View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15132_low_1 (Length: 807)

Name: NF15132_low_1
Description: NF15132
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15132_low_1
NF15132_low_1
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (264-777)||(4395011-4395523)
chr1 (271-791)||(5609177-5609697)
chr1 (268-759)||(44527123-44527615)
chr1 (264-782)||(48949546-48950064)
chr1 (264-782)||(51113162-51113680)
chr1 (267-782)||(25682498-25683013)
chr1 (268-751)||(16816623-16817108)
chr1 (276-775)||(36733548-36734043)
chr1 (264-629)||(44602752-44603112)
chr1 (314-759)||(52109324-52109768)
chr1 (264-532)||(2885320-2885592)
chr1 (276-782)||(24538357-24538841)
chr1 (264-717)||(48166149-48166591)
chr1 (290-527)||(21031251-21031488)
chr1 (264-484)||(14485161-14485375)
chr1 (276-397)||(5594266-5594387)
chr1 (301-430)||(17371647-17371776)
chr1 (268-481)||(23332577-23332791)
chr1 (269-438)||(4898447-4898616)
chr1 (266-327)||(3297024-3297085)
chr1 (362-423)||(23163357-23163418)
chr1 (264-320)||(23163419-23163475)
chr1 (396-459)||(38679050-38679113)
chr1 (388-437)||(22929755-22929804)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (268-785)||(88403-88920)
chr2 (264-786)||(34695726-34696246)
chr2 (264-786)||(34718138-34718658)
chr2 (268-777)||(12130464-12130973)
chr2 (276-551)||(9710033-9710308)
chr2 (271-627)||(1417819-1418166)
chr2 (266-532)||(26198779-26199045)
chr2 (268-579)||(13109698-13110006)
chr2 (268-563)||(11291891-11292181)
chr2 (295-565)||(22845600-22845857)
chr2 (355-782)||(44017231-44017658)
chr2 (267-583)||(14827126-14827441)
chr2 (268-482)||(35158668-35158885)
chr2 (324-480)||(18344176-18344332)
chr2 (510-759)||(18345555-18345803)
chr2 (272-462)||(25552312-25552502)
chr2 (364-452)||(10244492-10244580)
chr2 (402-480)||(36445479-36445557)
chr2 (264-353)||(43293919-43294008)
chr2 (560-648)||(9709910-9709998)
chr2 (382-447)||(43293835-43293900)
chr2 (592-696)||(26198626-26198730)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (271-785)||(16731777-16732291)
chr7 (271-785)||(17709911-17710425)
chr7 (271-737)||(16098382-16098851)
chr7 (264-782)||(9328424-9328941)
chr7 (278-782)||(22289088-22289592)
chr7 (271-777)||(1581467-1581975)
chr7 (1-254)||(33151898-33152147)
chr7 (264-787)||(29200778-29201294)
chr7 (267-777)||(17877260-17877760)
chr7 (276-785)||(30493444-30493952)
chr7 (268-530)||(3601751-3602013)
chr7 (276-532)||(3275131-3275388)
chr7 (264-449)||(24251619-24251801)
chr7 (269-730)||(30824323-30824762)
chr7 (264-449)||(44481267-44481452)
chr7 (264-451)||(33224382-33224569)
chr7 (264-482)||(47580022-47580239)
chr7 (264-419)||(24139221-24139376)
chr7 (266-431)||(35030482-35030643)
chr7 (346-423)||(6056281-6056358)
chr7 (442-522)||(24139138-24139218)
chr7 (268-479)||(35013709-35013920)
chr7 (457-537)||(44480892-44480972)
chr7 (355-433)||(43782950-43783028)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (271-749)||(25730688-25731166)
chr5 (264-782)||(20204802-20205320)
chr5 (274-759)||(4267969-4268458)
chr5 (267-782)||(8387933-8388448)
chr5 (268-759)||(27292304-27292794)
chr5 (288-785)||(15988593-15989092)
chr5 (264-759)||(26597288-26597774)
chr5 (265-735)||(12660210-12660680)
chr5 (295-791)||(27532759-27533256)
chr5 (264-782)||(41940558-41941077)
chr5 (271-725)||(11375351-11375796)
chr5 (264-782)||(22767095-22767597)
chr5 (264-688)||(34652083-34652499)
chr5 (268-596)||(32632548-32632875)
chr5 (323-511)||(23074950-23075138)
chr5 (264-463)||(30573499-30573698)
chr5 (281-532)||(30222677-30222928)
chr5 (268-429)||(26076480-26076642)
chr5 (577-782)||(30222934-30223139)
chr5 (503-671)||(37448083-37448251)
chr5 (264-466)||(31908221-31908420)
chr5 (268-331)||(26296365-26296428)
chr5 (694-767)||(16074598-16074671)
chr5 (714-771)||(34653864-34653921)
chr5 (271-331)||(3308174-3308234)
chr5 (276-336)||(40018906-40018966)
chr5 (271-339)||(2872262-2872336)
chr5 (488-699)||(42989243-42989454)
chr5 (281-330)||(23083639-23083688)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (276-785)||(21321371-21321883)
chr4 (276-791)||(49951151-49951666)
chr4 (269-790)||(18441974-18442493)
chr4 (264-787)||(2064695-2065218)
chr4 (276-777)||(28537617-28538120)
chr4 (264-776)||(51734794-51735305)
chr4 (271-757)||(41835141-41835626)
chr4 (284-767)||(37245694-37246177)
chr4 (276-790)||(55734848-55735368)
chr4 (266-782)||(32576872-32577386)
chr4 (264-782)||(51259351-51259870)
chr4 (264-785)||(29655488-29656008)
chr4 (281-782)||(56065476-56065981)
chr4 (264-782)||(49119222-49119727)
chr4 (264-759)||(28426066-28426548)
chr4 (276-785)||(43840159-43840650)
chr4 (276-595)||(26422436-26422755)
chr4 (271-597)||(44935911-44936237)
chr4 (276-605)||(47226166-47226493)
chr4 (276-532)||(24989768-24990023)
chr4 (278-481)||(8754299-8754502)
chr4 (284-438)||(23095405-23095559)
chr4 (264-375)||(6753941-6754051)
chr4 (264-370)||(10575271-10575377)
chr4 (264-383)||(3347351-3347470)
chr4 (264-337)||(17374597-17374670)
chr4 (268-428)||(51364555-51364710)
chr4 (267-422)||(34926171-34926326)
chr4 (264-423)||(21163267-21163425)
chr4 (370-459)||(7462588-7462677)
chr4 (561-612)||(24990042-24990093)
chr4 (370-423)||(40727169-40727222)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (267-767)||(15605819-15606319)
chr6 (288-785)||(14680003-14680503)
chr6 (346-782)||(28106986-28107422)
chr6 (268-649)||(11731495-11731873)
chr6 (295-682)||(29367908-29368294)
chr6 (301-519)||(34104324-34104542)
chr6 (323-616)||(19690760-19691053)
chr6 (299-697)||(15053032-15053430)
chr6 (276-482)||(21944462-21944668)
chr6 (304-531)||(27443029-27443258)
chr6 (425-649)||(30801974-30802198)
chr6 (346-459)||(3100415-3100525)
chr6 (271-331)||(19690332-19690392)
chr6 (276-339)||(3101270-3101332)
chr6 (713-782)||(11731920-11731989)
chr6 (271-351)||(1992479-1992559)
chr6 (346-455)||(5542541-5542650)
chr6 (713-777)||(19364217-19364280)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (268-759)||(53496902-53497395)
chr3 (264-772)||(42340099-42340606)
chr3 (264-782)||(55199358-55199876)
chr3 (264-532)||(27608725-27608993)
chr3 (264-532)||(34497194-34497462)
chr3 (264-585)||(646992-647306)
chr3 (278-759)||(2615363-2615834)
chr3 (329-767)||(46007163-46007599)
chr3 (271-581)||(2121129-2121439)
chr3 (264-542)||(31341547-31341829)
chr3 (281-616)||(11020020-11020354)
chr3 (264-506)||(19117542-19117784)
chr3 (266-453)||(26046864-26047051)
chr3 (264-471)||(55213483-55213690)
chr3 (264-508)||(27747508-27747751)
chr3 (268-431)||(48227566-48227729)
chr3 (400-532)||(24176867-24176999)
chr3 (493-737)||(48227305-48227550)
chr3 (536-709)||(647305-647478)
chr3 (264-406)||(24181749-24181895)
chr3 (359-469)||(1702806-1702916)
chr3 (577-709)||(27941129-27941261)
chr3 (327-429)||(49525079-49525181)
chr3 (684-787)||(1070855-1070958)
chr3 (271-342)||(50037083-50037153)
chr3 (283-333)||(1437383-1437433)
chr3 (273-375)||(15310819-15310921)
chr3 (346-423)||(18720845-18720922)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (264-791)||(477878-478405)
chr8 (271-739)||(13414913-13415381)
chr8 (271-777)||(40588559-40589050)
chr8 (361-759)||(23853802-23854200)
chr8 (299-757)||(8450980-8451438)
chr8 (316-774)||(7127078-7127536)
chr8 (284-671)||(185435-185818)
chr8 (264-542)||(598059-598337)
chr8 (288-532)||(33642610-33642854)
chr8 (276-529)||(11870364-11870617)
chr8 (312-577)||(3606607-3606874)
chr8 (264-614)||(9496797-9497142)
chr8 (298-718)||(37711990-37712398)
chr8 (264-447)||(36194443-36194626)
chr8 (276-420)||(28315316-28315459)
chr8 (331-429)||(8670203-8670301)
chr8 (264-321)||(32555083-32555140)
chr8 (283-370)||(34707886-34707973)
chr8 (406-468)||(14264970-14265032)
chr8 (479-530)||(42899152-42899204)
chr8 (359-420)||(4275914-4275975)
[»] scaffold0446 (1 HSPs)
scaffold0446 (281-767)||(48-538)
[»] scaffold0922 (1 HSPs)
scaffold0922 (325-613)||(147-434)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (304-531)||(44103-44332)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (306-457)||(20330-20481)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (268-333)||(26127-26192)
[»] scaffold0252 (1 HSPs)
scaffold0252 (333-429)||(13321-13415)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 264 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 4395523 - 4395011
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  4395523 accaaagcaaatttaactattatcgttaatcaactaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcccta 4395424  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  4395423 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaataggat 4395324  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  4395323 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagttggactcgaagataacctggtcccatctattcgcatcagcaaa 4395224  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4395223 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgcctcccctt-caaaactctcatatttgcccgctgccatttcgattgagcccggataaattgcccacgagagtct 4395125  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4395124 ctaacacagcatgcaaaagttgtgatatggttacggtcatggaacgcggcttccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactgagt 4395025  T
Q  764 tgttgccttgcact 777  Q
    ||||| ||||||||    
T  4395024 tgttgtcttgcact 4395011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 271 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 5609697 - 5609177
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  5609697 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacatgccgccctagctaatg 5609598  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609597 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattc 5609498  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||| |||||| || |||||||||||    
T  5609497 tgaatcaccatgaccctgagacgatagagtttgcactagagtagatgagtcgaactcgaagacaacccgatctcatctgttcgcaacatcaaagtgaagg 5609398  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
     ||||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||||| | |||| |||   | ||||||||| |||||||   |  | ||||||||| |||    
T  5609397 acctcgagtaaggctactgcctcccccttcaaaactatcatatttgtccgctgtcatagagtttgagcccgaataaattgctcgtgtgagtctctagcac 5609298  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 770  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5609297 agcacgcgaaagttgtaatatggttacagtcatggaacgcgacatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttgcc 5609198  T
Q  771 ttgcactgtattatgtctgtg 791  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  5609197 ttgcactctattatgcctgtg 5609177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 268 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 44527615 - 44527123
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa-tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |    
T  44527615 aagcaaatttaactattatcattaatcaagcaatgttcaatacaaaaaggataataataaaaaaatacggtgattaacccaagaacaggccgccctagtt 44527516  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  44527515 aaagtatgagcagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactaataattaatactagaaacaatagcataga 44527416  T
Q  467 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 566  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  44527415 attccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagtg 44527316  T
Q  567 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 666  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  44527315 aagggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacaagagtctcta 44527216  T
Q  667 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    |||||  ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  44527215 acacaacacgcaaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcggtcggtttctcccaaact 44527123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Original strand, 48949546 - 48950064
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||    
T  48949546 accaaagcaaagttaactattatctttaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgcccta 48949645  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48949646 gctaagctatgagtaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 48949745  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  48949746 aaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagttgaactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaa 48949845  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    |||||  || ||||||||||| | || |||||| ||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||  | ||| ||||||    
T  48949846 gtgaatcgcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactttcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgccaacgggagtct 48949945  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||    
T  48949946 ctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaatctgagt 48950045  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    ||||  |||||||| ||||    
T  48950046 tgttagcttgcactctatt 48950064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 51113680 - 51113162
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||   |||||||| | |||||||    
T  51113680 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccagtattcaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaacaggtcgcccta 51113581  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51113580 gctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgttaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 51113481  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | || || ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  51113480 aaaactccgaatcaccatggcccagagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaacaacaaa 51113381  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| | | ||||||||||| | || |||||| |||||||| || ||||||||  | |||||||||| ||||| ||| || ||||  ||||| ||||||    
T  51113380 gtgaatgacatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaacggttatatttgctcgttgccatttcgtttgagtccgaatgaattgcccacgggagtct 51113281  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||| | ||| ||||| |||   ||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||| |||    
T  51113280 ctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacggcatccacattgcactttaaccacgtctcacacgatttctcccaaactgagt 51113181  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    ||||  |||||||| ||||    
T  51113180 tgttagcttgcactctatt 51113162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 267 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 25683013 - 25682498
Alignment:
Q  267 aaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||||| ||   |||||||| ||| ||||||||    
T  25683013 aaagtaaagttaactattatcattaatcaacaaatgttcaatataagaaagataggaattaaaagtacggtgactaacccaagaacatgcctccctagct 25682914  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25682913 aaagtatgagcaaccatgctcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttagaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagtataga 25682814  T
Q  467 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 566  Q
    ||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  25682813 attctaaatcactgtggcccggagacgatagagcttgtactagagtagctgagtcaaactcgaagacagcccggtcccatctgttcacattagcaaagtg 25682714  T
Q  567 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 666  Q
    || | | ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  25682713 aatgacatcgagtaaggctactgcctccccctccaacactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccagataaattgcccacgggagtctcta 25682614  T
Q  667 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 766  Q
    |||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| | |||| |    
T  25682613 acacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatgaaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcacacggtttctcccaaattgagttct 25682514  T
Q  767 tgccttgcactgtatt 782  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25682513 tgccttgcactctatt 25682498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 268 - 751
Target Start/End: Original strand, 16816623 - 16817108
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||| |||    
T  16816623 aagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacgagatggataaggataaaaaatacggtgactagcccaagaataagtcgccctaacta 16816722  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16816723 aagtatgagcaaccatgttctcttctctcctaacaaacttcaccttaaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcgtagaa 16816822  T
Q  468 ttctgaatca---ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaag 564  Q
    ||| ||||||   ||||| |   |||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||||     
T  16816823 ttccgaatcacgtccatggctcggagacggtagaacttgaactagagtagacgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatcagcaaaa 16816922  T
Q  565 tgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctc 664  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||   | ||||||||||    
T  16816923 tgaagggcctcgagtaaggctactgcctcccc-tccaaaattgtcatatttgcccactgccattttgattgagctcgaataaattgcacgcgagagtctc 16817021  T
Q  665 taacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttct 751  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||||   |||||||||  || ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  16817022 taaaacaatacacaaaagatgtaatatggttacagacatggaacgcggcgtccgcattgcacttcaaccacatctcactcggtttct 16817108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 276 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 36734043 - 36733548
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36734043 ttaactattatcattaatcaaccaatattcaatacaagaaggataagaattaaaaatacgatgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatg- 36733945  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36733944 -----catgttcgcttgtctcgtaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattatgaat 36733850  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctc 575  Q
    || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||   | |     
T  36733849 catcatggcccggagacgatatagcttgcactagagttatagagtcagactcgaagacaacccggtcccatttgttcacatcagcaaagtgaataacatt 36733750  T
Q  576 gagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtac 675  Q
    ||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||||||| || | || ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  36733749 gagtaagactactgcctccccctccaaaactgccatatttacccgttgtcattttgtttgagcccgaataaattgtccacgagagtctctaacacaacac 36733650  T
Q  676 gcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccac--attgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttg 773  Q
     |||||| ||||| ||| |||   ||||| ||||  ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  36733649 acaaaaggtgtaagatggttatagtcatgaaacgcggcatccacatattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctccgaaactcagttattaccttg 36733550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 264 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 44603112 - 44602752
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  44603112 accaaagcaaagttagttattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgcccta 44603013  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
         ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44603012 -----agtatgagccaccatgttcgcttgtcccctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcat 44602918  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||||  |||    
T  44602917 agaattttgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaaggcaacccggtctcatctgttcacatcagtaaa 44602818  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccattt 629  Q
    ||||| | | ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  44602817 gtgaatgacatcgagtaagactaatgtctccccctccaaaattgtcatatttgtttgccgccattt 44602752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 314 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 52109768 - 52109324
Alignment:
Q  314 aaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctc 413  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||     
T  52109768 aaggataagaattaaaaatacggtgactagtccaagaacatgtcgccctatctaaagtatgaacaactatgtttgtttgtctcataacaaactttacctt 52109669  T
Q  414 gaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagta 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  52109668 gaagttagaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggtccggagacaatagagcttgtactagagta 52109569  T
Q  514 gatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatat 613  Q
    ||||| ||  |||| |||| ||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||   ||||||    
T  52109568 gatgaatcacactcaaagacaac-ccatcccatctgttagcatcagcaaagtgaaggacctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaatgatcatat 52109470  T
Q  614 ttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagc 713  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||  | ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||  | |    
T  52109469 ttgcccgctgccatttcgtttgagcctgaataaattgtccacaggagtctctaacacaacatgcaaaagatataagatgattacggtcatggaacacaac 52109370  T
Q  714 atccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  52109369 gtccacattacacttcaaccacgtctttgtcggtttctcccaaact 52109324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 264 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 2885592 - 2885320
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataat-aaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccct 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||| | ||||||    
T  2885592 accaaagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacaggtcgccct 2885493  T
Q  363 agctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaaga----taactgaaaaataatactagaaacaat 458  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2885492 agctaaagtatgagcaa-catgttcgcttgtatcctaacaaacttcaccacgaagttgaaatgtaaagataattaactgataaataatactagaaacaat 2885394  T
Q  459 agcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    |||||| || || ||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2885393 agcatataactccgaatcaccatagcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtctgactcgaaga 2885320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 276 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 24538841 - 24538357
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa-tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatg 374  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||   ||||||| |  | |||||| ||||||||    
T  24538841 ttaactattatcattaatcaactaatgtttaatacaagaaggataaaaaaaaaaaaatatggtgactagccgaagaacatgttgtcctagcaaaagtatg 24538742  T
Q  375 aacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaa 474  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24538741 agcaatcatgttcgcttgtttcctaacgaacttcacctcaaagttagaatgtaaagataacagataaataatactagaaataatagcgtagaattctgaa 24538642  T
Q  475 tcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcct 574  Q
    |||| ||||||   ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||          ||||| ||||||||| ||| |    
T  24538641 tcactatgacccgaagcagatagatcttgcactagagtagaagagtcagactcgaaaagaactcggtcc----------catcagcaaagtgaatggcat 24538552  T
Q  575 cgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagta 674  Q
    |||||||             || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  24538551 cgagtaa-------------ccctccaaaactgtcgtatttgcctgctgccaattcgtttgagcccgaataaattatccacgggagtctctaacacaaca 24538465  T
Q  675 cgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgc 774  Q
