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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15205_low_22 (Length: 346)

Name: NF15205_low_22
Description: NF15205
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15205_low_22
NF15205_low_22
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (23-238)||(25075129-25075345)
chr1 (15-188)||(16040805-16040978)
chr1 (15-192)||(16748931-16749109)
chr1 (19-192)||(48776597-48776771)
chr1 (15-192)||(28960849-28961024)
chr1 (15-192)||(48240056-48240233)
chr1 (15-133)||(36518773-36518892)
chr1 (15-133)||(52499566-52499685)
chr1 (15-133)||(37391411-37391529)
chr1 (15-188)||(7101746-7101922)
chr1 (15-133)||(6312258-6312377)
chr1 (15-133)||(18147523-18147642)
chr1 (20-192)||(36205994-36206165)
chr1 (15-174)||(2454019-2454179)
chr1 (15-192)||(16043139-16043316)
chr1 (71-180)||(12450755-12450875)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (15-192)||(15330315-15330492)
chr6 (15-192)||(12516162-12516341)
chr6 (15-192)||(24195677-24195855)
chr6 (15-175)||(10186342-10186505)
chr6 (15-133)||(31512758-31512877)
chr6 (15-192)||(12518390-12518567)
chr6 (15-192)||(4221273-4221459)
chr6 (15-133)||(29642620-29642739)
chr6 (45-175)||(14906291-14906422)
chr6 (15-192)||(30880827-30881015)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (15-192)||(31920244-31920423)
chr4 (15-192)||(49708952-49709130)
chr4 (15-180)||(786705-786869)
chr4 (15-188)||(618581-618754)
chr4 (15-133)||(55560234-55560353)
chr4 (15-133)||(35854742-35854860)
chr4 (15-239)||(37532673-37532904)
chr4 (18-133)||(49788098-49788215)
chr4 (41-133)||(6244756-6244849)
chr4 (15-87)||(38517436-38517508)
chr4 (15-80)||(1859565-1859630)
chr4 (303-338)||(36711955-36711990)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (15-192)||(25544010-25544188)
chr5 (23-188)||(4050586-4050752)
chr5 (15-192)||(43448256-43448434)
chr5 (20-149)||(30313201-30313331)
chr5 (15-133)||(10023966-10024085)
chr5 (15-133)||(24631067-24631186)
chr5 (15-133)||(26792645-26792764)
chr5 (18-133)||(8429845-8429961)
chr5 (15-192)||(6087993-6088170)
chr5 (15-133)||(30347747-30347866)
chr5 (19-192)||(15033850-15034023)
chr5 (68-192)||(18115583-18115708)
chr5 (44-192)||(43525174-43525323)
chr5 (15-133)||(27879920-27880040)
chr5 (15-188)||(14194139-14194323)
chr5 (15-192)||(2262258-2262443)
chr5 (15-94)||(3688820-3688899)
chr5 (15-94)||(3877886-3877965)
chr5 (15-192)||(17872167-17872355)
chr5 (15-80)||(39882072-39882137)
chr5 (15-100)||(37260185-37260271)
chr5 (58-133)||(37371747-37371824)
chr5 (15-105)||(26831498-26831589)
chr5 (159-246)||(3877963-3878049)
chr5 (159-192)||(3688789-3688822)
chr5 (15-53)||(37371842-37371880)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (19-188)||(45122623-45122792)
chr7 (15-191)||(21071319-21071499)
chr7 (15-133)||(7035539-7035658)
chr7 (15-133)||(42230989-42231108)
chr7 (15-133)||(9002388-9002509)
chr7 (15-118)||(12787249-12787352)
chr7 (15-190)||(5829799-5829987)
chr7 (15-105)||(22843403-22843491)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (15-192)||(10037418-10037596)
chr3 (15-192)||(41764633-41764812)
chr3 (15-192)||(11361032-11361210)
chr3 (15-192)||(11367421-11367599)
chr3 (15-188)||(23092321-23092496)
chr3 (15-192)||(15329833-15330010)
chr3 (15-192)||(9999193-9999373)
chr3 (15-180)||(37803021-37803186)
chr3 (15-133)||(10108813-10108932)
chr3 (15-133)||(10230052-10230171)
chr3 (15-192)||(10234204-10234385)
chr3 (15-133)||(27273239-27273358)
chr3 (15-133)||(31646-31764)
chr3 (15-133)||(10233647-10233766)
chr3 (15-192)||(10230612-10230792)
chr3 (15-192)||(50408935-50409121)
chr3 (15-192)||(10109373-10109563)
chr3 (44-188)||(10040851-10041000)
chr3 (15-180)||(10970167-10970340)
chr3 (96-192)||(46912134-46912232)
chr3 (98-188)||(52916744-52916836)
chr3 (15-188)||(41220976-41221157)
chr3 (15-111)||(47691894-47691988)
chr3 (15-92)||(52917633-52917708)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (15-188)||(24270217-24270391)
chr2 (15-188)||(21394143-21394318)
chr2 (44-192)||(35608673-35608823)
chr2 (15-133)||(36047961-36048080)
chr2 (15-133)||(26955189-26955308)
chr2 (15-133)||(39441936-39442055)
chr2 (18-133)||(41921443-41921559)
chr2 (19-175)||(17687621-17687779)
chr2 (15-192)||(24244642-24244823)
chr2 (15-192)||(27508149-27508333)
chr2 (18-133)||(28667446-28667563)
chr2 (18-133)||(37826280-37826397)
chr2 (15-192)||(3641835-3642020)
chr2 (15-177)||(2881740-2881911)
chr2 (15-192)||(40488956-40489146)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (19-188)||(23373-23543)
scaffold0073 (15-239)||(18188-18412)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (15-188)||(133133-133307)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (15-192)||(164302-164480)
scaffold0003 (15-192)||(172417-172595)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (15-188)||(37915303-37915478)
chr8 (15-188)||(21114941-21115116)
chr8 (15-192)||(14764406-14764580)
chr8 (15-239)||(31979790-31980014)
chr8 (15-133)||(25219835-25219954)
chr8 (15-111)||(7780602-7780698)
chr8 (15-111)||(7820692-7820788)
chr8 (15-188)||(13424402-13424584)
chr8 (87-188)||(33863079-33863182)
chr8 (44-192)||(14713047-14713206)
chr8 (26-133)||(30305978-30306085)
chr8 (15-88)||(33862651-33862724)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (15-188)||(310961-311135)
scaffold0002 (90-185)||(331413-331509)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (15-188)||(992-1164)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (15-188)||(17790-17965)
[»] scaffold0636 (1 HSPs)
scaffold0636 (15-133)||(28-147)
[»] scaffold1370 (1 HSPs)
scaffold1370 (15-192)||(1435-1612)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (15-133)||(10254-10373)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (15-133)||(4795-4914)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (15-133)||(50206-50325)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (15-133)||(13298-13417)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (15-188)||(6497-6681)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (15-116)||(9998-10099)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (15-188)||(98087-98267)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (15-192)||(13271-13446)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (15-192)||(44783-44960)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (15-133)||(29832-29954)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (15-188)||(185339-185523)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (15-192)||(124993-125178)
[»] scaffold0532 (1 HSPs)
scaffold0532 (15-192)||(3583-3768)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (96-183)||(23177-23265)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (15-180)||(459-642)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 25075129 - 25075345
Alignment:
