View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15120_high_15 (Length: 292)

Name: NF15120_high_15
Description: NF15120
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15120_high_15
NF15120_high_15
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (13-278)||(7643593-7643859)
chr4 (13-278)||(54331443-54331710)
chr4 (13-278)||(14829311-14829578)
chr4 (13-278)||(5272075-5272342)
chr4 (13-278)||(37701397-37701666)
chr4 (13-278)||(2776499-2776767)
chr4 (13-278)||(19831197-19831464)
chr4 (13-278)||(28973284-28973553)
chr4 (13-278)||(21353306-21353572)
chr4 (13-278)||(22115851-22116118)
chr4 (13-278)||(34056363-34056630)
chr4 (13-277)||(53342631-53342899)
chr4 (13-278)||(28134865-28135132)
chr4 (46-278)||(23479156-23479390)
chr4 (15-278)||(55998512-55998777)
chr4 (13-262)||(33502815-33503064)
chr4 (13-278)||(36857309-36857576)
chr4 (14-278)||(17699400-17699666)
chr4 (13-278)||(35495344-35495610)
chr4 (13-252)||(13628274-13628514)
chr4 (18-275)||(40622375-40622638)
chr4 (13-262)||(47557239-47557492)
chr4 (13-272)||(8531038-8531302)
chr4 (13-262)||(17740262-17740516)
chr4 (20-275)||(41984035-41984294)
chr4 (91-278)||(38008561-38008751)
chr4 (81-215)||(7842627-7842761)
chr4 (161-278)||(36515140-36515259)
chr4 (13-99)||(38008066-38008152)
chr4 (13-100)||(39742726-39742813)
chr4 (13-85)||(26870284-26870356)
chr4 (13-85)||(3839360-3839432)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (13-278)||(18598779-18599046)
chr6 (13-278)||(1073056-1073323)
chr6 (12-278)||(34856138-34856406)
chr6 (16-278)||(22373635-22373898)
chr6 (13-278)||(2521352-2521619)
chr6 (13-278)||(14887731-14887998)
chr6 (13-278)||(18311978-18312245)
chr6 (13-252)||(17939709-17939945)
chr6 (13-278)||(4424672-4424939)
chr6 (13-278)||(21799729-21799997)
chr6 (44-278)||(7222528-7222764)
chr6 (13-278)||(35041280-35041542)
chr6 (13-278)||(30044395-30044662)
chr6 (13-275)||(34321280-34321546)
chr6 (20-275)||(33321249-33321505)
chr6 (13-278)||(15275845-15276090)
chr6 (81-275)||(14831772-14831968)
chr6 (13-193)||(25540260-25540440)
chr6 (13-86)||(14831672-14831745)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (13-278)||(7285846-7286113)
chr5 (13-278)||(3028923-3029191)
chr5 (13-278)||(2195334-2195601)
chr5 (13-278)||(10512148-10512414)
chr5 (13-278)||(1851743-1852010)
chr5 (13-278)||(3150387-3150654)
chr5 (13-278)||(26320858-26321125)
chr5 (13-278)||(33610923-33611190)
chr5 (13-278)||(38934631-38934898)
chr5 (14-278)||(3396919-3397188)
chr5 (13-278)||(21030277-21030545)
chr5 (13-278)||(34374166-34374430)
chr5 (13-275)||(4882441-4882705)
chr5 (13-278)||(27066042-27066308)
chr5 (13-278)||(30689478-30689747)
chr5 (13-278)||(17996734-17997004)
chr5 (13-278)||(20758115-20758381)
chr5 (13-225)||(19448172-19448384)
chr5 (13-278)||(35539706-35539969)
chr5 (13-278)||(20350091-20350370)
chr5 (13-275)||(33706560-33706829)
chr5 (81-278)||(20995680-20995878)
chr5 (81-275)||(33930061-33930247)
chr5 (81-275)||(41781089-41781274)
chr5 (13-86)||(20995921-20995994)
chr5 (13-86)||(41780997-41781070)
chr5 (13-85)||(9702421-9702493)
chr5 (13-85)||(3210178-3210250)
chr5 (13-86)||(33929963-33930036)
chr5 (13-57)||(31295680-31295724)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (13-278)||(14078603-14078870)
chr8 (13-278)||(6477266-6477533)
chr8 (13-278)||(33424032-33424299)
chr8 (13-278)||(44599649-44599916)
chr8 (13-278)||(27273180-27273447)
chr8 (13-278)||(30826402-30826669)
chr8 (13-278)||(38962116-38962383)
chr8 (13-278)||(38992460-38992727)
chr8 (13-278)||(38993630-38993899)
chr8 (13-278)||(42810706-42810977)
chr8 (13-278)||(23522430-23522697)
chr8 (13-276)||(41628838-41629100)
chr8 (13-275)||(44382576-44382841)
chr8 (13-275)||(41156586-41156851)
chr8 (20-275)||(45293348-45293608)
chr8 (13-278)||(19395335-19395603)
chr8 (71-278)||(9761273-9761482)
chr8 (13-275)||(19248055-19248326)
chr8 (13-275)||(19321239-19321510)
chr8 (29-275)||(3751075-3751325)
chr8 (81-275)||(41977514-41977710)
chr8 (81-241)||(22332887-22333047)
chr8 (154-278)||(36597808-36597934)
chr8 (107-275)||(22946572-22946732)
chr8 (142-260)||(12760493-12760612)
chr8 (13-86)||(22333088-22333161)
chr8 (13-85)||(12250167-12250239)
chr8 (13-85)||(39444968-39445040)
chr8 (13-85)||(23626312-23626384)
chr8 (13-79)||(12760422-12760488)
chr8 (13-86)||(22946781-22946854)
chr8 (13-85)||(29433986-29434058)
chr8 (13-86)||(41977406-41977479)
chr8 (13-85)||(39204578-39204650)
chr8 (41-86)||(16668793-16668838)
chr8 (44-97)||(36597929-36597982)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (13-278)||(50771032-50771299)
chr3 (13-278)||(35087623-35087890)
chr3 (13-278)||(6103912-6104179)
chr3 (13-278)||(49113268-49113534)
chr3 (13-278)||(16341857-16342126)
chr3 (13-278)||(32755718-32755983)
chr3 (13-278)||(48976886-48977153)
chr3 (13-278)||(52853229-52853496)
chr3 (18-278)||(31368801-31369063)
chr3 (10-269)||(54512982-54513243)
chr3 (13-262)||(51248551-51248802)
chr3 (20-275)||(52462719-52462978)
chr3 (13-275)||(55294568-55294831)
chr3 (13-228)||(21699409-21699621)
chr3 (13-278)||(50741554-50741842)
chr3 (13-275)||(11597748-11598015)
chr3 (13-275)||(48520828-48521074)
chr3 (146-275)||(54934151-54934272)
chr3 (14-85)||(16496093-16496164)
chr3 (13-79)||(40827021-40827087)
chr3 (209-275)||(40824458-40824526)
chr3 (13-85)||(11383314-11383386)
chr3 (211-275)||(8242891-8242957)
chr3 (191-278)||(18742013-18742103)
chr3 (14-85)||(54792945-54793016)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (13-278)||(18814430-18814697)
chr1 (13-278)||(34687798-34688065)
chr1 (13-278)||(31619900-31620167)
chr1 (13-278)||(34692326-34692593)
chr1 (13-278)||(41829822-41830089)
chr1 (13-278)||(41962701-41962968)
chr1 (13-278)||(44406571-44406838)
chr1 (50-278)||(52521390-52521620)
chr1 (13-277)||(48340540-48340806)
chr1 (13-275)||(47135606-47135876)
chr1 (81-278)||(38844980-38845179)
chr1 (13-275)||(52310045-52310310)
chr1 (13-275)||(51965507-51965772)
chr1 (13-220)||(17671667-17671878)
chr1 (13-275)||(50561252-50561524)
chr1 (81-275)||(36682328-36682514)
chr1 (81-275)||(45005059-45005245)
chr1 (101-275)||(12245666-12245833)
chr1 (129-275)||(10694599-10694747)
chr1 (114-275)||(16031372-16031525)
chr1 (13-86)||(45004943-45005016)
chr1 (13-85)||(28631523-28631595)
chr1 (14-85)||(12714689-12714760)
chr1 (14-85)||(13662373-13662444)
chr1 (14-85)||(28565683-28565754)
chr1 (13-86)||(38845214-38845287)
chr1 (114-194)||(17709621-17709701)
chr1 (13-86)||(16031570-16031643)
chr1 (13-71)||(36681454-36681512)
chr1 (13-62)||(12245831-12245880)
chr1 (13-57)||(24294740-24294784)
chr1 (13-57)||(39760145-39760189)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (13-278)||(26145-26412)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (13-278)||(10131-10398)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (13-278)||(11500066-11500333)
chr7 (13-278)||(14309060-14309327)
chr7 (13-278)||(17469939-17470205)
chr7 (13-278)||(17583009-17583275)
chr7 (13-278)||(8925699-8925960)
chr7 (13-278)||(23766228-23766495)
chr7 (41-278)||(5962931-5963170)
chr7 (13-275)||(33638466-33638732)
chr7 (13-278)||(17482538-17482822)
chr7 (13-278)||(17570392-17570676)
chr7 (41-278)||(42687787-42688026)
chr7 (13-275)||(27734840-27735105)
chr7 (13-259)||(9149569-9149818)
chr7 (13-220)||(42827196-42827403)
chr7 (81-278)||(17478187-17478387)
chr7 (81-278)||(17574827-17575027)
chr7 (13-275)||(23299514-23299779)
chr7 (13-275)||(47174660-47174934)
chr7 (81-278)||(19521426-19521624)
chr7 (81-278)||(33031135-33031334)
chr7 (13-228)||(41262184-41262396)
chr7 (81-275)||(42918136-42918334)
chr7 (13-86)||(17478095-17478168)
chr7 (13-86)||(17575046-17575119)
chr7 (13-85)||(4481371-4481443)
chr7 (13-85)||(42996655-42996727)
chr7 (16-86)||(33031006-33031076)
chr7 (13-85)||(38434534-38434606)
chr7 (13-85)||(42244840-42244912)
chr7 (13-86)||(42918030-42918103)
chr7 (13-86)||(19521332-19521405)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (13-278)||(26821858-26822125)
chr2 (13-278)||(33907466-33907737)
chr2 (13-278)||(16724136-16724403)
chr2 (13-278)||(26827738-26828005)
chr2 (13-278)||(45204805-45205072)
chr2 (13-278)||(42885614-42885879)
chr2 (13-278)||(11706851-11707120)
chr2 (13-278)||(30570335-30570604)
chr2 (13-275)||(18092510-18092776)
chr2 (13-252)||(33663612-33663848)
chr2 (13-229)||(21097937-21098153)
chr2 (13-210)||(30572285-30572484)
chr2 (81-278)||(36632837-36633036)
chr2 (13-275)||(1514775-1515044)
chr2 (13-220)||(4811785-4812002)
chr2 (152-278)||(19126470-19126598)
chr2 (106-275)||(35286077-35286238)
chr2 (107-220)||(45399129-45399242)
chr2 (13-86)||(35286321-35286394)
chr2 (13-85)||(17025830-17025902)
chr2 (13-85)||(17037507-17037579)
chr2 (13-85)||(17092015-17092087)
chr2 (13-86)||(36633067-36633140)
chr2 (13-81)||(45398980-45399048)
chr2 (13-80)||(28379990-28380057)
chr2 (13-54)||(19167654-19167695)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (13-278)||(3204-3471)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (17-278)||(625-888)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (13-278)||(49020-49287)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (13-243)||(10430-10662)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (13-275)||(12717-12983)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (106-278)||(817-991)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (59-275)||(194-414)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (83-278)||(176734-176930)
scaffold0010 (81-275)||(120176-120372)
scaffold0010 (41-86)||(120102-120147)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (107-275)||(101017-101177)
scaffold0016 (13-78)||(100802-100867)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (13-85)||(52948-53020)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (13-100)||(26688-26775)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (14-85)||(152135-152206)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (179-248)||(4782-4850)
scaffold0032 (179-248)||(11231-11299)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (14-86)||(29977-30049)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7643859 - 7643593
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  7643859 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgcaacttctaattaatactgcaattt 7643760  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7643759 gttttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcccactcatcgacaaacaagctcaaaaaaagtat 7643660  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7643659 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 7643593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 54331710 - 54331443
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  54331710 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 54331611  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331610 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 54331511  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54331510 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 54331443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14829578 - 14829311
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  14829578 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 14829479  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829478 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 14829379  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14829378 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 14829311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5272342 - 5272075
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||    
T  5272342 aaaataaaacatgctattttcctacaataaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaattt 5272243  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5272242 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtat 5272143  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5272142 aaatgtcgcttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 5272075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37701666 - 37701397
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaat--gttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  37701666 aaaattaaacatgttcttttcctacaataaatctttataatgctttggtaaatatgttttagaaatgtgcatatatataacttctaattaacactgcaat 37701567  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37701566 ttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 37701467  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37701466 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaattgttcaaatt 37701397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 2776499 - 2776767
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  2776499 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 2776598  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2776599 attttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacggaaaacaatcacactcattgacaaacaagctcaaaaaaggtat 2776698  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatactt-aggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2776699 aagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaaggcggccaatggttcaaatt 2776767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19831464 - 19831197
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  19831464 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 19831365  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831364 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaagaatacggaaagcaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 19831265  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19831264 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 19831197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 28973284 - 28973553
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||    
T  28973284 aaaataaaacatgctcttttcatacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatatataacttctaattaatactgcaat 28973383  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28973384 ttgttttgtacctaacacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcacactcatcgataaacaagctcaaaaaaggt 28973483  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28973484 ataagtgtcacttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 28973553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 21353306 - 21353572
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  21353306 aaaataaaacatgctcttttcctacggtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 21353405  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21353406 attttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatac-gaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 21353504  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21353505 aagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 21353572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22116118 - 22115851
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  22116118 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 22116019  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22116018 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacgggaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaaaaaaggtat 22115919  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22115918 aagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 22115851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34056630 - 34056363
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  34056630 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 34056531  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34056530 gttttgtacctagcacttctaaaatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagatcaaaaaaggtat 34056431  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34056430 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 34056363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 53342631 - 53342899
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  || |||||    
T  53342631 aaaataaaatatgctcttttcctacattaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatatataacttctaattaacactgcaat 53342730  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53342731 ttgttttgtacctagcacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacatgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 53342830  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaat 277  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  53342831 ataagtgtcgcttgataacgacaaatagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtccatggttcaaat 53342899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28135132 - 28134865
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||    
T  28135132 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaattt 28135033  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28135032 gttttatacctagcaattctcaaatgagatatcaatgacatatctaaaaggaagacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtat 28134933  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  28134932 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaataattaggcgaccaatggttcgaatt 28134865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 46 - 278
Target Start/End: Original strand, 23479156 - 23479390
Alignment:
