View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15088_high_5 (Length: 507)

Name: NF15088_high_5
Description: NF15088
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15088_high_5
NF15088_high_5
[»] chr7 (109 HSPs)
chr7 (8-507)||(22072922-22073419)
chr7 (35-501)||(16219358-16219823)
chr7 (84-501)||(16056343-16056757)
chr7 (35-507)||(47831816-47832287)
chr7 (62-507)||(67754-68198)
chr7 (54-502)||(810790-811238)
chr7 (54-502)||(18005660-18006101)
chr7 (55-502)||(44014192-44014633)
chr7 (35-344)||(16324175-16324485)
chr7 (160-501)||(12901338-12901682)
chr7 (44-371)||(9389346-9389675)
chr7 (159-500)||(34200802-34201138)
chr7 (47-507)||(28504955-28505410)
chr7 (222-500)||(15754718-15754992)
chr7 (159-500)||(11995796-11996132)
chr7 (8-215)||(12255409-12255614)
chr7 (209-497)||(20220005-20220290)
chr7 (31-215)||(2279756-2279941)
chr7 (161-430)||(15113028-15113296)
chr7 (159-430)||(15116565-15116835)
chr7 (393-507)||(3564363-3564476)
chr7 (346-497)||(16495421-16495567)
chr7 (393-507)||(48273398-48273511)
chr7 (392-501)||(2280117-2280225)
chr7 (393-497)||(13647344-13647447)
chr7 (393-507)||(24275177-24275289)
chr7 (396-507)||(18456415-18456524)
chr7 (396-507)||(38227490-38227599)
chr7 (393-507)||(456327-456439)
chr7 (393-507)||(11393331-11393443)
chr7 (393-507)||(11972502-11972614)
chr7 (393-507)||(14949166-14949278)
chr7 (393-507)||(15376757-15376869)
chr7 (393-507)||(16232526-16232638)
chr7 (393-507)||(16410065-16410177)
chr7 (393-507)||(18640278-18640390)
chr7 (393-507)||(20385167-20385279)
chr7 (393-507)||(21189639-21189751)
chr7 (393-507)||(32125497-32125609)
chr7 (393-507)||(41522923-41523035)
chr7 (393-507)||(41525385-41525497)
chr7 (336-501)||(1867937-1868101)
chr7 (336-494)||(12255733-12255892)
chr7 (396-507)||(12698840-12698951)
chr7 (334-501)||(14044761-14044928)
chr7 (334-501)||(14354791-14354958)
chr7 (53-201)||(21064822-21064971)
chr7 (393-507)||(18430718-18430830)
chr7 (393-507)||(24702244-24702356)
chr7 (393-507)||(27216866-27216978)
chr7 (393-507)||(44116515-44116627)
chr7 (396-500)||(16386249-16386353)
chr7 (396-500)||(26212012-26212115)
chr7 (396-507)||(9509198-9509308)
chr7 (54-211)||(12756378-12756535)
chr7 (400-507)||(16213690-16213795)
chr7 (353-507)||(17061919-17062071)
chr7 (393-507)||(3386339-3386451)
chr7 (393-501)||(15144037-15144143)
chr7 (404-507)||(13869352-13869453)
chr7 (47-199)||(15143691-15143844)
chr7 (396-500)||(10589055-10589158)
chr7 (336-493)||(15008441-15008597)
chr7 (336-498)||(19486686-19486847)
chr7 (393-507)||(38898420-38898533)
chr7 (393-507)||(13831379-13831491)
chr7 (84-214)||(44116804-44116933)
chr7 (393-507)||(24704694-24704803)
chr7 (54-215)||(17061621-17061783)
chr7 (415-497)||(40443410-40443490)
chr7 (392-498)||(10063816-10063921)
chr7 (54-205)||(38227788-38227940)
chr7 (31-148)||(2529615-2529733)
chr7 (463-507)||(20110562-20110606)
chr7 (446-497)||(27847881-27847932)
chr7 (57-150)||(14045187-14045281)
chr7 (57-150)||(14355217-14355311)
chr7 (54-206)||(9509495-9509649)
chr7 (47-128)||(16385912-16385994)
chr7 (47-128)||(40443762-40443844)
chr7 (387-488)||(14036282-14036384)
chr7 (387-488)||(14346312-14346414)
chr7 (47-127)||(15754541-15754622)
chr7 (67-150)||(12901768-12901852)
chr7 (57-150)||(14036637-14036731)
chr7 (57-150)||(14346667-14346761)
chr7 (447-507)||(18154894-18154953)
chr7 (57-149)||(1867650-1867743)
chr7 (47-128)||(27847498-27847580)
chr7 (444-490)||(48991206-48991252)
chr7 (55-127)||(3564026-3564099)
chr7 (157-206)||(26212302-26212351)
chr7 (393-497)||(12756715-12756817)
chr7 (463-507)||(14932802-14932846)
chr7 (463-507)||(15356237-15356281)
chr7 (463-507)||(15360351-15360395)
chr7 (106-198)||(35366540-35366631)
chr7 (159-198)||(9177431-9177470)
chr7 (54-127)||(12699218-12699292)
chr7 (158-208)||(15008263-15008313)
chr7 (67-147)||(15008118-15008199)
chr7 (157-206)||(40443695-40443744)
chr7 (447-495)||(9177718-9177766)
chr7 (47-102)||(11995712-11995768)
chr7 (42-147)||(17017040-17017146)
chr7 (393-449)||(26356027-26356083)
chr7 (463-507)||(26356106-26356150)
chr7 (393-449)||(26358479-26358535)
chr7 (463-507)||(26358558-26358602)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (8-501)||(32551-33039)
scaffold0034 (415-497)||(51904-51985)
scaffold0034 (54-127)||(51545-51619)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (31-501)||(10542-11011)
[»] chr6 (104 HSPs)
chr6 (8-497)||(23019425-23019910)
chr6 (62-502)||(19652209-19652647)
chr6 (158-501)||(19668386-19668728)
chr6 (54-499)||(29808544-29808986)
chr6 (35-346)||(27332926-27333238)
chr6 (35-346)||(27393666-27393978)
chr6 (54-499)||(28496134-28496575)
chr6 (47-507)||(22080391-22080837)
chr6 (240-501)||(9098372-9098620)
chr6 (54-502)||(4185484-4185928)
chr6 (222-500)||(1561319-1561593)
chr6 (240-501)||(20109153-20109415)
chr6 (54-461)||(4667874-4668277)
chr6 (54-461)||(4674721-4675124)
chr6 (336-501)||(25644335-25644500)
chr6 (35-265)||(25644571-25644801)
chr6 (44-195)||(25956272-25956424)
chr6 (219-497)||(23076749-23077027)
chr6 (219-497)||(35008167-35008445)
chr6 (54-266)||(4189203-4189416)
chr6 (417-507)||(27333241-27333330)
chr6 (417-507)||(27393981-27394070)
chr6 (393-507)||(29060549-29060662)
chr6 (393-507)||(30676754-30676866)
chr6 (157-502)||(31155163-31155504)
chr6 (353-507)||(22782233-22782385)
chr6 (396-500)||(16496260-16496363)
chr6 (396-507)||(17287798-17287908)
chr6 (388-507)||(18409821-18409939)
chr6 (393-507)||(12742323-12742435)
chr6 (393-507)||(18334636-18334748)
chr6 (393-507)||(19005052-19005164)
chr6 (393-507)||(19858963-19859075)
chr6 (393-507)||(24422553-24422665)
chr6 (393-507)||(25629354-25629467)
chr6 (393-507)||(25656635-25656747)
chr6 (393-507)||(33861800-33861912)
chr6 (393-507)||(33864284-33864396)
chr6 (393-507)||(2291224-2291336)
chr6 (393-507)||(8055035-8055147)
chr6 (393-507)||(20593782-20593895)
chr6 (393-507)||(25688508-25688620)
chr6 (393-507)||(25754815-25754927)
chr6 (393-507)||(26924684-26924796)
chr6 (393-507)||(34963379-34963491)
chr6 (402-507)||(20076709-20076812)
chr6 (393-507)||(1540955-1541067)
chr6 (393-507)||(1595555-1595667)
chr6 (54-214)||(18457014-18457174)
chr6 (393-507)||(19303540-19303652)
chr6 (396-502)||(20360962-20361067)
chr6 (393-507)||(20556936-20557048)
chr6 (404-507)||(16448582-16448683)
chr6 (336-500)||(8227453-8227616)
chr6 (393-497)||(18456735-18456837)
chr6 (393-497)||(18461895-18461997)
chr6 (415-507)||(20638304-20638395)
chr6 (396-507)||(22780229-22780339)
chr6 (393-507)||(3852061-3852173)
chr6 (31-149)||(9098087-9098206)
chr6 (240-497)||(18199262-18199519)
chr6 (448-495)||(22831524-22831571)
chr6 (444-493)||(16920679-16920728)
chr6 (454-507)||(25714426-25714478)
chr6 (444-497)||(35245605-35245658)
chr6 (240-497)||(18177518-18177775)
chr6 (240-497)||(18204096-18204353)
chr6 (412-502)||(4186381-4186470)
chr6 (415-497)||(18821866-18821946)
chr6 (453-497)||(11185524-11185568)
chr6 (54-128)||(20360632-20360707)
chr6 (54-206)||(29060847-29061000)
chr6 (54-206)||(19303202-19303355)
chr6 (47-128)||(20637948-20638030)
chr6 (294-372)||(28103799-28103877)
chr6 (47-127)||(1561689-1561770)
chr6 (463-507)||(19848063-19848107)
chr6 (31-150)||(20109578-20109698)
chr6 (334-433)||(18696570-18696667)
chr6 (336-464)||(18706356-18706483)
chr6 (87-206)||(25629050-25629169)
chr6 (444-495)||(33443068-33443118)
chr6 (47-128)||(18821484-18821566)
chr6 (54-127)||(22779888-22779962)
chr6 (47-128)||(16920298-16920380)
chr6 (463-507)||(23992436-23992480)
chr6 (346-429)||(22949384-22949466)
chr6 (346-429)||(22953340-22953422)
chr6 (346-429)||(23871828-23871910)
chr6 (346-429)||(23875784-23875866)
chr6 (346-429)||(27325388-27325470)
chr6 (240-322)||(17105925-17106006)
chr6 (160-198)||(17106048-17106086)
chr6 (54-127)||(18409488-18409562)
chr6 (157-206)||(11185808-11185857)
chr6 (157-206)||(16920399-16920448)
chr6 (160-193)||(18177438-18177471)
chr6 (160-193)||(18204400-18204433)
chr6 (157-198)||(18821585-18821626)
chr6 (157-206)||(20360726-20360775)
chr6 (240-317)||(23539165-23539242)
chr6 (86-198)||(16830111-16830223)
chr6 (84-148)||(19023814-19023878)
chr6 (44-149)||(19668812-19668918)
[»] chr5 (93 HSPs)
chr5 (35-507)||(21329137-21329609)
chr5 (8-501)||(26011652-26012141)
chr5 (155-507)||(21501917-21502268)
chr5 (54-502)||(21565556-21566004)
chr5 (54-502)||(22959194-22959639)
chr5 (159-497)||(20026706-20027043)
chr5 (54-502)||(19668912-19669360)
chr5 (31-340)||(21741181-21741492)
chr5 (8-265)||(22144299-22144553)
chr5 (161-500)||(19660606-19660940)
chr5 (240-497)||(22178066-22178323)
chr5 (31-249)||(5888813-5889033)
chr5 (347-497)||(22144068-22144217)
chr5 (396-500)||(21729066-21729169)
chr5 (396-500)||(21808391-21808494)
chr5 (392-507)||(22412193-22412306)
chr5 (396-507)||(24529229-24529339)
chr5 (393-507)||(264812-264924)
chr5 (393-507)||(9077961-9078074)
chr5 (393-507)||(10732984-10733096)
chr5 (393-507)||(20909018-20909130)
chr5 (393-507)||(39363390-39363502)
chr5 (394-507)||(1096476-1096588)
chr5 (407-507)||(21997547-21997646)
chr5 (396-507)||(24493578-24493687)
chr5 (396-507)||(25421541-25421651)
chr5 (393-507)||(29329940-29330052)
chr5 (393-507)||(42245409-42245521)
chr5 (393-507)||(36154827-36154936)
chr5 (396-507)||(8286844-8286955)
chr5 (393-501)||(20902053-20902159)
chr5 (396-496)||(25431414-25431513)
chr5 (417-497)||(36314596-36314675)
chr5 (396-507)||(13025320-13025429)
chr5 (396-507)||(13095504-13095613)
chr5 (396-507)||(23390498-23390608)
chr5 (404-507)||(39245142-39245243)
chr5 (393-507)||(2154658-2154770)
chr5 (393-507)||(11581243-11581355)
chr5 (393-507)||(29345986-29346098)
chr5 (47-265)||(21871225-21871444)
chr5 (47-265)||(21875505-21875724)
chr5 (396-500)||(22075035-22075138)
chr5 (404-507)||(10775731-10775832)
chr5 (404-507)||(18319089-18319190)
chr5 (35-160)||(21498659-21498785)
chr5 (393-507)||(29348459-29348571)
chr5 (393-507)||(29350932-29351044)
chr5 (54-215)||(11580906-11581068)
chr5 (404-507)||(31061074-31061175)
chr5 (404-507)||(38619440-38619541)
chr5 (393-507)||(32027399-32027511)
chr5 (47-215)||(1096765-1096934)
chr5 (404-507)||(23064517-23064618)
chr5 (359-463)||(29448055-29448159)
chr5 (336-498)||(40725871-40726032)
chr5 (429-507)||(20918028-20918104)
chr5 (54-206)||(21985808-21985961)
chr5 (393-497)||(37723922-37724023)
chr5 (44-215)||(36154479-36154651)
chr5 (54-204)||(23390157-23390309)
chr5 (445-497)||(21293020-21293071)
chr5 (404-507)||(24067113-24067214)
chr5 (31-148)||(20026501-20026619)
chr5 (416-506)||(18418590-18418678)
chr5 (463-507)||(20806854-20806898)
chr5 (42-150)||(22177792-22177901)
chr5 (47-128)||(21292635-21292717)
chr5 (54-206)||(24529527-24529681)
chr5 (446-500)||(26732884-26732937)
chr5 (240-309)||(27988776-27988845)
chr5 (47-127)||(19660491-19660572)
chr5 (392-449)||(20766118-20766174)
chr5 (346-407)||(21741486-21741545)
chr5 (160-289)||(25743945-25744074)
chr5 (64-127)||(9078338-9078402)
chr5 (463-507)||(17517269-17517313)
chr5 (463-507)||(26704080-26704124)
chr5 (463-507)||(26973813-26973857)
chr5 (346-429)||(10753603-10753685)
chr5 (346-429)||(21871525-21871607)
chr5 (346-429)||(21875805-21875887)
chr5 (346-429)||(22120149-22120231)
chr5 (446-497)||(26740697-26740747)
chr5 (346-377)||(36314685-36314716)
chr5 (447-497)||(15796438-15796487)
chr5 (157-206)||(9078259-9078308)
chr5 (157-206)||(21292736-21292785)
chr5 (157-206)||(22075325-22075374)
chr5 (47-127)||(22119847-22119928)
chr5 (396-463)||(18356367-18356432)
chr5 (159-207)||(20469654-20469702)
chr5 (429-489)||(21873277-21873336)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (8-436)||(8094-8519)
scaffold0556 (54-502)||(6826-7271)
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (122-507)||(21285606-21285989)
chr8 (35-507)||(38854893-38855363)
chr8 (35-507)||(6520377-6520847)
chr8 (62-501)||(23760509-23760950)
chr8 (62-502)||(21673718-21674157)
chr8 (62-502)||(26355367-26355805)
chr8 (47-497)||(5865931-5866376)
chr8 (240-501)||(983249-983512)
chr8 (162-497)||(20498581-20498915)
chr8 (47-500)||(17140932-17141380)
chr8 (44-500)||(21491011-21491462)
chr8 (209-497)||(17266808-17267096)
chr8 (219-497)||(37116366-37116644)
chr8 (31-237)||(39834107-39834315)
chr8 (209-497)||(24353039-24353329)
chr8 (161-500)||(21249400-21249734)
chr8 (207-500)||(21255238-21255526)
chr8 (219-433)||(22364745-22364957)
chr8 (392-507)||(16092340-16092454)
chr8 (396-507)||(18818411-18818521)
chr8 (396-507)||(28649046-28649156)
chr8 (396-507)||(7372787-7372897)
chr8 (393-507)||(14409488-14409600)
chr8 (393-507)||(16413360-16413472)
chr8 (67-199)||(19801101-19801234)
chr8 (396-500)||(21919002-21919105)
chr8 (393-507)||(1484408-1484520)
chr8 (393-507)||(5853336-5853448)
chr8 (393-507)||(15203275-15203387)
chr8 (346-497)||(17439458-17439609)
chr8 (393-507)||(20403233-20403345)
chr8 (393-507)||(22001759-22001871)
chr8 (402-507)||(6759267-6759371)
chr8 (402-507)||(23406388-23406492)
chr8 (396-507)||(20536217-20536327)
chr8 (396-507)||(21923930-21924040)
chr8 (396-507)||(22626745-22626854)
chr8 (393-507)||(20046239-20046351)
chr8 (393-507)||(41598194-41598306)
chr8 (346-498)||(17612062-17612213)
chr8 (336-498)||(13508027-13508188)
chr8 (392-507)||(22875074-22875187)
chr8 (393-507)||(4483287-4483398)
chr8 (393-507)||(4542417-4542529)
chr8 (54-215)||(41598482-41598644)
chr8 (392-504)||(26219726-26219835)
chr8 (336-498)||(13597559-13597720)
chr8 (408-507)||(45290754-45290851)
chr8 (438-507)||(18879275-18879343)
chr8 (415-500)||(31971273-31971356)
chr8 (415-497)||(16199666-16199746)
chr8 (393-507)||(19896271-19896386)
chr8 (396-497)||(21395984-21396082)
chr8 (396-497)||(21790477-21790575)
chr8 (392-507)||(26225291-26225403)
chr8 (393-507)||(26223925-26224037)
chr8 (404-500)||(15070571-15070665)
chr8 (404-507)||(19937061-19937162)
chr8 (396-497)||(21389454-21389552)
chr8 (396-497)||(21778780-21778878)
chr8 (415-497)||(45131019-45131098)
chr8 (41-148)||(13507657-13507765)
chr8 (41-148)||(13597189-13597297)
chr8 (31-149)||(20499024-20499143)
chr8 (393-507)||(14823780-14823891)
chr8 (84-206)||(22875372-22875494)
chr8 (444-497)||(19154936-19154989)
chr8 (47-206)||(20536514-20536675)
chr8 (393-497)||(19801426-19801527)
chr8 (54-228)||(23406665-23406841)
chr8 (396-507)||(18678104-18678214)
chr8 (54-206)||(6759563-6759717)
chr8 (387-433)||(40492844-40492890)
chr8 (393-507)||(25484319-25484424)
chr8 (447-507)||(23648562-23648621)
chr8 (53-128)||(45130691-45130767)
chr8 (42-150)||(17266565-17266674)
chr8 (396-507)||(32121741-32121851)
chr8 (54-127)||(18878898-18878972)
chr8 (42-150)||(982975-983084)
chr8 (64-150)||(17439100-17439187)
chr8 (8-79)||(21286656-21286724)
chr8 (47-127)||(21918664-21918745)
chr8 (64-150)||(24353463-24353550)
chr8 (53-214)||(21414887-21415049)
chr8 (346-429)||(18862430-18862512)
chr8 (346-429)||(21383896-21383978)
chr8 (346-429)||(21387316-21387398)
chr8 (346-429)||(21411189-21411271)
chr8 (346-429)||(21805681-21805763)
chr8 (346-429)||(21827799-21827881)
chr8 (54-127)||(7373135-7373209)
chr8 (54-127)||(18818071-18818145)
chr8 (157-199)||(21918766-21918808)
chr8 (54-123)||(22627125-22627195)
chr8 (47-128)||(31971629-31971711)
chr8 (157-206)||(18818175-18818224)
chr8 (47-127)||(21255605-21255686)
chr8 (64-150)||(37116787-37116874)
chr8 (334-430)||(14103165-14103260)
chr8 (84-128)||(25362843-25362887)
chr8 (158-198)||(37116664-37116704)
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (35-507)||(39705930-39706400)
chr4 (31-407)||(15099457-15099833)
chr4 (44-407)||(15190424-15190787)
chr4 (158-501)||(12287974-12288316)
chr4 (55-502)||(8846370-8846834)
chr4 (54-502)||(12774021-12774458)
chr4 (240-497)||(13697-13953)
chr4 (219-497)||(53081976-53082254)
chr4 (209-497)||(46640272-46640558)
chr4 (219-501)||(43198381-43198661)
chr4 (8-215)||(52242811-52243016)
chr4 (31-215)||(15464567-15464752)
chr4 (31-184)||(43198226-43198380)
chr4 (222-500)||(15551833-15552105)
chr4 (53-478)||(16596686-16597106)
chr4 (44-198)||(13844854-13845009)
chr4 (336-501)||(52243136-52243302)
chr4 (393-507)||(16377522-16377633)
chr4 (392-507)||(54798752-54798866)
chr4 (396-507)||(7798783-7798893)
chr4 (392-507)||(14280322-14280435)
chr4 (396-507)||(52873369-52873479)
chr4 (393-507)||(18215318-18215430)
chr4 (393-507)||(44928923-44929036)
chr4 (396-500)||(12902773-12902876)
chr4 (396-507)||(7088886-7088996)
chr4 (393-507)||(12351-12463)
chr4 (393-507)||(15118396-15118508)
chr4 (393-507)||(19618216-19618328)
chr4 (393-507)||(44773131-44773243)
chr4 (62-215)||(44928592-44928746)
chr4 (393-507)||(52312516-52312628)
chr4 (396-507)||(7893712-7893822)
chr4 (393-507)||(1837553-1837665)
chr4 (393-507)||(3515013-3515125)
chr4 (393-507)||(14038657-14038770)
chr4 (393-507)||(18239463-18239575)
chr4 (393-507)||(19242705-19242817)
chr4 (393-507)||(44615294-44615406)
chr4 (393-507)||(50222383-50222495)
chr4 (393-507)||(51463912-51464024)
chr4 (396-500)||(23374361-23374464)
chr4 (404-507)||(15355380-15355481)
chr4 (396-507)||(16270238-16270347)
chr4 (400-507)||(23803316-23803421)
chr4 (423-500)||(3096309-3096385)
chr4 (393-505)||(14970751-14970861)
chr4 (396-507)||(6899900-6900009)
chr4 (392-507)||(8574867-8574979)
chr4 (396-507)||(16239972-16240081)
chr4 (396-507)||(22636444-22636554)
chr4 (396-507)||(44052838-44052948)
chr4 (415-497)||(6190481-6190563)
chr4 (393-507)||(44102220-44102332)
chr4 (31-148)||(15868273-15868391)
chr4 (444-497)||(17046506-17046559)
chr4 (54-214)||(21814964-21815124)
chr4 (54-214)||(21815293-21815453)
chr4 (54-214)||(21818386-21818546)
chr4 (454-507)||(7641286-7641338)
chr4 (454-507)||(12610956-12611008)
chr4 (36-148)||(32851816-32851929)
chr4 (404-498)||(15367708-15367800)
chr4 (404-498)||(15370036-15370128)
chr4 (404-498)||(15371220-15371312)
chr4 (404-498)||(15373501-15373593)
chr4 (404-498)||(15402721-15402813)
chr4 (35-150)||(13415-13532)
chr4 (393-497)||(21815629-21815731)
chr4 (415-497)||(14053323-14053403)
chr4 (389-435)||(15464926-15464972)
chr4 (404-498)||(16223550-16223642)
chr4 (53-128)||(3097017-3097093)
chr4 (256-324)||(14164739-14164807)
chr4 (393-497)||(22353852-22353955)
chr4 (84-206)||(15091203-15091326)
chr4 (404-507)||(20149835-20149936)
chr4 (84-150)||(12287825-12287891)
chr4 (54-206)||(14038955-14039109)
chr4 (157-215)||(44102508-44102566)
chr4 (84-149)||(53081789-53081854)
chr4 (159-199)||(13616-13656)
chr4 (65-128)||(12903131-12903195)
chr4 (47-128)||(14052967-14053049)
chr4 (256-324)||(14158034-14158102)
chr4 (346-429)||(630728-630810)
chr4 (346-429)||(3331970-3332052)
chr4 (157-204)||(7089185-7089232)
chr4 (346-429)||(13812763-13812845)
chr4 (346-429)||(14953915-14953997)
chr4 (54-127)||(16239653-16239728)
chr4 (157-204)||(17047838-17047885)
chr4 (346-429)||(25690146-25690228)
chr4 (54-127)||(6190819-6190893)
chr4 (67-128)||(7089251-7089313)
chr4 (157-206)||(3096949-3096998)
chr4 (157-206)||(7799003-7799052)
chr4 (157-206)||(12903063-12903112)
chr4 (47-127)||(15552199-15552280)
chr4 (47-127)||(24029127-24029208)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (47-501)||(12954-13407)
scaffold0138 (158-433)||(18002-18276)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (35-507)||(6620-7092)
scaffold0333 (35-507)||(14000-14472)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (47-501)||(15470939-15471391)
chr3 (35-507)||(14234496-14234969)
chr3 (62-502)||(16097342-16097782)
chr3 (158-497)||(37250932-37251270)
chr3 (31-407)||(1465047-1465423)
chr3 (54-502)||(32307691-32308128)
chr3 (54-502)||(16103794-16104240)
chr3 (161-500)||(13210096-13210432)
chr3 (43-267)||(324481-324706)
chr3 (31-211)||(2050839-2051018)
chr3 (158-497)||(22110116-22110454)
chr3 (283-502)||(12174152-12174366)
chr3 (64-502)||(49667754-49668183)
chr3 (54-322)||(12933971-12934241)
chr3 (8-215)||(52523345-52523550)
chr3 (222-406)||(49389459-49389642)
chr3 (62-502)||(1644352-1644780)
chr3 (54-502)||(9512934-9513370)
chr3 (54-502)||(9520909-9521345)
chr3 (336-497)||(52523669-52523831)
chr3 (396-507)||(18438543-18438653)
chr3 (392-507)||(27165256-27165370)
chr3 (392-498)||(42386428-42386533)
chr3 (405-507)||(53301562-53301663)
chr3 (394-507)||(14972863-14972975)
chr3 (396-500)||(12399225-12399328)
chr3 (54-215)||(17247947-17248109)
chr3 (393-507)||(29172627-29172739)
chr3 (157-275)||(12171869-12171988)
chr3 (396-507)||(23083363-23083473)
chr3 (396-507)||(24153211-24153320)
chr3 (392-507)||(36166604-36166716)
chr3 (353-497)||(43925977-43926121)
chr3 (393-507)||(6469178-6469290)
chr3 (393-507)||(9707651-9707763)
chr3 (393-507)||(17463184-17463296)
chr3 (393-507)||(17672632-17672744)
chr3 (393-507)||(25476384-25476497)
chr3 (393-507)||(28848655-28848767)
chr3 (393-507)||(34159332-34159444)
chr3 (393-507)||(45606951-45607063)
chr3 (393-507)||(55476497-55476609)
chr3 (396-501)||(26686902-26687006)
chr3 (398-507)||(55500948-55501055)
chr3 (393-505)||(38961935-38962045)
chr3 (396-507)||(20698437-20698547)
chr3 (31-214)||(42386710-42386894)
chr3 (209-356)||(43927291-43927438)
chr3 (393-507)||(7781391-7781503)
chr3 (393-507)||(8899100-8899212)
chr3 (393-507)||(12567566-12567678)
chr3 (393-507)||(13544031-13544143)
chr3 (396-502)||(14572603-14572707)
chr3 (393-507)||(16454325-16454437)
chr3 (54-214)||(53070360-53070520)
chr3 (353-497)||(43550482-43550625)
chr3 (415-507)||(11424781-11424871)
chr3 (393-507)||(13151834-13151947)
chr3 (393-507)||(13154299-13154412)
chr3 (396-507)||(13442283-13442393)
chr3 (396-507)||(17487865-17487975)
chr3 (396-507)||(17499347-17499457)
chr3 (392-503)||(21618459-21618567)
chr3 (336-498)||(24340665-24340826)
chr3 (396-507)||(43840941-43841051)
chr3 (393-507)||(10247767-10247879)
chr3 (393-507)||(15977521-15977633)
chr3 (393-507)||(16282855-16282967)
chr3 (393-507)||(17446699-17446810)
chr3 (392-498)||(23274705-23274810)
chr3 (393-507)||(40213720-40213832)
chr3 (393-507)||(41123896-41124005)
chr3 (451-507)||(28194699-28194755)
chr3 (393-505)||(50242830-50242940)
chr3 (404-507)||(12119780-12119881)
chr3 (404-507)||(15412435-15412536)
chr3 (336-498)||(37642207-37642368)
chr3 (393-497)||(53070697-53070799)
chr3 (404-507)||(8499524-8499625)
chr3 (396-502)||(14576835-14576939)
chr3 (43-150)||(605941-606049)
chr3 (392-507)||(10556991-10557105)
chr3 (388-497)||(12377940-12378050)
chr3 (64-206)||(40213392-40213535)
chr3 (412-507)||(44494815-44494908)
chr3 (336-454)||(2051141-2051260)
chr3 (454-507)||(17737242-17737294)
chr3 (463-507)||(45577950-45577994)
chr3 (336-498)||(22147467-22147628)
chr3 (393-497)||(606324-606428)
chr3 (65-228)||(14572873-14573037)
chr3 (42-148)||(23275106-23275213)
chr3 (34-148)||(23412814-23412929)
chr3 (54-206)||(25476046-25476199)
chr3 (42-150)||(43927543-43927652)
chr3 (54-126)||(49389305-49389378)
chr3 (36-148)||(14501564-14501677)
chr3 (54-198)||(11424424-11424569)
chr3 (47-127)||(14179708-14179789)
chr3 (53-150)||(12378359-12378457)
chr3 (463-507)||(46822274-46822318)
chr3 (36-148)||(45797608-45797721)
chr3 (54-127)||(18438920-18438994)
chr3 (47-128)||(20698101-20698183)
chr3 (54-206)||(26687193-26687347)
chr3 (54-206)||(14973161-14973314)
chr3 (84-149)||(37250804-37250869)
chr3 (463-507)||(12511066-12511110)
chr3 (346-429)||(14501207-14501290)
chr3 (65-127)||(14576505-14576568)
chr3 (65-127)||(17488243-17488306)
chr3 (65-127)||(17499725-17499788)
chr3 (346-429)||(19776007-19776089)
chr3 (44-150)||(22109926-22110033)
chr3 (346-429)||(37439421-37439503)
chr3 (160-198)||(606135-606173)
chr3 (445-495)||(13919350-13919399)
chr3 (47-127)||(12340138-12340219)
chr3 (157-206)||(20698202-20698251)
chr3 (447-507)||(856145-856204)
chr3 (64-127)||(13442660-13442724)
chr3 (447-507)||(23077530-23077589)
chr3 (162-206)||(23083132-23083176)
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (47-502)||(22921521-22921976)
chr1 (54-501)||(33681022-33681469)
chr1 (54-501)||(52927642-52928076)
chr1 (54-501)||(22237642-22238089)
chr1 (159-497)||(21861335-21861672)
chr1 (57-502)||(20248293-20248734)
chr1 (31-407)||(35981325-35981700)
chr1 (219-497)||(21896084-21896358)
chr1 (84-408)||(20636956-20637279)
chr1 (54-502)||(21754059-21754495)
chr1 (219-497)||(16368112-16368388)
chr1 (159-500)||(20918620-20918956)
chr1 (219-497)||(50613942-50614219)
chr1 (219-497)||(50621770-50622047)
chr1 (164-407)||(49261448-49261690)
chr1 (164-497)||(50686630-50686963)
chr1 (209-497)||(41049851-41050138)
chr1 (31-276)||(28194086-28194333)
chr1 (346-496)||(14295507-14295652)
chr1 (393-507)||(50210212-50210325)
chr1 (336-497)||(35261023-35261180)
chr1 (396-507)||(34509789-34509899)
chr1 (44-161)||(43697712-43697830)
chr1 (353-497)||(45574846-45574989)
chr1 (337-501)||(16758664-16758828)
chr1 (159-317)||(12271744-12271902)
chr1 (393-507)||(13988872-13988984)
chr1 (393-507)||(21840773-21840885)
chr1 (393-507)||(21923335-21923447)
chr1 (393-507)||(23593779-23593891)
chr1 (394-507)||(31612319-31612430)
chr1 (393-507)||(21475131-21475243)
chr1 (393-507)||(29298143-29298254)
chr1 (393-507)||(433018-433128)
chr1 (396-500)||(27250731-27250834)
chr1 (401-507)||(22123119-22123224)
chr1 (393-507)||(29776694-29776806)
chr1 (396-500)||(21026696-21026799)
chr1 (413-500)||(20847173-20847259)
chr1 (396-507)||(22532278-22532388)
chr1 (335-497)||(16093825-16093987)
chr1 (393-507)||(16361923-16362035)
chr1 (447-507)||(20454606-20454665)
chr1 (54-208)||(433312-433467)
chr1 (353-507)||(21707173-21707325)
chr1 (353-507)||(21711715-21711867)
chr1 (404-507)||(13212917-13213018)
chr1 (404-507)||(15860064-15860165)
chr1 (404-507)||(16275419-16275520)
chr1 (404-507)||(21342102-21342203)
chr1 (404-507)||(21346967-21347068)
chr1 (346-463)||(22130863-22130975)
chr1 (396-507)||(22468698-22468808)
chr1 (440-490)||(38801433-38801483)
chr1 (295-502)||(21161730-21161932)
chr1 (65-206)||(50209885-50210027)
chr1 (31-148)||(21861132-21861250)
chr1 (158-215)||(26065238-26065295)
chr1 (55-206)||(34510087-34510239)
chr1 (31-148)||(21895870-21895989)
chr1 (404-507)||(40389160-40389261)
chr1 (31-148)||(16759091-16759209)
chr1 (47-128)||(22355839-22355921)
chr1 (47-128)||(22357525-22357607)
chr1 (346-495)||(26064959-26065107)
chr1 (31-148)||(21342513-21342631)
chr1 (31-148)||(21347378-21347496)
chr1 (463-507)||(21714551-21714595)
chr1 (54-205)||(22532577-22532729)
chr1 (67-150)||(26065357-26065441)
chr1 (346-440)||(51130639-51130729)
chr1 (396-507)||(20135196-20135306)
chr1 (160-310)||(16381388-16381538)
chr1 (47-128)||(27250394-27250476)
chr1 (165-211)||(35260852-35260898)
chr1 (84-150)||(50687031-50687097)
chr1 (64-150)||(16367881-16367968)
chr1 (64-124)||(20918990-20919051)
chr1 (159-215)||(16758949-16759005)
chr1 (67-150)||(35260729-35260813)
chr1 (346-429)||(1924914-1924996)
chr1 (54-128)||(20846891-20846966)
chr1 (346-429)||(20923928-20924010)
chr1 (44-150)||(41049619-41049726)
chr1 (47-128)||(38801056-38801138)
chr1 (157-199)||(38801157-38801199)
chr1 (393-430)||(12271639-12271676)
chr1 (157-206)||(22354338-22354387)
chr1 (84-148)||(16093508-16093572)
chr1 (86-198)||(24087730-24087842)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (31-507)||(5760-6235)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (62-502)||(129919-130359)
scaffold0010 (389-497)||(60710-60818)
scaffold0010 (158-215)||(60479-60536)
scaffold0010 (67-150)||(60312-60396)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (54-502)||(19278-19726)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (31-507)||(666-1146)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (62-502)||(2313-2752)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (47-502)||(25175864-25176309)
chr2 (64-502)||(28405990-28406429)
chr2 (160-497)||(7499-7835)
chr2 (158-501)||(18786667-18787009)
chr2 (158-497)||(23207296-23207634)
chr2 (219-497)||(23791292-23791570)
chr2 (348-507)||(7679594-7679750)
chr2 (31-215)||(23708257-23708441)
chr2 (219-497)||(25108906-25109184)
chr2 (393-507)||(22105418-22105531)
chr2 (54-495)||(22133878-22134306)
chr2 (159-430)||(22459327-22459598)
chr2 (396-507)||(298816-298927)
chr2 (336-501)||(23708561-23708725)
chr2 (346-500)||(23071905-23072054)
chr2 (396-507)||(23060522-23060632)
chr2 (393-507)||(6726001-6726113)
chr2 (392-507)||(22337124-22337238)
chr2 (396-507)||(23076451-23076561)
chr2 (393-507)||(571403-571515)
chr2 (393-507)||(18808949-18809061)
chr2 (393-507)||(23130868-23130980)
chr2 (393-507)||(23133335-23133447)
chr2 (393-507)||(23135596-23135708)
chr2 (393-507)||(23709576-23709688)
chr2 (393-507)||(23712057-23712169)
chr2 (393-507)||(26505385-26505497)
chr2 (393-507)||(26507863-26507975)
chr2 (393-507)||(32214965-32215077)
chr2 (393-507)||(34402566-34402678)
chr2 (393-507)||(39682319-39682431)
chr2 (346-498)||(19671848-19671998)
chr2 (393-505)||(24367782-24367892)
chr2 (393-507)||(21155104-21155216)
chr2 (393-507)||(28577105-28577217)
chr2 (393-507)||(24898239-24898352)
chr2 (393-507)||(24900722-24900835)
chr2 (393-507)||(24903199-24903312)
chr2 (393-507)||(24905676-24905789)
chr2 (393-507)||(24908151-24908264)
chr2 (346-497)||(20520145-20520295)
chr2 (393-507)||(32039542-32039654)
chr2 (393-507)||(43137305-43137417)
chr2 (415-500)||(38136-38219)
chr2 (398-507)||(22731238-22731346)
chr2 (336-497)||(22413078-22413240)
chr2 (393-507)||(45029898-45030010)
chr2 (438-507)||(23285874-23285942)
chr2 (396-497)||(20309127-20309225)
chr2 (396-507)||(23660032-23660141)
chr2 (393-507)||(24529573-24529685)
chr2 (415-497)||(32451949-32452031)
chr2 (44-228)||(23076726-23076910)
chr2 (393-497)||(23103396-23103497)
chr2 (336-497)||(24697548-24697709)
chr2 (396-507)||(22738182-22738291)
chr2 (54-228)||(23660307-23660482)
chr2 (393-507)||(38967380-38967493)
chr2 (54-206)||(298476-298629)
chr2 (437-507)||(8946666-8946735)
chr2 (387-497)||(23004767-23004878)
chr2 (454-507)||(24643054-24643106)
chr2 (396-500)||(23654388-23654491)
chr2 (452-507)||(23040247-23040301)
chr2 (47-124)||(23071617-23071695)
chr2 (31-150)||(18786446-18786566)
chr2 (84-206)||(22337422-22337544)
chr2 (396-507)||(25616194-25616304)
chr2 (67-150)||(22412733-22412817)
chr2 (54-127)||(22730894-22730968)
chr2 (54-123)||(22737841-22737911)
chr2 (445-495)||(23287384-23287433)
chr2 (47-128)||(23654064-23654146)
chr2 (158-211)||(22412900-22412953)
chr2 (446-495)||(26392403-26392451)
chr2 (67-150)||(23207717-23207801)
chr2 (346-429)||(1283666-1283748)
chr2 (346-429)||(30344776-30344858)
chr2 (47-128)||(23286235-23286317)
chr2 (54-127)||(27753961-27754035)
chr2 (54-206)||(32451590-32451744)
chr2 (53-128)||(37787-37863)
chr2 (158-215)||(20519957-20520014)
chr2 (84-128)||(20309479-20309523)
chr2 (67-150)||(20519790-20519874)
chr2 (162-198)||(31756232-31756268)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (64-502)||(6549-6987)
scaffold0621 (159-501)||(8481-8824)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (31-495)||(7695-8161)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (84-502)||(39864-40281)
scaffold0023 (226-502)||(100388-100662)
scaffold0023 (54-309)||(101599-101854)
scaffold0023 (393-507)||(17484-17596)
scaffold0023 (393-507)||(94417-94529)
scaffold0023 (393-507)||(44460-44573)
scaffold0023 (443-500)||(119891-119948)
scaffold0023 (439-502)||(101513-101576)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (54-502)||(160698-161145)
scaffold0001 (393-507)||(501090-501202)
scaffold0001 (404-507)||(85635-85736)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (54-502)||(143-590)
[»] scaffold0555 (2 HSPs)
scaffold0555 (135-501)||(10283-10647)
scaffold0555 (53-113)||(10228-10289)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (54-502)||(45450-45899)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (158-501)||(7841-8180)
scaffold0218 (206-469)||(29093-29354)
scaffold0218 (48-123)||(28935-29011)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (222-502)||(12780-13058)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (205-507)||(1091-1391)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (44-325)||(15481-15764)
scaffold0020 (380-507)||(15763-15889)
scaffold0020 (463-507)||(178903-178947)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (222-502)||(5657-5934)
scaffold0278 (54-140)||(5966-6053)
[»] scaffold0021 (8 HSPs)
scaffold0021 (158-497)||(136132-136471)
scaffold0021 (158-497)||(144840-145179)
scaffold0021 (393-497)||(174785-174886)
scaffold0021 (446-507)||(121775-121835)
scaffold0021 (54-161)||(62913-63021)
scaffold0021 (44-150)||(135942-136049)
scaffold0021 (44-150)||(144650-144757)
scaffold0021 (157-206)||(124891-124940)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (54-502)||(2464-2913)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (187-501)||(22467-22776)
scaffold0037 (393-507)||(82078-82190)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (203-502)||(14506-14804)
[»] scaffold0413 (3 HSPs)
scaffold0413 (158-497)||(12587-12924)
scaffold0413 (54-199)||(15276-15422)
scaffold0413 (34-150)||(13007-13124)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (158-501)||(103403-103737)
scaffold0040 (44-150)||(103234-103341)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (230-498)||(62216-62479)
scaffold0028 (54-502)||(132672-133113)
scaffold0028 (393-507)||(136686-136798)
scaffold0028 (393-507)||(139155-139267)
scaffold0028 (393-507)||(144093-144205)
scaffold0028 (393-507)||(134217-134329)
scaffold0028 (393-507)||(141624-141736)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (158-497)||(19649-19987)
scaffold0080 (396-507)||(39922-40031)
scaffold0080 (157-227)||(40198-40268)
scaffold0080 (346-429)||(48939-49021)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (161-507)||(15670-16011)
scaffold0261 (54-124)||(16047-16118)
scaffold0261 (36-147)||(17909-18021)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (206-458)||(2030-2281)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (219-497)||(6108-6386)
scaffold0420 (450-497)||(13793-13840)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (240-497)||(53395-53651)
scaffold0075 (35-150)||(53113-53230)
scaffold0075 (47-265)||(7948-8167)
scaffold0075 (159-199)||(53314-53354)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (160-493)||(38339-38672)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (54-461)||(9133-9536)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (47-500)||(34139-34587)
scaffold0175 (396-466)||(13141-13211)
scaffold0175 (463-507)||(282-326)
scaffold0175 (157-206)||(13398-13447)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (222-500)||(11308-11581)
scaffold0046 (280-500)||(2013-2228)
scaffold0046 (396-507)||(28423-28533)
scaffold0046 (460-500)||(4568-4608)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (240-497)||(128817-129072)
scaffold0022 (219-493)||(78345-78617)
scaffold0022 (392-507)||(116436-116548)
scaffold0022 (64-150)||(80701-80788)
scaffold0022 (158-198)||(128735-128775)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (47-198)||(43438-43590)
scaffold0116 (47-198)||(47358-47510)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (240-497)||(97024-97280)
scaffold0006 (240-497)||(106302-106558)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (158-497)||(1562-1900)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (163-497)||(569-900)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (54-249)||(3195-3392)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (209-466)||(54-311)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (54-502)||(32112-32543)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (54-322)||(28470-28740)
scaffold0211 (439-502)||(28813-28877)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (393-507)||(3185-3298)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (389-501)||(27744-27855)
scaffold0165 (32-150)||(27281-27400)
scaffold0165 (159-200)||(27485-27526)
scaffold0165 (47-128)||(3855-3937)
scaffold0165 (47-128)||(7919-8001)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (346-497)||(1025-1171)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (389-501)||(16095-16206)
scaffold0357 (391-497)||(13147-13252)
scaffold0357 (160-215)||(15866-15921)
scaffold0357 (84-150)||(13570-13636)
scaffold0357 (445-497)||(2680-2732)
scaffold0357 (53-150)||(3133-3231)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (392-507)||(44705-44819)
scaffold0122 (393-507)||(26064-26177)
scaffold0122 (54-206)||(25726-25879)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (392-507)||(38700-38814)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (392-497)||(1051-1155)
[»] scaffold0540 (2 HSPs)
scaffold0540 (392-507)||(3149-3262)
scaffold0540 (64-206)||(684-827)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (392-507)||(39486-39599)
scaffold0141 (157-206)||(39783-39832)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (392-507)||(75213-75326)
scaffold0049 (157-206)||(74980-75029)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (346-501)||(25121-25275)
scaffold0123 (336-433)||(620-715)
scaffold0123 (64-150)||(25545-25632)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (393-507)||(17214-17329)
scaffold0056 (393-497)||(79328-79430)
scaffold0056 (54-206)||(16876-17029)
scaffold0056 (47-126)||(79016-79096)
scaffold0056 (170-214)||(79107-79151)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (259-497)||(267679-267916)
scaffold0005 (84-147)||(268094-268157)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (396-500)||(4865-4968)
scaffold0403 (47-128)||(5222-5304)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (396-507)||(22892-23001)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (396-507)||(51922-52032)
scaffold0011 (396-500)||(167980-168083)
scaffold0011 (54-206)||(52218-52372)
scaffold0011 (47-123)||(167644-167721)
scaffold0011 (157-206)||(167745-167794)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (393-507)||(10779-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (393-507)||(13398-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (393-507)||(20753-20865)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (393-507)||(37827-37939)
[»] scaffold0120 (7 HSPs)
scaffold0120 (393-507)||(16122-16235)
scaffold0120 (396-507)||(32959-33068)
scaffold0120 (396-507)||(45937-46046)
scaffold0120 (454-507)||(17389-17441)
scaffold0120 (53-205)||(32619-32772)
scaffold0120 (53-205)||(46233-46386)
scaffold0120 (64-127)||(16473-16537)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (393-507)||(158494-158606)
scaffold0003 (393-501)||(339949-340053)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (54-297)||(1962-2207)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (412-501)||(23901-23989)
scaffold0100 (54-200)||(20425-20572)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (64-156)||(227849-227942)
scaffold0012 (336-458)||(225465-225585)
scaffold0012 (151-265)||(225656-225769)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (393-504)||(4703-4812)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (336-498)||(11482-11643)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (396-507)||(13220-13330)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (336-498)||(38198-38359)
scaffold0124 (346-429)||(24605-24690)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (389-507)||(8488-8605)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (393-507)||(13953-14065)
[»] scaffold0228 (6 HSPs)
scaffold0228 (392-502)||(4522-4630)
scaffold0228 (392-502)||(12104-12212)
scaffold0228 (392-502)||(22056-22164)
scaffold0228 (54-206)||(4814-4968)
scaffold0228 (54-206)||(12396-12550)
scaffold0228 (54-206)||(22348-22502)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (393-507)||(16599-16712)
scaffold0217 (54-205)||(16260-16413)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (393-507)||(16790-16902)
scaffold0142 (54-215)||(17078-17240)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (393-507)||(11294-11406)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (47-440)||(2099-2488)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (396-507)||(3479-3589)
scaffold0292 (396-507)||(352-461)
scaffold0292 (54-206)||(649-802)
scaffold0292 (64-205)||(3777-3920)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (396-507)||(32951-33060)
scaffold0145 (393-507)||(9755-9867)
scaffold0145 (396-507)||(38770-38879)
scaffold0145 (54-206)||(39067-39219)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (396-498)||(24304-24406)
scaffold0042 (64-127)||(23973-24037)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (392-507)||(25905-26018)
scaffold0026 (392-507)||(39867-39980)
scaffold0026 (54-127)||(39592-39666)
scaffold0026 (64-127)||(40242-40306)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (396-507)||(1860-1970)
scaffold0016 (54-204)||(2159-2311)
scaffold0016 (42-121)||(119200-119280)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (393-507)||(12293-12405)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (393-507)||(9248-9360)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (31-180)||(12329-12478)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (393-499)||(29946-30050)
[»] scaffold0121 (2 HSPs)
scaffold0121 (396-507)||(8535-8641)
scaffold0121 (64-127)||(8203-8267)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (393-507)||(40406-40518)
[»] scaffold1842 (3 HSPs)
scaffold1842 (396-500)||(1050-1153)
scaffold1842 (47-123)||(714-791)
scaffold1842 (157-206)||(815-864)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (64-215)||(1748-1900)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (404-507)||(4220-4321)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (336-498)||(17969-18130)
scaffold0247 (404-505)||(2184-2283)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (393-507)||(4303-4415)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (396-507)||(6123-6236)
scaffold0647 (54-125)||(5782-5854)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (396-500)||(10427-10528)
scaffold0456 (53-128)||(10097-10173)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (396-498)||(20928-21030)
scaffold0088 (47-128)||(21275-21357)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (444-497)||(51601-51654)
scaffold0032 (65-128)||(51953-52017)
[»] scaffold0358 (5 HSPs)
scaffold0358 (424-500)||(4728-4803)
scaffold0358 (47-128)||(310-392)
scaffold0358 (47-128)||(5086-5168)
scaffold0358 (157-205)||(243-291)
scaffold0358 (157-205)||(5019-5067)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (54-214)||(12228-12388)
scaffold0503 (454-497)||(11982-12024)
[»] scaffold0427 (2 HSPs)
scaffold0427 (437-500)||(13513-13575)
scaffold0427 (47-128)||(13869-13951)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (446-497)||(1308-1359)
scaffold0106 (444-497)||(7285-7338)
scaffold0106 (447-507)||(15291-15350)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (396-495)||(4545-4643)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (393-507)||(112-224)
[»] scaffold0351 (2 HSPs)
scaffold0351 (413-497)||(16301-16382)
scaffold0351 (44-124)||(16657-16738)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (396-497)||(1971-2071)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (393-507)||(12070-12176)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (393-497)||(20423-20524)
scaffold0031 (54-214)||(20087-20247)
scaffold0031 (396-507)||(128760-128869)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (445-500)||(32083-32137)
scaffold0113 (47-128)||(32438-32520)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (404-507)||(1336-1437)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (393-507)||(161133-161246)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (42-150)||(24169-24279)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (415-500)||(11464-11548)
scaffold0235 (34-148)||(14004-14119)
scaffold0235 (47-128)||(11178-11260)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (415-500)||(15485-15568)
scaffold0114 (44-129)||(15127-15213)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (412-497)||(2694-2780)
[»] scaffold0718 (2 HSPs)
scaffold0718 (450-497)||(5183-5230)
scaffold0718 (47-128)||(4796-4878)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (446-497)||(47014-47065)
scaffold0064 (47-128)||(47360-47442)
[»] scaffold0598 (3 HSPs)
scaffold0598 (444-497)||(1098-1151)
scaffold0598 (47-128)||(717-799)
scaffold0598 (157-206)||(818-867)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (393-452)||(3529-3588)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (62-206)||(211-356)
[»] scaffold0395 (3 HSPs)
scaffold0395 (449-507)||(4888-4945)
scaffold0395 (85-198)||(8185-8298)
scaffold0395 (54-125)||(623-695)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (47-127)||(2739-2820)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (34-150)||(1344-1461)
scaffold0130 (54-125)||(28924-28996)
scaffold0130 (392-434)||(27911-27953)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (31-148)||(7095-7213)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (463-507)||(23848-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (463-507)||(36459-36503)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (54-198)||(20717-20863)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (53-126)||(17668-17742)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (54-127)||(18619-18693)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (207-265)||(12623-12681)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (36-125)||(29149-29239)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (162-198)||(338-374)
scaffold1419 (240-372)||(165-296)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (346-429)||(6-88)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (31-147)||(35508-35625)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (47-128)||(1288-1370)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (47-124)||(13262-13340)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (445-495)||(206575-206624)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (334-430)||(602-697)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (157-205)||(6917-6965)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (463-507)||(29563-29607)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22073419 - 22072922
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22073419 cagagagtcgacatggtttcgtagt---tttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattagaaaagattct 22073323  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22073322 agaatgagattgaacctagaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccag 22073223  T
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22073222 ttacagaatgctttgttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgtt 22073123  T
Q  307 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22073122 gtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 22073023  T
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22073022 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaag 22072923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 35 - 501
Target Start/End: Original strand, 16219358 - 16219823
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||  | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16219358 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctaaacttgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaatagttt 16219457  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatg 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16219458 aagaatgaatttttgggagttacacgtgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgccttgttaggttaaatg 16219557  T
Q  234 cgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 333  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16219558 cgatctttgtcgcacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatc 16219657  T
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16219658 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 16219756  T
Q  434 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
     | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219757 at-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 84 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 16056757 - 16056343
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 183  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16056757 taataatgaataggaaagattttagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatagcgagtagagg 16056658  T
Q  184 ccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaact 283  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16056657 ctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaact 16056558  T
Q  284 aagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttat 383  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16056557 aagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attat 16056459  T
Q  384 gtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16056458 gtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgca 16056361  T
Q  484 tgagtcggtctaagttga 501  Q
    | ||||||||||||||||    
T  16056360 tcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 47832287 - 47831816
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  47832287 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagattgaatctggaatagttt 47832188  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaat 232  Q
    ||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47832187 aagaacgaatttt-gagagttacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaat 47832089  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 332  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47832088 gtgatctttgtcggacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 47831989  T
Q  333 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47831988 ctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 47831890  T
Q  433 gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | | | | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831889 gat-gatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 47831816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 62 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 68198 - 67754
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacc 159  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   | || |||||||||||      
T  68198 gttttcgagtgcctgaa-tatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaataatttaagaacaaacttgtgggagttacaga 68100  T
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  68099 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgt 68000  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67999 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatata 67900  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgtt 457  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  67899 attgtatatacattatatga-attatg-ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgtt 67804  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67803 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 67754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Original strand, 810790 - 811238
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    || |||||| ||||||| ||     
T  810790 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaataagattgaacctggaaagaatttagaatgaatttttgtgaa 810889  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca-gttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||| ||| | ||||| | ||||||||||||  ||||||| | |    
T  810890 ctgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt-acttatgttacaaaatgccttgtttaagttaaatgcgatctttgtcgcgcaa 810988  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||| ||| || || || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  810989 gttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatg 811088  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  811089 ttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgc 811186  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811187 ctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 18006101 - 18005660
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||      |||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||||    
T  18006101 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagatt------tgagattgaacctaaaatagtttaagaacgaacttgtgggag 18006008  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||| ||    
T  18006007 ttatacctgaactcgccatggcgactagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataa-tgcgatctttgtcgcacaag 18005909  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  18005908 ttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatg 18005809  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||||    
T  18005808 gtatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttccatactgc 18005712  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005711 ttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 55 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 44014633 - 44014192
Alignment:
Q  55 cttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagt 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||  |||    
T  44014633 cttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttgttagt 44014534  T
Q  154 tacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagt 252  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  44014533 tgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccggttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatcattgtcgcacgaat 44014434  T
Q  253 tgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||     
T  44014433 tgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttg-ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatgg 44014337  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||   |||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  44014336 tatataactgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgaga---tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcc 44014243  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014242 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16324485 - 16324175
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||  | |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  16324485 ttttgacctttaagttgaaccttgaatgtttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagtttgagattgaacctggaatagttt 16324386  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatg 233  Q
    ||||| | ||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16324385 aagaacgaatttttgagagttagattggaactcgccatggcgagtagaggccctcgccttgcgaactgcccagttacagaatgccttgttaggttaaatg 16324286  T
Q  234 cgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 333  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324285 tgatccttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 16324186  T
Q  334 taatgttgttg 344  Q
    |||||||||||    
T  16324185 taatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 12901682 - 12901338
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||| ||  | ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  12901682 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacaaaacaccttgttaggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatgtg 12901583  T
Q  260 agttgatcttagaggta---aggaa-ctaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttata 355  Q
    |||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12901582 agttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttata 12901483  T
Q  356 taattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctat 454  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||    
T  12901482 tagttgtatatacattacatga-attatgtatgatg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctat 12901385  T
Q  455 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12901384 gttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 371
Target Start/End: Original strand, 9389346 - 9389675
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||  | |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9389346 ttaagttgaaccttggatgtttttgagtgtctggacttgtataatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaa 9389445  T
Q  143 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatactt 241  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||  ||    
T  9389446 tttatgtgagttacagctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaagcagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatcttt 9389545  T
Q  242 gtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttg 341  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |    |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  9389546 gtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatcgaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatattg 9389645  T
Q  342 ttgttaatgttatataattgtatatacatt 371  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9389646 atgataatgttatataattgtatatacatt 9389675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 159 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34201138 - 34200802