23 aataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttctt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
25075129 aataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttctt 25075228  T
122 atcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgtgctggaac 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||    
25075229 atcgaatttaaattataatcacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttatttcccccgtgctggcac 25075328  T
222 aggtcactatactagtt 238  Q
     ||||||||||||||||    
25075329 gggtcactatactagtt 25075345  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16040978 - 16040805
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
16040978 atactacaaataattagtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatatt 16040879  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
16040878 tttttcatatcg-atttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaatctatatatatgat 16040805  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 16748931 - 16749109
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |    
16748931 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatattcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaattatatt 16749030  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
16749031 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatataatcaaa 16749109  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 48776597 - 48776771
Alignment:
19 tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  || ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
48776597 tacaaataattaatacaagtataataaaacaaatactttaatcgatatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatttttt 48776696  T
119 -cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
48776697 tcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatctatacatattatcaaa 48776771  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28961024 - 28960849
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
28961024 atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcgttatttgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 28960928  T
115 tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28960927 ttttccatatcaaatttcaattataagtacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 28960849  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 48240056 - 48240233
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
48240056 atactacaaataattaatataagtataa--atccaaatagtttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 48240153  T
115 tttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||  | |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
48240154 tttttccatataaaatttaaattataatcacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttgatcaaa 48240233  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36518892 - 36518773
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
36518892 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatt 36518793  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
36518792 tttttcatatcgaatttaaa 36518773  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 52499685 - 52499566
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
52499685 atactataaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 52499586  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
52499585 tttttcatatcgaatttaaa 52499566  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 37391411 - 37391529
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
37391411 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgatatt 37391509  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
37391510 tttttcatatcgaatttaaa 37391529  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7101922 - 7101746
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
7101922 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatatt 7101825  T
115 tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaatt----ataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||| | | || ||||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
7101824 ttttccatgtcaaatttaaattataaccacacttataaataactttaaaataacataatataaaatctatacatttgat 7101746  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 6312258 - 6312377
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatga-tgt 113  Q
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6312258 atactacaaataattagtacaaatataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattatgatgatttt 6312357  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
6312358 tttttcatatcgaatttaaa 6312377  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18147642 - 18147523
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
18147642 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgctatgtgcaatgcttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 18147543  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
18147542 tttttcatatcgaatttaaa 18147523  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36206165 - 36205994
Alignment:
20 acaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gtttttt 118  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
36206165 acaaataattagtataagtataa--atctaaatactttaatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatattttttt 36206068  T
119 cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
36206067 catatcaaatttaaattatagctacatttataactttaagataatacaatataaaatctatatatttgatcaaa 36205994  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 2454019 - 2454179
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2454019 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 2454116  T
115 tttt--cttatcgaatttaaattataacca-caattataactttaagataacataatataaaa 174  Q
    ||||  | |||| ||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||    
2454117 tttttccatatcaaatttaaattataaccaccctttttaattttaagataacataatataaaa 2454179  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16043316 - 16043139
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
16043316 atactacaaataattaatataagtttaa--atccaaatactttgatcgttatgtgcaatggttacatatttcaaaatatagacaaaattaagatgatatt 16043219  T
114 tttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
16043218 tttttctatatcaaattgaaattataatcacacttttaactttaaaataacataatataaaatctatacattttatcaaa 16043139  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12450875 - 12450755
Alignment:
71 aatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat------gatgttttttctt-----atcgaatttaaattataaccacaattataactttaaga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||| |||||| ||     ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
12450875 aatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatattttttttttccatatcaaatttaaattatagccacacttataactttaaga 12450776  T
160 taacataatataaaatctata 180  Q
    |||||||||||||||||||||    
12450775 taacataatataaaatctata 12450755  T