Q  46 tttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatc 145  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  23479156 tttacaatgctttggtaaatgttttataaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttattttgtacctagcacttctaaaatgagatatc 23479255  T
Q  146 aatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23479256 aatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaagatataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt 23479355  T
Q  246 tac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23479356 tacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 23479390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 55998777 - 55998512
Alignment:
Q  15 aataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || ||||||| |    
T  55998777 aataaaacatgcacttttcctacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtatatatatataacttctaattaacactgcaatttgt 55998678  T
Q  115 tttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataa 214  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55998677 tttttacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacagggaaaaaaattacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataa 55998578  T
Q  215 gcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  55998577 gtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaatt 55998512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33503064 - 33502815
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  33503064 aaaataaaacatgttgtttttatacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaatgcaattt 33502965  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33502964 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaagaagctcaaaaaatgtat 33502865  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaatacttaggcg 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33502864 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttagaaaatacttaggcg 33502815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 36857309 - 36857576
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  || |||||||    
T  36857309 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataaaatctaattaacactgcaattt 36857408  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36857409 gttttgtatctagcacttctcaaatgagatatcaatgatatttctaagaggaacacggaaaaccatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 36857508  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  36857509 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatcgttcaaatt 36857576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 17699400 - 17699666
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattta 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |||||||     
T  17699400 aaataaaacatgctcttttcttacggtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaagtatatataacttctaattaacactgcaatttg 17699499  T
Q  114 ttttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtata 213  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17699500 ttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatatctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtgta 17699599  T
Q  214 agcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17699600 agtgtcgtttgataacggaaaagagagcaagctacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 17699666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35495610 - 35495344
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||    
T  35495610 aaaataaaacatgttcttttcctacggtaaatctttataatgcgttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctgattaacactgcaattt 35495511  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35495510 gttttgtac-tagcacttctaaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaataagctcaaaaaaggaat 35495412  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35495411 aagtgtcgcttgataacgacaaagagaacatgttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 35495344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 13628274 - 13628514
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttc-ctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  13628274 aaaataaaacatgctcttttttctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatt 13628373  T
Q  112 tattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggta 211  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13628374 ttttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgagatttctaaaaggaaaatggaaaacaatcacactcatcgaaaaacaagctcaaaaaaggta 13628473  T
Q  212 taagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaa 252  Q
    |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13628474 taactgtcgcttgataatggaaaagagagcaagttacaaaa 13628514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 275
Target Start/End: Original strand, 40622375 - 40622638
Alignment:
Q  18 aaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac----atatatgtaacttctaattagtaccgcaattta 113  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    |||||| |||| ||||||||  || |||||||     
T  40622375 aaaacatgttcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgtcttagaaatgtacttatatatatataacatctaattaacactgcaatttg 40622474  T
Q  114 ttttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtata 213  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40622475 ttttgtacctagcacgtcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtata 40622574  T
Q  214 agcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40622575 agtgtcgcttgataatggcaaatagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 40622638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 47557492 - 47557239
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  47557492 aaaatagaacatattcttttcccacaacaaatcttcataatgctttggtaaatattttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaat 47557393  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47557392 ttgttttgtaccttgcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacatggaaaaaaatcacattcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 47557293  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcg 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47557292 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcg 47557239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Original strand, 8531038 - 8531302
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  8531038 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaat 8531137  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctc-aaaaaagg 209  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8531138 ttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacaggggaaaaaatcacattcatcgacaaacaaactcaaaaaaagg 8531237  T
Q  210 tataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggtt 272  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  8531238 tataagtgtcgcttgataacgacaaagagaacaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggtt 8531302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 17740262 - 17740516
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||   | |||||    
T  17740262 aaaatagaatatgttcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatagaacatctaattaacgctgcaat 17740361  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaa-tcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaagg 209  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17740362 ttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaagg 17740461  T
Q  210 tataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcg 262  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17740462 tataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcg 17740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41984294 - 41984035
Alignment:
Q  20 aacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttatttt 117  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  41984294 aacatgctcttttcgtacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaattatatatataacatctaattagcactgcaatttgtttt 41984195  T
Q  118 gtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcg 217  Q
    | |||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  41984194 gcacctaacacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcattagcaaacaagctcaaaaaatgtataagtg 41984095  T
Q  218 tcgcttgataacggcaaagagagcaagtta--caaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  41984094 tcgcttgataatgggaaagagagcaagttatgaaaaatacataggcggtcaatggttcaa 41984035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 278
Target Start/End: Original strand, 38008561 - 38008751
Alignment:
Q  91 cttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcga 190  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38008561 cttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcga 38008660  T
Q  191 caaacaagctc-aaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38008661 caaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacagtaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 38008751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 215
Target Start/End: Original strand, 7842627 - 7842761
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7842627 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaataatca 7842726  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842727 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataag 7842761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36515259 - 36515140
Alignment:
Q  161 aggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatactta 258  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36515259 aggaatacgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtttcacttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatactta 36515160  T
Q  259 ggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  36515159 ggcggccaatggttcaaatt 36515140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Original strand, 38008066 - 38008152
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38008066 aaaataaaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatatatataacttctaatt 38008152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 39742813 - 39742726
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39742813 aaaataaaacatgctcttttcctacggtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaatta 39742726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26870356 - 26870284
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26870356 aaaatagaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 26870284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3839432 - 3839360
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3839432 aaaataaaacatgctcttttcctatagcaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 3839360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18599046 - 18598779
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  18599046 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 18598947  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598946 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 18598847  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18598846 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 18598779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1073323 - 1073056
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  1073323 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 1073224  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073223 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 1073124  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1073123 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 1073056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 278
Target Start/End: Original strand, 34856138 - 34856406
Alignment:
Q  12 gaaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatt 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  34856138 gaaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatt 34856237  T
Q  112 tattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggta 211  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34856238 tgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggta 34856337  T
Q  212 taagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34856338 taagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaatt 34856406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22373898 - 22373635
Alignment:
Q  16 ataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttatt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||    
T  22373898 ataaatcatgctcttttcctacaacaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttatt 22373799  T
Q  116 ttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataag 215  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22373798 ttgtacctagtacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaataaaggtataag 22373699  T
Q  216 cgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22373698 tgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaatacttaagcggccaatggttcaaatt 22373635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 2521352 - 2521619
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  2521352 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtgcatatatataacttctaattaacactgcaattt 2521451  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  2521452 gttttgtacctagcacttctaaaatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaagatgt 2521551  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2521552 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 2521619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14887998 - 14887731
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  14887998 aaaataaaacatgttattttcctgcagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 14887899  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887898 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 14887799  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14887798 aagtgtcgctttatatcgtcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 14887731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 18311978 - 18312245
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  18311978 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatcattataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 18312077  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18312078 attttgtacctagcacttctcaaatgagataacaatgatatttctaaaaggaacacgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 18312177  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18312178 aagtttcacttgataacggcaaagagatcaagttacaaaaaatacttaggcagtcaatggttcaaatt 18312245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 17939709 - 17939945
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||  ||||||    
T  17939709 aaaataaaacatgctattttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatat--aacttctaattaacactacaattt 17939806  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939807 gttttgtacctagcacttatcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 17939906  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaa 252  Q
     || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17939907 gagtgtc-cttgataacgacaaagagagcaagttacaaaa 17939945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 4424672 - 4424939
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||| |    
T  4424672 aaaataaaacatgctcttttcctacaataaatctttataacgctttgataaatgttttagaaatgtgcatatatataacttctaattcacactgcaatat 4424771  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4424772 gttttatacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaattacactcatcgacaaacaagctcaaacaaggtat 4424871  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4424872 aagtgtcgcttgataacgacaaagaaagcaagttacaaaaaatacttaggcgaccaatggtacaaatt 4424939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 21799729 - 21799997
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||    
T  21799729 aaaataaaacatgctattttcctacggtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcagttt 21799828  T
Q  113 atttt-gtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggta 211  Q
     |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21799829 ttttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaataatcacactca-cgacaaacaagctcaaaaaagcta 21799927  T
Q  212 taagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21799928 taagtgtcgcttgataacggcaaagtgagcaagttacaaaaaaatacttaggcggccaatggtttaaatt 21799997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 7222528 - 7222764
Alignment:
Q  44 tctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagata 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7222528 tctttataatgctttggtaaatgtttaagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagata 7222627  T
Q  144 tcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  7222628 tcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagttcaaaaaagatataagcgtcgcttgattacagcaaaaagagcaa 7222727  T
Q  244 gttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7222728 gttacaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaatt 7222764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 35041280 - 35041542
