgacaat-taacaacgtctctttcc--aacctctatataaaggagtgaagac 17788361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 39419836 - 39420012
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  39419836 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatgcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcatagga 39419935  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  39419936 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaatgactctattttggatgtgctggcaat 39420012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16848556 - 16848393
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |  |   |||| | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  16848556 actctgtttttgtctctcctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttctcattgggaacgcatttgaaattgatccttcatagaac 16848457  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16848456 aataaccatatcaagcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 16848393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11915688 - 11915485
Alignment:
Q  27 aagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaata 126  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  11915688 aagacaagaacaacaactatgcctgcaccggtgttccttcataattggaatggatttgaaattgattattcataggacaataaccatattaggcaaaaga 11915589  T
Q  127 tcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactc 226  Q
    |||||||||||| |    || ||||||| ||||| ||||||| || |||||||   ||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||     
T  11915588 tcattggtgatttaatctagtttcaaacgactctcttttgatttgctggcaat-caacaacatctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactt 11915492  T
Q  227 agagaat 233  Q
    |||||||    
T  11915491 agagaat 11915485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20977466 - 20977292
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   ||||   ||||||||||||||||||| | ||    
T  20977466 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacacatttgaaattgatccttcatagga 20977367  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||    
T  20977366 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactat-tttggatgtgctggcaat 20977292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38513887 - 38513725
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  38513887 actctgtttttgtctctgctacaagacgagaaaaacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatccttcatacga 38513788  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg 166  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38513787 caataaccatatcagacaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttg 38513725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 10661330 - 10661482
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  10661330 atacatggaatggatttgaaattgttccttcacatgacaataagcaaatcaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactctttttt 10661428  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaag 222  Q
    |||||| | |||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  10661429 gatgtgctagcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaag 10661482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 10875475 - 10875627
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  10875475 atacatggaatggatttgaaattgttccttcacatgacaataagcaaatcaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactctttttt 10875573  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaag 222  Q
    |||||| | |||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  10875574 gatgtgctagcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaag 10875627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 56533173 - 56533385
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||  ||||||||||||||||    | ||||||||||||    
T  56533173 tgtctctgctacaagacaataaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcaca-atgagaatacatttgaaattgatcctgtttaggacaataaccat 56533271  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    |||||| |||||   |||||||||| ||    
T  56533272 atcaggaaaatgatcattgatgattgatcaaaagcttcaaacgactctaatttgaatgtgctggcaat---tcaacgtttcttt--cacacctctatata 56533366  T
Q  212 aaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||||||||||||||    
T  56533367 aaggagtgaagactcagag 56533385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 154
Target Start/End: Original strand, 27188751 - 27188891
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |   ||||   |||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  27188751 tgtctctgctacaagacaagaataacatctctgcctgcaaacaatgttcatacacattgggaacacatttaaaattgatccttcataggacaataaccat 27188850  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaac 154  Q
    ||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  27188851 atcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaac 27188891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Original strand, 8685597 - 8685760
Alignment:
Q  58 tgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaa 156  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  8685597 tgttcctccagacttgaaatggatttgaaattaatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacga 8685695  T
Q  157 ctctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||    
T  8685696 ctct-ttttgatatgctggcaat-caacaacgtctcttt--catacctctatataaaggagtgaagact 8685760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 9751642 - 9751818
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||||||  | || |   ||||   ||||||||||||||||||| | ||    
T  9751642 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaaacaatgtttatgcacattgggaacacatttgaaattgatccttcatagga 9751741  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  9751742 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgatttataaaagcttctaacgactctattttggatgtgctggcaat 9751818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11901143 - 11900973
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  11901143 ttcctccatacttggaatggatttgaaattgatacctcataggacaataaccaaatcaggcaacagatcattggtgatttgatcaaa-cttcaaacgact 11901045  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || |||| || || |||||||   ||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11901044 ct-tttttatttgctggcaat-caacatcgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactaagagaatg 11900973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 14778501 - 14778632
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  14778501 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatcc 14778599  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  14778600 aaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 14778632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 3499764 - 3499930
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  3499764 tgtctctgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatccttcatagaaaaataaccat 3499863  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||  ||||  | ||| | |||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  3499864 atcaggcaaaggatcaacgatgaattatcaaagcttaaaacgactctattttggatgtgctggcaat 3499930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 25651215 - 25651415
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggattt-gaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||  |||||||| |  |  ||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  25651215 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctcggcctgcaaagatgttccttctcaattggaatgtattttgaaattgatctttcataggacaataaccat 25651314  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    ||||||||||  ||||||| | |      |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  25651315 atcaggcaaaggatcattgatca------aaagtttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 25651403  T
Q  213 aggagtgaagac 224  Q
    ||||||||||||    
T  25651404 aggagtgaagac 25651415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1672322 - 1672238
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1672322 atttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatcaatggtgaattatgaaagcttcagaacgactctatt 1672238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1674797 - 1674713
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | || ||||||||| ||| ||||||||    
T  1674797 atttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatcaatggtgaattatgaaagcttcagaacgactctatt 1674713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 14710837 - 14710968
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||  |  ||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  14710837 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctatagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatcc 14710935  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  14710936 aaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 14710968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33378420 - 33378261
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | ||||  ||| ||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||| ||||| | ||    
T  33378420 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgattcttcatagga 33378322  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  33378321 caacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcacaacgactctatt 33378261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 36210167 - 36210299
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  36210167 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataaatgttccttca-agataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatc 36210265  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  36210266 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 36210299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 17993852 - 17993982
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||| ||| ||     |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  17993852 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataatagctctgcctgcagaaatgtcccttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatcc 17993950  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17993951 aaatcaggcaaaagatcattggt-attgatcaa 17993982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 18007118 - 18007251
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |    
T  18007118 ttgtgtctacgctacaagacaagaa-aacagctctgcctgcaaaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatc 18007215  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    || || |||||||| || | |||||  |||||||||    
T  18007216 caaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 18007251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242115
Alignment:
Q  25 acaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaa 123  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||| |||| | ||||| | ||| |||||| |||    
T  19242235 acaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatcattcataggacaacatccaaatcaggaaaa 19242138  T
Q  124 atatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | ||||||||| | |||||||||    
T  19242137 agatcattggtaaatgatcaaag 19242115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36470696 - 36470605
Alignment:
Q  137 ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||| | ||| |||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  36470696 ttgatcaaagcttcaaacgacacaattttgatgtgctgtcaat-tcacagcgtctcttt--cacacctctatataaatgagtgaagacttagaga 36470605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 13890770 - 13890704
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  13890770 tggaatgaatttgaaattgttccttcatagaacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatt 13890704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Original strand, 19889166 - 19889309
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaac-tctattttgatgtg 171  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  19889166 ggaatgaatttgaaattgttccctcctaagacaataaccaaatcaagcaacatatcattggtgatt-atc-aagcttc-aacaacgactcttttgatgtg 19889262  T
Q  172 ttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaa 221  Q
     |||||||   |||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  19889263 ctggcaat-caacaatgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaa 19889309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13027689 - 13027571
Alignment:
Q  102 gacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctac 200  Q
    ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   | ||||||||||||||||||   |||||||||||||   ||    
T  13027689 gacaataaccaaatcaagcaatagatcattggtgatt-atcaa-gcttcaa-caacgaatcttttgatgtgttggcaatca-acaacgtctctttc--ac 13027596  T
Q  201 acctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13027595 acctctatataaaggagtgaagact 13027571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 25037350 - 25037579
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  25037350 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttaagagtac 25037449  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037450 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 25037549  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25037550 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 25037579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25829143 - 25828911
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  25829143 actcattttgtgtctctgctgcaagacaaggataacaactctgcatgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttaaaattgatccttcagaggac 25829044  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829043 aataatcatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgaatctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 25828944  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25828943 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 25828911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 22188193 - 22188421
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22188193 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 22188292  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22188293 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaatgtgacaacttctcttttctacacct 22188392  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22188393 ctatataaaggagtgaagacttagagaat 22188421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23235016 - 23234790
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23235016 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagttccgcctgcaacaatgttcctacatactggcaatggatttgaaattgatccttcagaggac 23234917  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23234916 aataaccatatcaggcaaaagattattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgctggaaaagtgacaacgtctcttttctacacct 23234817  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    | || |||||||||||| ||| ||||||    
T  23234816 c-atgtaaaggagtgaaaacttagagaa 23234790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30666998 - 30666795
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30666998 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagcgctgcctgcaacaatgttcctacatacatagaatggatttgaaattgatccttcagaggtc 30666899  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30666898 aataaccatttcaggaaaaagatcattggtgattgaccaaagcttcgaacaactctattttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 30666799  T
Q  205 ctat 208  Q
    ||||    
T  30666798 ctat 30666795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40782482 - 40782257
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40782482 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctacctgcaacaatgttcctacatactgggaatgaatttgaaattgatccttcataggacaata 40782383  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  40782382 accatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagattcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 40782286  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  40782285 ataaaggagtgaatacttagagaatgaca 40782257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22258210 - 22257985
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  22258210 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactaggaatggatttgaaattgattcttcataggac 22258111  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||   ||||||    
T  22258110 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgagcaaagcttcaaacgactctattttgatatgctggcaa-atcacaacgtctcttt--cacacct 22258014  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  22258013 ctacataaaggactgaagacttagagaat 22257985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25189407 - 25189183
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  25189407 actcaatttgtgtctctactactggacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttcattcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 25189308  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  25189307 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgataaaatcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--tacacct 25189211  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25189210 ctatataaaggagtgaagacttagagaa 25189183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 23184395 - 23184620
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23184395 actcagtttgtgtctctgctacaggacaagattaacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 23184494  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||   ||||||    
T  23184495 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaat-ttataacgtctcttt--cacacct 23184590  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23184591 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 23184620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 23595658 - 23595883
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23595658 actcagtttgtgtctctgctacaggacaagattaacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 23595757  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||   ||||||    
T  23595758 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaat-ttataacgtctcttt--cacacct 23595853  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23595854 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 23595883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 24850757 - 24850983
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  24850757 actcagtgtgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgcaacaatgttcctccatacttggaatggatttgaaattgatcctttaaaggac 24850856  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  24850857 aatcaccatatcaagcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttaaaacgactctattttgatgtgcttgcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 24850953  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24850954 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 24850983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 13964069 - 13964282
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13964069 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctccgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatcctttagaggac 13964168  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  13964169 aagaaccatatcaggcaaaagatcgttggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 13964265  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaa 221  Q
    | || ||||||||||||    
T  13964266 ccatataaaggagtgaa 13964282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 10009841 - 10010068
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  10009841 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcgtaggac 10009940  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  10009941 aataaccatattagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 10010037  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  10010038 tctatataaaggagtgaaaacttaaagaatg 10010068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 9015459 - 9015688
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9015459 actcagtttgtatctctgctataagacaaggagaacagctccgcctgcaacaatgttcatacatactgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 9015558  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  9015559 aataaccctatcatgcaaaagatcattggtgattgatcaaaacttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 9015655  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9015656 ctatataaaggagtgaagacttagggaatgaca 9015688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24377110 - 24376887
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24377110 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaataatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 24377011  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    |  ||||||||||   ||||||    
T  24377010 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaagcgactctattttgatgtgctggcaa----atcacgtctcttt--cacacct 24376917  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  24376916 ctatataaaggagtgaagacttatagaatg 24376887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30621225 - 30621024
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30621225 actcagtttgtgtctccgctacaacacaatgataacagcgttgcctgcaacaatgttcctacatacatagaatggatttgaaattgatccttcataggac 30621126  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30621125 actaaccatatgaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctagcaatgtatcaacgtctcttttctacacct 30621026  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  30621025 ct 30621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30623846 - 30623645
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30623846 actcagtttgtgtctccgctacaacacaatgataacagcgttgcctgcaacaatgttcctacatacatagaatggatttgaaattgatccttcataggac 30623747  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30623746 actaaccatatgaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctagcaatgtatcaacgtctcttttctacacct 30623647  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  30623646 ct 30623645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24576040 - 24575818
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24576040 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcccacatactgggaatggatttgaaattgatccttcaaaggacaata 24575941  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||||   ||||||||||    
T  24575940 accatatccggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgttctggaaat-caacaacgtctcttt--cacacctctat 24575844  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||||||| | ||||||    
T  24575843 ataaaggagtgaagacttaaagaatg 24575818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 21537339 - 21537567
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcc--tgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatg 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||  | ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21537339 actcagtttgtgtctttgctacaagacaagaataacagctcttcccctacaacattgttccctcatacttggaatggatttgaaattgatccttcacagg 21537438  T
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||   ||||    
T  21537439 acaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtcctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacac 21537535  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  21537536 ctctatataaagaagtgaagacttagagaatg 21537567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19540425 - 19540199
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19540425 actcagtttgtgtctctgctacaaggcaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccctcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataagac 19540326  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| | ||||||| |||||   | ||||    
T  19540325 aataaccatatcaagcaaaagatcactagtgattaatcaaagcttcaaacgactcttttttgatgtgctgccaat-tcacaacgtttcttt--catacct 19540229  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19540228 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 19540199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22317600 - 22317380
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22317600 tcagtttttatctctgctgcaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaa 22317501  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||    
T  22317500 taaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctct 22317404  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  22317403 atataaaggagtgaagacttagag 22317380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 22455081 - 22455296
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22455081 actcagtttgtgtctctgctacatgacaagaataacatttatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 22455180  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  22455181 aataaccatgtcaggcaaaagattattggtgattgatcaaaacttcaa--gactttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 22455275  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  22455276 ctatataaaggagtgaagact 22455296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 39037733 - 39037959
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  39037733 actcagtttgtgtctctgctacatgacaaggataacagctatgcctgcaacgatgttccttcatacttagaatgaatttgaaattgatcgttcataggac 39037832  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  39037833 aataaccatatcagacaaaagatcattggcgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatttgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 39037929  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  39037930 ctatataaagaagtgaagacttggagaatg 39037959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 20568841 - 20569070
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||   |||||||||| |||||||| | | |    
T  20568841 actcagtttgtgtatctgctataagacaagaataacaactctgcttacaacaatgttcctacatactgggaacaaatttgaaattcatccttcataggcc 20568940  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  20568941 aataaccatatcaggcaaaagatcattggcgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgaaaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 20569037  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20569038 ctatataaaagagtgaagacttagagaatgaca 20569070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 41121810 - 41122034
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41121810 actctgtttgtgtctctgctacaggacaagaataacagctatgcctgtaacgatgttccttcatacttgaaatggatttgaaattgatccttcatatgac 41121909  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  41121910 aataaccatatcaggaaaaagatcattcgtgattgatcaaagcttcaaacgactct-ttttggtgtactagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 41122005  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41122006 ctatataaaggagtgaagacttagagaat 41122034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 28711789 - 28712012
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28711789 actctgtttttgtctctgctaaaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 28711888  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||   |||||    
T  28711889 aataactatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat-ttacaacgtctcttt--cacacc 28711985  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28711986 tctatataaaggagtgaagactcagag 28712012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 6574226 - 6574439
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6574226 tgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 6574325  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  6574326 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaa 6574422  T
Q  214 ggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  6574423 ggagtgaaaacttagag 6574439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Original strand, 28140710 - 28140851
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  28140710 actcagtttgtgtctctgctacaaggcaaggataatagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcatagaac 28140809  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28140810 aataaccatatcaggcaaaagatcattgttgattgatcaaag 28140851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 233
Target Start/End: Original strand, 17963454 - 17963584
Alignment:
Q  102 gacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17963454 gacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcta-tttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctaaa 17963552  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17963553 cctctatataaaggagtgaagacttagagaat 17963584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38781397 - 38781184
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| ||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  38781397 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgtcccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataatcata 38781298  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |   ||| || ||| |||||    
T  38781297 tcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgtcaat-tcacaacgtctctat--cacaactatatataaag 38781201  T
Q  215 gagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38781200 gagtgaagacttagaga 38781184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40332096 - 40331874
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | || |  ||||| | |||| |||||||||||||| | |||    
T  40332096 actctgtttttgtctctgctacaagacacggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacatttggaacgcatttaaaattgatccttcataggac 40331997  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||   ||||    
T  40331996 aataaccatatcaggcaaaggatcatttgtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggca---tttcaacgtctcttt--cacac 40331902  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40331901 ctctatataaaggagtgaagactcagag 40331874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 31800978 - 31801200
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| |||||||||||||| |||  | |||    
T  31800978 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggac 31801077  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  31801078 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 31801172  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  31801173 ctctatataacggagtaaagactcagag 31801200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 34322041 - 34322249
Alignment:
Q  19 tctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcag 118  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |  |   || ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  34322041 tctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggtatacatttgaaattgatccttcttaggacaataaccatatcag 34322140  T
Q  119 gcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagga 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  34322141 gcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaagga 34322235  T
Q  217 gtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||    
T  34322236 gtgaagactcagag 34322249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 28551009 - 28551231
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || || |   |||| | ||||||| ||||||||||| | |||    
T  28551009 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttcacattgggaacgcatttgaatttgatccttcataggac 28551108  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  28551109 aataaccgtatcagacaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 28551203  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28551204 ctctatataaaggagtgaagactcagag 28551231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 31968134 - 31968356
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |    ||| | ||||||| || |||||||| | |||    
T  31968134 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgtttcttcacattgagaacgcatttgaatttaatccttcataggac 31968233  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||  |||||||   ||||    
T  31968234 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaatatctcttt--cacac 31968328  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31968329 ctctatataaaggagtgaagactcagag 31968356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33074235 - 33074013
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |  |   |||||  ||||||||||||| ||||  | |||    
T  33074235 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttctcagtgggaatacatttgaaattgattcttcttaggac 33074136  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  33074135 aataaccatatcaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 33074041  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33074040 ctctatataaaggagtgaagactcagag 33074013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44840443 - 44840221
