View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15107_low_2 (Length: 396)

Name: NF15107_low_2
Description: NF15107
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15107_low_2
NF15107_low_2
[»] chr7 (108 HSPs)
chr7 (7-380)||(12461328-12461701)
chr7 (105-380)||(16843859-16844133)
chr7 (15-380)||(13019516-13019891)
chr7 (117-380)||(23520923-23521185)
chr7 (150-380)||(19439264-19439495)
chr7 (189-380)||(46649762-46649954)
chr7 (178-378)||(17468242-17468443)
chr7 (178-378)||(17584771-17584972)
chr7 (176-378)||(2388547-2388750)
chr7 (176-379)||(46174303-46174509)
chr7 (189-374)||(13963995-13964182)
chr7 (176-374)||(49158722-49158921)
chr7 (189-374)||(37285201-37285388)
chr7 (176-378)||(20019659-20019864)
chr7 (196-374)||(11339770-11339950)
chr7 (196-374)||(11899302-11899482)
chr7 (196-374)||(26113748-26113928)
chr7 (189-374)||(2438876-2439063)
chr7 (194-374)||(11299646-11299828)
chr7 (194-374)||(11308010-11308192)
chr7 (258-380)||(30271770-30271892)
chr7 (196-374)||(11879066-11879246)
chr7 (196-374)||(17726325-17726505)
chr7 (196-374)||(18437159-18437339)
chr7 (189-374)||(1317758-1317945)
chr7 (189-374)||(26089943-26090130)
chr7 (189-374)||(40684755-40684942)
chr7 (194-374)||(8197192-8197374)
chr7 (189-374)||(5187235-5187423)
chr7 (189-374)||(49150577-49150765)
chr7 (189-374)||(49157267-49157455)
chr7 (196-362)||(642549-642718)
chr7 (196-374)||(26120361-26120541)
chr7 (196-374)||(32627396-32627576)
chr7 (189-374)||(749835-750022)
chr7 (189-374)||(48987913-48988100)
chr7 (194-374)||(40922915-40923097)
chr7 (189-374)||(2281078-2281266)
chr7 (194-374)||(42058546-42058729)
chr7 (194-374)||(2026217-2026399)
chr7 (258-378)||(13453790-13453911)
chr7 (258-378)||(21757354-21757475)
chr7 (258-378)||(37379952-37380073)
chr7 (196-374)||(33404652-33404832)
chr7 (194-337)||(8213299-8213445)
chr7 (17-235)||(30271871-30272093)
chr7 (176-317)||(32771473-32771619)
chr7 (256-374)||(30602854-30602974)
chr7 (315-380)||(15838732-15838797)
chr7 (176-317)||(3327778-3327924)
chr7 (221-317)||(14179061-14179158)
chr7 (176-317)||(37244359-37244506)
chr7 (156-317)||(46624800-46624967)
chr7 (15-186)||(15455199-15455379)
chr7 (176-240)||(37379914-37379978)
chr7 (189-317)||(18958480-18958613)
chr7 (221-317)||(15085974-15086072)
chr7 (221-317)||(46682244-46682343)
chr7 (150-255)||(147019-147126)
chr7 (150-255)||(2965883-2965990)
chr7 (221-317)||(15437658-15437756)
chr7 (240-317)||(10519883-10519960)
chr7 (221-317)||(82128-82227)
chr7 (221-317)||(15098017-15098116)
chr7 (221-317)||(15104394-15104493)
chr7 (156-211)||(18606824-18606880)
chr7 (150-213)||(23665988-23666052)
chr7 (150-213)||(29795682-29795746)
chr7 (150-213)||(29799501-29799565)
chr7 (150-255)||(14320683-14320790)
chr7 (150-255)||(14565660-14565767)
chr7 (150-255)||(15166726-15166833)
chr7 (150-255)||(18871818-18871925)
chr7 (156-257)||(19145524-19145629)
chr7 (156-257)||(20744923-20745028)
chr7 (235-317)||(26289819-26289902)
chr7 (150-255)||(31154319-31154426)
chr7 (295-376)||(11857657-11857739)
chr7 (156-257)||(13678240-13678345)
chr7 (150-211)||(20907523-20907585)
chr7 (295-364)||(32771636-32771706)
chr7 (221-317)||(11881580-11881677)
chr7 (237-317)||(12547215-12547296)
chr7 (150-213)||(11302804-11302868)
chr7 (156-211)||(14266166-14266222)
chr7 (219-313)||(16952292-16952388)
chr7 (309-376)||(14945824-14945891)
chr7 (309-376)||(15373417-15373484)
chr7 (189-240)||(15622161-15622212)
chr7 (150-255)||(16089973-16090080)
chr7 (17-101)||(23518632-23518718)
chr7 (18-69)||(49149702-49149752)
chr7 (150-211)||(2464265-2464327)
chr7 (150-211)||(3858518-3858580)
chr7 (295-364)||(14581415-14581485)
chr7 (295-364)||(15104307-15104377)
chr7 (295-364)||(45185589-45185658)
chr7 (196-241)||(13453884-13453929)
chr7 (159-211)||(14255890-14255943)
chr7 (319-364)||(18607026-18607071)
chr7 (196-241)||(21757336-21757381)
chr7 (309-370)||(26289728-26289788)
chr7 (309-370)||(37244268-37244328)
chr7 (319-363)||(14281617-14281661)
chr7 (321-364)||(16073934-16073978)
chr7 (310-370)||(18958389-18958448)
chr7 (196-240)||(30602946-30602990)
chr7 (319-363)||(35962709-35962753)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (7-380)||(10464179-10464555)
chr6 (7-379)||(10470702-10471077)
chr6 (15-380)||(12447166-12447538)
chr6 (15-380)||(17207708-17208087)
chr6 (117-380)||(29925615-29925878)
chr6 (153-379)||(27767314-27767542)
chr6 (176-380)||(14582783-14582988)
chr6 (18-380)||(13940242-13940617)
chr6 (133-381)||(23021318-23021568)
chr6 (176-379)||(94460-94666)
chr6 (227-380)||(13128236-13128390)
chr6 (176-374)||(8069665-8069865)
chr6 (189-374)||(1070609-1070796)
chr6 (189-374)||(15332093-15332280)
chr6 (189-374)||(17309665-17309852)
chr6 (189-374)||(25463832-25464019)
chr6 (189-374)||(34133941-34134128)
chr6 (189-374)||(29159059-29159247)
chr6 (189-374)||(16223629-16223816)
chr6 (196-374)||(24369186-24369365)
chr6 (196-374)||(25315616-25315796)
chr6 (196-374)||(26203110-26203290)
chr6 (196-374)||(30799408-30799587)
chr6 (189-374)||(4106688-4106871)
chr6 (117-261)||(17894611-17894756)
chr6 (189-374)||(22406613-22406801)
chr6 (150-231)||(13135929-13136010)
chr6 (150-317)||(25347034-25347206)
chr6 (219-317)||(23234982-23235082)
chr6 (258-374)||(24362628-24362746)
chr6 (156-317)||(25395958-25396125)
chr6 (219-317)||(26418719-26418820)
chr6 (237-317)||(23233463-23233544)
chr6 (237-317)||(17414038-17414118)
chr6 (150-255)||(15457417-15457524)
chr6 (150-255)||(15464012-15464119)
chr6 (237-317)||(19451326-19451407)
chr6 (237-317)||(19472379-19472460)
chr6 (237-317)||(10582895-10582975)
chr6 (223-317)||(5290196-5290291)
chr6 (319-374)||(19096758-19096812)
chr6 (295-364)||(14133011-14133082)
chr6 (150-255)||(20008998-20009105)
chr6 (237-317)||(24720638-24720720)
chr6 (321-363)||(937655-937697)
chr6 (295-364)||(18786204-18786274)
chr6 (150-211)||(20011102-20011164)
chr6 (15-69)||(23021579-23021633)
chr6 (150-211)||(28290370-28290432)
chr6 (150-211)||(9100172-9100233)
chr6 (167-317)||(18786031-18786187)
chr6 (237-317)||(19467858-19467939)
chr6 (150-211)||(29096758-29096819)
chr6 (150-213)||(12941752-12941816)
chr6 (150-255)||(4476317-4476424)
chr6 (150-255)||(31250244-31250351)
chr6 (295-364)||(10582808-10582878)
chr6 (189-235)||(19096815-19096861)
chr6 (295-376)||(19467962-19468043)
chr6 (150-211)||(21365630-21365692)
chr6 (295-364)||(23105332-23105402)
chr6 (150-211)||(23969612-23969674)
chr6 (339-376)||(2708552-2708589)
chr6 (319-364)||(8768145-8768190)
chr6 (319-364)||(19300639-19300684)
chr6 (309-370)||(23234891-23234951)
chr6 (15-59)||(94812-94855)
chr6 (196-257)||(1592758-1592821)
chr6 (309-376)||(17414149-17414216)
chr6 (319-363)||(19726766-19726810)
chr6 (309-376)||(24513785-24513852)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (15-380)||(23081714-23082092)
chr5 (15-380)||(23076266-23076644)
chr5 (69-380)||(20990172-20990485)
chr5 (8-380)||(7773623-7774003)
chr5 (150-380)||(28259848-28260079)
chr5 (15-381)||(23544835-23545215)
chr5 (19-380)||(24057411-24057783)
chr5 (15-380)||(25419630-25420004)
chr5 (17-380)||(26650209-26650585)
chr5 (17-380)||(26921794-26922170)
chr5 (15-380)||(5341694-5342069)
chr5 (15-380)||(39608848-39609223)
chr5 (105-379)||(16775018-16775291)
chr5 (133-381)||(18941188-18941436)
chr5 (150-379)||(41877980-41878211)
chr5 (117-379)||(37565957-37566221)
chr5 (133-381)||(19801859-19802109)
chr5 (150-381)||(19362550-19362783)
chr5 (176-378)||(22507487-22507691)
chr5 (189-378)||(22500920-22501110)
chr5 (176-374)||(597203-597402)
chr5 (176-378)||(19800316-19800522)
chr5 (258-380)||(41877809-41877932)
chr5 (200-374)||(19508115-19508291)
chr5 (258-373)||(22379543-22379658)
chr5 (196-374)||(5454437-5454617)
chr5 (196-374)||(5582258-5582438)
chr5 (196-374)||(25852924-25853104)
chr5 (189-374)||(14614931-14615118)
chr5 (189-374)||(22248222-22248409)
chr5 (196-364)||(10686093-10686264)
chr5 (189-374)||(14888972-14889160)
chr5 (196-374)||(25846292-25846472)
chr5 (196-374)||(30781013-30781193)
chr5 (196-374)||(40010953-40011133)
chr5 (189-374)||(24794997-24795184)
chr5 (189-374)||(24800364-24800551)
chr5 (189-374)||(37539939-37540126)
chr5 (189-374)||(37547483-37547670)
chr5 (194-374)||(1111659-1111841)
chr5 (194-374)||(38013680-38013862)
chr5 (189-374)||(7507995-7508183)
chr5 (189-374)||(14882295-14882483)
chr5 (194-374)||(17938864-17939047)
chr5 (196-374)||(43028989-43029169)
chr5 (189-374)||(11995078-11995265)
chr5 (197-374)||(15461421-15461600)
chr5 (196-374)||(18894976-18895156)
chr5 (258-378)||(29746569-29746692)
chr5 (261-378)||(18566603-18566721)
chr5 (261-374)||(20347157-20347272)
chr5 (127-235)||(22379455-22379564)
chr5 (261-374)||(20340553-20340668)
chr5 (219-317)||(27635930-27636030)
chr5 (176-317)||(24751584-24751729)
chr5 (237-317)||(21829546-21829626)
chr5 (223-317)||(24669046-24669141)
chr5 (223-317)||(24738815-24738910)
chr5 (16-69)||(19362469-19362522)
chr5 (15-68)||(19802122-19802175)
chr5 (221-317)||(23444254-23444353)
chr5 (150-255)||(19235799-19235906)
chr5 (150-255)||(28371543-28371650)
chr5 (150-255)||(38145870-38145977)
chr5 (150-255)||(42960034-42960141)
chr5 (237-317)||(20843186-20843267)
chr5 (221-317)||(21574071-21574168)
chr5 (176-240)||(29746666-29746731)
chr5 (221-317)||(427242-427341)
chr5 (150-213)||(9775419-9775483)
chr5 (176-240)||(18566562-18566626)
chr5 (237-317)||(23561664-23561744)
chr5 (150-213)||(37805476-37805540)
chr5 (15-66)||(18941451-18941502)
chr5 (150-255)||(22336059-22336166)
chr5 (150-255)||(22460054-22460161)
chr5 (150-255)||(22466678-22466785)
chr5 (150-255)||(22749705-22749812)
chr5 (319-374)||(24008126-24008180)
chr5 (150-255)||(34828980-34829087)
chr5 (150-211)||(23112900-23112962)
chr5 (150-211)||(28890521-28890583)
chr5 (150-211)||(28897225-28897287)
chr5 (150-211)||(28910425-28910487)
chr5 (150-211)||(28925693-28925755)
chr5 (150-211)||(28932116-28932178)
chr5 (150-211)||(28933620-28933682)
chr5 (150-211)||(28946820-28946882)
chr5 (295-364)||(22232605-22232674)
chr5 (176-212)||(33536284-33536320)
chr5 (18-69)||(597027-597077)
chr5 (189-240)||(20347129-20347180)
chr5 (150-255)||(22339597-22339704)
chr5 (295-364)||(15193998-15194068)
chr5 (150-211)||(37599456-37599518)
chr5 (197-235)||(41877911-41877949)
chr5 (319-364)||(23112708-23112753)
chr5 (251-317)||(26753622-26753690)
chr5 (319-364)||(34829191-34829236)
chr5 (309-364)||(20843298-20843354)
chr5 (319-363)||(20937755-20937799)
chr5 (319-363)||(22312801-22312845)
chr5 (309-364)||(23561577-23561633)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (118-380)||(42220302-42220565)
chr4 (105-381)||(33096952-33097228)
chr4 (117-379)||(21881462-21881725)
chr4 (15-380)||(33221131-33221504)
chr4 (117-379)||(20894863-20895127)
chr4 (15-380)||(46044819-46045203)
chr4 (150-379)||(2972682-2972912)
chr4 (117-379)||(49548533-49548797)
chr4 (117-379)||(20889244-20889508)
chr4 (176-380)||(35462560-35462765)
chr4 (117-379)||(31664929-31665193)
chr4 (150-379)||(19128292-19128523)
chr4 (117-380)||(41404656-41404920)
chr4 (150-381)||(899497-899728)
chr4 (105-380)||(30396057-30396330)
chr4 (150-379)||(36037465-36037696)
chr4 (176-379)||(47872371-47872577)
chr4 (223-380)||(49548317-49548475)
chr4 (176-378)||(45142499-45142704)
chr4 (176-374)||(7359175-7359375)
chr4 (189-379)||(34772108-34772301)
chr4 (189-378)||(45959691-45959883)
chr4 (176-364)||(54844912-54845103)
chr4 (176-379)||(42955971-42956177)
chr4 (176-374)||(11202385-11202585)
chr4 (189-374)||(1583850-1584037)
chr4 (189-374)||(5938865-5939052)
chr4 (196-374)||(52500498-52500678)
chr4 (189-374)||(26395625-26395812)
chr4 (194-374)||(29455315-29455497)
chr4 (196-374)||(3259946-3260126)
chr4 (176-330)||(7356182-7356339)
chr4 (189-374)||(21396756-21396944)
chr4 (196-374)||(23435937-23436117)
chr4 (194-364)||(29448640-29448813)
chr4 (189-374)||(3266574-3266761)
chr4 (193-374)||(39266192-39266374)
chr4 (194-374)||(11937103-11937286)
chr4 (196-374)||(29382719-29382899)
chr4 (197-374)||(49240799-49240978)
chr4 (197-374)||(49749513-49749692)
chr4 (196-302)||(391073-391180)
chr4 (176-277)||(45151372-45151473)
chr4 (196-281)||(50082207-50082292)
chr4 (258-374)||(391175-391293)
chr4 (156-317)||(15306959-15307126)
chr4 (156-263)||(10977129-10977240)
chr4 (237-317)||(15360879-15360959)
chr4 (221-317)||(16484623-16484721)
chr4 (189-315)||(37881388-37881519)
chr4 (15-76)||(42220240-42220301)
chr4 (15-69)||(899415-899469)
chr4 (221-317)||(15244126-15244224)
chr4 (221-317)||(16229175-16229273)
chr4 (237-317)||(12931881-12931962)
chr4 (176-288)||(13452204-13452320)
chr4 (156-317)||(13886624-13886791)
chr4 (159-317)||(14821317-14821479)
chr4 (237-314)||(18166345-18166422)
chr4 (221-317)||(13899671-13899770)
chr4 (221-317)||(53905371-53905470)
chr4 (295-364)||(16484738-16484807)
chr4 (150-255)||(14910537-14910645)
chr4 (15-80)||(33096850-33096914)
chr4 (150-213)||(15533738-15533802)
chr4 (309-364)||(14485663-14485717)
chr4 (309-364)||(26077682-26077736)
chr4 (319-374)||(50082293-50082347)
chr4 (295-364)||(10972873-10972943)
chr4 (295-364)||(18261439-18261508)
chr4 (295-364)||(18271404-18271473)
chr4 (295-364)||(14556050-14556119)
chr4 (319-364)||(14910747-14910792)
chr4 (327-364)||(16156803-16156840)
chr4 (158-211)||(18212099-18212152)
chr4 (319-364)||(18212298-18212343)
chr4 (15-48)||(34771918-34771951)
chr4 (309-370)||(49051086-49051146)
chr4 (194-230)||(15470652-15470688)
chr4 (319-363)||(17000139-17000183)
chr4 (309-364)||(18166255-18166311)
chr4 (221-261)||(18261324-18261364)
chr4 (221-261)||(18271289-18271329)
chr4 (327-378)||(27849427-27849479)
chr4 (319-363)||(43284868-43284912)
chr4 (15-59)||(54845247-54845290)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (15-380)||(15643243-15643621)
chr2 (18-380)||(32911436-32911812)
chr2 (15-380)||(45028320-45028693)
chr2 (117-380)||(13101127-13101392)
chr2 (119-379)||(27272174-27272436)
chr2 (133-381)||(25590154-25590402)
chr2 (105-380)||(36800467-36800741)
chr2 (150-379)||(17592487-17592719)
chr2 (176-378)||(35243982-35244188)
chr2 (196-377)||(14563832-14564014)
chr2 (176-379)||(11466051-11466256)
chr2 (189-374)||(27037237-27037424)
chr2 (189-374)||(22013065-22013252)
chr2 (189-374)||(34043-34230)
chr2 (189-374)||(21604757-21604944)
chr2 (189-378)||(28292712-28292904)
chr2 (194-374)||(24481552-24481734)
chr2 (189-374)||(2385874-2386062)
chr2 (194-374)||(4071496-4071679)
chr2 (196-374)||(4077420-4077600)
chr2 (194-374)||(20850187-20850370)
chr2 (194-374)||(30196467-30196649)
chr2 (196-374)||(24426793-24426974)
chr2 (189-374)||(31828605-31828793)
chr2 (189-374)||(31833957-31834145)
chr2 (189-374)||(36984517-36984705)
chr2 (196-374)||(44091041-44091221)
chr2 (194-374)||(1067094-1067276)
chr2 (196-374)||(27729508-27729688)
chr2 (194-374)||(11360196-11360374)
chr2 (194-374)||(1061711-1061893)
chr2 (189-281)||(71521-71613)
chr2 (194-277)||(35585355-35585438)
chr2 (176-317)||(28971332-28971478)
chr2 (219-317)||(21133306-21133407)
chr2 (156-317)||(24660415-24660581)
chr2 (15-69)||(25590414-25590468)
chr2 (221-317)||(8890022-8890121)
chr2 (150-255)||(9474-9581)
chr2 (319-374)||(71466-71520)
chr2 (237-317)||(25267243-25267325)
chr2 (150-255)||(27211097-27211204)
chr2 (221-317)||(19035505-19035603)
chr2 (150-213)||(10685785-10685849)
chr2 (237-317)||(22860345-22860425)
chr2 (150-255)||(19662942-19663049)
chr2 (237-317)||(23062590-23062672)
chr2 (150-211)||(9241285-9241347)
chr2 (240-317)||(25107524-25107601)
chr2 (150-211)||(26884105-26884167)
chr2 (150-211)||(29280893-29280955)
chr2 (150-213)||(20260776-20260840)
chr2 (156-211)||(21074143-21074199)
chr2 (226-312)||(22796688-22796776)
chr2 (17-81)||(28292516-28292579)
chr2 (295-378)||(17633968-17634051)
chr2 (237-317)||(20648113-20648195)
chr2 (17-59)||(36800364-36800406)
chr2 (319-364)||(9241493-9241538)
chr2 (157-186)||(17633781-17633810)
chr2 (309-370)||(21133215-21133275)
chr2 (319-364)||(22810043-22810088)
chr2 (309-370)||(28971241-28971301)
chr2 (156-211)||(21124039-21124095)
chr2 (156-211)||(21907206-21907262)
chr2 (15-59)||(27272113-27272156)
[»] chr3 (99 HSPs)
chr3 (17-379)||(29550731-29551102)
chr3 (117-380)||(9691390-9691654)
chr3 (17-380)||(20377223-20377599)
chr3 (15-380)||(30596842-30597220)
chr3 (131-379)||(16833151-16833400)
chr3 (117-379)||(16331577-16331839)
chr3 (15-380)||(32388000-32388375)
chr3 (150-380)||(46071093-46071324)
chr3 (105-380)||(8373908-8374183)
chr3 (117-379)||(54519961-54520225)
chr3 (150-381)||(19344134-19344366)
chr3 (17-380)||(12725107-12725473)
chr3 (150-381)||(49163103-49163334)
chr3 (150-380)||(11956579-11956809)
chr3 (150-379)||(29545146-29545377)
chr3 (218-380)||(20187758-20187921)
chr3 (223-380)||(54520283-54520441)
chr3 (176-378)||(48774601-48774807)
chr3 (176-374)||(9771904-9772103)
chr3 (176-374)||(38742895-38743095)
chr3 (176-374)||(12271383-12271583)
chr3 (258-380)||(3802716-3802839)
chr3 (189-374)||(29493527-29493715)
chr3 (196-374)||(2499032-2499212)
chr3 (196-374)||(45611647-45611827)
chr3 (189-374)||(43724052-43724239)
chr3 (258-379)||(3802554-3802676)
chr3 (258-379)||(54091720-54091842)
chr3 (189-374)||(28758873-28759060)
chr3 (189-374)||(50142757-50142944)
chr3 (194-374)||(50655976-50656158)
chr3 (194-374)||(53571222-53571404)
chr3 (189-374)||(3782739-3782927)
chr3 (194-374)||(10381918-10382101)
chr3 (194-374)||(10410571-10410754)
chr3 (196-374)||(10767737-10767917)
chr3 (244-381)||(18961002-18961139)
chr3 (196-374)||(21151445-21151625)
chr3 (189-374)||(47121121-47121308)
chr3 (189-374)||(47128489-47128676)
chr3 (258-380)||(15374697-15374820)
chr3 (189-374)||(14845155-14845343)
chr3 (120-241)||(27029558-27029679)
chr3 (120-241)||(27031726-27031847)
chr3 (196-374)||(54833175-54833355)
chr3 (147-248)||(18957712-18957814)
chr3 (117-235)||(54091821-54091939)
chr3 (176-279)||(20187671-20187775)
chr3 (117-235)||(15374599-15374718)
chr3 (150-235)||(3802489-3802575)
chr3 (189-317)||(11850717-11850848)
chr3 (237-317)||(11644873-11644953)
chr3 (219-317)||(17512563-17512663)
chr3 (176-317)||(10597787-10597933)
chr3 (150-211)||(10553825-10553887)
chr3 (237-317)||(11305825-11305905)
chr3 (164-317)||(2270315-2270470)
chr3 (319-374)||(6927529-6927583)
chr3 (150-255)||(17130649-17130756)
chr3 (189-317)||(18757016-18757149)
chr3 (150-255)||(38312268-38312375)
chr3 (15-69)||(18957632-18957686)
chr3 (15-69)||(49163021-49163075)
chr3 (237-317)||(12152895-12152975)
chr3 (219-317)||(12419415-12419515)
chr3 (150-255)||(14764248-14764355)
chr3 (150-255)||(14864740-14864847)
chr3 (150-255)||(23371994-23372101)
chr3 (150-255)||(51300054-51300161)
chr3 (150-211)||(12034510-12034572)
chr3 (15-113)||(8374246-8374347)
chr3 (295-364)||(18914144-18914213)
chr3 (150-211)||(19236169-19236230)
chr3 (221-317)||(12274248-12274347)
chr3 (309-364)||(15934960-15935016)
chr3 (156-211)||(18888924-18888980)
chr3 (156-211)||(18899963-18900019)
chr3 (295-364)||(12274364-12274435)
chr3 (164-317)||(17496088-17496243)
chr3 (197-235)||(3802699-3802737)
chr3 (150-211)||(10390560-10390622)
chr3 (150-211)||(10415669-10415731)
chr3 (150-211)||(10422339-10422401)
chr3 (17-59)||(11956914-11956956)
chr3 (295-364)||(14569938-14570008)
chr3 (310-364)||(17199011-17199065)
chr3 (18-59)||(9772239-9772279)
chr3 (226-298)||(12356031-12356104)
chr3 (226-298)||(12362580-12362653)
chr3 (319-364)||(13313907-13313952)
chr3 (309-364)||(17512694-17512751)
chr3 (309-370)||(18756925-18756985)
chr3 (319-364)||(23173922-23173967)
chr3 (319-376)||(23174317-23174374)
chr3 (309-376)||(2270216-2270284)
chr3 (150-213)||(12304701-12304765)
chr3 (156-211)||(17243843-17243899)
chr3 (309-376)||(17496274-17496341)
chr3 (156-211)||(23174117-23174173)
[»] chr1 (78 HSPs)
chr1 (15-380)||(49327841-49328216)
chr1 (120-380)||(29596788-29597049)
chr1 (120-380)||(21920719-21920980)
chr1 (150-381)||(47484059-47484291)
chr1 (150-381)||(43088343-43088576)
chr1 (133-381)||(36614870-36615120)
chr1 (218-380)||(29602223-29602386)
chr1 (176-378)||(42626177-42626381)
chr1 (189-378)||(4231179-4231371)
chr1 (189-378)||(21962996-21963188)
chr1 (196-374)||(20570739-20570919)
chr1 (189-374)||(20292671-20292858)
chr1 (196-374)||(6740516-6740696)
chr1 (196-374)||(18026689-18026869)
chr1 (196-374)||(28556439-28556619)
chr1 (194-374)||(38907991-38908173)
chr1 (194-374)||(39094317-39094499)
chr1 (196-374)||(20277189-20277369)
chr1 (194-374)||(37682082-37682265)
chr1 (189-374)||(31535237-31535424)
chr1 (189-374)||(31563954-31564141)
chr1 (189-374)||(39189618-39189805)
chr1 (189-374)||(48427844-48428031)
chr1 (194-374)||(22185541-22185723)
chr1 (196-374)||(18418122-18418302)
chr1 (194-374)||(37675389-37675572)
chr1 (189-335)||(17146249-17146397)
chr1 (231-379)||(20076882-20077033)
chr1 (196-302)||(3652709-3652816)
chr1 (176-281)||(9269910-9270016)
chr1 (176-279)||(52990692-52990796)
chr1 (176-269)||(24850077-24850171)
chr1 (196-281)||(36212043-36212128)
chr1 (258-374)||(20299374-20299492)
chr1 (196-279)||(20396911-20396994)
chr1 (218-281)||(20396865-20396928)
chr1 (189-317)||(24109078-24109211)
chr1 (221-364)||(21698159-21698305)
chr1 (237-317)||(15316561-15316641)
chr1 (176-317)||(23195529-23195675)
chr1 (189-317)||(24079543-24079676)
chr1 (221-364)||(22030704-22030849)
chr1 (189-240)||(20299349-20299400)
chr1 (150-255)||(20852183-20852290)
chr1 (150-255)||(20858809-20858916)
chr1 (150-255)||(21705174-21705281)
chr1 (319-374)||(36211988-36212042)
chr1 (313-374)||(20396810-20396871)
chr1 (15-69)||(36614805-36614859)
chr1 (15-69)||(47483977-47484031)
chr1 (226-317)||(11157038-11157131)
chr1 (237-317)||(21664203-21664284)
chr1 (15-60)||(24240767-24240812)
chr1 (237-317)||(11141058-11141138)
chr1 (167-313)||(20848993-20849145)
chr1 (150-211)||(16669435-16669497)
chr1 (237-317)||(19666787-19666869)
chr1 (15-69)||(43088261-43088315)
chr1 (237-317)||(19853074-19853155)
chr1 (237-317)||(19859209-19859290)
chr1 (17-81)||(4230983-4231046)
chr1 (221-317)||(21410731-21410830)
chr1 (156-211)||(21987129-21987185)
chr1 (150-255)||(16371489-16371596)
chr1 (235-317)||(31927473-31927556)
chr1 (295-364)||(20086450-20086519)
chr1 (17-59)||(21920604-21920645)
chr1 (221-317)||(23630980-23631078)
chr1 (157-186)||(7793000-7793029)
chr1 (319-364)||(19961297-19961342)
chr1 (319-364)||(20242694-20242739)
chr1 (311-364)||(20941826-20941879)
chr1 (157-186)||(21734654-21734683)
chr1 (309-370)||(24079707-24079768)
chr1 (309-370)||(24108987-24109047)
chr1 (156-211)||(19664292-19664348)
chr1 (223-298)||(22448334-22448412)
chr1 (319-363)||(23066673-23066717)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (117-380)||(1935-2198)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (15-380)||(29328007-29328380)
chr8 (150-381)||(29299023-29299253)
chr8 (150-381)||(29305569-29305799)
chr8 (117-380)||(14416519-14416784)
chr8 (150-379)||(11392552-11392783)
chr8 (105-380)||(43687310-43687583)
chr8 (117-379)||(25701514-25701778)
chr8 (176-378)||(40144242-40144445)
chr8 (176-378)||(16266816-16267021)
chr8 (176-378)||(27345695-27345899)
chr8 (189-374)||(23117202-23117389)
chr8 (176-374)||(14746470-14746671)
chr8 (176-374)||(3697623-3697823)
chr8 (189-374)||(10956636-10956823)
chr8 (189-362)||(26485982-26486158)
chr8 (176-374)||(3224634-3224835)
chr8 (196-374)||(16887249-16887429)
chr8 (189-374)||(27909535-27909722)
chr8 (189-374)||(27955954-27956141)
chr8 (189-374)||(36800393-36800580)
chr8 (194-374)||(14563539-14563721)
chr8 (189-374)||(9205301-9205488)
chr8 (189-374)||(28980717-28980904)
chr8 (189-374)||(28985937-28986124)
chr8 (194-374)||(4520684-4520867)
chr8 (196-374)||(23224698-23224877)
chr8 (194-374)||(14765585-14765767)
chr8 (261-379)||(27873818-27873937)
chr8 (261-379)||(27948606-27948725)
chr8 (196-374)||(14736772-14736952)
chr8 (17-233)||(27889736-27889964)
chr8 (17-233)||(27948394-27948622)
chr8 (196-374)||(35541048-35541228)
chr8 (261-379)||(27889948-27890067)
chr8 (258-378)||(6588132-6588253)
chr8 (120-233)||(27873721-27873834)
chr8 (156-317)||(23653798-23653962)
chr8 (219-317)||(39363504-39363604)
chr8 (256-374)||(214002-214123)
chr8 (256-374)||(238131-238252)
chr8 (256-374)||(727625-727746)
chr8 (256-374)||(800126-800247)
chr8 (256-374)||(851519-851640)
chr8 (156-317)||(23653040-23653206)
chr8 (237-317)||(20783927-20784006)
chr8 (221-317)||(19859533-19859631)
chr8 (319-374)||(10948554-10948608)
chr8 (150-255)||(24321720-24321827)
chr8 (150-255)||(27942291-27942398)
chr8 (221-317)||(14594808-14594906)
chr8 (236-317)||(38186014-38186096)
chr8 (176-240)||(6588093-6588158)
chr8 (221-317)||(21690487-21690584)
chr8 (221-364)||(20005592-20005737)
chr8 (150-255)||(8729130-8729237)
chr8 (221-317)||(21686162-21686260)
chr8 (176-263)||(31412618-31412710)
chr8 (176-263)||(31418800-31418892)
chr8 (309-364)||(20006374-20006430)
chr8 (237-317)||(36445806-36445888)
chr8 (194-240)||(213984-214030)
chr8 (194-240)||(238224-238270)
chr8 (194-240)||(727607-727653)
chr8 (194-240)||(800108-800154)
chr8 (194-240)||(851501-851547)
chr8 (150-211)||(8596253-8596315)
chr8 (295-364)||(21686075-21686145)
chr8 (17-59)||(43687207-43687249)
chr8 (319-364)||(22063558-22063603)
chr8 (319-364)||(22176030-22176075)
chr8 (237-317)||(16259558-16259637)
chr8 (15-59)||(16267166-16267209)
chr8 (327-378)||(20012136-20012188)
chr8 (321-364)||(39363648-39363692)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (17-379)||(101640-102010)
scaffold0037 (156-211)||(97504-97560)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (150-380)||(13-245)
scaffold0076 (310-364)||(51672-51725)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (22-381)||(74105-74474)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (117-379)||(543-807)
scaffold1427 (319-364)||(1000-1045)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (144-381)||(246966-247204)
scaffold0009 (144-381)||(253480-253718)
scaffold0009 (15-69)||(246889-246943)
scaffold0009 (15-69)||(253403-253457)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (133-381)||(178938-179188)
scaffold0001 (176-378)||(512512-512715)
scaffold0001 (295-364)||(488350-488420)
scaffold0001 (150-211)||(494120-494182)
scaffold0001 (156-186)||(524601-524631)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (120-339)||(7636-7856)
scaffold0310 (258-379)||(12921-13043)
scaffold0310 (120-235)||(12827-12942)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (150-379)||(65279-65510)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (150-381)||(41184-41415)
scaffold0060 (15-69)||(41102-41156)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (209-380)||(30845-31016)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (15-379)||(24457-24830)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (176-378)||(4616-4819)
scaffold0188 (235-317)||(31627-31710)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (176-377)||(15080-15284)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (176-378)||(19586-19790)
scaffold0103 (176-379)||(23793-23999)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (176-378)||(994-1200)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (176-379)||(15174-15380)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (176-378)||(870-1076)
[»] scaffold0113 (4 HSPs)
scaffold0113 (218-379)||(19235-19397)
scaffold0113 (117-279)||(19089-19252)
scaffold0113 (258-379)||(15177-15299)
scaffold0113 (117-235)||(15079-15198)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (176-374)||(5703-5903)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (7-179)||(1-177)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (176-378)||(25020-25223)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (15-263)||(143767-144028)
scaffold0019 (279-380)||(137159-137260)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (189-378)||(31632-31824)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (196-373)||(18401-18580)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (194-374)||(104284-104466)
scaffold0022 (309-376)||(38624-38691)
scaffold0022 (309-376)||(136684-136751)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (196-374)||(12208-12388)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (278-380)||(9835-9938)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (196-364)||(18513-18684)
scaffold0089 (156-257)||(1853-1958)
scaffold0089 (237-317)||(1984-2066)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (194-374)||(13403-13586)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (194-374)||(49998-50180)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (196-281)||(16100-16185)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (316-380)||(20096-20160)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (156-317)||(4178-4344)
scaffold0395 (321-364)||(4091-4135)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (176-317)||(26069-26215)
scaffold0104 (176-317)||(27451-27597)
[»] scaffold1061 (2 HSPs)
scaffold1061 (156-317)||(1244-1410)
scaffold1061 (295-376)||(1427-1509)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (237-317)||(9268-9348)
scaffold0124 (237-317)||(44938-45018)
scaffold0124 (150-211)||(36980-37042)
scaffold0124 (319-364)||(36789-36834)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (223-317)||(3353-3448)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (237-317)||(147050-147131)
scaffold0011 (221-317)||(75156-75255)
scaffold0011 (252-317)||(154186-154252)
scaffold0011 (221-317)||(56821-56920)
scaffold0011 (237-317)||(251927-252008)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (156-317)||(129747-129914)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (237-317)||(8518-8598)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (237-317)||(8280-8360)
scaffold0298 (237-317)||(18364-18444)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (237-317)||(9281-9361)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (219-317)||(5182-5282)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (237-317)||(47877-47957)
scaffold0114 (319-363)||(42091-42135)
[»] scaffold0516 (2 HSPs)
scaffold0516 (167-317)||(6096-6250)
scaffold0516 (295-364)||(6267-6337)
[»] scaffold0249 (3 HSPs)
scaffold0249 (150-255)||(14915-15022)
scaffold0249 (295-364)||(7778-7847)
scaffold0249 (156-211)||(7972-8028)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (219-317)||(248-349)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (157-257)||(16160-16264)
scaffold0139 (226-314)||(16056-16146)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (237-317)||(2912-2993)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (156-317)||(51089-51256)
scaffold0094 (295-362)||(51273-51341)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (237-317)||(999-1080)
scaffold0028 (221-317)||(64992-65090)
scaffold0028 (295-376)||(65107-65189)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (237-313)||(5067-5143)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (221-364)||(38448-38594)
scaffold0102 (235-317)||(44623-44706)
scaffold0102 (295-364)||(29944-30014)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (237-317)||(17484-17564)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (167-316)||(1-155)
[»] scaffold1251 (1 HSPs)
scaffold1251 (105-179)||(2230-2302)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (150-211)||(4331-4393)
[»] scaffold0331 (2 HSPs)
scaffold0331 (221-313)||(18532-18626)
scaffold0331 (297-364)||(18644-18712)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (156-364)||(42904-43116)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (295-364)||(1696-1765)
scaffold0348 (319-363)||(15451-15495)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (159-317)||(18230-18392)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (237-317)||(592-672)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (150-255)||(2967-3074)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (223-317)||(446-541)
scaffold0326 (221-317)||(5468-5566)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (150-255)||(110145-110252)
scaffold0026 (221-317)||(27973-28072)
scaffold0026 (221-317)||(38810-38909)
scaffold0026 (295-364)||(27886-27956)
scaffold0026 (295-364)||(38723-38793)
[»] scaffold0924 (2 HSPs)
scaffold0924 (295-364)||(2392-2462)
scaffold0924 (221-317)||(2276-2375)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (237-314)||(443-521)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (156-257)||(133-238)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (295-364)||(36323-36393)
scaffold0106 (221-317)||(28634-28733)
scaffold0106 (309-364)||(28751-28807)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (295-364)||(55912-55982)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (158-211)||(10421-10474)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (221-317)||(1409-1508)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (221-317)||(65-164)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (309-364)||(10626-10682)
scaffold0261 (309-364)||(18805-18861)
scaffold0261 (319-364)||(24472-24517)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (221-317)||(76741-76840)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (150-255)||(254-361)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (237-317)||(9372-9454)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (309-364)||(10076-10130)
scaffold0034 (159-257)||(35839-35941)
scaffold0034 (290-376)||(388-473)
scaffold0034 (290-376)||(6547-6632)
[»] scaffold1290 (1 HSPs)
scaffold1290 (295-364)||(1236-1305)
[»] scaffold0377 (2 HSPs)
scaffold0377 (310-364)||(3343-3397)
scaffold0377 (310-364)||(7382-7436)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (310-364)||(7402-7455)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (221-317)||(19821-19919)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (221-317)||(45527-45625)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (150-211)||(92296-92358)
scaffold0029 (150-211)||(98022-98084)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (295-364)||(207714-207783)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (319-364)||(139-184)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (319-364)||(11912-11957)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (156-212)||(4477-4534)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (319-364)||(41588-41633)
scaffold0107 (156-257)||(41732-41835)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (295-364)||(18136-18205)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (339-376)||(56044-56081)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (319-364)||(20489-20534)
[»] scaffold0661 (2 HSPs)
scaffold0661 (309-364)||(4058-4114)
scaffold0661 (221-317)||(4145-4244)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (237-317)||(3250-3330)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (319-363)||(14469-14513)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (309-376)||(6793-6860)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (319-363)||(17638-17682)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 108)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Original strand, 12461328 - 12461701
Alignment:
Q  7 acatcatcacatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattc 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12461328 acatcatcacatcatcttgtaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaacccatcgtaatttatgtataaatatacatgc 12461427  T
Q  107 atcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12461428 atcaacatcaatcaatatggcaactacaaccaatgagagagactcatgcatgacatgatgacaccattaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 12461527  T
Q  207 taccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 306  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12461528 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcatttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcattcaccgctgtgaacaactagtgctccatgacatga 12461627  T
Q  307 gtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12461628 gccctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 12461701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16844133 - 16843859
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatg 203  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  16844133 tcatcaacatcaatcaatatggca-ctacaaccaacaacagagactcatgcatgacatgacgacacccctaagactcctcaataaatgca-ttatgcatg 16844036  T
Q  204 tggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggaca 303  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844035 tggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggaca 16843936  T
Q  304 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16843935 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 16843859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 13019516 - 13019891
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| | ||   ||||||||||||||| ||||||||     
T  13019516 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaac-ttatcttcaaa-tcatttcatcatgataggtgtataaatatacatacatcaacaa 13019613  T
Q  115 caa-----------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    |||           ||| |||||||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  13019614 caacatcatcatcatcattatgacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgataccactaagacccctcaataaatgcaattatgcat 13019713  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13019714 gtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 13019813  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13019814 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 13019891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Original strand, 23520923 - 23521185
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||  |    
T  23520923 atcaatatgacaattacacccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacatcactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaccaaatag 23521021  T
Q  217 taccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521022 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgc 23521121  T
Q  317 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23521122 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 23521185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 380
Target Start/End: Original strand, 19439264 - 19439495
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19439264 tcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 19439363  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  19439364 agcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatcccgctgtttatgcatattctatggacctacttgtgt 19439463  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19439464 atatctacatacaacttgaccatgcatacatt 19439495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 380
Target Start/End: Original strand, 46649762 - 46649954
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  46649762 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgtgaacaac 46649861  T
Q  289 tagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46649862 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 46649954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17468443 - 17468242
Alignment:
Q  178 actcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccg 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17468443 actcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccg 17468344  T
Q  278 ctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcat 375  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17468343 ctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcat 17468245  T
Q  376 aca 378  Q
    |||    
T  17468244 aca 17468242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 178 - 378
Target Start/End: Original strand, 17584771 - 17584972
Alignment:
Q  178 actcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccg 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17584771 actcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccg 17584870  T
Q  278 ctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcat 375  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17584871 ctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcat 17584969  T
Q  376 aca 378  Q
    |||    
T  17584970 aca 17584972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2388750 - 2388547
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2388750 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 2388651  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 373  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2388650 cgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 2388552  T
Q  374 ataca 378  Q
    |||||    
T  2388551 ataca 2388547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Original strand, 46174303 - 46174509
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46174303 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 46174402  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  46174403 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatg 46174502  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  46174503 catacat 46174509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13964182 - 13963995
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  13964182 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 13964083  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13964082 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 13963995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Original strand, 49158722 - 49158921
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  49158722 agactcctcaaatatgcaat-atgcatgtggtaccaaacatgaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcac 49158820  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  49158821 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 49158919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 37285201 - 37285388