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  35041280 aaaataaaacatgctcttttcctacaataaatctttataatgctttggtaattgtt----aaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 35041375  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35041376 gttttgtaccttgcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacggaaa-caatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtat 35041474  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35041475 aagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 35041542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 30044395 - 30044662
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  30044395 aaaataaaacatgtttttttcatacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgttcatatatataacttctaattaacagtgcaattt 30044494  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30044495 gttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcacactcattgataaacaagctcaaaaaaggtat 30044594  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||  |||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30044595 aagtgtcgtttgataacgacaaagagagtcagttataaaaaatacttaggcggccaatggtttaaatt 30044662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 34321280 - 34321546
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacat--atatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| |||  | ||||||  |  |||||    
T  34321280 aaaatagaacatgttcttttcttacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttgtatatataatatttaattaacattgcaat 34321379  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321380 ttgttttgtacctaacacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaagaacacagaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 34321479  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34321480 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 34321546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33321505 - 33321249
Alignment:
Q  20 aacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaatttatttt 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||  || ||||||| ||||    
T  33321505 aacatgttcttttcctacagcaaatctttataatgttttggta--tgttttagaaatgtacttatatatagaacatctaattaacactgcaatttgtttt 33321408  T
Q  118 gtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcg 217  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  33321407 gtacctaacacttcccaaatgagatatcaatgacatttctaataggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataaatg 33321309  T
Q  218 tcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||    
T  33321308 tcgcttgataacggcaaaaagagcaagttacgaaaaatatttaggcggtcaatggttcaa 33321249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 15275845 - 15276090
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  || |||||    
T  15275845 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatg------------ttttagaaatgtacatatatatataacttctaattaacactgcaat 15275932  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    |  ||||||| |||| |||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15275933 tcgttttgtatctagcacttctcaa------------tgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaagt 15276020  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15276021 ataagtgtcgcttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 15276090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 14831772 - 14831968
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14831772 atatatataacatctaattaacacagcaatttgttttttacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatca 14831871  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  14831872 cactcatcgacaaaaaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagaaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 14831968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 25540260 - 25540440
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  || |||||||    
T  25540260 aaaatagaacatgttcttttcctacgacaaatctttataatgattaggtaactgttttagaaatgtacttatatataacatctaattaacactgcaattt 25540359  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaa 193  Q
     ||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  25540360 gttttgtatctagcacttcccaagtgagatatcaaggacatttctaaaaggaagaggggaaaaaatcacactcatcgacaa 25540440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 14831672 - 14831745
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14831672 aaaatagaacatgttattttcctacaacaaatctttataattctttggtaaatgttttagaaatgtacttatat 14831745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 7285846 - 7286113
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  7285846 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattagcactgcaattt 7285945  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285946 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 7286045  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7286046 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 7286113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 3028923 - 3029191
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||    
T  3028923 aaaataatacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatatagcttctaattaacactgcaattt 3029022  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3029023 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcgtcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 3029122  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3029123 aagtgtcgcttgataacggcaaaaagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 3029191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 2195334 - 2195601
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||    
T  2195334 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttcaaattatcactgcaattt 2195433  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195434 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 2195533  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2195534 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 2195601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10512414 - 10512148
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  10512414 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttataaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 10512315  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10512314 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgatagttctaaaaggaacacggaaaacaatcgcactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 10512215  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt-tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10512214 aagtgtcgcttgataacgacaaagatagcaagtacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 10512148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1852010 - 1851743
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | |||||    
T  1852010 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctctataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacattggaattt 1851911  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851910 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 1851811  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1851810 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 1851743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3150654 - 3150387
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||    
T  3150654 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaattt 3150555  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3150554 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 3150455  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  3150454 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcagccaatgattcaaatt 3150387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26321125 - 26320858
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||    
T  26321125 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttttaattaacactgcaattt 26321026  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26321025 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaataatcacactgatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 26320926  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26320925 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggacaatggttcaaatt 26320858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33611190 - 33610923
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  33611190 aaaataaaatatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 33611091  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33611090 gttttgtacctagcatttctcaaatgagatatgaatgacatttctaaaagaaacacggaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 33610991  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33610990 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 33610923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 38934631 - 38934898
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  38934631 aaaataaaacatgctattttcctatagtaagtatttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacattgcaattt 38934730  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934731 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 38934830  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38934831 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtcacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 38934898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3397188 - 3396919
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattta 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||     
T  3397188 aaataaaacatgctattttcctacaataaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttg 3397089  T
Q  114 ttttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtata 213  Q
    |||| || |||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3397088 ttttatatctaacacttctcaaatgagatatcaatgatatttctaaaaggaacacggaaaaaattcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtata 3396989  T
Q  214 agcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-----aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3396988 agtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 3396919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 21030277 - 21030545
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  || |||||||    
T  21030277 aaaatagaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtgcatagatataacttctaattaacactgcaattt 21030376  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctc-aaaaaaggta 211  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21030377 tttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggta 21030476  T
Q  212 taagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21030477 taagtgtcgcttgataacgacaaagagaacaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 21030545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34374430 - 34374166
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatg-cttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  34374430 aaaataaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatggctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatt 34374331  T
Q  112 tattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggta 211  Q
    | |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34374330 tgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaagacggaaaacaatca----catcgacaaacaagctcaaaaaaggta 34374235  T
Q  212 taagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34374234 taagtgtcgcttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 34374166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 4882441 - 4882705
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||    
T  4882441 aaaataaaacatactcttttcctacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcagttt 4882540  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4882541 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtat 4882640  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4882641 aagtgtcgcgtgataacgacaaagagagcaagttactaaaaatacttcggcggccaatggttcaa 4882705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 27066042 - 27066308
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||| |||    
T  27066042 aaaataaaacatgttcttttcctacaataaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataagttctaattaacactgcagttt 27066141  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27066142 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctc-aaaaaggtat 27066240  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  27066241 aaatgtcgcttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggatcaaatt 27066308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 30689478 - 30689747
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  || |||||    
T  30689478 aaaataaaacatgttattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtgcatatatatataacttctaattaacactgcaat 30689577  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689578 ttgttttgtacctagcacttgtcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacagaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 30689677  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30689678 ataagtgtcgcttgataacggcagagagagcaagttacaaaaaatacttaggcgaccaatggttcaaatt 30689747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 17996734 - 17997004
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  17996734 aaaataaagcatgctcttttcctacagtaaatctatttaatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 17996833  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17996834 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgatatttctaaaaggaacacgggaaataatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 17996933  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt-----acaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17996934 aagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttattacaaaaaatacttaggctgccaatggttcaaatt 17997004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 20758115 - 20758381
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  20758115 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 20758214  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758215 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacgg-aaacaatcatactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 20758313  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  20758314 aagtttcacttgataacggcaaagagagcagattacaaaaaatacttaggcagccaattgttcaaatt 20758381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 19448172 - 19448384
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  19448172 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatttttataatattttgataaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattaacactgcaattt 19448271  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19448272 gttttgtacctagcacttatcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaataggtat 19448371  T
Q  213 aagcgtcgcttga 225  Q
    ||| |||||||||    
T  19448372 aagtgtcgcttga 19448384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35539969 - 35539706
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  35539969 aaaataaaacatgttcttttcttacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 35539870  T
Q  113 attttgtacctagaa---cttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaagg 209  Q
     |||||||||||  |   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35539869 gttttgtacctactaacacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaagg 35539770  T
Q  210 tataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtta-caaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||  |||||||      |||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35539769 tataaatgtcgctt------ggcaaagagagccagttataaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 35539706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 20350091 - 20350370
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta------------acttctaatta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||            |||||||||||    
T  20350091 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaatgtatatatatatatatatatatataacttctaatta 20350190  T
Q  101 gtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagct 200  Q
      || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  20350191 acactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcaagcacaaacaagct 20350290  T
Q  201 caaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  20350291 caaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagcgatcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaacggttcaaatt 20350370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33706829 - 33706560
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac----atatatgtaacttctaattagtaccgca 108  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    |||||| |||| ||||||||  || |||    
T  33706829 aaaatagaacatgttcttttcccacaacaaatctttataatgctttggtaaaatttttagaaatgtacttatatatatataacatctaattaacactgca 33706730  T
Q  109 atttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaa-tcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaa 207  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33706729 atttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaa 33706630  T
Q  208 ggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  33706629 ggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatgattcaa 33706560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20995878 - 20995680
