View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15120_low_3 (Length: 639)

Name: NF15120_low_3
Description: NF15120
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15120_low_3
NF15120_low_3
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (17-415)||(1642420-1642818)
chr1 (84-633)||(38057393-38057942)
chr1 (114-633)||(22349357-22349867)
chr1 (44-558)||(42696561-42697072)
chr1 (231-633)||(38887998-38888402)
chr1 (148-555)||(24726170-24726571)
chr1 (362-634)||(51475774-51476047)
chr1 (438-634)||(1642242-1642445)
chr1 (200-633)||(7052903-7053334)
chr1 (362-633)||(8276973-8277245)
chr1 (84-385)||(8276732-8277034)
chr1 (208-544)||(45754312-45754644)
chr1 (43-385)||(51475986-51476330)
chr1 (448-633)||(41227829-41228022)
chr1 (359-633)||(16059381-16059658)
chr1 (488-633)||(24723757-24723909)
chr1 (423-624)||(20634685-20634894)
chr1 (423-623)||(20587465-20587671)
chr1 (423-623)||(20592003-20592209)
chr1 (114-259)||(19761998-19762141)
chr1 (448-622)||(7322051-7322231)
chr1 (359-522)||(19675580-19675738)
chr1 (422-621)||(28194890-28195097)
chr1 (422-559)||(35982120-35982257)
chr1 (359-522)||(42911878-42912036)
chr1 (438-622)||(51323117-51323310)
chr1 (359-522)||(4596912-4597070)
chr1 (439-595)||(14793526-14793689)
chr1 (423-559)||(19762235-19762372)
chr1 (448-591)||(43542621-43542772)
chr1 (280-513)||(17903997-17904221)
chr1 (422-617)||(20636382-20636585)
chr1 (359-522)||(20241656-20241814)
chr1 (495-622)||(17904231-17904364)
chr1 (74-386)||(13301795-13302109)
chr1 (448-522)||(14238637-14238711)
chr1 (71-188)||(18275122-18275241)
chr1 (61-179)||(19675970-19676092)
chr1 (85-177)||(21046786-21046880)
chr1 (50-188)||(52983352-52983492)
chr1 (165-294)||(11809355-11809483)
chr1 (358-467)||(4596831-4596934)
chr1 (534-623)||(41306112-41306208)
chr1 (426-559)||(43696916-43697050)
chr1 (534-623)||(46383074-46383170)
chr1 (297-377)||(4596808-4596888)
chr1 (422-511)||(41306028-41306117)
chr1 (445-498)||(46383019-46383072)
chr1 (439-539)||(13301689-13301788)
chr1 (279-386)||(23967583-23967689)
chr1 (284-395)||(16381042-16381152)
chr1 (71-188)||(18270468-18270587)
chr1 (531-617)||(43690366-43690459)
chr1 (358-467)||(20241792-20241895)
chr1 (85-154)||(16059051-16059120)
chr1 (297-377)||(19675760-19675840)
chr1 (297-377)||(20241838-20241918)
chr1 (297-377)||(42912059-42912139)
chr1 (85-179)||(4596582-4596678)
chr1 (85-179)||(20587897-20587993)
chr1 (85-179)||(20592435-20592531)
chr1 (445-520)||(21534178-21534253)
chr1 (423-507)||(35088332-35088416)
chr1 (423-474)||(21238642-21238693)
chr1 (423-508)||(21240311-21240393)
chr1 (358-467)||(42912014-42912116)
chr1 (448-507)||(48300720-48300779)
chr1 (358-467)||(16059300-16059403)
chr1 (297-377)||(16059277-16059357)
chr1 (498-622)||(21238511-21238641)
chr1 (200-269)||(23073077-23073146)
chr1 (85-154)||(42912296-42912365)
chr1 (448-520)||(47190375-47190447)
chr1 (448-520)||(52954629-52954701)
chr1 (438-510)||(18120438-18120510)
chr1 (85-179)||(20634372-20634468)
chr1 (61-174)||(21239966-21240081)
chr1 (448-522)||(22118547-22118622)
chr1 (85-165)||(41227441-41227523)
chr1 (448-522)||(50622256-50622331)
chr1 (325-378)||(4596915-4596969)
chr1 (423-492)||(16380970-16381039)
chr1 (448-520)||(20316151-20316224)
chr1 (427-494)||(21043571-21043640)
chr1 (448-492)||(26064703-26064748)
chr1 (325-377)||(42911980-42912033)
chr1 (448-492)||(50686413-50686458)
chr1 (358-467)||(19675716-19675817)
chr1 (280-328)||(19762147-19762195)
chr1 (279-394)||(14800387-14800504)
chr1 (279-394)||(14809261-14809378)
chr1 (202-241)||(22131090-22131129)
chr1 (448-522)||(50614428-50614503)
chr1 (216-293)||(20316470-20316548)
chr1 (455-520)||(23967492-23967558)
chr1 (302-386)||(24720764-24720851)
chr1 (448-507)||(51274672-51274727)
chr1 (325-377)||(16059384-16059437)
chr1 (325-377)||(19675682-19675735)
chr1 (454-494)||(20957952-20957993)
chr1 (92-184)||(21181073-21181166)
chr1 (216-276)||(48300936-48300997)
chr1 (279-344)||(48520243-48520307)
chr1 (220-269)||(51274461-51274510)
chr1 (85-188)||(7792593-7792697)
chr1 (205-241)||(12271441-12271477)
chr1 (74-188)||(18823813-18823929)
chr1 (436-480)||(22825912-22825956)
chr1 (458-510)||(28477878-28477930)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (84-634)||(19386-19939)
[»] chr3 (165 HSPs)
chr3 (84-633)||(14642292-14642841)
chr3 (84-632)||(6158159-6158707)
chr3 (114-631)||(12512591-12513109)
chr3 (260-633)||(42327235-42327610)
chr3 (85-634)||(16728048-16728598)
chr3 (85-633)||(45531358-45531909)
chr3 (61-633)||(19569040-19569612)
chr3 (84-419)||(37037790-37038128)
chr3 (20-415)||(14153140-14153540)
chr3 (362-633)||(14153446-14153718)
chr3 (362-633)||(37037616-37037888)
chr3 (30-415)||(50348786-50349173)
chr3 (43-385)||(20417089-20417432)
chr3 (362-633)||(50349079-50349351)
chr3 (448-633)||(53646974-53647167)
chr3 (426-631)||(12506755-12506966)
chr3 (424-633)||(15017423-15017634)
chr3 (42-513)||(16059115-16059584)
chr3 (423-631)||(41173430-41173646)
chr3 (362-557)||(46751791-46751979)
chr3 (216-421)||(17693056-17693262)
chr3 (448-633)||(22307738-22307931)
chr3 (424-631)||(9644219-9644427)
chr3 (362-559)||(20416959-20417149)
chr3 (423-633)||(14507627-14507845)
chr3 (42-509)||(16044260-16044724)
chr3 (42-513)||(16049732-16050198)
chr3 (84-290)||(14250860-14251062)
chr3 (423-633)||(17043819-17044037)
chr3 (114-264)||(42324994-42325143)
chr3 (249-413)||(10562698-10562863)
chr3 (202-377)||(42353459-42353635)
chr3 (325-543)||(11886774-11886989)
chr3 (256-385)||(46751919-46752049)
chr3 (494-634)||(35065806-35065953)
chr3 (450-544)||(8492584-8492678)
chr3 (445-620)||(12269058-12269242)
chr3 (422-621)||(18440288-18440495)
chr3 (422-621)||(19485362-19485569)
chr3 (202-385)||(37427573-37427757)
chr3 (362-520)||(37427483-37427634)
chr3 (358-522)||(44269437-44269595)
chr3 (494-629)||(11191690-11191831)
chr3 (423-539)||(11191814-11191930)
chr3 (362-522)||(2842522-2842677)
chr3 (426-622)||(6145796-6145998)
chr3 (359-507)||(11258282-11258424)
chr3 (501-629)||(16180138-16180272)
chr3 (562-631)||(19574676-19574745)
chr3 (359-522)||(35353398-35353556)
chr3 (483-626)||(16049582-16049731)
chr3 (359-539)||(35065647-35065823)
chr3 (161-464)||(11886492-11886790)
chr3 (445-522)||(5214760-5214837)
chr3 (486-626)||(16044106-16044252)
chr3 (486-626)||(16058965-16059111)
chr3 (453-621)||(49390141-49390317)
chr3 (440-510)||(17669132-17669202)
chr3 (85-321)||(41173108-41173344)
chr3 (448-522)||(10562516-10562591)
chr3 (428-522)||(14441137-14441232)
chr3 (445-559)||(19574788-19574903)
chr3 (43-241)||(13179297-13179495)
chr3 (358-466)||(2842438-2842540)
chr3 (534-621)||(6469603-6469697)
chr3 (438-538)||(11562403-11562503)
chr3 (85-179)||(35065317-35065413)
chr3 (448-522)||(18700810-18700885)
chr3 (71-188)||(23395786-23395905)
chr3 (448-507)||(31415052-31415111)
chr3 (583-633)||(14251059-14251109)
chr3 (423-505)||(17520081-17520163)
chr3 (423-505)||(17534878-17534960)
chr3 (358-467)||(35065566-35065669)
chr3 (422-519)||(1465851-1465948)
chr3 (534-621)||(28849083-28849177)
chr3 (423-507)||(30175625-30175709)
chr3 (423-507)||(40806853-40806937)
chr3 (423-507)||(40811668-40811752)
chr3 (448-522)||(42353620-42353695)
chr3 (448-522)||(43890120-43890195)
chr3 (453-507)||(5206744-5206798)
chr3 (202-276)||(6805803-6805877)
chr3 (453-522)||(10542960-10543030)
chr3 (429-514)||(15565410-15565496)
chr3 (551-621)||(15977099-15977169)
chr3 (534-621)||(21618062-21618157)
chr3 (534-621)||(36166168-36166263)
chr3 (551-621)||(45578319-45578389)
chr3 (423-513)||(54331456-54331546)
chr3 (85-154)||(2842199-2842268)
chr3 (448-520)||(15245754-15245827)
chr3 (297-480)||(17207055-17207238)
chr3 (483-615)||(17668990-17669128)
chr3 (85-154)||(22307320-22307389)
chr3 (297-377)||(35065543-35065623)
chr3 (302-377)||(2842420-2842495)
chr3 (85-179)||(5206391-5206487)
chr3 (106-345)||(5214922-5215159)
chr3 (85-188)||(13523152-13523256)
chr3 (534-617)||(15076409-15076499)
chr3 (423-507)||(15932565-15932649)
chr3 (358-464)||(11258405-11258505)
chr3 (448-507)||(15448082-15448141)
chr3 (448-507)||(31225039-31225098)
chr3 (76-188)||(3394733-3394847)
chr3 (448-521)||(9577441-9577515)
chr3 (494-595)||(11562311-11562419)
chr3 (500-621)||(17206895-17207022)
chr3 (535-632)||(23431324-23431428)
chr3 (85-154)||(11258713-11258782)
chr3 (85-154)||(14508097-14508166)
chr3 (423-492)||(17538002-17538071)
chr3 (297-377)||(44269538-44269618)
chr3 (85-154)||(44273720-44273789)
chr3 (423-507)||(13031836-13031920)
chr3 (85-188)||(13520522-13520626)
chr3 (325-385)||(17693054-17693114)
chr3 (452-522)||(12377694-12377765)
chr3 (448-506)||(15206686-15206745)
chr3 (91-154)||(15932250-15932313)
chr3 (85-178)||(35353819-35353914)
chr3 (297-421)||(14519331-14519458)
chr3 (85-135)||(17538372-17538422)
chr3 (75-210)||(18367488-18367623)
chr3 (297-377)||(11258448-11258528)
chr3 (448-520)||(15264875-15264948)
chr3 (85-154)||(17693314-17693383)
chr3 (435-515)||(19884584-19884665)
chr3 (452-520)||(32404466-32404534)
chr3 (325-377)||(35065650-35065703)
chr3 (305-377)||(35353580-35353652)
chr3 (358-415)||(35353580-35353637)
chr3 (279-344)||(9577534-9577600)
chr3 (74-188)||(14818231-14818347)
chr3 (439-511)||(17259287-17259359)
chr3 (74-188)||(52213206-52213322)
chr3 (75-188)||(179437-179552)
chr3 (423-466)||(6146000-6146043)
chr3 (85-152)||(19884260-19884327)
chr3 (423-466)||(24545616-24545659)
chr3 (449-522)||(13919101-13919175)
chr3 (256-383)||(15565494-15565619)
chr3 (469-507)||(23413761-23413799)
chr3 (469-507)||(37642588-37642626)
chr3 (469-507)||(45796738-45796776)
chr3 (494-556)||(54331555-54331617)
chr3 (448-492)||(315885-315930)
chr3 (220-269)||(31415334-31415383)
chr3 (85-154)||(40807242-40807311)
chr3 (205-241)||(324121-324157)
chr3 (61-127)||(9511836-9511903)
chr3 (61-127)||(9519811-9519878)
chr3 (302-386)||(11191963-11192049)
chr3 (205-241)||(11914214-11914250)
chr3 (205-241)||(12469787-12469823)
chr3 (205-241)||(14966055-14966091)
chr3 (205-241)||(17046197-17046233)
chr3 (573-617)||(17206799-17206842)
chr3 (71-179)||(17519594-17519706)
chr3 (71-179)||(17534456-17534568)
chr3 (422-474)||(20630530-20630582)
chr3 (448-492)||(43925725-43925769)
chr3 (436-480)||(50756447-50756491)
chr3 (205-241)||(52989920-52989956)
[»] chr8 (106 HSPs)
chr8 (30-633)||(22259051-22259655)
chr8 (114-633)||(42266365-42266885)
chr8 (271-623)||(39695542-39695896)
chr8 (42-559)||(17217424-17217942)
chr8 (114-512)||(25849219-25849603)
chr8 (42-595)||(22244199-22244757)
chr8 (47-559)||(22584437-22584945)
chr8 (147-559)||(23418186-23418575)
chr8 (43-557)||(23888565-23889078)
chr8 (114-355)||(39695301-39695541)
chr8 (297-633)||(20179484-20179823)
chr8 (202-631)||(23669180-23669618)
chr8 (439-632)||(22206940-22207140)
chr8 (202-557)||(13665324-13665673)
chr8 (202-557)||(13724599-13724948)
chr8 (208-514)||(19698951-19699253)
chr8 (42-384)||(17907666-17908012)
chr8 (42-348)||(23947247-23947553)
chr8 (425-625)||(31723824-31724030)
chr8 (453-633)||(19127714-19127902)
chr8 (232-522)||(19929709-19929994)
chr8 (422-560)||(20084626-20084764)
chr8 (423-559)||(23947117-23947253)
chr8 (424-621)||(36728403-36728606)
chr8 (423-557)||(17908007-17908141)
chr8 (448-609)||(5083427-5083596)
chr8 (444-633)||(18302947-18303144)
chr8 (448-632)||(41681761-41681953)
chr8 (422-620)||(20983066-20983272)
chr8 (448-623)||(29763909-29764093)
chr8 (423-543)||(9042-9162)
chr8 (453-617)||(39833463-39833635)
chr8 (448-632)||(21580315-21580510)
chr8 (440-622)||(20025343-20025531)
chr8 (205-377)||(5760434-5760604)
chr8 (71-348)||(20084358-20084633)
chr8 (359-520)||(42818965-42819121)
chr8 (422-511)||(1323518-1323607)
chr8 (446-539)||(2717865-2717958)
chr8 (205-320)||(18302832-18302948)
chr8 (534-623)||(1323602-1323698)
chr8 (534-623)||(38550510-38550606)
chr8 (427-522)||(5760256-5760352)
chr8 (279-520)||(22253310-22253548)
chr8 (531-621)||(26219340-26219437)
chr8 (531-621)||(26225733-26225830)
chr8 (534-623)||(13428567-13428663)
chr8 (538-623)||(27472811-27472903)
chr8 (422-511)||(13428483-13428572)
chr8 (279-520)||(22381877-22382117)
chr8 (494-621)||(2717941-2718074)
chr8 (534-621)||(20046624-20046718)
chr8 (85-175)||(20179258-20179350)
chr8 (423-507)||(24713078-24713162)
chr8 (422-498)||(38550432-38550508)
chr8 (448-522)||(22525293-22525368)
chr8 (560-622)||(22319173-22319234)
chr8 (358-463)||(42818884-42818983)
chr8 (297-377)||(42818861-42818941)
chr8 (434-510)||(21513183-21513259)
chr8 (302-386)||(45471427-45471513)
chr8 (448-522)||(20502412-20502487)
chr8 (456-507)||(23944271-23944322)
chr8 (445-511)||(27472752-27472818)
chr8 (453-507)||(33587132-33587186)
chr8 (85-177)||(42818644-42818738)
chr8 (501-621)||(18820199-18820325)
chr8 (85-154)||(19140011-19140080)
chr8 (85-154)||(39936747-39936816)
chr8 (494-621)||(4381945-4382082)
chr8 (423-494)||(6102752-6102823)
chr8 (448-515)||(17086462-17086529)
chr8 (432-520)||(18833172-18833260)
chr8 (449-496)||(19155199-19155247)
chr8 (448-522)||(16799220-16799294)
chr8 (423-510)||(18820093-18820180)
chr8 (448-522)||(28397284-28397359)
chr8 (439-510)||(38988199-38988270)
chr8 (439-510)||(39019296-39019367)
chr8 (448-507)||(39937146-39937205)
chr8 (453-507)||(18760287-18760341)
chr8 (205-377)||(18833314-18833485)
chr8 (97-188)||(20454446-20454538)
chr8 (435-507)||(22319058-22319130)
chr8 (439-491)||(45471560-45471612)
chr8 (602-633)||(9017-9048)
chr8 (448-522)||(17439817-17439892)
chr8 (424-467)||(18820011-18820054)
chr8 (448-522)||(22963723-22963798)
chr8 (452-522)||(22984019-22984090)
chr8 (448-522)||(22995577-22995652)
chr8 (448-522)||(24352756-24352831)
chr8 (449-491)||(35027128-35027171)
chr8 (302-386)||(4381736-4381824)
chr8 (302-386)||(22473550-22473637)
chr8 (220-269)||(21580080-21580129)
chr8 (448-520)||(37515263-37515336)
chr8 (448-492)||(40493285-40493330)
chr8 (578-633)||(18303150-18303206)
chr8 (302-384)||(18819846-18819932)
chr8 (205-241)||(19808560-19808596)
chr8 (205-241)||(22238216-22238252)
chr8 (436-480)||(22343999-22344043)
chr8 (205-241)||(22352923-22352959)
chr8 (436-480)||(22355659-22355703)
chr8 (205-241)||(44384867-44384903)
[»] chr2 (107 HSPs)
chr2 (114-634)||(18389070-18389590)
chr2 (114-559)||(25044846-25045284)
chr2 (42-633)||(19357707-19358289)
chr2 (42-385)||(5985100-5985439)
chr2 (232-559)||(14693066-14693386)
chr2 (202-557)||(24815536-24815885)
chr2 (448-633)||(10897765-10897957)
chr2 (439-633)||(25085173-25085375)
chr2 (52-622)||(27851351-27851922)
chr2 (448-633)||(24782041-24782231)
chr2 (423-633)||(5032475-5032693)
chr2 (423-632)||(356762-356979)
chr2 (362-556)||(5984973-5985161)
chr2 (43-622)||(27860066-27860637)
chr2 (362-557)||(24835060-24835248)
chr2 (448-623)||(24883195-24883378)
chr2 (359-522)||(17306315-17306473)
chr2 (302-622)||(18391269-18391584)
chr2 (359-522)||(28653568-28653726)
chr2 (494-629)||(25140671-25140812)
chr2 (423-615)||(9974666-9974866)
chr2 (453-612)||(22500627-22500794)
chr2 (453-612)||(22508561-22508728)
chr2 (423-555)||(21336814-21336946)
chr2 (43-377)||(44071506-44071844)
chr2 (424-513)||(25140821-25140910)
chr2 (423-555)||(21316824-21316956)
chr2 (423-559)||(22689485-22689621)
chr2 (202-384)||(24834937-24835120)
chr2 (297-513)||(3538649-3538863)
chr2 (42-338)||(10897483-10897778)
chr2 (423-513)||(10744007-10744096)
chr2 (432-510)||(21367707-21367785)
chr2 (363-522)||(24515014-24515168)
chr2 (438-539)||(44071389-44071490)
chr2 (500-610)||(10744111-10744227)
chr2 (448-506)||(26896168-26896226)
chr2 (297-377)||(36839183-36839263)
chr2 (577-633)||(22688446-22688502)
chr2 (468-559)||(27039308-27039400)
chr2 (551-621)||(45030337-45030407)
chr2 (534-618)||(28576730-28576821)
chr2 (423-507)||(7672559-7672642)
chr2 (85-179)||(9975147-9975243)
chr2 (423-507)||(19202315-19202399)
chr2 (423-507)||(24435910-24435994)
chr2 (85-179)||(28653239-28653335)
chr2 (448-507)||(20913147-20913206)
chr2 (448-507)||(22252756-22252815)
chr2 (494-622)||(22258682-22258813)
chr2 (279-394)||(34136799-34136915)
chr2 (85-135)||(5031867-5031917)
chr2 (85-154)||(23969360-23969429)
chr2 (494-617)||(1384899-1385028)
chr2 (85-179)||(17306706-17306802)
chr2 (448-522)||(18547257-18547332)
chr2 (216-345)||(22689684-22689814)
chr2 (216-345)||(22694280-22694410)
chr2 (359-480)||(36839043-36839159)
chr2 (362-464)||(36839140-36839236)
chr2 (494-556)||(44071344-44071406)
chr2 (85-154)||(24781577-24781646)
chr2 (85-154)||(27485207-27485276)
chr2 (297-381)||(28653465-28653548)
chr2 (448-520)||(43947639-43947712)
chr2 (85-179)||(24515405-24515501)
chr2 (358-465)||(28653488-28653588)
chr2 (85-179)||(36839393-36839489)
chr2 (51-188)||(3538946-3539084)
chr2 (448-522)||(21115476-21115550)
chr2 (279-394)||(22252634-22252749)
chr2 (448-507)||(22258828-22258887)
chr2 (456-507)||(23969787-23969838)
chr2 (448-507)||(24865896-24865955)
chr2 (423-480)||(1384815-1384872)
chr2 (448-492)||(20520465-20520510)
chr2 (499-560)||(21367626-21367687)
chr2 (43-276)||(21367919-21368153)
chr2 (586-623)||(23285447-23285484)
chr2 (573-621)||(1385176-1385223)
chr2 (297-377)||(17306497-17306576)
chr2 (202-246)||(20915208-20915252)
chr2 (460-507)||(6576094-6576141)
chr2 (448-522)||(21237506-21237581)
chr2 (448-522)||(23791008-23791083)
chr2 (427-520)||(34136676-34136771)
chr2 (297-377)||(24515196-24515275)
chr2 (279-377)||(43947510-43947611)
chr2 (85-134)||(14693472-14693521)
chr2 (325-377)||(17306417-17306470)
chr2 (423-480)||(22694160-22694217)
chr2 (448-492)||(24697838-24697883)
chr2 (325-377)||(28653571-28653624)
chr2 (448-492)||(39828268-39828313)
chr2 (427-467)||(17306451-17306491)
chr2 (448-522)||(18787214-18787287)
chr2 (205-241)||(21081934-21081970)
chr2 (205-241)||(22459760-22459796)
chr2 (205-241)||(23069481-23069517)
chr2 (205-241)||(23707486-23707522)
chr2 (326-385)||(24515108-24515168)
chr2 (205-241)||(24670882-24670918)
chr2 (205-241)||(24917997-24918033)
chr2 (262-349)||(25140944-25141031)
chr2 (436-480)||(25587815-25587859)
chr2 (205-241)||(27472306-27472342)
chr2 (205-241)||(34874410-34874446)
[»] chr7 (157 HSPs)
chr7 (114-633)||(36705441-36705963)
chr7 (114-559)||(10660032-10660466)
chr7 (61-559)||(33000799-33001295)
chr7 (42-559)||(15281099-15281616)
chr7 (85-634)||(37785102-37785646)
chr7 (325-629)||(14220067-14220377)
chr7 (114-559)||(17130514-17130955)
chr7 (297-633)||(44373696-44374035)
chr7 (297-633)||(44382561-44382900)
chr7 (444-634)||(47093887-47094084)
chr7 (114-415)||(17071060-17071365)
chr7 (30-415)||(43277505-43277895)
chr7 (362-631)||(13699736-13700003)
chr7 (362-633)||(17071270-17071542)
chr7 (43-418)||(11053603-11053984)
chr7 (362-623)||(43277801-43278063)
chr7 (359-633)||(19281801-19282077)
chr7 (423-633)||(12371025-12371243)
chr7 (30-415)||(3286904-3287288)
chr7 (448-633)||(32434767-32434960)
chr7 (423-633)||(11066149-11066367)
chr7 (147-560)||(4070571-4070973)
chr7 (454-633)||(13150720-13150907)
chr7 (448-633)||(20618966-20619159)
chr7 (437-559)||(11053487-11053609)
chr7 (359-615)||(14161937-14162196)
chr7 (448-632)||(30821952-30822144)
chr7 (30-338)||(18875605-18875913)
chr7 (423-632)||(48811561-48811778)
chr7 (362-506)||(3286861-3286998)
chr7 (485-633)||(15120490-15120646)
chr7 (423-633)||(36686311-36686530)
chr7 (280-464)||(14219984-14220163)
chr7 (494-633)||(13133673-13133818)
chr7 (359-521)||(12466327-12466488)
chr7 (30-162)||(14161621-14161748)
chr7 (456-621)||(6170577-6170750)
chr7 (453-622)||(22001350-22001525)
chr7 (358-521)||(20585264-20585422)
chr7 (435-622)||(8136179-8136368)
chr7 (280-396)||(47094083-47094198)
chr7 (448-633)||(18875985-18876178)
chr7 (438-622)||(15138862-15139052)
chr7 (280-513)||(19558245-19558477)
chr7 (453-560)||(12128280-12128388)
chr7 (448-617)||(37728004-37728181)
chr7 (273-385)||(13699684-13699797)
chr7 (422-522)||(9390137-9390237)
chr7 (423-522)||(14183735-14183835)
chr7 (114-214)||(47094260-47094359)
chr7 (422-511)||(8468084-8468173)
chr7 (71-188)||(3289548-3289667)
chr7 (423-510)||(20253717-20253804)
chr7 (534-623)||(14270559-14270655)
chr7 (423-513)||(16076000-16076090)
chr7 (438-539)||(13133589-13133690)
chr7 (422-511)||(14270475-14270564)
chr7 (502-622)||(15623757-15623883)
chr7 (358-467)||(19282055-19282158)
chr7 (534-621)||(10064251-10064345)
chr7 (560-632)||(12757357-12757429)
chr7 (422-510)||(17232221-17232309)
chr7 (534-621)||(18423310-18423404)
chr7 (453-522)||(16579316-16579386)
chr7 (448-513)||(9744157-9744222)
chr7 (297-377)||(19282101-19282181)
chr7 (551-623)||(8468004-8468076)
chr7 (423-507)||(8852276-8852360)
chr7 (85-179)||(20585575-20585671)
chr7 (85-175)||(44374169-44374261)
chr7 (85-175)||(44383034-44383126)
chr7 (536-623)||(45848150-45848244)
chr7 (85-165)||(12127901-12127983)
chr7 (358-464)||(14161856-14161956)
chr7 (560-623)||(16458686-16458749)
chr7 (448-522)||(16461441-16461516)
chr7 (448-522)||(32300842-32300917)
chr7 (448-507)||(38479880-38479939)
chr7 (432-507)||(46387159-46387234)
chr7 (202-276)||(709397-709471)
chr7 (448-521)||(9033622-9033696)
chr7 (358-467)||(12466246-12466349)
chr7 (562-620)||(15439252-15439310)
chr7 (202-276)||(16462172-16462246)
chr7 (534-623)||(17232129-17232225)
chr7 (202-276)||(41055611-41055685)
chr7 (453-522)||(16586277-16586346)
chr7 (297-377)||(20585365-20585445)
chr7 (287-520)||(42461685-42461916)
chr7 (494-621)||(9744231-9744363)
chr7 (534-621)||(18639867-18639961)
chr7 (85-179)||(46386824-46386920)
chr7 (448-507)||(61555-61614)
chr7 (75-188)||(8757126-8757241)
chr7 (448-522)||(17017729-17017804)
chr7 (422-497)||(45848064-45848139)
chr7 (202-269)||(48811981-48812048)
chr7 (453-507)||(18075625-18075679)
chr7 (448-520)||(11525876-11525948)
chr7 (297-385)||(12466223-12466311)
chr7 (297-377)||(14161833-14161913)
chr7 (279-520)||(38519108-38519347)
chr7 (85-179)||(12465997-12466093)
chr7 (435-539)||(15105204-15105308)
chr7 (439-507)||(15120416-15120483)
chr7 (97-179)||(19282311-19282395)
chr7 (85-188)||(40555484-40555588)
chr7 (427-520)||(131106-131200)
chr7 (448-494)||(11772565-11772612)
chr7 (457-522)||(16585215-16585281)
chr7 (85-154)||(11066714-11066783)
chr7 (325-381)||(12466330-12466387)
chr7 (85-154)||(13148209-13148278)
chr7 (448-492)||(14323174-14323219)
chr7 (457-517)||(48990958-48991018)
chr7 (448-480)||(16220029-16220061)
chr7 (224-343)||(18075455-18075574)
chr7 (449-492)||(20220463-20220507)
chr7 (439-491)||(48809583-48809635)
chr7 (279-394)||(130963-131079)
chr7 (302-349)||(9744093-9744140)
chr7 (448-522)||(14044482-14044557)
chr7 (448-522)||(14354512-14354587)
chr7 (51-188)||(15096392-15096530)
chr7 (85-132)||(32434327-32434374)
chr7 (216-321)||(32434507-32434614)
chr7 (114-188)||(832794-832868)
chr7 (114-188)||(1197974-1198048)
chr7 (469-507)||(1543534-1543572)
chr7 (449-522)||(16091532-16091605)
chr7 (42-83)||(4071038-4071079)
chr7 (22-60)||(8514475-8514515)
chr7 (85-154)||(12371524-12371593)
chr7 (280-349)||(13133475-13133543)
chr7 (448-492)||(15008810-15008855)
chr7 (51-174)||(15139343-15139467)
chr7 (51-174)||(19558032-19558156)
chr7 (220-269)||(30821129-30821178)
chr7 (220-269)||(36686123-36686172)
chr7 (205-241)||(1490252-1490288)
chr7 (445-492)||(1868265-1868313)
chr7 (448-522)||(2282561-2282634)
chr7 (205-241)||(8940136-8940172)
chr7 (573-621)||(9744507-9744554)
chr7 (51-173)||(14219720-14219843)
chr7 (205-241)||(14258337-14258373)
chr7 (205-241)||(14981633-14981669)
chr7 (205-241)||(15112830-15112866)
chr7 (205-241)||(15411109-15411145)
chr7 (205-241)||(15719882-15719918)
chr7 (205-241)||(16579645-16579681)
chr7 (205-241)||(16585982-16586018)
chr7 (205-241)||(16998479-16998515)
chr7 (221-269)||(38480167-38480215)
chr7 (438-510)||(43747328-43747400)
chr7 (205-241)||(46580873-46580909)
chr7 (325-377)||(47094065-47094117)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (114-623)||(51992292-51992802)
chr4 (30-633)||(19435457-19436053)
chr4 (362-634)||(19734096-19734369)
chr4 (42-559)||(21061365-21061881)
chr4 (202-555)||(15364767-15365113)
chr4 (202-555)||(27995609-27995955)
chr4 (362-633)||(40229243-40229515)
chr4 (84-377)||(9871308-9871602)
chr4 (302-633)||(16296260-16296593)
chr4 (202-467)||(13036620-13036879)
chr4 (325-622)||(13036781-13037084)
chr4 (362-632)||(9637617-9637888)
chr4 (163-348)||(32467113-32467297)
chr4 (312-559)||(15608133-15608374)
chr4 (325-633)||(33244204-33244522)
chr4 (224-557)||(50159856-50160182)
chr4 (287-467)||(33244129-33244302)
chr4 (423-633)||(10357592-10357810)
chr4 (205-423)||(19738071-19738288)
chr4 (208-421)||(20533-20747)
chr4 (20-179)||(37018817-37018980)
chr4 (236-520)||(16042752-16043031)
chr4 (423-555)||(19736339-19736471)
chr4 (333-559)||(20362-20584)
chr4 (205-507)||(53631454-53631746)
chr4 (494-629)||(14629499-14629640)
chr4 (200-415)||(19734274-19734495)
chr4 (280-385)||(40229454-40229560)
chr4 (445-620)||(46642371-46642555)
chr4 (279-514)||(40906654-40906885)
chr4 (423-617)||(26444643-26444842)
chr4 (423-514)||(32467291-32467382)
chr4 (280-415)||(9637794-9637933)
chr4 (334-522)||(14650449-14650631)
chr4 (445-522)||(3484864-3484941)
chr4 (422-617)||(13844080-13844283)
chr4 (438-622)||(26922822-26923006)
chr4 (482-621)||(15189826-15189973)
chr4 (422-511)||(19857173-19857262)
chr4 (359-522)||(25090481-25090638)
chr4 (359-522)||(42874626-42874784)
chr4 (438-513)||(14629649-14629724)
chr4 (428-522)||(16997354-16997449)
chr4 (438-522)||(14548539-14548624)
chr4 (422-519)||(15098932-15099029)
chr4 (570-631)||(33185676-33185737)
chr4 (445-509)||(361848-361912)
chr4 (423-522)||(15042239-15042339)
chr4 (423-522)||(15112085-15112185)
chr4 (448-522)||(35812573-35812648)
chr4 (61-154)||(33243967-33244061)
chr4 (551-621)||(44773584-44773654)
chr4 (358-462)||(11424922-11425020)
chr4 (297-377)||(11424963-11425043)
chr4 (208-316)||(15612054-15612163)
chr4 (297-377)||(16997536-16997616)
chr4 (50-188)||(4615771-4615911)
chr4 (85-269)||(10357173-10357356)
chr4 (427-507)||(11424797-11424877)
chr4 (534-621)||(15355770-15355864)
chr4 (85-179)||(16997746-16997842)
chr4 (71-188)||(2584937-2585056)
chr4 (560-623)||(4859033-4859096)
chr4 (85-178)||(14548846-14548941)
chr4 (448-522)||(37018420-37018495)
chr4 (487-554)||(40906585-40906652)
chr4 (531-621)||(44024649-44024745)
chr4 (437-507)||(33185851-33185921)
chr4 (358-467)||(42874762-42874865)
chr4 (358-415)||(16997536-16997593)
chr4 (85-154)||(25090899-25090968)
chr4 (297-377)||(42874808-42874888)
chr4 (534-621)||(7641630-7641724)
chr4 (50-188)||(27027942-27028082)
chr4 (487-559)||(32467383-32467455)
chr4 (494-621)||(35659519-35659652)
chr4 (85-178)||(42875019-42875114)
chr4 (534-623)||(361755-361851)
chr4 (534-623)||(19857082-19857178)
chr4 (358-467)||(25090616-25090719)
chr4 (371-468)||(37018556-37018647)
chr4 (500-617)||(46739930-46740053)
chr4 (422-507)||(19609138-19609222)
chr4 (297-377)||(25090662-25090742)
chr4 (71-188)||(6511781-6511900)
chr4 (84-174)||(9638226-9638317)
chr4 (220-345)||(10357362-10357488)
chr4 (453-510)||(2425721-2425778)
chr4 (71-178)||(13446669-13446778)
chr4 (448-496)||(17333038-17333087)
chr4 (85-154)||(19609570-19609639)
chr4 (427-494)||(26045583-26045652)
chr4 (427-494)||(26050764-26050833)
chr4 (359-415)||(14548599-14548655)
chr4 (74-188)||(20899489-20899605)
chr4 (302-377)||(12622406-12622483)
chr4 (448-522)||(13592458-13592532)
chr4 (75-184)||(15448141-15448252)
chr4 (302-385)||(26444836-26444920)
chr4 (448-494)||(32307223-32307270)
chr4 (302-381)||(35659692-35659774)
chr4 (362-396)||(9871550-9871584)
chr4 (469-507)||(15869218-15869256)
chr4 (469-507)||(22353563-22353601)
chr4 (325-359)||(25090601-25090635)
chr4 (469-507)||(32850952-32850990)
chr4 (89-179)||(11425173-11425266)
chr4 (448-492)||(15791449-15791494)
chr4 (325-377)||(42874728-42874781)
chr4 (448-492)||(46640729-46640774)
chr4 (448-492)||(53082464-53082509)
chr4 (448-522)||(12288522-12288595)
chr4 (205-241)||(14746781-14746817)
chr4 (85-188)||(14942388-14942492)
chr4 (297-349)||(16027037-16027088)
chr4 (205-241)||(17048332-17048368)
chr4 (334-377)||(37018603-37018647)
chr4 (302-377)||(46225560-46225636)
chr4 (436-480)||(55582207-55582251)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (84-634)||(20410-20959)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (114-559)||(10952814-10953253)
chr5 (20-294)||(23200234-23200508)
chr5 (280-634)||(20565175-20565531)
chr5 (76-559)||(25250623-25251106)
chr5 (76-559)||(25314408-25314891)
chr5 (280-633)||(21406604-21406964)
chr5 (200-633)||(36509664-36510099)
chr5 (42-556)||(20469823-20470336)
chr5 (439-633)||(26761185-26761387)
chr5 (202-622)||(16227109-16227534)
chr5 (302-633)||(23202699-23203034)
chr5 (422-621)||(5889600-5889807)
chr5 (422-621)||(21741982-21742189)
chr5 (448-617)||(12122583-12122761)
chr5 (448-632)||(31454652-31454844)
chr5 (453-615)||(17874806-17874976)
chr5 (448-633)||(21555465-21555659)
chr5 (423-632)||(31455265-31455482)
chr5 (279-520)||(15796159-15796394)
chr5 (302-553)||(25742695-25742922)
chr5 (448-633)||(21558130-21558324)
chr5 (475-622)||(12354138-12354291)
chr5 (423-513)||(21619109-21619199)
chr5 (423-507)||(13536465-13536549)
chr5 (302-395)||(25743579-25743672)
chr5 (551-621)||(39244737-39244807)
chr5 (297-480)||(6551460-6551642)
chr5 (438-622)||(20198811-20199001)
chr5 (494-617)||(6551669-6551798)
chr5 (427-515)||(25578320-25578409)
chr5 (494-622)||(21619208-21619342)
chr5 (448-556)||(29914135-29914243)
chr5 (448-507)||(19920572-19920631)
chr5 (451-517)||(23469542-23469609)
chr5 (448-522)||(26740956-26741031)
chr5 (453-504)||(29915488-29915539)
chr5 (92-154)||(19920880-19920942)
chr5 (427-491)||(25574754-25574820)
chr5 (571-621)||(29915612-29915662)
chr5 (217-322)||(33895855-33895958)
chr5 (302-421)||(8504701-8504823)
chr5 (448-520)||(21732239-21732311)
chr5 (448-520)||(21809890-21809962)
chr5 (223-345)||(12122397-12122519)
chr5 (439-514)||(8504834-8504909)
chr5 (42-174)||(24277302-24277437)
chr5 (42-174)||(24384776-24384911)
chr5 (202-241)||(29447890-29447929)
chr5 (303-386)||(29914299-29914384)
chr5 (427-491)||(25575947-25576013)
chr5 (448-489)||(26733100-26733142)
chr5 (220-345)||(31454932-31455056)
chr5 (469-507)||(40725584-40725622)
chr5 (448-492)||(16227537-16227582)
chr5 (220-269)||(21555253-21555302)
chr5 (220-269)||(21557918-21557967)
chr5 (448-492)||(22178532-22178577)
chr5 (85-188)||(8952791-8952895)
chr5 (436-480)||(16605467-16605511)
chr5 (220-272)||(17875141-17875193)
chr5 (205-241)||(22107632-22107668)
chr5 (436-480)||(22110685-22110729)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (202-633)||(20411639-20412072)
chr6 (84-633)||(19829694-19830241)
chr6 (202-557)||(22376755-22377103)
chr6 (236-520)||(20136408-20136686)
chr6 (236-520)||(22196183-22196461)
chr6 (43-555)||(22212206-22212715)
chr6 (423-634)||(23492339-23492557)
chr6 (423-634)||(23497937-23498155)
chr6 (238-557)||(15895631-15895943)
chr6 (202-467)||(23083140-23083398)
chr6 (200-557)||(16245038-16245388)
chr6 (325-557)||(23083300-23083530)
chr6 (42-415)||(31735620-31735990)
chr6 (423-633)||(23017266-23017484)
chr6 (236-491)||(23528206-23528456)
chr6 (302-520)||(17229826-17230038)
chr6 (130-276)||(24551067-24551212)
chr6 (217-385)||(18260087-18260256)
chr6 (453-633)||(27329002-27329194)
chr6 (453-633)||(27389742-27389934)
chr6 (438-557)||(31735965-31736084)
chr6 (362-555)||(18260196-18260381)
chr6 (422-614)||(25957062-25957262)
chr6 (360-522)||(17105391-17105545)
chr6 (359-522)||(7825473-7825631)
chr6 (448-623)||(20734531-20734715)
chr6 (453-622)||(18458221-18458397)
chr6 (456-633)||(27850638-27850823)
chr6 (302-520)||(18177842-18178055)
chr6 (466-617)||(25965153-25965312)
chr6 (362-522)||(27126467-27126622)
chr6 (423-539)||(22556046-22556162)
chr6 (360-515)||(23538293-23538441)
chr6 (360-522)||(19656482-19656637)
chr6 (432-507)||(18319490-18319565)
chr6 (205-377)||(19656210-19656380)
chr6 (85-338)||(17318859-17319111)
chr6 (284-415)||(18203916-18204047)
chr6 (448-522)||(18452954-18453029)
chr6 (85-188)||(24441132-24441235)
chr6 (453-522)||(22805491-22805561)
chr6 (71-179)||(31733927-31734039)
chr6 (85-178)||(27126214-27126309)
chr6 (551-621)||(19859422-19859492)
chr6 (205-515)||(15705641-15705945)
chr6 (438-539)||(28947346-28947447)
chr6 (453-556)||(6083867-6083971)
chr6 (74-188)||(13751083-13751199)
chr6 (85-179)||(15891440-15891536)
chr6 (303-377)||(27126446-27126520)
chr6 (448-507)||(31733605-31733664)
chr6 (457-507)||(17319215-17319265)
chr6 (332-389)||(18203904-18203962)
chr6 (42-188)||(610947-611096)
chr6 (448-520)||(16492886-16492958)
chr6 (448-520)||(17742932-17743005)
chr6 (279-377)||(17743075-17743173)
chr6 (71-141)||(7827231-7827303)
chr6 (494-617)||(22555934-22556063)
chr6 (97-188)||(29848258-29848350)
chr6 (448-522)||(35007885-35007959)
chr6 (280-377)||(17105569-17105665)
chr6 (85-127)||(18708772-18708814)
chr6 (494-556)||(19958080-19958142)
chr6 (448-517)||(20223685-20223754)
chr6 (448-517)||(22117669-22117738)
chr6 (280-386)||(23500654-23500762)
chr6 (448-520)||(18896620-18896692)
chr6 (279-357)||(20078316-20078395)
chr6 (279-377)||(27573247-27573345)
chr6 (358-414)||(7825656-7825712)
chr6 (453-520)||(20078486-20078554)
chr6 (448-522)||(20108872-20108945)
chr6 (573-621)||(23498474-23498521)
chr6 (449-522)||(33442782-33442856)
chr6 (75-175)||(18658426-18658528)
chr6 (85-135)||(23151003-23151053)
chr6 (280-377)||(23538543-23538639)
chr6 (325-377)||(7825575-7825628)
chr6 (279-357)||(18453079-18453157)
chr6 (448-492)||(19362191-19362236)
chr6 (445-489)||(25714211-25714256)
chr6 (297-376)||(7825656-7825735)
chr6 (205-241)||(15817717-15817753)
chr6 (205-241)||(17377995-17378031)
chr6 (436-480)||(19234287-19234331)
chr6 (573-621)||(19958266-19958313)
chr6 (573-621)||(22555839-22555886)
chr6 (205-241)||(22805819-22805855)
chr6 (436-480)||(25920511-25920555)
chr6 (436-480)||(30674485-30674529)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (114-559)||(397335-397775)
scaffold0002 (43-241)||(127493-127691)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (202-633)||(38876-39309)
scaffold0098 (469-507)||(34720-34758)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (42-559)||(127115-127632)
scaffold0010 (279-494)||(409-622)
scaffold0010 (429-494)||(6777-6844)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (200-617)||(13852-14270)
scaffold0077 (243-420)||(2880-3058)
scaffold0077 (423-492)||(56010-56081)
scaffold0077 (362-421)||(2917-2976)
[»] scaffold0170 (2 HSPs)
scaffold0170 (202-623)||(2295-2718)
scaffold0170 (279-357)||(2853-2931)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (42-559)||(28118-28632)
scaffold0042 (422-633)||(47600-47818)
scaffold0042 (85-385)||(47306-47607)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (114-558)||(775-1207)
[»] scaffold0065 (3 HSPs)
scaffold0065 (202-560)||(54712-55064)
scaffold0065 (84-385)||(53377-53678)
scaffold0065 (362-559)||(53617-53809)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (306-633)||(9044-9372)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (426-629)||(7073-7283)
scaffold0529 (280-466)||(7285-7466)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (159-554)||(24013-24399)
[»] scaffold0220 (10 HSPs)
scaffold0220 (325-633)||(15483-15792)
scaffold0220 (114-396)||(12940-13225)
scaffold0220 (114-421)||(15734-16043)
scaffold0220 (428-617)||(3234-3431)
scaffold0220 (208-498)||(17311-17598)
scaffold0220 (326-421)||(12879-12973)
scaffold0220 (423-467)||(12955-12999)
scaffold0220 (426-467)||(15773-15814)
scaffold0220 (342-385)||(12877-12920)
scaffold0220 (524-556)||(17278-17310)
[»] scaffold0083 (6 HSPs)
scaffold0083 (84-559)||(11447-11919)
scaffold0083 (61-386)||(653-980)
scaffold0083 (61-386)||(5957-6284)
scaffold0083 (423-559)||(7838-7974)
scaffold0083 (362-421)||(918-977)
scaffold0083 (362-421)||(6222-6281)
[»] scaffold1815 (1 HSPs)
scaffold1815 (200-633)||(789-1220)
[»] scaffold0379 (5 HSPs)
scaffold0379 (224-556)||(4668-4993)
scaffold0379 (427-557)||(14873-15002)
scaffold0379 (224-374)||(14714-14864)
scaffold0379 (436-480)||(9494-9538)
scaffold0379 (436-480)||(16686-16730)
[»] scaffold0241 (4 HSPs)
scaffold0241 (325-629)||(1132-1437)
scaffold0241 (280-467)||(1338-1520)
scaffold0241 (281-398)||(4568-4686)
scaffold0241 (362-421)||(4583-4642)
[»] scaffold0630 (3 HSPs)
scaffold0630 (334-633)||(7856-8158)
scaffold0630 (84-300)||(8158-8374)
scaffold0630 (325-419)||(8030-8129)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (231-509)||(10786-11058)
scaffold0039 (531-633)||(11052-11161)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (202-557)||(12976-13323)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (202-557)||(7510-7859)
scaffold0018 (205-241)||(20689-20725)
[»] scaffold0108 (5 HSPs)
scaffold0108 (84-421)||(5385-5727)
scaffold0108 (325-617)||(5150-5443)
scaffold0108 (426-513)||(7998-8085)
scaffold0108 (426-466)||(5425-5465)
scaffold0108 (494-621)||(8094-8227)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (202-555)||(446190-446536)
scaffold0001 (454-633)||(31590-31777)
scaffold0001 (454-633)||(36897-37084)
scaffold0001 (453-507)||(76566-76620)
scaffold0001 (448-520)||(497199-497272)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (200-554)||(740-1092)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (236-520)||(75933-76211)
scaffold0054 (423-629)||(66144-66353)
scaffold0054 (302-421)||(65944-66068)
[»] scaffold1539 (4 HSPs)
scaffold1539 (224-413)||(489-678)
scaffold1539 (279-357)||(835-913)
scaffold1539 (362-480)||(470-576)
scaffold1539 (448-492)||(703-748)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (423-633)||(78463-78681)
scaffold0036 (423-467)||(78421-78465)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (448-633)||(5675-5868)
scaffold0462 (448-633)||(169-362)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (448-633)||(13406-13599)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (423-633)||(6799-7017)
scaffold0737 (85-179)||(5450-5546)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (448-633)||(9936-10129)
scaffold0509 (85-154)||(9495-9564)
[»] scaffold0445 (2 HSPs)
scaffold0445 (46-513)||(2633-3101)
scaffold0445 (483-595)||(3102-3221)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (43-513)||(65905-66364)
scaffold0056 (527-622)||(65768-65869)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (457-633)||(65196-65380)
scaffold0051 (584-633)||(79547-79596)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (279-522)||(7289-7525)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (448-629)||(9480-9667)
scaffold0375 (85-135)||(9040-9090)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (359-632)||(25835-26110)
scaffold0019 (205-241)||(21838-21874)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (279-522)||(15194-15430)
[»] scaffold0040 (5 HSPs)
scaffold0040 (202-520)||(10875-11189)
scaffold0040 (202-520)||(21975-22289)
scaffold0040 (359-522)||(102163-102321)
scaffold0040 (297-377)||(102059-102139)
scaffold0040 (358-415)||(102082-102139)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (423-622)||(108981-109186)
scaffold0004 (71-188)||(59550-59669)
scaffold0004 (42-349)||(109219-109519)
scaffold0004 (436-484)||(64993-65041)
scaffold0004 (448-488)||(332087-332128)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (208-421)||(60232-60446)
scaffold0075 (333-559)||(60061-60283)
[»] scaffold0074 (7 HSPs)
scaffold0074 (20-162)||(765-902)
scaffold0074 (359-559)||(362-557)
scaffold0074 (358-467)||(535-638)
scaffold0074 (297-377)||(581-661)
scaffold0074 (325-385)||(493-554)
scaffold0074 (456-520)||(7898-7963)
scaffold0074 (279-394)||(8020-8136)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (205-507)||(1448-1740)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (448-622)||(142246-142428)
scaffold0020 (285-377)||(142456-142550)
scaffold0020 (205-241)||(169947-169983)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (202-445)||(11666-11906)
scaffold0338 (440-551)||(15222-15337)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (448-623)||(10320-10503)
scaffold0134 (85-135)||(9963-10013)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (362-522)||(56650-56803)
scaffold0073 (297-385)||(56742-56830)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (423-632)||(3035-3252)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (494-629)||(384-525)
scaffold1186 (438-513)||(534-609)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (494-629)||(187743-187884)
scaffold0005 (334-522)||(166661-166843)
scaffold0005 (438-513)||(187659-187734)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (423-510)||(95185-95272)
scaffold0003 (43-338)||(95342-95639)
scaffold0003 (483-560)||(95108-95181)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (42-319)||(303-582)
scaffold0409 (42-319)||(8558-8837)
[»] scaffold0111 (8 HSPs)
scaffold0111 (359-514)||(19868-20018)
scaffold0111 (85-179)||(13271-13367)
scaffold0111 (85-179)||(19538-19634)
scaffold0111 (423-507)||(7171-7255)
scaffold0111 (423-507)||(14290-14374)
scaffold0111 (297-375)||(19764-19842)
scaffold0111 (358-467)||(19787-19890)
scaffold0111 (325-377)||(19871-19924)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (362-515)||(19131-19279)
scaffold0203 (287-377)||(19094-19184)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (446-592)||(4128-4281)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (449-559)||(3146-3256)
scaffold0589 (161-349)||(3315-3501)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (358-522)||(10744-10903)
scaffold0301 (297-377)||(10846-10926)
[»] scaffold0371 (5 HSPs)
scaffold0371 (485-632)||(11466-11621)
scaffold0371 (494-622)||(14332-14466)
scaffold0371 (439-507)||(11391-11459)
scaffold0371 (423-507)||(2740-2824)
scaffold0371 (438-539)||(14449-14550)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (360-515)||(63309-63459)
scaffold0032 (280-468)||(63113-63294)
scaffold0032 (325-377)||(63311-63364)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (448-622)||(55774-55955)
scaffold0048 (316-386)||(56013-56087)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (453-560)||(56510-56618)
scaffold0034 (453-522)||(116657-116727)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (453-622)||(7658-7834)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (477-622)||(16956-17109)
[»] scaffold0107 (5 HSPs)
scaffold0107 (448-618)||(10699-10883)
scaffold0107 (448-618)||(16502-16686)
scaffold0107 (279-494)||(35942-36155)
scaffold0107 (224-338)||(10516-10632)
scaffold0107 (423-492)||(10420-10491)
[»] scaffold1662 (4 HSPs)
scaffold1662 (359-522)||(488-645)
scaffold1662 (85-179)||(158-254)
scaffold1662 (358-467)||(407-510)
scaffold1662 (297-376)||(384-463)
[»] scaffold0439 (6 HSPs)
scaffold0439 (359-495)||(1111-1240)
scaffold0439 (359-495)||(8971-9100)
scaffold0439 (200-349)||(11215-11364)
scaffold0439 (439-514)||(3301-3376)
scaffold0439 (487-559)||(1019-1091)
scaffold0439 (487-559)||(8879-8951)
[»] scaffold1223 (2 HSPs)
scaffold1223 (494-629)||(319-460)
scaffold1223 (423-539)||(220-336)
[»] scaffold0113 (3 HSPs)
scaffold0113 (423-539)||(34143-34259)
scaffold0113 (494-629)||(33920-34061)
scaffold0113 (445-539)||(34044-34138)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (423-621)||(39663-39867)
scaffold0011 (427-522)||(38404-38501)
scaffold0011 (287-377)||(125643-125732)
scaffold0011 (573-621)||(39563-39610)
scaffold0011 (205-241)||(125842-125878)
[»] scaffold0790 (2 HSPs)
scaffold0790 (279-415)||(5872-6008)
scaffold0790 (438-466)||(5869-5897)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (438-622)||(7539-7729)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (147-239)||(36344-36435)
scaffold0116 (422-511)||(44225-44314)
scaffold0116 (534-623)||(44309-44405)
[»] scaffold1695 (2 HSPs)
scaffold1695 (423-513)||(303-393)
scaffold1695 (51-174)||(583-707)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (466-622)||(113753-113915)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (423-539)||(18913-19029)
scaffold0231 (494-556)||(19012-19074)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (448-560)||(17122-17234)
scaffold0090 (448-492)||(2441-2486)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (423-514)||(19530-19621)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (200-344)||(15357-15501)
scaffold0207 (443-514)||(15477-15549)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (494-622)||(72859-72993)
scaffold0063 (438-513)||(73002-73077)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (423-515)||(103-195)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (435-622)||(3464-3657)
[»] scaffold0453 (3 HSPs)
scaffold0453 (71-188)||(3242-3361)
scaffold0453 (452-522)||(2140-2211)
scaffold0453 (573-621)||(6047-6094)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (432-507)||(20904-20979)
scaffold0230 (432-507)||(23834-23909)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (448-509)||(1254-1315)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (427-522)||(13832-13929)
scaffold0452 (205-241)||(13574-13610)
[»] scaffold0645 (2 HSPs)
scaffold0645 (438-538)||(192-292)
scaffold0645 (494-595)||(276-384)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (202-294)||(24973-25064)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (432-504)||(106163-106235)
scaffold0035 (551-623)||(106065-106137)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (432-522)||(7962-8053)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (448-522)||(8244-8319)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (427-515)||(4489-4579)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (551-621)||(71542-71612)
scaffold0008 (43-349)||(136316-136621)
scaffold0008 (97-188)||(12263-12355)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (432-492)||(6-66)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (494-621)||(4720-4853)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (50-188)||(6827-6967)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (534-621)||(116033-116127)
scaffold0022 (205-241)||(54036-54072)
[»] scaffold0810 (2 HSPs)
scaffold0810 (448-511)||(2636-2699)
scaffold0810 (533-617)||(2551-2642)
[»] scaffold0278 (4 HSPs)
scaffold0278 (448-522)||(7304-7379)
scaffold0278 (205-293)||(7669-7758)
scaffold0278 (448-496)||(10785-10834)
scaffold0278 (444-480)||(5421-5458)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (279-520)||(1630-1869)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (448-517)||(5006-5075)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (85-177)||(57969-58063)
scaffold0064 (423-492)||(57672-57741)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (453-522)||(145652-145722)
scaffold0026 (202-246)||(21247-21291)
scaffold0026 (51-269)||(145867-146084)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (74-188)||(317-433)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (50-188)||(10883-11023)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (86-154)||(8124-8192)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (85-188)||(6113-6217)
scaffold0309 (85-188)||(8265-8369)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (50-168)||(34096-34216)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (85-269)||(299-480)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (448-507)||(14048-14107)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (75-188)||(8264-8379)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (448-522)||(106055-106130)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (85-177)||(134-228)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (449-515)||(10733-10798)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (449-515)||(1003-1068)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (114-188)||(159723-159797)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (448-520)||(8626-8699)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (85-188)||(5031-5135)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (423-507)||(77943-78027)
scaffold0047 (256-345)||(78090-78179)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (448-494)||(4908-4955)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (448-522)||(13993-14068)
scaffold0420 (448-492)||(6539-6584)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (114-173)||(12554-12613)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (448-522)||(17238-17313)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (439-514)||(278-353)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (448-521)||(1436-1510)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (22-56)||(5434-5468)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (494-556)||(21109-21171)
scaffold0251 (232-377)||(20908-21057)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (432-520)||(733-823)
[»] scaffold1256 (2 HSPs)
scaffold1256 (423-480)||(385-442)
scaffold1256 (573-621)||(640-687)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (42-188)||(2913-3062)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (279-392)||(18313-18428)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (74-188)||(2719-2835)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (74-188)||(366-482)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (85-188)||(40966-41070)
[»] scaffold0853 (1 HSPs)
scaffold0853 (448-522)||(2975-3050)
[»] scaffold1212 (1 HSPs)
scaffold1212 (572-622)||(178-227)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (114-188)||(1300-1374)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (280-394)||(10022-10137)
scaffold0485 (427-517)||(9911-10003)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (469-507)||(13133-13171)
scaffold0235 (469-507)||(24835-24873)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (469-507)||(9659-9697)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (85-134)||(23662-23711)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (448-492)||(38196-38241)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (448-520)||(19958-20030)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (205-241)||(304-340)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (205-241)||(2911-2947)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (205-241)||(6950-6986)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (205-241)||(1490-1526)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (205-241)||(739-775)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (205-241)||(7139-7175)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (205-241)||(7100-7136)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (205-241)||(3590-3626)
scaffold0165 (205-241)||(7654-7690)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (436-480)||(1700-1744)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (436-480)||(10304-10348)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (205-241)||(78290-78326)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1642818 - 1642420
Alignment:
Q  17 acttgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtta 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1642818 acttgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaatgtatgttatagaaaataatgttgtta 1642719  T
Q  117 tatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642718 tatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgctgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagag 1642619  T
Q  217 ttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatact 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1642618 ttggtctaagttgtaaagttctaagatattaatccaagatattggagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatggatact 1642519  T
Q  317 catttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1642518 catttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgatctgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgc 1642420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 84 - 633
Target Start/End: Original strand, 38057393 - 38057942
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  38057393 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgt 38057492  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  38057493 tgttgaac-cattattgtcattaagttgcaaatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga-tcatataagttgtgaagtt 38057590  T
Q  283 gtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgt 382  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38057591 gtctaagttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggtttgatgctctgt 38057690  T
Q  383 gagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatcc 482  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |    
T  38057691 gagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagagtttgatgccctggttggtactacatgc 38057783  T
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaaga 574  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||  |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  | ||    
T  38057784 atgattaagaagttgaagtttcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcactgagttgttaataagga 38057883  T
Q  575 actatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38057884 actacctgaagtattaatatttattaaatgttgttgttcatgttgttataagatgatgt 38057942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 114 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 22349867 - 22349357
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22349867 ttatatcattcaagttattattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttttgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcta 22349769  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||| ||||||         |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22349768 gtgttggtttaagtt---------taagttgttattccaagatattgga-tcatataagttgtaaaattgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcat 22349679  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttga 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  22349678 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgaagccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttga 22349579  T
Q  413 tgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcga 512  Q
    |||| ||||      ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22349578 tgctttgtg------agtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccaaatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcga 22349485  T
Q  513 gtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgt 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  22349484 gtcgaagtcgttgatgtcgcattgtcgttgtcattaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatttgaagaattaatatttattaattgt 22349385  T
Q  606 tgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349384 tgttgtttatgttgttatatgatgatgt 22349357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 44 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 42697072 - 42696561
Alignment:
Q  44 tgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgc 143  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||     
T  42697072 tgattaatgttcttgattaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagatgttgttattaatgt 42696973  T
Q  144 tgatatgttgtaagatg-tttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaaga 242  Q
    || || |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  42696972 tgctacgttgcaagttgttttatgttgttgtctctgctgttgttg-agtcattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttg-aagt 42696875  T
Q  243 tgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg--tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattc 340  Q
    ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |    
T  42696874 tgttgttccaagatattggaatcatataagttgttgaagtttgtctaagttgtaagttgatgagtccatgcatactcatat-atgttgagggcttgatgc 42696776  T
Q  341 cctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtattta 437  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| | |||| |||||||| ||      ||||||| || |||    
T  42696775 cctgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatg-tc-----gtgtgagtataatta 42696682  T
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42696681 tactctacatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcgagtcgaagttgttgatgtcgcattgt 42696582  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcatt 558  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  42696581 cgttgtctttaagttgtcatt 42696561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 231 - 633
Target Start/End: Original strand, 38887998 - 38888402
Alignment:
Q  231 aaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttga 329  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38887998 aaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttga 38888097  T
Q  330 gagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
    | | |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||     ||||||    
T  38888098 gggtttgatgttctgtgagcttttgctcttacgttgaggacttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgc-ct-----tgtgag 38888190  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatg 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |    
T  38888191 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaag 38888290  T
Q  529 tcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38888291 tcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaataaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 38888390  T
Q  622 atatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||    
T  38888391 atatgatgatgt 38888402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 148 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 24726571 - 24726170
Alignment:
Q  148 atgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgtta 247  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24726571 atgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtta 24726473  T
Q  248 atccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtga 347  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || |||||    
T  24726472 ttccaagatattggagtcatataagttgtggagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcgtttaaagttgagggcttgatgccatgtga 24726373  T
Q  348 gcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctcttta 446  Q
    || ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | |||| | ||||| |||     |||||||| || |||| |||| ||    
T  24726372 gcctttgctctttacgttgagggtttgacgccctgtgagtttttgctctttaagttgagggtttgat-ctc-----ctgtgagtataattatactctata 24726279  T
Q  447 tgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   | |||||||||||| |||| ||| |    
T  24726278 tgttaagggcttgatgccctggttggtatcacattcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtttaataagttgatgtcgcattatcgtagtctt 24726179  T
Q  547 taagttgtc 555  Q
    |||||||||    
T  24726178 taagttgtc 24726170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 362 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 51476047 - 51475774
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51476047 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtg------agtataattatactctttatgttgagggcttgat 51475954  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-- 559  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  51475953 gccttggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcatcgtcgagtcgaagtcgctgatgtcgcattgtcgttgtcgttaatttgtcatttat 51475854  T
Q  560 -----agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
         ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51475853 caatgagttgttaacgaagaactatgagaagtattaacatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 51475774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 438 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1642445 - 1642242
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642445 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 1642346  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatga 630  Q
     |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1642345 tgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatattttttaatcgttgttgtttatgttgttatatgatga 1642246  T
Q  631 tgtc 634  Q
    ||||    
T  1642245 tgtc 1642242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 200 - 633
Target Start/End: Original strand, 7052903 - 7053334
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt--gttgtctaagttgtacat 297  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |    
T  7052903 tcattaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttggaagttgtctaagttgtaagt 7053002  T
Q  298 tgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt 396  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  7053003 tgttgattccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctttgagcttttcctctatacgttgatggcttgatgctctgtgagtttttgctc-t 7053101  T
Q  397 tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
    |||| |||| |||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7053102 tatgttgagggcttgatg-tc-----atgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagtt 7053195  T
Q  497 gtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgtt--gtcgttaagttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaata 593  Q
    | |||||||| | | ||||  |||| |  || ||||| ||||||||  || | | | |||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7053196 gaagttgcatatattgagtttaagttgtagaagtcgcgttgtcgttaagttg-tcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaata 7053294  T
Q  594 tttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  7053295 tttattaatcattgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 7053334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 362 - 633
Target Start/End: Original strand, 8276973 - 8277245
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276973 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgccctgt------gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 8277066  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-- 559  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||      
T  8277067 gtcctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtaattgcattatcgagttgaagtcgtagatgttgcatagtcgttgtcgttaagttgtcatttat 8277166  T
Q  560 -----agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
         ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8277167 caatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatattgttatatgatgatgt 8277245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 84 - 385
Target Start/End: Original strand, 8276732 - 8277034
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgt-tatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||| |||| || |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||  |    
T  8276732 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtatatatcattcaagttgttgttattgatgttgttatgttgcaagatatttatgttgatgtttctgctct 8276831  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  8276832 tgttgaac-cattattgttattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatataagttgtagagtt 8276930  T
Q  283 gtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctg 381  Q
    || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  8276931 gtttaagttgtacgttgttgagtccacgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgccctg 8277030  T
Q  382 tgag 385  Q
    ||||    
T  8277031 tgag 8277034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 208 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 45754644 - 45754312
Alignment:
Q  208 ttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtc 306  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||    
T  45754644 ttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaagttgttgttccaagatattggaatcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtc 45754545  T
Q  307 catgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctg 403  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| | ||    
T  45754544 catgcatactcataa-aagttgagggcttgatgtcctatgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttg 45754446  T
Q  404 agagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttg 503  Q
    || |||||||||  ||||      ||| || |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45754445 agggcttgatgccatgtg------agtataattatactctatatgttgagg-cttgacgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 45754353  T
Q  504 cattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtc 544  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45754352 cattgtcgagtcgaagtcgttaatgtcgcattgtcgttgtc 45754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51476330 - 51475986
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||  |||||| |||| ||||||| ||||||| || |    
T  51476330 atgattaatgttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattattaa 51476231  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    || || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||  | |||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51476230 tgttgctatgttgcaagttgtttatgttgttctctctactgttgttga--ttattaatatcattaagctgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaa 51476133  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgt-ctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    | ||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51476132 gttgttgttccaagatattggagtcatataggttgttgaagttgtccaaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgat 51476034  T
Q  339 tccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  51476033 gccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag 51475986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 41227829 - 41228022
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  41227829 gttgggggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 41227928  T
Q  547 taagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||| | |||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41227929 taagttataatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatataatgatgt 41228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 633
Target Start/End: Original strand, 16059381 - 16059658
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      ||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  16059381 tacgttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgag------agtgtatttttgctcaatatgttgggggctt 16059474  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16059475 gatgccctgaattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 16059574  T
Q  557 ttt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||       |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16059575 tttgtcaatgagttgttaataaagaactaagcgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 16059658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 488 - 633
Target Start/End: Original strand, 24723757 - 24723909
Alignment:
Q  488 taagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatg 580  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||    
T  24723757 taagtagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcgttgatgttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatg 24723856  T
Q  581 tgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24723857 tgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 24723909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 423 - 624
Target Start/End: Original strand, 20634685 - 20634894
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  20634685 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggctttatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgtagagttaaagtt 20634784  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20634785 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaacgtgttattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatctttgttgttta 20634884  T
Q  615 tgttgttata 624  Q
    ||||||||||    
T  20634885 tgttgttata 20634894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20587671 - 20587465
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||  ||||     
T  20587671 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaatttgcatatgttgagtttaagtt 20587572  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttagt---tg---ttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587571 gtagaagtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcattt-gtcaatgagattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 20587473  T
Q  616 gttgttat 623  Q
    ||| ||||    
T  20587472 gttattat 20587465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20592209 - 20592003
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||  ||||     
T  20592209 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaatttgcatatgttgagtttaagtt 20592110  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttagt---tg---ttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592109 gtagaagtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcattt-gtcaatgagattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 20592011  T
Q  616 gttgttat 623  Q
    ||| ||||    
T  20592010 gttattat 20592003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Original strand, 19761998 - 19762141
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19761998 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtctctgctgctgttg-aatcattattgtcattaagttgcaa 19762096  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatt 259  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  19762097 gtg-tggactaagttgtaaagttgtaagttattattccaagatatt 19762141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 622
Target Start/End: Original strand, 7322051 - 7322231
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgtt 547  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  7322051 gttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgtt 7322150  T
Q  548 aagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    | ||||||| ||       | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7322151 atgttgtcaattatcaatgaattgttaatgaagaactatgtgaagtattaata-ttattaattgttgtggtttatgttgtta 7322231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 19675738 - 19675580
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  19675738 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 19675645  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  19675644 gatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 19675580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 422 - 621
Target Start/End: Original strand, 28194890 - 28195097
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  28194890 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 28194989  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28194990 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgccaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttggtt 28195089  T
Q  614 atgttgtt 621  Q
    || |||||    
T  28195090 atattgtt 28195097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 422 - 559
Target Start/End: Original strand, 35982120 - 35982257
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  35982120 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaagtc 35982219  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    | ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35982220 gttgaagttgcattgtcgttgtctttaagttgacattt 35982257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 42912036 - 42911878
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  42912036 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggttt 42911943  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  42911942 gatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 42911878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 438 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 51323310 - 51323117
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaa---gaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||   |  ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  51323310 tgctctataagttgggggcttgatgccttgattggtaccacatgcatgattaagttgttgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcat 51323211  T
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  51323210 tgtcgttgtcgataagttgtcaattatcaatgagttgttagtgaagaactatgtgaagtattaat-gttattaattgttgttgtttatgttgtta 51323117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Original strand, 4596912 - 4597070
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || |      |||||| |||||||   ||||||| ||||||    
T  4596912 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgctttggg------agtgtacttatgcttaatatgttgggggctt 4597005  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  4597006 gatgccctggattgataccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 4597070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 439 - 595
Target Start/End: Original strand, 14793526 - 14793689
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtc 538  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||    
T  14793526 gctcttaaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcttgtttaagttgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttattgtcgcattgtc 14793625  T
Q  539 gttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14793626 gttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatt 14793689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 423 - 559
Target Start/End: Original strand, 19762235 - 19762372
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||     
T  19762235 ctgtgagtataattatactctatatgttgagggctcgatgccctggttggtaccacatggatgattaagaagttgaagttgcatttgttgagtttaagtt 19762334  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19762335 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 19762372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 448 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 43542772 - 43542621
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  43542772 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgttgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 43542673  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaa 591  Q
    |||||||| ||||       ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43542672 taagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgcgaagtattaa 43542621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 513
Target Start/End: Original strand, 17903997 - 17904221
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctc 379  Q
    ||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |     || |||||||| ||||||| |    
T  17903997 gttgtctaagttgttggttgctgagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagcttat-----taagttgagggtttgatgccc 17904091  T
Q  380 tgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtacca 477  Q
    ||||||| |  ||||||| || | || | | ||||||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17904092 tgtgagcctatttgctctataagttgggggattgatgccctgtg------agtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtacca 17904185  T
Q  478 catccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  17904186 catgcatgattaagttattgcagttgcattgtcgag 17904221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 20636585 - 20636382
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||  ||||    
T  20636585 tctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgtatatgttgagtttaagt 20636486  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  20636485 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattgttgtct 20636386  T
Q  614 atgt 617  Q
    ||||    
T  20636385 atgt 20636382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20241814 - 20241656
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||  || |||    
T  20241814 tacgttgagggcttgatgtcctgtgagctttttctctttaagttgaggacttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttagggactt 20241721  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  20241720 gatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 20241656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 495 - 622
Target Start/End: Original strand, 17904231 - 17904364
Alignment:
Q  495 ttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagta 587  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17904231 ttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagta 17904330  T
Q  588 ttaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  17904331 tcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtta 17904364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13302109 - 13301795
Alignment:
Q  74 atatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| |   || || ||||||| ||| | || ||||||||    
T  13302109 atatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatgttgcaagtttttgatgttgtt 13302011  T
Q  172 gtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataa 271  Q
    |||| | | |||||| |  | |||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||    
T  13302010 gtcttttctgttgttta--ttattaatatcattaagttgcaagtattggtcaaagtcgctaagttgtaagttgttgttccaagatgttggagtcgtataa 13301913  T
Q  272 gttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct-tacgttgag 367  Q
    |||| ||  ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||   |||||||| || |||| |    
T  13301912 gttgttgaagttgtctaagttgttggttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggtttgatgccctatgagcctatttgctctataagttggg 13301814  T
Q  368 ggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  13301813 ggcttgatgccctgtgagc 13301795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 14238637 - 14238711