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  44840443 actctgtttttgtctctgctataagacaaggataccagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 44840344  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  44840343 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgccgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 44840249  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  44840248 ctctatataaaggagtgaagactcagag 44840221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6392633 - 6392421
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  6392633 tgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaacaaccata 6392534  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  6392533 ttaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactttattttgaatgtgttggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 6392439  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6392438 aggagtgaagactcagag 6392421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 1587133 - 1587342
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |  | ||| ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  1587133 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttctca-atgagaatacatttgaaattgatccttcataggacaataatcat 1587231  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  1587232 atcaagcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatata 1587326  T
Q  212 aaggagtgaagactca 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  1587327 aaggagtgaagactca 1587342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 22776379 - 22776542
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |  ||||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  22776379 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacatttggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 22776478  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattga-tcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22776479 aataaccatatcgggcaaaggatcattggtgattgattaaaagcttcgaacgactctattttga 22776542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 22781757 - 22781920
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |  ||||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  22781757 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacatttggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 22781856  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattga-tcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22781857 aataaccatatcgggcaaaggatcattggtgattgattaaaagcttcgaacgactctattttga 22781920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 30557421 - 30557633
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||||| || |   |||| | ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  30557421 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaaagcatttgaaattgatccttcttaggacaacaaccata 30557520  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattga-tcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  30557521 tcaggcaaatgatcattggtgattgattaaaagcttcaaacaactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 30557615  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  30557616 aggagtgaagattcagag 30557633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19115069 - 19114867
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| | |||| || |||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  19115069 gacaagaacaacagctatgcctgcatcaatgttcctccatacttgaaatgaatttgaaattgatccttcgtaggacaataaccaaattaggcaaaagatc 19114970  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19114969 attggtgatttgatc-aagcttcaaacgtctct-ttttgatgtgctggcaattcgacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactta 19114874  T
Q  228 gagaatg 234  Q
    | |||||    
T  19114873 gggaatg 19114867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Original strand, 20152117 - 20152263
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||    
T  20152117 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcgtaggac 20152216  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20152217 aataaccatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttca 20152263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22785758 - 22785963
Alignment:
Q  17 tctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatc 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  22785758 tctctactacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttat-cacattgggaacgcatttgaaattgatgcttcataggacaaaaaccatatc 22785856  T
Q  117 aggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  22785857 aggcaatggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaag 22785951  T
Q  215 gagtgaagactc 226  Q
    ||||||||||||    
T  22785952 gagtgaagactc 22785963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Original strand, 26619215 - 26619406
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| | |||| || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||| |||    
T  26619215 gacaagaacaacagctatgcctgcatcagtgttcctccatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataatcaaatcaggaaaaagatc 26619314  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  26619315 attggtgatttgatc-aagctttaaacgactct-ttttgatgtgttggcaat-caacaatgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagac 26619406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 31328066 - 31328232
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |   ||||    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  31328066 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttcctacacattgggaacacgtttgaaattgatccttcataggacaataaccaaa 31328165  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31328166 tcaggcaaaggatcattagtgattgatcaaaagtttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat 31328232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 31334787 - 31334953
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |   ||||    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  31334787 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttcctacacattgggaacacgtttgaaattgatccttcataggacaataaccaaa 31334886  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31334887 tcaggcaaaggatcattagtgattgatcaaaagtttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat 31334953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22802460 - 22802248
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||||    
T  22802460 tgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgtctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaacttgattcttcttaggacaataatcata 22802361  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||| || ||| |||    
T  22802360 tcacgcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacaactatatataa 22802266  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22802265 aggagtgaagactcagag 22802248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 35744091 - 35744254
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||  ||  | |||    
T  35744091 actcagtttttgtctctgctataaaacaagaaaaacagctctgtctgcaacaatgttccttctcaataggaatgcatttgaaattgatcactcttaggac 35744190  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35744191 aataactatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 35744254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22272118 - 22271925
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| |||||| || |||||||| || ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22272118 gacaagaataacagctatgcctgcaccagtgttcctccagacttggaatgaatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatc 22272019  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    ||||||||||| |   | |||||||| ||||||||||||||||    
T  22272018 attggtgatttgatc-aaggttcaaacgactct-ttttgatgtgctggaaaatcaacaacgtctctct--caaacctctatataaaggagtgaagact 22271925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 23392769 - 23392898
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| || |   | ||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |    
T  23392769 tgtctctgctacaagacaatgataacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaatagaaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaa 23392868  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23392869 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 23392898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 1084023 - 1083864
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  1084023 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggac 1083924  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  1083923 aacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaggcttcacaacgactctatt 1083864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 224
Target Start/End: Original strand, 18431091 - 18431245
Alignment:
Q  66 catacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattt 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18431091 catacttggaatggatttgaaattgatcattcataggacaataaccaaatcaggcaacaaatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttt 18431188  T
Q  165 tgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    ||||||| || ||||   |||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18431189 tgatgtgctgacaat-caacaacgtctcttt--cacacatctatataaaggagtgaagac 18431245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24779352 - 24779288
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  24779352 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataatagctctgcctgcaacaatgttcctacata 24779288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14581441 - 14581358
Alignment:
Q  85 aaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14581441 aaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 14581358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24779286 - 24779166
Alignment:
Q  102 gacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||  ||  |||    
T  24779286 gacaataatcatatcatgcaaaagataattggtgatcgatcaaagcatcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctc--ttacaca 24779190  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  24779189 cctctatataaaggagtgaagact 24779166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22755459 - 22755337
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  22755459 gctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcatatgacaatatccaaatcagac 22755361  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  22755360 aaaagatcattggtgactgatcaa 22755337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 56
Target Start/End: Original strand, 25041457 - 25041508
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaaca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25041457 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaaca 25041508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 24814691 - 24814813
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  24814691 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggca 24814790  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  24814791 aaagatcattggtgattgatcaa 24814813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44881124 - 44880961
Alignment:
Q  58 tgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaa 156  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |    
T  44881124 tgttcctccagacttgtaatggatttgaaattgatcattcataagacaataaccaaatcaggcaaaagatcattggtgatttgatc-aggcttcaaacga 44881026  T
Q  157 ctctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| |||| ||||| || ||||   | |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44881025 ctct-ttttaatgtgctgacaat-caataacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 44880961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18702693 - 18702533
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||    
T  18702693 ttcctccatacttggaatggatttgaaattgctccttcataagacaataactaaatcagacaacaaatcattgatgatttgatcaaa-cttcaaatgact 18702595  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    || |||| ||||| | |||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  18702594 ct-tttttatgtgctagcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagac 18702533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 133
Target Start/End: Original strand, 28701325 - 28701448
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| | || |  ||| | |||||| |||||||| || |   ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  28701325 gtttttgtccctgctacaagacaagaaaaatagttctacttgcaacgatgttccttcacaatgggaatagatttgaaattgatccttcatgggacaataa 28701424  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattgg 133  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  28701425 ctatatcaggcaaaagatcattgg 28701448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 20646657 - 20646790
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |    
T  20646657 ttgtgtctacgctacaagacaagaa-aacagctctgcctgcaaaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatc 20646754  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    || || |||||||| || | |||||  |||||||||    
T  20646755 caaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 20646790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22774527 - 22774404
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  22774527 gctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggc 22774430  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    |||| || | |||||  |||||||||    
T  22774429 aaaagattactggtggatgatcaaag 22774404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 10896596 - 10896661
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  10896596 ggaatgaatttgaaattgttccatcctaggacaataaccaaatcaagcaacatatcattggtgatt 10896661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 230
Target Start/End: Original strand, 28701449 - 28701526
Alignment:
Q  151 aaacaactctattttga-tgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28701449 aaacgactctattttgaatgtgctgacaattt-acaacgtctctttc--acacctctatataaaggagtgaagactcagag 28701526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 74)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 20954539 - 20954771
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20954539 actcagtttgtttctctgctacaagacaaggataacaaccccgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 20954638  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20954639 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatatgacaacgtctcttttctacacct 20954738  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20954739 ctatataaaggagtgaagacttagagaaagaca 20954771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1577881 - 1577654
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1577881 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataccagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgattcttcagaggac 1577782  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1577781 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatatgacagcgtctcttttctacacct 1577682  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1577681 ctatataaaggagtgaagacttagagaa 1577654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19717536 - 19717309
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19717536 tcagtttgtgtctctgctaaaagacaagaataaaagctatgactgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggacaa 19717437  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19717436 taaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactatattttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 19717337  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||    
T  19717336 atataaaggagtgaagacttagagaatg 19717309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 22201802 - 22202028
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22201802 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggatagcaactctgcttgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 22201901  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  22201902 aataaccatatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 22201998  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  22201999 ctatataaaagagtgaagacttagagaatg 22202028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 33256417 - 33256643
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  33256417 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatac-tggaattggatttgaaattgatccttcatagga 33256515  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||    
T  33256516 aaataatcatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 33256612  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33256613 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 33256643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 33276589 - 33276815
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  33276589 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatac-tggaattggatttgaaattgatccttcatagga 33276687  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||    
T  33276688 aaataatcatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 33276784  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33276785 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 33276815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48704218 - 48703989
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  48704218 actcaatttatgtctctgctacaagacaatgataacaattctgcctgcaacaatgttcctacatactgtgaatggatttgaatttgatccttcataggac 48704119  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactcta-ttttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||| | |||||||||||||||||||||    
T  48704118 aataaccatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctatttttgatttgctgacaat-tcacaacgtctcttttctacacc 48704020  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  48704019 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 48703989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12284435 - 12284211
Alignment:
Q  7 tcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12284435 tcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataatatatctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaaaggatttgaaattgattcttcatatgacaa 12284336  T
Q  107 taaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||||    
T  12284335 taaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagctcgaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctct 12284239  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  12284238 atataaagaagtgaagacttagagaatg 12284211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 28492470 - 28492695
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||| |||| | ||     
T  28492470 actcagtttgtgtctctgctactagacaagaataatagctctgcctgcaacaatgttcttacatactgggaatgaatttgaatttgatcattcataggat 28492569  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||      |||||||||||||||||||    
T  28492570 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat----tcacgtctcttttctacacct 28492665  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28492666 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 28492695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30893102 - 30892884
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  30893102 agtttgtgtctctactacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatac-tggaatggttttgaaattgatccttcataggacaata 30893004  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  30893003 accatatcaggcgaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctagaaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 30892907  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
     ||||||| |||||||| |||||    
T  30892906 gtaaaggaatgaagacttagaga 30892884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21028807 - 21028579
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  21028807 actcagtttgtgtctctgctacaggacaagaata-caactatgcctgcaacaatgttccttcatactttgaatggatttgaaattaatccttcataggac 21028709  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  21028708 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgaatctattttgatgtgttggaaat-tcacaatgtctcttt--cacacct 21028612  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21028611 ctatataaaggagtgatgacttagagaatgaca 21028579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 26702203 - 26702421
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  26702203 tgtgtctctgctacaagacaagaataacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatcattcataggacaataacca 26702302  T
Q  113 tatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  26702303 tatccggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactatattttgatgtgctggaaat-tcacaacgtct-ttttc-acacctctatataa 26702399  T
Q  213 aggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  26702400 aggagtgaagacttagagaatg 26702421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 16235372 - 16235591
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |  |  || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16235372 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccctctcaattgaaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 16235471  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||| || |||||    
T  16235472 tcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgacactattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctccatataaag 16235568  T
Q  215 gagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  16235569 gagtgaagacttagagaatgaca 16235591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1900359 - 1900137
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| || |   || ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1900359 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatattccttcacaatggggatggatttgaaattgatccttcataggac 1900260  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    |||||    
T  1900259 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cgcacct 1900163  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  1900162 ctatataaaggaatgaagacttagag 1900137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 22464885 - 22465098
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22464885 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 22464984  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  22464985 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 22465081  T
Q  215 gagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22465082 gagtgaagacttagaga 22465098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 237
Target Start/End: Original strand, 12624663 - 12624850
Alignment:
Q  46 tgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaa 145  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12624663 tgcctgcaacgatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaa 12624762  T
Q  146 gcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12624763 gcttcaaacgactct-ttttgatgtgatggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 12624850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2268545 - 2268319
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| |||||||  |  |  |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  2268545 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttacctgcaacgatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatcctttggaggac 2268446  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  2268445 aataaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacaactatattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 2268349  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  2268348 ctatataatggagtgaagacttagagaatg 2268319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38282581 - 38282359
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| | || | |||||| ||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  38282581 actctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaatagctctgcttgcaacaatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 38282482  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  38282481 aataaccatatcaggcaaaaggtcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 38282385  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  38282384 ctatataaaggagtgaatacttagag 38282359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36134204 - 36133977
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| | |||    
T  36134204 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcataagtggaatggatttaaaattgatcattcataggac 36134105  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || |||| | ||||||||||  ||| |||||    
T  36134104 aataaccatatcaggaaaaagataattggtgattgatcaaaagcttcaaacgacactattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctc--ttccacacc 36134008  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36134007 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 36133977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 22600248 - 22600474
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || |   ||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22600248 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatcattcataggac 22600347  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  22600348 aataaccatatcaggcaaaagataatgggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 22600444  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22600445 ctataaaaaggagtgaagacttagagaatg 22600474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22153871 - 22153648
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||||||  || |   ||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22153871 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctacatgcaaaaatgttccatcacaataggaatggatttgaaattgatcattcataggac 22153772  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  22153771 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgattaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 22153675  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||    
T  22153674 ctatataaaagagtgaaaacttagaga 22153648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10757435 - 10757211
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  10757435 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcattgttccttcatacttggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 10757336  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||| |||||| | |||||||||||||| || |||| | ||| |||||||||   ||||||    
T  10757335 aataaccatatcagacaaaagatcattggtgattg-gccaagc-tcaaacgaatctattttgatgtgctgacaat-tcacagcgtctcttt--cacacct 10757241  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  10757240 ctgtataaaggagtgaagacttagagaatg 10757211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7309827 - 7309608
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||| |  |  ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  7309827 ttgtgtatctgctacaagacaagaaaaacagttctgcgtgcaacaatgttccttcccaattggaatgaatttgaaattgatcattcataggacaacaacc 7309728  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  7309727 atatcaggcgaaagatcattggtgatcgatcaaagctttaaacgactctattttgatgcgctggcaatttcacaacgtctc-tttct-cacctctattta 7309630  T
Q  212 aaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  7309629 aaggagtgaagacttagagaat 7309608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 22427428 - 22427647
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22427428 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaacgatgttccttcaca-atggaaatgcatttgaaattgatccttcataggacaata 22427526  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||   ||| |||||    
T  22427527 accatatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacatctcta 22427623  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  22427624 tataaagaagtgaagactcagaga 22427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2834693 - 2834481
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||| || || |   |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  2834693 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgtctgcaacgatgttacttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcattcataggacaataaccata 2834594  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |   ||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  2834593 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttttttgatgtgctactaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 2834497  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  2834496 gagtgaagacttagag 2834481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29215811 - 29215588
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||  ||||||||||||||||| | | |||    
T  29215811 actctgtttttgtctctgctacaaggcaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatatatttgaaattgatcctttataggac 29215712  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  29215711 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaaaattctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 29215615  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29215614 tctatataaaggagtgaagacttagag 29215588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35040180 - 35039962
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| | |||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  35040180 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaaagctctgcctgcaacgacgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataagac 35040081  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||    
T  35040080 aataactatatcagacaaaagaccattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacc 35039986  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  35039985 tctatataaaggagtgaagactca 35039962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 17025039 - 17025257
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17025039 tgtctctgctataagaaaagaataacaactcttcctgcaacgatattccttcagacttggaatggatttgaaattgatccttcatatgacaataaccaaa 17025138  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    ||||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| | | |||||||||||   |||||||||| ||||     
T  17025139 tcaggaaaaagatcaaatgtgattgatcaaagattcaaacgactct-ttttgatgtcctggcaat-tcataacgtctcttt--cacacctctatataaat 17025234  T
Q  215 gagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  17025235 aagtgaagacttagagaatgaca 17025257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 21135226 - 21135448
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  21135226 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 21135325  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  21135326 aataaccatatcaggcaaaagataattagtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 21135420  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21135421 ctctatataaaggagtgaagactcagag 21135448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21702828 - 21702606
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  21702828 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 21702729  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||   ||||    
T  21702728 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatttatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 21702634  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||    
T  21702633 ctttatataaaggagtgaagacttagag 21702606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 23036605 - 23036751
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23036605 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 23036704  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactcta 161  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23036705 tcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcta 23036751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 25448632 - 25448854
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  25448632 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 25448731  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||| |   ||||    
T  25448732 aacaaccatatcaggcaaagaatcattgatgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctctct--cacac 25448826  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25448827 ctctatataaaggagtgaagactcagag 25448854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 32786008 - 32786226