    | |||||| | |||  || ||||| | || |||||  |||||||||||||| |||  ||| ||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  24538464 cacaaaagatctaacttggttacggttatagaacgcggcatccacattgcatttcgaccaggtctcacttggtttctctcaaactgagatgttaccttgc 24538365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 264 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 48166591 - 48166149
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||  |||||  | ||||| |||    
T  48166591 accaaaacaaagttaattattat-attaatcaaccaatattcaatacaagaaggataaaaatcaaagatacggtgactagcccaagagtaggccgctcta 48166493  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    | ||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||           ||||||||    
T  48166492 gttaaagtacgagcaatcatgttcgtttgtttcctaacaaacttcatcttgaagttgaaatgtaaagataacagataaatat----------aatagcat 48166403  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    ||||||||| ||||||||   |   |||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| ||| || |||||| ||||| ||| | ||||    
T  48166402 agaattctgtatcaccatcgtcccaagactatagagcttgcaatagagtagctgaatcagactcgaagacaacccgatcccatatattcacataagcaaa 48166303  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| | | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  48166302 gtgaatgacatcgagtaaggctattgtctcccactccaaaactgtcatatttgctcgctgccatttcatttgagcccgaataaattgaccacgggagtct 48166203  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatcc 717  Q
    ||||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  48166202 ctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgtggcatcc 48166149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 290 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 21031488 - 21031251
Alignment:
Q  290 taattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgc 389  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||   ||| |||| || ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21031488 taatcaaccaatgttcaatacgagaaggataagaataaaacatacggtaactaacccaaaaacaggctgccctggctaaactatgagcaatcatgttcgc 21031389  T
Q  390 ttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttga 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||   |  ||    
T  21031388 ttgtctcctaaaaaacttcacctcgaagttaggatgtaaagataattgataaataatactagaaactataacataaaattccgaatcaccatagtccgga 21031289  T
Q  490 gacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactc 527  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21031288 gacgatagagcttgcactagaatagctgagtcagactc 21031251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 264 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 14485375 - 14485161
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||    
T  14485375 accaaagaaaagttaaccattatcattaatctaccaataatcaatacaagaaggataagaataaaaaatatgattactagctcaagaacaagccgcccta 14485276  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||      |||    
T  14485275 gctaaagtatgagcaactatgttcgtttgtctcctaatgaacttcaccttaaagttggaatgtaaaaataactgataaacaatactaaaaa------cat 14485182  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgac 484  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14485181 agaattctgaatcaccatgac 14485161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 276 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 5594387 - 5594266
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  5594387 ttaactattatcattaatcaatcaatatttaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagtccaagaacatgccgtcctagttaaagtatga 5594288  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcc 397  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  5594287 gcaaccatgttcgcttgtctcc 5594266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 301 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17371776 - 17371647
Alignment:
Q  301 tgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaa 400  Q
    ||||||||||| | ||||||  | | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  17371776 tgttcaatacatggaggatataactcaaaaatacggtgactagctcaagaacatgccgccctagctaaggtatgagcgaccatattcgcttgtctcctaa 17371677  T
Q  401 caaacttcacctcgaagttggaatgtaaag 430  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17371676 taaacttcaccttgaagttggaatgtaaag 17371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 23332791 - 23332577
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaa-ggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||   ||  ||||||| | | |  |||||||    
T  23332791 aagcaaagttaactattattattaatcaaacaatgttcaatacaagaaaggataaaaataaaaattacggtagctaactcaagaatacgtcatcctagct 23332692  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||  |||| | ||   |||||||||| | |||||||| || |||||||| |||| |    
T  23332691 caagtatgagcaaccatgctcgcttgtcttctaacaaatttcatcttaaagtagaaaaacaaagataactcacaaataataataaaaacaataacataca 23332592  T
Q  467 attctgaatcaccat 481  Q
    ||| |||||||||||    
T  23332591 attttgaatcaccat 23332577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 438
Target Start/End: Original strand, 4898447 - 4898616
Alignment:
Q  269 agcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaa 368  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||||| | |  ||  ||||||||| | || |||| ||||    
T  4898447 agcaaagttaaccattatcattagtcaaccaatgtttaatataagaatgatgagaataaaaaatacagcgtctaactcaagaacaggtcggcctaactaa 4898546  T
Q  369 agtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga 438  Q
    ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4898547 agtatgagcaatcatattcgtttgtctcctaacaaactttacatcgaagttgaaatgtaaagacaactga 4898616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 327
Target Start/End: Original strand, 3297024 - 3297085
Alignment:
Q  266 caaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataa 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3297024 caaagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataa 3297085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 362 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 23163418 - 23163357
Alignment:
Q  362 tagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 423  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  23163418 tagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtcttctaacaaactttatctcgaagttggaa 23163357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23163475 - 23163419
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggata 320  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23163475 accaaagcaaagttaactattattattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggata 23163419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 459
Target Start/End: Original strand, 38679050 - 38679113
Alignment:
Q  396 cctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaata 459  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||    
T  38679050 cctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagctaccttataaataatattagaaacaata 38679113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 437
Target Start/End: Original strand, 22929755 - 22929804
Alignment:
Q  388 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactg 437  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  22929755 gcttgtcacctaataaacttcacctcgaagttgaaatttatagataactg 22929804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 268 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 88920 - 88403
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  88920 aagcaaaattaactattatcattaatcaaccaatgctcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagcta 88821  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  88820 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctccaaataaacttcacgttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatactggaaacaatagcatagaa 88721  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  88720 ttctgaatcaccatgatcttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcaacaaagtga 88621  T
Q  568 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 667  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  88620 agggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccattgccatttcatttgagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaa 88521  T
Q  668 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 767  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  88520 cacaacatgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgtgttgtt 88421  T
Q  768 gccttgcactgtattatg 785  Q
    |||||||||| |||||||    
T  88420 gccttgcactctattatg 88403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 264 - 786
Target Start/End: Original strand, 34695726 - 34696246
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  34695726 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgcccta 34695825  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  34695826 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcat 34695925  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||    
T  34695926 aaaattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaa 34696025  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  34696026 gtgaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaataaattgcccacgggagtct 34696123  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||    
T  34696124 ctaacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgcagtttctcccaaactgagt 34696223  T
Q  764 tgttgccttgcactgtattatgt 786  Q
    |||| ||||||| | ||||||||    
T  34696224 tgttaccttgcattctattatgt 34696246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 264 - 786
Target Start/End: Original strand, 34718138 - 34718658
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  34718138 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgacaagcccaagaacaagccgcccta 34718237  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  34718238 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactggtaaattatactagaaacaatagcat 34718337  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||| ||||    
T  34718338 aaaattctgaatcaccatgacccggagacgataacgcttgcactagagtagcggagtcggactcgaagacaacccgttcccatctattgacatcagcaaa 34718437  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  34718438 gtgaatggccttgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgcca--tcgattgagcccgaataaattgcccacgggagtct 34718535  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |||    
T  34718536 ctaacgcaacacgcaaaagatgtaatatgcttatggtcatggaatgtggcatccacgttgtacttcaaccacgactcgcgcagtttctcccaaactgagt 34718635  T
Q  764 tgttgccttgcactgtattatgt 786  Q
    |||| ||||||| | ||||||||    
T  34718636 tgttaccttgcattctattatgt 34718658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 268 - 777
Target Start/End: Original strand, 12130464 - 12130973
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||  ||||||||    
T  12130464 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtaactagctcaagaataggccctcctagcta 12130563  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12130564 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaataatagcatagaa 12130663  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
    ||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12130664 ttctgaatcaccatgtcccgaagatgatagagcttggactagagtagatgagtcagactcgaagataacccgattccatctatttgcatcagcaaagtga 12130763  T
Q  568 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 667  Q
    || ||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||| ||  || || ||||||||||    
T  12130764 agagcctcaagtaaggctactgcctccccctccaacactatcatatttgctcgctgtcatttcgtttgagcccgaataatttgcccgcgggagtctctaa 12130863  T
Q  668 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 767  Q
    ||||  || |||||| |  |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12130864 cacaacacccaaaagatagaatatggttacggtcatggaacggggcatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcgatttctcccaaattgagttgtt 12130963  T
Q  768 gccttgcact 777  Q
     |||||||||    
T  12130964 accttgcact 12130973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 276 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9710308 - 9710033
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | |||  ||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  9710308 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaactaaaaatacggttactagcccaagaacagaccgtcttagctaaagtatga 9710209  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9710208 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaattgcatagaattatgaat 9710109  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctatt 551  Q
     |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9710108 taccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcaaagtcagactcgaagacaacccggtcccatctatt 9710033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 271 - 627
Target Start/End: Original strand, 1417819 - 1418166
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa-tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaa 369  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||  | ||||||||||||    
T  1417819 caaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaagaacagcctgccctagctaaa 1417918  T
Q  370 gtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 469  Q
     |||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1417919 ctatga----------tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatagaatt 1418008  T
Q  470 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 569  Q
    ||||||||||||   |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| || |||||| ||||   ||     
T  1418009 ctgaatcaccatagtccagagacaatagagcttgaactagagtagatgagtcagactcgaagacaacccagtcccatctgtttgcatcagcaaatcaaat 1418108  T
Q  570 ggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccat 627  Q
      ||||||||||||||| |||||| || | || ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  1418109 tacctcgagtaaggctactgtctctcccttcataaccgtcatatttgcccgctaccat 1418166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 266 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 26199045 - 26198779
Alignment:
Q  266 caaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagc 365  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| | |||||||    
T  26199045 caaagcaaagttaattattatcattaatcaatcaatgttcaatatatgaatgataagaataaaaaatgcggtgactagctcaagaagaagtcaccctagc 26198946  T
Q  366 taaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 465  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26198945 taaagtatgagaaaccatgttcacttgttacctaacaaacttcacctcaaagttgaaatgtaaagataactggtaaataatactagaaacaatagcatag 26198846  T
Q  466 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    ||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26198845 aatttcaattcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 26198779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 268 - 579
Target Start/End: Original strand, 13109698 - 13110006
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||   |||   || | |||||||||||    
T  13109698 aagcaaagttaattattatcgtaaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagagtaaaaaatacggtgactaaaccaa---catgtcgccctagcta 13109794  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  13109795 aagtatgaacaactatgttcgtttgtctcctgacaaacttcacctcaacgttggaatgtaaagataactgataaataatactggaaacaatagcttataa 13109894  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
    |||  |||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||  |||||||| | ||||||    
T  13109895 ttccaaatcaccatggcccgaagacgatagagcttccactagagtagaagagtcggactcgaagacaaccatgtcccatctgatcgcatcagctaagtga 13109994  T
Q  568 agggcctcgagt 579  Q
    ||||||||||||    
T  13109995 agggcctcgagt 13110006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 268 - 563
Target Start/End: Original strand, 11291891 - 11292181
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  11291891 aagcaaagttatttattatcattaatcaaccaatgtt-aatacaggaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaagccgacctagcta 11291989  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  11291990 aagtatgagcaaacatgttcgctcgtctcctaacaaacttcaccttgaagtt-gaatgtatagataactgataaataatactataaacaataacataaaa 11292088  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    || ||||||| |||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | || ||||||||| |||||||||||    
T  11292089 ttttgaatcatcatggcc-gaaaacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaa--ccgttccatctatttgcatcaacaaa 11292181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 295 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 22845857 - 22845600
Alignment:
Q  295 aaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtc 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||     
T  22845857 aaccaaagttcaatacaagaaggataagaataaaaaatatggtgactagcttaagaacaggtcgccctagctaaagtatgagcaa--atgttcgcttgt- 22845761  T
Q  395 tcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacga 494  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| | |||          | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22845760 tcctaacaaacttcacattgaagttggaaagcaaa----------agataatactagaaacaatagcctagaattctgaatcaccatgatctggagacga 22845671  T
Q  495 tagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 565  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22845670 tagagcttgcactagagtagattagttggactcgaagacaacccggtcccatctgttcgcatcagcaaagt 22845600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 355 - 782
Target Start/End: Original strand, 44017231 - 44017658
Alignment:
Q  355 gccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaa 454  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44017231 gccgccctagttaaagtatgagcaactatgtttacttgtctcctaacacacttcatatcgaagttagaatgaaaagataactgataaataatacaagaaa 44017330  T
Q  455 caatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgc 554  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||     ||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||| |||| ||| | ||| |    
T  44017331 caatggcatataattcttaatgaccatgtttcggagacgatagagcttgcactaaagtaacggagtcagactcgaagacaacttggtctcatatgttcac 44017430  T
Q  555 atcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttcca 654  Q
    || | ||| ||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||   ||||||||| |||||||  |||    
T  44017431 attagcaacgtgaatggcatcgagtaaggttgttgtctccccctccaaaactgtcatatttgcacggtgtcattttatttgagcccgaataaattgccca 44017530  T
Q  655 cgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctccc 754  Q
    || ||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||| | | |||||  |||||  | || | |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |     
T  44017531 cgggagtctctaacacaacacgcgaaagatgtaagatggtcatgatcacagaacgcggaattcgcattgcacttcaaccatgtctcgctcggcttcttca 44017630  T
Q  755 aaactaagttgttgccttgcactgtatt 782  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  44017631 aaacttagctgttaccttgcactttatt 44017658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 267 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 14827441 - 14827126
Alignment:
Q  267 aaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||  |||||| | | |||||||| |    
T  14827441 aaagcaaagttaactaatatcattaatcaactaatgttcaatacaagaagaataagaatagaaaatgcggtgactagcccaagaatatgtcgccctagat 14827342  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||| |||||||||||    
T  14827341 aaagtatgagcaaccatgttcgtttgt-tcttaactaactttacctcgaagttggaatgtaaagataactaatacataatattataaataatagcataga 14827243  T
Q  467 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 566  Q
    |||  ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| | |||| || || |||| |||||| || |||||||||  ||||  ||||||    
T  14827242 atttcgaatcaccatgacccaaacacgatagagcttgcactagagtagctaagtcagattcaaagacaactcgatctcatctattcatatcagtaaagtg 14827143  T
Q  567 aagggcctcgagtaagg 583  Q
    || | | ||||||||||    
T  14827142 aatgacatcgagtaagg 14827126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 268 - 482
Target Start/End: Original strand, 35158668 - 35158885
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaa-ccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||     
T  35158668 aagcaaagttaaatattatcattaatcaaaccaatgttcaatataaaaagcataagaataaaaaatacggtgcctagcccaagaacaggccgccctagcg 35158767  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttca--cctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcata 464  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35158768 aaactatgagcaactatgttcgcttgtctcataacaaacttcatgccttgaagttggaatgtaaaaataattgataaataataatagaaacaatagcata 35158867  T
Q  465 gaattctgaatcaccatg 482  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  35158868 gaattctgaatcatcatg 35158885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 324 - 480
Target Start/End: Original strand, 18344176 - 18344332
Alignment:
Q  324 ataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 423  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18344176 ataaaaaatacgatgattagtctaacaacaggccgccctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaatttcaccttgaagttggaa 18344275  T
Q  424 tgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacca 480  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18344276 tgtaaagataactgataattaatactagaaacaatatcatagaattctaaatcacca 18344332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 510 - 759
Target Start/End: Original strand, 18345555 - 18345803
Alignment:
Q  510 agtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtc 609  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||    
T  18345555 agtagatgagtcggattcgaagacaattcgatcccatctgttagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggctactgcctccccctc-aaaactgtc 18345653  T
Q  610 atatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacg 709  Q
    ||||||| | | | |||||||| |||||  |  |||||||  |||||  |||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  18345654 atatttgtccgttaccatttcgtttgagttcaaataaattacccacggaagtctctaacacaacacgcaaaagaagtaatatggttacgctcatggaacg 18345753  T
Q  710 tagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    | || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  18345754 ttgcgtccacattgcacttcaaccatgtctcgttcggtttcttccaaact 18345803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 272 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 25552502 - 25552312
Alignment:
Q  272 aaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagt 371  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||| | |  |||| |||||||    
T  25552502 aaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacctaagaacaggtcttcctaactaaagt 25552403  T
Q  372 atgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagca 462  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||  || ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25552402 atgagcaaccatgttcacttgtctcttaacaaatttcatcttaaaattgaaatgtaaaaataactgataaataatattagaaataatagca 25552312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 364 - 452
Target Start/End: Original strand, 10244492 - 10244580
Alignment:
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaga 452  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  10244492 gctaaagtatgagcaatcatgttcacttgccgcttaataaacttcacctcgaagttggaatctaaagctaactcagaaataatactaga 10244580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 480
Target Start/End: Original strand, 36445479 - 36445557
Alignment:
Q  402 aaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacca 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| | || |||| || |||||||||    
T  36445479 aaacttcacctcgaagttggaatgtaaagagaattgaaaaataatatgagaaacaacaacaaagaactcggaatcacca 36445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43294008 - 43293919
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaaca 353  Q
