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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF15194_low_3 (Length: 601)
Name: NF15194_low_3
Description: NF15194
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15194_low_3 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 545601 - 545019
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
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| T |
545601 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccctgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
545502 |
T |
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| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggctt-gaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcata |
199 |
Q |
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| T |
545501 |
agatttgaataactaatgcataaattcacttactaaaatacacagactttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcata |
545402 |
T |
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| Q |
200 |
gacaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta-gttacatgaaagaacttatgctttagttg |
298 |
Q |
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| T |
545401 |
tacaatgacattcagatttgtacaaaaaggcattgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaaggacttatgcttttgttg |
545302 |
T |
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| Q |
299 |
ctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaag |
398 |
Q |
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| T |
545301 |
ctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctacaaag |
545202 |
T |
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| Q |
399 |
ttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagac |
497 |
Q |
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| T |
545201 |
tagaacaaattttaagttagaaattatcttaaaagaaattcaacagaaatgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattaccgtatactcagac |
545102 |
T |
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| Q |
498 |
ctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgt |
580 |
Q |
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| T |
545101 |
ctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatagatttgttaattcattgt |
545019 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 584
Target Start/End: Original strand, 14890350 - 14890917
Alignment:
| Q |
19 |
attataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagaaatttgaataactaatg |
118 |
Q |
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| T |
14890350 |
attataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagatttgaataactaatg |
14890449 |
T |
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| Q |
119 |
cataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgacattcagattt |
218 |
Q |
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| T |
14890450 |
cataaattcacttactaaaatacacatgcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgacattcggattt |
14890549 |
T |
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| Q |
219 |
gtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatt-agttacatgaaagaacttatgctttagttgctttaacttctcatgaaag |
317 |
Q |
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| T |
14890550 |
gtacaaaaaggcgttgatttaatagtatcaaatatcatattcatgctattaatttacttgaaagaacttatgctttagttgctttagcttctcatgaaag |
14890649 |
T |
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| Q |
318 |
aaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaacaaattttgagtta |
417 |
Q |
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| T |
14890650 |
taaaaattaaagtgagaaatttgataataaaattggaaagataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagtagaacaaattttaagtta |
14890749 |
T |
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| Q |
418 |
gaaattatgttaaaagaaattcaac-aaaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaagatatga |
516 |
Q |
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| T |
14890750 |
gaaattatgttaaaagaaattcaactgaaatgaattatcatttgaatatatcttgagatcttgattaatgtatgctcagacctacggggtagagatatga |
14890849 |
T |
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| Q |
517 |
attatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
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| T |
14890850 |
attatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
14890917 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 40612210 - 40611631
Alignment:
| Q |
9 |
ggtgtgtttaat--tataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagaaattt |
106 |
Q |
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| T |
40612210 |
ggtgtgtttaatattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagattt |
40612111 |
T |
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| Q |
107 |
gaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagaca--a |
204 |
Q |
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| T |
40612110 |
gaataactaatgcataacttcacttactaaaatatacaggcttgaagttgcctgttgtgattattattaccataatttaagacattgtgcatagacaata |
40612011 |
T |
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| Q |
205 |
tgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatt-agttacatgaaagaacttatgctttagttgcttta |
303 |
Q |
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| T |
40612010 |
tgacattcagatttgtacaaaaaggcgttgattcaataatatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaaggacttatgctttagttgcttta |
40611911 |
T |
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| Q |
304 |
acttctcatgaaag-aaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaa |
402 |
Q |
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| T |
40611910 |
acttctcatgaaagaaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctacaaagtaga |
40611811 |
T |
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| Q |
403 |
acaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaac-aaaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctac |
501 |
Q |
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| T |
40611810 |
acaaattttaagttagaaattatgttaaaagaaattcaacaaaaatgaattatcatttgaatatatatcgagctcttgattaccgtatactcagacctac |
40611711 |
T |
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| Q |
502 |
ggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtc |
581 |
Q |
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| T |
40611710 |
ggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatggatttgccaattcattgtc |
40611631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 583
Target Start/End: Original strand, 8075023 - 8075589
Alignment:
| Q |
9 |
ggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagaaatttga |
108 |
Q |
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| T |
8075023 |
ggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccattttttggtggagagatttga |
8075122 |
T |
|
| Q |
109 |
ataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattg--tgcatagacaatg |
206 |
Q |
| |
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| T |
8075123 |
ataactaatgcataaattcacttactaaaatacacaggcttgaagttacctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgttttcatagacaatg |
8075222 |
T |
|
| Q |
207 |
acattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatt-agttacatgaaagaacttatgctttagttgctttaac |
305 |
Q |
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| T |
8075223 |
acattcagatttgtacaaaaagtcgttgattcaatagtatctaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgctttagttgctt---- |
8075318 |
T |
|
| Q |
306 |
ttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaaca |
405 |
Q |
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| T |
8075319 |
--------aaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttgaaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagcaaaaca |
8075410 |
T |
|
| Q |
406 |
aattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggg |
504 |
Q |
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| T |
8075411 |
aattttaagttagaaattatgttaaaagaaattcaacagaaatgaattatcatttgaatatatgttgagctattgattacggtatgctcagacatacggg |
8075510 |
T |
|
| Q |
505 |
gtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcag |
583 |
Q |
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| T |
8075511 |
gtagagatatgaattattatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag |
8075589 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 28590267 - 28590867
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|