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||       |||||| ||| | || |||||||||||||||| | ||||   |||||||||||    
T  34201138 ctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacataatgcctttttaggttaaatgcgatccctgtcattcgagttgatgt 34201039  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||  ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||    
T  34201038 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 34200939  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34200938 ttgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttg 34200844  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200843 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 507
Target Start/End: Original strand, 28504955 - 28505410
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | |||||| |  |    
T  28504955 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agacttagaatgaaaat 28505053  T
Q  146 ttgg-gagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    || | || |   ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  |||||    
T  28505054 ttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtc 28505152  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 344  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||   |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |     
T  28505153 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 28505252  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||   ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  28505253 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggttt-gca 28505347  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28505348 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 28505410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 500
Target Start/End: Original strand, 15754718 - 15754992
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||    
T  15754718 ttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactg 15754817  T
Q  322 aattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 420  Q
    |    ||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||    
T  15754818 atgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgata 15754913  T
Q  421 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15754914 ttattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 500
Target Start/End: Original strand, 11995796 - 11996132
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  11995796 ctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctttttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgt 11995895  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||  |||  ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||    
T  11995896 gagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataa 11995995  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11995996 ttgtatatacattacatgacttaa-gtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttg 11996090  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11996091 ttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 12255409 - 12255614
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   ||||  |||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||||    
T  12255409 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgatccttaagttggtatttagatgattttgagtgcttgaacatgtataataatgattaggaaagattct 12255505  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  12255506 agattgagattgaacctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccag 12255605  T
Q  207 ttacagaat 215  Q
    |||||||||    
T  12255606 ttacagaat 12255614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Original strand, 20220005 - 20220290
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 308  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  20220005 acagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 20220104  T
Q  309 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 408  Q
    | |||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||   ||||||     
T  20220105 tccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgaga---tgttgat 20220200  T
Q  409 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220201 ttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 2279756 - 2279941
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||    ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  2279756 gtagttttgatccttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaac-atgcataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgtaat 2279854  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  2279855 agtttaagaatggatttttgggtgttacacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaat 2279941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15113296 - 15113028
Alignment:
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 260  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||      |  |||| || | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  15113296 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacaggatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 15113197  T
Q  261 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |  | |||||  |  |||||| ||||||||    
T  15113196 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataatt 15113097  T
Q  361 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| | |||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15113096 gtatatatattacttgag-ttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15116835 - 15116565
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||      |  ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15116835 ctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 15116736  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||  | ||| |  | ||||| ||  |||||| ||||||    
T  15116735 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgatataa 15116636  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||| | |||   ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  15116635 ttgtatatatattacttgag-ttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564476
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3564461  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  3564462 ctaagttgatgaaga 3564476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 346 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495421
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 16495473  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273398
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaaga 48273398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 501
Target Start/End: Original strand, 2280117 - 2280225
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 2280215  T
Q  492 tctaagttga 501  Q
    ||||||||||    
T  2280216 tctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13647447 - 13647344
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 13647349  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  13647348 ctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275177
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24275192  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  24275191 ctaagttgattaaga 24275177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 18456415 - 18456524
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456415 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18456512  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  18456513 agttgattaaga 18456524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38227599 - 38227490
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227599 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 38227502  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||| ||| ||||    
T  38227501 agtagatgaaga 38227490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 456439 - 456327
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  456439 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 456342  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  456341 ctaagttgattaaga 456327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 11393331 - 11393443
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393331 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11393428  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  11393429 ctaagttgattaaga 11393443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11972614 - 11972502
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972614 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11972517  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  11972516 ctaagttgattaaga 11972502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 14949166 - 14949278
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949166 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14949263  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  14949264 ctaagttgattaaga 14949278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 15376757 - 15376869
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376757 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15376854  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  15376855 ctaagttgattaaga 15376869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16232638 - 16232526
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232638 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16232541  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16232540 ctaagttgattaaga 16232526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16410177 - 16410065
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410177 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16410080  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16410079 ctaagttgattaaga 16410065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18640390 - 18640278
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640390 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18640293  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  18640292 ctaagttgattaaga 18640278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 20385167 - 20385279
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385167 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20385264  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  20385265 ctaagttgattaaga 20385279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 21189639 - 21189751
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189639 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21189736  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  21189737 ctaagttgattaaga 21189751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32125609 - 32125497
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 32125512  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  32125511 ctaagttgattaaga 32125497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 41523035 - 41522923
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 41522938  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  41522937 ctaagttgattaaga 41522923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 41525497 - 41525385
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 41525400  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  41525399 ctaagttgattaaga 41525385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 501
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868101
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 433  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgag 1868034  T
Q  434 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868035 ctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 494
Target Start/End: Original strand, 12255733 - 12255892
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || || | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  12255733 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaatt-atatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatga 12255831  T
Q  435 -tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 494  Q
     | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255832 attgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12698951 - 12698840
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 494  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698951 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12698853  T
Q  495 aagttgattaaga 507  Q
    |||||||| ||||    
T  12698852 aagttgatgaaga 12698840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14044928 - 14044761
Alignment:
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||     
T  14044928 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcag 14044831  T
Q  433 g--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |  ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044830 gagctg-ttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14354958 - 14354791
Alignment:
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||     
T  14354958 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcag 14354861  T
Q  433 g--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |  ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354860 gagctg-ttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 53 - 201
Target Start/End: Original strand, 21064822 - 21064971
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  21064822 accttagatgtttatgagggcctgaac-atgtacaataatgattaggaaatattttagaatgagattgaacttggaatagtgtcagaatggatttttgag 21064920  T
Q  151 agttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagtta 201  Q
     |||  |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21064921 tgttttaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagtta 21064971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18430830 - 18430718
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430830 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18430733  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  18430732 ctaagttgattaaga 18430718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24702356 - 24702244
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702356 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24702259  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  24702258 ctaagttgattaaga 24702244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27216978 - 27216866
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27216978 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 27216881  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  27216880 ctaagttgattaaga 27216866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44116627 - 44116515
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  44116627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggt 44116530  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  44116529 ctaagttgattaaga 44116515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 16386249 - 16386353
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386249 agatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16386348  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  16386349 agttg 16386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26212115 - 26212012
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26212115 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtcta 26212017  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  26212016 agttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 9509308 - 9509198
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509308 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 9509210  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  9509209 agttgatgaaga 9509198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 211
Target Start/End: Original strand, 12756378 - 12756535
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||| |    
T  12756378 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggatta-tttaagaatgaactttttggaa 12756476  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 211  Q
    | |  |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  12756477 gctg-acctgaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca 12756535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213690
Alignment:
Q  400 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 499  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16213698  T
Q  500 gattaaga 507  Q
    ||||||||    
T  16213697 gattaaga 16213690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 353 - 507
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062071
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgcta-ttttgtatactgct 17062016  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062017 ga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17062071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 3386451 - 3386339
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386451 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 3386354  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  3386353 ctaagttgattaaga 3386339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 501
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  493 ctaagttga 501  Q
    |||||||||    
T  15144135 ctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869352
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13869356  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  13869355 aaga 13869352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 15143691 - 15143844
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||    
T  15143691 agttgtaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattttagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaactt 15143790  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    ||| || |   ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15143791 ttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 15143844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10589055
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  10589059 agttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 336 - 493
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 433  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaa 15008538  T
Q  434 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008539 ctg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486847
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 19486784  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19486785 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 38898420 - 38898533
Alignment:
Q  393 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38898420 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38898517  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    | ||||||||||||||    
T  38898518 tttaagttgattaaga 38898533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13831491 - 13831379
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831491 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13831394  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||| ||||||||||    
T  13831393 ctaaattgattaaga 13831379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44116933 - 44116804
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 183  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||| || || |||||| |  ||||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44116933 taataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacccggaa-agatttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatggcgagcagagg 44116835  T
Q  184 ccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    |  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  44116834 ctctcgcctcgcgagtgactcagttacagaa 44116804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24704803 - 24704694
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || |   |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704803 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt---tttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24704709  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  24704708 ctaagttgattaaga 24704694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 17061621 - 17061783
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatag-tttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |  |||| ||    
T  17061621 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg-atagattttagaataaaactttgaga 17061719  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
     |   |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17061720 atctgacctgaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 17061783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443410
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 498
Target Start/End: Original strand, 10063816 - 10063921
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||| ||||   || |||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  10063816 tttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 10063914  T
Q  492 tctaagt 498  Q
    |||||||    
T  10063915 tctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38227940 - 38227788
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||  | |||| |||    
T  38227940 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaactttttgga 38227842  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  38227841 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 38227788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 2529615 - 2529733
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||  |     
T  2529615 gtagttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgacaa 2529713  T
Q  129 agtttaagaatggatttttg 148  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  2529714 agtttaaaaatggatttttg 2529733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110562
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20110562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847932
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 27847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14045281 - 14045187
Alignment:
Q  57 tagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  14045281 tagatgtttttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 14045187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14355311 - 14355217
Alignment:
Q  57 tagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  14355311 tagatgtttttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 14355217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9509649 - 9509495
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||  | || |||||    
T  9509649 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 9509550  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  9509549 ttctgacctgaactcgccacggcgaggagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 9509495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 16385912 - 16385994
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  16385912 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 16385994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40443844 - 40443762
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  40443844 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaat 40443762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14036384 - 14036282
Alignment:
Q  387 tgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 483  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14036384 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 14036287  T
Q  484 tgagt 488  Q
    |||||    
T  14036286 tgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14346414 - 14346312
Alignment:
Q  387 tgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 483  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14346414 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgca 14346317  T
Q  484 tgagt 488  Q
    |||||    
T  14346316 tgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Original strand, 15754541 - 15754622
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15754541 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 15754622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12901852 - 12901768
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  12901852 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 12901768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14036731 - 14036637
Alignment:
Q  57 tagaggtttttgagtgcctgaactatgtaa--taatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  14036731 tagatgtttttgagtgcctgaa-tatgtaaaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctaggaaagtttaaaaatggatttttggg 14036637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14346761 - 14346667
Alignment:
Q  57 tagaggtttttgagtgcctgaactatgtaa--taatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  14346761 tagatgtttttgagtgcctgaa-tatgtaaaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctaggaaagtttaaaaatggatttttggg 14346667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154953
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 18154953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 1867650 - 1867743
Alignment:
Q  57 tagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgg 149  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  1867650 tagatgttttttagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttgg 1867743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 27847498 - 27847580
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27847498 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacctggaat 27847580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 490  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 127
Target Start/End: Original strand, 3564026 - 3564099
Alignment:
Q  55 cttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  3564026 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 3564099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26212351 - 26212302
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26212351 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 26212302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 12756715 - 12756817
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  12756715 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaactgctcgagtcggt 12756812  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  12756813 ctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932846
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaaga 14932846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356281
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaaga 15356281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360395
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaaga 15360395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35366631 - 35366540
Alignment:
Q  106 tagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| | |||  |||  |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  35366631 tagaatgagattgaacttggaatagtgtcagaatggattcttgagtgttttaccctaactcgccgtggcgagt-gaggctctcgcctcgcgag 35366540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 198
Target Start/End: Original strand, 9177431 - 9177470
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9177431 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgag 9177470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12699292 - 12699218
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  12699292 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaa 12699218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 15008263 - 15008313
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagtt 208  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15008263 cctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagtt 15008313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 15008118 - 15008199
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattttt 147  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  15008118 tgagtgcctgaacatgtataataatgattagacaattttttagattgagattgaacctgggaaagttttaaaatggattttt 15008199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40443744 - 40443695
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  40443744 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 40443695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 495
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 102
Target Start/End: Original strand, 11995712 - 11995768
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaaga 102  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  11995712 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaga 11995768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 147
Target Start/End: Original strand, 17017040 - 17017146
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaat 139  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||  |  | ||||||| |||    
T  17017040 ccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacaagagaaagtttaaaaat 17017138  T
Q  140 ggattttt 147  Q
    ||||||||    
T  17017139 ggattttt 17017146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 449
Target Start/End: Original strand, 26356027 - 26356083
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 449  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26356027 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 26356106 - 26356150
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26356106 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaaga 26356150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 449
Target Start/End: Original strand, 26358479 - 26358535
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 449  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26358479 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 26358558 - 26358602
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26358558 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaaga 26358602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33039 - 32551
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   ||||  |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  33039 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttggtccttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattct 32943  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32942 agattgagattgaacttggaatagtctaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccag 32843  T
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 306  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  32842 ttacagaatgccttgttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttatt 32743  T
Q  307 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32742 gtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttg 32644  T
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    | || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32643 a-ttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Original strand, 51904 - 51985
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51904 ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 51545 - 51619
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  51545 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa 51619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 31 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11011 - 10542
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11011 gtagttttgatccttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctggaata 10912  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtta 229  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||    
T  10911 gtttaagaatgaatttttgtgagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacctagttccaaaatgccttgttaggtta 10812  T
Q  230 aatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat 329  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10811 aatgcgatctctgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatat 10712  T
Q  330 aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10711 aatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatga-attatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 10613  T
Q  430 catgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10612 catgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 104)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23019910 - 23019425
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |    
T  23019910 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgacccttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtgtgataatgattaggaaagatttt 23019814  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||     
T  23019813 agattgagattgaacctggaatattttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagttgtccaa 23019714  T
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 306  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23019713 ttacaaaatgcttggttaggttaaatgcgatctttgtcgaacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgtt 23019614  T
Q  307 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23019613 gtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttg 23019515  T
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019514 acttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19652647 - 19652209
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    || |||||| ||||||| || ||  ||||    
T  19652647 gtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacct 19652548  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19652547 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgggctaactagttacaaaataccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 19652448  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  19652447 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 19652348  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||     
T  19652347 tgtatatactttaaatg-gattatg-ttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgt 19652252  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652251 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 158 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19668728 - 19668386
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  19668728 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgtccaattacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatg 19668629  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  19668628 tgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatata 19668529  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
     |||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||    
T  19668528 gttgtatatacattacatga-attacgtatgatg-ttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgcatactatctatg 19668432  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668431 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 499
Target Start/End: Original strand, 29808544 - 29808986
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat-agtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |  |||||||    
T  29808544 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttggga 29808643  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  29808644 atctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacga 29808742  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||    
T  29808743 gttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatg 29808842  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  29808843 ttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgc 29808937  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 499  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808938 ctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Original strand, 27332926 - 27333238
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||    
T  27332926 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattt 27333025  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatg 233  Q
     |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27333026 tagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttgttaggttaaatg 27333125  T
Q  234 cgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 333  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333126 tgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatc 27333225  T
Q  334 taatgttgttgtt 346  Q
     ||||||||||||    
T  27333226 caatgttgttgtt 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 346
Target Start/End: Original strand, 27393666 - 27393978
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| | | |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||    
T  27393666 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagtggctgaacatgtataatgatgattaggaaagattttagaatgaggttgaacctggaaagattt 27393765  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatg 233  Q
     |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27393766 tagaatgaagttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttgttaggttaaatg 27393865  T
Q  234 cgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 333  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393866 tgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatc 27393965  T
Q  334 taatgttgttgtt 346  Q
     ||||||||||||    
T  27393966 caatgttgttgtt 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 499
Target Start/End: Original strand, 28496134 - 28496575
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggat-ttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |  ||||| ||    
T  28496134 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agacttagaatgaaacttttgaga 28496232  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  28496233 atctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacga 28496331  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||    
T  28496332 gttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatg 28496431  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  28496432 ttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgc 28496526  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 499  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496527 ctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 507
Target Start/End: Original strand, 22080391 - 22080837
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  22080391 agttgaaccttagatgtttttgagtgactgaacatgtctaataatgattagaaaagattagagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaactt 22080490  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |      | ||||||  | ||||| |||   |||||||| ||||||    
T  22080491 atgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtctgacagaacaccttgtttaggaataatgcgatccttgtc 22080590  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgtt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||    
T  22080591 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgtt 22080690  T
Q  344 gttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgact-tacatttgatattgttatatcatgctggttttg 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||   ||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22080691 gttaatgttatataaatgtatatacattatatta-attatg-acgatgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgat-gttttg 22080785  T
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22080786 catactgcctatg-------------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 22080837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 240 - 501
Target Start/End: Original strand, 9098372 - 9098620
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||           
T  9098372 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaattatatgat------- 9098464  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggt 438  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9098465 -----ttaatgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgt 9098557  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098558 tttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Original strand, 4185484 - 4185928
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat-agtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| | | |||||| |||||  ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||    
T  4185484 ccttagatgcttttgagtgcatgaacaagtctaataacgattatgaaagaatgtagagtgagattgaacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtga 4185582  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4185583 actgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttatagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgccgcacgag 4185682  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  |  | || ||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  4185683 ttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgt 4185781  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    || | || |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  4185782 taaacaaatgtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcc 4185877  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185878 tatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1561593 - 1561319
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||    
T  1561593 ttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactg 1561494  T
Q  322 aattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 420  Q
    |    ||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||    
T  1561493 atgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgata 1561398  T
Q  421 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1561397 ttattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 240 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20109415 - 20109153
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||  |||||| ||||  | ||| |  | ||||    
T  20109415 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgt 20109316  T
Q  340 tgttgttaatgttatataat--tgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg 436  Q
    ||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  20109315 tgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg 20109217  T
Q  437 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109216 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 461
Target Start/End: Original strand, 4667874 - 4668277
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat-agtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||    
T  4667874 ccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtga 4667972  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4667973 actgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgtcgcacgag 4668072  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  |  | |||||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  4668073 ttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgt 4668171  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    || | || |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  4668172 taaacaaatgtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcc 4668267  T
Q  452 tatgttgctg 461  Q
    ||||||||||    
T  4668268 tatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 461
Target Start/End: Original strand, 4674721 - 4675124
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat-agtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||    
T  4674721 ccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtga 4674819  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
      |  |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4674820 actgaaccttaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgtcgcacgag 4674919  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  |  | |||||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  4674920 ttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgt 4675018  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    || | || |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  4675019 taaacaaatgtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcc 4675114  T
Q  452 tatgttgctg 461  Q
    ||||||||||    
T  4675115 tatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 336 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25644500 - 25644335
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644500 atgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgc 25644402  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644401 tgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25644801 - 25644571
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgtaataa---tgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagt 131  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||   ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  25644801 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgttc-atgta-taacgttgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaatagt 25644704  T
Q  132 ttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaa 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||  |||||||       
T  25644703 ttaagaatggatttttgggagttacacccgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatgcttgtttaggtt-tt 25644605  T
Q  232 tgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttga 265  Q
    ||||||  ||||||||||||||| || |||||||    
T  25644604 tgcgatctttgtcgcacgagttgctgagagttga 25644571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 25956272 - 25956424
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| | | |||| | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25956272 ttaagttgaatcttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaattacgattggaaaagattctagattgagatttaacctggaatagtttaagaatgga 25956371  T
Q  143 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgc 195  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25956372 ttttttggagttacacctgtattcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgc 25956424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23077027 - 23076749
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    |||||||| |||||| ||   |||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  23077027 ttgttaggataaatgtgacctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 23076928  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| || ||||||||| |  || ||||    
T  23076927 ctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttga 23076829  T
Q  419 tattgttatatcatgct-ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076828 tattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 35008445 - 35008167
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    |||||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  35008445 ttgttaggataaatgtgacctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagc 35008346  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| || |||| |||| |  || ||||    
T  35008345 ctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatga-attatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttga 35008247  T
Q  419 tattgttatatcatgct-ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008246 tattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4189416 - 4189203
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat-agtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||    
T  4189416 ccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtga 4189318  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
      |  |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4189317 actgaacctaaactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatcgttgtcgcacgag 4189218  T
Q  252 ttgatgtgagttgat 266  Q
    ||| |||||||||||    
T  4189217 ttgttgtgagttgat 4189203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 417 - 507
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333330
Alignment:
Q  417 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 27333330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 417 - 507
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394070
Alignment:
Q  417 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 27394070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060549
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 29060564  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    ||||| |||| ||||    
T  29060563 ctaagctgatgaaga 29060549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 30676754 - 30676866
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676754 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 30676851  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  30676852 ctaagttgattaaga 30676866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 502
Target Start/End: Original strand, 31155163 - 31155504
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgat 256  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||  |||||  || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  31155163 acctgtactctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctacccctttacaacatgccttgttaggttaaatgcggtccttgtcgcacgagttgtt 31155262  T
Q  257 gtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 356  Q
    ||||| |||| ||||| || | |||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| || || |||| | |||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  31155263 gtgagatgattttagatgttaagaactaagttgcctagcttgctgttgatgttccagtgagtctaaattttttaatccgatgatgttgttgatgttatat 31155362  T
Q  357 aattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
    || |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||| | | |  ||||||||||  || ||    
T  31155363 aaatgtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat-gacttgcatactgttta-gt 31155457  T
Q  457 tgctg-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||    
T  31155458 tgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgat 31155504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 353 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782233
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaatt-atgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 22782288  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782287 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 22782233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 16496363 - 16496260
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496363 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16496265  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  16496264 agttg 16496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 17287798 - 17287908
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287798 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17287896  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  17287897 agttgattaaga 17287908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 507
Target Start/End: Original strand, 18409821 - 18409939
Alignment:
Q  388 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 487  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactgagctgcatgag 18409919  T
Q  488 tcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  18409920 tcggtctaagttgatgaaga 18409939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12742435 - 12742323
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742435 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12742338  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  12742337 ctaagttgattaaga 12742323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 18334636 - 18334748
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334636 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18334733  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  18334734 ctaagttgattaaga 18334748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19005164 - 19005052
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005164 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19005067  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  19005066 ctaagttgattaaga 19005052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 19858963 - 19859075
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858963 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19859060  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  19859061 ctaagttgattaaga 19859075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24422665 - 24422553
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422665 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24422568  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  24422567 ctaagttgattaaga 24422553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629467
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctg-ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggt 25629452  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  25629453 ctaagttgatgaaga 25629467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25656747 - 25656635
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656747 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 25656650  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  25656649 ctaagttgattaaga 25656635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 33861912 - 33861800
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861912 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 33861815  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  33861814 ctaagttgattaaga 33861800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 33864396 - 33864284
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 33864299  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  33864298 ctaagttgattaaga 33864284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 2291224 - 2291336
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291224 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 2291321  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  2291322 ctaagttgattaaga 2291336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8055147 - 8055035
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055147 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8055050  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  8055049 ctaagttgattaaga 8055035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593782
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggt 20593797  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  20593796 ctaagttgatgaaga 20593782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688508
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  25688522 ctaagttgattaaga 25688508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25754927 - 25754815
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754927 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 25754830  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  25754829 ctaagttgattaaga 25754815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 26924684 - 26924796
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924684 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26924781  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  26924782 ctaagttgattaaga 26924796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 34963491 - 34963379
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34963491 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 34963394  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  34963393 ctaagttgattaaga 34963379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 402 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076709
Alignment:
Q  402 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20076715  T
Q  502 ttaaga 507  Q
    | ||||    
T  20076714 tgaaga 20076709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 1540955 - 1541067
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1540955 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 1541052  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  1541053 ctaagttgattaaga 1541067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1595667 - 1595555
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1595667 ttgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 1595570  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  1595569 ctaagttgattaaga 1595555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18457174 - 18457014
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||| |    
