View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15182_low_58 (Length: 331)

Name: NF15182_low_58
Description: NF15182
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15182_low_58
NF15182_low_58
[»] chr8 (115 HSPs)
chr8 (37-275)||(13269232-13269470)
chr8 (37-314)||(27545721-27545996)
chr8 (37-314)||(2823562-2823837)
chr8 (37-288)||(1201630-1201880)
chr8 (37-288)||(10616252-10616502)
chr8 (37-314)||(32068983-32069256)
chr8 (37-314)||(8258282-8258557)
chr8 (45-314)||(26042901-26043167)
chr8 (37-288)||(3369673-3369922)
chr8 (41-277)||(184071-184307)
chr8 (37-314)||(34102961-34103236)
chr8 (37-314)||(26867883-26868159)
chr8 (37-314)||(30207128-30207403)
chr8 (37-314)||(35550552-35550827)
chr8 (37-314)||(13468261-13468537)
chr8 (37-313)||(10776936-10777208)
chr8 (63-314)||(25127856-25128107)
chr8 (49-277)||(5946783-5947010)
chr8 (37-306)||(26629990-26630250)
chr8 (37-314)||(30633025-30633300)
chr8 (37-288)||(32486912-32487163)
chr8 (37-257)||(9483936-9484156)
chr8 (51-233)||(23544832-23545014)
chr8 (39-235)||(36899700-36899897)
chr8 (66-288)||(25123368-25123589)
chr8 (37-269)||(13290457-13290688)
chr8 (99-315)||(29125669-29125883)
chr8 (37-294)||(45299568-45299822)
chr8 (84-315)||(39934360-39934590)
chr8 (46-314)||(9413778-9414044)
chr8 (37-199)||(17691176-17691337)
chr8 (43-234)||(35066966-35067159)
chr8 (37-189)||(39922359-39922510)
chr8 (147-314)||(1281844-1282010)
chr8 (37-130)||(42556643-42556736)
chr8 (143-279)||(44874128-44874264)
chr8 (45-169)||(7089934-7090058)
chr8 (39-311)||(9483612-9483884)
chr8 (39-291)||(19971412-19971665)
chr8 (39-247)||(1782965-1783173)
chr8 (63-188)||(25123646-25123770)
chr8 (63-288)||(14826275-14826501)
chr8 (187-277)||(23161315-23161405)
chr8 (39-306)||(31071517-31071783)
chr8 (37-133)||(34969938-34970034)
chr8 (78-291)||(21021186-21021401)
chr8 (37-128)||(29377880-29377971)
chr8 (39-311)||(21442091-21442363)
chr8 (37-133)||(7977241-7977337)
chr8 (37-166)||(23053922-23054053)
chr8 (156-314)||(32512112-32512269)
chr8 (174-288)||(42556759-42556873)
chr8 (40-311)||(41942823-41943091)
chr8 (63-291)||(30577855-30578085)
chr8 (37-106)||(17883927-17883996)
chr8 (210-311)||(23053813-23053913)
chr8 (84-311)||(5642482-5642702)
chr8 (84-311)||(5644423-5644643)
chr8 (143-249)||(17884005-17884111)
chr8 (212-288)||(17952615-17952691)
chr8 (156-272)||(18804868-18804984)
chr8 (144-251)||(21352255-21352362)
chr8 (180-311)||(25281053-25281184)
chr8 (51-101)||(29126156-29126206)
chr8 (39-135)||(4018675-4018770)
chr8 (227-314)||(36901237-36901323)
chr8 (184-314)||(42556441-42556570)
chr8 (66-236)||(29377561-29377728)
chr8 (39-135)||(3154209-3154304)
chr8 (176-275)||(10776927-10777027)
chr8 (37-128)||(26042939-26043029)
chr8 (176-314)||(29377842-29377980)
chr8 (158-208)||(21442416-21442466)
chr8 (58-128)||(29125708-29125777)
chr8 (176-275)||(1201621-1201721)
chr8 (39-135)||(1775535-1775630)
chr8 (39-135)||(14819270-14819365)
chr8 (61-128)||(23053848-23053914)
chr8 (226-311)||(3154069-3154154)
chr8 (211-261)||(21352419-21352469)
chr8 (58-128)||(25128000-25128069)
chr8 (226-276)||(35067345-35067394)
chr8 (78-135)||(18804323-18804380)
chr8 (177-218)||(45299698-45299739)
chr8 (175-275)||(3154216-3154316)
chr8 (176-275)||(10616243-10616343)
chr8 (176-275)||(17691167-17691267)
chr8 (39-135)||(25280959-25281054)
chr8 (214-250)||(30400533-30400569)
chr8 (61-128)||(23161317-23161383)
chr8 (263-314)||(30577817-30577867)
chr8 (58-128)||(1281882-1281951)
chr8 (39-89)||(33568106-33568156)
chr8 (185-218)||(184151-184184)
chr8 (185-218)||(1201714-1201747)
chr8 (185-218)||(10616336-10616369)
chr8 (185-218)||(17691260-17691293)
chr8 (37-74)||(17884126-17884163)
chr8 (209-250)||(18804307-18804348)
chr8 (185-218)||(26630074-26630107)
chr8 (79-128)||(42556484-42556533)
chr8 (66-103)||(44873139-44873176)
chr8 (211-275)||(1775542-1775606)
chr8 (211-275)||(1782989-1783053)
chr8 (176-275)||(2823746-2823846)
chr8 (51-91)||(3210903-3210943)
chr8 (211-275)||(4018682-4018746)
chr8 (175-235)||(5643083-5643143)
chr8 (175-235)||(5645024-5645084)
chr8 (211-275)||(25280983-25281047)
chr8 (176-275)||(27545712-27545812)
chr8 (175-215)||(31071601-31071641)
chr8 (176-275)||(34102952-34103052)
chr8 (39-91)||(39077319-39077371)
chr8 (176-275)||(42556634-42556734)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (37-314)||(34082525-34082800)
chr2 (37-275)||(11675110-11675348)
chr2 (37-314)||(16513035-16513307)
chr2 (52-314)||(42849989-42850249)
chr2 (37-313)||(18370190-18370464)
chr2 (37-306)||(8386655-8386925)
chr2 (37-248)||(23387153-23387363)
chr2 (37-280)||(768545-768781)
chr2 (37-313)||(13001984-13002258)
chr2 (37-314)||(37169515-37169789)
chr2 (37-276)||(29512073-29512313)
chr2 (37-235)||(33739505-33739702)
chr2 (37-250)||(1576611-1576823)
chr2 (63-314)||(1750150-1750398)
chr2 (79-314)||(16075006-16075237)
chr2 (63-291)||(23664732-23664960)
chr2 (37-242)||(41527927-41528132)
chr2 (39-288)||(7681979-7682228)
chr2 (39-311)||(44542809-44543081)
chr2 (63-311)||(6332274-6332522)
chr2 (37-135)||(32601349-32601447)
chr2 (39-311)||(39906243-39906516)
chr2 (39-311)||(22711007-22711279)
chr2 (39-311)||(30406435-30406707)
chr2 (39-288)||(9689349-9689600)
chr2 (147-290)||(17265338-17265481)
chr2 (78-291)||(33173478-33173692)
chr2 (41-277)||(20939686-20939923)
chr2 (63-314)||(15554020-15554271)
chr2 (100-306)||(29403914-29404118)
chr2 (95-304)||(2586348-2586558)
chr2 (39-287)||(22301952-22302201)
chr2 (39-291)||(4293178-4293431)
chr2 (39-277)||(38986952-38987192)
chr2 (39-294)||(44257434-44257692)
chr2 (37-135)||(39435169-39435267)
chr2 (79-311)||(9690171-9690404)
chr2 (54-135)||(29511941-29512022)
chr2 (78-191)||(23387063-23387176)
chr2 (37-130)||(45629694-45629788)
chr2 (174-313)||(3769412-3769552)
chr2 (63-306)||(39904620-39904863)
chr2 (37-265)||(44288758-44288976)
chr2 (174-281)||(324996-325105)
chr2 (37-125)||(21545844-21545932)
chr2 (143-202)||(24755176-24755235)
chr2 (58-130)||(11675279-11675350)
chr2 (37-125)||(43660810-43660898)
chr2 (85-123)||(20940066-20940104)
chr2 (231-313)||(33740105-33740186)
chr2 (232-314)||(41527820-41527901)
chr2 (175-275)||(23387272-23387373)
chr2 (39-135)||(1297564-1297659)
chr2 (210-249)||(29513923-29513962)
chr2 (37-75)||(17528492-17528530)
chr2 (63-112)||(324742-324791)
chr2 (226-314)||(23234009-23234097)
chr2 (63-135)||(3769702-3769773)
chr2 (176-275)||(11675101-11675201)
chr2 (39-135)||(19630726-19630821)
chr2 (39-135)||(19827627-19827722)
chr2 (176-275)||(34082516-34082616)
chr2 (178-277)||(41528039-41528139)
chr2 (58-128)||(1750188-1750257)
chr2 (176-273)||(16513218-16513316)
chr2 (185-223)||(23387246-23387284)
chr2 (210-275)||(29511949-29512015)
chr2 (50-79)||(6533081-6533110)
chr2 (226-259)||(10137254-10137287)
chr2 (37-126)||(16075044-16075132)
chr2 (39-100)||(17264903-17264963)
chr2 (176-275)||(33739496-33739596)
chr2 (185-218)||(33739589-33739622)
chr2 (226-277)||(8741656-8741708)
chr2 (39-91)||(12725750-12725802)
chr2 (56-112)||(29513917-29513972)
chr2 (175-215)||(33173606-33173646)
chr2 (263-311)||(39904851-39904898)
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (37-314)||(938857-939132)
chr7 (37-313)||(25818447-25818722)
chr7 (37-306)||(28912052-28912319)
chr7 (39-311)||(41407307-41407577)
chr7 (37-288)||(18352274-18352525)
chr7 (37-314)||(11766085-11766358)
chr7 (37-312)||(19069360-19069633)
chr7 (37-314)||(38367815-38368090)
chr7 (40-316)||(454064-454338)
chr7 (45-275)||(15957181-15957410)
chr7 (37-277)||(2509280-2509518)
chr7 (37-265)||(9401615-9401842)
chr7 (37-313)||(2936603-2936878)
chr7 (36-314)||(38796781-38797059)
chr7 (37-313)||(6559320-6559591)
chr7 (37-288)||(6736472-6736720)
chr7 (43-288)||(2362739-2362981)
chr7 (41-274)||(2633855-2634085)
chr7 (37-314)||(27168217-27168487)
chr7 (50-250)||(23740063-23740263)
chr7 (75-314)||(41037320-41037558)
chr7 (39-311)||(27811906-27812178)
chr7 (39-288)||(12080685-12080935)
chr7 (39-288)||(15230051-15230300)
chr7 (39-311)||(20516884-20517157)
chr7 (39-306)||(24720230-24720497)
chr7 (39-288)||(14777913-14778161)
chr7 (39-244)||(32852888-32853093)
chr7 (39-276)||(11327594-11327833)
chr7 (39-306)||(8047934-8048197)
chr7 (63-311)||(38876152-38876401)
chr7 (186-291)||(3512711-3512816)
chr7 (45-311)||(14718961-14719226)
chr7 (158-311)||(45225224-45225378)
chr7 (39-314)||(48454505-48454781)
chr7 (39-265)||(45225403-45225630)
chr7 (39-296)||(22479185-22479442)
chr7 (39-311)||(4655009-4655286)
chr7 (39-313)||(28605405-28605677)
chr7 (39-313)||(34986488-34986762)
chr7 (39-208)||(37138896-37139065)
chr7 (105-288)||(43711898-43712084)
chr7 (143-218)||(27168296-27168371)
chr7 (39-311)||(27596984-27597269)
chr7 (179-311)||(33889046-33889179)
chr7 (78-246)||(18123080-18123250)
chr7 (144-311)||(48193117-48193285)
chr7 (79-289)||(7437798-7438011)
chr7 (63-208)||(14770143-14770287)
chr7 (63-208)||(15220594-15220738)
chr7 (189-311)||(18199532-18199655)
chr7 (184-289)||(1325335-1325442)
chr7 (201-263)||(7835347-7835409)
chr7 (158-294)||(26380155-26380293)
chr7 (144-204)||(32577615-32577675)
chr7 (39-130)||(32577716-32577806)
chr7 (39-129)||(18199720-18199809)
chr7 (41-135)||(18829839-18829932)
chr7 (58-129)||(15957341-15957411)
chr7 (175-261)||(22479368-22479454)
chr7 (176-238)||(44868037-44868099)
chr7 (165-238)||(24251875-24251948)
chr7 (176-255)||(9401606-9401686)
chr7 (176-275)||(28912228-28912328)
chr7 (41-121)||(48193343-48193422)
chr7 (177-275)||(939041-939140)
chr7 (37-112)||(24720277-24720352)
chr7 (175-311)||(32577469-32577607)
chr7 (58-112)||(7835352-7835405)
chr7 (211-261)||(33889919-33889969)
chr7 (185-223)||(38367894-38367932)
chr7 (185-222)||(454224-454261)
chr7 (82-127)||(3512505-3512550)
chr7 (63-127)||(33618578-33618644)
chr7 (176-275)||(6559500-6559600)
chr7 (95-135)||(17317400-17317440)
chr7 (39-91)||(21993538-21993590)
chr7 (39-135)||(26380036-26380131)
chr7 (39-91)||(26928000-26928052)
chr7 (174-238)||(27131052-27131116)
chr7 (172-236)||(38368213-38368277)
chr7 (39-91)||(48227266-48227318)
[»] chr5 (89 HSPs)
chr5 (37-288)||(4083709-4083959)
chr5 (37-311)||(4737881-4738153)
chr5 (37-314)||(28747708-28747984)
chr5 (37-315)||(2528712-2528990)
chr5 (37-311)||(12909983-12910255)
chr5 (37-277)||(14369749-14369988)
chr5 (37-288)||(7944258-7944508)
chr5 (37-315)||(25912003-25912279)
chr5 (37-314)||(17421640-17421915)
chr5 (37-313)||(6436370-6436644)
chr5 (37-275)||(33696037-33696274)
chr5 (37-288)||(13710992-13711244)
chr5 (46-313)||(6260961-6261226)
chr5 (43-272)||(2695064-2695290)
chr5 (37-314)||(3038833-3039095)
chr5 (37-247)||(31752128-31752337)
chr5 (37-306)||(39038473-39038735)
chr5 (47-311)||(39548813-39549073)
chr5 (37-287)||(22701705-22701953)
chr5 (50-314)||(22800614-22800871)
chr5 (37-314)||(17232877-17233148)
chr5 (50-255)||(9124706-9124912)
chr5 (100-288)||(31240268-31240455)
chr5 (37-293)||(17233235-17233488)
chr5 (37-247)||(33832728-33832939)
chr5 (84-277)||(10951037-10951229)
chr5 (37-313)||(8410591-8410853)
chr5 (45-250)||(10471002-10471205)
chr5 (54-218)||(857929-858094)
chr5 (39-311)||(4736746-4737015)
chr5 (37-163)||(32736356-32736481)
chr5 (39-288)||(30687877-30688128)
chr5 (37-135)||(17210139-17210236)
chr5 (37-274)||(1951394-1951632)
chr5 (43-311)||(15808922-15809191)
chr5 (39-311)||(29302067-29302340)
chr5 (45-311)||(17604993-17605258)
chr5 (51-249)||(38952198-38952396)
chr5 (44-199)||(15294098-15294252)
chr5 (39-306)||(1921417-1921684)
chr5 (78-277)||(3960639-3960840)
chr5 (39-314)||(37468491-37468757)
chr5 (45-135)||(11351787-11351877)
chr5 (39-294)||(26905865-26906118)
chr5 (151-314)||(40234162-40234310)
chr5 (95-291)||(17209894-17210089)
chr5 (85-311)||(33026179-33026406)
chr5 (63-291)||(11448703-11448933)
chr5 (178-311)||(14795643-14795777)
chr5 (158-291)||(27005161-27005296)
chr5 (41-311)||(33282208-33282477)
chr5 (144-311)||(33833121-33833289)
chr5 (175-311)||(7014477-7014614)
chr5 (39-204)||(37249361-37249526)
chr5 (39-205)||(37282237-37282403)
chr5 (143-313)||(31752393-31752568)
chr5 (174-311)||(30486061-30486199)
chr5 (211-311)||(22213112-22213212)
chr5 (178-255)||(1797420-1797498)
chr5 (63-135)||(7014631-7014702)
chr5 (74-218)||(3189722-3189864)
chr5 (37-128)||(31240352-31240442)
chr5 (176-277)||(17421822-17421924)
chr5 (105-200)||(38661242-38661337)
chr5 (176-275)||(2528899-2528999)
chr5 (176-275)||(4738062-4738162)
chr5 (39-277)||(30667544-30667780)
chr5 (175-275)||(37249438-37249538)
chr5 (175-261)||(11448883-11448970)
chr5 (37-128)||(39548948-39549038)
chr5 (79-125)||(19334841-19334887)
chr5 (225-275)||(31752246-31752296)
chr5 (263-312)||(1807579-1807627)
chr5 (185-218)||(2695141-2695174)
chr5 (185-222)||(6261032-6261069)
chr5 (37-74)||(10470951-10470988)
chr5 (185-218)||(14369871-14369904)
chr5 (78-135)||(22282213-22282270)
chr5 (185-218)||(25912087-25912120)
chr5 (185-218)||(32736364-32736397)
chr5 (176-255)||(4083888-4083968)
chr5 (180-275)||(7944417-7944513)
chr5 (39-91)||(9741794-9741846)
chr5 (43-91)||(17689377-17689425)
chr5 (39-91)||(18015711-18015763)
chr5 (175-215)||(26905994-26906034)
chr5 (176-275)||(32736390-32736490)
chr5 (175-250)||(33696208-33696284)
chr5 (64-128)||(40234209-40234272)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (37-314)||(20579-20855)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (37-314)||(9692-9967)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (41-288)||(26842961-26843207)
chr1 (37-314)||(13157516-13157794)
chr1 (37-314)||(16005525-16005801)
chr1 (37-314)||(34515088-34515365)
chr1 (37-277)||(158373-158613)
chr1 (37-288)||(28454691-28454941)
chr1 (37-314)||(51431806-51432083)
chr1 (37-288)||(16073397-16073649)
chr1 (37-316)||(41146209-41146486)
chr1 (37-272)||(6192383-6192619)
chr1 (45-288)||(10764582-10764827)
chr1 (37-314)||(24770590-24770864)
chr1 (41-314)||(8642957-8643225)
chr1 (37-288)||(23413623-23413871)
chr1 (37-313)||(32155945-32156219)
chr1 (37-277)||(34306399-34306642)
chr1 (37-314)||(45818743-45819017)
chr1 (37-314)||(50559208-50559484)
chr1 (37-250)||(36389418-36389630)
chr1 (37-243)||(3273363-3273569)
chr1 (37-315)||(14387214-14387489)
chr1 (47-288)||(4158077-4158318)
chr1 (143-313)||(463377-463546)
chr1 (37-287)||(13157240-13157477)
chr1 (37-277)||(42199850-42200089)
chr1 (37-277)||(42208718-42208957)
chr1 (37-311)||(32994146-32994402)
chr1 (66-275)||(5491590-5491798)
chr1 (37-203)||(33676084-33676250)
chr1 (105-277)||(13264528-13264699)
chr1 (145-288)||(27787867-27788010)
chr1 (143-313)||(3979442-3979612)
chr1 (37-129)||(10558171-10558263)
chr1 (39-265)||(39424230-39424455)
chr1 (37-238)||(28764509-28764708)
chr1 (39-133)||(20201661-20201755)
chr1 (39-311)||(20411157-20411430)
chr1 (37-130)||(462977-463070)
chr1 (39-311)||(1804940-1805212)
chr1 (58-185)||(28704439-28704565)
chr1 (39-288)||(13385706-13385959)
chr1 (63-277)||(16960267-16960482)
chr1 (39-265)||(47130912-47131139)
chr1 (63-311)||(14494353-14494602)
chr1 (63-311)||(36817634-36817883)
chr1 (37-124)||(3977930-3978018)
chr1 (40-311)||(12864244-12864514)
chr1 (158-311)||(14387479-14387633)
chr1 (39-288)||(27255612-27255863)
chr1 (39-274)||(27389475-27389714)
chr1 (158-311)||(43236241-43236395)
chr1 (63-315)||(32374488-32374740)
chr1 (144-311)||(32716358-32716526)
chr1 (143-218)||(32151930-32152005)
chr1 (50-128)||(32379581-32379659)
chr1 (39-108)||(13264723-13264792)
chr1 (196-272)||(33675823-33675899)
chr1 (174-311)||(13943357-13943495)
chr1 (174-276)||(47130804-47130907)
chr1 (78-277)||(27348129-27348325)
chr1 (37-100)||(27787804-27787867)
chr1 (143-250)||(28182157-28182264)
chr1 (39-218)||(20201743-20201922)
chr1 (146-249)||(9005191-9005291)
chr1 (44-166)||(10368051-10368172)
chr1 (143-208)||(32144056-32144121)
chr1 (39-247)||(52772206-52772415)
chr1 (143-204)||(50797727-50797788)
chr1 (58-130)||(5491729-5491800)
chr1 (157-205)||(32144129-32144177)
chr1 (37-128)||(463419-463509)
chr1 (37-128)||(27787907-27787997)
chr1 (143-198)||(32151863-32151918)
chr1 (226-311)||(28094383-28094468)
chr1 (157-203)||(32152003-32152049)
chr1 (226-314)||(12010472-12010559)
chr1 (64-236)||(24190767-24190940)
chr1 (39-135)||(28646722-28646817)
chr1 (63-135)||(43236138-43236209)
chr1 (37-128)||(13264530-13264620)
chr1 (37-128)||(26843104-26843194)
chr1 (63-289)||(51464995-51465221)
chr1 (37-71)||(48643977-48644011)
chr1 (39-112)||(2965336-2965408)
chr1 (84-179)||(3099574-3099668)
chr1 (176-275)||(10558162-10558262)
chr1 (176-275)||(16073388-16073488)
chr1 (176-255)||(28704515-28704595)
chr1 (187-218)||(6192469-6192500)
chr1 (176-250)||(16005735-16005810)
chr1 (58-125)||(33675823-33675889)
chr1 (263-314)||(36817596-36817646)
chr1 (177-222)||(33676124-33676170)
chr1 (176-275)||(50559199-50559300)
chr1 (263-313)||(51465209-51465257)
chr1 (185-218)||(13157600-13157633)
chr1 (37-82)||(28182348-28182392)
chr1 (185-218)||(36389502-36389535)
chr1 (176-275)||(158364-158464)
chr1 (39-91)||(5226868-5226920)
chr1 (176-275)||(26842948-26843048)
chr1 (213-261)||(27348117-27348165)
chr1 (175-215)||(27389590-27389630)
chr1 (211-275)||(43236138-43236202)
chr1 (211-275)||(47131051-47131115)
chr1 (176-255)||(51432012-51432092)
[»] chr3 (94 HSPs)
chr3 (37-311)||(31039523-31039795)
chr3 (37-314)||(13349086-13349361)
chr3 (37-277)||(33837775-33838019)
chr3 (37-315)||(1375963-1376240)
chr3 (37-314)||(3800147-3800423)
chr3 (45-286)||(8814756-8814996)
chr3 (77-313)||(53581511-53581745)
chr3 (37-314)||(36823906-36824181)
chr3 (37-249)||(50801589-50801800)
chr3 (37-249)||(50874080-50874291)
chr3 (37-243)||(12127562-12127767)
chr3 (37-314)||(27317590-27317866)
chr3 (66-288)||(53467346-53467567)
chr3 (45-314)||(27359948-27360213)
chr3 (41-279)||(29239564-29239800)
chr3 (37-286)||(32203132-32203375)
chr3 (37-312)||(48765176-48765452)
chr3 (47-276)||(3269357-3269587)
chr3 (37-288)||(50912966-50913216)
chr3 (37-231)||(17605506-17605699)
chr3 (37-205)||(22894513-22894679)
chr3 (39-311)||(6114739-6115012)
chr3 (104-291)||(26103649-26103834)
chr3 (39-311)||(6748614-6748886)
chr3 (39-311)||(7848485-7848757)
chr3 (45-190)||(8815062-8815206)
chr3 (39-311)||(21727603-21727876)
chr3 (39-311)||(47461652-47461925)
chr3 (39-311)||(8815290-8815561)
chr3 (39-306)||(11460113-11460380)
chr3 (37-135)||(54244749-54244847)
chr3 (39-288)||(12896617-12896868)
chr3 (39-311)||(45059496-45059769)
chr3 (84-311)||(37504499-37504727)
chr3 (198-313)||(22894875-22894989)
chr3 (39-311)||(6109128-6109401)
chr3 (37-123)||(30033150-30033236)
chr3 (174-311)||(17226273-17226411)
chr3 (39-279)||(38797967-38798210)
chr3 (98-311)||(26158254-26158469)
chr3 (78-274)||(7521352-7521551)
chr3 (39-291)||(994686-994940)
chr3 (63-311)||(27728149-27728400)
chr3 (165-311)||(4043586-4043733)
chr3 (143-274)||(34277552-34277683)
chr3 (43-288)||(994996-995243)
chr3 (37-118)||(30685186-30685267)
chr3 (63-277)||(51148000-51148215)
chr3 (143-276)||(2868231-2868366)
chr3 (144-314)||(3544243-3544415)
chr3 (43-311)||(17065686-17065952)
chr3 (227-313)||(17604884-17604969)
chr3 (78-203)||(51952269-51952395)
chr3 (39-288)||(26152161-26152413)
chr3 (39-135)||(17226166-17226261)
chr3 (39-135)||(26152474-26152569)
chr3 (39-135)||(30347738-30347833)
chr3 (37-128)||(8814767-8814857)
chr3 (226-311)||(21408634-21408719)
chr3 (39-198)||(52654387-52654545)
chr3 (63-135)||(4043771-4043842)
chr3 (37-128)||(53581548-53581638)
chr3 (58-128)||(22894883-22894952)
chr3 (37-111)||(53467464-53467537)
chr3 (185-222)||(27360104-27360141)
chr3 (63-135)||(3269221-3269292)
chr3 (175-275)||(7521501-7521601)
chr3 (176-275)||(12127676-12127776)
chr3 (175-275)||(17226154-17226254)
chr3 (175-275)||(26152462-26152562)
chr3 (186-276)||(27800456-27800548)
chr3 (143-203)||(29950609-29950669)
chr3 (143-203)||(29999763-29999823)
chr3 (211-275)||(30347762-30347826)
chr3 (143-203)||(53455639-53455699)
chr3 (185-219)||(17605582-17605616)
chr3 (176-277)||(29239551-29239653)
chr3 (185-218)||(12127650-12127683)
chr3 (185-218)||(29950657-29950690)
chr3 (185-218)||(29999811-29999844)
chr3 (50-91)||(36418793-36418834)
chr3 (185-222)||(36824064-36824101)
chr3 (39-130)||(38101190-38101280)
chr3 (39-130)||(54411793-54411883)
chr3 (39-91)||(3283311-3283363)
chr3 (211-275)||(4043778-4043842)
chr3 (168-236)||(6125820-6125888)
chr3 (175-275)||(12896780-12896880)
chr3 (84-128)||(17604921-17604965)
chr3 (211-275)||(27800589-27800653)
chr3 (39-91)||(37702609-37702661)
chr3 (176-255)||(50801729-50801809)
chr3 (176-255)||(50874071-50874151)
chr3 (211-255)||(51952365-51952409)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (37-314)||(33730479-33730751)
chr6 (37-277)||(25061649-25061886)
chr6 (57-291)||(4898426-4898659)
chr6 (37-277)||(14488292-14488528)
chr6 (37-311)||(30525315-30525586)
chr6 (37-315)||(4838232-4838514)
chr6 (37-313)||(15718167-15718442)
chr6 (44-288)||(18102671-18102915)
chr6 (37-312)||(4898087-4898361)
chr6 (40-276)||(21969857-21970092)
chr6 (37-315)||(11742279-11742555)
chr6 (57-276)||(3437973-3438191)
chr6 (37-277)||(11009874-11010115)
chr6 (143-313)||(18154503-18154672)
chr6 (37-246)||(11100081-11100292)
chr6 (63-311)||(1369886-1370134)
chr6 (39-314)||(31132839-31133115)
chr6 (39-288)||(11100343-11100594)
chr6 (39-311)||(29646178-29646450)
chr6 (39-277)||(9955758-9955998)
chr6 (39-291)||(8171857-8172110)
chr6 (78-288)||(15962738-15962951)
chr6 (63-294)||(9406559-9406789)
chr6 (147-277)||(26211348-26211478)
chr6 (144-288)||(4184327-4184473)
chr6 (40-205)||(5703815-5703974)
chr6 (44-288)||(10777911-10778157)
chr6 (39-311)||(16599032-16599305)
chr6 (46-306)||(5187740-5187999)
chr6 (144-287)||(27828379-27828524)
chr6 (199-276)||(228020-228096)
chr6 (158-311)||(20755437-20755591)
chr6 (39-135)||(15881889-15881984)
chr6 (175-277)||(32889636-32889737)
chr6 (225-276)||(32194210-32194261)
chr6 (78-135)||(35002025-35002082)
chr6 (180-288)||(10315306-10315417)
chr6 (63-135)||(11210284-11210355)
chr6 (49-135)||(24022877-24022962)
chr6 (63-236)||(26667852-26668026)
chr6 (204-265)||(11122528-11122589)
chr6 (71-112)||(32194227-32194268)
chr6 (211-275)||(10196611-10196675)
chr6 (211-275)||(15962724-15962788)
chr6 (176-275)||(33730660-33730760)
chr6 (78-129)||(10196610-10196661)
chr6 (63-122)||(27828294-27828352)
chr6 (58-112)||(11122530-11122583)
chr6 (175-261)||(27828258-27828344)
chr6 (185-218)||(4838397-4838430)
chr6 (185-218)||(11742438-11742471)
chr6 (185-218)||(25061770-25061803)
chr6 (39-91)||(10075061-10075113)
chr6 (211-275)||(11210284-11210348)
chr6 (176-275)||(11742464-11742564)
chr6 (39-91)||(12159484-12159536)
chr6 (176-277)||(14488438-14488537)
chr6 (211-275)||(15881913-15881977)
chr6 (60-128)||(18154540-18154607)
chr6 (39-91)||(19104316-19104368)
[»] chr4 (108 HSPs)
chr4 (37-314)||(26335704-26335979)
chr4 (37-312)||(52306733-52307006)
chr4 (37-314)||(46106637-46106912)
chr4 (37-313)||(6946609-6946878)
chr4 (39-288)||(40496117-40496366)
chr4 (37-314)||(9744105-9744380)
chr4 (45-277)||(6192936-6193168)
chr4 (37-248)||(20458805-20459016)
chr4 (41-276)||(16553425-16553659)
chr4 (45-314)||(45875723-45875989)
chr4 (37-314)||(14862936-14863205)
chr4 (37-240)||(11777469-11777671)
chr4 (41-248)||(49425737-49425943)
chr4 (37-312)||(29101950-29102224)
chr4 (85-315)||(4490627-4490856)
chr4 (63-313)||(38425651-38425899)
chr4 (37-247)||(15725208-15725417)
chr4 (37-234)||(23383899-23384092)
chr4 (37-314)||(4712620-4712896)
chr4 (54-313)||(14948087-14948343)
chr4 (77-314)||(33105874-33106110)
chr4 (39-314)||(26958519-26958792)
chr4 (39-246)||(36955387-36955592)
chr4 (143-314)||(6137577-6137747)
chr4 (63-314)||(54742411-54742664)
chr4 (37-219)||(142676-142857)
chr4 (37-312)||(43638942-43639240)
chr4 (39-311)||(5046603-5046875)
chr4 (39-311)||(48559981-48560253)
chr4 (63-286)||(52437423-52437647)
chr4 (37-311)||(30820449-30820724)
chr4 (37-311)||(13211798-13212072)
chr4 (36-242)||(40496480-40496679)
chr4 (39-306)||(42807873-42808141)
chr4 (39-314)||(41172390-41172665)
chr4 (143-314)||(33811008-33811178)
chr4 (151-314)||(49605982-49606144)
chr4 (63-288)||(6213988-6214215)
chr4 (52-183)||(102235-102366)
chr4 (39-311)||(7630040-7630313)
chr4 (39-311)||(50182158-50182428)
chr4 (43-311)||(5156980-5157249)
chr4 (39-250)||(3818788-3819001)
chr4 (37-127)||(13211513-13211603)
chr4 (39-296)||(21519728-21519987)
chr4 (39-311)||(14202832-14203105)
chr4 (39-311)||(12584248-12584521)
chr4 (78-311)||(49970578-49970811)
chr4 (45-238)||(10216220-10216413)
chr4 (39-306)||(34683010-34683278)
chr4 (174-311)||(10981398-10981536)
chr4 (158-311)||(17180933-17181087)
chr4 (39-207)||(30258089-30258256)
chr4 (39-306)||(13621086-13621353)
chr4 (43-306)||(17377481-17377745)
chr4 (41-311)||(51783933-51784205)
chr4 (39-277)||(578719-578961)
chr4 (39-276)||(17745165-17745401)
chr4 (37-108)||(49606163-49606234)
chr4 (174-314)||(18470237-18470378)
chr4 (37-135)||(38425532-38425630)
chr4 (37-102)||(54818630-54818695)
chr4 (185-275)||(6137498-6137589)
chr4 (213-313)||(13211625-13211724)
chr4 (78-249)||(13371256-13371428)
chr4 (78-249)||(13381457-13381629)
chr4 (144-288)||(13621381-13621527)
chr4 (37-111)||(50677961-50678033)
chr4 (37-91)||(4505237-4505291)
chr4 (37-81)||(6137472-6137516)
chr4 (37-128)||(52437546-52437636)
chr4 (226-288)||(40496405-40496467)
chr4 (240-314)||(49426124-49426197)
chr4 (185-315)||(50677905-50678033)
chr4 (37-101)||(33811285-33811349)
chr4 (39-135)||(47382312-47382407)
chr4 (174-293)||(45801804-45801928)
chr4 (233-313)||(142598-142677)
chr4 (176-275)||(23383890-23383990)
chr4 (39-91)||(32868053-32868105)
chr4 (211-275)||(49970761-49970825)
chr4 (58-125)||(33105916-33105982)
chr4 (210-255)||(102245-102291)
chr4 (37-111)||(6137516-6137589)
chr4 (37-87)||(48474984-48475034)
chr4 (185-218)||(6946766-6946799)
chr4 (185-218)||(14863093-14863126)
chr4 (185-222)||(15725300-15725337)
chr4 (185-218)||(26335862-26335895)
chr4 (79-112)||(40496434-40496467)
chr4 (205-238)||(42560166-42560199)
chr4 (236-288)||(4505563-4505615)
chr4 (39-91)||(5975724-5975776)
chr4 (39-91)||(6137328-6137380)
chr4 (211-275)||(10216238-10216302)
chr4 (176-275)||(11777460-11777560)
chr4 (39-91)||(19329428-19329480)
chr4 (39-91)||(20503501-20503553)
chr4 (176-275)||(26335888-26335988)
chr4 (39-91)||(27907058-27907110)
chr4 (211-275)||(30258113-30258177)
chr4 (37-112)||(34683156-34683231)
chr4 (39-91)||(34728259-34728311)
chr4 (39-91)||(38427108-38427160)
chr4 (39-91)||(40875280-40875332)
chr4 (39-91)||(42434268-42434320)
chr4 (186-218)||(49425817-49425849)
chr4 (176-275)||(52306915-52307015)
[»] scaffold0627 (2 HSPs)
scaffold0627 (37-277)||(4057-4295)
scaffold0627 (176-275)||(4204-4304)
[»] scaffold0418 (5 HSPs)
scaffold0418 (39-288)||(5669-5917)
scaffold0418 (36-184)||(5355-5503)
scaffold0418 (226-288)||(5568-5630)
scaffold0418 (79-112)||(5568-5601)
scaffold0418 (186-218)||(5803-5835)
[»] scaffold1808 (2 HSPs)
scaffold1808 (37-277)||(561-800)
scaffold1808 (176-255)||(729-809)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (37-306)||(6508-6775)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (78-311)||(452367-452601)
scaffold0002 (37-112)||(452474-452549)
scaffold0002 (39-91)||(94845-94897)
[»] scaffold1717 (1 HSPs)
scaffold1717 (37-127)||(1340-1429)
[»] scaffold1527 (1 HSPs)
scaffold1527 (37-127)||(1586-1675)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (39-311)||(57857-58130)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (78-306)||(26052-26282)
scaffold0074 (211-275)||(26038-26102)
scaffold0074 (66-112)||(26189-26235)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (85-276)||(22624-22815)
scaffold0193 (79-128)||(22765-22814)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (63-236)||(2767-2941)
scaffold0119 (63-236)||(14822-14996)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (78-135)||(82743-82800)
[»] scaffold0778 (2 HSPs)
scaffold0778 (39-119)||(6234-6313)
scaffold0778 (263-315)||(6219-6270)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (143-205)||(66025-66087)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (39-91)||(35122-35174)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (211-275)||(14877-14941)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 115)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13269470 - 13269232
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13269470 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaaaatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctt 13269371  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13269370 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 13269271  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  13269270 gtagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 13269232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 27545721 - 27545996
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27545721 atacacccactagtttttattaaggcgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 27545820  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27545821 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 27545919  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||  | ||||||||||| |||||||    
T  27545920 gtagttaaatacaccttaaggtgtagattgctaaaacactaccacataaaaactagcg-ggtgtgttctagcaaatcc 27545996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2823837 - 2823562
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2823837 atacacccactaatttttattaaagtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcta 2823738  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2823737 aaaaa-taattgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaa 2823639  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  2823638 gtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacacttccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 2823562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 1201630 - 1201880
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  1201630 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttcta 1201729  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1201730 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaa 1201828  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  1201829 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgttaaaacactcccacataaaaa 1201880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 10616252 - 10616502
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  10616252 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttcta 10616351  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10616352 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 10616450  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
     ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  10616451 atagttaaatacaccttaaggtgtagtttgctaaaacactcccacataaaaa 10616502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 32068983 - 32069256
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32068983 atacaccaactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta 32069082  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||    
T  32069083 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataact--aaa 32069179  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| || || |||||| |||| |||||||    
T  32069180 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcacacatgaaaactagtg-ggtgtggtctagcaaatcc 32069256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8258557 - 8258282
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |     
T  8258557 atacacccactagtttttattaatgtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattccttata 8258458  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  8258457 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaattataaccaaaaa 8258359  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||| || |||||||    
T  8258358 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttatagcaaatcc 8258282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26043167 - 26042901
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||       ||    
T  26043167 actagtttttattaag-tgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaa-ta 26043070  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26043069 agtgggtgtatgttaacaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 26042970  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  26042969 atacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 26042901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 3369673 - 3369922
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3369673 atacagccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatatagctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcta 3369772  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3369773 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttaa-aaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 3369870  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3369871 gtagttaaatataccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 3369922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Original strand, 184071 - 184307
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||         
T  184071 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaa 184170  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt-agaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagta 239  Q
      |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  184171 a-taagtgggtgtatgttagcaacccatatagacatttgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagttataactaaaaagta 184269  T
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  184270 gttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 184307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 34102961 - 34103236
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34102961 atacacccgctagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct- 34103059  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34103060 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctataggcttttgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 34103159  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| | |||| || || ||||||||||| |||||||    
T  34103160 atagttaaatacactttaacgtgtagcttgctaaaacaatcccacatgaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 34103236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26868159 - 26867883
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  26868159 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttctt 26868060  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  26868059 aaaaattaagtgcgtgtatgttagcaactcctataggcatttactataacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagttatatctaaaaa 26867960  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  26867959 gtagttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaattactcccacataaaaattattg-gatgtgttctagcaaatcc 26867883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 30207128 - 30207403
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  30207128 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagtaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatcta 30207227  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaaga-tgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||    
T  30207228 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta-aagagtgtgttttagcaaattataattaaaa 30207325  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  30207326 agtagttaaatgcacattaaggtgtaacttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatcc 30207403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35550827 - 35550552
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  35550827 atacatccattagtttttattaaggtgtcttttaacaaagatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttcta 35550728  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  35550727 aaata-taagtgggtgtatattagcaactcctataggcatttgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 35550629  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  35550628 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatcc 35550552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13468537 - 13468261
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13468537 atacacctactagtttttagtaatatgtgttttaagaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctt 13468438  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  13468437 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagttataactaaaaa 13468338  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  13468337 gtagttaaatactccttaaggtatagcttgctaaaatactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaatcc 13468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Original strand, 10776936 - 10777208
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  10776936 atacacccactaatttttattaaggtgtgtattaacaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattcta 10777035  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10777036 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatttgctaagatacatccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 10777132  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||| |||||| ||| || ||||||| || ||||||    
T  10777133 gtagttaaatacaccttaaagtgtagtttgctaaaatacttccacataaaaactaaaga-gtgtgttatagcaaatc 10777208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128107
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn-taagtgggtgtatgttagc 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||        |||||||||||||||||||    
T  25127856 gtgttttagcaaaaatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagc 25127955  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  25127956 aactcctacagacatttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 25128055  T
Q  262 gcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  25128056 gcttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttatagcaaatcc 25128107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5947010 - 5946783
Alignment:
Q  49 gtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtg 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||       ||||||    
T  5947010 gtttttattaaagtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaataagtg 5946911  T
Q  149 ggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatac 248  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5946910 ggtgtatgttagcaactcctatcggcatttgctaggatacacc-acttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatac 5946812  T
Q  249 acattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  5946811 accttaagatgtagcttgctaaaacactc 5946783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 26629990 - 26630250
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  26629990 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct- 26630088  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacattt-gctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||    
T  26630089 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttagctaggatacacccacttatttttttgaagatgtgtt--------ttataactaaaa 26630180  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    |||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  26630181 agtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctcaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 26630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30633300 - 30633025
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||    || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  30633300 atacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcta 30633201  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30633200 aaaaa-taagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcatttgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 30633102  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30633101 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttactaaaacactctcacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaatcc 30633025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32487163 - 32486912
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||| ||       
T  32487163 atacacccactagtttttattaaggtgtgtattaataaatatataactaaaaagttgttaaatacatcttaagataaatcttggtaaaacacacctttaa 32487064  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32487063 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagttataactaaaaa 32486964  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32486963 gtagttaaatacaccttaaagtgcagcttgctaaaacactcccacgtaaaaa 32486912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9484156 - 9483936
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||| |||| || |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9484156 atacgcccattaatttttattaaagtgtgttttggcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta 9484057  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9484056 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcatttgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaa 9483957  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaag 257  Q
     ||||||||||||| ||||||    
T  9483956 atagttaaatacaccttaaag 9483936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23545014 - 23544832
Alignment:
Q  51 ttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtggg 150  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  23545014 ttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtggg 23544915  T
Q  151 tgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  23544914 tgtatgttagcaactcctatagacatttgttagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaa 23544832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Original strand, 36899700 - 36899897
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacac--cttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36899700 acacctactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 36899799  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36899800 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctatacgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 36899897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 66 - 288
Target Start/End: Original strand, 25123368 - 25123589
Alignment:
Q  66 ttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaact 165  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| ||| ||||||||||||||     
T  25123368 ttttagtaaagatataactaaaaaattgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taaatggttgtatgttagcaacg 25123466  T
Q  166 cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||   |||||||    
T  25123467 cctatagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatgcacctgaagacgtagctt 25123566  T
Q  266 gctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  25123567 gctaaaacactctcacataaaaa 25123589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 269
Target Start/End: Original strand, 13290457 - 13290688
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||| |||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13290457 atacatccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaaaataaaattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacagacattcta 13290556  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||| |||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13290557 aaaaa-taagtggatgtatgttagcaactcttacatgcatttgttagaatacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 13290655  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgcta 269  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  13290656 gtagttaaatgcactttaaggtgtagcttgcta 13290688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29125883 - 29125669
Alignment:
Q  99 tacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttat 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||       ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  29125883 tacaccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaa-taagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacctat 29125785  T
Q  199 tttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggt 298  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  29125784 tttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggt 29125686  T
Q  299 gtgttctatcaaatcct 315  Q
    |||||||| ||||||||    
T  29125685 gtgttctagcaaatcct 29125669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45299822 - 45299568
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45299822 atacatccattaatttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaa-gttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 45299724  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  45299723 aaaaa-taagtgggtgtatgctagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaaattataattaaaaa 45299625  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatg 294  Q
     |||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  45299624 atagtgaaatgcac-ttaaggtgtagcttgctcaaacactcccacataaaaactaatg 45299568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 39934590 - 39934360
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctag 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  39934590 taaaaagttgttaaatataccttaatgtgaatgttgctaaaacactcatttaaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgctag 39934491  T
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgt 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| ||  |    
T  39934490 aatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaggtagttaaatacaccctaaggtgtaacttgataaaacactcccaaat 39934391  T
Q  284 aaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  39934390 aaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcct 39934360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 9413778 - 9414044
Alignment:
Q  46 ctagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaa 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||       |||    