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14238637 gttgagggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgtattgtcgagtcaaagtcg 14238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18275241 - 18275122
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || | | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  18275241 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgtt 18275142  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  18275141 gttgtccctgctgttgttga 18275122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19676092 - 19675970
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aag 157  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| |||    
T  19676092 taatttgaaatacatatatttatgtgcaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaag 19675993  T
Q  158 atgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
     |||| |||||||||||||||||    
T  19675992 ttgttgtatgttgttgtctctgc 19675970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Original strand, 21046786 - 21046880
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctct 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  21046786 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctct 21046880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52983492 - 52983352
Alignment:
Q  50 atgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgat 147  Q
    |||||||| |||||| | |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||| || |    
T  52983492 atgttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgtt 52983393  T
Q  148 atgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52983392 atgttgcaagttgcttatgttgatgtctctgcagttgttga 52983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 294
Target Start/End: Original strand, 11809355 - 11809483
Alignment:
Q  165 tgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagt 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||    
T  11809355 tgttgttgtctctgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttacgaagttgtaagatgttgatccaaattattggagt 11809452  T
Q  265 catataagttgtg-gtgttgtctaagttgta 294  Q
    ||||| || ||||   |||||||||||||||    
T  11809453 catatgagatgtgtaagttgtctaagttgta 11809483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Original strand, 4596831 - 4596934
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  4596831 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctaggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 4596924  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  4596925 tgatgccctg 4596934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 41306112 - 41306208
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  41306112 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaattgttgttgtttaagttattat 41306208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 426 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 43697050 - 43696916
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgat 524  Q
    ||||| |||||| ||||  || |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |      
T  43697050 tgagtctatttacgctcaatacgttgggggcttgataccttggttagtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgta 43696951  T
Q  525 gatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43696950 gaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcattt 43696916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 46383074 - 46383170
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46383074 ttgtcgttatcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 46383170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 4596808 - 4596888
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4596808 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 4596888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Original strand, 41306028 - 41306117
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  41306028 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccttggttggtaccacaagcatgattaagaagttgaagttgcgttgtcg 41306117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 498
Target Start/End: Original strand, 46383019 - 46383072
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgt 498  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46383019 tatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgt 46383072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 439 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13301788 - 13301689
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtc 538  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || |||| || ||| ||||||||    
T  13301788 gctctatatgttg-gggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcaagatgatgtcgttgttgttgcattgtc 13301690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 279 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23967689 - 23967583
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  23967689 tgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagcttttgctcaacacgttgagggcttgatgc 23967592  T
Q  378 tctgtgagc 386  Q
     ||| ||||    
T  23967591 cctgggagc 23967583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16381152 - 16381042
Alignment:
Q  284 tctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtg 383  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || | |||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  16381152 tctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattt-atgttgagggcttgatgccttttgagtttttactctaccgttgagggcttgatgccctgtg 16381054  T
Q  384 agcttttgctct 395  Q
    |||||| |||||    
T  16381053 agctttagctct 16381042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18270587 - 18270468
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||| || | | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  18270587 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatttacgttgttatgttgcaagttgtttatgtt 18270488  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  18270487 gttgtccctgctgttgttga 18270468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 43690459 - 43690366
Alignment:
Q  531 gcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43690459 gcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattgttgtttatgt 43690366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 20241895 - 20241792
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  20241895 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 20241802  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||| ||||    
T  20241801 tgatgtcctg 20241792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 16059051 - 16059120
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  16059051 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 16059120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19675840 - 19675760
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19675840 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggtttgattccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgc 19675760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20241918 - 20241838
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  20241918 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggcttgatgc 20241838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42912139 - 42912059
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42912139 ttgttgagtccatgcgtactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcattaagttgagggcttgatgc 42912059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 4596582 - 4596678
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  4596582 gaaaaggtatgatatagaaactaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgc 4596678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20587993 - 20587897
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  20587993 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgc 20587897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20592531 - 20592435
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  20592531 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgc 20592435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 520
Target Start/End: Original strand, 21534178 - 21534253
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  21534178 tatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacattcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 21534253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 35088416 - 35088332
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  35088416 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgacgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 35088332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 21238693 - 21238642
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggta 474  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21238693 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggta 21238642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 508
Target Start/End: Original strand, 21240311 - 21240393
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattg 508  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||    
T  21240311 ctgtgagtatatttatgctctatatgttggggacttgatgtcgtggttggtaccacatgcatgatt---atgttgtagttgcattg 21240393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 42912116 - 42912014
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| |||       |||| ||||||||||   || ||||||||||    
T  42912116 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcattaagttgagggcttgatgccctg-------gagtttatttatgcttaatacgttgagggct 42912024  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  42912023 tgatgccctg 42912014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 48300779 - 48300720
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  48300779 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtggttgcatt 48300720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Original strand, 16059300 - 16059403
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  16059300 ttacgttgagggcatgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 16059393  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||| ||||    
T  16059394 tgatgtcctg 16059403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 16059277 - 16059357
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16059277 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcatgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 16059357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21238641 - 21238511
Alignment:
Q  498 tagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtatta 590  Q
    ||||||||||||||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  21238641 tagttgcattgtcgaggtgatgtcgttgttgtcgcattgacgttgttgttaagttgtcaattatcaatgagttgttaatgaagaactatatgaagaatta 21238542  T
Q  591 atatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||| |||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  21238541 ata-ttattaattgatgttgtctattttgtta 21238511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23073146 - 23073077
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  23073146 tcattaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttctaagatgttgatccaaattattggagtcatat 23073077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 42912365 - 42912296
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  42912365 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 42912296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 47190447 - 47190375
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  47190447 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 47190375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 52954629 - 52954701
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  52954629 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 52954701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18120510 - 18120438
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  18120510 tgctctataagttgggggcttgttgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtagttgtcgttgcattgtc 18120438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 20634372 - 20634468
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  20634372 gaaaaggcatgatataaaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgc 20634468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 174
Target Start/End: Original strand, 21239966 - 21240081
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaaga 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||     
T  21239966 taatttgaaatacatatattatgtgaatgttgtatgttgtagaaatatttgttgttcatatcattcaagttgttattgttgatgttgttatgttgcaagt 21240065  T
Q  159 tgtttatgttgttgtc 174  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  21240066 tgtttgtgttgctgtc 21240081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22118622 - 22118547
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  22118622 gttgagggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 22118547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Original strand, 41227441 - 41227523
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt--aagatgtttat 165  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  || ||| || ||||||||  |||||||||||    
T  41227441 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaatttgttatcattaatgatgctatgttgtgaaagatgtttat 41227523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 50622256 - 50622331
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  50622256 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcg 50622331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 378
Target Start/End: Original strand, 4596915 - 4596969
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  4596915 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgct 4596969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16381039 - 16380970
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16381039 ctgtgagtatattaatactctt-atgttgagggattgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 16380970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20316224 - 20316151
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  20316224 gttgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 20316151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 494
Target Start/End: Original strand, 21043571 - 21043640
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21043571 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 21043640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 26064748 - 26064703
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  26064748 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 26064703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42912033 - 42911980
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42912033 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 42911980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 50686458 - 50686413
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50686458 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatacatgattaaga 50686413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 19675817 - 19675716
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |        |||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  19675817 ttacgttgagggtttgattccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccc--------tgagagtatttatgctcaatacgttgagggct 19675726  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  19675725 tgatgccctg 19675716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 328
Target Start/End: Original strand, 19762147 - 19762195
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttg 328  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19762147 gttgtctaagttgtacgttattgagtctatgcatactcatttgaagttg 19762195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14800504 - 14800387
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||   |||||| |||||||||    
T  14800504 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagctcgtgcatactcattt-aagttgagggtttgatgccctgggagtctttgctcaacacgttgggggcttgat 14800406  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc 394  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14800405 gccctgtgagcttttgctc 14800387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14809378 - 14809261
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||   |||||| |||||||||    
T  14809378 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagctcgtgcatactcattt-aagttgagggtttgatgccctgggagtctttgctcaacacgttgggggcttgat 14809280  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc 394  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14809279 gccctgtgagcttttgctc 14809261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 241
Target Start/End: Original strand, 22131090 - 22131129
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22131090 attaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 22131129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 50614428 - 50614503
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  50614428 gttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcg 50614503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20316548 - 20316470
Alignment:
Q  216 gttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgt 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20316548 gttggtctaaattgtaaagttgtaagttatcgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtctaagttgt 20316470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 455 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 23967558 - 23967492
Alignment:
Q  455 gcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  23967558 gcttgatgccctgtattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 23967492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 386
Target Start/End: Original strand, 24720764 - 24720851
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  24720764 gagtccatgcatactcatta-aagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgagc 24720851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 51274672 - 51274727
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  51274672 gttgagggcttgatgcc----ttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 51274727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 16059384 - 16059437
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16059384 gttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 16059437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19675735 - 19675682
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  19675735 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgc 19675682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20957993 - 20957952
Alignment:
Q  454 ggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20957993 ggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 20957952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Original strand, 21181073 - 21181166
Alignment:
Q  92 tatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttg 184  Q
    |||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||    
T  21181073 tatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgctgttg 21181166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48300997 - 48300936
Alignment:
Q  216 gttggtctaagttgta-aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  48300997 gttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagttgt 48300936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48520307 - 48520243
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctg 344  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  48520307 tgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatgctcattt-aagttgagggcttgatgccctg 48520243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 51274461 - 51274510
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  51274461 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 51274510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 7792593 - 7792697
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtta-tatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| |||    
T  7792593 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctttgctgtt 7792692  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  7792693 gttga 7792697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12271477 - 12271441
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12271477 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 12271441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18823929 - 18823813
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| |||| || || ||  || ||||||| ||| || |||||||| |    
T  18823929 atatattatgtggaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatgttgcaagttgcttatgttgct 18823830  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||| ||||||||    
T  18823829 gtctctgctgttgttga 18823813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 22825912 - 22825956
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22825912 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 22825956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 458 - 510
Target Start/End: Original strand, 28477878 - 28477930
Alignment:
Q  458 tgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  28477878 tgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgtcgttgcattgtc 28477930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 84 - 634
Target Start/End: Original strand, 19386 - 19939
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  19386 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgatgt 19485  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||    
T  19486 tgttgaac-cattattgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttattattccaagatattggagtcata--agttgtggagtt 19582  T
Q  283 gtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgt 382  Q
    || |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19583 gtttaagttgtatgttgtctagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgccctgt 19682  T
Q  383 gag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccac 478  Q
    |||     || ||||||||||| |||| |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19683 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccac 19776  T
Q  479 atccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacga 571  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  19777 atgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcactgatgtcgtattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacga 19876  T
Q  572 agaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19877 agaactatgagaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 19939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 165)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 84 - 633
Target Start/End: Original strand, 14642292 - 14642841
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||  | ||||| ||    
T  14642292 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgtgttttctgctgt 14642391  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  14642392 tgttgaac-cattattgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga-tcatataagttgtgaagtt 14642489  T
Q  283 gtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgt 382  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642490 gtctaagttgtacgtttttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgt 14642589  T
Q  383 gagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatcc 482  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14642590 gagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgc 14642682  T
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaaga 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||    
T  14642683 atgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaaga 14642782  T
Q  575 actatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14642783 actaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatgagatgatgt 14642841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 84 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 6158707 - 6158159
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||    
T  6158707 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctgttgt 6158608  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  6158607 tgttgaac-cattattgtcattaagttgaaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga-tcatataagttgtgaagtt 6158510  T
Q  283 gtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgt 382  Q
     |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6158509 atctaagttgtacgtttttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgtcgtgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgttctgt 6158410  T
Q  383 gagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatcc 482  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6158409 gagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttaagggcttgatgccctggttggtaccacatgc 6158317  T
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaaga 574  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||    
T  6158316 atgattaaaaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaaga 6158217  T
Q  575 actatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  6158216 actaagtgatgtattaatatttattaatcgtggttgtttatgttattatgagatgatg 6158159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 114 - 631
Target Start/End: Original strand, 12512591 - 12513109
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  | ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12512591 ttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttatgtttctatctctgttgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 12512689  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  12512690 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgatattccaagatattggagtcatataagttgtagagttgtctaagatgtacgttgttgagtccatgcat 12512789  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgat 413  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  12512790 actcattttaagttgagggattgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagctttttctctttaagttgagggcttgat 12512889  T
Q  414 gctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcga 512  Q
    ||       |||||| | || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || || ||||||  |||||||| ||| ||    
T  12512890 gc------cctgtgattataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgtttggtaccacatgcaagaatacgaagttaaagttgcatatgttga 12512983  T
Q  513 gtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgt 605  Q
    ||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||||||       |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512984 gtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagtagtcatttgtcaatgagttattaataaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgt 12513083  T
Q  606 tgttgtttatgttgttatatgatgat 631  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12513084 tgttgtttatgttgttatacgatgat 12513109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 260 - 633
Target Start/End: Original strand, 42327235 - 42327610
Alignment:
Q  260 tgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-t 358  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |    
T  42327235 tgagtcatataagttgtggagttgtttaagttgtacgttgttgagttcatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctt 42327334  T
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||      ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||    
T  42327335 tacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------tctgtgagtataattatactctatatgttgagggctt 42327428  T
Q  459 gatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatt 558  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42327429 gatgctctgattggtaccacatacatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcgttggagtcgcattgtcgttgtcgttaagctgtcatt 42327528  T
Q  559 t-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42327529 tattaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 42327610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 85 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 16728598 - 16728048
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||        
T  16728598 gaaaatgtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctg---- 16728503  T
Q  183 tgttgaaatcattattg--tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt- 279  Q
      ||| | | ||||||   |||||||||||||   ||| ||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| || |||||| |      
T  16728502 --ttgtattgattattaaatcattaagttgcatatgttagtcaaggttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcacatgagttgttgaa 16728405  T
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16728404 gttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattcaaagttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgcg 16728305  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccac 478  Q
     |||||||||||||||||||   |||| | ||||||| |||||      ||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16728304 ttgtgagcttttgctctttaatttgagggtttgatgccctgtg------agtataattatactctttattttgagggtttgatgccctggttggtaccac 16728211  T
Q  479 atccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacga 571  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||||||    
T  16728210 atgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgggtcgaagtcgctgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagctgttaacga 16728111  T
Q  572 agaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16728110 agaactatgagaagtattaacatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgattatgtc 16728048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 85 - 633
Target Start/End: Original strand, 45531358 - 45531909
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  45531358 gaaaatgtatgatataaaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttattgtctctgctgt 45531457  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gt 281  Q
    | ||||  | ||| |  |||||||||||||   || |||| ||||||| |||| |||||  |||  |||||||| || ||||||||| |||||| |  ||    
T  45531458 tattga--ttatt-taatcattaagttgcatatgtaggtcaaagttgtcaagtcgtaagtagttgttccaagattttggagtcatatgagttgttgaagt 45531554  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctct 380  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45531555 tgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattggaagttgagggcttgatgccctatgagcttctgctctttaagttgagggcttgatgctct 45531654  T
Q  381 gtgagcttt----tgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtacc 476  Q
    |||||  |     | |||| |||| |||| ||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45531655 gtgagtataataatactctatatgttgagggcttgatgc-ct-----tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgccctggttggtacc 45531748  T
Q  477 acatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaac 569  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||     
T  45531749 acatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaat 45531848  T
Q  570 gaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45531849 gaagaactatgtgaagtattaatatttattaatc---gttgtttattttgttatatgatgatgt 45531909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 61 - 633
Target Start/End: Original strand, 19569040 - 19569612
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaaga 158  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| | ||  |||| ||| || |||| || |||     
T  19569040 taatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttattgctgttaatgttgttatgatgcaagt 19569138  T
Q  159 tgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatat 258  Q
    ||||  ||||| ||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  19569139 tgttattgttgctgtctctgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagtcgcaaagttgtaagttgtttttccaagatat 19569236  T
Q  259 ttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct 358  Q
    | ||||||||||||||  | |||   | ||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19569237 tggagtcatataagttaagttgtc--caaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctct 19569333  T
Q  359 t-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgaggg 455  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| || | |||| |||||||||  ||||      ||| || |||| |||| || ||||||||    
T  19569334 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgccatgtg------agtataattatactctataagttgaggg 19569427  T
Q  456 cttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19569428 cttgatgctctggttggtgccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgtcgcattgtcgttgtagttaagttgtc 19569527  T
Q  556 attt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||       ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19569528 atttatcaatgagttgttaaagaagaactatgtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttatgttataatatgatgatgt 19569612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 84 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 37038128 - 37037790
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||    
T  37038128 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctgttgt 37038029  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||    
T  37038028 tgttgaac-cattattgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga-tcatataagttgtgaattt 37037931  T
Q  283 gtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgt 382  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37037930 gtctaagttgtacgtttttgagtccatgcataatcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccctgt 37037831  T
Q  383 gag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgctctg 419  Q
    |||     || ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37037830 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgctctg 37037790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 415
Target Start/End: Original strand, 14153140 - 14153540
Alignment:
Q  20 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatata-ttatgt-gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14153140 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat 14153239  T
Q  118 atcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattatt--gtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||  ||||||      || || | ||||||||   |||||||||||||     
T  14153240 atcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttactgtctc------tgatgtattcattattaaatcattaagttgcat 14153333  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgca 312  Q
      ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||| |||||| || ||||| ||  |||||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  14153334 atgttagtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgtttcaagatattggagtcacatgagttgttgaagttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgca 14153433  T
Q  313 tactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctctttatgctgagagc 408  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||| |||| ||    
T  14153434 tactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggc 14153533  T
Q  409 ttgatgc 415  Q
    |||||||    
T  14153534 ttgatgc 14153540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 362 - 633
Target Start/End: Original strand, 14153446 - 14153718
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153446 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgt------gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 14153538  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt- 559  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14153539 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttg 14153638  T
Q  560 ------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
          |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14153639 tcactgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcggtgttgtttatgttgttatgagatgatgt 14153718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 362 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 37037888 - 37037616
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37037888 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 37037796  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt- 559  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37037795 gctctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagatgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttg 37037696  T
Q  560 ------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
          |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  37037695 tcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 37037616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 415
Target Start/End: Original strand, 50348786 - 50349173
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaag 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  50348786 tatgatgttattaatgattattgttgttggttaatgtgaaatacatgtatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataccattcaag 50348885  T
Q  128 atgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaag 226  Q
     ||||||| || ||| || ||||||||  || ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||  | ||||   |||||||||||||   ||| ||| |||    
T  50348886 ttgttattattaatgatgctatgttgt--gaagttgtatgttgctgtctctgctgta-ttga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttagtcaaag 50348979  T
Q  227 ttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaag 325  Q
    |||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50348980 ttgtcaagttttaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatattcatttgaag 50349079  T
Q  326 ttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||     || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  50349080 ttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgagggctagatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 50349173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20417432 - 20417089
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |    
T  20417432 atgattaatgttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaa 20417333  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20417332 tattgatatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaa 20417235  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgt-ctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    | ||||  ||||||||||| |||||||||  |||| ||  ||||| | ||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  20417234 gttgttgttccaagatattggagtcatatgggttgttgaagttgtccaaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttg-t 20417137  T
Q  339 tccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20417136 gccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag 20417089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 362 - 633
Target Start/End: Original strand, 50349079 - 50349351
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| ||||| || ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50349079 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggctagatgccctatg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 50349171  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt- 559  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50349172 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaaattgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttg 50349271  T
Q  560 ------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
          |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  50349272 tcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatacttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 50349351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 53646974 - 53647167
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  53646974 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 53647073  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53647074 taagttgtcatttatcaatgagttgttaaggaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatatgatgatgt 53647167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 426 - 631
Target Start/End: Original strand, 12506755 - 12506966
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatg 525  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||| |  |    
T  12506755 tgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgca-tgttgagtttaagttgtag 12506853  T
Q  526 atgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 618  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506854 aagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 12506953  T
Q  619 gttatatgatgat 631  Q
    |||||| ||||||    
T  12506954 gttatacgatgat 12506966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 424 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 15017634 - 15017423
Alignment:
Q  424 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |    
T  15017634 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttg 15017535  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  15017534 tagaggtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaataaagaactatgtga------aatatttattaatcgttgttgtttat 15017441  T
Q  616 gttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15017440 gttgttataagatgatgt 15017423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 42 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16059584 - 16059115
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt----g 136  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||    |    
T  16059584 aatgattaatgttgttggttattttgaaatacatatattatgtggaaagtgtatgatatagaaa-tgatgttgttaaatcattcaagttattattatcag 16059486  T
Q  137 ttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagtt 236  Q
    ||| |||    |||||||||| |||| |||||| ||| | ||  |||  |||  | |||| | || ||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  16059485 ttgttgc----atgttgtaagttgttgatgttgctgtttttgttgttaatga--ttattaatatccttatgttgcaagtgttggtaaaagttgcaaagtt 16059392  T
Q  237 gtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagctt 335  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||    
T  16059391 gtaagttgttgttccaagatattggaatcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgtgtacccattt-aagttgagggctt 16059293  T
Q  336 gattccctgtgagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||| |  |||  |||||||| |||||      ||    
T  16059292 gatgccctgtgagcctatttgctctactaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctatttacgtcgaggacttgatgccctgtg------ag 16059199  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16059198 tatatttatgctctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtaggtgcattgtcgag 16059115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 423 - 631
Target Start/End: Original strand, 41173430 - 41173646
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  41173430 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagtt 41173529  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41173530 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaacgagttattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 41173629  T
Q  615 tgttgttatatgatgat 631  Q
    |||||||||||||||||    
T  41173630 tgttgttatatgatgat 41173646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 362 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 46751979 - 46751791
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46751979 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttgagggtttgat 46751887  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  46751886 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcgtagatgttgcatagtcgttgttgataagttgtcat 46751791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17693262 - 17693056
Alignment:
Q  216 gttggtctaagttgta-aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||    ||||| |||||||||  |||| |||||||||||     
T  17693262 gttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttaatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagttgttgagtccatgcac 17693163  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgat 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  17693162 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttgtgctc-ttatgttgagggcttgat 17693064  T
Q  414 gctctgtg 421  Q
    || |||||    
T  17693063 gccctgtg 17693056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 22307738 - 22307931
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  22307738 gttgggggcttgatgccctggttgataccacatgcatgattaagaagttgaagtaacatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 22307837  T
Q  547 taagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22307838 taagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttattgtttatgttgttatatgatgatgt 22307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 424 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 9644427 - 9644219
Alignment:
Q  424 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcga 523  Q
    ||||||| || |||| || | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  9644427 tgtgagtataattatactttatatgttgagggcttgatgctctgtttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgattcgaagtcgt 9644328  T
Q  524 tgatgtcgcattgtcgtt--gtcgttaagttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    || | || ||||||||||  || || |  || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9644327 tggtttcacattgtcgttaagttgtcat-ttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 9644229  T
Q  622 atatgatgat 631  Q
    ||||||||||    
T  9644228 atatgatgat 9644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 362 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20417149 - 20416959
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||      ||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  20417149 gttgagggcttg-tgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtg------agtataattatactctatatgttgagggcttgat 20417057  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20417056 gctctggttggtaccacatgcatgattaagaatttgtagttgcattgtcgagttaaagttgttgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 20416959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 14507845 - 14507627
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  14507845 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccccggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 14507746  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14507745 gttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagatgttaatgaagaactatgtaaagtattaatatttattaatcgctgttattta 14507646  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14507645 tattgttatatgatgatgt 14507627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 16044724 - 16044260
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt----g 136  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||||    |    
T  16044724 aatgattaatgttgttggttattttgaaatacatatattatgcggaaagtgtatgatatagaaa-tgatgttgttaaatcattcaagttattattatcag 16044626  T
Q  137 ttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagtt 236  Q
    ||| |||    || ||||||| |||| |||||| ||| | ||  |||  |||  | |||| | || ||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  16044625 ttgttgc----atattgtaagttgtt-atgttgctgtttttgttgttaatga--ttattaatatccttatgttgcaagtgttggtaaaagttgcaaagtt 16044533  T
Q  237 gtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagctt 335  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  16044532 gtaagttgttgttccaagatattggaatcacataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcgtacccattt-aagttgagggctt 16044434  T
Q  336 gattccctgtgagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
    ||| |||||||||| |  |||||||  || |||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||| | |||| ||||||||| |||||      ||    
T  16044433 gatgccctgtgagcctatttgctctactaagttgaggggttgatgccctgtgagcctatttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg------ag 16044340  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgt 509  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16044339 tatatttatgttctatatgttgagggcttgatgtcctggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcattgt 16044260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 42 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16050198 - 16049732
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt----g 136  Q
    ||||||||||||||   |||| | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||    |    
T  16050198 aatgattaatgttg---gttattttgatatacatatattatgtggaaagtgtatgatatagaaa-tgatgttgttatatcattcaagttagtattatcag 16050103  T
Q  137 ttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagtt 236  Q
    ||| |||    |||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||  |||  | |||| | || ||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  16050102 ttgttgc----atgttgtaagttgttgatgttgttgtttttgctgttaatga--ttattaatatccttatgttgcaagtgttggtaaaagttgcaaagtt 16050009  T
Q  237 gtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagctt 335  Q
    ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  16050008 gtaagttgttgttccaagatattggaatcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcgtacccattt-aagttgagggctt 16049910  T
Q  336 gattccctgtgagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
     || || ||| ||| |  |||||||  || |||||||||||||||| | |||||| |  || ||||||| | |||| ||||||||| |||||      ||    
T  16049909 catgccttgtaagcctatttgctctactaagttgagggcttgatgccccgtgagcctattttctctttacgttgagggcttgatgccctgtg------ag 16049816  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16049815 tatatttattctatatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcattgtcgag 16049732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 290
Target Start/End: Original strand, 14250860 - 14251062
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    |||||| ||||| ||| |||| || | ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14250860 tgaaaatgtatgatatggaaattattattgttata--attcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgctgtt 14250957  T
Q  184 gttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttg 283  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  14250958 gttgaa-tcattatcgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaggttgtaagttgttattccaagatattgga-tcatataagttgtggagttg 14251055  T
Q  284 tctaagt 290  Q
    | |||||    
T  14251056 tttaagt 14251062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 17044037 - 17043819
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  17044037 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagtt 17043938  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17043937 gtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaattgttgttgttta 17043838  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  17043837 tgttgttatcagatgatgt 17043819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 264
Target Start/End: Original strand, 42324994 - 42325143
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42324994 ttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 42325092  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagt 264  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  42325093 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggagt 42325143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 249 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10562863 - 10562698
Alignment:
Q  249 tccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtga 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    |||||    
T  10562863 tccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtatgttgttgagtccttgcatactcatttgaagttgagggcttgatgttatgtga 10562764  T
Q  348 gcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgat 413  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  10562763 gcttttgctcttatgttgagggattgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgat 10562698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 377
Target Start/End: Original strand, 42353459 - 42353635
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||    
T  42353459 attaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgt 42353558  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgc 377  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42353559 tgagtacatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctttatgagcttttgctcttacgttgggggcttgatgc 42353635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 325 - 543
Target Start/End: Original strand, 11886774 - 11886989
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||| |  || ||||||| | |||| |||||||||| ||||    
T  11886774 gttgagggcttgatgccatgtgagcatttgctcttcacgttgtgggcttgataccctatgagcctattttctctttaagttgagggcttgatgctatgtg 11886873  T
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
          ||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11886874 ------agcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtt 11886967  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgt 543  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  11886968 gttgatgtcgcattgtcgttgt 11886989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 256 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 46752049 - 46751919
Alignment:
Q  256 tatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttg 354  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  46752049 tattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttg 46751950  T
Q  355 ctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46751949 ctcttacgttgagggcttgatgccctgtgag 46751919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 494 - 634
Target Start/End: Original strand, 35065806 - 35065953
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||       ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35065806 gttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgttaatgttgcattgtcgttgtcattaagttatcatttatcaataagttgttaacgatgaactatgtgaagt 35065905  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35065906 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatataatgatgtc 35065953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 450 - 544
Target Start/End: Original strand, 8492584 - 8492678
Alignment:
Q  450 tgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtc 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8492584 tgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcgttgatgtcgcatcgtcgttgtc 8492678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 445 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 12269242 - 12269058
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttg 542  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||| ||||||    
T  12269242 tatgttgggggcttcatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattttcgttg 12269143  T
Q  543 tcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgt 620  Q
    ||||| |||||||||||       |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12269142 tcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataatgaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgt 12269058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 422 - 621
Target Start/End: Original strand, 18440288 - 18440495
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  18440288 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgataaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 18440387  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18440388 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaatattaatatttattaatcgttgttggtt 18440487  T
Q  614 atgttgtt 621  Q
    ||||||||    
T  18440488 atgttgtt 18440495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 422 - 621
Target Start/End: Original strand, 19485362 - 19485569
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  19485362 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgataaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 19485461  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19485462 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaatattaatatttattaatcgttgttggtt 19485561  T
Q  614 atgttgtt 621  Q
    ||||||||    
T  19485562 atgttgtt 19485569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37427757 - 37427573
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||    
T  37427757 attaagttgaaaatgtcggtctaagttgtgaagtgttaagatgttgttccaaaatattggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagctgtaagttgt 37427658  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  37427657 tgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagtttagggtttgatgccctgtgag 37427573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 362 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37427634 - 37427483
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || | ||||||| |||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37427634 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagtttagggtttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctt-atgttgagggcttgat 37427542  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| |||||    
T  37427541 gccctggctggtaccacatgcatgattaagaagatgatgttgcatagtcaagttgaagt 37427483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 358 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 44269595 - 44269437
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  44269595 ttacgttgagggctttatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttg-gggct 44269503  T
Q  458 tgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  44269502 tgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 44269437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 11191831 - 11191690
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||       |||||||| ||| ||||||||||||     
T  11191831 gttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcggattgtcgttgttattaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaaaaactatgtgaagc 11191732  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11191731 attaatatt-attaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 11191690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 423 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 11191930 - 11191814
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  11191930 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtactacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcg 11191831  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcg 539  Q
     || ||| |||||||||    
T  11191830 ttgttgttgcattgtcg 11191814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 362 - 522
Target Start/End: Original strand, 2842522 - 2842677
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  2842522 gttgagggcttgatgccctttgagtttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgat 2842615  T
Q  462 gccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  2842616 gccatggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattttcgagtcaaagtcg 2842677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 6145998 - 6145796
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatg 525  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| ||    
T  6145998 tgagtatatttatgctctaaa-gttgggggcttgatcccctaattggtaccacatgcatgtttaagttgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttg 6145900  T
Q  526 atgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttg-tttatgt 617  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||       ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  6145899 ttgtcgcattgttgttgttgttaagttatcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaaggattaata-ttattaattgatgttgttttatgt 6145801  T
Q  618 tgtta 622  Q
    |||||    
T  6145800 tgtta 6145796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11258424 - 11258282
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | | || |||||||||  || |      |||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  11258424 tacgttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctttaagtttagggcttgatgccatggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggttt 11258331  T
Q  459 gatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11258330 gatgccatggttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 11258282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Original strand, 16180138 - 16180272
Alignment:
Q  501 ttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaata 593  Q
    ||||||||||||||  | |||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||       | |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16180138 ttgcattgtcgagtgaatgtcgttgttgttgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagatgttaatgaagaactatgtgaaatattaata 16180237  T
Q  594 tttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180238 tt-attaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 16180272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 562 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 19574745 - 19574676
Alignment:
Q  562 ttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgat 631  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19574745 ttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatacgatgat 19574676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35353556 - 35353398
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||| |      ||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  35353556 tacgttgaggacttgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgacggcttgatgccctggg------agtgtatgtatgctcaatatgttgggggctt 35353463  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  35353462 gatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 35353398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 483 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16049731 - 16049582
Alignment:
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaa 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||| || |||    
T  16049731 atgattaagatgttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgttgtagcattgtcgttactgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgatgaa 16049632  T
Q  576 ctatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatg 626  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16049631 ctatatgaagaattaata-ttattaattgatgttgtttatgttgttatatg 16049582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 539
Target Start/End: Original strand, 35065647 - 35065823
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  35065647 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 35065740  T
Q  459 gatgccct-ggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcg 539  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||| ||||||||  || |||| || ||| |||||||||    
T  35065741 gatgccctagattggtaccacatgcatgattcagttgtcgtagttgcatttgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgtcg 35065823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 464
Target Start/End: Original strand, 11886492 - 11886790
Alignment:
Q  161 tttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatattt 260  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||| | ||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  11886492 tttatgttgctgtctctgctgttattga--tcattaatatcatttaattggaggtgttggtctaagttgcaaagttgtaagttgttgttccaagatattg 11886589  T
Q  261 gagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt 359  Q
    |  || ||||||||| || ||||||||||||| ||  |||   ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  11886590 gcatcctataagttgttgatgttgtctaagttctaagttgctaagtccatgcatactcatat-atgttgagggcttgatgccatgtgagcatttgctctt 11886688  T
Q  360 -acgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggc 456  Q
     |||||| ||||||||| | || |||||   ||| ||||||| | |||| |||||||||      | ||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  11886689 cacgttgtgggcttgataccctatgagcctattttctctttaagttgagggcttgatgc------tatgtgagtataattatactctatatgttgagggc 11886782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5214837 - 5214760
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  5214837 tatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 5214760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16044252 - 16044106
Alignment:
Q  486 attaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaacta 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||| || ||||||    
T  16044252 attaagatgttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgttgtagcattgtcgttactgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgatgaacta 16044153  T
Q  579 tgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatg 626  Q
    | ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16044152 tatgaagaattaata-ttattaattgatgttgtttatgttgttatatg 16044106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 16059111 - 16058965
Alignment:
Q  486 attaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaacta 578  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||| || ||||||    
T  16059111 attaagatgttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgttgtagcattgtcgttactgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgatgaacta 16059012  T
Q  579 tgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatg 626  Q
    | ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16059011 tatgaagaattaata-ttattaattgatgttgtttatgttgttatatg 16058965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 453 - 621
Target Start/End: Original strand, 49390141 - 49390317
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||||||| |||    
T  49390141 gggcttgatgtcc-ggctggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgtatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagt 49390239  T
Q  552 tgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt-tatgttgtt 621  Q
    ||||||||       |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  49390240 tgtcatttgtcaatgagttattaatgaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgttatatgttgtt 49390317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 440 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17669202 - 17669132
Alignment:
Q  440 ctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669202 ctctatatgttgggggcttgatgccctggttggcaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtc 17669132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 41173108 - 41173344
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |     
T  41173108 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctg- 41173206  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttg-taaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtg 280  Q
    | |||  || ||||   |||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || |||    |    
T  41173207 tattg--attatta-aatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaag 41173303  T
Q  281 ttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcattt 321  Q
    |||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  41173304 ttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattt 41173344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 10562591 - 10562516
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  10562591 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 10562516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14441232 - 14441137
Alignment:
Q  428 agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  14441232 agtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgtatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 14441137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 445 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19574903 - 19574788
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgt 543  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||| |  || ||||||||||| ||||    
T  19574903 tatgttgagggtttgatgctctgcttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcattgt 19574804  T
Q  544 cgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||| |||||||||    
T  19574803 cgttaaattgtcattt 19574788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13179495 - 13179297
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgt-tg 139  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |    
T  13179495 atgattattgttgttggttaatttgagctacatatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcag 13179396  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
     || || ||||||| ||| |||| |||||| | ||| ||| |||||||  || |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  13179395 ttgttg-tatgttgcaagttgttgatgttgctatctttgctgttgttg--attattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaaagttgctaagttgta 13179299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 466
Target Start/End: Original strand, 2842438 - 2842540
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2842438 ttacgttgagggcttgatgccctatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatatgttgagggct 2842531  T
Q  458 tgatgccct 466  Q
    |||||||||    
T  2842532 tgatgccct 2842540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Original strand, 6469603 - 6469697
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6469603 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 6469697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 438 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 11562503 - 11562403
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||    
T  11562503 tgctctataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgaataagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgt 11562404  T
Q  538 c 538  Q
    |    
T  11562403 c 11562403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 35065317 - 35065413
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  35065317 gaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 35065413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 18700810 - 18700885
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  18700810 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 18700885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Original strand, 23395786 - 23395905
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || | | || ||| ||| ||| ||||||||||    
T  23395786 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattgcaagttgtttatgtt 23395885  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  23395886 gttgtctctgctgttgttga 23395905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31415111 - 31415052
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  31415111 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgtatgattaagaggttgtagttgcatt 31415052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 583 - 633
Target Start/End: Original strand, 14251059 - 14251109
Alignment:
Q  583 aagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14251059 aagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatatgatgatgt 14251109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 423 - 505
Target Start/End: Original strand, 17520081 - 17520163
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca 505  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17520081 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgca 17520163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 423 - 505
Target Start/End: Original strand, 17534878 - 17534960
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca 505  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17534878 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgca 17534960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Original strand, 35065566 - 35065669
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  35065566 ttacgttgagggcctgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 35065659  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  35065660 tgatgccctg 35065669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 519
Target Start/End: Original strand, 1465851 - 1465948
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaag 519  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  1465851 tctgtgagcctatttaagctcaataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgaataagaagttgaagttgcatagtcaagttgaag 1465948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Original strand, 28849083 - 28849177
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28849083 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtatttatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 28849177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 30175625 - 30175709
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  30175625 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 30175709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40806937 - 40806853
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  40806937 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 40806853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40811752 - 40811668
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  40811752 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 40811668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 42353620 - 42353695
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  42353620 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaaaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 42353695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 43890120 - 43890195
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  43890120 gttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 43890195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 507
Target Start/End: Original strand, 5206744 - 5206798
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  5206744 gggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 5206798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 276
Target Start/End: Original strand, 6805803 - 6805877
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  6805803 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgt 6805877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 522
Target Start/End: Original strand, 10542960 - 10543030
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  10542960 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 10543030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 429 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 15565496 - 15565410
Alignment:
Q  429 gtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15565496 gtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccatggattggtgccacatgcatgattaagaataagaagttgcattgtcgagt 15565410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 15977169 - 15977099
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15977169 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtatttatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 15977099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 21618157 - 21618062
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattta--------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21618157 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttatcaatggagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtatatgttgtt 21618062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 36166263 - 36166168
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattta--------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36166263 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttatcaaaggagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtatatgttgtt 36166168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Original strand, 45578319 - 45578389
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45578319 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattcttgtttatgttgtt 45578389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Original strand, 54331456 - 54331546
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  54331456 ctgtgagtataattatgctctatatgttgggggattgatgccctggttggtaccagatgcatgagtacgttgttgtagttgcatggtcgag 54331546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 2842199 - 2842268
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| || ||||||||    
T  2842199 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagtttttattattaatgatgctatgttgt 2842268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15245827 - 15245754
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||    
T  15245827 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagt 15245754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17207238 - 17207055
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--tt 390  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||||  || ||||||| ||||||||  ||||||| |  ||    
T  17207238 ttgttgagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgaggacttgatgccatgtgagcctattt 17207139  T
Q  391 gctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    ||||| || | |  | ||||||||| |||||      ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17207138 gctctataagtttggggcttgatgccctgtg------agtatatttatgctctatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 17207055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17669128 - 17668990
Alignment:
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaa 575  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  ||    
T  17669128 atgattaagatgtttaagttgcattgtcgagttgatgtcgatgttgttgcattgtcgttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaa 17669029  T
Q  576 ctatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  17669028 ctatgtgaagtatcaata-ttatttattgttgttgtttat 17668990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 22307320 - 22307389
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  22307320 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 22307389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 35065543 - 35065623
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35065543 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcctgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 35065623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 2842420 - 2842495
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2842420 gagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 2842495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 5206391 - 5206487
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  5206391 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgc 5206487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 5215159 - 5214922
Alignment:
Q  106 taatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagat-gtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcat 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||  ||||  | ||||   ||||    
T  5215159 taatgttgttataccattcaagttgttattatttatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctctgctgta-ttga--ttattaaa-tcat 5215064  T
Q  204 taagttgcaagagttggtctaagttgt-aaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtg 301  Q
    |||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || |||    ||||| |||||||||  | ||     
T  5215063 taagttgcatatgttggtc-aagttgttaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagtcgtt 5214965  T
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  5214964 gagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgt 5214922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 13523152 - 13523256
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  13523152 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctgctgtt 13523251  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  13523252 gttga 13523256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 617
Target Start/End: Original strand, 15076409 - 15076499
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15076409 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttattaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgt 15076499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 15932565 - 15932649
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15932565 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 15932649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 11258505 - 11258405
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||        || ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11258505 ttacgttgaaggcttgatgctctgtgaacttttgctctttaagttgagggcttgatgc------catgagagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 11258412  T
Q  458 tgatgcc 464  Q
    |||||||    
T  11258411 tgatgcc 11258405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 15448082 - 15448141
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  15448082 gttgagggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagagatcgtagttgcatt 15448141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 31225039 - 31225098
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31225039 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatacatgattaagaggtcatagttgcatt 31225098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 3394733 - 3394847
Alignment:
Q  76 atattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgt 173  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  3394733 atattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgt 3394832  T
Q  174 ctctgccgttgttga 188  Q
     ||||| ||||||||    
T  3394833 ttctgctgttgttga 3394847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9577515 - 9577441
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| ||||||||||    
T  9577515 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtc 9577441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 11562419 - 11562311
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || || | || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  11562419 gttgttgttgcattgtcaagtggatgttgttgttgtcgcattgtcgttgttgctaagttatcatttataaataagttgttaatgaagaactatgtgaagt 11562320  T
Q  587 attaatatt 595  Q
    |||||||||    
T  11562319 attaatatt 11562311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 17207022 - 17206895
Alignment:
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    ||||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||       |||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  17207022 gttgcattgtcgagttgatgttgattgtgtcgcattgtcgttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagtatcaat 17206923  T
Q  593 atttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  17206922 a-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 17206895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 535 - 632
Target Start/End: Original strand, 23431324 - 23431428
Alignment:
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatga 627  Q
    ||||||||||| |||||||||||||       |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||    
T  23431324 tgtcgttgtcgataagttgtcatttgtcaatgagttattaatgaagaattatgtggagtattaatatttattaattgttgttgtccatgttgtgataaga 23431423  T
Q  628 tgatg 632  Q
    |||||    
T  23431424 tgatg 23431428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11258782 - 11258713
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  11258782 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgt 11258713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14508166 - 14508097
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  14508166 gaaaaggtattatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 14508097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 17538071 - 17538002
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17538071 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaaga 17538002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44269618 - 44269538
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44269618 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggctttatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 44269538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44273789 - 44273720
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  44273789 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 44273720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 13031836 - 13031920
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13031836 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccttggttggttccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 13031920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 13520522 - 13520626
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||    
T  13520522 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgctgtt 13520621  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  13520622 gttga 13520626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17693114 - 17693054
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17693114 gttgagggcttgatgctctgtgagcttgtgctcttatgttgagggcttgatgccctgtgag 17693054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 452 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 12377765 - 12377694
Alignment:
Q  452 agggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  12377765 agggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcg 12377694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15206745 - 15206686
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||    
T  15206745 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcat 15206686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 154
Target Start/End: Original strand, 15932250 - 15932313
Alignment:
Q  91 gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  15932250 gtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 15932313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35353914 - 35353819
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| || ||  || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  35353914 gaaaatgtatgttatagaaaataatgttgttataccttttaagttgttattattaattatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctg 35353819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14519458 - 14519331
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc---ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgc 392  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||    
T  14519458 ttgtcgagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttcgctctatacgttgggggctcgatgccctgagagcttatgc 14519360  T
Q  393 tctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    ||| || | || | ||||||||| |||||    
T  14519359 tctataagttgggggcttgatgccctgtg 14519331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17538422 - 17538372
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt 135  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  17538422 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttgttatt 17538372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Original strand, 18367488 - 18367623
Alignment:
Q  75 tatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttg 172  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||| ||    
T  18367488 tatattatgtggaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttatgttgctg 18367587  T
Q  173 tctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttg 210  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||    
T  18367588 tctctgctgttgtt--aattattaatatcattaagttg 18367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11258528 - 11258448
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11258528 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgaaggcttgatgctctgtgaacttttgctctttaagttgagggcttgatgc 11258448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15264948 - 15264875
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||    
T  15264948 gttgagggattgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagt 15264875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17693383 - 17693314
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  17693383 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 17693314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 435 - 515
Target Start/End: Original strand, 19884584 - 19884665
Alignment:
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  19884584 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgcctttgattggtaccacatgcatgattaaaaagtcgaagttgcattgttgagtc 19884665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 452 - 520
Target Start/End: Original strand, 32404466 - 32404534
Alignment:
Q  452 agggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  32404466 agggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 32404534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 35065650 - 35065703
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35065650 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 35065703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 35353652 - 35353580
Alignment:
Q  305 tccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||||||||||| | |||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35353652 tccatgcatactcattt-acgttgatgacttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 35353580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 35353637 - 35353580
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  35353637 ttacgttgatgacttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 35353580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 9577600 - 9577534
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctg 344  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  9577600 tgttgtctaagttgtacacattgttgagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctg 9577534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 14818347 - 14818231
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || | | ||| ||| || |||||||| |    
T  14818347 atatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctgtattgcaagttgcttatgttgct 14818248  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||| ||||||||    
T  14818247 gtctctgctgttgttga 14818231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 511
Target Start/End: Original strand, 17259287 - 17259359
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||    
T  17259287 gctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgactaagtcgttgttgtcgcattgtcg 17259359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 52213206 - 52213322
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||| |||| | || ||| ||| ||| || ||||||||||    
T  52213206 atatattatgtggaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattgaagttgctattttgcaagttgcttatgttgtt 52213305  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    || ||||| ||||||||    
T  52213306 gtttctgctgttgttga 52213322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Original strand, 179437 - 179552
Alignment:
Q  75 tatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttat-atcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttg 172  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| | || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||    
T  179437 tatattatgtgcaaaatgtttgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttg 179536  T
Q  173 tctctgccgttgttga 188  Q
    | ||||| ||||||||    
T  179537 tttctgctgttgttga 179552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6146043 - 6146000
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 466  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6146043 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgaggacttgatgccct 6146000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 19884260 - 19884327
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgtt 152  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||    
T  19884260 gaaaatgtatgatatagaaaataatgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgtt 19884327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 423 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24545659 - 24545616
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 466  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24545659 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccct 24545616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 13919175 - 13919101
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  13919175 ttgagggcttaatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcg 13919101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15565619 - 15565494
Alignment:
Q  256 tatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttg 354  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  15565619 tattggagtcgtataagttgttgatgttgtccaagttgtatgttgtcgagtccatgcata--cattt-aagttaagggcttgatgccctg-gagcttttg 15565524  T
Q  355 ctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtg 383  Q
    |||   ||||| |||||||||||| |||||    
T  15565523 ctcaacacgttaagggcttgatgccctgtg 15565494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Original strand, 23413761 - 23413799
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23413761 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 23413799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Original strand, 37642588 - 37642626
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37642588 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 37642626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 45796776 - 45796738
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45796776 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 45796738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 556
Target Start/End: Original strand, 54331555 - 54331617
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54331555 gttgtcgttgcgttgtcaagttgatgtcgatgttgtcacattgtcgttgtcgtcaagttgtca 54331617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 315930 - 315885
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  315930 gttgagggcttgatgccctggattagtaccacatgcatgattaaga 315885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31415383 - 31415334
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  31415383 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 31415334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40807311 - 40807242
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| || ||| || ||||||||    
T  40807311 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattaaagttattattattaatgatgctatgttgt 40807242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 324157 - 324121
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  324157 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 324121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 127
Target Start/End: Original strand, 9511836 - 9511903
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaa-aaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaag 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9511836 taatttgaaatacatatattatgtgaatatggtatgttgtag-aaatattgttgttcatatcattcaag 9511903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 127
Target Start/End: Original strand, 9519811 - 9519878
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaa-aaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaag 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9519811 taatttgaaatacatatattatgtgaatatggtatgttgtag-aaatattgttgttcatatcattcaag 9519878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11192049 - 11191963
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||    
T  11192049 gagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgcccggtgagc 11191963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 11914214 - 11914250
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11914214 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 11914250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12469823 - 12469787
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12469823 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 12469787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14966091 - 14966055
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14966091 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 14966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17046233 - 17046197
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17046233 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 17046197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 17206842 - 17206799
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17206842 gaactatgtgaagtatcaatatt-attaattgttgttgtttatgt 17206799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Original strand, 17519594 - 17519706
Alignment:
Q  71 tacatatatt-atgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatg 166  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| || ||| || ||| |||| ||| |||| ||||    
T  17519594 tacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttatattgtgaagttgttgtatg 17519693  T
Q  167 ttgttgtctctgc 179  Q
    ||| |||||||||    
T  17519694 ttgctgtctctgc 17519706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Original strand, 17534456 - 17534568
Alignment:
Q  71 tacatatatt-atgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatg 166  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| || ||| || ||| |||| ||| |||| ||||    
T  17534456 tacatatatttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatgtggtcataccattcaagttgttattattaatgatgttatattgtgaagttgttgtatg 17534555  T
Q  167 ttgttgtctctgc 179  Q
    ||| |||||||||    
T  17534556 ttgctgtctctgc 17534568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 422 - 474
Target Start/End: Original strand, 20630530 - 20630582
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggta 474  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20630530 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggta 20630582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 43925769 - 43925725
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  43925769 gttgagggcttgatgcctggattggtaccacatgcatgattaaga 43925725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 50756447 - 50756491
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50756447 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 50756491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 52989920 - 52989956
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  52989920 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 52989956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 106)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 22259051 - 22259655
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22259051 tatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtt 22259150  T
Q  130 gttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagt 227  Q
    |||||| || ||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||  | ||||   |||||||||||||   ||||||| ||||    
T  22259151 gttattattaatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgta-ttga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttggtcaaagt 22259246  T
Q  228 tgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagt 326  Q
    ||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| || |||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  22259247 tgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcacatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattcaaagt 22259346  T
Q  327 tgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgt 426  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||||    
T  22259347 tgaaagcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgt 22259440  T
Q  427 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatg 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||| | ||    
T  22259441 gagtgtatttatgctctttatgttgaaggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaagtagaagttgcatttgtcgagtttaagttgttg 22259540  T
Q  526 atgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 618  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22259541 aagtcgcattgtcattgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgtt 22259640  T
Q  619 gttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||    
T  22259641 gttatatgatgatgt 22259655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 114 - 633
Target Start/End: Original strand, 42266365 - 42266885
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgca 212  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42266365 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgttttatgttgttgtttctgctgttgttgaac-cattattgtcattaagttgca 42266463  T
Q  213 agagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgca 312  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42266464 agtgttggtctaagttgtaaagctgtaagttgttattccaagatattaga-tcatataagttgtgaagttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgca 42266562  T
Q  313 tactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttg 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||     
T  42266563 tactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgcgcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagtttagggcttt 42266662  T
Q  412 atgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||      ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42266663 atgc------tctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgctctgtttggtaccatatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcg 42266756  T
Q  512 agtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcg 604  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266757 agtcgaaatcgttggtgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcg 42266856  T
Q  605 ttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266857 ttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 42266885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 271 - 623
Target Start/End: Original strand, 39695542 - 39695896
Alignment:
Q  271 agttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgaggg 369  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39695542 agttgtggagttgtttaagttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgaggg 39695641  T
Q  370 cttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggt 469  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||       |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39695642 cttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggctcgatgc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgctctggt 39695735  T
Q  470 tggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agt 562  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||       |||    
T  39695736 tggcactacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatatcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagt 39695835  T
Q  563 tgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39695836 tgttaatgaaaaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 39695896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17217942 - 17217424
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |    
T  17217942 aatgattaatgttgtcggttattttgaattacatatattatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatctaagttgttattattaa 17217843  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    || || ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||  |    
T  17217842 tgttgctatgttgcaagttgttttatgttgctgtctctgctgttgttgaatt-attaatatcattaagttgcaagtatcggtctaagttgcaaagttcaa 17217744  T
Q  240 agatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  17217743 agttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgatgagtccatgcatactcatat-aagttgagggcttgat 17217645  T
Q  339 tccctgtgagc--ttttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgt 432  Q
     ||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| | |||| |||||||||       |||||||| |    
T  17217644 gccctgtgagcctatttactctaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgtgagtat 17217551  T
Q  433 atttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgc 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  17217550 atttatgctctatatgttgagggcttgacaccctggttggtaccacatgcgtgattaagaagtcttagttgcattgtctagttgaagtcgttgatgtcgc 17217451  T
Q  533 attgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17217450 attgtcgctgtcgttaagttgtcattt 17217424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 114 - 512
Target Start/End: Original strand, 25849219 - 25849603
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || | ||||| |||||| ||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25849219 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctgtgttgcaagatggttatgttgccatctctgcagttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 25849317  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||        | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25849318 gtgttggtctaagttgtaa--------gttgttattccaaaatattggagtcatataagttgtggagttgtccaagttgtacgttgttgagtccatgcat 25849409  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttga 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  25849410 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttga 25849509  T
Q  413 tgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcga 512  Q
    |||       |||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25849510 tgc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtagaagttgcattgtcga 25849603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 42 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22244757 - 22244199
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgt-gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||| ||     
T  22244757 aatgattaatgttgttggttaat-taagctacatatattatgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattatta 22244659  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgt 238  Q
    ||| |  ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||  | |||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22244658 atgtttctatgttgcaagttgttttatgttgatgtctctgctgttattga--ttattaatatcattaaattgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgt 22244561  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttga 337  Q
    ||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||    
T  22244560 aagttgttgttccaagatcttggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcttactcatttaaagttgagggtttga 22244461  T
Q  338 ttccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtat 434  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||   ||||||||||| | |||  | |||||||       |||||||| |||    
T  22244460 tgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgataccatgtgagcctatttgctctttaagttgaatgtttgatgc------cctgtgagtatat 22244367  T
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  22244366 ttatgctctatatgttgggggtttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcattgatgtcgcat 22244267  T
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22244266 tgtcgttgtcgttaagttgtcatttttcaatgagttgttaatgaagtactatatgaagtattattatt 22244199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 559
Target Start/End: Original strand, 22584437 - 22584945
Alignment:
Q  47 ttaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgct 144  Q
    ||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||  |||||| || ||| |    
T  22584437 ttaatgttgttggttaatctaagctacatatattatgtgaaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgtt 22584536  T
Q  145 gatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatg 244  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||    
T  22584537 gctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttagtctaagttgcaaatttgtaagttg 22584634  T
Q  245 ttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtct-aagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccc 342  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  22584635 ttgttccaagatattggagtcatataggttgttgaagttgtctaaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccc 22584733  T
Q  343 tgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgct 441  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||       |||||||| || |||| ||    
T  22584734 tatgagctttagctctttacgttgagggtttgatgccctgtgagtttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgtgagtataattatact 22584827  T
Q  442 ctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgtt 541  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||    
T  22584828 ctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcataattaaaaagttatagttgtattgtcgagttgaagttgttgatgttacattgtcgtt 22584927  T
Q  542 gtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22584928 gtcattaagttgtcattt 22584945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 147 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23418575 - 23418186
Alignment:
Q  147 tatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgtt 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23418575 tatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctactgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaagtggtggtctacgttgtaaagttgtaagttgtt 23418477  T
Q  247 aatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtg 346  Q
    | |||||||| || ||||||||||||                 |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23418476 attccaagatgttggagtcatataag-----------------ttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtg 23418394  T
Q  347 agcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctcttt 445  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||       |||||||| || |||| |||| |    
T  23418393 agcttttgctctttatgttgagggcttgacgccctgtgagcttttactctttaagttgaggtcttgatgc------cctgtgagtataattatactctat 23418300  T
Q  446 atgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||| |||     
T  23418299 atgttgatggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtttaagaagttgatgtcgcattgtcgtagtct 23418200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 43 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23889078 - 23888565
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| || |    
T  23889078 atgattaatgttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattattaa 23888979  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    ||  | | ||||| ||| ||||||||||| |||||||   ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23888978 tgtagctgtgttgcaagttgtttatgttgctgtctctattgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaa 23888881  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgatt 339  Q
    | ||||  ||||||||||| || ||||||| |||| ||   ||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||     
T  23888880 gttgttgttccaagatattggattcatataggttgttgaatttgtccaagttgtaagttgctgagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatg 23888782  T
Q  340 ccctgtgagc--ttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtat 434  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||| | | |||| |||||||||       |||||||| |||    
T  23888781 ccctgtgagcctatttgctctttacgttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctcttaaagttgagggcttgatgc------cctgtgagtatat 23888688  T
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  23888687 ttatgctctatattatgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgttgtcgcat 23888588  T
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  23888587 tgtcgttgttgttaagttttcat 23888565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 355
Target Start/End: Original strand, 39695301 - 39695541
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  39695301 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgttgttgaac-cattattgtcatcaagttgcaa 39695399  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39695400 gtgttggtctaagttgtgaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatataagttgtggagttgtttaagttgtacgttgttgagtccatgcat 39695499  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgc 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39695500 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgc 39695541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 297 - 633
Target Start/End: Original strand, 20179484 - 20179823
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccct-gtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20179484 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc 20179582  T
Q  395 tttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    |||| | |||| ||||||||  ||     || ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20179583 tttaagttgagggcttgatgtcct-----tg-gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaag 20179676  T
Q  495 ttgtagttgcattg-tcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||| |||||||||  ||||||  |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  20179677 ttgaagttgcatttatcgagtttaagttgttgtagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 20179776  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20179777 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 20179823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 202 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 23669618 - 23669180
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||| |   |||||  |||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||   |||    
T  23669618 attatgttgcaagtgttggtctaagttacgaagttgtaagatttcgttccaaagtattggagtcatataagttggtgaagttgtccaagttgtaagctgt 23669519  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggctt-gatgctctgtgag----cttttgctct 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||    
T  23669518 tgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagctattgctcttatgttgagggctttgatgccctgtgagtgtacttatgctct 23669419  T
Q  396 ttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagt 495  Q
    | ||| |||| | ||||||| || |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23669418 t-atgttgagggtttgatgccctatgt----gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagt 23669324  T
Q  496 tgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagta 587  Q
    || |||| ||| ||| ||||  |||| |   | || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||   ||||||  ||||| ||    
T  23669323 tgaagttccatatgttgagtttaagttgtaaaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaatagagaacttggtgaaata 23669224  T
Q  588 ttaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgat 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23669223 ttaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttataagatgat 23669180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 439 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 22207140 - 22206940
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtc 538  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22207140 gctcttaaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgtcgcattgtc 22207041  T
Q  539 gttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgat 631  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22207040 gttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaattgttgttgtttatgtcgttataagatgat 22206941  T
Q  632 g 632  Q
    |    
T  22206940 g 22206940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 557
Target Start/End: Original strand, 13665324 - 13665673
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||  |||||| |||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||||    
T  13665324 attaagttgcaaatggtggtctaagttacaaagttttaagatgttgttccaaagcattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgt 13665423  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagctttt-gctcttta 398  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||| |    
T  13665424 tgagtccatgcatactcattg--agttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgaagccttgatgccctgtgagatttttgctctt-a 13665520  T
Q  399 tgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgt 498  Q
    || |||| ||||||||| |||||      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13665521 tgttgagggcttgatgccctgtg------agtgcatttatgctatttatgttgagggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgt 13665614  T
Q  499 agttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  13665615 agttgcattgtcgagttgaagtcgtagatgttgcatagtcgttgttgataagttgtcat 13665673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 557
Target Start/End: Original strand, 13724599 - 13724948
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||  |||||| |||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||||    
T  13724599 attaagttgcaaatggtggtctaagttacaaagttttaagatgttgttccaaagcattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgt 13724698  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagctttt-gctcttta 398  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||| |||||| |    
T  13724699 tgagtccatgcatactcattg--agttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgaagccttgatgccctgtgagatttttgctctt-a 13724795  T
Q  399 tgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgt 498  Q
    || |||| ||||||||| |||||      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  13724796 tgttgagggcttgatgccctgtg------agtgcatttatgctatttatgttgagggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgt 13724889  T
Q  499 agttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  13724890 agttgcattgtcgagttgaagtcgtagatgttgcatagtcgttgttgataagttgtcat 13724948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 208 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19699253 - 19698951
Alignment:
Q  208 ttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtc 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||| | ||  |||||||||||||||  |||| |||||    
T  19699253 ttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagtcgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtc 19699154  T
Q  307 catgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctg 403  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| ||| | ||    
T  19699153 catgcatactcatat-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctc-ttaagttg 19699056  T
Q  404 agagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttg 503  Q
    || |||||||||       |||||||| || |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19699055 agggcttgatgc------cctgtgagtataattatactttatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttg 19698962  T
Q  504 cattgtcgagt 514  Q
    |||||||||||    
T  19698961 cattgtcgagt 19698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 384
Target Start/End: Original strand, 17907666 - 17908012
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||     
T  17907666 aatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtggaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattatta 17907765  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgt 238  Q
    ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||  | ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  17907766 atgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctctgctgttgttga--ttattgatatcattaagttgcaaatgttagtctaagttgcaaagttgt 17907863  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataag-ttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttga 337  Q
    ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||  |||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  17907864 aagttgttgttccaagatattggagtcatataagtttctgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatgctca-ttaaagttgagagcttga 17907962  T
Q  338 ttccctgtgagc--ttttgc-tcttacgttgagggcttgatgctctgtga 384  Q
    | ||||||||||   ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17907963 tgccctgtgagcctatttgctttttaagttgagggcttgatgccctgtga 17908012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 42 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23947553 - 23947247
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| || |    
T  23947553 aatgattaatgtttttggttaat-tgagctacatatattatgtggaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaa 23947455  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    || || ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  23947454 tgttgctatgttgcaagttgttttatgttgctgtctctgctgttattga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagtcgta 23947357  T
Q  240 agatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23947356 agttgttgttccaagatattggagtcatataagttgatgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgat 23947257  T
Q  339 tccctgtgag 348  Q
     |||||||||    
T  23947256 gccctgtgag 23947247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 425 - 625
Target Start/End: Original strand, 31723824 - 31724030
Alignment:
Q  425 gtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgat 524  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  31723824 gtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagtggatgtcgtt 31723923  T
Q  525 gatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  31723924 gttgtcgcattgtcgttgttgttaagttatcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaata-ctattaatcgttattgtttatgt 31724022  T
Q  618 tgttatat 625  Q
    ||||||||    
T  31724023 tgttatat 31724030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 453 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 19127902 - 19127714
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19127902 gggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagacgttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagt 19127803  T
Q  552 tgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||| |||||       |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19127802 tgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 19127714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 232 - 522
Target Start/End: Original strand, 19929709 - 19929994
Alignment:
Q  232 aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgag 330  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19929709 aagttgtaagttgttgttccaaaatattggaatcatataagttgtcgacgttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttggg 19929807  T
Q  331 agcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||| || | |||| | ||||||| |||||      ||    
T  19929808 ggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgggggattgatgccctggcagcttttgctctataagttgagggtttgatgccctgtg------ag 19929901  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19929902 tgtatttatgctctt-atgttgaggggttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 19929994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 422 - 560
Target Start/End: Original strand, 20084626 - 20084764
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||    
T  20084626 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagttgacgtc 20084725  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta 560  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20084726 gttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcattta 20084764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 423 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23947253 - 23947117
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23947253 ctgtgagtatatttatactttatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgtatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcg 23947154  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23947153 ttgatgccgcattgtcgttgtcgttaagctgtcattt 23947117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 424 - 621
Target Start/End: Original strand, 36728403 - 36728606
Alignment:
Q  424 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcga 523  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||     
T  36728403 tgtgagtatatttatactctatatgttgagggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgaattgatgtcgt 36728502  T
Q  524 tgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatg 616  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| |||    
T  36728503 tgttgtcgcattgtcgttgttgttaagtcgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaggtattaata-ttattaattgttattgttgatg 36728601  T
Q  617 ttgtt 621  Q
    |||||    
T  36728602 ttgtt 36728606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 423 - 557
Target Start/End: Original strand, 17908007 - 17908141
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17908007 ctgtgaatatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcattgtcgagttgaagttg 17908106  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17908107 ttgttgtcgcattgtcgttgttgtcaagttgtcat 17908141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 448 - 609
Target Start/End: Original strand, 5083427 - 5083596
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||| ||||| ||    
T  5083427 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgttgttgttgt 5083526  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgtt 609  Q
    |||||||||||||       |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5083527 taagttgtcatttgtcaatgagttattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgtt 5083596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 444 - 633
Target Start/End: Original strand, 18302947 - 18303144
Alignment:
Q  444 ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttg 542  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||| |    
T  18302947 ttatgttgagggctcgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgtcg 18303046  T
Q  543 tcgttaagttgtcattta------gttgttaacgaagaacta-tgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||||||        || |||  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18303047 tcgttaagttgtcatttatcaatgagtgataaaaaagaactattgtgaagtattaatgtttatcaatcgttgttgtttatgttattatatgatgatgt 18303144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 448 - 632
Target Start/End: Original strand, 41681761 - 41681953
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |   | |||||||||||||||||||    
T  41681761 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtataagtcgcattgtcgttgtcgt 41681860  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||||||||| ||       |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  41681861 taagttgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaatattaatatttattaatcgtggttgtttatgttattatgagatgatg 41681953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 422 - 620
Target Start/End: Original strand, 20983066 - 20983272
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  20983066 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 20983165  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20983166 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaataataatatttattaatcgttgttgttt 20983265  T
Q  614 atgttgt 620  Q
    |||||||    
T  20983266 atgttgt 20983272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 448 - 623
Target Start/End: Original strand, 29763909 - 29764093
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||| |||||||||    
T  29763909 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattttcgttgtcg 29764008  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    || |||||||||||       |||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29764009 ttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataatgaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttat 29764093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 423 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9162 - 9042
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  9162 ctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgattagtaccacatgcatgattaagaagttgcagttgcattgtcaagttgaagtcg 9063  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgt 543  Q
      |||||||||||||||||||    
T  9062 tcgatgtcgcattgtcgttgt 9042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 453 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 39833635 - 39833463
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||||||| |||    
T  39833635 gggcttgatgtcctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagt 39833536  T
Q  552 tgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    ||||||||       |||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39833535 tgtcatttgtcaatgagttattaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattgttgtttatgt 39833463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 448 - 632
Target Start/End: Original strand, 21580315 - 21580510
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccct-ggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||    
T  21580315 gttgagggcttgatgcccttggttggtatcacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcg 21580414  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaag-aactatgtgaagtattaata-tttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    ||||||||||| ||       |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  21580415 ttaagttgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaaactaagtgaagtattaatattttattaatcgtggttgtttatgttattatgagatgatg 21580510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 440 - 622
Target Start/End: Original strand, 20025343 - 20025531
Alignment:
Q  440 ctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcg 539  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  20025343 ctctatatgttgggggcttgatgccctgatgggtaccacatgcattattaagttgttgttgttgcattgtcgagttaatgtcgatgttgtcgcattgtcg 20025442  T
Q  540 ttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  20025443 ttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagtatcaata-ttatttattgtttttgtttatgttgtta 20025531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5760604 - 5760434
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||| |||||   ||||||| || ||||||| ||||||||  |||| ||    
T  5760604 aagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtc--ttaagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttga 5760507  T
Q  304 gtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  5760506 gtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgc 5760434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 348
Target Start/End: Original strand, 20084358 - 20084633
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtt-tatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| || |||| |  ||| |||| ||||||    
T  20084358 tacatatattatgtgaatattgtatgatata-aaaataatgttgttataccat-caagtggttattattaatgttgttatgattcaagttgttgtatgtt 20084455  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcata 268  Q
    ||||||||||| ||| ||||  | ||||   | |||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  20084456 gttgtctctgctgttattga--ttattaaatt-attaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcata 20084552  T
Q  269 taagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag 348  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  20084553 tgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatattcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgag 20084633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 359 - 520
Target Start/End: Original strand, 42818965 - 42819121
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | || | || |||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  42818965 tacgttgagggcttgatgctctgtgagctttttttctttaagtttagggttttatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 42819058  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  42819059 gatgccatggattggtaccacatgcatgattaagaagtcaaagttgcattgtcgagtccaagt 42819121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Original strand, 1323518 - 1323607
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1323518 tctgtgagcttatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttggagttgcgttgtcg 1323607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 446 - 539
Target Start/End: Original strand, 2717865 - 2717958
Alignment:
Q  446 atgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcg 539  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||||    
T  2717865 atgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgtcg 2717958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 320
Target Start/End: Original strand, 18302832 - 18302948
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  |||  ||    
T  18302832 aagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaggttgctga 18302931  T
Q  304 gtccatgcatactcatt 320  Q
    |||||||||||||||||    
T  18302932 gtccatgcatactcatt 18302948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 1323602 - 1323698
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1323602 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 1323698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 38550510 - 38550606
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38550510 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 38550606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 427 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 5760352 - 5760256
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  5760352 gagtgtatttatgctcaatacgttggggggttaatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 5760256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 520
Target Start/End: Original strand, 22253310 - 22253548
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  22253310 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctgggagcctttgctcaacacgttgggggcttgat 22253408  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggt 473  Q
    || ||| |||| ||| |||  || | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||    
T  22253409 gccctg-gagcctttactcaataagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggt 22253501  T
Q  474 accacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||| |||||    
T  22253502 accacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagttgaagt 22253548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 26219437 - 26219340
Alignment:
Q  531 gcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26219437 gcattgtcgttgtccttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 26219340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 531 - 621
Target Start/End: Original strand, 26225733 - 26225830
Alignment:
Q  531 gcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26225733 gcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaattagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatatattaatcattgttgtttatgttgtt 26225830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 13428567 - 13428663
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13428567 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 13428663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 538 - 623
Target Start/End: Original strand, 27472811 - 27472903
Alignment:
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27472811 cgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 27472903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Original strand, 13428483 - 13428572
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13428483 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgcactggttggtaccatatgcatgattaagaagttgaagttgcgttgtcg 13428572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 520
Target Start/End: Original strand, 22381877 - 22382117
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  22381877 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatccatactcattt-aagttgagggcttgatgccctaggagcatttgctcaacacgttgggggcttgat 22381975  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc-tttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgg-ttgg 472  Q
    || ||||||||||||||||   || | || | |||||||||        || ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22381976 gccctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgc------catgcgagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattgg 22382069  T
Q  473 taccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    || ||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  22382070 taacacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 22382117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 494 - 621
Target Start/End: Original strand, 2717941 - 2718074
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       | ||||||| ||  |||||||||||||    
T  2717941 gttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattactaatgacttgttaatgagaaactatgtgaagt 2718040  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2718041 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 2718074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Original strand, 20046624 - 20046718
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20046624 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgtcaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 20046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 20179258 - 20179350
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtct 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  20179258 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtct 20179350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24713162 - 24713078
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24713162 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 24713078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 498
Target Start/End: Original strand, 38550432 - 38550508
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgt 498  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38550432 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttgataccacatgcatgattaagaagttgt 38550508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22525368 - 22525293
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  22525368 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 22525293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 560 - 622
Target Start/End: Original strand, 22319173 - 22319234
Alignment:
Q  560 agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22319173 agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat-gttattaattgttgttgtttatgtagtta 22319234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 463
Target Start/End: Original strand, 42818884 - 42818983
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  42818884 ttacgttgagggattgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgagagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 42818977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 42818861 - 42818941
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42818861 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggattgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 42818941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 434 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21513259 - 21513183
Alignment:
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  21513259 tttatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgtcgttgcattgtc 21513183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 386
Target Start/End: Original strand, 45471427 - 45471513
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  45471427 gagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgccctgtgagc 45471513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 20502412 - 20502487
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  20502412 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 20502487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 456 - 507
Target Start/End: Original strand, 23944271 - 23944322
Alignment:
Q  456 cttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23944271 cttgatgcccttgttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 23944322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 511
Target Start/End: Original strand, 27472752 - 27472818
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  27472752 tatgttgggggcttgatgctctagttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcgttgtcg 27472818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 507
Target Start/End: Original strand, 33587132 - 33587186
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  33587132 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 33587186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Original strand, 42818644 - 42818738
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctct 177  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || | | ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  42818644 gaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagtttttattattaacgatgatatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctct 42818738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 621
Target Start/End: Original strand, 18820199 - 18820325
Alignment:
Q  501 ttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaata 593  Q
    |||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||| || ||||||||| |||       |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  18820199 ttgcattgtcgagttgatgtcgatgttatctcattgtcgttgttgtcaagttgtcaattactgatgagttgttaatgagaaactatgtgaagtatcaata 18820298  T
Q  594 tttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  18820299 -ttatttattgttgttgtttatgttgtt 18820325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19140080 - 19140011
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  19140080 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 19140011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 39936747 - 39936816
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  39936747 gaaaaggtatgatatagaaaataatgtggttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 39936816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 621
Target Start/End: Original strand, 4381945 - 4382082
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  4381945 gttgtcgttgcattgtcgagttgatgtcgatgttgttgcattgtcgttgttgtcaagttgtcaattattaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagt 4382044  T
Q  587 attaat--at-ttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  4382045 attaattaatattatttattgttgttgtttacgttgtt 4382082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 494
Target Start/End: Original strand, 6102752 - 6102823
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6102752 ctgtgagcctatttatgct-tatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 6102823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 515
Target Start/End: Original strand, 17086462 - 17086529
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggt-tggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17086462 gttgagggcttgatgccctgaaatggtaccacatgcatgattaagaagtt-aagttgcattgtcgagtc 17086529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 18833260 - 18833172
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  18833260 tatttacgctcaatatgttgggggcttgatgcctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 18833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 449 - 496
Target Start/End: Original strand, 19155199 - 19155247
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19155199 ttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtt 19155247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16799294 - 16799220
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  16799294 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagatgat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 16799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 510
Target Start/End: Original strand, 18820093 - 18820180
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||    
T  18820093 ctgtgagtatatttatgcactatacgttgggggcttgatgctctgattggtaccacatgcatatttaagtcgttgtcgttgcattgtc 18820180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 28397359 - 28397284
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  28397359 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagttgaagtcg 28397284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 38988270 - 38988199
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  38988270 gctcttaaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgtcgttgcattgtc 38988199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 39019367 - 39019296
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  39019367 gctcttaaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgtcgttgcattgtc 39019296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 39937146 - 39937205
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  39937146 gttgggggcttgatgccctggttgataccatatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 39937205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18760341 - 18760287
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||    
T  18760341 gggcttgatgccctggttggtactacatgcatgattaaggggtcgtagttgcatt 18760287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18833485 - 18833314
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |  |||| |||||   |||||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||    
T  18833485 aagttgtaggagttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccgaagtattggagtc--ttaagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgttga 18833388  T
Q  304 gtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| || || |||| |||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  18833387 gtctatgcatactcattt-aagttaagggcttgatgccatg-gagcctttgctcaattaagttgagggctggatgc 18833314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20454538 - 20454446
Alignment:
Q  97 tatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20454538 tatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgctgttgttga 20454446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 435 - 507
Target Start/End: Original strand, 22319058 - 22319130
Alignment:
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||    
T  22319058 ttatgctctacaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacattcatgtttaagttgttgttgttgcatt 22319130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 491
Target Start/End: Original strand, 45471560 - 45471612
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45471560 gctctatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaag 45471612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 9048 - 9017
Alignment:
Q  602 tcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9048 tcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 17439817 - 17439892
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  17439817 gttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcg 17439892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 424 - 467
Target Start/End: Original strand, 18820011 - 18820054
Alignment:
Q  424 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18820011 tgtgagtatatttatgctctatacgttgagggcttgatgccctg 18820054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 22963723 - 22963798
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  22963723 gttgagggtttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 22963798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22984090 - 22984019
Alignment:
Q  452 agggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  22984090 agggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 22984019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22995652 - 22995577
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  22995652 gttgagggcttgatgccctggattggtaccaaatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtagaagtcg 22995577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24352831 - 24352756
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  24352831 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcg 24352756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 491
Target Start/End: Original strand, 35027128 - 35027171
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35027128 ttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 35027171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 386
Target Start/End: Original strand, 4381736 - 4381824
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| || |||||||   |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4381736 gagtccatccatactcatttaaagttaagggcttgatgccttgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgagc 4381824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22473637 - 22473550
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||| ||||||||    
T  22473637 gagtccatgcatactcatta-aagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgagc 22473550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 21580080 - 21580129
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  21580080 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 21580129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 37515336 - 37515263
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggt-tggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  37515336 gttgggggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgatttagaagattaagttgcatagtcaagtcgaagt 37515263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 40493285 - 40493330
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  40493285 gttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgcatgattaaga 40493330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 633
Target Start/End: Original strand, 18303150 - 18303206
Alignment:
Q  578 atgtgaagtat-taatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18303150 atgtgaagtatatgatgtttatcaatcgttgttgtttatgtggttatatggtgatgt 18303206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 384
Target Start/End: Original strand, 18819846 - 18819932
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctgtga 384  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||   |||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18819846 gagtccatgcatactcatctaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgggggcttgatgccctgtga 18819932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 19808560 - 19808596
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19808560 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 19808596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 22238216 - 22238252
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22238216 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 22238252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22344043 - 22343999
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22344043 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 22343999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22352959 - 22352923
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22352959 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 22352923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22355703 - 22355659
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22355703 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 22355659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 44384867 - 44384903
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44384867 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 44384903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 107)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 114 - 634
Target Start/End: Original strand, 18389070 - 18389590
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  18389070 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctactgttgctgga-tcattattgtcattaagttgcaa 18389168  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18389169 gtgttgctctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga-tcttataacttgtgaagttgtctaagctgtacgttgttgagtccatgcat 18389267  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttga 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | || | ||||||    
T  18389268 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttgcgttgagggctagatgccctgtgatcttttgctctttaagttgggggcttga 18389367  T
Q  413 tgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcga 512  Q
    |||       |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18389368 tgc------cctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaggaagttgtagttgcattatcga 18389461  T
Q  513 gtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgt 605  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389462 gtcgaagtcgctgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgt 18389561  T
Q  606 tgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389562 tgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 18389590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 114 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 25045284 - 25044846
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||| || ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25045284 ttatatcattcaagttgttgttattgatgttgctatgttgcaagacgtttatgttgctgtttctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 25045186  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25045185 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcat 25045086  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgat 413  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||    
T  25045085 actcatttgatgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgaaattttgctctttaagttgagggcttgat 25044986  T
Q  414 gctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcga 512  Q
    ||       |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||    
T  25044985 gc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagctgaagttgcatatgttga 25044892  T
Q  513 gtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||  |||| |  || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25044891 gtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtc-ataagttgtcattt 25044846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 42 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 19358289 - 19357707
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  19358289 aatgattaa-gttgtt-gttaatttgagttacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattatta 19358192  T
Q  140 atgctgatatgttgtaa-gatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttg 237  Q
    ||| || |||||||||| | |||| ||||||| ||||||| | ||  |||   | ||||   |||||||||||||   |||||||        |||||||    
T  19358191 atgatgctatgttgtaaagttgttgtatgttgatgtctctactgta-ttg---ttattaaa-tcattaagttgcatatgttggtc--------aaagttg 19358105  T
Q  238 taagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttg 336  Q