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Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15330492 - 15330315
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
15330492 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 15330393  T
115 ttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15330392 ttttcatatccaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 15330315  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12516341 - 12516162
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatg--atg 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
12516341 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 12516242  T
113 ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
12516241 ttttttcatatcgaatttaaattataaacacaattataactttaagatatcataatataaaatctatatatatgatcaaa 12516162  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24195855 - 24195677
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
24195855 atactacaaaaaattaatacaagtataataatcaaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatt 24195756  T
115 -ttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
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24195755 gttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgatcaaa 24195677  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10186505 - 10186342
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt---aagatgat 111  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
10186505 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatattttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgat 10186408  T
112 gtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaat 175  Q
     ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
10186407 atttttttccatatcaaatttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat 10186342  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 31512758 - 31512877
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
31512758 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 31512857  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
31512858 tttttcatatcgaatttaaa 31512877  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12518567 - 12518390
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
12518567 atactacaaataattaatataagtataa--atccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatttatacaaaattaggatgatatt 12518470  T
115 tttt-ct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||| || |||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12518469 tttttctatattaaatttaaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 12518390  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 4221273 - 4221459
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  || || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
4221273 atactacaaataattagtataagtataa--atacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaactaa 4221370  T
106 gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
4221371 gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 4221459  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 29642620 - 29642739
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
29642620 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttgtatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatcatatt 29642719  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
29642720 tttttcatatcgaatttaaa 29642739  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14906422 - 14906291
Alignment:
45 atccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccac 143  Q
    ||||| ||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||   |||||||||||||||| || |||    
14906422 atccaaatactttaatcattatgtgcaatatttagatatttcaaaatatttacagaattaagaagatatttttttaatatcgaatttaaattacaatcac 14906323  T
144 aattataactttaagataacataatataaaat 175  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
14906322 atttataactttaagataacataatataaaat 14906291  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30881015 - 30880827
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaa---------ttaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         ||||    
30881015 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaacaaaattaa 30880918  T
106 gatgat--gttttttcttatcgaatttaaattataaccacaat--tataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||   ||||| | |||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
30880917 gatgatacttttttccatatcaaattcaaattataaccatacttatataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaa 30880827  T