T  18457174 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaa 18457076  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    | |  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18457075 gctg-acctgaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 18457014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303652
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19303637  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19303638 ctaagatgatgaaga 19303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 502
Target Start/End: Original strand, 20360962 - 20361067
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20360962 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 20361060  T
Q  496 agttgat 502  Q
    |||||||    
T  20361061 agttgat 20361067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 20556936 - 20557048
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20556936 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 20557033  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  20557034 ctaagttgattaaga 20557048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 16448582 - 16448683
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16448582 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatt 16448679  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  16448680 aaga 16448683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 336 - 500
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227616
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 8227551  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227552 tg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 8227616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18456837 - 18456735
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456837 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18456740  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  18456739 ctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461895
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18461900  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  18461899 ctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 507
Target Start/End: Original strand, 20638304 - 20638395
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 20638395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 22780229 - 22780339
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22780229 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 22780327  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  22780328 agttgatgaaga 22780339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 3852061 - 3852173
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3852061 ttgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggt 3852158  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  3852159 ctaagttgattaaga 3852173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Original strand, 9098087 - 9098206
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaact-atgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||| | || |||||||||||||  || |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| | |    
T  9098087 gtagttttgacccttaagtcgaactttagatgattctgagtgcctgaacagatataataatgattagacaagtttctagattgatattgaacctgggaaa 9098186  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgg 149  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  9098187 gtttaaaaatggatttttgg 9098206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 18199262 - 18199519
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  |  || || | ||||    
T  18199262 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgt 18199361  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga-tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctgg 437  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||| | |||||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |    
T  18199362 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtga-attatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttg 18199460  T
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||   | || ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18199461 ttttatgtgcttcctatgttgctgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831524
Alignment:
Q  448 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 493
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920728
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714426
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 25714426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 35245658 - 35245605
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 18177518 - 18177775
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  |  || || | ||||    
T  18177518 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgt 18177617  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga-tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctgg 437  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||| | |||||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |    
T  18177618 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtga-attatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttg 18177716  T
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||   | || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18177717 ttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18177775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 18204353 - 18204096
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  |  || || | ||||    
T  18204353 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatgt 18204254  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga-tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctgg 437  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||| | |||||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |    
T  18204253 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtga-attatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttg 18204155  T
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||   | || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18204154 ttttatgtgcttcctatgttgttgtttatta-ttgattaagctgcatgagtcggtctaag 18204096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 412 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186381
Alignment:
Q  412 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 453 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185524
Alignment:
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Original strand, 20360632 - 20360707
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20360632 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20360707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29061000 - 29060847
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| || || | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| | |||||| |    
T  29061000 ccttagatgcttttgagtgcctgaac-atgtccaataatgattaggaaggaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaa 29060902  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  29060901 atctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 29060847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 19303202 - 19303355
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| || || ||||||  | |||||| |    
T  19303202 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct-gaaaagatttagaatgaaacttttggaa 19303300  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  19303301 atctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgagagtgacccag 19303355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 20637948 - 20638030
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20637948 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20638030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 372
Target Start/End: Original strand, 28103799 - 28103877
Alignment:
Q  294 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacatta 372  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28103799 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1561770 - 1561689
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  1561770 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaagtagaatgagattgaacctggaa 1561689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848107
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 19848107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20109698 - 20109578
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||| | || ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||| | | |    
T  20109698 gtagttttgatccttaagttgaactttagatgattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctaggaaa 20109599  T
Q  130 gtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  20109598 gtttaaaaatggattattggg 20109578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 18696667 - 18696570
Alignment:
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18696667 taatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 18696570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 18706483 - 18706356
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||      
T  18706483 atgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaa 18706386  T
Q  434 ctggttttgcatactgcctatgttgctgttt 464  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706385 ct-gttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Original strand, 25629050 - 25629169
Alignment:
Q  87 taatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcca 186  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||  | ||||| || |   ||||| ||||||| ||||||| ||||||      
T  25629050 taatgattaggaaatattgtagaatgagattgaacctggaaatattttagaataaacttttgtgattatgacctgtactcgccgtggcgagcagaggctc 25629149  T
Q  187 tcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  25629150 tcgcctcgcgagtgacccag 25629169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 18821484 - 18821566
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  18821484 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaat 18821566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 22779888 - 22779962
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22779888 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22779962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 16920298 - 16920380
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||    
T  16920298 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa-tatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggataagattgtacctggaat 16920380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992436
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 23992436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22949466 - 22949384
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22949466 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22949384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22953422 - 22953340
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22953422 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22953340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23871910 - 23871828
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23871910 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23871828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23875866 - 23875784
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23875866 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23875784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 27325388 - 27325470
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| | || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  27325388 taatgttatataattatatatatattgcattaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 27325470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17106006 - 17105925
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||    
T  17106006 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttg-ttcagtaaccctga 17105925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17106086 - 17106048
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17106086 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgactcgcgag 17106048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 18409488 - 18409562
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18409488 ccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 18409562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11185857 - 11185808
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  11185857 acctgaactcgccacggcgagcagaggccctcgcctcgtgagtgacccag 11185808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 16920399 - 16920448
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  16920399 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgccttgcgagtgacccag 16920448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 193
Target Start/End: Original strand, 18177438 - 18177471
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18177438 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 18177471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18204433 - 18204400
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctc 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18204433 tgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 18204400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Original strand, 18821585 - 18821626
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  18821585 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 18821626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 20360726 - 20360775
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20360726 acctgaactcgccatggcgagctgaggctctcgcctcgcgagtgacccag 20360775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23539242 - 23539165
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaag 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  ||||||||| | || | |||||||||||||||||    
T  23539242 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaataaagttgtttatattacagttgttgtttcagtaag 23539165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16830223 - 16830111
Alignment:
Q  86 ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcc 185  Q
    |||||||||||  ||  || ||||||||||||||||  ||||  |  | |||||||||| ||| | |||  |||| |||||||| ||||||||||||||     
T  16830223 ataatgattaggcaaagttttagaatgagattgaactcggaaatgagtcagaatggattcttgagcgttttaccttaactcgccgtggcgagtagaggct 16830124  T
Q  186 atcgcctcgcgag 198  Q
     ||||||||||||    
T  16830123 ctcgcctcgcgag 16830111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19023878 - 19023814
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttg 148  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  19023878 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatggatttttg 19023814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19668918 - 19668812
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgg 141  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||| |||||| |||||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||   ||||||| ||||     
T  19668918 ttaagtcgaaccttagatgtttctgagtgtctgaac-atgtatcataatgattagacaagtttttatattgagattgaacctggggaagtttaaaaatga 19668820  T
Q  142 atttttgg 149  Q
    ||||||||    
T  19668819 atttttgg 19668812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 93)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Original strand, 21329137 - 21329609
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21329137 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaataattt 21329236  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaat 232  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21329237 aggaatgaatttttgggagttgcacttgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgaattacctagttacagaatgccttgtttaggttaaat 21329336  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 332  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329337 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 21329436  T
Q  333 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  21329437 ctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattat 21329535  T
Q  433 gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329536 gat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21329609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 501
Target Start/End: Original strand, 26011652 - 26012141
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   ||||  |||||||||| || ||||| | || |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  26011652 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgatccttaagttgaactttagatgattatgagtgtctaaacatgtgtaataatgattaagaaagattct 26011748  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||    
T  26011749 aaattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccttcgcctcgcgagttgtctag 26011848  T
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||    
T  26011849 ttacagaatgctttgttaggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgtt 26011948  T
Q  307 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26011949 gtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttg 26012047  T
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012048 attcacatttgatattgttatatcatg-ttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 155 - 507
Target Start/End: Original strand, 21501917 - 21502268
Alignment:
Q  155 acacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttg 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21501917 acacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagtt-cagaatgccttgttgggttaaatgcgatatttgtcgcacgagttg 21502015  T
Q  255 atgtgagttgatcttagaggtaaggaa-ctaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgtt 352  Q
    |||| |||||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21502016 atgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtt 21502115  T
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattta-catactgcct 21502213  T
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502214 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21502268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21566004 - 21565556
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| | ||     
T  21566004 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaattttcgtgaa 21565905  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| || | |||||||||||   ||||| | || |||||||||  ||||||||||||    
T  21565904 ttgtacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctaactagttacagaatgacttgtttatgtaaaatgcgatctttgtcgcacgag 21565805  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||    
T  21565804 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 21565705  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  21565704 tatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttggatactgcc 21565607  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565606 tatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Original strand, 22959194 - 22959639
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga-atagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||| ||    
T  22959194 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaatttttgtga 22959292  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |    
T  22959293 actgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgttgcacaa 22959392  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaat 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |||| ||||||| |   |||    
T  22959393 gttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatc-aatgttggttaaaat 22959491  T
Q  350 gttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  22959492 gttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactg 22959586  T
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959587 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 159 - 497
Target Start/End: Original strand, 20026706 - 20027043
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||      |  ||||||| | ||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| |||||    
T  20026706 ctgaactcgccacagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgttagcttaaatgtgaccgttgtcgcacgagtcgatgt 20026805  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| ||||||     
T  20026806 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatag 20026905  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  20026906 ttgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaact-gttttggatactgcctatgt 20027002  T
Q  457 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20027003 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19669360 - 19668912
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgg-ga 151  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||    || |||||| |||||| | ||    
T  19669360 ccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacgtggaaagactttagaatgaattttttgtga 19669261  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | || || | ||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  19669260 attgtacctgaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctcaccagctaactagttacagaatgccttgtttaggataaatgtgattcttgtcgcacaa 19669161  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatcta-atgttgttgttaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| ||| |  ||||||||  |||    
T  19669160 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataa 19669061  T
Q  349 tgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatact 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||    
T  19669060 tgttatataattgtatatacattacaggactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatact 19668966  T
Q  449 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668965 gtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgat 19668912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 340
Target Start/End: Original strand, 21741181 - 21741492
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21741181 gtagttttgacctttaagtcgaaccttagatatttttgagtgcctgaact-tgtatgatgatgaataggaaagattatagattgagattgaacctggaat 21741279  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggt 227  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||  ||||||    
T  21741280 agtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagctaaccagttacataatgtcttgtttaggt 21741379  T
Q  228 taaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt 327  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||  |||| ||||||  || ||||||||||| |||||    
T  21741380 taaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgt 21741479  T
Q  328 ataatctaatgtt 340  Q
    ||| |||||||||    
T  21741480 atattctaatgtt 21741492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144299
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   ||||  |||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  22144553 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgatccttaagttggtatttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaacaatgattaggaaagattct 22144457  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  22144456 agattgagattgaacctggaataatttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccag 22144357  T
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttga 265  Q
    ||||||||| |||  ||||| |   ||||||  ||||||||||||||| || |||||||    
T  22144356 ttacagaatgcttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttgagagttga 22144299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 500
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19660940
Alignment:
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||  | || ||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctttttaggttgaatgcaatctttgtcgttcgagttgatgtga 19660705  T
Q  261 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 360  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  19660706 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 19660805  T
Q  361 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||| ||| |||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660806 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatgg-tttgcatactgcctatgttgct 19660900  T
Q  461 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660901 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 22178066 - 22178323
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||    
T  22178066 ttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgt 22178165  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctgg 437  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  22178166 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagct-g 22178263  T
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Original strand, 5888813 - 5889033
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  5888813 gtagttttgacctttaagtcgaagcttagatgtttttgagtgcctgaact-tgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacatggaat 5888911  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggt 227  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  5888912 agtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgtttaggt 5889011  T
Q  228 taaatgcgatacttgtcgcacg 249  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  5889012 taaatgcgatctttgtcgcacg 5889033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 347 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22144068
Alignment:
Q  347 aatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatg-ttgttttgcat 22144120  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144119 actacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 21729066 - 21729169
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729066 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21729164  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  21729165 agttg 21729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 21808391 - 21808494
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808391 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21808489  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  21808490 agttg 21808494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22412306 - 22412193
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22412306 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcgg 22412209  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  22412208 tctaagttgattaaga 22412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529229
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  24529240 agttgatgaaga 24529229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 264812 - 264924
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  264812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 264909  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  264910 ctaagttgattaaga 264924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077961
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  9077975 ctaagttgatgaaga 9077961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 10732984 - 10733096
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10733081  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  10733082 ctaagttgattaaga 10733096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20909130 - 20909018
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909130 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 20909033  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  20909032 ctaagttgattaaga 20909018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 39363502 - 39363390
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363502 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 39363405  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  39363404 ctaagttgattaaga 39363390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1096588 - 1096476
Alignment:
Q  394 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096588 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1096490  T
Q  494 taagttgattaaga 507  Q
    ||||||||| ||||    
T  1096489 taagttgatgaaga 1096476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 407 - 507
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997646
Alignment:
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 506  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24493687 - 24493578
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24493687 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtcta 24493590  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  24493589 agttgatgaaga 24493578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25421651 - 25421541
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421651 agatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25421553  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  25421552 agttgatgaaga 25421541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29330052 - 29329940
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330052 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29329955  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29329954 ctaagttgattaaga 29329940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 42245409 - 42245521
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42245409 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 42245506  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  42245507 ctaagttgattaaga 42245521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 36154827 - 36154936
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154827 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 36154921  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  36154922 ctaagttgattaaga 36154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 8286844 - 8286955
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 494  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286844 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8286942  T
Q  495 aagttgattaaga 507  Q
    |||||||| ||||    
T  8286943 aagttgatgaaga 8286955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 501
Target Start/End: Original strand, 20902053 - 20902159
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902053 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20902150  T
Q  493 ctaagttga 501  Q
    |||||||||    
T  20902151 ctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 25431513 - 25431414
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25431513 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 25431415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 417 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314596
Alignment:
Q  417 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13025429 - 13025320
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13025429 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 13025332  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  13025331 agttgatgaaga 13025320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13095613 - 13095504
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13095613 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtcta 13095516  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  13095515 agttgatgaaga 13095504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 23390498 - 23390608
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390498 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23390596  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  23390597 agttgatgaaga 23390608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 39245243 - 39245142
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245243 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 39245146  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  39245145 aaga 39245142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 2154658 - 2154770
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154658 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 2154755  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  2154756 ctaagttgattaaga 2154770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 11581243 - 11581355
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581243 ttgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 11581340  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  11581341 ctaagttgattaaga 11581355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29346098 - 29345986
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346098 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggt 29346001  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29346000 ctaagttgattaaga 29345986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 21871225 - 21871444
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaag-aatggatt 144  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | || |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||| |    
T  21871225 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa-agattatggaatggact 21871323  T
Q  145 tttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    |||| || |   ||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  21871324 tttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttgctaggttaaacgcgatccttgtc 21871423  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttga 265  Q
    ||| |||||| | ||||||||    
T  21871424 gcatgagttgttatgagttga 21871444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 21875505 - 21875724
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaag-aatggatt 144  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | || |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||| | |||||| |    
T  21875505 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttattaatgattaggaaagagtgtaggatgagattgaacctggaa-agattatggaatggact 21875603  T
Q  145 tttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    |||| || |   ||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  21875604 tttgtgattctgacctgtactcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttgctaggttaaacgcgatccttgtc 21875703  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttga 265  Q
    ||| |||||| | ||||||||    
T  21875704 gcatgagttgttatgagttga 21875724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 22075138 - 22075035
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22075138 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtcta 22075040  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  22075039 agttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 10775731 - 10775832
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775731 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 10775828  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  10775829 aaga 10775832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 18319089 - 18319190
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18319089 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatt 18319186  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  18319187 aaga 18319190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 21498659 - 21498785
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  21498659 ttttgacctttaagttgaaccttggatgtttttgagtgcctgaacatgtataataattattaggagagattgtagattgagattgaacctggaatagttg 21498758  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  21498759 aagaataaatttttgagagttacacct 21498785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29348571 - 29348459
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348571 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggt 29348474  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29348473 ctaagttgattaaga 29348459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29351044 - 29350932
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29351044 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggt 29350947  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29350946 ctaagttgattaaga 29350932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 11580906 - 11581068
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatag-tttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |  |||| ||    
T  11580906 ccttagaagcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgga-tagattttagaataaaactttgaga 11581004  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11581005 atctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacagaat 11581068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31061074
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 31061078  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  31061077 aaga 31061074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619440
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 38619444  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  38619443 aaga 38619440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32027511 - 32027399
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  32027511 ttgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggt 32027414  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  32027413 ctaagttgattaaga 32027399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1096934 - 1096765
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||   ||  |||||| | ||    
T  1096934 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaaagattgcagaatgaactt 1096835  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||| | |   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1096834 ttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaat 1096765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064517
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 23064521  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  23064520 aaga 23064517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448055
Alignment:
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
    |||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaatt-acgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagct-gttttatatactgcctatgt 29448062  T
Q  457 tgctgtt 463  Q
    |||||||    
T  29448061 tgctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725871
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 40725934  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725933 tgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 507
Target Start/End: Original strand, 20918028 - 20918104
Alignment:
Q  429 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918028 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20918104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 21985808 - 21985961
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||  | |||||| |    
T  21985808 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaacttttggaa 21985906  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21985907 ttctgacctgaactcgccacggcaagcagaggccctcgcctcgcgagtgacccag 21985961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37724023 - 37723922
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37724023 ttgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagt 37723927  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  37723926 ctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 215
Target Start/End: Original strand, 36154479 - 36154651
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatag-tttaagaatgg 141  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||      
T  36154479 ttaagttgatccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagagtgagattgaacctgga-tagattttagaataa 36154577  T
Q  142 atttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |  |||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  36154578 aactttgagaatctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 36154651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 204
Target Start/End: Original strand, 23390157 - 23390309
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttt-tggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| |  || |||||    
T  23390157 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 23390256  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccc 204  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23390257 ttctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccc 23390309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 497
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293071
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067113
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgatt 24067117  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  24067116 aaga 24067113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 20026501 - 20026619
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | ||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| ||| | |    
T  20026501 gtagttttgacccttaagtcgatctttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacatgggaaa 20026600  T
Q  130 gtttaagaatggatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  20026601 gtttaaaaatggatttttg 20026619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  416 tgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 506  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgtt-gttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806898
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaaga 20806898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 22177792 - 22177901
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaat 139  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||| |||||||||  | ||||||| |||    
T  22177792 ccttaagttgaaccctagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagtttgaacctgagaaagtttaaaaat 22177890  T
Q  140 ggatttttggg 150  Q
    |||||||||||    
T  22177891 ggatttttggg 22177901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 21292635 - 21292717
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  21292635 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 21292717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24529681 - 24529527
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||  | |||||| |    
T  24529681 ccttagatgcttttcagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaaggttgtagaatgaaacttttggaa 24529582  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   | |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  24529581 ttctgatctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 24529527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 500
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 309
Target Start/End: Original strand, 27988776 - 27988845
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagg-taaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  27988776 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcat-gaggttaaggaactaagttgtttatatatctgttgttgtt 27988845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Original strand, 19660491 - 19660572
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||    
T  19660491 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtggaatgagattaaacctggaa 19660572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 449
Target Start/End: Original strand, 20766118 - 20766174
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20766118 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 407
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741545
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25744074 - 25743945
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      ||| ||||| | | |||||||| |  ||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  25744074 tgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgagtgacagactgccttgttagggtttatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 25743975  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttg 289  Q
    |||||||| | | |||||  ||||||||||    
T  25743974 agttgatcatgggggtaataaactaagttg 25743945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 9078402 - 9078338
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  9078402 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtagaatgagattgaacctggaa 9078338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517313
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 17517313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704080
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 26704080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973813
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 26973813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10753685 - 10753603
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  10753685 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 10753603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 21871525 - 21871607
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21871525 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21871607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 21875805 - 21875887
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21875805 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 22120149 - 22120231
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22120149 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttatat 22120231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36314716 - 36314685
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314716 taatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796438
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9078308 - 9078259
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  9078308 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 9078259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 21292736 - 21292785
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  21292736 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 21292785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22075374 - 22075325
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  22075374 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 22075325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Original strand, 22119847 - 22119928
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22119847 agttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22119928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 396 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18356432 - 18356367
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 463  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  18356432 agatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--tttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Original strand, 20469654 - 20469702
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  20469654 ctgaactcgccatagcgagtagagtggatcgcctcgcgagttactcagt 20469702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 429 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 21873336 - 21873277
Alignment:
Q  429 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 489  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873336 tcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8519 - 8094
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  8519 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgacccttaagttgaaccttaaatgtttttgggtgtctgaatatgtgtaataatgattagaaaagattct 8423  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||    
T  8422 agattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagttgtccag 8323  T
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 306  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8322 ttacataatgctttgttaggtataatgtgatctttgtctcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgtt 8223  T
Q  307 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8222 gtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttg 8124  T
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctg 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8123 acttgcatttgatattgttatatcatgctg 8094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7271 - 6826
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| ||     
T  7271 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttgtgaa 7172  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  7171 ctgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaag 7072  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||||  ||||||    
T  7071 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgt 6972  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   |||||||| || ||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6971 tatataattgtatatacattacatga-cttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcc 6877  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6876 tatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 102)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 122 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21285989 - 21285606
Alignment:
Q  122 ctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  21285989 ctggaatagtttaagaatgaatttttgggagttacacctgaactcgctatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagttgcccagttacagaatgctttg 21285890  T
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21285889 ttaggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctg 21285790  T
Q  322 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat 421  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21285789 aattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatga-actatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatat 21285691  T
Q  422 tgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285690 tgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Original strand, 38854893 - 38855363
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  38854893 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattaagatttaacctggaatagttt 38854992  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaat 232  Q
    ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||     
T  38854993 aagaacgaatttt-gagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgcccagttacagaatgccttgcttaggttaaac 38855091  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 332  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855092 acgatctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 38855191  T
Q  333 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  38855192 ctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 38855289  T
Q  433 gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855290 gat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 38855363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6520847 - 6520377
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||| |||||||  ||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  6520847 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagattaagactgaacctgaaatagttt 6520748  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatg 233  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6520747 aagaatggatttttgagagttagacctgaattcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaaactgcccaattacagaatgctttgttaggttaaatg 6520648  T
Q  234 cgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 333  Q
    ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520647 cgatctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatc 6520548  T
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6520547 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatg-ttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 6520450  T
Q  434 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520449 at-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 6520377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 62 - 501
Target Start/End: Original strand, 23760509 - 23760950
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||    
T  23760509 gtttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaatattggatattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacct 23760608  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 260  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  23760609 gaacttgccaaggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtga 23760708  T
Q  261 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgttt---gtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat-tgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 356  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    | ||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23760709 gttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 23760808  T
Q  357 aattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  23760809 aattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgat-gatttacatactgcctatgt 23760905  T
Q  457 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760906 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21674157 - 21673718
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| || |||| ||||| |||||    
T  21674157 gtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatatttgtgagttgcacct 21674058  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  21674057 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgacttgttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttaatgtg 21673958  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21673957 agttgatattagaggttaaaaactaagttg-ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 21673859  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  21673858 ttgtatatacattaaat-aaattat-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcataatgcctatgttg 21673762  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
     ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673761 ttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Original strand, 26355367 - 26355805
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||    || |||||| ||||||| || ||  ||||    
T  26355367 gtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggagagattgaagattgagattgaacctggaaagactttagaatgaatttttgtgaattgtacct 26355466  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26355467 gaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgagctaactagttacagaatgccttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 26355566  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||| |||||  |||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  26355567 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 26355666  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||| ||||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||     
T  26355667 tgtatatacattaaatg-gaatatg-ttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgat-gatttgcatactgcctatgttgt 26355762  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355763 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 497
Target Start/End: Original strand, 5865931 - 5866376
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | |||||| |  |    
T  5865931 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agacttagaatgaaaat 5866029  T
Q  146 ttgg-gagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    || | || |   ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  |||||    
T  5866030 ttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtc 5866128  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 344  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |     
T  5866129 gttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 5866228  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  5866229 ataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgca 5866323  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866324 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 240 - 501
Target Start/End: Original strand, 983249 - 983512
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtc---ttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaa 336  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||    
T  983249 ttgtcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaa 983348  T
Q  337 tgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--c 434  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |    
T  983349 tgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaac 983446  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983447 ttg-tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 162 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20498915 - 20498581
Alignment:
Q  162 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 261  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  | |||||||||| | || ||   ||||| ||||||||||||||||    