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| | |||| |||||| |||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32786008 gtttttgtctccgctaaaagacaagaaaaacagctctgcttgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataa 32786107  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttga-tgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || | || |||| | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  32786108 ccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacggctctattttgaatgcgctgacaat-tcacaacgtctctttt--acacctctat 32786204  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  32786205 ataaaggagtgaagacttagag 32786226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2267098 - 2266881
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||| || || ||||||  |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  2267098 gtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctttgtctgcaaagatgttccttcaca-atggaaatgcatttgaaattgatcattcataggacaata 2267000  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  2266999 accatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatttgctggaaat-tcacaacgtct-ttttc-acacatctat 2266903  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  2266902 ataaaggagtgaagacttagag 2266881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 21191931 - 21192156
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| || ||| ||||||   |||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21191931 actctgtttgtgtctcttctacaggacaagaataacagctatgcttgcaacggggttccttcatattggaaatggatttgaaattgatccttcataggac 21192030  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||   ||||||    
T  21192031 aataaccatattaggcaaaagattattggtgattgatcaaagcttcaatcgactcttttttcatgcgctggcaat-tcacaacatctcttt--cacacct 21192127  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21192128 ctatataaaggagtgaagacttagagaat 21192156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30572211 - 30571989
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  30572211 actctgtttttgtttctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacattgggaactcatttgaaattgatccttcataggac 30572112  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||||   ||||    
T  30572111 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatttatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatggcaat---tcaatgtctcttt--cacac 30572017  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30572016 ctctatataaatgagtgaagactcagag 30571989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46089003 - 46088781
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | |||||||||||||| |||| | |||    
T  46089003 actctgtttttgtctctgctactagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatcattcataggac 46088904  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  46088903 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaatcgactctattttgaatgtgctgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 46088809  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46088808 ctctatataaaggagtgaagactcagag 46088781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42284632 - 42284479
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42284632 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 42284533  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa-agcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42284532 tcaggcaaaagatcattggtgatagatcaagagcttcaaacgactctattttga 42284479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 229
Target Start/End: Original strand, 14263528 - 14263741
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||| || ||     |||| | |||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  14263528 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcaacaatgtttcttcactatgggaaggcatttgaaattgatcattcttaggacaataaccata 14263627  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactct-attttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||    |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14263628 tcatgcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctaattttgaatgtgatggcaat---tcaacgtctcttttc-acacctctatata 14263723  T
Q  212 aaggagtgaagactcaga 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14263724 aaggagtgaagactcaga 14263741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 2327516 - 2327669
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||| |||||||| || |   |||||| |||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  2327516 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcttgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattaatccttcttaggacaataaccata 2327615  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2327616 tcatgcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 2327669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19215626 - 19215450
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  19215626 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatccttcatagga 19215527  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  19215526 caataaccatatcaggcaaaggaccaatggtgatttatctaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 19215450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21984599 - 21984387
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21984599 tgtctctgctacaagacaaggatgacagttctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 21984500  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  |||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  21984499 tcaggcaaaggatcattagtgatagttcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacacctctatataa 21984405  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21984404 aggagtgaagactcagag 21984387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 39201058 - 39201218
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||| |||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||| ||||| || || |   |||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  39201058 actctgtttttgtttctgctacaacacaa--aaaacagctctgcctgcaacgatgtttcttcacaatgggaatgcatttgaaatttatccttcataggac 39201155  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39201156 aataaccatatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttga 39201218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10251000 - 10250778
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |  | | |||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  10251000 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacatctctgcctgcaacaatgtttcttctcaaagggaatacatttgaaattgatccttcataggac 10250901  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||| |  | ||||    ||||||||||||   ||||    
T  10250900 aataaccataccaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactataatttgaatgagaagacaat---tcaacgtctcttt--cacac 10250806  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10250805 ctctatataaaggagtgaagactcagag 10250778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35401812 - 35401683
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||| || |   |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  35401812 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctacaacgatgttccttcacaatgggaatatatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 35401713  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35401712 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 35401683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 21121130 - 21121352
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || |   ||||   ||||||||||||||||  | | |||    
T  21121130 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgtctgcaacaatgtttattcacattgggaacacatttgaaattgatcctatataggac 21121229  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  21121230 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactcgattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 21121324  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21121325 ctctatataaaggagtgtagactcagag 21121352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23024802 - 23024626
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  23024802 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcatgcaacaatgtttatgcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 23024703  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||| |||||||||||||||  |||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  23024702 aatgaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 23024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 48570297 - 48570519
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||||| |||||| || |  |   |||||  ||||||||| |||| |||  | |||    
T  48570297 actctgtttttgtctctgctacaggacaagaaaaacagctatgcctgcaataatgtttcttctcaatgggaatacatttgaaatcgatctttctaaggac 48570396  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||||   ||||    
T  48570397 aataaccatatcaggcaaaggatcgttggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacac 48570491  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48570492 ctctatataaaggagtgaagactaagag 48570519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Original strand, 18896723 - 18896886
Alignment:
Q  66 catacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |   ||||||||||| ||||| || |    
T  18896723 catacttggaatggatttgaaattgatcattcacatggcaataaccaaatcaggcaatagatcattggtgatttaatcaagcttcaaacgactct-ttat 18896821  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  18896822 gatgtgctggcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtggatacttagagaat 18896886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 34255592 - 34255700
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgc-aacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34255592 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccat 34255691  T
Q  114 atcaggcaa 122  Q
    |||||||||    
T  34255692 atcaggcaa 34255700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 17400966 - 17400897
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttca 98  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17400966 gacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttca 17400897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20909359 - 20909206
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||  ||||    
T  20909359 atacatggaatagatttgaaattgttccttcttaggacaataaccaaatcaagcaacatatcattggtgatttgatc-aagtttcaaacgactc--tttt 20909263  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20909262 gatgtgctggcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 20909206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17371056 - 17370917
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | || | |||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  17371056 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaaatgttccttcatgataggaatggatttgaacgtgatccttcataggac 17370957  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17370956 aacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 17370917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37640948 - 37640862
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg 166  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37640948 atttgaaattgatccttcataggaaaataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttg 37640862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 167
Target Start/End: Original strand, 44823906 - 44823991
Alignment:
Q  83 tgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44823906 tgaaattgatcattcttaggacaataaccatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 44823991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 19170400 - 19170560
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| | || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  19170400 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcgttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcatagga 19170498  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctattt 164  Q
    ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  19170499 caacaaccaaatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaggtttcacaactactctattt 19170560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44201025 - 44200886
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  44201025 actctgtttgtgtctacgctacaagacaag-ataacaactttgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatctttcatagga 44200928  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    ||| | ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  44200927 caacatccaaatcaggaaaaagatcattggt-attgatcaaag 44200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20251781 - 20251651
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  20251781 ttgtgtctatgctacaaaacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 20251684  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20251683 caaatcaggcaaaagatcattggt-attgatcaa 20251651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 18614853 - 18614782
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  18614853 atacatggaatggatttgaaattgttccttcataggataataaccaaatcaaacaaaagatcattggtgatt 18614782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28474234 - 28474101
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||  | | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  28474234 ttgtgtctgcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttta-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 28474137  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  28474136 caaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaag 28474101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5929710 - 5929580
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | | || |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |    
T  5929710 ttgtgtctacgctacaagacaag-acaccagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatc 5929613  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5929612 caaatcaggcaaaagatcattggt-attgatcaa 5929580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22655484 - 22655352
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||  | ||||| | |    
T  22655484 ttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaatgtgatccttcttaggacaacatc 22655386  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22655385 caaatcaggcaaaagatcattggtgactgatcaa 22655352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28380002 - 28379871
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||| ||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  28380002 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 28379905  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  28379904 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 28379871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17018531 - 17018381
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| | | |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  17018531 atacttggaatggatttgaaattgttccttcataggataatatcaaaatcaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-tttt 17018434  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaa 221  Q
     ||||| ||| |||   |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||    
T  17018433 tatgtgctggaaat-caacaacgtctcttt--tacacgtctatataaaggagtgaa 17018381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 52350759 - 52350889
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||  ||||| ||| ||     |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  52350759 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataatagctctgcctgcagaaatgtcccttcaagttaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatcc 52350857  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52350858 aaatcaggcaaaagatcattggt-attgatcaa 52350889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 229
Target Start/End: Original strand, 21205058 - 21205160
Alignment:
Q  124 atatcattggtgattgatcaaa-gcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  21205058 atatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaa 21205152  T
Q  222 gactcaga 229  Q
    ||||||||    
T  21205153 gactcaga 21205160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 21214850 - 21214964
Alignment:
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||||||||     
T  21214850 atatcaggcaaaggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacacctctata 21214944  T
Q  210 taaaggagtgaagactcaga 229  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  21214945 taaaggagttaagactcaga 21214964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21544026 - 21543904
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| |  ||||||||| ||     ||||||||||||||  |||| ||| | | ||||| | ||| ||||||||    
T  21544026 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaaatgttccttcaagttaggaatggatttgaacatgattctttataggacaacatccaaatcaggca 21543927  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  21543926 aaagatcattggtgattgatcaa 21543904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 19038014 - 19037882
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||| ||| | | ||||| | |    
T  19038014 ttgtgtctgcgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaacatc 19037916  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  19037915 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 19037882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 167
Target Start/End: Original strand, 21206806 - 21206862
Alignment:
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21206806 atatcaggcaaaggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttga 21206862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22642841 - 22642770
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  | ||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22642841 ggaatggatttgaacatgatccttcttaggacaacatccaaataaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 22642770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 61
Target Start/End: Original strand, 21204998 - 21205044
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgtt 61  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  21204998 tgtctgtgctacaagacaaggataacagctcttcttgcaacaatgtt 21205044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22019343 - 22019211
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||| ||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||   |    
T  22019343 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacttc 22019245  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  22019244 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 22019211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 675568 - 675445
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| | | ||| ||||||||    
T  675568 gctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggca 675470  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    ||| || | |||||  |||||||||    
T  675469 aaagattactggtggatgatcaaag 675445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 18717 - 18944
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18717 actcagtttgtgtctctggtacaagacaaggataacagctctgcctacaacaatggtcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcaaaggac 18816  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18817 aataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatatgacaacgtctcttttctacacct 18916  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18917 ctatataaaggagtgaagacttagagaa 18944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 6512554 - 6512784
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6512554 actcagtttgtgtctctgctacacgacaaggataatagctacgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcaaaggac 6512653  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6512654 aataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 6512753  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatga 235  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6512754 ctatataaaggagtgaagacttagagaatga 6512784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17814979 - 17814749
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17814979 actcagtttgtgtctctgctacaaggcaaggataacagctctgcctgcaacaatgtttctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 17814880  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactcta-ttttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17814879 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaacttcaaacgactctattttttatgtgctgacaatgtggcaacatctcttttctacacc 17814780  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17814779 tttatataaaggagtgaagacttagagaatg 17814749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 89548 - 89774
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  89548 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcatcaatgttccttcatacttggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 89647  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  89648 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 89744  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  89745 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 89774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 21099830 - 21100056
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21099830 actcagtttgtgtctctgctacaggacaaggataacaactatgcttgcaacaatgttccttcatacttagaatggatttgaaattgatccttcataggac 21099929  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  21099930 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattaatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 21100026  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21100027 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 21100056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6499250 - 6499024
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6499250 actcagtttgtgtctctgctacaggacaagaataatagctacgcctgcaacaatgatccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 6499151  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  6499150 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggtaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 6499054  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6499053 ctatataaaggagtgaagactcagagaatg 6499024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 12352921 - 12353147
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  12352921 actcagtttgtgtctctgctacaggacaagaataacaactatgcctacaacgatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccctcataggac 12353020  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  12353021 agtaaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacct 12353117  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12353118 ctatataaaggagtgaagactcagacaatg 12353147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23881074 - 23880853
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23881074 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacaactctgcctgcaacattgttccctcatactttgaatggatttgaaattgatccttcataggacaata 23880975  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||   ||| ||||||    
T  23880974 accatataaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctatttttatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacagctctat 23880878  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
     |||||||||||||||| |||||||    
T  23880877 ataaaggagtgaagacttagagaat 23880853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21910567 - 21910401
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  21910567 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaagataacagttctgcctacaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattgatccttcatagaac 21910468  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtg 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21910467 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtg 21910401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 21199129 - 21199357
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21199129 actcagtttgtgtctctgctactggacaaggataacagctatgcctgcaacgatgttccttcatactttgaatggatttgaaattgatccttcataggac 21199228  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | ||  | |||||||||||||   ||||||    
T  21199229 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctcg-aaaattacaacgtctcttt--cacacct 21199324  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21199325 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 21199357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26784365 - 26784138
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26784365 actcagtttgtgtgtctgctacaagacaagaataacaactctgcctgcaaaaatgttcctacatgctgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 26784266  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||   |||||    
T  26784265 aataactatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttattttgatgtgctgggaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 26784169  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||| | ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26784168 tctgtataagggagtgaagacttagacaatg 26784138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 23413100 - 23413327
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagat--g 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  23413100 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaaaataacagctatgcctgcaacaatgttcccttatacttggaatggatttgaaattgatccttcatatagg 23413199  T
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||   ||||    
T  23413200 ataataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactc-attttgatgtgctggcaat-tcgcaacgtctcttt--cacac 23413295  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23413296 ctctatataaaggagtgaagacttagagaatg 23413327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 7745819 - 7746036
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7745819 actcggtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaactatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatccttcataggac 7745918  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  7745919 aataaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 7746015  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| |||| |||||||||||    
T  7746016 ctatataaaagagtgaagact 7746036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 9398860 - 9399047
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9398860 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacattgttccctcagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 9398959  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctctt 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  9398960 aataaccatatcaggcaaaagatcatt-gcgattgatcaaagcttcgaacgactctattttgatgtgctggcaat-ttacaacgtctctt 9399047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Original strand, 642837 - 643057
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || | | ||||  ||||    
T  642837 ttgtgtctctgctacaggacaaggataacagctatgcttgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatcatttataggaca--aacc 642934  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||    
T  642935 atattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatata 643031  T
Q  212 aaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    || ||||||||||| |||||||||||    
T  643032 aaagagtgaagacttagagaatgaca 643057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 19536431 - 19536650
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  19536431 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcttacatac-tggaatggatttgatattgattcttcgtatgacaata 19536529  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||      ||||||||||   |||||||||    
T  19536530 accatatcaggcaaaagatcattggcgattgatcaaagcttcaaacgactcttatttttatgtgctggcaat----tcacgtctcttt--cacacctcta 19536623  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  19536624 tataaaggagtgaagacttagaaaatg 19536650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 25096961 - 25097182
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  25096961 tgtctctgcaacaagacaagaataacagctatgcctgcaacaatgttccttcagacttggaatggatttaaaattgattcttcatatgacaataaccaaa 25097060  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctat--tttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||    
T  25097061 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttttcttttatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataa 25097157  T
Q  213 aggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  25097158 aggagtgaagacttggagaatgaca 25097182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 25154931 - 25155152
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  25154931 tgtctctgcaacaagacaagaataacagctatgcctgcaacaatgttccttcagacttggaatggatttaaaattgattcttcatatgacaataaccaaa 25155030  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctat--tttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||    
T  25155031 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttttcttttatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataa 25155127  T
Q  213 aggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  25155128 aggagtgaagacttggagaatgaca 25155152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20550906 - 20550682
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||| |||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  20550906 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagcttttcctgcaacgatgttccttcacaaattggaatcgatttgaaattgatccttcatagga 20550807  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||   |||||    
T  20550806 aaataaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggaaat-ttacaacgtctcttt--cacacc 20550710  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20550709 tctatataaaggagtgaagacttagaga 20550682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25741065 - 25740911
Alignment:
Q  74 gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  25741065 gaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgct 25740966  T
Q  174 ggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25740965 ggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactcagaga 25740911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 13545648 - 13545861
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||| ||| ||     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13545648 tgtctctgctacaagacaagataaacaactctgcctgcaatgatgtcccttcactatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 13545747  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||   | |||||||| |||||    
T  13545748 tcaggaaaaagatcaatgttgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatttgctggcaat-tcacaacgtctcttt--caaacctctatataaag 13545844  T
Q  215 gagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||||||||||||||    
T  13545845 gagtgaagactcagaga 13545861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 21203796 - 21203997
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||    
T  21203796 gacaaggataacagctatgcctgcaacgatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcatagaacaataaccatatcaggcaaaagatc 21203895  T
Q  129 attggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | | ||| | |||||||||||||   |||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21203896 attggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-tttttatgtgctagaaat-ttacaacgtctcttt--cacacatctatataatggagtgaagacttag 21203991  T
Q  229 agaatg 234  Q
    | ||||    
T  21203992 ataatg 21203997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 29138532 - 29138754
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |  |   |||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  29138532 actctgtttgtgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgtttcttctcaatgggaatacatttgaaattgatccttcataggac 29138631  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  29138632 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcgaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 29138726  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29138727 ctctatataaatgagtgaagactcagag 29138754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33022670 - 33022456