    |||||| |||| ||||||   |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43294008 accaaaacaaacttaacttaaatcattaattaaacgatgtttaatacaagaaggataaagataaaaaatacggtgactagtccaagaaca 43293919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 560 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 9709998 - 9709910
Alignment:
Q  560 caaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaat 648  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  9709998 caaagtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaataaat 9709910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 43293900 - 43293835
Alignment:
Q  382 atgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataata 447  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  |||||||    
T  43293900 atgttcgcttgtcgcctaataagcttcacctcgaggttgaaatgtaaagataattgagcaataata 43293835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 592 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 26198730 - 26198626
Alignment:
Q  592 tccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatat 691  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||   |||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||||| || |||||    
T  26198730 tccccctccaaaactgtcatatttgttcgctaccattttatttgagctcgaataaattgcccacatgagtctctaacacagcacacaaaagatgcaatat 26198631  T
Q  692 gatta 696  Q
    |||||    
T  26198630 gatta 26198626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 271 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 16732291 - 16731777
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  16732291 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagctaaag 16732192  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16732191 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattc 16732092  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |    
T  16732091 tgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtgaatg 16731992  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||    
T  16731991 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgggaatctctaacac 16731892  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 770  Q
    |  | ||||||| ||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16731891 aacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttacc 16731792  T
Q  771 ttgcactgtattatg 785  Q
    ||||||| |||||||    
T  16731791 ttgcactctattatg 16731777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 271 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 17710425 - 17709911
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  17710425 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagtccgccctagctaaag 17710326  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17710325 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattc 17710226  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |    
T  17710225 tgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcagagtgaatg 17710126  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||  || || || ||||||||||    
T  17710125 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgccctctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgggaatctctaacac 17710026  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 770  Q
    |  | ||||||| ||||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17710025 aacatgcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaacacggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttacc 17709926  T
Q  771 ttgcactgtattatg 785  Q
    ||||||| |||||||    
T  17709925 ttgcactctattatg 17709911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 271 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 16098851 - 16098382
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa---tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  16098851 caaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaaaaatacggtgactagctcatgaacaggccgccctagcta 16098752  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16098751 aaatatgagcaaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataactaatactagaaacaatatcatagaa 16098652  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||| |||| |||    
T  16098651 ttctgaatcaccatggcccggagacgatggagcttgtactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatttgttagcatcagcaaattga 16098552  T
Q  568 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 667  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||| || ||||||| |||||||||||   | | |||||||| ||||||||| |||||||  | | | ||||||||||    
T  16098551 agggcctctagtaaggctactacctctccctccaaaattgtcatatttgttcgtttccatttcgtttgagcccgaataaattgcctatgggagtctctaa 16098452  T
Q  668 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgt 737  Q
    ||||  |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  16098451 cacaacacgcaaaagaagtaatatggttacggtcatggaacgatgcgtccacattgcacttcaaccacgt 16098382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Original strand, 9328424 - 9328941
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| | | || | ||    
T  9328424 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggacgtcgta 9328523  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  9328524 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaaacgcat 9328623  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9328624 agaattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactccaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaa 9328723  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    |||||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||| || ||||||| ||| || || |||    
T  9328724 gtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatattttcccgttgccatttcgtttgagctcgaataaattgtcc-cgggaatct 9328822  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9328823 ctaacacaacacgcaaatgatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagt 9328922  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  9328923 tgttaccttgcactctatt 9328941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 278 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 22289592 - 22289088
Alignment:
Q  278 aactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaac 377  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  22289592 aactattatcattaatcaactagtgttcaatataagaaggataaaaataaaaaatacggtaactagttcaagaacaggccgccctagctaagctatgagc 22289493  T
Q  378 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22289492 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacatcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataaaattctgaatca 22289393  T
Q  478 ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcga 577  Q
    ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| | ||| || |  ||||||||| ||| ||||    
T  22289392 ccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacagcccggtcccatttgttcccaacggcaaagtgaatggcatcga 22289293  T
Q  578 gtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgc 677  Q
    ||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||| || ||||  ||||| || |||||||||||  ||||    
T  22289292 gtaaggcaaccacctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtctgagtccgaatgaattgcccacgggaatctctaacacaacacgc 22289193  T
Q  678 aaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcact 777  Q
     |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22289192 gaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcacttaaaccacgtctcacgcggcttctcccaaactgagttgttagcttgcact 22289093  T
Q  778 gtatt 782  Q
     ||||    
T  22289092 ctatt 22289088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 271 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 1581975 - 1581467
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| || ||||| || ||||||||     
T  1581975 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaaaaataagcctccttagctaaac 1581876  T
Q  371 tatgaacaacc-atgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 469  Q
    ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  1581875 tatgagcaccccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatattataaacaatggcatagaatt 1581776  T
Q  470 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 569  Q
      |||||||||||  |  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1581775 tcgaatcaccatggtccggagacgatagagtttgcattagtgtagatgagttggactccaatagaacccgatctcatctgttcgcatcagcaaagtgaag 1581676  T
Q  570 ggcctcgagtaaggctagtgtct-ccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaac 668  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||| || |||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||||||||| |    
T  1581675 ggcctcgagtaaggctactgcatcccccctcaaaaactataatatttgccctctgccatttcgtttgagcccggataaactatccgctggagtctctagc 1581576  T
Q  669 acagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttg 768  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  1581575 acaacacgcaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacatctcgctcagtttctcccaaactgagttgtta 1581476  T
Q  769 ccttgcact 777  Q
    | |||||||    
T  1581475 cgttgcact 1581467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33152147 - 33151898
Alignment:
Q  1 ggtctctaaatacaataaagacgtgtgttgtgtggtggttcgatggaaagtaagttatttaagaagccaacaaactaatcacgcgggaaatcttttcctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33152147 ggtctctaaatacaataaagacgtgtgttgtgtggtggttcgatggaaagtaagttatttaagaagccaacaaactaatcacgcgggaaatcttttcctg 33152048  T
Q  101 gggttttttaagtaaattagtttaacatgttactttgaatttagcttagttcttaattttgtaagtaataaccaactttaggaattctccgtgaaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33152047 gggttttttaagtaaattagtttaacatgttactttgaatttagcttagatcttaatttt----gtaataaccaactttaggaattctccgtgaaagagt 33151952  T
Q  201 gtctcgcaagttgttcaagacatgagattttattacatttcggcaggttgagca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33151951 gtctcgcaagttgttcaagacatgagattttattacatttgggcaggttgagca 33151898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 264 - 787
Target Start/End: Original strand, 29200778 - 29201294
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||||||||    
T  29200778 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaag-ataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgcccta 29200876  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29200877 gctaaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcat 29200976  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || | |||||| ||| ||||| ||||    
T  29200977 agaattctgaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgaagacaacccgtttccatctgttcacatcagcaaa 29201076  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttc--cacgagagt 661  Q
    ||||| | | || |||||   |  |  |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |  |||  ||||    
T  29201077 gtgaatgacatcaagtaaacatgctacctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgtcatttcgtttgagcccgaataaactggccacacatgagt 29201176  T
Q  662 ctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaa 761  Q
    |||||| |||  | ||||||| | |||||||         |||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  29201177 ctctaatacaacatgcaaaagatataatatg--------gatggaaagcggcatcaacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaactga 29201268  T
Q  762 gttgttgccttgcactgtattatgtc 787  Q
    | | || |||||||||||||| ||||    
T  29201269 gctattaccttgcactgtattttgtc 29201294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 267 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 17877760 - 17877260
Alignment:
Q  267 aaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| |||| ||    
T  17877760 aaagcaaagttaactattatcattaattaatcaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaataacatgccgtcctacct 17877661  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17877660 aaagtatgagcaaccatggtcgcttgtctcataacaaacttcacctcgaaattgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataga 17877561  T
Q  467 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 566  Q
    |||  ||||||||||||||   | ||||||||||||||||          ||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||    ||||||    
T  17877560 attacgaatcaccatgacccataaacgatagagcttgcac----------gagtcagactcgaagacaacccgattccatctgttcgcatttgtaaagtg 17877471  T
Q  567 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 666  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||| || || || || ||| | |||||| ||    
T  17877470 aagggccttgagtaaggctacttcctccccctccaatactgtcatatttccccgctgcgatttcgtttgagcacgaatgaacttcccatgggagtctata 17877371  T
Q  667 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 766  Q
    || |   |||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17877370 acgccacacgcaacaaatgtaatatggttacaatcatggaacgcgacatccacattgcatttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaattgagttgt 17877271  T
Q  767 tgccttgcact 777  Q
    | |||||||||    
T  17877270 taccttgcact 17877260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 785
Target Start/End: Original strand, 30493444 - 30493952
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30493444 ttaactattatcagtaatcaacaaatattcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatga 30493543  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30493544 acaaccatgtttggttgtctcctaacaaacttcactatgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcataaaattctgaat 30493643  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctc 575  Q
    ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||  |||| | ||||||| | | ||    
T  30493644 caccatggcccgaagacgatagagcttgcactagagtaattgagtcggactcgaagacaacctggtctcatctgttcatatcagctaagtgaacgacatc 30493743  T
Q  576 gagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtac 675  Q
     |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||  ||| |||| | |||||||||  ||    
T  30493744 aagtaaggctactgcctcccc-tccaaaactgtcatacttgtctgctgccatttcgtttgagcctgagtaaattgcccatgagaatttctaacacaacac 30493842  T
Q  676 gcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgca 775  Q
    ||||||  |||||  || ||||  |||||||| |   |||||| ||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||    
T  30493843 gcaaaatatgtaagttggttacagtcatggaatgcgacatccatattgcactttaaccacgtttcgttcgatttcttccaaactgtgttgttatcttgca 30493942  T
Q  776 ctgtattatg 785  Q
    || |||||||    
T  30493943 ctttattatg 30493952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 268 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 3602013 - 3601751
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||  ||| ||||  ||||||||||||    
T  3602013 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatgcaagaaggataagaataaaaaatacggtgacaagcccaacaacagcccgccctagcta 3601914  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3601913 aactatgagcaaccatgttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaatttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataaaa 3601814  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaa 530  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3601813 ttctgaatcaccatggtccagagacgataaagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaa 3601751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 276 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 3275388 - 3275131
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag-tatg 374  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  3275388 ttaattattatcattaatcaaacactgtttaatataagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgccctagcttaagctatg 3275289  T
Q  375 aacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaa 474  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  3275288 atcaaccatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattatgaa 3275189  T
Q  475 tcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    ||| | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3275188 tcatcgtggcctagagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 3275131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 264 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24251801 - 24251619
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  24251801 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaag---gataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacaggccgcccta 24251705  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatact 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24251704 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatact 24251619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 269 - 730
Target Start/End: Original strand, 30824323 - 30824762
Alignment:
Q  269 agcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaa 368  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||  || || ||  |||    
T  30824323 agcaaagttaact-ttatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacagaccacc-taattaa 30824420  T
Q  369 agtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 468  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30824421 ggtatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaacttcacttcaaagttggaatgtaaagataactgataaataagactagaaacaataacatagaat 30824520  T
Q  469 tctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaa 568  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||                   ||||||||| |||  | |||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  30824521 tctgaatcaccatgacccagagacgatagagcatgc-------------------actcgaagacaacctgatcccatctgttcgcattagaaaagtgaa 30824601  T
Q  569 gggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctg-ccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 667  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||||  | |||| |  |||   || |||||| ||||||| | | ||  |||||||||    
T  30824602 gggcctcgagtaaggctactgcctccc--ttcaaaactgtcatatttatccgctgtctttttttttttagcccgaataaattattcgcggcagtctctaa 30824699  T
Q  668 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttca 730  Q
    ||||  | ||||||| |||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30824700 cacaacatgcaaaagatgtaatatgactacagtcatgaaatgtagcatccacattgcacttca 30824762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 264 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 44481452 - 44481267
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  44481452 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaacccatgttcaatacaagatggataagaataaaaaatatggtgactagcccaagaacaggccgcccta 44481353  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatact 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44481352 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgtaaagataactggtaaataatact 44481267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 264 - 451
Target Start/End: Original strand, 33224382 - 33224569
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||    
T  33224382 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaatgataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgcccta 33224481  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactag 451  Q
    | |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33224482 gataagttatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactag 33224569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 264 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 47580239 - 47580022
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||  |||||||| |||| | ||    
T  47580239 accaaaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaataaaaa-tacggtgactagcccaagaacaggccgtctta 47580141  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
     || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  47580140 actgaagaatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaccaaacttcacctcgaagttggaatataaagataactgataaataatactagatccaatagcat 47580041  T
Q  464 agaattctgaatcaccatg 482  Q
    || | ||||||||||||||    
T  47580040 aggactctgaatcaccatg 47580022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 24139376 - 24139221
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  24139376 accaaaacaaaattaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccgcccta 24139277  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagtt 419  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24139276 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagtt 24139221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 431
Target Start/End: Original strand, 35030482 - 35030643
Alignment:
Q  266 caaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagc 365  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   ||||||| | | |||| ||   |||||||| |  || |||||    
T  35030482 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatactagaaagatat--ataaaaa-tccagtgactaac-caagaacaggttgctctagc 35030577  T
Q  366 taaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaaga 431  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35030578 taaagtatgagcaattatgttcgcttgtctcttcgcaaacttcacctcaaagttggaatgtaaaga 35030643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 423
Target Start/End: Original strand, 6056281 - 6056358
Alignment:
Q  346 caagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 423  Q
    |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  6056281 caagaacatgccgccctagcaatcgtatgaacaaccatgttcgcttgacgcccaacaaacttcacctcaaagttggaa 6056358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 24139218 - 24139138
Alignment:
Q  442 ataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcg 522  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24139218 ataatactagaaacaatagcataaaatttcaaatcaacatgacccggagacgacagagcttgcactagagtagctgagtcg 24139138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 35013920 - 35013709
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||   | ||||||||||| | ||||||  | | ||||| |||| || |||   ||||| | | |||||||||||    
T  35013920 aagcaaaatcaactaatatcattaattacatattgttcaatacatggaggatagaactcaaaaacacggcgactagccgaagaataggtcgccctagcta 35013821  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    ||||| || | ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| |  |||||||| ||||| |||||| || ||    
T  35013820 aagtacgagcgaccatatttgcttgtctcctaataaacttcaacttgaaattggaatgtaaaactaacttagcaataatacaagaaataatagcctaaaa 35013721  T
Q  468 ttctgaatcacc 479  Q
    ||  ||||||||    
T  35013720 tttagaatcacc 35013709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 44480972 - 44480892
Alignment:
Q  457 atagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataact 537  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  | ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  44480972 atagcataaaattccgaatcaccatgacccggagacgataacgtttgcagtagagtagcggagtcggactcgaagacaact 44480892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 433
Target Start/End: Original strand, 43782950 - 43783028
Alignment:
Q  355 gccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagata 433  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||| || | |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43782950 gccgccctcgctaaagagtgagcaactatatccgcttgtcgccgaataaactttacctcgaagttggaatgtagagata 43783028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 271 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 25731166 - 25730688
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  25731166 caaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaag 25731067  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25731066 tatgagcaaccatgttcgcttatctcctaacaaacttcacctggaagttggaatgtaaatataactgataaataatactagaaacaataacatagaattc 25730967  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25730966 ttaatcaccatgaccctgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcagtcccatctgttcgcatcagcaaagtgaagg 25730867  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| || || ||| |||||||||    