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Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31920423 - 31920244
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
31920423 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 31920324  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
31920323 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataaaataatataaaatctatacatatgatcaaa 31920244  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49709130 - 49708952
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |    
49709130 atactacaaataattagtacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaaaattatatt 49709031  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
49709030 tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatatatatgatcaaa 49708952  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 786869 - 786705
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
786869 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttat--gcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaagttaagatgatatt 786772  T
115 tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata 180  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
786771 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatttata 786705  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 618581 - 618754
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
618581 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaagatgatatt 618678  T
115 tttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    ||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
618679 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttgat 618754  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 55560234 - 55560353
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
55560234 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 55560333  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
55560334 tttttcatatcgaatttaaa 55560353  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35854860 - 35854742
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
35854860 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgatatt 35854762  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
35854761 tttttcatatcgaatttaaa 35854742  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 37532673 - 37532904
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
37532673 atactacaaataatttagttaagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa 37532770  T
106 gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnat 204  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          ||    
37532771 gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaacagttttttat 37532870  T
205 ttcccccgtgctggaacaggtcactatactagtta 239  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
37532871 tt-ccccgtgctggcacgggtcactatactagtta 37532904  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 49788098 - 49788215
Alignment:
18 ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||    
49788098 ctacaaataattagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt 49788197  T
116 tttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||| |||||||||||||    
49788198 tttcatatcgaatttaaa 49788215  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6244849 - 6244756
Alignment:
41 aataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
6244849 aataatccaaatatttttatcgttgtatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatttttttcatatcgaatttaaa 6244756  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38517508 - 38517436
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttca 87  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38517508 atactacaaataattagtacaagtataataatccagatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttca 38517436  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1859630 - 1859565
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
1859630 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatacaatatttaga 1859565  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36711990 - 36711955
Alignment:
303 aaaatgagacatttcacttttccccacattcttttc 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
36711990 aaaacgagacatttcacttttccccacattcttttc 36711955  T

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Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 25544010 - 25544188
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
25544010 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcgatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 25544109  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25544110 tttttcataacgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 25544188  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4050752 - 4050586
Alignment:
23 aataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttctt 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
4050752 aataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttctt 4050653  T
122 atcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4050652 atcgaatttaaattataaacacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 4050586  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43448434 - 43448256
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||    
43448434 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttaaatttttcaaaatatatacaaaattaagattatatt 43448335  T
115 -ttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
43448334 gttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgatcaaa 43448256  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 30313331 - 30313201
Alignment:
20 acaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt-tttt 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
30313331 acaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttt 30313232  T
119 cttatcgaatttaaattataaccacaattat 149  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
30313231 cttatcaaatttaaattataaccacaattat 30313201  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10024085 - 10023966
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
10024085 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 10023986  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
10023985 tttttcatatcgaatttaaa 10023966  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 24631067 - 24631186
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
24631067 atactataaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 24631166  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
24631167 tttttcatatcgaatttaaa 24631186  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26792764 - 26792645
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
26792764 atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 26792665  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
26792664 tttttcatatcgaatttaaa 26792645  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 8429845 - 8429961
Alignment:
18 ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gtttt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
8429845 ctacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatgaagatgatattttt 8429944  T
117 ttcttatcgaatttaaa 133  Q
    ||| |||||||||||||    
8429945 ttcatatcgaatttaaa 8429961  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6088170 - 6087993
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
6088170 atactacaaataattagtataagtataa--attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaactatatacaaaattaagatgatatt 6088073  T
115 tttt---cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||   | |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
6088072 ttttttccatattaaatttaaattataaccacatttataactttaa-ataacataatataaaatctatatatttgatcaaa 6087993  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 30347747 - 30347866
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
30347747 atactataaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 30347846  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
30347847 tttttcatatcgaatttaaa 30347866  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 15033850 - 15034023
Alignment:
19 tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt 118  Q
    |||||||||||  || ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
15033850 tacaaataattaatataagtataa--atccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatattcaaaattaagatgaaatttttt 15033947  T
119 ct--tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
        |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15033948 tcaatatcaaatttaaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 15034023  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18115708 - 18115583
Alignment:
68 tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacata 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
18115708 tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttccatgtcaaatttaaattaaaaccacacttataactttaagataacata 18115609  T
167 atataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||    
18115608 atataaaatctatacacttgatcaaa 18115583  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 43525174 - 43525323
Alignment:
44 aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataacca 142  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | ||||||||||| |||||    
43525174 aatccaaatactttaatcattatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttccatgacaaatttaaattaaaacca 43525273  T
143 caattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
43525274 cacttataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaa 43525323  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27880040 - 27879920
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccata-tatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-g 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
27880040 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaaatatttttatcgttatatggaatttttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 27879941  T
113 ttttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    ||||||| |||||||||||||    
27879940 ttttttcatatcgaatttaaa 27879920  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 14194139 - 14194323
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||    
14194139 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa 14194236  T
106 gatga----tgttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||    | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
14194237 gatgatcttttttttttcatatcaaatttaaattataactacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgat 14194323  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 2262258 - 2262443
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata---------caaaattaa 105  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||  || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
2262258 atactacaaataatttagttaagtataa--attcaaatactttaatcgttatctgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaacaaaattaa 2262355  T
106 gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
2262356 gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 2262443  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3688899 - 3688820
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatata 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
3688899 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata 3688820  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 3877886 - 3877965
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatata 94  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
3877886 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata 3877965  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 17872167 - 17872355
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||         ||||||||||    
17872167 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaacaaaattaa 17872264  T
106 gatgat--gttttttcttatcgaatttaaattataaccacaat--tataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||   ||||| | |||| |||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
17872265 gatgatacttttttccatatcaaattcaaattataaccatacttatataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaa 17872355  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 39882137 - 39882072
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 80  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39882137 atactacaaataattagtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 39882072  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37260271 - 37260185
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatat-ttcaaaatatatacaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
37260271 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcattatatgcaatgtttagatatatacaaaatatatacaaa 37260185  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37371824 - 37371747
Alignment:
58 tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatg--atgttttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
37371824 tatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttcatatcgaatttaaa 37371747  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26831589 - 26831498
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26831589 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 26831498  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 3877963 - 3878049
Alignment:
159 ataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgtgctggaacaggtcactatactagttagtagtaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
3877963 ataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt-ccccgtgctggcacgggtcactatactagttaatagtaa 3878049  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3688822 - 3688789
Alignment:
159 ataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3688822 ataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 3688789  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 37371880 - 37371842
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatata 53  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
37371880 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaata 37371842  T