    |||| ||||  || |||||||| |||||| || |||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  19358104 taagttgttgttctaagatattggagtcacatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattcaaagttgagggtttg 19358005  T
Q  337 attccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||      ||||||| || |    
T  19358004 atgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgctc------tgtgagtataat 19357911  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcatt 535  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||| |||| |||||||    
T  19357910 tatactttatatgttgagggtttgatgctctgtttggtaccacatgcatgattaagaaattgaagttgcattgtcaatttgaagtcg-tgatatcgcatt 19357812  T
Q  536 gtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgat 628  Q
    || |||||||||||||||| ||||       ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19357811 gttgttgtcgttaagttgttatttatcaatgagttgttaaagaagaactatgtgcattattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgac 19357712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5985439 - 5985100
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaa---gatgttattgtt 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||||| ||    
T  5985439 aatgattaatgttgttggttaatgtgaaattcatatattatgtgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttgttattatt 5985340  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatg-tttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttg 237  Q
    |||| || ||||| | ||| || ||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5985339 gatgttgctatgtggcaagttgttttctgttgctgtctctgttgttgttg-aattattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttg 5985241  T
Q  238 taagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttga 337  Q
    |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  5985240 taagttgttgttccaagatattggagtcatataa--------gttgtctaagttgtaagttgctaagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttga 5985149  T
Q  338 ttccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5985148 ttccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgatgcgctgtgag 5985100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 232 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 14693386 - 14693066
Alignment:
Q  232 aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgaga 331  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14693386 aagttgtaagttgttgtttcaagatattggagtcatatgagttgaagt--tgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatttgaagtcgagg 14693289  T
Q  332 gcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagt 430  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |      |||    
T  14693288 gcttgatgccctgtgatcatttgctctttacgttgggggcttgatgccttgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgccctgcg------agt 14693195  T
Q  431 gtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtc 530  Q
     || |||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||     
T  14693194 ataattatactatatatgttgagggtttgatgccctgtttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaggtcgttgatgtt 14693095  T
Q  531 gcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14693094 gcattgtcgttgtcgtaaagttttcattt 14693066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 557
Target Start/End: Original strand, 24815536 - 24815885
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||  |||| || ||||||||||| | | ||||||| ||||||||  ||||    
T  24815536 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataagttttcgatgttgtccaagttgtaagttgt 24815635  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24815636 tgagtccatgcatactcattc-aagttgagggcttgataccctgtgagctttggctccttacgttgacggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaa 24815734  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| ||| ||||| || |   ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24815735 gttgagggctcgatgccctat---tg---gtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgataccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgta 24815827  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    | | ||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  24815828 gctccatagtcgagttgaagtcttagatgttgcattgtcgttgttgataagttgtcat 24815885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 10897765 - 10897957
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgtt 547  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  10897765 gttgagggcttgatgttcaggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaaatcgttaatgtcgccttgtcgttgtcgtt 10897864  T
Q  548 aagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10897865 aagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatacgatgatgt 10897957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 439 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 25085375 - 25085173
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||||||    
T  25085375 gctcttaaagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgt 25085276  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatga 630  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25085275 cgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttattaatgaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatatgatga 25085176  T
Q  631 tgt 633  Q
    |||    
T  25085175 tgt 25085173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 27851922 - 27851351
Alignment:
Q  52 gttgttagttaatgtgaaatacatatattatgt-gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatat 149  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |   || || |||    
T  27851922 gttgttggttaatttgaaatacatatattatgtggaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttat 27851824  T
Q  150 gttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaat 249  Q
    |||| ||| | || |||||||||||| ||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||| ||||  |    
T  27851823 gttgcaagttattgatgttgttgtctttgctgttgtt--aattattaatatcattaagttgcaagtattggtcaaagtcgctaagttgtaagttgttgtt 27851726  T
Q  250 ccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag 348  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||  ||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  27851725 ccaagatgttggaatcgtataagttgttgaagttgtctaagttgttggttgctgagtccatgcatactcattt-aagctgagggcttgatgccctgtgag 27851627  T
Q  349 c--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctct 443  Q
    |   || |||||  | |||| ||||||||||| ||||||||   |||||||| || | || | |||||||||       |||||||  ||||   |||||    
T  27851626 cctattcgctctaaatgttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctatacgttgggggcttgatgc------cctgtgagcctatt--cgctct 27851535  T
Q  444 ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgt 543  Q
      |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||||||    
T  27851534 aaatgttg-gggcttaatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgaattgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgt 27851436  T
Q  544 cgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
     |||||||||||| ||       ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  27851435 tgttaagttgtcaattatcaaagagttgttaatgaagaacaatgtgaagaattaata-ttattaattgatgttgtctatgttgtta 27851351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 24782041 - 24782231
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  24782041 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 24782140  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| ||||       ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24782141 taagttgtaatttatcaatgagttgtta---aagaactatgggaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 24782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 5032475 - 5032693
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  5032475 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgataccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 5032574  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5032575 gttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaataactatatgaagtattaatatttgttaatcgttgttgttta 5032674  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5032675 tgttgttatatgatgatgt 5032693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 423 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 356979 - 356762
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  356979 ctgtgagcctatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagtt 356880  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  356879 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgtggttgttta 356780  T
Q  615 tgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  356779 tgttattatgagatgatg 356762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 362 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 5985161 - 5984973
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||| |||||      ||| || |||| || | |||||||||||||||||    
T  5985161 gttgagggcttgattccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgatgcgctgtg------agtataattatactatatatgttgagggcttgat 5985068  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5985067 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgttgagttgaagttgtttatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 5984973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 27860637 - 27860066
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| |       
T  27860637 atgattaatgttgttggttaaattgagatagatatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattatcag 27860539  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    || || ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||| | |||||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||    
T  27860538 tgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtattggtcaaagtcgctaagttgtaa 27860441  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattc 340  Q
    | ||||  |||||||| || || || |||||||||| |        |||||||   |||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  27860440 gttgttgttccaagatgttggaatcgtataagttgttg--------aagttgttggttgatgagtccaagcatactcattt-aagttgagggcttgatgc 27860350  T
Q  341 cctgtgagctttt--gctcttac-gttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
    ||||||||| | |  ||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||| || | || | ||||||||| |||||      ||  ||||    
T  27860349 cctgtgagcctattcgctctaaatgttgggggcttgatgccctgtgagcctctttgctctatacgttgggggcttgatgccctgtg------agcctatt 27860256  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcatt 535  Q
       |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  27860255 c--gctctaaatgttg-gggcttgatgccctggttggtaccacgtgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcatt 27860159  T
Q  536 gtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||       ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  27860158 gtcgttgtttttaagttgtcaattatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagaattaata-ttattaattgatgttgtctatgttgtta 27860066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 362 - 557
Target Start/End: Original strand, 24835060 - 24835248
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||| ||||      |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24835060 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgtgactgt------atttatgctctt-atgttgagggcttgat 24835152  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  24835153 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagctgcatagtcgagttgaagttgtagatgttgcattgtcgttgttgataagttgtcat 24835248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 448 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 24883378 - 24883195
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||    
T  24883378 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgt 24883279  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||||| ||       |||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24883278 taagttgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaacttggagaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttat 24883195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17306473 - 17306315
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  17306473 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 17306380  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17306379 gatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 17306315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 302 - 622
Target Start/End: Original strand, 18391269 - 18391584
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctt 396  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||||| || |||||||||||||||  |||||||| |  ||| |||     
T  18391269 gagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgtcctgtgagcatatttggtcta 18391367  T
Q  397 tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
    || | || | ||||||||| |||||      ||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  18391368 taagttgggggcttgatgccctgtg------agtatatttatgctctatatgttgggggcttgttgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgtt 18391461  T
Q  497 gtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtatt 589  Q
    ||||||| ||||||||||         ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  18391462 gtagttgaattgtcgagt---------tgatgtcgctttgtcgttgtggttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatatgaagagtt 18391552  T
Q  590 aatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||| |||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18391553 aata-ttattaattgatgttgtctatgttgtta 18391584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Original strand, 28653568 - 28653726
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  28653568 tacgttgagggcttgatgccccgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 28653661  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28653662 gatgccctggattggtacaacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 28653726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 25140812 - 25140671
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  25140812 gttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttatgttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 25140713  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25140712 attaatatt-attaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 25140671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 423 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 9974866 - 9974666
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  9974866 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagtt 9974767  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || |||||||||||||||||||||| |||||| ||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9974766 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaaattgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgtggttgttta 9974667  T
Q  615 t 615  Q
    |    
T  9974666 t 9974666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 453 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22500794 - 22500627
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||| |||||||    
T  22500794 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagttgtagaagtcgcattgtcgttgttgttaagt 22500695  T
Q  552 tgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 612  Q
    ||||| ||       ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22500694 tgtcaattgtcaacgagttgttaatgaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgtggttgtt 22500627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 453 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 22508728 - 22508561
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||| |||||||    
T  22508728 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagttgtagaagtcgcattgtcgttgttgttaagt 22508629  T
Q  552 tgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 612  Q
    ||||| ||       ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22508628 tgtcaattgtcaacgagttgttaatgaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgtggttgtt 22508561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 423 - 555
Target Start/End: Original strand, 21336814 - 21336946
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  21336814 ctgtgagcctatttatgctctatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcg 21336913  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  21336914 atgttgttgcattgtcgttgttgtcaagttgtc 21336946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44071844 - 44071506
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||      
T  44071844 atgattattgttgttggataatttgagatacatatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcgttcaagttgttattattag 44071746  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    || || ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||  || |||| | |||||||||||||||   ||||| |||| |  |||||||||    
T  44071745 tgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgctgttgttg--attattaatatcattaagttgcaagttatggtcaaagtcgctaagttgtaa 44071648  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgatt 339  Q
    | ||||  |||||||| ||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||     
T  44071647 gttgttgttccaagatgttgaagtcgtataagttgttgaagttgtctaagttgttggttgatgagtccatgcatactca-ttaaagttgagggtttgatg 44071549  T
Q  340 ccctgtgagc----ttttgctct-tacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||||    || |||||| |||||||||||||||||||    
T  44071548 ccctgtgagcccttttgtgctctatacgttgagggcttgatgc 44071506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 424 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25140910 - 25140821
Alignment:
Q  424 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25140910 tgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 25140821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 423 - 555
Target Start/End: Original strand, 21316824 - 21316956
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||   |||| |||| |||||||||| || ||||    
T  21316824 ctgtgagcctatttatgctctatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccagatgcatgattaagttattgttgttgtattgtcgagttgatgtcg 21316923  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21316924 atgttgtcgcattgtcgttgttgtcaagttgtc 21316956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 423 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 22689621 - 22689485
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  22689621 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgtatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaagtcg 22689522  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
     ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22689521 ttgaagttgtattgtcgttgtctttaagttgtcattt 22689485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 24834937 - 24835120
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||  |||| || ||||||||  ||| | | ||||| ||||||||  ||||    
T  24834937 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataaaatgtcgatattgtccaagttgtaagttgt 24835036  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtga 384  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  24835037 tgagtccatgcatactcattc-aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgtga 24835120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 297 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3538863 - 3538649
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttg 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||| |  |||    
T  3538863 ttgttgagtccatgcatactcatta-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgaggactttatgccctgtgagcctatttg 3538765  T
Q  392 ctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    |||| || | || |   |||||||||||||      ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3538764 ctctataagttggggatttgatgctctgtg------agtatatttatgctatatatgttgggggcttgatgccctggttgataccacatgcatgattaag 3538671  T
Q  492 aagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
      ||||||||||||||||||||    
T  3538670 ttgttgtagttgcattgtcgag 3538649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 338
Target Start/End: Original strand, 10897483 - 10897778
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt 138  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||| ||| ||||  |||||| ||    
T  10897483 aatgattaatgttgttggtaaatttgagctacatatatttatgtggaaaagatatgttatacaaaatattcatgtttataccatccaagtggttattatt 10897582  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttg 237  Q
     ||| || |||| |  ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||  | ||||   |||||||||||||    |||||| ||||||| ||||||    
T  10897583 aatgttgctatgattcaagttgttgtatgttgttgtctctgctgttattga--ttattaaa-tcattaagttgcatatattggtcaaagttgtcaagttg 10897679  T
Q  238 taagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtg-ttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttg 336  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10897680 taagttgtt---ccaagatattggagtcatatgagttgttgaggttgtctaagttgtaagttgttgagtctatgcatactcatttgaagttgagggcttg 10897776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Original strand, 10744007 - 10744096
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  10744007 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgcc-tggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttggattgtcgag 10744096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 432 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21367785 - 21367707
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21367785 tatttatgctctatacgttgtggggttgatgccctggttggtaccacatgcataattaagaagttgtagttgcattgtc 21367707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 363 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24515168 - 24515014
Alignment:
Q  363 ttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatg 462  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||      |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24515168 ttgagggcttgatgccctgtgagatttttctctttaagttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatg 24515075  T
Q  463 ccct-ggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
     ||| | |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  24515074 tcctagattggtaccacatgcatgactaagaaatcgaagttgcaatgtcgagtcaaagtcg 24515014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 438 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 44071490 - 44071389
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||    
T  44071490 tgctctatatgttgggggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagctgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgt 44071391  T
Q  538 cg 539  Q
    ||    
T  44071390 cg 44071389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 610
Target Start/End: Original strand, 10744111 - 10744227
Alignment:
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10744111 gttgcattgtcgagtgaatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaat 10744210  T
Q  593 atttattaatcgttgttg 610  Q
    | |||||||| |||||||    
T  10744211 a-ttattaattgttgttg 10744227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 448 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 26896226 - 26896168
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26896226 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcat 26896168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36839263 - 36839183
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36839263 ttgttgagtccatgcatactcattt-atgttgagagcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 36839183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 22688502 - 22688446
Alignment:
Q  577 tatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22688502 tatgtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttataagatgatgt 22688446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 559
Target Start/End: Original strand, 27039308 - 27039400
Alignment:
Q  468 gttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27039308 gttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 27039400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Original strand, 45030337 - 45030407
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45030337 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 45030407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 28576821 - 28576730
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 618  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28576821 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgtt 28576730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 7672559 - 7672642
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  7672559 ctgtgagcctatttatgct-tatacgttgagggcttgatgccctggttgataccacatgcatgattaagatgtcgtagttgcatt 7672642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9975243 - 9975147
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  9975243 gaaaatgtatggtatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaagttgttgtatgttgttgtctctgc 9975147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 19202315 - 19202399
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19202315 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 19202399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24435994 - 24435910
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24435994 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 24435910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 28653239 - 28653335
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  28653239 gaaaaggtatgatatagataataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 28653335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 20913147 - 20913206
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20913147 gttgagggcttgatgccctggttgataccacatacatgattaagaggtcgtagttgcatt 20913206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 22252756 - 22252815
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  22252756 gttgagggcttgatgccctggttggtagcacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 22252815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 22258813 - 22258682
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  22258813 gttgttgttgcattgtcgagttgttgtcgttgttgtcgcattgtcgtcgttgttaagttgtcaattaccaacaagttgttaatgaagaactatgtgaagt 22258714  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||| |||||||   || |||||||||||||||    
T  22258713 attaata-ttattaa---tttttgtttatgttgtta 22258682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34136915 - 34136799
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||   |||||| |||||||||    
T  34136915 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagccttcgctcaacacgttgggggcttgat 34136818  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc 394  Q
    || ||||||||||||||||    
T  34136817 gccctgtgagcttttgctc 34136799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Original strand, 5031867 - 5031917
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5031867 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttatt 5031917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 23969360 - 23969429
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  23969360 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgt 23969429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 617
Target Start/End: Original strand, 1384899 - 1385028
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  1384899 gttgtcgttgcattgtcgagttgatgtcgatgttgtcgcattgttgttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagt 1384998  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  1384999 atcaatattaatt-attgttgttgtttatgt 1385028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17306802 - 17306706
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17306802 gaaaaggtatgatatagaaaataatattgttataaaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 17306706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 18547257 - 18547332
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  18547257 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 18547332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22689814 - 22689684
Alignment:
Q  216 gttggtctaagttgta-aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||    || ||||||||||||    
T  22689814 gttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcat 22689715  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  22689714 actcattt-aagttgagggcttgatgccctgt 22689684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22694410 - 22694280
Alignment:
Q  216 gttggtctaagttgta-aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||    || ||||||||||||    
T  22694410 gttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcat 22694311  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  22694310 actcattt-aagttgagggcttgatgccctgt 22694280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 36839159 - 36839043
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||       ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  36839159 tacgttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttcatgc------cctgagagtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 36839066  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacat 480  Q
    ||| |||||| || |||||||||    
T  36839065 gataccctggatttgtaccacat 36839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 36839236 - 36839140
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||     || ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36839236 gttgagagcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc-ct-----tgagagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgat 36839143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 44071406 - 44071344
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44071406 gttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtca 44071344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 24781577 - 24781646
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  24781577 gaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 24781646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 27485207 - 27485276
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  27485207 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 27485276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 381
Target Start/End: Original strand, 28653465 - 28653548
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctg 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  28653465 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgag-gcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgatggtttgatgctctg 28653548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 43947639 - 43947712
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||    
T  43947639 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagt 43947712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24515501 - 24515405
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttg-taagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  || ||| || |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  24515501 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattgaagttgttatgattaatgatgctatgttgcgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 24515405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 465
Target Start/End: Original strand, 28653488 - 28653588
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||  | |||||||      |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  28653488 ttacgttgagg-cttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgatggtttgatgc------tctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 28653580  T
Q  458 tgatgccc 465  Q
    ||||||||    
T  28653581 tgatgccc 28653588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36839489 - 36839393
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgt-ttatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||    
T  36839489 gaaaatgtatgatatagaaaatagtgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtcgtatgttgttgtctctgc 36839393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3539084 - 3538946
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgata 148  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  3539084 tgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgtta 3538986  T
Q  149 tgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    ||||| ||| ||||  ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  3538985 tgttgcaagttgttgttgttgctgtcaatgctgttgttga 3538946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21115550 - 21115476
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggt-tggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  21115550 gttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 21115476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Original strand, 22252634 - 22252749
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  22252634 tgttgtccaagttgtacacgttgtggagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgataccctg-gagcctttgctcaacacgttgggggcttgat 22252731  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc 394  Q
    || ||| |||| |||||||    
T  22252732 gccctg-gagcctttgctc 22252749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22258887 - 22258828
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22258887 gttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagtcgttgttgttgcatt 22258828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 456 - 507
Target Start/End: Original strand, 23969787 - 23969838
Alignment:
Q  456 cttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23969787 cttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 23969838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 24865896 - 24865955
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  24865896 gttgagagcttgatgtactggttggtaccacatgcatgattaagatgtcgtagttgcatt 24865955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 480
Target Start/End: Original strand, 1384815 - 1384872
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1384815 ctgtgagtatatttatgctccatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 1384872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 20520465 - 20520510
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20520465 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 20520510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 21367687 - 21367626
Alignment:
Q  499 agttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta 560  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21367687 agttgaattgtcgagttgttgtcgatgttgtcgcattgtcgttgttgtcaagttgtcattta 21367626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21368153 - 21367919
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaa-aggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| || | || || |||| ||| || | ||||| |||||||||||||||| ||| ||      
T  21368153 atgattaatgttgttacttaatgtgaaatatttataatatgtggaagatgtttgatatataaattattattgtttatatcattcaagatgtcattattag 21368054  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgttta-tgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    || |||  ||||| | | | |||| ||||| || |||||| |||||   | | |||| | |||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  21368053 tgttgacttgttgcatgttatttaatgttgctgcctctgcggttgtg--atttattaatatcattaagatgcaaacgttggtctaagaagtaaagttgta 21367956  T
Q  240 agatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    |||||||  |||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  21367955 agatgttgttccaaattattggagtcatatgagttgt 21367919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 586 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 23285484 - 23285447
Alignment:
Q  586 tattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23285484 tattaatatttattaatcgttgttgtttatattgttat 23285447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Original strand, 1385176 - 1385223
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1385176 gaactatgtgaagtatcaatatt-atttatcgttgttgtttatgttgtt 1385223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17306576 - 17306497
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | |||  ||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  17306576 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgctgaaggcttgatgccttgtgagcttttgcttttaagttgagggattgatgc 17306497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20915252 - 20915208
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgtt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20915252 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtt 20915208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 6576141 - 6576094
Alignment:
Q  460 atgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  6576141 atgctctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 6576094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 21237581 - 21237506
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggt-tggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||  |||||||||||    
T  21237581 gttgagggcttgatgccctggaatggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagttaagtcgaagtcg 21237506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 23791083 - 23791008
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  23791083 gttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcg 23791008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34136771 - 34136676
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||    
T  34136771 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaagt 34136676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24515275 - 24515196
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   | |||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  24515275 ttgttgagtccatgcatactcattt--cgctgagggcttgatgccctctgagctttttctctttaagttgagggcttgatgc 24515196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Original strand, 43947510 - 43947611
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca---ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttg 373  Q
    ||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  43947510 tgttgtctaagttgtacaagtttattgagtccatgcatactca-ttaaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttg 43947607  T
Q  374 atgc 377  Q
    ||||    
T  43947608 atgc 43947611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14693521 - 14693472
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttat 134  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  14693521 gaaaatgtatgatatagaaaatattgatgttatatcattcaagttgttat 14693472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17306470 - 17306417
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  17306470 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgc 17306417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22694217 - 22694160
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694217 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacat 22694160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 24697838 - 24697883
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  24697838 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataaga 24697883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 28653571 - 28653624
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28653571 gttgagggcttgatgccccgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 28653624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 39828268 - 39828313
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39828268 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 39828313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17306491 - 17306451
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  17306491 gagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctg 17306451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 18787214 - 18787287
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  18787214 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 18787287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 21081934 - 21081970
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21081934 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 21081970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 22459760 - 22459796
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22459760 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 22459796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 23069481 - 23069517
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23069481 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 23069517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 23707486 - 23707522
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23707486 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 23707522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 326 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 24515168 - 24515108
Alignment:
Q  326 ttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  24515168 ttgagggcttgatgccctgtgagatttttctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag 24515108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24670918 - 24670882
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24670918 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 24670882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24918033 - 24917997
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24918033 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 24917997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25141031 - 25140944
Alignment:
Q  262 agtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc 349  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  25141031 agtcatataagttgttgaagttgtctaagttgttggttgttgagtccatccatactca-ttaaagttgagggcttgatgcgctgtgagc 25140944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 25587815 - 25587859
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25587815 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 25587859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27472342 - 27472306
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27472342 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 27472306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 34874410 - 34874446
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34874410 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 34874446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 157)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 114 - 633
Target Start/End: Original strand, 36705441 - 36705963
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36705441 ttatatcattcaagttgttattgttcatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 36705539  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgca 312  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  36705540 gtattggtctaagttgtaaagttgtgagttgttattccaagatattggagtcatataagttgtgggagtcgtctaagttgtacgttgttgagtccatgca 36705639  T
Q  313 tactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttg 411  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||    
T  36705640 tactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttg 36705739  T
Q  412 atgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtc 510  Q
    ||||      ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||     
T  36705740 atgc------tctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgattggtaccacaagcatgattaagaagttgaagttgcatatgtt 36705833  T
Q  511 gagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatc 603  Q
    ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36705834 gagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttatcatttatcaatgagttgttaataaagaactatgtgaattattaatatttattaatc 36705933  T
Q  604 gttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36705934 gctgttgtttatgttgttatatgatgatgt 36705963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 114 - 559
Target Start/End: Original strand, 10660032 - 10660466
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10660032 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttacgttgctgtctttgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 10660130  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |     ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10660131 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagtttt-----caagatattggagtcatataagttgtggagttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcat 10660225  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttga 412  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||  |||||    
T  10660226 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgacgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggtcttga 10660325  T
Q  413 tgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcga 512  Q
    |||      | ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10660326 tgc------tttgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattatcga 10660419  T
Q  513 gtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10660420 gttaaagttgttgatgtcgcattgtcgttgtctttaagttgtcattt 10660466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 61 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 33001295 - 33000799
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatg 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| | || || || | | || ||||||| ||| ||    
T  33001295 taatttgagatacatatattatgtgaaaatgtatgatatagaaaattatgttgttgtatcatccaagttattgttattaacgttgctatgttgcaagttg 33001196  T
Q  161 ttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatt 259  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  33001195 ttttatgttgctgtctctgctgttgttgaag-cattaatatcattaagttgtaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttgtttcaagatatt 33001097  T
Q  260 tgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgc-tc 357  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||    
T  33001096 ggagtcatataagttgttgaagttgtctaaattgtaagttgctgagtccatgcatactcatataaagttgagggcttaatgccctgtgagcctttgcttc 33000997  T
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgaggg 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||| || | |||| ||||||||| ||     ||||||| || || | |||| |||||||||||    
T  33000996 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgc-ct-----tgtgagtataattgtactctatatgttgaggg 33000903  T
Q  456 cttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33000902 cttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaggttgttgatgtcgcattatcgttgtcgttaagttgtc 33000803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 42 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15281616 - 15281099
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |    
T  15281616 aatgattaatgttgttggttattttgaattacatatattatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgttattata-a 15281518  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgttta-tgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    || || ||||||| ||| |||||| || ||||||||||||   ||||||| | |||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15281517 tgttgctatgttgcaagttgtttaatggtgttgtctctgctagtgttgaatt-attaatatcattaagttgcaagtgtcggtctaagttgcaaagttgta 15281419  T
Q  240 agatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  15281418 agttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtctaagtcgtaagttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttaat 15281320  T
Q  339 tccctgtgag-ct-tttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgt 432  Q
     ||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||   ||||||||||| | |||| |||| ||||       |||||||| |    
T  15281319 gccctgtgagtctatttgctctactacgttgagggcttgatgtcgtgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttaatgc------cctgtgagtat 15281226  T
Q  433 atttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgc 532  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15281225 atttaagctctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaaattgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgtcgc 15281126  T
Q  533 attgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15281125 attgtcgttgtcgttaagctatcattt 15281099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 85 - 634
Target Start/End: Original strand, 37785102 - 37785646
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| | ||    
T  37785102 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctactgt 37785201  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gt 281  Q
      ||||  | ||||   |||||||||||||   ||| ||| |  |||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| || |||||| |  ||    
T  37785202 a-ttga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttagtcaagattgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcacatgagttgttgaagt 37785297  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctct 380  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  37785298 tgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaaagttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttacattgagggcttgatgcact 37785397  T
Q  381 gtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||||||||||||| | |||   ||||||| ||     | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37785398 gtgagcttttgctctttaagttgatgacttgatg-tc-----ccgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 37785491  T
Q  481 ccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgtt--gtcgttaagttgtcatttagttgttaacgaagaacta 578  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || | | | || ||| | |||||||||||||||||||    
T  37785492 gcatgattaagaagttgtatttgcattgtcgattcgaagtcgctgatgtcgcattgtcgttaagttg-tcatttatcaatgagttgttaacgaagaacta 37785590  T
Q  579 tgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37785591 tgagaagtattaacatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgattatgtc 37785646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 325 - 629
Target Start/End: Original strand, 14220067 - 14220377
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctg 419  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||     || | ||||||||| |||| |||||||||  ||    
T  14220067 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctataagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccatg 14220166  T
Q  420 tgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaag 519  Q
    ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14220167 tg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgttgagtcgaag 14220260  T
Q  520 tcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 612  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14220261 tcactgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacgtaaaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 14220360  T
Q  613 tatgttgttatatgatg 629  Q
    |||||||||||||||||    
T  14220361 tatgttgttatatgatg 14220377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 114 - 559
Target Start/End: Original strand, 17130514 - 17130955
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgca 212  Q
    ||||||||| |||| ||||| | || |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||  | |||| | || |||| |||||    
T  17130514 ttatatcatccaagttgttagtattaatgtggctatgttgtaagttgttttatgttgttgtctctactgttattga--ttattaatatccttaaattgca 17130611  T
Q  213 agagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgc 311  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  17130612 agcgttggtctaagttgtaa-gttgtaagttgatgttccaagatattagagtcatataagttgttgaagttgtctaagttggaagttgttgagtccatgc 17130710  T
Q  312 atactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagc 408  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||| |  |||||||| | | |||| ||    
T  17130711 atactcatttgaagttgagggtttgatgccatgtgagcctttgcactttacgtcgtgggcttgatgccctgtgagcctatttgctcttcaagttgagggc 17130810  T
Q  409 ttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattg 508  Q
    ||||||| |||||      ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17130811 ttgatgccctgtg------agtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattg 17130904  T
Q  509 tcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17130905 tcgagtcgaagttgttgatgtcgcattgtcgttgtcattaagttgtcattt 17130955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 297 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 44374035 - 44373696
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccct-gtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44374035 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc 44373937  T
Q  395 tttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    |||| | |||| ||||||||  ||     || ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44373936 tttaagttgagggcttgatgtcct-----tg-gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaag 44373843  T
Q  495 ttgtagttgcattg-tcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||| |||||||||  ||||||  |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  44373842 ttgaagttgcatttatcgagtttaagttgttgtagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 44373743  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44373742 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 44373696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 297 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 44382900 - 44382561
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccct-gtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44382900 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc 44382802  T
Q  395 tttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    |||| | |||| ||||||||  ||     || ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44382801 tttaagttgagggcttgatgtcct-----tg-gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaag 44382708  T
Q  495 ttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||| ||||||| || ||||||  |||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44382707 ttgaagttgcatttatcgagtttaagttgttgtagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 44382608  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44382607 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgaagatgt 44382561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 444 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 47094084 - 47093887
Alignment:
Q  444 ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgt 543  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47094084 ttatgttgaggacttaatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcaagtcgaagtcgctgatgtcgcattgtcgttgt 47093985  T
Q  544 cgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47093984 cgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacgaagaactatgtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 47093887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 415
Target Start/End: Original strand, 17071060 - 17071365
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17071060 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgttgttgttgaac-cattattgccattaagttgcaa 17071158  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  17071159 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttatttcaagatattggagtcatataagttgtggagttgtttaagttgtacgttgttgagtacatgcat 17071258  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctctttatgctgagagc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||     || ||||||||||| |||| ||    
T  17071259 actcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctatttaagttaagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggc 17071358  T
Q  409 ttgatgc 415  Q
    |||||||    
T  17071359 ttgatgc 17071365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 415
Target Start/End: Original strand, 43277505 - 43277895
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaag 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43277505 tatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaag 43277604  T
Q  128 atgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaa 225  Q
     ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||| ||  ||||  | ||||   |||||||||||||   ||| ||| ||    
T  43277605 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttactgtctctgctgta-ttga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttagtcaaa 43277700  T
Q  226 gttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaa 324  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43277701 gttgtcaagttgtaagttgttgttccaaaatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaa 43277800  T
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  43277801 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 43277895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 362 - 631
Target Start/End: Original strand, 13699736 - 13700003
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||     |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  13699736 gttgagggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttgagggcttgatg-tc-----ctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgat 13699829  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-- 559  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13699830 gctctggttggtaccacatgcataattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgccgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttat 13699929  T
Q  560 -----agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgat 631  Q
         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||    
T  13699930 caatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatc---gttgtttatgttgttatacgatgat 13700003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 362 - 633
Target Start/End: Original strand, 17071270 - 17071542
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | || ||||||||| || ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17071270 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctatttaagttaagggcttgatgccctatg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 17071363  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-- 559  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||      
T  17071364 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcgtagatgttgcatagtcgttgtcgttaagttgtcatttat 17071463  T
Q  560 -----agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
         |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  17071464 caatgagttgttaataaggaactatgtgaactattaatatttattaaacattgtttttcatgttgttataagatgatgt 17071542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11053984 - 11053603
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |    
T  11053984 atgactaatgttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaa 11053885  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    || || ||| ||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11053884 tgttgctatattgcaagttctttatgttgttgtctatgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaa 11053787  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataag-ttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgatt 339  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||     
T  11053786 gttgttgttccaagatatttgagtcatataagtttttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgaatactcattt-aagttgagggcttgatg 11053688  T
Q  340 ccctgtgagc--ttttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctct 418  Q
    ||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| | |||| |||| |||||||    
T  11053687 ccctgtgagcctatttgctctactacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttaatgctct 11053603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 362 - 623
Target Start/End: Original strand, 43277801 - 43278063
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43277801 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgt------gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 43277893  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt- 559  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| ||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43277894 gccctggttggtaccacatgcattataaagaagttgaagttacatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttg 43277993  T
Q  560 ------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
          |||||||||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43277994 tcaatgagttgttaataaagaaataagagaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttat 43278063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 359 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 19282077 - 19281801
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| |||        |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  19282077 tacgttgagggcttgatgccctgtgagattttgctctttaagttgagggcttgatgccctgga------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 19281984  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19281983 gatgccctggattggtactacatgcatgatta-gaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 19281885  T
Q  557 ttt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||       ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19281884 tttgtcaatgagttgttaatgaagaactatgcgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 19281801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 12371243 - 12371025
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||     
T  12371243 ctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccttggttggtacgacatggatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 12371144  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371143 gttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 12371044  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12371043 tgttgttatatgatgatgt 12371025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3287288 - 3286904
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaag 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3287288 tatgatgttattaatgattaatgttgttgcttaatgtgaaatacatatatttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaag 3287189  T
Q  128 atgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattg--tcattaagttgcaagagttggtct 223  Q
     ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| |||            || | | ||||||   |||||||||| ||   ||| |||     
T  3287188 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgt------------tgtattgattattaaatcattaagtttcatatgttagtca 3287101  T
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttg 322  Q
    ||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  3287100 aagttgtcaggttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataaattgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtcaatgtatactcatttg 3287001  T
Q  323 aagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  3287000 aagttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 3286904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 32434767 - 32434960
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  32434767 gttgggggcttgatgcactggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcaagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 32434866  T
Q  547 taagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32434867 taagttgtaatttattaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgtttttgtttatgttgttatatgatgatgt 32434960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 11066367 - 11066149
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||     
T  11066367 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 11066268  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066267 gttaaagtcgcattgttgttttcgttaagttgtagtttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 11066168  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11066167 tgttgttatatgatgatgt 11066149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 147 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 4070973 - 4070571
Alignment:
Q  147 tatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgtt 246  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  4070973 tatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgttgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaaagttgcaaagttgtaagttgtt 4070876  T
Q  247 aatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
      ||||||||||| || || |||||||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | | |||||| | ||||| ||||||    
T  4070875 gttccaagatattggaatcgtataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatat-atgttgagggtttgatgccctgt 4070777  T
Q  346 gagctt--ttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatg 439  Q
    |||| |  |||||||  || |||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||| || | || | | ||||||| |||||      ||| ||||||||    
T  4070776 gagcctatttgctctattaagttgagagcttgatgccatgtgagcctatttgctctataagttgggggtttgatgccctgtg------agtatatttatg 4070683  T
Q  440 ctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcg 539  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||         ||| ||||||||||||||||    
T  4070682 ctctatagattgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcattatc---------tcgttgatgtcgcattgtcg 4070592  T
Q  540 ttgtcgttaagttgtcattta 560  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  4070591 ttgttgttaagttgtcattta 4070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 454 - 633
Target Start/End: Original strand, 13150720 - 13150907
Alignment:
Q  454 ggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagtt 552  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13150720 ggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcattgtcgttaagtt 13150819  T
Q  553 gtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    || |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150820 gtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcactgttgtttatgttgttatatgatgatgt 13150907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 20619159 - 20618966
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20619159 gttgggggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 20619060  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| ||||       ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20619059 taagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaataactatttgaagtattaatattttttaatcgtttttgtttatgttgttatatgatgatgt 20618966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 437 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 11053609 - 11053487
Alignment:
Q  437 atgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattg 536  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  11053609 atgctctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccgcatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgttgcattg 11053510  T
Q  537 tcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11053509 tcgttgtcgttaagttgtcattt 11053487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 359 - 615
Target Start/End: Original strand, 14161937 - 14162196
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | | |      |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14161937 tacgttgagggcttgatgcctcatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccccggg------agtgtatttatgctcaatatgttgagggctt 14162030  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14162031 gatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 14162130  T
Q  557 ttt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
    |||       |||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14162131 tttgtcaatgagttgttaataaataactaagtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttat 14162196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 448 - 632
Target Start/End: Original strand, 30821952 - 30822144
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |   | |||||||||||||||||||    
T  30821952 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagttgtaaaagtcgcattgtcgttgtcgt 30822051  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  30822052 taagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatgagatgatg 30822144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 338
Target Start/End: Original strand, 18875605 - 18875913
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatata-ttatgt-gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaag 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18875605 tatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacaattcaag 18875704  T
Q  128 atgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaa 225  Q
     ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | | |||  || ||||   |||||||||||||   ||| ||| ||    
T  18875705 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctg-tattg--attatta-aatcattaagttgcatatgttagtcaaa 18875800  T
Q  226 gttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaa 324  Q
     |||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| |||||| ||| || |||||| |||||||||    || |||||||||||||||||||| ||    
T  18875801 attgtcaagttataagttgttgttccaagatattggagtgatataaattgttgatgttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattt-aa 18875899  T
Q  325 gttgagagcttgat 338  Q
    |||||| |||||||    
T  18875900 gttgagggcttgat 18875913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 48811778 - 48811561
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  48811778 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagtt 48811679  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  48811678 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcaattatcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcttggttgttta 48811579  T
Q  615 tgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  48811578 tgttattatgagatgatg 48811561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 362 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 3286998 - 3286861
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3286998 gttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 3286906  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3286905 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcat 3286861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 485 - 633
Target Start/End: Original strand, 15120490 - 15120646
Alignment:
Q  485 gattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaac 576  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||| |||| ||| |||    
T  15120490 gattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgttatttatcaatgagttattaatgaaaaac 15120589  T
Q  577 tatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15120590 tatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 15120646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 36686311 - 36686530
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  36686311 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 36686410  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36686411 tgtagaagtcgcatcgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaatagagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 36686510  T
Q  614 atgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||| |||||  ||||||||    
T  36686511 atgtcgttatgagatgatgt 36686530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 280 - 464
Target Start/End: Original strand, 14219984 - 14220163
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  14219984 gttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctatacgttgagggcttgatgcc 14220083  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgcc 464  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | |||||||       |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14220084 ctgtgagcttttgctctataagttgagggtttgatgc------cctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgcc 14220163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 494 - 633
Target Start/End: Original strand, 13133673 - 13133818
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||| ||||||||||    
T  13133673 gttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcacattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaaatatgtgaagt 13133772  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13133773 attaatatt-attaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 13133818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 521
Target Start/End: Original strand, 12466327 - 12466488
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |   |||  | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  12466327 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagagcttgatgctctggg--agtgtatttatgtatgctcaatatgttgagggctt 12466424  T
Q  459 gatgccct-ggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||    
T  12466425 gatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaaatcgaagttgcattgtcgaatcaaagtc 12466488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 162
Target Start/End: Original strand, 14161621 - 14161748
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14161621 tatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatatatatattatgtgaaaagg-----tatagaaaataatgttgttatatcatccaagat 14161715  T
Q  130 gttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtt 162  Q
    ||| || || ||| ||  |||||||||| ||||    
T  14161716 gttgttattaatgttgtcatgttgtaagttgtt 14161748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 456 - 621
Target Start/End: Original strand, 6170577 - 6170750
Alignment:
Q  456 cttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgt 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||  |||| |  || || |||||||||||||| || ||||||    
T  6170577 cttgatgtcctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgtatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcattgagttgt 6170676  T
Q  555 cattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6170677 cattttccaataagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 6170750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 453 - 622
Target Start/End: Original strand, 22001350 - 22001525
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagtt 552  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  22001350 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagttgttgttgttgcattgttgagttgatgtcgatgttgtcgcattgtcgttgttgtcaagtt 22001449  T
Q  553 gtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  22001450 gtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagtataaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtta 22001525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 358 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 20585422 - 20585264
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20585422 ttacgttgatggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggct 20585329  T
Q  458 tgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  20585328 tgatgccctgaattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaatttgcattgtcgagtcaaagtc 20585264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 435 - 622
Target Start/End: Original strand, 8136179 - 8136368
Alignment:
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| ||  |||||||    
T  8136179 ttatgctctatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgttgttgcattgtcgagttgacgtcgttgtggtcgcat 8136278  T
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcatt---tagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||||| || ||||| | | |    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  8136279 tgtcgttgttgtcaagttattactaaagagttgttaatgagaaactatgtgaagtattaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtta 8136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 280 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 47094198 - 47094083
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctc 379  Q
    ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47094198 gttgtttaagttgttggttgttgagtccatgcatactcatta-aagttgagggcttgatgccatgcgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctc 47094100  T
Q  380 tgtgagcttttgctctt 396  Q
    |||||||||||||||||    
T  47094099 tgtgagcttttgctctt 47094083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 18875985 - 18876178
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  || |  | || |||||| ||||||||| |    
T  18875985 gttgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaatttta-gaagtcgcaatgtcgttgttg 18876083  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||       |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  18876084 ttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaatagagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 18876178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 438 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 15139052 - 15138862
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||    
T  15139052 tgctctatacgttgggggcttgacgccttgattggtaccacatgcatgattaagttgttgtcgttgcattgtcgaattgatgtcgatgttgccgcattgt 15138953  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15138952 cgttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagtatcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtta 15138862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 280 - 513