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |    | ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33022670 gtttttgtctctgctacaagacaagaa----agctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataa 33022575  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  33022574 ccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcagacgactctattttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 33022478  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  33022477 ttaaaggagtgaagacttagag 33022456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 41566693 - 41566845
Alignment:
Q  43 ctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc 142  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41566693 ctctgcctgaaacaatgttcctacatacatggaatgaatttgaaattgatcattcgtaggacaataacgatatcagggaaattatcattggtgattgatc 41566792  T
Q  143 aaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  41566793 aaagcttcaaacgactcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt 41566845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 35986368 - 35986520
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat--ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35986368 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgt--ctatatacattgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataacca 35986465  T
Q  113 tatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35986466 tatcaagcaaaagatcagtgatgatagatcaaagcttcaaacgactctattttga 35986520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 133
Target Start/End: Original strand, 41566560 - 41566688
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  | |||    
T  41566560 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgaaacaatgttcctacatgcatggaatgaatttgaaattgatcattcgtaggac 41566659  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattgg 133  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41566660 aataatcatatcaggcaaattatcattgg 41566688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 21072366 - 21072590
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  21072366 actcagtttgtgtctctgctacaagacaataataacagctctgcctgtagcattgttccttcatacttcaaatgaatttgaaattgatccttcataggac 21072465  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  21072466 aataaccatatcagacaaaagatcactggtgattgatc-aagc-tcaaacgaccct-ttttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 21072559  T
Q  205 -ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21072560 cctatataaaggagtgaagacttagagaatg 21072590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4887033 - 4886811
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||  ||||||||||||||||||  | |||    
T  4887033 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatacatttgaaattgatccttcttaggac 4886934  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgat-caaagcttcaaacaactcta-ttttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    |||||||||| |   ||||    
T  4886933 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgataaaaagcttcaaacgactctatttttaatgtgttggcaat---tcaacgtctctct--gacac 4886839  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4886838 ctctatataaaggagtgaagacttagag 4886811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21660213 - 21660047
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21660213 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaaacaatgtttatgcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccat 21660114  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  21660113 atcaggcaaaagatcaatggtgaatcatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat 21660047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28139618 - 28139396
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| || |  |   |||||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  28139618 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacattgtttcttctcaatgggaatacatttgaaattgatcattcataggac 28139519  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  28139518 aataaccatatcaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctaatttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 28139424  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28139423 ctctatataaaggagtgaagactcagag 28139396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 28464465 - 28464686
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  28464465 actctgtttttgtctctactataagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 28464564  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||    ||||||||||||   |||||    
T  28464565 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatttatcaaaagcttcaaacgactctttttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacacc 28464659  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28464660 tctatataaaggagtgaagactcagag 28464686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30742982 - 30742770
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||  | |   |||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  30742982 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcaacgatgttcctttacaatgggaatgcatttgaaattgatacttcttaggacaataaccata 30742883  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||| |||||||   |||||||||| |||    
T  30742882 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacatctcttt--cacacctctatataa 30742788  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30742787 aggagtgaagactcagag 30742770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 30115963 - 30116184
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  30115963 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 30116062  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    |||||||||||   |||||    
T  30116063 aataaccatatcaggcaaatgatcattagtgatttatcaaaagcttcaaacgactctattttaaatgtgctggcaat---tcaacgtctctt---tacac 30116156  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  30116157 cgctatataaaggagtgaagacttagag 30116184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10848784 - 10848562
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  | || |   |||| | |||||||||| |||||||| | |||    
T  10848784 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattaatccttcataggac 10848685  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  10848684 aataaccatatcaggcaaaggatcatttgtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 10848590  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10848589 ctctatataaaggagtgaagactcagag 10848562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11993899 - 11993677
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||||||||| | | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  11993899 actctgtttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgtccttgcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 11993800  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||| |   ||||    
T  11993799 aataaccatatcaggtaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttgaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctctct--cacac 11993705  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11993704 ctctatataaaggagtgaagactcagag 11993677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 14086665 - 14086886
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| || | ||| |||  ||||||||||||||||||  | |||    
T  14086665 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacatctcttcctgcaacgatgttccttcaca-atgaaattcatttgaaattgatccttcttaggac 14086763  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||||||   ||||    
T  14086764 aataaccatatcaggcaaatgatcattggtgattaatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggaaat---tcaacgtctcttt--cacac 14086858  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14086859 atctatataaagaagtgaagactcagag 14086886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15516971 - 15516758
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |  |   |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  15516971 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaaattgatctttcttaggacaataaccata 15516872  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgat--caaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  15516871 tcaggcaaatgatcattggtgattgattaaaaagcttcaaacgactttattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatata 15516777  T
Q  212 aaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15516776 aaggagtgaagacttagag 15516758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9088980 - 9088758
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| || |  | | |||||  ||||||||| ||||||||| | |||    
T  9088980 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgtctgcaacaatgtttcttctcaaagggaatacatttgaaatcgatccttcataggac 9088881  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  9088880 aacaaccatattaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 9088786  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  9088785 ctctatataaaagagtgaaaactcagag 9088758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 35932132 - 35932354
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  | || |   |||| | ||||||||||||| ||||| | |||    
T  35932132 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataactactctgtctgcaacaatttttattcacattgggaacgcatttgaaattgattcttcataggac 35932231  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  35932232 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 35932326  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35932327 ctctatataaaggagtgaaaactcagag 35932354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26759151 - 26758999
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||   |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  26759151 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatattccttcataataggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataaccata 26759052  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc--aaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  26759051 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaaagtttcaaacgactctatttt 26758999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 23391740 - 23391892
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23391740 tgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatgcttcataggacaataaccat 23391839  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg 166  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23391840 atcaggcaaaggatcattggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttg 23391892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 25930282 - 25930503
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| || |  | ||| ||||  |||||||||||||| |||| | ||    
T  25930282 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctacaacaatgtttcttctca-atgtgaatacatttgaaattgatcattcatagga 25930380  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||    
T  25930381 caataaccatatcaggcaaagaattattggtgattgatcaaaagcttc-aacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--caca 25930474  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25930475 cctctatataaaggagtgaagactcagag 25930503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 3245567 - 3245789
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| || || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  3245567 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgtctgcaacaatgtttcttcacattgggaacgtatttgaaattgatccttcataggac 3245666  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||||   ||||    
T  3245667 aataaacatattaggcaaaggatcattggtgatttatcaaaagtttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacac 3245761  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3245762 ctctatataaaggagtgaagactcagag 3245789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26765500 - 26765287
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |  |   |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  26765500 tgtctcagctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataaccata 26765401  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc--aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||| |||||||   |||||||||| ||    
T  26765400 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaaagtttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacatctcttt--cacacctctatata 26765306  T
Q  212 aaggagtgaagactcagag 230  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  26765305 atagagtgaagactcagag 26765287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33933278 - 33933057
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||| | ||   |||||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  33933278 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaacgatgttcattcacg-atggaaagcatttgaaattgatccttcataggac 33933180  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    |||||||||| |   ||||    
T  33933179 aataaccatatcaggcaaatgatcattgatgatcgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctctct--cacac 33933085  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33933084 ctctatataaatgagtgaagactcagag 33933057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Original strand, 13736326 - 13736481
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtg 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |    
T  13736326 ggaatgcatttgaaattgatcctttataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagctttaaacgactctattttaaatgcg 13736425  T
Q  172 ttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     || |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13736426 ctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagag 13736481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31117888 - 31117666
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||  |||||||| || |   |||| | |||||||||||| | |||| | |||    
T  31117888 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagcgctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaacgcatttgaaattgaacattcataggac 31117789  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||  ||| | |||||||| ||||   ||||||    
T  31117788 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaaacttcaaacgactctatttgaatgtgctgaaaat-tcacaacgtcccttt--cacacct 31117692  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  31117691 ctatataaagaagtgaagacttagag 31117666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31488138 - 31488033
Alignment:
Q  126 atcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||    
T  31488138 atcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctataaaaaggagtgaagact 31488042  T
Q  226 cagagaatg 234  Q
    |||||||||    
T  31488041 cagagaatg 31488033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16607469 - 16607350
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  16607469 ttcctccatacatggaatggatttgaaattgttcgttcataggacaataaccaaatcaggcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgact 16607371  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  16607370 ctattttaatgtgatggcaat 16607350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42243682 - 42243470
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||| |||| |||||||| ||     |||||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  42243682 tgtctctgctacaagacaagaaagacagctttgcctacaacgatgttccttcactatgggaatgcatttgaaattgatcattctttagacaataaccata 42243583  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattga-tcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||| |   |||||| ||| |||    
T  42243582 tcaggcaaaggatcattgatgattgattaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat---tcaacgtctctat--cacacctttatataa 42243488  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42243487 aggagtgaagactcagag 42243470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 22000297 - 22000408
Alignment:
Q  119 gcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||   |||||||||| |||||||||    
T  22000297 gcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttaatgtgctggcaat-tcacaacatctcttt--cacacctctatataaaggagt 22000393  T
Q  219 gaagactcagagaat 233  Q
    ||||||| |||||||    
T  22000394 gaagacttagagaat 22000408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 25112021 - 25112143
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  25112021 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataagacaacaaccaaatcaggca 25112120  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  25112121 aaagatcattggtgattgatcaa 25112143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 25171112 - 25171234
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  25171112 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataagacaacaaccaaatcaggca 25171211  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  25171212 aaagatcattggtgattgatcaa 25171234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Original strand, 11208111 - 11208270
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |    ||||||||||||| || || ||||| | |||    
T  11208111 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaaaataagaatggatttgaacttaattcttcataggac 11208210  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  11208211 aacatccaaatcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaggcttcagaacgactctatt 11208270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32160709 - 32160638
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32160709 ggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 32160638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1915421 - 1915290
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  1915421 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacaactctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 1915324  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1915323 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 1915290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13405120 - 13404989
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||   | |||||||||||||| |||||||||||   ||||| | ||    
T  13405120 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcattggacaacatcc 13405022  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  13405021 aaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 13404989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23478380 - 23478241
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| || |||||| |  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||  | ||    
T  23478380 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaatgtgatccttcttagga 23478282  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23478281 caacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 23478241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23488458 - 23488387
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23488458 ggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcagaagatcattggtgattgatcaa 23488387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 40032899 - 40033030
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  40032899 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcttgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 40032996  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  40032997 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 40033030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40228663 - 40228532
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  40228663 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 40228566  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  40228565 caaatcaggcaaaagaccattggtatttgatcaa 40228532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Original strand, 20215249 - 20215371
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  20215249 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 20215347  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggt 134  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  20215348 caaatcaggcaaaagatcattggt 20215371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 34638400 - 34638337
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtg 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  34638400 tggaatggatttgaaattgttccttcataggacaataaccaaatcaagcaacaaatcattggtg 34638337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 122
Target Start/End: Original strand, 2156463 - 2156518
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  2156463 atacaaggaatggatttgaaattgttccttcacaagacaataaccaaatcaagcaa 2156518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17668417 - 17668191
Alignment:
Q  8 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||    
T  17668417 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatctatttgaaattgatcctttaaaggacaat 17668318  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17668317 aaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactttattttgatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 17668218  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||    
T  17668217 tataaaggagtgaagacttagagaatg 17668191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 49642907 - 49643133
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49642907 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 49643006  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||   ||||||    
T  49643007 aataaccatatcaggcaaaagattattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtgctggcaat-tcgcaacgtctcttt--cacacct 49643103  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  49643104 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 49643133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15903212 - 15902983
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15903212 actcagtttgtgtctctactaaatgacaaggataacagctctgcctgcaacaatgtacccacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagaggac 15903113  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15903112 atcaaccatatcaggcaaaagatcgttggtgattgatcaaagcttcaaacgactatattttgatgtgctggcaatatgacaacgtctcttttctacacct 15903013  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  15903012 ctatataaaggagtgaagacctagagaatg 15902983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 13780729 - 13780956
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  13780729 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgcaacaatgttcctacgtacatggaatagatttgaaattgatccttttgaggac 13780828  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  13780829 aataaccatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttttctacaact 13780927  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13780928 atatataaaggagtgaagacttagagaat 13780956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31303400 - 31303192
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31303400 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactagcaatggatttgaaattgatccttcagagggc 31303301  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  31303300 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 31303204  T
Q  205 ctatctaaagga 216  Q
    |||| |||||||    
T  31303203 ctatataaagga 31303192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 30000736 - 30000963
Alignment:
Q  4 cactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  30000736 cactcagtttgagtctctgctactggacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcatagga 30000835  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||| |||||    
T  30000836 caataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaatgtctc--ttccacacc 30000932  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30000933 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 30000963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 29951582 - 29951809
Alignment:
Q  4 cactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29951582 cactcagtttgagtctctgctactggacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcatagga 29951681  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||  ||||||    
T  29951682 caataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctttcaat-tcacaatgtctcttt--tacacc 29951778  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29951779 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 29951809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20646168 - 20645941
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  20646168 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagttctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaatttgatccttcataggac 20646069  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||    
T  20646068 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactcttattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 20645972  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20645971 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 20645941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13948350 - 13948124
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13948350 actcaggttgtgtctctactacaagacaaggataacagatctgcctgcaacaatgttcctacgtacgtggaatggatttgaaattgatccttcataggac 13948251  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  13948250 aataaccatattaggaaaaagatcattggtaattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 13948154  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13948153 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 13948124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37467344 - 37467118
Alignment:
Q  8 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  37467344 cagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcccgcaacaatgttcctgcatactgggaatggatttgaaattgatcattcataagacaat 37467245  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||||||    
T  37467244 aaccatatcaggcaaaagatcatttatgattgattaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctcta 37467148  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37467147 tataaaggagtgaagacttcgagaatgaca 37467118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 22804168 - 22804393
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22804168 actcaatttgtgtctctgctacaggacaagaataacagctctgcctgcaactttgttccctcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 22804267  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  22804268 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagctttaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaa-gtctcttt--cacacct 22804363  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22804364 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 22804393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 16658767 - 16658990
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16658767 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaattaatccttcatatgacaata 16658866  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc-tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| ||||    
T  16658867 accatatcatgcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgaatcttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacttcta 16658963  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  16658964 tataaaggactgaaaacttagagaatg 16658990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28582120 - 28581898
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28582120 actcagtttttgtctctggtacaaaacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 28582021  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  28582020 aataaccatagcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 28581924  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  28581923 ctatataaaggagtgaagacttagag 28581898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 12963230 - 12963459
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||  |||| |||| | |||    
T  12963230 actcagtatgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctatctgcaacaatgttccttcataattagaatggatttgaaagcgatcgttcataggac 12963329  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  12963330 aataaacatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcgaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 12963426  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12963427 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 12963459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 19889089 - 19889314
Alignment:
Q  6 ctcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgaca 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| |||| |  | |    
T  19889089 ctcagtttgtgtctctgctacaagataaggataacaactctacctgcaacaatgttccaacatactgagaatggatttgaaattgatcattcatagtaaa 19889188  T
Q  106 ataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctc 205  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||   |||||||    
T  19889189 ataaccatatcagtcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcataacgtctcttt--cacacctc 19889285  T
Q  206 tatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||| ||| ||| |||||| | ||||||||    
T  19889286 tatataatggattgaagaattagagaatg 19889314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 14393153 - 14393375
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  14393153 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcggcaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatcctccataggacaata 14393252  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||  ||  ||||||||||    
T  14393253 acaatatcatgcataagatcattggtgattgatcaaagctttaaacgactctattttgatgtgctggaaat-tcacaacgtctc--ttacacacctctat 14393349  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14393350 ataaaggagtgaaaacttagagaatg 14393375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 231
Target Start/End: Original strand, 38177801 - 38178011
Alignment:
Q  18 ctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatc 116  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38177801 ctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacgatgttccttcaca-atgagaattgatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatc 38177899  T
Q  117 aggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagga 216  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  38177900 agacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaagga 38177996  T
Q  217 gtgaagactcagaga 231  Q
    ||||||||| |||||    
T  38177997 gtgaagacttagaga 38178011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 49553644 - 49553863
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| || ||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49553644 tgtctctgctacaagacaggaaaaacaactttgtctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 49553743  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||   ||||| |||| |||||    
T  49553744 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcgtcaaacgactctattttgatgtgttgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacccctatataaag 49553840  T
Q  215 gagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  49553841 gagtgaagacttagagaatgaca 49553863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2561202 - 2560979
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||| || |   |||||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  2561202 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaaattgatcattcataggac 2561103  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  2561102 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 2561006  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||    
T  2561005 ctatataaagaagtgaagacttagaga 2560979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6090746 - 6090519
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||| || ||||  |  |  ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  6090746 actctgtttttgtctctgctgcaagacaagaaaaacagctcttcctgcaacgatattccctctcaattggtatggatttgaaattgattcttcataggac 6090647  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  6090646 aataatcatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcgaacgactctattttgatgtgctggcaatatgacaatgtctcttttctacatct 6090547  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6090546 ctatataaaggagtgaatactcagagaa 6090519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 20627588 - 20627799
Alignment:
Q  17 tctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatc 116  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20627588 tctctgctacaagataagaaaaacaactctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatc 20627687  T
Q  117 aggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagg 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20627688 aggcaaaagatcattggtgattgatcaaatcttcaaacgactctgttttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--tacacctctatataaagg 20627784  T