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Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 45122623 - 45122792
Alignment:
19 tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
45122623 tacaaataattagtacaagtataataattcaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt 45122722  T
119 cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
45122723 catatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatctatacatatgat 45122792  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 21071319 - 21071499
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
21071319 atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttgtgtacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 21071418  T
114 tttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaa 191  Q
    ||||| |   |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
21071419 tttttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgatcaa 21071499  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7035658 - 7035539
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
7035658 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgaaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 7035559  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
7035558 tttttcatatcgaatttaaa 7035539  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42231108 - 42230989
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
42231108 atactaaaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 42231009  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
42231008 tttttcatatcgaatttaaa 42230989  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 9002388 - 9002509
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat--- 111  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
9002388 atactacaaaaaattagtacaagtataataattcaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatata 9002487  T
112 gttttttcttatcgaatttaaa 133  Q
     ||||||| |||||||||||||    
9002488 tttttttcatatcgaatttaaa 9002509  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 12787249 - 12787352
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
12787249 atactacaaataataaatacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 12787348  T
115 tttt 118  Q
    ||||    
12787349 tttt 12787352  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 5829799 - 5829987
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa-------- 105  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||            
5829799 atacgacaaataattagtataagtatagtaaatcaaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatttacaaaattaacaaaatta 5829898  T
106 -gatgatgttttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatca 190  Q
     |||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
5829899 agatgatattttttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatca 5829987  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22843491 - 22843403
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 105  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||  ||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
22843491 atactacaaataattagtataaatataa--atccaaatactttagtcgttatgtgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 22843403  T