T  20498915 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgttaggtttattgtgacctttgtcacacgagttgatgtgag 20498816  T
Q  262 ttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattg 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||    
T  20498815 ttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattg 20498716  T
Q  362 tatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20498715 tatatacattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactgcctatgttgct 20498618  T
Q  461 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498617 gtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 17141380 - 17140932
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | |||||| |  |    
T  17141380 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agacttagaatgaaaat 17141282  T
Q  146 ttgg-gagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    || | || | | ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||  | || ||||||| ||||||||  |||||    
T  17141281 ttagagaatcagacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctttttaggttgaatgcgatctttgtc 17141183  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 344  Q
       |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |     
T  17141182 attcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 17141083  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||  |||||    
T  17141082 ataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatgg-attgca 17140988  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140987 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21491462 - 21491011
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||| |    
T  21491462 ttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaa-agacttagaatgaa 21491364  T
Q  143 tttttgg-gagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatactt 241  Q
      ||| | || |   |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||    
T  21491363 aatttagagaatctgacca-aacttgccatggcgagtagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatcttt 21491265  T
Q  242 gtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttg 341  Q
    || |  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||    
T  21491264 gtagttcgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttg 21491165  T
Q  342 ttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt 441  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||| |||    
T  21491164 cttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatgg-ttt 21491070  T
Q  442 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491069 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Original strand, 17266808 - 17267096
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 308  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  17266808 acagaactccttgttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 17266907  T
Q  309 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 408  Q
    |||||| |||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||     
T  17266908 ttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaaga-attatatatgatgtttgagatgttgttgat 17267006  T
Q  409 ttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||    |||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267007 ttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 37116644 - 37116366
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  37116644 ttgttaggataaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 37116545  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    |||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37116544 ctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 37116446  T
Q  419 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116445 tattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39834315 - 39834107
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39834315 gtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaact-tgtatgataatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 39834217  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggt 227  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||    
T  39834216 agtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaataccttgtttaagt 39834117  T
Q  228 taaatgcgat 237  Q
    ||||||||||    
T  39834116 taaatgcgat 39834107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 24353329 - 24353039
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgt--- 305  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||| || |||| |||||||       
T  24353329 acagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 24353230  T
Q  306 tgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||  || | |  ||||||||||||||||||    
T  24353229 tgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatga-attgtatacgatgtttgagatgttgtt 24353131  T
Q  406 gacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || || || |||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353130 gatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249400
Alignment:
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctttttaggttaaatgcgatctttgtcgttcaagttgatgtga 21249635  T
Q  261 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 360  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||  ||| ||| |||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  21249634 gtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccct-gctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 21249536  T
Q  361 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||    
T  21249535 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcatactgcttatgttgct 21249441  T
Q  461 -gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249440 atttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21249400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 207 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21255526 - 21255238
Alignment:
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 306  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||  |    
T  21255526 ttacagaatgcctttttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccct-gctgttaat 21255428  T
Q  307 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    || ||| |||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||    
T  21255427 gtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttg 21255332  T
Q  407 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct-gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255331 atttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 219 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22364957 - 22364745
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||   | | |||  |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22364957 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 22364858  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  22364857 ctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttga 22364760  T
Q  419 tattgttatatcatg 433  Q
    |||||||||||||||    
T  22364759 tattgttatatcatg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 16092340 - 16092454
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092340 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 16092438  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  16092439 tctaagttgatgaaga 16092454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 18818411 - 18818521
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818411 agatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18818509  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  18818510 agttgatgaaga 18818521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649156
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28649144  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  28649145 agttgatgaaga 28649156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7372897 - 7372787
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7372799  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  7372798 agttgatgaaga 7372787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 14409488 - 14409600
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409488 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 14409585  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  14409586 ctaagttgattaaga 14409600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 16413360 - 16413472
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16413457  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16413458 ctaagttgattaaga 16413472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Original strand, 19801101 - 19801234
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaact 165  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||    
T  19801101 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagactagagaataagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaact 19801200  T
Q  166 cgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19801201 cgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagt 19801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 21919002 - 21919105
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919002 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21919100  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  21919101 agttg 21919105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1484520 - 1484408
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484520 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 1484423  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  1484422 ctaagttgattaaga 1484408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 5853336 - 5853448
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853336 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 5853433  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  5853434 ctaagttgattaaga 5853448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 15203275 - 15203387
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203275 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgct 15203372  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  15203373 ctaagttgattaaga 15203387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 497
Target Start/End: Original strand, 17439458 - 17439609
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 443  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||      
T  17439458 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttat 17439555  T
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
     |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439556 gtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20403345 - 20403233
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403345 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20403248  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  20403247 ctaagttgattaaga 20403233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22001871 - 22001759
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001871 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 22001774  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  22001773 ctaagttgattaaga 22001759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 402 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759267
Alignment:
Q  402 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 6759273  T
Q  502 ttaaga 507  Q
    | ||||    
T  6759272 tgaaga 6759267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 402 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406388
Alignment:
Q  402 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23406394  T
Q  502 ttaaga 507  Q
    | ||||    
T  23406393 tgaaga 23406388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20536327 - 20536217
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536327 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20536229  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  20536228 agttgatgaaga 20536217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 21923930 - 21924040
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923930 agatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21924028  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  21924029 agttgatgaaga 21924040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22626854 - 22626745
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626854 agatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22626757  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  22626756 agttgatgaaga 22626745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 20046239 - 20046351
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20046336  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  20046337 ctaagttgattaaga 20046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 41598306 - 41598194
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41598306 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggt 41598209  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  41598208 ctaagttgattaaga 41598194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Original strand, 17612062 - 17612213
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| || |||||||    
T  17612062 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgca 17612159  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17612160 tactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508188
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13508125  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508126 tg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22875187 - 22875074
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22875187 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcgg 22875090  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  22875089 tctaaattgatgaaga 22875074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4483398 - 4483287
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483398 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggt 4483302  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  4483301 ctaagttgattaaga 4483287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 4542417 - 4542529
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4542514  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  4542515 ctaagttgattaaga 4542529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41598644 - 41598482
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||||     
T  41598644 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaa 41598545  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41598544 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaat 41598482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 26219835 - 26219726
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26219835 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatacta-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26219739  T
Q  492 tctaagttgatta 504  Q
    |||||||||||||    
T  26219738 tctaagttgatta 26219726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597720
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||| ||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13597657  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597658 tg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 408 - 507
Target Start/End: Original strand, 45290754 - 45290851
Alignment:
Q  408 cttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290754 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45290851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 438 - 507
Target Start/End: Original strand, 18879275 - 18879343
Alignment:
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18879343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 415 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971273
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199746
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19896386 - 19896271
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata---tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 489  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||| |||| |  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19896386 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 19896289  T
Q  490 ggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19896288 ggtctaagttgattaaga 19896271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396082
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790575
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 26225291 - 26225403
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26225291 tttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactg-ttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 26225387  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  26225388 tctaagttgattaaga 26225403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26224037 - 26223925
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| | | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  26224037 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt-tattgctgtt-gttatttaattaagctgcatgggtcgat 26223940  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  26223939 ctaagttgattaaga 26223925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937162
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 19937158  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  19937159 aaga 19937162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389552
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21389550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778878
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131098
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Original strand, 13507657 - 13507765
Alignment:
Q  41 cccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaa 138  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  13507657 cccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattagacaagtttttagattgagactgaacctgggaaagtttaaaaa 13507755  T
Q  139 tggatttttg 148  Q
    ||||||||||    
T  13507756 tggatttttg 13507765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Original strand, 13597189 - 13597297
Alignment:
Q  41 cccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaa 138  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||    
T  13597189 cccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattagacaagtttttagattgagactgaacctgggaaagtttaaaaa 13597287  T
Q  139 tggatttttg 148  Q
    ||||||||||    
T  13597288 tggatttttg 13597297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20499143 - 20499024
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | |    
T  20499143 gtagttttgacccttgagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattgaacctgagaaa 20499044  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgg 149  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  20499043 gtttaaaaatggatttttgg 20499024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14823891 - 14823780
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  14823891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactttgctgcatgagt-ggt 14823795  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||| ||||||||||    
T  14823794 ctaaattgattaaga 14823780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22875494 - 22875372
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 183  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||   ||| |||||| |  ||||||| |   |||||||||||||||| |||| |||||    
T  22875494 taataatgattaggaaagattgtagaacgaggttgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacctgaactcgccatgacgagcagagg 22875395  T
Q  184 ccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |  ||||||||||||| ||||||    
T  22875394 ctctcgcctcgcgagtgacccag 22875372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20536675 - 20536514
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| |  |    
T  20536675 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaact 20536576  T
Q  146 t-tgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    | ||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20536575 tatgggattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 20536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 19801426 - 19801527
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19801426 ttgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggt 19801522  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  19801523 ctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23406841 - 23406665
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttt-tggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||   ||  |||||| |  || |||||    
T  23406841 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 23406742  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 228  Q
     |   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||||||    
T  23406741 ttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtt 23406665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 18678104 - 18678214
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18678104 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 18678202  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  18678203 agttgattaaga 18678214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6759717 - 6759563
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||   ||| ||||||  | |||||| |    
T  6759717 ccttagatgcttttgagtgcttgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaaatattttagaatgaaacttttggaa 6759618  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  6759617 atctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 6759563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 433
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492890
Alignment:
Q  387 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 40492890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 25484319 - 25484424
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||         |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25484319 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta--------gctgtt-gttatttaactaagctgcacgagttggt 25484409  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  25484410 ctaagttgattaaga 25484424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648562
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 23648562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 45130691 - 45130767
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  45130691 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 45130767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 17266565 - 17266674
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaat 139  Q
    |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||   | ||||||| |||    
T  17266565 ccttaagtcgaactttagatgtttttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctacgaaagtttaaaaat 17266663  T
Q  140 ggatttttggg 150  Q
    |||||||||||    
T  17266664 ggatttttggg 17266674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32121851 - 32121741
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  32121851 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattcta 32121753  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  32121752 agttgattaaga 32121741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 18878898 - 18878972
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  18878898 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18878972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 982975 - 983084
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg 140  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||| |||||| | | || || ||||||| |||| || |||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  982975 ccttaagttgaactttagatgattttgagtgtctgaacatgtatattagtgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatg 983074  T
Q  141 gatttttggg 150  Q
    ||||||||||    
T  983075 gatttttggg 983084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 17439100 - 17439187
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  17439100 ttttgagtgcctgaa-tatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgggattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 17439187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21286724 - 21286656
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac 79  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  21286724 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgacccttaagttgaaccttagatgtttttaagtgcctgaac 21286656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Original strand, 21918664 - 21918745
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  21918664 agttgaaccttagatgctttggagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtaggaagagattgaacctggaa 21918745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24353550 - 24353463
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  24353550 ttttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttataaatggatttttggg 24353463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 214
Target Start/End: Original strand, 21414887 - 21415049
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaactatgtaa--taatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| |   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| || | |||||| |  || |    
T  21414887 accttagatgtttttgagtgcctgaag-atgcacactaatgattaggaaagattgtagaatgagattgaactcggattagcttcaaaatggaatggtgag 21414985  T
Q  151 agttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
      ||  |||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21414986 tattttaccctaactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagttgtccaattacagaa 21415049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 18862430 - 18862512
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  18862430 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 18862512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383896
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21383896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21387398 - 21387316
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21387398 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21387316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21411271 - 21411189
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21411271 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21411189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21805763 - 21805681
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21805763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21805681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 21827799 - 21827881
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21827799 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21827881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 7373209 - 7373135
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||    
T  7373209 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgaaattgaacctggaa 7373135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 18818071 - 18818145
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  18818071 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaa 18818145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Original strand, 21918766 - 21918808
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  21918766 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 21918808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22627195 - 22627125
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct 123  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  22627195 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22627125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31971711 - 31971629
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||| |||||||||| | | ||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  31971711 agttgaaccttagatgcttttgtgtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtaggatgagattgaacctggaat 31971629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 18818175 - 18818224
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  18818175 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 18818224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 21255686 - 21255605
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||  ||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  21255686 agttgaaccttagatgcttttgagtgcccaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 21255605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37116874 - 37116787
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||    
T  37116874 ttttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtataaaaatggatttttggg 37116787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 430
Target Start/End: Original strand, 14103165 - 14103260
Alignment:
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  14103165 taatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 14103260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Original strand, 25362843 - 25362887
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  25362843 taataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 25362887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37116704 - 37116664
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37116704 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 37116664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Original strand, 39705930 - 39706400
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39705930 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgaagattaagattgaacctggaatagttt 39706029  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaat 232  Q
    ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39706030 aagaacgaatttt-gagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaat 39706128  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 332  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  39706129 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgat 39706228  T
Q  333 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39706229 ctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatg-ttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcat 39706326  T
Q  433 gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706327 gat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 39706400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15099833 - 15099457
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15099833 gtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaact-tgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctggaat 15099735  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggt 227  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||    
T  15099734 agtttaagaatgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgtcttgtttaggt 15099635  T
Q  228 taaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt 327  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || ||||||||||| |||||    
T  15099634 taaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgt 15099535  T
Q  328 ataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 407  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15099534 atattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15190787 - 15190424
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15190787 ttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaaggttctagattgagatttaacctggaatagtttaagaatgga 15190688  T
Q  143 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatactt 241  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||  ||    
T  15190687 tttttgggcgttacatctgtactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatcttt 15190588  T
Q  242 gtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15190587 gtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttg 15190488  T
Q  342 ttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 407  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15190487 atgataatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 158 - 501
Target Start/End: Original strand, 12287974 - 12288316
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |    ||  ||| ||  |||||||||||| |||| ||   ||||||||  ||||||||    
T  12287974 cctgaactcgccatagcgagtagaagctctcgcctcgcgagctcaagagagacataacactttgttaggtttaatgtgacttttgtcgcataagttgatg 12288073  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  12288074 tgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatata 12288173  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  12288174 gttgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgcatactgcctatg 12288270  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288271 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 55 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 8846834 - 8846370
Alignment:
Q  55 cttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgg-gag 152  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||| | |||    
T  8846834 cttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaattttttgtgag 8846735  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  8846734 ttgcaccttaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgag 8846635  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||    
T  8846634 ttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 8846535  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgactt----------------acatttgatattgttatatcatgct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||                 |||| ||||||||||| ||||| |    
T  8846534 tatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgat 8846436  T
Q  436 ggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8846435 -gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12774458 - 12774021
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga-atagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||| |||||  | |    
T  12774458 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagattggagaatgagattgaacctggagagacgtta-gaatgaattttgtgaa 12774360  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     | | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12774359 ctga-acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacga 12774261  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||    
T  12774260 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg 12774161  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
            |||||||||||||| ||| | ||||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  12774160 --------ttgtatatacattaaatg-gattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgc 12774073  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774072 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 13697 - 13953
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||    
T  13697 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgt 13796  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggt 438  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  13797 tgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-t 13894  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13895 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Original strand, 53081976 - 53082254
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagg-taaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaag 317  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  53081976 ttgttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaag 53082075  T
Q  318 cctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttg 417  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||| || | ||||    
T  53082076 cctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttg 53082173  T
Q  418 atattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||  || |||||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082174 atattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Original strand, 46640272 - 46640558
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 308  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  46640272 acagaataccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgt 46640370  T
Q  309 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 408  Q
    |||||||| |||||||| ||| || | ||||||||  | |||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| |||||||| ||||     
T  46640371 ttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt-gagatgttattgat 46640468  T
Q  409 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640469 tttcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 501
Target Start/End: Original strand, 43198381 - 43198661
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||     
T  43198381 ttgttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaaga 43198477  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttg 417  Q
    || |    ||| |  | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  43198478 ctaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttg 43198576  T
Q  418 atattgttatatcatgc-tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198577 atatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 52242811 - 52243016
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   ||||  | |||||||||   ||||| | ||| |||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||    
T  52242811 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttgatctttaagttggtatttagatgatttcgagtgcctgaacatgtataataatgatcaggaaagattct 52242907  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  52242908 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgcattgttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccag 52243007  T
Q  207 ttacagaat 215  Q
    |||||||||    
T  52243008 ttacagaat 52243016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 15464567 - 15464752
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||    ||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  15464567 gtagttttgacccttaagttgatatttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctgaaat 15464665  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15464666 agtttaagaatggatttttgggtgttacacctgaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 15464752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 184
Target Start/End: Original strand, 43198226 - 43198380
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  43198226 gtagttttgacccttaagttaaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtgtaataatgattaggaaagattttagattgagattgaacatggaata 43198325  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggc 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43198326 gtttaagaattgatttttgggagttacacctgaactcaccatagcgagtagaggc 43198380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 222 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 15552105 - 15551833
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   || ||||||  |||  ||||||| |||    
T  15552105 ttaggtaaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttaccct-gctgttaatgtcccagtaagactg 15552007  T
Q  322 aattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 420  Q
    |    ||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||| || ||||    
T  15552006 atgcttatgaatc-aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttaccttcgata 15551912  T
Q  421 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551911 ttattatatcatgatgg-attgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16597106 - 16596686
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgg-g 150  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |  ||| | |    
T  16597106 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agacttagaatgaaaatttagag 16597008  T
Q  151 agttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
    | |   ||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |       |||||||||| | || ||||||| |||| |||  ||||||  |||    
T  16597007 aatctgacc-gaactcgccatggcgagtagaggttctcgccccgcgggcgtttgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgtgatctttgtcgttcga 16596909  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||  |||||| ||||    |||||  |||||||| |  |||||    
T  16596908 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatg 16596809  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  16596808 ttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactac 16596714  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaag 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596713 ctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13845009 - 13844854
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13845009 ttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagatcaagatttaacctggaatagtttaagaatgga 13844910  T
Q  143 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13844909 tttttgggagttacacctgtacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 13844854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 336 - 501
Target Start/End: Original strand, 52243136 - 52243302
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || | |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  52243136 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttg-gattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatga 52243234  T
Q  434 -ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243235 act-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377633
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16377618  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  16377619 ctaagttgatgaaga 16377633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 54798752 - 54798866
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54798752 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcgg 54798850  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  54798851 tctaagttgattaaga 54798866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7798893 - 7798783
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798893 agatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7798795  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  7798794 agttgatgaaga 7798783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14280435 - 14280322
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14280435 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 14280338  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  14280337 tctaagttgattaaga 14280322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873479
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 52873467  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  52873468 agttgatgaaga 52873479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 18215318 - 18215430
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215318 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18215415  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  18215416 ctaagttgattaaga 18215430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 44928923 - 44929036
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928923 ttgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44929021  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  44929022 ctaagttgattaaga 44929036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12902876 - 12902773
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902876 agatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12902778  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  12902777 agttg 12902773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088886
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  7088897 agttgatgaaga 7088886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 12351 - 12463
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12448  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  12449 ctaagttgattaaga 12463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 15118396 - 15118508
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15118493  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  15118494 ctaagttgattaaga 15118508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 19618216 - 19618328
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618216 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19618313  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  19618314 ctaagttgattaaga 19618328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 44773131 - 44773243
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44773228  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  44773229 ctaagttgattaaga 44773243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Original strand, 44928592 - 44928746
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  ||||||| |   |||     
T  44928592 gtttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaatctgacca 44928691  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44928692 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 44928746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 52312628 - 52312516
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312628 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 52312531  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  52312530 ctaagttgattaaga 52312516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7893822 - 7893712
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7893822 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtcta 7893724  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  7893723 agttgatgaaga 7893712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 1837553 - 1837665
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837553 ttgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 1837650  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  1837651 ctaagttgattaaga 1837665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 3515125 - 3515013
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3515125 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggt 3515028  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  3515027 ctaagttgattaaga 3515013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038657
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  14038671 ctaagttgatgaaga 14038657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 18239463 - 18239575
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239463 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18239560  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  18239561 ctaagttgattaaga 18239575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19242817 - 19242705
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242817 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 19242720  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  19242719 ctaagttgattaaga 19242705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44615406 - 44615294
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44615309  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  44615308 ctaagttgattaaga 44615294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 50222383 - 50222495
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222383 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50222480  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  50222481 ctaagttgattaaga 50222495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 51463912 - 51464024
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463912 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 51464009  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  51464010 ctaagttgattaaga 51464024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 23374361 - 23374464
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23374361 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgttcta 23374459  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  23374460 agttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 15355380 - 15355481
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355380 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15355477  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  15355478 aaga 15355481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 16270238 - 16270347
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270238 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 16270335  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    | ||||| ||||    
T  16270336 acttgatgaaga 16270347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 507
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803421
Alignment:
Q  400 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 499  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  500 gattaaga 507  Q
    ||||||||    
T  23803414 gattaaga 23803421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 423 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 3096385 - 3096309
Alignment:
Q  423 gttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096385 gttacatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3096309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 505
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970861
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 14970848  T
Q  493 ctaagttgattaa 505  Q
    |||||||||||||    
T  14970849 ctaagttgattaa 14970861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6900009 - 6899900
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6900009 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtcta 6899912  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  6899911 agttgatgaaga 6899900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 8574867 - 8574979
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8574867 tttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 8574963  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||| |||||||    
T  8574964 tctaagttaattaaga 8574979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 16239972 - 16240081
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16239972 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtcta 16240069  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  16240070 agttgatgaaga 16240081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22636554 - 22636444
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22636456  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  22636455 agttgatgaaga 22636444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44052948 - 44052838
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  44052948 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggccta 44052850  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  44052849 agttgatgaaga 44052838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44102332 - 44102220
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102332 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 44102235  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  44102234 ctaagttgattaaga 44102220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 15868273 - 15868391
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |     
T  15868273 gtagttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgggaa 15868371  T
Q  129 agtttaagaatggatttttg 148  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  15868372 agtttaaaaatagatttttg 15868391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046506
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 21814964 - 21815124
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | ||||||| |    
T  21814964 ccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaa 21815062  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    | |  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21815063 gctg-acttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 21815124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 21815293 - 21815453
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||| | | |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | ||||||| |    
T  21815293 ccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaataatttagaatgataatgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaa 21815391  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21815392 gctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 21815453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 21818386 - 21818546
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || || ||||||| | ||||||| |    
T  21818386 ccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatttagaatgataatgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaa 21818484  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    | |  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21818485 gctg-acttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 21818546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 507
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641338
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 7641338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610956
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12610956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32851929 - 32851816
Alignment:
Q  36 tttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||| |  ||||    
T  32851929 tttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattagacaagtttttagattgagattggacctgggaaggttt 32851831  T
Q  134 aagaatggatttttg 148  Q
    || ||||||||||||    
T  32851830 aaaaatggatttttg 32851816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15367800 - 15367708
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367800 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15370036
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371220
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373501
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 15402813 - 15402721
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402813 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Original strand, 13415 - 13532
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  13415 ttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagttt 13514  T
Q  134 -aagaatggatttttggg 150  Q
     || ||||||||||||||    
T  13515 aaaaaatggatttttggg 13532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 21815629 - 21815731
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||| |  | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21815629 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcacgagtcggt 21815726  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  21815727 ctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053403
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Original strand, 15464926 - 15464972
Alignment:
Q  389 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 435  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15464926 atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgct 15464972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223550
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3097093 - 3097017
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  3097093 accttagatgttttcgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 3097017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14164807 - 14164739
Alignment:
Q  256 tgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat 324  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14164807 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaat 14164739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 22353955 - 22353852
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| || |  | ||  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22353955 ttgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggt 22353857  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  22353856 ctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15091326 - 15091203
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggat-ttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagag 182  Q
    ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||| | |   |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15091326 taatattgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaggattttagaatgaaacttttggaaatctgacctgaactcgccacggcgagcagag 15091227  T
Q  183 gccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||    