Q  216 agtgaagactcagag 230  Q
    |||||||||| ||||    
T  20627785 agtgaagacttagag 20627799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Original strand, 17239071 - 17239293
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||| || | ||||| |    
T  17239071 agtttgtatctctactataagacaagaataacagctctgcctgcagtaatgttccttcatactttgaattgatttgaaactgatcctccataggacaaaa 17239170  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  17239171 accatatcaggcaaaagatcattgattattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 17239267  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  17239268 ataaaggagtgaagacttagagaatg 17239293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 12389017 - 12389246
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  12389017 actctgtttttgtctctgcaacaagactagaataacaactatgcctgcaacgatgttcctttagacttggaatggatttgaaattgatccttcattggac 12389116  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||  ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  12389117 aataaccaaatcaggcaaaagatcgttggtgattgatcaaagcttctaacgactcttttttgatgtgctgagaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 12389213  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12389214 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 12389246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 47405571 - 47405788
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47405571 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataa 47405670  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| | |||||||||||||   | ||||||||     
T  47405671 ccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgctgacaat-tcacaacgtctcttt--catacctctata 47405767  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  47405768 taaaggagtgaagacttagag 47405788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 19249566 - 19249783
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||| ||  |||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  19249566 tgtctctgcaacaagtcaagaataacagctacgcctgcaacagtgttccttcagacttggaatggattcgaaattgatccttcataggacaataacaaaa 19249665  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  19249666 tcaggcaaaagatcattggtgattgataaaagcttcaaacgactcttttttgatgtgctggcaattcaacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 19249763  T
Q  215 gagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  19249764 gagtgaagacttagagaatg 19249783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 25398400 - 25398614
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||  |  |  |||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  25398400 actctgtttttgtctctgctacaagacaataaaaacagctctgcctgcaacgatgttccctctcaattggaatggatttaaaattgatccttcataggac 25398499  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||   ||||||    
T  25398500 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctactttgatgtgctggcaat-tcataacgtctcttt--cacacct 25398596  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaag 222  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25398597 ctatataaaggagtgaag 25398614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41495013 - 41494786
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||| |||||| || ||||   |||| ||||||| |||||||||||||| |||| |   |    
T  41495013 actcagtttgtgtatctgctacaagataagaataacagctatgcatgcaacgatattcccttatacttggaatgaatttgaaattgatcattcatagatc 41494914  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41494913 aataaccatatcaggcaaag-attattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgcagtcaatttgacaatgtctcttttctacacct 41494815  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
     ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  41494814 ttatataaaggagtggagacttagagaat 41494786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 12726375 - 12726604
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||  |  |  |||| || ||||||||||||||||||| | ||     
T  12726375 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctggaacgatgttccctctcaattggactgaatttgaaattgatccttcataggat 12726474  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  12726475 aataaccatatcacacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactatattttgatgtgctggaaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 12726571  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12726572 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 12726604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52920415 - 52920193
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||| || |||||||||| |||||    |  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  52920415 gtttttgtctctgatacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacgatgttttctctcaattggaatggatttgaaattgatccttcatatgacaa--a 52920318  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||     
T  52920317 ccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtactggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctata 52920221  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  52920220 taaaggagtgaagacttagagaatgaca 52920193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40799888 - 40799664
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   |||||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  40799888 actctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcattcataggac 40799789  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||   ||| |    
T  40799788 aataaccatatcaaggaaaagatcattgttgattgatcaaagctttaaacgactctattttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacatc 40799692  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40799691 tctatataaaggagtgaagactcagaga 40799664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Original strand, 18142956 - 18143111
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtg 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18142956 tggaatgaatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtg 18143055  T
Q  172 ttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     || |||| | |||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18143056 ctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacatctctatataaaggagtgaagacttagag 18143111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16812184 - 16812004
Alignment:
Q  48 cctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagc 147  Q
    |||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16812184 cctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaacaaccatatcaggcaaaagatcattggtgattggtcaaagc 16812085  T
Q  148 ttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16812084 ttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaatttcacaatgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactcagaga 16812004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 46350000 - 46350210
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  46350000 tgtctctgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcaca-atggaatgcatt-gaaattgatcgttcataggacaataaccata 46350097  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  46350098 ttaggcaaaagatcattgatgattgatgaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 46350194  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||| ||||    
T  46350195 gagtaaagacttagag 46350210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2785069 - 2784857
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  2785069 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaagaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaaattgatccttctttggacaataaccata 2784970  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  2784969 tcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 2784875  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2784874 aggagtgaagactcagag 2784857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 49666560 - 49666772
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  49666560 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataagacaataatcata 49666659  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  49666660 tcaggcaaaggatcattggtgatttatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggaaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 49666754  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49666755 aggagtgaagactcagag 49666772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11868283 - 11868060
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||    
T  11868283 actctgtttttgtctctgctacaaaacaagaaaaacaactcagcctgcaacgatgttccttcgcaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggac 11868184  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||| ||||||||   |||||    
T  11868183 aataaccttatcaggcaaaagatcattggtgattgagcaaagctttaaacaactctattttgaatgtgctggaaat-tcacaaagtctcttt--cacacc 11868087  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11868086 tctatataaaggagtaaagactcagag 11868060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20725092 - 20724876
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  20725092 tgtctctactacaggacaagaataacaattatgcttgcaacgatgttccttcagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaa 20724993  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgatt-gatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||   |||||| ||| ||||    
T  20724992 tcaggcaaaagatcattggtgatttgattaa-gattctaacgactct-ttttgatgtgttggcaattcaacaacgtctctttc--acacctttatataaa 20724897  T
Q  214 ggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20724896 ggagtgaagacttagagaatg 20724876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11223568 - 11223356
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||| || |   |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  11223568 tgtctctgctacaagacaagaaaaacaactttgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttaaaattgatccttcataggacaataactaca 11223469  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  | || ||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  11223468 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaataagctgacaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 11223374  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11223373 aggagtgaagactcagag 11223356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Original strand, 18121826 - 18121979
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtg 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18121826 tggaatgaatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattga--aaagcttcaaacgactctattttgatgtg 18121923  T
Q  172 ttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     || |||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18121924 ctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagag 18121979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33583234 - 33583022
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  33583234 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaataaccata 33583135  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  33583134 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtcctggaaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 33583040  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    | ||||||||||||||||    
T  33583039 aagagtgaagactcagag 33583022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 21605799 - 21606021
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || || |   ||||   ||||||||||||||||||| | ||     
T  21605799 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctccaacaatgtttcttcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggat 21605898  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||  |||||    
T  21605899 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaaacttcaaacgattctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--tacac 21605993  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21605994 ctctatataaaggagtgaagattcagag 21606021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13824092 - 13823863
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13824092 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatccttcataggac 13823993  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||||   | | |  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  13823992 aataaccatatcatgcaaaattgaaattgaaattgatcaaatcttcaaacgactttgttttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 13823896  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13823895 ctatataaatgagtgaagaataagagaatgaca 13823863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21640871 - 21640662
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21640871 tgtctcttttacaagacaagaataacagctctgcctccaacaatgtttcttcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 21640772  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  21640771 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 21640677  T
Q  213 aggagtgaagactca 227  Q
    |||||||||||||||    
T  21640676 aggagtgaagactca 21640662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 21636815 - 21637037
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |  |||||   ||||||||||||||||||| |  ||    
T  21636815 actctgtttttgtctctgctacaagacaagcaaaacaactctgcctgcaacaatgtttattcacatttggaacacatttgaaattgatccttcatagaac 21636914  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||   |  ||||||||||||   ||||    
T  21636915 aataaccatatcaggcaaatgatcattgatgattgatcaaaagcttcaaactactctattttaaatgtgatgaca---tttcaacgtctcttt--cacac 21637009  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21637010 ctctatataaaggagtgaagactcagag 21637037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 226
Target Start/End: Original strand, 24775679 - 24775896
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  24775679 actctgtttttgtctctgctacaagacaagtaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 24775778  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||    |||||||||| |   ||||    
T  24775779 aataa-catattaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggaaat---tcaacgtctctct--cacac 24775872  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactc 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  24775873 ctctatataaaggagtgaagactc 24775896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14969313 - 14969168
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgt 172  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  14969313 ggaatggatttgaaattgatcctttataggacaataactatatcaggaaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgc 14969214  T
Q  173 tggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaa 221  Q
    |  |||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  14969213 taacaat-tcacaacgtctcttt--gacacctctatataaaggagtgaa 14969168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16032539 - 16032406
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16032539 actctgtttttgtctctgctacatgacaacaataacaactatgcctgcaacgatgttccttcatacttgaaatggatttgaaattgatccttcataggac 16032440  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16032439 aatgaccatatcaggcaaaaaatcattggtgatt 16032406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40850991 - 40850769
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || |   |||| | |||||||||||||| |||| | |||    
T  40850991 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacaactctgccttcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatctttcataggac 40850892  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | | ||| |  ||||||||||||   ||||    
T  40850891 aataaccatatcaggaaaaggatcattgctgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgat-gaaattt--caacgtctcttt--cacac 40850797  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40850796 ctctatataaaggagtgaagactcagag 40850769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29855411 - 29855201
Alignment:
Q  17 tctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatc 116  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||  ||||||| || |   ||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  29855411 tctctgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcaacgttgttccttcacaatgggaatgcttttgaaattgatccttcttaggacaataaccatatc 29855312  T
Q  117 aggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||| |||    |||||||||| |||||    
T  29855311 aggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat-tcacaacgtccctt---cacacctctatataaag 29855216  T
Q  215 gagtgaagactcaga 229  Q
    |||||||||||||||    
T  29855215 gagtgaagactcaga 29855201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50300237 - 50300025
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| || |   |||||| |||| |||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  50300237 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgtctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcattttaaattgatccttcttaggacaataatcata 50300138  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    |||| |||||||  ||||| ||||| |||    
T  50300137 tcaggcaaaggatcattgatgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacatctcttt--tacacatctatataa 50300043  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50300042 aggagtgaagactcagag 50300025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22140778 - 22140615
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| || |   |||| |  |||||||||||||||||| | |||    
T  22140778 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacaatgttcctgcacattgggaacgcgtttgaaattgatccttcataggac 22140679  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22140678 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtaattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 22140615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 1728160 - 1728336
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   ||||   ||||||||||||||||||| | ||    
T  1728160 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacacatttgaaattgatccttcatagga 1728259  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  1728260 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 1728336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3238703 - 3238486
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |  |   ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3238703 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcaacaatgttccttcggaatgggaacacatttgaaattgatccttcataggacaataa 3238604  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    ||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||| ||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||     
T  3238603 ccaaatcaggcaaaagatcactcgtaattgatcaaagtttcaaacgactctttttgaatgtgctggcaatttcacaacttctcttt--cacacctctatt 3238506  T
Q  210 taaaggagtgaagactcaga 229  Q
    ||||||| |||  |||||||    
T  3238505 taaaggaatgataactcaga 3238486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 30054362 - 30054538
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat--ggaatggatttgaaattgatccttcagatg 102  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||  |||| | ||||||| ||  ||||||| | |    
T  30054362 actctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgcaacaatgtt--tactcacattgggaacgcatttgaatttattccttcatagg 30054459  T
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  30054460 acaataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat 30054538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 46796517 - 46796673
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| || |  | | |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46796517 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgtttcttctcaaagggaatacatttgaaattgatctttcatatgacaataa 46796616  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  46796617 ccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacggctctatttt 46796673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47207720 - 47207496
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||  || ||||||||| |||||| | || |   |||||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  47207720 actctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagttcagcctgcaacgatgttcattcacaatgggaatgcatttgaaattgattcttcataggac 47207621  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | | ||||| | |||||||||||||   ||| |    
T  47207620 aatgaccatatcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactttattttgaatgagctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacatc 47207524  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  47207523 tctatataaagaagtgaagacttagaga 47207496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5213582 - 5213369
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |  |   |||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  5213582 tgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcgtgcaacaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaatagccata 5213483  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc--aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| ||    
T  5213482 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaaagcttcaaacgattctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatata 5213388  T
Q  212 aaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  5213387 aaggagtgaaaactcagag 5213369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14955430 - 14955220
Alignment:
Q  17 tctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatc 116  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| |  |   |||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||    
T  14955430 tctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataaccatatc 14955331  T
Q  117 aggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |    ||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  14955330 aggcaaatgatcattgatgattgatcaaaatcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcagt---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaag 14955236  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14955235 gagtgaagacttagag 14955220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Original strand, 26417874 - 26418046
Alignment:
Q  58 tgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaa 156  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||| || | |||||||| || |||||| ||||||||||| |    
T  26417874 tgttcctccatacttggaatggatttgaaattgatctttcataggacaataaccaaatcagggaacagatcattggagatttgatc-aagcttcaaacga 26417972  T
Q  157 ctctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  26417973 ctct-ttttgatgtgttggcaat-cgacaacgtctcttt--cacacctttatataaaggagtgaagatttagagaatg 26418046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 9700181 - 9700342
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |   ||||   |||| |||||||||||||| | ||    
T  9700181 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaataacatctctgcctgcaaacaatgttcatacacattgggaacacatttaaaattgatccttcatagga 9700280  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9700281 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctttttt 9700342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12968266 - 12968106
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  12968266 ttcctccatacttggaatatatttgaaatttctccttcacatgacaataaccaaatcaggcaatagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgact 12968168  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    || ||||||||||||||||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  12968167 ct-ttttgatgtgttggcaat-aaacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagac 12968106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6253366 - 6253217
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgt 170  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6253366 tggaatgaatttgaaattgttccttcataggacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacaactct-ttttgatgt 6253269  T
Q  171 gttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    | || ||||   |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6253268 gctgacaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 6253217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 45861734 - 45861856
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  45861734 gctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacaaccaaatcaggca 45861833  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  45861834 aaagatcattggtgattgatcaa 45861856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 12752765 - 12752904
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || |   ||||||| ||||||  ||||| |||| | |||    
T  12752765 actctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaaaatgttccttcagaataggaatggctttgaacgtgatcattcataggac 12752864  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12752865 aacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 12752904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Original strand, 53056872 - 53057033
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatgg-aatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||  | || ||||||  |||||| | || | |||| |||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  53056872 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagttatgtctgcaaagatgttcattcaca-atggtaatgcatttgaaattgatccttcatagga 53056970  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  53056971 caataactatatcaggcaaaaaataattgctgattgatcaaaagcttcaaaagactctatttt 53057033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 49990258 - 49990116
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  49990258 gctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggc 49990160  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  49990159 aaaagatcattggtgattgatcaaagtttcacaacgactctatt 49990116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 51341025 - 51340886
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| |||  ||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| |  ||    
T  51341025 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaaatgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcatagtac 51340926  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51340925 aacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 51340886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15833401 - 15833281
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | | ||||| ||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  15833401 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-ata-ggaattgatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggca 15833304  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  15833303 aaagatcattggtgattgatcaa 15833281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 237
Target Start/End: Original strand, 23538334 - 23538538
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| | |||| || ||||| ||||  ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||| |||    
T  23538334 gacaagaacaacagctatgcctacaacggtgttcctccagactttgaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcagagaaaagatc 23538433  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    | |||||| |||||| ||||||||||| |||   |||||||||| |  ||||   ||||||| |||||   |||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  23538434 aatggtgatttgatc-aagcttcaaacgact-gcttttgatgtgctaacaat-caacaacgtttcttt--cacacctttatataaaggagtgaagactta 23538528  T
Q  228 gagaatgaca 237  Q
    ||||||||||    
T  23538529 gagaatgaca 23538538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22151253 - 22151101
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||| | || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  22151253 ttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttctttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatc 22151155  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca-aacaactctatt 163  Q
    || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22151154 caaatcaggcaaaagatcattgctgtttgatcaaagtttcacaacgactctatt 22151101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12397016 - 12396864
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata---accatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||   |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  12397016 tggaatggatttgaaattgttccttcataggacaataaccaccaaatcaagcaacaaatcattggtgatttgatcaaa-cttcaaacgactct-ttttga 12396919  T
Q  168 tgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| || ||||   |||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||    
T  12396918 tgtgctgacaat-caacaacgtctcttt--cacacctctgtataaaggagtgaagact 12396864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15851023 - 15850884
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | || | |||||||| ||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  15851023 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctccagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcatagga 15850925  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15850924 caacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 15850884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 13148212 - 13148141
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13148212 ggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 13148141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Original strand, 22766730 - 22766841
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttca-aacaactctattt 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  22766730 atacatggaatggttttgaaattgttccctcataggacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcataacgactc--ttt 22766826  T
Q  165 tgatgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||||||||    
T  22766827 tgatgtgttggcaat 22766841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10529353 - 10529222
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  10529353 ttgtgtctacgctacaagacaagaa-aacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 10529256  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  10529255 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 10529222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 11909174 - 11909310
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaatt-gatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||  || |   |||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |    
T  11909174 gtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaactttgatccttcataggacaaca 11909273  T
Q  109 acc-atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11909274 acccaaattaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 11909310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Original strand, 19198089 - 19198155
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  19198089 tggaatggattcgaaattgttccttcacaagataataaccaaatcaagcaaaaaatcattggtgatt 19198155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27374621 - 27374561
Alignment:
Q  162 ttttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27374621 ttttgatgtgttggcaatctg-caacgtctctttc--acacctctatataaaggagtgaagact 27374561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37412543 - 37412471
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||  |||| |||||| | || ||||||||||    
T  37412543 atttgaaattgatccttcataggacaataactatatcaggaaaatgatcaatggtgaatcataaaagcttcaa 37412471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22128895 - 22128843
Alignment:
Q  183 acaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22128895 acaacgtctctttt--acacctctatataaaggaatgaaaactcagagaatgaca 22128843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 51989173 - 51989307
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||| ||| | | ||||| |    
T  51989173 gtttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgattctttataggacaaca 51989271  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
     ||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  51989272 tccaaatcaggaaaaagatcattggtatttgatcaa 51989307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2246577 - 2246437
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  2246577 actctgtttttgtctatgctacaagacaag-acaacagctctgcctgcataaatgttccttca-agataggaatgaatttgaagttgatccttcatagga 2246480  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | | | ||| ||||||||||| || | |||||  |||||||||    
T  2246479 ctacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 2246437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 8729201 - 8729263