T  25730866 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagctcgaataaatttcccgcgtgagactctaacac 25730767  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggttt 749  Q
    |  |||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25730766 aacacgtgaaaattgtaatatggttacggtcatggaacgcggaatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcggttt 25730688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 20205320 - 20204802
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |  |||||| | || ||||||    
T  20205320 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacgttgactggcccaagaataggctgcccta 20205221  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20205220 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctagaagttggaatgtaaagataactgatatataatactagaaacaatagcat 20205121  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  20205120 agaattttgaatcaccatgacccggagaggatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcaacaacaaa 20205021  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  20205020 gtgaatggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcctggataaatttcccgcgggagtct 20204921  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||| ||||  | | ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |||    
T  20204920 ctagcacaaaatgtaaaagatgtaatatggttatggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcatttggtttctcccaaactgagt 20204821  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    | || |||| |||| ||||    
T  20204820 tattaccttacactctatt 20204802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 274 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 4268458 - 4267969
Alignment:
Q  274 atttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa----tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaa 369  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  4268458 atttaactattatcattaatcaaacaatgctcaatacaagaaggataataataaaaaaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccctagataaa 4268359  T
Q  370 gtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 469  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4268358 gtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgagaattaatactagaaacaatagcatagaatt 4268259  T
Q  470 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 569  Q
    | ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  4268258 ccgaatcaccatggcccggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagaaaacccggtcccacctgttagcatcagcaaagtgaag 4268159  T
Q  570 ggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaaca 669  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4268158 ggcctctagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcctgaataaattgcccacgagagtctctaaca 4268059  T
Q  670 cagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||  || ||||| |||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4268058 caacacgcaaaagatgtaatatggttacaatcaagaaacgcggcgtccacgttgcactttaaccatgactcgttcggtttctcccaaact 4267969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 267 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 8388448 - 8387933
Alignment:
Q  267 aaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||    
T  8388448 aaagcaatgttaactattatcattaatcaaccagtgtttaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaaaccaccctagct 8388349  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8388348 aagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcccctcgaagttggaatgtaaagaaaactgaaaaataatactggaaacaatagcataaa 8388249  T
Q  467 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 566  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| || |  |||||||    
T  8388248 attctgaatcaccatggcctggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttcccaaccgcaaagtg 8388149  T
Q  567 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 666  Q
    || ||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  8388148 aatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgttcgttgccatttcgtttgagcctgaatgaattgcccacgagagtctcta 8388049  T
Q  667 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 766  Q
    |||||  |||| |||| ||||||||  | ||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  8388048 acacaacacgcgaaagatgtaatattttaacggtcatgaaacgcggcatccacattgtacttcaaccacgtctcacgcggtttctcccagactgagttgt 8387949  T
Q  767 tgccttgcactgtatt 782  Q
    |  |||||||| ||||    
T  8387948 tagcttgcactctatt 8387933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 268 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 27292794 - 27292304
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| | | |||||||||    
T  27292794 aagcaaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgtc-ccctagcta 27292696  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  27292695 aagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctgataaacttcactttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcataaaa 27292596  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
    |||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  27292595 ttccaaatcaccatggcctggagacgatagagtttgcactagagcagatgagtcgaactcgaagacaacccggtcccatctgttatcatcagcaaagtga 27292496  T
Q  568 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaa 667  Q
    ||||| || |||||||||| || |||||| | ||||||  | ||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27292495 agggcatctagtaaggctattgcctcccccttcaaaacaataatatttgtccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacgagagtctctaa 27292396  T
Q  668 cacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||||  | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  27292395 cacaacatgcaaaatatgtaatatggttactatcatggaacgtgacatccacattgcacttcaaccatgactcgttcggtttctcccaaact 27292304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 288 - 785
Target Start/End: Original strand, 15988593 - 15989092
Alignment:
Q  288 attaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa--tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgt 385  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||  ||| | || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15988593 attaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaaaatatggtgactagcccaatagcaggccgccttagctaaagtatgagcaaccatgt 15988692  T
Q  386 tcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgacc 485  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  15988693 ctgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgtaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaataacatagaattccgaatcaccatggcc 15988792  T
Q  486 ttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggct 585  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  15988793 tgaagacgatagagattgcactagagtagctgagacggacttgaagacaacccggtcccatatgttcgcatcagcaaagtaaagggcctcgagtaaggtt 15988892  T
Q  586 agtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttg 685  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||   | ||| ||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15988893 actgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgctcgcgaaagtctctgacataacacgcaaaagttg 15988992  T
Q  686 taatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtattatg 785  Q
    ||||||| || || ||||||||||   |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  15988993 taatatggttgcggtcatggaacgcgacatccatatttcacttcaacaacgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattatg 15989092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 264 - 759
Target Start/End: Original strand, 26597288 - 26597774
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  26597288 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaatatacggtgattagtccaagaacaggctgcccta 26597387  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26597388 ---------tgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataattgaaaaataatactagaaacaataacat 26597478  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |  ||||    
T  26597479 aaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtctcatctattcccaactgcaaa 26597578  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  26597579 gtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaattgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgtccacgggagtct 26597678  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||| | | ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||    
T  26597679 ctaacacaacacgcgaaagatgtaatatgttgatgatcatgaaacgcggcatccacattgcacttcaaccacgtcttacacgatttctcccaaact 26597774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 265 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 12660680 - 12660210
Alignment:
Q  265 ccaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctag 364  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  12660680 ccaaagcaaaaataactattatcattaatcaatcaatgtttaatacaaaaaagataaaaataaaaaatatgttgattagctcaagaacaggccgtcctag 12660581  T
Q  365 ctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcata 464  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12660580 ctaaagtatgagcagtcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttagaatgtaaacataactgaaaaataatactagaaacaatatcata 12660481  T
Q  465 gaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaag 564  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| | ||| ||| | |||||    
T  12660480 gaattctgaatcaccgtggcccgaagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcagactcgacgataacacggtctcatttgttcacattagcaaag 12660381  T
Q  565 tgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctc 664  Q
    |||| | | ||||||||| ||| || |||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||    
T  12660380 tgaatgacatcgagtaagactactgcctcccgctctaacactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgtccatgaaagtctc 12660281  T
Q  665 taacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccac 735  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12660280 taacacaacacgcaaaagatgtaagatggttacgttcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccac 12660210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 295 - 791
Target Start/End: Original strand, 27532759 - 27533256
Alignment:
Q  295 aaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtc 394  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| | | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  27532759 aaccattgttcaatacgagaaggataagaataaaaaatacagtgattagcccaagaacatgtcaccctagctaaagtataagtaaccatgttcgcttgtc 27532858  T
Q  395 tcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacga 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27532859 tcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaatagcaaagaattctgaatcaccatgacccggagacga 27532958  T
Q  495 tagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctcc 594  Q
    || ||  ||||||| || ||   ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | |||| ||| |||| || ||||    
T  27532959 taaagtctgcactaaagaagcaaagtcggactcgaaaacaacccggtcccatctattcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaagctattgcctcc 27533058  T
Q  595 ccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgc-aaaagttgtaatatga 693  Q
    || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||  ||     
T  27533059 ccctccaaaactgttatattttcctgctaccatttcgtttgagcccgaataaattgcccacgggagtctctaacacaacacgcaaaaagatgtaaactgg 27533158  T
Q  694 ttacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtattatgtctgtg 791  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||  | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  27533159 ttacgatcatggaacgcgacatccacattacacttcagtcgcgtctcgcgcgatttctcccaaactaaactattaccttgcactatattctgtctgtg 27533256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Original strand, 41940558 - 41941077
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa-tacggtgattagttcaagaacaagccgccct 362  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||| | |||    
T  41940558 accaaagcaaagttaacaactatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataagaataaaaaaatacggtgactagcccaataacaagcagtcct 41940657  T
Q  363 agctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagca 462  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  41940658 agctaaagtattagcaatcatgttctcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataaccggtaaataatactagaaacaatagca 41940757  T
Q  463 tagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaa 562  Q
    |||||||||||||||| |||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  | | ||| ||| | |||    
T  41940758 tagaattctgaatcacaatggtccagagacgatagagtttgcactagagtagttgagtcggactcgaagacaacccggtccagt-tgttcacatgagcaa 41940856  T
Q  563 agtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcct-gctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagt 661  Q
    |||||| | | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||   || ||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  41940857 agtgaatgacattgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttttctatatgtcatttcgtttgagctcgaataaatttcccacgggagt 41940956  T
Q  662 ctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaa 761  Q
    || ||||||   || |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  41940957 ctttaacactacacacaaaagatgtaagatagttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccacatctcgctcggtttctcccaaattgg 41941056  T
Q  762 gttgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  41941057 gttgataccttgcactctatt 41941077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 271 - 725
Target Start/End: Original strand, 11375351 - 11375796
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  11375351 caaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgaatagcccaagaacaggccgccctagctaaag 11375450  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||          ||||||||    
T  11375451 tatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcggagttggaatgtaaagataactcataaataatacgagag---------tagaattc 11375541  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
     |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| |||| |||||  |||| ||||||    
T  11375542 cgaatcaccatggaccggagacgatagagcttgcactagaatagatgaatcagactcaaagacaacccggtcccatatatttgcatccgcaaaatgaagg 11375641  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||   |  ||||||||||||||||    
T  11375642 gcctcgagtaaggctactgtctccccctccaaaactgtcatatttactcgctgccatttcgtttgagtccgaataaatcacctgcgagagtctctaacac 11375741  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgca 725  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11375742 aacatgcaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacgcagcatccacattgca 11375796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Original strand, 22767095 - 22767597
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||    
T  22767095 accaaaacaaagttaactattatcattcatcaaccaatgttcaacacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgcctta 22767194  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||| ||||    
T  22767195 gctaaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga----------------caatcgcat 22767278  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    |||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  22767279 agaattctgaattaccatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcaaactcgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaa 22767378  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    |||||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||  || || || |||    
T  22767379 gtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccccgggaatct 22767478  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22767479 ctaacacaacacgcaaaagatgtaagatgattactgtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagt 22767578  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  22767579 tgttaccttgcactctatt 22767597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 264 - 688
Target Start/End: Original strand, 34652083 - 34652499
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||  ||||    
T  34652083 accaaagcaaatgtaactattgtccttaatcaaccaatattcaatacaagaaagataagaataaaaaatacggtgactaacccaagaataagccatccta 34652182  T
Q  364 gctaaagtat--gaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagc 461  Q
    | ||||||||  || |||||||||||||||||||    ||||||     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  34652183 gttaaagtatatgagcaaccatgttcgcttgtct----acaaac-----ctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaataac 34652273  T
Q  462 atagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaaca 561  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||| ||||  ||    
T  34652274 atataattctgaatcaccatggcccagagacggtagagcttgcactagagtagtcgagtcgggctcgaagacaacccgatcccatctgttcacatcggca 34652373  T
Q  562 aagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagt 661  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||    
T  34652374 aagtgaatggcatcgagtaaggttattatctccccttacaacactgtcatatttgctcgctgcc-ttttgtttgagaccggataaattgcccacgggagt 34652472  T
Q  662 ctctaacacagtacgcaaaagttgtaa 688  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||    
T  34652473 ctctaacacaacacacaaaagatgtaa 34652499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 268 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 32632875 - 32632548
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||    
T  32632875 aagcaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatccaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcc-tagcta 32632777  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  32632776 aagtatgggcaactatgttcgcttgtctcataataaacgtcacctcgaagttagaatgtaaagataacaaataaataatattagaaacaatgtcatagaa 32632677  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
    ||||||||||| ||| |   ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||   ||||||||| ||||  ||| |||    
T  32632676 ttctgaatcactatggctcggagacgataaagcttacactaaagtagatgagtcagactcaaagacaacccggtttaatctattcgtatcagtaaaatga 32632577  T
Q  568 agggcctcgagtaaggctagtgtctcccc 596  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||    
T  32632576 aaggcctcgagtaaggttattgtctcccc 32632548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 323 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23075138 - 23074950
Alignment:
Q  323 aataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgga 422  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23075138 aataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgtcgtcctagctaaactatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttaaagttgga 23075039  T
Q  423 atgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagag 511  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |   |||||||| ||||||||||||||    
T  23075038 atgtaaacataactgataaataatactataaacaataacatagaattatgaatcaccatggaccgaagacgataaagcttgcactagag 23074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 463
Target Start/End: Original strand, 30573499 - 30573698
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||| ||||  ||||| ||    
T  30573499 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactaacccaaaaacagaccgcctta 30573598  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30573599 gctaaaatatgaacaaccatgttcgcttgtcttctaacaaatttcacctcaaaattaaaatataaagataactgataaataatactaaaaacaatagcat 30573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 281 - 532
Target Start/End: Original strand, 30222677 - 30222928
Alignment:
Q  281 tattatcattaatt-aaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa-tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaaca 378  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||| | ||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||    
T  30222677 tattatcattaaatcaatcaatgttcaatataagaagaataagactaaaaaaatacgctaattatgtcaagaacaggccgccctaattaaagtatgagca 30222776  T
Q  379 accatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcac 478  Q
    | |||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30222777 atcatgtttgcatgtctcttaacaaacttcacatcaaagttagaatgtaaagataattgataa--aattctataaacaatagcatagaattccgaatcac 30222874  T
Q  479 catgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    | |||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  30222875 cgtgacccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcagattcgaaga 30222928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 268 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26076642 - 26076480
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct- 366  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| ||  ||||  ||     
T  26076642 aagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacagtgattatcccaagaacaggctaccctgacta 26076543  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 429  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26076542 aaaatatgagcaaccatgtttgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaa 26076480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 577 - 782
Target Start/End: Original strand, 30222934 - 30223139
Alignment:
Q  577 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 676  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||||||  |||    
T  30222934 agtaaagctactgtctccctctccaaaactgtcaaattcgcttgctgcaaattcgtttgagcccgaataaattgcccatggaagtctctaacacaacacg 30223033  T
Q  677 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcac 776  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||   | ||||  ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  30223034 caaaagatgtaatatggttacagtcatggaacgcgacgtccatgttgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcccaaacagagttgttaccttgcac 30223133  T
Q  777 tgtatt 782  Q
    | ||||    
T  30223134 tctatt 30223139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 37448251 - 37448083
Alignment:
Q  503 gcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaa 602  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | | |||||||||||||  | |||||||| |||    
T  37448251 gcactagagtagttgaattgaactcgaagacaacccggttccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctaccgcctcccctttcaa 37448152  T
Q  603 aactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 671  Q
     |||||||| |||||  |||||||||| | ||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37448151 cactgtcatgtttgcacgctgccattttgtttgagtccgaatacattgtccacgagagtctctaacaca 37448083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 466
Target Start/End: Original strand, 31908221 - 31908420
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||   || ||    ||| | ||    
T  31908221 accaaaacagatttaattattatcatcaattaaccaatgtttaatacaagaaggataaaaa---aaaatacgatgactagactaaaaatcgaccgtctta 31908317  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
      |||||||||| |||||||||| | || ||  ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  31908318 attaaagtatgagcaaccatgtttgtttatcgactaacaaacttcatctcaaagttgaaatgtgaagataactgataaataatattataaacaatagcat 31908417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 26296428 - 26296365
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26296428 aagcaaatttaactattatcattaatcaaacaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa 26296365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 694 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16074671 - 16074598
Alignment:
Q  694 ttacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 767  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16074671 ttacgttcatggaacgcggcatccacattgcactttgaccacgtctcgcacggtttctcctaaactaagttgtt 16074598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 714 - 771
Target Start/End: Original strand, 34653864 - 34653921
Alignment:
Q  714 atccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcct 771  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34653864 atccacattgcacttcaaccacgtctcgtgcggtttctcccaaacttagttgttgcct 34653921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Original strand, 3308174 - 3308234
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3308174 caaagttaactattatcattaatcgatcaatgttcaatacaagaaggagaaaaataaaaaa 3308234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40018966 - 40018906
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacgg 336  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40018966 ttaactattatcattaatcaattaatgtttaatataaaaaggataataataaaaaatacgg 40018906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 339
Target Start/End: Original strand, 2872262 - 2872336
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaat------gttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtga 339  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2872262 caaagttaactattatcattaatcaaccaatggcaatgttcaatacaagaaggataaaaatcaaaaatacggtga 2872336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 699
Target Start/End: Original strand, 42989243 - 42989454
Alignment:
Q  488 gagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctag 587  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| || |||||| | | ||||||||   |      
T  42989243 gagacgataaagtttgcattagagtagttgagacggacacgaagataactcgattgcatctgttcacatcatcatagtgaatgacatcgagtaatattcc 42989342  T
Q  588 tgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgta 687  Q
    || || ||| | ||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||   ||||  |||||||||  ||  ||||||||| || |    
T  42989343 tgcctaccccttcaaagttgtcatatttgtctgctgctatttcgcttgagccggaataaattagtcacggaagtctctaaaccaacacgcaaaagatgaa 42989442  T
Q  688 atatgattacga 699  Q
    ||||| ||||||    
T  42989443 atatggttacga 42989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23083688 - 23083639
Alignment:
Q  281 tattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaa 330  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23083688 tattatcattaatcaatcaatattcaatacaagaaggataaaaataaaaa 23083639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 276 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 21321883 - 21321371
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21321883 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatga 21321784  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaa-acaatagcatagaattctgaa 474  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||    
T  21321783 gcaaccatgatcgcttgtctcttaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagctaactgataaataatattggaacacaataacatagaattctgaa 21321684  T
Q  475 tcaccatgaccttgagacgatagagc--ttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggc 572  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  21321683 tcaccatgaccctgagacaatagagcaattgcactagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagaaaagtgaagggc 21321584  T
Q  573 ctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacag 672  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||     
T  21321583 ctcgagtaaggctattgtctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaatttcccgcgagagtctctaatacaa 21321484  T
Q  673 tacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcctt 772  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  21321483 catgcaaaagttgtaatatggttacggtcatggaacgcaacatccacattgcacttcaaccacgtttcgctcgatttctcccaaactgtgttgttgcctt 21321384  T
Q  773 gcactgtattatg 785  Q
    ||||| |||||||    
T  21321383 gcactctattatg 21321371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 276 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 49951666 - 49951151
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49951666 ttaactattatcattaatcaactaatgttcaatacaataaggataagaataaaaaatacaatgactagcccaagaacaggccgccctagctaaagtatga 49951567  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49951566 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattctgaat 49951467  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctc 575  Q
    ||||| | ||   ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49951466 caccacggcccgaagatgataaagcttgcactagagtagacgagtcggactcgaagacaactcggttccatctgttcgcatcagcaaagtgaagggcctc 49951367  T
Q  576 gagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtac 675  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||| |     
T  49951366 gagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattggccgcgagaatctctaacacagcat 49951267  T
Q  676 gcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgca 775  Q
    ||||||| ||||||||| || || |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  49951266 gcaaaagatgtaatatggttgcggtcatggaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctccaaaactgagttgttaccttgca 49951167  T
Q  776 ctgtattatgtctgtg 791  Q
    || ||||||| |||||    
T  49951166 ctctattatgcctgtg 49951151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 269 - 790
Target Start/End: Original strand, 18441974 - 18442493
Alignment:
Q  269 agcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaa 368  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  18441974 agcaaaattaactattatcaataatgaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaa 18442073  T
Q  369 agtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 468  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18442074 aatatgagcaaccattttcgtttgtctcataacaaacttcaccttgaagttggaatataaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaat 18442173  T
Q  469 tctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaa 568  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||| || ||||||| |    
T  18442174 tctgaatcaccatgggccaaagacgatatagcttgcact--agtagatgagtcgcactcgaaaataacccggttccatctgttcgcaacagcaaagtgta 18442271  T
Q  569 gggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaac 668  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  18442272 gggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatattttcccgcttccatttcgtttgagcccgaataaattgcccatgggagtctctaac 18442371  T
Q  669 acagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttg 768  Q
    |||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  18442372 acaacacgcaaaagttgtaatatggttgcggtcatggaacgcgacatccgcattgcacttcaaccacgtctcgctcggtttctcccaaacagagttgtta 18442471  T
Q  769 ccttgcactgtattatgtctgt 790  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  18442472 ccttgcactctattttgtctgt 18442493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 264 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 2065218 - 2064695
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||  |||||    
T  2065218 accaaaacaaagttaattattatcatcaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgctacccta 2065119  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2065118 gctaaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttgaaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcat 2065019  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||   |||||| ||| ||||| ||||    
T  2065018 ataatttcgaatcaccatgacctggagacgatagagcttgggctagagtagatgagtccgactcaaagacaacccgactccatctgttctcatcagcaaa 2064919  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  2064918 gtgaagggcgtcgagtaaggctactgcctcccccttcaatactgtcatatttgcccgctgtcattttgtttgagcccgaataaattatccgcgggagtct 2064819  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  ||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  2064818 ctaacacaacacgcagaggatgtaatatggttacggtcatggaacgtggcgtccacattgcacttcaaccacgactcgctcagtttctcccaaactgagt 2064719  T
Q  764 tgttgccttgcactgtattatgtc 787  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||    
T  2064718 tgttaccttgcactctattttgtc 2064695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 276 - 777
Target Start/End: Original strand, 28537617 - 28538120
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa--tacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag--t 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |   |    
T  28537617 ttaactattatcattaatcaaccaatattcaatataagaaggataagaataaaaaaaatatggtgactagtccaaggacaggccgccctagctatatact 28537716  T
Q  372 atgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattct 471  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28537717 atgagcaaccatgttcgcttgtcttctaccaaacttcacctcgaagttggaatgtaatgataactgattaataatactagaaacaatagcatagaatttt 28537816  T
Q  472 gaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaaggg 571  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28537817 gaatcaccatggcccagagacgatagagcttgcactaaagtagatgagtcggacttgaacacaacccggtcccatctgttcgcatcaacaaagtgaaggg 28537916  T
Q  572 cctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 671  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||  | ||||||||||||||    
T  28537917 cctcgagtaaggctactgcctccccctc--aaactatcatattttcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgtgggagtctctaacaca 28538014  T
Q  672 gtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcct 771  Q
      ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  28538015 acacgcaaaatatgtaatatggttacgatcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccacgtctcgttcggtttctcccaaactgaattgttacct 28538114  T
Q  772 tgcact 777  Q
    ||||||    
T  28538115 tgcact 28538120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 264 - 776
Target Start/End: Original strand, 51734794 - 51735305
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  51734794 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaggataagaatcaaagatacggtaattagcccaagaacaggccgcccta 51734893  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  51734894 gctaaagtatgagcaaccatgttcacttgtcacctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacagataaataatactagaaacaatatcat 51734993  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    |||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  51734994 agaattatgaatcaccatggtccagagacgatagagcttgcactagagtagaggagcctgactcgaagacaactc-gtcctatctattcacatcagcaaa 51735092  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||| ||||||| || |||  |||||    
T  51735093 gtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcacgctgtcatttcgtttaagcccgaataaattgtcaacggaagtct 51735192  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  || |||||| ||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  51735193 ctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacaatcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcgctcggtttcgcccaaactgaga 51735292  T
Q  764 tgttgccttgcac 776  Q
    |||| | ||||||    
T  51735293 tgttacattgcac 51735305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 271 - 757
Target Start/End: Original strand, 41835141 - 41835626
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||  |||||||| ||||||||| |||||     
T  41835141 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgt-caatacaagaaagataagaataaaaaatatagtgactagcccaagaacaggccgccctatctaaac 41835239  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41835240 tatgaggaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcataggattc 41835339  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
     ||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||||    
T  41835340 cgaatcaccatggcccggagacgatagcgtttgcactagagtagatgaatcgaactcgaagacaacccggtcccatctgtttgcatccgcaaaatgaagg 41835439  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  41835440 gtctcgagtaaggctactgcatccccctccaaaactgtcatatttgccagctgtcattttgtttgagcccgaataaattgtctgcgagagtctctaacac 41835539  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaa 757  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41835540 aacacgcaaaagttgtaatatggttacgttcaaggaacgtggcatccacattgcacttcaaccacgtctcgctcgatttctcccaaa 41835626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 284 - 767
Target Start/End: Original strand, 37245694 - 37246177
Alignment:
Q  284 tatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccat 383  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37245694 tatcattaatcaactaatgtgcaatacaagaaggataagagttaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaaccat 37245793  T
Q  384 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatga 483  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37245794 gttcgattgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgg 37245893  T
Q  484 ccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaagg 583  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||  || ||||||||||    
T  37245894 cccagagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgaagacaacccggtcccatctgttcacataagcaaagtgaatagcatcgagtaagg 37245993  T
Q  584 ctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagt 683  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||  | ||| | |     
T  37245994 ctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgtgcccgaataaatttccctcgggagtctctaacacaacatgcagagga 37246093  T
Q  684 tgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 767  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37246094 tgtaagacgattacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 37246177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 276 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 55735368 - 55734848
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||||    
T  55735368 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgagaattaaaaatatggtgattagatcaaaaacagaccgccctagctaaactatga 55735269  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgt------ctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaatt 469  Q
     ||||||| || ||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55735268 gcaaccatatttgcttgtagttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgaaatgttaagataactgatcaataatactagaaacaatagcatagaatt 55735169  T
Q  470 ctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaag 569  Q
    |||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  55735168 ctgaatcaccatggtccgaagacgatagagcttgcactagagtagatgaatcggactcgaaaataacccggttccatgtgttcgcaacaacaaagtgaag 55735069  T
Q  570 ggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaaca 669  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| | |||||   || | ||||||||||||    
T  55735068 ggcctcgagtaaggctactgcctccccctccaatactgtcatatttgctcgcttccatttcgtttgagcccgaacaaattgctcatgggagtctctaaca 55734969  T
Q  670 cagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgc 769  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  55734968 caacacgcaaaagatgtaatatggttgagatcatggagcgcgacatccacattgcacttcaaccacatctcgctcggtttctcccaaaccgagttgttac 55734869  T
Q  770 cttgcactgtattatgtctgt 790  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  55734868 cttgcactctattttgtctgt 55734848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 266 - 782
Target Start/End: Original strand, 32576872 - 32577386
Alignment:
Q  266 caaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagc 365  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||  |||||||| || ||||||||    
T  32576872 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaaacaaaaatacagtgactagcccaagaacaggctgccctagc 32576971  T
Q  366 taaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 465  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  32576972 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatcgcatag 32577071  T
Q  466 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 565  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| | ||||||| | ||  ||||| ||||||    
T  32577072 aattctgaatcaccatgtcccgctgacgattgagcttgcactagagtagcagagtcagactcgaagacaacccagtcccatatgtttacatcagcaaagt 32577171  T
Q  566 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 665  Q
     ||  ||  ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || || || || |||||    
T  32577172 aaatagcagcgagtaaggctagtacctccccctccaaaacagtcatatttgcccgttgccatttcgtttgagcccgaataaa-ttgccccgggaatctct 32577270  T
Q  666 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttg 765  Q
    ||||||  ||||||||| ||||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32577271 aacacaacacgcaaaagatgtaagatggttaaggtcatggaacgcagcatccacattgcacttcaaccatgtctc-ctcggtttctcccaaactgagttg 32577369  T
Q  766 ttgccttgcactgtatt 782  Q
    || ||||||||| ||||    
T  32577370 ttaccttgcactatatt 32577386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Original strand, 51259351 - 51259870
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| || | |||||||||    
T  51259351 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagttttcaatacaaaaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaaaaataggccgcccta 51259450  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51259451 gctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaataacat 51259550  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| | ||  || || || ||||    
T  51259551 aaaattctgaatcaccatggcccgaagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacctggtccgaactgatcccaacagcaaa 51259650  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtct-ccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtc 662  Q
    ||||| | | ||||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  51259651 gtgaatgacatcgagtaaggcaactgcctcccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgccatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgagagtc 51259750  T
Q  663 tctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaag 762  Q
    |||||||||  |  | |||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  51259751 tctaacacaacatacgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacgcggcatccacattgcagttcaaccacgtctcacgcggtttctcccaaactgag 51259850  T
Q  763 ttgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||||  |||||||| ||||    
T  51259851 ttgttagcttgcactctatt 51259870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 264 - 785
Target Start/End: Original strand, 29655488 - 29656008
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||| | |||||||    
T  29655488 accaaagcagagttaactattattattaatcaatcaatgttcaataaaagaatgataagaataaaaaatgcggtgattagccaaagaacaggtcgcccta 29655587  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  29655588 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagtggaaatgtaaagatagctgataaataatactagaaacaataacat 29655687  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  29655688 agaattctgaatcaccatggcccgaagatgatagagcttgcactagagtagcgtagtcagactcgaagacaacacggttccatctgttcacatcagcaaa 29655787  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| | | ||||||||||||| || ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| ||| ||    
T  29655788 gtgaatgacatcgagtaaggctactgcctctccctccaaaacagtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgcccacgggagcct 29655887  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  |  |||||| ||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||     
T  29655888 ctaacacaaca-acaaaagatgtaagagggttacgatcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccatgtctcactcggtttcttccaaactgaga 29655986  T
Q  764 tgttgccttgcactgtattatg 785  Q
    | || ||||||| | |||||||    
T  29655987 tattaccttgcattctattatg 29656008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 281 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 56065981 - 56065476
Alignment:
Q  281 tattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaac 380  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||  | | ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  56065981 tattatcattaatcaatcagtgtttaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaac 56065882  T
Q  381 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc----tgaatc 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    | ||||    
T  56065881 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatc 56065782  T
Q  477 accatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcg 576  Q
    ||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||    
T  56065781 accatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcg 56065682  T
Q  577 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 676  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| |||  |||    
T  56065681 agtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacg 56065582  T
Q  677 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcac 776  Q
    | |||| ||||||||| | ||| ||||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  56065581 cgaaagatgtaatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtctcacacagtttctcccaaactgagttgttagcttgcac 56065482  T
Q  777 tgtatt 782  Q
    | ||||    
T  56065481 tctatt 56065476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Original strand, 49119222 - 49119727
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||  ||||| || ||| || ||    
T  49119222 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccacctta 49119321  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49119322 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcat 49119421  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | |||||| ||| |||||| ||    |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  49119422 ataattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaa 49119521  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    |||||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |              || |||    
T  49119522 gtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccgaa-------------ggaatct 49119608  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||    
T  49119609 ctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcgcttggtttatcccaaactgggt 49119708  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||| |||| |||| ||||    
T  49119709 tgttaccttacactctatt 49119727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 264 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 28426548 - 28426066
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||  ||||| || ||| || ||    
T  28426548 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgtttaatacaagaaggataagaattaaaaatacagtgactagcccaagagcaggccacctta 28426449  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28426448 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttctcctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatcgcat 28426349  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | |||||| ||| |||||| ||    |||||||||||| |||||||||||   ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  28426348 ataattctaaattaccatgtcccgctgacgatagagctggcactagagtatcagagtcagacttgaagacaacccggtcccatctgtttacatcagcaaa 28426249  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    |||||  ||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |              || |||    
T  28426248 gtgaatagcagcgagtaaggctactgcctccccctccaaaacagtcatatttgcctgttgccatttcgtttgagcccgaa-------------ggaatct 28426162  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||||||||  || |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  28426161 ctaacacaacacacaaaagatgtaagatggttacggtcatggaacgcggcatccacattgcacttcagccatgtctcgcttggtttatcccaaact 28426066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 276 - 785
Target Start/End: Original strand, 43840159 - 43840650
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||    
T  43840159 ttaactattatcgttaatcaaataattttcaatacatgaaagataagaataaaaaatacgatgattaattcaagaacagactgccctagttaaagtatga 43840258  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43840259 acaaccatgttcgtttgtttcctaaccaacttcactttaaagttggaat-------------------aatactagaaacaatagcatagaattccgaat 43840339  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctc 575  Q