T  15091226 gctctcgcctcgcgagtgacccag 15091203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20149936 - 20149835
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||| ||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20149936 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgtcgctg-ttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgatt 20149839  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  20149838 aaga 20149835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 12287825 - 12287891
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  12287825 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 12287891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14039109 - 14038955
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||  | |||||| |    
T  14039109 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgatttggaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagattttagaatgaaacttttggaa 14039010  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   ||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  14039009 atctgaccagaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 14038955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44102566 - 44102508
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  44102566 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 44102508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Original strand, 53081789 - 53081854
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgg 149  Q
    ||||||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53081789 taataatgattaagcaagtttttagattgagattgaacctggaaaagtttaaaaatggatttttgg 53081854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 199
Target Start/End: Original strand, 13616 - 13656
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13616 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 13656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12903195 - 12903131
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  12903195 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 12903131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 14052967 - 14053049
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  14052967 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa-tatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacttggaat 14053049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14158102 - 14158034
Alignment:
Q  256 tgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat 324  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14158102 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttttttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaat 14158034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 630728 - 630810
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  630728 taatgttatataattggatatatattgcatgcatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 630810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3332052 - 3331970
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  3332052 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttatat 3331970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7089232 - 7089185
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7089232 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 7089185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 13812763 - 13812845
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  13812763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 13812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 14953915 - 14953997
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14953915 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14953997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 16239653 - 16239728
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagat-tctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16239653 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaaatgtagaatgagattgaacctggaa 16239728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 204
Target Start/End: Original strand, 17047838 - 17047885
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccc 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  17047838 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccc 17047885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25690146
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  25690228 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 25690146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6190893 - 6190819
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  6190893 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacctggaa 6190819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7089313 - 7089251
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  7089313 tgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 7089251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3096998 - 3096949
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  3096998 acctgaactcgccaaggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 3096949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7799052 - 7799003
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  7799052 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 7799003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12903112 - 12903063
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  12903112 acctgaactcgccacggcgagtagaggctcccgcctcgcgagtgacccag 12903063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15552280 - 15552199
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||| | | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||    
T  15552280 agttgaaccttatatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa 15552199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24029208 - 24029127
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | | ||||| ||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  24029208 agttgaaccttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattatgaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 24029127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 47 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13407 - 12954
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13407 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtttaagaatgaattt 13308  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcg 245  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||     
T  13307 ttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgttaggttaaatgtgatctttgtca 13208  T
Q  246 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgt 345  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13207 cacgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgc 13108  T
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13107 taatgttatataattgtatatacattacacga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgct-gatttgcat 13010  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13009 actgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 158 - 433
Target Start/End: Original strand, 18002 - 18276
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagtta--cagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttga 255  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||   || ||| |  |||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  18002 cctgaactcgccatagcgagtggaggctctcgcctcgcgagc--cctagtgagacagaataccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttga 18099  T
Q  256 tgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttata 355  Q
    |||||| ||||| | | |||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||    
T  18100 tgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgata 18199  T
Q  356 taattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  18200 taaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatg 18276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6620
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  7092 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaatagttt 6993  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaat 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  6992 aagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaat 6893  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 332  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  6892 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgat 6793  T
Q  333 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  6792 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat 6694  T
Q  433 gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
     |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693 -catgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14472 - 14000
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  14472 ttttgacctttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattaagattgaacctggaatagttt 14373  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaat 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  14372 aagaatggatttttgggaattacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaat 14273  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataat 332  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  14272 gcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgat 14173  T
Q  333 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  14172 ctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat 14074  T
Q  433 gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
     |  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14073 -catgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 14000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 47 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 15471391 - 15470939
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15471391 agttgaaccttagatgtttttgagtccctgaacatgtataatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaattt 15471292  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  15471291 t-gagagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtc 15471193  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 344  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15471192 gcacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttg 15471094  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||    
T  15471093 ttaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgca 15470996  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470995 tactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 35 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14234969 - 14234496
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||     
T  14234969 ttttgacctttaagttgaaccttagatttttttgagtgcctgaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacccgaaatagtt- 14234871  T
Q  134 aagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaat 232  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  14234870 aagaatgaatttttgggagttgcacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaat 14234771  T
Q  233 gcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtt--tcagtaagcctgaattgtata 330  Q
    | |||  |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  14234770 gtgatctttgtcgaacaagttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgttta 14234671  T
Q  331 atctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  14234670 atctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 14234572  T
Q  431 atgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14234571 atgat-gatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaaga 14234496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16097782 - 16097342
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||| ||||||| || ||  ||||    
T  16097782 gtttttgagtgtctgaacatgtctaataattattaggaaagattggagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaatttttgtgaattggacct 16097683  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | ||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16097682 gaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 16097583  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  16097582 agttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 16097483  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||     
T  16097482 tgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgat-gatttgcatattgcctatgttgt 16097385  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097384 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Original strand, 37250932 - 37251270
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||    
T  37250932 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaacaccttgttaggttaaaagtgacctttgtcgcacgagttgatg 37251031  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||    
T  37251032 tgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatata 37251131  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
    | ||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  37251132 aatgtatatgcattacatga-attatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatg 37251228  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251229 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 407
Target Start/End: Original strand, 1465047 - 1465423
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1465047 gtagttttgacctttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctgaact-tgtatgatgatgattatgaaagattgtagattgagattgaacctggaat 1465145  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggt 227  Q
    | |||||||| | |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||||    
T  1465146 aatttaagaacgaatttgtgtgagttgcacctgaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggt 1465245  T
Q  228 taaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt 327  Q
    |||| |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| || |||  || ||||||||||| |||||    
T  1465246 taaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgt 1465345  T
Q  328 ataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 407  Q
     || |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1465346 ttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32308128 - 32307691
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct-ggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| || |    
T  32308128 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagacttta-gaatgaattttgggaa 32308030  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     | | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  32308029 ctga-acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacga 32307931  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||||    ||| |  ||||||||||  |||||    
T  32307930 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatg 32307831  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    ||        |||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  32307830 tt--------gtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgc 32307743  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307742 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16104240 - 16103794
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct-ggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||| | ||||   || || ||||| ||    
T  16104240 ccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgaggttgaacctgggaagacttta--gattgaattttgtga 16104143  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     ||  | | ||||||| | ||||||| ||||||  |||||||| ||||      |||||||| | | ||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16104142 attgaatccgaactcgtcgtggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtactggtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgctctttgtcgcacga 16104043  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |    ||| |  | ||||||||  |||||    
T  16104042 gttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatg 16103943  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  16103942 ttatataattttatatacattaaatga-attatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgc 16103846  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103845 ctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 500
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210432
Alignment:
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||| | ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 13210195  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    || ||||||| ||||    ||| |||  ||||||| |  |||||||||||||    
T  13210196 agttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataa 13210295  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13210296 ttgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttg 13210390  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210391 ctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 324706 - 324481
Alignment:
Q  43 cttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg 140  Q
    ||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  324706 cttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggaaagattgtagaatgagattgaactgagaatagtttaagaatg 324608  T
Q  141 gatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatact 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |    
T  324607 aatttttgggagttgcacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctt 324508  T
Q  241 tgtcgcacgagttgatgtgagttgatc 267  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||    
T  324507 tgtcgtacaagttgatgtgagttgatc 324481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 211
Target Start/End: Original strand, 2050839 - 2051018
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  2050839 gtagttttgacccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctcaacatgtgtaataatgattaggaaagattctagattgagattgaacc--gaata 2050936  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  2050937 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttaca 2051018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Original strand, 22110116 - 22110454
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  | |||||||||| |||| ||   ||||||||||| ||||||    
T  22110116 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagggacagaacaccttgttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgaattgatg 22110215  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||| |   |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||  |||||| |||||    
T  22110216 tgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatata 22110315  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
    | ||||||  ||||||||||  || | | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||    
T  22110316 aatgtatacgcattacatga-attctatatgatg-ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatg 22110412  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110413 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 283 - 502
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174366
Alignment:
Q  283 taagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagttt 381  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatc-aatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactt- 12174249  T
Q  382 atgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 481  Q
    ||||||||| |||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174250 atgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 12174345  T
Q  482 catgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12174346 catgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 64 - 502
Target Start/End: Original strand, 49667754 - 49668183
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 162  Q
    ||||||| |||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| | | ||| ||  |  ||||||    
T  49667754 ttttgagcgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaatattgtgaactgaacctga 49667853  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 261  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||| | | ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49667854 actcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 49667953  T
Q  262 ttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat-- 359  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||  || |||   | | |||| ||||     ||||||||      
T  49667954 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga--tgcata---tga-gttgatgttg----tatataatgc 49668043  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt-gttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||   ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  49668044 tgtatatactttaaatg-gattatgtt-gataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 49668139  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49668140 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 322
Target Start/End: Original strand, 12933971 - 12934241
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| ||     
T  12933971 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaattttgtgaa 12934070  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
     |  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||      |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12934071 ctgaacctgaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagtacttgtgttacagacttccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgag 12934170  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  12934171 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 12934241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 52523345 - 52523550
Alignment:
Q  8 cagagagtcgacatggtttcgtagtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattct 106  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   ||||  |||||||||||   ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  52523345 cagagagtcaacatgatttcgtagt---tttggtccttaagttggtatttagatgattttgagtgcctgaacatgtgtaataattattaggaaagattct 52523441  T
Q  107 agaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||    
T  52523442 agtttgatattgaacctggaacagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctgacgagttgcccag 52523541  T
Q  207 ttacagaat 215  Q
    |||||||||    
T  52523542 ttacagaat 52523550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 222 - 406
Target Start/End: Original strand, 49389459 - 49389642
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  49389459 ttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactg 49389558  T
Q  322 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 406  Q
    |    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  49389559 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatga-attatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Original strand, 1644352 - 1644780
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg-gaatagtttaagaatggatttttgggagttacacc 159  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||  | | | | |||    
T  1644352 gtttttgagtgcctgaacatgtctgataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgagaagacttta-gaatgaattttgtgaactga-acc 1644449  T
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||| | | | ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1644450 tgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacaaactgccttgtttaagttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgt 1644549  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||            
T  1644550 gagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg-------- 1644641  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||  ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1644642 ttgtatatacattaaatg-gattatg-ttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgat-gatttgcatactgcctatgttg 1644737  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
     || |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  1644738 ttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgat 1644780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9513370 - 9512934
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||| | |||||| ||    
T  9513370 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaaatttttgtga 9513271  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca-gttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacg 249  Q
      || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| || ||||    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||  |||||||||     
T  9513270 actaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgaga-ttacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcaca 9513172  T
Q  250 agttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaat 349  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||    
T  9513171 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 9513072  T
Q  350 gttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 449  Q
    ||| ||||        ||||||| ||| | ||||||| |||   |||||||||| |    | |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  9513071 gttttata--------tacattaaatg-gattatgtt-gataaatgagatgttgat----tgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactg 9512987  T
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9512986 cctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 9521345 - 9520909
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||| | |||||| ||    
T  9521345 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattagagaatgagattgaacctgaaaagattttagaatgaaatttttgtga 9521246  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca-gttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacg 249  Q
      || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| || ||||    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||  |||||||||     
T  9521245 actaaacctgaactcaccatggcgagcagaggctctcgcctcgaga-ttacttgtgttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcaca 9521147  T
Q  250 agttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaat 349  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||    
T  9521146 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 9521047  T
Q  350 gttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 449  Q
    ||  ||||        ||||||| ||| | ||||||| |||   |||||||||| |    | |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  9521046 gtgttata--------tacattaaatg-gattatgtt-gataaatgagatgttgat----tgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactg 9520962  T
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9520961 cctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 336 - 497
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 52523767  T
Q  434 -ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523768 act-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438543
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  18438554 agttgatgaaga 18438543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 27165370 - 27165256
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165370 tttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 27165272  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  27165271 tctaagttgattaaga 27165256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42386533 - 42386428
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42386533 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcgg 42386435  T
Q  492 tctaagt 498  Q
    |||||||    
T  42386434 tctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 405 - 507
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301663
Alignment:
Q  405 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 504  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 53301660  T
Q  505 aga 507  Q
    |||    
T  53301661 aga 53301663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 394 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14972975 - 14972863
Alignment:
Q  394 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972975 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14972877  T
Q  494 taagttgattaaga 507  Q
    ||||||||| ||||    
T  14972876 taagttgatgaaga 14972863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12399328 - 12399225
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12399230  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  12399229 agttg 12399225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Original strand, 17247947 - 17248109
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||||     
T  17247947 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaa 17248046  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17248047 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 17248109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 29172627 - 29172739
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29172724  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29172725 ctaagttgattaaga 29172739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Original strand, 12171869 - 12171988
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttga 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12171869 acctgaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgatctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttga 12171968  T
Q  256 tgtgagttgatcttagaggt 275  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12171969 tgtgagttgatcttagaggt 12171988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 23083363 - 23083473
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083363 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23083461  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  23083462 agttgatgaaga 23083473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 24153211 - 24153320
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153211 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24153308  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  24153309 agttgattaaga 24153320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 36166716 - 36166604
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36166716 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 36166620  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  36166619 tctaagttgattaaga 36166604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 353 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||   ||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctg-ttttatgtactgc 43926024  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926023 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469290
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 6469275  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  6469276 ctaagttgattaaga 6469290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 9707651 - 9707763
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707651 ttgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9707748  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  9707749 ctaagttgattaaga 9707763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17463296 - 17463184
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463296 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17463199  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  17463198 ctaagttgattaaga 17463184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672632
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17672647  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  17672646 ctaagttgattaaga 17672632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476497
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggt 25476482  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  25476483 ctaagttgatgaaga 25476497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 28848655 - 28848767
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848655 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28848752  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  28848753 ctaagttgattaaga 28848767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 34159444 - 34159332
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159444 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 34159347  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  34159346 ctaagttgattaaga 34159332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 45606951 - 45607063
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606951 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 45607048  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  45607049 ctaagttgattaaga 45607063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 55476609 - 55476497
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 55476512  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  55476511 ctaagttgattaaga 55476497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 396 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26687006 - 26686902
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687006 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 26686908  T
Q  496 agttga 501  Q
    ||||||    
T  26686907 agttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 398 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500948
Alignment:
Q  398 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  498 ttgattaaga 507  Q
    ||||||||||    
T  55500957 ttgattaaga 55500948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 393 - 505
Target Start/End: Original strand, 38961935 - 38962045
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961935 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 38962032  T
Q  493 ctaagttgattaa 505  Q
    |||||||||||||    
T  38962033 ctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698547
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  20698536 agttgatgaaga 20698547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42386894 - 42386710
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||||  |||| | |||| || ||||||||||| |||    
T  42386894 gtagttttgacctttaagttgaaccttagttgtttatgagtgcatgaac-atgcataataatgattaggcaagactttagactgtgattgaacctgaaat 42386796  T
Q  129 agtttaagaatggat-ttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    |||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  42386795 agtt-aagaatgaaacttttgggagttatacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa 42386710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43927438 - 43927291
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 308  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43927438 acagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 43927339  T
Q  309 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| ||||    
T  43927338 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 7781391 - 7781503
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781391 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 7781488  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  7781489 ctaagttgattaaga 7781503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8899212 - 8899100
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899212 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 8899115  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||| ||||||||||    
T  8899114 ctaaattgattaaga 8899100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12567678 - 12567566
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567678 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 12567581  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  12567580 ctaagttgattaaga 12567566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13544143 - 13544031
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544143 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13544046  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  13544045 ctaagttgattaaga 13544031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 396 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 14572707 - 14572603
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572707 agatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14572610  T
Q  496 agttgat 502  Q
    |||||||    
T  14572609 agttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 16454325 - 16454437
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16454325 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 16454422  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16454423 ctaagttgattaaga 16454437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 53070360 - 53070520
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||| |    
T  53070360 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaa 53070458  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53070459 gctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 53070520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 353 - 497
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550625
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||     
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaatt-atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgca 43550580  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550581 tatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 415 - 507
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424871
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 13151834 - 13151947
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13151834 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 13151931  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  13151932 tctaagttgattaaga 13151947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 13154299 - 13154412
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13154299 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 13154396  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  13154397 tctaagttgattaaga 13154412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13442393 - 13442283
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442393 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 13442295  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  13442294 agttgatgaaga 13442283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17487975 - 17487865
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487975 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17487877  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  17487876 agttgatgaaga 17487865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17499457 - 17499347
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499457 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 17499359  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  17499358 agttgatgaaga 17499347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 21618567 - 21618459
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21618567 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 21618471  T
Q  492 tctaagttgatt 503  Q
    ||||||||||||    
T  21618470 tctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340826
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 24340763  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340764 tg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43841051 - 43840941
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttta 43840953  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  43840952 agttgatgaaga 43840941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 10247767 - 10247879
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247767 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggt 10247864  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  10247865 ctaagttgattaaga 10247879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977521
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  15977535 ctaagttgattaaga 15977521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 16282855 - 16282967
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282855 ttgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16282952  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16282953 ctaagttgattaaga 16282967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 17446699 - 17446810
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17446699 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gt 17446795  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  17446796 ctaagttgattaaga 17446810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 23274810 - 23274705
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  23274810 tttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 23274712  T
Q  492 tctaagt 498  Q
    |||||||    
T  23274711 tctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213832
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  40213818 ctaagttgattaaga 40213832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 41124005 - 41123896
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124005 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 41123911  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  41123910 ctaagttgattaaga 41123896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 451 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194699
Alignment:
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 28194699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 50242940 - 50242830
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242940 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 50242843  T
Q  493 ctaagttgattaa 505  Q
    |||||||||||||    
T  50242842 ctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119881
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 12119877  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  12119878 aaga 12119881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412435
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 15412439  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  15412438 aaga 15412435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642368
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 37642305  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642306 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 53070697 - 53070799
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070697 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 53070794  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  53070795 ctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499524
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 8499528  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  8499527 aaga 8499524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 502
Target Start/End: Original strand, 14576835 - 14576939
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| | ||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14576835 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgttt-atactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtcta 14576932  T
Q  496 agttgat 502  Q
    |||||||    
T  14576933 agttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 150
Target Start/End: Original strand, 605941 - 606049
Alignment:
Q  43 cttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgg 141  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  605941 cttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatgtgtataataatgattaggcaattttctagattgagattgaacctggaaaagtttaaaaatgg 606040  T
Q  142 atttttggg 150  Q
    |||||||||    
T  606041 atttttggg 606049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 10557105 - 10556991
Alignment:
Q  392 tttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 490  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10557105 tttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 10557008  T
Q  491 gtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||||    
T  10557007 gtctaagttgattaaga 10556991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 388 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12378050 - 12377940
Alignment:
Q  388 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 485  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  12378050 gatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagcta-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatg 12377952  T
Q  486 agtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||    
T  12377951 agtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 40213392 - 40213535
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 162  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| | |||||||| |   ||||||    
T  40213392 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttgggaatctaacctga 40213491  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  40213492 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 40213535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 412 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494815
Alignment:
Q  412 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaaga 44494815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 454
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2051239  T
Q  434 -ctggttttgcatactgcctat 454  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  2051240 act-gttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737242
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 17737242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577994
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 45577994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147628
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 22147565  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22147566 tg-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606428
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 489  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatg--tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 606420  T
Q  490 ggtctaag 497  Q
    ||| ||||    
T  606421 ggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14573037 - 14572873
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatt-tttgggagttacacctga 162  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |   ||||| | |   ||||||    
T  14573037 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agacttagaatgaaacctttggaaatctgacctga 14572939  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||| | | ||||||||||    
T  14572938 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtt 14572873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23275213 - 23275106
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaat 139  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||    
T  23275213 ccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttgggaaagtttaaaaat 23275115  T
Q  140 ggatttttg 148  Q
    |||||||||    
T  23275114 ggatttttg 23275106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Original strand, 23412814 - 23412929
Alignment:
Q  34 gttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagt 131  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||| | |||    
T  23412814 gttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataaaaatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgggaaagt 23412912  T
Q  132 ttaagaatggatttttg 148  Q
    |||| ||||||||||||    
T  23412913 ttaaaaatggatttttg 23412929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 25476046 - 25476199
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| |  ||| |||     
T  25476046 ccttagatgtttttgagtacctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtagaatgagatcgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaa 25476145  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |   |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25476146 tctgacctgaactcgccacgacgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 25476199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 43927652 - 43927543
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg 140  Q
    |||||||| | || ||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  43927652 ccttaagtcgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattagacaagtttttagattgagtttgaacctgggaaagtttaaaaatg 43927553  T
Q  141 gatttttggg 150  Q
    ||||||||||    
T  43927552 gatttttggg 43927543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 49389305 - 49389378
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49389305 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctgga 49389378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14501677 - 14501564
Alignment:
Q  36 tttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||| |  ||||    
T  14501677 tttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaaggttttagattgagattggacctgggaaggttt 14501579  T
Q  134 aagaatggatttttg 148  Q
    || ||||||||||||    
T  14501578 aaaaatggatttttg 14501564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Original strand, 11424424 - 11424569
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| || || ||||||  | |||| | |    
T  11424424 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaataatgtagaatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaactttttgaa 11424522  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
     |   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  11424523 ctctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 11424569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14179789 - 14179708
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  14179789 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacttggaa 14179708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12378457 - 12378359
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  | | || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  12378457 accttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtacaataatgattaggcatgtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 12378359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822274
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaaga 46822274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45797721 - 45797608
Alignment:
Q  36 tttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||| |  ||||    
T  45797721 tttgtcccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattggacctgggaaggttt 45797623  T
Q  134 aagaatggatttttg 148  Q
    || ||||||||||||    
T  45797622 aaaaatggatttttg 45797608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18438994 - 18438920
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  18438994 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaaaatgagattgaacctggaa 18438920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 20698101 - 20698183
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20698101 agttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20698183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26687347 - 26687193
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||  | || |||||    
T  26687347 ccttagatgcttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 26687248  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26687247 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 26687193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14973314 - 14973161
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| | ||   ||| |||| | | |||||| |     
T  14973314 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattaaaccagaaaagattttagaaagaacttttggaat 14973215  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  14973214 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgacccag 14973161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 149
Target Start/End: Original strand, 37250804 - 37250869
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgg 149  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37250804 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttgg 37250869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12511110 - 12511066
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12511110 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaaga 12511066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14501290 - 14501207
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14501290 taatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14501207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Original strand, 14576505 - 14576568
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14576505 tttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagaatgtagaatgacattgaacctggaa 14576568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17488306 - 17488243
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  17488306 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 17488243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 17499788 - 17499725
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  17499788 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 17499725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19776089 - 19776007
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  19776089 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 19776007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Original strand, 22109926 - 22110033
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||  ||||||||||||||  |  |||| | ||||||    
T  22109926 ttaagttgaactttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctgtgagtgtttgaaaatgga 22110025  T
Q  143 tttttggg 150  Q
    ||||||||    
T  22110026 tttttggg 22110033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 37439421 - 37439503
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  37439421 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 37439503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 606135 - 606173
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  606135 tgaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgag 606173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12340219 - 12340138
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  12340219 agttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 12340138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 20698202 - 20698251
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20698202 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 20698251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856145
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctatt-gttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaaga 856145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13442724 - 13442660
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  13442724 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaa 13442660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077589
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaaga 23077589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Original strand, 23083132 - 23083176
Alignment:
Q  162 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  23083132 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 23083176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 47 - 502
Target Start/End: Original strand, 22921521 - 22921976
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  22921521 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaaccaggaatagtttaagaacgaattt 22921620  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttagg-ttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | || ||||||||||| | ||||| || |||||||||||  |||||    
T  22921621 ttgagagttagacttgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcctagttacagaatgccttgtttgggttaaatgcgatctttgtc 22921720  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgtt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22921721 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 22921820  T
Q  344 gttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgc 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||    
T  22921821 gttaatgttatataattgtatatacattatatgaattt-tg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgc 22921917  T
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33681469 - 33681022
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| ||    
T  33681469 ccttagatgtttttgagttcctgaa-tatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttgtga 33681371  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  33681370 gttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcacacga 33681271  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||    