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37285201 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagctctcaccgctgttgagcaa 37285300  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37285301 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 37285388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20019864 - 20019659
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20019864 agactcgtcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 20019765  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20019764 cgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccat 20019666  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  20019665 gcataca 20019659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 11339770 - 11339950
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  11339770 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11339869  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11339870 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 11339950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11899482 - 11899302
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  11899482 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11899383  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11899382 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 11899302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26113928 - 26113748
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  26113928 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26113829  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26113828 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 26113748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 2438876 - 2439063
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  2438876 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 2438975  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2438976 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaact-gaccatgca 2439063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11299828 - 11299646
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11299828 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11299729  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11299728 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 11299646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11308192 - 11308010
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11308192 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11308093  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11308092 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 11308010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30271892 - 30271770
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctaca 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  30271892 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctaca 30271793  T
Q  358 tacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  30271792 tacaacttgaccatgcatacatt 30271770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 11879066 - 11879246
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  11879066 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 11879165  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11879166 tccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaact-gaccatgca 11879246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17726505 - 17726325
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  17726505 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgttgagcaactagtac 17726406  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17726405 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 17726325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18437339 - 18437159
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  18437339 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcttcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18437240  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18437239 tccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 18437159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 1317758 - 1317945
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1317758 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1317857  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1317858 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 1317945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26090130 - 26089943
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  26090130 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26090031  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26090030 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 26089943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40684942 - 40684755
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  40684942 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 40684843  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40684842 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 40684755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8197374 - 8197192
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  8197374 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 8197275  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8197274 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 8197192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5187423 - 5187235
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  5187423 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 5187324  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5187323 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaact-gaccatgca 5187235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 49150577 - 49150765
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  49150577 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 49150676  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49150677 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 49150765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 49157267 - 49157455
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  49157267 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 49157366  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49157367 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 49157455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 362
Target Start/End: Original strand, 642549 - 642718
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |    
T  642549 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtac 642648  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa 362  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  642649 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 642718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26120541 - 26120361
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  26120541 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcacgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26120442  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26120441 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaact-gaccatgca 26120361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 32627396 - 32627576
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  32627396 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 32627495  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32627496 tccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 32627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 749835 - 750022
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  749835 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 749934  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  749935 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 750022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48988100 - 48987913
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||    
T  48988100 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaa 48988001  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48988000 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 48987913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40923097 - 40922915
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  40923097 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagt 40922998  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40922997 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 40922915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 2281078 - 2281266
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  2281078 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 2281177  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgc--tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2281178 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 2281266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 42058546 - 42058729
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  42058546 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 42058645  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42058646 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 42058729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2026399 - 2026217
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  2026399 attatgcatgtggtaccaatcgggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 2026300  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   ||  ||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2026299 actccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 2026217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13453911 - 13453790
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatcta 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13453911 caggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 13453812  T
Q  356 catacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  13453811 catacaact-gaccatgcataca 13453790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 378
Target Start/End: Original strand, 21757354 - 21757475
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatcta 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21757354 caggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 21757453  T
Q  356 catacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21757454 catacaact-gaccatgcataca 21757475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 378
Target Start/End: Original strand, 37379952 - 37380073
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatcta 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  37379952 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 37380051  T
Q  356 catacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  37380052 catacaact-gaccatgcataca 37380073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 33404652 - 33404832
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  33404652 tatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccgtcatcgcttttgaatggttaaagcattcataaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 33404751  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    || |||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33404752 tctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 33404832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8213445 - 8213299
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  8213445 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 8213346  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatgga 337  Q
     |||||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8213345 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30272093 - 30271871
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaa-ca 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |||  ||  | |||||| |||| ||||  |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  30272093 atcatcttgcaaatataaatgtatattttacaaagtaacaacagcatcaccatcagatcaattcatcataatacatgtataagtatatactcatcaaaca 30271994  T
Q  114 tca--atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
     ||  ||||| ||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||| ||    
T  30271993 acatcatcaacatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcgataatgcagttatgcatgtggtatca 30271895  T
Q  212 aacggtaccgaagccctcaccgct 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  30271894 aacaggaccgaagccctcaccgct 30271871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 32771473 - 32771619
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |    
T  32771473 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccc 32771572  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32771573 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 32771619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30602974 - 30602854
Alignment:
Q  256 atcaggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatat 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30602974 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 30602875  T
Q  353 ctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  30602874 ctacatacaact-gaccatgca 30602854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 380
Target Start/End: Original strand, 15838732 - 15838797
Alignment:
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15838732 gctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 15838797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 3327778 - 3327924
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||  |    
T  3327778 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 3327877  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3327878 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 3327924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14179158 - 14179061
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14179158 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 14179061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37244506 - 37244359
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagca 270  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||      
T  37244506 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtc 37244407  T
Q  271 ctcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37244406 ctcaccgttttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 37244359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 46624800 - 46624967
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaa 250  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |   || |  | |||||||||||||  | |||||||||||||     
T  46624800 atgacatcacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccgatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaag 46624899  T
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46624900 cattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 46624967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 15455199 - 15455379
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||     
T  15455199 acattatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaac-ttatcttc-aaatcatttcatcataataggtgtataattatacatacatcaacaa 15455296  T
Q  115 ca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa 186  Q
    ||           |||| ||| |||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15455297 caacatcatcatcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaa 15455379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 37379914 - 37379978
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  37379914 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttga 37379978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18958613 - 18958480
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||    
T  18958613 atgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcatgacataagtcctcaccgctttgaa 18958514  T
Q  285 caacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18958513 caacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 18958480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15086072 - 15085974
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  15086072 gaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccatgacataagtcctcccgct 15085974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46682343 - 46682244
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46682343 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 46682244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 147019 - 147126
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  147019 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggtta 147118  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  147119 aagcattc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 2965883 - 2965990
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  2965883 tcatgcaggacatgacaaccccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 2965982  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  2965983 aagcattc 2965990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15437756 - 15437658
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15437756 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgctttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctcccgct 15437658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Original strand, 10519883 - 10519960
Alignment:
Q  240 aatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10519883 aatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctcccgct 10519960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 82227 - 82128
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  82227 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcactcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 82128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15098116 - 15098017
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15098116 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtccttccgct 15098017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15104493 - 15104394
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15104493 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccagaacatgagtcctcccgct 15104394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 18606824 - 18606880
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18606824 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 18606880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23666052 - 23665988
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  23666052 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 23665988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 29795682 - 29795746
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29795682 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29795746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 29799501 - 29799565
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  29799501 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29799565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14320790 - 14320683
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  14320790 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggtta 14320691  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  14320690 aagcattc 14320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 14565660 - 14565767
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  14565660 tcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggtta 14565759  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  14565760 aagcattc 14565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 15166726 - 15166833
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  15166726 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 15166825  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  15166826 aagcattc 15166833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 18871818 - 18871925
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  18871818 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 18871917  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  18871918 aagcattc 18871925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 19145524 - 19145629
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca---aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    || |  | |||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  19145524 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagc 19145623  T
Q  252 attcat 257  Q
    ||||||    
T  19145624 attcat 19145629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 20744923 - 20745028
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca---aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    || |  | |||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  20744923 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagc 20745022  T
Q  252 attcat 257  Q
    ||||||    
T  20745023 attcat 20745028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26289902 - 26289819
Alignment:
Q  235 ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26289902 ttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgttttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 26289819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 31154319 - 31154426
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||| |||||||||| | | |||||||||    
T  31154319 tcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaggccctcaccgttatagaatggtta 31154418  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  31154419 aagcattc 31154426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11857739 - 11857657
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11857739 tccagggcaagagtcctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 11857657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 13678240 - 13678345
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |    
T  13678240 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagc 13678339  T
Q  252 attcat 257  Q
    ||||||    
T  13678340 attcat 13678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20907585 - 20907523
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  20907585 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 20907523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 32771636 - 32771706
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32771636 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 32771706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11881677 - 11881580
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| |||     ||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11881677 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattagggtatgagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11881580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 12547215 - 12547296
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12547215 ttgaatggttaaagcatttatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcgtcccgct 12547296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 11302804 - 11302868
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11302804 tcatgcaagacatgaaaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 11302868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14266222 - 14266166
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  14266222 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 14266166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16952388 - 16952292
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcc 313  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||    
T  16952388 ccgaagacctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcttcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccatgacataagtcctcc 16952292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14945891 - 14945824
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14945891 cctcccgctttatatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactaaacaatgcata 14945824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15373484 - 15373417
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15373484 cctcccgctttatatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactaaacaatgcata 15373417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 15622161 - 15622212
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||    
T  15622161 atgcaaatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgctgttga 15622212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 16089973 - 16090080
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||  | | |||||||||    
T  16089973 tcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcacctttatagaatggtta 16090072  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  16090073 aaccattc 16090080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 101
Target Start/End: Original strand, 23518632 - 23518718
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||  ||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  23518632 atcatcttgcaaatataaatatatattttacaaaacaacaataacatcaccatcaaatcaattcatcataatatatgtataaatata 23518718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 49149702 - 49149752
Alignment:
Q  18 tcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  49149702 tcatcttgcaaatataaatatataattcaca-agcaacaacatcatcatcaa 49149752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 2464265 - 2464327
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2464265 tcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 2464327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3858580 - 3858518
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3858580 tcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 3858518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14581485 - 14581415
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| |||||| || | ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14581485 tccagggcatgagccctcccactttatatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14581415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15104377 - 15104307
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15104377 tccagggcaagagtcctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 15104307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 45185589 - 45185658
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45185589 tccagggcatgagccctcccgctttatatgt-tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 45185658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13453929 - 13453884
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  13453929 tatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttgaa 13453884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14255943 - 14255890
Alignment:
Q  159 acatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  14255943 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 14255890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 18607026 - 18607071
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18607026 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Original strand, 21757336 - 21757381
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaa 241  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  21757336 tatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttgaa 21757381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26289788 - 26289728
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26289788 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 26289728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37244328 - 37244268
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  37244328 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 37244268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14281661 - 14281617
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14281661 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16073978 - 16073934
Alignment:
Q  321 tatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16073978 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18958448 - 18958389
Alignment:
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18958448 ctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 18958389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30602990 - 30602946
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  30602990 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 30602946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35962753 - 35962709
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35962753 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10464555 - 10464179
Alignment:
Q  7 acatcatcacatcatcttgcaaatataaatatatat--ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464555 acatcatcacatcatcttgcaaatataaatatatatatttcacagagcaacggcattatcttcaaaatcagtccatcgtaatctatgtataaatatacat 10464456  T
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464455 tcatcaacatcaatcaatatggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 10464356  T
Q  205 ggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464355 ggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 10464256  T
Q  305 gagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464255 gagttctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 10464179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10471077 - 10470702
Alignment:
Q  7 acatcatcacatcatcttgcaaatataaatatatat--ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10471077 acatcatcacatcatcttgcaaatataaatatatatatttcacagagcaacgacattatcttcaaaatcagtccatcgtaatctatgtataaatatacat 10470978  T
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470977 tcatcaacatcaatcaatatggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 10470878  T
Q  205 ggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470877 ggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 10470778  T
Q  305 gagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10470777 gagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 10470702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12447538 - 12447166
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||     
T  12447538 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaaaatcaattcatcataatatatgtataaatatatgttcatcaacaa 12447439  T
Q  115 ca-----atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggta 208  Q
    ||     ||||||||||||  |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12447438 catcatcatcaatatgacatttacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggta 12447339  T
Q  209 ccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgag 307  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12447338 ccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgtgaacaacaagtgctctaggacatgag 12447239  T
Q  308 tcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12447238 tcctcccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 12447166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17208087 - 17207708
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatat--ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaac 112  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  17208087 acatcatcttgtaagtataaatatatatatttcacaaggcaacaacatcatcttcaaaatcaatccatcataatatatgtataagtatatattcatcaac 17207988  T
Q  113 atca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgca 201  Q
    | ||           ||||||||| ||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17207987 aacatcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaataaagactcatgcatgacatgacgaccccactaagactcctcaataatgcaattatgca 17207888  T
Q  202 tgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccagg 300  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17207887 tgtggtaccaaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatatgaacaactagtgctccagg 17207788  T
Q  301 acatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17207787 acatgagtcctcccactgtttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 17207708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Original strand, 29925615 - 29925878
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaact-acaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  29925615 atcaatatgacaacttacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaattatgcaaatatgcatgtggtaccaaaca 29925713  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccg 315  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29925714 ggaccgaagtcctcaccccttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctcccg 29925813  T
Q  316 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29925814 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 29925878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 379
Target Start/End: Original strand, 27767314 - 27767542
Alignment:
Q  153 tgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27767314 tgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 27767413  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtat 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27767414 attcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 27767513  T
Q  351 atctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27767514 atctacatacaacttgaccatgcatacat 27767542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Original strand, 14582783 - 14582988
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14582783 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 14582882  T
Q  276 cgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct-cccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14582883 cgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccccactgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaactagatcatgca 14582982  T
Q  375 tacatt 380  Q
    ||||||    
T  14582983 tacatt 14582988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 380
Target Start/End: Original strand, 13940242 - 13940617
Alignment:
Q  18 tcatcttgcaaatataaatatatatttcacaga-gcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacatca 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13940242 tcatcttgtaaatataaatatatatatctcacaagcaacaacatcatcttcaaa-tcaattcatcatagtatatgtataaatatatattcatcaacaaca 13940340  T
Q  117 -----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgt 204  Q
               ||||||||| ||| ||| | |||  ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13940341 tcatcatcatcatcaatatggcaattacgaacaacaacaaagactcatggatgacatgactacaccactaagacccctcaatagatgcaattatgcatgt 13940440  T
Q  205 ggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggaca 303  Q
    ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13940441 ggtaccaaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgaca 13940540  T
Q  304 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  13940541 tgagtcctcccgttgtttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatgcaaacatt 13940617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23021568 - 23021318
Alignment:
Q  133 caaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctca 230  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  23021568 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacacctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 23021469  T
Q  231 ccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 330  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23021468 ccgctttagaatggttaaagaattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 23021369  T
Q  331 caatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23021368 caatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 23021318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 94666 - 94460
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  94666 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 94567  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  94566 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 94467  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  94466 catacat 94460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 227 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13128390 - 13128236
Alignment:
Q  227 ctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgc 325  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13128390 ctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgg 13128291  T
Q  326 atatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13128290 atatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 13128236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8069865 - 8069665
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8069865 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 8069766  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8069765 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 8069667  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  8069666 ca 8069665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 1070609 - 1070796
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1070609 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1070708  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1070709 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 1070796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15332280 - 15332093
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  15332280 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 15332181  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15332180 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 15332093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 17309665 - 17309852
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17309665 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17309764  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17309765 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 17309852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 25463832 - 25464019
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  25463832 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 25463931  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25463932 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 25464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34134128 - 34133941
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  34134128 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 34134029  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34134028 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 34133941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 29159059 - 29159247
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaaca 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  29159059 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 29159158  T
Q  287 actagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29159159 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 29159247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16223816 - 16223629
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  16223816 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 16223717  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16223716 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 16223629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 24369186 - 24369365
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  24369186 tatgcatgtggtaccaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 24369284  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24369285 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 24369365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25315796 - 25315616
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  25315796 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 25315697  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25315696 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 25315616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26203290 - 26203110
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  26203290 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 26203191  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26203190 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 26203110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30799587 - 30799408
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  30799587 tatgcatgtggtaccaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 30799489  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30799488 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 30799408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 4106688 - 4106871
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  4106688 atgcaaatatgaatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 4106787  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||     |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4106788 ctagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaact-gaccatgca 4106871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 117 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17894756 - 17894611
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  17894756 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagaca 17894657  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagg 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17894656 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 17894611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 22406613 - 22406801