T  9413778 ctagtttttattaaggtgtattttagcaaaaatataactaaaaaattgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaactcaccttctaacaaa-taa 9413876  T
Q  146 gtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaa 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| |||||||| | | ||    
T  9413877 gtggatgtatgttagcaactcctatagacatttgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagttataattaaaaagtcggtgaa 9413976  T
Q  246 tacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    || |  |||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || ||| | |||||||| |||||||    
T  9413977 tataacttaaggtgtagcttgctaaaacactcctacataaaaactagtga-gcgtgttctagcaaatcc 9414044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Original strand, 17691176 - 17691337
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17691176 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct- 17691274  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt 199  Q
          ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17691275 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctatagacatttgttataatacacccacttatt 17691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 35066966 - 35067159
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattc-tnnnnnn 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |          
T  35066966 ccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaatatataattaaaaagttgttaattacaccttaagataaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaa 35067065  T
Q  142 ntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  35067066 ataagtgggtgtatgttagcaactcctttaggtatttgctagaatacgcccacttatttttttagaaggtgtgctttagcaagttataactaaa 35067159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 39922510 - 39922359
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  39922510 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacacattct- 39922412  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaataca 189  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  39922411 aaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggataca 39922359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1282010 - 1281844
Alignment:
Q  147 tgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaat 246  Q
    |||||| | |||||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1282010 tgggtgcaagttagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaatgtagttaaat 1281911  T
Q  247 acacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  1281910 acactttaaggtgtaacttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 1281844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Original strand, 42556643 - 42556736
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42556643 atacacccactagtttttattagggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 42556736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44874264 - 44874128
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  44874264 taagtgggtgtatgttaacaactcctacagacaattgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgtttcaccaacttataactaaaaagtagtt 44874165  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctc 279  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  44874164 aaatacaccttaagatgtagcttgttaaaacactctc 44874128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7090058 - 7089934
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||    
T  7090058 actagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaata 7089959  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactccta 169  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  7089958 agtgtgtgtatgttaacaactccta 7089934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 9483612 - 9483884
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  9483612 acacccactagtttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 9483710  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  9483711 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 9483810  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  9483811 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaatactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 9483884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19971665 - 19971412
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||       
T  19971665 acacccactagtttttatgttggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaa 19971567  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        ||||||||||| |  || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  |||||||||||     
T  19971566 aaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaa 19971467  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19971466 tggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaatta 19971412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 1782965 - 1783173
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  1782965 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 1783063  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  1783064 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagtgaataactaaaaag 1783163  T
Q  238 tagttaaata 247  Q
    | ||||||||    
T  1783164 tggttaaata 1783173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 188
Target Start/End: Original strand, 25123646 - 25123770
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  25123646 gtgttttagcatagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-aaaaaataagtgggtgtatgttaaca 25123744  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatac 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  25123745 actcttataaacatttgctagaatac 25123770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14826501 - 14826275
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||| ||||| |  |||||    
T  14826501 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtaggtgtgttctagca 14826403  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  14826402 aatcctataagcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgaatatttttgcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 14826303  T
Q  262 gc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  14826302 gctttgctaaaacactcccacataaaaa 14826275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23161405 - 23161315
Alignment:
Q  187 acacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23161405 acacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagcttgctaaaacactc 23161315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Original strand, 31071517 - 31071783
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||       
T  31071517 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaa 31071615  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  31071616 aaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaag 31071714  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  31071715 tggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 31071783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34970034 - 34969938
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34970034 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataaccaaaaagttattaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt 34969938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Original strand, 21021186 - 21021401
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||       ||||||||||| |  || ||| |||||||  ||||    
T  21021186 tataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatt 21021285  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  21021286 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacac 21021385  T
Q  276 tctcacgtaaaaatta 291  Q
    || ||| |||||||||    
T  21021386 tcccacataaaaatta 21021401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29377971 - 29377880
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29377971 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacac 29377880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 21442091 - 21442363
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || ||||||||| || | ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  21442091 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagtaa-gttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 21442189  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  21442190 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacc-acttgttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 21442288  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  21442289 gtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 21442363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7977337 - 7977241
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt 133  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7977337 atacatccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttattaaatatactttaaggtgaatgtggctaaaacactcatt 7977241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23054053 - 23053922
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataatt---aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23054053 atacacccactactttttattaaggcgtgttttagcaaatatacaacttataaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacgcatt 23053954  T
Q  134 ctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactc 166  Q
    ||       ||||| ||||||||||||||||||    
T  23053953 ct-aaaatataagtaggtgtatgttagcaactc 23053922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Original strand, 32512112 - 32512269
Alignment:
Q  156 gttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||   | |||||||||||||   |||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  32512112 gttagcaactcttataggcatttgctataatacatttatttattttttagaatgagtgttttagcaaatgataaataaaaaatagttaaatacatcttaa 32512211  T
Q  256 agtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  32512212 agtgtagcttgctaaaacactctcacataaaaactagtg-gatgtgttctaacaaatcc 32512269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 288
Target Start/End: Original strand, 42556759 - 42556873
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaac 273  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  42556759 catttgctaggatacactcacttatttttttgaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagcagtgaaatgtaccttaaggtgtagcttgctaaaac 42556858  T
Q  274 actctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||| || ||||||    
T  42556859 actcttacataaaaa 42556873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Original strand, 41942823 - 41943091
Alignment:
Q  40 cacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnn 139  Q
    ||||| |||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||        
T  41942823 cacccgctagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaa 41942921  T
Q  140 nnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagt 238  Q
        ||||||| || |  |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  41942922 aac-aagtggg-gtgttctagcaaatcctataggcatt-gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 41943018  T
Q  239 agttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  41943019 ggttaaatacactttaaggtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-gatgtgttctagcaaa 41943091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Original strand, 30577855 - 30578085
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn-taagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        || |||||||| |  ||||    
T  30577855 gtgttttagcaa-gttataactgaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtgggtgtgttctagc 30577953  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || | |||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||   || ||||| || || | |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  30577954 aaattctataggcatttgctaggatacacccgcttattttttagaatgagtattttagcaggtgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgt 30578053  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30578054 agctttgctaaaacactcccacataaaaatta 30578085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 106
Target Start/End: Original strand, 17883927 - 17883996
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacacctt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17883927 atacacccactagtttttgttaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgtaaaatacacctt 17883996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23053913 - 23053813
Alignment:
Q  210 tgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatca 309  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||    
T  23053913 tgtgttttagcaagatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagca 23053815  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  23053814 aa 23053813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5642702 - 5642482
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctag 183  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||||     |||| |||||||  ||||||||||    
T  5642702 taaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtgta-----gcaaatcctataggcatttgctag 5642608  T
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcac 281  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||   | ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  5642607 aatacacccactttttttgtaggag---tattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacactcccac 5642511  T
Q  282 gtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  5642510 ataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaa 5642482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5644643 - 5644423
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctag 183  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||||     |||| |||||||  ||||||||||    
T  5644643 taaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataacaagtgggtgta-----gcaaatcctataggcatttgctag 5644549  T
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcac 281  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||   | ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  5644548 aatacacccactttttttgtaggag---tattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacactcccac 5644452  T
Q  282 gtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  5644451 ataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaa 5644423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Original strand, 17884005 - 17884111
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| || |||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  17884005 taagtggatgtaagttagcaactcccacaagcatttgttaaaatacatccacttattttttagaatgagtgttttaacacgtcataactaaaaagtagct 17884104  T
Q  243 aaataca 249  Q
    |||||||    
T  17884105 aaataca 17884111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17952691 - 17952615
Alignment:
Q  212 tgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17952691 tgttttagcaaattataactaaaaagtagttaaatacaccctaaaatgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 17952615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 272
Target Start/End: Original strand, 18804868 - 18804984
Alignment:
Q  156 gttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    ||||||||||  ||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||   | ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18804868 gttagcaacttttatagccatttgttagaataaacccacatattttttagaaggactattttaacaaatgataactaaaaagtagttaagtacaccttaa 18804967  T
Q  256 agtgtagcttgctaaaa 272  Q
     || |||||||||||||    
T  18804968 ggtatagcttgctaaaa 18804984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21352362 - 21352255
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtta 243  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  21352362 aagtgggtatacgttagcaacttctgtaagcatatgctataatacacccacttattttttagaaggggtattttaacaaatgataattaaaaaatagtta 21352263  T
Q  244 aatacaca 251  Q
    | ||||||    
T  21352262 agtacaca 21352255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 25281053 - 25281184
Alignment:
Q  180 ctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25281053 ctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtgcttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 25281152  T
Q  278 tcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     ||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||    
T  25281153 acacataaaaattact--ggtgtgttctagcaaa 25281184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29126206 - 29126156
Alignment:
Q  51 ttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29126206 ttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatac 29126156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4018770 - 4018675
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4018770 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 4018675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 314
Target Start/End: Original strand, 36901237 - 36901323
Alignment:
Q  227 taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||| || |||||||    
T  36901237 taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttttagcaaatcc 36901323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 314
Target Start/End: Original strand, 42556441 - 42556570
Alignment:
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacg 282  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| | |||     
T  42556441 aatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatcttgctaaaacac-cccaca 42556539  T
Q  283 taaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  42556540 taaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 42556570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 29377561 - 29377728
Alignment:
Q  66 ttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaact 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | | ||||||||||||  |||| |        |||||| |||| ||||||||||    
T  29377561 ttttagcaaaaatataattaaaaagtggttaaatacacctataggcgcaggttgctaaaacagtcatt-ttgaaaaacaagtggttgtaagttagcaact 29377659  T
Q  166 cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||  || |||||||| |  |||||||||||    
T  29377660 cctacaaacatttgctag--tacacctagttatcttttagaaggagtattttaacatgcgataactaaaaa 29377728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3154304 - 3154209
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  3154304 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 3154209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 10776927 - 10777027
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  10776927 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgtattaacaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaaca 10777026  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  10777027 c 10777027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26043029 - 26042939
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  26043029 atacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 26042939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29377980 - 29377842
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| |||||||||  || | ||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  29377980 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaaca 29377881  T
Q  275 ctctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||| ||| |||||| | | | ||||||||||| |||||||    
T  29377880 ctcccacataaaaact-agggggtgtgttctagcaaatcc 29377842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21442466 - 21442416
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaag 208  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21442466 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaag 21442416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29125777 - 29125708
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29125777 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 29125708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 1201621 - 1201721
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  1201621 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaaca 1201720  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  1201721 c 1201721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 1775630 - 1775535
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| ||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  1775630 acacccactagtttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 1775535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 14819270 - 14819365
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  14819270 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 14819365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23053914 - 23053848
Alignment:
Q  61 gtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  23053914 gtgtgttttagcaa-gatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagcttgctaaaacac 23053848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3154154 - 3154069
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  3154154 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 3154069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21352469 - 21352419
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||    
T  21352469 gtgttttaacaagttataactaaaaattcgataaatacacattaaggtgta 21352419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 25128000 - 25128069
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  25128000 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 25128069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 276
Target Start/End: Original strand, 35067345 - 35067394
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35067345 ataactaaaaagtagttaaaaacac-ttaaggtgtagcttgctaaaacact 35067394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 18804323 - 18804380
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  18804323 tataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataagacaccttct 18804380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 218
Target Start/End: Original strand, 45299698 - 45299739
Alignment:
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45299698 ttgctagcatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 45299739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3154316 - 3154216
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  3154316 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 3154217  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  3154216 c 3154216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 10616243 - 10616343
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |  |||||||||||    
T  10616243 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaaca 10616342  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  10616343 c 10616343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 17691167 - 17691267
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  17691167 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 17691266  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  17691267 c 17691267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 25280959 - 25281054
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||||| ||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  25280959 acacccactagtttttatgtgagagtgttttaacaaat-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttct 25281054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 250
Target Start/End: Original strand, 30400533 - 30400569
Alignment:
Q  214 ttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacac 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30400533 ttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacac 30400569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23161383 - 23161317
Alignment:
Q  61 gtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23161383 gtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagcttgctaaaacac 23161317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30577867 - 30577817
Alignment:
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  30577867 cttgctaaaacactctcacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaatcc 30577817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1281951 - 1281882
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  1281951 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaatgtagttaaatacactttaaggtgtaacttgctaaaacac 1281882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33568156 - 33568106
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaa 89  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  33568156 acaccaactagtttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaa 33568106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 184184 - 184151
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  184184 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 184151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1201747 - 1201714
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1201747 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 1201714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10616369 - 10616336
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10616369 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 10616336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17691293 - 17691260
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17691293 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 17691260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17884163 - 17884126
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaa 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17884163 atacacccactagtttttatgaagatgtgttttagcaa 17884126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 250
Target Start/End: Original strand, 18804307 - 18804348
Alignment:
Q  209 atgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacac 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  18804307 atgtgttttaacaagttataattaaaaagttgataaatacac 18804348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26630107 - 26630074
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26630107 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 26630074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Original strand, 42556484 - 42556533
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  42556484 ataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatcttgctaaaacac 42556533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 44873176 - 44873139
Alignment:
Q  66 ttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacac 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44873176 ttttagcaaagatataactaaaaagtagttaaatacac 44873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1775606 - 1775542
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  1775606 gtgttttaacaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 1775542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 1782989 - 1783053
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  1782989 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 1783053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2823846 - 2823746
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||  ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |  |||||||||||    
T  2823846 tttgctaggatacacccactaatttttattaaagtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaaca 2823747  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  2823746 c 2823746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3210943 - 3210903
Alignment:
Q  51 ttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3210943 ttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataattaaaaagt 3210903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4018746 - 4018682
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  4018746 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 4018682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5643143 - 5643083
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||  |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  5643143 atttgatagaatacacccactagtttttacgtggaagtgttttaacaagttataactaaaa 5643083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5645084 - 5645024
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||  |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  5645084 atttgatagaatacacccactagtttttacgtggaagtgttttaacaagttataactaaaa 5645024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 25280983 - 25281047
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  25280983 gtgttttaacaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacac 25281047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 27545712 - 27545812
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   |||  |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  27545712 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggcgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 27545811  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  27545812 c 27545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31071641 - 31071601
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31071641 atttgctagaacacacccacttgttttttagaaggtgtgtt 31071601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 34102952 - 34103052
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  34102952 tttgctaggatacacccgctagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 34103051  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  34103052 c 34103052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 39077371 - 39077319
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39077371 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 39077319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 42556634 - 42556734
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   | | ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  42556634 tttgctaggatacacccactagtttttattagggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 42556733  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  42556734 c 42556734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 34082525 - 34082800
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34082525 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcta 34082624  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34082625 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 34082723  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  34082724 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactaccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 34082800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Original strand, 11675110 - 11675348
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  11675110 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttcta 11675209  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttt-ttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11675210 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 11675308  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11675309 agtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 11675348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16513307 - 16513035
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  16513307 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttcta 16513208  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    ||| | ||| ||| |||||||||||||    
T  16513207 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagg---tgtatgttagcaaattataactaaaaa 16513112  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  16513111 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacgtaaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 16513035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 314
Target Start/End: Original strand, 42849989 - 42850249
Alignment:
Q  52 tttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||       ||  |||||    
T  42849989 tttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaagaa-tagatgggt 42850087  T
Q  152 gtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaca 251  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42850088 gtatgttagcaattcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacc 42850187  T
Q  252 ttaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  42850188 ctaaagtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtattctagcaaatcc 42850249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Original strand, 18370190 - 18370464
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  18370190 atacacctactagtttttattaagatgtgttttaacaaagatataactaaaaaattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttcta 18370289  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18370290 aaaaa-taagtgggtgtatgttagaaactcttatagtcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaa 18370388  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  18370389 gtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 18370464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Original strand, 8386655 - 8386925
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  8386655 atacacccactagttttcattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactccttcta 8386754  T
Q  137 nnnnnntaagt-gggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt-agaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
             || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8386755 aaaaaagtggttgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagttataactaaa 8386854  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  8386855 aagtagttaaatacaccctaagatgtagcttgataaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttcta 8386925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23387363 - 23387153
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  23387363 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattct- 23387265  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  23387264 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagttataactaaaaa 23387165  T
Q  237 gtagttaaatac 248  Q
    ||||||||||||    
T  23387164 gtagttaaatac 23387153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 768781 - 768545
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaac-acacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  768781 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaaatacacattct 768682  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  768681 aaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagttataactaaaa 768583  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctca 280  Q
    |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  768582 agtagttaaatacac-------tgtagcttgctaaaacactctca 768545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13002258 - 13001984
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |      
T  13002258 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgaatgttgctaaaacactcct-cgt 13002160  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13002159 aaacaataagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtgataactaaaaa 13002060  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    || |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  13002059 gtggttaaatacaccctaaggtgtagcatgctaaaacactcccacataaaaattagt-cggtgtgttctagcaaatc 13001984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 37169515 - 37169789
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |     
T  37169515 atacacctactagtttttattaaggtgttttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactcctttta 37169614  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  37169615 aaaa--taagtgggtgtatgttagcaacccatataggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagttataactaaaaa 37169712  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  37169713 gtagttaaatacaccctaaggtgtagcttgttaagacactcccacataaaaattagtg-gatgtgttctagcaaatcc 37169789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29512313 - 29512073
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29512313 atacacctactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacattttatggtgaatgttgctaaaacacacattcta 29512214  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt--agaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
          ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29512213 gaaaa-taagtgggtatatgttagcaacttctatagacatttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaa 29512115  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29512114 aagtggttaaatacactttaaggtgtagcttgctaaaacact 29512073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 235
Target Start/End: Original strand, 33739505 - 33739702
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33739505 atacacccattagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct- 33739603  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  33739604 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaa 33739702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Original strand, 1576611 - 1576823
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  1576611 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttct- 1576709  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||    
T  1576710 gaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataatcatttgctaggatgcacccacttattttttagaatgtgtgttttaggaaattataactaaaaa 1576809  T
Q  237 gtagttaaatacac 250  Q
    ||||||||||||||    
T  1576810 gtagttaaatacac 1576823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1750398 - 1750150
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||||||| ||||||||||||    
T  1750398 gtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttc-caaaaaataagtgg-tgtatgttagca 1750301  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag 262  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  1750300 actcctacatgcatttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtag 1750201  T
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || |||||||    
T  1750200 cttgctaaaacactctcacctaaaaactagtg-ggtgtgttttagcaaatcc 1750150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075006
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacattt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcattt 16075139  T
Q  179 gctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactct 278  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  16075138 actaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgtagcttgctaaa--actct 16075041  T
Q  279 cacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     || |||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  16075040 tacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaatcc 16075006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Original strand, 23664732 - 23664960
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||| || |||||||||||||    
T  23664732 gtgttttagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacattttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaataaatgagtgtatgttagca 23664831  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag 262  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||    
T  23664832 actcctataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagttaaatacactttaagatatag 23664931  T
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  23664932 cttgctgaaacactcacaagtaaaaatta 23664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 41528132 - 41527927
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |     
T  41528132 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttaacaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatattgctaaaacactcatt-tt 41528034  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41528033 aaaaaataagtgggtgtacgttagcaacttatatagacatttgctataatacacccacttacttttttagaatgtgtgttttaacaagttataactaaaa 41527934  T
Q  236 agtagtt 242  Q
    |||||||    
T  41527933 agtagtt 41527927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 7681979 - 7682228
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||| ||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  7681979 acacccattagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaa 7682077  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  7682078 aaaagaagtgggtgtattttagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactt-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 7682176  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  7682177 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 7682228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44543081 - 44542809
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  44543081 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 44542983  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||  ||    
T  44542982 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaggag 44542883  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  44542882 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 44542809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Original strand, 6332274 - 6332522
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||    
T  6332274 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagca 6332372  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  6332373 aatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 6332472  T
Q  262 gc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  6332473 gctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 6332522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Original strand, 32601349 - 32601447
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32601349 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataacaaaaaagttgttaagtataccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 32601447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 39906243 - 39906516
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  39906243 acacccactaatttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 39906341  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  39906342 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 39906441  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  39906442 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 39906516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 22711007 - 22711279
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||       
T  22711007 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaa 22711105  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        ||| ||||||| |  || ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||  || |  ||||||||||||    
T  22711106 aaaataaatgggtgtgttataacaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagtaaataaataactaaaaag 22711205  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22711206 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 22711279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 30406435 - 30406707
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  30406435 acacccactagtttttatgtgagagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaa 30406533  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  30406534 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcacttgctacaatacacccacttattttttagatggagtattttagcaaatcaataactaaaaag 30406633  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  30406634 tggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagt-aggtgtgttctagcaaa 30406707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 9689349 - 9689600
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||| |||||||||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  9689349 acacccgctagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 9689447  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          ||||| ||||||  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  || ||||||||    
T  9689448 aaaaacaagtgagtgtattctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaattactaaaaa 9689547  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  9689548 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 9689600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 290
Target Start/End: Original strand, 17265338 - 17265481
Alignment:
Q  147 tgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaat 246  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| | |||||||| |||||||||| |    
T  17265338 tgggtgtacgttatgaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgataactaagaagtagttaagt 17265437  T
Q  247 acacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaatt 290  Q
    |||| |||| |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17265438 acaccttaaggtgatgcttgctaaaacactcccacataaaaatt 17265481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 78 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33173692 - 33173478
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||        ||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||    
T  33173692 tataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttc-caaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatt 33173594  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  33173593 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaacac 33173494  T
Q  276 tctcacgtaaaaatta 291  Q
    || ||| |||||||||    
T  33173493 tcccacataaaaatta 33173478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 277
Target Start/End: Original strand, 20939686 - 20939923
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    ||||||||||||||||   |  || ||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||         