    |||||||  |   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  43840340 caccatggtccgaagacgatagagcttgcattagagtagctgagtcgaactcgaagacaaaccggtctcatttgttcacatcagcaaagtgaatggcatc 43840439  T
Q  576 gagtaaggctagt-gtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagta 674  Q
    |||||| | | || |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  43840440 gagtaaaggttgttgtctccccctccaacactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgaccccgaataaattgtccacgggagtctctaacacaaaa 43840539  T
Q  675 cgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgc 774  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| | |||| |||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43840540 cgcaaaagatgtaagatggttatgctcatagaacgcggcatccacgttgaacttcaaccacgtctcgtgcggtctctcccaaactaagttgttgtcttgc 43840639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 276 - 595
Target Start/End: Original strand, 26422436 - 26422755
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| | |||||| ||| ||||||||||    
T  26422436 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataggccgccgtagttaaagtatga 26422535  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26422536 gcaaccatgtttgtctgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactaaaaacaatcgcatagaattctgaat 26422635  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctc 575  Q
    ||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||  ||||| |||||| ||  || ||    
T  26422636 cactatgtcccgctgacgatagagcttgcactagagtatcagagtcagactcgaagacaacccgatcccatctgtttacatcagcaaagtaaatagcatc 26422735  T
Q  576 gagtaaggctagtgtctccc 595  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  26422736 gagtaaggctactgcctccc 26422755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 271 - 597
Target Start/End: Original strand, 44935911 - 44936237
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||| |||| | ||||||||     
T  44935911 caaagttaactattatcattaatcaatcaatattcaatacaagaaggataaaaaaaaaaaatacggtgactaacccaagaacatgccgtcatagctaaac 44936010  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44936011 tatgagcaaccatgttcgcttgtctgctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataataatagaaacaataacatagaattc 44936110  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
    | ||||||| || ||   | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |  ||||| || |||| | |||||| ||||    
T  44936111 taaatcaccgtggcccgaaaacgatagagtttgcactagagtaaatgagtcggactcgaacacaacccaatttcatctgtttgcattagcaaagtaaagg 44936210  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctcccct 597  Q
      |||||||||||||| || |||||||    
T  44936211 atctcgagtaaggctattgcctcccct 44936237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 276 - 605
Target Start/End: Original strand, 47226166 - 47226493
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||| ||   ||| |    
T  47226166 ttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaaaaaagataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaaaatgtcgccctagttac--tataa 47226263  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     ||| |||||| ||||||| |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47226264 gcaatcatgtttgcttgtcgcctaacattcttcactttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcatataaatctgaat 47226363  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctc 575  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  47226364 caccatggcctgaagacgatagagcttgctctaaagtagatgagtcggactcgaacacaactcgatctcatctgttcgcatcagcaaagtgaaaagcctc 47226463  T
Q  576 gagtaaggctagtgtctccccttccaaaac 605  Q
    ||||||| ||| |  |||||| ||||||||    
T  47226464 gagtaagactattacctccccctccaaaac 47226493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 276 - 532
Target Start/End: Original strand, 24989768 - 24990023
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||   | |||||| |||||||| |    
T  24989768 ttaactattatcattaatcaatcaatgttcaatacaaaaagaataagaataaaaagtacggtgattagctcaaaaacatatcaccctagataaagtataa 24989867  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  24989868 gcaaccgtgttcgtttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaac-ataacatagaattttgaat 24989966  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    |||| || ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24989967 caccgtggcccagagacggtagagcttgcactagagtagctgagtcagactcaaaga 24990023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 278 - 481
Target Start/End: Original strand, 8754299 - 8754502
Alignment:
Q  278 aactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaac 377  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||    |||||||  |||| ||| |||||||| || |    
T  8754299 aactattatcattaatcaaataatgttgaatacaagaaaaataagaataaaaaatacggtgactatccaaagaacagaccgctctatctaaagtacgagc 8754398  T
Q  378 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 477  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  8754399 aaccatgttcgcttgtctcataacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagtatagaattccaaatca 8754498  T
Q  478 ccat 481  Q
    ||||    
T  8754499 ccat 8754502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 284 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23095559 - 23095405
Alignment:
Q  284 tatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccat 383  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| |||  |||||||| ||| ||||||||||| |||||  || |||    
T  23095559 tatcattaatcaactaatgtgcaatacaaaaatgataagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacaggccaccctagctaaaatatgagtaatcat 23095460  T
Q  384 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23095459 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactga 23095405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Original strand, 6753941 - 6754051
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| || ||    
T  6753941 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactag-ccaagaacaggccacctta 6754039  T
Q  364 gctaaagtatga 375  Q
    ||||||||||||    
T  6754040 gctaaagtatga 6754051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 264 - 370
Target Start/End: Original strand, 10575271 - 10575377
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| |||| |||||||||    
T  10575271 accaaagcaaagttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatatggtgactagcccaaaaacaggccgcccta 10575370  T
Q  364 gctaaag 370  Q
    |||||||    
T  10575371 gctaaag 10575377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 3347470 - 3347351
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||  || |||| || |||||  ||||||||    
T  3347470 accaaagcaaagttaacgattatcattaatcaactaatgtccaatataagaaatataagaataaaaaatacgaggactagtccatgaacatcccgcccta 3347371  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccat 383  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  3347370 gctaaaatatgagcaaccat 3347351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 337
Target Start/End: Original strand, 17374597 - 17374670
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggt 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  17374597 accaaagtaaatttaactattatcattaatcaactaatgttaaatacaagaatgataagaacaaaaaatacggt 17374670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 428
Target Start/End: Original strand, 51364555 - 51364710
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataat-aaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||||   |  ||||  || |  |||||||||    
T  51364555 aagcaaaattatctattatcattaatcaaccaatgttcaatacaacaacaataaaaataaaaaaatacggtga--cgcccaagggcaggttgccctagct 51364652  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaa 428  Q
    ||||||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  51364653 aaagtatgagcaacaatattcgtttgtcttctaacaaacttcac----aagttggaatgtaa 51364710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 422
Target Start/End: Original strand, 34926171 - 34926326
Alignment:
Q  267 aaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||   ||| || | | ||| ||| ||    
T  34926171 aaagtaaagttaattattatcataaatcaaccaatattcaatgcaaaaatgataagaataaaaaatacggtgattaacccaaaaataggtcgctctaact 34926270  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgga 422  Q
    ||||||||  |||| || || |||||| || | | |||||||||||| ||||||||    
T  34926271 aaagtatgggcaactatatttgcttgtttcatgaaaaacttcacctcaaagttgga 34926326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 423
Target Start/End: Original strand, 21163267 - 21163425
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || | |||||||||| ||||  |   ||||||| | ||||| ||| ||||||||| | |||| ||    
T  21163267 accaaagcaaacttaactgatatcattaattaaaaaa-gatcaatacaaggaggacgaatctaaaaaacatggtgactaggtcaagaacatgtcgcctta 21163365  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 423  Q
    || |  |||||| ||  |||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21163366 gcaatcgtatgagcagtcatgttcgcttgacgcctgacaaacttcacctcaaagttggaa 21163425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 459
Target Start/End: Original strand, 7462588 - 7462677
Alignment:
Q  370 gtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaata 459  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||| ||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  7462588 gtatgaacaatcatgttcatttgactcttaataaacttcacttcaaaattgaaatgtaaagataactaaacaataatacaagaatcaata 7462677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 561 - 612
Target Start/End: Original strand, 24990042 - 24990093
Alignment:
Q  561 aaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcata 612  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24990042 aaagtgaatgacatcgagtaaggctactgtctccacttccaaaactgtcata 24990093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 40727222 - 40727169
Alignment:
Q  370 gtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 423  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40727222 gtatgagcaactatgctcgcttgacgcctaacaaacttcacctcaaagttggaa 40727169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 267 - 767
Target Start/End: Original strand, 15605819 - 15606319
Alignment:
Q  267 aaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagct 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  15605819 aaagcaaaattaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataataaatatggtgactagcccaagaataagccgccctagct 15605918  T
Q  367 aaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcataga 466  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  15605919 aaagcatgagcaaccatgttcgcttgtctgctaacaaaattcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagt 15606018  T
Q  467 attctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtg 566  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  15606019 gttctgaatcaccatgacctagagacgatagagcttgcactagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatttgttcccatcaacaaagtg 15606118  T
Q  567 aagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctcta 666  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||    
T  15606119 aatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatgttttcccgctgccattttgtttgagcccgaataagttgcccatgggagtctcta 15606218  T
Q  667 acacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgt 766  Q
    |||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| || || |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  15606219 acacaacacgaaaaagatgtaatatggttacgatcgtgaaatgcggcatccacattgcacttcaaccatgtctcgtgcggtttctcccaaactgagttgt 15606318  T
Q  767 t 767  Q
    |    
T  15606319 t 15606319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 288 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 14680503 - 14680003
Alignment:
Q  288 attaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttc 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14680503 attaatcaaccaatgttcaatacaagaaggatgaaaataaaaaatacggtgactagcctgagaacaggccgccctagttaaagtatgagcaaccatgttc 14680404  T
Q  388 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgacctt 487  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||      
T  14680403 gcatgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcagagaattttgaatcaccactgcccg 14680304  T
Q  488 gagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctag 587  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||| |||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||     
T  14680303 gagatgatagagcttgcaatagagtagacgagtcggaatcaaagacaactcggttccatctgtttgcatcagcagagtgaagggcctcgagtaaggctac 14680204  T
Q  588 tgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaatt---ttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagtt 684  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||  |||||||   |||||||     || || ||||||||||||||  | ||||||| |    
T  14680203 tgcctccccctccaatactgtcatattttcccgctgccatttcatttgagccataataaattgcccgccgcgggagtctctaacacaacatgcaaaagat 14680104  T
Q  685 gtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtattat 784  Q
    ||||| || || || ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  14680103 gtaatgtggttgcggtcatggaacgcggtatccacattgcacttcaaccatgtctcgctcggtttctcccaaactgagttgttaccttgcactctattat 14680004  T
Q  785 g 785  Q
    |    
T  14680003 g 14680003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 346 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28107422 - 28106986
Alignment:
Q  346 caagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataa 445  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28107422 caagaacaagttgccctagctaaagtatgagcaaccatgtttggttgtctcctaacaaactacagctcgaagttggaatgtaaagataactaataaataa 28107323  T
Q  446 tactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtccca 545  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||  | |||||    
T  28107322 tactagaaacaataacatagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagcggagttagactcgaagacaacgtgatccca 28107223  T
Q  546 tctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggata 645  Q
    |||||||  ||   ||||||||| ||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| | |||    
T  28107222 tctattcatatttgcaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatctgtccgctgccatttcgtttgagcctgaata 28107123  T
Q  646 aattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcg 745  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  || | |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||| | |    
T  28107122 aattgtccacgggagtctctaacacaacacacgaaagatgtaagatggttacgatcatggaacgtggcttcctcgttgcacttcaaccacgtctcgtttg 28107023  T
Q  746 gtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  28107022 gtttctcccaaactgagatgttaccttgcactctatt 28106986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 268 - 649
Target Start/End: Original strand, 11731495 - 11731873
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||  ||||| || || ||||||||||    
T  11731495 aagcaaagctaactattatcattaatcaacgaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatatggtgactagcccaagagcaggctgccctagcta 11731594  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaa 467  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11731595 aagtatgagcaaccatgttcgcttgcctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaatattactagaaacagtagcatagaa 11731694  T
Q  468 ttctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga 567  Q
     || ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| |||  | ||| || | ||| ||||| ||||||||    
T  11731695 ctccgaaccaccatggcccggagacaatagagcttgcactatattgaaagagtcggactcgaagacaacctgttcctatatgttctcatcagcaaagtga 11731794  T
Q  568 agggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaatt 649  Q
    || | ||||||  |||||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11731795 agagtctcgag--aggctgctgcctcccc-tccaaaactgtcatatttgcccgctgccattttgtttgagcccggataaatt 11731873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 295 - 682
Target Start/End: Original strand, 29367908 - 29368294
Alignment:
Q  295 aaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaa-gtatgaacaaccatgttcgcttgt 393  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||||   ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  29367908 aaccaacgttcaatacaagaacgataagtataaaaaatagtgtggttagcgtaagaacatgtcgccctaactaaaagtatgaataactatgttcgcttgt 29368007  T
Q  394 ctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacg 493  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||    
T  29368008 ttcctaacaaactttaccttgaagttggaaggtaaagataactgataactaatactagaagcaatagcatagaattacgaatcactatgacccggagacg 29368107  T
Q  494 atagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctc 593  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  29368108 atagagcttgcactatagtagatgagtcggactcgaaaacagttaggtcccatctattagcatcagcaaagtgaagggcctcgagtaaggatattgcctc 29368207  T
Q  594 cccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaag 682  Q
    ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  29368208 cccctccaaaactgtcatatttatccgctgccatttcttttgag--cgaataaattgtccacgagagtctcaaacacaacacgcaaaag 29368294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 301 - 519
Target Start/End: Original strand, 34104324 - 34104542
Alignment:
Q  301 tgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaa 400  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34104324 tgttcaatacgagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacatgccgccatagctaagctatgagcaaccatgtttgcttgtctcctaa 34104423  T
Q  401 caaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagc 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||| ||    
T  34104424 caaacttcacctcgaagttcgaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggtccggagacgatagcgc 34104523  T
Q  501 ttgcactagagtagatgag 519  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  34104524 ttgcactagagtagctgag 34104542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 323 - 616
Target Start/End: Original strand, 19690760 - 19691053
Alignment:
Q  323 aataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttgga 422  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||| | |||||| || |||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  19690760 aataaaaaatacagtgactagcccaagaacaggtcgcccttgcaaaaacatgagcaatcatgttcgcttgtttcctaacaaacttcacctcaaagtttaa 19690859  T
Q  423 atgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcg 522  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  19690860 atgtaaagataactgataaataatactagaaacaatgacatagaattccaaatcaccatgactcagagacgatagagcttgcactaaagtagctgagtca 19690959  T
Q  523 gactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttg 616  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | | |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19690960 gactcgaagacaactcggtcacatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgaataaggctattgcctccccttccaaaacggtcatatttg 19691053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 697
Target Start/End: Original strand, 15053032 - 15053430
Alignment:
Q  299 aatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcct 398  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    | ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||    
T  15053032 aatgtacaatataagaaggataagaattaaaaatacggtgattaacctaggaacaggctgccctagctaaagtatgagcaatcatgtttgcttgtcttct 15053131  T
Q  399 aacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgataga 498  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||     
T  15053132 aacaaacttcacctcgaaattggaatgtaaatataattgataaataatattataagcaacagcatagaattccgaatcaccatggcccgaagacgatagc 15053231  T
Q  499 gcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctcccctt 598  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||| ||| | ||| | ||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| || |||||| |    
T  15053232 gtttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaaccttgtctcattttttcacgtcagcaaggcgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccct 15053331  T
Q  599 ccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattac 697  Q
    |||| ||| |||||||| || |||| ||| | | ||||||||| ||||||| |||||   |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15053332 ccaacactatcatatttacccgctgtcatcttgtttgagcccgaataaattgtccactgaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttac 15053430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 276 - 482
Target Start/End: Original strand, 21944462 - 21944668
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||| |||||||||||    
T  21944462 ttaacaattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcacaagaacctgctgctctaactaaagtatga 21944561  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21944562 gcaacaatgatcgcttgtcttttaacaaacttcacatcgaagttggaatataaaaataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 21944661  T
Q  476 caccatg 482  Q
     ||||||    
T  21944662 taccatg 21944668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 304 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 27443258 - 27443029
Alignment:
Q  304 tcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaa 403  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||| |||  ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27443258 tcaatagaagaaggatatgaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaa 27443159  T
Q  404 acttcacctcgaagttgg---aatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagc 500  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  27443158 acttcacctcaaagttggtggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc 27443059  T
Q  501 ttgcactagagtagatgagtcggactcgaag 531  Q
     ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  27443058 -tgcactagagtagctgagtccaactcgaag 27443029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 425 - 649
Target Start/End: Original strand, 30801974 - 30802198
Alignment:
Q  425 gtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcgga 524  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |   || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  30801974 gtaaagttatctgataaataatactagaaacaataacatagaattccaagtcaccatggctcggaaacgatagagcttgcactaaagtagctgaatcgga 30802073  T
Q  525 ctcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgc 624  Q
    |||||||| |||   ||||||| | ||| ||||  |||||| || ||| || |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  30802074 ctcgaagacaacctagtcccattttttcacatctgcaaagtaaatggcatctagtaaggctactgcctcccccaccaaaactgtcatatttgcccgctgc 30802173  T
Q  625 catttcgattgagcccggataaatt 649  Q
    ||||| | || |||||| |||||||    
T  30802174 cattttgtttaagcccgaataaatt 30802198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3100525 - 3100415
Alignment:
Q  346 caagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt-aaagataactgaaaaata 444  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3100525 caagaacataccaccctagctaaagtatgatca----tgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcaaagttggaatgtaaaagataactgataaata 3100430  T
Q  445 atactagaaacaata 459  Q
    |||||| ||||||||    
T  3100429 atactataaacaata 3100415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 331
Target Start/End: Original strand, 19690332 - 19690392
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaa 331  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19690332 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaa 19690392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3101332 - 3101270
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtga 339  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3101332 ttaactattatcattaatcaac-aatgttcaatacaacaaggataagaataaaaaatacggtga 3101270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 713 - 782
Target Start/End: Original strand, 11731920 - 11731989
