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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF15205_low_22 (Length: 346)
Name: NF15205_low_22
Description: NF15205
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15205_low_22 |
 |  |
|
| [»] scaffold0073 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0029 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0002 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0888 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0262 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0636 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1370 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0582 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0550 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0472 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0134 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0499 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0118 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0532 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0196 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1424 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 238
Target Start/End: Original strand, 25075129 - 25075345
Alignment:
| Q |
23 |
aataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttctt |
121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25075129 |
aataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttctt |
25075228 |
T |
 |
| Q |
122 |
atcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgtgctggaac |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25075229 |
atcgaatttaaattataatcacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttatttcccccgtgctggcac |
25075328 |
T |
 |
| Q |
222 |
aggtcactatactagtt |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
25075329 |
gggtcactatactagtt |
25075345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16040978 - 16040805
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
16040978 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatatt |
16040879 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16040878 |
tttttcatatcg-atttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaatctatatatatgat |
16040805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 16748931 - 16749109
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |
|
|
| T |
16748931 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatattcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaattatatt |
16749030 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16749031 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatataatcaaa |
16749109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 48776597 - 48776771
Alignment:
| Q |
19 |
tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
48776597 |
tacaaataattaatacaagtataataaaacaaatactttaatcgatatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatttttt |
48776696 |
T |
 |
| Q |
119 |
-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
48776697 |
tcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatctatacatattatcaaa |
48776771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28961024 - 28960849
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
28961024 |
atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcgttatttgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
28960928 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28960927 |
ttttccatatcaaatttcaattataagtacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
28960849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 48240056 - 48240233
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
48240056 |
atactacaaataattaatataagtataa--atccaaatagtttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
48240153 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||| | ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48240154 |
tttttccatataaaatttaaattataatcacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttgatcaaa |
48240233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 36518892 - 36518773
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
36518892 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatatt |
36518793 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36518792 |
tttttcatatcgaatttaaa |
36518773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 52499685 - 52499566
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
52499685 |
atactataaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
52499586 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52499585 |
tttttcatatcgaatttaaa |
52499566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 37391411 - 37391529
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
37391411 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgatatt |
37391509 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37391510 |
tttttcatatcgaatttaaa |
37391529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7101922 - 7101746
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7101922 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatatt |
7101825 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaatt----ataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||| | | || ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7101824 |
ttttccatgtcaaatttaaattataaccacacttataaataactttaaaataacataatataaaatctatacatttgat |
7101746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 6312258 - 6312377
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatga-tgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
6312258 |
atactacaaataattagtacaaatataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattatgatgatttt |
6312357 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6312358 |
tttttcatatcgaatttaaa |
6312377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18147642 - 18147523
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18147642 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgctatgtgcaatgcttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
18147543 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18147542 |
tttttcatatcgaatttaaa |
18147523 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36206165 - 36205994
Alignment:
| Q |
20 |
acaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gtttttt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
36206165 |
acaaataattagtataagtataa--atctaaatactttaatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatattttttt |
36206068 |
T |
 |
| Q |
119 |
cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
36206067 |
catatcaaatttaaattatagctacatttataactttaagataatacaatataaaatctatatatttgatcaaa |
36205994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Original strand, 2454019 - 2454179
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2454019 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
2454116 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt--cttatcgaatttaaattataacca-caattataactttaagataacataatataaaa |
174 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2454117 |
tttttccatatcaaatttaaattataaccaccctttttaattttaagataacataatataaaa |
2454179 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16043316 - 16043139
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||| ||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
16043316 |
atactacaaataattaatataagtttaa--atccaaatactttgatcgttatgtgcaatggttacatatttcaaaatatagacaaaattaagatgatatt |
16043219 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
16043218 |
tttttctatatcaaattgaaattataatcacacttttaactttaaaataacataatataaaatctatacattttatcaaa |
16043139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12450875 - 12450755
Alignment:
| Q |
71 |
aatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat------gatgttttttctt-----atcgaatttaaattataaccacaattataactttaaga |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12450875 |
aatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatattttttttttccatatcaaatttaaattatagccacacttataactttaaga |
12450776 |
T |
 |
| Q |
160 |
taacataatataaaatctata |
180 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12450775 |
taacataatataaaatctata |
12450755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15330492 - 15330315
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15330492 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