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggt 134  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||    
T  8729201 tggaatgaatttgaaattgttctttcatatgacaataaccaaatcaagcaatagatcattggt 8729263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 9081088 - 9081150
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggt 134  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||    
T  9081088 tggaatgaatttgaaattgttctttcatatgacaataaccaaatcaagcaatagatcattggt 9081150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 377655 - 377883
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  377655 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaagaatgctcctacatatatggaatggatttgaaattgatccttcataggac 377754  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  377755 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaatttgacaacatctctttcctacacct 377854  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  377855 ctatataaaggaatgaagacttagagaat 377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 220253 - 220027
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  220253 actcagtttgtgcctctgctaaaagacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccatcataggac 220154  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||   ||||||    
T  220153 aataaccataacaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaattgactctattttgatttgctggcaat-tcacaacatctcttt--cacacct 220057  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  220056 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 220027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 211413 - 211193
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| ||   || |||||| |||||||||| ||||||   | ||    
T  211413 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttca---atgggaatgcatttgaaatttatccttattagga 211317  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||    
T  211316 caataaccatatcaggaaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--caca 211222  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  211221 cctctatataaaggagtgaagactcagag 211193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 244402 - 244603
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| |||||||| || || |  || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  244402 gacaagaataacagctatgcctgcaacgatgttcctccagactttaaacggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatc 244501  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   | |||||||| ||||| |||||||||| |    
T  244502 attggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--caaacctctatataaagaagtgaagactta 244596  T
Q  228 gagaatg 234  Q
    |||||||    
T  244597 gagaatg 244603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 12715554 - 12715782
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12715554 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacggctcttcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatcattcagaggac 12715653  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12715654 aacaaccatatcaggcaaaagatcactggtgattgatcaaagcttcaaacaactatattttgatgtgctgacaatgtcacaacgtctcttttctacacct 12715753  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12715754 ctatataaaggagtgaagacttagagaat 12715782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18378329 - 18378101
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaa-tgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  18378329 actcagtttgtgtctctgctacaaaacaaggataacaactctacctgcaacaaatattcctacatactgggaatagttttgaaattgatctttcagagga 18378230  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18378229 taataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctgttttgatgtgctggaaatgtgacaacgtctcttttctacacc 18378130  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaa 232  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18378129 tctatataaaggagtgaagacttagagaa 18378101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19623994 - 19623769
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  19623994 actcagtttgtgtctttgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcaatgttccttcatacttagaatggatttgaaattgatcctttataggac 19623895  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  19623894 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaatcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 19623798  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19623797 ctatataaaggagtgaagacttagagaat 19623769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19086173 - 19085948
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  19086173 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcatcaatgttccttcatacttggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 19086074  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||   ||||||    
T  19086073 aataacaatattaggcaaaatatcattggtgatggatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctattt--cacacct 19085977  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
     ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  19085976 ttatataaaggactgaagacttagagaat 19085948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13602187 - 13601960
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| | |||    
T  13602187 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgcaacaatgctcctacatactgggaatggatttaaatttgatccttcataggac 13602088  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13602087 aataaccatattagacaaaagatccttggtgattgatcaaagtttcatacgactctatttagatttgctggcaat-tcacaacgtctcttttctacacct 13601989  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13601988 ctatataaaggagtgaagacttagagaat 13601960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15302215 - 15301989
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  15302215 actcagttagtgtctctgctacaagacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatgaatttgaaattcatccttcataggac 15302116  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  15302115 aataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 15302019  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  15302018 ctatataaaggagtgaatacttagagaatg 15301989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15987248 - 15987022
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15987248 actcagtttgtgtctctactacaggacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 15987149  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||   ||||||    
T  15987148 aataaccatatcagacaaaagatcgttggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggaaat-tcataacgtctcttt--cacacct 15987052  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  15987051 ctatattaaggagtgaagacttagagaatg 15987022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24116843 - 24116621
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24116843 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgccttcaacaatgttcttacatactgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 24116744  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||  |   ||||||    
T  24116743 aataatcatatcaggcaaaagatcattggtgattaatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggaaat-tcacaacgtctc--tcgcacacct 24116647  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  24116646 ctatataaaggagtgaagacttagag 24116621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 20112834 - 20113059
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  20112834 actcagtttgtgtctctgcgacaagacaagaataacagctctccctgcaacattgttccctcatacttggaatagatttgaaattgatccttcataggac 20112933  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  20112934 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgtaaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 20113030  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20113031 ctatataaaggagtgaagact-agagaatg 20113059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23284579 - 23284390
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  23284579 actcagtttgtgtctccgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatggatttgaaattaatccttcataggac 23284480  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  23284479 aataaacatatcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt 23284390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25594083 - 25593857
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25594083 actcagtttgtgtctctgctacaagaaaagaataacagctctgcttgcaataatgttcgtacgtacatggaatggatttgaaattgatcctttagaggac 25593984  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||   ||||||    
T  25593983 aataaccatatcagccaaaaggtcattggtgattaatcaaaacttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-ttacaacatctcttt--cacacct 25593887  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25593886 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 25593857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32544280 - 32544063
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32544280 actctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 32544181  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||| ||    
T  32544180 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacatct 32544084  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  32544083 ctatataaaggagtgaagact 32544063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9717858 - 9717636
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  9717858 actctgtttttgtctctgatacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggag 9717759  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  9717758 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 9717662  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     | | |||||||||||||||| ||||    
T  9717661 ttgtataaaggagtgaagacttagag 9717636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29918032 - 29917810
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||| | || |   |||||| ||||||||||||| ||||| | |||    
T  29918032 actctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttcattcacaatgggaatgcatttgaaattgattcttcataggac 29917933  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  29917932 aatgaccatatcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 29917836  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  29917835 ctatataaaggagtgaagacttagag 29917810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18435566 - 18435348
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatac-atgg-aatggatttgaaattgatccttcagatgacaat 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18435566 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttc--acttactatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaat 18435469  T
Q  108 aaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  18435468 aaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgctggcaat-tcacaacgtctcttt--tacacctcta 18435372  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
      |||| |||| |||| |||||||    
T  18435371 cataaatgagtaaagaatcagaga 18435348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 15531768 - 15531980
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||| || |   ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  15531768 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatattccttcacaatgggaatggatttcaaattgatccttcataggacaataattata 15531867  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
     | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  15531868 cccggtaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgttggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaag 15531964  T
Q  215 gagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15531965 gagtgaagacttagag 15531980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21625100 - 21624890
Alignment:
Q  21 tgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    |||||||||||||| | || | |||| |||||||| | |||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  21625100 tgctacaagacaagaaaaatagctctacctgcaacgacgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggataataactatatcaggc 21625001  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtga 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  21625000 aaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatatgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtga 21624904  T
Q  221 agactcagagaatg 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  21624903 agacttagagaatg 21624890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 26972360 - 26972582
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  26972360 actcagtatttgtctctgctacaagacaagaaaaaaagctctgtctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggat 26972459  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |    
T  26972460 aataaaaatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaccttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--gacacgt 26972556  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  26972557 ctatataaaggagtgaagacttagag 26972582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 14100583 - 14100795
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14100583 tgtctctgctacaagacaagaa-aacaactctgcatgcaacgatgtttcttcacaattggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 14100681  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaag 214  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   | |||||||| |||||    
T  14100682 tcagacaaaagatcattgattattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--catacctctatataaag 14100778  T
Q  215 gagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| |||||| |||||    
T  14100779 gagtaaagacttagaga 14100795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19470676 - 19470456
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||  ||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |    
T  19470676 tgtctctgcaacaagacaagaataacaactatgcttccaacggtgttccttcagacttggaatggatttgaaattaatccttcataggacaataaccaaa 19470577  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc---tattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||| |||||||||||||   |||||||||||||   |||||||||| ||    
T  19470576 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactcttttttttttatgtgttggcaattcaacaacgtctcttt--cacacctctatata 19470479  T
Q  212 aaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| ||||||||  |||||||    
T  19470478 aaggaatgaagacttggagaatg 19470456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 16265284 - 16265506
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||  |||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  16265284 actctgtttgtgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaaagatgttccttcgcaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataagac 16265383  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || || |||| | |||| ||||||||   | ||||    
T  16265384 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattcatcaaagcttcaaacaaatctattttgaattgctgacaat-tcacaatgtctcttt--catacct 16265480  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16265481 ctatataaaggagtgaagacttagag 16265506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 33352060 - 33352282
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| || || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  33352060 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgtctgcaacaatgtttcttcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 33352159  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||   ||||    
T  33352160 aataaccatatcaagcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgttggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 33352254  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||    
T  33352255 ctctatatgaaggagtgaagactcagag 33352282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 20488052 - 20488215
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||    
T  20488052 actctgtttttgtatctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggac 20488151  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20488152 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 20488215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 20730843 - 20731060
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||  |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||    
T  20730843 gtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctctgcctacaaagatgttccttcaca-atgtgaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaata 20730941  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || || |||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  20730942 accatatcaggcaaaagatcattggtgattaatcaaagcttcaaatgactttattttgatttgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 20731038  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  20731039 ataaaggagtgaagacttagag 20731060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21235129 - 21234949
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |  |||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  21235129 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcgaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcgtaggacaataaccata 21235030  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21235029 tcaagcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgaatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt 21234949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21618248 - 21618039
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  21618248 tgtctctgctacaagacaataaaaatagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaataaccata 21618149  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  21618148 tcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataa 21618054  T
Q  213 aggagtgaagactca 227  Q
    |||||||||||||||    
T  21618053 aggagtgaagactca 21618039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16336142 - 16335919
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |  |   |||||  ||||||||||||||||||  | |||    
T  16336142 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttctcctcaatgggaatacatttgaaattgatccttcttaggac 16336043  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgat--caaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||    ||    
T  16336042 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgattaaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cgca 16335948  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16335947 cctctatataaaggagtgaagacttagag 16335919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17381531 - 17381316
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||| |  |   |||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||    
T  17381531 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgacgttccttcgcaatgggaatg-atttgaaattgatccatcttaggacaataa 17381433  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||| ||||||   |||||||||    
T  17381432 ccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgcctcttt--cacacctcta 17381338  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcaga 229  Q
    | ||||||||| ||||||||||    
T  17381337 tataaaggagtaaagactcaga 17381316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16915411 - 16915217
Alignment:
Q  32 aaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcatt 131  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16915411 aaggataacaactatgcctacaacgatgttccttcatactttgaatggatttgaaattgatctttcatagaacaataaccatataaggcaaaagatcatt 16915312  T
Q  132 ggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | | ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16915311 gattattaatcaaagtttcaaacgacact-ttttgatgtgctggcaat-tcacaacatctcttt--cacacctctatgtaaaggagtgaagacttagag 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Original strand, 17316664 - 17316835
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17316664 gtttttgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaata 17316763  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  17316764 accatatcaggcaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 17316835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26943591 - 26943437
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| ||||| | |||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26943591 actctgtttttgtctttgctataggacaagaataacagttatgccttcaacgatgttccttcaaacttggaatggatttgaaattgatccttcataggac 26943492  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactc 159  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26943491 aataaccatatcatgcaaaagatcattggtgatcgatcaaagcttcaaacgactc 26943437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 19066152 - 19066315
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||   | || |   ||||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  19066152 actctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctacaacaatgtctattcacattgggaacacatttgaaattgatccttcataggac 19066251  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19066252 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttga 19066315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19688790 - 19688571
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||| | |||||  |  |  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  19688790 actctgtttttgtctctgatacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaactacgttccctctcaactggaatggatttgaaattgttccttcataggac 19688691  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  19688690 aa----catatcaggaaaaagattattggtgattgatcaaagcttcatacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 19688598  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||    
T  19688597 ctatataaagaagtgaagacttagaga 19688571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15954718 - 15954499
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| || |   |||||| |||||||||| |||||||| | |||    
T  15954718 actctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattaatccttcataggac 15954619  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||   ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  15954618 aataac---atcagacaaaagttcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 15954527  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15954526 ctctatataaaggagtgaagacttagag 15954499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 19833180 - 19833388
Alignment:
Q  19 tctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcag 118  Q
    |||||| ||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||| || |  |   |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  19833180 tctgcttcaaaacaagaaaaacagctctgcttgcaacaatgtttcttctcaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaataaccatatcag 19833279  T
Q  119 gcaaaatatcattggtgattga-tcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagga 216  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  19833280 gcaaatgatcattggtgattgattaaaagcttaaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaagga 19833374  T
Q  217 gtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||    
T  19833375 gtgaagactcagag 19833388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 22076541 - 22076763
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaa-tggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| || |  | |||||| |  ||||||||||||| ||||  | ||    
T  22076541 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacattgtttcttctca-atggaaatacatttgaaattgatacttcgtagga 22076639  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||    
T  22076640 caataaccatatcatgcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--caca 22076734  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22076735 tctctatatagaggagtgaagactcagag 22076763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19482767 - 19482605
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgca-acaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||    
T  19482767 actctgtttttgtctctactaaaagacaagaataacagctctgcctgcagacaatgtttatacacattgggaacgtatttgaaattgatccttcatagga 19482668  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg 166  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19482667 caataaccatatcaggaaaaggatcaatggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttg 19482605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12423276 - 12423116
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||| || |  |   |||||  |||||||||||||||||   | |||    
T  12423276 actctgtttttgtctccgctataagacaagaaaaacaactctgcctgcagccatgtttcttctcaatgggaatacatttgaaattgatcctttgtaggac 12423177  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattt 164  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12423176 aataaccatatcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattt 12423116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22802146 - 22801932
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||  |||| ||  | |   ||||||  ||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  22802146 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgttgtttcttgaaaatgggaatgcctttcaaattgatcattcatagtacaataaccata 22802047  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| | ||||  | |||||||||||||   ||| |||||| ||||    
T  22802046 tcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgattctatttggaatgtgct-gcaaattcacaacgtctcttt--cacatctctatataaa 22801950  T
Q  214 ggagtgaagactcagaga 231  Q
    | |||||||||| |||||    
T  22801949 gaagtgaagacttagaga 22801932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 14051515 - 14051729
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| || || |    |||||||||||||||| || ||||| | |||    
T  14051515 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtttcttcaaattcagaatggatttgaaattaattcttcataggac 14051614  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||   ||| ||    
T  14051615 aacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaggctac-aacaactc---tttgacgtgctggcaatttcacaacgtctcttt--cacatct 14051708  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  14051709 ctatataaaggagtgaagact 14051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16876821 - 16876699
Alignment:
Q  103 acaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    |||||||| ||||| ||    
T  16876821 acaataaccatattaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtactggcaat---tcaacgtcttttttc-ac 16876726  T
Q  201 acctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16876725 acctctatataaaggagtgaagactca 16876699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20635734 - 20635595
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  20635734 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagcaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcatagga 20635636  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20635635 caacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 20635595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26589538 - 26589438
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaa 178  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  26589538 atttgaaatcgatccttcataggacaataaccataccaggcaaaggatcaatggtgaatcatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaa 26589439  T
Q  179 t 179  Q
    |    
T  26589438 t 26589438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 17608457 - 17608579
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||| |||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  17608457 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatgaatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggc 17608555  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  17608556 aaaagatcattggtgattgatcaa 17608579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Original strand, 14070213 - 14070410
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| || || |    |||||||||||||||| || ||||| | ||||  | ||| ||||| ||    
T  14070213 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgtttcttcaaattcagaatggatttgaaattaattcttcataggacatcatccaaatcagaca 14070312  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaa 221  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||   ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  14070313 aaagatcattggtgattgatcaaggctac-aacgactc---tttgacgtgctggcaatttcacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaa 14070406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 7586292 - 7586429
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  7586292 actctgtttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcatagga 7586389  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| | ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  7586390 caacatccaaatcaggcaacagatcattggt-attgatcaa 7586429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21128241 - 21128103
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||   ||| ||||| | ||    
T  21128241 actctgtttgtgtctacgctacaagacaag-ataacatctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaatgcgattcttcatagga 21128144  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21128143 caacaaccaaatcaggcaaaagataattggtgattgatcaa 21128103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19625769 - 19625609
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggattt-gaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaac 157  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||    
T  19625769 ttcctccatacaaggaatggattttgaaattcttccttcataggacaataaccaaatcaggcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaatgac 19625671  T
Q  158 tctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaag 222  Q
    ||| |||||||||  | |||||   |||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||    
T  19625670 tcttttttgatgtcctagcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctacataaaggagtgaag 19625609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25930427 - 25930316
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25930427 atacatggaatgaatttaaaattgttccttcataggataataaccaaatcaagcaatagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-tttt 25930330  T
Q  166 gatgtgttggcaat 179  Q
    |||||| |||||||    
T  25930329 gatgtggtggcaat 25930316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 30451732 - 30451809
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || |||| | || | |||||||||||||||||||    
T  30451732 atacatggaatggatttgaaattgttccttcataggacaataatcaaatcaagaaacagatcattggtgattgatcaa 30451809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 32335781 - 32335714
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  32335781 atacatggaatggatttgaaattgttccctcataggacaataaccaaatcaagcaacatatcattggt 32335714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16877228 - 16877123
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| || |   ||||   ||||||||||||||| ||| | |||    
T  16877228 actctgtttttgcctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaacacatttgaaattgatccatcataggac 16877129  T
Q  105 aataac 110  Q
    ||||||    
T  16877128 aataac 16877123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22386817 - 22386678
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacat-acatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| ||  | ||  ||||||||| ||  |||||||||| | ||    
T  22386817 actctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagtaatgttccttcaagatatt-aatggattttaacgtgatccttcatagga 22386719  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22386718 caacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 22386678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Original strand, 23006249 - 23006316
Alignment:
Q  71 atggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  23006249 atggaatggatttgaaattgttccctcataggacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatt 23006316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23782117 - 23782050
Alignment:
Q  71 atggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  23782117 atggaatggatttgaaattgttccctcataggacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatt 23782050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11235642 - 11235541
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||  |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  11235642 gctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatttttcataggacaatatccaaatcaggc 11235545  T
Q  121 aaaa 124  Q
    ||||    