T  20939686 acccactagtttttatgtggaagtattttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaata 20939784  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagta 239  Q
       |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  |||||||||||||     
T  20939785 aacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 20939884  T
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20939885 gttaaatacatcttaaggtgtagctttgctaaaacactc 20939923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Original strand, 15554020 - 15554271
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||        || ||||||| |  |||||    
T  15554020 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaacaaatgggtgtgttctagca 15554118  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||| | | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  15554119 aatcctattgacatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagttattaaatacaccttaaagtgta 15554218  T
Q  262 gc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     | |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||    
T  15554219 actttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-gatgtgttctagcaaatcc 15554271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29404118 - 29403914
Alignment:
Q  100 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||       |||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29404118 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctagaaaa-taagtgggtgtaagttagcaactctcacaagcatttgctaaaatacacccacttatt 29404020  T
Q  200 ttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtg 299  Q
    ||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||| | ||| ||| |||  ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||    
T  29404019 ttttagaatgagtgttttagcaaatgataactaaaaaatggttcaatgcaccctaaggtgtagcttgctaaaatactcccacataaaaactagtg-ggtg 29403921  T
Q  300 tgttcta 306  Q
    |||||||    
T  29403920 tgttcta 29403914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2586558 - 2586348
Alignment:
Q  95 taaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccac 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       ||||| ||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  2586558 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagttggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctac 2586459  T
Q  195 ttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaa 292  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||     
T  2586458 ttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataacaaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattag 2586359  T
Q  293 tgaggtgtgttc 304  Q
    || |||||||||    
T  2586358 tg-ggtgtgttc 2586348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 287
Target Start/End: Original strand, 22301952 - 22302201
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| ||||       
T  22301952 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaa 22302049  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   || ||||| |||||  |||||||||||    
T  22302050 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 22302149  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaa 287  Q
    || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  22302150 gtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaacactcccacataaaa 22302201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Original strand, 4293178 - 4293431
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||| ||||||||||  | | |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  4293178 acacccattagtttttatgtaagagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaa 4293276  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  4293277 aaaacaagtgggtgtgttatagcaaattatataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaag 4293376  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    |  ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  4293377 tgattaaatacaccctaagatgtagctttgctaaaacactcctacataaaaatta 4293431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38987192 - 38986952
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||| ||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  38987192 acacccattagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaca 38987094  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||  || |||||||||||  |||||||||||    
T  38987093 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttacattttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaa 38986994  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38986993 ttggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 38986952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44257692 - 44257434
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||       
T  44257692 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaa 44257594  T
Q  139 nnnnt--aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaa 235  Q
           |||||||||| |  || ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||    
T  44257593 aaaaagcaagtgggtgtgttctaacaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaa 44257494  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatg 294  Q
    | | ||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  44257493 aatggttcaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactaatg 44257434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39435267 - 39435169
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39435267 atacacccactggtttttattaagccatgttttagcaaagatataattaaagagttgttaaatacaatttaagatgaatgttgttaaaacacacattct 39435169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 311
Target Start/End: Original strand, 9690171 - 9690404
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacattt 178  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        ||||| |||| |  |||||| || ||||  |||||    
T  9690171 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcttataggcattt 9690270  T
Q  179 gctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| ||| ||||| |||    
T  9690271 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgttaaaatact 9690370  T
Q  277 ctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  9690371 cccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 9690404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Original strand, 29511941 - 29512022
Alignment:
Q  54 tattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29511941 tattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttct 29512022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23387176 - 23387063
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatac-accttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23387176 tataactaaaaagtagttaaatacgaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 23387078  T
Q  177 ttgctagaatacacc 191  Q
    ||||||| |||||||    
T  23387077 ttgctaggatacacc 23387063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Original strand, 45629694 - 45629788
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgtttt-agcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45629694 atacacccactagtttttatgtgggagtgtttttaccaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacac 45629788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3769552 - 3769412
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  3769552 catttgctagaacacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 3769453  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
     ||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  3769452 gcactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 3769412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39904863 - 39904620
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  39904863 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 39904765  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  39904764 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 39904665  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    ||| ||||| |||||||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  39904664 agctttgct-aaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 39904620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44288976 - 44288758
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   | ||     
T  44288976 atacacccagtagtttttattaaaatgtattttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttactaacacac---tccta 44288880  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| ||||| ||  ||| |||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |    | |||||||||||||    
T  44288879 aaaaaataaatgggtata-cttaacaactcatataggcatttgctaaaatactcccacttattttttagaag--gtgttat----acttataactaaaaa 44288787  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
     |||||||||||||  ||| |||||||||    
T  44288786 atagttaaatacaccctaaggtgtagctt 44288758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 281
Target Start/End: Original strand, 324996 - 325105
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  324996 catttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaa 325095  T
Q  272 acactctcac 281  Q
    ||||||||||    
T  325096 acactctcac 325105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Original strand, 21545844 - 21545932
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaa 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  21545844 atacaccaactagtttttattaaggtgcgttttaacaaagatataactaaaatattgttaaatacatcttaatgtgaatgttgttaaaa 21545932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24755235 - 24755176
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttt 202  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24755235 taagtgggtgtatattagcaagtcctataaatatttgctaaaatacacccacttattttt 24755176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 11675279 - 11675350
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11675279 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacacac 11675350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 43660898 - 43660810
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaa 125  Q
    ||||||||| | ||||||  | ||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43660898 atacacccaattgttttttatgaggagtattttaggaaagatataactaaaaagtggttaaatacaccttgaggtgcatgttgctaaaa 43660810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20940104 - 20940066
Alignment:
Q  85 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20940104 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaa 20940066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Original strand, 33740105 - 33740186
Alignment:
Q  231 taaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  33740105 taaaaagtagttaaatgtaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 33740186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41527901 - 41527820
Alignment:
Q  232 aaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  41527901 aaaaagtagttaaatacactctaaggtgtagttttctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 41527820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23387373 - 23387272
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaac 273  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||    
T  23387373 atttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaac 23387274  T
Q  274 ac 275  Q
    ||    
T  23387273 ac 23387272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 1297564 - 1297659
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||| |||||||||||||   || |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  1297564 acactcactagtttttatacgggagtgttttagcaaat-tataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 1297659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 249
Target Start/End: Original strand, 29513923 - 29513962
Alignment:
Q  210 tgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaataca 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29513923 tgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaataca 29513962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 75
Target Start/End: Original strand, 17528492 - 17528530
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaa 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17528492 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaa 17528530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Original strand, 324742 - 324791
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  324742 gtgttttaacaaaaatataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 324791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23234097 - 23234009
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagctt-gctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   | | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  23234097 ataactaaaaagtggttaaatacatcctgaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagt-aggtgtgttctaacaaatcc 23234009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3769773 - 3769702
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  3769773 gtgttttagcaa-gttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 3769702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 11675101 - 11675201
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  11675101 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaaca 11675200  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  11675201 c 11675201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 19630726 - 19630821
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  19630726 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagc-aagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttct 19630821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 19827627 - 19827722
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  19827627 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagc-aagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttct 19827722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 34082516 - 34082616
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  34082516 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 34082615  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  34082616 c 34082616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41528139 - 41528039
Alignment:
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || |  |||||||||||||    
T  41528139 tgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttaacaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatattgctaaaacact 41528040  T
Q  277 c 277  Q
    |    
T  41528039 c 41528039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1750257 - 1750188
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  1750257 aaggtgtgttttagtaa-gttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 1750188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16513316 - 16513218
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaac 273  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  16513316 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaac 16513218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 23387246 - 23387284
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23387246 atacacccacttattttttagaatgtgtgttttaacaag 23387284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 275
Target Start/End: Original strand, 29511949 - 29512015
Alignment:
Q  210 tgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||    
T  29511949 tgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacac 29512015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 6533110 - 6533081
Alignment:
Q  50 tttttattaaggtgtgttttagcaaagata 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6533110 tttttattaaggtgtgttttagcaaagata 6533081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10137287 - 10137254
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtg 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10137287 ataactaaaaagtggttaaatacacattaaagtg 10137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16075132 - 16075044
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaac 126  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  16075132 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgtagcttgctaaaac 16075044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Original strand, 17264903 - 17264963
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaata 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||    
T  17264903 acacccactagtttttatgtaggagtgttttagcaaa-ttataactaaaaagttgataaata 17264963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 33739496 - 33739596
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttag-aagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaac 273  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  33739496 tttgctaggatacaccca-ttagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaac 33739594  T
Q  274 ac 275  Q
    ||    
T  33739595 ac 33739596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33739622 - 33739589
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33739622 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 33739589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 277
Target Start/End: Original strand, 8741656 - 8741708
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8741656 ataactaaaaagtggttaaatatactttaaggtgtagctttgctaaaacactc 8741708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12725802 - 12725750
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12725802 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 12725750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 112
Target Start/End: Original strand, 29513917 - 29513972
Alignment:
Q  56 ttaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  29513917 ttaaggtgtgttttagc-aagttataactaaaaagtagttaaatacattttaaggtg 29513972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Original strand, 33173606 - 33173646
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33173606 atttgctagaacacacccacttattttttggaaggtgtgtt 33173646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 311
Target Start/End: Original strand, 39904851 - 39904898
Alignment:
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  39904851 cttgctaaaacactctcacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaa 39904898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 939132 - 938857
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  939132 atacacccactactttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 939033  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  939032 aaaag-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 938934  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  938933 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 938857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25818722 - 25818447
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  25818722 atacacctactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt 25818623  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25818622 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 25818523  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  25818522 gcagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 25818447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28912319 - 28912052
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28912319 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcta 28912220  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28912219 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 28912121  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  || |||||| || ||| ||||||||||    
T  28912120 gtagttaaatacaccttaaggcgtagcttgctaaaacactcctacataaaaactagtga-gtgtgttcta 28912052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41407577 - 41407307
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||       
T  41407577 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatacaactaaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaa 41407478  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41407477 ata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 41407379  T
Q  239 agttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  41407378 agttaaatacaccttaatgtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactaat-aggtgtgttctagcaaa 41407307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 18352274 - 18352525
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  18352274 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagtgaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctt 18352373  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18352374 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 18352473  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18352474 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgttaaaacactcccacataaaaa 18352525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11766358 - 11766085
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  11766358 atacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattcta 11766259  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11766258 aaaaa-taagtggacgtatgttagcaactcttatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 11766160  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  11766159 gtagttaaata-aatttaaggtgtagcttgctaaaacactc-cacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 11766085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19069633 - 19069360
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19069633 atacaccaactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 19069534  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19069533 aaata-taagtgggtttatgttagcaactcctatagctatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataattaaaaa 19069435  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  19069434 ctagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcttacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaat 19069360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 38367815 - 38368090
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||     
T  38367815 atacacccaccagtttttattaaagtgtattttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttcta 38367914  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38367915 aaaaa-taagtgggtgtatgttgacaactcctataggcatttgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 38368013  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38368014 gtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 38368090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 454338 - 454064
Alignment:
Q  40 cacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnn 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||        
T  454338 cacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaa 454239  T
Q  140 nnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagta 239  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  454238 aa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagttttaactaaaaagta 454140  T
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcctt 316  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  454139 gttaattacaccttaagatgtagcttgctaaaacactcctacataaaaaatagtg-ggtgtgttctagcaaatcctt 454064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 275
Target Start/End: Original strand, 15957181 - 15957410
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||       ||    
T  15957181 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttctaaaaa--ta 15957278  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttt-ttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtta 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15957279 agtgggtgtatgttaacaactcctatagacatttgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtta 15957378  T
Q  244 aatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15957379 aatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 15957410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 2509280 - 2509518
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2509280 atacactcactaatttctattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcta 2509379  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2509380 aagaa-taagtgggtgtatgttaacaactcctatatgcatttgctagaatacacccacttattttt-agaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 2509477  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    || |||||||  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  2509478 gtggttaaatgtaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 2509518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 265
Target Start/End: Original strand, 9401615 - 9401842
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  9401615 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttct- 9401713  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9401714 aaaatataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgttataattaaaaa 9401813  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  9401814 gtagttaaatataccttaaggtgtagctt 9401842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2936878 - 2936603
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  2936878 atacaccctctaatttttattaaggtgtgttgtagcaaatatataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttcta 2936779  T
Q  137 nnnnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2936778 aaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcctattggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 2936680  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  2936679 agtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcaaacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaatc 2936603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 38796781 - 38797059
Alignment:
Q  36 tatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  38796781 tatacactcattagtttttattaagatgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaagcattcattct 38796880  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataact-aaa 234  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  38796881 aaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagttataactaaaa 38796980  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    || ||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||  | || ||||||||||| |||||||    
T  38796981 aaatagttaattacaccctaaggtgtaacttgctaaaacacttccacataaaaacaagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 38797059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6559591 - 6559320
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  6559591 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---- 6559496  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||||||    
T  6559495 aaaaaataagtgggtgtatgttaacaactcatataggcatttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagttataactaaaaa 6559396  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| || || ||||||||||| ||||||    
T  6559395 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacatcaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 6559320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 6736472 - 6736720
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    ||      
T  6736472 atacacccactagtttttactaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaactacaccttaaggtgaatattgctaaaacac----tcct 6736567  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttt-ttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6736568 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaa 6736667  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  6736668 agtagttaagtacaccttaaggtgtagcttactaaaacactcccacataaaaa 6736720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2362981 - 2362739
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||           
T  2362981 ccactaggttttattaaattgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaa 2362882  T
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2362881 taagtggatgtatgttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttatcactaaaaagtagtt 2362785  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||| |||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2362784 aaatacaccttaaggtataacttgctaaaacactcccacataaaaa 2362739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 2633855 - 2634085
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||         
T  2633855 acccagtagtttttattaagatgtgttttagcatagatataacgaaaaagttgttaaatacaccttacgatgaatattgctaaaacacacattctagaaa 2633954  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtag 240  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2633955 aataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttt---aggtgtgttttagcaagttataaccaaaaagtag 2634051  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  2634052 ttaaatgcaccttaaggtgtagcttgttaaaaca 2634085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 27168217 - 27168487
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27168217 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagcaa-----taattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 27168311  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaact-cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||  || ||| | ||||||   | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27168312 aaaaa-taagtgggtgtatcctaccaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 27168409  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  27168410 agtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcacacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 27168487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23740263 - 23740063
Alignment:
Q  50 tttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgg 149  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||       ||||||     
T  23740263 tttttattaatgtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatattgttaaaacactccttctaaaaaa-taagtgt 23740165  T
Q  150 gtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt-agaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatac 248  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23740164 gtgtatgttagcaactcctataggcatttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtggttaaatac 23740065  T
Q  249 ac 250  Q
    ||    
T  23740064 ac 23740063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41037558 - 41037320
Alignment:
Q  75 agatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaac 174  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  41037558 agatataacgaaaaatttgttatatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaataagtgagtgtaagttagcaactcctataggc 41037459  T
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41037458 atttgctaaaatacacccagttatatttaagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaaca 41037359  T
Q  275 ctctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     || ||| |||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  41037358 ttcccacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatcc 41037320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27812178 - 27811906
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||       
T  27812178 acacccactagtttttatatgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaa 27812080  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||    
T  27812079 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctgtaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaag 27811980  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  27811979 tagttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 27811906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12080935 - 12080685
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  12080935 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 12080837  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        ||||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  12080836 aaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaag 12080737  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12080736 tggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 12080685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15230300 - 15230051
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||       
T  15230300 acacccactagtttttatgt-ggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaa 15230203  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  15230202 caaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 15230103  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  15230102 tggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 15230051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20517157 - 20516884
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  20517157 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaat-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 20517059  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  |||||||||||    
T  20517058 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaa 20516959  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  20516958 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctaacaaa 20516884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24720497 - 24720230
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||       
T  24720497 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaa 24720399  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        ||| ||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  24720398 aaaataaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaaaag 24720299  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||    
T  24720298 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaattagtg-ggtgtgttcta 24720230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14778161 - 14777913
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||       
T  14778161 acacccactagtttttatgt-ggagtgttttagcaa-gttataactaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaa 14778065  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  14778064 caaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 14777965  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  14777964 tggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 14777913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32853093 - 32852888
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  32853093 acacccactagtttttatgtgggaatgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 32852995  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  32852994 aaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 32852895  T
Q  238 tagttaa 244  Q
    | |||||    
T  32852894 tggttaa 32852888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11327833 - 11327594
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  11327833 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 11327735  T
Q  139 nnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
         ||||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  11327734 aaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 11327635  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    || ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||    
T  11327634 gtggttaaatacaccttaaggtatagctttgctaaaacact 11327594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Original strand, 8047934 - 8048197
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |       
T  8047934 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaa 8048032  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        |||||| || |||   ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  8048033 aaaataagtgtgt-tat---agcaaatcctacagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaag 8048128  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  8048129 tggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttcta 8048197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Original strand, 38876152 - 38876401
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  38876152 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 38876250  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  38876251 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgt 38876350  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  38876351 agctttgttaaaacactcccatataaaaattagtga-gtgtgttctagcaaa 38876401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 186 - 291
Target Start/End: Original strand, 3512711 - 3512816
Alignment:
Q  186 tacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3512711 tacacccacttattttttagaagatgtgttttagtaagttataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataa 3512810  T
Q  286 aaatta 291  Q
    ||||||    
T  3512811 aaatta 3512816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 311
Target Start/End: Original strand, 14718961 - 14719226
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| |||||  ||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |    
T  14718961 actagtttttatataggagtgttttagcaa-gttataactaaaattttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaca 14719059  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtta 243  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14719060 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggtta 14719159  T
Q  244 aatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  14719160 aatacacctt-aagtgtagctttgctaaaagactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 14719226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45225378 - 45225224
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtt-ataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  45225378 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 45225279  T
Q  257 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  45225278 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 45225224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 314
Target Start/End: Original strand, 48454505 - 48454781
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||| || | ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||       
T  48454505 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagtaa-gttataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaa 48454603  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  | |||||||||    
T  48454604 ataaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaagaactaaaaa 48454703  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    || ||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  48454704 gtggttaaatgcaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 48454781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45225630 - 45225403
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||       
T  45225630 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaa 45225532  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtt-ataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  45225531 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaa 45225432  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  45225431 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctt 45225403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22479442 - 22479185
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||        
T  22479442 acacccactagtttttatgtgggtgtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaa 22479344  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  22479343 aaaacaagtgggtgtgttctatcaaatcctatatacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaag 22479244  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgag 296  Q
    | ||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  22479243 tggttaaattcaccct-aagtgtagctttgctaaaacacttccacataaaaattagtgag 22479185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4655286 - 4655009
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaa----cacacattc 134  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    ||||| |||    
T  4655286 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttc 4655188  T
Q  135 tnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataacta 232  Q
    |         |||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  |||||||    
T  4655187 tagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctaaaatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataacta 4655088  T
Q  233 aaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  4655087 aaaagtggttaaatacatcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 4655009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28605677 - 28605405
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| | ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||       
T  28605677 acacccactagtttttatgagagaatgttttagcaa-gttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaa 28605579  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| | ||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  28605578 aaac-aagtgggtgtgttttagcaaattctataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 28605480  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    | |||||| |||| |||| ||||||| || ||||| ||||| ||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||||    
T  28605479 tggttaaacacaccttaaggtgtagctttactaaagcactcccacataaaaacta--gtggtgtgttctagcaaatc 28605405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34986762 - 34986488
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |       
T  34986762 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaa 34986664  T
Q  139 nnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
         ||||||  ||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  | |||||||||    
T  34986663 ataaataagtgaatgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagtgaagaactaaaaa 34986564  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    || |||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  34986563 gtggttaaatacac-ctaaagcgtaactttgctaaaacactctcacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 34986488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 208
Target Start/End: Original strand, 37138896 - 37139065
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-nn 137  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||       
T  37138896 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaa 37138994  T
Q  138 nnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaag 208  Q
         ||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37138995 aaaaataagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctaaaatacacccacttattttttagaag 37139065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43712084 - 43711898
Alignment:
Q  105 ttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt-tttt 203  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43712084 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatactatatacatttgctagaatatacccacttattttttt 43711985  T
Q  204 agaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  43711984 agaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaagtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaa 43711898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27168371 - 27168296
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27168371 taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 27168296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27597269 - 27596984
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||||| |||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  27597269 acacccactagtatttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 27597171  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaa-------------ctcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt- 224  Q
         |||||||||| |  ||||||              ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||| ||| |     
T  27597170 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttcctatagacatttgctagaatacatccacttattttttagaatgagtattttagcaaata 27597071  T
Q  225 tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  27597070 aataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactataacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 27596984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33889179 - 33889046
Alignment:
Q  179 gctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  33889179 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaggggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacact 33889080  T
Q  277 ctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |  || |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  33889079 ccgacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 33889046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 246
Target Start/End: Original strand, 18123080 - 18123250
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  18123080 tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 18123179  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaat 246  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||  ||||||||||||| |||||||    
T  18123180 ttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaat 18123250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48193285 - 48193117
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  48193285 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggtt 48193186  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||   ||  |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  48193185 aaatacaccccaagatgtagctttgctaaaatactcccatctaaaaattagtg-ggtgtgttctaacaaa 48193117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 289