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg--tgaaca 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |    
T  22406613 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtttgagta 22406712  T
Q  287 actagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22406713 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctact-gtgtatatctacatacaact-gaccatgca 22406801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13136010 - 13135929
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcac 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13136010 tcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcatatattcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 13135929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Original strand, 25347034 - 25347206
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaata-tgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggt 245  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |  | |   |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25347034 tcatgcaagacatgacaactccactaagacacctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttgaatggt 25347133  T
Q  246 taaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25347134 taaagcattcatcaggacctaggccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 25347206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23235082 - 23234982
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  23235082 ccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtactcaccgctttgaacaacatggtgttccaggacataagtcctcccgc 23234983  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  23234982 t 23234982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 24362628 - 24362746
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatct 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24362628 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 24362727  T
Q  355 acatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  24362728 acatacaact-gaccatgca 24362746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 25395958 - 25396125
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaaa 250  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  | |||||||||||| | | |||||||||||||     
T  25395958 atgatatgacgacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaag 25396057  T
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  25396058 cattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctcccgct 25396125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26418820 - 26418719
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 315  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  26418820 ccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccg 26418721  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  26418720 ct 26418719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23233544 - 23233463
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23233544 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 23233463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 17414038 - 17414118
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17414038 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 17414118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 15457417 - 15457524
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  15457417 tcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggtta 15457516  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  15457517 aagcattc 15457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 15464012 - 15464119
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  15464012 tcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggtta 15464111  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  15464112 aagcattc 15464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 19451326 - 19451407
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19451326 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 19451407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19472460 - 19472379
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19472460 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 19472379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10582975 - 10582895
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10582975 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacttgagtcctcccgct 10582895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5290291 - 5290196
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5290291 agccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagtgttccagaacatgagtcctcccgct 5290196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19096812 - 19096758
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19096812 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 19096758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14133082 - 14133011
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgttt-atgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14133082 tccagggcaagagccctcccgctgttttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20009105 - 20008998
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  20009105 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgtaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 20009006  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  20009005 aagcattc 20008998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 24720638 - 24720720
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720638 ttgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24720720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 937697 - 937655
Alignment:
Q  321 tatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  937697 tatgcttatgcaattgacccactcgtgtatatctacatacaac 937655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 18786204 - 18786274
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18786204 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20011164 - 20011102
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  20011164 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 20011102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23021633 - 23021579
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23021633 acatcatcttgtaaatacaaatatatgtttcacaaagcaacaacatcatcttcaa 23021579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28290432 - 28290370
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  28290432 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 28290370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9100233 - 9100172
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  9100233 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaatgcaactatgcatgtggtacca 9100172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Original strand, 18786031 - 18786187
Alignment:
Q  167 acaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcat-cagg 261  Q
    |||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |  | |  | |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||    
T  18786031 acaccaataagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggcagaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttattcagg 18786130  T
Q  262 accgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||  |||  ||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18786131 acataagtcctcaccgcttttaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 18786187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 19467858 - 19467939
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||| | |||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19467858 ttgaatggttaaagcattcattagggcctaagccctcaccgatttgaacaataaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 19467939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 29096758 - 29096819
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  29096758 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaatgcaactatgcatgtggtacca 29096819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 12941752 - 12941816
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  12941752 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaa 12941816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 4476317 - 4476424
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  4476317 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 4476416  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  4476417 aagcattc 4476424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 31250244 - 31250351
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  ||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  31250244 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggtta 31250343  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  31250344 aagcattc 31250351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10582878 - 10582808
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10582878 tccaggacaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 10582808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19096861 - 19096815
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  19096861 atgcaaatatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgct 19096815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 19467962 - 19468043
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19467962 tccagggcaagagccctcccgct-tttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 19468043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21365692 - 21365630
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21365692 tcatgcaagacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 21365630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 23105332 - 23105402
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  23105332 tccagggcatgagccctcccgctttatatgtttatgcaatggactccacttatgtatatctacatacaact 23105402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23969674 - 23969612
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23969674 tcatgcaagacatgacaacccttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 23969612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 376
Target Start/End: Original strand, 2708552 - 2708589
Alignment:
Q  339 ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2708552 ccacttgtgtatatctacatacaactagacaatgcata 2708589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8768190 - 8768145
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8768190 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19300684 - 19300639
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19300684 tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23234951 - 23234891
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23234951 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 23234891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 94855 - 94812
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  94855 acatcatcttgcaaatataagtatataattcaca-agcaacaaca 94812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 257
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592821
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat 257  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcat 1592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Original strand, 17414149 - 17414216
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17414149 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcata 17414216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 19726766 - 19726810
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19726766 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24513852 - 24513785
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24513852 cctcccgct-tttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcata 24513785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23082092 - 23081714
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  23082092 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaaaatcaattcatcataatatatgtataaatatatattcatcaacaa 23081993  T
Q  115 ca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    ||           ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  23081992 catcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcat 23081893  T
Q  203 gtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccagga 301  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081892 gtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccagga 23081793  T
Q  302 catgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23081792 catgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 23081714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 23076644 - 23076266
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  23076644 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaaaatcaattcatcataatatatgtataaatatatattcatcaacaa 23076545  T
Q  115 ca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    ||           ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  23076544 catcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcat 23076445  T
Q  203 gtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccagga 301  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076444 gtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccagga 23076345  T
Q  302 catgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23076344 catgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 23076266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 69 - 380
Target Start/End: Original strand, 20990172 - 20990485
Alignment:
Q  69 aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacatca--atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacg 166  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||| |||||  |||||||| ||||| |||  |||  | | ||| |||||||||||||||||    
T  20990172 aaatcaatccatcataatatatgtataaatgtatactcatcatcatcatcatcaatataacaaccacagtcaacaataaagactcatgcatgacatgacg 20990271  T
Q  167 acaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccga 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20990272 acaccactaagactcctcaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccga 20990370  T
Q  267 agcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacta 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20990371 agccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacta 20990470  T
Q  366 gaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||    
T  20990471 gaccatgcatacatt 20990485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7774003 - 7773623
Alignment:
Q  8 catcatcacatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattca 107  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| | || |||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||    
T  7774003 catcaacacttcatcttgtaaatataaatatataactcacaaaacatcaacatcatcttcaaaatcaattcatcacaatatatgtataagtatatattca 7773904  T
Q  108 tcaacatca-----atcaa---tatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatg 199  Q
    |||||| ||     |||||   |||| |||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7773903 tcaacaacatcatgatcaacattatggcaactacatccaacaacaaagactcatgcatgacatgactacaccactaagactctccaaatatgcaattatg 7773804  T
Q  200 catgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccag 299  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7773803 catgtggtaccaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccag 7773705  T
Q  300 gacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7773704 gacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgcatacatt 7773623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 150 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28260079 - 28259848
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28260079 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaa 28259980  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28259979 gcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 28259880  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28259879 atatctacatacaactagaccatgcatacatt 28259848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23545215 - 23544835
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatat--ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23545215 acatcatcttgtaaatataaatatatatatttcacaaagcaacatcatcatcttcaaa-tcaattcatcataatatatgtataaatatatattcatcaac 23545117  T
Q  113 atca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgc 200  Q
    | ||           ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  23545116 aacatcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagatccctcaataaatgcaattatgc 23545017  T
Q  201 atgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccag 299  Q
    ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23545016 atgcggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgccccag 23544917  T
Q  300 gacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23544916 gacattagtcatcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 23544835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Original strand, 24057411 - 24057783
Alignment:
Q  19 catcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacatcaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |  | | ||||   |||||||||||||||||||||||| |||     
T  24057411 catcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacttcatcttcaaa-tcatttgaccataataggtgtataaatatacattcatcaacaacaac 24057509  T
Q  118 ----------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtgg 206  Q
              ||| ||| |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  24057510 atcatcatcatcattataacaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtgg 24057609  T
Q  207 taccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 306  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24057610 taccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 24057709  T
Q  307 gtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24057710 gtcctcccgctgtgtatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaacttgaccatgcatacatt 24057783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 25419630 - 25420004
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||     
T  25419630 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacttcatcttcaaa-tcatttcatcataataggtgtataaatatacattcatcaacaa 25419728  T
Q  115 ca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtg 205  Q
    ||        |||| ||| |||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||    
T  25419729 catcatcatcatcattataacaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgtcaccactaagacccctcaataaatgcatttatgcatgtg 25419828  T
Q  206 gtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25419829 gtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgtgaacaaatagtgctccaggacat 25419928  T
Q  305 gagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25419929 gagtcctcccgctgtttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgaatacatt 25420004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 26650209 - 26650585
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaa--- 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||   |  | |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||       
T  26650209 atcatcttgcaaatataattatatattttacaaagcaacaacagcatcactatcagatcaattcatcgtaatatatgtataaatatatactcatcaaaca 26650308  T
Q  112 ----catcaa-----tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 202  Q
        ||||||     |||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  26650309 acatcatcaacatcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataatgcagatatgcat 26650407  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26650408 gtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgac 26650507  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26650508 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 26650585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Original strand, 26921794 - 26922170
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaa--- 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||   |  | |||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||       
T  26921794 atcatcttgcaaatataattatatattttacaaagcaacaacagcatcactatcagatcaattcatcgtaatatatgtataaatatatactcatcaaaca 26921893  T
Q  112 ----catcaa-----tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 202  Q
        ||||||     |||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||    
T  26921894 acatcatcaacatcatcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataatgcagatatgcat 26921992  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26921993 gtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccatgac 26922092  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26922093 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 26922170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5342069 - 5341694
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||     
T  5342069 acattatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaac-ttatcttcaaa-tcatttcatcataataggtgtataattatacatacatcaacaa 5341972  T
Q  115 caa-----------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    |||           ||| ||| | || ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  5341971 caacatcatcatcatcattataaaaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgtaattatgcat 5341872  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5341871 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 5341772  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5341771 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 5341694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 39609223 - 39608848
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||||||||| ||||||||     
T  39609223 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaac-ttatcttcaaa-tcaattcatcataataggtgtataaatatacatacatcaacaa 39609126  T
Q  115 caa-----------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    |||           ||| ||| |||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  39609125 caacatcatcatcatcattataacaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagaccccttaataaatgcaattatgcat 39609026  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39609025 gtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 39608926  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39608925 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 39608848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16775291 - 16775018
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775291 tcatcaacatca-tcaatatgacaattacaaccaacatca-agactcatccatgacatgacaacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 16775194  T
Q  205 ggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16775193 ggcaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacat 16775094  T
Q  305 gagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16775093 gagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 16775018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18941436 - 18941188
Alignment:
Q  133 caaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcacc 232  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18941436 caaccaacaacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 18941337  T
Q  233 gcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgca 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18941336 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagccctcccgctgtttatgcatatgct 18941237  T
Q  333 atggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18941236 atggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 18941188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41878211 - 41877980
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878211 tcatgcaagacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 41878112  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  41878111 agcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtg 41878012  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41878011 tatatctacatacaacttgaccatgcatacat 41877980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 37565957 - 37566221
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  37565957 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgataacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagaca 37566056  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  37566057 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctcc 37566156  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37566157 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 37566221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19802109 - 19801859
Alignment:
Q  133 caaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctca 230  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  19802109 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 19802010  T
Q  231 ccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19802009 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatcccgctgtttatgcatatg 19801910  T
Q  331 caatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19801909 ctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 19801859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Original strand, 19362550 - 19362783
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19362550 tcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 19362649  T
Q  248 aaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    || |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19362650 aagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcatcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtg 19362749  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19362750 tatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 19362783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Original strand, 22507487 - 22507691
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22507487 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 22507586  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  22507587 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaact-gaccatg 22507685  T
Q  373 cataca 378  Q
    ||||||    
T  22507686 cataca 22507691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 22500920 - 22501110
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  22500920 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 22501019  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22501020 ctagtgctccaagacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcataca 22501110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Original strand, 597203 - 597402
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  597203 agactcctcaaatatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 597301  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  597302 cgctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 597400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19800522 - 19800316
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  19800522 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctca 19800423  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19800422 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat 19800323  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  19800322 gcataca 19800316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 258 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 41877932 - 41877809
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877932 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 41877833  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41877832 atacaactagaccatgcatacatt 41877809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Original strand, 19508115 - 19508291
Alignment:
Q  200 catgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgctcca 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  19508115 catgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactcca 19508214  T
Q  299 ggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19508215 ggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 19508291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Original strand, 22379543 - 22379658
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctaca 357  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22379543 caggaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctaca 22379642  T
Q  358 tacaactagaccatgc 373  Q
    ||||||| ||||||||    
T  22379643 tacaacttgaccatgc 22379658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 5454437 - 5454617
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  5454437 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 5454536  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5454537 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 5454617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5582438 - 5582258
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  5582438 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 5582339  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5582338 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 5582258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 25852924 - 25853104
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  25852924 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 25853023  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25853024 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 25853104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14615118 - 14614931
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  14615118 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 14615019  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14615018 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14614931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22248409 - 22248222
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  22248409 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 22248310  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22248309 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 22248222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 364
Target Start/End: Original strand, 10686093 - 10686264
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  10686093 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 10686192  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10686193 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 10686264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14889160 - 14888972
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  14889160 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 14889061  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14889060 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14888972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 25846292 - 25846472
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |    
T  25846292 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtac 25846391  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25846392 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 25846472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 30781013 - 30781193
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| |    
T  30781013 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtac 30781112  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30781113 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 30781193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40011133 - 40010953
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  40011133 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 40011034  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40011033 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 40010953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24795184 - 24794997
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  24795184 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 24795085  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24795084 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 24794997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24800551 - 24800364
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  24800551 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 24800452  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24800451 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 24800364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37540126 - 37539939
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||    
T  37540126 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaa 37540027  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37540026 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 37539939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37547670 - 37547483
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||    
T  37547670 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaa 37547571  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37547570 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 37547483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1111841 - 1111659
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  1111841 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 1111742  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1111741 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 1111659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 38013680 - 38013862
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  38013680 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 38013779  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38013780 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 38013862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7508183 - 7507995
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  7508183 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 7508084  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7508083 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 7507995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14882483 - 14882295
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  14882483 atgcaattatgcatgcggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 14882384  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14882383 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14882295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17939047 - 17938864
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  17939047 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 17938948  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17938947 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 17938864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 43028989 - 43029169
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  43028989 tatgcatgtggtaccaatcaagaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 43029088  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43029089 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 43029169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 11995078 - 11995265
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  11995078 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 11995177  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||| |||||   || |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11995178 ctagtactctaggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 11995265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 15461421 - 15461600
Alignment:
Q  197 atgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgct 295  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||    
T  15461421 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 15461520  T
Q  296 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15461521 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 15461600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18895156 - 18894976
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  18895156 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggctgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18895057  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18895056 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 18894976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29746692 - 29746569
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatct 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29746692 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 29746593  T
Q  355 acatacaactagaccatgcataca 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  29746592 acatacaacttgaccatgcataca 29746569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 378
Target Start/End: Original strand, 18566603 - 18566721
Alignment:
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacat 358  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  18566603 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 18566702  T
Q  359 acaactagaccatgcataca 378  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  18566703 acaa-ttgaccatgcataca 18566721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 261 - 374
Target Start/End: Original strand, 20347157 - 20347272
Alignment:
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctaca 357  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20347157 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 20347256  T
Q  358 tacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20347257 tacaact-gaccatgca 20347272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 235
Target Start/End: Original strand, 22379455 - 22379564
Alignment:
Q  127 caactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagc 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  22379455 caactacaaccaacgacagagactaatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagc 22379554  T
Q  226 cctcaccgct 235  Q
    ||||||||||    
T  22379555 cctcaccgct 22379564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 374
Target Start/End: Original strand, 20340553 - 20340668
Alignment:
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctaca 357  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  20340553 gaccgaagccatcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctaca 20340652  T
Q  358 tacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20340653 tacaact-gaccatgca 20340668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27636030 - 27635930
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  27636030 ccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgc 27635931  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  27635930 t 27635930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24751729 - 24751584
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcact 272  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||    
T  24751729 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctct 24751630  T
Q  273 caccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24751629 caccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24751584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 21829546 - 21829626
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21829546 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 21829626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24669141 - 24669046
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24669141 agccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24669046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24738910 - 24738815
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24738910 agccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24738815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 19362469 - 19362522
Alignment:
Q  16 catcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19362469 catcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaa 19362522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19802175 - 19802122
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19802175 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttca 19802122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23444353 - 23444254
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23444353 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 23444254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 19235799 - 19235906
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  19235799 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 19235898  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  19235899 aagcattc 19235906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28371650 - 28371543
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  28371650 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggtta 28371551  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  28371550 aagcattc 28371543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38145977 - 38145870
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  38145977 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggtta 38145878  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  38145877 aagcattc 38145870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 42960034 - 42960141