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| T |
28590267 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccatgtaagcattttaaagtcatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
28590366 |
T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
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|
|
| T |
28590367 |
agatttgaataattaatgcataaattcacttgctaaaatacattggattgaagttgcctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
28590466 |
T |
|
| Q |
201 |
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282 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28590467 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgatttgtacaagaagttgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaaattacatgaaaga |
28590566 |
T |
|
| Q |
283 |
acttatgctttagttgctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagc |
382 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28590567 |
acttatactttagttgctttaacttatcatgaaagaaaaa-ttaaagtgagaaatttaataataaacttaaaaacataaacaatttatattagatgtagc |
28590665 |
T |
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| Q |
383 |
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481 |
Q |
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| T |
28590666 |
actagtgcctactaaggagaacaaattttgagttagaaattatgttaagagaaattcaatagaaatgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgat |
28590765 |
T |
|
| Q |
482 |
tattgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtc |
581 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28590766 |
tattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtc |
28590865 |
T |
|
| Q |
582 |
ag |
583 |
Q |
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|| |
|
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| T |
28590866 |
ag |
28590867 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 504
Target Start/End: Original strand, 2465233 - 2465754
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2465233 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctt-caatagcaatatccaatttttgatggag |
2465331 |
T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
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| T |
2465332 |
agatttgaataactaatgcataaattcatttactaaaatacataggcttgaagttgcctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgggtag |
2465431 |
T |
|
| Q |
201 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtg-----------------ttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta-gttacatgaaaga |
282 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2465432 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgatttgtacaagaaggtgttgattcgataatatcaaatatcatactcatgttattaagttacatgaaaga |
2465531 |
T |
|
| Q |
283 |
acttatgctttagttgctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagc |
382 |
Q |
| |
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| T |
2465532 |
acttacgctttagttgctttagtttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatattagatgtagc |
2465631 |
T |
|
| Q |
383 |
actagtacctactaagttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgat |
481 |
Q |
| |
|
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| T |
2465632 |
actagtacctactaagtagaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttgtatatatcttgatctcttgat |
2465731 |
T |
|
| Q |
482 |
tattgtatgctcagacctacggg |
504 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2465732 |
tattgtatgctcagacctacggg |
2465754 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 214 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 32641027 - 32640656
Alignment:
| Q |
214 |
gatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta-gttacatgaaagaacttatgctttagttgctttaacttctcat |
312 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32641027 |
gatttgtacaagaaggtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaacaacttatgctttagttgctttaacttctcat |
32640928 |
T |
|
| Q |
313 |
gaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaacaaattttg |
412 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32640927 |
aaaagaaaaa-ttaaattgagaaatttgataataaacttgaaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagtagaacaaattttg |
32640829 |
T |
|
| Q |
413 |
agttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaaga |
511 |
Q |
| |
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| T |
32640828 |
ggttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttcagaatatcttgagctcttgattattgtatgctcagacctacagggtagaga |
32640729 |
T |
|
| Q |
512 |
tatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
| |
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| T |
32640728 |
tatgaattattatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
32640656 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 276 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 25591107 - 25590798
Alignment:
| Q |
276 |
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375 |
Q |
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T |
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376 |
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474 |
Q |
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25590808 |
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584 |
Q |
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| T |
25590807 |
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25590798 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 269 - 578
Target Start/End: Original strand, 4593544 - 4593857
Alignment:
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367 |
Q |
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4593643 |
T |
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| Q |
368 |
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466 |
Q |
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4593644 |
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4593743 |
T |
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| Q |
467 |
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564 |
Q |
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| T |
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4593843 |
T |
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| Q |
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578 |
Q |
| |
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| T |
4593844 |
tttgttaattcatt |
4593857 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32641180 - 32641063
Alignment:
| Q |
39 |
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138 |
Q |
| |
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32641081 |
T |
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| Q |
139 |
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156 |
Q |
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| T |
32641080 |
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32641063 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 4593418 - 4593540
Alignment:
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Q |
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| T |
4593418 |
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4593517 |
T |
|
| Q |
100 |
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122 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4593518 |
gagatttgaataactaatgcata |
4593540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 32641294 - 32641193
Alignment:
| Q |
9 |
ggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagaaatttga |
108 |
Q |
| |
|
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| T |
32641294 |
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32641195 |
T |
|
| Q |
109 |
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110 |
Q |
| |
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|| |
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| T |
32641194 |
at |
32641193 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 496 - 582
Target Start/End: Original strand, 2466440 - 2466526
Alignment:
| Q |
496 |
acctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtca |
582 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2466440 |
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2466526 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30261442 - 30261380
Alignment:
| Q |
294 |
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355 |
Q |
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|