Target Start/End: Original strand, 7437798 - 7438011
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||          |||||||||| |  ||| || |||||||  ||||    
T  7437798 ataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaaaacaagtgggtgtgttatagtaaatcctataggcatt 7437897  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  7437898 tgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaacccaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 7437997  T
Q  276 tctcacgtaaaaat 289  Q
    || ||| |||||||    
T  7437998 tcccacataaaaat 7438011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14770287 - 14770143
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||        ||||| |||| |  |||||    
T  14770287 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagca 14770189  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaag 208  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14770188 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaag 14770143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15220738 - 15220594
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||        ||||| |||| |  |||||    
T  15220738 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaacaagtgagtgtgttatagca 15220640  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaag 208  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15220639 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaag 15220594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18199655 - 18199532
Alignment:
Q  189 acccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaa 286  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18199655 acccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaa 18199556  T
Q  287 aattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || || || ||||||||||| ||||    
T  18199555 aactagtg-ggtgtgttctagcaaa 18199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 289
Target Start/End: Original strand, 1325335 - 1325442
Alignment:
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||    
T  1325335 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaatgcacgttaagatgtagctttgctaaaacactcccac 1325434  T
Q  282 gtaaaaat 289  Q
     |||||||    
T  1325435 ataaaaat 1325442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 7835347 - 7835409
Alignment:
Q  201 tttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc 263  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  7835347 tttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagc 7835409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 294
Target Start/End: Original strand, 26380155 - 26380293
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||   || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||     
T  26380155 tagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccgcttagtttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaacttaag 26380254  T
Q  257 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatg 294  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  26380255 gtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatg 26380293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32577675 - 32577615
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttta 204  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577675 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttatttttta 32577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 32577806 - 32577716
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32577806 acacccactagtttttatgtgggaatgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacac 32577716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18199809 - 18199720
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 129  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18199809 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactacaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacaca 18199720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18829932 - 18829839
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  18829932 acccactagtttttatatgggaatgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 18829839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 129
Target Start/End: Original strand, 15957341 - 15957411
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  15957341 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacaca 15957411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22479454 - 22479368
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  22479454 atttgctagaacacacccactagtttttatgtgggtgtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 22479368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44868099 - 44868037
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44868099 tttgctagaagacacccactaatttttatgaaagtgttttttaacaagttataactaaaaagt 44868037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 238
Target Start/End: Original strand, 24251875 - 24251948
Alignment:
Q  165 tcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| | | ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24251875 tcctataagcatttgctaaaagacaccaattaatttttatgaaggtgtcttttaacaagttataactaaaaagt 24251948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Original strand, 9401606 - 9401686
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9401606 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 9401686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28912328 - 28912228
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  28912328 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 28912229  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  28912228 c 28912228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 48193422 - 48193343
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgct 121  Q
    ||||| ||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  48193422 acccattagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgct 48193343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 939140 - 939041
Alignment:
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  939140 ttgctaggatacacccactactttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 939041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 24720352 - 24720277
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24720352 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtg 24720277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32577607 - 32577469
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttatttttt-agaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||  || ||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| ||||||||    
T  32577607 atttgctagaacacacccatttgtttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagttgttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaa 32577508  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||| ||  ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  32577507 acactcccatataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 32577469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 7835352 - 7835405
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  7835352 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtg 7835405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33889969 - 33889919
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  33889969 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgta 33889919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38367932 - 38367894
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38367932 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag 38367894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 454224 - 454261
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  454224 atacacccacttattttttagaatgtgtgttttaacaa 454261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 3512505 - 3512550
Alignment:
Q  82 attaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 127  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  3512505 attaaaaagttattaaatacatatgaaggtgaatgttgctaaaaca 3512550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 33618644 - 33618578
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagt---tgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 127  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  33618644 gtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttgttaaatacacgttaaggt-aatattgctaaaaca 33618578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6559600 - 6559500
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  6559600 tttgttaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 6559501  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  6559500 c 6559500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17317440 - 17317400
Alignment:
Q  95 taaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  17317440 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 17317400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 21993538 - 21993590
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21993538 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 21993590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 26380036 - 26380131
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| | ||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||    
T  26380036 acacccactagtttttatgtgggagtgttttaac-aagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtatatgtttctataacacaccttct 26380131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26928052 - 26928000
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26928052 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 26928000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 238
Target Start/End: Original strand, 27131052 - 27131116
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27131052 catttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagt 27131116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Original strand, 38368213 - 38368277
Alignment:
Q  172 aacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38368213 aacatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtattttagcaagttataactaaaaa 38368277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 48227318 - 48227266
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48227318 acaccaactaatttttataaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 48227266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 89)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4083959 - 4083709
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  4083959 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttcta 4083860  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4083859 aaata-taagtgggtgtacgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaa 4083761  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  4083760 gtagttaaatacaccttaaagtgtagcttgttaaaacactcccacataaaaa 4083709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4738153 - 4737881
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4738153 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 4738054  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4738053 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcatatgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 4737955  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  4737954 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 4737881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28747984 - 28747708
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||     
T  28747984 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttcta 28747885  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28747884 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 28747785  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| |||||||    
T  28747784 atagttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaaacactctcacataaaaacaagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 28747708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2528990 - 2528712
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2528990 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagttataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctt 2528891  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  2528890 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagttataactgaaa 2528791  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||| ||||||||    
T  2528790 agtagttaaatgcaccttaaggtataccttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatcct 2528712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 12909983 - 12910255
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12909983 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacacattcta 12910082  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||    
T  12910083 aaata-taagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgttataactaaaaa 12910181  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  12910182 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaa 12910255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14369988 - 14369749
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14369988 atacacccactagtttttattatggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 14369889  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14369888 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 14369790  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14369789 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 14369749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7944508 - 7944258
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  7944508 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctccta 7944409  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7944408 aaaa--taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 7944311  T
Q  237 gt-agttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7944310 gtaagttaaatacaccttaaagtgtaacttgctaaaacactcccacataaaaa 7944258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Original strand, 25912003 - 25912279
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  25912003 atacacccaccagtttttattaaggtgtgttttaacaacgatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttcta 25912102  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25912103 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 25912201  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||    
T  25912202 gtaattaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccacataaaaactagt-aggtgtgttctagcaaatcct 25912279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17421915 - 17421640
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  17421915 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttaacaaatatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaatactcattcta 17421816  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17421815 aaaaa-taagtgggtgtatgttagaaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 17421717  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  17421716 gtagttaaatacaccataaggcgtagcttgctaaatcactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 17421640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6436644 - 6436370
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||     
T  6436644 atacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacaaacattcta 6436545  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6436544 aaaaa-taagtggttgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttacaactaaaaa 6436446  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  6436445 gtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 6436370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33696274 - 33696037
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  33696274 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttcta 33696175  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  33696174 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgttataactaaaaa 33696076  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  33696075 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgttaaaacac 33696037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 13710992 - 13711244
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  13710992 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagctaatatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattcta 13711091  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttta-gaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||   |||||||| ||||||||||  ||||    
T  13711092 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagttataatcaaaa 13711191  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13711192 agtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactctcacataaaaa 13711244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 46 - 313
Target Start/End: Original strand, 6260961 - 6261226
Alignment:
Q  46 ctagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaa 145  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |       |||    
T  6260961 ctagtttttattaaagtgtattttagcaaaaatataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacctt-ttaaaaaataa 6261059  T
Q  146 gtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  6261060 gtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaaatagttaaa 6261159  T
Q  246 tacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||| |||  || | |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  6261160 tacactttacggtatggcttgctaaaacactctcacataaaaaatagt-aggtgtgttctagcaaatc 6261226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Original strand, 2695064 - 2695290
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||           
T  2695064 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaa-atataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa- 2695161  T
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2695162 taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 2695260  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaa 272  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2695261 aaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaa 2695290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3039095 - 3038833
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  3039095 atacacccactagtttttattaaagtgtgttttaacaaagatataactaaaaa-ttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttc-- 3038999  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
               ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3038998 -----------gggtgtatgttagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 3038910  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||| ||||||| |||||||    
T  3038909 gtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtatgttctagcaaatcc 3038833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31752337 - 31752128
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31752337 atacatccactagtttttattaagatgcgtttaagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 31752238  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31752237 aaaaa-taagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 31752139  T
Q  237 gtagttaaata 247  Q
    |||||||||||    
T  31752138 gtagttaaata 31752128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39038735 - 39038473
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||     
T  39038735 atacactcattagtttttattaaggtgtg------caaagatttaactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttcta 39038642  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39038641 aaaaaataagtgggtctatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaa 39038542  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||    
T  39038541 gtagttaaataaaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcatacataaaaattagt-aggtgtgttcta 39038473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Original strand, 39548813 - 39549073
Alignment:
Q  47 tagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaag 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||        ||||    
T  39548813 tagtttttattaagatgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgataaa-cacaccatc-aaaaaaataag 39548910  T
Q  147 tgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaat 246  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39548911 tgg-tgtatgttagcaacttctatagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaat 39549009  T
Q  247 acacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||||||  || |||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  39549010 ataccttaagatgtagcttgctaaaacactcctacataaaaact-aggaggtgtgttctaacaaa 39549073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 287
Target Start/End: Original strand, 22701705 - 22701953
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| |||||||   || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22701705 atacacccactaatttttatgtgggagtgttttaacaaagatataactaaaaagttgtgaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 22701804  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22701805 aaaaa-taagcgggtgtacgttagcaactcttataagcatttgctagaatacacccacttatttttg-gaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 22701902  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaa 287  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22701903 gtagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccacataaaa 22701953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 314
Target Start/End: Original strand, 22800614 - 22800871
Alignment:
Q  50 tttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgg 149  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |        ||||||    
T  22800614 tttttattaacgtgtgttttaataaatatataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaagaagtgg 22800713  T
Q  150 gtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaataca 249  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22800714 gtgtatgttagcaactcctacagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaagtagctaaataca 22800813  T
Q  250 cattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |      |||||  ||||||||||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||    
T  22800814 c------gtgtaatttgctaaaacactctcacgtaaaaactagtg-gatttgttctatcaaatcc 22800871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 17232877 - 17233148
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||     
T  17232877 atacacctactaatttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttcta 17232976  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||      
T  17232977 aaaaa-taaatgaatgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaattataactaaa-- 17233073  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
      ||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  17233074 --agtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcctacataaaaactagtg-ggtgtgttctaccaaatcc 17233148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9124912 - 9124706
Alignment:
Q  50 tttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  9124912 tttttattaagctgtgttttagcaaagatataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaataagtgg 9124813  T
Q  150 gtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatac 248  Q
    |||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9124812 gtgtatgttaacaacttctataggcatttgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaaatatttaaatac 9124713  T
Q  249 acattaa 255  Q
    || ||||    
T  9124712 accttaa 9124706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 288
Target Start/End: Original strand, 31240268 - 31240455
Alignment:
Q  100 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  31240268 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaata-taagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttatt 31240366  T
Q  200 ttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31240367 ttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacactctcacataaaaa 31240455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 293
Target Start/End: Original strand, 17233235 - 17233488
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||  ||||     
T  17233235 atacacctactaatttttattaaggtgtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatatattttaaggtgaacgttgctaaaacaca--ttcta 17233332  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  17233333 aaaaa-taaatgtgtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaattataattaaaaa 17233431  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaat 293  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  17233432 gtagttaaatactccttaaggtgtaacttgctaaaacacttccacataaaaactaat 17233488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33832939 - 33832728
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||     
T  33832939 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttcta 33832840  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33832839 aaaaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgttagaacgcacccacttattgttttggaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 33832740  T
Q  236 agtagttaaata 247  Q
    |||| |||||||    
T  33832739 agtaattaaata 33832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10951229 - 10951037
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctag 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  10951229 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattc-gaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgatat 10951131  T
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  10951130 aatacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagttatatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacactc 10951037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Original strand, 8410591 - 8410853
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||            ||||||||||||||||||||     
T  8410591 atacacacattagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatatatctaaaaagttcttaaatacac------------gttgctaaaacacacattcta 8410678  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8410679 aaata-taagtgagtgtatcctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 8410777  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| | ||||||    
T  8410778 gtagttaaacatacattaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttccaacaaatc 8410853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10471205 - 10471002
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||       ||    
T  10471205 actagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatatagctaaaaagttgttaaaaacaccttaaggtgaatattgctaaaacacttattct---aaagta 10471109  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataact-aaaaagtagtta 243  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||||||| || || |||||| ||||||||| ||    
T  10471108 agtgggtgtaagttagcaactcccacaaacatttgctaaaatacacccacttatgttttagaattagtgttttagcatgtcataactaaaaaagtagcta 10471009  T
Q  244 aatacac 250  Q
    |||||||    
T  10471008 aatacac 10471002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 858094 - 857929
Alignment:
Q  54 tattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgt 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||    
T  858094 tattaaagtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-agaaaataagtgggtgt 857996  T
Q  154 atgttagcaactcctataaaca-tttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgtttta 218  Q
     |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  857995 ctgttagcaactcctatatgcattttgctagaatacacccacttacttttttaaaaggtgtgtttta 857929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4737015 - 4736746
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  4737015 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaa 4736917  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |   || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  4736916 aaaacaagtgggtgtgttatagcaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagga---gtattttagcaagtgaataactaaaaag 4736820  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  4736819 tggttaaatacaccttaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaa 4736746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32736481 - 32736356
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  32736481 atacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct- 32736383  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaa 163  Q
          |||||||||||||||||||||    
T  32736382 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaa 32736356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 30687877 - 30688128
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  30687877 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 30687975  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  30687976 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 30688075  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  30688076 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 30688128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17210236 - 17210139
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17210236 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttg-taaatacaccttaaggtgaatgttggtaaaacacacattct 17210139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 1951394 - 1951632
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  1951394 atacacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaaat-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta 1951492  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaa 235  Q
           |||||||||| |  |||||| |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||  ||||||||||    
T  1951493 aagaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatatgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaa 1951592  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaaca 274  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1951593 agtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 1951632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15809191 - 15808922
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||| | || || | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||           
T  15809191 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttacaacttaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 15809093  T
Q  143 t-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtt-ataactaaaaagtag 240  Q
      |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| || ||||||||||||| |    
T  15809092 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtgg 15808993  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  15808992 ttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 15808922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 29302067 - 29302340
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  29302067 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 29302165  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||     
T  29302166 aaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccgcttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaag 29302265  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  29302266 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 29302340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17605258 - 17604993
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |    
T  17605258 actagtttttatgtaggagtgttttagcaa-gttataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaaca 17605160  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtta 243  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  17605159 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtaaataactaaaaagtggtta 17605060  T
Q  244 aatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  17605059 aatacacctt-aagtgtagctttgctaaaagactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 17604993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38952396 - 38952198
Alignment:
Q  51 ttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtggg 150  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||| | ||||       ||| ||||    
T  38952396 ttttatttaggtgtgatttggcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaatatgaatgtggctaaaacactcgttctaaaaaaataaatggg 38952297  T
Q  151 tgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaataca 249  Q
    |||| |||| ||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  38952296 tgtaagttaacaacgtccacaaacatttgctaaaatacacccacttattttttataaggagtgttttggcatgtcataactaaaaagtagctaaataca 38952198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15294252 - 15294098
Alignment:
Q  44 cactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |       |    
T  15294252 cactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagacataattaaaaagttgttaaatacactttaagatgaatgttgttaaaacactcatt-ttgaaaaat 15294154  T
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt 199  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||    
T  15294153 aagtgagtgtacgttaacaactgctatagacatttgttaggatacatctacttatt 15294098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1921684 - 1921417
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||| ||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| || ||||||  ||||       
T  1921684 acacctactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaac 1921586  T
Q  139 nnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaa 236  Q
         |||||| |||| |  |||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  1921585 aaaaataagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 1921486  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||||||||||    
T  1921485 gtggttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagt-aggtgtgttcta 1921417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 277
Target Start/End: Original strand, 3960639 - 3960840
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||||||||    |||||| ||||| |  ||||    
T  3960639 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgcatt 3960738  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  3960739 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacac 3960838  T
Q  276 tc 277  Q
    ||    
T  3960839 tc 3960840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37468757 - 37468491
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||       
T  37468757 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttctaaa 37468659  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttata--actaaaaa 236  Q
        ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||      ||||||| |   || ||||| ||||| |||  ||||||||    
T  37468658 aaaataagtgggtgtatgttagcaaatcctataggaatttgctagaatacaccc------tttttagga---gtattttagcaagtgataacactaaaaa 37468568  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    || ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||| || |||||||    
T  37468567 gtggttaaatgcaccctaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttttagcaaatcc 37468491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 135
Target Start/End: Original strand, 11351787 - 11351877
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11351787 actagtttttatgtgggagtgttttagcaaagatataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 11351877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26906118 - 26905865
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  26906118 acacccactagtttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 26906020  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||   ||  || ||||| ||| | | |||||||||||    
T  26906019 aaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacagccacttattttttt--aggagtattttagcaaatgaataactaaaaag 26905923  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatg 294  Q
    | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26905922 ttgttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattaatg 26905865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Original strand, 40234162 - 40234310
Alignment:
Q  151 tgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacac 250  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40234162 tgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatgttttag--------------caagttataactaaaaagtagttaaatacac 40234247  T
Q  251 attaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  40234248 tttaaggtgtagtttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 40234310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 291
Target Start/End: Original strand, 17209894 - 17210089
Alignment:
Q  95 taaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccac 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       ||||||||||| |   ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17209894 taaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccac 17209993  T
Q  195 ttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    ||||||||||| |   || ||||| ||| |  ||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17209994 ttattttttagga---gtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaatta 17210089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33026406 - 33026179
Alignment:
Q  85 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctaga 184  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |   ||||| |||||||  |||||||||||    
T  33026406 aaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctaga 33026307  T
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtt-ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaaacactctcacg 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||  |||||||||||||| |||     
T  33026306 atacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggttaaatacaccctaagatgtagttttgctaaaacactcccaca 33026207  T
Q  283 taaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  33026206 taaaaattagtg-ggtgtgttctaacaaa 33026179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11448933 - 11448703
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  11448933 gtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagc 11448835  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || |||||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11448834 aaatcctataggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaatatctaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 11448735  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11448734 agctttgctaaaacactcccacataaaaatta 11448703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 178 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14795777 - 14795643
Alignment:
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||    
T  14795777 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 14795678  T
Q  276 tctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||| |||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  14795677 tcccacataaaaactagtga-gtgtgttctagcaaa 14795643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 291
Target Start/End: Original strand, 27005161 - 27005296
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||||     
T  27005161 tagcaaatcctttagacatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatagaccttaag 27005260  T
Q  257 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27005261 gtgtagctttgctaaaatactctcacataaaaatta 27005296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33282477 - 33282208
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    |||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||| || ||||||| ||||         
T  33282477 acccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaa 33282379  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagta 239  Q
       |||||||||| |  |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  33282378 aacaagtgggtgtgttctagcaaatccaataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagta 33282279  T
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||| || |||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  33282278 gttaaataaac-ttaaggtatagctttgctaagacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 33282208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Original strand, 33833121 - 33833289
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || |||||   ||| | |||||||||||| |||    
T  33833121 aagtgggtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagttagtgaataactaaaaagtggtt 33833220  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  33833221 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 33833289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7014614 - 7014477
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagctt-gctaaaa 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| | | |||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  7014614 atttgctagaacacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 7014515  T
Q  273 cactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7014514 cactcccacataaaaattaatg-ggtgtgttctagcaaa 7014477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37249526 - 37249361
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-nn 137  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  37249526 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 37249428  T
Q  138 nnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttta 204  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37249427 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccatttatttttta 37249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37282403 - 37282237
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaa-gttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnn 137  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||      
T  37282403 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaagttaacaaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaa 37282305  T
Q  138 nnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttag 205  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37282304 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacactcacttattttttag 37282237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31752568 - 31752393
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaag------ttataactaaaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| |||||| ||  ||  ||||||||| ||||      |||||||||||||    
T  31752568 taagtgggtgtatgttagcaactcttataagcatttgttataatatacccatttatttctttcaatttgtgttttagcaagttactattataactaaaaa 31752469  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
     |||||||||  || ||||  ||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||| ||||||    
T  31752468 ctagttaaatgtaccttaagatgtagtttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-gttgtgttctagcaaatc 31752393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30486199 - 30486061
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||   || ||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  30486199 catttgctaggatacatccacttagtttttagaatgagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 30486100  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  30486099 acactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 30486061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Original strand, 22213112 - 22213212
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatca 309  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||    
T  22213112 gtgttttagcaatttataattaaaaagtggttaaatacaccctaaattgtagctttgttaaaacactctcacttaaaaattagtg-ggtgtgttctagca 22213210  T
Q  310 aa 311  Q
    ||    
T  22213211 aa 22213212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1797498 - 1797420
Alignment:
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1797498 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 1797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 7014702 - 7014631
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7014702 gtgttttagcaa-gctctaactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattct 7014631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 3189722 - 3189864
Alignment:
Q  74 aagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaa 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||| |        |||||| | || |||| ||||||| | |||    
T  3189722 aagatataactaaaaagttgttaaatacactttgaagtgaatgttg-taaaa-acacattttaaaaagaaaagtggatataagttaacaactcccacaaa 3189819  T
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||| || | ||||||||    
T  3189820 catttgctagaataaactcacttatattttaaaaaaagtgtttta 3189864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 31240352 - 31240442
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  31240352 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacac 31240442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17421924 - 17421822
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||| |    
T  17421924 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttaacaaatatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaata 17421825  T
Q  275 ctc 277  Q
    |||    
T  17421824 ctc 17421822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  105 ttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattt 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2528999 - 2528899
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  2528999 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagttataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 2528900  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  2528899 c 2528899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4738162 - 4738062