T  11235544 aaaa 11235541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 16462847 - 16462918
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |   | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  16462847 atacaaggaatggatttgaaattgttcccttctaggacaataaccaaatcaagcaacatatcattggtgatt 16462918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Original strand, 19452722 - 19452793
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  19452722 ggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 19452793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19875773 - 19875714
Alignment:
Q  79 gatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  19875773 gatttgaaattgttcattcataggacaataaccaaatcaagcaaaagatcattggtgatt 19875714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23296676 - 23296605
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||    
T  23296676 atacttggaatggatttgaaattgtttcttcttaggacaataaccaaatcaagcaacagatcattggtgatt 23296605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25675321 - 25675204
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  25675321 actctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcatagga 25675224  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaa 123  Q
    ||| | ||| ||||||||||    
T  25675223 caacatccaaatcaggcaaa 25675204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 25735594 - 25735711
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  25735594 actctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcatagga 25735691  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaa 123  Q
    ||| | ||| ||||||||||    
T  25735692 caacatccaaatcaggcaaa 25735711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7811965 - 7811853
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaac-tctattt 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  || |||    
T  7811965 atacatggaatgaatttgaaattgttccctcttaggacaataaccaaatcaagcaaccgatcattggtgatttgatc-aagcttc-aacaacgactcttt 7811868  T
Q  165 tgatgtgttggcaat 179  Q
    |||||||||||||||    
T  7811867 tgatgtgttggcaat 7811853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17927737 - 17927671
Alignment:
Q  72 tggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||    
T  17927737 tggaatggatttgaaattgttcctttataggacaataaccaaatcaagcaacaaatcattagtgatt 17927671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13435537 - 13435492
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgt 60  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  13435537 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgt 13435492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11206096 - 11205966
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||  |||| |  |||||| |||     
T  11206096 tgtctatgctacaacacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatttttcatagtacaatatccaa 11205999  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    ||||||||||| || | |||||  |||||||||    
T  11205998 atcaggcaaaagattactggtggatgatcaaag 11205966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 60031 - 59802
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  60031 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggatttgaaatcgatccttcataagac 59932  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  59931 aataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaattactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 59835  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  59834 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 59802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7937 - 7715
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7937 agtttgtgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgctacaatgttcctacatactaggaatggatttgaaattgatccttcataggacaata 7838  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  7837 accatatcatgcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtcctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 7741  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  7740 ataaaggagtgaagacttagagaatg 7715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14663 - 14437
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  14663 actcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatacttcagaggat 14564  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  14563 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaccttcgaacgaatctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 14467  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14466 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 14437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49347 - 49121
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  49347 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctataaaaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatcattcataggac 49248  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||   ||||||    
T  49247 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcatt--cacacct 49151  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  49150 ctatgtaaaggagtgaagacttagaaaatg 49121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32500 - 32271
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  32500 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctttgcctgcaaaaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcgtaggac 32401  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  32400 aataaccatatcaggcaaacgatcattggtcattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 32304  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32303 ttatataaaggagtgaatacttagagaatgaca 32271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 467 - 606
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||  || |   |||||||||||||| ||||||||| | | |||    
T  467 actctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaacttgatcctttataggac 566  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  567 aacaagtaaatcaggcaaacgatcattggtgattgatcaa 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 26071 - 26297
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  26071 actcagtttgtgtctctcttacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 26170  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |  |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  26171 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattaatcaaagcttcaaacaactctattttaatgtactaacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 26267  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26268 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 26297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12224 - 12028
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  12224 actcagattgtgtctctgctacaagacaaggataactgctctgcctacaccaatgttcctacatacatggaatgaatttgaaattgattcttcagaggac 12125  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12124 aataatcatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttaatgtgctggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 2087 - 2314
Alignment:
Q  4 cactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  2087 cactcagtatgtgtctctggtacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatacttggaatggatttgaatttgatccttcatagga 2186  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  2187 caataaccatatcaggaaaaagatcaatggtgattgatcaaagcttcaaaggactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacc 2283  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2284 tctatataaaggagtgaagacttagagaatg 2314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 490 - 264
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  490 actcaggttgtgtctctactacaagacaaggataacagatctgcctgcaacaatgttcctacgtacgtggaatggatttgaaattgatccttcataggac 391  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  390 aataaccatattaggaaaaagatcattggtaattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 294  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  293 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1701 - 1479
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  1701 agtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacagtattcctacatacatggaatggatttgaaattgatacttcagaggataata 1602  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  1601 accatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaaccttcgaacgaatctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 1505  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  1504 ataaaggagtgaagacttagagaatg 1479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9909 - 9705
Alignment:
Q  17 tctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatc 116  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9909 tctctgctacaaaacaaggaaaacagctctgcctgcaacaatgtttctacaaacatggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatc 9810  T
Q  117 aggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagga 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  9809 aggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-tattgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatataaagga 9714  T
Q  217 gtgaagact 225  Q
    |||||||||    
T  9713 gtgaagact 9705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 5786 - 6003
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  5786 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctccgtctgcaacaatgttccttcacaattggaatggatttgaaattgatcgttcataggac 5885  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  5886 aataaccatattaggcaaaagatcattgatgattggtcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 5982  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  5983 ctatataaaggagtgaagact 6003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9971 - 9744
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9971 actcagtttgtgtcgctgctacaagacaaggataacagctatgcctgcaacaatgttcattcatacttgaaatggatttgaaattgatccttcataggac 9872  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| | ||||||| ||| ||  ||||||    
T  9871 aataaccatattaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctttttttatgtgctggaaat-tcacaacgt-tctctttcacacct 9774  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9773 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 21067 - 21290
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||  || || |||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  21067 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaacaatgttccgtcacacttggaatggatttcaaattgatccttcataggac 21166  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  21167 aataaccatatcaggcaaaagatcattgatgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 21263  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  21264 ctatataaaggagtgaaaacttagaga 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13586 - 13360
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13586 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataatatctcttcctgcaacaatgtttctacatattgtgaatggatttgaaattgatccttcataagac 13487  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||   ||||||    
T  13486 aataaccatatcaagcaaaagatcattagtgattgatcaaagcttcaaccgactatattttgatgtgctagcaat-tcacaatgtctcttt--cacacct 13390  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13389 ctatataaaggagtgaagacttagagaatg 13360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1670 - 1449
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |  |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1670 gtttttgtctctgctagaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccctctcaattggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataa 1571  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||| |||||     
T  1570 ccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactttattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacatctata 1474  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  1473 taaaggagtgaagacttagagaatg 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 19568 - 19794
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  19568 actcagtttgtgtctctttaacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgtttcttcatacttggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 19667  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||      |||    
T  19668 aataaccatatcaggcaaaagatcgttggtgattgattaaaacttcaaacgactctattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt-----ccct 19761  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19762 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 19794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 99301 - 99523
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||| |||| || |  |   |||||  ||||||||||||||||||  | |||    
T  99301 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgaaacattgtttcttctcaatcggaatacatttgaaattgatccttcgtaggac 99400  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  99401 aataaccatatcaggcaaagaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 99495  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||    
T  99496 gtatatataaaggagtgaagactcagag 99523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29746 - 29592
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| || ||||   || | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  29746 atacttggaatggatttgaaattgttccttcgtaggacaataatcaaatcaataaacagatcattggtgatttgatc-aagcctcaaacgactct-tttt 29649  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||    
T  29648 gatgtgctggcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggtgtgaagact 29592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7839 - 7614
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  7839 actcagtttgtgtctctactagaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatgaatttgaaattgatccttcataggac 7740  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  7739 aataatcatatcagaaaaatgatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 7644  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    || | |||||||||||||||| | ||||||    
T  7643 ctgtataaaggagtgaagacttaaagaatg 7614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6016 - 5807
Alignment:
Q  11 tttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6016 tttgtgtctctgctacaggacaagaataacatctatgcctgcaacgttgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataagacaataac 5917  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatct 210  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||||||   |||||||||| |    
T  5916 catatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgagtct-ttttgatgtgctggcaat-tcacaatgtctcttt--cacacctctatat 5821  T
Q  211 aaaggagtgaagac 224  Q
    ||||||||||||||    
T  5820 aaaggagtgaagac 5807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 143108 - 142890
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  143108 agtttttgtctatgctacaagaaaaaaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaata 143009  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  143008 accatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 142912  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  142911 ataaaggagtgaagacttagag 142890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 212369 - 212149
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||   ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  212369 actctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaa---tgttccttcacaattggaatggatttgaaattgatccttcataggac 212273  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  212272 aataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 212176  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  212175 ctatataaaggagtgaagacttagaga 212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 61229 - 61098
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||   | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||    
T  61229 ttgtgtctacgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatcc 61131  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  61130 aaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 61098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9913 - 9690
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | | || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9913 gtttgtgtctctgctacaggacaagaattaaagctatgcctgcaacgatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataa 9814  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| | | || ||||||||   ||||||||||     
T  9813 ccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactct-ttttgatgtggtgacaat-tcagaaagtctcttt--cacacctctata 9718  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9717 taaatgagtgaagacttagagaatgaca 9690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19046 - 18824
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||  |||||||| |  |   |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19046 actcagtttttgtctctgctacaagaaaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcgcaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggac 18947  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  18946 aataaccgtatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaatcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 18850  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18849 atatataaaggagtgaagacttagag 18824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 22227 - 22449
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || |  |   |||||  ||||||||||||||| ||  | |||    
T  22227 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttctcaatgggaatacatttgaaattgatccctcttaggac 22326  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  22327 aataaccatatcaggaaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactatattttgaatgggatggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 22421  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22422 ctctatataaaggagtgaagactcagag 22449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15128 - 14906
Alignment:
Q  9 agtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaata 108  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||| || | ||||| |    
T  15128 agtttgtatctctactataagacaagaataacagctctgcctgcagtaatgttccttcatactttgaattgatttgaaactgatcctccataggacaaaa 15029  T
Q  109 accatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctat 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  15028 accatatcaggcaaaagatcattgattattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctat 14932  T
Q  209 ctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
     |||||||||||||||| ||||||||    
T  14931 ataaaggagtgaagacttagagaatg 14906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9984 - 9755
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||  | ||  |||| || ||||||||||||||||||| | ||     
T  9984 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgtaacgatgttccctcttaattggattgaatttgaaattgatccttcataggat 9885  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  9884 aataaccatatcacacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 9788  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9787 ctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 9755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 84410 - 84187
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  84410 actcagtttttgtctctactacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaattggattggatttgaaattgatccttcataggac 84311  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacc 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||  || | |||||||||||||   |||||    
T  84310 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactctattttgaatgcgctggatat-tcacaacgtctcttt--cacacc 84214  T
Q  204 tctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  84213 tctatataaaggagtgaagacttagag 84187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 268734 - 268579
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgatt-gatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  268734 atacatggaatggatttgaaattgttccttcataggacaataaccaaatcaagcaacagatcattgataattcgatc-aagcttcaaacaactctttttt 268636  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
     ||||| |||| ||   |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  268635 tatgtgctggctat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 268579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7710 - 7531
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7710 tgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 7611  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttt 195  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  7610 tcaggcaatagatcattggtgattgatcaaagcttcgaacgactctattttaatatgttggcaat-tcacaacgtctcttt 7531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 74591 - 74371
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||| |  | ||| |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  74591 gtttgtatctctgctataggacaagaataatagatatgcatgcaatgatattccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttcataagacaataa 74492  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatc 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||| |||     
T  74491 ccatatcaggaaaaatatcattggtgattgatcaaactttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctttata 74395  T
Q  210 taaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  74394 taaaggagtgaagacttagagaat 74371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 103572 - 103361
Alignment:
Q  19 tctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcag 118  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||  |||||||  |  |   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  103572 tctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctacaatgatgttccctctcaatgggaatggatttgaaattgatccttcggacgacaataaccatatcag 103473  T
Q  119 gcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagt 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   |||||||||| | |||||||    
T  103472 gcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacctctatat-aaggagt 103377  T
Q  219 gaagactcagagaatg 234  Q
    ||||||| ||||||||    
T  103376 gaagacttagagaatg 103361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37407 - 37194
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||   ||  || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37407 tgtctctgctacaagacaagaaaaacatccctgcctgcaacgatgttccct-atcgattggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccat 37309  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||   |||||||||| ||||    
T  37308 atcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgacgtgctggcaat-tcaaaacgtctcttt--cacacctctatataaa 37212  T
Q  214 ggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||||||||| |||||    
T  37211 ggagtgaagacttagaga 37194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 135467 - 135254
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||   ||  || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  135467 tgtctctgctacaagacaagaaaaacatccctgcctgcaacgatgttccct-atcgattggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccat 135369  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||   |||||||||| ||||    
T  135368 atcagacaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgacgtgctggcaat-tcaaaacgtctcttt--cacacctctatataaa 135272  T
Q  214 ggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||||||||| |||||    
T  135271 ggagtgaagacttagaga 135254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 159065 - 158977
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttca 98  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||| | || | ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  159065 gtttgtgtctctgctacaggacatgaataatatctattcctacaacgatgttccttcatacttggaatggatttgaaattgatccttca 158977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 158981 - 158899
Alignment:
Q  147 cttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaat 233  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||  |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  158981 cttcaaacgactct-ttttgatgtgttggcaat-tcacaacatctctttcatac--ctctatataaaggagtgaagacttagagaat 158899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 90151 - 90373
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  ||||| || || |   |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  90151 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaatgatgtttcttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggac 90250  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  90251 aataaccatatcaggaaatagatcattggtgattgatcaaagcttcaaacgactctattttgatgtggtagcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 90347  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  90348 ctatataaaggagtgaagacttagag 90373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 78467 - 78685
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||   ||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  78467 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaacacatttgaaatggatccttcataggacaataa 78566  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatca-aagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||| |||||||||| |||||||||    
T  78567 ccatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcataagtttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaaagtctcttttc-acacctcta 78662  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  78663 tataaaggagtgaagactcagag 78685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Original strand, 10204 - 10370
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  10204 actctgtttgtgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgccagcaacgatattccttcacaattggaattgatttgaaattgatccttcataggac 10303  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtg 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10304 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtg 10370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Original strand, 14868 - 15034
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| ||||| || ||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  14868 actctgtttgtgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgccagcaacgatattccttcacaattggaattgatttgaaattgatccttcataggac 14967  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtg 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14968 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagcttcaaatgactctattttgatgtg 15034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 44024 - 44241
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  44024 tgtctctgcaacaagacaagaataacaactatgcctgaaacgatgttcctctagacatggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaa 44123  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||||   |||||| ||| ||||    
T  44124 ttaggaaaaagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactcttttttgatgtggtgacaatttaacaacgtctcttt--cacacctttatataaa 44220  T
Q  214 ggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  44221 ggagtcaagacttagagaatg 44241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 215604 - 215814
Alignment:
Q  16 gtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatat 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| | || |   |||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  215604 gtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttctttcacattgggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataaccatat 215703  T
Q  116 caggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  215704 caggcaaaagatcattggtgattgatcaaaaacttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaa 215798  T
Q  214 ggagtgaagactcaga 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  215799 ggagtgaagactcaga 215814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 7722 - 7855
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacat-acatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| | ||  | ||| |||| ||||||| ||||| ||||| | ||||| | ||    
T  7722 tgtgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgttcattcaagatatg-aatgaatttgaacttgatgcttcataggacaacatcc 7820  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  7821 aaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaag 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 127838 - 127721
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  127838 actctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcatagga 127741  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaa 123  Q
    ||| | ||| ||||||||||    
T  127740 caacatccaaatcaggcaaa 127721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 1800 - 2017
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  1800 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcttaggacaataa 1899  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||    ||||||||||||   |||||||||    
T  1900 ccatatcaggcaaaagatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgattctattttgaacgtgttggaaat---tcaacgtctcttt--cacacctcta 1994  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  1995 tataaaggagtgaagactcagag 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 5431 - 5583
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat--ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacca 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  5431 tgtctctgctacaagaaaaggataacagctctgcctgcaacaatgt--ctatatacattgggaacgcatttgaaattgatccttcgtaggacaataacca 5528  T
Q  113 tatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5529 tatcaggcaaaagatcattggtgatagatcaaagcttcaaacgactctattttga 5583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 27525 - 27748
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||||| |  |  |  |||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  27525 actctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcaatgatgtttcctctcaattggaatggatttgaaattgatcattcataggac 27624  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||   ||||||    
T  27625 aataaccatattaggaaaaagatcattggtgattgatgaatgcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 27721  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||    
T  27722 ttatataaaggagtgaagacttagaga 27748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60599
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |  |   |||||  ||||||||||||||||||  | ||     
T  60818 actctgtttttgtctcttctacaagacatgaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttctcaatgggaatacatttgaaattgatccttcttaggaa 60719  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||   ||||||    
T  60718 aataaccatatcaggcaaaggatcattgatgattaatcaaagcttcaaacgaatctattttgatgtgctgacaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 60622  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  60621 ctatataaaggagtgaagactca 60599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 17861 - 18083
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| || || |   | || | ||||||| ||||||| ||| | |||    
T  17861 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttcacattggaaacgcatttgaatttgatccatcataggac 17960  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  17961 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 18055  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18056 ctctatataaagaagtgaagactcagag 18083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3164 - 3010
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||    
T  3164 atttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattcgtgattgatcaaagcttcaagcgactctattttgatgtgctggaaat 3065  T
Q  180 gtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatgaca 237  Q
     | ||| | |||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3064 -tcacagcttctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagagaatgaca 3010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 926 - 1138
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  926 tgtctctgctacaagacaaggataacagctctgtctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacaataaccata 1025  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaa 212  Q
    ||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||   |  ||||||||||||   |||||||||| |||    
T  1026 tcaggcaatggatcattggtgatagatcaaaagcttcaaacgactctatattgaatgtgatggca---tttcaacgtctcttt--cacacctctatataa 1120  T
Q  213 aggagtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1121 aggagtgaagactcagag 1138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2987 - 2779