|||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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30261442 |
agttgctttagcttctgatgaaagaaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaa |
30261380 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32641060 - 32641027
Alignment:
| Q |
198 |
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231 |
Q |
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|
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32641060 |
tagacaatgacattcagatttgtacaagaaggtg |
32641027 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 438; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 35728650 - 35728066
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
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35728551 |
T |
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200 |
Q |
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| T |
35728550 |
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35728452 |
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| Q |
201 |
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299 |
Q |
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| T |
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35728352 |
T |
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| Q |
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399 |
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| T |
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35728252 |
T |
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| Q |
400 |
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498 |
Q |
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| T |
35728251 |
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35728152 |
T |
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| Q |
499 |
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584 |
Q |
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| T |
35728151 |
tacgaggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
35728066 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 580
Target Start/End: Original strand, 48787846 - 48788426
Alignment:
| Q |
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ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
48787846 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccctgtaagtgttttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttgatggag |
48787945 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
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48788045 |
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201 |
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299 |
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48788145 |
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399 |
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| T |
48788146 |
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48788245 |
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| Q |
400 |
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498 |
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48788344 |
T |
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580 |
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| T |
48788345 |
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48788426 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 48647002 - 48646417
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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| T |
48647002 |
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48646903 |
T |
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| Q |
101 |
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200 |
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48646902 |
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48646803 |
T |
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| Q |
201 |
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299 |
Q |
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| T |
48646802 |
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48646703 |
T |
|
| Q |
300 |
tttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagt |
399 |
Q |
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| T |
48646702 |
tttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacatggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagt |
48646603 |
T |
|
| Q |
400 |
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498 |
Q |
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| T |
48646602 |
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48646503 |
T |
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499 |
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584 |
Q |
| |
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|
| T |
48646502 |
tatggggttgagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgcttattcattgtcagg |
48646417 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 7259244 - 7258644
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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| T |
7259244 |
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7259145 |
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| Q |
101 |
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200 |
Q |
| |
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| T |
7259144 |
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7259045 |
T |
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201 |
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282 |
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| T |
7259044 |
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7258945 |
T |
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| Q |
283 |
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382 |
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| |
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| T |
7258944 |
acttatgttttagttgctttagcttctcatgaaagaataaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttctgatagatgtagc |
7258845 |
T |
|
| Q |
383 |
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481 |
Q |
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| T |
7258844 |
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7258745 |
T |
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| Q |
482 |
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581 |
Q |
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| T |
7258744 |
tattgtatgctcagacctacggggtaaatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatggatttgctaattaattgtc |
7258645 |
T |
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582 |
Q |
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| T |
7258644 |
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7258644 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 215 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 44333875 - 44333505
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| Q |
215 |
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313 |
Q |
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| T |
44333875 |
atttgtacaagaaggtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgctttagttgttttagcttctcatg |
44333776 |
T |
|
| Q |
314 |
aaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaacaaattttga |
413 |
Q |
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| T |
44333775 |
aaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaa-cataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagtagaacaaattttga |
44333677 |
T |
|
| Q |
414 |
gttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaagat |
512 |
Q |
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| T |
44333676 |
gttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttgaatatatcttaagctcttgattattgtatgcccaaacctgcgaggtagagat |
44333577 |
T |
|
| Q |
513 |
atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
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| T |
44333576 |
atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcatcgtcagg |
44333505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30924568 - 30924188
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
30924568 |
ggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatcccatttttggtggaaagatttga |
30924469 |
T |
|
| Q |
109 |
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208 |
Q |
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| T |