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20995878 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatca 20995779  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20995778 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacgaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 20995680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 33930061 - 33930247
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33930061 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 33930160  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33930161 cgctcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 33930247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 41781089 - 41781274
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||| ||  || ||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781089 atatatataacatctaactaacactgcaatttgttttgtacctatcacttttcaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 41781188  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtta--caaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||          |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41781189 cactcatcgactaacaagct-aaaaaaggtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttatgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 41781274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20995994 - 20995921
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20995994 aaaatagaacatgctctttttctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatat 20995921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 41780997 - 41781070
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  41780997 aaaatagaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatatatatat 41781070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 9702421 - 9702493
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9702421 aaaatagaatatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 9702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3210250 - 3210178
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3210250 aaaatagaacgtgctcttttcctacatcaaatcttcataatgctttggtaaatgtttttgaaatatacatata 3210178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 33929963 - 33930036
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  33929963 aaaatagaccatgttcttttcctccagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatatatatat 33930036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 31295724 - 31295680
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctt 57  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  31295724 aaaatagaacatgctctttttctacagcagatctttataatgctt 31295680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14078870 - 14078603
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  14078870 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 14078771  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078770 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 14078671  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14078670 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 14078603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6477533 - 6477266
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  6477533 aaaataaaacatgctcttttcctacaataaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 6477434  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6477433 gttttatacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtac 6477334  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6477333 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagtaatttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 6477266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33424299 - 33424032
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  33424299 aaaataaaacatgctattttcctacaataaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaccgcaattt 33424200  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33424199 gttttgtagctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 33424100  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33424099 aagtgtcacttgataacggcaaagagagcaaattacaaaaaatacttaggcagccaatggttcaaatt 33424032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 44599649 - 44599916
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  44599649 aaaataaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 44599748  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599749 gttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaagacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 44599848  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44599849 aagtgtcgcttgataacggcaaaaagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 44599916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 27273180 - 27273447
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  27273180 aaaataaaacatgttattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 27273279  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27273280 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactaatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 27273379  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  27273380 aagtgtcacttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaaaacttaggcggccaatggtttaaatt 27273447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 30826402 - 30826669
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  30826402 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttgataaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 30826501  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30826502 gttttgtacctatcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaataggaacacggaaaacaatcacactcatcggcaaacaagctcaaaaaaggtat 30826601  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  30826602 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 30826669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 38962116 - 38962383
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  38962116 aaaataaaacatgctcttttcctgcagtaaatctttataatgatttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 38962215  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38962216 tttttgtacctatcacttctcaaatgagatatcaatgacatttataaaaggaacacggaaaacaatcacactaatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 38962315  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38962316 aagtgtcgtttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 38962383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 38992460 - 38992727
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  38992460 aaaataaaacatgctcttttcctgcagtaaatctttataatgatttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 38992559  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38992560 tttttgtacctatcacttctcaaatgagatatcaatgacatttataaaaggaacacggaaaacaatcacactaatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 38992659  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38992660 aagtgtcgtttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 38992727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 38993630 - 38993899
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  38993630 aaaataaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 38993729  T
Q  113 -attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgaca-tttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
      |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38993730 gtttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacattttttaaaaggaagacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 38993829  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38993830 ataagtgtcgcttgataacggcaaaaagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 38993899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42810977 - 42810706
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  42810977 aaaataaaacatgctcttttcctacattaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacagtgcaattt 42810878  T
Q  113 attttgta--cctaga--acttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaag 208  Q
     |||| ||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42810877 tttttttatacctatagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaag 42810778  T
Q  209 gtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42810777 gtataagtgtcgcttgataacgaaaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 42810706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23522697 - 23522430
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||   || |||||||    
T  23522697 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttttaattgacactgcaattt 23522598  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23522597 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacgggaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaaaaaaggtat 23522498  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23522497 aagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggaaaatggttcaaatt 23522430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Original strand, 41628838 - 41629100
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||    
T  41628838 aaaataaaacatgttgtttttcaacagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgaaattt 41628937  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41628938 gttttgtacctatcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacgctcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 41629037  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaa 276  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41629038 aag-ttcgcttgataatggcaaagagagcaagttacaaaatacttaggcggccaatggttcaaa 41629100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44382841 - 44382576
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  44382841 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaat 44382742  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44382741 ttattttgtacctatcacttcccaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaaca-ggaaaaaaatcacactcatcgacaaataaactcaaaaaaggt 44382643  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  44382642 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacctaggcggtcaatggttcaa 44382576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 41156586 - 41156851
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  41156586 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaat 41156685  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41156686 ttgttttgtacctagcatttcccaaatgagatatcaaggacgtttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcagaaaaggt 41156784  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  41156785 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatgattcaa 41156851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45293608 - 45293348
Alignment:
Q  20 aacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac----atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttatt 115  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||||| ||  || ||||||  ||    
T  45293608 aacatgttcctttcctataacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatatataacatctaactaacactgcaattg-tt 45293510  T
Q  116 ttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataag 215  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45293509 ttgtacctagcacatcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataaa 45293410  T
Q  216 cgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45293409 ggtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 45293348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19395603 - 19395335
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta--acttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||  |  | |||    
T  19395603 aaaataaaacatgctcttttcaaa-agtaaatctttataatgctttgctaaatgttttataaatgtacatatatatataacttctaattaacattgtaat 19395505  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19395504 ttgttttatacctagcacttctccaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaacaagctcaaaaaaggt 19395405  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19395404 ataagtgtcgcttgataacgacaaagagagaaagttacaaaaaatatttaggcggccaatggttcaaatt 19395335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 71 - 278
Target Start/End: Original strand, 9761273 - 9761482
Alignment:
Q  71 agaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgg 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9761273 agaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacga 9761372  T
Q  171 aaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  9761373 aaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaagtataagtgtcgcttgataaagacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaat 9761472  T
Q  269 ggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||    
T  9761473 ggttcaaatt 9761482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 19248055 - 19248326
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac------atatatgtaacttctaattagtaccg 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||      |||||| |||| ||||||||  ||      
T  19248055 aaaatagaacatgttcttttcctacagcaaatcgttataatgttttggtaaatattttgaaaatgtacttatatatatatataacatctaattaacacta 19248154  T
Q  107 caatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19248155 caatttgttttgtccctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctaaaaaa 19248254  T
Q  207 aggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19248255 aggtataagggtcgcttgataacagcaaagagagcaatttacaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 19248326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 19321239 - 19321510
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac------atatatgtaacttctaattagtaccg 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||      |||||| |||| ||||||||  ||      
T  19321239 aaaatagaacatgttcttttcctacagcaaatcgttataatgttttggtaaatattttgaaaatgtacttatatatatatataacatctaattaacacta 19321338  T
Q  107 caatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19321339 caatttgttttgtccctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcatactcatcgacaaacaagctaaaaaa 19321438  T
Q  207 aggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19321439 aggtataagggtcgcttgataacagcaaagagagcaatttacaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 19321510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 3751075 - 3751325
Alignment:
Q  29 ttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctaga 126  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||||||  || ||||||| |||||||||||      
T  3751075 ttttccttcagcaaatctttataatgctctggtaaatgttttagaaatatacttatatatataatatctaattaacactgcaatttgttttgtacctaac 3751174  T
Q  127 acttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcg-acaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttga 225  Q
    ||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3751175 actttctaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaa-aatcacactcatcggacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttga 3751273  T
Q  226 taacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  3751274 taacggcaaagggagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 3751325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 41977514 - 41977710
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41977514 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacataacacttcccaaatgagatatcaagtacatttctaaaaggaacatggaaaaaaatca 41977613  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  41977614 cactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 41977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 81 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22333047 - 22332887
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||||||||||  || | ||||| |||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22333047 atatatataacttctaattaacactgaaatttgttttatatctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacagaaaacaatca 22332948  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagc 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22332947 cattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagc 22332887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36597934 - 36597808
Alignment:
Q  154 ttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  36597934 ttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagggcaagttacaaaaa 36597835  T
Q  252 atacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  36597834 atacttaggcgggcaatggttcaaatt 36597808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 107 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22946732 - 22946572
Alignment:
Q  107 caatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22946732 caatttgttttgtacctagcactttacaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcaccgacaaacaagctcaaaaa 22946633  T
Q  207 aggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||| ||          ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22946632 aggtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 22946572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 260
Target Start/End: Original strand, 12760493 - 12760612