Target Start/End: Original strand, 19558245 - 19558477
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctttt--gctct-tacgttgagggcttgatg 376  Q
    ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | |  ||||| || ||||||| ||| |||    
T  19558245 gttgtttaagttgttggttgttgagtccatgcatactcatta-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctattagctctataagttgaggactttatg 19558343  T
Q  377 ctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgaggg-cttgatgccctggttggt 473  Q
    | |||||||| |  ||||||| || | || | ||||||||| ||     ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19558344 ccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgc-ct-----tgtgagtatatttatgctctatatgttggggggcttgatgccctggttggt 19558437  T
Q  474 accacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19558438 accacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 19558477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 453 - 560
Target Start/End: Original strand, 12128280 - 12128388
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12128280 gggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgtatttgtcaagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagt 12128379  T
Q  552 tgtcattta 560  Q
    ||| |||||    
T  12128380 tgtaattta 12128388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 448 - 617
Target Start/End: Original strand, 37728004 - 37728181
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||  |||| |  || || ||||||||||||||||    
T  37728004 gttgggggcttgatgccatggttgataccacatgcatgattaagaagttgaggtggcatatgtcgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgt 37728103  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    | |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37728104 tgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattattgtttatgt 37728181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 385
Target Start/End: Original strand, 13699684 - 13699797
Alignment:
Q  273 ttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggct 371  Q
    |||||| ||||| | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  13699684 ttgtggagttgtttgagttctacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttgagggct 13699783  T
Q  372 tgatgctctgtgag 385  Q
    |||||  |||||||    
T  13699784 tgatgtcctgtgag 13699797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 422 - 522
Target Start/End: Original strand, 9390137 - 9390237
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  9390137 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaagtc 9390236  T
Q  522 g 522  Q
    |    
T  9390237 g 9390237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 423 - 522
Target Start/End: Original strand, 14183735 - 14183835
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||    
T  14183735 ctgtgagtctatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagtttcattgtcgagtcaaagtc 14183834  T
Q  522 g 522  Q
    |    
T  14183835 g 14183835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47094359 - 47094260
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| |||| || | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47094359 ttatatcattcaagttgttgttatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgttgtt-aaatcattattgtcattaagttgcaa 47094261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8468173 - 8468084
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8468173 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcgttgtcg 8468084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Original strand, 3289548 - 3289667
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  3289548 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatgttgcaagttgtttatgtt 3289647  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  3289648 gttgtctctgttgttgttga 3289667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 510
Target Start/End: Original strand, 20253717 - 20253804
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||| || |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20253717 ctgtgagcctatttatgctctatacgttggggacttgatgccctgatttgtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtc 20253804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 14270559 - 14270655
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14270559 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 14270655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16076090 - 16076000
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16076090 ctgtgagtatatttatgctctatatgttggggacttgatgccctaattggtaacacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 16076000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 438 - 539
Target Start/End: Original strand, 13133589 - 13133690
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||    
T  13133589 tgctctatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgt 13133688  T
Q  538 cg 539  Q
    ||    
T  13133689 cg 13133690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Original strand, 14270475 - 14270564
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14270475 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcttgattaagaagttgaagttgcgttgtcg 14270564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 502 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 15623883 - 15623757
Alignment:
Q  502 tgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttag-------ttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatat 594  Q
    ||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||        ||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  15623883 tgcattgtcgagttgatgtcgctgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattatcaataaattgttaatgaagaactatatgaagtattaata- 15623785  T
Q  595 ttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15623784 ttattaattgttgtggtttatgttgtta 15623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 19282158 - 19282055
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| || ||     ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  19282158 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc-ctttg-----gagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 19282065  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  19282064 tgatgccctg 19282055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Original strand, 10064251 - 10064345
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10064251 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 10064345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 560 - 632
Target Start/End: Original strand, 12757357 - 12757429
Alignment:
Q  560 agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  12757357 agttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatgagatgatg 12757429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 422 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17232309 - 17232221
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17232309 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatggatgattaagaagttgaagttgcgttgtc 17232221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 18423404 - 18423310
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18423404 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 18423310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16579386 - 16579316
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  16579386 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 16579316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 448 - 513
Target Start/End: Original strand, 9744157 - 9744222
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9744157 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgagtaagttgttgtagttgcattgtcgag 9744222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19282181 - 19282101
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19282181 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 19282101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 551 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 8468076 - 8468004
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8468076 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 8468004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 8852276 - 8852360
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  8852276 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 8852360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20585671 - 20585575
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20585671 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 20585575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44374261 - 44374169
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtct 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  44374261 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtct 44374169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 44383126 - 44383034
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtct 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  44383126 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtct 44383034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 536 - 623
Target Start/End: Original strand, 45848150 - 45848244
Alignment:
Q  536 gtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45848150 gtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaacgagttgttgataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 45848244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Original strand, 12127901 - 12127983
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt--aagatgtttat 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||||  |||||||||||    
T  12127901 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatactatgttgtgaaagatgtttat 12127983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 464
Target Start/End: Original strand, 14161856 - 14161956
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  14161856 ttacattgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcagtacgttgagggct 14161949  T
Q  458 tgatgcc 464  Q
    |||||||    
T  14161950 tgatgcc 14161956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 16458749 - 16458686
Alignment:
Q  560 agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16458749 agttgttaataaagaactaagggaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattat 16458686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 16461441 - 16461516
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||    
T  16461441 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgttgagtcaaagtcg 16461516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 32300917 - 32300842
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  32300917 gttgggggcttgattccctggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgttgagtcaaagtcg 32300842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38479939 - 38479880
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38479939 gttgagggcttgatgtcctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 38479880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 507
Target Start/End: Original strand, 46387159 - 46387234
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  46387159 tatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 46387234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 276
Target Start/End: Original strand, 709397 - 709471
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  709397 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgt 709471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 521
Target Start/End: Original strand, 9033622 - 9033696
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||||    
T  9033622 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcgagtcgaagtc 9033696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Original strand, 12466246 - 12466349
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||      ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  12466246 ttacgttgagggtttgatgccctgtgagtttttgttctttaagttgagggcttgatgccctgt------gagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 12466339  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  12466340 tgatgccctg 12466349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 15439310 - 15439252
Alignment:
Q  562 ttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgt 620  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15439310 ttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatattgt 15439252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16462246 - 16462172
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16462246 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgt 16462172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 17232225 - 17232129
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  17232225 ttgtcattgtcgttaagttgtcatttgtcactgagttgttaattaagaactaagtgaagtattaatatttattaattgttgttgtttaagttattat 17232129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41055685 - 41055611
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||| || |||||||||||||    
T  41055685 attaagttgcaagtgttggtctaagttataaagttgtaagatgttgctccaaagtattagaatcatataagttgt 41055611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 522
Target Start/End: Original strand, 16586277 - 16586346
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  16586277 gggcttgatgcctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 16586346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20585445 - 20585365
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20585445 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgatggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 20585365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 42461916 - 42461685
Alignment:
Q  287 aagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtg 383  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || || |||| |||||||   |||||| ||| |||||||||||||    
T  42461916 aagttgtacacgttgttgagtccatgtatactcattt-aagttgagggcttgatgcc-tgggagcctttgctcaacacgttgggggtttgatgctctgtg 42461819  T
Q  384 agcttttgctc-tttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctc-tttatgttgagggcttgatgccct-ggttggtaccacat 480  Q
    |||||||||||   || | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||   || | || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42461818 agcttttgctcaaataagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaaataagatgggggcttgatgccctagattggtaccacat 42461725  T
Q  481 ccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
     ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  42461724 gcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 42461685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 621
Target Start/End: Original strand, 9744231 - 9744363
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| | |||||||||||||||    
T  9744231 gttgtcgttgcattgtcaagttgatgtcgatgttgtcacattgtcgttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatg-agaactatgtgaagt 9744329  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9744330 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 9744363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 18639961 - 18639867
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18639961 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatattttctaatcattgttgtttatgttgtt 18639867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 46386824 - 46386920
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  46386824 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctgc 46386920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Original strand, 61555 - 61614
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  61555 gttgggggcttgatgcactggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 61614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Original strand, 8757126 - 8757241
Alignment:
Q  75 tatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttg 172  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||| ||    
T  8757126 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctg 8757225  T
Q  173 tctctgccgttgttga 188  Q
    ||||||| ||||||||    
T  8757226 tctctgctgttgttga 8757241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 17017729 - 17017804
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  17017729 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcg 17017804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 422 - 497
Target Start/End: Original strand, 45848064 - 45848139
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttg 497  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45848064 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgacgccctggttggtaccacatgtatgattaagaagttg 45848139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 48812048 - 48811981
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  48812048 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 48811981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 507
Target Start/End: Original strand, 18075625 - 18075679
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18075625 gggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaaaaggttgtagttgcatt 18075679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 11525876 - 11525948
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  11525876 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 11525948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 385
Target Start/End: Original strand, 12466223 - 12466311
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12466223 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggtttgatgccctgtgagtttttgttctttaagttgagggcttgatgccctgtgag 12466311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 14161833 - 14161913
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14161833 ttgttgagtccatgcataatcatttaca-ttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 14161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 38519347 - 38519108
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  38519347 tgttgtccaagttatacacgttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctga-agcctttgctcaacacgttgggggcttgat 38519250  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctctt-tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttgg 472  Q
    ||  |||||||||||||||   || | |||| ||||||| | ||| |      |||||||||||||||   || |||  |||||||||||||||| ||||    
T  38519249 gccttgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgataccctggg------agtgtatttatgctcaaataagttaggggcttgatgccctggattgg 38519156  T
Q  473 taccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||    
T  38519155 taccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaagt 38519108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 12465997 - 12466093
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttg-taagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||    
T  12465997 gaaaatgtatgatatagtaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgttaagttgttgtatgttgctgtctctgc 12466093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 539
Target Start/End: Original strand, 15105204 - 15105308
Alignment:
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||| |||| | || |||| || ||| ||||    
T  15105204 ttatgctctacaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgttgttgcattatcgacttgatgtcgttgttgttgcat 15105303  T
Q  535 tgtcg 539  Q
    |||||    
T  15105304 tgtcg 15105308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 439 - 507
Target Start/End: Original strand, 15120416 - 15120483
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15120416 gctcttaaagttgggggcttgatgccctg-ttggtatcacatgcatgattaagaagttgaagttgcatt 15120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19282395 - 19282311
Alignment:
Q  97 tatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | | || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  19282395 tatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaacgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 19282311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 40555484 - 40555588
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  40555484 gaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgctgtt 40555583  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  40555584 gttga 40555588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 427 - 520
Target Start/End: Original strand, 131106 - 131200
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  131106 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 131200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 494
Target Start/End: Original strand, 11772565 - 11772612
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11772565 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 11772612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16585281 - 16585215
Alignment:
Q  457 ttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||    
T  16585281 ttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaattcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 16585215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11066783 - 11066714
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  11066783 gaaaatgtatgatatggaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 11066714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 381
Target Start/End: Original strand, 12466330 - 12466387
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctg 381  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  12466330 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagagcttgatgctctg 12466387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 13148209 - 13148278
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  13148209 gaaaaggtatgatatagaaaataatatttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 13148278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 14323219 - 14323174
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14323219 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 14323174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 457 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 48991018 - 48990958
Alignment:
Q  457 ttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcga 517  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  48991018 ttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtt-aagttgcatagtcgagtcga 48990958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 480
Target Start/End: Original strand, 16220029 - 16220061
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16220029 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 16220061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 343
Target Start/End: Original strand, 18075455 - 18075574
Alignment:
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttg 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| | |    ||||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||     
T  18075455 aagttgtcaagttgtaagatgttgattcaaattatttgagtcatataagatatctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcatactcattt- 18075553  T
Q  323 aagttgagagcttgattccct 343  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  18075554 aagttgagggcttgatgccct 18075574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 492
Target Start/End: Original strand, 20220463 - 20220507
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20220463 ttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 20220507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 439 - 491
Target Start/End: Original strand, 48809583 - 48809635
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48809583 gctctatatgttgggggcttgatgctctgattggtaccacatgcatgattaag 48809635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Original strand, 130963 - 131079
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacat--tgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  130963 tgttgtccaagttgtacacgctgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-aagcctttgctcaacacgttgggggcttgat 131060  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc 394  Q
    |  |||||| |||||||||    
T  131061 gtcctgtgaacttttgctc 131079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 349
Target Start/End: Original strand, 9744093 - 9744140
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc 349  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9744093 gagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagc 9744140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14044557 - 14044482
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  14044557 gttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaggtgtaagttgcatagtcaagttgaagtcg 14044482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14354587 - 14354512
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  14354587 gttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaggtgtaagttgcatagtcaagttgaagtcg 14354512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Original strand, 15096392 - 15096530
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaa-aaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgata 148  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| || ||    
T  15096392 tgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgtta 15096490  T
Q  149 tgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    ||||| ||| ||||  ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  15096491 tgttgcaagttgttattgttgctgtcattgctgttgttga 15096530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 132
Target Start/End: Original strand, 32434327 - 32434374
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgtt 132  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32434327 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgtt 32434374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 321
Target Start/End: Original strand, 32434507 - 32434614
Alignment:
Q  216 gttggtctaagttgta-aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||    || ||||||||||||    
T  32434507 gttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgcat 32434606  T
Q  314 actcattt 321  Q
    ||||||||    
T  32434607 actcattt 32434614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 832794 - 832868
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  832794 ttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgttgttgttga 832868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 1197974 - 1198048
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1197974 ttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgttgttgttga 1198048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Original strand, 1543534 - 1543572
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1543534 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 1543572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 449 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16091605 - 16091532
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  16091605 ttgagggcttgatgccctgtattgctaccacatgcatgattaagaagtt-aagttgcatagtcaagttgaagtcg 16091532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4071079 - 4071038
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatg 83  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  4071079 aatgattaatgttgttggttaatttgagatacatatattatg 4071038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 60
Target Start/End: Original strand, 8514475 - 8514515
Alignment:
Q  22 ttgataactatgatgttatta--atgattaatgttgttagt 60  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8514475 ttgataactatgatgttattaagatgattaatgttgttagt 8514515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12371593 - 12371524
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  12371593 gaaaaagtatgatatagaaaataaagtttttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 12371524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 349
Target Start/End: Original strand, 13133475 - 13133543
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc 349  Q
    ||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13133475 gttgtctaagttgttggttgctgagtccatgcatactcattt-aagctgagggcttgatgccctgtgagc 13133543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 15008810 - 15008855
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  15008810 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataaga 15008855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15139467 - 15139343
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaa-aaggtatgttatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgata 148  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || ||    
T  15139467 tgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaacattgtatgatatag-aaatattgttgtttatatcaatcaagttgttagtgttaatgttgtta 15139369  T
Q  149 tgttgtaagatgtttatgttgttgtc 174  Q
    ||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  15139368 tgttgcaagttgttattgttgttgtc 15139343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Original strand, 19558032 - 19558156
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgata 148  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| || |||||| || ||    
T  19558032 tgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatagaaa-tatagttgttcatatcattcaagttgttgttattgatgttgtta 19558130  T
Q  149 tgttgtaagatgtttatgttgttgtc 174  Q
    ||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  19558131 tgttgcaagttgttattgttgttgtc 19558156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 30821129 - 30821178
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  30821129 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 30821178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 36686123 - 36686172
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  36686123 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 36686172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 1490252 - 1490288
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1490252 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 1490288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 445 - 492
Target Start/End: Original strand, 1868265 - 1868313
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  1868265 tatgttgagggcttaatgccctagattggtaccacatgcatgattaaga 1868313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 2282561 - 2282634
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  2282561 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcg 2282634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8940172 - 8940136
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8940172 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 8940136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Original strand, 9744507 - 9744554
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9744507 gaactatgtgaaggatcaatatt-atttatcgttgttgtttatgttgtt 9744554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Original strand, 14219720 - 14219843
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgata 148  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || || ||    
T  14219720 tgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatagaag-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttggtgttgtta 14219818  T
Q  149 tgttgtaagatgtttatgttgttgt 173  Q
    ||||| ||| ||||  |||||||||    
T  14219819 tgttgcaagttgttattgttgttgt 14219843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14258373 - 14258337
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14258373 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 14258337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 14981633 - 14981669
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14981633 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 14981669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15112866 - 15112830
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15112866 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 15112830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 15411109 - 15411145
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15411109 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 15411145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15719918 - 15719882
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15719918 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 15719882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16579681 - 16579645
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16579681 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 16579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 16585982 - 16586018
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16585982 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 16586018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16998515 - 16998479
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16998515 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 16998479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38480215 - 38480167
Alignment:
Q  221 tctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  38480215 tctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 38480167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 438 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 43747400 - 43747328
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  43747400 tgctctataagttgggggcttgatgctctaattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgtcgttgcattgtc 43747328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 46580873 - 46580909
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  46580873 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 46580909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47094117 - 47094065
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  47094117 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttatgttgaggacttaatgc 47094065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 114 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 51992802 - 51992292
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51992802 ttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 51992704  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  51992703 gtgttggtctaagttgtaaggttgtaagctgttattccaagatattgga-tcatataagttgtggagttgtctaagttgtacgttgttgagtccctgcat 51992605  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttga 412  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||    
T  51992604 actcatttgaagttgagggattgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttga 51992505  T
Q  413 tgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcg 511  Q
    |||      ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  51992504 tgc------tctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgtttggtatcacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttg 51992411  T
Q  512 agtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcg 604  Q
    |||  |||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51992410 agtttaagttgtagaagtcgcattgtctttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaataaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcg 51992311  T
Q  605 ttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51992310 ttgttgtttatgttgttat 51992292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 633
Target Start/End: Original strand, 19435457 - 19436053
Alignment:
Q  30 tatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatatt-atgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaag 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19435457 tatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaacaatgttgttataccattcaag 19435556  T
Q  128 atgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaa 225  Q
     ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||  | ||||   |||||||||||||   ||| ||| ||    
T  19435557 ttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctgta-ttga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttagtcaaa 19435652  T
Q  226 gttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaa 324  Q
     |||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19435653 tttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaa 19435752  T
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtct 424  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||         |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||        
T  19435753 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc---------gggcttgatgctatgtgagcttttgatctt-atgttgagggcttgatgccctgt---- 19435838  T
Q  425 gtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcga 523  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |     
T  19435839 --gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttaatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgt 19435936  T
Q  524 tgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatg 616  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19435937 agaagtcgcattgtcgttgtcgataagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatacttattaatcgttgttgtttatg 19436036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 362 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 19734369 - 19734096
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19734369 gttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 19734276  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-- 559  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  19734275 gccctagttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgctgacgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttat 19734176  T
Q  560 -----agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19734175 caatgaattgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 19734096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 42 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 21061881 - 21061365
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    |||||| ||||||||| |||| | | || ||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| || ||     
T  21061881 aatgatcaatgttgttggttattttcaattacatttattatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttatta 21061782  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgt 238  Q
    ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||  | |||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21061781 atgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctctactgttattga--ttattaatatcgttaagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgt 21061684  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttga 337  Q
    ||| ||||  | ||| ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  21061683 aagttgttgtttcaaaatattggattcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctaagtccatgcatactcttttaaagttgaaggcttga 21061584  T
Q  338 ttccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtat 434  Q
    |  || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| | |||| | |||||||||| |||      || |||    
T  21061583 tgtccggtgagcctttgctctttatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggtttgatgctctatgt------gtatat 21061490  T
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  21061489 ttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtggttgatgtcgcat 21061390  T
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21061389 tgtcgttgtcgttaagttgtcattt 21061365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 202 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15365113 - 15364767
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||    
T  15365113 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 15365014  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15365013 tgagtccatgcatactcatt--gagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttat 15364917  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15364916 gttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgataagggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaagatgta 15364823  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15364822 gttgcatagtcgagttgaagtcttagatgttgcattgtcgttgttgataagttgtc 15364767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 202 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27995955 - 27995609
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||    
T  27995955 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttattccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 27995856  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  27995855 tgagtccatgcatactcatt--gatttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgagggcttgatcccctgtgagcttttgctc-ttat 27995759  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  27995758 gttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaaaatgta 27995665  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  27995664 gttgcatagtcaagttgaagtcttagatgttgcattgtcgttgttgataagttgtc 27995609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 362 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 40229515 - 40229243
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||      ||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  40229515 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggcttgatgctctgtg------agtataattatactctatatgttgagggcttgat 40229422  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-- 559  Q
    || ||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  40229421 gctctgattggtaccaaatgcataattaagaagttgaagttgcattgtcgagtagaagtcgtagatgacgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttat 40229322  T
Q  560 -----agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
         ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229321 caatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 40229243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 84 - 377
Target Start/End: Original strand, 9871308 - 9871602
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9871308 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcagtcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgt 9871407  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgt 281  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | ||     
T  9871408 tgttgaac-cattattgtcattaagttacaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtttttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgg 9871506  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9871507 tgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgc 9871602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 302 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 16296593 - 16296260
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16296593 gagtccatgcatattcatttgaagttgagggcttggtgctttgtgagcttttgctctatacgttgagggcttgatgatctgtgagcttttgctctt-atg 16296495  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtag 500  Q
     |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16296494 ttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgccctggttggtacaacatgcatgattaagaagttgaag 16296401  T
Q  501 ttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    |||||| ||| ||||  |||| |  ||  |  |||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  16296400 ttgcatatgttgagtttaagttgtagaattttcattgtcgatgtcgttaagttgtcatttgtcactgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaat 16296301  T
Q  593 atttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  16296300 atttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 16296260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 467
Target Start/End: Original strand, 13036620 - 13036879
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||  ||||    
T  13036620 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataatttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 13036719  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13036720 tgagtccatgcatactcgtttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgcttttacgttgagggcttgatgttctgtgagcttttgctc-ttatg 13036818  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
     |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036819 ttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 13036879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 325 - 622
Target Start/End: Original strand, 13036781 - 13037084
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgt 420  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  13036781 gttgagggcttgatgttctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgt 13036880  T
Q  421 gtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaag 519  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  13036881 ------gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaag 13036974  T
Q  520 tcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 612  Q
    | |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13036975 ttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 13037074  T
Q  613 tatgttgtta 622  Q
    ||||| ||||    
T  13037075 tatgtcgtta 13037084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 362 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 9637888 - 9637617
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9637888 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 9637796  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt- 559  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9637795 gccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagccgcattgtcgttgtcgttaagttgtcaattg 9637696  T
Q  560 ------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
          |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  9637695 tcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatgagatgatg 9637617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 348
Target Start/End: Original strand, 32467113 - 32467297
Alignment:
Q  163 tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttga 262  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  32467113 tatgttgttgtctctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga 32467211  T
Q  263 gtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag 348  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32467212 gtcatataagttatggagttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgag 32467297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 312 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 15608374 - 15608133
Alignment:
Q  312 atactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagctt 410  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||  ||||    
T  15608374 atactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgctctgtgagccttt-ctctttaagttgatggctt 15608276  T
Q  411 gatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    ||||| |||||      ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15608275 gatgccctgtg------agtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcattgtc 15608182  T
Q  511 gagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15608181 gagttaaagttgttgatgtcgcattgtcgttgtctttaagtcgtcattt 15608133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 325 - 633
Target Start/End: Original strand, 33244204 - 33244522
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgt 420  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  33244204 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttatgttgagagcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgt 33244303  T
Q  421 gtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg----ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtc 515  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||     
T  33244304 ------gagtgtatttatgctctttatgttgagggtttgatgccctggttaattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtt 33244397  T
Q  516 gaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgt 608  Q
     |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244398 taagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcattgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgt 33244497  T
Q  609 tgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  33244498 tgtttatgttgttatgagatgatgt 33244522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 224 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 50160182 - 50159856
Alignment:
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttg 322  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||  |||| || ||||||||| ||| | |||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||      
T  50160182 aagttgttaagttgtaagaagttgttccaaagtattggattcatataagctgtcgatgttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattc- 50160084  T
Q  323 aagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctta-cgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||||    
T  50160083 aagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttgcgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatcccctgtg 50159985  T
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
          |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  50159984 ------agtgtatttatgctcttg-tgttgagggcttgataccctggttggcaccacatgcatgattaagaaggtgtagttgcattgtcgagttgaagtc 50159892  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    |  ||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  50159891 gtagatgttgcatagtcgttgttgataagttgtcat 50159856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 467
Target Start/End: Original strand, 33244129 - 33244302
Alignment:
Q  287 aagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244129 aagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattcaaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagc 33244228  T
Q  387 ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244229 ttttgctc-ttatgttgagagcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 33244302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 10357592 - 10357810
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  10357592 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccatatgcatgattaagaaattgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 10357691  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357692 gttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 10357791  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  10357792 tgttattatataatgatgt 10357810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 205 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 19738288 - 19738071
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||    
T  19738288 aagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgttga 19738189  T
Q  304 gtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgct 402  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  19738188 gtccatgcatactcatt--gagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttatgtt 19738092  T
Q  403 gagagcttgatgctctgtgtc 423  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  19738091 gagggcttgatgccctgtgtc 19738071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 208 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20747 - 20533
Alignment:
Q  208 ttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtc 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |||||    
T  20747 ttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtc 20648  T
Q  307 catgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgag 405  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  20647 catgcatactcatat-aagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctctttacgttgaggacttgatgccctgtgagccttttctctttacgttgag 20549  T
Q  406 agcttgatgctctgtg 421  Q
     ||||||||| |||||    
T  20548 ggcttgatgccctgtg 20533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37018980 - 37018817
Alignment:
Q  20 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatata-ttatgt-gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37018980 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatatttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttat 37018881  T
Q  118 atcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    | |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  37018880 accattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 37018817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16043031 - 16042752
Alignment:
Q  236 tgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagct 334  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  16043031 tgtaagatgttgatccaaactattggagtcatataagatgttcatgttgtctaaggtataagatgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggtt 16042933  T
Q  335 tgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgta 433  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||       |||||||| ||    
T  16042932 tgatgccctgtgagcgtttgctctacacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagtata 16042839  T
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  16042838 tttatgctc-ttacattgagggtttgatgccctggattggtaccacatgcgtgattaagaagatagagttgcatagtcaagtcgaagt 16042752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 423 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 19736471 - 19736339
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||     
T  19736471 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcatagtcaagttgaagtct 19736372  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
      ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19736371 tagatgtcgcattgtcgttgttgataagttgtc 19736339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 333 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 20584 - 20362
Alignment:
Q  333 cttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | | |||| |||||||||   |||      ||    
T  20584 cttgatgccctgtgagccttttctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctcttaa-gttgagggcttgatgccacgtg------ag 20492  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgt 529  Q
    | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  20491 tataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtagaagttgttgatgt 20392  T
Q  530 cgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20391 cgcattgtcgttgtctttaagtggtcattt 20362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 507
Target Start/End: Original strand, 53631454 - 53631746
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||| ||  |||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||    
T  53631454 aagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtctta--agttgttgatgttgtccaagttgtaatttgttga 53631551  T
Q  304 gtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgct 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||  |||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || | |    
T  53631552 gtccatgcatactcattt-aagttgatggcttcatgcccta-gagcctttactcaacacgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagtt 53631648  T
Q  403 gagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagtt 502  Q
    ||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  53631649 gagggcttgatgccctg-------gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgtcgtagtt 53631741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 14629640 - 14629499
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  14629640 gttgtagttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 14629541  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14629540 attaata-ttattaattgttgttgtttatgatgttatatgatg 14629499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19734495 - 19734274
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacatt 298  Q
    |||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  ||    
T  19734495 tcattaagttgcatatgatggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagtt 19734396  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgct 393  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     || ||||    
T  19734395 gctgagtccatgcatactcattggaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgct 19734296  T
Q  394 ctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
T  19734295 ctttatgttgagggcttgatgc 19734274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 280 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40229560 - 40229454
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  40229560 gttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggcttgatgct 40229461  T
Q  379 ctgtgag 385  Q
    |||||||    
T  40229460 ctgtgag 40229454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 445 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 46642555 - 46642371
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttg 542  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||    
T  46642555 tatgttgggggcttgatgtcatggattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttg 46642456  T
Q  543 tcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgt 620  Q
    ||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46642455 tcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgt 46642371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 40906885 - 40906654
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac--gttgagggcttgatg 376  Q
    ||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  40906885 tgttgtccatgttgtaagttgttgagttcatgcatactcattc-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatg 40906787  T
Q  377 ctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtac 475  Q
    | |||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||| |||||      |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40906786 ccctgtgagctttttctctttaagttgagggtttgatgccctgtg------agtgtatttatgctcaataagttgagggcttgacgccctggattggtac 40906693  T
Q  476 cacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  40906692 cacatgcatgattaagatgtagaagttgcattatcgagt 40906654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 26444842 - 26444643
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  26444842 ctgtgagtatatttatgttttatatgttgggggcttgatgccctggttg-taccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcg 26444744  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
     || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  26444743 ttgttgttgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagtatcaata-ttatttattgttgttgtttat 26444645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 423 - 514
Target Start/End: Original strand, 32467291 - 32467382
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32467291 ctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagt 32467382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 280 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9637933 - 9637794
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctc 379  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9637933 gttgtctaagttgtcagttgttgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccc 9637834  T
Q  380 tgtgag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    ||||||     || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  9637833 tgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 9637794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14650631 - 14650449
Alignment:
Q  334 ttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgt 432  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||  | ||||||| |||||      |||||    
T  14650631 ttgattccttgtgagcctttgctctttacgttgggggcttgatgccctatgcgcttttgctctttaagttgaaggtttgatgccctgtg------agtgt 14650538  T
Q  433 atttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||| ||||||    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  14650537 atttatgctctt-atgttggaatcttgatgccctggatggtaccatatgcatgattaagaagttgaaattgcattgtcgagtcaaagtcg 14650449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 445 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3484941 - 3484864
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  3484941 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 3484864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 422 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 13844283 - 13844080
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  13844283 tctgtgagcctatttaagctcaatacgttgggggcttgatgccctggtttgtaccacatgcatgattaagaaattgaagttgcatatgttgagtttaagt 13844184  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||  |||||||||||       |||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13844183 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgtagagttgtcatttgtcaatgagttattaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattgttgttt 13844084  T
Q  614 atgt 617  Q
    ||||    
T  13844083 atgt 13844080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 438 - 622
Target Start/End: Original strand, 26922822 - 26923006
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||      ||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  26922822 tgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgta------ttgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgt 26922915  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||| |||| ||||||| |||       |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  26922916 cgttgttgttaggttgtcaattatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaaatattaata-ttgttaattgttgttgtttatgttgtta 26923006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 15189973 - 15189826
Alignment:
Q  482 catgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaag 573  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||    
T  15189973 catgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaag 15189874  T
Q  574 aactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15189873 aactaagtgaagtattaatatttaataatcgttgttggttatgttgtt 15189826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19857262 - 19857173
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19857262 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcgttgtcg 19857173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 25090638 - 25090481
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| | ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25090638 tacgttgagggcttgattccctgtgagcttttgctctttaagttgaggg-ttgatcccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 25090546  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  25090545 gatgcccttgattgataccacatgcataattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 25090481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 42874784 - 42874626
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||| ||| ||| ||    
T  42874784 tacgttgagggcttgataccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctggg------agtgtatttatgctcgatatattgggggatt 42874691  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  42874690 gatgtcatggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgaatcaaagtcg 42874626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 438 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14629724 - 14629649
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14629724 tgctctataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 14629649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 428 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16997449 - 16997354
Alignment:
Q  428 agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  16997449 agtgtatttatgctcaatatgttaggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcactgtcgagtcaaagtcg 16997354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 438 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 14548624 - 14548539
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttgg-taccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  14548624 tgctgtttaagttgagggcttgatgccctggatgggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 14548539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 422 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 15099029 - 15098932
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaag 519  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  15099029 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatagtcaagttgaag 15098932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 570 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 33185737 - 33185676
Alignment:
Q  570 gaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgat 631  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33185737 gaagaactatgttaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttattatatgatgat 33185676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 445 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 361912 - 361848
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgt 509  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  361912 tatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcgttgt 361848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 522
Target Start/End: Original strand, 15042239 - 15042339
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  15042239 ctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttcatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtc 15042338  T
Q  522 g 522  Q
    |    
T  15042339 g 15042339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15112185 - 15112085
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  15112185 ctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggctttatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtc 15112086  T
Q  522 g 522  Q
    |    
T  15112085 g 15112085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 35812573 - 35812648
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  35812573 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 35812648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Original strand, 33243967 - 33244061
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaa-aaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  33243967 taatttgagatacatatattgtgtgaataaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 33244061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Original strand, 44773584 - 44773654
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44773584 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 44773654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 358 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11425020 - 11424922
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11425020 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 11424927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11425043 - 11424963
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11425043 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 11424963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15612163 - 15612054
Alignment:
Q  208 ttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtc 306  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||||||  |||| ||| |    
T  15612163 ttgcaagtgttggtctaggttgtaaagttgtaagttgatgctccaagatattggagtcatataagatgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagcc 15612064  T
Q  307 catgcatact 316  Q
    ||||||||||    
T  15612063 catgcatact 15612054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16997616 - 16997536
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16997616 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 16997536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Original strand, 4615771 - 4615911
Alignment:
Q  50 atgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgat 147  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || |    
T  4615771 atgttgttggttaatttgagttacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 4615870  T
Q  148 atgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| ||| || |||||||| |||||||||  |||||||    
T  4615871 atgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgcttttgttga 4615911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 269
Target Start/End: Original strand, 10357173 - 10357356
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |     
T  10357173 gaaaagatatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctttgctg- 10357271  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttg-taaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    | |||  || ||||   |||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  10357272 tattg--attatta-aatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 10357356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 427 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11424877 - 11424797
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  11424877 gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgctctggttggtaccgcatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 11424797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Original strand, 15355770 - 15355864
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15355770 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtagtaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 15355864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16997842 - 16997746
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  16997842 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 16997746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Original strand, 2584937 - 2585056
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || | | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  2584937 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttgcaagttgtttatgtt 2585036  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    | ||||||||  ||||||||    
T  2585037 gctgtctctgttgttgttga 2585056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 560 - 623
Target Start/End: Original strand, 4859033 - 4859096
Alignment:
Q  560 agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4859033 agttgttaataaagaattaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattat 4859096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14548941 - 14548846
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  14548941 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 14548846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 37018495 - 37018420
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  37018495 gttgagggcttgatgccctggattggtaacacatgcatgattaagaagtcgaagttgtattgtcgagtcaaagtcg 37018420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40906652 - 40906585
Alignment:
Q  487 ttaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgt 554  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40906652 ttaagaagttgaagttgcattgtcaagtcgaagttgttaatgtcgcattgtcgttgtcattaagttgt 40906585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 531 - 621
Target Start/End: Original strand, 44024649 - 44024745
Alignment:
Q  531 gcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44024649 gcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaat-gttattaattgttgttgttgatgttgtt 44024745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 437 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 33185921 - 33185851
Alignment:
Q  437 atgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||||||||||    
T  33185921 atgctctgtaagttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcattattaaaaggtcgtagttgcatt 33185851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 42874865 - 42874762
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       |||  |||||||||||||||  || ||||||||||    
T  42874865 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgacagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 42874772  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    |||| |||||    
T  42874771 tgataccctg 42874762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16997593 - 16997536
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  16997593 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 16997536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25090968 - 25090899
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  25090968 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgttatgttgt 25090899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42874888 - 42874808
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42874888 ttgttgagtccatggatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 42874808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Original strand, 7641630 - 7641724
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  7641630 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattcttatttatgttgtt 7641724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27028082 - 27027942
Alignment:
Q  50 atgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgat 147  Q
    |||||||| |||||| | || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || |    
T  27028082 atgttgttggttaatttaaactatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgct 27027983  T
Q  148 atgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27027982 atgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgctgttgttga 27027942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 559
Target Start/End: Original strand, 32467383 - 32467455
Alignment:
Q  487 ttaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32467383 ttaagaagttgaagttgcattgtcgagtttaagaagttgatgtcgcattgtcgtagtctttaagttgtcattt 32467455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 35659652 - 35659519
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| || |||| |||| ||       ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  35659652 gttgttgttgcattgtcgagttgatgtcaataatgtcgcattgtcgttgttgtcaagtcgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagt 35659553  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  35659552 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 35659519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42875114 - 42875019
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 178  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  42875114 gaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 42875019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 361851 - 361755
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||| |||||||||||||||||||||       ||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  361851 ttgttgttgtcgttaagttgtcatttgtcaataagttgttcataaagaactaagtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 361755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 19857178 - 19857082
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  19857178 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaagttagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttaagttattat 19857082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25090719 - 25090616
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25090719 ttactttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctttttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 25090626  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    |||| |||||    
T  25090625 tgattccctg 25090616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 37018647 - 37018556
Alignment:
Q  371 ttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg 468  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  37018647 ttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctgg 37018556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 46740053 - 46739930
Alignment:
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  46740053 gttgcattgtcgagttgatgtcgatgttgtcacattgtcgttgttgtcaagttgtcaattactagtgagttgttaatgagaaactatgtgaagtatcaat 46739954  T
Q  593 atttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    | ||||| || ||||||||||||||    
T  46739953 a-ttatttattgttgttgtttatgt 46739930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 422 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19609222 - 19609138
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||| |||||| ||||  || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19609222 tctgtgagtttatttacgctcaatacgttggaggcttgatgcc-tggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 19609138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25090742 - 25090662
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgc-tcttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  25090742 ttgttgagtccatgcatactcattt-actttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctttttaagttgagggcttgatgc 25090662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6511900 - 6511781
Alignment:
Q  71 tacatatattatgt-gaaaaggtatgttatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| || | | || ||| ||  ||| ||||||||||    
T  6511900 tacatatattatgtagaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatatttcaagttgtttatgtt 6511801  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||| |||||  ||||||||    
T  6511800 gttgcctctgttgttgttga 6511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9638317 - 9638226