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Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10037596 - 10037418
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
10037596 atactacaaataattagtacaagtatagtaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 10037497  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10037496 tttttaatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 10037418  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 41764633 - 41764812
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
41764633 atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 41764732  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41764733 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 41764812  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11361210 - 11361032
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
11361210 atactacaaataattagtacaaatataataatccaaatacttttatggttatatgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatatt 11361111  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11361110 tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 11361032  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11367599 - 11367421
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
11367599 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaataatttaatcgatatatgcaaagtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 11367500  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
11367499 tttttcatatcgaatttaaattataacgacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 11367421  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23092496 - 23092321
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
23092496 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatatttcaaaatatatacaaaaataagattatata 23092397  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataac-ataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
23092396 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaaatataaaatctatacatatgat 23092321  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 15329833 - 15330010
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
15329833 atactacaaataattagtacaagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatt 15329932  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15329933 tttttcacatcgaatttaaattataa-cacaattataattttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 15330010  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9999373 - 9999193
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
9999373 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 9999274  T
114 ttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||  | |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
9999273 ttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaa 9999193  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 37803021 - 37803186
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
37803021 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatctcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 37803118  T
115 tttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata 180  Q
    ||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37803119 tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctata 37803186  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10108932 - 10108813
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
10108932 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 10108833  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
10108832 tttttcatatcgaatttaaa 10108813  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10230171 - 10230052
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
10230171 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 10230072  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
10230071 tttttcatatcgaatttaaa 10230052  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10234385 - 10234204
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10234385 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 10234286  T
114 ttttt---cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||   | |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
10234285 tttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaa 10234204  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27273358 - 27273239
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
27273358 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatatt 27273259  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
27273258 tttttcatatcgaatttaaa 27273239  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31764 - 31646
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
31764 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt-agatgatatt 31666  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
31665 tttttcatatcgaatttaaa 31646  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10233766 - 10233647
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
10233766 atactacaaataattattacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataatatt 10233667  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
10233666 tttttcatatcgaatttaaa 10233647  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10230792 - 10230612
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10230792 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaa-gtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 10230694  T
114 tttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||| |   |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
10230693 tttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatggtataaaatctatacatttgatcaaa 10230612  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 50409121 - 50408935
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaa---------aattaa 105  Q
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50409121 atactacaaataattagtataagtataa--attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaatattaacaaaattaa 50409024  T
106 gatgatgttttttct--tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||||| |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
50409023 gatgatattttttttcatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatatatacatttgatcaaa 50408935  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10109563 - 10109373
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa-------- 105  Q
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10109563 atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaatta 10109464  T
106 -gatgatgttttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
     |||||| |||||| |   |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
10109463 agatgatattttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaa 10109373  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10041000 - 10040851
Alignment:
44 aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga--tatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttcttatcg---aatttaaattata 138  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||||    
10041000 aatccaaatactttaatccttatgtgcaatgtttagacatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttttcatgtgaaatttaaattata 10040901  T
139 accacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
10040900 accacacttataattgtaagataacataatataaaatctatacatttgat 10040851  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 10970167 - 10970340
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaat---------taa 105  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||   |||| ||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
10970167 atactacaaataattagtataactataac--tccaaatactttaatcgttgtgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaacaaaattaa 10970264  T
106 gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata 180  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10970265 gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctata 10970340  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46912232 - 46912134
Alignment:
96 acaaaattaagatgatgttttttct--tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
46912232 acaaaattaagatgatattttttcccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatatatacattttatcaaa 46912134  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52916836 - 52916744
Alignment:
98 aaaattaagatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
52916836 aaaattaagatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataaatttaagataacataatataaaatctatacatttgat 52916744  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41221157 - 41220976
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||| ||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||             
41221157 atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatatttatgtgcaatgtttaggtatttcaaaatatatacaaaattaataaaattaa 41221061  T
106 gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
41221060 gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccgcacttataactttaatataacataatataaaatttatacatttgat 41220976  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 47691988 - 47691894
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 111  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||  || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
47691988 atactacaaataattaatataagtataa--attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgat 47691894  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 52917708 - 52917633
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaata 92  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||   |||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
52917708 atactacaaataattagtataagtataac--tccaaatactttaatcgttatgtccaatgtttagatattttaaaata 52917633  T

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Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 24270217 - 24270391
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
24270217 atactacaaataattagtacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatata 24270316  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
24270317 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat 24270391  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21394318 - 21394143
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |     
21394318 atactacaaataattagtacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatattttaaaatatatacaaaaataagattatata 21394219  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataac-ataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
21394218 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaaatataaaatctatacatatgat 21394143  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35608823 - 35608673
Alignment:
44 aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttct--tatcgaatttaaattataacc 141  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||  ||||||||||||||||    
35608823 aatccagatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatcttttttttcatatgaaatttaaattataacc 35608724  T
142 acaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
35608723 acacttataactttaagataacataatataaaatttatacatttgatcaaa 35608673  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 36047961 - 36048080
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
36047961 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 36048060  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
36048061 tttttcatatcgaatttaaa 36048080  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 26955189 - 26955308
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
26955189 atactacaaataattagtacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 26955288  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
26955289 tttttcatatcgaatttaaa 26955308  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 39441936 - 39442055
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
39441936 atactacatataattagtacaagtataatgatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 39442035  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
39442036 tttttcatatcgaatttaaa 39442055  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 41921443 - 41921559
Alignment:
18 ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
41921443 ctacaaataattagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt 41921542  T
117 ttcttatcgaatttaaa 133  Q
    ||| |||||||||||||    
41921543 ttcatatcgaatttaaa 41921559  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 17687621 - 17687779
Alignment:
19 tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa---gatgatgttt 115  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||    
17687621 tacaaataattagtataagtataa--atcca-atactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgatattt 17687717  T
116 ttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaat 175  Q
    |||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17687718 ttttccatatcaaatttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat 17687779  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24244823 - 24244642
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa------gat 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |     
24244823 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaataaaattaa 24244726  T
109 gatg-ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
24244725 gatgatatttccatatcaaatttaaattataaccacacttataa-tttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 24244642  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27508333 - 27508149
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------g 106  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |    
27508333 atactacaaataattagtataagtataa--attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaaaaaattaag 27508236  T
107 atgatgttttttct--tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
27508235 atgatattttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaa-ataacataatataaaatatatacatttgatcaaa 27508149  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 28667446 - 28667563
Alignment:
18 ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttt 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||    
28667446 ctacaaataatcagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt 28667545  T
116 tttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||| |||||||||||||    
28667546 tttcatatcgaatttaaa 28667563  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 37826280 - 37826397
Alignment:
18 ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttt 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||    
37826280 ctacaaataatcagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt 37826379  T
116 tttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||| |||||||||||||    
37826380 tttcatatcgaatttaaa 37826397  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3642020 - 3641835
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
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3642020 atactacaaataattaatataagaataa--atctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa 3641923  T
106 gatgatgttttttc-ttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
3641922 gatgatattttttccttatcatatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttaatcaaa 3641835  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 2881740 - 2881911
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  || || ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
2881740 atactacaaataattagtataagtataa--attcaaatactttaattgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa 2881837  T
106 gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatct 177  Q
    |||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
2881838 gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatct 2881911  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 40488956 - 40489146
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaatta 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         |||||||||    
40488956 atactacaaataattagtataagtataataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttaaaaatatatacaaaattaacaaaatta 40489055  T
105 agatg--atgttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataacttta-agataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
40489056 agatgatatgtttttccatatcaaatttaaattataataacacttataactttataattaacatagtataaaatctatatatttgatcaaa 40489146  T