T  33681270 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg 33681171  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  33681170 ttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgc 33681073  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681072 ctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 501
Target Start/End: Original strand, 52927642 - 52928076
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   |||  ||||| ||||||   ||    
T  52927642 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagattggagaatgagattgaacctggaaagattttggaatgaattttttaaag 52927741  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagt 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  52927742 ttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgaccagttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagt 52927841  T
Q  253 tgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgtt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||    
T  52927842 tgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt 52927941  T
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||            ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  52927942 atataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgtct 52928027  T
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928028 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 54 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22238089 - 22237642
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||   |||  |||| || ||||| |||    
T  22238089 ccttagatatttttgagtgcctgaacatgtctaataatggttaggaaagattggagaatgagattaaacctggaaagattttggaat-gaattttgtgag 22237991  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22237990 ttgcacttgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttttcgcacgag 22237891  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctg-ttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  || ||||    ||| |  | ||||||||  ||| |    
T  22237890 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaag 22237791  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||    
T  22237790 ttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcataatgc 22237693  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237692 ctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 159 - 497
Target Start/End: Original strand, 21861335 - 21861672
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||      |  ||||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  21861335 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgtgtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgt 21861434  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| ||||||    
T  21861435 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataa 21861534  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgtt 457  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21861535 ttgtatatacattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgtt 21861632  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861633 gctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20248734 - 20248293
Alignment:
Q  57 tagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga-atagtttaagaatggatttttgggagtt 154  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||| ||  |    
T  20248734 tagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagatcggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaatttttgtgaact 20248636  T
Q  155 acacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagtt 253  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  20248635 gaacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttatttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagtt 20248536  T
Q  254 gatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgtt 352  Q
    ||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||    ||| |||| | |||||||  ||||| |    
T  20248535 gatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgtc-cagtaagactgatgcatatgaatcca-tgttgtttataatgat 20248438  T
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  20248437 atataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 20248343  T
Q  453 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248342 atgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 407
Target Start/End: Original strand, 35981325 - 35981700
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  35981325 gtagttttgacctttaagtcgaacctt-gatgtttttgagtgcctgaact-tgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgggat 35981422  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggt 227  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| ||||    
T  35981423 agtttaagaacgaatttatgtgagttgcacctgaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggt 35981522  T
Q  228 taaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt 327  Q
    |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||  || ||||||||||| |||||    
T  35981523 taaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgt 35981622  T
Q  328 ataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 407  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35981623 atattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Original strand, 21896084 - 21896358
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  21896084 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatct---tgttgttgtttcagtaagc 21896180  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttg 417  Q
    ||||||  ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896181 ctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttg 21896279  T
Q  418 atattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896280 atattgttatatcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20637279 - 20636956
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 183  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20637279 taatgatgattaggaaagattggagattaagattgaacctggaatagtttaagaacgaatttttgtgagttgcacctgaactcgccatggcgagtagagg 20637180  T
Q  184 ccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaac 282  Q
    |  |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  20637179 ctctcgcctcgcgagctaatcagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaac 20637080  T
Q  283 taagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagttta 382  Q
    |||||| |||  |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  20637079 taagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatga-atta 20636981  T
Q  383 tgtttgatgtttgagatgttgttgac 408  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||    
T  20636980 tgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21754495 - 21754059
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg-aatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||| || | |||| ||||| |||||  | |    
T  21754495 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaaagagattgaacctgggaagacttta-gaatgaattttgtgaa 21754397  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
     | | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||       ||||||| | | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21754396 ctga-acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgttttacagactgccttgttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgag 21754298  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||    
T  21754297 ttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 21754198  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    |        |||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  21754197 t--------gtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 21754110  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754109 tatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Original strand, 16368112 - 16368388
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16368112 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagc 16368211  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  16368212 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgca-ttga 16368308  T
Q  419 tattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||  | |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368309 tattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20918956 - 20918620
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |     |||| ||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||    
T  20918956 ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtgttaaagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgacttgatgt 20918857  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||| ||||  |||| ||||||| || |    ||| |  | |||||| |  |||||||||||||    
T  20918856 gagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttatataa 20918757  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20918756 ttgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttg 20918662  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918661 cagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Original strand, 50613942 - 50614219
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  50613942 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagc 50614040  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50614041 ctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 50614139  T
Q  419 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614140 tattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Original strand, 50621770 - 50622047
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  50621770 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagc 50621868  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50621869 ctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 50621967  T
Q  419 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621968 tattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 49261690 - 49261448
Alignment:
Q  164 ctcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 262  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49261690 ctcgccatggcgaatagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagt 49261591  T
Q  263 tgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgt 362  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49261590 tgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgt 49261491  T
Q  363 atatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 407  Q
    |||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49261490 atatacattatat-aaattatg-ttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50686963 - 50686630
Alignment:
Q  164 ctcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagtt 263  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||   |   |  ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| |||||||    
T  50686963 ctcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccctgtgagacagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacgtgagtt 50686864  T
Q  264 gatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgta 363  Q
    |||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  50686863 gatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgta 50686764  T
Q  364 tatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg 461  Q
    ||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||  ||||    |||||||||||||| |    
T  50686763 tatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaact-attttatgaactgcctatgttgccg 50686666  T
Q  462 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686665 tttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 209 - 497
Target Start/End: Original strand, 41049851 - 41050138
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 308  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||    
T  41049851 acagaataccttgttaggttatatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgt 41049950  T
Q  309 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 408  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| |||  |||| | ||||| |||||||||||||||     
T  41049951 ttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttga-attatatatgatg-ttgagatgttgttgat 41050048  T
Q  409 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050049 ttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 276
Target Start/End: Original strand, 28194086 - 28194333
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  28194086 gtagttttgacctttaagtcgaaccttggatgtttttgagtgcctgaact-tgtatgatgatgattaggaaagattgtagattgagattgaacctgaaat 28194184  T
Q  129 agtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggt 227  Q
    |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  ||||||    
T  28194185 agtttaagaatgaatctttgtgagttgcacctgaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacaaaatgtcttgtttaggt 28194284  T
Q  228 taaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggta 276  Q
    || |||||||  |||||||||| | || | |||||||| ||| ||||||    
T  28194285 tacatgcgatctttgtcgcacgtgatgttatgagttgacctttgaggta 28194333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 346 - 496
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295652
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 14295601  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 496  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295602 actacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210325
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 50210310  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  50210311 ctaagttgatgaaga 50210325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 336 - 497
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261180
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaatt-atgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgc 35261118  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261119 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509789
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  34509800 agttgatgaaga 34509789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 43697830 - 43697712
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43697830 ttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctatttatgattagaaaagattctagattgagatttaacctggaatagtttaagaatgga 43697731  T
Q  143 tttttgggagttacacctg 161  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  43697730 ttttcgggagttacacctg 43697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 353 - 497
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45574989
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcc 45574944  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574945 tatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 337 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 16758828 - 16758664
Alignment:
Q  337 tgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--c 434  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  |    
T  16758828 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaac 16758730  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758729 tggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12271902 - 12271744
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||      |  ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  12271902 ctgaactctccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 12271803  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaag 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  12271802 gagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13988984 - 13988872
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13988887  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  13988886 ctaagttgattaaga 13988872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840773
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21840788  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  21840787 ctaagttgattaaga 21840773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 21923335 - 21923447
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923335 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21923432  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  21923433 ctaagttgattaaga 21923447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 23593779 - 23593891
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593779 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23593876  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  23593877 ctaagttgattaaga 23593891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31612430 - 31612319
Alignment:
Q  394 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612430 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 31612333  T
Q  494 taagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||    
T  31612332 taagttgattaaga 31612319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 21475131 - 21475243
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21475131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggt 21475228  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  21475229 ctaagttgattaaga 21475243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29298254 - 29298143
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298254 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29298158  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29298157 ctaagttgattaaga 29298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 433128 - 433018
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  433128 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggt 433033  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  433032 ctaagttgattaaga 433018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 27250731 - 27250834
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 27250829  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  27250830 agttg 27250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 401 - 507
Target Start/End: Original strand, 22123119 - 22123224
Alignment:
Q  401 ttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22123119 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 22123217  T
Q  501 attaaga 507  Q
    |||||||    
T  22123218 attaaga 22123224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29776806 - 29776694
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776806 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29776709  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  29776708 ctaagttgattaaga 29776694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 21026799 - 21026696
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026799 agatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21026701  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  21026700 agttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 413 - 500
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847259
Alignment:
Q  413 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22532388 - 22532278
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22532388 agatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtcta 22532290  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  22532289 agttgatgaaga 22532278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 335 - 497
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  335 aatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt-gacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-acctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatg 16093922  T
Q  434 --ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
      ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093923 agctg-ttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16362035 - 16361923
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16361938  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16361937 ctaagttgattaaga 16361923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454665
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 20454665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 433467 - 433312
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| | | || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  |||||||     
T  433467 ccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttgggaa 433368  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagtt 208  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  433367 tctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagtt 433312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21707325 - 21707173
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21707325 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21707228  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707227 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21707173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 353 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21711867 - 21711715
Alignment:
Q  353 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21711867 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21711770  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711769 tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 21711715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 13212917 - 13213018
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212917 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 13213014  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  13213015 aaga 13213018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860165
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatt 15860161  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  15860162 aaga 15860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 16275419 - 16275520
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16275419 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatt 16275516  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  16275517 aaga 16275520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21342102
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21342106  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  21342105 aaga 21342102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21347068 - 21346967
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347068 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21346971  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  21346970 aaga 21346967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 463
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130975
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttggat 22130957  T
Q  446 actgcctatgttgctgtt 463  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130958 actgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 22468698 - 22468808
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | || |||||||| | ||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22468698 agatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtcta 22468796  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  22468797 agttgattaaga 22468808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 440 - 490
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801483
Alignment:
Q  440 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 490  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21161932 - 21161730
Alignment:
Q  295 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgttt 394  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||| |||| |     
T  21161932 cttgctgttgatgttccagtgagcctaatttgtttaatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatga-tttatgtt-gatgata 21161835  T
Q  395 gagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 494  Q
      || |||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||     
T  21161834 t-gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatcc 21161738  T
Q  495 aagttgat 502  Q
    ||||||||    
T  21161737 aagttgat 21161730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 206
Target Start/End: Original strand, 50209885 - 50210027
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttgggagttacacctga 162  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||  | |||||| | |   ||||||    
T  50209885 tttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaacttttggaattctgacctga 50209983  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  50209984 actcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 50210027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 21861132 - 21861250
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||| | || ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | |    
T  21861132 gtagttttgacccttaagttgatctttagatgattctgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaa 21861231  T
Q  130 gtttaagaatggatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  21861232 gtttaaaaatggatttttg 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26065295 - 26065238
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26065295 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 26065238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34510239 - 34510087
Alignment:
Q  55 cttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagt 153  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| | |||||| | |    
T  34510239 cttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaacttttggaaat 34510140  T
Q  154 tacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
       |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  34510139 ctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcacgagtgacccag 34510087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 21895870 - 21895989
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||||| | || ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| | |    
T  21895870 gtagttttgacccttaagttgatctttagatgattatgagtgcctgaacaagtataataatgattaggaaagtttttagattgagattgaacctgggaaa 21895969  T
Q  130 gttt-aagaatggatttttg 148  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  21895970 gtttaaaaaatggatttttg 21895989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389160
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgatt 40389164  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  40389163 aaga 40389160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16759209 - 16759091
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||   | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | |    
T  16759209 gtagttttgacccttaagtcgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacacgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaa 16759110  T
Q  130 gtttaagaatggatttttg 148  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  16759109 gtttaaagatggatttttg 16759091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 22355839 - 22355921
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  22355839 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 22355921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 22357525 - 22357607
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  22357525 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 22357607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064959
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgca 444  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| || || | |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||  |  ||||       
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaatt-atatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21342631 - 21342513
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||| |     
T  21342631 gtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctgggaa 21342533  T
Q  129 agtttaagaatggatttttg 148  Q
    | ||| | ||||||||||||    
T  21342532 aattttaaaatggatttttg 21342513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21347496 - 21347378
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||| |     
T  21347496 gtagttttgacccttaagttgaaccttagatgattttgagtgtctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctgggaa 21347398  T
Q  129 agtttaagaatggatttttg 148  Q
    | ||| | ||||||||||||    
T  21347397 aattttaaaatggatttttg 21347378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714551
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaaga 21714551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22532729 - 22532577
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| | |||||| |     
T  22532729 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaggattgtagaatgaacttttggaaa 22532630  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    |   || ||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22532629 tctgacttgaactcgccacggtgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 22532577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26065441 - 26065357
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  26065441 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 26065357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130639
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 51130639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20135306 - 20135196
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||| || | ||| |  ||||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  20135306 agatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttgtttaactaagttgcatgagtcagtcta 20135208  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  20135207 agttgattaaga 20135196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16381538 - 16381388
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |  ||| ||||| | | |||||||| |    ||||| |||| || |||||||||||||    
T  16381538 tgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagtccctgagtgacagactgccttgttagggttttagcgattcttggcgtacgagttgatgtg 16381439  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgttt 310  Q
    |||||||| |   |||||| ||||||||||||| | || || |||||||||    
T  16381438 agttgatcatgagggtaagaaactaagttgtttatatttctattgttgttt 16381388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 27250394 - 27250476
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  27250394 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgggattgaacctggaat 27250476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 35260852 - 35260898
Alignment:
Q  165 tcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35260852 tcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtttcccagttaca 35260898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50687097 - 50687031
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  50687097 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 50687031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Original strand, 16367881 - 16367968
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  16367881 ttttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagaatgaacctggaaaagtttaaagatggatttttggg 16367968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20919051 - 20918990
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg 124  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  20919051 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 20918990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16759005 - 16758949
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  16759005 ctgaactcgccatagcaagtagaggccctcacctcgcgagttgcctagttacagaat 16758949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Original strand, 35260729 - 35260813
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  35260729 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtttaaaaatggatttttggg 35260813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 1924914 - 1924996
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1924914 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1924996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 128
Target Start/End: Original strand, 20846891 - 20846966
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20846891 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggtaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20846966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 20923928 - 20924010
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  20923928 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 20924010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Original strand, 41049619 - 41049726
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||| | |||| |    
T  41049619 ttaagtcgaaccttagatgtttctgagtgcctgaacatgtataataatggttaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttgaaaatgaa 41049718  T
Q  143 tttttggg 150  Q
    ||||||||    
T  41049719 tttttggg 41049726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 38801056 - 38801138
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  38801056 agttgaactttagatgtctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgtgattgaacctggaat 38801138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Original strand, 38801157 - 38801199
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  38801157 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt 38801199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12271676 - 12271639
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12271676 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 22354338 - 22354387
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  22354338 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtgacccag 22354387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 16093508 - 16093572
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttg 148  Q
    ||||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  16093508 taataatgatttggcaagtttttagattgagattgaacctggaaaagttaaaaaatggatttttg 16093572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24087842 - 24087730
Alignment:
Q  86 ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggcc 185  Q
    |||||||||||  ||  || |||| |||||||||||  |||||||  | |||||||||| ||| | |||  |||  |||||||| ||||||||||||||     
T  24087842 ataatgattaggcaaagttttagactgagattgaactcggaatagagtcagaatggattcttgagtgttttaccctaactcgccgtggcgagtagaggct 24087743  T
Q  186 atcgcctcgcgag 198  Q
     ||||||||||||    
T  24087742 ctcgcctcgcgag 24087730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 507
Target Start/End: Original strand, 5760 - 6235
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    |||| |||| || |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| | ||||    
T  5760 gtagatttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtacctgaacatgtataataatgattaggaaaaattgtagattgagattgaaccagtaata 5859  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggtt 228  Q
    ||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  5860 gtttaaggatggatttt-gtgatttgcacctgaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggtt 5958  T
Q  229 aaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgta 328  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5959 aaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgta 6058  T
Q  329 taatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  6059 taatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttata 6157  T
Q  429 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158 tcatgat-gatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 130359 - 129919
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  130359 gtttttgagtgcctgaacatgtctagttatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggaattacacct 130260  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
     |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || | ||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  130259 aaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 130160  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||   |||||||||||||    
T  130159 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataat 130060  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  130059 tgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 129962  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129961 tgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 389 - 497
Target Start/End: Original strand, 60710 - 60818
Alignment:
Q  389 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 486  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  60710 atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 60807  T
Q  487 gtcggtctaag 497  Q
    |||||| ||||    
T  60808 gtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 60479 - 60536
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  60479 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaat 60536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Original strand, 60312 - 60396
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  60312 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacatgggaaagtttaaaaatggatttttggg 60396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19726 - 19278
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||  | |    
T  19726 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaggattggagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaatttttatgtg 19627  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  19626 ttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatccttgtcgcacaag 19527  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19526 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatg 19427  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19426 gtatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgc 19330  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19329 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 507
Target Start/End: Original strand, 666 - 1146
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattga------acct 123  Q
    |||| |||| || |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||      ||||    
T  666 gtagatttgacctttaagttgaatcttagatgtttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggaaagattgtagattgagattgagattgaacct 765  T
Q  124 ggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt 223  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||    
T  766 gtaatagtttaaggatggatttt-gtgagttgcacctgaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtt 864  T
Q  224 -aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 322  Q
     ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||| || || || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  865 taggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctga 964  T
Q  323 attgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatatt 422  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||    
T  965 attgta-aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgtt 1062  T
Q  423 gttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| | | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063 gttatatcatgat-gatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 62 - 502
Target Start/End: Original strand, 2313 - 2752
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacct 160  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | | || ||||||||| ||||    
T  2313 gtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggattagtt-aagaacgtacttgtgggagttatacct 2411  T
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  2412 gaactcgccatggcgagtagaggccattgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 2511  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2512 agttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 2611  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  2612 ttgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgat-gatttacatactgcctatgttg 2708  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2709 atgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25176309 - 25175864
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25176309 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattaggaaaggttggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacagattt 25176210  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcg 245  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| | |||||    ||     |||  ||||||    
T  25176209 ttgagagttagacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcgcagttacagaatgccttgtt----ta-----gatctttgtcg 25176119  T
Q  246 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttg 344  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  25176118 cacgaattgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 25176019  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||    
T  25176018 ttaatgttatataattatatatacgttatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgca 25175922  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25175921 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 64 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 28406429 - 28405990
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 162  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||  | ||||| ||  |  ||||||    
T  28406429 ttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagattggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaataaaattttgtgaactgaacctga 28406330  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 261  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||      |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406329 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgag 28406230  T
Q  262 ttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 360  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406229 ttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataatt 28406130  T
Q  361 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||||||||||  |||| || |   ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28406129 gtatatacattttatgaattaa--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgct 28406032  T
Q  461 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406031 gtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 160 - 497
Target Start/End: Original strand, 7499 - 7835
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |    ||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  7499 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaatacttggttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtg 7598  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  7599 agttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataat 7698  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7699 tgtatatacattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttg 7796  T
Q  459 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7797 ctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 158 - 501
Target Start/End: Original strand, 18786667 - 18787009
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  |||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||||    
T  18786667 cctgaacttgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagagacagaacactttgttaggtctaatgtgacttttgtcgcacgagttgatg 18786766  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  18786767 tgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatata 18786866  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  18786867 gttgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactgg-tttgcatactacctatg 18786963  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786964 ttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23207634 - 23207296
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  23207634 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttgcccagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatg 23207535  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||    
T  23207534 tgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatata 23207435  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
    | ||||||| ||||||||||  |||| | | ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  23207434 aatgtatatgcattacatga-attatttataatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatg 23207338  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207337 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23791570 - 23791292
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23791570 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagc 23791471  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23791470 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 23791372  T
Q  419 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||| ||||||||||  || |||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23791371 tatttttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 348 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679594
Alignment:
Q  348 atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatac 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatac 7679654  T
Q  448 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7679653 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaaga 7679594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 215
Target Start/End: Original strand, 23708257 - 23708441
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |  |||| |||||||||| | ||||||    
T  23708257 gtagttttgacccttgagttgatctttagatgtttttgagtgtctgaacatatgtattaatgattaggaaagttcgtagattgagattgaatc-ggaata 23708355  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23708356 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaat 23708441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25109184 - 25108906
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  25109184 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 25109085  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||| ||   |||||    
T  25109084 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttga 25108986  T
Q  419 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108985 tattgttatatcatgaact-attttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22105531 - 22105418
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105531 ttgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22105433  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  22105432 ctaagttgattaaga 22105418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 495
Target Start/End: Original strand, 22133878 - 22134306
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct-ggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||  | |    
T  22133878 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctaggaagacttta-gaatgaattttgtgaa 22133976  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     | |   ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |      |||||||| | | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22133977 ctgaa--ctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacga 22134074  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  || || ||||||| ||||  || || ||  | || ||||||         
T  22134075 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactga--tgcat-atgaattggtgttgt----- 22134166  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    |||||   |||||||||||||| ||| | ||||| |||||   ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||    
T  22134167 ttataatgttgtatatacattaaatg-gattatg-ttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgat-gatttgcatactgc 22134262  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134263 ctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 430
Target Start/End: Original strand, 22459327 - 22459598
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||      |  ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||  ||||||||||||    
T  22459327 ctgaactcgccatagcgagtagaggctcttgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgt 22459426  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||  |  | ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22459427 gagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataa 22459526  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22459527 ttgtatatacattacttgagttatatg-tgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 298816 - 298927
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298816 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  298916 agttgattaaga 298927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 336 - 501
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708725
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||     
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgt 23708659  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708660 tg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 346 - 500
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072054
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 23071999  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttg 23072054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23060632 - 23060522
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060632 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23060534  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  23060533 agttgatgaaga 23060522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6726113 - 6726001
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726113 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 6726016  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  6726015 ctaagttgattaaga 6726001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22337238 - 22337124
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22337238 tttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 22337140  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22337139 tctaagttgatgaaga 22337124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23076561 - 23076451
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076561 agatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23076463  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||| ||| ||||    
T  23076462 agtggatgaaga 23076451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 571515 - 571403
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  571515 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 571418  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  571417 ctaagttgattaaga 571403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18809061 - 18808949
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809061 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 18808964  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  18808963 ctaagttgattaaga 18808949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23130980 - 23130868
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130980 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23130883  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  23130882 ctaagttgattaaga 23130868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23133447 - 23133335
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23133350  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  23133349 ctaagttgattaaga 23133335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23135708 - 23135596
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135708 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23135611  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  23135610 ctaagttgattaaga 23135596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 23709576 - 23709688
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709576 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23709673  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  23709674 ctaagttgattaaga 23709688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 23712057 - 23712169
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712057 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 23712154  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  23712155 ctaagttgattaaga 23712169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26505497 - 26505385
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26505400  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  26505399 ctaagttgattaaga 26505385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26507975 - 26507863
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507975 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 26507878  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  26507877 ctaagttgattaaga 26507863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 32214965 - 32215077
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214965 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 32215062  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  32215063 ctaagttgattaaga 32215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 34402566 - 34402678
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402566 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 34402663  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  34402664 ctaagttgattaaga 34402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 39682431 - 39682319
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682431 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 39682334  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  39682333 ctaagttgattaaga 39682319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 19671998 - 19671848
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  19671998 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcat 19671901  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19671900 actgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 393 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 24367892 - 24367782
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367892 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 24367795  T
Q  493 ctaagttgattaa 505  Q
    |||||||||||||    
T  24367794 ctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 21155104 - 21155216
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155104 ttgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 21155201  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  21155202 ctaagttgattaaga 21155216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28577217 - 28577105
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577217 ttgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28577120  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  28577119 ctaagttgattaaga 28577105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 24898239 - 24898352
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24898239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24898336  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  24898337 tctaagttgattaaga 24898352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 24900722 - 24900835
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24900722 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24900819  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  24900820 tctaagttgattaaga 24900835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 24903199 - 24903312
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24903199 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24903296  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  24903297 tctaagttgattaaga 24903312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 24905676 - 24905789
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24905676 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24905773  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  24905774 tctaagttgattaaga 24905789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 24908151 - 24908264
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaact-aagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24908151 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaaagctgcatgagtcgg 24908248  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  24908249 tctaagttgattaaga 24908264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 497
Target Start/End: Original strand, 20520145 - 20520295
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 443  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||||      
T  20520145 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactg-ttttat 20520241  T
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
     |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520242 gtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 32039542 - 32039654