Alignment:
Q  142 tatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagc 241  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12760493 tatcaaggacatttcgaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagc 12760591  T
Q  242 aagttac--aaaatacttagg 260  Q
    |||||||  ||||||||||||    
T  12760592 aagttacgaaaaatacttagg 12760612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22333161 - 22333088
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333161 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatat 22333088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12250239 - 12250167
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12250239 aaaatagaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 12250167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 39444968 - 39445040
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39444968 aaaatagaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 39445040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23626384 - 23626312
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23626384 aaaatagaacatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 23626312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 12760422 - 12760488
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgta 79  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12760422 aaaataaaacatgttcttttcctacaacaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgta 12760488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22946854 - 22946781
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22946854 aaaatagaacatgctcttttcctccagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatat 22946781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 29433986 - 29434058
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29433986 aaaatagaacatgctattttcttacaacaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 29434058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 41977406 - 41977479
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41977406 aaaatagaacatgttatttttctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatat 41977479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 39204578 - 39204650
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39204578 aaaatagaacgtgctcttttcctacatcaaatcttcataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacgtata 39204650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16668838 - 16668793
Alignment:
Q  41 aaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16668838 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatat 16668793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 36597982 - 36597929
Alignment:
Q  44 tctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaa 97  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36597982 tctttataatgctttggtaaatgattaagaaatgtacatatatataacttctaa 36597929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50771299 - 50771032
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  50771299 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 50771200  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50771199 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtat 50771100  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50771099 aagtgtcatttgataatggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 50771032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 35087890 - 35087623
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  35087890 aaaataaaacatgttattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 35087791  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087790 gttttgtacctatcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 35087691  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35087690 aagtgtcgcttgaaaacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 35087623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6104179 - 6103912
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||    
T  6104179 aaaataaaacatgctattttcctatagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactccaattt 6104080  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6104079 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcactaacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 6103980  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6103979 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 6103912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 49113268 - 49113534
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  49113268 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctt-ggtaaatattttaggaatgtacatatatataacttctaattaacagtgcaattt 49113366  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49113367 attttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcgtcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 49113466  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49113467 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 49113534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 16341857 - 16342126
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  16341857 aaaataaaacatgctattttcctacagcaaatctttataatgcttttgtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 16341956  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatat--caatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
     |||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16341957 gttttgtacctagcacttttcaaatgagatatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 16342056  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16342057 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagaaccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 16342126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 32755718 - 32755983
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||    
T  32755718 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatat--aacttctaattaacactgcaattt 32755815  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755816 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaacgacatttttaaaaggaatacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 32755915  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32755916 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 32755983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 48976886 - 48977153
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  48976886 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatttttataatgctttggtaaatgttttataaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 48976985  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  48976986 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaatgaactcggaaaacaatcacaccaatcgacaaataagctcaaaaaaggtat 48977085  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48977086 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 48977153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52853496 - 52853229
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||  | |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||    
T  52853496 aaaataaaacataatattttcctacggtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataagttctaattaacactgcaattt 52853397  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52853396 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatattaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 52853297  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  52853296 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatagttaggcgatcaatggttcaaatt 52853229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31369063 - 31368801
Alignment:
Q  18 aaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttatttt 117  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  31369063 aaaacatgttattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgtttt 31368964  T
Q  118 gtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcg 217  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31368963 gtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcatactcattgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtg 31368864  T
Q  218 tcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31368863 tcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatagttcaaatt 31368801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 269
Target Start/End: Original strand, 54512982 - 54513243
Alignment:
Q  10 aagaaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  |  ||||    
T  54512982 aagaaaaaaaaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatactttggtaaatgttttagaaatgtacgtatatataacatctaattaaaattgcaa 54513081  T
Q  110 tttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaagg 209  Q
    ||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54513082 tttgttttgtacctaacacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaagg 54513181  T
Q  210 tataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  54513182 tataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatg 54513243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 262
Target Start/End: Original strand, 51248551 - 51248802
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  51248551 aaaataaaacatgctcttttcctacagtgaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 51248650  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  51248651 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacggaaaacaatcacattcatcgacaaataagctctaaaaatgtat 51248750  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcg 262  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  51248751 aaatgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttataaaaaatacttaggcg 51248802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 52462978 - 52462719
Alignment:
Q  20 aacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttatttt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||| || ||||||| ||||    
T  52462978 aacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatccaattagcactgcaatttgtttt 52462879  T
Q  118 gtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcg 217  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||  |    
T  52462878 gtacctagcacttcccaaattagatatcaaggacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacaatcgtcagcaaacaagctcaaaaaaggtataactg 52462779  T
Q  218 tcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  52462778 tcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 52462719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 55294831 - 55294568
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||  ||||||    
T  55294831 aaaataaaacatgttcttttcctacaacaaatctttata-tgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatataacatctaattaacactacaattt 55294733  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55294732 gttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaattcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtat 55294633  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  55294632 aagtgtcacttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 55294568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21699621 - 21699409
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||   ||    
T  21699621 aaaataaaacatgctcttttcctatagtaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgc---tt 21699525  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21699524 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacttttctaaaaggaacacggaaaacaatcacacgcattgacaaacaagctcaaaaaaggtat 21699425  T
Q  213 aagcgtcgcttgataa 228  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21699424 aagtgtcgcttgataa 21699409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 50741554 - 50741842
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatg----------------------tacatatatgtaa 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||                      || |||||| |||    
T  50741554 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtatatatatatatatatatatatatatatatataa 50741653  T
Q  91 cttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcga 190  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50741654 cttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttatcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcca 50741753  T
Q  191 caaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50741754 caaacaaactc-aaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaatt 50741842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11598015 - 11597748
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||  ||||||||  |  |||||    
T  11598015 aaaatagaacatgttcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagtaatgtacttatatatataatatctaattaacagtgcaat 11597916  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa--ag 208  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |     
T  11597915 ttgttttgtacctagaacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgaaaaacaaactcaaaaaatat 11597817  T
Q  209 gtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  11597816 gtataagtttcgcttgataacggcaatgagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatgattcaa 11597748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48521074 - 48520828
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaat-gtac-atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  48521074 aaaatagaagatgttcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaattgtactatatatataacatctaattaacactgcaat 48520975  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||  ||||| ||| |||                    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48520974 ttgttttgtacctaacacttcccaagtaa--------------------aaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 48520895  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||    
T  48520894 ataagtgtcgcttaataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaagcggtcaatggttcaa 48520828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 275
Target Start/End: Original strand, 54934151 - 54934272
Alignment:
Q  146 aatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          | |||||||||||||||    
T  54934151 aatgacatttctaaaaggaacacagaaaaaaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgt----------cagcaaagagagcaagt 54934240  T
Q  246 tac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54934241 tacgaaaaatacttaggcgaccaatggttcaa 54934272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 16496093 - 16496164
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16496093 aaatagaacatgctattttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 16496164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 40827087 - 40827021
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgta 79  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40827087 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatgtttataatgctttggtaaatgttttagaaatgta 40827021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40824526 - 40824458
Alignment:
Q  209 gtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40824526 gtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 40824458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 11383314 - 11383386
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11383314 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaagctttataatgctttggtaaatattttagaatggtacatata 11383386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 8242891 - 8242957
Alignment:
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8242891 ataagtgtcgcttgataacgtcaaagagagcaagttaccaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 8242957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18742103 - 18742013
Alignment:
Q  191 caaacaagctcaaaaaa-ggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaa--gtt-acaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18742103 caaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagaga-caatggttcaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 18742013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 54793016 - 54792945
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    ||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||    
T  54793016 aaatagaacatgttcttttcctacggtaaatctttataatgctttgataaatgctttcgaaatgtacatata 54792945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 18814430 - 18814697
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  18814430 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 18814529  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814530 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 18814629  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18814630 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 18814697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 34687798 - 34688065
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  34687798 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 34687897  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34687898 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 34687997  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34687998 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 34688065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 31619900 - 31620167