30924468 |
ataactaatacataaattcacttactaaaatacagaggattgaagtttcctgttgtgattattattaccatagtttaagacattg-gcatagacaatgac |
30924370 |
T |
|
| Q |
209 |
attcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgcta-ttagttacatgaaagaacttatgctttagttgctttaactt |
307 |
Q |
| |
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| T |
30924369 |
attcagatttgtac---aaggtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcattctactaagttacatgaaagaacttatgctttagttgatttaactt |
30924273 |
T |
|
| Q |
308 |
ctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtaccta |
393 |
Q |
| |
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| T |
30924272 |
ctcatgaaagaaaaaattaaaatgagaaatttgataataaactt-gaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtaccta |
30924188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 220 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 42478111 - 42477748
Alignment:
| Q |
220 |
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318 |
Q |
| |
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| T |
42478111 |
tacaagaaggtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgttattaagttacatgaaagaacctatgctttagttgctttagct---cgtgaaaga |
42478015 |
T |
|
| Q |
319 |
aaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaacaaattttgagttag |
418 |
Q |
| |
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| T |
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aaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttgaaaacataaacaacttatgttagatgtagcactaatacctactcagtagaacaaattttgagttag |
42477915 |
T |
|
| Q |
419 |
aaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaa |
517 |
Q |
| |
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| T |
42477914 |
aaattatgttaaaagaaattcaacataaatgaattatcatttgaatatattttgagcttttgattattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaa |
42477815 |
T |
|
| Q |
518 |
ttatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
| |
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| T |
42477814 |
ttatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatagatttgctaattcattgtcagg |
42477748 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 367 - 581
Target Start/End: Original strand, 10895197 - 10895412
Alignment:
| Q |
367 |
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465 |
Q |
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| T |
10895197 |
ttatgttagatgtagcactagtacctactaactagaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaacagaaatgaattatcatttgaatat |
10895296 |
T |
|
| Q |
466 |
atcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggat |
565 |
Q |
| |
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| T |
10895297 |
atcttgagctcttgattattgtatgctcagacctatggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaataaatgctaatggat |
10895396 |
T |
|
| Q |
566 |
ttgttaattcattgtc |
581 |
Q |
| |
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| T |
10895397 |
ttgctaattcattgtc |
10895412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Original strand, 10894928 - 10895193
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
10894928 |
atttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagatttgaataactaatgcataaattcacttactaaaatacacaagcttgaagtt |
10895027 |
T |
|
| Q |
156 |
gtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgacattca-----------------gatttgtacaagaaggtgttgattc |
238 |
Q |
| |
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| T |
10895028 |
gtctgttgtgattattattaccatagtttaatacattgtgcatagacaatgacattcaaatttgtacaggaaggtgagttgtacaagaaggtgttgattc |
10895127 |
T |
|
| Q |
239 |
aataatataaaatatcatattcatgctatt-agttacatgaaagaacttatgctttagttgcttta |
303 |
Q |
| |
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|||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
10895128 |
aatagtatcaaatatcatattcatgctattaagtcacatgaaagaacttatgctttagttgtttta |
10895193 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44334018 - 44333875
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
44334018 |
ttatgaacgatgtgtttaattataatccctgtaagtattttaaagtcatagcttaatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttgatggag |
44333919 |
T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacaca |
144 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
44333918 |
agatttgaataactaacgcataaattcacttactaaaatacaca |
44333875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 444 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 45584095 - 45583957
Alignment:
| Q |
444 |
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543 |
Q |
| |
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|
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| T |
45584095 |
aaatgaattatgatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcaaacctgcggggtagagatataaattatcatgtgaatataacaataatca |
45583996 |
T |
|
| Q |
544 |
agagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtca |
582 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
45583995 |
agagtaatagatgctaatcgatttgctaattcattgtca |
45583957 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 424; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 584
Target Start/End: Original strand, 31090719 - 31091282
Alignment:
| Q |
24 |
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123 |
Q |
| |
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|
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| T |
31090719 |
aatccctgtaagtattttaaagtcattgtttgattttttatgtatctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagatttgaataactaatgcataa |
31090818 |
T |
|
| Q |
124 |
actcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaa-tgacattcagatttgtac |
222 |
Q |
| |
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| T |
31090819 |
attcacttactaaaatacacaggcttgaagttgcctgttgtgattattattaccatagtttaagaaattgtgcatagacaaatgacattcaaatttgtac |
31090918 |
T |
|
| Q |
223 |
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321 |
Q |
| |
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|
| T |
31090919 |
aagaaggtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgctttagttgctttagattctcatgaaagaaaa |
31091018 |
T |
|
| Q |
322 |
aattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaacaaattttgagttagaaa |
421 |
Q |
| |
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| T |
31091019 |
aattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaaaataaagagcttatgttagatgtagcactagtacctactaagtagaacaaattttaagttcgaaa |
31091118 |
T |
|
| Q |
422 |
ttatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaatta |
520 |
Q |
| |
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| T |
31091119 |
ttatgttaaaagaaattcaacagaaatgaattatcatttgaatatatattgaactcttgattattgtatgctcagacctacggggtagagatatgaatta |
31091218 |
T |
|
| Q |
521 |
tcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31091219 |
tcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
31091282 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Original strand, 24458624 - 24459208
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
24458624 |
ttatgaacgatgtgtttaattataatctccgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatattcaatttttgggtgga |
24458723 |
T |
|
| Q |
100 |
gaaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcata |
199 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24458724 |
gagatttgaataacttatgcataaattcacttactaaaatacactggcttgaagttgcctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcata |
24458823 |
T |
|
| Q |
200 |
gacaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta-gttacatgaaagaacttatgctttagttg |
298 |
Q |
| |
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|
| T |
24458824 |
gacaatgacatttagatttgtacaagaaggtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgttttagttg |
24458923 |
T |
|
| Q |
299 |
ctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaag |
398 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24458924 |
atttaccttctcatgaaagaaacaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacttaaacaacttatgttatatgcagcactagtacctactaag |
24459023 |
T |
|
| Q |
399 |
ttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaacaaaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacc |
498 |
Q |
| |
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| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24459024 |
tagaacaaattttaagttagaaattatgttaaaagaaattcaacagaatgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgattattgtatgctcagact |
