View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15178_low_9 (Length: 600)

Name: NF15178_low_9
Description: NF15178
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15178_low_9
NF15178_low_9
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (1-579)||(38321037-38321615)
chr8 (1-579)||(38300292-38300870)
chr8 (17-579)||(38325787-38326349)
chr8 (1-579)||(38316942-38317520)
chr8 (1-579)||(38308939-38309517)
chr8 (4-579)||(38313533-38314106)
chr8 (1-579)||(38306211-38306767)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-576)||(38849816-38850400)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 575; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 575; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38321615 - 38321037
Alignment:
Q  1 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38321615 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaata 38321516  T
Q  101 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38321515 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgag 38321416  T
Q  201 ccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38321415 ccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttc 38321316  T
Q  301 agccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38321315 agccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgt 38321216  T
Q  401 gctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcat 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38321215 gctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacacacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcat 38321116  T
Q  501 aattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38321115 aattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 38321037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38300870 - 38300292
Alignment:
Q  1 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaata 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||    
T  38300870 acttacatcaaataggccgtcagataaagagtttaacttctcttgaaatggcatgctagaagattggtcctggataattctttgcacgcaagaaggagta 38300771  T
Q  101 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |  ||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  38300770 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttgctctttacttgttgcaacttcctttcacgtgttgatgcatcaagttttgagtaacaattag 38300671  T
Q  201 ccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttc 300  Q
    ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38300670 ccaatgttgaaagcttaatccttgggtcaagaaccgctcccattgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttggtcagcatcctttc 38300571  T
Q  301 agccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgt 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38300570 agccattctctttatatcttcatcttgatctcccaaacaatcaactaaaaggcattggactttccaaacttgcaaaaaatacaagttggaagtaggatgt 38300471  T
Q  401 gctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcat 500  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38300470 gttgtggcattaatcatgttggcagtttcactaaaaggcaacaagaacacacaaatcttttgtactcttttccactcttctaccgaaggacataacacat 38300371  T
Q  501 aattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38300370 aactatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcattgaataagttgagtt 38300292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38326349 - 38325787
Alignment:
Q  17 ccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaatacttttgctagaatact 116  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||| |||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  38326349 ccgtgagataaagacttggagttcttttgcaatgacatggtcgaagattggccctgaacagttctttgcatgccagaagaagtacgttggctagaatact 38326250  T
Q  117 tgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgagccaatgtagaaaactt 216  Q
    || |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  38326249 tgccaaatagcatgtacaacttcgtccttacttgttgcaacttcctttcacaggttgatgcatcaagttttgagtaacaataagccaatgttgaaaattt 38326150  T
Q  217 catccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttcagccattctctttata 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38326149 aatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactgtactcattccaaaatttgtcaaacttgctcatcatcctttcagccattctctttata 38326050  T
Q  317 gcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgtgctgtgccattaatca 416  Q
     ||||||||||||||| |||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  38326049 acttcatcttcatctcccaaagtagcaactagaacacattggactttccaaacttgcaaaaattacaaattggaagtaggatgcgttgtgtcattaatca 38325950  T
Q  417 tgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcataattatcatcatacaa 516  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38325949 tgttagcagtttcacaaaaaggcaacaagaatgcacagatcttttctactcttttctactcttctaccgaaggacataactcataattatcctcatacaa 38325850  T
Q  517 gtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38325849 gtgaagactttcaaacacacgccgatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 38325787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38317520 - 38316942
Alignment:
Q  1 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaata 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |  ||||||||| |     
T  38317520 acttacattgaataggccgtgagataaagactttaatttcttttgcaatggcatggtagaagattggtcctgagtagttctttttaggccagaagaagtg 38317421  T
Q  101 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||   || ||||  ||   |||||||||||||||||||| ||    
T  38317420 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaactttctctttactagttgcaacttctgctcgcaggttgatggatcaagttttgagtaacaataag 38317321  T
Q  201 ccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttc 300  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38317320 ccaacgtcgaaaacttcatccgtgggtcaagaactgctcccagtgcaagaacaacactatactcatcccaatatttgtcaaactcgctcatcatcctttc 38317221  T
Q  301 agccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgt 400  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  38317220 agccattctctttataactttatcttcatctcccaaactatcaactagaacacattggactttccaaacttgcaaaaaacacaagtttgaagtaggatgc 38317121  T
Q  401 gctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcat 500  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |  ||||||||||||  |    
T  38317120 gttgtgtcattaatcatgttggcagtttcataaaaaggcagcaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccactcatgtgctaaaggacataactggt 38317021  T
Q  501 aattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38317020 aattatcatcatacaagtgaaaactttcaaatacatgccgatatttaagagcactttcaagcatcacataagttgagtt 38316942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38309517 - 38308939
Alignment:
Q  1 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  38309517 acttacatcaaataggccctgagataaagactttaacttcttttgcaatggcacactagaagattggtcctgaattgttctttgcacgccagaagaagta 38309418  T
Q  101 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgag 200  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||||||||||||||| ||    
T  38309417 cttttgcaagaattcttgtgaaatagcatgtacaacttgctctttacttgctgcaacttcctttcgcaggttgatgcattaagttttgagtaacaataag 38309318  T
Q  201 ccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttc 300  Q
    ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38309317 ccaatgtggaaagctttatccttgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcttcccaatatttctcaaacttggtcaacatcctttc 38309218  T
Q  301 agccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgt 400  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  38309217 aaccattctctttatatcttcatcttcatctcccaaattatcaactagaacacattggactttccaaacttgcaaaaaatacaagttggaagtacgatgt 38309118  T
Q  401 gctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcat 500  Q
    | ||  ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||    
T  38309117 gttgcaccatttatcgtgttggcagtttcgctaaaaggcaacaagaatgcacaaatcttttctactcttttccactcttctgccgcaggacatgaatcat 38309018  T
Q  501 aattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38309017 aaccatcgtcatacaagtgaagactttcaaatgcaagctgatatttaagagcactttgaagcatcaaataagttgagtt 38308939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38314106 - 38313533
Alignment:
Q  4 tacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaatactt 103  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  38314106 tacatcaactaggtcgagagatgaagactcagagttcttttgcaatggcatggtagaagattggccctaaatagttgtttgcaccctagaagaagtactt 38314007  T
Q  104 ttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgagcca 203  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||   ||| |||||||||||||||  |||||    
T  38314006 ttgctagagtacttggcaaatagcatgtacaactttgtctttactttttgcaacttccgttcacaagttgatggatctagttttgagtaacaagcagcca 38313907  T
Q  204 atgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttcagc 303  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||    
T  38313906 atcttgaaaatttcatccgtgggtcaagaactgctcccattgcaagaacaacacta--ctcatcccaatatttcttaaacttgcccatcatacttttagc 38313809  T
Q  304 cattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgtgct 403  Q
    |||||||  || |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  38313808 cattctcgctacaaattcatcttcatctcccaaactatcaactaaaacacattgaagtttccaaacttgcgaaaaatacaagttggaagtaggatgtgtt 38313709  T
Q  404 gtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcataat 503  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||    
T  38313708 gcgccattaatcatgttggcagtttcacaaaaaggtaacaagaatgcacaaatcttttctactcttttccagtcttctgccgcaggacatgaatcataat 38313609  T
Q  504 tatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38313608 catcatcatacaagtgaagactttcaaacgcacgctgatatttaagagcactttgaagcatcaaataagttgagtt 38313533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 38306767 - 38306211
Alignment:
Q  1 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctgaatagttctttgcaccccagaagaaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||  ||||||||| ||    
T  38306767 acttacatcaaataggccatgagataaagactcagagttcttttgcaatggcatggtagaagattggccctgaacagttgtttgcataccagaagaagta 38306668  T
Q  101 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagtaacaatgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||   ||| |||||||||||||||| ||    
T  38306667 cttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaactttgtctttactttttgcaacttccgttcacaagttgatggatcgagttttgagtaacaatcag 38306568  T
Q  201 ccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcatcatcctttc 300  Q
    ||||  | || || ||||||||||||||            || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  38306567 ccaaccttgagaatttcatccgtgggtc------------cattgcaagaacaacactatgctcatcccaatatttcttaaacttgcccatcatcctttt 38306480  T
Q  301 agccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaagtaggatgt 400  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  38306479 agccattctcgctataacttcatcttcatctcccaaactatcaacaagaacacattggactttccaaacttgcaaaaaatacaagttggaagtgggatgt 38306380  T
Q  401 gctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggacataactcat 500  Q
    | ||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||          ||||||||  |  |||    
T  38306379 gttgcaccattgatcatgttggcagtttcacgaaaaggcaacatgaatgcacaaatcttttccactcttttgca----------gaaggacacgagacat 38306290  T
Q  501 aattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttgagtt 579  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38306289 aatcaccatcatacaagtgaaaactttcaaacacatgttgatatttaagagcactatcgagcatcaaataagttgagtt 38306211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 576
Target Start/End: Original strand, 38849816 - 38850400
Alignment:
Q  1 acttacatcaaataggccgtgagatgaagacttcaatttcttttgcaatggcatgctagaagattcgtcctga---------atagttctttgcacccca 91  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||         ||||||||||| ||||||    
T  38849816 acttacatcaaataggccatgagataaagactttaatttcttttgtaatggcatgctagaagattggtcctgattctccttaatagttctttgaacccca 38849915  T
Q  92 gaagaaatacttttgctagaatacttgtcaaatagcatgtacaacttactctttacttcttgcaacttcctttcacaggccgaaacatcaagttttgagt 191  Q
    | || | | || |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||  ||  |||| |||||||| |    
T  38849916 gcagtagtgctgttgccagaatgcttctcaaatagcatgcacaactttctctttacttgctgtagcttcctttcacaggttgatgcatccagttttgaat 38850015  T
Q  192 aacaatgagccaatgtagaaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcat 291  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38850016 aacaataagccaaggttgtaaacttcatccgtgggtcaagaaccgctcccaatgcaagaacaacactatactcatcccaatatttctcaaacttgctcat 38850115  T
Q  292 catcctttcagccattctctttatagcttcatcttcatctctcaaactatcagctaaaacacattgaactttccaaacttgcaaaaaatacatgtttgaa 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  38850116 catcctttcagccattttctttatatcttcatcttcatctcccaaactatcaactagaacacattggactttccaaacttgtaaaaaatacaagttggaa 38850215  T
Q  392 gtaggatgtgctgtgccattaatcatgttagcagtttcccttaaaggcaacaagaacgcacaaatcttttcaactcttttccattcttctaccgaaggac 491  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  38850216 gtaggatgtgttgtgctattaatcatgttggcagtttcacaaaaaggcaacaggaatgcacaaatcttttctactcttttccactcttccgccgaaggac 38850315  T
Q  492 ataactcataattatcatcatacaagtgaagactttcaaacacacacctatatttaagagcactttcaagcatcaaataagttga 576  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  38850316 ataaatcataactatcatcatacaagtgaaaactttcaaacgcacaccggtatttaagagctctttcaagcaacatataagttga 38850400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University