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  42960034 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggtta 42960133  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  42960134 aagcattc 42960141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 20843186 - 20843267
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  | || ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20843186 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataggccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 20843267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21574168 - 21574071
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||| || ||||  |||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21574168 gaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcctaagccatcaccgcactgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 21574071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29746731 - 29746666
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  29746731 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctgttga 29746666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 427242 - 427341
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  427242 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 427341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 9775419 - 9775483
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  9775419 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 9775483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 18566562 - 18566626
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||    
T  18566562 agacttctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccagacatgaccgaagccctcaccgctgttga 18566626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23561744 - 23561664
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||  || |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23561744 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgcttggaccaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 23561664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37805540 - 37805476
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  37805540 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 37805476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 18941502 - 18941451
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatctt 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  18941502 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcccaaagcaacaacatcatctt 18941451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 22336059 - 22336166
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  22336059 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 22336158  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  22336159 aagcattc 22336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 22460054 - 22460161
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||  | | | |||||||||    
T  22460054 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcattgttatagaatggtta 22460153  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  22460154 aagcattc 22460161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 22466678 - 22466785
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  22466678 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 22466777  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  22466778 aagcattc 22466785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 22749705 - 22749812
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  22749705 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 22749804  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  22749805 aagcattc 22749812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Original strand, 24008126 - 24008180
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24008126 tttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 24008180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 34828980 - 34829087
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  34828980 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccggagccctcaccgttatagaatggtta 34829079  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  34829080 aagcattc 34829087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23112962 - 23112900
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  23112962 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 23112900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28890583 - 28890521
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28890583 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28890521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28897287 - 28897225
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28897287 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28897225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28910487 - 28910425
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28910487 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28910425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28925755 - 28925693
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28925755 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28925693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28932178 - 28932116
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28932178 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28932116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28933682 - 28933620
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28933682 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28933620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28946882 - 28946820
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28946882 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 28946820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22232674 - 22232605
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22232674 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22232605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 212
Target Start/End: Original strand, 33536284 - 33536320
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33536284 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaa 33536320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 597027 - 597077
Alignment:
Q  18 tcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||    
T  597027 tcatcttgcaaatataaatatataattcaca-agcaacaacaatatcatcaa 597077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 20347129 - 20347180
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  20347129 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccctcaccgctgttga 20347180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 22339597 - 22339704
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  22339597 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtcgtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 22339696  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  22339697 aagcattc 22339704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15194068 - 15193998
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| | |||| ||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15194068 tccagggcctgagccctcccgctttaaatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15193998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37599518 - 37599456
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  37599518 tcatgcaagacatgacaactccactaagacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 37599456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41877949 - 41877911
Alignment:
Q  197 atgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgct 235  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41877949 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 41877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23112753 - 23112708
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23112753 tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Original strand, 26753622 - 26753690
Alignment:
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26753622 cattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 26753690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 34829191 - 34829236
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34829191 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Original strand, 20843298 - 20843354
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20843298 cctcccgctttatatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 20843354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 20937755 - 20937799
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20937755 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22312845 - 22312801
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22312845 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23561633 - 23561577
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23561633 cctcccgctttatatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 23561577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 118 - 380
Target Start/End: Original strand, 42220302 - 42220565
Alignment:
Q  118 tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42220302 tcaatatggcaactacaaccaacgacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 42220401  T
Q  217 taccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42220402 gaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgc 42220501  T
Q  317 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42220502 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 42220565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 105 - 381
Target Start/End: Original strand, 33096952 - 33097228
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatg 203  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  33096952 tcatcaacatcaatcaatacggca-ctacaaccaacgacagagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatg 33097050  T
Q  204 tggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggaca 303  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33097051 tggtaccaaacaggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggaca 33097150  T
Q  304 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33097151 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 33097228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 21881462 - 21881725
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    |||||||| ||||| |||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21881462 atcaatataacaaccacaatcaacaataaagattcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 21881561  T
Q  217 taccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccg 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  21881562 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgaggcatctccg 21881661  T
Q  316 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21881662 ctgtttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 21881725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 33221131 - 33221504
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||| |||| | ||| |||||||| |||||||  ||| | | |||||||||| |||||||||||     
T  33221131 acatcatcttgtaaatataagtttatatctcaca-agcagcaacctcatcatcaaaatccatccatcacaatatgtatataaatatatattcatcaacaa 33221229  T
Q  115 ca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 206  Q
    ||        |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33221230 catcatcatcatcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccaccaagactcctcaactatgcaaatatgcatgtgg 33221329  T
Q  207 taccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33221330 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatttatcatgaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacacga 33221429  T
Q  307 gtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33221430 gtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaactagaccatgcatacatt 33221504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 20894863 - 20895127
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20894863 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaagattcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 20894962  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20894963 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctcc 20895062  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20895063 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 20895127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 46045203 - 46044819
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat---------- 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||              
T  46045203 acatcatcttgtaaatataaatatatctttcacaaagcaacaacatcatctgcaaaatcaattcatcataatatatgtataaatatatatatttcatcaa 46045104  T
Q  105 -----tcatcaacatca--atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaatt 196  Q
         |||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  46045103 caacatcatcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagacccctcaataaatgcaatt 46045004  T
Q  197 atgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgct 295  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46045003 atgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacattagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 46044904  T
Q  296 ccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46044903 ccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 46044819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2972912 - 2972682
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2972912 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcttcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcactcaccgcttttgaatggttaaa 2972813  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2972812 gcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgt 2972713  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2972712 atatctacatacaacttgaccatgcatacat 2972682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 49548797 - 49548533
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  49548797 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaaaactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 49548698  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  49548697 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttctctcc 49548598  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49548597 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 49548533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 20889244 - 20889508
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20889244 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 20889343  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20889344 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcgccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctcc 20889443  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20889444 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 20889508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 176 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35462765 - 35462560
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35462765 agactccgcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 35462666  T
Q  276 cgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35462665 cgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 35462566  T
Q  375 tacatt 380  Q
    ||||||    
T  35462565 tacatt 35462560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 31664929 - 31665193
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||     
T  31664929 atcaatttggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaaaatatgcagttatgcatgtggtaccagaca 31665028  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31665029 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctcc 31665128  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31665129 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgcatacat 31665193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19128523 - 19128292
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19128523 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgagtggttaa 19128424  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19128423 agcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacctacttgtg 19128324  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19128323 tatatctacatacaacttgaccatgcatacat 19128292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 41404920 - 41404656
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-c 214  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41404920 atcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacataacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaac 41404821  T
Q  215 ggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccc 314  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41404820 tggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcatgaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcttccc 41404721  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41404720 gctg-ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 41404656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Original strand, 899497 - 899728
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  899497 tcatgcatgacatgatgacaccactaagac-cctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 899595  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
    | |||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  899596 agcattcatcagaacataagccatcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgt 899695  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  899696 atatctacatacaacttgaccatgcatacattt 899728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Original strand, 30396057 - 30396330
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 204  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||    
T  30396057 tcatcaacatca-tcaatatggcaattacaacccacaaccaagactcatgcatgacatgacaaaaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgt 30396155  T
Q  205 ggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30396156 ggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttt-gaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaacgctgtgaacaactagtgctccaggacat 30396254  T
Q  305 gagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30396255 gagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 30396330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Original strand, 36037465 - 36037696
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36037465 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctctacaaatgcaactatgcatgcggtaccaaccaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaa 36037564  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36037565 agcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactaatgttccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtg 36037664  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36037665 tatatctacatacaacttgaccatgcatacat 36037696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 47872577 - 47872371
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47872577 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctca 47872478  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47872477 ccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 47872378  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  47872377 catacat 47872371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 223 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 49548475 - 49548317
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49548475 agccctcaccgcttttaaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 49548376  T
Q  322 atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49548375 atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 49548317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45142704 - 45142499
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  45142704 agactcctcaaatatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 45142605  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45142604 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 45142505  T
Q  373 cataca 378  Q
    ||||||    
T  45142504 cataca 45142499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Original strand, 7359175 - 7359375
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7359175 agacacctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 7359274  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7359275 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 7359373  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  7359374 ca 7359375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 189 - 379
Target Start/End: Original strand, 34772108 - 34772301
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  34772108 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgattggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 34772207  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34772208 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgactatgcatacat 34772301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 45959883 - 45959691
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  45959883 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 45959784  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45959783 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcataca 45959691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 176 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54845103 - 54844912
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  54845103 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagacctca 54845004  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  54845003 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42956177 - 42955971
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  42956177 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctca 42956078  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42956077 ccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcatctctgctgtttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 42955978  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  42955977 catacat 42955971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11202585 - 11202385
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  11202585 agactccgcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaacccctcac 11202486  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11202485 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagct-gaccatg 11202387  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  11202386 ca 11202385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 1583850 - 1584037
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1583850 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 1583949  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1583950 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 1584037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 5938865 - 5939052
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgc-tgtgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||    
T  5938865 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgcttttgagcaa 5938964  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5938965 ctagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 5939052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 52500498 - 52500678
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  52500498 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 52500597  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52500598 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 52500678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 26395625 - 26395812
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  26395625 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26395724  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26395725 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 26395812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29455497 - 29455315
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  29455497 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 29455398  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29455397 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 29455315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3260126 - 3259946
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  3260126 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 3260027  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3260026 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataact-gaccatgca 3259946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 176 - 330
Target Start/End: Original strand, 7356182 - 7356339
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7356182 agacacctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 7356281  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatg 330  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7356282 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 21396756 - 21396944
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaaca 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  21396756 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagca 21396855  T
Q  287 actagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21396856 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 21396944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23436117 - 23435937
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  23436117 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 23436018  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23436017 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 23435937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 29448813 - 29448640
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  29448813 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 29448714  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29448713 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 29448640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3266761 - 3266574
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  3266761 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 3266662  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3266661 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 3266574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39266374 - 39266192
Alignment:
Q  193 aattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactag 291  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  39266374 aattatgcatgtggtaccaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactag 39266276  T
Q  292 tgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    | |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39266275 tactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 39266192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 11937103 - 11937286
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11937103 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11937202  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || | || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11937203 actccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 11937286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29382899 - 29382719
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  29382899 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 29382800  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29382799 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 29382719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49240978 - 49240799
Alignment:
Q  197 atgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgct 295  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||    
T  49240978 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 49240879  T
Q  296 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49240878 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 49240799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49749692 - 49749513
Alignment:
Q  197 atgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgct 295  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||    
T  49749692 atgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtact 49749593  T
Q  296 ccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49749592 ccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 49749513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 302
Target Start/End: Original strand, 391073 - 391180
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  391073 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 391172  T
Q  295 tccaggac 302  Q
    ||||||||    
T  391173 tccaggac 391180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45151473 - 45151372
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  45151473 agactcctcaaatatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 45151374  T
Q  276 cg 277  Q
    ||    
T  45151373 cg 45151372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Original strand, 50082207 - 50082292
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt 281  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50082207 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 50082292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 391175 - 391293
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatct 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  391175 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 391274  T
Q  355 acatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  391275 acatacaact-gaccatgca 391293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 15306959 - 15307126
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaa 250  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  |  ||||||||||||  | |||||||||||||     
T  15306959 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccggatattgaatggttaaag 15307058  T
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  15307059 cattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagcgttccaggacatgagtcctcccgct 15307126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10977240 - 10977129
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  10977240 atgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcgactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagc 10977141  T
Q  252 attcatcaggac 263  Q
    ||||||||||||    
T  10977140 attcatcaggac 10977129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15360959 - 15360879
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15360959 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataggtgttccaggacatgagtcctcccgct 15360879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 16484623 - 16484721
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16484623 gaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 16484721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 315
Target Start/End: Original strand, 37881388 - 37881519
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||   |||||||| ||||    
T  37881388 atgcaaatatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccctcaccgctattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcatcaccgctttgaa 37881487  T
Q  285 caacta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 315  Q
    |||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  37881488 caacaaggtgttccaggacataagtcctcccg 37881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 42220240 - 42220301
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaat 76  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42220240 acatcatcttgtaaatataattatatgtttcacaaagcaacaacatcatcttcaaaatcaat 42220301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 899415 - 899469
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  899415 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcgtcttcaa 899469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 15244126 - 15244224
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  15244126 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctcccgct 15244224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16229273 - 16229175
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16229273 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 16229175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 12931881 - 12931962
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12931881 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 12931962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 288
Target Start/End: Original strand, 13452204 - 13452320
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  |    
T  13452204 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 13452303  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaac 288  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  13452304 tcactgctttgaacaac 13452320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 13886624 - 13886791
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaa 250  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  | |||||||||||||  | |||||||||||||     
T  13886624 atgacttgacaacacccctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaag 13886723  T
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||| ||| |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||| |||||||    
T  13886724 cattcattagggcttaagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttcgaggacatgagtcatcccgct 13886791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Original strand, 14821317 - 14821479
Alignment:
Q  159 acatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacatt 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  14821317 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcatt 14821416  T
Q  255 catcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    || |||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14821417 ca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccaggacaggagccctcccgct 14821479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18166422 - 18166345
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccc 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  18166422 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctccc 18166345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13899770 - 13899671
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  13899770 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttctaggacatgagtcctcccgct 13899671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53905470 - 53905371
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| | ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53905470 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 53905371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 16484738 - 16484807
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggaccc-actcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16484738 tccagggcatgagccctcccgct-tttatgtttatgcaatggaccccacttgtgtatatctacatacaact 16484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 14910537 - 14910645
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacc--aaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtt 246  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||  || | |  ||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  14910537 tcatgcaagacatgacaactccactaagactactcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaatggtt 14910636  T
Q  247 aaaacattc 255  Q
    ||| |||||    
T  14910637 aaagcattc 14910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 33096850 - 33096914
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccat 80  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| || ||||||||||||    
T  33096850 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcagcaacttcatcatc-aaatcaatccat 33096914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 15533738 - 15533802
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  15533738 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaa 15533802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Original strand, 14485663 - 14485717
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14485663 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26077736 - 26077682
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26077736 cctcccgct-tttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Original strand, 50082293 - 50082347
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50082293 tttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 50082347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10972943 - 10972873
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| |||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10972943 tccagggcaagagccctctcgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 18261439 - 18261508
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18261439 tccagggcatgagccctcccgctttatatgt-tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18261508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 18271404 - 18271473
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18271404 tccagggcatgagccctcccgctttatatgt-tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18271473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14556119 - 14556050
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14556119 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgctactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14556050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 14910747 - 14910792
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14910747 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 364
Target Start/End: Original strand, 16156803 - 16156840
Alignment:
Q  327 tatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156803 tatgcaactgacccactcgtgtatatctacatacaact 16156840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 18212099 - 18212152
Alignment:
Q  158 gacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  18212099 gacatgacgatacatctaagactcctcacaaatgcaactatgcatgtggtacca 18212152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 18212298 - 18212343
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18212298 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 48
Target Start/End: Original strand, 34771918 - 34771951
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcaca 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34771918 acatcatcttgcaaatataaatatataattcaca 34771951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 49051086 - 49051146
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  49051086 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 49051146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15470688 - 15470652
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctca 230  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15470688 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 15470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17000183 - 17000139
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17000183 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18166311 - 18166255
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18166311 cctcccgctttatatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 18166255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 18261324 - 18261364
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagg 261  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18261324 gaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 18261364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 261
Target Start/End: Original strand, 18271289 - 18271329
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagg 261  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18271289 gaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 18271329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27849479 - 27849427
Alignment:
Q  327 tatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27849479 tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaatgcataca 27849427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43284912 - 43284868
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43284912 tttatgcttatgcaactgacccactcttgtatatctacatacaac 43284868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 54845290 - 54845247
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  54845290 acatcatcttgcaaatataagtatataattcaca-agcaacaaca 54845247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 15643621 - 15643243
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat--tcatcaac 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  15643621 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacttcatcatcaaa-tcaattcatcataatatatgtataaatatatatattcatcaac 15643523  T
Q  113 atca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgc 200  Q
    | ||           |||||||| ||||  ||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15643522 aacatcctcatcatcatcaatataacaatcacaaccaacaacaaggactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgc 15643423  T