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Target: scaffold0073 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23543 - 23373
Alignment:
19 tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttt 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
23543 tacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt 23444  T
118 tcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23443 tcatatcgagtttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 23373  T

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Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18412 - 18188
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||  |    
18412 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatatt 18313  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgt 213  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||          |||| ||||||    
18312 tttttcatttcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatctatatatataatcaaaaaagctttttattt-ccccgt 18214  T
214 gctggaacaggtcactatactagtta 239  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
18213 gctggcacgggtcactatactagtta 18188  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 133133 - 133307
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
133133 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatata 133232  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
133233 tttttcatatggaatttaaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat 133307  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 164480 - 164302
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |    
164480 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatatt 164381  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
164380 tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatatgatcaaa 164302  T

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Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 172595 - 172417
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |    
172595 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatatt 172496  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
172495 tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatatgatcaaa 172417  T

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Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 37915303 - 37915478
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
37915303 atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 37915402  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37915403 tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgat 37915478  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 21114941 - 21115116
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatac-aaaattaagatgatgt 113  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
21114941 atactacaaataattagtataggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaaattaagattatat 21115040  T
114 -tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
21115041 atttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat 21115116  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14764580 - 14764406
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    |||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
14764580 atactacaaataatt---acaagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatt 14764484  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14764483 tttttcacatcgaatttaaattataa-cacaattataattttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 14764406  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 31979790 - 31980014
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||  |    
31979790 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatatt 31979889  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgt 213  Q
    |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||          |||| ||||||    
31979890 tttttcatttcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatctatatatataatcaaaaaagctttttattt-ccccgt 31979988  T
214 gctggaacaggtcactatactagtta 239  Q
    ||||| || |||||||||||||||||    
31979989 gctggcacgggtcactatactagtta 31980014  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 25219835 - 25219954
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
25219835 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 25219934  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
25219935 tttttcatatcgaatttaaa 25219954  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7780698 - 7780602
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 111  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7780698 atactacaaataattagtaaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 7780602  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7820788 - 7820692
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 111  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7820788 atactacaaataattagtaaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 7820692  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13424584 - 13424402
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
13424584 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa 13424487  T
106 gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    ||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13424486 gatgatgcttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgat 13424402  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 33863079 - 33863182
Alignment:
87 aaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacata 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
33863079 aaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacata 33863178  T
185 tgat 188  Q
    ||||    
33863179 tgat 33863182  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14713206 - 14713047
Alignment:
44 aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa---------gatgatgtttttt--cttatcgaatttaa 132  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||||  | |||| |||||||    
14713206 aatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatgatatttttttccatatcaaatttaa 14713107  T
133 attataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14713106 attataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 14713047  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30306085 - 30305978
Alignment:
26 aatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttcttatc 124  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
30306085 aattagtacaagtataa-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcatatc 30305987  T
125 gaatttaaa 133  Q
    |||||||||    
30305986 gaatttaaa 30305978  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Original strand, 33862651 - 33862724
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaa 88  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
33862651 atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaa 33862724  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 310961 - 311135
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
310961 atactacaaataattagtacatgtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatata 311060  T
114 tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
311061 tttttcatatggaatttaaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat 311135  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Original strand, 331413 - 331509
Alignment:
90 atatatacaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatat 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
331413 atatatacaaaattaagatgatatttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatat 331509  T