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  4738162 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 4738063  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  4738062 c 4738062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Original strand, 30667544 - 30667780
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||| ||||||||||   || |||||||||| ||| ||| | |||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||       
T  30667544 acacccattagtttttatgtgggagtgttttagc-aagttatgactaaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaa 30667642  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         ||||| |||| |  |||||| | |||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   || ||||| |||||  | || |||||||    
T  30667643 aaaa-aagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaataca--cacatattttttagaatgagtattttagcaagtgaaaaattaaaaag 30667739  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30667740 tgattaaatacactttaacgtgtagctttgctaaaacactc 30667780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37249538 - 37249438
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  37249538 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 37249439  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  37249438 c 37249438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11448970 - 11448883
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagat-gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||| |||||    
T  11448970 atttgctagaacacacccactaattttttatgtgatagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgta 11448883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 39548948 - 39549038
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||    
T  39548948 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatataccttaagatgtagcttgctaaaacac 39549038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19334887 - 19334841
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaa 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  19334887 ataattaaaaatttgttaaatacaccctaaggtgcatgttgttaaaa 19334841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31752296 - 31752246
Alignment:
Q  225 tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  31752296 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacac 31752246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 312
Target Start/End: Original strand, 1807579 - 1807627
Alignment:
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  1807579 cttgctaaaacactctcatgtaaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaat 1807627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2695174 - 2695141
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2695174 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 2695141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6261069 - 6261032
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6261069 atacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaa 6261032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 10470951 - 10470988
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaa 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10470951 atacacccactagtttttatgaagttgtgttttagcaa 10470988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 14369871 - 14369904
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14369871 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 14369904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 22282213 - 22282270
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  22282213 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttct 22282270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25912120 - 25912087
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25912120 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 25912087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 32736364 - 32736397
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32736364 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 32736397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4083968 - 4083888
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4083968 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 4083888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7944513 - 7944417
Alignment:
Q  180 ctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||    
T  7944513 ctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacac 7944417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 9741794 - 9741846
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9741794 acaccaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttataactaaaaagt 9741846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17689425 - 17689377
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17689425 ccactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 17689377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 18015711 - 18015763
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18015711 acaccaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttataactaaaaagt 18015763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Original strand, 26905994 - 26906034
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26905994 atttgctagaacacacccacttgttttttagaaggtgtgtt 26906034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32736490 - 32736390
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  32736490 tttgctaggatacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 32736391  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  32736390 c 32736390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33696284 - 33696208
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacac 250  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  33696284 atttgttaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacac 33696208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 40234209 - 40234272
Alignment:
Q  64 tgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  40234209 tgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagtttgctaaaacac 40234272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 20579 - 20855
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  20579 atacacccagtagtttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcta 20678  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  20679 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagttataactaaaaa 20778  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  20779 gtagttaaatacaccttaaggtgtatcttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 20855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 9692 - 9967
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9692 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 9791  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9792 aaaaaataagtgggcgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 9891  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||| ||  | ||||||||||| |||||||    
T  9892 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcctacataaaaacta--gtggtgtgttctagcaaatcc 9967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 288
Target Start/End: Original strand, 26842961 - 26843207
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         
T  26842961 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataa 26843060  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtag 240  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26843061 a-taagtgggtgtgtgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtag 26843159  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26843160 ttaaatacaccttaagttgtagcttgctaaaacactcacacataaaaa 26843207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 13157516 - 13157794
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13157516 atacacccactagtctttattaaggcgtcttttagcaaaaatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 13157615  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaact---cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaa 233  Q
          |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13157616 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactgatcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaa 13157714  T
Q  234 aaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  13157715 aaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagt-aggtgtgttctagcaaatcc 13157794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16005801 - 16005525
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  16005801 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttcta 16005702  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16005701 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 16005602  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||   || |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  16005601 gtagttaaatacaccttaagatgtagcttgttaaaacacttctacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 16005525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 34515088 - 34515365
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||     
T  34515088 atacacccaccagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacgcatcttctt 34515187  T
Q  137 nnnnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34515188 aaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 34515287  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||| || |||||||    
T  34515288 agtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttatagcaaatcc 34515365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 158373 - 158613
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  158373 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt 158472  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| ||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  158473 aaaaattaaatggatgtatgttagcaactcctataggaatttgctataattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 158572  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  158573 gtagctaaatacaccttaaggtgttgcttgctaaaacactc 158613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28454941 - 28454691
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  28454941 atacatccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttcta 28454842  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28454841 aaaaaa-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaca 28454743  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28454742 gtagttaaatataacttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 28454691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51432083 - 51431806
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  51432083 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttctt 51431984  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataact-aaaa 235  Q
          |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  51431983 aaaaaataagtgggtgtatgttaggaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaattataactaaaaa 51431884  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |  |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||  |||||||    
T  51431883 aacagttaaatgcaccttaaggtgtaacttgctaaaacactccaacataaaaactagtg-ggtgtgttctggcaaatcc 51431806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 16073397 - 16073649
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct- 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  16073397 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctccta 16073496  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16073497 aaaaaaataagtgggtgtttgttagcaactcctacaggcatttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaa 16073596  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16073597 agtagttaaatacacgttaaggtgtaacttgctaaaacacacccacataaaaa 16073649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41146486 - 41146209
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  41146486 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaggttgctaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattcta 41146387  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41146386 agaaa-taagtgggcgtatgttaacaactccaatagacatttgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 41146288  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcctt 316  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  41146287 gtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccatataaaaactagtg-ggtgttttctagcaaatcctt 41146209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 6192383 - 6192619
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaagg--tgaatgttgctaaaacacacattc 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  6192383 atacacccactattttttattaaggtgtgttttggcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttc 6192482  T
Q  135 tnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
    |       ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  6192483 taaaaaa-taagtgggtgtgtgttagcaactcctatatgcatttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagttataactaaa 6192581  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaa 272  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6192582 aagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaa 6192619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10764827 - 10764582
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||    
T  10764827 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaata 10764728  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtta 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  10764727 agtgggtgtatgttagcaactcttatagacattttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagtgaataactaaaaagtggtta 10764628  T
Q  244 aatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  10764627 aatacaccctaaggtgtagctttgttaaaacactctcacataaaaa 10764582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 24770590 - 24770864
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | || ||||     
T  24770590 atacacccactagtttatattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacat-ttaaggggaatgttgctaaaataaaccttcta 24770688  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24770689 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaacccctataggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 24770787  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  24770788 gtagtgaaatgcaccttaagatgtagcttgctaaaacactctcacataaaaactagtga-gtgtgttctaccaaatcc 24770864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 41 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8643225 - 8642957
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||          
T  8643225 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaa---cactttaagatgaatgttgctaaaacacaccttc-aaaaa 8643130  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtag 240  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8643129 aataagtgggtgtatgttagcaactcctatacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataaccaaaaagtag 8643030  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||| | | ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  8643029 ttaaatgcgccttaagatgtagcttgctaaaacactcccatataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 8642957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23413871 - 23413623
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23413871 atacaccaactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcta 23413772  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
           ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||| ||||  || |||||||||||||    
T  23413771 aaatac-aagtgggtgtatgttagcaactcctatgaacatttgctagaatacatccacttatttttt--taggtgtgctttaggaatttataactaaaaa 23413675  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  23413674 gtggttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacacccccacataaaaa 23413623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 32156219 - 32155945
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||     
T  32156219 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaaattgttaaatgcaccttaagatgaatgttgctaaaacaccgtttcta 32156120  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||||    
T  32156119 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctgtatgcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagttataaataaaaa 32156021  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  32156020 gtagttaaatacatcctaaggtgtagcttgctaaaacattcacacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaatc 32155945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 34306399 - 34306642
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  34306399 atacaccaactagtttttattaaagtgtgttttaacaaagatataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattcta 34306498  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacac----ccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataacta 232  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  34306499 aaaaa-taagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagttataacta 34306597  T
Q  233 aaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||    
T  34306598 aaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttcctgaaacactc 34306642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45819017 - 45818743
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45819017 atacatccactagtttttattaaggtatgttttagcaaatatataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt 45818918  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||    
T  45818917 aaaaaataagt-ggtgtatgttagcaactcatatagacatttgctataatacacccacttattttttagaagttgtgctttagaaaattataactaaaaa 45818819  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||  || |||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  45818818 gaagttaaaaacacctt-aagtgtagcttgctaaaacactccgacataaaaactagtg-ggtgtattctagcaaatcc 45818743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 50559208 - 50559484
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaa-gatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50559208 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttaaaaaatgatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 50559307  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           ||| | | |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50559308 -aaaaaataaatagatgtatgttagcaactcctataggcatttgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 50559406  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||| |||| ||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  50559407 agtagtgaaatgcaccttaaggtttagcttgctaaaacactcctacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 50559484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Original strand, 36389418 - 36389630
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36389418 atacacctagtagtttttattaaggtgtgtttaagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 36389517  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36389518 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 36389616  T
Q  237 gtagttaaatacac 250  Q
    ||||||||||||||    
T  36389617 gtagttaaatacac 36389630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3273569 - 3273363
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||     
T  3273569 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattcta 3273470  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  3273469 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgttagaatgcacccacttattttttaaaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaa 3273370  T
Q  237 gtagtta 243  Q
     ||||||    
T  3273369 atagtta 3273363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Original strand, 14387214 - 14387489
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  14387214 atacactcactagtttttatgtgggagtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcttcta 14387313  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14387314 aaaaa-taaatgggtgcatgttagcagctcctatagccatttactagaatacatccatttattttt-agaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaa 14387411  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
     ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14387412 atagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaacacactcccacataagaactaatg-ggtgtgttctagcaaatcct 14387489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 288
Target Start/End: Original strand, 4158077 - 4158318
Alignment:
Q  47 tagtttttattaaggtgtgttttagcaaaga-tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||       |||    
T  4158077 tagtttttattaaggtgtgttttagcaaaaaatataattaaaa-gttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa-taa 4158174  T
Q  146 gtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaa 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  4158175 gtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgttaggaaacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggttataactaaaaaataattaaa 4158274  T
Q  246 tacacattaaagtgtagcttgct-aaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4158275 tacaccttaaggtgtagcttgctaaaaacactcccacataaaaa 4158318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Original strand, 463377 - 463546
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  463377 taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 463476  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  463477 aaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 463546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 287
Target Start/End: Original strand, 13157240 - 13157477
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct- 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  13157240 atacatccactagtttttattaagttgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactaattcta 13157339  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||              |||||||||||||||    
T  13157340 aaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctataattcacccacttattttttaga--------------aagttataactaaaa 13157425  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaa 287  Q
    | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13157426 aatagttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaa 13157477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42200089 - 42199850
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || |     
T  42200089 atacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatctt-tt 42199991  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42199990 aaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaa 42199891  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42199890 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 42199850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42208957 - 42208718
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| ||||||    || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || |     
T  42208957 atacacccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatctt-tt 42208859  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42208858 aaaaaataagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaa 42208759  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42208758 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 42208718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 32994146 - 32994402
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  32994146 atacacccactagtttttatttaggagtgttttagcaaa--tataactaaaaagttgttaagtacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---- 32994239  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
               |||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32994240 -----------gggtgtatgttagcaaatcatatggccatttgctagaatacactcatttattttttagaatatgtgttttagcaagttataattaaaaa 32994328  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  32994329 gtagttaaatgcatcttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 32994402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 66 - 275
Target Start/End: Original strand, 5491590 - 5491798
Alignment:
Q  66 ttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaact 165  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||   ||||       ||||||| |||||||||||||||    
T  5491590 ttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgattgttgctgaaacactacttctaaaaaa-taagtggatgtatgttagcaact 5491688  T
Q  166 cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  5491689 cctatagacatttactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatctt 5491788  T
Q  266 gctaaaacac 275  Q
    ||||||||||    
T  5491789 gctaaaacac 5491798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33676250 - 33676084
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  33676250 atacacacactagtttttattaaggtgtattttaacaaagatataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcta 33676151  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
          |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33676150 aaaaaataagtgggtgtatgctagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttatttttt 33676084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13264699 - 13264528
Alignment:
Q  105 ttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13264699 ttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaa-taagtggatgtatgttagcaactcatataggcatttgctaggatacacccacttatttttta 13264601  T
Q  205 gaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13264600 gaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 13264528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 288
Target Start/End: Original strand, 27787867 - 27788010
Alignment:
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27787867 agtgggtgtatgttagcaactcttataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaa 27787966  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27787967 atacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 27788010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Original strand, 3979442 - 3979612
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3979442 taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagttataactaaaaagtagtt 3979541  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcac-gtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||| |||  ||||  ||||| |||||||||||||| |||  |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  3979542 aaaaacatcttaagatgtagattgctaaaacactcccacaataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 3979612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 129
Target Start/End: Original strand, 10558171 - 10558263
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10558171 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 10558263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Original strand, 39424230 - 39424455
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  39424230 acacccactagtttttatgt-ggagtgttttagcaa-gatataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 39424327  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        ||||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  39424328 aaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 39424427  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||    
T  39424428 tggttaaatacaccttaaggtgtagctt 39424455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 28764509 - 28764708
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28764509 atacaccaactaatttttattaaggtgt-ttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattct- 28764606  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaa-gatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          |||||||||||| |||| ||||||| |  | |||| | || |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  28764607 aaaaaataagtgggtgtaagttatcaactcccacgagcattggataaaatacatccacttattttttagaatgat-tgttttagcaagtcataactaaaa 28764705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 133
Target Start/End: Original strand, 20201661 - 20201755
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20201661 acacccattagtttttattaaggtgtcttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt 20201755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 20411157 - 20411430
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  20411157 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 20411255  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| |||||  |||||||||||    
T  20411256 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagtcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatcttagcaagtgaataactaaaaa 20411355  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  20411356 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 20411430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 130
Target Start/End: Original strand, 462977 - 463070
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  462977 atacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttcctaaaacacac 463070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1805212 - 1804940
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||| |||||||||||||   || |||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |       
T  1805212 acactcactagtttttatgttggagtgttttagcaaat-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttttaaa 1805114  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  1805113 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatcttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaag 1805014  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1805013 tggttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattaatg-ggtgtgttctagcaaa 1804940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28704565 - 28704439
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||| || |||||| |    
T  28704565 aaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattct-aaaaaataaatgagtgtatat 28704467  T
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaa 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28704466 tagcaactcctataagcatttgctagaa 28704439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13385959 - 13385706
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-nn 137  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  13385959 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 13385861  T
Q  138 nnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
         ||||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||| |  |||||||||||    
T  13385860 aaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattgaataactaaaaa 13385761  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagctt---gctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||| |||   |||||||||||| ||| ||||||    
T  13385760 gtggttaaatacaccttaaggtgtaactttgcgctaaaacactcccacataaaaa 13385706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 16960267 - 16960482
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||    
T  16960267 gtgttttagcaa-gatataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttatagca 16960365  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16960366 aatcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 16960465  T
Q  262 gc-ttgctaaaacactc 277  Q
    || ||||||||||||||    
T  16960466 gctttgctaaaacactc 16960482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47131139 - 47130912
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  47131139 acacccactagtttttatgtgtgagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 47131041  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
        ||||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||| |  |||||||||||    
T  47131040 aaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaa 47130941  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    || |||||||||||  ||| |||||||||    
T  47130940 gtggttaaatacaccctaaggtgtagctt 47130912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Original strand, 14494353 - 14494602
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||         |||||||||| |  ||||    
T  14494353 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagc 14494451  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  14494452 aaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgt 14494551  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  14494552 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 14494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Original strand, 36817634 - 36817883
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  36817634 gtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgggtgtgttctagc 36817732  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  36817733 aaatcctataggaatttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaattcaccttaaggtgt 36817832  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  36817833 agctttgctaaaacactctcacataaaaactagtga-gtgtgttctagcaaa 36817883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Original strand, 3977930 - 3978018
Alignment:
Q  37 atacacccactagttttt-attaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaa 124  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3977930 atacacccactagtttttgattaaggtatgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaa 3978018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12864514 - 12864244
Alignment:
Q  40 cacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnn 139  Q
    ||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |           
T  12864514 cacccactaatttttatatgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacacctaaaaaaa 12864416  T
Q  140 nnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagt 238  Q
        |||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  12864415 aac-aagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 12864317  T
Q  239 agttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  12864316 ggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactactg-ggtgtgttctagcaaa 12864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 14387479 - 14387633
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  14387479 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttggcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 14387578  T
Q  257 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  14387579 gtgtagctttgctaaaacactcacacggaaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 14387633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 27255612 - 27255863
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |       
T  27255612 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttaga 27255710  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||  ||||  |||||||||||    
T  27255711 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggagtattttaggaagtaaataactaaaaa 27255810  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27255811 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 27255863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27389714 - 27389475
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||| | |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  27389714 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttatgactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 27389616  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactc----ctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaa 233  Q
         |||||||||| |  |||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||    
T  27389615 aaac-aagtgggtgtgttctagcaaatcaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaa 27389517  T
Q  234 aaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaaca 274  Q
    ||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  27389516 aaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 27389475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 43236241 - 43236395
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  43236241 tagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagtggataactaaaaagtggttaaatacaccttaat 43236340  T
Q  257 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||| || |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  43236341 gtgttgctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 43236395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32374740 - 32374488
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||         |||||||||| |  ||||    
T  32374740 gtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgggtgtgttatagc 32374642  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  32374641 aaatcctatagacatttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 32374542  T
Q  261 agcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    | ||||||||||||||  ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  32374541 aacttgctaaaacacttccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcct 32374488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32716526 - 32716358
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||  ||||||||||||| |||    
T  32716526 aagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttaagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtt 32716427  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  32716426 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaa 32716358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Original strand, 32151930 - 32152005
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32151930 taagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 32152005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 32379659 - 32379581
Alignment:
Q  50 tttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32379659 tttttattaaggcgtgttttagcaaagatgtaactaaaaagttgttaaatacatctcaaggtgaatgttgctaaaacac 32379581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Original strand, 13264723 - 13264792
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  13264723 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatgcaccttaa 13264792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675823
Alignment:
Q  196 tattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaa 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaa 33675823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Original strand, 13943357 - 13943495
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  13943357 catttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaa 13943456  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  13943457 acactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 13943495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 276
Target Start/End: Original strand, 47130804 - 47130907
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaa 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  47130804 catttgctaggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 47130903  T
Q  273 cact 276  Q
    ||||    
T  47130904 cact 47130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 277
Target Start/End: Original strand, 27348129 - 27348325
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || |       ||| ||||| | |||||||||||| ||||  ||||    
T  27348129 tataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacaccttataaaaaa-taaatgggtatgtgttagcaactcttatag-catt 27348225  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||  ||||  ||||||||| | ||||||||    
T  27348226 tgttagaatacaccaacttattttttagaagaagtattttagcaaatgataactaaaaaatagttaagtacatcttaagttgtagcttgttcaaacactc 27348325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Original strand, 27787804 - 27787867
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27787804 atacatccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaata 27787867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28182264 - 28182157
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28182264 taagtgggcgtaagttagcaactcccacaagcatttgctaaaatacaccaacttatttttttgaaagagtgttttaacatgtcataactaaaaagtagtt 28182165  T
Q  243 aaatacac 250  Q
    ||| ||||    
T  28182164 aaacacac 28182157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20201922 - 20201743
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||       
T  20201922 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaga 20201824  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
          |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  20201823 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctataatacacccacttattttttataatgtgtgtttta 20201743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 249
Target Start/End: Original strand, 9005191 - 9005291
Alignment:
Q  146 gtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaa 245  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||| || || |||||||| |||||| ||||    
T  9005191 gtgggtgtaagttagcaactcccacaatcatttgctaaaatacacctacttattttttagaa---gtgttttagcatgtcataactaagaagtagctaaa 9005287  T
Q  246 taca 249  Q
    ||||    
T  9005288 taca 9005291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 166
Target Start/End: Original strand, 10368051 - 10368172
Alignment:
Q  44 cactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt 143  Q
    |||||||||||||   || ||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||       |    
T  10368051 cactagtttttatgtgggagtgttttaataaagatataactaaaat-ttgttaaatacaccttaagttgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat 10368149  T
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactc 166  Q
    |||||| |||| |||||||||||    
T  10368150 aagtggatgtaagttagcaactc 10368172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 208
Target Start/End: Original strand, 32144056 - 32144121
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32144056 taagtgggtgtatgttagcaactcttatatgcatttgctgggatacacccacttattttttagaag 32144121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Original strand, 52772206 - 52772415
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||| || | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||       
T  52772206 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagtaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg-tataacacatcttctaaa 52772303  T
Q  139 nnnnta--agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaa 235  Q
         |  ||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||  ||||||||||    
T  52772304 aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaa 52772403  T
Q  236 agtagttaaata 247  Q
    ||| ||||||||    
T  52772404 agtggttaaata 52772415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Original strand, 50797727 - 50797788
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttta 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50797727 taagtgggtgtatgatagcaactcctataagcacttgttagaatatacccacttatttttta 50797788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 130
Target Start/End: Original strand, 5491729 - 5491800
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  5491729 aaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatcttgctaaaacacac 5491800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Original strand, 32144129 - 32144177
Alignment:
Q  157 ttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttag 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32144129 ttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttag 32144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 463419 - 463509
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  463419 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 463509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 27787907 - 27787997
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  27787907 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 27787997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Original strand, 32151863 - 32151918
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  32151863 taagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaagatacacccacttat 32151918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28094468 - 28094383
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  28094468 ataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 28094383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 203
Target Start/End: Original strand, 32152003 - 32152049
Alignment:
Q  157 ttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32152003 ttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt 32152049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12010559 - 12010472
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12010559 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa-actcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 12010472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24190940 - 24190767
Alignment:
Q  64 tgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaa 163  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||  |||||| ||||||     
T  24190940 tgttttagcagagttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttct-aaaaaataagtaagtgtatattagcat 24190842  T
Q  164 ctcctataaacatttgctagaatacacccact--tattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
    || |||||  |||||||||||||| | | |||  |||||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||    
T  24190841 cttctatatgcatttgctagaatagaacgacttatattttttagaaggagtattttatcaagtgaaaactaaaaa 24190767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 28646722 - 28646817