Q  201 atgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccagg 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15643422 atgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacctcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcgccgctgtgaacaactagtgctccagg 15643323  T
Q  301 acatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15643322 acatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 15643243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32911812 - 32911436
Alignment:
Q  18 tcatcttgcaaatataaatatatat--ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacatc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32911812 tcatcttgtaaatataaatatatatatttcacaaagcaacatcatcatcttcaaa-tcaattcatcatattatatgtataaatatatattcatcaacaac 32911714  T
Q  116 a-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatg 203  Q
    |           ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  32911713 atcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatg 32911614  T
Q  204 tggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32911613 tggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 32911514  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32911513 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 32911436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 45028320 - 45028693
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaaca- 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  45028320 acatcatcctgtaaatataaatatatatttcacaaggca-caacatcatcttcaaa-tcaattcatcataatatatgtatagatatatattcatcaacaa 45028417  T
Q  114 -----tca--atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtg 205  Q
         |||  ||||||||| ||| ||| |||||  ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  45028418 cttcatcatcatcaatatggcaattaccaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacatcactaagacccctcgataaatgcaattatgcatgtg 45028517  T
Q  206 gtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45028518 gtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgttgtgaacaactagttctccaggacat 45028617  T
Q  305 gagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45028618 gagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 45028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 13101392 - 13101127
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||||| ||||| |||| |||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||     
T  13101392 atcaatataacaaccacaatcaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaaca 13101293  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13101292 tgaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctcc 13101193  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101192 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 13101127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 119 - 379
Target Start/End: Original strand, 27272174 - 27272436
Alignment:
Q  119 caatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggta 218  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  27272174 caatatggcaactacatccaacaacaaagactcatgcatgacatcactacaccactaagaatcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacagga 27272273  T
Q  219 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27272274 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtcgagcaaccagtgctctaggacatgagtcctctccgc 27272373  T
Q  317 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27272374 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 27272436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25590402 - 25590154
Alignment:
Q  133 caaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcacc 232  Q
    |||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25590402 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccattaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacc 25590303  T
Q  233 gcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgca 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  25590302 gcttttgaatggttaaagcattcatcaggacaaaagcactcaccgctgtgaacaactagtgaaccaggacataagtcatcccgctgtttatgcatatgaa 25590203  T
Q  333 atggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25590202 atggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 25590154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Original strand, 36800467 - 36800741
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 204  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||   |||||||||    
T  36800467 tcatcaacatca-tcaatatggcaattacaacccacaaccaagactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgccgatatgcatgt 36800565  T
Q  205 ggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800566 ggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaggcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 36800665  T
Q  305 gagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36800666 gagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 36800741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17592719 - 17592487
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac--cgaagccctcaccgcttttgaatggtt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17592719 tcatgcatgacatgacgacatcacta-gactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggacaccgaagccctcaccgcttttgaatggtt 17592621  T
Q  247 aaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcg 345  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17592620 aaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttg 17592521  T
Q  346 tgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17592520 tgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 17592487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 35244188 - 35243982
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  35244188 agactcctcaatagatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 35244089  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35244088 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat 35243989  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  35243988 gcataca 35243982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 196 - 377
Target Start/End: Original strand, 14563832 - 14564014
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgct 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14563832 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaaaaactagtgct 14563931  T
Q  296 ccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatac 377  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14563932 ccaggacatgattcctctccgctgtttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatacatac 14564014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Original strand, 11466051 - 11466256
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11466051 agactcctcaacaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 11466149  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
     ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11466150 tcgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 11466249  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  11466250 catacat 11466256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 27037237 - 27037424
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  27037237 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27037336  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27037337 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 27037424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22013252 - 22013065
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  22013252 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 22013153  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22013152 ctaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 22013065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 34043 - 34230
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||    
T  34043 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgttgagcaa 34142  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34143 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 34230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 21604757 - 21604944
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  21604757 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 21604856  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21604857 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 21604944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 28292712 - 28292904
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  28292712 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccatcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 28292811  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||| ||||||||||  || | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28292812 ctagtactccaggacaaaagacatcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccttgcataca 28292904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24481734 - 24481552
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  24481734 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 24481635  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24481634 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 24481552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2386062 - 2385874
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaaca 286  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  2386062 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagca 2385963  T
Q  287 actagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2385962 actagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 2385874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4071679 - 4071496
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  4071679 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 4071580  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4071579 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 4071496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 4077420 - 4077600
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |    
T  4077420 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgctgttgagcaactagtac 4077519  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4077520 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 4077600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 20850187 - 20850370
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  20850187 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 20850286  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20850287 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 20850370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30196649 - 30196467
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  30196649 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagt 30196550  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30196549 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 30196467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24426974 - 24426793
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtg 293  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||     
T  24426974 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagta 24426875  T
Q  294 ctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24426874 ctccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 24426793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 31828605 - 31828793
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  31828605 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31828704  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31828705 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 31828793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 31833957 - 31834145
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  31833957 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31834056  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31834057 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 31834145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36984705 - 36984517
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  36984705 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 36984606  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36984605 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 36984517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44091221 - 44091041
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  44091221 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcattgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 44091122  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44091121 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 44091041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 1067094 - 1067276
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  1067094 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 1067193  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1067194 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 1067276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 27729508 - 27729688
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  27729508 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 27729607  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    || ||| |   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27729608 tctagggccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaact-gaccatgca 27729688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11360374 - 11360196
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11360374 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 11360275  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11360274 actccaggaccgaagccctcaccgctgttt---tatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaact-gaccatgca 11360196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 1061711 - 1061893
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |    
T  1061711 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactact 1061810  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1061811 actccaggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 1061893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 71613 - 71521
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  71613 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 71521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 194 - 277
Target Start/End: Original strand, 35585355 - 35585438
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccg 277  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35585355 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 35585438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28971478 - 28971332
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  |    
T  28971478 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 28971379  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||| ||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  28971378 tcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 28971332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21133407 - 21133306
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 315  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21133407 ccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccg 21133308  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  21133307 ct 21133306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 24660415 - 24660581
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||   ||    | ||||||||||  |  | ||||||||||||| |    
T  24660415 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcagtggatattgaatggttaaagc 24660514  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24660515 attcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 24660581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25590468 - 25590414
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25590468 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaa 25590414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8890121 - 8890022
Alignment:
Q  221 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8890121 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 8890022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 9474 - 9581
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  9474 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 9573  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  9574 aagcattc 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 71520 - 71466
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  71520 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 71466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 25267243 - 25267325
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25267243 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 25267325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27211204 - 27211097
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  27211204 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggtta 27211105  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    ||||||||    
T  27211104 aaacattc 27211097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 19035505 - 19035603
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19035505 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 19035603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10685849 - 10685785
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  10685849 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 10685785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 22860345 - 22860425
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22860345 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaataagtgttccaggacacgagtcctcccgct 22860425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19663049 - 19662942
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  19663049 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 19662950  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  19662949 aagcattc 19662942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 23062590 - 23062672
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23062590 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgaatcctcccgct 23062672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 9241285 - 9241347
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  9241285 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 9241347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25107601 - 25107524
Alignment:
Q  240 aatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| |||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  25107601 aatggttaaagcattca-cagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 25107524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 26884105 - 26884167
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  26884105 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 26884167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 29280893 - 29280955
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  29280893 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 29280955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 20260776 - 20260840
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  20260776 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaaagcaactatgcatgtggtaccaaa 20260840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21074199 - 21074143
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21074199 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 21074143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22796776 - 22796688
Alignment:
Q  226 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattca-tcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctc 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||  |||  ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  22796776 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattccggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctc 22796688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 28292516 - 28292579
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatc 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  28292516 atcatcttgcaaatataagtatataattcaca-agcaacaacaacatcatcaaaatccatccatc 28292579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 17633968 - 17634051
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    |||||| |||||| |||||| || | ||||  |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17633968 tccagggcatgagccctcccactttatatgattatgcaatgactccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcataca 17634051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 20648113 - 20648195
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20648113 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtccttccgct 20648195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 36800364 - 36800406
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36800364 atcatcttgtaaatataattatatatttcacaaagcaacaaca 36800406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 9241493 - 9241538
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9241493 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Original strand, 17633781 - 17633810
Alignment:
Q  157 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17633781 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa 17633810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21133275 - 21133215
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21133275 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 21133215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 22810043 - 22810088
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22810043 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28971301 - 28971241
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28971301 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 28971241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21124095 - 21124039
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | || | | ||||||||||||||||    
T  21124095 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaattcgactatgcatgtggtacca 21124039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 21907206 - 21907262
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  21907206 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtacca 21907262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Original strand, 27272113 - 27272156
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  27272113 acatcatcttgcaaatataagtatataattcaca-agcaacaaca 27272156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 99)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Original strand, 29550731 - 29551102
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||  ||||||||||||| |||| | | |||||||||| || ||||||||     
T  29550731 atcatcttgtaaatataaatatatatttcaca-agcaacaacaacatct-cattaaatcaatccatcataatatgtatataaatatatatccatcaacaa 29550828  T
Q  115 ca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 206  Q
    ||        || |||||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29550829 catcatcatcattaatatgacaactacaaccaacgaccacgactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 29550928  T
Q  207 taccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29550929 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatga 29551028  T
Q  307 gtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  29551029 gtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatgcatacat 29551102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 9691654 - 9691390
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9691654 atcaatataacaaccacaaccaacaataaagactcatgcatgacataacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaatcag 9691555  T
Q  217 taccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccg 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9691554 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccg 9691455  T
Q  316 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9691454 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 9691390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20377599 - 20377223
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaa----tatacattcatca 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||||||||||| |||| | | ||||||    |||| || |||||    
T  20377599 atcatcttgcaaatatagatatatatttcaca-agcaacaacaacat-ttcatcaaatcaatccatcataatatgtatataaatatgtatatatccatca 20377502  T
Q  111 acatca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 202  Q
    ||| ||        || |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20377501 acaacatcatcatcattaatatgtcaactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcat 20377402  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377401 gtggtaccaaataagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 20377302  T
Q  303 atgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377301 atgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 20377223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30597220 - 30596842
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat-----tcatc 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||| | || |||| |||||||||||||| ||     ||| |    
T  30597220 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacttcatcttctaa-tcaattcttcataatatatgtataaatatatatattcatcaac 30597122  T
Q  110 aacatca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgc 200  Q
    |||||||        |||||||| |||| ||||| ||   |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30597121 aacatcatcatcatcatcaatataacaattacaagcagcaacaatgactcatgcatgacatgacaacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgc 30597022  T
Q  201 atgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccagg 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30597021 atgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctagg 30596922  T
Q  301 acatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30596921 acatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 30596842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 379
Target Start/End: Original strand, 16833151 - 16833400
Alignment:
Q  131 tacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctca 230  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  16833151 tacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtgccaaacaggaccgaagccctca 16833250  T
Q  231 ccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatat 329  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16833251 ccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 16833350  T
Q  330 gcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16833351 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 16833400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16331839 - 16331577
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  16331839 atcaatataacaactacaaccaacaataaagagtcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-tatgcaattatgcatgtggtaccagacag 16331741  T
Q  217 taccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccg 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16331740 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctatgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccg 16331641  T
Q  316 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16331640 ctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 16331577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32388375 - 32388000
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||     
T  32388375 acattatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaac-ttatcttcaaa-tcatttcatcataataggtgtataattatacatacatcaacaa 32388278  T
Q  115 caa-----------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    |||           ||| ||| |||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  32388277 caacatcatcatcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgatgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcat 32388178  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32388177 gtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 32388078  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32388077 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 32388000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 150 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 46071324 - 46071093
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46071324 tcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcccttatcgcttttgaatggttaaa 46071225  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46071224 gcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcttctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtat 46071125  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46071124 atatctacatacaactagaccatgcatacatt 46071093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8374183 - 8373908
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatg 203  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  8374183 tcatcatcatcaa-caatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacaacacctctaagacccctcaataaatgcaaatatgcatg 8374085  T
Q  204 tggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggaca 303  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8374084 tggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgtgaagaactagtgctccaggaca 8373985  T
Q  304 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8373984 tgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 8373908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 54519961 - 54520225
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  54519961 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacaccactaatactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 54520060  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54520061 ggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctcc 54520160  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54520161 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 54520225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19344366 - 19344134
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19344366 tcatgcatgacatgatgacaccactaagactcctcaaatatccaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaa 19344267  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19344266 gcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgt 19344167  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19344166 atatctacatacaacttgaccatacatacattt 19344134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12725473 - 12725107
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaa-ca 113  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||  |||  ||  | |||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||    
T  12725473 atcatcttgcaattataaatgtacattttacaaagcaacaacagcatcaccatcagatcaattcatcgtaatatatgtataaatacatactcatcaaaca 12725374  T
Q  114 tca--atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
     ||  ||||||||||||| |||||||||  |  ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  12725373 acatcatcaatatgacaattacaaccaacaat-gagacacatgcatgacatgacaacatcactaagac-cctcaataatgcagatatgcatgtggtacca 12725276  T
Q  212 aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 311  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12725275 aacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacctctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcct 12725176  T
Q  312 cccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12725175 cccgctatttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 12725107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Original strand, 49163103 - 49163334
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  49163103 tcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttcaa 49163202  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgta 349  Q
     |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49163203 gcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaaccaatgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgta 49163302  T
Q  350 tatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  49163303 tatctacatacaacttgaccatgaatacattt 49163334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 11956809 - 11956579
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11956809 tcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgtggtaacaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 11956710  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgta 349  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  11956709 gcattcatcaggaccgaagccctccccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgta 11956610  T
Q  350 tatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11956609 tatctacatacaacttgaccatgcatacatt 11956579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29545377 - 29545146
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaata-tgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545377 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaaaaaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 29545278  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29545277 agcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacctacttgtg 29545178  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29545177 tatatctacatacaacttgaccatgcatacat 29545146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 218 - 380
Target Start/End: Original strand, 20187758 - 20187921
Alignment:
Q  218 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20187758 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 20187857  T
Q  317 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20187858 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 20187921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 223 - 380
Target Start/End: Original strand, 54520283 - 54520441
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520283 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt 54520382  T
Q  322 atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520383 atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 54520441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48774807 - 48774601
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48774807 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 48774708  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48774707 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat 48774608  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  48774607 gcataca 48774601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9772103 - 9771904
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  9772103 agactcctcaaatatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagggccgaagccctcat 9772005  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9772004 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 9771906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Original strand, 38742895 - 38743095
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  38742895 agactcctcaaatatgcaaatttgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcac 38742994  T
Q  276 cgctgtgaa-caactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38742995 cgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaact-gaccatg 38743093  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  38743094 ca 38743095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12271583 - 12271383
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12271583 agacttctcaaatatgcaaatatgcatgttgtaccaaagaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 12271484  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12271483 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 12271385  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  12271384 ca 12271383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 258 - 380
Target Start/End: Original strand, 3802716 - 3802839
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3802716 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctac 3802815  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3802816 atacaactagaccatgcatacatt 3802839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 29493527 - 29493715
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  29493527 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 29493626  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29493627 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 29493715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2499212 - 2499032
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  2499212 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 2499113  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2499112 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 2499032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 45611647 - 45611827
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  45611647 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 45611746  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45611747 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 45611827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43724239 - 43724052
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  43724239 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 43724140  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43724139 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 43724052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Original strand, 3802554 - 3802676
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3802554 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 3802653  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  3802654 atacaacttgaccatgcatacat 3802676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54091842 - 54091720
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54091842 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 54091743  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  54091742 atacaacttgaccatgcatacat 54091720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 28758873 - 28759060
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  28758873 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 28758972  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28758973 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 28759060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50142944 - 50142757
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  50142944 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 50142845  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50142844 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 50142757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50656158 - 50655976
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  50656158 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 50656059  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50656058 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 50655976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53571404 - 53571222
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  53571404 attatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagt 53571305  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53571304 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 53571222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3782927 - 3782739
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  3782927 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 3782828  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3782827 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 3782739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 10381918 - 10382101
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  10381918 attatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 10382017  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10382018 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 10382101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 10410571 - 10410754
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  10410571 attatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 10410670  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10410671 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 10410754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 10767737 - 10767917
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  10767737 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 10767836  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10767837 tccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 10767917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 381
Target Start/End: Original strand, 18961002 - 18961139
Alignment:
Q  244 gttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccact 343  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18961002 gttaaagcattcatcgggacataagccctcaccgctgtgaacaacaagtgcttcaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggactcact 18961101  T
Q  344 cgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18961102 tgtgtatatctacatacaacttcaccatgcatacattt 18961139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21151625 - 21151445