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||| |||| || |   |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  2987 tgtccctgctacaagacaa--aaaacagctctgcctgcaacgatgctccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatccttcataggacaataactata 2890  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaa 213  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||  |||    
T  2889 taaggcaaaatatcattcgttattgatcaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat-tcacaacatctcttt--cacacctctatacaaa 2793  T
Q  214 ggagtgaagactca 227  Q
    ||||||||||||||    
T  2792 ggagtgaagactca 2779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 15808 - 15682
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| | |||    
T  15808 actcagtttgtgtctctgctactagacaaggataactgctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatggttttgaaattgatctttcataggac 15709  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcatt 131  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15708 aataatcatataaggcaaaagatcatt 15682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 16298 - 16444
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctatttt 165  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||||| |||||| |||  ||||| ||||    
T  16298 atacttggaatgaatttgaaattgttccttcataggacaataaccaaatcaggaaatagatcatcggtgatttgatc-aagctttaaatgactctttttt 16396  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtg 219  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  16397 gatgtgttggcaat----caacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtg 16444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22691 - 22467
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatg-gaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |  ||||||| || | ||| ||||| |||| ||||||||| |||| | ||    
T  22691 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagcactgcctgcatcgttgttccttcaca-atgcgaatgcatttaaaattgatctttcatagga 22593  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||| |||||||||   ||||    
T  22592 caataatcatatcaggcaaaggatcattggtgattaatcaaagcttcaaacaactctattttgaatgtgctggtaat-tcacagcgtctcttt--cacac 22496  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22495 ctctatataaaggaatgaagactcagaga 22467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6021 - 5799
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| | |||| || |  | | |||||  ||||||||||||||||||| | |||    
T  6021 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaatatctctgcctgcaatattgtttcttctcaaagggaatacatttgaaattgatccttcataggac 5922  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||    ||||||||||||   ||||    
T  5921 aataaccatatcaggcaaaggatctttgatgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctagcaat---tcaacgtctcttt--cacac 5827  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5826 ctctatataaaggagtgaagactcagag 5799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 2826 - 3048
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |  |   || ||  ||||||||||||||||||  | |||    
T  2826 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaataatgttccttctcaatggggatacatttgaaattgatccttcttaggac 2925  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||    ||||||||||||   ||||    
T  2926 aataaccatatcaggcaaatgatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctgagaat---tcaacgtctcttt--cacac 3020  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3021 ctctatataaagaagtgaagactcagag 3048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 17909 - 18043
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  17909 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacatc 18007  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  18008 caaatcaggcaaaagatcaatggtgaatgatcaaag 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9165 - 8948
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| || |  |   |||||  ||||||||||||||||||  | || |||||    
T  9165 gtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacattgtttcttctcaataggaatacatttgaaattgatccttcttaggagaataa 9066  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||    
T  9065 ccatatcaggcaaagaatcattagtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctcta 8971  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  8970 tataaaggagtgaagactcagag 8948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Original strand, 36904 - 37053
Alignment:
Q  79 gatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36904 gatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgattaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaa 37003  T
Q  179 tgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    | | || | ||||||||   | | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37004 t-tcacgatgtctcttt--catatctctatataaaggagtgaagacttagaga 37053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42101 - 41952
Alignment:
Q  79 gatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42101 gatttgaaattgatccttcataggacaataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgattaaagcttcaaacgactctattttgatgtgctggcaa 42002  T
Q  179 tgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagaga 231  Q
    | | || | ||||||||   | | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42001 t-tcacgatgtctcttt--catatctctatataaaggagtgaagacttagaga 41952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 7269 - 7476
Alignment:
Q  20 ctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatgga-atggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcag 118  Q
    ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| || |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  7269 ctgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcaacattgtttcttctca-atggatatacatttgaaattgatccttcgtaggacaataaccatatcag 7367  T
Q  119 gcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaagga 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  7368 gcaaaaaatcattggtgattgatcaaaagcttcaaacgactttattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctctatataaagga 7462  T
Q  217 gtgaagactcagag 230  Q
    ||||||||||||||    
T  7463 gtgaagactcagag 7476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40631 - 40428
Alignment:
Q  28 agacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatat 127  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| ||    
T  40631 agacaagaataacagctatgcctgcaacggtgttccttcagatttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcaggaaaaagat 40532  T
Q  128 cattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactc 226  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||      
T  40531 cattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactct-ttttgatgtgctggaaattcaacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaatacat 40436  T
Q  227 agagaatg 234  Q
    ||||||||    
T  40435 agagaatg 40428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 576
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  728 tgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatgcttcataggacaataaccat 629  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttg 166  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  628 atcaggcaaaggatcattggtgaattatcaaagcttcaaacgactctattttg 576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Original strand, 1640 - 1841
Alignment:
Q  29 gacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatc 128  Q
    |||||| | |||| || ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||    
T  1640 gacaagaacaacagctatgcctacaccagtgttcctccatacatggaatggattggaaattgatccttcataggacaataaccaaataaggcaaaagatc 1739  T
Q  129 attggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactca 227  Q
    |||||||| |||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1740 attggtgatttgaac-aagtttcaaacgactct-ttttgatgtgctggcaat-tatcaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagactta 1834  T
Q  228 gagaatg 234  Q
    |||||||    
T  1835 gagaatg 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 65502 - 65723
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |  || ||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  65502 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgtttattcacatttg-aacacatttgaaattgatccttcataggac 65600  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    || |||||||||||| |||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  65601 aacaaccatatcaggaaaaggatcattggtgatctatcaaaagcttcaaacaactctattttgaataagctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 65695  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  65696 ctctatataaaggagtgaagactcagag 65723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 144547 - 144768
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |  || ||   ||||||||||||||||||| | |||    
T  144547 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctgcctgcaacaatgtttattcacatttg-aacacatttgaaattgatccttcataggac 144645  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    || |||||||||||| |||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||    ||||||||||||   ||||    
T  144646 aacaaccatatcaggaaaaggatcattggtgatctatcaaaagcttcaaacaactctattttgaataagctggcaat---tcaacgtctcttt--cacac 144740  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  144741 ctctatataaaggagtgaagactcagag 144768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 59509 - 59356
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaac-tctatttt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||  |  ||||    
T  59509 atacatggaatggatttgaaattgttccttcctaggacaataactaaatcaagcaagagatcattagtgatt-atc-aagcttc-aacaacgaccttttt 59413  T
Q  166 gatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  59412 gatgtgttggcaat-caaaaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagact 59356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3314 - 3098
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||| | || | | |||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  3314 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttctttca-ata-ggaatgcatttgaaattgatcattcttaggacaataa 3217  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgat--caaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctct 206  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||   ||||||||    
T  3216 ccatatcaggcaaaggatcattggtgattgattaaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctcttt--cacacctct 3122  T
Q  207 atctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || ||||| |||||||||| ||||    
T  3121 atttaaagaagtgaagactgagag 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 751 - 973
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||| | || | || |||||||||| |||||||| || |   ||||   ||||||||||| || |||  | |||    
T  751 actctgtttttgtctctactacaagataagaaaaatagctttgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaacacatttgaaattgttcattcctaggac 850  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacct 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||| | |||||||||||||   ||||||    
T  851 aataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagtttcaaacgactctatttgaatgtgctggaaat-tcacaacgtctcttt--cacacct 947  T
Q  205 ctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | || |||||||||||||||| ||||    
T  948 caatataaaggagtgaagactaagag 973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 1851 - 1969
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||  |  | |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  1851 actctgtttttgtctttgcaacaagacaaggataacagctctaccagtaacaatgtttgtttacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataagac 1950  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaa 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1951 aataaccatatcaggcaaa 1969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 6846 - 7059
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||| |||||||| |  |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  6846 tgtctctgctacaacacaagaaaaacagctctgcatgcaacgatgttccttcgcaatgggaacgcatttgaaattgatccttcataggacgataaccata 6945  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatc--aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatcta 211  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||| |   |||||| ||| ||    
T  6946 tcaggcaaaggatcattggtgattaatcaaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctctct--cacacctatatata 7040  T
Q  212 aaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7041 aaggagtgaagactcagag 7059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5590 - 5418
Alignment:
Q  58 tgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaa 156  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  5590 tgttcctccttacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataaccaaatcgggcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacga 5492  T
Q  157 ctctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagactcagagaatg 234  Q
    |||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5491 ctct-ttttgatgtgctggaaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatataaaggagtgaagacttagagaatg 5418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1311 - 1107
Alignment:
Q  27 aagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaata 126  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||| |||||| |    
T  1311 aagacaagaataacaactatgtttgcaacgatattcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaattaacaaatcatgcaaaaga 1212  T
Q  127 tcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  1211 tcattggtgatttgatcaaa-ctccaaacgactctattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacagctctatataaaggggtgaaaact 1116  T
Q  226 cagagaatg 234  Q
     ||||||||    
T  1115 tagagaatg 1107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 100 - 304
Alignment:
Q  27 aagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaata 126  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | || |||| |||||| |    
T  100 aagacaagaataacaactatgtttgcaacgatattcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaattaacaaatcatgcaaaaga 199  T
Q  127 tcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||   ||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  200 tcattggtgatttgatcaaa-ctccaaacgactctattttgatgtgctagcaat-tcacaacgtctcttt--cacagctctatataaaggggtgaaaact 295  T
Q  226 cagagaatg 234  Q
     ||||||||    
T  296 tagagaatg 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 5703 - 5920
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||  |||||||| ||     |||||| |||| ||| ||||||||||   ||||||||    
T  5703 gtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcaatgatgttccttcactatgggaatgcattttaaactgatccttcattggacaataa 5802  T
Q  110 ccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctcta 207  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||| |   |||||||||    
T  5803 ccatatcaagcaaaggatcgttggtgattgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgctggcaat---tcaacgtctctct--cacacctcta 5897  T
Q  208 tctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  5898 tataaaggagtgaagactcagag 5920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 141
Target Start/End: Original strand, 2787 - 2923
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | |||    
T  2787 actctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacaactctacctacaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggac 2886  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgat 141  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2887 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgattgat 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7396 - 7220
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||  |||| |   |||| | ||||||||||||||||| | | ||    
T  7396 actctgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaacaatgtttatacacattgggaacgcatttgaaattgatccttaatagga 7297  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttcaaacaactctatttt-gatgtgttggcaat 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  7296 caataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgaatcatcaaagcttcaaacgactctattttggatgtgctggcaat 7220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 87696 - 87859
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   | || |   |||| | ||||||||||||||||||| | ||     
T  87696 actctgtttctgtctctgctacaagacaatgataacaactctgcctacaacaatgtctattcacattgggaacgcatttgaaattgatccttcataggat 87795  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa-agcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  87796 aataaccatctcaggcaaacgataattggtgatagatcaagagcttcaaacgactctattttga 87859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 34900 - 35122
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||| | | |||    
T  34900 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaatagctttgcctgcaacaatgtttattcacattgggaacgcatttgaaattgatcctttataggac 34999  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacac 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |  |  ||||||||||||   ||||    
T  35000 aataaccatatcaggcaaaggatcaatggtgactgatcaaaagcttcaaacgactctattttgaatgtgatg---agatttcaacgtctcttt--cacac 35094  T
Q  203 ctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  35095 ctctatataaaggagtgaagactcagag 35122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 25761 - 25924
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgac 104  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||  | || |   |||| | ||||||||||||||||| | | ||     
T  25761 actctgtttttgtctctactacaagacaagaaaagcagctctgcctgcatcaatgtttattcaaattgggaacgcatttgaaattgatcctttataggat 25860  T
Q  105 aataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25861 aataaccatatcaggcaaaggatcattggtgactgatcaaaagcttcaaacgactctattttga 25924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 179
Target Start/End: Original strand, 36321 - 36451
Alignment:
Q  48 cctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaag 146  Q
    |||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||    
T  36321 cctgcaccagtgttcctccagacttggaatggatttgaaattgatccttcataggacaataactaaatcaggaaaaagatcattggtgatttgatc-aag 36419  T
Q  147 cttcaaacaactctattttgatgtgttggcaat 179  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  36420 cttcaaacgactct-ttttgatgttctggcaat 36451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 144866 - 144705
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  144866 ttccttcatatatggaatgaatttgaaattaatccttcataggacaataaccaaatcaggcaaaagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgact 144768  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
    || |||| ||||| |||||||   |||||||||||||    |||||||||  ||||||||||||||    
T  144767 ctttttttatgtgctggcaat-caacaacgtctcttt--cgcacctctataaaaaggagtgaagac 144705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 15835 - 16056
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataa-caactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| || || |   |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  15835 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttcacattgggaacgcgtttgaaattgatccttcatacga 15934  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||    |||||||||||   ||||    
T  15935 caataaccatatcacgcaaagaatca-tggtgatttatcaaaagcctaaaacaactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctctt---taca 16027  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16028 ccgctatataaaggagtgaagacttagag 16056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 25495 - 25716
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataa-caactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||| || || |   |||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  25495 actctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaaacagctctgcctgcaacaatgtttcttcacattgggaacgcgtttgaaattgatccttcatacga 25594  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttg-atgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctaca 201  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||    |||||||||||   ||||    
T  25595 caataaccatatcacgcaaagaatca-tggtgatttatcaaaagcctaaaacaactctattttgaatgtgctgacaat---tcaacgtctctt---taca 25687  T
Q  202 cctctatctaaaggagtgaagactcagag 230  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25688 ccgctatataaaggagtgaagacttagag 25716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10725 - 10595
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgca-acaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |    ||| | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||     
T  10725 tgtctctgctacaggacaaggataacagctctgcctgcatacaatgtttatgcacattgagaacgcatttgaaattgatccttcataggacaacaaccaa 10626  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10625 atcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 10595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20626 - 20496
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaa-caatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccat 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  | || | | ||||   |||||| |||||||||||| | ||||| |||||     
T  20626 tgtctctgctaaaagacaaggataacagctctgcctgcaaacaatgtttatgcacatagggaacacatttgatattgatccttcataggacaacaaccaa 20527  T
Q  114 atcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20526 atcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 20496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 144
Target Start/End: Original strand, 38190 - 38319
Alignment:
Q  15 tgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccata 114  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||  || |   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |    
T  38190 tgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccatcaaaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaa 38289  T
Q  115 tcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38290 tcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 38319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 462 - 581
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||  ||||||||||| | |    
T  462 ttcctccatacaaggaatggatttgaaattgttccttcaaaggacaataaccaaatcaggcaatagatcattagtgatttgat-taagcttcaaacgaat 560  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaat 179  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  561 cttttttgatgtgttggcaat 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 224
Target Start/End: Original strand, 1945 - 2105
Alignment:
Q  60 ttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaact 158  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||    
T  1945 ttcctccatacttggaatggatttgaatttgatccttcataggacgataaccaaatcagacaacagatcattggtgatttgatc-aagcttgaaaccact 2043  T
Q  159 ctattttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagac 224  Q
     | |||||||||| ||||||||  |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||    
T  2044 -ttttttgatgtgctggcaatg-aacaacgtctcttt--cacacctctatataaatgagtgaagac 2105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 16953 - 16831
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| ||||| |||| |||    
T  16953 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataaatgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaagca 16854  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  16853 aaagatcattggtgattgatcaa 16831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 6635 - 6757
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  6635 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggca 6734  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  6735 aaagatcattggtgattgatcaa 6757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 1049 - 1170
Alignment:
Q  23 ctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaa 122  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| |||||||||    
T  1049 ctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 1148  T
Q  123 aatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  1149 aagatcattggtgattgatcaa 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 144
Target Start/End: Original strand, 1242 - 1363
Alignment:
Q  23 ctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaa 122  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||| ||||   ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| |||||||||    
T  1242 ctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 1341  T
Q  123 aatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  1342 aagatcattggtgattgatcaa 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 31942 - 32099
Alignment:
Q  67 atacatggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaac--tctatt 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | | ||    
T  31942 atacatggaatggatttgaaattgttccttgatagtacaataaccaaatcaagcaatagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactttttttt 32040  T
Q  164 ttgatgtgttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    || |||||||||||||   |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32041 tttatgtgttggcaat-caacaacgtctcttt--cacacctctatttaaaggagtgaagact 32099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 146
Target Start/End: Original strand, 40416 - 40550
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |    
T  40416 ttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatc 40514  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  40515 caaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaag 40550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 146
Target Start/End: Original strand, 58973 - 59096
Alignment:
Q  23 ctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggca 121  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||    
T  58973 ctacgagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataagacaacatccaaatcaggca 59071  T
Q  122 aaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    ||| ||||||||| | |||||||||    
T  59072 aaagatcattggtaaatgatcaaag 59096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2604 - 2458
Alignment:
Q  74 gaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtga-ttgatcaaagcttcaaacaactctattttgatgtgt 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| || | |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||     
T  2604 gaatggatttgaaattgttccttcttaggacaataaccaaataaagcaacagatcattggtgatttgatc-aagcttcaaacgactc--ttttgatgtgc 2508  T
Q  173 tggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    ||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2507 tggcaat-taaaaacgtct-ttttc-acacctctatataaaggagtgaagact 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12138 - 12050
Alignment:
Q  80 atttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatc-aaagcttcaaacaactctattttga 167  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12138 atttgaaattgatccttcgtaggacaataaccatatctggcaaaggatcattagtgatagatcaaaagcttcaaacgactctattttga 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7282 - 7163
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  7282 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaaagttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggc 7184  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgat 141  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7183 aaaatatcattggtgattgat 7163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5124 - 4993
Alignment:
Q  13 tgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataacc 111  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| | ||    
T  5124 tgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacatgattcttcataggacaacatcc 5026  T
Q  112 atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5025 aaatcaggcaaaagaccattggtgattgatcaa 4993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Original strand, 4060 - 4131
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4060 ggaatggatttgaacgtgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaatatcattgctgattgatcaa 4131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1238
Alignment:
Q  22 gctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggc 120  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||  ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  1118 gctacaagacaag-ataacagctctgtctgcagaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcaggc 1215  T
Q  121 aaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  1216 aaaagatcattggt-attgatcaa 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Original strand, 20540 - 20611
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20540 ggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 20611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Original strand, 156790 - 156861
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  156790 ggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 156861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 475353 - 475485
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||| |||||||  |||||||||| | |||||   |    
T  475353 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttc 475451  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  475452 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 475485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Original strand, 481873 - 482005
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||  ||||||||| || | || |||||| |||||||  |||||||||| | |||||   |    
T  481873 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agataggaatgaatttgaacatgatccttcataggacaacttc 481971  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  481972 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 482005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 61740 - 61608
Alignment:
Q  12 ttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacat-ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataac 110  Q
    ||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||| ||| ||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||| | |    
T  61740 ttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctacaaaaatgttccttca-agataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatc 61642  T
Q  111 catatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  61641 caaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaa 61608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20014 - 19870
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaagcttca--aacaactctattttgatgt 170  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  20014 ggaatgaatttgaaattgttccctcataggacaataaccaaatcaagcaataaatcattggtgatt-atc-aagcttcaacaacaactc--ttttgatgt 19919  T
Q  171 gttggcaatgtgacaacgtctcttttctacacctctatctaaaggagtgaagact 225  Q
    | | |||||    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19918 gctagcaat----caacgtctcttt--cacacctctatctaaagaagtgaagact 19870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 1898 - 2034
Alignment:
Q  10 gtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatggaatggatttgaaatt-gatccttcagatgacaata 108  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||  || |   |||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |    
T  1898 gtttatgtctatgttacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaactttgatccttcataggacaaca 1997  T
Q  109 acc-atatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1998 acccaaattaggcaaaagatcattggtgattgatcaa 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11708 - 11637
Alignment:
Q  73 ggaatggatttgaaattgatccttcagatgacaataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaa 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11708 ggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaactaccaaatcaggtaaaagatcattggtgattgatcaa 11637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 40694 - 40554
Alignment:
Q  5 actcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgcaacaatgttcctacatacatgg-aatggatttgaaattgatccttcagatga 103  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||| || | |||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  40694 actctgtttttgtctacgctacaagacaag-acaacagctctgcctgcagaaatgttccttca-agatgggaatgaatttgaagttgatccttcaaagga 40597  T
Q  104 caataaccatatcaggcaaaatatcattggtgattgatcaaag 146  Q
    | | | ||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  40596 ctacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaag 40554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University