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtc 174  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  9638317 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttattgttgttgtc 9638226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 345
Target Start/End: Original strand, 10357362 - 10357488
Alignment:
Q  220 gtctaagttgta-aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactc 317  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || |||    ||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  10357362 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgagtccatgcatactc 10357461  T
Q  318 atttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  10357462 attt-aagttgagggcttgatgccctgt 10357488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 453 - 510
Target Start/End: Original strand, 2425721 - 2425778
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  2425721 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgttgttgcattgtc 2425778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13446778 - 13446669
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||||| || | | || ||||||| ||| || |||||||    
T  13446778 tacatatattatgtgaaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgcttatgtt 13446679  T
Q  169 gttgtctctg 178  Q
    ||||||||||    
T  13446678 gttgtctctg 13446669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17333087 - 17333038
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17333087 gttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaagaagtt 17333038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19609639 - 19609570
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  19609639 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttaaaccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 19609570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 494
Target Start/End: Original strand, 26045583 - 26045652
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26045583 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 26045652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 494
Target Start/End: Original strand, 26050764 - 26050833
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26050764 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 26050833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14548655 - 14548599
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  14548655 tacgtggagggcttgatgccctgtgagcttttgctgtttaagttgagggcttgatgc 14548599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 20899489 - 20899605
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| |||| || || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||    
T  20899489 atatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatgttgcaagttgcttatgttgtt 20899588  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| | ||||||||    
T  20899589 gtctctactgttgttga 20899605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12622483 - 12622406
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12622483 gagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctatacgttgggggcttgatgc 12622406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 13592458 - 13592532
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  13592458 gttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgcatgattaagatgat-aagttgcatagtcaagtcgaagtcg 13592532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 184
Target Start/End: Original strand, 15448141 - 15448252
Alignment:
Q  75 tatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttg 172  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| || ||  |  ||||||| ||| || |||||||||||    
T  15448141 tatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttgttg 15448240  T
Q  173 tctctgccgttg 184  Q
    ||||||| ||||    
T  15448241 tctctgctgttg 15448252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 26444920 - 26444836
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag-ct-tttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||    
T  26444920 gagtccatgcatactcatt--aagttgagggcttgatgccctgtgagtctatttgctctatatgttgggggcttgatgccctgtgag 26444836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 494
Target Start/End: Original strand, 32307223 - 32307270
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  32307223 gttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgattaagaag 32307270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35659774 - 35659692
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctg 381  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  35659774 gagtccatgcatactcatctaaagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctatacgttgggggtttgatgctctg 35659692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 396
Target Start/End: Original strand, 9871550 - 9871584
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9871550 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt 9871584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Original strand, 15869218 - 15869256
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15869218 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 15869256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22353601 - 22353563
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22353601 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 22353563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25090635 - 25090601
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt 359  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25090635 gttgagggcttgattccctgtgagcttttgctctt 25090601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 32850990 - 32850952
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32850990 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 32850952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11425266 - 11425173
Alignment:
Q  89 aggtatgttatagaaaa-taatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatg-tttatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||| || |||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  11425266 aggtatgatatagaaaaataatattgttatatcattcatgttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgatgtatgttgttgtctctgc 11425173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 15791494 - 15791449
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15791494 gttgagggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgattaaga 15791449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42874781 - 42874728
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  42874781 gttgagggcttgataccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgc 42874728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 46640729 - 46640774
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  46640729 gttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgattaaga 46640774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 53082464 - 53082509
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  53082464 gttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgattaaga 53082509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 12288522 - 12288595
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  12288522 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ataagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcg 12288595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 14746781 - 14746817
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14746781 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 14746817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 14942388 - 14942492
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||| ||||| |||    
T  14942388 gaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgctgtt 14942487  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  14942488 gttga 14942492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 349
Target Start/End: Original strand, 16027037 - 16027088
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc 349  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16027037 ttgttgagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagc 16027088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 17048332 - 17048368
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17048332 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 17048368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 37018647 - 37018603
Alignment:
Q  334 ttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37018647 ttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 37018603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Original strand, 46225560 - 46225636
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46225560 gagtccatgcatactcatt--aagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctatacgttgggggcttgatgc 46225636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 55582251 - 55582207
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55582251 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 55582207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 84 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20959 - 20410
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20959 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgt 20860  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgt 281  Q
    | ||||  | ||||   |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||| |||| | |||    
T  20859 tattga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataaattgttgatgt 20763  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctg 381  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20762 tgtccaagttgtaagttgttgagtccgtgcatactcatttgaagttgaggatttgatgctctgtgagcttttactcttacgttgagggcttgatgctctg 20663  T
Q  382 tgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatc 481  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| |||||      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  20662 tgagcttttgttctt-atgttgagggctggatgccctgtg------agtgtatttatactctttatgttgagggcttgatgccttgattggtaccacatg 20570  T
Q  482 catgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaaga 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| | |    
T  20569 catgattaagaagttatagttgcattatcgagtcgaagtcgctgatgtggcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatctatgagttgttaacgcaaa 20470  T
Q  575 actatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20469 actatgtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 20410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 114 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 10953253 - 10952814
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10953253 ttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaa 10953155  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  10953154 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgatattccaagatattggagtcatataagttgtggagttgtctaagatgtacgttgttgagtccatgcat 10953055  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgat 413  Q
    |||||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  10953054 actcattttaagttgagggtttgctgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgat 10952955  T
Q  414 gctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcga 512  Q
    ||       |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  || ||    
T  10952954 gc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaatttgaagttgcataagttga 10952861  T
Q  513 gtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||  |||| |  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10952860 gtttaagttgtagaagtcgcattgtctttgtcgttaagttgtcattt 10952814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 294
Target Start/End: Original strand, 23200234 - 23200508
Alignment:
Q  20 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200234 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatat 23200333  T
Q  120 cattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200334 cattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgtaagatgtttatgttgttgtctatgctgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttg 23200433  T
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgta 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23200434 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatattggagtcatataagttgtggtgttttctaagatgta 23200508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 280 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 20565531 - 20565175
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20565531 gttgtctaagttgtaagttgatgagtccatgcatactcatttaaagttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttacgttgatggcttgatgct 20565432  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccac 478  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20565431 ctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctttatgttaagggcttcatgccctagttggtaccac 20565338  T
Q  479 atccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacga 571  Q
    || |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  20565337 atgcatgattaagaagttgtagttgtagtgacgagtcgaattcgctgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacga 20565238  T
Q  572 agaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20565237 agaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgtc 20565175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 76 - 559
Target Start/End: Original strand, 25250623 - 25251106
Alignment:
Q  76 atattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtc 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| || || ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  25250623 atattatgtgaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtc 25250722  T
Q  175 tctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagtt 274  Q
    ||| |  |||||||| | |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25250723 tctactattgttgaatt-attaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagtt 25250821  T
Q  275 g-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct--tacgttgaggg 369  Q
    | ||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||  |||||||||||    
T  25250822 gttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatat-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttactctaatacgttgaggg 25250920  T
Q  370 cttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||| | | |||| | |||||||       |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25250921 cttgatgccctgtgagcctatttgctcttcaagttgagggtttgatgc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgataccctg 25251014  T
Q  468 gttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25251015 gttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcgttgatgtcgcgttgtcgttgtcattaagttgtcattt 25251106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 76 - 559
Target Start/End: Original strand, 25314408 - 25314891
Alignment:
Q  76 atattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtc 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| || || ||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  25314408 atattatgtgaaaatgtatgatatagaaaataatgttgatatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtc 25314507  T
Q  175 tctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagtt 274  Q
    ||| |  |||||||| | |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25314508 tctactattgttgaatt-attaatatcattaagttgcaaatgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatataagtt 25314606  T
Q  275 g-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct--tacgttgaggg 369  Q
    | ||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||  |||||||||||    
T  25314607 gttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatat-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttactctaatacgttgaggg 25314705  T
Q  370 cttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||| | | |||| | |||||||       |||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25314706 cttgatgccctgtgagcctatttgctcttcaagttgagggtttgatgc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgataccctg 25314799  T
Q  468 gttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25314800 gttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcgttgatgtcgcgttgtcgttgtcattaagttgtcattt 25314891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 280 - 633
Target Start/End: Original strand, 21406604 - 21406964
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21406604 gttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctatacgttgagggcttgatgct 21406703  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctcttta-----tgttgagggcttgatgccctggttggt 473  Q
    |||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||      ||||||||| || |||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21406704 ctgtgaccttttgttctttaagttgagggcttgatgc------tctgtgagtataattatactctttatgttgtgttgagggcttgatgccctggttggt 21406797  T
Q  474 accacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgt 565  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  21406798 accacatgcatgattaagaaattgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgt 21406897  T
Q  566 taacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21406898 taataaagaactatgtgaaatattaatatttattaatcgttgttatttatgttg-tatatgatgatgt 21406964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 200 - 633
Target Start/End: Original strand, 36509664 - 36510099
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacatt 298  Q
    |||||||||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |     
T  36509664 tcattaagttgcatatgttagtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagtc 36509763  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttt 397  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36509764 gttgagtccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgcactgtgagcttttgttgtatatgttgagggcttgatgctctgtgagattttgctc-tt 36509862  T
Q  398 atgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttg 497  Q
    ||| |||| | |||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36509863 atg-tgaggggttgatgc------cctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggtttgatgtcttggttggtaccacatgcatgattaagaagttg 36509955  T
Q  498 tagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtatt 589  Q
     |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  36509956 aagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagcgaagtatt 36510055  T
Q  590 aatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  36510056 aatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 36510099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 556
Target Start/End: Original strand, 20469823 - 20470336
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtta--tatcattcaagatgttattgtt 138  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||| | || || ||||   ||||||||||| |||| || |     
T  20469823 aatgattaatgttgttggttaatttgagatacatatattatgtggaaattgtatgatatagaga-tattgatgttcattatcattcaagttgtttttatc 20469921  T
Q  139 -gatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttg 237  Q
     | || || |||| || ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  20469922 agttgttg-tatgctgcaagttgttgatgttgttgtctttgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaaatgttggtcaaagttgcaaagttg 20470018  T
Q  238 taagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttg 336  Q
    |||| ||||  ||||| ||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20470019 taagttgttgttccaaaatactggagtcgtataagttgttgaagttgtctaagttgtaggttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttg 20470117  T
Q  337 attccctgtgag-ct-tttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtg 431  Q
    || |||| |||| || |||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |  ||||||| || | || | ||||||||| |||||      |||     
T  20470118 atgccctatgagtctatttgctctataagttgagggcttgataccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtg------agta 20470211  T
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcg 531  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||    
T  20470212 tatctatgctctatatgttgagggcttgatgctcttgttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcatcgtcgagttgaagtctttgttgtcg 20470311  T
Q  532 cattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    |||||||||||| |||| |||||||    
T  20470312 cattgtcgttgttgttatgttgtca 20470336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 439 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 26761387 - 26761185
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||||||    
T  26761387 gctctataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgt 26761288  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatga 630  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26761287 cgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtttttatatgatga 26761188  T
Q  631 tgt 633  Q
    |||    
T  26761187 tgt 26761185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16227534 - 16227109
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtaca--tt 298  Q
    |||||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  ||    
T  16227534 attaagttgcatatgttagtcaaagttgtcaagttttaagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgatgttgtccaaattgtacacgtt 16227435  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt- 396  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||| || || || | |||||||   |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||       
T  16227434 gtggagtccatgcatactcattt-aagttgggggtttgatgccttg-gaacctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaa 16227338  T
Q  397 tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagt 495  Q
    || | |||| |||||||| ||     ||| |||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16227337 taagttgagggcttgatg-tc-----ctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagt 16227244  T
Q  496 tgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagta 587  Q
    || |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16227243 tgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttattaatgaagaactatgtgaagta 16227144  T
Q  588 ttaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227143 ttaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 16227109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 302 - 633
Target Start/End: Original strand, 23202699 - 23203034
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac--gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-ta 398  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||| ||||| |||| |||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  23202699 gagtccatgcatactcattc-atgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaata 23202796  T
Q  399 tgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
     | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||   || ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23202797 agttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaaataagttgatggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatta-gaagtt 23202889  T
Q  497 gtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtat 588  Q
    | |||||||| ||| ||||  |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23202890 gaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtat 23202989  T
Q  589 taatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23202990 taatattttttaatcgttgttgtttatgttgttatatgattatgt 23203034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 621
Target Start/End: Original strand, 5889600 - 5889807
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  5889600 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 5889699  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5889700 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgccaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttggtt 5889799  T
Q  614 atgttgtt 621  Q
    ||||||||    
T  5889800 atgttgtt 5889807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 422 - 621
Target Start/End: Original strand, 21741982 - 21742189
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  || |    
T  21741982 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaatt 21742081  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21742082 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgccaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttggtt 21742181  T
Q  614 atgttgtt 621  Q
    ||||||||    
T  21742182 atgttgtt 21742189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 448 - 617
Target Start/End: Original strand, 12122583 - 12122761
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||    
T  12122583 gttgagggcttgatgcactggattgataccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcg 12122682  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    ||||||||||||||       |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122683 ttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaatagagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 12122761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 448 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 31454844 - 31454652
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||| ||||||||    
T  31454844 gttgagggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagttgtagaagtcgcattgttgttgtcgt 31454745  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||||||||| ||       |||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||    
T  31454744 taagttgtcaattgttaatgagttgttaataaagaaataagtaaagtattaatatttattaatcgtggttgtttatgttattatgagatgatg 31454652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 453 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 17874976 - 17874806
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||    
T  17874976 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaaattgaagttgcatatgttgagttcaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagt 17874877  T
Q  552 tgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
    ||||| ||       ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17874876 tgtcaattgtcaatgagttgttaatgaagaattaagtgaagtattaatatttattaatcgtggttgtttat 17874806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 21555465 - 21555659
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||| ||||||||| ||||    
T  21555465 gttgagggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcacattgtcgtggtcg 21555564  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||| ||||       |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  21555565 ttaagttgttatttgtcaatgagttgttaatagagaactaggtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 21555659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 423 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 31455482 - 31455265
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  31455482 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggtttgatgccctggtttgttccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagtt 31455383  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || |||||||||| |||||||||||||||||| ||       |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31455382 gtagaagtcgcattgttgttgtcgttaagttgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaactaagtaaagtattaatatttattaatcgtggttgttta 31455283  T
Q  615 tgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  31455282 tgttattatgagatgatg 31455265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 279 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 15796394 - 15796159
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac-gttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  15796394 tgttttctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattt-atgtttagggcttgatgccctgtgagcttttgctctacccgttgagggtttgatgc 15796296  T
Q  378 tctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtacc 476  Q
     |||||||| ||||||||    | |||| ||||||||| |||||      ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15796295 cctgtgagcctttgctctactcgttgagggcttgatgccctgtg------agtatatttatactctt-atgttgagggcttgatgccctggattggtacc 15796203  T
Q  477 acatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| ||| |||||    
T  15796202 acatgcatgattaagaagatagagttgcatagtcaagttgaagt 15796159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25742922 - 25742695
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctcttta 398  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  25742922 gagtccatgcatactcattc-aagttgagggcttgatgccctgtgagccattgctctttacgttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctcttta 25742824  T
Q  399 tgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgt 498  Q
     | |||| ||||||||| |||||      ||| ||||||||||||||||||||                    ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25742823 agttgagggcttgatgccctgtg------agtatatttatgctctttatgttg--------------------gtaccacatgcatgattaagaagatgt 25742750  T
Q  499 agttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttg 553  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25742749 agttgcattgtcgagttgaagtcgtagatgttgcattgtcgttgttgttaagttg 25742695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 21558130 - 21558324
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||    
T  21558130 gttgggggcttgatgcactagattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcg 21558229  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    || ||||| |||||       |||||||||   | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  21558230 tttagttggcatttgtcaatgagttgttaatagataattaagtgaagtattaatatttatcaatcgttgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 21558324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 475 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 12354291 - 12354138
Alignment:
Q  475 ccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgtta 567  Q
    |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || || | || ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||       |||||||    
T  12354291 ccacatgcatgtttaagtcgttgttgttgcattgtcgagttgatgtggttgttgtcgcattgtcgctgttgttaagttatcaattatcaatgagttgtta 12354192  T
Q  568 acgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12354191 atgaagaactatgtgaattattaata-ttattaattgttgttgtttatgttgtta 12354138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Original strand, 21619109 - 21619199
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  21619109 ctgtgagtatatttatactctatatgttgggggcttgatgcccaggttggtaccacacgcatgattaagttgttgtagttgcatcgtcgag 21619199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Original strand, 13536465 - 13536549
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13536465 ctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgtggtagttgcatt 13536549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 25743672 - 25743579
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac-gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctct 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25743672 gagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctatgagtttttactctacccgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct 25743579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 39244807 - 39244737
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39244807 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 39244737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 480
Target Start/End: Original strand, 6551460 - 6551642
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--tttt 390  Q
    |||| ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||| |||||   |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||   |||    
T  6551460 ttgttgagtccatgcatacttatctaaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgagcctattt 6551559  T
Q  391 gctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    ||||| || | || | |||||||||      ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  6551560 gctctataagttgggggcttgatgc------tctgtgagtatatttatgctctatacgttg-gggcttgatgccttgattggtaccacat 6551642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 622
Target Start/End: Original strand, 20198811 - 20199001
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  || || ||||||||||||||| || || | || |||| ||||||    
T  20198811 tgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgtagttgttgcattgtcgagttgatgttgttgttgtcacattgt 20198910  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    | | || |  ||||||||| ||       ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||||    
T  20198911 catcgttgacaagttgtcaattactaaggagttgttaatgagaaactatgtgaagtattaataatcatt-attgttgttgtttacgttgtta 20199001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 617
Target Start/End: Original strand, 6551669 - 6551798
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  6551669 gttgtcgttgcattgtcgagttgatgtcgatagtgtcgcattgtcgttgttgtcaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagt 6551768  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6551769 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgt 6551798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 515
Target Start/End: Original strand, 25578320 - 25578409
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25578320 gagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcattgtcgagtc 25578409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 622
Target Start/End: Original strand, 21619208 - 21619342
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||| ||||||||||  ||||     
T  21619208 gttgttgttgcattgttgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattatcaatgagttgttaatgaagaactatacgaaga 21619307  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||| |||||||| | | |||| ||||||||||    
T  21619308 attaata-ttattaattgatattgtctatgttgtta 21619342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 29914243 - 29914135
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgtt 547  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||  || || ||||||||||||||| || || |||| | ||||||||||||||| ||     
T  29914243 gttgggggtttgatgccctgattggtaccacattcatgtgtaagttgtcgttgttgcattgtcgagtagatgttgatgttatcgcattgtcgttgttgtc 29914144  T
Q  548 aagttgtca 556  Q
     ||||||||    
T  29914143 cagttgtca 29914135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 19920631 - 19920572
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  19920631 gttgggggcttgatgccctggttggtactacatgcatgattaagaggtcgtagtagcatt 19920572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 451 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 23469609 - 23469542
Alignment:
Q  451 gagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcga 517  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||    
T  23469609 gagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcgagtcga 23469542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 26740956 - 26741031
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  ||||| || ||| |||||||||||    
T  26740956 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttggatagtcaagtcgaagtcg 26741031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 504
Target Start/End: Original strand, 29915488 - 29915539
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgc 504  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29915488 gggcttgatgtcctagttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgc 29915539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19920942 - 19920880
Alignment:
Q  92 tatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||| |||||||||||    
T  19920942 tatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttattattattaatgatgatatgttgt 19920880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 491
Target Start/End: Original strand, 25574754 - 25574820
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25574754 gagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 25574820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 571 - 621
Target Start/End: Original strand, 29915612 - 29915662
Alignment:
Q  571 aagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29915612 aagaactaagtgaagtgttaatatttattaaatgttgttgtttatgttgtt 29915662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 322
Target Start/End: Original strand, 33895855 - 33895958
Alignment:
Q  217 ttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatact 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||  |||| ||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||  |    
T  33895855 ttggtctaagttgtaaagtcgtaagttgttgttccaaagtattggagtctta--agttgtgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatttt 33895952  T
Q  317 catttg 322  Q
    ||||||    
T  33895953 catttg 33895958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 8504701 - 8504823
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc---ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttt 397  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||| |    
T  8504701 gagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttcgctctatacgttgggggcttgatgccctaagagcttatgctctat 8504799  T
Q  398 atgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    | | || | ||||||||| |||||    
T  8504800 aagttgggggcttgatgccctgtg 8504823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 21732239 - 21732311
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  21732239 gttgagggcttgatgcccaggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 21732311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 21809890 - 21809962
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  21809890 gttgagggcttgatgcccaggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 21809962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 345
Target Start/End: Original strand, 12122397 - 12122519
Alignment:
Q  223 taagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtcca-tgcatactcatt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||    ||||| |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12122397 taagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattatttgagtcatatgagatgtctaagttgt-taagttgtaagatgttgagtccattgcatactcatt 12122495  T
Q  321 tgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||    
T  12122496 t-aagttgagggcttgatgccctgt 12122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 439 - 514
Target Start/End: Original strand, 8504834 - 8504909
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  8504834 gctcttaaagttgggggcttgatgccctgattgataccacatgcatgtttaagttgttgttgttacattgtcgagt 8504909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Original strand, 24277302 - 24277437
Alignment:
Q  42 aatgattaatg-ttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | ||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||| ||    
T  24277302 aatgattaatgattgttagttagtttaagatatatatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattatt 24277401  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtc 174  Q
     ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24277402 aatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 24277437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24384911 - 24384776
Alignment:
Q  42 aatgattaatg-ttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | ||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||| ||    
T  24384911 aatgattaatgattgttagttagtttaagatatatatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataccattcaagttgttattatt 24384812  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtc 174  Q
     ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24384811 aatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 24384776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29447929 - 29447890
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29447929 attaagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 29447890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29914384 - 29914299
Alignment:
Q  303 agtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  29914384 agtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagc 29914299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 427 - 491
Target Start/End: Original strand, 25575947 - 25576013
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25575947 gagtgtatttatgctcaaataagtttagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 25576013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 489
Target Start/End: Original strand, 26733100 - 26733142
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgatta 489  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26733100 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatta 26733142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31455056 - 31454932
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactca 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || |||    ||||| ||||| |||   ||| |||| ||||||||||||    
T  31455056 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaagttgt-taagtcgtaagatgttgagttcatgcatactca 31454958  T
Q  319 tttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31454957 ttt-aagttgagggcttgatgccctgt 31454932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40725622 - 40725584
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40725622 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 40725584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16227582 - 16227537
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  16227582 gttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgattaaga 16227537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 21555253 - 21555302
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  21555253 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 21555302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 269
Target Start/End: Original strand, 21557918 - 21557967
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  21557918 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 21557967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 22178532 - 22178577
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22178532 gttgagggcttgctgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 22178577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 8952791 - 8952895
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||| |||| || || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||    
T  8952791 gaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgttgtt 8952890  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  8952891 gttga 8952895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 16605467 - 16605511
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16605467 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 16605511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17875193 - 17875141
Alignment:
Q  220 gtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataag 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||    
T  17875193 gtctaagttgttaagttgtaagatattgatccaaattattggagtcatataag 17875141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 22107632 - 22107668
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22107632 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 22107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22110729 - 22110685
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22110729 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 22110685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 202 - 633
Target Start/End: Original strand, 20411639 - 20412072
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||| || |||||  ||||    
T  20411639 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattgaagtcatataagttgttgatgttgtccaaattgtaagttgt 20411738  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20411739 tgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatg 20411837  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtag 500  Q
     |||| |||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  20411838 ttgagggcttgatg-tc-----ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggttgaag 20411931  T
Q  501 ttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    ||||| |||||||||  |||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20411932 ttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcacattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaat 20412031  T
Q  593 atttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20412032 atttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 20412072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 84 - 633
Target Start/End: Original strand, 19829694 - 19830241
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| || |||| |||||| || ||||||| ||||||||   |||||||| ||||| ||    
T  19829694 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttgcaagatgtt---gttgttgtttctgctgt 19829790  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgt 281  Q
    || ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | |||    
T  19829791 tgctgaac-cattatggtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgt 19829889  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctg 381  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19829890 tgtccaagttgtaagttgttgagtctatgcatacttatttgaagttgagggcttgatgctctatgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctg 19829989  T
Q  382 tgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatc 481  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||      ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19829990 tgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgc------tctgtgaatgtatttatgctc-ttatattgagggtttgatgccctggttggtaccacatg 19830081  T
Q  482 catgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaag 573  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  | || |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||| |||  |||    
T  19830082 catgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttatgttgtagaagtcgcattgtcgctgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgctaataaag 19830181  T
Q  574 aactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19830182 tactatttaaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtggttataagatgatgt 19830241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 557
Target Start/End: Original strand, 22376755 - 22377103
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||| |||||||  |||||  | || ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||  ||||    
T  22376755 attaagttgcaagtgttggtctaatgtacaaagttgtgagatgttgttccaaagttttggagtcatataacttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 22376854  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  22376855 tgagtccatgcatactcattg--agttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctacttatgttgagggattgatgccctgtgagcttttgctctt-at 22376951  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| ||||||||| ||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22376952 gttgagggcttgatgccctgt------gagtgtatttatgctctttatgttgagggattgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgta 22377045  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| ||| |||| | |||||||||||    
T  22377046 gttgcattgtcgagttgaagtcatagatgttgcatagtcattgttgataagttgtcat 22377103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20136686 - 20136408
Alignment:
Q  236 tgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagct 334  Q
    |||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20136686 tgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggct 20136588  T
Q  335 tgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgta 433  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||       ||||||| |||    
T  20136587 tgatgccctgttagcttttgatctatacgttgagggcttgatgccctgtgagattttgctctttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagggta 20136494  T
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  20136493 tttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcatagtcaagtcgaagt 20136408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 520
Target Start/End: Original strand, 22196183 - 22196461
Alignment:
Q  236 tgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagct 334  Q
    |||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22196183 tgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggct 22196281  T
Q  335 tgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgta 433  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||       ||||||| |||    
T  22196282 tgatgccctgttagcttttgatctatacgttgagggcttgatgccctgtgagattttgctctttatgttgagggcttgatgc------cctgtgagggta 22196375  T
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||    
T  22196376 tttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttgcatagtcaagtcgaagt 22196461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 555
Target Start/End: Original strand, 22212206 - 22212715
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22212206 atgaataatgttgttggttaatttgagatacatatattatgtgaaaattgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattga 22212305  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgta-aagttgt 238  Q
    || || | ||||| ||| ||||| |||||| || ||||||  |||||||  | |||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22212306 tgttgttgtgttgcaagttgttttatgttgctgcctctgcttttgttga--ttatttatatcataaagttgcaagtgttggtctaagttgtctaagttgt 22212403  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttga 337  Q
    |||  |||  |||||  | || |||| ||||||| ||| | ||||||  | ||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22212404 aagtcgttgttccaaagttttggagttatataagatgttgatgttgtgcatgttgtaagttgttgagtccacgcatactcattt-aagttgagggcttga 22212502  T
Q  338 ttccctgtgagcttttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
    | || ||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| || ||      ||||||||    
T  22212503 tgccatgtgagcctttactcaaatacgttgagggcttgatgccccgtgagcctttgctctttgagttgagggcttgatgccctatg------agtgtatt 22212596  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcatt 535  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |  ||||||||     
T  22212597 tatgctcttaa-gttgagggcttgatgttctggttggtaccacatgcatgactaagaagttgaagttgcatagtcaagtcgaagttgttagtgtcgcatc 22212695  T
Q  536 gtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||||||| |||| |||||    
T  22212696 gtcgttgtcattaaattgtc 22212715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 423 - 634
Target Start/End: Original strand, 23492339 - 23492557
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23492339 ctgtgagtatatttatgctctatacgtcgggggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagttgatgtcg 23492438  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
     || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492439 ttgttgtcgcattgtcgttgttgttcagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaaccatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 23492538  T
Q  616 gttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23492539 gttgttatatgataatgtc 23492557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 423 - 634
Target Start/End: Original strand, 23497937 - 23498155
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  23497937 ctgtgagtatatttatgctctatacgtcgggggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagttgatgtcg 23498036  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
     || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498037 ttgttgtcgcattgtcgttgttgttcagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaaccatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 23498136  T
Q  616 gttgttatatgatgatgtc 634  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23498137 gttgttatatgataatgtc 23498155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 238 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 15895943 - 15895631
Alignment:
Q  238 taagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttg 336  Q
    |||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  15895943 taagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattc-aagttgagggcttg 15895845  T
Q  337 attccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
    || ||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||      ||||||||    
T  15895844 atgccccgtgagcctttgctccttaatttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt-atgttgagggtttgatgccctgtg------agtgtatt 15895752  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcatt 535  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||     
T  15895751 tatgctctttatgttgagggtttgatgccctggttggtaccacatgtatga-taagaagatgtagttgcattgtcgagttgaagtcgtagatgttgcata 15895653  T
Q  536 gtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    |||||| | | |||||||||||    
T  15895652 gtcgttattgataagttgtcat 15895631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 202 - 467
Target Start/End: Original strand, 23083140 - 23083398
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||    
T  23083140 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtcgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 23083239  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23083240 tgagtccatgcatactcatt--gagttgagggcttaatgccctgtgagcctttgctccttacgttgaggggttgatgccctgtgagcttttgctc-ttat 23083336  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    | |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083337 gttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 23083398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16245388 - 16245038
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacatt 298  Q
    |||||||||||||   ||| ||| | ||||| |||||||||||||||  |||||  |||| || |||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||    
T  16245388 tcattaagttgcatatgttagtccatgttgttaagttgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataagttgtccatgttgtccaagttgtaagtt 16245289  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttt 397  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||  ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16245288 gttgagtccatgcatactcattc-aagttgagggtttgatggcctgtgagcctttgctccttgcgttgaaggcttgatgccctgtgagcttttgctctt- 16245191  T
Q  398 atgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttg 497  Q
    ||| |||| ||||||||| || ||      |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  16245190 atgttgagggcttgatgccctatg------agtgtattaatgatctt-atgttgagggcttgacgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagaag 16245098  T
Q  498 tagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  16245097 tagtcgcattgtcaagttgaagtcgaagatgttgcatagtcgttgttgataagttgtcat 16245038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 325 - 557
Target Start/End: Original strand, 23083300 - 23083530
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgt 420  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||     || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  23083300 gttgaggggttgatgccctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgt 23083399  T
Q  421 gtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23083400 ------gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcatagtcgagttgaagt 23083493  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
        ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23083494 tttagatgttgcattgtcgttgttgataagttgtcat 23083530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 42 - 415
Target Start/End: Original strand, 31735620 - 31735990
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| ||     
T  31735620 aatgattaatgttgttggttaatttgaaatacatatattatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttattatta 31735719  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgt 238  Q
    ||| || ||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31735720 atgttgctatgttacaagttgttttatgttgctgtctctgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgt 31735817  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||        |||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  31735818 aagttgttgttccaagatattggagtcatataa--------gttgtctaagttataagttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggtttgat 31735908  T
Q  339 tccctgtgagc--ttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
     ||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  31735909 gccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgcgcctatttgctctttaagttgagggcttgatgc 31735990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 23017266 - 23017484
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||     
T  23017266 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgtccttgttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtctagtttaagtt 23017365  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23017366 gttgaagtcgcattgtcgttgtcgtcaagttgtaatttatcaacgagttgttaatgaagaactatgtgaagaattaatatttattaatcgttgttgttta 23017465  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23017466 tgttgttatatgatgatgt 23017484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 491
Target Start/End: Original strand, 23528206 - 23528456
Alignment:
Q  236 tgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagct 334  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||   || |||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23528206 tgtaagatgttgatccaaactattggagtcatataagatgttcatgatgtctaagttgtaagatgttgagttcatgcatactcattt-aagttgagggct 23528304  T
Q  335 tgattccctgtgagcttttgctctta-cgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgta 433  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||       |||||||| ||    
T  23528305 tgatgccctgtgagatttttctctactcgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaggttgagggcttgatgc------cctgtgagtata 23528398  T
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaag 491  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23528399 tttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaag 23528456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 302 - 520
Target Start/End: Original strand, 17229826 - 17230038
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17229826 gagtccatccatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctatatacgttgagggcttgatgccctgtgagctttagctctttatg 17229924  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
     |||| |||||| ||       || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |    
T  17229925 ttgagggcttgaagc------cctatgagtatatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaa 17230017  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  17230018 gttgcatagtcaagtcgaagt 17230038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 276
Target Start/End: Original strand, 24551067 - 24551212
Alignment:
Q  130 gttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttg 229  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24551067 gttattattgatgttgctatgttgcaagatatttatgttgatgtctctgctgttgatgaa-tcattatagtcattaagttgcaagtgttggtttaagttg 24551165  T
Q  230 taaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt 276  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24551166 taaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatataagttgt 24551212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 385
Target Start/End: Original strand, 18260087 - 18260256
Alignment:
Q  217 ttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcat 313  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18260087 ttggcctaagttgcaaagttgtaagttgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatgcat 18260186  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18260187 actcatt--aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgacgccctgtgag 18260256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 453 - 633
Target Start/End: Original strand, 27329002 - 27329194
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaa-- 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||   |||   ||| |||||||| |||||||      
T  27329002 gggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagttcaagttcttgaaaccgcgttgtcgttttcgttaatt 27329101  T
Q  550 --gttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
      ||||| |||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27329102 aagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgcgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 27329194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 453 - 633
Target Start/End: Original strand, 27389742 - 27389934
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaa-- 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||   |||   ||| |||||||| |||||||      
T  27389742 gggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagttcaagttcttgaaaccgcgttgtcgttttcgttaatt 27389841  T
Q  550 --gttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
      ||||| |||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27389842 aagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgcgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 27389934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 438 - 557
Target Start/End: Original strand, 31735965 - 31736084
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  31735965 tgctctttaagttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgatttaaatgttgtagttgcagtgtcgagttgaagtcgttgttgtcgcattgt 31736064  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  31736065 cgttgttattaagttgtcat 31736084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 362 - 555
Target Start/End: Original strand, 18260196 - 18260381
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||| || |||||      |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18260196 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgacgccctgtg------agtgtatttatgctatt-atgttgagggcttgat 18260287  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||  || || |||| |||||||| | |||||||||    
T  18260288 gccctcgttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagtttcattgtcaagttgaagtcgtagaggttgcatagtcgttgttgataagttgtc 18260381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 422 - 614
Target Start/End: Original strand, 25957062 - 25957262
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||    
T  25957062 tctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagt 25957161  T
Q  521 cgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttt 613  Q
     |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25957162 tgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgttaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattgttgttt 25957261  T
Q  614 a 614  Q
    |    
T  25957262 a 25957262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 360 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17105545 - 17105391
Alignment:
Q  360 acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttg 459  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||  |||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17105545 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaatattttgagggcttgatgccctg-------gagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttg 17105454  T
Q  460 atgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  17105453 atgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 17105391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7825631 - 7825473
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  7825631 tacgttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 7825538  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  7825537 gatgccctggattgataccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgaatcaaagtcg 7825473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 448 - 623
Target Start/End: Original strand, 20734531 - 20734715
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| || |  |||| |  || ||||||||||||||||||    
T  20734531 gttgagggtttgatgccctggattagtaccacatgcatgattatgaagttgaagttgcatatgttgatttcaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcg 20734630  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||| ||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20734631 ttaagttgtcaattgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgtggttgtttatgttattat 20734715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 453 - 622
Target Start/End: Original strand, 18458221 - 18458397
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagtt 552  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18458221 gggcttgatgccttggttgataccacatgcatgtttaagttgttgttgttgcattgtcgagttaatgtcgttgttgtcgcattgtcgctgttgttaagtt 18458320  T
Q  553 gtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttg-tttatgttgtta 622  Q
    |||||||       ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18458321 gtcatttatcaataagtagttaatgaagaactatgtgaagtattaata-ttattaattgatgttgttttatgttgtta 18458397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 456 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 27850823 - 27850638
Alignment:
Q  456 cttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||| |||  |||||||     
T  27850823 cttgatgccctggttggtaccacatgcataattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgtcgtcaataagttgc 27850724  T
Q  555 cattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||       |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  27850723 catttgtcaatgagttattaatgaagaattatgtggagtattaatatttattaatcgttgttgtccatgttgtgataagatgatgt 27850638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 520
Target Start/End: Original strand, 18177842 - 18178055
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac-gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18177842 gagtgcatgcatactcattt-atgttgagggtttgatgccctgtgagctttcactctacccgttaagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacg 18177940  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatga-ttaagaagttgt 498  Q
     |||| ||||||||| ||     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |      
T  18177941 ttgagggcttgatgc-ct-----tgtgagtatatttatgctc-ttatgttgagggcttgattccctggattggtaccacatgcatgatttaagaagatag 18178033  T
Q  499 agttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||| ||| ||| |||||    
T  18178034 agttgcatagtcaagttgaagt 18178055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 466 - 617
Target Start/End: Original strand, 25965153 - 25965312
Alignment:
Q  466 tggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt----- 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||||||| |||||||||||         
T  25965153 tggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttgttaa 25965252  T
Q  560 --agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
      |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25965253 tgagttgttaataaagaactaagtgaagtgttaatatttattaatcattgttgtttatgt 25965312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 362 - 522
Target Start/End: Original strand, 27126467 - 27126622
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | || ||||||||| |||        |||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  27126467 gttgagggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttcagggcttgatgccctgga------agtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgat 27126560  T
Q  462 gccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  27126561 gccctggattcgtaccacatgcatgattaataagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 27126622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 423 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 22556162 - 22556046
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  22556162 ctgtgagtatatttatgttctatatattgggggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcg 22556063  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcg 539  Q
     || ||| |||||||||    
T  22556062 ttgttgttgcattgtcg 22556046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23538441 - 23538293
Alignment:
Q  360 acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttg 459  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||  |||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23538441 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaatattttgagggcttgatgccctg-------gagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttg 23538350  T
Q  460 atgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||    
T  23538349 atgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagtcgcattgtctagtc 23538293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 360 - 522
Target Start/End: Original strand, 19656482 - 19656637
Alignment:
Q  360 acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttg 459  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  || | |||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  19656482 acgttgagggcttgatgttctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgccctg-------gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttg 19656573  T
Q  460 atgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  19656574 atgccctggattgataccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 19656637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18319565 - 18319490
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  18319565 tatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacattcatgattaagaggtcgtagttgcatt 18319490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 377
Target Start/End: Original strand, 19656210 - 19656380
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||  |||| |||||   ||||||| || ||||||| ||||||||  |||| ||    
T  19656210 aagttgcaagtgttggtcaaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtc--ttaagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttga 19656307  T
Q  304 gtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||  || ||||||||||||||||    
T  19656308 gtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagactttgctcaataagttgagggcttgatgc 19656380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 17318859 - 17319111
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |     
T  17318859 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgctg- 17318957  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttg-taaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtg 280  Q
    | |||  || |||| | ||||||||| |||   |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || |||    |    
T  17318958 tattg--attatta-tatcattaagtagcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatatgagatgtctaag 17319054  T
Q  281 ttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    |||| |||||||||    || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  17319055 ttgtttaagttgtaagacgttgagtccatgtatactcattt-aagttgagggcttgat 17319111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18204047 - 18203916
Alignment:
Q  284 tctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac-gttgagggcttgatgctctgt 382  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||  | ||| |||||||||||| ||||    
T  18204047 tctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcattt-atgttgagggtttgatgccctgtgagctttcactctacccgttaagggcttgatgccctgt 18203949  T
Q  383 gagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  18203948 gagcttttgctctttacgttgagggcttgatgc 18203916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 18453029 - 18452954
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  18453029 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 18452954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24441235 - 24441132
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttg 184  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  24441235 gaaaaggtatgatattgaagataatgttgttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgctgttg 24441136  T
Q  185 ttga 188  Q
    ||||    
T  24441135 ttga 24441132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 453 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 22805561 - 22805491
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  22805561 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 22805491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31734039 - 31733927
Alignment:
Q  71 tacatatatt-atgtgaaaa-ggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatg 166  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||    
T  31734039 tacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatg 31733940  T
Q  167 ttgttgtctctgc 179  Q
    |||||||||||||    
T  31733939 ttgttgtctctgc 31733927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 178
Target Start/End: Original strand, 27126214 - 27126309
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctg 178  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  27126214 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgctgtctctg 27126309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Original strand, 19859422 - 19859492
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19859422 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattattgtttatgttgtt 19859492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 515
Target Start/End: Original strand, 15705641 - 15705945
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaa-gttgtacattgtgg 302  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||  |||| ||||| || |  |||| | ||||||| || ||||||  |||| |    
T  15705641 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcgttccaaagtattggagtcttaaa--ttgtcgatgttgtccaaagttgtaagttgttg 15705738  T
Q  303 agtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgc 401  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||  |||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  || |     
T  15705739 agtccatgcataatcattt-aagttgggggcttgatgacctg-gagcctttgctcaacacgttgagggattgatgccctg-gagcctttgctcaataagt 15705835  T
Q  402 tgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    |||| ||||| ||| ||| |      |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | |    
T  15705836 tgagggcttgttgccctggg------agtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattgttaccacatgcatgattaagaagtcgaa 15705929  T
Q  500 gttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15705930 gttgcattgtcaagtc 15705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28947447 - 28947346
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||  || |||| || ||| |||||||    
T  28947447 tgctctataagttgggggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgttgttgtattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgt 28947348  T
Q  538 cg 539  Q
    ||    
T  28947347 cg 28947346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 453 - 556
Target Start/End: Original strand, 6083867 - 6083971
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgatt-aagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||| || ||||    
T  6083867 gggcttgatgccttgattggtaccacatgcatgttttaagttgttgttgttgcattgtcaagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgtcaagt 6083966  T
Q  552 tgtca 556  Q
    |||||    
T  6083967 tgtca 6083971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 13751083 - 13751199
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||    
T  13751083 atatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgtt 13751182  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||| ||||||||    
T  13751183 gtctctgctgttgttga 13751199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 15891440 - 15891536
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  15891440 gaaaatgtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 15891536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 377
Target Start/End: Original strand, 27126446 - 27126520
Alignment:
Q  303 agtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  27126446 agtccatgcatactcatttga-gttgagggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttcagggcttgatgc 27126520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31733664 - 31733605
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  31733664 gttgggggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 31733605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 457 - 507
Target Start/End: Original strand, 17319215 - 17319265
Alignment:
Q  457 ttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  17319215 ttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 17319265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18203962 - 18203904
Alignment:
Q  332 gcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttt 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18203962 gcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccttgtgagcttt 18203904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 611096 - 610947
Alignment:
Q  42 aatgattaatg-ttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | |||  ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  611096 aatgattaatgattgttagttagtctaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattatt 610997  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