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| | |    
T  21151625 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactattac 21151526  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21151525 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 21151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 47121121 - 47121308
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  47121121 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 47121220  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47121221 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaact-gaccatgca 47121308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 47128489 - 47128676
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  47128489 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 47128588  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47128589 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaact-gaccatgca 47128676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 380
Target Start/End: Original strand, 15374697 - 15374820
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15374697 caggaccgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 15374796  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||  |||||||||||||||    
T  15374797 atacaacatgaccatgcatacatt 15374820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14845343 - 14845155
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  14845343 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaa 14845244  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||||| ||   || |||| | ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14845243 ctagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14845155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27029679 - 27029558
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27029679 aatatggcaactacaacccatggccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 27029580  T
Q  220 cgaagccctcaccgcttttgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27029579 cgaagccctcaccgcttttgaa 27029558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27031847 - 27031726
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27031847 aatatggcaactacaacccatggccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 27031748  T
Q  220 cgaagccctcaccgcttttgaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27031747 cgaagccctcaccgcttttgaa 27031726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54833355 - 54833175
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |    
T  54833355 tatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtac 54833256  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54833255 tccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 54833175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 18957712 - 18957814
Alignment:
Q  147 gaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18957712 gaatcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggt 18957811  T
Q  246 taa 248  Q
    |||    
T  18957812 taa 18957814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54091939 - 54091821
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54091939 atcaatataacaaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 54091840  T
Q  217 taccgaagccctcaccgct 235  Q
     ||||||||||||||||||    
T  54091839 gaccgaagccctcaccgct 54091821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 279
Target Start/End: Original strand, 20187671 - 20187775
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20187671 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 20187770  T
Q  275 ccgct 279  Q
    |||||    
T  20187771 ccgct 20187775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Original strand, 15374599 - 15374718
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||     
T  15374599 atcaatataacaaccacaaccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaaca 15374698  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgct 235  Q
    | ||||||| ||||||||||    
T  15374699 ggaccgaagtcctcaccgct 15374718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 235
Target Start/End: Original strand, 3802489 - 3802575
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgct 235  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3802489 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11850848 - 11850717
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaaca 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | |  ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||    
T  11850848 atgcaattatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaaca 11850749  T
Q  287 ac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11850748 acaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11850717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11644953 - 11644873
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11644953 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaggccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11644873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Original strand, 17512563 - 17512663
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||    
T  17512563 ccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttcaaggacataagtcctcccgc 17512662  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  17512663 t 17512663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10597933 - 10597787
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||  |    
T  10597933 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgtcaccactgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 10597834  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10597833 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 10597787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Original strand, 10553825 - 10553887
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  10553825 tcatgcatgacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 10553887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11305905 - 11305825
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11305905 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-tgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 11305825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2270470 - 2270315
Alignment:
Q  164 acgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcat-ca 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||| |  | |  || ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  2270470 acgactccactaagactcctcaacaatgcac--atgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattca 2270373  T
Q  260 ggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||  |||  ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2270372 ggacataagtcctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 2270315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6927583 - 6927529
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6927583 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 6927529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 17130649 - 17130756
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  17130649 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 17130748  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  17130749 aagcattc 17130756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18757149 - 18757016
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||||  |||  ||||||||| ||||    
T  18757149 atgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcaatcattaggacaaaagtcctcaccgctttgaa 18757050  T
Q  285 caacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18757049 caacaaggtgttccaggacataagtcctcccgct 18757016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 38312375 - 38312268
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  38312375 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggtta 38312276  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    ||||||||    
T  38312275 aaacattc 38312268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 18957632 - 18957686
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18957632 acatcatcttgtaaatataaatatataattcacaaagcaacaacatcatcttcaa 18957686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 49163021 - 49163075
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  49163021 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacatcatcatcttcaa 49163075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 12152895 - 12152975
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||  ||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12152895 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccatcaccactttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 12152975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Original strand, 12419415 - 12419515
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||| ||| | ||| ||||||| || |||||||||||    
T  12419415 ccgaagccctcactgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaaaaacaaggtgttccaggagataagtcctcccgc 12419514  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  12419515 t 12419515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14764355 - 14764248
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  14764355 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 14764256  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  14764255 aagcattc 14764248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 14864740 - 14864847
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |  | | |||||||||    
T  14864740 tcatgcaggacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaatggtta 14864839  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    ||||||||    
T  14864840 aaacattc 14864847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23372101 - 23371994
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  23372101 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 23372002  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  23372001 aagcattc 23371994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 51300054 - 51300161
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  51300054 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 51300153  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  51300154 aagcattc 51300161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12034572 - 12034510
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  12034572 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtacca 12034510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 8374347 - 8374246
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataa----atatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatca 110  Q
    ||||||||||| ||||||||    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||| |||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  8374347 acatcatcttgtaaatataagtatatatatatttcacaaagcaacatcatcatcatcaaa-tcaattcatcataatatatggacaaatatatattcatca 8374249  T
Q  111 aca 113  Q
    |||    
T  8374248 aca 8374246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 18914144 - 18914213
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||||  || ||||||||| | ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18914144 tccaggacaatagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18914213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19236230 - 19236169
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  19236230 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaatgcaactatgcatgtggtacca 19236169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 12274248 - 12274347
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | ||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12274248 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaagacatgagtcctcccgct 12274347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15935016 - 15934960
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15935016 cctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 18888924 - 18888980
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  18888924 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 18888980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 18899963 - 18900019
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  18899963 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 18900019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 12274364 - 12274435
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctccc-gctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12274364 tccagggcatgagccctccccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Original strand, 17496088 - 17496243
Alignment:
Q  164 acgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcag 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  17496088 acgactccactaagactcctcaacaatgcac--atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcag 17496185  T
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
     |   |||  |||||| || |||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17496186 aatataagtcctcaccactttgaacaacaaggtgttccaagacatgaatcctcccgct 17496243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 235
Target Start/End: Original strand, 3802699 - 3802737
Alignment:
Q  197 atgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgct 235  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3802699 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10390622 - 10390560
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaata-tgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10390622 tcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtacca 10390560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10415731 - 10415669
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaata-tgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10415731 tcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtacca 10415669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10422401 - 10422339
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaata-tgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10422401 tcatgcaagacacgacaactctactaagactcctcaactaatgcaattatgcatgtggtacca 10422339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 11956956 - 11956914
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11956956 atcatcttgtaaatataattatatatttcacaaagcaacaaca 11956914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 14569938 - 14570008
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14569938 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatagactccacttgtgtatatctacatacaact 14570008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17199065 - 17199011
Alignment:
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||||| ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17199065 ctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatacaact 17199011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 9772279 - 9772239
Alignment:
Q  18 tcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9772279 tcatcttgcaaatataaatatataattcaca-agcaacaaca 9772239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12356104 - 12356031
Alignment:
Q  226 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattca-tcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctcca 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||  ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12356104 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttcca 12356031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12362653 - 12362580
Alignment:
Q  226 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattca-tcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctcca 298  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||  ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12362653 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttcca 12362580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13313952 - 13313907
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13313952 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Original strand, 17512694 - 17512751
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtt-tatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17512694 cctcccgcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18756985 - 18756925
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18756985 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 18756925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 23173922 - 23173967
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23173922 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 376
Target Start/End: Original strand, 23174317 - 23174374
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  23174317 tttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcata 23174374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2270284 - 2270216
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2270284 cctcccgctttttatgcttatgaaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcata 2270216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 213
Target Start/End: Original strand, 12304701 - 12304765
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa 213  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||    
T  12304701 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgtatgtggtatcaaa 12304765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17243899 - 17243843
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  17243899 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtacca 17243843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Original strand, 17496274 - 17496341
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17496274 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcata 17496341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 23174117 - 23174173
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  23174117 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtacca 23174173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 78)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 49327841 - 49328216
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||| ||||||| ||||||||     
T  49327841 acattatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaac-ttatcttcaaa-tcatttcatcataataggtgtataattatacatacatcaacaa 49327938  T
Q  115 caa-----------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcat 202  Q
    |||           ||| ||| |||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  49327939 caacatcatcatcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcat 49328038  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 302  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49328039 gtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggac 49328138  T
Q  303 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49328139 atgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 49328216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 120 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29597049 - 29596788
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29597049 aatatgtcaactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 29596950  T
Q  220 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29596949 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgatgccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 29596850  T
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29596849 tttatgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgcatacatt 29596788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 120 - 380
Target Start/End: Original strand, 21920719 - 21920980
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  21920719 aatatgtcaactacaaccaacgaccaagactcatgcatgacatgacgacactactaagactcctcagatatgcaattatgcatgtggtaccaaaaaagac 21920818  T
Q  220 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21920819 cgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtactccaggacataagtcctctccgctg 21920918  T
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21920919 tttatgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 21920980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Original strand, 47484059 - 47484291
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47484059 tcatgcatgacatgacgacaccactaagaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaa 47484158  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgt 348  Q
    | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  47484159 agcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatagacccactagtgt 47484258  T
Q  349 atatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47484259 atatctacatacaacttgaccatgcatacattt 47484291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Original strand, 43088343 - 43088576
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43088343 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 43088442  T
Q  248 aaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    ||  |||||| |||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  43088443 aagtattcattaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccccttgtg 43088542  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43088543 tatatctacatacaaattgaccatgcatacattt 43088576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Original strand, 36614870 - 36615120
Alignment:
Q  133 caaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctca 230  Q
    |||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||    
T  36614870 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgaagacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacagggccgaaaccctca 36614969  T
Q  231 ccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36614970 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 36615069  T
Q  331 caatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36615070 caatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 36615120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 218 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29602386 - 29602223
Alignment:
Q  218 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29602386 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 29602287  T
Q  317 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29602286 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 29602223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Original strand, 42626177 - 42626381
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42626177 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 42626276  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42626277 ccactgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 42626375  T
Q  373 cataca 378  Q
    ||||||    
T  42626376 cataca 42626381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 4231179 - 4231371
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  4231179 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 4231278  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4231279 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcataca 4231371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 21962996 - 21963188
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  21962996 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 21963095  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21963096 ctagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcataca 21963188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 20570739 - 20570919
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaa-caactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  20570739 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctctccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtac 20570838  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20570839 tccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 20570919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 20292671 - 20292858
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgc-tgtgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||    
T  20292671 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggatcgaagccctcaccgcttttgagcaa 20292770  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20292771 ctagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 20292858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 6740516 - 6740696
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  6740516 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 6740615  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6740616 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 6740696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18026869 - 18026689
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  18026869 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18026770  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18026769 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 18026689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28556619 - 28556439
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  28556619 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 28556520  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28556519 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 28556439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38908173 - 38907991
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  38908173 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 38908074  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38908073 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 38907991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 39094317 - 39094499
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  39094317 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 39094416  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39094417 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 39094499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20277369 - 20277189
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  20277369 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 20277270  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20277269 tccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 20277189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 37682082 - 37682265
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  37682082 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 37682181  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37682182 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 37682265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31535424 - 31535237
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  31535424 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31535325  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31535324 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 31535237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31564141 - 31563954
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  31564141 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31564042  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31564041 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 31563954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39189805 - 39189618
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  39189805 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 39189706  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39189705 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 39189618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 48427844 - 48428031
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  48427844 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 48427943  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48427944 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 48428031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22185723 - 22185541
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  22185723 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 22185624  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22185623 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 22185541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 18418122 - 18418302
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |    
T  18418122 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtac 18418221  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18418222 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 18418302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 37675389 - 37675572
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  37675389 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 37675488  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || | || ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37675489 actccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 37675572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 17146249 - 17146397
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17146249 atgcaaatatgcatgtggtaccaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 17146347  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatg 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17146348 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 231 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20077033 - 20076882
Alignment:
Q  231 ccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctccc-gctgttt-atgcat 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  20077033 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcat 20076934  T
Q  328 atgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20076933 atgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgcatacat 20076882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 3652816 - 3652709
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  3652816 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 3652717  T
Q  295 tccaggac 302  Q
    ||||||||    
T  3652716 tccaggac 3652709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 281
Target Start/End: Original strand, 9269910 - 9270016
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  9269910 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagaaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctca 9270009  T
Q  275 ccgctgt 281  Q
    |||||||    
T  9270010 ccgctgt 9270016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 176 - 279
Target Start/End: Original strand, 52990692 - 52990796
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52990692 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 52990791  T
Q  275 ccgct 279  Q
    |||||    
T  52990792 ccgct 52990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 269
Target Start/End: Original strand, 24850077 - 24850171
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagc 269  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24850077 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 24850171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 36212128 - 36212043
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt 281  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36212128 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 36212043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 20299374 - 20299492
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatct 354  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20299374 caggaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 20299473  T
Q  355 acatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  20299474 acatacaact-gaccatgca 20299492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20396994 - 20396911
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgct 279  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20396994 tatgcatgtggtaccaaacagggccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcgttcatcaggaccgaagccctcaccgct 20396911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 20396928 - 20396865
Alignment:
Q  218 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20396928 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 20396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24109211 - 24109078
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| ||||    
T  24109211 atgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 24109112  T
Q  285 caacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24109111 caacgaggtgttccaggacataagtcctcccgct 24109078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 364
Target Start/End: Original strand, 21698159 - 21698305
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgctg 318  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||||  | |||||||  | ||| |||||| |||||| |||||||||     
T  21698159 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccaatttgaacaataaagtgttccagggcatgagccctcccgctt 21698258  T
Q  319 tttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21698259 tatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15316641 - 15316561
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15316641 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 15316561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23195675 - 23195529
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||  |    
T  23195675 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 23195576  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||| |||||||| | ||| | || ||||| ||||||||||||    
T  23195575 tcaccgctttgaacaacaaggtgtttcatgacattagtcctcccgct 23195529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 317
Target Start/End: Original strand, 24079543 - 24079676
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaa 284  Q
    |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| ||||    
T  24079543 atgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 24079642  T
Q  285 caacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||| | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  24079643 caacaaggtgttccaggacataagtcttcccgct 24079676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22030849 - 22030704
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc-ccgct 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||| | | | |||||| |||||| |||| ||||     
T  22030849 gaagccctcaccgaattttgaatggtcaaagcattcatcagggcctaagccctcaccactttgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgc- 22030751  T
Q  318 gtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22030750 -tttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 22030704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Original strand, 20299349 - 20299400
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20299349 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 20299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20852290 - 20852183
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  20852290 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 20852191  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  20852190 aagcattc 20852183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20858916 - 20858809
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  20858916 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 20858817  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  20858816 aagcattc 20858809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 21705174 - 21705281
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  21705174 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 21705273  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  21705274 aagcattc 21705281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36212042 - 36211988
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36212042 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 36211988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20396871 - 20396810
Alignment:
Q  313 ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20396871 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 20396810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 36614805 - 36614859
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36614805 acatcatcttgtaaatataaatatatgtttcacaaagcaacaacatcatcttcaa 36614859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 47483977 - 47484031
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  47483977 acatcatcttgtaattataaatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaa 47484031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 317
Target Start/End: Original strand, 11157038 - 11157131
Alignment:
Q  226 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattca-tcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |||  |||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11157038 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaacgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11157131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 21664203 - 21664284
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21664203 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtccttccgct 21664284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24240812 - 24240767
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacat 60  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24240812 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacat 24240767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11141138 - 11141058
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11141138 ttgaatggttaaagcattcatcaaagcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 11141058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Original strand, 20848993 - 20849145
Alignment:
Q  167 acaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcagga 262  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||||   || |  | |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |     
T  20848993 acaccgctaagactcctcgacaatgcaacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaattgttaaaacattcatcaagg 20849092  T
Q  263 ccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcc 313  Q
    |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  20849093 cataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcc 20849145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16669497 - 16669435
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16669497 tcatgcaagacatgacaactctactaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 16669435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19666869 - 19666787
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcat-caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  19666869 ttgaatggttaaagcattcattcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgtttcaggacatgagtcctcccgct 19666787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 43088261 - 43088315
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43088261 acatcatcttgtaaatacaaatatatgtttcacaaagcaacaacatcatcttcaa 43088315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 19853074 - 19853155
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcat-caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |  |||| |||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19853074 ttgaatggttaaagcattcattcagggcataagccctcagcgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 19853155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 19859209 - 19859290
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcat-caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |  |||| |||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19859209 ttgaatggttaaagcattcattcagggcataagccctcagcgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 19859290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 4230983 - 4231046
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatc 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  4230983 atcatcttgcaaatataagtatataattcaca-agcaacaacaacatcatcaaaatccatccatc 4231046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21410830 - 21410731
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| || || |||||||||||||||||    
T  21410830 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttctagtacatgagtcctcccgct 21410731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21987185 - 21987129
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  21987185 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 21987129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 16371489 - 16371596
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  16371489 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 16371588  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  16371589 aagcattc 16371596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31927556 - 31927473
Alignment:
Q  235 ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  31927556 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctcccgct 31927473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20086519 - 20086450
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20086519 tccagggcataagccctcccgct-tttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 20086450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 21920604 - 21920645
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21920604 atcatcttgcaaatatagatatatatttcaca-agcaacaaca 21920645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 23630980 - 23631078