24459123 |
T |
|
| Q |
499 |
tacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcag |
583 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24459124 |
tacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagaagctggtggatatgctaattcattgtcag |
24459208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 583
Target Start/End: Original strand, 2910670 - 2911242
Alignment:
| Q |
6 |
aacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagaaatt |
105 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2910670 |
aacggtgtgtttaattat--ttcgtgtaagtaatttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagatt |
2910767 |
T |
|
| Q |
106 |
tgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaat |
205 |
Q |
| |
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| T |
2910768 |
tgaataactaatgcataaattcacttactaaagtacacagacttgaagttgcctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaat |
2910867 |
T |
|
| Q |
206 |
gacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctattagttacatgaaagaacttat--gctttagttgcttta |
303 |
Q |
| |
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| T |
2910868 |
gacatttagatttgtactagaatgtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcat-ctatta-----atgaaagaacttatatgctttagttgcttta |
2910961 |
T |
|
| Q |
304 |
acttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagttaaa |
403 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2910962 |
acttctcatgaaagaaaaaactaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtggcactagtacctactaagtagaa |
2911061 |
T |
|
| Q |
404 |
caaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacg |
502 |
Q |
| |
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| T |
2911062 |
caaattttgagttagaaactatgttaaaagaaattcaacagaaatgaattatcatttgaatatatattgagctcttgattattgtatgttcagacctacg |
2911161 |
T |
|
| Q |
503 |
gggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcag |
583 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
2911162 |
gggttgagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcag |
2911242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 39015953 - 39015373
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39015953 |
ttatgaacggtatgtttaattataatccctgtaagtattttaaagttatagtttgatttttgatgtgtctttcaataacaatatccaatttttggtggag |
39015854 |
T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
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300 |
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39015558 |
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499 |
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39015458 |
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584 |
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39015373 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 551
Target Start/End: Original strand, 14704552 - 14705097
Alignment:
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1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtgga- |
99 |
Q |
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14704651 |
T |
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100 |
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197 |
Q |
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296 |
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14704850 |
T |
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396 |
Q |
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| T |
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495 |
Q |
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| T |
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14705041 |
T |
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| Q |
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551 |
Q |
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| T |
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acctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaat |
14705097 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 584
Target Start/End: Original strand, 39999499 - 40000090
Alignment:
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1 |
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100 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
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282 |
Q |
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| T |
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39999795 |
T |
|
| Q |
283 |
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381 |
Q |
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| T |
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T |
|
| Q |
382 |
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479 |
Q |
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| T |
39999887 |
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39999985 |
T |
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579 |
Q |
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39999986 |
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40000085 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 297 - 584
Target Start/End: Original strand, 32765748 - 32766035
Alignment:
| Q |
297 |
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396 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
32765748 |
tgctttagcttctcatgaaagataaaattaaagtgagaaatttgataataaacttgaaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctacta |
32765847 |
T |
|
| Q |
397 |
agttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcag |
495 |
Q |
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||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |
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| T |
32765848 |
agtagaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttaaatatatcttgagctcttgattattgtatactcag |
32765947 |
T |
|
| Q |
496 |
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584 |
Q |
| |
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|||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
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| T |
32765948 |
acctgc-gggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatcgatttgctaattcattgtcagg |
32766035 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 32765586 - 32765679
Alignment:
| Q |
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227 |
Q |
| |
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|
| T |
32765586 |
taaaatacacaggcttgaagttccctgttgtgattattattaccatagtgtaagacattgtgcatagacaatgcaattcagatttgtacaagaa |
32765679 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 584
Target Start/End: Original strand, 35177958 - 35178560
Alignment:
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Q |
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ttatgaacgatgtgtttaattataatccctgtaagtattttaaagtcatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
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T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
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| T |
35178058 |
agatttgaataactaatgcataaattcacttgctaaaatacacaagcttgaagttgcctgttgtgattactattaccatagtttaagacattgtgcatag |
35178157 |
T |
|
| Q |
201 |
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282 |
Q |
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| T |
35178158 |
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35178257 |
T |
|
| Q |
283 |
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382 |
Q |
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| T |
35178258 |
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35178357 |
T |
|
| Q |
383 |
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481 |
Q |
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| T |
35178358 |
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35178457 |
T |
|
| Q |
482 |
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581 |
Q |
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| T |
35178458 |
tattgtatgctcatacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtc |
35178557 |
T |
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| Q |
582 |
agg |
584 |
Q |
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||| |
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| T |
35178558 |
agg |
35178560 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 10407126 - 10406559