     ||  || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  610996 aatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgctgttgttga 610947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 16492958 - 16492886
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  16492958 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 16492886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17743005 - 17742932
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  17743005 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 17742932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17743173 - 17743075
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatg 376  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  17743173 tgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatacccattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatg 17743076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7827303 - 7827231
Alignment:
Q  71 tacatatatt-atgtgaaaa-ggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgat 141  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  7827303 tacatatatttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataattttgttataccattcaagttgttattattgat 7827231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 22556063 - 22555934
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  22556063 gttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtctcattgtcgttgttgttaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaact 22555964  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22555963 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgt 22555934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Original strand, 29848258 - 29848350
Alignment:
Q  97 tatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29848258 tatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgctgttgttga 29848350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 35007959 - 35007885
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  35007959 gttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaagtt-aagttgcatagtcaagttgaagtcg 35007885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17105665 - 17105569
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||||| || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  17105665 gttgtctacgtcgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgc 17105569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18708814 - 18708772
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaag 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18708814 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaag 18708772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 556
Target Start/End: Original strand, 19958080 - 19958142
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  19958080 gttgtcgttgcattgtcgagttgatgtcgatgttgtcgcattgtcgttgtgttcaagttgtca 19958142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 20223754 - 20223685
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcga 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  20223754 gttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgcatgattaagaagtt-aagttgcatagtcaagtcga 20223685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22117738 - 22117669
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcga 517  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  22117738 gttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgcatgattaagaagtt-aagttgcatagtcaagtcga 22117669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23500762 - 23500654
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctt--ttgctct-tacgttgagggcttgatg 376  Q
    ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||||| || |||||||||||||||    
T  23500762 gttgtttaagttgttggttgttgagtccatgcatactcatta-aagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctataagttgagggcttgatg 23500664  T
Q  377 ctctgtgagc 386  Q
    | ||||||||    
T  23500663 ccctgtgagc 23500654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 18896620 - 18896692
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  18896620 gttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgattaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 18896692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Original strand, 20078316 - 20078395
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc 357  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  20078316 tgttgtctaagttgtccaagttgttgagtctatgcatactcattt-aagttgagagcttgatgtcctgagagcctttgctc 20078395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 377
Target Start/End: Original strand, 27573247 - 27573345
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatg 376  Q
    ||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||   || |||||||||||||||    
T  27573247 tgttgtccaagatgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaataagttgagggcttgatg 27573344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 7825712 - 7825656
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatg 414  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||| ||||||||    
T  7825712 ttacgttgagggcttgatgttctatgagctgttgctctttaagttgagggcttgatg 7825656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 520
Target Start/End: Original strand, 20078486 - 20078554
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||    
T  20078486 gggcttgatgtcctagattggtaccacatgcatgattaagaaatcgaagttgcattgtcgagtcaaagt 20078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 20108945 - 20108872
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  20108945 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat--ttaagaggtttaagttgcatagtcgagttgaagtcg 20108872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Original strand, 23498474 - 23498521
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23498474 gaactatgtgaagtatcaatatt-atttatcgttgttgtttatgttgtt 23498521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 33442856 - 33442782
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgatt-aagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  33442856 ttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatttaagaagata-agttgcatagtcgagtcgaagtcg 33442782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18658528 - 18658426
Alignment:
Q  75 tatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttg 172  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||  || |||||||||||    
T  18658528 tatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 18658429  T
Q  173 tct 175  Q
    |||    
T  18658428 tct 18658426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Original strand, 23151003 - 23151053
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt 135  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23151003 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttatt 23151053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23538639 - 23538543
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  23538639 gttgtctaagttgtaagatgttgagtccatgcatactcatat-aagttgagggcttgatgcactg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgc 23538543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7825628 - 7825575
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7825628 gttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 7825575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18453157 - 18453079
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc 357  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18453157 tgttgtccaagttgtacacgttgtggagtccatgcatactca-ttcatgttgggggcttgatgccctg-gagcttttgctc 18453079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 19362236 - 19362191
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  19362236 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgaataaga 19362191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 25714256 - 25714211
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgatta 489  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25714256 tatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatta 25714211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7825735 - 7825656
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatg 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  7825735 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgttctatgagctgttgctctttaagttgagggcttgatg 7825656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 15817717 - 15817753
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15817717 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 15817753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 17377995 - 17378031
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17377995 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 17378031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19234331 - 19234287
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19234331 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 19234287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Original strand, 19958266 - 19958313
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19958266 gaactatgtgaagtatcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 19958313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 22555886 - 22555839
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22555886 gaactatgtgaaggatcaatatt-atttatcgttgttgtttatgttgtt 22555839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22805855 - 22805819
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22805855 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 22805819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25920555 - 25920511
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25920555 tatgctctatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 25920511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 30674485 - 30674529
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30674485 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 30674529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 114 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 397775 - 397335
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||| || |||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  397775 ttatatcattcaagttgttattcttgatgttgctattttgcaaaatgtttatgttgctacctctgctgttgttgaa-tcattgttgtcattatgttgcaa 397677  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |  | ||||||||||||    
T  397676 gtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatataagttgtggatttgtccaagttgtacgtatttgagtccatgcat 397577  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttga 412  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  397576 actcatttgaagttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctctatacgttgagggtttgatgccctgtgagctttttctctttaagttgagggcttga 397477  T
Q  413 tgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcg 511  Q
    |||       |||||||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  397476 tgc------cctgtgagtataattatactctatatgttgagggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgttg 397383  T
Q  512 agtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  397382 agtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 397335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Original strand, 127493 - 127691
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgt-tg 139  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |    
T  127493 atgattattgttgttggttaatttgagctacatatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattatcag 127592  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
     || || ||||||| ||| |||| |||||| | ||| ||| |||||||  || |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  127593 ttgttg-tatgttgcaagttgttgatgttgctatctttgctgttgttg--attattaatatcattaagttgcaagtgttggtcaaagttgctaagttgta 127689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 202 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 39309 - 38876
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  || ||  |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  ||||    
T  39309 attaagttgcaagtgtttgtctaagttacaaagttgtaagatgttgttctaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 39210  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39209 tgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctatgagcttttgctc-ttatg 39111  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtag 500  Q
     |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  39110 ttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaag 39017  T
Q  501 ttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    |||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  39016 ttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagctgttaataaagaactaagtgaagtattaat 38917  T
Q  593 atttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||||    
T  38916 atttattaatcgttgttgattgtgtcgttatgagatgatgt 38876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 34758 - 34720
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34758 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 34720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 559
Target Start/End: Original strand, 127115 - 127632
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||| || || |     
T  127115 aatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtggaaaggtatgatagggaaaataatgttattatatcatccaagttgttgttattaaa 127214  T
Q  142 gctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    | || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  127215 gttgctatgttgcaagctgttttatgttgttgtctctgctgttgttgaatt-attaatatcattaagttacaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaa 127313  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgatt 339  Q
    | || |  | ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  127314 gttgattttgcaagatattggagtcatataagttgttcaagttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattt-aagtagatggcttgatt 127412  T
Q  340 ccctgtgagc--ttttgctct--tacgttgagggcttgatgctctgtgagct--tttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgta 433  Q
    ||||||||||   |||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||       ||| |||| ||    
T  127413 ccctgtgagcctatttgctgtactatgttgagggcttgatgccctgtgagcttattttctctttaagttgagggcttgatgc------cctgcgagtata 127506  T
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgca 533  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  127507 tttatgatctatatgttgggggtttgatgctctggttggtatcacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgatgtcgca 127606  T
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  127607 ttgtcattgtcgttaagttgtcattt 127632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 622 - 409
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    ||| || |||||||||    
T  622 tgttgtccaagttgtgcacgttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgcttaacacgctgggggcttgat 525  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctctt-tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttgg 472  Q
    || ||||||| ||||||||   || | |||| ||||||||| ||  |      |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  524 gccctgtgagattttgctcaaataagttgagggcttgatgccctagg------agtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattgg 431  T
Q  473 taccacatccatgattaagaag 494  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  430 taccacatgcatgattaagaag 409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 429 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6844 - 6777
Alignment:
Q  429 gtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6844 gtgtatttatgctcaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaag 6777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 200 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 14270 - 13852
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattg 299  Q
    |||||||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||  |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14270 tcattaagttgcatatgttagtcaaagttgtcaagttataagatgttgttccaaagtattggaatcacataagttgtggagttgtctaagttgtacgttg 14171  T
Q  300 tggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14170 ttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttat 14072  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| |||||||||       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |    
T  14071 gttgagggcttgatgc------cctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcattataaagaagttgaa 13978  T
Q  500 gttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaa 591  Q
    ||| ||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||       |||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13977 gttacatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgtgaagttgtcaattgtcaatgagttattaataaagaactaagtgaagtattaa 13878  T
Q  592 tatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13877 tatttattaatcgttgttgtttatgt 13852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 243 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2880
Alignment:
Q  243 tgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccc 342  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  3058 tgttattccaagatattggagtcatataagttgtggagttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgtcc 2959  T
Q  343 tgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgt 420  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||    
T  2958 tatgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgt 2880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 492
Target Start/End: Original strand, 56010 - 56081
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  56010 ctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 56081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2976 - 2917
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  2976 gttgagggcttgatgtcctatgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 202 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2718 - 2295
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||  |||     
T  2718 attaagttgcatatgctggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgc 2619  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2618 tgagtccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatg 2520  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtag 500  Q
     |||| | |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  2519 ttgagggtttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaaaaagttgaag 2426  T
Q  501 ttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    |||||| ||| ||||  |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2425 ttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaaagagttgttaataaagaactaagtgaagtattaat 2326  T
Q  593 atttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2325 atttattaatcgttgttgtttatgtcgttat 2295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2931 - 2853
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc 357  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  2931 tgttgtccaagttgtacacgttgtggagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgataccctg-gagcctttgctc 2853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 42 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 28632 - 28118
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  28632 aatgattaatgttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaatgtatgatacagaaactaatgttgttatatcattcaagttgttattattaat 28533  T
Q  142 gctga-tatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    | ||| |||| || ||| ||||| |||||| | ||||||| ||| ||||  | ||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28532 g-tgactatgctgcaagttgttttatgttgctatctctgctgttattga--ttattaacatcatttagttgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgta 28436  T
Q  240 agatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgat 338  Q
    || |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| || | |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28435 agttgtcgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtccaaatagtaagttgttgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgat 28336  T
Q  339 tccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
     |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| | | |||| | ||||||| || |       ||| ||||    
T  28335 gccctgtgagcctttgctctttacattgagggcttgatgccctgtgagcctattttctcttcaagttgagggtttgatgccctata------agtatatt 28242  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcatt 535  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  28241 tatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttttagttgcattgtcaagttgaagtcgttgatgtcgcatt 28142  T
Q  536 gtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
     || |||| |||||||||||||||    
T  28141 atcattgttgttaagttgtcattt 28118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 422 - 633
Target Start/End: Original strand, 47600 - 47818
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  47600 tctgtgagtataattatactctatatgttgagggtttgatgctctgtttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagtttcattgtcgagtcgaagtc 47699  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||       ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47700 gttgatgtcgcattgtcattgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaaaaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 47799  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47800 tgttgttatatgatgatgt 47818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 385
Target Start/End: Original strand, 47306 - 47607
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  || ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||    
T  47306 gaaaaggtatgatatagaaaa-aatgttgttataccattcaagttgttataattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctactgt 47404  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gt 281  Q
      ||||  | ||||   |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| | |||||| |  ||    
T  47405 a-ttga--ttattaaa-tcattaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgtttcaagatattggagtcatgtgagttgttgaagt 47500  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagct--tttgctctt-acgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  47501 tgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggattgatgccctgtgagcacattttctctttaagttgagggcttgatgct 47600  T
Q  379 ctgtgag 385  Q
    |||||||    
T  47601 ctgtgag 47607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 558
Target Start/End: Original strand, 775 - 1207
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  775 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgttgttgttgaa-tcattattgtcattaacatgcaa 873  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||| ||||  |||||||||||    
T  874 gcgtttgtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggagtcatataagttgtgg---------agttgtacgttgttcagtccatgcat 964  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagct--tttgctctttatgctgagagctt 410  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||| | |||| | ||    
T  965 actcatttgaagttgaggacttgatgccccgtgagcttttgctatatacgttgagggcttgatgccctatgagcttattttctctttaagttgagggttt 1064  T
Q  411 gatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgt 509  Q
    |||||       ||| |||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1065 gatgc------cctgcgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgt 1158  T
Q  510 cgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatt 558  Q
     ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1159 tgagttaaagtagtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatt 1207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 202 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 55064 - 54712
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||||    
T  55064 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttatccaagttgtaagttgt 54965  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatg 400  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54964 tgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgttctgtgagcttttgctc-ttatg 54866  T
Q  401 ctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtag 500  Q
     |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||    
T  54865 ttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcaatgttaagaagatgtag 54772  T
Q  501 ttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta 560  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| |||| ||||| || | ||||||||| ||||    
T  54771 ttgcattgtcgagttgaagtcagagatgttgcatagtcgtcgttgataagttgtcgttta 54712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 84 - 385
Target Start/End: Original strand, 53377 - 53678
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    |||||| ||||| ||| |||| || | || |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  53377 tgaaaatgtatgatatggaaattattatttttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgttgtt 53476  T
Q  184 gttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttg 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  53477 gttgaa-tcattattgtcattaagttgcaagtgttggttaaagttgtaaagttgtaagtttttattccaagatattcgagtcatataagttgtggagttg 53575  T
Q  284 tctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgt 382  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  53576 tctaagttgtacgttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggtttgatgccctgtgtgcttttgctctttatgttgagggtttgatgccctgt 53675  T
Q  383 gag 385  Q
    |||    
T  53676 gag 53678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 362 - 559
Target Start/End: Original strand, 53617 - 53809
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||      ||| || |||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  53617 gttgagggtttgatgccctgtgtgcttttgctctttatgttgagggtttgatgccctgtg------agtataattatactctatatattgagtgcttgat 53710  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53711 gccctggttggtaccatatgcatgattaagaggttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 53809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 306 - 633
Target Start/End: Original strand, 9044 - 9372
Alignment:
Q  306 ccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9044 ccatgcatactcatttgaagttgagtgcttgatgccctgtgagcctttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgag 9142  T
Q  406 agcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca 505  Q
     |||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9143 ggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctctttatgctgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgca 9236  T
Q  506 t-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatattta 597  Q
    | ||| ||||  || | |  ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9237 tatgttgagtttaatttgtagaatttgcattgtcgttttcgttaagttgtcatttgtcactgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatattta 9336  T
Q  598 ttaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  9337 ttaatcgttgtcgattatgttgttataagatgatgt 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 426 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 7283 - 7073
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatg 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7283 tgagtgtatttatgctcgttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgcagttgcattgtcgagtcgaagtcgctg 7184  T
Q  526 atgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7183 atgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacaaagaactatgtgaagttttaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 7084  T
Q  619 gttatatgatg 629  Q
    |||||||||||    
T  7083 gttatatgatg 7073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 280 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 7466 - 7285
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | || | ||| |||||||| ||| |||||||||||||||     
T  7466 gttgtctaagttgtaagtttctgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctttcagcatttgctctatacattgagggcttgatgcc 7367  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 466  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||       |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7366 ctgtgagcttttactctttaagttgagggtttgatgc------cctgtgagtataattatactctttatgttgggggtttgatgccct 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 159 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24399 - 24013
Alignment:
Q  159 tgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatat 258  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  | || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||| |||   || ||  |||    
T  24399 tgtttatgttgttgcctctgttgttgttga--ttatcattatcattaagttggaagtgttggtctaagttacaaagttttaagttgtagttctaaagtat 24302  T
Q  259 ttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc 357  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  24301 tggagtcatataagttgttgatgttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctc 24203  T
Q  358 tt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggc 456  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||| || |||||| |||        ||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  24202 tttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttaagttgagggcctgatgccctg--------agtatatttatgctctatatgttgggggc 24111  T
Q  457 ttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgt 554  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24110 ttcatgccctggttggtaccacatgcatgatcaagaagttgaagttgcattgtcgagtcgaagtcgttgatgtcgcattgtcgttgttgttaagttgt 24013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 10)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 325 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 15792 - 15483
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtct 424  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||       
T  15792 gttgagggcttgttgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgct-tttatgttgagatcttgatgcactatg--- 15697  T
Q  425 gtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcga 523  Q
       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||     
T  15696 ---agtgtatttatgctctttatgttgagtgcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagtcgt 15600  T
Q  524 tgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatg 616  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15599 agaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataacgaactaagtgaagtattaatatttattaattgttgttgtttatg 15500  T
Q  617 ttgttatatgatgatgt 633  Q
    | |||||  ||||||||    
T  15499 tcgttatgagatgatgt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 114 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 13225 - 12940
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13225 ttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgttgctgctgttgttgaac-cattattgtcattaagttgcaa 13127  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13126 gtgttggtctaagttgtaaagctgtaaattgttattccaagatattgga-tcatataagttgtgaagttgtctaagttgtacgttgttgagtccatgcat 13028  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag----cttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     || ||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13027 actcatttgaagttgagagcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatattgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt 12940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16043 - 15734
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16043 ttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgctgttgttgaac-cattattgtcattaagttgcaa 15945  T
Q  214 gagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcat 313  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  ||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  15944 gtgttagtctaatttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattgga-tcgtataagttgtgaagttgtttaagttctacgttgttgagttcatgcat 15846  T
Q  314 actcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag----cttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagc 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||     || ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||    
T  15845 actcatttgaagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgttgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggc 15747  T
Q  409 ttgatgctctgtg 421  Q
    |||||||||||||    
T  15746 ttgatgctctgtg 15734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 428 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 3431 - 3234
Alignment:
Q  428 agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatga 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || |  |||| |  ||    
T  3431 agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgaatttaagttgtaga 3332  T
Q  527 tgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||       |||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3331 agtcgcaatgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagtttttaataaagaactaagtaaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 3234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 208 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17311
Alignment:
Q  208 ttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtc 306  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||  ||||||||||| |  || |||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||    
T  17598 ttgcaagtgttggtctgagttgcgaagttgtaagttgttgttccaagatattggcatcgtataagttgttgatgttgtctaagttgtaagttgttgagtc 17499  T
Q  307 catgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctg 403  Q
    ||||||||||| | | | |||||| ||||||| |||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||||||| | ||    
T  17498 catgcatactcctat-atgttgagggcttgatgccctatgagcctttgcttttcacgttgagggtttgatgccctgtgagcctattttctctttaagttg 17400  T
Q  404 agagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgt 498  Q
    || |||||||||      ||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17399 agggcttgatgc------tctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttgataccacatgcatgattaagaagttgt 17311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 326 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12973 - 12879
Alignment:
Q  326 ttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  12973 ttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgaggatttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgtg 12879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12999 - 12955
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12999 ctgtgagtgtatttatgctctttatattgagggcttgatgccctg 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15814 - 15773
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15814 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgttgccctg 15773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12920 - 12877
Alignment:
Q  342 ctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12920 ctgtgagcttttgctcttatgttgagggcttgatgccctgtgag 12877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 524 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 17310 - 17278
Alignment:
Q  524 tgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17310 tgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 17278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 6)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 84 - 559
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11919
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| | || |  || | | || ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||    
T  11447 tgaaaaagtatgatatagaaaataattttgttgtatcatccaaggttttgtcattaacgttgctatgttgcaatttgttttatgttgttgtctctgctgt 11546  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gt 281  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||| |  ||    
T  11547 tgttgaag-cattaatatcattaagttgcaagtgttggtctaagttataaagttgtaagttgttgtttcaagatattggagtcatataatttgttgaagt 11645  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctct 380  Q
    |||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  11646 tgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctatgagcctt-gctctttacgttgagggcttaatgccct 11744  T
Q  381 gtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccac 478  Q
    |||||| |  || |||| || | | |  ||||||||| |||||      ||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11745 gtgagcctattttctctataagttaaatgcttgatgccctgtg------agtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccac 11838  T
Q  479 atccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11839 atgcgtgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaggttgttgatgtcgcattttcgttgtcgttaagttgtcattt 11919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Original strand, 653 - 980
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatg 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || || | | || ||||||| ||| ||    
T  653 taatttgagatacatatattatgtgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatgttggaagttg 752  T
Q  161 ttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatt 259  Q
    ||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  753 ttttatgttgctctctctgctgttgttgaag-cattaatatcattaatttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttgttccaagatatt 851  T
Q  260 tgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc- 357  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||     
T  852 ggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctaagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctct 951  T
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  952 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagc 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Original strand, 5957 - 6284
Alignment:
Q  61 taatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatg 160  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  || || | | || ||||||| ||| ||    
T  5957 taatttgagatacatatattatgtgaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatgttggaagttg 6056  T
Q  161 ttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatt 259  Q
    ||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6057 ttttatgttgctctctctgctgttgttgaag-cattaatatcattaatttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttgttccaagatatt 6155  T
Q  260 tgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc- 357  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||     
T  6156 ggagtcatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgctaagtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctct 6255  T
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6256 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagc 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 423 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 7974 - 7838
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  7974 ctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagttgaggttg 7875  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7874 ttgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgttattt 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 421
Target Start/End: Original strand, 918 - 977
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  918 gttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 421
Target Start/End: Original strand, 6222 - 6281
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  6222 gttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 200 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 1220 - 789
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt--gttgtctaagttgtacat 297  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |   |||||||||||||||  |    
T  1220 tcattaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttggaagttgtctaagttgtaagt 1121  T
Q  298 tgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt 396  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1120 tgttgattccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctttgagcttttcctctatacgttgatggcttgatgctctgtgagtttttgctc-t 1022  T
Q  397 tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
    |||| |||| |||||||| ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1021 tatgttgagggcttgatg-tc-----atgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagtt 928  T
Q  497 gtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgtt--gtcgttaagttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaata 593  Q
    | |||||||| | | ||||  |||| |  || ||||| ||||||||  || | | | |||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  927 gaagttgcatatattgagtttaagttgtagaagtcgcgttgtcgttaagttg-tcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaata 829  T
Q  594 tttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  828 tttattaatcattgttgtttatgtcgttatgagatgatgt 789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 556
Target Start/End: Original strand, 4668 - 4993
Alignment:
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttg 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||      
T  4668 aagttgttaagttgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataagttgtggatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattc- 4766  T
Q  323 aagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||          
T  4767 aagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctcattgcgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgc------ 4859  T
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4860 cctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgcactagttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagtggaagtc 4958  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    |  ||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  4959 gtagatgttgcatagtcgttgttgataagttgtca 4993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 427 - 557
Target Start/End: Original strand, 14873 - 15002
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatga 526  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  14873 gagtgtatttatgctctt-atgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttgcattgtcgagtggaagtcgtaga 14971  T
Q  527 tgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  14972 tgttgcatagtcgttgttgataagttgtcat 15002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 374
Target Start/End: Original strand, 14714 - 14864
Alignment:
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttg 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||  |||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||      
T  14714 aagttgttaagttgtaagatgttgttccaaagtattggattcatataaattgtcgatgttgtctaagttgtaagttgttgagaccatgcatactcattc- 14812  T
Q  323 aagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttga 374  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14813 aagttgagtgcttgatgccctgtgagcgtttgctcttatgttgagggcttga 14864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9538 - 9494
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9538 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 9494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16730 - 16686
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16730 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 16686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 325 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 1437 - 1132
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctg 419  Q
    |||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||     || | ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1437 gttgagggcttgatgctctgtgagatttttctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccctg 1338  T
Q  420 tgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaag 519  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1337 tg------agtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatcccctggttggtaccacatacatgattaagaagttgtagttgcattgttgagtcgaag 1244  T
Q  520 tcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtt 612  Q
    ||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||       ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1243 tcgctgatgtcgcattgtcgt-----ttaagttgtcatttatcaatgagttgttaacgtataactatgtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtt 1149  T
Q  613 tatgttgttatatgatg 629  Q
    |||||||||||||||||    
T  1148 tatgttgttatatgatg 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 280 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1520 - 1338
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1520 gttgtctaagttgtaagttgctgagtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctcagtgagcctttgctctatacgttgagggcttgatgct 1421  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||| |||||||||       |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1420 ctgtgagatttttctctttaagttgagggcttgatgc------cctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccctg 1338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4568
Alignment:
Q  281 ttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctc 379  Q
    ||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |    
T  4686 ttgtctaagttgtaagttcccgagtccatgcatactcatttcaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctatatgttgagggcttgatgccc 4587  T
Q  380 tgtgagcttttgctcttta 398  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  4586 tgtgagcgtttgctcttta 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4642 - 4583
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  4642 gttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctatatgttgagggcttgatgccctgtg 4583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 334 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 8158 - 7856
Alignment:
Q  334 ttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgt 432  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||      |||||    
T  8158 ttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttaatgctctgtgagcttttgctctttaagttgatggcttgatgctctgtg------agtgt 8065  T
Q  433 atttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcg 531  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||    
T  8064 atttatgctctatatgttgagggcttgatgctctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcg 7965  T
Q  532 cattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaacta-tgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||       ||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7964 cattgtcgtcgtcgttaagttgtcatttatcaatgagtt-ataaaaaagaactattgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 7866  T
Q  624 atgatgatgt 633  Q
    | ||||||||    
T  7865 aagatgatgt 7856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8374 - 8158
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8374 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgt 8275  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgtt 282  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  8274 tgttgaac-cattattgtcattaagttgctatttttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattagagtcatataagttgtggagtt 8176  T
Q  283 gtctaagttgtacattgt 300  Q
    || |||||||||| ||||    
T  8175 gtttaagttgtacgttgt 8158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8129 - 8030
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctctttatgctgagagcttgatgctctg 419  Q
    |||||| |||| || | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||     || |||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8129 gttgagggcttaatgctctgtgagcttttgctctttaagttgatggcttgatgctctgtgagtgtatttatgctctatatgttgagggcttgatgctctg 8030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 231 - 509
Target Start/End: Original strand, 10786 - 11058
Alignment:
Q  231 aaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttga 329  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |  ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10786 aaagttgtaagttgttattccaagatattagagtcatatgtgttgttgaagttgtctaacttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttga 10885  T
Q  330 gagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||       |||||||    
T  10886 gggcttgatgctctgtgagcttttgctcttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggtttgatgc------cctgtgag 10978  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgt 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10979 tgtatttatgatctttatgttgagggcttgacgccctggttggtaccacatgtatgattaagaagttaaagttgcattgt 11058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 531 - 633
Target Start/End: Original strand, 11052 - 11161
Alignment:
Q  531 gcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11052 gcattgttgttgtcgttaagttgtcatttgtcactgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtttttat 11151  T
Q  624 atgatgatgt 633  Q
    | ||| ||||    
T  11152 aagattatgt 11161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 202 - 557
Target Start/End: Original strand, 12976 - 13323
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||    
T  12976 attaagttgcaagtgtcggtctaagttacagagttgtaagatgttgttccaaagtattggagtcgtataagttgttgacgttgtccaagttgtaagttgt 13075  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||    
T  13076 tgagtccatgcatactcatt--gagttgagagcttgatgccctgtgagcttttgctccttacgttgagggcttgacgccctgtgagatttttctc-ttat 13172  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||     
T  13173 gttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagaagtg 13265  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||||| | |||||||||||    
T  13266 gttgcactgtcgagttgaagtcgtagatgttgcatagccgttgttgataagttgtcat 13323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 557
Target Start/End: Original strand, 7510 - 7859
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   |||||  |||| || ||||||||||| | | ||||||| ||||||||  ||||    
T  7510 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtagttccaaagtattggaatcatataagttttcgatgttgtccaagttgtaagttgt 7609  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7610 tgagtccatgcatactcattc-aagttgagggcttgataccctgtgagctttggctccttacgttgacggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaa 7708  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| ||| ||||| || |   ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7709 gttgagggctcgatgccctat---tg---gtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgataccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgta 7801  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    | | ||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  7802 gctccatagtcgagttgaagtcttagatgttgcattgtcgttgttgataagttgtcat 7859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20725 - 20689
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20725 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 20689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 5)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 84 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5727 - 5385
Alignment:
Q  84 tgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    |||||| ||||| |||||||| || | ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5727 tgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgctgt 5628  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgt 281  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  5627 tgttgaac-cattattgtcattaaattgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtatttgagtcatataagttgttgatgt 5529  T
Q  282 tgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgag----cttttgctc-ttacgttgagggcttgatg 376  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||     || ||||| ||| |||||||||||||||    
T  5528 tgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatg 5429  T
Q  377 ctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
    | || ||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||    
T  5428 ccctatgagcttttgctc-ttacgtttagggcttgatgctctgtg 5385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 325 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 5443 - 5150
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtct 424  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||       
T  5443 gttgagggcttgatgccctatgagcttttgctcttacgtttagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtg--- 5348  T
Q  425 gtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcga 523  Q
       |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |     
T  5347 ---agtgttattaagctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgt 5251  T
Q  524 tgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatg 616  Q
      | || |||||||| |||||||||||||||| |||       |||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5250 aaaagttgcattgtcattgtcgttaagttgtcctttgtcaatgagttgttaataaataactaactgaagtattaatatttattaatcgatgttgtttatg 5151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 426 - 513
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8085
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7998 tgagtatatttatgctctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 8085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 426 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5465 - 5425
Alignment:
Q  426 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5465 tgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 621
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8227
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  8094 gttgttgttgcattgtagagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattactaatgagttgttaatgagaaactatgtgaaat 8193  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  8194 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 8227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 202 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 446536 - 446190
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||    
T  446536 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaaaatgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgt 446437  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttat 399  Q
      | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  446436 taattccatgcatactcatt--gagttgagggcttgatgccctatgagcctttgctccttacgtttagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttat 446340  T
Q  400 gctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgta 499  Q
    | |||| |||||||||        | |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  446339 gttgagggcttgatgc------catatgagtgtacttatgctctttatgatgagggtttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgta 446246  T
Q  500 gttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| | | |||||||||    
T  446245 gttgcatagtcgagttgaagtcttagatgttgcattgtcgttattgataagttgtc 446190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 31777 - 31590
Alignment:
Q  454 ggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagtt 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31777 ggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcacattgtcgttgtcgttaagtt 31678  T
Q  553 gtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    || |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31677 gtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 31590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 454 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 37084 - 36897
Alignment:
Q  454 ggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagtt 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37084 ggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcacattgtcgttgtcgttaagtt 36985  T
Q  553 gtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    || |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984 gtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 36897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 76620 - 76566
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  76620 gggcttgatgccgtggttggtaccacattcatgattaagaggtcgtagttgcatt 76566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 497272 - 497199
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||    
T  497272 gttgagggattgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagt 497199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 200 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1092 - 740
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacatt 298  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | ||||  |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  1092 tcatcaagttgcaagtgctggtctaatttgcaaagttgta-gttgttgttccaaagtattggagtcatataagttgttgatgttgtctaagttgtaagtt 994  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttt 397  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  993 gctgagtccatgcatactcattc-aagttgaggttttgatgccctatgagcctttgctctctacgttgagggcttgatgccttgtgagtctttgctcttt 895  T
Q  398 atgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttg 497  Q
    | | |||| ||||||||| ||||       ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  894 aagttgagggcttgatgccctgta------agtatacttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatg 801  T
Q  498 tag----ttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgt 554  Q
    |||    |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  800 tagttaattgcattgccgagttgaagtcgtagatgttgcattgtcgttgttgttaagttgt 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 520
Target Start/End: Original strand, 75933 - 76211
Alignment:
Q  236 tgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagct 334  Q
    |||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  75933 tgtaagatgttgttccaaaatgttggagtcatataagatgtcgatgttgtctaagttataagatgttgagtccatgcatactgattt-aagttgagggct 76031  T
Q  335 tgattccctgtgagcttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgta 433  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||       || ||||||||    
T  76032 tgatgccctgtgagcttttgctctatacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgc------cctatgagtgta 76125  T
Q  434 tttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||  || ||| |||||||||    
T  76126 tttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgaagttttatagtcaagtcgaagt 76211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 423 - 629
Target Start/End: Original strand, 66144 - 66353
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  66144 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagtggatgtcg 66243  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  66244 ttgttgtcgcattgtcgtt---gttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaaatattaata-ttattaattgttgttgtttat 66339  T
Q  616 gttgttatatgatg 629  Q
    ||||||||||||||    
T  66340 gttgttatatgatg 66353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 421
Target Start/End: Original strand, 65944 - 66068
Alignment:
Q  302 gagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc--ttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctgtgagct--tttgctct 395  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||   |||||||  ||| ||||||| |||||||| || ||||||  ||||||||    
T  65944 gagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcctatttgctctattaagttgaggccttgatgccctctgagcttatttgctct 66042  T
Q  396 ttatgctgagagcttgatgctctgtg 421  Q
     || | |||| ||||||||| |||||    
T  66043 atacgttgagggcttgatgccctgtg 66068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 678 - 489
Alignment:
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttg 322  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  678 aagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggtgtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaacttgttgagtccatgcatactcatttg 579  T
Q  323 aagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgat 413  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  578 aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 835
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc 357  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  913 tgttgtccaagttgtacacgttgtggagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctc 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 576 - 470
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||      ||     || ||||||| ||||||||||||||||    
T  576 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtg------agc----ttttgctctt-atgttgagggcttgat 489  T
Q  462 gccctggttggtaccacat 480  Q
     || |||||||||||||||    
T  488 accgtggttggtaccacat 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 748 - 703
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  748 gttgagggcttgatgccctggattgataccacatgcatgattaaga 703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 78463 - 78681
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  78463 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 78562  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78563 gttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcatttatcaatgagttattaatgaagaactacgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 78662  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  78663 tgttgttatatgatgatgt 78681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 467
Target Start/End: Original strand, 78421 - 78465
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctg 467  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  78421 ctgtgagcctatttacggtctttatgttgagggcttgatgccctg 78465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 5868 - 5675
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  5868 gttgggggcttgatgccctggtttgtaccgcatgcatgattaagaatttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 5769  T
Q  547 taagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    ||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768 taagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 5675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 362 - 169
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  362 gttgggggcttgatgccctggtttgtaccgcatgcatgattaagaatttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 263  T
Q  547 taagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| |||||       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262 taagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 13599 - 13406
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  13599 gttgggggcttgattccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 13500  T
Q  547 taagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| |||||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13499 taagttgtaatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgcgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 13406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 423 - 633
Target Start/End: Original strand, 6799 - 7017
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||     
T  6799 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagtt 6898  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||       | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6899 gttgaagtcgcattgtcgttatcgttaagttgtaatttatcaatgacttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcattgttgttta 6998  T
Q  615 tgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6999 tgttgttatatgatgatgt 7017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 5450 - 5546
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  5450 gaaaaagtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgttgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 448 - 633
Target Start/End: Original strand, 9936 - 10129
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  9936 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacttgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 10035  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||| ||||       |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10036 taagttgtaatttatcaatgagtttttaatgaagaactatgttaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 10129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 9495 - 9564
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  9495 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttatacctttcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 9564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 513
Target Start/End: Original strand, 2633 - 3101
Alignment:
Q  46 attaatgttgttagttaatgt-gaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt-gat 141  Q
    ||||||| |||| |||||| | || |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||| |  | |    
T  2633 attaatgatgttggttaattttgagatacatatattatgtggaaattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattatcagtt 2732  T
Q  142 gctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    | || ||||||| ||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||  | ||||   |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  2733 gttgctatgttgcaagttgtttatgttgatgtccttgctgttgttga--ttattaaattcattaagttgcaagttttggtcaaagttgcaaagttgtaag 2830  T
Q  242 atgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattc 340  Q
     |||   ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  2831 ttgtcgttccaagatattggagtcgtataagttgttggagttgtctaagtcgttggttgttgagtccatgtatactca-ttaaagttgagggcttgatgc 2929  T
Q  341 cctgtgagc--ttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
    | |||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||| | |||| |||||||||       |||||||| ||||    
T  2930 catgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgtgagtatatt 3023  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  3024 tatgctctatacgttgggggcttgatgcactggttggtaccacatgcatgattaagctgttgcagttgcattgtcgag 3101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 483 - 595
Target Start/End: Original strand, 3102 - 3221
Alignment:
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaa 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||       ||||||||| ||||||    
T  3102 atgattaagatgttgtagttgcattgtcgagttgaagtcgttgttgtcgcattgttgttgttgttaagttgtcaattatcaatgagttgttaatgaagaa 3201  T
Q  576 ctatgtgaagtattaatatt 595  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  3202 ctatatgaagaattaatatt 3221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 66364 - 65905
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||| || |    
T  66364 atgattattgttgttggttaatttgagatacatatatgatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattaaagttgttattattaa 66266  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    || || ||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||  | |||| | |||||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||    
T  66265 tgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgctgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtattggtcaaagtcgcaaagttgtaa 66168  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattc 340  Q
    | ||||| |||||||| |  ||||| |||||        ||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  66167 gttgttattccaagatgtcggagtcgtataa--------gttgtctaagttgttggttgctgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgc 66077  T
Q  341 cctgtgagc--ttttgctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatt 435  Q
    | |||||||   |||||||| || |||| |||| ||||||  |||||||   |||||||| || | || | |||||||||       |||||||| ||||    
T  66076 catgtgagcctatttgctctataagttgggggcatgatgccatgtgagcctatttgctctatacgttgggggcttgatgc------cctgtgagtatatt 65983  T
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  65982 tatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcataattaagttgttgtagttgcattgtcgag 65905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 527 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 65869 - 65768
Alignment:
Q  527 tgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttg 619  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||| |||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||    
T  65869 tgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattatcaatgagtttttaatgaggaactatatgaagaattaata-ttattaattgatgttgtctatgttg 65771  T
Q  620 tta 622  Q
    |||    
T  65770 tta 65768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 457 - 633
Target Start/End: Original strand, 65196 - 65380
Alignment:
Q  457 ttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 555  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  65196 ttgatgccctggttgataccacatgcatgattaagaagttgaagttgcctttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtc 65295  T
Q  556 attta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  65296 atttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcattgttttttatgttgttatatgatgatgt 65380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 633
Target Start/End: Original strand, 79547 - 79596
Alignment:
Q  584 agtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatgt 633  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79547 agtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgttatataatgatgt 79596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 279 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7525 - 7289
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||  | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7525 tgttgtccaagttgtaatttgttgagtccatgcatactcattc-atgttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacattgggggcttgatgc 7427  T
Q  378 tctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtacca 477  Q
     |||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||||      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7426 cctgtgagcttttgctctttaagttgggggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctt-atgttgggggcttgatgccctggatggtacca 7334  T
Q  478 catccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  7333 catggatgattaagaagttgaggttgcattgtcgagtcaaagtcg 7289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 448 - 629
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9667
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  9480 gttgggggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgt 9579  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    |||||||| ||||       ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9580 taagttgtaatttatcgatgagttgttaatgaagaacta--tgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 9667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Original strand, 9040 - 9090
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt 135  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9040 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttatt 9090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 632
Target Start/End: Original strand, 25835 - 26110
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25835 tacgttgagaacttgatgccctgtgagtttttgctctttaagttgaggtcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 25928  T
Q  459 gatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaag------- 550  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||||||||||||||||||           
T  25929 gatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgttaa 26028  T
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  26029 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatgagatgatg 26110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21874 - 21838
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21874 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 21838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 279 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 15430 - 15194
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||  | |||| | |||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15430 tgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattc-atgttgggggcttcatgccctgtgagcttttgctctttacgttggaggcttgatgc 15332  T
Q  378 tctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtacca 477  Q
     ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15331 cctgtgagcttttgctctctaagttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctt-atgttgggggcttgatgccctggatggtacca 15239  T
Q  478 catccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  15238 catgcatgattaagaagttgaagttacattatcgagtcaaagtcg 15194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 11189 - 10875
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||   |||    
T  11189 attaagttgcaaatgtcgatctaagttgtgaagttgtaagatgttgttccaaaatattggagtcatataagatgtcgatgttgtccaagttgtaggatgt 11090  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttta 398  Q
       |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11089 ttggtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctgtcagcctttgctcaaacacgttggggacttgatgccctgtgagcttttgctcttta 10991  T
Q  399 tgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttg 497  Q
    |  |||| |||||||||       || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10990 tcttgagggcttgatgc------cctatgagtgtatttatgctc-ttatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagatg 10898  T
Q  498 tagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
     |||||||| ||| ||| |||||    
T  10897 aagttgcatagtcaagttgaagt 10875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 22289 - 21975
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||   | |    
T  22289 attaagttgcaaatgtcgatctaagttgtgaagttgtaagatgttgttccaaaatattggagtcatataagatgtcgatgttgtccaagttgtaagatat 22190  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctcttac--gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctcttta 398  Q
      || |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||  ||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22189 ttaggccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctgtgagcctttgctcaaacacgttggggacttgatgccctgtgagcttttgcttttta 22091  T
Q  399 tgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttg 497  Q
    |  |||| ||||||||| || ||      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  22090 tcttgagggcttgatgccctatg------agtgtatttatgctctt-atgttgggggcttgatgccctggattggtacaacatgcatgattaagaagatg 21998  T
Q  498 tagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  21997 aagttgcatagtcgagtcgaagt 21975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Original strand, 102163 - 102321
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| |      ||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  102163 tacgttgaaggtttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctggg------agtgtatttatactcaatatgttgggggctt 102256  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  102257 gatgccctggcttggtaccacatgcatgattcagaagtcgaagtagcattgtcaagtcaaagtcg 102321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Original strand, 102059 - 102139
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  102059 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 102139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 415
Target Start/End: Original strand, 102082 - 102139
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  102082 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 102139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 423 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 109186 - 108981
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  109186 ctgtgagtatatttatgatttatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaatatgttgtagttgcattgtcgagttgaagtcg 109087  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||  |||||||| | |||||| |||    
T  109086 ttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatataaagaattaat-gttattaattgatgttgtctat 108988  T
Q  616 gttgtta 622  Q
    |||||||    
T  108987 gttgtta 108981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 59669 - 59550
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||| || | | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  59669 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatgttgcaagttgtttatgtt 59570  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||  |||| ||||||||    
T  59569 gttgttcctgctgttgttga 59550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 109519 - 109219
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt- 138  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||| | |||| | || |  |||| |||||||||||| ||||||| |      
T  109519 aatgattaatgttgttggttaatttgagatacatatattatgtggaaattgtatgatgtagaga-tattaatgttcatatcattcaagttgttattatca 109421  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctct-gccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttg 237  Q
    | || || ||||||||||| |||| |||||| ||||| | |  ||||||||  | |||| | ||||||||||||||| |||||||        |||||||    
T  109420 gttgttg-tatgttgtaagttgttgatgttgctgtcttttgttgttgttga--ttattaatatcattaagttgcaagtgttggtc--------aaagttg 109332  T
Q  238 taagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg--tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagctt 335  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  |||||||||| |  ||| || ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  109331 taagttgttgtcccaagatattggagttgtataagttgttgaatgtcgtttaagttgttggttgcggagtccatgcatactcattt-aagttgagggctt 109233  T
Q  336 gattccctgtgagc 349  Q
    ||| ||||||||||    