Alignment:
Q  221 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  23630980 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcactgctttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 23631078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7793029 - 7793000
Alignment:
Q  157 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793029 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa 7793000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 19961297 - 19961342
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19961297 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 20242694 - 20242739
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20242694 tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20941879 - 20941826
Alignment:
Q  311 tcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| | ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20941879 tcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20941826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21734683 - 21734654
Alignment:
Q  157 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21734683 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa 21734654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Original strand, 24079707 - 24079768
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  24079707 cctcccgctttttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatacctacatacaactcgacca 24079768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24109047 - 24108987
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagacca 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24109047 cctcccgct-tttatgcatatgcgactgactcacttgtgtatatctacatacaactcgacca 24108987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19664348 - 19664292
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  19664348 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtacca 19664292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22448412 - 22448334
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat---caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctcca 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  22448412 agccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacaggacataagtcctcaccactttgagcaactagtgctcca 22448334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23066717 - 23066673
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23066717 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Original strand, 1935 - 2198
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacgg 216  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1935 atcaatataacaaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactacgactcctcaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacag 2033  T
Q  217 taccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccg 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2034 gaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccg 2133  T
Q  316 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 380
Target Start/End: Original strand, 29328007 - 29328380
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacat 114  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||  | | | | |||||||||| |||||||||||     
T  29328007 acatcatcttgtaaatataagtttatatctcaca-agcagcaacatcatcatcaaaatccatccatcacattatgtatataaatatatattcatcaacaa 29328105  T
Q  115 ca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 206  Q
    ||        |||||| || ||| |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  29328106 catcatcatcatcaatgtggcaaatacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactacgactcctcaactatgcatatatgcatgtcg 29328205  T
Q  207 taccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328206 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 29328305  T
Q  307 gtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29328306 gtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 29328380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29299253 - 29299023
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29299253 tcatgcatgacatgactacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccgtc-ccgcttttgaatggttaaa 29299155  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgta 349  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29299154 gcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgta 29299055  T
Q  350 tatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29299054 tatctacatacaacttgaccatgcatacattt 29299023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 29305799 - 29305569
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29305799 tcatgcatgacatgactacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc-ccgcttttgaatggtttaa 29305701  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgta 349  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29305700 gcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgta 29305601  T
Q  350 tatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29305600 tatctacatacaacttgaccatgcatacattt 29305569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 117 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 14416784 - 14416519
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  14416784 atcaatataacaaccacagccaacaataaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 14416685  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14416684 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctcc 14416585  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14416584 gctgtttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 14416519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11392783 - 11392552
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11392783 tcatgcatgacatgacgacatcactaagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 11392684  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11392683 agaattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtg 11392584  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11392583 tatatctacatacaacttgaccatgcatacat 11392552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 380
Target Start/End: Original strand, 43687310 - 43687583
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgt 204  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||    
T  43687310 tcatcaacatca-tcaacatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagacccctcaataatgcagatatgcatgt 43687407  T
Q  205 ggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacat 304  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43687408 ggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaacggttaaagtattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgagcaactagtgctccaggacat 43687507  T
Q  305 gagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43687508 gagtcctcccgctgtttatgcatatgtaatggactcccttatgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 43687583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25701778 - 25701514
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||     
T  25701778 atcaatatggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacattacaacaccactgagactcctcaaaatatgcaataatgcatgtggtaccaaaca 25701679  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcc-tccc 314  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25701678 agaccgaagccctcaccgcttctgaatggttaaagcattcatcaggatcgtagccctcaccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcctttcc 25701579  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25701578 gctgtttatgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgcatacat 25701514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40144445 - 40144242
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  40144445 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 40144346  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 373  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40144345 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 40144247  T
Q  374 ataca 378  Q
    |||||    
T  40144246 ataca 40144242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16267021 - 16266816
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16267021 agactcctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcac 16266922  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg--tatatctacatacaactagaccat 371  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16266921 cgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaact-gaccat 16266823  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  16266822 gcataca 16266816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Original strand, 27345695 - 27345899
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27345695 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 27345794  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27345795 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 27345893  T
Q  373 cataca 378  Q
    ||||||    
T  27345894 cataca 27345899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 23117202 - 23117389
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  23117202 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 23117301  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23117302 ctagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 23117389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14746671 - 14746470
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  14746671 agacttctcaaatatgcaagtatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcac 14746572  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14746571 cgctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccat 14746473  T
Q  372 gca 374  Q
    |||    
T  14746472 gca 14746470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Original strand, 3697623 - 3697823
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  3697623 agacttctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggtccgaagccctcac 3697722  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3697723 cgctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 3697821  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  3697822 ca 3697823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10956823 - 10956636
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10956823 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 10956724  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10956723 ctagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 10956636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 189 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26486158 - 26485982
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  26486158 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 26486059  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaa 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26486058 ctagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 26485982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3224835 - 3224634
Alignment:
Q  176 agactcctcaaat-atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3224835 agacttctcaaatgatgcaaatatacatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcatcgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 3224736  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3224735 ccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccat 3224637  T
Q  372 gca 374  Q
    |||    
T  3224636 gca 3224634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16887429 - 16887249
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  16887429 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 16887330  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16887329 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 16887249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27909722 - 27909535
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  27909722 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27909623  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27909622 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 27909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27956141 - 27955954
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  27956141 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 27956042  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27956041 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 27955954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36800580 - 36800393
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  36800580 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 36800481  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36800480 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 36800393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 14563539 - 14563721
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  14563539 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 14563638  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14563639 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14563721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9205488 - 9205301
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  9205488 atgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 9205389  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9205388 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 9205301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 28980717 - 28980904
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  28980717 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaa 28980816  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28980817 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 28980904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 28985937 - 28986124
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  28985937 atgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaa 28986036  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||| |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28986037 ctagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 28986124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4520867 - 4520684
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  4520867 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 4520768  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4520767 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 4520684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23224877 - 23224698
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  23224877 tatgcatgtggtaccaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcactcaccgctgttgagcaactagtac 23224779  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    |||||||    || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23224778 tccaggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 23224698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 14765585 - 14765767
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  14765585 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatctggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 14765684  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14765685 actccaggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14765767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 379
Target Start/End: Original strand, 27873818 - 27873937
Alignment:
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacata 359  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27873818 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27873917  T
Q  360 caactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27873918 caacttgaccatgcatacat 27873937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 379
Target Start/End: Original strand, 27948606 - 27948725
Alignment:
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacata 359  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27948606 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27948705  T
Q  360 caactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  27948706 caacttgaccatgcatacat 27948725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14736952 - 14736772
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  14736952 tatgcatggggtaccaaacaggaccgacgccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 14736853  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgct-gtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14736852 tccaggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 14736772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 27889736 - 27889964
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat-------tca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||       |||    
T  27889736 atcatcttgcaaatataaatatataattcaca-agcaacaacatcatct-catcaaatcaatccatcataatatgtatataaatatatatagatccatca 27889833  T
Q  108 tcaacatca-----atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 202  Q
     ||||||||     || |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27889834 acaacatcatcatcattaatatgacaactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 27889933  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccg 233  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27889934 gtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27889964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 27948394 - 27948622
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacat-------tca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||| | | |||||||||| ||       |||    
T  27948394 atcatcttgcaaatataaatatataattcaca-agcaacaacatcatct-catcaaatcaatccatcataatatgtatataaatatatatagatccatca 27948491  T
Q  108 tcaacatca-----atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 202  Q
     ||||||||     || |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27948492 acaacatcatcatcattaatatgacaactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcat 27948591  T
Q  203 gtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccg 233  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27948592 gtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27948622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Original strand, 35541048 - 35541228
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |    
T  35541048 tatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactcgtac 35541147  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35541148 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 35541228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 379
Target Start/End: Original strand, 27889948 - 27890067
Alignment:
Q  261 gaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacata 359  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27889948 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27890047  T
Q  360 caactagaccatgcatacat 379  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  27890048 caaattgaccatgcatacat 27890067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 378
Target Start/End: Original strand, 6588132 - 6588253
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatcta 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6588132 caggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatcta 6588231  T
Q  356 catacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6588232 catacaact-gaccatgcataca 6588253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 27873721 - 27873834
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  27873721 aatatgacaactacaaccaacgaccaagactcatgcaggacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgac 27873820  T
Q  220 cgaagccctcaccg 233  Q
    ||||||||||||||    
T  27873821 cgaagccctcaccg 27873834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 23653798 - 23653962
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  23653798 atgacatgacaacaccccta-gactcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagc 23653896  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||| |||||  |||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23653897 attcattaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 23653962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Original strand, 39363504 - 39363604
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  39363504 ccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaaacattcatcaggacccaggtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgc 39363603  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  39363604 t 39363604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Original strand, 214002 - 214123
Alignment:
Q  256 atcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  214002 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 214101  T
Q  352 tctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  214102 tctacatacaact-gaccatgca 214123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 238252 - 238131
Alignment:
Q  256 atcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  238252 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 238153  T
Q  352 tctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  238152 tctacatacaact-gaccatgca 238131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Original strand, 727625 - 727746
Alignment:
Q  256 atcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  727625 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 727724  T
Q  352 tctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  727725 tctacatacaact-gaccatgca 727746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Original strand, 800126 - 800247
Alignment:
Q  256 atcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  800126 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 800225  T
Q  352 tctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  800226 tctacatacaact-gaccatgca 800247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 374
Target Start/End: Original strand, 851519 - 851640
Alignment:
Q  256 atcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtata 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  851519 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 851618  T
Q  352 tctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  851619 tctacatacaact-gaccatgca 851640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23653206 - 23653040
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  23653206 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagc 23653107  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||| ||||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||| || ||| |||||||||    
T  23653106 atttatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccagggcaagagccctcccgct 23653040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20784006 - 20783927
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20784006 ttgaatggttaaagcattcatcaggacctaagc-ctcaccgctttgaacaataagtgtgccaggacatgagtcctcccgct 20783927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 19859533 - 19859631
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19859533 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 19859631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948554
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 10948554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24321827 - 24321720
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  24321827 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 24321728  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  24321727 aagcattc 24321720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27942398 - 27942291
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  27942398 tcatgcaagacatgacaactcaactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggtta 27942299  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    ||||||||    
T  27942298 aaacattc 27942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14594906 - 14594808
Alignment:
Q  221 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14594906 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 14594808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38186096 - 38186014
Alignment:
Q  236 tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38186096 tttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagttctcccgct 38186014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 6588093 - 6588158
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  6588093 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttga 6588158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21690584 - 21690487
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaa-ctagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21690584 gaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaataaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 21690487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20005737 - 20005592
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctc-ccgct 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||||  | |||||||| || || |||||| |||||| |||| |||||    
T  20005737 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaaacattctttagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcaccgct 20005638  T
Q  318 gtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
      |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20005637 --ttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 20005592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8729237 - 8729130
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  8729237 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 8729138  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  8729137 aagcattc 8729130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21686260 - 21686162
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |  |||  ||||||  | ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21686260 gaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagtcctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 21686162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31412710 - 31412618
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggac 263  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31412710 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31412618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31418892 - 31418800
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggac 263  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31418892 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31418800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Original strand, 20006374 - 20006430
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20006374 cctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 20006430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36445888 - 36445806
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36445888 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 36445806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 213984 - 214030
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  213984 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 214030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 238270 - 238224
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  238270 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 238224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 727607 - 727653
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  727607 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 727653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 800108 - 800154
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  800108 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 800154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 240
Target Start/End: Original strand, 851501 - 851547
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttga 240  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  851501 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8596315 - 8596253
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  8596315 tcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 8596253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21686145 - 21686075
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21686145 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatttacatacaact 21686075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Original strand, 43687207 - 43687249
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  43687207 atcatcttgcaaatataaatatatattttacaaagtaacaaca 43687249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22063603 - 22063558
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22063603 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22176075 - 22176030
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22176075 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 16259558 - 16259637
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16259558 ttgaatggttaaagcattcatcaaagcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatga-tcctcccgct 16259637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 16267209 - 16267166
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaaca 59  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  16267209 acatcatcttgcaaatataaacatataattcaca-agcaacaaca 16267166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20012188 - 20012136
Alignment:
Q  327 tatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20012188 tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaactcaacaatgcataca 20012136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 364
Target Start/End: Original strand, 39363648 - 39363692
Alignment:
Q  321 tatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39363648 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 102010 - 101640
Alignment:
Q  17 atcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttca--aaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaaca- 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||  ||||||||||||| |||| | | |||||||||| || ||||||||     
T  102010 atcatcttgtaaatataaatatatatttcaca-agcaacaacggcatct-catcaaatcaatccatcataatatgtatataaatatatatccatcaacaa 101913  T
Q  114 -----tca--atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtgg 206  Q
         |||  || |||||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  101912 tatcatcatcattaatatgtcaactacaaccagcgaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcgactatgcatctgg 101813  T
Q  207 taccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101812 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgtgaacaactagtgctccaggacatga 101713  T
Q  307 gtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  101712 gtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatgcatacat 101640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 97560 - 97504
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  97560 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtacca 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 150 - 380
Target Start/End: Original strand, 13 - 245
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13 tcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 112  T
Q  248 aaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  113 aaacattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtg 212  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  213 tatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51725 - 51672
Alignment:
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51725 ctcccgct-tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 74474 - 74105
Alignment:
Q  22 cttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaacatcaa---- 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||        
T  74474 cttgtaaatataaatatatatttcacaaaacaacaac-ttatcttcaaa-tcatttcatcataataggtgtataattatacatacatcaacaacaacatc 74377  T
Q  118 -------tcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaata-tgcaattatgcatgtggtac 209  Q
           ||| ||| |||| ||| |||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||     
T  74376 atcatcatcattataacaattaccaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaattaatgcaattatgcatgtggtat 74277  T
Q  210 caaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtc 309  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  74276 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtc 74177  T
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  74176 ctcccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 74105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 117 - 379
Target Start/End: Original strand, 543 - 807
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacg 215  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  543 atcaatgtggcaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacaacatcactaagactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 642  T
Q  216 gtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-cc 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  643 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctctgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctcc 742  T
Q  315 gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  743 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Original strand, 1000 - 1045
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1000 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 144 - 381
Target Start/End: Original strand, 246966 - 247204
Alignment:
Q  144 agagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaat 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  246966 agagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaat 247065  T
Q  243 ggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccac 342  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  247066 ggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacccac 247165  T
Q  343 tcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  247166 ttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 247204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 144 - 381
Target Start/End: Original strand, 253480 - 253718
Alignment:
Q  144 agagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctcaccgcttttgaat 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  253480 agagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaat 253579  T
Q  243 ggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccac 342  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  253580 ggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgctatggacccac 253679  T
Q  343 tcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  253680 ttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 253718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 246889 - 246943
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  246889 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcaccttcaa 246943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 253403 - 253457
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  253403 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacaacatcaccttcaa 253457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Original strand, 178938 - 179188
Alignment:
Q  133 caaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa-cggtaccgaagccctca 230  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  178938 caaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctca 179037  T
Q  231 ccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  179038 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatg 179137  T
Q  331 caatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  179138 caatggacccacttttgtatatctacatacaacttgaccatgcatacattt 179188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 512715 - 512512
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  512715 agactactcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 512616  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 373  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  512615 cgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 512517  T
Q  374 ataca 378  Q
    |||||    
T  512516 ataca 512512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 488420 - 488350
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  488420 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 494182 - 494120
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  494182 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 494120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 186
Target Start/End: Original strand, 524601 - 524631
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  524601 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa 524631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Original strand, 7636 - 7856
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7636 aatatggcaactacaaccaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaattatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggac 7735  T
Q  220 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7736 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgatgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 7835  T
Q  319 tttatgcatatgcaatggacc 339  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7836 tttatgcatatgcaatggacc 7856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Original strand, 12921 - 13043
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12921 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 13020  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||| | ||||||||||||||    
T  13021 atacaaattgaccatgcatacat 13043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 12827 - 12942
Alignment:
Q  120 aatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtac 219  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  12827 aatatggcaactacaacaaacaaccaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatggaattatgcatgtggtaccaaacaggac 12926  T
Q  220 cgaagccctcaccgct 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  12927 cgaagccctcaccgct 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 65510 - 65279
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 248  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65510 tcattcatgacatgacaataccactaagactcctcaaaatatgcaattattcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaa 65411  T
Q  249 aacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg 347  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| |||    
T  65410 agcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatgaaactacttgtg 65311  T
Q  348 tatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  65310 tatatctacatacaacttgaccatgcatacat 65279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 381
Target Start/End: Original strand, 41184 - 41415
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184 tcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaa 41283  T
Q  250 acattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgta 349  Q
     |||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41284 gcattcatcaggacataagccctcaccgaagtgaacaacaaatgctccaggacatgagtactcccactgtttatgcatatgatatggacccacttgtgta 41383  T
Q  350 tatctacatacaactagaccatgcatacattt 381  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41384 tatctacatacaacttgaccatgcatacattt 41415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 41102 - 41156
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatatttcacagagcaacaacattatcttcaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  41102 acatcatcttgtaaatataaatatatatttcacaaagcaacatcatcatcttcaa 41156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 209 - 380
Target Start/End: Original strand, 30845 - 31016
Alignment:
Q  209 ccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagt 308  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30845 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagt 30944  T
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30945 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 31016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Original strand, 24457 - 24830
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatata-tttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaaca 113  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||| | |||||  ||| | | || ||||||| |||||||||||    
T  24457 acatcatcttgtaaatataagcatataatttcaca-agcaacaacaacatcatcaaaatccacccatcacaatatgtatacaaatatatattcatcaaca 24555  T
Q  114 tca--------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtg 205  Q
     ||        |||||| ||  ||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||    
T  24556 acatcatcatcatcaatgtggaaactacaaccaacaactaagactcatgcatgacataaccacaccactaagactcctcaactatgtgaatgtgcatgtg 24655  T
Q  206 gtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatg 305  Q
    |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24656 gtaccagacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatg 24755  T
Q  306 agtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24756 agtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaacttgaccatgcatacat 24830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4819 - 4616
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  4819 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaaccgaagccctcac 4720  T