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
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T |
|
| Q |
119 |
cataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgacattcagattt |
218 |
Q |
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| T |
10407026 |
cataaattcacttactaaaatacacatgcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgacattcggattt |
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T |
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| Q |
219 |
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317 |
Q |
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| T |
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gtacaaaaaggcattgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgccttagttgttttagcttctcatgaaaa |
10406827 |
T |
|
| Q |
318 |
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417 |
Q |
| |
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| T |
10406826 |
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10406727 |
T |
|
| Q |
418 |
gaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagacctacggggtaaagatatga |
516 |
Q |
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| T |
10406726 |
gaaattatgttaaaagaaattcaacataaatgaattatcatttgaatatatcttgagctctttattattgtatgttcagacctatgtggtatttatatga |
10406627 |
T |
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| Q |
517 |
attatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
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| T |
10406626 |
attatcatgttaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
10406559 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 1952542 - 1952048
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
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| T |
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ttatgaacggtatgtttaattataatccatgtaagtattttaaa-tcatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacgatatccaatttgtggtggag |
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T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
| |
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| T |
1952443 |
agatttgaataattaatgcataaattcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccgtagtttaagacattgtgcatag |
1952344 |
T |
|
| Q |
201 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatt-agttacatgaaagaacttatgctttagttgc |
299 |
Q |
| |
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| T |
1952343 |
acaatgacattcagatttgtacaaaaaggcgttgattcaatagtatcaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgctttagttgt |
1952244 |
T |
|
| Q |
300 |
tttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagt |
399 |
Q |
| |
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| T |
1952243 |
tttaacctctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttgaaaacataaacaatttatgttagatgtagcactaatacctacttag- |
1952145 |
T |
|
| Q |
400 |
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497 |
Q |
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| T |
1952144 |
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1952048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 269
Target Start/End: Original strand, 3476888 - 3477127
Alignment:
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |
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| T |
3476888 |
tttaaagttgtagcttgatttttgatgtgtttttcaacaataataatatttatttttggtggtgagatttgaataattaatgcataaattcacgtactaa |
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T |
|
| Q |
137 |
aatacacagg-----cttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgacattcagatttgtacaagaa---g |
228 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
229 |
gtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta |
269 |
Q |
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| T |
3477087 |
gcgttgattcaatggcatcaaatatcaaattcatgctatta |
3477127 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 584
Target Start/End: Original strand, 9340221 - 9340795
Alignment:
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111 |
Q |
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| T |
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gtgtttaattataatccctgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagatttgaata |
9340320 |
T |
|
| Q |
112 |
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211 |
Q |
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9340321 |
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T |
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310 |
Q |
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| T |
9340421 |
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9340520 |
T |
|
| Q |
311 |
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410 |
Q |
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| T |
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9340620 |
T |
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| Q |
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509 |
Q |
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| T |
9340621 |
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9340720 |
T |
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| Q |
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584 |
Q |
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| T |
9340721 |
gatatgaattatcatgtgaatataagaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
9340795 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 32665387 - 32664921
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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|
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T |
|
| Q |
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200 |
Q |
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| T |
32665287 |
aaatttgaataactaatgcataaattcacttactaaaatacacaggcttgaagttgcctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
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T |
|
| Q |
201 |
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299 |
Q |
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| T |
32665187 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaatagtataaaatatcatattcatgctattaagttacatgaaagaacttatgctttagttgc |
32665088 |
T |
|
| Q |
300 |
tttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaagt |
399 |
Q |
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| T |
32665087 |
tttagcttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggacacataaacaacttatgttacatgtagcactagtacctactaagt |
32664988 |
T |
|
| Q |
400 |
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466 |
Q |
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| T |
32664987 |
taaacaaattatgagttagaaattatgttaaaagaaattcaacaaaatgaattatcatgtgaatata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 584
Target Start/End: Original strand, 7944731 - 7945329
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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|
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| T |
7944731 |
ggtgtgtttaattataatccctgtaagtattttaaattcatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagagatttga |
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T |
|
| Q |
109 |
ataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgac |
208 |
Q |
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| T |
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ataagtaatgcataaattcacttactaaaatatacaggcttgaagttgcatgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatagacaatgac |
7944930 |
T |
|
| Q |
209 |
attcagatttgtacaagaaggtg-----------------ttgattcaataatataaaatatcatattcatgctattag-ttacatgaaagaacttatgc |
290 |
Q |
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| T |
7944931 |
attcagatttgtgcaagaaggtgatttgtacaagaatgtgttgattcaataatatcaaatatcatattcatgctattaaattacatgaaagaacttatgc |
7945030 |
T |
|
| Q |
291 |
tttagttgctttaacttctcatg----aaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcacta |
386 |
Q |
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| T |
7945031 |
tttagttgctttaacttctcatgcatgaaagaaaaaattaaagtgaaaaatttgataataaacttgaaaacataaacaacttatgttagatgtagcacta |
7945130 |
T |
|
| Q |
387 |
gtacctactaagttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattatt |
485 |
Q |
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| T |
7945131 |
atacctactgagtagaacacattttgagttagaaattttgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttgaaaatatcttgagctcttgattatt |
7945230 |
T |
|
| Q |
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gtatgctcagacctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
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| T |
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gtatgctcagacttacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttcctaattcattgtcagg |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 582
Target Start/End: Original strand, 52440153 - 52440313
Alignment:
| Q |
416 |
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515 |
Q |
| |
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|
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| T |
52440153 |
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T |
|
| Q |
516 |
aattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtca |
582 |
Q |
| |
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|
|
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aattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagaagctaatggatttgctaattcattgtca |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 513 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 32664941 - 32664870
Alignment:
| Q |
513 |
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584 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32664941 |
atgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttcctaattcattgtcagg |
32664870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 52440055 - 52440144
Alignment:
| Q |
1 |
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90 |
Q |
| |
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| T |
52440055 |
ttatgaacggtgtatttaattataatccccgtaagtattttaaagtcatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacaatatccaatt |
52440144 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 17701488 - 17700887
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
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| T |
17701488 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagtttgattttttatgtgtctttcaacaacaataaccaatttttggtggag |
17701389 |
T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
| |
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| T |
17701388 |
atatttgaataactaatgcataaattcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtatgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
17701289 |
T |
|
| Q |
201 |
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282 |
Q |
| |
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| T |
17701288 |
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17701190 |
T |
|
| Q |
283 |
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382 |
Q |
| |
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| T |
17701189 |
acttatgctttagttgctttaccttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataacaaacttggaaacataaacaacttatgttatatgtagc |
17701090 |
T |
|
| Q |
383 |
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481 |
Q |
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| T |
17701089 |
actagtacctactaagtagaacaaatattgagttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttgaatatatctggagctcttgat |
17700990 |
T |
|
| Q |
482 |
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581 |
Q |
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| T |
17700989 |
tattgtatgcttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgttaatagatttgctaattcattgtc |
17700890 |
T |
|
| Q |
582 |
agg |
584 |
Q |
| |
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| T |
17700889 |
agg |
17700887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 582
Target Start/End: Original strand, 55388623 - 55389222
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55388623 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccctgtaagtattttaaagtcataacttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
55388722 |
T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
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| T |
55388723 |
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55388822 |
T |
|
| Q |
201 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtg-----------------ttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta-gttacatgaaaga |
282 |
Q |
| |
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| T |
55388823 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgatttgtacaagaatgtgttgattcaatagtatcaaatatcatattcacgctattaagttacatgaaaga |
55388922 |
T |
|
| Q |
283 |
acttatgctttagttgctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagc |
382 |
Q |
| |
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| T |
55388923 |
acttctgctttagttgctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgatgataaacttggaaacataaacaacctatgttagatgtagc |
55389022 |
T |
|
| Q |
383 |
actagtacctactaagttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgat |
481 |
Q |
| |
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| T |
55389023 |
actagtacttactaattagaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgat |
55389122 |
T |
|
| Q |
482 |
tattgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtc |
581 |
Q |
| |
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| T |
55389123 |
tattgtatgctcagacctacggaatagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaa-agatgataattgatttgctaattcattgtc |
55389221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 48573920 - 48573358
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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| T |
48573920 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacaataaccaatttttgatggag |
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T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
| |
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| T |
48573820 |
agatttgaataactaatgcataaattcacttactaaaatacacatgctagaagttgcatgttgtgatcattattaccatagtttaagacattgtgtatag |
48573721 |
T |
|
| Q |
201 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatgctatta-gttacatgaaagaacttatgctttagttgc |
299 |
Q |
| |
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| T |
48573720 |
acaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttga----------------------ttcatggtattaagttacatgaaagaacttatgctttagttgc |
48573643 |
T |
|
| Q |
300 |
tttaacttctcatgaa-agaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagtacctactaag |
398 |
Q |
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| T |
48573642 |
tttaacttttcatgaagaaaaaaaattaaagtgagaaatttgataacaaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcactagcacctactaag |
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T |
|
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399 |
ttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaaca-aaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgattattgtatgctcagac |
497 |
Q |
| |
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| T |
48573542 |
tagaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaatagaaatgaattatcatttcaatatatcttgagctcttgattattgtatgcttagac |
48573443 |
T |
|
| Q |
498 |
ctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtca |
582 |
Q |
| |
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| T |
48573442 |
ctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatatatttgctaattcatcgtca |
48573358 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 52317885 - 52317282
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1 |
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Q |
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T |
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196 |
Q |
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T |
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278 |
Q |
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T |
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377 |
Q |
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52317488 |
T |
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476 |
Q |
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52317389 |
T |
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477 |
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576 |
Q |
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52317388 |
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52317289 |
T |
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| Q |
577 |