Alignment:
Q  713 catccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtatt 782  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  11731920 catctacattgcacttccaccacgtctcgctcagtttctcccaagctgagttgttaccttgcactatatt 11731989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 351
Target Start/End: Original strand, 1992479 - 1992559
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaa 351  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||  ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1992479 caaagttaactattataattaatcaaccaatattaaatctaagaaggataagaataaaaaatatgatgactagttcaagaa 1992559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 5542650 - 5542541
Alignment:
Q  346 caagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataa 445  Q
    |||||| | ||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |  || |||| ||||||| ||| ||||  | ||||||    
T  5542650 caagaatatgccgccctagcaagtgtatgagcaaccatgttcgcttgtcgcctagcaaactttatgtcaaagtcggaatgtgaagctaacatagaaataa 5542551  T
Q  446 tactagaaac 455  Q
    || |||||||    
T  5542550 tattagaaac 5542541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 713 - 777
Target Start/End: Original strand, 19364217 - 19364280
Alignment:
Q  713 catccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcact 777  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19364217 catccacaatgcactttaaccac-tctcgctcagtttctcccaaactgagttgttaccttgcact 19364280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 268 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 53497395 - 53496902
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatc--attaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagc 365  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||||    
T  53497395 aagcaaatttaactattatctcattaatcaagcaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggctgccctagc 53497296  T
Q  366 taaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatag 465  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  53497295 taaagtatgagcagccatgttcgcttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataattaatactagaaacaatagcatag 53497196  T
Q  466 aattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagt 565  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  53497195 aattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcacaagagtagatgagtcggactcgaagacaacccggtcccatctgttagcatcagcaaagt 53497096  T
Q  566 gaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct 665  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||| | |||| ||||| | ||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  53497095 gaagggcctctagtaaggctactgcctccccctcaaaaactgtcacatttgtccgctgtcattttgtttgagcccgaataaattgcccacaagagtctct 53496996  T
Q  666 aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  53496995 aacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacggtcatggaacgcggcgtccacattgcactttaaccatgactcggtcggtttctcccaaact 53496902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 264 - 772
Target Start/End: Original strand, 42340099 - 42340606
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||    
T  42340099 accagagcaaatttaactattatcatttatcaaccaatcttcaatacaagaaggataaaaattaaaaatacggtgactagccaaagaacaggccgcccta 42340198  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42340199 tctaaagtgtgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagatagctgataaataatattagaaacaatagcat 42340298  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||||    
T  42340299 agaattctgaatcaccatggcccggagacgacagagcttgcactaaagtagctgagtctgactcgaagacaactcggtcccatctgttcacatctgcaaa 42340398  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| | | ||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42340399 gtgaatgacatcgagtagggctattgcctccccctccaacactgtcatatctgcccgctgccattttgtttgagcccgaataaattgtccacgagagtct 42340498  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||| || |   ||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  42340499 ctaacacaacacgcaaaagatgtaagatggttgccgacatagaac-caacatccacattgcacttcaaccacgtctcgcacggtttctctcaaactgagt 42340597  T
Q  764 tgttgcctt 772  Q
    |||||||||    
T  42340598 tgttgcctt 42340606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 264 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 55199876 - 55199358
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||  |||||||| |||||| ||    
T  55199876 accaaagcaaagttaacgattatcattaatcaactagtgatcagtacaagaaggataagaataaaaaatatggtcactagcgcaagaacaggccgccgta 55199777  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55199776 gctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagatgactgaaaaataatactagaaacaatagcat 55199677  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  || |||||||    
T  55199676 aaaattccgaatcaccatgacccgtagacgatagcgcttgcaccagagtagctgagtcggacttgaagacaacccggtcccatctgtttccaacaacaaa 55199577  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  55199576 gtgaatggcatcgagtaaggcaactgcctccccctccaaaactgtcatatttatcagctgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtct 55199477  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||    
T  55199476 ctaacacaacacgcgaaagatgtaatatattgacggtcatgaaacgtggcatccacattgcacgtcaaccacatctcacgcggtttctcccaaactgagt 55199377  T
Q  764 tgttgccttgcactgtatt 782  Q
    ||||  |||||||| ||||    
T  55199376 tgttagcttgcactttatt 55199358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 264 - 532
Target Start/End: Original strand, 27608725 - 27608993
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||    
T  27608725 accaaagcaaagttaactattatcattaattaaccagtattcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgctcta 27608824  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608825 gctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcagctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 27608924  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    | ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27608925 aaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 27608993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 264 - 532
Target Start/End: Original strand, 34497194 - 34497462
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  34497194 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccagtgttcaatacatgaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgcccta 34497293  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34497294 gctaagctatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaggaacaatagcat 34497393  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    | ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34497394 aaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaaga 34497462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 264 - 585
Target Start/End: Original strand, 646992 - 647306
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  646992 accaaatcaaaattaactattattattaatcaaccaatgttcaatacaagaaagataaaattcaaaaatacggtgattagtccaagaacaggccgcccta 647091  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| | |||    
T  647092 actaaagtatgagcaaccatgttcgtttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaagataactg-------atactataaacaacaacat 647184  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    
T  647185 agaattccgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcagactcgaagataactcggtcacatctgttcacatcagcaaa 647284  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggct 585  Q
    ||||| | | ||||||||||||    
T  647285 gtgaatgacatcgagtaaggct 647306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 278 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 2615834 - 2615363
Alignment:
Q  278 aactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaac 377  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||| |||  |||||||| | |||||||| |||||||||| |    
T  2615834 aactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaacgcttaaaataaaaattacggtgactagcccaagaacaggtcgccctagttaaagtatgagc 2615735  T
Q  378 aaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatca 477  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2615734 aaccatgttcgtttgtctcctaacaaacttcatctcgaggttggaatgtaaaaataactgataaataatactaaaaacaatatcatagaattctgaatca 2615635  T
Q  478 ccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcga 577  Q
    ||||| |    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||| |||           | ||| ||||| ||||||||| | | ||||    
T  2615634 ccatggcacaaagacgatagagctcgcactagagtagttgagtcggattgaaagacaac----------attttcccatcagcaaagtgaacgacatcga 2615545  T
Q  578 gtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgc 677  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||  |||| | || ||||||||||   | |    
T  2615544 gtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgcccgctgccaattcgtttgagcccgaatgaattgcccacaaaagcctctaacacaacgcac 2615445  T
Q  678 aaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||||  ||||||||| ||| ||||||| ||||  | |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  2615444 aaaaaatgtaatatggttatgatcatgaaacgcggtatccacattgcatttcaaccacgtcttgcacgatttctcccaaact 2615363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 329 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 46007599 - 46007163
Alignment:
Q  329 aaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaa 428  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||| |||   || || ||||||||    
T  46007599 aaatacggtgattagcttaagaagatgccgccctagttaaagtatgagcaatcatgttcatttgtcttctaacaaactttaccctaaaattagaatgtaa 46007500  T
Q  429 agataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcg 528  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46007499 aaataactgataaataatgctagaaacaatagcataaaattccgaatcgccatggcccggagacgatatagtttgcactagagtagttgaatcggactcg 46007400  T
Q  529 aagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatt 628  Q
    ||||  || ||  ||||||| |||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| |  |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  46007399 aaga-cacccg--cccatctgttcatatcgacaaagtgaatggcatcaagtaaggctactgtctccccctaaaaaattgtcgtatttgcccgctgccatt 46007303  T
Q  629 tcgattgagcccggataaattttccacgagagtctct-aacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcact 727  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| | ||| ||| |||| || |||||||   ||||||||||||||||    
T  46007302 tcgtttgagcccgaataaattttccacgagagtctctaaacaaaacacgcaaaagatataagatggttacaataatggaacacggcatccacattgcact 46007203  T
Q  728 tcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 767  Q
    ||| ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  46007202 tcaaccacgtctcgctttgtttttcccaaactgagttgtt 46007163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 271 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 2121439 - 2121129
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||   ||||||||  |||||||| ||||||    
T  2121439 caaaattaactattatcatcaatcaaccaatgtgcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtaactaacccaagaacagaccgccctaactaaag 2121340  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  2121339 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaactttacctcgaagttgagatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcacaaaatta 2121240  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
    ||||| | |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | ||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| |    
T  2121239 tgaataatcatggcctagagacaatagagcttgcattagagtagttaagtcggactcaaaaacaacacgatcccatctattcatatcagcaaagtgaatg 2121140  T
Q  571 gcctcgagtaa 581  Q
     | ||||||||    
T  2121139 acatcgagtaa 2121129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 264 - 542
Target Start/End: Original strand, 31341547 - 31341829
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||  || ||||||    
T  31341547 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcccaagaaccggctgcccta 31341646  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
     |||| |||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  31341647 actaaggtatgagcaaccatgtcagtttgtctcctaataaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatagtat 31341746  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagac----gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtc 542  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||    
T  31341747 aaaattctgaatcaccatgacccggagacgtaggatagagcttgcactagagtagtggagtcagattcgaagataacccggtc 31341829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 281 - 616
Target Start/End: Original strand, 11020020 - 11020354
Alignment:
Q  281 tattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaac 380  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||  |||| | | |  | |||||||||| |||||  |||    
T  11020020 tattatcattaatcaattaatgttcaatacaagaag-ataagaataaaaaatacagtgactagcccaaggataggttgtcctagctaaaatatgattaac 11020118  T
Q  381 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcacca 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11020119 catgttcgcttgtctccaaacaaacttcacatcgaggttgaaatgtaaagataattgataaataatactagaaacaatagcacagaattctgaatcacca 11020218  T
Q  481 tgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagta 580  Q
    || ||  ||||||||||| ||| |||| |||||| | |||| |||||||||| ||| | || |||| | ||| ||||| |||||| ||  || |||||||    
T  11020219 tggcccggagacgatagaccttacactggagtagttaagtcagactcgaagacaacccagttccatttgttcccatcagcaaagtaaatagcatcgagta 11020318  T
Q  581 aggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttg 616  Q
    | |||  ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  11020319 aagctgatgtctccccctccaaaagtgtcatatttg 11020354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 264 - 506
Target Start/End: Original strand, 19117542 - 19117784
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||| |||| ||||    
T  19117542 accaaagcaaagttaactattatcatcaatcaaccagtgttcaatacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactagcctaagaacaggccgaccta 19117641  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19117642 gctaagctatgagcaactatgttcgactgtctcctaacaaacttcacctcaaatttggaatgcaaaaataactgaaaaataatactaaaaacaatagcat 19117741  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcac 506  Q
    | ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  19117742 aaaattccgaatcaccatggcccggagacgatagcgcttgcac 19117784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 266 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26047051 - 26046864
Alignment:
Q  266 caaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagc 365  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  26047051 caaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatatttaatataagaaggataagaattaaaaatacggtgactagcccaagaataagccgccctagc 26046952  T
Q  366 taaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaa 453  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26046951 taaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacgtcacctcaaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaa 26046864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 264 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 55213690 - 55213483
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||  |||||||  |||||||||    
T  55213690 accaaagcaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaagaataagaataaaaaatacagtgactagcccaagaaccggccgcccta 55213591  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  55213590 gttaaagtataagcaaccatgttcgcttttctcctaacaaatttcacctcgaagttggaacgtaaagataactgatatataataccaaaaacaatagcat 55213491  T
Q  464 agaattct 471  Q
    ||||||||    
T  55213490 agaattct 55213483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 264 - 508
Target Start/End: Original strand, 27747508 - 27747751
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcc--- 360  Q
    |||| |||||| |||||||||||   |||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||   |||||| |  ||| |       
T  27747508 accagagcaaagttaactattat---taatcaaccactgttgagtacaagaaggataagaatcaaaaatacggtgactacc-caagaatagaccgtcaac 27747603  T
Q  361 ctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatag 460  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27747604 ctagataaagtatgagcaactatgttcgcttgtctcttaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactaaaaacaatag 27747703  T
Q  461 catagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcacta 508  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||    
T  27747704 catagaattttgaatcaccatggcccggagacgataaagcctgcacta 27747751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 268 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 48227729 - 48227566
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagcta 367  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||   |||||||||| |||||||||||    
T  48227729 aagcaaaattaactattatcattaatcaaccattgttcaatacaagaaagataaaaataaaaaatatggcgaataacccaagaacaagtcgccctagcta 48227630  T
Q  368 aagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaaga 431  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48227629 aagtatgaggaaccatatttgcttgtctcctaacaaatttcacctcgaagttggaatgtaaaga 48227566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 400 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 24176999 - 24176867
Alignment:
Q  400 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24176999 acaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataacttataaataatactagatacaatagcttagaattccgaatcaccatgacccagagacgatagag 24176900  T
Q  500 cttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  24176899 cttgcactagagtagttgtgtcagactcgaaga 24176867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 493 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 48227550 - 48227305
Alignment:
Q  493 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtga-agggcctcgagtaaggctagtgtc 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||      
T  48227550 gatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcaaagacaactcggttttatccattcacatcagcaaagtgatggggtctcgagtaaggctactgca 48227451  T
Q  592 tccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatat 691  Q
    ||||  ||||| || ||||| ||| ||  ||||  ||||| || |||||| |||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  48227450 tcccactccaatacagtcatgttttcccactgctgtttcgtttaagcccgaataaattgcccgcgagagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaacat 48227351  T
Q  692 gattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgt 737  Q
    | ||||| | ||| || |  |||||||||||| |||||| ||||||    
T  48227350 ggttacggtaatgaaatgcggcatccacattgtacttcaaccacgt 48227305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 536 - 709
Target Start/End: Original strand, 647305 - 647478
Alignment:
Q  536 ctcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattg 635  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  647305 ctcggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatgacatcgagtaaggctgctgcctccccctccataactgtcatattagcccgctgccatttcgtttg 647404  T
Q  636 agcccggataaattttccacgag-agtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacg 709  Q
    |||||||| ||| || ||  ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  647405 agcccgga-aaaattgcctagagaagtctctaacacaacacgcaaaagatgtaatatggttacgctcatggaacg 647478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 264 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24181895 - 24181749
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||   |||||||| |||||||||    
T  24181895 accaaaacaaagttaactattatgattaatcaatcaatgttcaatacaacaaggataaaaattaaaaatatggtgactaacccaagaacaggccgcccta 24181796  T
Q  364 gctaaagtatg----aacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaact 406  Q
    |||||||| ||    | ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  24181795 gctaaagtgtgagtaaccaaccgtgttcatttgtctcctaacaaact 24181749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 359 - 469
Target Start/End: Original strand, 1702806 - 1702916
Alignment:
Q  359 ccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaat 458  Q
    |||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||    
T  1702806 ccctagttaaagtatgagtaatcatattcgcttgtcttctaacaaacttcaccttgaagttcgaatgtaaagataactagtaaataatactaaaaataat 1702905  T
Q  459 agcatagaatt 469  Q
    |  ||||||||    
T  1702906 aaaatagaatt 1702916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 577 - 709
Target Start/End: Original strand, 27941129 - 27941261
Alignment:
Q  577 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 676  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  27941129 agtaaggctactgcctccccctccaaaactatcatatttgtccgctgccattttgtttgagtccgaataaattgtcctcgagaatctctaatacaacacg 27941228  T
Q  677 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacg 709  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  27941229 caaaaaatataatatggttacgatcatgaaacg 27941261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 429
Target Start/End: Original strand, 49525079 - 49525181
Alignment:
Q  327 aaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgt 426  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||| |  || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  49525079 aaaaatatggtgactagtccaagaacagaccgccctagcaagggtgtgagcagccatgttcgcttgtcgcctaacaaactttacctcaaaattggaatgt 49525178  T
Q  427 aaa 429  Q
    |||    
T  49525179 aaa 49525181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 684 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 1070958 - 1070855
Alignment:
Q  684 tgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgcactgtatta 783  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| || | || |||||| || |||||    
T  1070958 tgtaagatggttacgatcatggaaggcaacatccacattgcagttcaaccatgtctcgcgcggtttctcctaaactgaggttttaccttgctctctatta 1070859  T
Q  784 tgtc 787  Q
    ||||    
T  1070858 tgtc 1070855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50037153 - 50037083
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgatta 342  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50037153 caaaattaattattatcattaatcaaccaatattcaacacaaaaag-ataaaaataaaaaatacggtgatta 50037083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1437433 - 1437383
Alignment:
Q  283 ttatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaata 333  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1437433 ttatcattaatcaagcaatgttcaatacaaaaaggataagaataaaaaata 1437383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15310921 - 15310819
Alignment:
Q  273 aatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagta 372  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||  | | || ||||| | || |||| |||||||| |||||||||| ||| |||    
T  15310921 aatttaactgatatcattaattaaacattgttcaatacatgtaggatagaactcaataatacagcgactagtccaagaacaggccgccctagttaacgta 15310822  T
Q  373 tga 375  Q
    |||    
T  15310821 tga 15310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 18720922 - 18720845
Alignment:
Q  346 caagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaa 423  Q
    |||||||| |||||| |||| |  |||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18720922 caagaacatgccgccatagcaatcgtatgagcaaccatgtgcacttgatgcctaacaaacttcacctcaaagttggaa 18720845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 264 - 791
Target Start/End: Original strand, 477878 - 478405
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||    
T  477878 accaaaacaaagttaattattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaatacggtgattagcccaagaacaggacgcccta 477977  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  477978 gctaaggtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatattagaaacaatatcat 478077  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    | ||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||    