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  31619900 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 31619999  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31620000 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 31620099  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31620100 aagtgtcgcttgatagcggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 31620167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 34692326 - 34692593
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  34692326 aaaataaaatatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaatgcaattt 34692425  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34692426 gttttgtacctagcacttcttaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcaacaaacaagctcaaaaaaggtat 34692525  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34692526 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatagttcaaatt 34692593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41830089 - 41829822
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||    
T  41830089 aaaataaaacatgctattttcctacggtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaattt 41829990  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41829989 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacattcatcgacaaacaagctcaaaaaagatat 41829890  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt--acaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41829889 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttaaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 41829822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41962968 - 41962701
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  41962968 aaaatgaaacatgttattttcctacagtaaatctttacgatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 41962869  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41962868 gttttgtacctagcacttctaaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 41962769  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  41962768 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggtcaatggtttaaatt 41962701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 44406571 - 44406838
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  44406571 aaaataaaacatgatcttttcctacagtagatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacaatgcaattt 44406670  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44406671 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgtcatttctaaaaggaacacgggaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 44406770  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44406771 aagtttcacttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 44406838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 52521620 - 52521390
Alignment:
Q  50 taatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatg 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52521620 taatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatg 52521521  T
Q  150 acatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac- 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52521520 acatttctaaaaggaacacggaaaacaattacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttaca 52521421  T
Q  249 -aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
     |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  52521420 aaaaatacttaggcagccaatgtttcaaatt 52521390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 48340540 - 48340806
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | ||||| |    
T  48340540 aaaataaaacaagctcttttcctacaacaaatctttatgatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacatctaattaaccctgcaatat 48340639  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| |||||  |||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48340640 gttttgtacctagcacttcctaaatgatatatcaaagacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 48340739  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt--acaaaatacttaggcgcccaatggttcaaat 277  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48340740 aaatgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttaaaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaat 48340806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 47135606 - 47135876
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac------atatatgtaacttctaattagtaccg 106  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||      |||||| |||| ||||||||  ||      
T  47135606 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatatatataacatctaattaacacaa 47135705  T
Q  107 caatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47135706 caatttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaaaaatcaaactcatcgacaaacaaactcaaaaa 47135805  T
Q  207 aggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  47135806 aggtataagtgtcgcttgataacggcaaagatagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 47135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38845179 - 38844980
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||||||||||  |  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38845179 atatatataacttctaattaacaatgcaatttgttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacgatca 38845080  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38845079 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcacagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 38844980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 52310045 - 52310310
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || ||| |    
T  52310045 aaaatagaacatgttctttttctacaacaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcagt 52310144  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52310145 ttgttt-gtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaaatcaaaaaaggt 52310243  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||    
T  52310244 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaattgttcaa 52310310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 51965772 - 51965507
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||  ||  ||||    
T  51965772 aaaatagaacatgttcttttgctacaacagatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacttatatatataacatctaattaacactacaat 51965673  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  51965672 ttgttttgtacgtagcacttcccaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacatggaaaa-aatcacactcatcaacaaacaaactcaagaaaggt 51965574  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||||    
T  51965573 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttacgcggtcaatgattcaa 51965507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17671667 - 17671878
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtaca----tatatgtaacttctaattagtaccgca 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||  ||  ||    
T  17671667 aaaatagaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacacatatatatataacatctaattaacacaaca 17671766  T
Q  109 atttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaag 208  Q
    |||| |||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17671767 atttgttttgtacctaacactttccaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacagaaaacaatcacacttatcgacaaacaagctcaaaaaag 17671866  T
Q  209 gtataagcgtcg 220  Q
    ||||||| ||||    
T  17671867 gtataagtgtcg 17671878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 50561252 - 50561524
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac----------atatatgtaacttctaattagt 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||          |||||| |||| ||||||||      
T  50561252 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaatgtacttatatatatatatatataacatctaattaac 50561351  T
Q  103 accgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctca 202  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||     
T  50561352 actgcaatttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaatagggaaaaaaatcacactcatcgacaaa-aaactc- 50561449  T
Q  203 aaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  50561450 aaaaaggtataagtgtcgcttgataactgcaaagagagtaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 50561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 36682328 - 36682514
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36682328 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacattgctaaaaggaacacggaaaacaatca 36682427  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36682428 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 36682514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 45005059 - 45005245
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45005059 atatatataacatctaattaacaccgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacattgctaaaaggaacacggaaaacaatca 45005158  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||          ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45005159 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 45005245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 101 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12245833 - 12245666
Alignment:
Q  101 gtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagct 200  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12245833 gtactgcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaaact 12245734  T
Q  201 caaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||||| ||          ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12245733 caaaaaaggtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 12245666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10694747 - 10694599
Alignment:
Q  129 ttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataa 228  Q
    |||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10694747 ttctcaaacaaggtgtcaagaacaattctaaaaggaaggtgcaaaacaatcacactcatcgacaagcaaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataa 10694648  T
Q  229 cggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10694647 cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 10694599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16031525 - 16031372
Alignment:
Q  114 ttttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtata 213  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16031525 ttttgtacctagcactttccaaattagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggtaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcgaaaaaggtata 16031426  T
Q  214 agcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    || ||          ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||    
T  16031425 agtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatgattcaa 16031372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 45004943 - 45005016
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  45004943 aaaatagaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttgataaatgttttagaaatatatatatat 45005016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 28631523 - 28631595
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28631523 aaaatagaatatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 28631595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 12714689 - 12714760
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12714689 aaatagaacatgttcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttataaatgtacatata 12714760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13662444 - 13662373
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662444 aaatagaacatgctattttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 13662373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28565754 - 28565683
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28565754 aaatagaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgatttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 28565683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38845287 - 38845214
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  38845287 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatattttaaaaatgtatatatat 38845214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17709701 - 17709621
Alignment:
Q  114 ttttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaa 194  Q
    |||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17709701 ttttgttcccagcacttcccaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaacatgaaaaacaatcacactcatcgacaaa 17709621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 16031643 - 16031570
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16031643 aaaatagaacatgttcttttcctacagcaaatctctataatgttttggtaaatgttttagaaatgtatatatat 16031570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Original strand, 36681454 - 36681512
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgtttta 71  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36681454 aaaatagaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgctttgataaatgtttta 36681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 12245880 - 12245831
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggta 62  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12245880 aaaatagaacatgctcttttcctccaacaaatctttataatgctttggta 12245831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 24294740 - 24294784
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctt 57  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24294740 aaaatagaacatgctctttttctacagcaaatctttataatgctt 24294784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 39760189 - 39760145
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctt 57  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39760189 aaaatagaacatgctctttttctacagcaaatctttataatgctt 39760145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26412 - 26145
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  26412 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 26313  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26312 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 26213  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26212 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 26145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 10131 - 10398
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  10131 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatatacatatatataacttctaattaacactgcaattt 10230  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10231 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 10330  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10331 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 10398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 11500066 - 11500333
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  11500066 aaaataaaatatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 11500165  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500166 gttttgtatctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 11500265  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11500266 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtaacaaaaaatacttaggcggctaatggttcaaatt 11500333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 14309060 - 14309327
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  14309060 aaaataaaacatgctattttcctacggtaaatctttacaatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 14309159  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309160 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 14309259  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14309260 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcagtcaatggttcaaatt 14309327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 17469939 - 17470205
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  17469939 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 17470038  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17470039 tttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacgg-aaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 17470137  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17470138 aagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 17470205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17583275 - 17583009
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||    
T  17583275 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttataatgctttggtaattgttttagaaatgtacatatatataacttctaattgacactgcaattt 17583176  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17583175 tttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaatacgg-aaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 17583077  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||  || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17583076 aagtttcacttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 17583009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8925960 - 8925699
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  8925960 aaaataaaacatgctattttcctacaataaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 8925861  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||    