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583 |
Q |
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| T |
52317288 |
ttgtcag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 130 - 583
Target Start/End: Original strand, 53958401 - 53958856
Alignment:
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130 |
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229 |
Q |
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53958500 |
T |
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| Q |
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328 |
Q |
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| T |
53958501 |
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53958600 |
T |
|
| Q |
329 |
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428 |
Q |
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| T |
53958601 |
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53958700 |
T |
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| Q |
429 |
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527 |
Q |
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| T |
53958701 |
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53958800 |
T |
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| Q |
528 |
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583 |
Q |
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| T |
53958801 |
aatataacaataatcaaaagtaatagatgctaatggatctgctaattcattgtcag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 214 - 584
Target Start/End: Original strand, 36279700 - 36280072
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
36279700 |
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T |
|
| Q |
313 |
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412 |
Q |
| |
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| T |
36279800 |
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36279899 |
T |
|
| Q |
413 |
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511 |
Q |
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| T |
36279900 |
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36279999 |
T |
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| Q |
512 |
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584 |
Q |
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| T |
36280000 |
tatgaattattatatgaatataacaataatcaagactaatagatgctaatgaatttgctaattcattgtcagg |
36280072 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 386 - 584
Target Start/End: Original strand, 48809213 - 48809411
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484 |
Q |
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| T |
48809213 |
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48809312 |
T |
|
| Q |
485 |
tgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtcagg |
584 |
Q |
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tgtatgctcagacctacggg-tagatatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgctaattcattgtcagg |
48809411 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 53958192 - 53958402
Alignment:
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Q |
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53958192 |
ttatgaacgatgtgtttaattataatccctgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttgatggag |
53958291 |
T |
|
| Q |
101 |
aaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcatag |
200 |
Q |
| |
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| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
53958292 |
agatttaaataactaatgcataaattcacttactaaatgacacaagcttgaagttgcctgctgtgattattattatcatagtttaagacattgtgcatag |
53958391 |
T |
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| Q |
201 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
53958392 |
acaatgacatt |
53958402 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 203 - 359
Target Start/End: Original strand, 48809052 - 48809208
Alignment:
| Q |
203 |
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301 |
Q |
| |
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| T |
48809052 |
aatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaatagtattaaatatcatattcatgctattaagttacattaaagaacttatgttttagttgctt |
48809151 |
T |
|
| Q |
302 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
48809152 |
taacttctcatgaaag-aaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacat |
48809208 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 188
Target Start/End: Original strand, 36279516 - 36279695
Alignment:
| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
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| T |
36279516 |
ggtgtgtttaattataatccctctaagtattttaaagttatagcttgattttttatgtgtctgtcaacaacaatattcaatttttggtggagagatttga |
36279615 |
T |
|
| Q |
109 |
ataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaaga |
188 |
Q |
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| T |
36279616 |
ataattcatgcataaattcacttactaaaatacacaagcttgaagttgcctgttgtgattattattatcatagtttaaga |
36279695 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 48808906 - 48809051
Alignment:
| Q |
10 |
gtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggagaaatttgaa |
109 |
Q |
| |
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| T |
48808906 |
gtgtgtttaattataatctctgtaagtattttaaagttatagcttgattttttatgtgtctttcaacaacaatatcaaatttttggtggagagatgtgaa |
48809005 |
T |
|
| Q |
110 |
taactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagtt |
155 |
Q |
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| T |
48809006 |
taactaatgcataaattcacttgctaaaatacacaggcttaaagtt |
48809051 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 285 - 581
Target Start/End: Original strand, 47877957 - 47878254
Alignment:
| Q |
285 |
ttatgctttagttgctttaacttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataataaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcac |
384 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ttatgctttaattgttttagcttctcatgaaagaaaaaattaaagtgagaaatttgataacaaacttggaaacataaacaacttatgttagatgtagcac |
47878056 |
T |
|
| Q |
385 |
tagtacctactaagttaaacaaattttgagttagaaattatgttaaaagaaattcaa-caaaatgaattatcatttaaatatatcttgaacacttgatta |
483 |
Q |
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| T |
47878057 |
tagtacctactaagtagaacaaattttgagttagaaattatgttgaaagaaatttaataaaaatgaattatcatttgaatatatcttgagctcttgatta |
47878156 |
T |
|
| Q |
484 |
ttgtatgctcagacctacggggtaaagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaatagatgctaatggatttgttaattcattgtc |
581 |
Q |
| |
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| T |
47878157 |
ttgtatacttagacctacggggtagagatatgaattatcatgtgaatataacaataatcaagagtaataaatgccaatagatttgctaattcattgtc |
47878254 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Original strand, 47875118 - 47875381
Alignment:
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99 |
Q |
| |
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| T |
47875118 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttttatgtgtctttcaacaacgataaccaatttttggcgga |
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T |
|
| Q |
100 |
gaaatttgaataactaatgcataaactcacttactaaaatacacaggcttgaagttgtctgttgtgattattattaccatagtttaagacattgtgcata |
199 |
Q |
| |
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| T |
47875218 |
gagatttgaatacctgatgcataaattcacttactaaaatacacaggcttgaagttgcatgttgtgattattattaccatagtttaaaacattctgcata |
47875317 |
T |
|
| Q |
200 |
gacaatgacattcagatttgtacaagaaggtgttgattcaataatataaaatatcatattcatg |
263 |
Q |
| |
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| T |
47875318 |
gacaatgacattcaaatttgtacaagaaggtgttgattcaataatatcaaatatcatattcatg |
47875381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 42278605 - 42278725
Alignment:
| Q |
1 |
ttattaacggtgtgtttaattataatcccggtacgtaatttaaagtcatagcttgatttttgatttgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
100 |
Q |
| |
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| T |
42278605 |
ttatgaacggtgtgtttaattataatccatgtaagtattttaaagtcatagcttgatttttgatgtgtctttcaacaacaatatccaatttttggtggag |
42278704 |
T |
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aaatttgaataactaatgcat |
121 |
Q |
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| T |
42278705 |
agatgtgaataactaatgcat |
42278725 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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