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  28646722 acacccattagtttttatgtaggagtattttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttct 28646817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Original strand, 43236138 - 43236209
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  43236138 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 43236209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 13264620 - 13264530
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13264620 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 13264530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 26843104 - 26843194
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  26843104 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgtagcttgctaaaacac 26843194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 51465221 - 51464995
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||| ||| |  |||||    
T  51465221 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtggatgtgttatagca 51465123  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    | || || |  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||| | | |||||||||| | ||||||||||   ||| |||||    
T  51465122 aatcttacaggcaattgctagaatacacc-acttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaatacagcctaaggtgta 51465024  T
Q  262 gctt-gctaaaacactctcacgtaaaaat 289  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  51465023 actttgctaaaacactcccacataaaaat 51464995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 71
Target Start/End: Original strand, 48643977 - 48644011
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttag 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48643977 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttag 48644011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2965408 - 2965336
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2965408 acacccactagtttttatgtcggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg 2965336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 179
Target Start/End: Original strand, 3099574 - 3099668
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||       ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3099574 taaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattct-aaaaaataaatagatgtatgttaacaactcctataaacatttg 3099668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 10558162 - 10558262
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  10558162 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 10558261  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  10558262 c 10558262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 16073388 - 16073488
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  16073388 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 16073487  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  16073488 c 16073488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28704595 - 28704515
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28704595 tttgctatgatacatccatttattctttagaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 28704515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6192500 - 6192469
Alignment:
Q  187 acacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192500 acacccacttattttttagaagatgtgtttta 6192469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16005810 - 16005735
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacac 250  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16005810 tttgctaggatacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacac 16005735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33675889 - 33675823
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaa 125  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  33675889 aaggtgtgttttagc-aagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaa 33675823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36817646 - 36817596
Alignment:
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  36817646 cttgctaaaacactctcacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 36817596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 33676124 - 33676170
Alignment:
Q  177 ttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaa 222  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33676124 ttgctagcatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttaacaa 33676170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 50559199 - 50559300
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt--tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaac 273  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| |||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  50559199 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttaaaaaatgatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaac 50559298  T
Q  274 ac 275  Q
    ||    
T  50559299 ac 50559300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 313
Target Start/End: Original strand, 51465209 - 51465257
Alignment:
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51465209 cttgctaaaacactc-cacgtaaaaattaatg-ggtgtgttctagcaaatc 51465257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13157633 - 13157600
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13157633 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 13157600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28182392 - 28182348
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataa 82  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28182392 atacacccact-gattttattaaggtgtgctttagcaaagatataa 28182348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36389535 - 36389502
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36389535 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 36389502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 158364 - 158464
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  158364 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 158463  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  158464 c 158464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 5226868 - 5226920
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  5226868 acaccaactaatttttatgaaggtgtgttttaacaaagatataaccaaaaagt 5226920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 26842948 - 26843048
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  26842948 tttgctaggatatacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaaca 26843047  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  26843048 c 26843048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 261
Target Start/End: Original strand, 27348117 - 27348165
Alignment:
Q  213 gttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||    
T  27348117 gttttatcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgta 27348165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 215
Target Start/End: Original strand, 27389590 - 27389630
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtt 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27389590 atttgctagaacacacccacttgttttttagaaggtgtgtt 27389630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 43236138 - 43236202
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  43236138 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 43236202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47131115 - 47131051
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  47131115 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 47131051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51432092 - 51432012
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51432092 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaa 51432012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 94)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 31039523 - 31039795
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  31039523 atacacctactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaatttgttcaatacaccttaaggtgaatgatgctaaaacacacattcta 31039622  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31039623 aaaaa-taagtgcgtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaa 31039721  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  31039722 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcctacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 31039795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13349361 - 13349086
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13349361 atacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 13349262  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13349261 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactccaataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagttataactaaaaa 13349163  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  | || ||||||||||| |||||||    
T  13349162 gtagttaaatacaccttaaggtggagcttgctaaaacactcccacataaaaaccagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 13349086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 33837775 - 33838019
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33837775 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 33837874  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataac----ta 232  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    ||    
T  33837875 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaatta 33837974  T
Q  233 aaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33837975 aaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 33838019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Original strand, 1375963 - 1376240
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1375963 atacactcactaaattttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 1376062  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1376063 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 1376162  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    ||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  1376163 gtagttaaatatacctgaaggtgtagctagctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcct 1376240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3800423 - 3800147
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  3800423 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaatgatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaatacaccttcta 3800324  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagat-gtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  3800323 aaaaa-taagtgggtgtatgttaacaacatctataagcattttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagttataactaaaa 3800225  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3800224 agtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 3800147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8814996 - 8814756
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  8814996 actagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-ta 8814898  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||| |    
T  8814897 agtgggtgtatgttagcaacttctataagcatttgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagttatgattaaaaagtagttca 8814798  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaa 286  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8814797 atacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaa 8814756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 77 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53581745 - 53581511
Alignment:
Q  77 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53581745 atataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 53581647  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  53581646 ttgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacact 53581547  T
Q  277 ctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    | ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  53581546 cccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 53581511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36824181 - 36823906
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  36824181 atacagccactagtctttattaaagtatgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattcta 36824082  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36824081 aaaaa-taagtgggtgtatgttagtaactccaataggcatttgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagttataattaaaaa 36823983  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  36823982 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagt-tggtgtgttctagcaaatcc 36823906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50801800 - 50801589
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||     
T  50801800 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttct- 50801702  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50801701 ataaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 50801602  T
Q  237 gtagttaaataca 249  Q
    |||||||||||||    
T  50801601 gtagttaaataca 50801589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Original strand, 50874080 - 50874291
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||     
T  50874080 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttct- 50874178  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50874179 ataaaataaatgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 50874278  T
Q  237 gtagttaaataca 249  Q
    |||||||||||||    
T  50874279 gtagttaaataca 50874291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12127767 - 12127562
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12127767 atacacccactgatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct- 12127669  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  12127668 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcattttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgttataactaaaaa 12127569  T
Q  237 gtagtta 243  Q
    |||||||    
T  12127568 gtagtta 12127562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27317866 - 27317590
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca-cacattct 135  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||    
T  27317866 atacacctactagtttttattaaggcgtgttttaggaaagatataactaaaaatttattaaatacaccttagagtgaatgttgctaaaaaaacaccttct 27317767  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27317766 aaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 27317668  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||| |||||||    
T  27317667 agtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacgaaaaaactagcga-gtgtgttctagcaaatcc 27317590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 288
Target Start/End: Original strand, 53467346 - 53467567
Alignment:
Q  66 ttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaact 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||    
T  53467346 ttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaata-taagttggtgtatgttagcaact 53467444  T
Q  166 cctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||    
T  53467445 catgtaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataactt 53467544  T
Q  266 gctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    | |||||||||| ||| ||||||    
T  53467545 gttaaaacactcccacataaaaa 53467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27360213 - 27359948
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||       ||    
T  27360213 actagtttttaataaggcgtgttttaacaaagatataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa-ta 27360115  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27360114 agtgggtgtatgttagcaactcctatag-catttgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagttataact-aaaagtagttaa 27360017  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||  || |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  27360016 atgtaccttaaggtatagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 27359948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 279
Target Start/End: Original strand, 29239564 - 29239800
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         
T  29239564 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacactcattctaaaaa 29239663  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagta 239  Q
       | || |||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29239664 ---atgtaggtgtatgttagcaactcgtataggcatttgttaaaatacacccacatatttttttagaatgtgtgttttaccaagttataactaaaaagta 29239760  T
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctc 279  Q
    |||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29239761 gttagatatactctaaggtgtagcttgctaaaacaatctc 29239800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32203375 - 32203132
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||     
T  32203375 atacacccattagtttttatgtcggagtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtg----ttgctaaaacatacattcta 32203280  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32203279 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactagaaa 32203181  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaa 286  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32203180 gtagttaaatgcac-ttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaa 32203132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Original strand, 48765176 - 48765452
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgcta---aaacacacatt 133  Q
    ||||| ||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  48765176 atacatccactagtttttatgtgggagtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctactaaaacacacttt 48765275  T
Q  134 ctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaa 233  Q
    ||       ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  48765276 ctacaaaa-taagtgggtgtatgttaacaactcctatggatatttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaa 48765374  T
Q  234 aaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  48765375 aaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaatactcacacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaat 48765452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3269587 - 3269357
Alignment:
Q  47 tagtttttattaaggtgtgtttt-agcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaa 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||    
T  3269587 tagtttttattaaggtgtgtttttatcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-aaaaaataa 3269489  T
Q  146 gtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataact-aaaaagtagttaa 244  Q
    || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||    
T  3269488 gttggtgtatgttaccaactcctatatgcatttgctaggatacacacacttattttttagaatgtctgttttagcatgttataactaaaaaaatagttaa 3269389  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  3269388 atacactttaaggtgcagcttgctaaaacact 3269357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Original strand, 50912966 - 50913216
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| |||||||   || || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  50912966 atacacccactaatttttatgtgggagtattttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacatattcta 50913065  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  50913066 aaaaa-taaatgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagttataactaaaaa 50913164  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  50913165 gtagttaaatgtaccttaagatgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 50913216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 37 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17605699 - 17605506
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||     
T  17605699 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttttaaaacacatcttct- 17605601  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataact 231  Q
          |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17605600 aaaaaataagtgggggtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtttgttttagcaagttataact 17605506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 22894513 - 22894679
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  22894513 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaca-tct- 22894610  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttag 205  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22894611 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctaggatacacccacttattttttag 22894679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6115012 - 6114739
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  6115012 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 6114914  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  6114913 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaa 6114814  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  6114813 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 6114739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 291
Target Start/End: Original strand, 26103649 - 26103834
Alignment:
Q  104 cttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  26103649 cttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgccagga--cacccacttatttttt 26103746  T
Q  204 agaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  26103747 agaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacactcccaaataaaaatta 26103834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 6748614 - 6748886
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  6748614 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 6748712  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  6748713 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 6748812  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||  ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  6748813 tggttaaatacaccttaaggtgtaactttgctaaaacacttccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 6748886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7848757 - 7848485
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||       
T  7848757 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaa 7848659  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  7848658 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 7848559  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  7848558 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 7848485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8815206 - 8815062
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||       ||    
T  8815206 actagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacgttct-aaaaaata 8815108  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacac 190  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8815107 agtgggtgtatgttagcaacttctataagcatttgctagaatacac 8815062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21727876 - 21727603
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |       
T  21727876 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaa 21727778  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  21727777 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaa 21727678  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  21727677 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 21727603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47461925 - 47461652
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  47461925 acacccactagtttttatgtgggaatgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctatt 47461827  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
        | |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  47461826 aaaattaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 47461727  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  47461726 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 47461652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8815561 - 8815290
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  8815561 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 8815463  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||  |||||  ||||||||||||    
T  8815462 aaaacaagtgggtgtgttttagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactta-tttttagaaggagtattttcgcaagtgaataactaaaaag 8815364  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  8815363 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 8815290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11460380 - 11460113
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  11460380 acacccactagtttttatgtgggaatgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 11460282  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         ||||| ||||    |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  11460281 aaaacaagtgagtgtgctctagcaaatcctataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaag 11460182  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  11460181 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 11460113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 54244847 - 54244749
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54244847 atacacctactagtttttattaaggtgtgttttaacaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 54244749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12896868 - 12896617
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   |  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  12896868 acacccactagtttttatgtggaagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 12896770  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  12896769 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 12896670  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  12896669 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 12896617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 45059496 - 45059769
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| ||  | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||       
T  45059496 acacccactagtttttatgtgggagtgttttaacag-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaac 45059594  T
Q  139 nnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
         ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  |||||||||||    
T  45059595 aaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 45059694  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  45059695 gtggttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaaacactcccaaataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 45059769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37504727 - 37504499
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctag 183  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||| |||    
T  37504727 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgttag 37504628  T
Q  184 aatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcac 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||    
T  37504627 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttccac 37504528  T
Q  282 gtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  37504527 ataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 37504499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 313
Target Start/End: Original strand, 22894875 - 22894989
Alignment:
Q  198 ttttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgagg 297  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||    
T  22894875 ttttatagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-gg 22894973  T
Q  298 tgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  22894974 tgtattctagcaaatc 22894989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 6109128 - 6109401
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  6109128 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 6109226  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||| |||||  |||||||||||    
T  6109227 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 6109326  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  6109327 gtggttaaatacaccttaaggtgtagcgttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 6109401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30033236 - 30033150
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaa 123  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30033236 atacatccattagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataataaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaa 30033150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Original strand, 17226273 - 17226411
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  17226273 catttgctagaatacacccacttattttttagaagaaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 17226372  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  17226373 acactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaa 17226411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38798210 - 38797967
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||       
T  38798210 acacccactagtttttatgcgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaagtgtatgttgcgataacacaccttctaaa 38798112  T
Q  139 nnnnta--agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaa 235  Q
         |  ||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||    
T  38798111 aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacatccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaa 38798012  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctc 279  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  38798011 agtggttaaatacacattaaggtatagctttgttaaaacactctc 38797967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158469
Alignment:
Q  98 atacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactt 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  197 attttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatg 294  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 26158453  T
Q  295 aggtgtgttctatcaaa 311  Q
     ||||||||||| ||||    
T  26158454 -ggtgtgttctagcaaa 26158469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7521551 - 7521352
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         ||||||||||||  |||||| |||||||  |||    
T  7521551 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtattctagcaaatcctataggcat 7521452  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaaca 274  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  7521451 ttgttagaatacacccacttattttttagaaagaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 7521352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Original strand, 994686 - 994940
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||       
T  994686 acacccactaatttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaa 994784  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         || ||||||| |  || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  994785 aaaacaattgggtgtgttctaccaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaag 994884  T
Q  238 tagttaaatacacattaa-agtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    | |||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  994885 tggttaaatacactctaagggtgtagctttgctaaaacattcccacataaaaatta 994940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27728400 - 27728149
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaca--ttctnnnnnnn-taagtgggtgtatgtta 159  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||        ||||||||||| | |||    
T  27728400 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataagtgggtgtgtttta 27728302  T
Q  160 gcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagt 258  Q
    |||| |||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||   | ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  27728301 gcaaatcctataggcatttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggt 27728202  T
Q  259 gtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| || || || ||||||||||| ||||    
T  27728201 gtagctttgctaaaacactcccacataataactagtg-ggtgtgttctagcaaa 27728149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4043733 - 4043586
Alignment:
Q  165 tcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag- 262  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  4043733 tcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtaga 4043634  T
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  4043633 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 4043586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Original strand, 34277552 - 34277683
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataact-aaaaagtagt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||   |||||| ||||| | ||    
T  34277552 taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacgtttg-tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaacgataactaaaaaaatggt 34277650  T
Q  242 taaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  34277651 taaatacactctaaggtgtagtttgctaaaaca 34277683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 288
Target Start/End: Original strand, 994996 - 995243
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||||||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||           
T  994996 ccactagtttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaa 995094  T
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtag 240  Q
     |||||||| | |  |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||||| |    
T  995095 caagtgggtatgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtgg 995194  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||    
T  995195 ttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaaacattcccacataaaaa 995243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30685267 - 30685186
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtt 118  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30685267 atacacccattaatttttattaaggtgcgttttaccgaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgtt 30685186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 51148000 - 51148215
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct-nnnnnnntaagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  51148000 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaagaaacaagtgggtgtgttctagc 51148098  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||   || |||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  51148099 aaatcctataga-atttgctagaacgcacccacttattttttagaatgagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaacttaaggtgt 51148197  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactc 277  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  51148198 agctttgctaaaacactc 51148215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Original strand, 2868231 - 2868366
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagt 241  Q
    ||||||||||| |  |||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||  |||| |||||||| ||    
T  2868231 taagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagtgaataaataaaaagtggt 2868330  T
Q  242 taaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2868331 taaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacact 2868366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3544415 - 3544243
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagt 241  Q
    ||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||  | || |||||||| ||    
T  3544415 aagtgggtgtattctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaagaattaaaaagtggt 3544316  T
Q  242 taaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  3544315 taaatacaccctaaggtgtagctttactaaaacactcccacataaaaactagtga-gtgtgttctagcaaatcc 3544243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17065952 - 17065686
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| ||| |||||  |||||||  ||||||||| |||||  || ||||||| ||||           
T  17065952 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaa 17065854  T
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagt 241  Q
     |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||||| | ||    
T  17065853 caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggt 17065754  T
Q  242 taaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||   ||  |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  17065753 taaatacacccgaagatgtagctttgctaaaaca--ctcacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 17065686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17604969 - 17604884
Alignment:
Q  227 taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||| ||||||    
T  17604969 taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatc 17604884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51952395 - 51952269
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||        ||||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  51952395 tataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 51952296  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  51952295 ttgctagaatacacccacttatttttt 51952269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 26152161 - 26152413
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||||||| | | ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  26152161 acacccactagtttttatgtgagagtgttttagcta-gttataactaaaaagttaataaatataccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 26152259  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaa 236  Q
          |||  ||||| |  || ||| |||||||  |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  26152260 aaaaacaagcaggtgtgttctatcaaatcctataggcatttggtaagatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 26152359  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc--ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||    
T  26152360 gtggttaaatacaccttaaggtgtagcttttactaaaacactcccacataaaaa 26152413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 17226166 - 17226261
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  17226166 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 17226261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 26152474 - 26152569
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26152474 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 26152569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 30347738 - 30347833
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  30347738 acacccactagtttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 30347833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8814857 - 8814767
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  8814857 atacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaa-gttatgattaaaaagtagttcaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 8814767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 21408634 - 21408719
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  21408634 ataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 21408719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52654545 - 52654387
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||       
T  52654545 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaa 52654447  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttat 198  Q
        |||||| |||| |  |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  52654446 aaaataagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatttgctaaaatacacccacttat 52654387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4043842 - 4043771
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4043842 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 4043771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 53581638 - 53581548
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||    
T  53581638 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacac 53581548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 22894883 - 22894952
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22894883 aaggtgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 22894952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 111
Target Start/End: Original strand, 53467464 - 53467537
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 111  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  53467464 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 53467537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 27360104 - 27360141
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27360104 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaa 27360141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Original strand, 3269221 - 3269292
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  3269221 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttct 3269292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7521601 - 7521501
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  || |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  7521601 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtattttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 7521502  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  7521501 c 7521501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12127776 - 12127676
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  12127776 tttgttaggatacacccactgatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 12127677  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  12127676 c 12127676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Original strand, 17226154 - 17226254
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  17226154 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 17226253  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  17226254 c 17226254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Original strand, 26152462 - 26152562
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  |  |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  26152462 atttgctagaacacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 26152561  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  26152562 c 26152562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27800548 - 27800456
Alignment:
Q  186 tacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||    
T  27800548 tacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaagatgtaactttgctaaaacact 27800456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29950669 - 29950609
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29950669 taagtgggtgtatgttaccaagtgatataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29950609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29999823 - 29999763
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29999823 taagtgggtgtatgttaccaagtgatataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29999763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 30347762 - 30347826
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  30347762 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 30347826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 203
Target Start/End: Original strand, 53455639 - 53455699
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt 203  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53455639 taagtgggtgtaaattagtagctcctataggcatttgctagaatacacccacttctttttt 53455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 219
Target Start/End: Original strand, 17605582 - 17605616
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaa 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17605582 atacccccacttattttttagaagatgtgttttaa 17605616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 277
Target Start/End: Original strand, 29239551 - 29239653
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  29239551 tttgctagaatatacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 29239650  T
Q  275 ctc 277  Q
    |||    
T  29239651 ctc 29239653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 12127650 - 12127683
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12127650 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 12127683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 29950657 - 29950690
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29950657 atacacccacttattttttagaagaagtgtttta 29950690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 29999811 - 29999844
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29999811 atacacccacttattttttagaagaagtgtttta 29999844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Original strand, 36418793 - 36418834
Alignment:
Q  50 tttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36418793 tttttatcaaggtgtcttttagcaaagttataattaaaaagt 36418834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 36824064 - 36824101
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  36824064 atacacccacttattttttagaatgtgtgttttaacaa 36824101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 38101280 - 38101190
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaat-acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  38101280 acaccaactaatttttataaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagtgg--aaatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaaaacac 38101190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 54411883 - 54411793
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaat-acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacac 130  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  54411883 acaccaactaatttttataaaggtgttttttagcaaagttataactaaaaagtgg--aaatcacaccttgaggtgtaggttgctaaaagacac 54411793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3283363 - 3283311
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3283363 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagctataactaaaaagt 3283311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4043842 - 4043778