T  109232 gatgccctgtgagc 109219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 436 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 65041 - 64993
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccat 484  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  65041 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatccat 64993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 332128 - 332087
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgatt 488  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  332128 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 332087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 208 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 60446 - 60232
Alignment:
Q  208 ttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtc 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| |||||    
T  60446 ttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgttattccaagatattggaggtatataagttgttgaagttgtctaagttgtaagttgttgagtc 60347  T
Q  307 catgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgag 405  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  60346 catgcatactcatat-aagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctctttacgttgaggacttgatgccctgtgagccttttctctttacgttgag 60248  T
Q  406 agcttgatgctctgtg 421  Q
     ||||||||| |||||    
T  60247 ggcttgatgccctgtg 60232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 333 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 60283 - 60061
Alignment:
Q  333 cttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagctt--ttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgag 429  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| | | |||| |||||||||   |||      ||    
T  60283 cttgatgccctgtgagccttttctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctcttaa-gttgagggcttgatgccacgtg------ag 60191  T
Q  430 tgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgt 529  Q
    | || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  60190 tataattatactctatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtagaagttgttgatgt 60091  T
Q  530 cgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  60090 cgcattgtcgttgtctttaagtggtcattt 60061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 7)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 765
Alignment:
Q  20 tgttgataactatgatgttattaatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  902 tgttgataactatgatgttattaatgattaatcttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaagg-----tatagaaaataatgttgttatat 808  T
Q  120 cattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtt 162  Q
    ||| ||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||    
T  807 catccaagatgttgttattaatgctgctatgttgtaagttgtt 765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 362
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||      ||| || |||| |||| ||||||| ||||||    
T  557 tacgttgagggcttgatgccctgtgtgctttttctctttaagttgagggcttgatgctctgtg------agtataattatactctatatgttgtgggctt 464  T
Q  459 gatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcat 557  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  463 gatgctctgtttggtaccacatgcatgactaagaagttgaagttgcatatgtagagtttaagttgtagaagtcgcatgaccgttgtcgttaagttgtcat 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 638 - 535
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  638 ttacgttgaaggcttgatgccctatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc------cctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 545  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  544 tgatgccctg 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 661 - 581
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  661 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgaaggcttgatgccctatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 554 - 493
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  554 gttgagggcttgatgccctgtgtgctttttctctttaagttgagggcttgatgctctgtgag 493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 456 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7963 - 7898
Alignment:
Q  456 cttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||    
T  7963 cttgatgccctggattggtactacatgcatgattaagaagtcgaagttgcactgtcgagtcaaagt 7898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8136 - 8020
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| || |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  8136 tgttgtccaaattgtacacgttgttgagtctatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgggagcctttgctcaacacgttg-gggcttgat 8039  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc 394  Q
     |||| ||||||| |||||    
T  8038 tctctatgagcttatgctc 8020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 507
Target Start/End: Original strand, 1448 - 1740
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtgga 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||| ||  |||||| | ||||||| ||||||||  |||| ||    
T  1448 aagttgcaagtgttggtctaagttgtaaagttgtaagttgtcattccaaagtattggagtctta--agttgttgatgttgtccaagttgtaatttgttga 1545  T
Q  304 gtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgct 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||  |||| ||| |||   |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  || | |    
T  1546 gtccatgcatactcattt-aagttgatggcttcatgcccta-gagcctttactcaacacgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagtt 1642  T
Q  403 gagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagtt 502  Q
    ||| ||||||||| |||       ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1643 gagggcttgatgccctg-------gagtgtatttatgctcaataagttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgtagtt 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 448 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 142428 - 142246
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||  |||||| ||||| ||    
T  142428 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtttcattgttgttgttgt 142329  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||||||||||       |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  142328 taagttgtcatttgtcaatgagttattaatgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgtcgtttatgttgtta 142246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 142550 - 142456
Alignment:
Q  285 ctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc--ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||   || ||||||||||||||||    
T  142550 ctaagttgtacacgttgtggagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgc 142456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 169947 - 169983
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  169947 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 169983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 445
Target Start/End: Original strand, 11666 - 11906
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacattgt 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  |||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||     
T  11666 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgttgttccaaagtattggaatcatataagttgtcgatgttgtccaagttgtaagttgc 11765  T
Q  301 ggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgct-cttacgttgagggcttgatgctctgtgagc--ttttgctcttt 397  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||    
T  11766 tgagtccatacatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagtctttgctccttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgttcttt 11864  T
Q  398 atgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctcttt 445  Q
    | | |||| |||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  11865 aagttgagggcttgatgc------cctgtgagtgtatttatgctcttt 11906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 440 - 551
Target Start/End: Original strand, 15222 - 15337
Alignment:
Q  440 ctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtag----ttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcatt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||    
T  15222 ctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagatgtagttaattgcattgccgagttgaagtcgtagatgttgcatt 15321  T
Q  536 gtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||| |||||||    
T  15322 gtcgttgttgttaagt 15337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 448 - 623
Target Start/End: Original strand, 10320 - 10503
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgt 546  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || || ||||||||||||||||    
T  10320 gttgagggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagttgcattgtcgttgtcgt 10419  T
Q  547 taagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||| ||||||       |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10420 taagttatcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaatattaatatttattaatcgttgttgtttatgtcgttat 10503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 135
Target Start/End: Original strand, 9963 - 10013
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttatt 135  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  9963 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttgtaccattcaagttgttatt 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 362 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 56803 - 56650
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  56803 gttgggggcttgttgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtg------agtgtatttatgctctt-atgttgggggcttgat 56711  T
Q  462 gccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  56710 gccctggatggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 56650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 297 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 56830 - 56742
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgag 385  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  | |||| | ||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  56830 ttgttgagtccatgcagactcattc-atgttgggggcttgttgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag 56742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 423 - 632
Target Start/End: Original strand, 3035 - 3252
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtc 521  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||     
T  3035 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagttcaagtt 3134  T
Q  522 gatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaag-------ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgttta 614  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||       |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3135 gtagaagtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtaaattgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaacatttattaatcgtggttgttta 3234  T
Q  615 tgttgttatatgatgatg 632  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  3235 tgttattatgagatgatg 3252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 525 - 384
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  525 gttgtagttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 426  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  425 attaata-ttattaattgttgttgtttatgatgttatatgatg 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 438 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 534
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  609 tgctctataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Original strand, 187743 - 187884
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  187743 gttgtagttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaagt 187842  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  187843 attaata-ttattaattgttgttgtttatgatgttatatgatg 187884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 334 - 522
Target Start/End: Original strand, 166661 - 166843
Alignment:
Q  334 ttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgt 432  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| | |||  | ||||||| |||||      |||||    
T  166661 ttgattccttgtgagcctttgctctttacgttgggggcttgatgccctatgcgcttttgctctttaagttgaaggtttgatgccctgtg------agtgt 166754  T
Q  433 atttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||| ||||||    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  166755 atttatgctctt-atgttggaatcttgatgccctggatggtaccatatgcatgattaagaagttgaaattgcattgtcgagtcaaagtcg 166843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 438 - 513
Target Start/End: Original strand, 187659 - 187734
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  187659 tgctctataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 187734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 423 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 95272 - 95185
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtc 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95272 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgtatttgcattgtc 95185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 95639 - 95342
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaa-aggtatgttatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |  || |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  95639 atgattaatgttgttacttaatgtgaaatacttatattatgtggaagatggttgatatagaaattattattgcttatatcattcaagatgttattattta 95540  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgttta-tgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    |  || |||| || | | | |||| ||||| ||||||||| |||||    || | ||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||    
T  95539 tattgctatgctgcatgttatttaatgttgatgtctctgctgttgtgattattaatatt--cattaagatgcaaatgttggtctaagttgcaaagtcgta 95442  T
Q  240 agatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt---ggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttg 336  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  95441 agatgttgttccaagttattggagtcatataagttgttcaagt-ttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactca-ttaaagttgagggcttg 95344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 95181 - 95108
Alignment:
Q  483 atgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta 560  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  95181 atgattaagatgtcgaagttgcattgtcaagttgaagtcg----tgtcgcattgtcattgttgttaagttgttattta 95108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 303
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgt-tatatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||  ||| ||||||| ||     
T  582 aatgattaatgttgttggtaaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattc 483  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgt 238  Q
    ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||  | |||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  482 atgttgctacgttgtaagttgttttatgttgttgtctctactgttactga--ttattaatatcactaagttgcaagtgtcggtctaagttgcaaagttgt 385  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcat 319  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  384 aagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtttaagttgtaatttgatgagcccatgcatactcat 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8837 - 8558
Alignment:
Q  42 aatgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgt-tatatcattcaagatgttattgttg 139  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||  ||| ||||||| ||     
T  8837 aatgattaatgttgttggtaaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgttattattc 8738  T
Q  140 atgctgatatgttgtaagatgttt-atgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgt 238  Q
    ||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||  |||  | |||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8737 atgttgctacgttgtaagttgttttatgttgttgtctctactgttactga--ttattaatatcactaagttgcaagtgtcggtctaagttgcaaagttgt 8640  T
Q  239 aagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcat 319  Q
    ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  |||  ||| ||||||||||||||    
T  8639 aagttgttgttccaagatattggagtcatataagttgttgaagttgtttaagttgtaatttgatgagcccatgcatactcat 8558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 8)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 514
Target Start/End: Original strand, 19868 - 20018
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  19868 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgggggctt 19961  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19962 gatgccctggattggtaccacatgcatcattaagaagtcgaagttgcattgtcgagt 20018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 13271 - 13367
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  13271 gaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttattgtctctgc 13367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 19538 - 19634
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  19538 gaaaaggtataatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttcttgtctctgc 19634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7255 - 7171
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  7255 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgtgggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggccgtagttgcatt 7171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14374 - 14290
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  14374 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgtgggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggccgtagttgcatt 14290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 19764 - 19842
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgat 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  19764 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgat 19842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Original strand, 19787 - 19890
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| |       ||  ||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  19787 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatac------cctaggagtgtatttatgctcaatacgttgagggct 19880  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  19881 tgatgccctg 19890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 19871 - 19924
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19871 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 19924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 362 - 515
Target Start/End: Original strand, 19131 - 19279
Alignment:
Q  362 gttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgat 461  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||  |      | |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19131 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctagg------attgtatttatgctcaatatgttgagggcttgat 19224  T
Q  462 gccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19225 gccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtc 19279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 377
Target Start/End: Original strand, 19094 - 19184
Alignment:
Q  287 aagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19094 aagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 19184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 446 - 592
Target Start/End: Original strand, 4128 - 4281
Alignment:
Q  446 atgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcg 545  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||  |    
T  4128 atgttgggggcttgatgccctgattagtaccacatgcatgattaagtcgttgaagttgcattgtcgagtcgatgttgttgttgtcgcattgtcgttggtg 4227  T
Q  546 ttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaat 592  Q
    ||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4228 ttaagttgtcatttatcaatgagttgttaaggaagaactatgtgaagtattaat 4281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 449 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 3256 - 3146
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgtta 548  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||    
T  3256 ttgagggcttgatgcccaagttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttacattgtcgagtcgaagttgttgatgttgctttgtcgctgtcgtta 3157  T
Q  549 agttgtcattt 559  Q
    |||||||||||    
T  3156 agttgtcattt 3146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3501 - 3315
Alignment:
Q  161 tttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatattt 260  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||  | |||| | ||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||     
T  3501 tttatgtttttgtctctgctgttattga--ttattaatatcatttaaatgcaagtgttggtctaagttgcaaagttgtaacttgttgttccaagatattg 3404  T
Q  261 gagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc 349  Q
    || |||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||  ||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  3403 gaatcatataagttgctgaagttgtctaagttgtaagttgctgagtctatgcatactcatat-atgttgagggcttgatgccctgtgagc 3315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 358 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 10903 - 10744
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||| ||  ||||||| ||| |    
T  10903 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgttcaatatgttggggggt 10810  T
Q  458 tgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  10809 tgatcccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 10744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10926 - 10846
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10926 ttgttgagtccatgcatactcattt-acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgc 10846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 5)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 485 - 632
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11621
Alignment:
Q  485 gattaagaagttgtagttgcatt-gtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaac 576  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||  ||||||    
T  11466 gattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttgagttgtcatttatcaatgagttgttaataaagaac 11565  T
Q  577 tatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatgatg 632  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  11566 taagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttattatgagatgatg 11621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 494 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 14466 - 14332
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||       |||||||| || |||||||||||||     
T  14466 gttgttgttgcattgtcgagtttatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattatcaatgagttgttaatgacgaactatgtgaaga 14367  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14366 attaata-ttagtaattgttgttgtttatgttgtta 14332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 507
Target Start/End: Original strand, 11391 - 11459
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11391 gctcttaaagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatt 11459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 2824 - 2740
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  2824 ctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggttccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 2740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14550 - 14449
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  || |||| || ||| |||||||    
T  14550 tgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagttgttgttgttgcattgtcaagatgatgtcgttgttgttgcattgt 14451  T
Q  538 cg 539  Q
    ||    
T  14450 cg 14449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 515
Target Start/End: Original strand, 63309 - 63459
Alignment:
Q  360 acgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttg 459  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  63309 acgttgagggcttgatgccctgtgaccttttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttgagggcttg 63402  T
Q  460 atgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  63403 atgccctggattggtacgacatgtatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtc 63459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 468
Target Start/End: Original strand, 63113 - 63294
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgct 378  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||| |||||||   |||||||| ||||||||      
T  63113 gttgtctaagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccttg-gagcctttgctcaacacgttgagagcttgatgtc 63210  T
Q  379 ctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg 468  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||      |  ||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  63211 atgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgat------ttcctgggagcgtatttatgcttaatatgttgagggcttgatgccctgg 63294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 63311 - 63364
Alignment:
Q  325 gttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  63311 gttgagggcttgatgccctgtgaccttttgctctttaagttgagggcttgatgc 63364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 448 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 55955 - 55774
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgtt 547  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||| || ||| || |||| || ||||||||||||||||| |||    
T  55955 gttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagttgttgttgttgcattatcaagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgtt 55856  T
Q  548 aagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttg-tttatgttgtta 622  Q
    ||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  55855 aagttgtcatttatcaatgagttgttaatgaagagctatgtgaagtattaata-ttattaattgatgttgttttatgttgtta 55774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 56087 - 56013
Alignment:
Q  316 tcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagctttt---gctct-tacgttgagggcttgatgctctgtgagc 386  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  56087 tcatttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttcgctctataagttgagggcttgatgctctgtgagc 56013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 453 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 56618 - 56510
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgca-ttgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagt 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56618 gggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatttgtcgagtttaagttgttgaagtcgcattgtcgttgtcgttaagt 56519  T
Q  552 tgtcattta 560  Q
    ||| |||||    
T  56518 tgtaattta 56510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 116727 - 116657
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  116727 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 116657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 453 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 7834 - 7658
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagtt 552  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7834 gggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagttgttgttgttgcattgttgagttgatgtcgtttttgtcgcattgtcgttgttgttaagtt 7735  T
Q  553 gtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttg-tttatgttgtta 622  Q
    |||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  7734 gtcatttatcaatgagttgttaatgaagagctatgtgaagtattaata-ttattaattgatgttgttttatgttgtta 7658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 477 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 17109 - 16956
Alignment:
Q  477 acatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaa 568  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || |||| |||||||||||||||||||||| ||||       |||| ||||    
T  17109 acatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgtattgtcgttgtcgttaagttgttatttgtcaatgagttattaa 17010  T
Q  569 cgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17009 tgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 16956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 5)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 448 - 618
Target Start/End: Original strand, 10699 - 10883
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgca------ttgtcgt 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||      |||||||    
T  10699 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgt 10798  T
Q  541 tgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 618  Q
    |||||||||||||||| ||       |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10799 tgtcgttaagttgtcagttgtcaatgagttattaatgaagaactatgtgatttattaatatttattaatcgttgtggtttatgtt 10883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 448 - 618
Target Start/End: Original strand, 16502 - 16686
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcat-tgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgca------ttgtcgt 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || ||||||      |||||||    
T  16502 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcatatgttgagtttaagttgtagaagtcgcattgtcgttgtcgt 16601  T
Q  541 tgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgtt 618  Q
    |||||||||||||||| ||       |||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16602 tgtcgttaagttgtcagttgtcaatgagttattaatgaagaactatgtgatttattaatatttattaatcgttgtggtttatgtt 16686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 279 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 36155 - 35942
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  36155 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccct-tgagcctttgctcaacacgttgagggcttgat 36058  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctc-tttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctc-tttatgttgagggcttgatgccctgg-ttgg 472  Q
    || |||||||||||| |||   || | |||| |||||||      |  ||| ||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36057 gccctgtgagctttttctcaaataagttgagggcttgat------tccctgggagtgtatttatgctcaaacaagttgagggcttgatgccctggattgg 35964  T
Q  473 taccacatccatgattaagaag 494  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  35963 taccacatgcatgattaagaag 35942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Original strand, 10516 - 10632
Alignment:
Q  224 aagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatt 320  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||||    
T  10516 aagttgtcaagttgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatatgttgttgatgttgtccaagttatacacgctatggagtccatgcatactcatt 10615  T
Q  321 tgaagttgagagcttgat 338  Q
    | |||||| | |||||||    
T  10616 t-aagttgggggcttgat 10632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 423 - 492
Target Start/End: Original strand, 10420 - 10491
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10420 ctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 10491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 522
Target Start/End: Original strand, 488 - 645
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| ||| |      |||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  488 tacgttgagggcttgatgccctgtgagattttgctctttaagttgagggcttgatgccctggg------agtgtatttatgctcaatatgttg-gggttt 580  T
Q  459 gatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  581 gattccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 158 - 254
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgc 179  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  158 gaaaatgtatgatatagaaaataatgttgttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgc 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 467
Target Start/End: Original strand, 407 - 510
Alignment:
Q  358 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggct 457  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||     ||| |||  |||||||||||  || ||||||||||    
T  407 ttacgttgagggcttggtgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatg-tc-----ctgggagcttatttatgctcaatacgttgagggct 500  T
Q  458 tgatgccctg 467  Q
    ||||||||||    
T  501 tgatgccctg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Original strand, 384 - 463
Alignment:
Q  297 ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatg 376  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  384 ttgttgagtccattcatactcattt-acgttgagggcttggtgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatg 463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 6)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 1111
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||      ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1240 tacgttgagggcttgatgccttgtgagctttagctctttatgttgagggattgatgccctgtg------agtgtatttatgctcttaa-gttgagggctt 1148  T
Q  459 gatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagt 495  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1147 gatgcgctggttggtaccacatgcatgattaagaagt 1111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 359 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8971
Alignment:
Q  359 tacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggctt 458  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||      ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9100 tacgttgagggcttgatgccttgtgagctttagctctttatgttgagggattgatgccctgtg------agtgtatttatgctcttaa-gttgagggctt 9008  T
Q  459 gatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagt 495  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9007 gatgcgctggttggtaccacatgcatgattaagaagt 8971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11215
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgt-ggtgttgtctaagttgtacatt 298  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||| ||| | || |||| | ||||||  ||    
T  11364 tcattaagttgcatatgttggtcaaagttgtcaagttgtaagttgttgatccaaagtattggagtcatataagatgtcgatgatgtccatgttgtaagtt 11265  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagc 349  Q
    || ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  11264 gttgagtccatgcatactca-ttcatgttgagggcttgatgccctgtgagc 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 3376 - 3301
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  3376 gctcttaaagttgggggcttaatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagttgttgttgttgcattgtcgagt 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1091 - 1019
Alignment:
Q  487 ttaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  1091 ttaagaagttgaaattgcattgtcaagtcgaagttgttaatgtcgcgttgtcgtcgtcattaagttgttattt 1019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 487 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 8951 - 8879
Alignment:
Q  487 ttaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt 559  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  8951 ttaagaagttgaaattgcattgtcaagtcgaagttgttaatgtcgcgttgtcgtcgtcattaagttgttattt 8879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Original strand, 319 - 460
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  319 gttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgtggttaagttgtcatttttcaatgagtggttaatgaagaactatgtgaagt 418  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  419 attaaca-ttattaattgttgttgtttatgatgttatatgatg 460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 539
Target Start/End: Original strand, 220 - 336
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||  || ||||    
T  220 ctgtgggtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggtcggtaccacatgcatgattaagttattgtagttgcatcgtcgagatgatgtcg 319  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcg 539  Q
     || ||| |||||||||    
T  320 ttgttgttgcattgtcg 336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 423 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34259 - 34143
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  34259 ctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctggttggtactacattcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcg 34160  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcg 539  Q
     || ||| |||||||||    
T  34159 ttgttgttgcattgtcg 34143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 494 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 34061 - 33920
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||       |||||||| ||||||||||||||| |    
T  34061 gttgttgttgcattgtcgagtggatgtcgtttttgtcgcattgttgttgttgttaagttgccatttatcaatgagttgttaatgaagaactatgtgaact 33962  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttatatgatg 629  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33961 attaatatt-attaattgttgttgtttatgttgttatatgatg 33920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 445 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34138 - 34044
Alignment:
Q  445 tatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcg 539  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||||    
T  34138 tatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatacatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgtcg 34044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 423 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 39867 - 39663
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| | | || ||||    
T  39867 ctgtgagtatatttatgctctatacgttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaagtcgttgtcgttgcattgtcaaattgatgtcg 39768  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttat 615  Q
    ||| | |||| |||||||||| || ||||||||| ||       | ||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  39767 atgttatcgcgttgtcgttgttgtcaagttgtcaattactaatgaattgttaatgagaaactatgtgaagtatcaata-ttatttattgttgttgtttat 39669  T
Q  616 gttgtt 621  Q
    ||||||    
T  39668 gttgtt 39663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 522
Target Start/End: Original strand, 38404 - 38501
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctct-ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  38404 gagtatatttatgctcaattaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 38501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 125732 - 125643
Alignment:
Q  287 aagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 377  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  125732 aagttgtaagttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgc 125643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 39610 - 39563
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  39610 gaactatgtgaagtatcaatatt-atttattgttgttgtttatgttgtt 39563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 125878 - 125842
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  125878 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 125842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 279 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 6008 - 5872
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctta-cgttgagggcttgatgc 377  Q
    |||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||     
T  6008 tgttgtttaagttgtaagatgttgattccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctactcgttgagggcttgatgt 5910  T
Q  378 tctgtgagcttttgctctttatgctgagagcttgatgc 415  Q
      ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5909 catgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgc 5872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 438 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5897 - 5869
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccct 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5897 tgctctttatgttgagggcttgatgccct 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 438 - 622
Target Start/End: Original strand, 7539 - 7729
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  |  ||||| ||||||||||||||| || |||| || |||||||||||    
T  7539 tgctctataagttgggggcttgatgccctgattgataccacatgcatgttttcgtcgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgt 7638  T
Q  538 cgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||| |||||||||||| ||       | ||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7639 cgttgttgttaagttgtcaattattaataaattgttaatgaagaactatgtgaattattaa-aattattaattgttgtggtttatgttgtta 7729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 7e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 239
Target Start/End: Original strand, 36344 - 36435
Alignment:
Q  147 tatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgta 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36344 tatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctgctgttgttgaa-tcattattgtcattaagttgcaagtgttggtctaagttgtatagttgta 36435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 422 - 511
Target Start/End: Original strand, 44225 - 44314
Alignment:
Q  422 tctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44225 tctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgcgttgtcg 44314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 534 - 623
Target Start/End: Original strand, 44309 - 44405
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44309 ttgtcgttgtcgttaagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttaagttattat 44405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 303
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  393 ctgtgagtatatttatactctatatgttgggggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgag 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 707 - 583
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgata 148  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  707 tgttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgtta 609  T
Q  149 tgttgtaagatgtttatgttgttgtc 174  Q
    ||||  ||| ||||  ||||||||||    
T  608 tgttacaagttgttattgttgttgtc 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 622
Target Start/End: Original strand, 113753 - 113915
Alignment:
Q  466 tggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt------ 559  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||          
T  113753 tggttggtaccacatgcatgattaagatgttgtagttgcctcgtcgagttgaagttgttgtcgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtcaattatcaat 113852  T
Q  560 -agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  113853 gagttgttaatgaagaactatatgaagaattaata-atattaattgatgttgtctatgttgtta 113915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 423 - 539
Target Start/End: Original strand, 18913 - 19029
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  18913 ctgtgagtatatttatgctctatatgttggggacttgatgtcccggttggtaccacatgcatgattaagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcg 19012  T
Q  523 atgatgtcgcattgtcg 539  Q
     || ||| |||||||||    
T  19013 ttgttgttgcattgtcg 19029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 556
Target Start/End: Original strand, 19012 - 19074
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19012 gttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtca 19074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 17234 - 17122
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgtt 547  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  |||    
T  17234 gttgggggcttgatgccctgatttgtaccacatgcattattaagtcgttgatgttgcattgtcgagtcgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgatgtt 17135  T
Q  548 aagttgtcattta 560  Q
    |||||||||||||    
T  17134 aagttgtcattta 17122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2486 - 2441
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2486 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 2441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 423 - 514
Target Start/End: Original strand, 19530 - 19621
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  19530 ctgtgagcctatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtcaaagttgcattgtcgagt 19621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 344
Target Start/End: Original strand, 15357 - 15501
Alignment:
Q  200 tcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacatt 298  Q
    |||||||||||||   ||||||| || |||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  ||    
T  15357 tcattaagttgcatatgttggtcaaatttgtcaagtcgtaagttgttgttccaagatattggagtcatatgagttgttgaagttgtctaagttgtaagtt 15456  T
Q  299 gtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctg 344  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15457 gtcgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgccctg 15501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 443 - 514
Target Start/End: Original strand, 15477 - 15549
Alignment:
Q  443 tttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||   | ||||||||| ||||||    
T  15477 tttaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgactaagaataagaagttgcattatcgagt 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 494 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 72993 - 72859
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||       |||||||| ||||||||||||||||     
T  72993 gttgttgttgcatagtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgatgttgttaagttgtcaattatcaaggagttgttaatgaagaactatgtgaaga 72894  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  72893 attaata-ttattaattgttgttgtttatgttgtta 72859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 438 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 73077 - 73002
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgag 513  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| |||||    
T  73077 tgctctatatgttgggggattgatgccctgattggtaccacatgcatgattaagttgatgttgttgcattttcgag 73002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 195 - 103
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    |||||||  |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  195 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattttcgagtc 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 435 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 3657 - 3464
Alignment:
Q  435 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcat 534  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| || |||| |  ||||  ||    
T  3657 ttatgctctatacgttgggggcttgatgccctgattgataccacatgcatgtttaagttgttgttgttgcattgtcgagttgatgtcgttattgtcaaat 3558  T
Q  535 tgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  3557 tgtcgttgttgtcaagttgtcaattactaaggagttgttaatgagaaactatgagaagtattaata-ttgtttattgttgttgtttatgttgtta 3464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3361 - 3242
Alignment:
Q  71 tacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  || ||||||| ||| ||||||||||    
T  3361 tacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgctatgttgcaagttgtttatgtt 3262  T
Q  169 gttgtctctgccgttgttga 188  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  3261 gttgtctctgctgttgttga 3242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 2211 - 2140
Alignment:
Q  452 agggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||||    
T  2211 agggcttgatgccctggattgctaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagtcg 2140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Original strand, 6047 - 6094
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  6047 gaactatgtgaagtatcaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 6094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 507
Target Start/End: Original strand, 20904 - 20979
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  20904 tatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacattcatgattaagaggtcgtagttgcatt 20979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 432 - 507
Target Start/End: Original strand, 23834 - 23909
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  23834 tatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaggtcgtagttgcatt 23909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 448 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1315 - 1254
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  1315 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagatgtcgtagttgcattgt 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 522
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13929
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  13832 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 13929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 13574 - 13610
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13574 aagttgcatgtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 13610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 438 - 538
Target Start/End: Original strand, 192 - 292
Alignment:
Q  438 tgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgt 537  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||||    
T  192 tgctctataagttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgaataagttgttgtagttgcattgtcgagatgatgtcgttgttgttgcattgt 291  T
Q  538 c 538  Q
    |    
T  292 c 292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 595
Target Start/End: Original strand, 276 - 384
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattta-------gttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || || | || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||       |||||||| |||||||||||||||||    
T  276 gttgttgttgcattgtcaagtggatgttgttgttgtcgcattgtcgttgttgctaagttatcatttataaataagttgttaatgaagaactatgtgaagt 375  T
Q  587 attaatatt 595  Q
    |||||||||    
T  376 attaatatt 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 294
Target Start/End: Original strand, 24973 - 25064
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggtgttgtctaagttgta 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24973 attaagttgcaagtgttggtctaagtagcaaagttgtaagttattattccaagatattgga-tcatataagttgtgaagttgtctaagttgta 25064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 106235 - 106163
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgc 504  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  106235 tatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagttgaagttgc 106163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 551 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 106137 - 106065
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgttat 623  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  106137 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaattgttgttgtttaagttattat 106065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 432 - 522
Target Start/End: Original strand, 7962 - 8053
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  7962 tatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtcgaagttgcattgtcgagtcaaagtcg 8053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 8319 - 8244
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  8319 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtctaagtcg 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 427 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 4579 - 4489
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    ||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4579 gagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgtcgagtc 4489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 71612 - 71542
Alignment:
Q  551 ttgtcatttagttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||| | |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  71612 ttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgtttatgttgtt 71542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 349
Target Start/End: Original strand, 136316 - 136621
Alignment:
Q  43 atgattaatgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaa-ggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttga 140  Q
    ||||||| ||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| || || |    
T  136316 atgattattgtagttggataatttgagatacatatattatgtgaaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttattaa 136414  T
Q  141 tgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaa 240  Q
    || |  ||||||| ||| |||   ||||||||||  ||| |||||||  || |||| | |||||||||||||||   | ||| |||| |  |||||||||    
T  136415 tgttattatgttgcaagttgtcattgttgttgtcattgctgttgttg--attattaatatcattaagttgcaagttattgtcaaagtcgctaagttgtaa 136512  T
Q  241 gatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgatt 339  Q
    | ||||  |||||||| || ||||| |||||| || ||  ||||||||||||||   | || ||||||||||||| ||| || |||||||| |  ||||     
T  136513 gttgttgttccaagatgttggagtcgtataagctgttgaagttgtctaagttgttggtcgttgagtccatgcatagtca-ttaaagttgagggtgtgatg 136611  T
Q  340 ccctgtgagc 349  Q
    ||||||||||    
T  136612 ccctgtgagc 136621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Original strand, 12263 - 12355
Alignment:
Q  97 tatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12263 tatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgctgttgttga 12355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 432 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 66 - 6
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  66 tatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaaga 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 494 - 621
Target Start/End: Original strand, 4720 - 4853
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagt 586  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  4720 gttgtcgttgcattgtcgagttgatgtcgatgttgtcgcattgtcgttgttgtcaagttgtcaattcctaatgagttgttaatgagaaactatgtgaagt 4819  T
Q  587 attaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    || |||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  4820 atcaata-ttatttattgttgttgtttatgatgtt 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6967 - 6827
Alignment:
Q  50 atgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgat 147  Q
    |||||||| |||||| | |  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||| || ||| || |    
T  6967 atgttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgct 6868  T
Q  148 atgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6867 atgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgctgttgttga 6827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 534 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 116127 - 116033
Alignment:
Q  534 ttgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  116127 ttgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaagtattaatatttattaatcattgttgattatgttgtt 116033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 54036 - 54072
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  54036 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 54072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2699 - 2636
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcg 511  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  2699 gttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaagaagtagaagttgtattgtcg 2636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 533 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 2642 - 2551
Alignment:
Q  533 attgtcgttgtcgttaagttgtcattt-------agttgttaacgaagaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgt 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||  |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2642 attgtcgttgtcgttgagttgtcatttgtcaatgagttgttaataaagaactaagtgaaatgttagtatttattaatcattgttgtttatgt 2551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 7379 - 7304
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7379 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattctcgagtcaaagtcg 7304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7758 - 7669
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttg-tggtgttgtctaagttgt 293  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||| |||   |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7758 aagttgcaggtgttgctctaaattgtaaagttataagttgtcgttccaaagtattggagtcatataagttgttggtgttgtctaagttgt 7669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 496
Target Start/End: Original strand, 10785 - 10834
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagtt 496  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10785 gttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgattaagaagtt 10834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 5458 - 5421
Alignment:
Q  444 ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5458 ttatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacat 5421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1630
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||| || || |||| |||||||   |||||| |||||||||    
T  1869 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatgcatactcatt--aagttgagggattgatgccttgggagcctttgctcaacacgttgggggcttgat 1772  T
Q  376 gctctgtgagcttttgctctt-tatgctgagagcttgatgctctgtgtctgtgagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttgg 472  Q
     | ||||||||||||||||   || | || | ||||||||| ||  |      |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1771 accctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgccctagg------agtgtatttatgctcaaataagttgcgggcttgatgccctggattgg 1678  T
Q  473 taccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  1677 taccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 1630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 517
Target Start/End: Original strand, 5006 - 5075
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcga 517  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  5006 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagtt-aagttgcatagtcgagtcga 5075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 58063 - 57969
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctct 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||||||    
T  58063 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgtcgtgaagttgttgtatgttgttgtctct 57969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 57741 - 57672
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  57741 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggttggtaccacatgcatgattaaga 57672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 145722 - 145652
Alignment:
Q  453 gggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  145722 gggcttgatgccctggattggtaccacatacatgattaagaagtcgaagtcgcattgtcgagtcaaagtcg 145652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21291 - 21247
Alignment:
Q  202 attaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgtt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21291 attaagttgcaagtgttggtctaagttacaaagttgtaagatgtt 21247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 146084 - 145867
Alignment:
Q  51 tgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatat 149  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| || ||     
T  146084 tgttgttgattaatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatagaaa-taatgttgttatatcatccaagtggttattattaatgttgctac 145986  T
Q  150 gttgtaagatgtt-tatgttgttgtctctgccgttgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttg-taaagttgtaagatgtta 247  Q
    | |  ||| |||| ||||||||||||  ||  ||| |||  || ||||   |||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  145985 ggttcaagttgttgtatgttgttgtcattgttgttattg--attatta-aatcattaagttgcatatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttg 145889  T
Q  248 atccaagatatttgagtcatat 269  Q
    ||||||  |||| |||||||||    
T  145888 atccaaattattggagtcatat 145867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 433 - 317
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || ||||||||||    
T  433 atatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgtt 334  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||| ||||||||    
T  333 gtctctgctgttgttga 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11023 - 10883
Alignment:
Q  50 atgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgat 147  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||| |||| || |||||||||||| ||||||| || ||| |  |    
T  11023 atgttgttggttaatttgagttacatatattatgtggaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttct 10924  T
Q  148 atgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10923 atgttgcaagttgtctatgttgttgtctctgctgttgttga 10883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Original strand, 8124 - 8192
Alignment:
Q  86 aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| || ||||||||    
T  8124 aaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgt 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6217 - 6113
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| | ||||| || ||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6217 gaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgctgtt 6118  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  6117 gttga 6113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8369 - 8265
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| | ||||| || ||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8369 gaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgctgtt 8270  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  8269 gttga 8265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 34096 - 34216
Alignment:
Q  50 atgttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgat 147  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| || |    
T  34096 atgttgttggttaatttgagttacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgct 34195  T
Q  148 atgttgtaagatgtttatgtt 168  Q
    ||||||  || ||||||||||    
T  34196 atgttgctagttgtttatgtt 34216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 480 - 299
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctctgccgt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| | |     
T  480 gaaaaggtatgatatagaaaataacgtttttataccattcaagttgttattattaatgatgatatgttgtgaagttgttgtacgttgttgtctctactg- 382  T
Q  183 tgttgaaatcattattgtcattaagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatat 269  Q
    | |||  || ||||   |||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||    
T  381 tattg--attatta-aatcattaagttgcatatgttggtc-aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaattattggagtcatat 299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14107 - 14048
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  14107 gttgagggcttgatgccctagttggtaccacatgcatgattaagagatcgtagttgcatt 14048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8379 - 8264
Alignment:
Q  75 tatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgttat-atcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttg 172  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||| || ||  |||||||||| ||| || |||||||| ||    
T  8379 tatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgcttatgttgctg 8280  T
Q  173 tctctgccgttgttga 188  Q
    || |||| ||||||||    
T  8279 tccctgctgttgttga 8264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 106130 - 106055
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||||    
T  106130 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtcg 106055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 177
Target Start/End: Original strand, 134 - 228
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgt-aagatgtt-tatgttgttgtctct 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  134 gaaaaggtatgatatagaaaataatgttgttataccatttaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctct 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10798 - 10733
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  10798 ttgagggcttgatgca-tggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgccgagtc 10733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 515
Target Start/End: Original strand, 1003 - 1068
Alignment:
Q  449 ttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtc 515  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  1003 ttgagggcttgatgca-tggttggtaccacatgcatgattaagaagtcgaagttgcattgccgagtc 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 159723 - 159797
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  159723 ttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgctgctgtctctgctgttgttga 159797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 8699 - 8626
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||    
T  8699 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcgaagt 8626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5135 - 5031
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| | ||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||    
T  5135 gaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgctgtt 5036  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  5035 gttga 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 423 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 78027 - 77943
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||  |||||| ||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  78027 ctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgattggtactacatgcatgattaagaagtcgtggttgcatt 77943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 78179 - 78090
Alignment:
Q  256 tatttgagtcatataagttgtgg-tgttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgt 345  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  78179 tattggagtcatataagttgttgatgttgtccaagttgtaagttgttgagtccatgcatcctcattt-aagttgagggcttaatgccctgt 78090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 494
Target Start/End: Original strand, 4908 - 4955
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaag 494  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4908 gttgagggcttgatgccctgggttggtaccacatgcatgattaagaag 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 13993 - 14068
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| ||| |||||||    
T  13993 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaggtctaagttgcatagtcaagttgaagtcg 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Original strand, 6539 - 6584
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6539 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaaga 6584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12613 - 12554
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgt 173  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12613 ttatatcattcaagttattattatcgatgttgatatgttgcaagatgtttatgttgttgt 12554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 17313 - 17238
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    |||||||| ||| |||||||||||    
T  17313 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgattaagaagaataagttgcatagtcaagtcgaagtcg 17238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 439 - 514
Target Start/End: Original strand, 278 - 353
Alignment:
Q  439 gctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagt 514  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||   ||||| |||||||||||||||    
T  278 gctcttaaagttgggggcttgatgccctgattggtaccacatgcatgtttaaattgttgttgttgcattgtcgagt 353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1510 - 1436
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtc 521  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| ||||||    
T  1510 gttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgattaagaggtttaagttgcatagtcaagttgaagtc 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 5434 - 5468
Alignment:
Q  22 ttgataactatgatgttattaatgattaatgttgt 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5434 ttgataactatgatgttattaatgattaatgttgt 5468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 556
Target Start/End: Original strand, 21109 - 21171
Alignment:
Q  494 gttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcgatgatgtcgcattgtcgttgtcgttaagttgtca 556  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21109 gttgttgtcgcattgtcgagttgatgtcgttgttgtcgcattgtcgttgttgttaagttgtca 21171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 377
Target Start/End: Original strand, 20908 - 21057
Alignment:
Q  232 aagttgtaagatgttaatccaagatatttgagtcatataagttgtggt-gttgtctaagttgtacattgtggagtccatgcatactcatttgaagttgag 330  Q
    |||||||||| ||||  ||||| || ||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20908 aagttgtaagttgttgttccaaaatgttgaagtcgtataagttgttgaagttgtctaagttgttggttgctgagtccatgcatactca-ttaaagttgag 21006  T
Q  331 agcttgattccctgtgagc---ttttgctct-tacgttgagggcttgatgc 377  Q
     ||||||| ||||||||||   || |||||| || ||||||||||||||||    
T  21007 ggcttgatgccctgtgagccttttatgctctataagttgagggcttgatgc 21057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 432 - 520
Target Start/End: Original strand, 733 - 823
Alignment:
Q  432 tatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaa-gaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  733 tatttatgctcaatatgttgcgggcttgatgccctggattggtaccacttgcatgattaaggaagataaagttgcatagtcaagtcgaagt 823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 423 - 480
Target Start/End: Original strand, 385 - 442
Alignment:
Q  423 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  385 ctgtgagtatatttatgctctatacgttaggggcttgatgccctgattggtaccacat 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 573 - 621
Target Start/End: Original strand, 640 - 687
Alignment:
Q  573 gaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtt 621  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  640 gaactatgtgaagtattaata-ttatttattgttgttgtttatgttgtt 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3062 - 2913
Alignment:
Q  42 aatgattaatg-ttgttagttaatgtgaaatacatatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt 138  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | |||  ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  3062 aatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattatt 2963  T
Q  139 gatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
     ||  |  ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2962 aatattactatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgctgttgttga 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 279 - 392
Target Start/End: Original strand, 18313 - 18428
Alignment:
Q  279 tgttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgat 375  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | | ||||  ||||||   |||||| |||||||||    
T  18313 tgttgtccaagttgtacacgttgttgagtccatgcatactcattt-aagttgagggcttgatgctcagggagccattgctcaacacgttgggggcttgat 18411  T
Q  376 gctctgtgagcttttgc 392  Q
    ||  |||||||||||||    
T  18412 gccatgtgagcttttgc 18428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 2719 - 2835
Alignment:
Q  74 atatattatgtg-aaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||| |    
T  2719 atatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgct 2818  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||| | ||||||||    
T  2819 gtctctactgttgttga 2835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Original strand, 366 - 482
Alignment:
Q  74 atatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgtt 171  Q
    |||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||| ||| || |||||||| |    
T  366 atattttatgtgaaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgct 465  T
Q  172 gtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||| ||||||||    
T  466 gtctctgctgttgttga 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 40966 - 41070
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgtt 183  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||| ||| || |||||||| |||| |||| |||    
T  40966 gaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgcttatgttgctgtcactgctgtt 41065  T
Q  184 gttga 188  Q
    |||||    
T  41066 gttga 41070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0853
Description:

Target: scaffold0853; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 522
Target Start/End: Original strand, 2975 - 3050
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagtcg 522  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||| |||| ||||||    
T  2975 gttgggggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgattaagaagataaagttgcatagtcaagtcaaagtcg 3050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1212 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1212
Description:

Target: scaffold1212; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 622
Target Start/End: Original strand, 178 - 227
Alignment:
Q  572 agaactatgtgaagtattaatatttattaatcgttgttgtttatgttgtta 622  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  178 agaactatgtgaagaattaatata-attaattgttgttgtttatgttgtta 227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1374
Alignment:
Q  114 ttatatcattcaagatgttattgttgatgctgatatgttgtaagatgtttatgttgttgtctctgccgttgttga 188  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  1300 ttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgtaagttgcttatgttgctgtctctactgttgttga 1374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10137 - 10022
Alignment:
Q  280 gttgtctaagttgtaca--ttgtggagtccatgcatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatg 376  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||| ||||| |||| |||||||   ||| || ||||||||||    
T  10137 gttgtctaagttgcacacgttgttgagtccatacatactcattt-aagttgggggtttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgctgggggcttgatg 10040  T
Q  377 ctctgtgagcttttgctc 394  Q
    | ||||||||||||||||    
T  10039 ccctgtgagcttttgctc 10022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 427 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 10003 - 9911
Alignment:
Q  427 gagtgtatttatgctctt-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcga 517  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| | |  |||||||| ||| ||||||    
T  10003 gagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcctttgattggtaccacatgcatgattaagaggattaagttgcatagtcaagtcga 9911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 13171 - 13133
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13171 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 13133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 24873 - 24835
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24873 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 24835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9659
Alignment:
Q  469 ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcatt 507  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9697 ttggtaccacatgcatgattaagaggttgtagttgcatt 9659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23711 - 23662
Alignment:
Q  85 gaaaaggtatgttatagaaaataatgttgttatatcattcaagatgttat 134  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  23711 gaaaaggtatgatgtagaaaataatgttgttataccatttaagttgttat 23662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 38241 - 38196
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  38241 gttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgattaaga 38196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 19958 - 20030
Alignment:
Q  448 gttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatccatgattaagaagttgtagttgcattgtcgagtcgaagt 520  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||| ||| |||||||||    
T  19958 gttgagggctagatgccctggattggtaccacatgcatgactaagaagat-aagttgcatagtcaagtcgaagt 20030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 340 - 304
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  340 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 2911 - 2947
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2911 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 2947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 6950 - 6986
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6950 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 6986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 1490 - 1526
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1490 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 1526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 739
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  775 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 7139 - 7175
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7139 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 7175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 7100 - 7136
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7100 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 7136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3626 - 3590
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3626 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 3590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7690 - 7654
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7690 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 7654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1744 - 1700
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1744 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 1700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 436 - 480
Target Start/End: Original strand, 10304 - 10348
Alignment:
Q  436 tatgctctttatgttgagggcttgatgccctggttggtaccacat 480  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10304 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgattggtaccacat 10348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 78326 - 78290
Alignment:
Q  205 aagttgcaagagttggtctaagttgtaaagttgtaag 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  78326 aagttgcaggtgttggtctaagttgtaaagttgtaag 78290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University