T  8925860 gttttgtacctagcatttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcg------aagttcaaaaaaggtat 8925767  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8925766 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 8925699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23766495 - 23766228
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  23766495 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 23766396  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23766395 gttttgtacctaacacttctcaaatgagatatcaatgacattttgaaaaggaacacggaaaataatcacactcatcgactaacaagctcaaaaaatgtat 23766296  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23766295 aattgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggtggccaatggttcaaatt 23766228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 41 - 278
Target Start/End: Original strand, 5962931 - 5963170
Alignment:
Q  41 aaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataag 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||    
T  5962931 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttgtaattaacactgcaatttgttttatacctagcaattctcaaatgag 5963030  T
Q  141 atatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagag 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5963031 atatcaatgacatttctaaagggaacacggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagagtcgcttgataacgacaaagagag 5963130  T
Q  241 caagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5963131 caagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 5963170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33638732 - 33638466
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  ||  ||||    
T  33638732 aaaatagaacatgttcttttcccacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacacttcaat 33638633  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33638632 ttgttttgtacctagaacttcccaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 33638533  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  33638532 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 33638466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 17482538 - 17482822
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta----------------acttcta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||                |||||||    
T  17482538 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatatatatatatatatatataacttcta 17482637  T
Q  97 attagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaaca 196  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17482638 attaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaaca 17482737  T
Q  197 agctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17482738 agctcaaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaatt 17482822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17570676 - 17570392
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta----------------acttcta 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||                |||||||    
T  17570676 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatatatatatatatatatataacttcta 17570577  T
Q  97 attagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaaca 196  Q
    ||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17570576 attaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatccacaaaca 17570477  T
Q  197 agctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17570476 agctcaaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaatt 17570392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 278
Target Start/End: Original strand, 42687787 - 42688026
Alignment:
Q  41 aaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataag 140  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||    
T  42687787 aaatatttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttttataaatagcacttctcaaatgag 42687886  T
Q  141 atatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagag 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  42687887 atatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaataagctctaaaaaggtatgagtgtcgcttgataatgacaaagagag 42687986  T
Q  241 caagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42687987 caagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 42688026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27735105 - 27734840
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||  |  |||||    
T  27735105 aaaataaaacatgttcttttcctacaacaaatctttata-tgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctgattaacaatgcaat 27735007  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27735006 ttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaattcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 27734907  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  27734906 ataagtgtcacttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaacggttcaa 27734840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 9149569 - 9149818
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || | |||    
T  9149569 aaaatagaacatgttcttttcctataacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgaaat 9149668  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9149669 ttgtgttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 9149767  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttag 259  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9149768 ataagtgtcgcttgataacgataaagagagcaagttacgaaaaatacttag 9149818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42827403 - 42827196
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  || |||||||    
T  42827403 aaaatagaacatgctcttttcctacaacaaatttttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtatatatatataacgtctaattaacactgcaattt 42827304  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42827303 gttttgtacctatcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcgtcgataaacaagctcaaaaaaggtat 42827204  T
Q  213 aagcgtcg 220  Q
    ||| ||||    
T  42827203 aagtgtcg 42827196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 17478187 - 17478387
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478187 atatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 17478286  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaaat 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17478287 cactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaat 17478386  T
Q  278 t 278  Q
    |    
T  17478387 t 17478387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17575027 - 17574827
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575027 atatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 17574928  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac---aaaatacttaggcgcccaatggttcaaat 277  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17574927 cactcatccacaaacaagctcaaaaaaggtatgagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaaat 17574828  T
Q  278 t 278  Q
    |    
T  17574827 t 17574827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23299779 - 23299514
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||  || |||||    
T  23299779 aaaatagaacatgttcttttcctacaggaaatatttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatcaaattaacactgcaat 23299680  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  23299679 ttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaa-aatcacactcatcaacatacaaactcaaaaaaggt 23299581  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23299580 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagaaagttacgaaaaatactttggcggtcaatggttcaa 23299514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 47174660 - 47174934
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtaca----------tatatgtaacttctaattagt 102  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||          ||||| |||| ||||||||      
T  47174660 aaaatagaacattctctttttctacagtaagtctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacacacacacatatatatataacatctaattaac 47174759  T
Q  103 accgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctca 202  Q
    || ||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47174760 actgcaatttgttttgtacctaacacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaatggaacacggaaaacaatcacactcatcgagaaacaagctca 47174859  T
Q  203 aaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtta--caaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47174860 gaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttaagaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 47174934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 19521426 - 19521624
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19521426 atatatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatca 19521525  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19521526 cattcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgtttgataatcgcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggcc-atggttcaaatt 19521624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Original strand, 33031135 - 33031334
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031135 atatatataacttctaattaacagtgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 33031234  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||| ||||||||    
T  33031235 cactcaacgacaaacatgctcaaaaaaagtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagcaagttacaaaaaaaacttaggcggtcaatgattcaaatt 33031334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41262396 - 41262184
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||| |    
T  41262396 aaaataaaatatgttcttttcctacggtaaatctttataatgttttggtaaatattttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactacaatgt 41262297  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41262296 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacattt---aaagaaagacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagcgcaaaaaaggtat 41262200  T
Q  213 aagcgtcgcttgataa 228  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  41262199 aagtgtctcttgataa 41262184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 42918136 - 42918334
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42918136 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacatcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacatgaaaaacaatca 42918235  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctc-aaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt---acaaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  42918236 tactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggtataagggtcgcttgataacggcaaagggagcaagttatgaaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 42918334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 17478095 - 17478168
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478095 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatat 17478168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17575119 - 17575046
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575119 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatat 17575046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4481443 - 4481371
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4481443 aaaatagaacatgctcttttccaacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 4481371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 42996655 - 42996727
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  42996655 aaaatagaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtaaatata 42996727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Original strand, 33031006 - 33031076
Alignment:
Q  16 ataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33031006 ataaatcatgctcttttcctacaacaaatctttataatgttttgataaatgttttagaaatgtacatatat 33031076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 38434606 - 38434534
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38434606 aaaatagaacatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttatagaaatgtacatata 38434534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42244912 - 42244840
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42244912 aaaatagaacatgctcttttcctacaataaatttttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatata 42244840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 42918030 - 42918103
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  42918030 aaaatagaacatgttcttttactacaacaaatctttataatgctttggtaaatcttttagtaatgtacttatat 42918103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 19521332 - 19521405
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||||||    
T  19521332 aaaataaaacatgctcttttcctatagtaaatctttataatgctttgggaaatgttttataaatatatatatat 19521405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 26821858 - 26822125
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  26821858 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 26821957  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26821958 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtat 26822057  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26822058 aagtgtcatttgataatggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 26822125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 33907466 - 33907737
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta----acttctaattagtaccgca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||  || |||    
T  33907466 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatatatataacttctaattaacactgca 33907565  T
Q  109 atttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaag 208  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33907566 atttgttttgtacctagaacttttcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaag 33907665  T
Q  209 gtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33907666 gtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 33907737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16724403 - 16724136
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  16724403 aaaataaaacatgctattttcctacagtaaatccttacaatcctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 16724304  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16724303 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaataatcacactcatcgactaacaagctcaaaaaatgtat 16724204  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16724203 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 16724136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 26827738 - 26828005
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||    
T  26827738 aaaataaaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacattgcaattt 26827837  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26827838 gttttgtacctaacacttttcaaatgagatatcaataacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacacccatcgacacgcaagctcaaaaaaggtat 26827937  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26827938 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 26828005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45205072 - 45204805
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||    
T  45205072 aaaataaaacaagctcttttcctacaacaaatctttatgatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacatctaattaacactgcaattt 45204973  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45204972 gttttgtacctaacacttcccaaatgatatatcaaagacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 45204873  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45204872 aagtgtcgcttgataaggacaaaaagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatagttcaaatt 45204805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 42885614 - 42885879
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  || |||||||    
T  42885614 aaaataaaacatgctcttttcctacagtaaatctttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtaaatatat--aacttctgattaacactgcaattt 42885711  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42885712 gttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacataaaacaatcacactcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtat 42885811  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42885812 aagtgtcgcttgataacagcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatgattcaaatt 42885879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Original strand, 11706851 - 11707120
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||    
T  11706851 aaaataaaacatgctcttttcatacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgtaattt 11706950  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctc-aaaaaaggta 211  Q
     |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11706951 gttttgtacctatcacttttcaaatgagatatcaatgaaatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggta 11707050  T
Q  212 taagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt---acaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11707051 taagtgtcgtttgataacggcaaagagagtcagttataaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 11707120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30570604 - 30570335
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttc-ctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||    
T  30570604 aaaataatacatgctcttttttctacagtaaatctttataatgcttcggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaatttacactgcaatt 30570505  T