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  4043842 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 4043778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 236
Target Start/End: Original strand, 6125820 - 6125888
Alignment:
Q  168 tataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6125820 tatagacatttgctaaaagacaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaa 6125888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12896880 - 12896780
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||  |  || |||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||    
T  12896880 atttgctagaacacacccactagtttttatgtggaagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataaca 12896781  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  12896780 c 12896780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17604965 - 17604921
Alignment:
Q  84 taaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  17604965 taaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 17604921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27800653 - 27800589
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||  |||||| |||||    
T  27800653 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaagtgtatgttgctataacac 27800589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37702661 - 37702609
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37702661 acaccaactaatttttatgaaggtgttttttagcaaagttataactaaaaagt 37702609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50801809 - 50801729
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50801809 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 50801729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Original strand, 50874071 - 50874151
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50874071 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 50874151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 51952409 - 51952365
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  51952409 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 51952365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33730751 - 33730479
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  33730751 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt 33730652  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||| |    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33730651 aaaaaataagag----tatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 33730556  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  33730555 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 33730479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25061886 - 25061649
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  25061886 atacacgcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag-tgaatgttgctaaaacacaccttcta 25061788  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25061787 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagttataactaaaaa 25061689  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  25061688 gtagttaaataca-tttaaggtgtagcttgctaaaacactc 25061649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 57 - 291
Target Start/End: Original strand, 4898426 - 4898659
Alignment:
Q  57 taaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |       ||||||||||||||    
T  4898426 taaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctt-ttaaaaaataagtgggtgtatg 4898524  T
Q  157 ttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  4898525 ttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaag 4898624  T
Q  257 gtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4898625 gtgtagcttgctaaaacactcatacataaaaatta 4898659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14488528 - 14488292
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  14488528 atacacccactagttttta---aggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattcta 14488432  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14488431 aaaaa-taagtgagtgtatgttagcaactcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 14488333  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||    
T  14488332 gtagttaaatacattctaaggtgtagcttactaaaacactc 14488292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 30525315 - 30525586
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||     
T  30525315 atacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatacaactaaaaagttgttaa-tacaccttaaggtgaatcttgctaaaatacaccttcta 30525413  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  30525414 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaagtatgttttagcaaattataactaaaaa 30525512  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  30525513 gtagttaaatacaccttaaggtgcagcttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaa 30525586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4838514 - 4838232
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  4838514 atacacccattagtttctattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttct- 4838416  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgc------tagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataac 230  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |      ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4838415 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttactaggaataggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataac 4838316  T
Q  231 taaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    |||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  4838315 taaaaaatacttagatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcct 4838232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15718442 - 15718167
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15718442 atacacccactagtttttatgtgggagtgttgtagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacattttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta 15718343  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15718342 aaaaattaagtgggtgtaagttagcaactcctataggcatttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaattataactaaaaa 15718243  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  15718242 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacattcccacataaaaactattga-gtgtgttctagcaaatc 15718167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18102915 - 18102671
Alignment:
Q  44 cactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |       |    
T  18102915 cactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaat 18102816  T
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtta 243  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18102815 aagttggtgtatgtcagcaacttctataggcatttgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagttataactaaagagtagtta 18102716  T
Q  244 aatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18102715 aatacaccttcaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 18102671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Original strand, 4898087 - 4898361
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  4898087 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttaggatagatataactaaaaagttgtccaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattcta 4898186  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttta-gaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4898187 aaaaa-taagttggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagttataactaaaa 4898285  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    | | ||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  4898286 aattgttaaatacacctcatggtgtagcttgctaaaatactcccacataaaaagtagtg-ggtgtgttctaacaaat 4898361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Original strand, 21969857 - 21970092
Alignment:
Q  40 cacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnn 139  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |  ||||        
T  21969857 caccaactcgtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaatgttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaatataatttctaaaa 21969956  T
Q  140 nnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagta 239  Q
       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21969957 aa-taagtgggtgtatgttaccaactcttataaacatttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagttataactaaaaagta 21970055  T
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  21970056 gttaaatacaccttaagatgtagcttgctaaaacact 21970092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11742555 - 11742279
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||     
T  11742555 atacacccattaatttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttcta 11742456  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  11742455 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggttataactaaaaa 11742357  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
     |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  11742356 atagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacacttcctcataaaaattagtg-ggtgtgttctaacaaatcct 11742279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 276
Target Start/End: Original strand, 3437973 - 3438191
Alignment:
Q  57 taaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||       || |||||||||||    
T  3437973 taaggtgtgttttagcaaatatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgctgctaaaatacaacttctaaaaaa-tatgtgggtgtatg 3438071  T
Q  157 ttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    ||| |||||| ||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  3438072 ttaccaactcttataggcatttgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaag 3438171  T
Q  257 gtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  3438172 gtgtagcttactaaaacact 3438191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Original strand, 11009874 - 11010115
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  11009874 atacaccaactaatttttattaaggtatgttctagtaaagatataattaaaatattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaagactcattct- 11009972  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccac--ttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
          ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  || ||||||    || ||||||||||||||||||||||||    
T  11009973 aaaaaataagtgggtctatgttaacaactcctatatgcatttgctagaatacactcactttttttttttttttgaagtgttttaacaagttataactaaa 11010072  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  11010073 aagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacactc 11010115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18154672 - 18154503
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18154672 taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagttataacaaaaaaatagtt 18154573  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  18154572 aaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 18154503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11100292 - 11100081
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  11100292 atacacccactaatttttattaatgtgtgttttagtaaagatataactaaatagttgttacatacagcttaagatgaatgttgctaaaacactcatttta 11100193  T
Q  137 nnnnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttatttttt-agaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
           | | ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  11100192 aaaaaagtgaatggttgtatattagcaactcctatatgcatttgctagaatgcacccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaa 11100093  T
Q  235 aagtagttaaat 246  Q
    ||||||||||||    
T  11100092 aagtagttaaat 11100081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Original strand, 1369886 - 1370134
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||        |||||||||| |  || ||    
T  1369886 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctaaca 1369984  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1369985 aatcctatagacatttgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 1370084  T
Q  262 gc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1370085 gctttgctaaaacactctcacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 1370134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 314
Target Start/End: Original strand, 31132839 - 31133115
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||       
T  31132839 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctaga 31132937  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  31132938 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 31133037  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  31133038 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 31133115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 11100343 - 11100594
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||       
T  11100343 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaac 11100441  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  11100442 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 11100541  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11100542 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 11100594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29646450 - 29646178
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  29646450 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaa-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 29646353  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  29646352 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 29646253  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  29646252 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 29646178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Original strand, 9955758 - 9955998
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||       
T  9955758 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaa 9955856  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |  |||||||||||    
T  9955857 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttaacaaatgaataactaaaaa 9955956  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9955957 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 9955998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8172110 - 8171857
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  8172110 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaa 8172012  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  ||||||||| ||    
T  8172011 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaacag 8171912  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaatta 291  Q
    | |||||||||||  |||  | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8171911 tggttaaatacactctaagttatagctttgctaaaacactcccacataaaaatta 8171857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 288
Target Start/End: Original strand, 15962738 - 15962951
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  |||||| | |||||  |||    
T  15962738 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcat 15962837  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaaca 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  15962838 tttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 15962937  T
Q  275 ctctcacgtaaaaa 288  Q
    ||| ||| ||||||    
T  15962938 ctcccacataaaaa 15962951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9406789 - 9406559
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |  ||||||| ||||       ||| | ||||||| ||||||    
T  9406789 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttgataaatacactttgaggtgcatgttgttgcaacacaccttctaaaaaaataaataggtgtatattagca 9406691  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag 262  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||| | ||||| | ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||    
T  9406690 attcctatatgcatttgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaaaactaaaaagtagttcagtgcaccataaagtgtag 9406591  T
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatg 294  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  9406590 cttgctaaaacactaccgcataaaaattaatg 9406559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 277
Target Start/End: Original strand, 26211348 - 26211478
Alignment:
Q  147 tgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaat 246  Q
    ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |    
T  26211348 tgggtgtatgttagcaattcttgtaggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatgataattaaaaagtagtcaagt 26211447  T
Q  247 acacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26211448 acaccttaaggtgtagcttgctaaaacactc 26211478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 288
Target Start/End: Original strand, 4184327 - 4184473
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  4184327 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 4184426  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  4184427 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 4184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 5703815 - 5703974
Alignment:
Q  40 cacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnn 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||        
T  5703815 cacccactagtttttattaaggagttttttaacaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtagatgttgctaaaa-actccttctaaaa 5703913  T
Q  140 nnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttag 205  Q
       |||||||||||| ||||||||||||      |||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  5703914 aaataagtgggtgtaagttagcaactcc-----gcatttgttaaaatatacccacttattttttag 5703974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 288
Target Start/End: Original strand, 10777911 - 10778157
Alignment:
Q  44 cactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt 143  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||            
T  10777911 cactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaa 10778009  T
Q  144 -aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagt 241  Q
     |||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||||  |    
T  10778010 caagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgtt 10778109  T
Q  242 taaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  10778110 taaatacaccttaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 10778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 16599032 - 16599305
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  16599032 acacccactaatttttatgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 16599130  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||| ||||| | ||||  | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  16599131 aaaaacaagttggtgtgttttagtgaatcctataggcatttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 16599230  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||   ||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  16599231 gttaataaatacaccttaaggtgtagctttggtaaaacactcccacataaaaactagtga-gtgtgttctagcaaa 16599305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Original strand, 5187740 - 5187999
Alignment:
Q  46 ctagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaa 145  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |       |||    
T  5187740 ctagtttttatgtaggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaataa 5187838  T
Q  146 gtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaa 244  Q
    |||||||| |  ||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  5187839 gtgggtgtgttctagcaaaacctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagattgagtattttaacaaatgaataactaaaaagtgattaa 5187938  T
Q  245 atacacattaaagtgtag-cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    ||||||  |||  |||||  |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5187939 atacac-ctaagatgtagatttgctaaaacacttccacataaaaattaatg-ggtgtgttcta 5187999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Original strand, 27828379 - 27828524
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  27828379 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 27828478  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaa 287  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  27828479 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaa 27828524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 276
Target Start/End: Original strand, 228020 - 228096
Alignment:
Q  199 tttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  228020 tttttagaaggtatgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatataccttaaa-tgtagcttgctaaaacact 228096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 20755437 - 20755591
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  20755437 tagcaaatcctatagacgtttgctagaatacacgcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 20755536  T
Q  257 gtgta-gcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||   || ||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  20755537 gtatattttttctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 20755591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Original strand, 15881889 - 15881984
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  15881889 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 15881984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 277
Target Start/End: Original strand, 32889636 - 32889737
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaac 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||| |||    
T  32889636 atttgctagaatacacccacttattttttaaaagaagtattttaacaaagatataact--aaagtggttaaatacaccttaaaatgcatgttgctataac 32889733  T
Q  274 actc 277  Q
    ||||    
T  32889734 actc 32889737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 32194261 - 32194210
Alignment:
Q  225 tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  32194261 tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttactaaaacact 32194210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35002082 - 35002025
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35002082 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattct 35002025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 288
Target Start/End: Original strand, 10315306 - 10315417
Alignment:
Q  180 ctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa--gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| |||  |  |||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  10315306 ctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaaataactaaaaggttgttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaacact 10315405  T
Q  277 ctcacgtaaaaa 288  Q
    | ||| ||||||    
T  10315406 cccacataaaaa 10315417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Original strand, 11210284 - 11210355
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  11210284 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 11210355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24022962 - 24022877
Alignment:
Q  49 gtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  24022962 gtttttatgtaggagtattttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 24022877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 26667852 - 26668026
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| |||||| || |||||| || ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  26667852 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagc 26667950  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
    || | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| ||||||||||||    
T  26667951 aaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 265
Target Start/End: Original strand, 11122528 - 11122589
Alignment:
Q  204 agaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagctt 265  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  11122528 agaaggtgtattttagcaagttataattaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagctt 11122589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 32194268 - 32194227
Alignment:
Q  71 gcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32194268 gcaaagatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 32194227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10196675 - 10196611
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  10196675 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 10196611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 15962724 - 15962788
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  15962724 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 15962788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33730760 - 33730660
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  33730760 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 33730661  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  33730660 c 33730660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10196661 - 10196610
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 129  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10196661 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacaca 10196610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 122
Target Start/End: Original strand, 27828294 - 27828352
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgcta 122  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27828294 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcta 27828352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 112
Target Start/End: Original strand, 11122530 - 11122583
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11122530 aaggtgtattttagcaa-gttataattaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtg 11122583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Original strand, 27828258 - 27828344
Alignment:
Q  175 atttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgta 261  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||   |  || |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  27828258 atttgctagaacacacccactaattttaatgtggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 27828344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 4838397 - 4838430
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4838397 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 4838430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 11742438 - 11742471
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11742438 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 11742471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 25061770 - 25061803
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25061770 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 25061803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 10075061 - 10075113
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10075061 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttaacaaagttataattaaaaagt 10075113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 11210284 - 11210348
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  11210284 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 11210348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11742564 - 11742464
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||   ||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  |||||||||||    
T  11742564 tttgctaggatacacccattaatttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaaca 11742465  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  11742464 c 11742464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12159536 - 12159484
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12159536 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 12159484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14488537 - 14488438
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  ||| |||||||    
T  14488537 tttgctaggatacacccactagttttt---aaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaaca 14488441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 15881913 - 15881977
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  15881913 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 15881977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18154607 - 18154540
Alignment:
Q  60 ggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18154607 ggtgtgttttagcaa-gttataacaaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacac 18154540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19104368 - 19104316
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19104368 acaccaactaatttttacgaaggtgtgttttagcaaagttataactaaaaagt 19104316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 108)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26335979 - 26335704
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  26335979 atacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttcta 26335880  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26335879 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 26335781  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  26335780 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagt-tggtgtgttctagcaaatcc 26335704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 52307006 - 52306733
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  52307006 atacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttata 52306907  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  52306906 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaacttataactaaaaa 52306808  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  52306807 gtagttaaatacaccttaaggtgtaggttgctaaaacactctcccataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaat 52306733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 46106912 - 46106637
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  46106912 atacacccactagtttttattaaagtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctccta 46106813  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46106812 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactccaataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaa 46106714  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  46106713 gtagttgaatacaccttaaggtggagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 46106637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6946878 - 6946609
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||| ||||     
T  6946878 atacatccactagtttttattaaggtgtgttttggtaaagatataactaaaaagttgttaaatacat-----ggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 6946784  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6946783 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaa 6946685  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  6946684 gtagttaaatacactttaaggtgtagcttgctaaaacactctcacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 6946609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Original strand, 40496117 - 40496366
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  40496117 acaccgactagtttttatataggagtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaa 40496216  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
        |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40496217 aaaataagtgggtgtaagttagcaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 40496316  T
Q  239 agttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40496317 agttaaatataccttaaggtgtagcttactaaaacactcccacgtaaaaa 40496366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 9744105 - 9744380
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  9744105 atacacccactagtttttattaacgtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttcta 9744204  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9744205 aaaaa-taagtgggtgtatattagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataaataaaaa 9744303  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  9744304 gtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaatactctcacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatcc 9744380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 277
Target Start/End: Original strand, 6192936 - 6193168
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |       |     
T  6192936 actagtttttatttaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaatg 6193035  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6193036 agtgggtgtatgttagcaacacctataagcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataacaaaaaagtagttaa 6193135  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  6193136 atacaccctaaggtgtagcttgctaaaacactc 6193168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Original strand, 20458805 - 20459016
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||     
T  20458805 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatatagttaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttcta 20458904  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20458905 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagttataactaaaaa 20459004  T
Q  237 gtagttaaatac 248  Q
     ||| |||||||    
T  20459005 atagctaaatac 20459016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16553659 - 16553425
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||         
T  16553659 acccattagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaat 16553560  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtag 240  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16553559 a-taagtaggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtaa 16553461  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16553460 ttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacact 16553425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45875989 - 45875723
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||    
T  45875989 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacatt-ttaaaaaata 45875891  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaa 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  45875890 agtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaattataactaaaaagtagtgaa 45875791  T
Q  245 atacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    || ||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  45875790 atgcaccttaaggtgtagcttgttaaaacactcccacataaaaact-atg-ggtgtgttctagcaaatcc 45875723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14863205 - 14862936
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||     
T  14863205 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaaagtataactaaagagttgttaaatacac-----ggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 14863111  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14863110 aaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaag-tgtgttttagcaagttataattaaaaa 14863013  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  14863012 gtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaatcc 14862936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Original strand, 11777469 - 11777671
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11777469 atacacccactagtttttattaaggtatgttttagcaaaggtataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattct- 11777567  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  11777568 aaaaaataattgggtgtatgttagcaactcctataagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaa 11777667  T
Q  237 gtag 240  Q
    ||||    
T  11777668 gtag 11777671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Original strand, 49425737 - 49425943
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         
T  49425737 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct-aaaa 49425835  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtag 240  Q
      |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  49425836 aataagtgggtgtacgttagcaacttctataggcatttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaacttataactaaaaagtag 49425935  T
Q  241 ttaaatac 248  Q
    ||||||||    
T  49425936 ttaaatac 49425943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29102224 - 29101950
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaag-ttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  29102224 atacactcattaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaaattgttaaatacactttaaggtaaatgttgctaaatcacaccttct 29102125  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
            ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29102124 acaaaac-aagtgagtgtatgttaacaactcctataaacatttgctaggatacacccacttattttttataagatgtgttttagcaagttataattaaaa 29102026  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  29102025 agtagttaaatacacattaagatgtagcttactaaaacactcctacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaat 29101950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490627
Alignment:
Q  85 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctaga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctata 4490757  T
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgta 284  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  4490756 atacacccacttatttcctaaaatatgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacgctaagatgtagcttgttaaaacactcccacata 4490657  T
Q  285 aaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  4490656 aaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcct 4490627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 313
Target Start/End: Original strand, 38425651 - 38425899
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagca 162  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||    
T  38425651 gtgttttagcaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacatt-ttaaaaaataagtgggtgtatgttagca 38425749  T
Q  163 actcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag 262  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||    
T  38425750 actcctataggcatttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaacttaaggtgtag 38425849  T
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  38425850 cttgctaaaacactcccacataaaaactcgtg-ggtgtgttctagcaaatc 38425899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15725417 - 15725208
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  15725417 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct- 15725319  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  15725318 aaaaaataagtgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaa 15725219  T
Q  237 gtagttaaata 247  Q
     ||||||||||    
T  15725218 atagttaaata 15725208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 23383899 - 23384092
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  23383899 atacacccactggtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct---- 23383994  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaa 234  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23383995 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttaacaagttataactaaa 23384092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4712896 - 4712620
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||| ||||||||||   || || |||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||     
T  4712896 atacacccattagtttttatgtgggagtattttcgtaaagatataactagaaatttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttcta 4712797  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4712796 aaaaaataagtgggtgtaagttagcaactcctataggcattcgctaaaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaa 4712697  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||| || |||||||    
T  4712696 gtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaaccaatg-ggtgtgttttagcaaatcc 4712620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14948343 - 14948087
Alignment:
Q  54 tattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgt 153  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||||    
T  14948343 tattaaggtgtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaaaa-taagtgggtgt 14948245  T
Q  154 atgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacatt 253  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  14948244 atgttagcaactcatttagacatttgttaggattcacccacttattttttaaaaggtgtgttttaataagttataact-aaaagtagttaaatacacctt 14948146  T
Q  254 aaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||  |||||||||||||||| |||  || |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  14948145 aagatgtagcttgctaaaaccctcctacataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaatc 14948087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33106110 - 33105874
Alignment:
Q  77 atataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33106110 atataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaa-taagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 33106012  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  33106011 ttgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagttataatcaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaatact 33105912  T
Q  277 ctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    | ||| |||||| || || | |||||| || |||||||    
T  33105911 cccacataaaaactagtgggatgtgttatagcaaatcc 33105874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26958792 - 26958519
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||| ||||||||||||   || ||||| |||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  26958792 acacctactagtttttatgtgggagtgttgtagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 26958694  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
         |||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26958693 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaattataactaaaaagt 26958594  T
Q  239 agttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  26958593 agttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 26958519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 39 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 36955592 - 36955387
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||       
T  36955592 acacccactagttttcattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatatactttaaggtgaatgttgctaaaacacttatact-aa 36955494  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
        ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36955493 aaaataagt-ggtgtatgttagcaactcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 36955395  T
Q  239 agttaaat 246  Q
    ||||||||    
T  36955394 agttaaat 36955387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 314
Target Start/End: Original strand, 6137577 - 6137747
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6137577 taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagttataactaaaaagtagtt 6137676  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||| ||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  6137677 aaatgcaccttaaggtatagcttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 6137747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 54742664 - 54742411
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn-taagtgggtgtat--gtta 159  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |  ||||    
T  54742664 gtgttttagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaaataagtgggtgtgtaagtta 54742565  T
Q  160 gcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtg 259  Q
     |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||    
T  54742564 acaactcttataggcatttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagttataactagaaagtagttaaatgcactttaaggtg 54742465  T
Q  260 tagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  54742464 tagcttgctaaaacattcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 54742411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 142857 - 142676
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||     
T  142857 atacaccaactagtttttactaaggtgtgttttaggaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttct- 142759  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaa 219  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  142758 aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttaa 142676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43639240 - 43638942
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaag-ttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||| ||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43639240 atacacccattagtttttatgtgggagtgctttagcaaagatataattaaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct 43639141  T
Q  136 -nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgcta----------------------gaatacacccacttattttttagaagatgt 212  Q
            ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||                      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639140 agaaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctatagacatttgttagaatacacccacttattttttagaatacacccacttattttttagaagatgt 43639041  T
Q  213 gttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  43639040 gttttagcaagttataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaatacttccacataaaaattaatga-atgtgttctagcaaat 43638942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 5046603 - 5046875
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  5046603 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaa 5046701  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||     
T  5046702 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaa 5046801  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  5046802 tggttaaatacaccttaaggtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatg-ggtgtgttctagcaaa 5046875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48560253 - 48559981