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32039542 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggt 32039639  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  32039640 ctaagttgattaaga 32039654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 43137417 - 43137305
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| | | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 43137320  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  43137319 ctaagttgattaaga 43137305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 415 - 500
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38219
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 398 - 507
Target Start/End: Original strand, 22731238 - 22731346
Alignment:
Q  398 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22731238 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaac 22731336  T
Q  498 ttgattaaga 507  Q
    ||||| ||||    
T  22731337 ttgatgaaga 22731346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 497
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat--tgttatatcatg 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatg 22413175  T
Q  434 --ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
      ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413176 agctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 45029898 - 45030010
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029898 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 45029995  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  45029996 ctaagttgattaaga 45030010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 438 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23285942 - 23285874
Alignment:
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23285942 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23285874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309127
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20309129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23660141 - 23660032
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  23660141 agatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtcta 23660044  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  23660043 agttgatgaaga 23660032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 24529573 - 24529685
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529573 ttgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggt 24529670  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  24529671 ctaagttgattaaga 24529685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 497
Target Start/End: Original strand, 32451949 - 32452031
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451949 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23076910 - 23076726
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  23076910 ttaagttgatccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataataattaggaaagaatgtaggatgagattggacctggaa-agatttagaatgaa 23076812  T
Q  143 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 228  Q
      ||||| | |   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||    
T  23076811 actttggaattctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggtt 23076726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103497
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 23103492  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  23103493 ctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 497
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697709
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaa 24697646  T
Q  434 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697647 ct-gtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 22738182 - 22738291
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738182 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22738279  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  22738280 agttgatcaaga 22738291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23660482 - 23660307
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  ||| |||     
T  23660482 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaacttttggaa 23660383  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 228  Q
    |   |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||| ||||||  ||||| | | ||||||||||    
T  23660382 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgtgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtt 23660307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38967493 - 38967380
Alignment:
Q  393 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38967493 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgt-tgtgtcgatgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 38967396  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  38967395 tctaagttgattaaga 38967380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 298476 - 298629
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| || || ||||||  | || |||||    
T  298476 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatataggatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaacttgtggga 298574  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  298575 ttctgacctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 298629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 437 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8946735 - 8946666
Alignment:
Q  437 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8946735 gttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8946666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 387 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23004878 - 23004767
Alignment:
Q  387 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 484  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||   |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23004878 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaacta-ttttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 23004780  T
Q  485 gagtcggtctaag 497  Q
    |||||||| ||||    
T  23004779 gagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 507
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643106
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24643106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 23654388 - 23654491
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| ||  |||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  23654487 agttg 23654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 507
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040301
Alignment:
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23040301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Original strand, 23071617 - 23071695
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg 124  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23071617 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 23071695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 18786446 - 18786566
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||   | || || |||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | |    
T  18786446 gtagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacacgtatattattgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaa 18786545  T
Q  130 gtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  18786546 gtttaaaaatggatttttggg 18786566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22337544 - 22337422
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttac-acctgaactcgccatggcgagtagag 182  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| || || |||||| |  |||  |||||   ||||||| |||||| |||||||||||    
T  22337544 taataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaactttttgagttctgacctgaattcgccacggcgagtagag 22337446  T
Q  183 gccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||    
T  22337445 gctctcgcctcgcgagtgacccag 22337422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 25616304 - 25616194
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25616304 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtcta 25616206  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  25616205 agttgattaaga 25616194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Original strand, 22412733 - 22412817
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  22412733 tgagtgcctgaac-atgtatgataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 22412817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 22730894 - 22730968
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  22730894 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 22730968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Original strand, 22737841 - 22737911
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct 123  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  22737841 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatatctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacct 22737911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 23654064 - 23654146
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  23654064 agttgaaccttagatgcttttgactgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 23654146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 22412900 - 22412953
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22412900 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttaca 22412953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 446 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23207801 - 23207717
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||    
T  23207801 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctaggaaagtttaaaaatggatttttggg 23207717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1283748 - 1283666
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1283748 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1283666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 30344776 - 30344858
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  30344776 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 30344858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23286317 - 23286235
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||    
T  23286317 agttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacatggaat 23286235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27754035 - 27753961
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  27754035 ccttagatgcttttgagtgcctcaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 27753961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 32451590 - 32451744
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttt-tggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||| |||||   ||  |||||| |  || |||||    
T  32451590 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggagagaatgtaggatgagattgaacatggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 32451689  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  32451690 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 32451744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 37787 - 37863
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgatta-gaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  37787 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaga-tgtaggatgagattgaacctggaat 37863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 20519957 - 20520014
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  20519957 cctgaagtcgccatagcgtgtagaggctctcgcctcgcgagttgcctagttacagaat 20520014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20309523 - 20309479
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20309523 taataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 20309479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Original strand, 20519790 - 20519874
Alignment:
Q  67 tgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||    
T  20519790 tgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacatgggaaagttaaaaaatggatttttggg 20519874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  162 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 64 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 6987 - 6549
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttt-tgggagttacacctg 161  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||| |||||    
T  6987 ttttgagtgcctggacatgtctaataataattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaaacttgtgggagttatacctg 6888  T
Q  162 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6887 aactcgccatggcgagtggaggccctcccctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtga 6788  T
Q  261 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6787 gttgatcttagaggttaaaaactaagttgtta-tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataat 6689  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 459  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  6688 tgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgc 6592  T
Q  460 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6591 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 159 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8824 - 8481
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      |  ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  8824 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgt 8725  T
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||| |  | ||||||||  |||||| ||||||    
T  8724 gaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataa 8625  T
Q  359 t--tgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatg 455  Q
    |  |||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8624 tattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatg 8527  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8526 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 31 - 495
Target Start/End: Original strand, 7695 - 8161
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  7695 gtagttttgatccttaagttgaaccttagatgtttttgagtgtctgaacatgtgtaataatgattaggaaagatcctagactgagattgaacctagaata 7794  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtta 229  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||    
T  7795 gtttaagaatgaatttttgggggttacacctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccttgttccagaatgccttgctaggtta 7894  T
Q  230 aatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat 329  Q
    ||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||  | |||    
T  7895 aatgcgatctttgtcgcaagaattgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatat 7994  T
Q  330 aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata 428  Q
     || | ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||| | || |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  7995 gatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttga-attatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattata 8093  T
Q  429 tcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8094 tcatgagct-gatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 84 - 502
Target Start/End: Original strand, 39864 - 40281
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagagg 183  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39864 taataatggttaggaaagattggagattgacattcaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggagttatacctgaacttgccatggcaagtagagg 39963  T
Q  184 ccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaac 282  Q
    |  |||||||||||| || | ||||||| ||| | || || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  39964 ctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaac 40063  T
Q  283 taagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagttt 381  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  40064 taagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-att 40162  T
Q  382 atgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 481  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40163 atg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctg 40260  T
Q  482 catgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  40261 catgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 226 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 100662 - 100388
Alignment:
Q  226 gttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 325  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  100662 gttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaatt 100563  T
Q  326 g-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgt 424  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  || |||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  100562 aatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaatt-atgtta-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattat 100465  T
Q  425 tatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100464 tatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 101854 - 101599
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga-atagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| |||||  | |    
T  101854 ccttagaagtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaattttgtgaa 101756  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
     ||  ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||      |||| ||| | ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  101755 cttg-acctgaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgggagtacttgtgttatagactgtcttgtttaggttaaatgtgatccttgtcgcacga 101657  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  101656 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg-ttctcttgttgttgttgtt 101599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 17484 - 17596
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 17581  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  17582 ctaagttgattaaga 17596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 94529 - 94417
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  94529 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 94432  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  94431 ctaagttgattaaga 94417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 44460
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44573 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 44476  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  44475 tctaagttgattaaga 44460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 443 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119891
Alignment:
Q  443 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 119891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 439 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101513
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 161145 - 160698
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga-atagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | | |||| ||||| ||||||| ||    
T  161145 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggagagacttta-gaatgaatttttgtga 161047  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
      |  ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| || | ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  161046 actgaacctgaagtcgccatggcgagtagaggctctcacctcacgaggtaactagttacagaatgtcttggttaggataaatgtgatctttgtcgcacga 160947  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||    
T  160946 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg 160847  T
Q  351 ttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgc 450  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  160846 ttatataattgtatatatattacatgactt-atgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgc 160750  T
Q  451 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160749 ctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 501202 - 501090
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  501202 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 501105  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  501104 ctaagttgattaaga 501090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 85635 - 85736
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  85635 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatt 85732  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  85733 aaga 85736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 143
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||| |||    
T  590 ccttagacttttttgagtgcctaaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacttggaaagattttagaatgaatttttgtgag 491  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  490 ttgcacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgtacgag 391  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||| || ||||    ||| |  | ||||||||  |||| |    
T  390 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttg-ttatcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttataatat 292  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  291 tatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcc 194  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  193 tatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 135 - 501
Target Start/End: Original strand, 10283 - 10647
Alignment:
Q  135 agaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  || |||||| | | | ||||||||||||||||    
T  10283 agaatgaatttttgtgagttacacctgaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtcctgttacatactgccttgttaggttaaatgc 10382  T
Q  235 gatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct 334  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| |  |    
T  10383 gatctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatt 10482  T
Q  335 aatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||     
T  10483 gatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 10581  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10582 tgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 10228 - 10289
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatga 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10228 accttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagtaaagattttagaatga 10289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Original strand, 45450 - 45899
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg-aatagtttaagaatggatttttgg- 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| || | |||| ||||| |||||| |     
T  45450 ccttagatgtttttgagtgcctgaa-tatgtctaataatgattaggaaagattggggaatgagattgaacctggtaagacttta-gaatgaattttttgt 45547  T
Q  150 gagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcac 248  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  45548 gaattgtacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcac 45647  T
Q  249 gagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||    
T  45648 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataa 45747  T
Q  349 tgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatact 448  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45748 tgttatataattgtatatacatcacatgaatt-atgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatact 45845  T
Q  449 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45846 gcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 158 - 501
Target Start/End: Original strand, 7841 - 8180
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7841 cctgaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacaaaatgccttgttagggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatg 7940  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  7941 tgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgc---tgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatata 8037  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
     |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  8038 gttgtatatacattacatga-attatatatgatg-ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgtatactgcctatg 8134  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8135 ttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 206 - 469
Target Start/End: Original strand, 29093 - 29354
Alignment:
Q  206 gttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgt 305  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||      
T  29093 gttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaa 29192  T
Q  306 tgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgtta---atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 402  Q
    |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||   |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||   |||    
T  29193 tgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatga-cttaagtttgataattga---gtt 29288  T
Q  403 gttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttat 469  Q
    | ||| ||||||| |||||| |||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29289 gctgatttacattcgatattattatatcatgatag-tttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 123
Target Start/End: Original strand, 28935 - 29011
Alignment:
Q  48 gttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct 123  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28935 gttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct 29011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 222 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 13058 - 12780
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13058 ttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctg 12959  T
Q  322 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat 421  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  12958 aattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatat 12860  T
Q  422 tgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12859 tgttatatcatgat-gatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 205 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 1091
Alignment:
Q  205 agttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttg 304  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  1391 agttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttg 1292  T
Q  305 ttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgt 404  Q
    ||||| ||||||| ||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  1291 ttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatga-attatgtttgatgtttgaaatgttga 1193  T
Q  405 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 504  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1192 tgacctgtattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1094  T
Q  505 aga 507  Q
    |||    
T  1093 aga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 325
Target Start/End: Original strand, 15481 - 15764
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15481 ttaagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaacatgtataatgatgattaggaaagattatagattgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 15580  T
Q  143 tttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatactt 241  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||  ||    
T  15581 tttttcggaattacacatgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttatgttaaatgtgatcttt 15680  T
Q  242 gtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15681 gtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 507
Target Start/End: Original strand, 15763 - 15889
Alignment:
Q  380 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 479  Q
    ||||||||||||| |  |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15763 ttatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 15861  T
Q  480 tgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862 tgcatgagtcggtctaagttgattaaga 15889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178903
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaaga 178903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 222 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5934 - 5657
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5934 ttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctg 5836  T
Q  322 aattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 420  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  5835 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgata 5738  T
Q  421 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5737 ttgttatatcatgatgatttt-catactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 6053 - 5966
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg 140  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6053 ccttagatgtttttgagtgcctgaacaggtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacttggaatagtttaagaatg 5966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 8)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Original strand, 136132 - 136471
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||    
T  136132 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatg 136231  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatat 356  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  136232 tgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatat 136331  T
Q  357 aattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctat 454  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||    
T  136332 agttgtatatacattacatga-attatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctat 136428  T
Q  455 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136429 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Original strand, 144840 - 145179
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||    
T  144840 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatg 144939  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatat 356  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  144940 tgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatat 145039  T
Q  357 aattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctat 454  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||    
T  145040 agttgtatatacattacatga-attatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctat 145136  T
Q  455 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145137 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174785
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 174790  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  174789 ctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 446 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121775
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 121775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 63021 - 62913
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| |||    
T  63021 ccttagatgtttttgagtgcatgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaatattttagaatgaatttttgtgag 62922  T
Q  153 ttacacctg 161  Q
    || ||||||    
T  62921 ttgcacctg 62913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Original strand, 135942 - 136049
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||| | ||||||||||  | ||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  135942 ttaagtcgaaccttagaggactctgagtgcttgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaa 136041  T
Q  143 tttttggg 150  Q
    ||||||||    
T  136042 tttttggg 136049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Original strand, 144650 - 144757
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||| | ||||||||||  | ||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  144650 ttaagtcgaaccttagaggactctgagtgcttgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaa 144749  T
Q  143 tttttggg 150  Q
    ||||||||    
T  144750 tttttggg 144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 124940 - 124891
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  124940 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 124891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Original strand, 2464 - 2913
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||   ||| |||||| | |||  | |     
T  2464 ccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagtttgaacctgtaaagattttagaatgaaatttgtgaac 2563  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  2564 tga-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggaaaaatgtgatccttgtcgcacgag 2662  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2663 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatg 2762  T
Q  351 ttatataattg----tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcata 446  Q
       ||||||||    ||||||||||  |||| || |    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  2763 --gtataattgtatatatatacattttatgaattaa--gctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgat-gatttgcata 2857  T
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2858 ctgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 187 - 501
Target Start/End: Original strand, 22467 - 22776
Alignment:
Q  187 tcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaa 285  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22467 tcgccttgcgaatgacccagttacagaaagtcttgcttatgctaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaa 22566  T
Q  286 gttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 385  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  || ||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22567 gttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactga--tgcatattg--atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgt 22661  T
Q  386 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 485  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22662 ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatg 22760  T
Q  486 agtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||||||    
T  22761 agtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 82190 - 82078
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  82190 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggt 82093  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  82092 ctaagttgattaaga 82078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 203 - 502
Target Start/End: Original strand, 14506 - 14804
Alignment:
Q  203 ccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctg 301  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  14506 ccagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctg 14605  T
Q  302 ttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatg 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  14606 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatg 14703  T
Q  401 ttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||| || |||| ||||||  ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14704 ttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgatttt-cttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12924 - 12587
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||    
T  12924 cctgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggatg 12825  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||  |||||| |||||    
T  12824 tgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatata 12725  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| |  | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12724 attgtatatacattac-tgaattatatataag-tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgt 12628  T
Q  457 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12627 tgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Original strand, 15276 - 15422
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatag-tttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| |  ||||||    
T  15276 ccttagatgcttttgagtgcctgaa-tatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctgg-atagattttagaatgaaactttggg 15373  T
Q  151 agttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    | |   ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15374 aatctgacctgaactcgccatagcgagcagaggctctcgcctcgcgagt 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13124 - 13007
Alignment:
Q  34 gttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtt 132  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| | | | || ||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||  | ||||    
T  13124 gttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaccatgtatattaatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtt 13025  T
Q  133 taagaatggatttttggg 150  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13024 taaaaatggatttttggg 13007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 501
Target Start/End: Original strand, 103403 - 103737
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||    
T  103403 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatg 103502  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  103503 tgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgta 103602  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| ||||||      |||||||   || ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| |||||||    
T  103603 gttgtatatacattacatga-attatgtatgatgt------tgttgtt---ttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgt 103692  T
Q  457 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  103693 tgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 150
Target Start/End: Original strand, 103234 - 103341
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga 142  Q
    |||||| | |||||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |    
T  103234 ttaagtcgaaccttagaggattctgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatgaa 103333  T
Q  143 tttttggg 150  Q
    ||||||||    
T  103334 tttttggg 103341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 230 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 62479 - 62216
Alignment:
Q  230 aatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-ta 328  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  62479 aatgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtta 62380  T
Q  329 taatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata 428  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||   | |||| |||||| |||||    
T  62379 tgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattata 62285  T
Q  429 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62284 ccatgat-gtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 133113 - 132672
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    || |||||| | ||||| ||     
T  133113 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaaattttgtgaa 133014  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
     |  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||       ||||| ||| | ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  133013 ctgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtcttacataatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgag 132914  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||    
T  132913 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 132814  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    | ||      ||||||||||| ||| | ||||| |||||  |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |     
T  132813 tgta------tatatacattaaatg-gattatg-ttgataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactact 132723  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 136798 - 136686
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  136798 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 136701  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  136700 ctaagttgattaaga 136686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 139267 - 139155
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  139267 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 139170  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  139169 ctaagttgattaaga 139155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 144205 - 144093
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  144205 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 144108  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  144107 ctaagttgattaaga 144093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 134329 - 134217
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  134329 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 134232  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    ||| |||||||||||    
T  134231 ctatgttgattaaga 134217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 141736 - 141624
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  141736 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 141639  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  141638 ctaagttgattaaga 141624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Original strand, 19649 - 19987
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||     
T  19649 cctgaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgata 19748  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || | ||||| ||  |||||| |||||    
T  19749 tgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatata 19848  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  19849 aatgtatatgcattacatgag-ttatttatgatg-ctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatg 19945  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19946 ttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40031 - 39922
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40031 agatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtcta 39934  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  39933 agttgatgaaga 39922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40268 - 40198
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggt 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| | | |||||||||    
T  40268 acctgaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggt 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49021
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  48939 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 49021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 161 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15670
Alignment:
Q  161 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |     |||||||||| | || ||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttttgtgttacagaatgcctttttaggtggaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtga 15912  T
Q  261 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 360  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  || | ||||||| |||| |  ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  15911 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttatataatt 15812  T
Q  361 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  15811 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgtatactgcctatgttgct 15717  T
Q  461 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15716 gtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaaga 15670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16118 - 16047
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg 124  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16118 ccttagatgcttttgagtgcctgaa-tatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctg 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 147
Target Start/End: Original strand, 17909 - 18021
Alignment:
Q  36 tttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||| |  ||||    
T  17909 tttgtcccttaagttgaaccttagataattttgagtgcatgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgggaaggttt 18007  T
Q  134 aagaatggattttt 147  Q
    || |||||||||||    
T  18008 aaaaatggattttt 18021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 206 - 458
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  206 gttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttg 304  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||    
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  305 ttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg 403  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||    
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-attatg-ctgatatttgagatgttg 2227  T
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  2228 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 219 - 497
Target Start/End: Original strand, 6108 - 6386
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  6108 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagc 6207  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6208 ctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 6306  T
Q  419 tattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6307 tattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 497
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 53395 - 53651
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||    
T  53395 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgt 53494  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggt 438  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| | || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  53495 tgtttataatgtgatataattgtatatacattacttga-attatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgt 53592  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53593 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Original strand, 53113 - 53230
Alignment:
Q  35 ttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttt 133  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  53113 ttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacaagtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagttt 53212  T
Q  134 -aagaatggatttttggg 150  Q
     || ||||||||||||||    
T  53213 aaaaaatggatttttggg 53230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 265
Target Start/End: Original strand, 7948 - 8167
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||  | |||||| |  |    
T  7948 agttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaatattgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agacttagaatgaaact 8046  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    ||||    |  | | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||    
T  8047 ttggagaatctaacagaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtc 8146  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttga 265  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  8147 gcacgagttgatatgggttga 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 199
Target Start/End: Original strand, 53314 - 53354
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53314 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 53354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 160 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38672 - 38339
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||       |  ||||||| | ||||| ||||||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  38672 tgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgtgagacagaataccttgttgggttaaatgagacctttatcgcacgagttgatgtg 38573  T
Q  260 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 359  Q
    ||||||||   | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||   ||||||| |||||      
T  38572 agttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatata 38473  T
Q  360 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgtt 457  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  38472 tgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgtt 38375  T
Q  458 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38374 gctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9536 - 9133
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat-agtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||    
T  9536 ccttagatgcttttgagtgcctgaacaagtctaataacgattaggaaagaatgtagagtgagattggacctggaaagagttta-gaatgaatttttgtga 9438  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
      |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9437 actgaacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgtcgcacgag 9338  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  |  | |||||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  9337 ttgttgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgt 9239  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    || | || |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||    
T  9238 taaacaaatgtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcc 9143  T
Q  452 tatgttgctg 461  Q
    ||||||||||    
T  9142 tatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 34587 - 34139
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | |||||| |  |    
T  34587 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgaaa-agacttagaatgaaaat 34489  T
Q  146 ttgg-gagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    |||| || |   ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||     |||||| ||||| || ||||||| ||||||||  ||||     
T  34488 ttggagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgattttttgtgttacataattcctttttaggttgaatgcgatctttgtt 34390  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 344  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  | || ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |     
T  34389 gttctagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 34290  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 444  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||| |    
T  34289 ataatgttatataattgtatatatattacttga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-gttgta 34195  T
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34194 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 13141
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgt 466  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13211 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 282
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaaga 282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13447 - 13398
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13447 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 11581 - 11308
Alignment:
Q  222 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 321  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||  ||||  |||||| |||    
T  11581 ttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactg 11482  T
Q  322 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat 421  Q
    |    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||    
T  11481 atgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatat 11386  T
Q  422 tgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11385 tattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 280 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 2228 - 2013
Alignment:
Q  280 aactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagt 379  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2228 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-c 2130  T
Q  380 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 479  Q
    ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2129 ttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagc 2034  T
Q  480 tgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2033 tgcatgagtcggtctaagttg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28423
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  28434 agttgatgaaga 28423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 460 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4568
Alignment:
Q  460 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Original strand, 128817 - 129072
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||    
T  128817 ttgtcgcacgagatgttatgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgt 128915  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggt 438  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||    
T  128916 tgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgt 129014  T
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129015 tttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 78617 - 78345
Alignment:
Q  219 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 318  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  78617 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 78518  T
Q  319 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 418  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  78517 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgca-ttga 78421  T
Q  419 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    |||||||||||||||  || |||||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78420 tattgttatatcatgaact-gttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 116548 - 116436
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  116548 tttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 116452  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  116451 tctaagttgattaaga 116436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 80788 - 80701
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  80788 ttttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggatttttggg 80701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 198
Target Start/End: Original strand, 128735 - 128775
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  128735 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgag 128775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 43438 - 43590
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43438 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 43537  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  43538 ttgggagttacacctgtactcgccatgacgagtagaggctctcgcctcgcgag 43590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 47358 - 47510
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47358 agttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaattatgattagaaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggattt 47457  T
Q  146 ttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  47458 ttgggagttacacctgtactagccatgacgagtagaggctctcgcctcgcgag 47510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 97280 - 97024
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||    
T  97280 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgt 97182  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctgg 437  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |    
T  97181 tgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-g 97084  T
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97083 ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 106558 - 106302
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||    
T  106558 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgt 106460  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctgg 437  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |    
T  106459 tgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-g 106362  T
Q  438 ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106361 ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 158 - 497
Target Start/End: Original strand, 1562 - 1900
Alignment:
Q  158 cctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatg 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||    
T  1562 cctgaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagatgcccaattacagaacaccttgttaggttacatgtgacctttgtcgcacgagttgatg 1661  T
Q  258 tgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 357  Q
    ||||||||||||   |||||| ||||||||||  | |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| |||||    
T  1662 tgagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatata 1761  T
Q  358 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatg 455  Q
    | ||||||| |||||||| |  |||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||| ||||||    
T  1762 aatgtatatgcattacat-aaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactacctatg 1858  T
Q  456 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||  |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  1859 ttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 900 - 569
Alignment:
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  900 actcgccatggcgagtagaggccctcacctcgcgagctagtgttagacagaacaccttgttaggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgagt 801  T
Q  263 tgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgt 362  Q
    ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || || |   |||| | |||| | |||    
T  800 tgatcatat-ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgt 702  T
Q  363 atatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgct 460  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||||||||||    