T  478078 aaaataccgaatcaccataacccggagacgatagagcttgcactagagtagtagagtcagattcgaagataacccggtcccatctattcacattagcaaa 478177  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtct 663  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||  ||| |  | |||    
T  478178 gtgaatggcatcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgcccgttgccattttgtttgagcccggataaattgaccatggaaatct 478277  T
Q  664 ctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagt 763  Q
    ||||||||  || |||||| ||| | ||| ||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||     
T  478278 ctaacacaacacacaaaagatgttagatggttgtggtcatggaacgttgcatccacattacacttcaaccacatctcgcttggtttctcccaaattgaga 478377  T
Q  764 tgttgccttgcactgtattatgtctgtg 791  Q
    |||| ||||| ||| |||| || |||||    
T  478378 tgttaccttggactctattttgcctgtg 478405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 271 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 13415381 - 13414913
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  13415381 caaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaag 13415282  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13415281 tatgagcaaccatgttcgcttgtctcctagcaaacttcaccttgaagttggaatgtaaagataattgataaataatactaaaaacaatagcataaaattc 13415182  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
     ||||||||||| ||  | ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||  ||||  |||||    
T  13415181 agaatcaccatggcccggggacgatataccttgcactagagtagaagaatcggactcaaagacaactcgatcccatctgtttgcatccgcaaaaggaagg 13415082  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||| ||||||||| |     
T  13415081 gcctcgagtaaggctactgcctccccctccaaaactgtcatatttgtccgctgccatttcgtttgagcccgaataaattgcccgcgaaagtctctaaaaa 13414982  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtct 739  Q
    |  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  13414981 aacacacaaaagttgtaatatggttacgttcatggaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtct 13414913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 271 - 777
Target Start/End: Original strand, 40588559 - 40589050
Alignment:
Q  271 caaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40588559 caaagttaactattatcattaatcaactaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaatacggtgactagcccaagaacaggccgccctagctaaag 40588658  T
Q  371 tatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc 470  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40588659 tatgtgcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactataaacaatagcatagaattc 40588758  T
Q  471 tgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagg 570  Q
     |||||| |||| ||  | |||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||||  ||||  |||||    
T  40588759 agaatcatcatggcccggggacgatagagtttacactagagtagatgaatcagactcaaagacaacccggtctcatctgtttgcatccgcaaaacgaagg 40588858  T
Q  571 gcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacac 670  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||          | ||   ||      
T  40588859 gcctcgagtacggctactgcctccccctccaaaactgttatatttgcccgctgccatttcgtttgagcccgaataaatt----------gcctgctac-- 40588946  T
Q  671 agtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgcc 770  Q
       | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40588947 ---aagcaaaagttgttatatggttacgttcatggaacgcggcatccacgttgcacttcaaccacgtctcactcggtttctcccaaactgagttgttacc 40589043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 361 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 23854200 - 23853802
Alignment:
Q  361 ctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatag 460  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  23854200 ctagctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaagttcaccttgaagttggaatgtaaagataacggataactaatactagaaacaatag 23854101  T
Q  461 catagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaac 560  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  23854100 catagaattctgaatcaccatggcccggagacgatagagcttgcactagagttgatgagtcggactcgaagacaactcagtctcatctgttagcatcaac 23854001  T
Q  561 aaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagag 660  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||| |||| |||||||  ||||| |||    
T  23854000 aaagtgaatggcctcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatttttccgctgtcatttcgtttgaacccgaataaattgcccacgggag 23853901  T
Q  661 tctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaact 759  Q
    ||||||||| |  ||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23853900 tctctaacataacacgcaaaagatgtaatatagttacggtcatggaacgcggcgtccacatcgcacttcaaccacgtctcgttcggtttctcccaaact 23853802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 299 - 757
Target Start/End: Original strand, 8450980 - 8451438
Alignment:
Q  299 aatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcct 398  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||   ||||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8450980 aatgttccatacaagaaggataaggataaaaaatacggtgactagcctaagacagggccgccctaactagagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcnt 8451079  T
Q  399 aacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgataga 498  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  8451080 aacaaacttcacctcgaagtttgaatgtaaagataactgatanataatactagacacaataacataaaattccgaatcaccatgacctggagacgataaa 8451179  T
Q  499 gcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctcccctt 598  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||  |||||||| |||| || |||||| |    
T  8451180 gcttgcactaaagtagatgagtcagactcgaagacaacccggtcccatccgttcacatcagcgaagtgaatggaatcgagtaaagctactgcctccccct 8451279  T
Q  599 ccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacg 698  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  |  |||||| ||||| ||| |||||    
T  8451280 ccaacactgtcatatttgcccgcttcctttttgtttgagcccgaataaattgtccacaagagtctctaacacaacatccaaaagatgtaaaatggttacg 8451379  T
Q  699 atcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaa 757  Q
     ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8451380 gtcatggaacgcggcatccacattacacttcaaccacgtctcgcacggtttctcccaaa 8451438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 316 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7127536 - 7127078
Alignment:
Q  316 ggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcga 415  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7127536 ggataagaattaaaaatgcggtgactagcccaagaacagaccgccctagctaaagtatgagcaatcatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcaa 7127437  T
Q  416 agttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtaga 515  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| |||||     
T  7127436 agttggaatgtaaagataactgataaataatacttgaaacaataacatagaatactaaatcaccatggcccggagacgaaagagcttgcactaaagtagc 7127337  T
Q  516 tgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatattt 615  Q
      |||| |||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  7127336 atagtcagactcgaaggcaacccggtcccatctgttcacatcagcaaagtgaatagcatcgagtaaggctactacctccccctccaaaactttcatattt 7127237  T
Q  616 gcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcat 715  Q
    ||| | | |||||||  ||| || || |||||||| || |||||||||||||||||  | ||| | | ||||| | | ||||| ||||||||||  ||||    
T  7127236 gcccgtttccatttcatttgtgcacgaataaatttcccccgagagtctctaacacaacatgcagaggatgtaagacggttacgttcatggaacgcggcat 7127137  T
Q  716 ccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgttgccttgc 774  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7127136 ccacattccacttcaaccatgtctcgctcggcttctcccaaactaagttgttaccttgc 7127078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 284 - 671
Target Start/End: Original strand, 185435 - 185818
Alignment:
Q  284 tatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccat 383  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || | ||||| || | ||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  185435 tatcattaattaaccaatgtgcaatacaagaaggataagaattaaaaatgcggtgacta-tccaagatcaggtcgccctagctaaactatgaccaactat 185533  T
Q  384 gttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatga 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  185534 gttcgcttgtctcctaacaaactacacctcgaatgtg-aatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgg 185632  T
Q  484 ccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaagg 583  Q
     |  ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  185633 tccggagacgaaagagcttgcactaaagtagcagagtcagactcgtagacaacccggttccatctattcacatcaacaaagtgaatagtatcgagtaagg 185732  T
Q  584 ctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacaca 671  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||| |||||    
T  185733 ctacttcctcccc-tccaaaactgtcatatttgcccgtttccatttcgtttgagcccagataaatttccctcg-gagtctcttacaca 185818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 264 - 542
Target Start/End: Original strand, 598059 - 598337
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||  ||||| ||    
T  598059 accaaagcaaatttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatataagaaggataagaataaaaaatacggtgactagcctaagaacagaccgcctta 598158  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  598159 gctaaagtatgagcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaatttcaccacgaagttgaaatgtaaagataactaataaataatactagaaacaatagcat 598258  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtc 542  Q
    |||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  598259 agaacttcgaatcaccatgacctgaagacgatagagcttgcactagagtagctaagtccgacttgaagacaacccggtc 598337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 288 - 532
Target Start/End: Original strand, 33642610 - 33642854
Alignment:
Q  288 attaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttc 387  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33642610 attaatcaactaatgttcaatacaagaatgataagaataaaaaatacggtgactagcccaagaacagaccaccctagctaaagtatgaacaaccatgttc 33642709  T
Q  388 gcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgacctt 487  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||      
T  33642710 gcttgtctcctaacaaacttcgccttgaagttggaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatatcattgaattctgaatcaccatggcccg 33642809  T
Q  488 gagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaaga 532  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  33642810 gagacgacagagcttgcattagagtagatgagttggacttgaaga 33642854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 276 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 11870617 - 11870364
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  11870617 ttaactattattattaaccaacaaatgttcaatacaagtaggataagaataaaaaatatggtgattagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatga 11870518  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaat 475  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11870517 gcaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaaatccgaat 11870418  T
Q  476 caccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcga 529  Q
    ||||||| |   ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  11870417 caccatggctccgagacaatagagcttgcacaagagtagctgagtcagactcga 11870364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 312 - 577
Target Start/End: Original strand, 3606607 - 3606874
Alignment:
Q  312 agaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagc--cgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttca 409  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3606607 agaatgataagaattaaaaatacggtgactagcctaagaacaggcgtcaccctagctaaagtatgaacaaccatattcgcttgtctcctaacaaacttca 3606706  T
Q  410 cctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactag 509  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||     
T  3606707 cctcgaagttagaatgtaaagataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattccaagtcaccatgaccctgagacgatagagtttgtactaa 3606806  T
Q  510 agtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcga 577  Q
    ||| | ||||||||||| ||| | |||| ||| |||||| ||| |||||| ||| |||| ||| ||||    
T  3606807 agttgttgagtcggacttgaaaacaacttggttccatctgttcacatcaagaaattgaatggcatcga 3606874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 264 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 9497142 - 9496797
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  9497142 accaaagcaaaattaattattatcattaatcaatcaatgttcaac-cagaaaagataagaataaaaaatacggtgactagtccaagaacaggccgcccta 9497044  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcat 463  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||| || || || |||||||  ||| ||||||| |||    
T  9497043 gctaaagtataagcaactatgttcgcttgtctcctaataaacttcactctgaagttgggatgtaaatatcacagataaataatgttagcaacaataacat 9496944  T
Q  464 agaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaa 563  Q
    |||||||  | ||||||||||    ||||||||||| ||||||||   | | ||| | |||||| |||| ||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  9496943 agaattccaagtcaccatgactcgaagacgatagagattgcacta---tggctgaattggactcaaagacaacacggtcccat-agttcacatcaacaaa 9496848  T
Q  564 gtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatt 614  Q
    ||||| | | || |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||    
T  9496847 gtgaatgtcatcaagtaaggctactgcctcaccctccaaaactgtcatatt 9496797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 298 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 37712398 - 37711990
Alignment:
Q  298 caatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcc 397  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| || ||||||||||      ||||| |||||||||| || ||||||     
T  37712398 caatgttcaatataaaaaggataataataaaaaatatagtgactaattcaagagcatgccgccctag------tatgagcaaccatgtttgcatgtctct 37712305  T
Q  398 taacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatag 497  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||| ||||    
T  37712304 taacagacttcacatcgaagttagaatgtaaagataactcataaataatactagaaacaatagcatagtattctgaatcaccatgtcc-gaagacaatag 37712206  T
Q  498 agcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctcccct 597  Q
    ||||| |||||||||||  | |||  ||| |||||||||  | || ||||| ||| ||||||||||||||| |||    | ||| |||| |  |||||||    
T  37712205 agcttacactagagtagcagggtcaaactagaagataacctgatctcatctgttcacatcaacaaagtgaatggc----attaaagctactacctcccct 37712110  T
Q  598 tccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacgcaaaagttgtaatatgattac 697  Q
    | |||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||| |  |||||||  ||||  |||| |||||||||  ||||||||  ||||| || |||||    
T  37712109 t-caaaactgtcatattttcccgctgtcatttcgttttagctcaaataaattgcccacacgagtttctaacacaacacgcaaaaaatgtaagataattac 37712011  T
Q  698 gatcatggaacgtagcatcca 718  Q
      |||||| ||| | ||||||    
T  37712010 agtcatggtacgcaacatcca 37711990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 264 - 447
Target Start/End: Original strand, 36194443 - 36194626
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgcccta 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||    
T  36194443 accaaagcaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaatacaagaaggataagaattaaaaatacggtgactagctcaagaacatgtcacccta 36194542  T
Q  364 gctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataata 447  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  36194543 gctaaactatgagcaaccatgttttcttgtctcctaacaaacttcatctcgaaattgaaatataaagataatcgataaataata 36194626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 28315459 - 28315316
Alignment:
Q  276 ttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatga 375  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||  || |||||  |||||||||||||| |||||    
T  28315459 ttaactattatcattaatcaattaatgttcaatacaagaaggataaaaataaaaaa-acggcgactagcccaggaacagaccgccctagctaaaatatga 28315361  T
Q  376 acaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 420  Q
     |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28315360 gcaaccatgtttgcttatctgctaacaaacttcgcctcgaagttg 28315316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 331 - 429
Target Start/End: Original strand, 8670203 - 8670301
Alignment:
Q  331 atacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 429  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  | ||| ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  8670203 atacggtgactagtccaagaacaggccgccctagtaagagtgtgagcaaccatgtttgtttgtcgcctaacaaactttacctcaaagttgggatgtaaa 8670301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 32555140 - 32555083
Alignment:
Q  264 accaaagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataa 321  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32555140 accaaaacaaagttaactattatcattaatcaaccaatgttcaataaaagaaggataa 32555083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 370
Target Start/End: Original strand, 34707886 - 34707973
Alignment:
Q  283 ttatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaag 370  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  34707886 ttatcattaatcaatcaatgttcaatacaagaagaataagaataaaaaatacgatgactaatctaagaataggccgctctagctaaag 34707973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 468
Target Start/End: Original strand, 14264970 - 14265032
Alignment:
Q  406 ttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaat 468  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  14264970 ttcacctcgaagttggaacgtatagctaactgatcaataatacaagaaacaataacatggaat 14265032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 479 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 42899204 - 42899152
Alignment:
Q  479 catgaccttgagacgatagagcttgcact--agagtagatgagtcggactcgaa 530  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  42899204 catgaccttgagacgatagag-ttgcattggagagtagatgagtcggactcgaa 42899152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4275975 - 4275914
Alignment:
Q  359 ccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttg 420  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  4275975 ccctaactaaattatgagcaaccatactcgcttgtcgcctaataaacttcacctcaaagttg 4275914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0446 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0446
Description:

Target: scaffold0446; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 281 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 538 - 48
Alignment:
Q  281 tattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaac 380  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||  | | ||||||||||||||  ||||| ||||    
T  538 tattatcattaatcaatcagtgtttaatacaagaagaataagaataaaaaatacggtgactagcccaaatataggccgccctagctaagctatgagcaac 439  T
Q  381 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattc----tgaatc 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    | ||||    
T  438 catgttcgcttgtctcctaacaaacttcatctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatattagaaacaatagcataaaattccgaattaatc 339  T
Q  477 accatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcggactcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcg 576  Q
    ||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||| ||| |||    
T  338 accatggtctggagatgatagcgcttgcactagagtagctgagtcggactcgaagacaacccggtcccatatattcccaacagcaaagtgaatggcatcg 239  T
Q  577 agtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatatttgcctgctgccatttcgattgagcccggataaattttccacgagagtctctaacacagtacg 676  Q
    |||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| |||  |||    
T  238 agtaaggcaactgcctccccctcccaaactgtcatatttgctcgttgtcatttcgtttgagcccgaatgaattgcccacgggagtctctaaaacaacacg 139  T
Q  677 caaaagttgtaatatgattacgatcatggaacgtagcatccacattgcacttcagccacgtctcgctcggtttctcccaaactaagttgtt 767  Q
    | |||| |   ||||| | ||| ||||| |||    |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||    
T  138 cgaaagatngtatatgttgacggtcatgaaacacgacatccacattgcacttcaaccacgtctcacacagtttctcccaaactgagttgtt 48  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0922 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0922
Description:

Target: scaffold0922; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 325 - 613
Target Start/End: Original strand, 147 - 434
Alignment:
Q  325 taaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaat 424  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  147 taaaaaatacggtgactagcccaagaacaagtcgtcctagttaaagtatgagcaaccgtgttcgcttgtctcctaacaaacttcacatcgaagttggaat 246  T
Q  425 gtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagcttgcactagagtagatgagtcgga 524  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  247 gtaaggataactgataaataatactagaaacaatagcatagaattctgaattaccatgacctggagatgatagagcttgcactagagtagatgagtcgga 346  T
Q  525 ctcgaagataactcggtcccatctattcgcatcaacaaagtgaagggcctcgagtaaggctagtgtctccccttccaaaactgtcatat 613  Q
    |||||| |||| | | |||||| | || |||||| |||| | ||||||||| |  ||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  347 ctcgaaaataattggatcccatttgtttgcatcagcaaaataaagggcctccaacaaggctactacctcccc-tccaaaactgtcatat 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 304 - 531
Target Start/End: Original strand, 44103 - 44332
Alignment:
Q  304 tcaatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaa 403  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||| |||  ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44103 tcaatagaagaaggatatgaatcaaaaatacagtgactagcccaagaacagaccgccctagctaagctatgagcaaccatgttcgcttctctcctaacaa 44202  T
Q  404 acttcacctcgaagttgg---aatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaatagcatagaattctgaatcaccatgaccttgagacgatagagc 500  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  44203 acttcacctcaaagttggtggaatgtaaagataactgaaatataatactagaaacaatagcataaaattctgaatcaccatggcctagagacgatagcgc 44302  T
Q  501 ttgcactagagtagatgagtcggactcgaag 531  Q
     ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  44303 -tgcactagagtagctgagtccaactcgaag 44332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 306 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20481 - 20330
Alignment:
Q  306 aatacaagaaggataataataaaaaatacggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaac 405  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||  |||||||| |  ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  20481 aatacaagaatgataagaataaaaaatacgatgactagcccaagaacaggttgccctagctaaagtatgagtaatcatattcgcttgtctcctaacaaac 20382  T
Q  406 ttcacctcgaagttggaatgtaaagataactgaaaaataatactagaaacaa 457  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20381 ttcacctcaaagttgacatgtaaagataactgataaataatactagaaacaa 20330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 333
Target Start/End: Original strand, 26127 - 26192
Alignment:
Q  268 aagcaaatttaactattatcattaattaaccaatgttcaatacaagaaggataataataaaaaata 333  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26127 aagcaaagttaaccattatcattaatcgaacaatgttcaatacaagaaggataagaataaaaaata 26192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0252 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0252
Description:

Target: scaffold0252; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13415 - 13321
Alignment:
Q  333 acggtgattagttcaagaacaagccgccctagctaaagtatgaacaaccatgttcgcttgtctcctaacaaacttcacctcgaagttggaatgtaaa 429  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||||||||| | |||  || || |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  13415 acggtgactagcccaagaacaggccgccctagcaagagt--gagcagccatgttcgcttgtcgtctaacaaactttacctcaaagttgggatgtaaa 13321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University