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||| || | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||       
T  48560253 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagtaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaa 48560155  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtt-ataactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| || ||||||||||||    
T  48560154 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaag 48560055  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  48560054 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 48559981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 286
Target Start/End: Original strand, 52437423 - 52437647
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaa--gtgggtgtatgttag 160  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||||        ||  |||||||| |  |||    
T  52437423 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtgggtgtgttctag 52437521  T
Q  161 caactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  52437522 caactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 52437621  T
Q  261 agcttgctaaaacactctcacgtaaa 286  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||    
T  52437622 agtttgctaaaacactcccacataaa 52437647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 30820449 - 30820724
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  30820449 atacacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaaat-tataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta 30820547  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccactta-ttttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaa 234  Q
          ||| | |||||||  |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||    
T  30820548 aaaaaataaattggtgtattctagcaaatcctataggcatttgctagaagacacccacttatttttttagaaggagtattttaccaagtgaataactaaa 30820647  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  30820648 aagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 30820724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13212072 - 13211798
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||     
T  13212072 atacacccactagtttttatatgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttcta 13211974  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaa 235  Q
           |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||    
T  13211973 aaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaa 13211874  T
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||| || |||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  13211873 agtggtcaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaagcactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 13211798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 36 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40496679 - 40496480
Alignment:
Q  36 tatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  40496679 tatacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataagtataaagttgttaaatatacgttaaggtgaatgttggtaaaacaaaccttct 40496580  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaa 235  Q
           |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  40496579 aaaaaaataagcgggtggatgttagcaactcctatagacatttgctaga-------tacttatttgttaagagatgtgttttagcaggttataactaaaa 40496487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Original strand, 42807873 - 42808141
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  42807873 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 42807971  T
Q  139 nnnn-taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
         ||||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  42807972 aaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 42808071  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  42808072 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttccacataaaaattagtg-ggtgtgttcta 42808141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41172665 - 41172390
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  41172665 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gatataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 41172567  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
        ||| ||||||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  41172566 aaaataaatgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaag 41172467  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  41172466 tggttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaagcactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 41172390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33811178 - 33811008
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagtt 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33811178 taagtggatgtatgttagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagttataactaaaaagtagtt 33811079  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||| ||| |||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||| || || | ||||||||| |||||||    
T  33811078 aaatgcaccttaaggtatagcttgttaaaacactcccacataaaaactagtg-gatgtgttctagcaaatcc 33811008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49606144 - 49605982
Alignment:
Q  151 tgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacac 250  Q
    |||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49606144 tgtatgttagcagcttctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagttatagataaaaagtagttaaatacac 49606045  T
Q  251 attaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || || ||| ||||||| |||||||    
T  49606044 tttaaagtgtagcttgttaaaacactcccacctaaaaactagtg-ggtatgttctagcaaatcc 49605982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6214215 - 6213988
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||         |||||||||| |  ||||    
T  6214215 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagc 6214117  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgt 260  Q
    || |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6214116 aaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgt 6214017  T
Q  261 agc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6214016 agctttgctaaaacactctcacataaaaa 6213988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 102235 - 102366
Alignment:
Q  52 tttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggt 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||       |||||||||    
T  102235 tttattaaggtgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgttaaaacacaccttcttaaaaaataagtgggt 102334  T
Q  152 gtatgttagcaactcctataaacatttgctag 183  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  102335 ttatgttagcaactcctataggcatttgctag 102366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7630313 - 7630040
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||| ||||||||||   || |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||       
T  7630313 acacccattagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaac 7630215  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  7630214 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 7630115  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  7630114 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 7630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50182428 - 50182158
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||       
T  50182428 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaa 50182330  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaag 237  Q
         |||||||||| |  |||||| |  ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  50182329 aaaacaagtgggtgtgttctagcaaat--tataggcatttgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagtgaataactaaaaag 50182232  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50182231 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaatactttcacataaaaattaatg-ggtgtgttctagcaaa 50182158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5157249 - 5156980
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||           
T  5157249 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 5157151  T
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagt 241  Q
     || ||||||| |  |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||  ||||||||||||| ||    
T  5157150 caaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcctttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggt 5157051  T
Q  242 taaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||   ||||||||||| ||||    
T  5157050 taaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactttcacataaaaactaaatgggtgtgttctagcaaa 5156980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3819001 - 3818788
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||       
T  3819001 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaat-tataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaa 3818903  T
Q  139 nnnn--taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaa 235  Q
          ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||    
T  3818902 aaaaaataagtgggtgtgttctagcaaatcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaa 3818803  T
Q  236 agtagttaaatacac 250  Q
    ||| |||||||||||    
T  3818802 agtggttaaatacac 3818788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 13211513 - 13211603
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13211513 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaaaatataactaaaaagttgttaaatacacctttaggtgaatgttgctaaaaca 13211603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21519987 - 21519728
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |       
T  21519987 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaa 21519889  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |  |||||||||||    
T  21519888 aaaaacaagtgggtgtgttctagtaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaaatcaataactaaaaa 21519789  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgag 296  Q
    || |||||||||||  ||| | ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21519788 gtggttaaatacaccctaaggagtagctttactaaaacactcccacataaaaattaatgag 21519728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 14202832 - 14203105
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||| | | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||       
T  14202832 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcga-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaa 14202930  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          ||||| |||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  |||||||||||    
T  14202931 aaaagcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtggataactaaaaa 14203030  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  14203031 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 14203105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 12584248 - 12584521
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||||||||||    || |||||||| ||| | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  12584248 acacccactagtttttacgtgggagtgttttaacaa-gttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 12584346  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||| | |  |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||    
T  12584347 aaaaacaagtgggtatgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 12584446  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  12584447 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctagaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaa 12584521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49970811 - 49970578
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||        |||||||||| | ||||||| |||||||  ||||    
T  49970811 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaacaagtgggtgtgt-ttagcaaatcctataggcatt 49970713  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgtttta-acaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | ||   ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||    
T  49970712 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaatgtgtagatttgctaaaacac 49970613  T
Q  276 tctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||  ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  49970612 tcccaaataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 49970578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 10216220 - 10216413
Alignment:
Q  45 actagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnta 144  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||        |    
T  10216220 actagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaca 10216318  T
Q  145 agtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagt 238  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  10216319 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 10216413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Original strand, 34683010 - 34683278
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  34683010 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaac 34683108  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||| |  |||||||||||    
T  34683109 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattaaataactaaaaa 34683208  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagct-tgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    || ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  34683209 gtggttaaatacaccttaaggtgtaactctgctaaaacactcccacgtaaaaactagtg-ggtgtgttcta 34683278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 311
Target Start/End: Original strand, 10981398 - 10981536
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaa 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10981398 catttgctagaatacatccacttattttctagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacattaaggtgtagctttgctaaa 10981497  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  10981498 acactctcacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 10981536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17181087 - 17180933
Alignment:
Q  158 tagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtt-ataactaaaaagtagttaaatacacattaaa 256  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  17181087 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttttgcaatttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaag 17180988  T
Q  257 gtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  17180987 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 17180933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 30258089 - 30258256
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||       
T  30258089 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaa 30258187  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaa 207  Q
         ||||| |||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30258188 aaaacaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 30258256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13621353 - 13621086
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  13621353 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 13621255  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaa 236  Q
          |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||| | ||||||||||    
T  13621254 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacc-acttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 13621156  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    || ||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  13621155 gtggttaaatacaccttaatttttagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 13621086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17377745 - 17377481
Alignment:
Q  43 ccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnn 142  Q
    ||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||           
T  17377745 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 17377647  T
Q  143 t-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtag 240  Q
      |||||||||| |  |||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||| |||    
T  17377646 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcttttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatag 17377547  T
Q  241 ttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    || ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||| || || |||||||||||    
T  17377546 tttaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccgcataaaaactagtg-ggtgtgttcta 17377481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 51783933 - 51784205
Alignment:
Q  41 acccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnn 140  Q
    ||||||||||||||||   |  ||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         
T  51783933 acccactagtttttatgtggaagtgttttagcaagta-ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaata 51784031  T
Q  141 nntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacaccc-acttattttttagaa-gatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
       |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||  || |  ||||||||||||    
T  51784032 aacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccctacttattttttagaagggagtattttagtaaataaataactaaaaag 51784131  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51784132 tgattaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaatactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaa 51784205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Original strand, 578719 - 578961
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaa--acacacattctn 136  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||     
T  578719 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttcta 578817  T
Q  137 nnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaa 234  Q
            || |||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||| |  |||||||||    
T  578818 gaaaaagcaaatgggtgtattctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaa 578917  T
Q  235 aagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactc 277  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  578918 aagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 578961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17745401 - 17745165
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||| |||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  17745401 acactcactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaa 17745303  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaag 237  Q
         |||||| ||| |  |||||| |||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||  |||||||||||     
T  17745302 aaaacaagtggatgtgttctagcaaatcctataggcat--gctagaatacacccacctattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaa 17745205  T
Q  238 tagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacact 276  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  17745204 tggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacact 17745165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 49606234 - 49606163
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaa 108  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49606234 atacacccattagtttttattagggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaa 49606163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18470378 - 18470237
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtag-cttgctaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  18470378 catttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagttttgctaaa 18470279  T
Q  272 acactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  18470278 acactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctaacaaatcc 18470237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 135
Target Start/End: Original strand, 38425532 - 38425630
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||| ||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38425532 atacacctactagtttttatgttggagtgttttagtaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct 38425630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 54818695 - 54818630
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaataca 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  54818695 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaacatataactaaaaagttgttaaataca 54818630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6137589 - 6137498
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| || || | ||||||||||||    
T  6137589 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaggtataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtatatctttgctaaaacac 6137498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 13211625 - 13211724
Alignment:
Q  213 gttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaat 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||| |||||||||| |||||    
T  13211625 gttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccacatcaaaactagtga-gtgtgttctagcaaat 13211723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13371428 - 13371256
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||    
T  13371428 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13371329  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 249  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||  ||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  13371328 tgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaataca 13371256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13381629 - 13381457
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| |  |||||| |||||||  ||||    
T  13381629 tataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 13381530  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 249  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||  ||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  13381529 tgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaataca 13381457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 288
Target Start/End: Original strand, 13621381 - 13621527
Alignment:
Q  144 aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagtt 242  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| |||    
T  13621381 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 13621480  T
Q  243 aaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||   ||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  13621481 aaatacaccacaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 13621527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 50678033 - 50677961
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50678033 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagc-aagttataactaaaaag-tattaaatacaccttaaggt 50677961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 91
Target Start/End: Original strand, 4505237 - 4505291
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4505237 atacacccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaaaatataactaaaaagt 4505291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 6137472 - 6137516
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatata 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6137472 atacacccactagtttttattaaggcgtgttttagcaaagatata 6137516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 128
Target Start/End: Original strand, 52437546 - 52437636
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  52437546 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaa-gttataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagtttgctaaaacac 52437636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40496467 - 40496405
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40496467 ataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttattaaaacattctcacgtaaaaa 40496405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 49426124 - 49426197
Alignment:
Q  240 gttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcc 314  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  49426124 gttaaatacaccttaaggtgtaggttgctaaaacactctcacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatcc 49426197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 50678033 - 50677905
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgta 284  Q
    |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| || ||||||||||  || ||    
T  50678033 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaagttataactaaaaagta-ttaaatacaccttaaggtatagcatgataaaacactcctacata 50677935  T
Q  285 aaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  50677934 aaaactagtg-ggtgtattctaacaaatcct 50677905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33811349 - 33811285
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatac 101  Q
    |||||||||||| |||||||   || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33811349 atacacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatac 33811285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 47382407 - 47382312
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||    
T  47382407 acacccactagtttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttct 47382312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45801928 - 45801804
Alignment:
Q  174 catttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataac---taaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgct 268  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||  |||||   |||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||| |    
T  45801928 catttgttagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaataaaaagtggttaaatacactctaatgtgtagctttgtt 45801829  T
Q  269 aaaacactctcacgtaaaaattaat 293  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||    
T  45801828 aaaacactcccacataaaaactaat 45801804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 142677 - 142598
Alignment:
Q  233 aaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatc 313  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  142677 aaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactccaacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaatc 142598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 23383890 - 23383990
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  23383890 tttgctaggatacacccactggtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 23383989  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  23383990 c 23383990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 32868053 - 32868105
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32868053 acaccaactaatttttatgaaggtgtgttttagcaaagttataactaaaaagt 32868105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49970825 - 49970761
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  49970825 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 49970761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33105982 - 33105916
Alignment:
Q  58 aaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  33105982 aaggtgtgttttagcaa-gttataatcaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaa 33105916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 102245 - 102291
Alignment:
Q  210 tgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  102245 tgtgttttaacaaagatataactaaaaagttgttaaatacacattaa 102291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6137589 - 6137516
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggt 111  Q
    |||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6137589 atacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagg-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggt 6137516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Original strand, 48474984 - 48475034
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaa 87  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  48474984 atacacacattagtttttattaagatgtgttttaacaaagatataactaaa 48475034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 6946766 - 6946799
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6946766 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 6946799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 14863093 - 14863126
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14863093 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 14863126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 222
Target Start/End: Original strand, 15725300 - 15725337
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15725300 atacactcacttattttttagaaggtgtgttttaacaa 15725337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 218
Target Start/End: Original strand, 26335862 - 26335895
Alignment:
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26335862 atacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 26335895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 40496467 - 40496434
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40496467 ataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 40496434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42560199 - 42560166
Alignment:
Q  205 gaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42560199 gaagatgtattttaacaagttataactaaaaagt 42560166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 288
Target Start/End: Original strand, 4505563 - 4505615
Alignment:
Q  236 agtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4505563 agtagttaaatacacccaaaggtgtagcttgctaaaacactcccacataaaaa 4505615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 5975724 - 5975776
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5975724 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 5975776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 6137328 - 6137380
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6137328 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 6137380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 10216238 - 10216302
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  10216238 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 10216302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Original strand, 11777460 - 11777560
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| | ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  11777460 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtatgttttagcaaaggtataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 11777559  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  11777560 c 11777560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 19329428 - 19329480
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19329428 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 19329480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 20503501 - 20503553
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20503501 acaccaactaatttttataaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 20503553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26335988 - 26335888
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||   ||| ||| ||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||    
T  26335988 tttgctaggatacacccactagtttttattaaggtgtattttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaaca 26335889  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  26335888 c 26335888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 27907058 - 27907110
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27907058 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 27907110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 30258113 - 30258177
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  30258113 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 30258177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 34683156 - 34683231
Alignment:
Q  37 atacacccact-agtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34683156 atacacccacttagtttttag-aaggagtattttagcaattaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtg 34683231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34728311 - 34728259
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34728311 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 34728259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 38427160 - 38427108
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38427160 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 38427108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 40875280 - 40875332
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40875280 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 40875332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42434320 - 42434268
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42434320 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 42434268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49425849 - 49425817
Alignment:
Q  186 tacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49425849 tacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 49425817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 52307015 - 52306915
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  52307015 tttgctaggatacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 52306916  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  52306915 c 52306915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4295 - 4057
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4295 atacacacactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 4196  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  4195 aaaaa-taagtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagttataactaaaaa 4098  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4097 gtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactc 4057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 4204
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaa-gttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaaca 274  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||   ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||    
T  4304 tttgctaggatacacacactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 4205  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  4204 c 4204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 5)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5669
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       
T  5917 acaccgactagtttttatataggagtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaa 5818  T
Q  139 nnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaagt 238  Q
        |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5817 aaa-taagtgggtgtaagttagcaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagttataactaaaaagt 5719  T
Q  239 agttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5718 agttaaatataccttaaggtgtagcttactaaaacactcccacgtaaaaa 5669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 184
Target Start/End: Original strand, 5355 - 5503
Alignment:
Q  36 tatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  5355 tatacacccactagtttttattaaggtgtgttttaacaaagatataagtataaagttgttaaatatacgttaaggtgaatgttggtaaaacaaaccttct 5454  T
Q  136 nnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctaga 184  Q
           |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5455 aaaaaaataagcgggtggatgttagcaactcctatagacatttgctaga 5503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 288
Target Start/End: Original strand, 5568 - 5630
Alignment:
Q  226 ataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaa 288  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5568 ataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttattaaaacattctcacgtaaaaa 5630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 112
Target Start/End: Original strand, 5568 - 5601
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5568 ataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 218
Target Start/End: Original strand, 5803 - 5835
Alignment:
Q  186 tacacccacttattttttagaagatgtgtttta 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5803 tacacccacttattttttagaaggtgtgtttta 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 800 - 561
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||     
T  800 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaattacaccttaagatgaatgcttctaaaacacacattcta 701  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  700 aaata-taagtgggtgtatgttagcaactcctataggcattttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaagctataactaaaaa 602  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactc 277  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  601 gtagttaaaaacaccttaaggtgtagcttgctagaacactc 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 809 - 729
Alignment:
Q  176 tttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaac-aagttataactaaaaagtagttaaatacacattaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  809 tttgctagaatacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaattacaccttaa 729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6775 - 6508
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctn 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6775 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 6676  T
Q  137 nnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagttataactaaaaa 236  Q
          ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6675 aaaaa-taattgggtgtgtgttagcaactcctataggcatttgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagttataactaaaaa 6577  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || |||||||||||    
T  6576 gtaattaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacacttccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 311
Target Start/End: Original strand, 452367 - 452601
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatt 177  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       |||||| |||| |  |||||| || ||||  ||||    
T  452367 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaataagtgcgtgtgttctagcaaatcgtataggcatt 452466  T
Q  178 tgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacac 275  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  452467 tgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 452566  T
Q  276 tctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
    || ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  452567 tcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 452601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 452474 - 452549
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    |||||||||||  |||||   |||| || |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  452474 atacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtg 452549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 94897 - 94845
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  94897 acaccaactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 94845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1717 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1717
Description:

Target: scaffold1717; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 1340 - 1429
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1340 atacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaaca 1429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1527 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1527
Description:

Target: scaffold1527; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 1586 - 1675
Alignment:
Q  37 atacacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaaca 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1586 atacactcactagtttttattaaggtgtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaaca 1675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 58130 - 57857
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnn 138  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||       
T  58130 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaga 58032  T
Q  139 nnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
          |||| ||||| |  |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |  |||||||||||    
T  58031 aaaagcaagttggtgttttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaa 57932  T
Q  237 gtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaa 311  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||||| ||||    
T  57931 atggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg-ggtgtgttctagcaaa 57857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 306
Target Start/End: Original strand, 26052 - 26282
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 176  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||         |||||||||| |  |||||| || ||||  |||    
T  26052 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcat 26151  T
Q  177 ttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagc-ttgctaaaaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  26152 ttgctagaatacacccacttatattttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 26251  T
Q  275 ctctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttcta 306  Q
    ||| ||| |||||| || || |||||||||||    
T  26252 ctcccacataaaaactagtg-ggtgtgttcta 26282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 26038 - 26102
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  26038 gtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacac 26102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 112
Target Start/End: Original strand, 26189 - 26235
Alignment:
Q  66 ttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtg 112  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26189 ttttagcaaataaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtg 26235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 276
Target Start/End: Original strand, 22624 - 22815
Alignment:
Q  85 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnntaagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctaga 184  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |        |||||||||||||||||||| |  ||||    |||| ||||    
T  22624 aaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacacttt-tgaaaaaacaagtgggtgtatgttagcaagttttatatgtgtttgttaga 22722  T
Q  185 atacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacact 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||  |||   |||| | ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22723 atacacccacttattttttagaaggagtcatttggtaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaaacact 22815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 128
Target Start/End: Original strand, 22765 - 22814
Alignment:
Q  79 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacac 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  22765 ataattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagcttgctaaaacac 22814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2941 - 2767
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| |||||| || |||||| || ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  2941 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagc 2843  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
    || | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| ||||||||||||    
T  2842 aaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14996 - 14822
Alignment:
Q  63 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctnnnnnnnt-aagtgggtgtatgttagc 161  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| |||||| || |||||| || ||||||| ||||         |||||||||| |  ||||    
T  14996 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaacaagtgggtgtgttctagc 14898  T
Q  162 aactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttaacaagt-tataactaaaaa 236  Q
    || | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| ||||||||||||    
T  14897 aaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Original strand, 82743 - 82800
Alignment:
Q  78 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  82743 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct 82800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0778
Description:

Target: scaffold0778; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 119
Target Start/End: Original strand, 6234 - 6313
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttg 119  Q
    |||||||||| |||||||   || |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  6234 acacccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6270 - 6219
Alignment:
Q  263 cttgctaaaacactctcacgtaaaaattaatgaggtgtgttctatcaaatcct 315  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  6270 cttgctaaaacactcccacataaaaattagtg-ggtgtgttctagcaaatcct 6219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 205
Target Start/End: Original strand, 66025 - 66087
Alignment:
Q  143 taagtgggtgtatgttagcaactcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttag 205  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  66025 taagtaggtgtatgttaataactcctatatgcatttgctagaattcacacaattattttttag 66087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 35122 - 35174
Alignment:
Q  39 acacccactagtttttattaaggtgtgttttagcaaagatataattaaaaagt 91  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35122 acaccgactaatttttatgaaggtgtcttttagcaaagttataactaaaaagt 35174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14941 - 14877
Alignment:
Q  211 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaagtgtagcttgctaaaacac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  |||||  |||||| |||||    
T  14941 gtgttttaacaagttataactaaaaagttattaaacacaccttactgtgtatgttgctataacac 14877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University