Q  276 cgctgtgaa-caactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 373  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4719 cgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 4621  T
Q  374 ataca 378  Q
    |||||    
T  4620 ataca 4616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31710 - 31627
Alignment:
Q  235 ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  31710 ttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagatgttccaggacataagtcctcccgct 31627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 176 - 377
Target Start/End: Original strand, 15080 - 15284
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  15080 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 15179  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcct-cccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15180 ccgctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 15279  T
Q  373 catac 377  Q
    |||||    
T  15280 catac 15284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Original strand, 19586 - 19790
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19586 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 19685  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19686 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 19784  T
Q  373 cataca 378  Q
    ||||||    
T  19785 cataca 19790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23793
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  23999 agactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccttataggaccgaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctca 23900  T
Q  275 ccgctgt-gaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23899 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 23800  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  23799 catacat 23793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 994
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1200 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 1101  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtt-tatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1100 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat 1001  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  1000 gcataca 994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 176 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15380 - 15174
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15380 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtactaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaggattcatcaggaccgaagccctca 15281  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15280 ccgctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 15181  T
Q  373 catacat 379  Q
    |||||||    
T  15180 catacat 15174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Original strand, 870 - 1076
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactca 274  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  870 agactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagataggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 969  T
Q  275 ccgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccat 371  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  970 ccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat 1069  T
Q  372 gcataca 378  Q
    |||||||    
T  1070 gcataca 1076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 218 - 379
Target Start/End: Original strand, 19235 - 19397
Alignment:
Q  218 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  19235 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctctctgc 19334  T
Q  317 tgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19335 tgtttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacat 19397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 279
Target Start/End: Original strand, 19089 - 19252
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgac-atgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaac 214  Q
    |||||| || || ||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19089 atcaatgtggcatctacaaccaacaactaagactcatgcatgaccatgacaacaccactaa-actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagac 19187  T
Q  215 ggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgct 279  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19188 aggacggaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 19252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 379
Target Start/End: Original strand, 15177 - 15299
Alignment:
Q  258 caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccc-gctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctac 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15177 caggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaagacatgagtcctctctgctgtttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctac 15276  T
Q  357 atacaactagaccatgcatacat 379  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  15277 atacaacttgatcatgcatacat 15299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Original strand, 15079 - 15198
Alignment:
Q  117 atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgac-atgacgacaccactaagactcctcaaa-tatgcaattatgcatgtggtaccaaac 214  Q
    |||||| || || ||||||||||  ||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  15079 atcaatgtggcatctacaaccaacaactaagactcatgcatgaccatgacaacaccactga-actcctaaaaatatgcaattatgcatgtggtactagac 15177  T
Q  215 ggtaccgaagccctcaccgct 235  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  15178 aggaccgaagccctcaccgct 15198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5903 - 5703
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  5903 agacttctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcac 5804  T
Q  276 cgctg-tgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5803 cgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 5705  T
Q  373 ca 374  Q
    ||    
T  5704 ca 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 177 - 1
Alignment:
Q  7 acatcatcacatcatcttgcaaatataaatatatat----ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatac 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  177 acatcatcacatcatctttcaaatataaatatatatatatttcacagagcaacggcattatcttcaaaatcagtccatcgtaatctatgtataaatatac 78  T
Q  103 attcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagac 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77 attcatcaacatcaatcaatatggcaattacaaccaacaactaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 176 - 378
Target Start/End: Original strand, 25020 - 25223
Alignment:
Q  176 agactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcac 275  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25020 agacttctcaaatatgcaaatatgcatgtggtaacaacagg-accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 25118  T
Q  276 cgct-gtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatg 372  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25119 cgctattgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaact-gaccatg 25217  T
Q  373 cataca 378  Q
    ||||||    
T  25218 cataca 25223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 263
Target Start/End: Original strand, 143767 - 144028
Alignment:
Q  15 acatcatcttgcaaatataaatatatat--ttcacagagcaacaacattatcttcaaaatcaatccatcgtaatctatgtataaatatacattcatcaac 112  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  143767 acattatcttgtaaatataaatatatatatttcacaaagcaacaacatcatcttcaaa-tcaattcataataatatatgtataaatatatattcatcaac 143865  T
Q  113 atca-----------atcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgc 200  Q
    | ||           ||||||||| ||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  143866 aacatcatcatcatcatcaatatggcaattacaaccaacaacaaagactcatgcatgacatgacgacaccactaagacccctcaataaatgcaattatgc 143965  T
Q  201 atgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggac 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  143966 atgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 144028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 279 - 380
Target Start/End: Original strand, 137159 - 137260
Alignment:
Q  279 tgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  137159 tgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcataca 137258  T
Q  379 tt 380  Q
    ||    
T  137259 tt 137260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 378
Target Start/End: Original strand, 31632 - 31824
Alignment:
Q  189 atgcaattatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaa 287  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  31632 atgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaa 31731  T
Q  288 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcataca 378  Q
    ||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31732 ctagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttaaccatgcataca 31824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 196 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18580 - 18401
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  18580 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18481  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 373  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18480 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 18401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 104284 - 104466
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  104284 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 104383  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  104384 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 104466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38691 - 38624
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38691 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgactccactcgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 38624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 136751 - 136684
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  136751 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgactccactcgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 196 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12388 - 12208
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  12388 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 12289  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12288 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 12208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Original strand, 9835 - 9938
Alignment:
Q  278 ctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9835 ctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 9934  T
Q  377 catt 380  Q
    ||||    
T  9935 catt 9938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 196 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18684 - 18513
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagtgc 294  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  18684 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 18585  T
Q  295 tccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18584 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 18513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 1853 - 1958
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  1853 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagc 1952  T
Q  252 attcat 257  Q
    ||||||    
T  1953 attcat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2066
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcat-caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1984 ttgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 2066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 13403 - 13586
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  13403 attatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagt 13502  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg--tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13503 actccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 13586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 374
Target Start/End: Original strand, 49998 - 50180
Alignment:
Q  194 attatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctg-tgaacaactagt 292  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  49998 attatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagt 50097  T
Q  293 gctccaggacatgagtcctc-ccgctg-tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 374  Q
     |||||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50098 actccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 50180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 16185 - 16100
Alignment:
Q  196 tatgcatgtggtaccaaacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgt 281  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16185 tatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 16100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 20160 - 20096
Alignment:
Q  316 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcatacatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20160 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacatt 20096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4344 - 4178
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |    
T  4344 atgacatgacaacaccactaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagc 4245  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||    
T  4244 attcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaatttgttccaggacatgagtcctcccgct 4178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  321 tatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 26069 - 26215
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |  |||| |    
T  26069 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccc 26168  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26169 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 26215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Original strand, 27451 - 27597
Alignment:
Q  176 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcac 271  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |  |||| |    
T  27451 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccc 27550  T
Q  272 tcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27551 tcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 27597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 1244 - 1410
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||   ||    | |||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  1244 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaatgcgacgatgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcaccgtatattgaatggttaaagc 1343  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1344 attcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 1427 - 1509
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  1427 tccagggcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacgtacaactcgacaatgcata 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9348
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9268 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 9348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 44938 - 45018
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44938 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 45018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 37042 - 36980
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  37042 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36834 - 36789
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36834 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3448 - 3353
Alignment:
Q  223 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  3448 agccctcaccggattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagggttccaggacatgagtcctcccgct 3353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 147050 - 147131
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  147050 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 75156 - 75255
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  75156 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 75255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Original strand, 154186 - 154252
Alignment:
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  154186 attcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 154252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 56920 - 56821
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56920 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggaattgagtcctcccgct 56821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 251927 - 252008
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatc-aggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  251927 ttgaatggttaaagcattcatttagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacacgagtcctcccgct 252008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 129914 - 129747
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaa 250  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  | |||||||||||||  | |||||||||||||     
T  129914 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaag 129815  T
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  129814 cattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaacaaagtgttccagggcatgagtcctcccgct 129747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 8518 - 8598
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8518 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 8280 - 8360
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8280 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctcccgct 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 18364 - 18444
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18364 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctcccgct 18444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9361
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9281 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctcccgct 9361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5282 - 5182
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  5282 ccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtactcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctcccgc 5183  T
Q  317 t 317  Q
    |    
T  5182 t 5182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47957 - 47877
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  47957 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttctaggacatgagtcctcccgct 47877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 42091 - 42135
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42091 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Original strand, 6096 - 6250
Alignment:
Q  167 acaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtaccaa--acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggac 263  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||  || |  | ||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6096 acaccgctaagactcctcgacaatgcaataatgcatgtggtaccaattacagggcagaaaccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggc 6195  T
Q  264 cgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
      |||| ||||||||| |||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  6196 ataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttacaggacatgagtcctcccgct 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 6267 - 6337
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6267 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15022 - 14915
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  ||||||||||||||| | | |||||||||    
T  15022 tcatgcatgacatgacgactcctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggtta 14923  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  14922 aagcattc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7847 - 7778
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||  |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7847 tccaggacaagagacctcccgctttatatgtttatgcaactgacccaattgtgtatatctacatacaact 7778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8028 - 7972
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  8028 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatatggtacca 7972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 317
Target Start/End: Original strand, 248 - 349
Alignment:
Q  219 ccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccg 315  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||    
T  248 ccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctaccg 347  T
Q  316 ct 317  Q
    ||    
T  348 ct 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16264 - 16160
Alignment:
Q  157 tgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaaca 252  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16264 tgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaaca 16165  T
Q  253 ttcat 257  Q
    |||||    
T  16164 ttcat 16160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16146 - 16056
Alignment:
Q  226 cctcaccgcttttgaatggttaaaacattcat-caggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctccc 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  |||  ||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16146 cctcaccgctattgaatggttaaagaattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacgacaaagtgttccaggacatgagtcctccc 16056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 2912 - 2993
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2912 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccttcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 317
Target Start/End: Original strand, 51089 - 51256
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaa 250  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  | |||||||||||||  | |||||||||||||     
T  51089 atgatatgacgacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaag 51188  T
Q  251 cattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactag-tgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||  || |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  51189 cattcatcagggcataagccctcacttctttgaataacaaggtgttccaggacatgagtcctcccgct 51256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 362
Target Start/End: Original strand, 51273 - 51341
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaa 362  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51273 tccagggcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaa 51341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 999 - 1080
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaac-tagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  999 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacagagtgttccaggacatgagtcctcccgct 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 64992 - 65090
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  64992 gaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaatgtgttccaggacacgagtcctcccgct 65090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 65107 - 65189
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  65107 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaactcgacaatgcata 65189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 5067
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcc 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||    
T  5143 ttgaatggttaaatcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccacgacatgagtcctcc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 364
Target Start/End: Original strand, 38448 - 38594
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctttt--gaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  38448 gaagccctcaccactatttcgaatggttaaagcattcatcaagacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctcccgct 38547  T
Q  318 gtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
     | ||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  38548 -tatatgcttatgcaacggactccacttgtgtctatcttcatacaact 38594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 317
Target Start/End: Original strand, 44623 - 44706
Alignment:
Q  235 ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44623 ttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtccacaccgctttgaacaacaaggtgttccagaacatgagtcctcccgct 44706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 29944 - 30014
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  29944 tccagggcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtatatatctacatacaact 30014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 17564 - 17484
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17564 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcactgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 1
Alignment:
Q  167 acaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcagga 262  Q
    |||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||  ||    
T  155 acaccaataagactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcattcatcgaga 56  T
Q  263 ccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgc 316  Q
    |  |||  ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  55 cataagtcctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1251 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1251
Description:

Target: scaffold1251; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Original strand, 2230 - 2302
Alignment:
Q  105 tcatcaacatcaatcaatatgacaactacaaccaatgacagagaatcatgcatgacatgacgacaccactaagac 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2230 tcatcaacatca-tcaatatgacaattacaaccaacaaca-agactcatgcatgacatgacaacaccactaagac 2302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4331
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  4393 tcatgcaggacatgacgactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 313
Target Start/End: Original strand, 18532 - 18626
Alignment:
Q  221 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcc 313  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  18532 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacgaggtgttccaggacatgagtcctcc 18626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 364
Target Start/End: Original strand, 18644 - 18712
Alignment:
Q  297 caggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18644 cagggcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaact 18712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43116 - 42904
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca---aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    || |  | ||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  43116 atgacatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcacctaatttgaatggttaaagc 43017  T
Q  252 attcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgt 348  Q
    ||||| |||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| |||||| |||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||| | ||| ||||    
T  43016 attca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcaccgc--tttatgtttatgcaatggactcaacttgtgt 42920  T
Q  349 atatctacatacaact 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  42919 atatctacatacaact 42904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1765 - 1696
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1765 tccaggtcatgagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15495 - 15451
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15495 tttatgcttatgcaactgacccactcgtgtatatctacatacaac 15451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18392 - 18230
Alignment:
Q  159 acatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa---acggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacatt 254  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||   || |  | |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18392 acatgacaacaccactaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcatt 18293  T
Q  255 catcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    || |||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18292 ca-cagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccaggacaagagccctcccgct 18230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 592 - 672
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |  |||| |||| |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  592 ttgaatggttaaatcaatcatcagggcataagccctcatcgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctcccgct 672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2967
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  3074 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 2975  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  2974 aagcattc 2967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 541 - 446
Alignment:
Q  223 agccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  541 agccctcaccactgtagaatgattaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5566 - 5468
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  5566 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 5468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110252
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | | |  |||||||||||| || | | |||||||||    
T  110145 tcatgcaagacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggtta 110244  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  110245 aagcattc 110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28072 - 27973
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28072 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaagtgttccatgacatgagtcctcccgct 27973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38909 - 38810
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||| || ||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38909 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaattaaagtgttccatgacatgagtcctcccgct 38810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27956 - 27886
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacc-cactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27956 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactgcacttgtgtatatctacatacaact 27886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38793 - 38723
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacc-cactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  38793 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 2392 - 2462
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2392 tccagggcaagagccctcccgctttttatacttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 2462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 2276 - 2375
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  | ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2276 gaagccctcaccgaatattgaatggttaaggcattcatcagggcctaagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 314
Target Start/End: Original strand, 443 - 521
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctccc 314  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  443 ttgaatggttaaagcattcaccagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctccc 521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 133 - 238
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaac 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |    
T  133 atgacatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagc 232  T
Q  252 attcat 257  Q
    ||||||    
T  233 attcat 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Original strand, 36323 - 36393
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36323 tccagggcatgagccctcccgctttatatgcttatccaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 36393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 28634 - 28733
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta--gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28634 gaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcatgagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctcccgct 28733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Original strand, 28751 - 28807
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28751 cctcccgctttatatgcttatgcaattgactccacttgtgtatatctacatacaact 28807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55982 - 55912
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  55982 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10474 - 10421
Alignment:
Q  158 gacatgacgacaccactaagactcctcaaatatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  10474 gacatgacgacacatctaagactcctcacaaatgcaactatgcatgtggtacca 10421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1508 - 1409
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | ||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1508 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaagacatgagtcctcccgct 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 65
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  164 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccagaacatgagacctcccgct 65  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10682 - 10626
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10682 cctcccgctttgtatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18861 - 18805
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18861 cctcccgctttgtatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24517 - 24472
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24517 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 76741 - 76840
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||  |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  76741 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctctcgct 76840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 150 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 361 - 254
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca-aacggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggtta 247  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||| |  | |||||||||| || | | |||||||||    
T  361 tcatgcaggacatgacaactccactaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtgggaccataacagagctgaagccctcatcgttatagaatggtta 262  T
Q  248 aaacattc 255  Q
    || |||||    
T  261 aagcattc 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9454
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| || |  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9372 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaaaaattaaagtgttctaggacatgagtcctcccgct 9454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10130 - 10076
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10130 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35941 - 35839
Alignment:
Q  159 acatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaaacatt 254  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  35941 acatgacgacacttctaagactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaaaggttaaagcatt 35842  T
Q  255 cat 257  Q
    |||    
T  35841 cat 35839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 388
Alignment:
Q  290 agtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggaccc-actcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  473 agtgttccagtacaggagccctcccgct--ttatgcttatgcaactgaccccacttgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6632 - 6547
Alignment:
Q  290 agtgctccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggaccc-actcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6632 agtgttccagtacaggagccctcccgct--ttatgcttatgcaactgaccccacttgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1305 - 1236
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1305 tccagggcatgagccctcccgctttatatgt-tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 1236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0377
Description:

Target: scaffold0377; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Original strand, 3343 - 3397
Alignment:
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||||| ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3343 ctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatacaact 3397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0377; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Original strand, 7382 - 7436
Alignment:
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||||| ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7382 ctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatacaact 7436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 364
Target Start/End: Original strand, 7402 - 7455
Alignment:
Q  310 ctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7402 ctcccgct-tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 19821 - 19919
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19821 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacggctttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 19919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Original strand, 45527 - 45625
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaacta-gtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||    
T  45527 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcccgct 45625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 92358 - 92296
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  92358 tcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 92296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 98084 - 98022
Alignment:
Q  150 tcatgcatgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtacca 211  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  98084 tcatgcaagacatgacaactcttctaagactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtacca 98022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 207783 - 207714
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  207783 tccagggcatgagccctcccgctttatatgt-tatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 207714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 184 - 139
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  184 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11957 - 11912
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11957 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4534 - 4477
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaa 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||    
T  4534 atgacatgacaacacctctaagactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaa 4477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41633 - 41588
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41633 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41835 - 41732
Alignment:
Q  156 atgacatgacgacaccactaagactcctc-aaatatgcaattatgcatgtggtaccaaa--cggtaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaaca 252  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||    
T  41835 atgacatgacaacacctctaagactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagca 41737  T
Q  253 ttcat 257  Q
    |||||    
T  41736 ttcat 41732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18205 - 18136
Alignment:
Q  295 tccaggacatgagtcctcccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    |||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18205 tccagggcaagagccctcccgctttatatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctatatacaact 18136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 376
Target Start/End: Original strand, 56044 - 56081
Alignment:
Q  339 ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56044 ccacttgtgtatatctacatacaactagacaatgcata 56081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20534 - 20489
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20534 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0661
Description:

Target: scaffold0661; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4114 - 4058
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaact 364  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4114 cctcccgctttatatgcttatgtaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4244 - 4145
Alignment:
Q  221 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaact--agtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||  | ||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4244 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaattaaagtgttccaggacctgagtcctcccgct 4145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 317
Target Start/End: Original strand, 3250 - 3330
Alignment:
Q  237 ttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctcccgct 317  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| |  |||| ||||||| | |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3250 ttgaatggttaaggcgttcatcagggcataagccctcaccgatttgaacaataagtgttccaggatatgagtcctcccgct 3330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14513 - 14469
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14513 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Original strand, 6793 - 6860
Alignment:
Q  309 cctcccgctgtttatgcatatgcaatggac-ccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgcata 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6793 cctcccgct-tttatgcttatgcaactgactccacttgtgtatatctacatacaacttgacaatgcata 6860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 363
Target Start/End: Original strand, 17638 - 17682
Alignment:
Q  319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaac 363  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17638 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University