Q  112 tattttg-tacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30570504 tttttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 30570405  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
     |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30570404 ttaagtgttgcttgataacgataaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatagttcaaatt 30570335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18092776 - 18092510
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  18092776 aaaataaaacatgttcttttcctacaacaaatctttataatgatttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacacagcaat 18092677  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18092676 ttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaaaagagaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 18092577  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  18092576 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagaacaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 18092510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33663848 - 33663612
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |  | |||||    
T  33663848 aaaataaaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttttaattaacattgtaattt 33663749  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33663748 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacatggaaaacaatcacaatcatcgacaaacaagcttaaaaaaggtat 33663649  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaa 252  Q
     ||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33663648 gag---cgcttgataacgacaaaaagagcaagttacaaaa 33663612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 21097937 - 21098153
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||    
T  21097937 aaaataaaacatgctattttcctacaataaatatttacaatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttttaattaacactgcaattt 21098036  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098037 gttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaagaaacacagaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 21098136  T
Q  213 aagcgtcgcttgataac 229  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  21098137 aagtgtcgtttgataac 21098153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 30572484 - 30572285
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttc-ctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatt 111  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||    
T  30572484 aaaataatacatgctcttttttctacagtaaatctttataatgcttcggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaatttacactgcaatt 30572385  T
Q  112 tattttg-tacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30572384 tttttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 30572285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36633036 - 36632837
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36633036 atatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcgatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatca 36632937  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaa-aaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac-aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36632936 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagatagcaagttacgaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 36632837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1515044 - 1514775
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcc-tacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac----atatatgtaacttctaattagtaccgc 107  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||||||||  ||  |    
T  1515044 aaaatagaacatgttcttttccctacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatatttaacatctaattaacactac 1514945  T
Q  108 aatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaa 207  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1514944 aatttgttttgtacctattacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacggggaaaaatatcacactcatctacaaacaaactcaaaaaa 1514845  T
Q  208 ggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtta--caaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  1514844 ggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttatgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 1514775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 4811785 - 4812002
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgta----------acttctaattagt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||          || ||||||||      
T  4811785 aaaatagaacatgctcttttcctacaacaaatctttataacgctttggtaaatgttgtagaaatgtatatatatatatatatatataacatctaattaac 4811884  T
Q  103 accgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctca 202  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4811885 accgcaatttgttttgtacctaccactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctca 4811984  T
Q  203 aaaaaggtataagcgtcg 220  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  4811985 aaaaaggtataagtgtcg 4812002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19126598 - 19126470
Alignment:
Q  152 atttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--a 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  19126598 atttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaa 19126499  T
Q  250 aaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19126498 aaatacttaggcggccaatggttcaaatt 19126470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35286238 - 35286077
Alignment:
Q  106 gcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaa 205  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35286238 gcaatttgttttgtacctagcactttccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaa 35286139  T
Q  206 aaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    |||||||||| ||          ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  35286138 aaggtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 35286077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 220
Target Start/End: Original strand, 45399129 - 45399242
Alignment:
Q  107 caatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45399129 caatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaaagacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 45399228  T
Q  207 aggtataagcgtcg 220  Q
    ||||||||| ||||    
T  45399229 aggtataagtgtcg 45399242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 35286394 - 35286321
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35286394 aaaatagaacatgctcttttcctccagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatat 35286321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 17025830 - 17025902
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17025830 aaaatagaacatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttctagaaatgtacatata 17025902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 17037507 - 17037579
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17037507 aaaatagaacatgctcttttcccacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttctagaaatgtacatata 17037579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 17092015 - 17092087
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17092015 aaaatagaacatgctcttttcctacatcaaagctttataatgctttggtaaatgttctagaaatgtacatata 17092087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 36633140 - 36633067
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36633140 aaaatagaacatgctctttatctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatat 36633067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Original strand, 45398980 - 45399048
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtaca 81  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  45398980 aaaatagaacatgctcttttactacagcaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaacgtaca 45399048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 28380057 - 28379990
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac 80  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  28380057 aaaatagaacatgctcttttactacagcaaatctttataatgctttggtaaatattttagaaacgtac 28379990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19167695 - 19167654
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatg 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  19167695 aaaataaaacatgctcttttcctacattagatctttataatg 19167654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3471 - 3204
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  3471 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 3372  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3371 gttttatacctagcacttttcaaatgagatatcaatgacatttttaaaaggaacacggaaaacaatcacacttatcgaaaaacaagctcaaaaaaggtat 3272  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3271 aagtgtcgcttgataacggcaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatagttcaaatt 3204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 278
Target Start/End: Original strand, 625 - 888
Alignment:
Q  17 taaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattt 116  Q
    ||||||||| | |||||||||   ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||    
T  625 taaaacatgttattttcctacggtaaatctttacaatgctttgataaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaatttgttt 724  T
Q  117 tgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagc 216  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  725 tgtacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaatgtataagt 824  T
Q  217 gtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  825 gtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49287 - 49020
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaattagtaccgcaattt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  49287 aaaataaaacatgcttttttcatacagcaaacctttataatactttggtaaatgttttagaaatgtacatatatataacttctaattaacactgcaattt 49188  T
Q  113 attttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtat 212  Q
     |||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  49187 gttttgtacctaacacttttcaaatgagatatcaatgatatttctaaaaggaacacagaaaacaatcacactcattgataaacaagctcaaaaaaggtat 49088  T
Q  213 aagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49087 aagtgtcgcttgataacgacaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 49020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10662 - 10430
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  10662 aaaatagaacatgttcttttcctataacaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaat 10563  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10562 ttgttttgtacctagcacttctcaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacagggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 10463  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaa 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10462 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaa 10430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12983 - 12717
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacat--atatgtaacttctaattagtaccgcaat 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||  || |||||    
T  12983 aaaatagaacatgttcttttcctacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttagaaatgtacttgtatatataacatctaattaacactgcaat 12884  T
Q  111 ttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggt 210  Q
    || ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12883 ttgttttgtacccagcacttcccaaatgagatatcaaagacatttgtaaaaggaacatggaaaaaaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggt 12784  T
Q  211 ataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12783 ataagtgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 12717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 817
Alignment:
Q  106 gcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaa 205  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  991 gcaatttgttttatacctagcacttctcaaatgagatatcaatgacatttctaaaaggaacacgaaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctaaaaa 892  T
Q  206 aaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  891 aaggtataagtgtcgtttgataacggcaaagagagcaagttacaaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 275
Target Start/End: Original strand, 194 - 414
Alignment:
Q  59 ggtaaatgttttagaaatgtac--atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttc 156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  194 ggtaaatgttttagaaatgtacttatatatataacatctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttc 293  T
Q  157 taaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaata 254  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  294 taaaaggaacagggaaaataatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaaaggtataggtctcgcttgataacggcaaagagagcaagttacgaaaaata 393  T
Q  255 cttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  394 cttaggcggtcaatggttcaa 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 278
Target Start/End: Original strand, 176734 - 176930
Alignment:
Q  83 atatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcaca 182  Q
    |||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| |||| | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176734 atatataacttctaattaacactgcaatttgttttgtacctagcactttttaaatga-atatcaataacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcaca 176832  T
Q  183 ctcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagt--tacaaaatacttaggcgcccaatggttcaaatt 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  176833 cccatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcttgataacgacaaagagagccagttataaaaaatacttaggcggccaatggttcaaatt 176930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 81 - 275
Target Start/End: Original strand, 120176 - 120372
Alignment:
Q  81 atatatgtaacttctaattagtaccgcaatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatca 180  Q
    |||||| |||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  120176 atatatataacttgtaattaacactgcaatttgttttgtacctagcacttcccaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacagaaaacaatca 120275  T
Q  181 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagtt--acaaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||  |||||||||||    
T  120276 cactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagtgtcgcatgataacgacaaagagagcaagttgagaaaaatacttaggcggtcaatggttcaa 120372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 86
Target Start/End: Original strand, 120102 - 120147
Alignment:
Q  41 aaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  120102 aaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatatatatatat 120147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 107 - 275
Target Start/End: Original strand, 101017 - 101177
Alignment:
Q  107 caatttattttgtacctagaacttctcaaataagatatcaatgacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaagctcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  101017 caatttgttttgtacctagcacttttcaaatgagatatcaaggacatttctaaaaggaacacggaaaacaatcacactcatcgacaaacaaactcaaaaa 101116  T
Q  207 aggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac--aaaatacttaggcgcccaatggttcaa 275  Q
    ||||||||| ||          ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  101117 aggtataagtgt----------cggcaaagagagcaagttacgaaaaatacttaggcggccaatggttcaa 101177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 100802 - 100867
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgt 78  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  100802 aaaatagaacatgctcttttcctacagcaaatctttataatgttttggtaaatgttttaaaaatgt 100867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 53020 - 52948
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53020 aaaatagaacatgctcttttcctacatcaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacatata 52948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 100
Target Start/End: Original strand, 26688 - 26775
Alignment:
Q  13 aaaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatatgtaacttctaatta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26688 aaaataaaacatgctcttttcctacggtaaatctttataatgctttgctaaatattttagaaatgtacatatatataacttctaatta 26775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 152206 - 152135
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatata 85  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  152206 aaatagaacatgctattttcctacagcaaatctttataatgctttggtaaatgttttaaaaatgtacatata 152135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4850 - 4782
Alignment:
Q  179 cacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac 248  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4850 cacactcatcgacaa-caaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttcataacggcaaagagagcaagttac 4782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11299 - 11231
Alignment:
Q  179 cacactcatcgacaaacaagctcaaaaaaggtataagcgtcgcttgataacggcaaagagagcaagttac 248  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11299 cacactcatcgacaa-caaactcaaaaaaggtataagtgtcgcttcataacggcaaagagagcaagttac 11231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 30049 - 29977
Alignment:
Q  14 aaataaaacatgctcttttcctacaacaaatctttataatgcttaggtaaatgttttagaaatgtacatatat 86  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  30049 aaatagaacatgtttttttcctacaggaaatctttataatgctttggtaaatgttttagaaatgtacttatat 29977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University