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Target: scaffold0888 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 992 - 1164
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
992 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 1089  T
115 tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
1090 ttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgat 1164  T

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Target: scaffold0262 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17965 - 17790
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-g 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
17965 atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat 17866  T
113 ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
17865 ttttttcatatcaaattaaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgat 17790  T

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Target: scaffold0636 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0636
Description:

Target: scaffold0636; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 28 - 147
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
28 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 127  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
128 tttttcatatcgaatttaaa 147  T

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Target: scaffold1370 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1370
Description:

Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 1435 - 1612
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatat--ttcaaaatatatacaaaattaagatgatg 112  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
1435 atactacaaatatattttataagtataa--atccaaatactttaatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 1532  T
113 ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
1533 ttttttcatgtcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgatcaaa 1612  T

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Target: scaffold0582 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10373 - 10254
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
10373 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 10274  T
115 ttttct-tatcgaatttaaa 133  Q
    |||| | |||||||||||||    
10273 ttttttatatcgaatttaaa 10254  T

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Target: scaffold0550 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 4795 - 4914
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
4795 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgttttgatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 4894  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
4895 tttttcatatcgaatttaaa 4914  T

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Target: scaffold0090 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 50206 - 50325
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
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50206 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaagatgatatt 50305  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
50306 tttttcatatcgaatttaaa 50325  T

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Target: scaffold0472 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13417 - 13298
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt 113  Q
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13417 atactacaaataattagtacaagtataataatttaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 13318  T
114 tttttcttatcgaatttaaa 133  Q
    |||||| |||||||||||||    
13317 tttttcatatcgaatttaaa 13298  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 6497 - 6681
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata---------caaaatta 104  Q
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6497 atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaacaaaatta 6596  T
105 agatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
6597 agatgatatttttttcatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgat 6681  T

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Target: scaffold0499 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9998
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
10099 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatactttcatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 10000  T
115 tt 116  Q
    ||    
9999 tt 9998  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 98087 - 98267
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
98087 atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa 98183  T
106 gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
98184 gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgat 98267  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13446 - 13271
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- 113  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
13446 atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatattttaatcgttacgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt 13349  T
114 -tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
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13348 gttttccatatcaaatttaaattataacgacacttataactt--agataacataatcccaaatctattcatttgatcaaa 13271  T

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Target: scaffold0107 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44960 - 44783
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatat--ttcaaaatatatacaaaattaagatgatg 112  Q
    ||||||||||||  || || ||||||||  ||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
44960 atactacaaatatattttataagtataa--atccaaatactttaatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 44863  T
113 ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
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44862 tttttttatgtcaaatttaaattataatcagacttataactttaagataacataatataaaatcaatatatttgatcaaa 44783  T

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Target: scaffold0118 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 29832 - 29954
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttat---atgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
29832 atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcattattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataat 29931  T
112 -gttttttcttatcgaatttaaa 133  Q
      ||||||| |||||||||||||    
29932 atttttttcatatcgaatttaaa 29954  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 185523 - 185339
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa-------- 105  Q
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185523 atactacaaataattagtataagtataataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaacaaaataa 185424  T
106 -gatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat 188  Q
     |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
185423 agatgatatttttttcatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacataatataaaatctatacatttgat 185339  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 125178 - 124993
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
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125178 atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatattgcaaaatatatacaaaattaacaagattaa 125082  T
106 gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    |||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
125081 gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa 124993  T

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Target: scaffold0532 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0532
Description:

Target: scaffold0532; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 3583 - 3768
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- 105  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||  ||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
3583 atactacaaataattattataagtataa--atccaaagactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacagaattaa 3680  T
106 gatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa 192  Q
    ||| || |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
3681 gataatatttttttcatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctacacattcgatcaaa 3768  T

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Target: scaffold0196 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23265 - 23177
Alignment:
96 acaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacat 183  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23265 acaaaattaagatgatatttttttcatatgaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacat 23177  T

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Target: scaffold1424 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 459
Alignment:
15 atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaa---------tta 104  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | || ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||    
642 atactacaaataattagtataagtataataaattcaaatacttcaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaatta 543  T
105 agatg--atgttttttcttatc------gaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata 180  Q
    |||||  |||||||| | ||||       ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
542 agatgatatgtttttccatatcaaatttaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatctata 459  T

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