T  701 atatgcattacatga-attatatatgatg-ttgggatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttatatgctgcctatgttgct 606  T
Q  461 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3392 - 3195
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||    
T  3392 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagattgagattgaacctggaatagtttaagaacgaacttgtgggag 3293  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacg 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3292 ttatacctgaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacg 3195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 209 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 54
Alignment:
Q  209 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 308  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  311 acagaataccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgt 212  T
Q  309 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 408  Q
    |||||||||||| ||||  || || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||     
T  211 ttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttattgat 113  T
Q  409 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgt 466  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  112 ttgcatctgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32543 - 32112
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    || |||||| | ||||| ||     
T  32543 ccttagatgtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctggaaagactttagaatgaaattttgtgaa 32444  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
     |  ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||      |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  32443 ctgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcacctcgcgagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcactag 32344  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgt 351  Q
    |||||          ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||    
T  32343 ttgat----------cttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgt 32254  T
Q  352 tatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 451  Q
    | ||||      ||||||||| ||| | ||||||| |||  |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |     
T  32253 tgtata------tatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactact 32163  T
Q  452 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 322
Target Start/End: Original strand, 28470 - 28740
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg-gaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||    
T  28470 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacctacgaagacttta-gaatgaaattttgtga 28568  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
      |  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  28569 actgaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacga 28668  T
Q  251 gttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  28669 gttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 28740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 439 - 502
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28877
Alignment:
Q  439 tttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3298
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3283  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  3284 ctaagttgatgaaga 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 389 - 501
Target Start/End: Original strand, 27744 - 27855
Alignment:
Q  389 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 488  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27744 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 27842  T
Q  489 cggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||    
T  27843 cggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 27281 - 27400
Alignment:
Q  32 tagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatag 130  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||| || |||  ||||||||||||||| | |     
T  27281 tagttttgacccttaagttgaactttagatgattttgagtgcctgaacatgtataataatgattaggcaagtttttagtttgagattgaacctgggaaat 27380  T
Q  131 tttaagaatggatttttggg 150  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27381 tttaagaatggatttttggg 27400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 27485 - 27526
Alignment:
Q  159 ctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagtt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27485 ctgaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtt 27526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 3937 - 3855
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  3937 agttgaaccttagatgactttgagtgcctgaac-atgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8001 - 7919
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  8001 agttgaaccttagatgactttgagtgcctgaac-atgactagtaatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 7919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 346 - 497
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1171
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 1119  T
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 501
Target Start/End: Original strand, 16095 - 16206
Alignment:
Q  389 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 488  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16095 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 16193  T
Q  489 cggtctaagttga 501  Q
    |||||||||||||    
T  16194 cggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 391 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13252 - 13147
Alignment:
Q  391 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 490  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13252 gtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 13154  T
Q  491 gtctaag 497  Q
    |||||||    
T  13153 gtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 15866 - 15921
Alignment:
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15866 tgaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 15921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13636 - 13570
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13636 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaagaatggatttttggg 13570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3231 - 3133
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  3231 accttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtacaataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttgggaaagtttaaaaatggatttttggg 3133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 44705 - 44819
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44705 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 44803  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  44804 tctaagttgattaaga 44819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26177
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 26162  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  26163 ctaagttgatgaaga 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 25726 - 25879
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||   ||  |||||| |||||||| |     
T  25726 ccttagatggttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgaaaagattgtagaatgaatttttggaaa 25825  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25826 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 25879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 38700 - 38814
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38700 tttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtagg 38798  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||    
T  38799 tctaagttgattaaga 38814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1051
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1155 tttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1057  T
Q  492 tctaag 497  Q
    ||||||    
T  1056 tctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 3149 - 3262
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3149 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 3246  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3247 tctaagttgatgaaga 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 684 - 827
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 162  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| ||   ||  |||||| | |||||| | |   ||||||    
T  684 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaatctgaaaagattgtagaatgaacttttggaaatctgacctga 783  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||| || |||  |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  784 actcgccacggtgagcggaggctctcgcctcgcgagtgacccag 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 39599 - 39486
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39599 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 39502  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  39501 tctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39832 - 39783
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  39832 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 39783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Original strand, 75213 - 75326
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  75213 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 75310  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  75311 tctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 74980 - 75029
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  74980 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 75029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 346 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 25275 - 25121
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 443  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||  ||| ||||      
T  25275 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctg-ttttat 25179  T
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25178 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 620
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 433  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  715 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25632 - 25545
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggg 150  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25632 ttttgagtgcctgaaaatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacttggaaaagtttaaaaatggatttttggg 25545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17329
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 490  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 17312  T
Q  491 gtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17313 gtctaagttgatgaaga 17329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 79328 - 79430
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79328 ttgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 79425  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  79426 ctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Original strand, 16876 - 17029
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||||||  | |||||| |    
T  16876 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaacttttggaa 16974  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  16975 ttctgacctgaactcgccacggagagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 17029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Original strand, 79016 - 79096
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga 126  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| ||||| | | ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  79016 agttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaacatgtttaataatgattaggaaggaatgtagaatgagattgaacctgga 79096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 214
Target Start/End: Original strand, 79107 - 79151
Alignment:
Q  170 atggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  79107 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 79151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 267916 - 267679
Alignment:
Q  259 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 358  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||| ||||  |||||| ||||||    
T  267916 gagttgatcataagggtaagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataa 267817  T
Q  359 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgt 456  Q
     ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||    
T  267816 atgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactgcatatgt 267720  T
Q  457 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267719 tgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 268157 - 268094
Alignment:
Q  84 taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggattttt 147  Q
    |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  268157 taataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaaagtttaaaaatggattttt 268094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4865
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  4869 agttg 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5304 - 5222
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| ||||  | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  5304 agttgaaccttagatgcttttgagtgcatgaagatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 5222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23001 - 22892
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23001 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22904  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||    
T  22903 agttgattaaga 22892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 52032 - 51922
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52032 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 51934  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  51933 agttgatgaaga 51922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 167980 - 168083
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167980 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 168078  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  168079 agttg 168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52372 - 52218
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||  | || |||||    
T  52372 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 52273  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  52272 ttctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 52218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 167644 - 167721
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct 123  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  167644 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 167721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 167745 - 167794
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  167745 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 167794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10779
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 10794  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  10793 ctaagttgattaaga 10779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13510 - 13398
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 13413  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  13412 ctaagttgattaaga 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 20865 - 20753
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20865 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20768  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  20767 ctaagttgattaaga 20753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 37939 - 37827
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37939 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 37842  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  37841 ctaagttgattaaga 37827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16122
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| ||||    
T  16136 ctaagttgatgaaga 16122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 32959 - 33068
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32959 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 33056  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  33057 agttgatgaaga 33068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 46046 - 45937
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46046 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 45949  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  45948 agttgatgaaga 45937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 507
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17441
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 17441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 32619 - 32772
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||| ||||||| ||    
T  32619 accttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtga 32718  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    ||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||   |||||||||||| |||||    
T  32719 gttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgaccca 32772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 46386 - 46233
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||| ||||||| ||    
T  46386 accttagatgcttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaggactggagaatgagattgaacctgtaaagattttagaatgaatttttgtga 46287  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    ||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||   |||||||||||| |||||    
T  46286 gttgcaccctaactcgccacagcgaggagaggctcccgcctcgcgagtgaccca 46233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16537 - 16473
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  16537 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaa 16473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 158494 - 158606
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  158494 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 158591  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  158592 ctaagttgattaaga 158606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 501
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340053
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggt 340044  T
Q  493 ctaagttga 501  Q
    |||||||||    
T  340045 ctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 297
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2207
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |  ||    || |||||| | ||||| ||     
T  1962 ccttagatgtttttgagtcactgaacatgtctaataatgattaggaaagattggagaatgagattgaacataaaaagactttagaatgaaattttgtgaa 2061  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgag 251  Q
     |  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2062 ctgaacctgaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgag 2161  T
Q  252 ttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtctt 297  Q
    | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  2162 tggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatctt 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 412 - 501
Target Start/End: Original strand, 23901 - 23989
Alignment:
Q  412 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 501  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20572 - 20425
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| || || |||||| |  ||| ||||    
T  20572 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaataagattgaacctggaa-agatttagaatgaaacttttggag 20474  T
Q  153 tt-acacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagtt 200  Q
    ||   |||||| ||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||    
T  20473 ttctgacctgagctcgccacgacgagcagaggctctcgcctcgcgagtt 20425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 227942 - 227849
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttac 156  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  227942 ttttgagtgcctaaacatgtataataatgattaggaaagattctagattgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttac 227849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 336 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgc 225488  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttg 458  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  225487 t-gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 225769 - 225656
Alignment:
Q  151 agttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| |   ||||||  |||||||||||    
T  225769 agttacacctgaaatcgccataacaagtagaggcccttgcctcgcgagttacatagttacagaatgcttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacga 225671  T
Q  251 gttgatgtgagttga 265  Q
    |||| || |||||||    
T  225670 gttgttgagagttga 225656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 393 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 4812 - 4703
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4715  T
Q  493 ctaagttgatta 504  Q
    ||||||||||||    
T  4714 ctaagttgatta 4703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11482
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 11545  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11544 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13330 - 13220
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13330 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 13232  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  13231 agttgatgaaga 13220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38359
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 38296  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38297 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24690
Alignment:
Q  346 taatgttatataattg--tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  24605 taatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 389 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8605 - 8488
Alignment:
Q  389 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 488  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  8605 atgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagt 8507  T
Q  489 cggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  8506 cggtctaagttgatgaaga 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14065 - 13953
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14065 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggt 13968  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  13967 ctaagttgattaaga 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 6)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 4630 - 4522
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4630 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 4533  T
Q  492 tctaagttgat 502  Q
    |||||||||||    
T  4532 tctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12212 - 12104
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12212 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 12115  T
Q  492 tctaagttgat 502  Q
    |||||||||||    
T  12114 tctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 392 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22164 - 22056
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22164 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcgg 22067  T
Q  492 tctaagttgat 502  Q
    |||||||||||    
T  22066 tctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4814
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg-aatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||| |||||| |  |||||||    
T  4968 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttggga 4869  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  4868 atctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccag 4814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12550 - 12396
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg-aatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||| |||||| |  |||||||    
T  12550 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttggga 12451  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  12450 atctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccag 12396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22502 - 22348
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg-aatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || | ||| |||||| |  |||||||    
T  22502 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagatttttagaatgaaactttggga 22403  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  22402 atctgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcttcgcgagtgacccag 22348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16712
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16697  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||| ||||| ||||    
T  16698 ctaaattgatgaaga 16712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Original strand, 16260 - 16413
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   |||  |||||  |  ||||| |    
T  16260 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttagaatgagattgaacctggaaagattttcgaatgaaacgtttggaa 16359  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  16360 atctaacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 16413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 16902 - 16790
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16805  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  16804 ctaagttgattaaga 16790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17240 - 17078
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatag-tttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |  |||| ||    
T  17240 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg-atagattttagaataaaactttgaga 17142  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
     |   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17141 atatgacctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 17078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11294
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggt 11309  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||| ||||||||||    
T  11308 ctaatttgattaaga 11294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 440
Target Start/End: Original strand, 2099 - 2488
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatg-gatt 144  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||  | |    
T  2099 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacct-gaaaagacttagaatgaaaat 2197  T
Q  145 tttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtc 244  Q
    || | || |   ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||| |    
T  2198 ttagagaatctgacc-gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtgtgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgcc 2296  T
Q  245 gcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 344  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |     
T  2297 gttcgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgctt 2396  T
Q  345 ttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  2397 ataatgttatataattgtatatacattaaatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 2488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3479
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3589 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtcta 3491  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  3490 agttgatgaaga 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 352
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461 agatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgcta-ttttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 364  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||| ||| ||||    
T  363 agtcgataaaga 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 649
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||    || |||||| |  ||| |||     
T  802 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattagaaaagaatgtagaatgagattgaacctagaaagaatttagaatgaaacttttggaa 703  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |   | |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  702 tctgaactgaactcgccgcggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3920 - 3777
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaat-ggatttttgggagttacacctg 161  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||  |||||   | || ||||| |   |||||    
T  3920 ttttgagtgtctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaatgattgtagaatcaaacttgtgggattctgacctg 3821  T
Q  162 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  3820 aactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 3777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 33060 - 32951
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33060 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtcta 32963  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    | ||||| ||||    
T  32962 acttgatgaaga 32951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 9867 - 9755
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9867 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9770  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  9769 ctaagttgattaaga 9755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38879 - 38770
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38879 agatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtcta 38782  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  38781 agttgatgaaga 38770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 39219 - 39067
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggag 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |  ||  |||     
T  39219 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa-agattttgaatgaaacttgtggat 39121  T
Q  153 ttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  39120 tctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 39067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 498
Target Start/End: Original strand, 24304 - 24406
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 494  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304 agatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 24402  T
Q  495 aagt 498  Q
    ||||    
T  24403 aagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Original strand, 23973 - 24037
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||    
T  23973 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaaaatgtaggatgagattgaacctggaa 24037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 26018 - 25905
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26018 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcgg 25921  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25920 tctaagttgatgaaga 25905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 392 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 39980 - 39867
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  39980 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttgg 39883  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||| ||||    
T  39882 tctaagttgatgaaga 39867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 39592 - 39666
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| | | || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39592 ccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaa 39666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40306 - 40242
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  40306 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatggaggatgagattgaacctggaa 40242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1970 - 1860
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1872  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  1871 agttgatgaaga 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2311 - 2159
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttt-tggga 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||   ||  |||||| |  || |||||    
T  2311 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaaagattgtagaatgaaacttgtggga 2212  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccc 204  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2211 ttctgacctgaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccc 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 121
Target Start/End: Original strand, 119200 - 119280
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaac 121  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  119200 ccttaagttgaacattagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattagacaagtttttagattgagattgaac 119280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 12293 - 12405
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12293 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 12390  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  12391 ctaagttgattaaga 12405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9248
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 9263  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  9262 ctaagttgattaaga 9248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12478 - 12329
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    |||||||||  ||||||||||    ||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12478 gtagttttgatccttaagttgatatttagatgattttgagtgtctgaacatgtataataatgattaggaaagattttagattgagattgaacctggaata 12379  T
Q  130 gtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtag 180  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  12378 g-ttaagaatggattttttggagttacaactgaatttgccatagcgagtag 12329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 30050 - 29946
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30050 ttgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 29953  T
Q  493 ctaagtt 499  Q
    |||||||    
T  29952 ctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 8535 - 8641
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8535 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtcta 8629  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    ||||||| ||||    
T  8630 agttgatgaaga 8641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 127
Target Start/End: Original strand, 8203 - 8267
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  8203 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 8267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40518 - 40406
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40518 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggt 40421  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  40420 ctaagttgattaaga 40406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 1050 - 1153
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1050 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 1148  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  1149 agttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 123
Target Start/End: Original strand, 714 - 791
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacct 123  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  714 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatttaggatgagattgaacct 791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 815 - 864
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  815 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 1748 - 1900
Alignment:
Q  64 ttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctga 162  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |  ||||| | |   ||||||    
T  1748 ttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggaaagattttagaatgaaactttggaaatctgacctga 1847  T
Q  163 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 215  Q
    | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1848 attcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4220
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4321 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatt 4224  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  4223 aaga 4220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 498
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18130
Alignment:
Q  336 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 18067  T
Q  435 tggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 498  Q
    || || |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18068 tg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 505
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2283
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatt 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4303
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 4318  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  4317 ctaagttgattaaga 4303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6236
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 493  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6123 agatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6222  T
Q  494 taagttgattaaga 507  Q
    ||||||||| ||||    
T  6223 taagttgatgaaga 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Original strand, 5782 - 5854
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg 125  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5782 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtaggatgagattgaacctgg 5854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 396 - 500
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10528
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtcta 10523  T
Q  496 agttg 500  Q
    |||||    
T  10524 agttg 10528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 128
Target Start/End: Original strand, 10097 - 10173
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  10097 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 10173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 396 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20928
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  496 agt 498  Q
    |||    
T  20930 agt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 21357 - 21275
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  21357 agttgaaccttagatgttttttagtgcctgaacatgtctaataatgattatgaaagaatgtaggatgagattgtacctggaat 21275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 51654 - 51601
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51654 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 52017 - 51953
Alignment:
Q  65 tttgagtgcctgaacta-tgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  52017 tttgagtgcctgaacaagtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctggaat 51953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 5)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 424 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4728
Alignment:
Q  424 ttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 392 - 310
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  392 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaat 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5168 - 5086
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  5168 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaatctggaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 291 - 243
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  291 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgaccca 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 5019
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  5067 acctgaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcaagtgaccca 5019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12388 - 12228
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttggga 151  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||| | |||| |||    
T  12388 ccttagatgcttttgagtgtctgaa-tatgtttaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttgga 12291  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  12290 aactgacctgaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa 12228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  454 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 437 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13513
Alignment:
Q  437 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13575 gttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13951 - 13869
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  13951 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaaggatgtagcatgagattgaacctggaat 13869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1308
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7285
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 447 - 507
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15350
Alignment:
Q  447 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaaga 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 396 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 4643 - 4545
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4643 agatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 112
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  224 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 127  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  126 ctaagttgattaaga 112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 413 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16301
Alignment:
Q  413 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16738 - 16657
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg 124  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| | |||||||||||||    
T  16738 ttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggacgagattgaacctg 16657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 396 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2071 - 1971
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2071 agatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtcta 1973  T
Q  496 ag 497  Q
    ||    
T  1972 ag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 12070
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  12176 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggt 12085  T
Q  493 ctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||||||    
T  12084 ctaagttgattaaga 12070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 20423 - 20524
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 492  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20423 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 20519  T
Q  493 ctaag 497  Q
    |||||    
T  20520 ctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 214
Target Start/End: Original strand, 20087 - 20247
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatgga-tttttggga 151  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| | | ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||| |    
T  20087 ccttagatgcttttgagttcctgaacatgtttaataatgagtaggaaagaatgtagaatgagattgaacctggattaatt-aagaatgaactttttggaa 20185  T
Q  152 gttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 214  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||    
T  20186 gctg-acctgaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagttgcctaattacagaa 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 396 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 128869 - 128760
Alignment:
Q  396 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||   |  |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  128869 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttt-tgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtcta 128772  T
Q  496 agttgattaaga 507  Q
    | ||||||||||    
T  128771 atttgattaaga 128760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 32083
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32137 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32520 - 32438
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  32520 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgactaggaaagaatgtgggatgagattgaacctggaat 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 404 - 507
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1437
Alignment:
Q  404 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 503  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 1433  T
Q  504 aaga 507  Q
    ||||    
T  1434 aaga 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Original strand, 161133 - 161246
Alignment:
Q  393 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 491  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  161133 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcgg 161230  T
Q  492 tctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||| ||||||    
T  161231 tctaagttggttaaga 161246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 150
Target Start/End: Original strand, 24169 - 24279
Alignment:
Q  42 ccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaat- 139  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24169 ccttaagttgaagcttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagcttttagattgagattgaacctggaatagtttaaaaatg 24268  T
Q  140 ggatttttggg 150  Q
    |||||||||||    
T  24269 ggatttttggg 24279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 500
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11548
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14119 - 14004
Alignment:
Q  34 gttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagt 131  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||| |||||||| |||||| |  ||    
T  14119 gttttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggtaagtttttagattgagattggacctggtaatgt 14021  T
Q  132 ttaagaatggatttttg 148  Q
    |||| ||||||||||||    
T  14020 ttaaaaatggatttttg 14004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 11178 - 11260
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  11178 agttgaaccttagattcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 11260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 500
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15568
Alignment:
Q  415 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 500  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Original strand, 15127 - 15213
Alignment:
Q  44 ttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaata 129  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  15127 ttaagttgaaccgtagatgcttttgagtgccttaa-tatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaata 15213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 412 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2694
Alignment:
Q  412 catttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 497
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5230
Alignment:
Q  450 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 4796 - 4878
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  4796 agttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 4878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 47014
Alignment:
Q  446 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 47442 - 47360
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||    
T  47442 agttgaaccttagatgcttttgagtgtctgaa-tatgtctaataatgattaggaatgaatgtaggatgagattgaacctggaat 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 497
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1151
Alignment:
Q  444 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 497  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098 atactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Original strand, 717 - 799
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgt--aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  717 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaa-tatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 818 - 867
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  818 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtaacccag 867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 452
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3588
Alignment:
Q  393 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 452  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  3529 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 356 - 211
Alignment:
Q  62 gtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagtt-acacc 159  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| || || |||||| |  |||  |||||   |||    
T  356 gtttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agatttagaatgaaactttttgagttctgacc 258  T
Q  160 tgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 206  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  257 tgaactcgccacagcgagtagaggctctcgccacgcgagtgacccag 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 449 - 507
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4945
Alignment:
Q  449 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 198
Target Start/End: Original strand, 8185 - 8298
Alignment:
Q  85 aataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtttaagaatggatttttgggagttacacctgaactcgccatggcgagtagaggc 184  Q
    ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| | |||  |||  || ||||| ||||||||||||||    
T  8185 aataatgattaggcaaggttttagaatgagattgaacttggaatagtgtcagaatggattcttgagtgttttaccctaaatcgccgtggcgagtagaggc 8284  T
Q  185 catcgcctcgcgag 198  Q
      || |||||||||    
T  8285 tctcacctcgcgag 8298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Original strand, 623 - 695
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg 125  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  623 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagattgtagaacgagattgaacctgg 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 127
Target Start/End: Original strand, 2739 - 2820
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  2739 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 2820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1461
Alignment:
Q  34 gttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagtt 132  Q
    |||||| |||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||  | ||||    
T  1344 gttttgaccctaaagttgaacttcagatgattttgagtgcctgaacatgtatattaatgattagacaagtttttagattgagattgaacctgagaaagtt 1443  T
Q  133 taagaatggatttttggg 150  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1444 taaaaatggatttttggg 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 28996 - 28924
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg 125  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28996 ccttagatgcttttgagttcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtagaatgagattgaacctgg 28924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27953 - 27911
Alignment:
Q  392 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27953 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7213 - 7095
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatgta--ataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||| |  ||||| | ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||| |     
T  7213 gtagttttgaaccttaagttgaattttagatgattttgagtgactgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagattgaacctgggaa 7115  T
Q  129 agtttaagaatggatttttg 148  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  7114 agtttaaaaatggatttttg 7095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23848
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaaga 23848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36459
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaaga 36459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20863 - 20717
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaatagttta-agaatg-gatttttggg 150  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||  | || ||||    
T  20863 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa-agattatagaatgaaacttgtggg 20765  T
Q  151 agttacacctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    | |   |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20764 attctgacctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgag 20717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 126
Target Start/End: Original strand, 17668 - 17742
Alignment:
Q  53 accttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgga 126  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  17668 accttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctgga 17742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 127
Target Start/End: Original strand, 18619 - 18693
Alignment:
Q  54 ccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaa 127  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  18619 ccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaa 18693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 12623 - 12681
Alignment:
Q  207 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttga 265  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  12623 ttacagaatgcttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacgagttgttatgagttga 12681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 29239 - 29149
Alignment:
Q  36 tttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaa-ctatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctgg 125  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||| || |||| |||||||| ||||||    
T  29239 tttgtcccttaagttgaaccttagatgattttgagtgcctgaatatatataataatgattaggcaagtttttagattgagattggacctgg 29149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 338
Alignment:
Q  162 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  374 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 165
Alignment:
Q  240 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| | ||  ||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||  |  || || | ||||    
T  296 ttgtcgcacgagttgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgtt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgt 198  T
Q  340 tgttgttaatgttatataattgtatatacatta 372  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  197 tgttaataatgtgatataattgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 6
Alignment:
Q  346 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 429  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  88 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 35508 - 35625
Alignment:
Q  31 gtagttttgccccttaagttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg--taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||| |||||| | |||||  |     
T  35508 gtagttttgtcccttaagttgaaccttaaatgattttgagtgcctgaa-tatgtataataatgattaggcaagtttttagattgagatcggacctgagaa 35606  T
Q  129 agtttaagaatggattttt 147  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  35607 agtttaaaagtggattttt 35625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1288
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaactatg-taataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctggaat 128  Q
    ||||| |||||||| |  |||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  1370 agttgaaccttagatgcctttgagtgcctgaacattactaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgaacctggaat 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Original strand, 13262 - 13340
Alignment:
Q  47 agttggaccttagaggtttttgagtgcctgaac-tatgtaataatgattagaaaagattctagaatgagattgaacctg 124  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||    
T  13262 agttgaaccttagatgcttttgagtgcctgaacatgtctaataatgattaggaaagaatgtaggatgagattgagcctg 13340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 495
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  445 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 495  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 430
Target Start/End: Original strand, 602 - 697
Alignment:
Q  334 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 430  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  602 taatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6965 - 6917
Alignment:
Q  157 acctgaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 205  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6965 acctgaactcgccacggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 6917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 463 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29563
Alignment:
Q  463 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 507  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaaga 29563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University