15330393 |
T |
 |
| Q |
115 |
ttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15330392 |
ttttcatatccaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
15330315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12516341 - 12516162
Alignment:
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15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatg--atg |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12516341 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
12516242 |
T |
 |
| Q |
113 |
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192 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12516241 |
ttttttcatatcgaatttaaattataaacacaattataactttaagatatcataatataaaatctatatatatgatcaaa |
12516162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24195855 - 24195677
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
24195855 |
atactacaaaaaattaatacaagtataataatcaaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatt |
24195756 |
T |
 |
| Q |
115 |
-ttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24195755 |
gttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgatcaaa |
24195677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10186505 - 10186342
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt---aagatgat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
10186505 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatattttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgat |
10186408 |
T |
 |
| Q |
112 |
gtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaat |
175 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10186407 |
atttttttccatatcaaatttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat |
10186342 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 31512758 - 31512877
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31512758 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
31512857 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31512858 |
tttttcatatcgaatttaaa |
31512877 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12518567 - 12518390
Alignment:
| Q |
15 |
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114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
12518567 |
atactacaaataattaatataagtataa--atccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatttatacaaaattaggatgatatt |
12518470 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt-ct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||| || ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12518469 |
tttttctatattaaatttaaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
12518390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 4221273 - 4221459
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4221273 |
atactacaaataattagtataagtataa--atacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaactaa |
4221370 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4221371 |
gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
4221459 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 29642620 - 29642739
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
29642620 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttgtatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatcatatt |
29642719 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29642720 |
tttttcatatcgaatttaaa |
29642739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14906422 - 14906291
Alignment:
| Q |
45 |
atccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccac |
143 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
14906422 |
atccaaatactttaatcattatgtgcaatatttagatatttcaaaatatttacagaattaagaagatatttttttaatatcgaatttaaattacaatcac |
14906323 |
T |
 |
| Q |
144 |
aattataactttaagataacataatataaaat |
175 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14906322 |
atttataactttaagataacataatataaaat |
14906291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30881015 - 30880827
Alignment:
| Q |
15 |
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105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30881015 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaacaaaattaa |
30880918 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgat--gttttttcttatcgaatttaaattataaccacaat--tataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30880917 |
gatgatacttttttccatatcaaattcaaattataaccatacttatataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaa |
30880827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31920423 - 31920244
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
31920423 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
31920324 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31920323 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataaaataatataaaatctatacatatgatcaaa |
31920244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49709130 - 49708952
Alignment:
| Q |
15 |
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |
|
|
| T |
49709130 |
atactacaaataattagtacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaaaattatatt |
49709031 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49709030 |
tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatatatatgatcaaa |
49708952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 786869 - 786705
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
786869 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttat--gcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaagttaagatgatatt |
786772 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata |
180 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
786771 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatttata |
786705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 618581 - 618754
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
618581 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
618678 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
618679 |
tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttgat |
618754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 55560234 - 55560353
Alignment:
| Q |
15 |
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
55560234 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
55560333 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
55560334 |
tttttcatatcgaatttaaa |
55560353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35854860 - 35854742
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
35854860 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgatatt |
35854762 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35854761 |
tttttcatatcgaatttaaa |
35854742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 37532673 - 37532904
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532673 |
atactacaaataatttagttaagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa |
37532770 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnat |
204 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
37532771 |
gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaaacagttttttat |
37532870 |
T |
 |
| Q |
205 |
ttcccccgtgctggaacaggtcactatactagtta |
239 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532871 |
tt-ccccgtgctggcacgggtcactatactagtta |
37532904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 49788098 - 49788215
Alignment:
| Q |
18 |
ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
49788098 |
ctacaaataattagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt |
49788197 |
T |
 |
| Q |
116 |
tttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49788198 |
tttcatatcgaatttaaa |
49788215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6244849 - 6244756
Alignment:
| Q |
41 |
aataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6244849 |
aataatccaaatatttttatcgttgtatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatttttttcatatcgaatttaaa |
6244756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38517508 - 38517436
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttca |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38517508 |
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38517436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1859630 - 1859565
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga |
80 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
1859630 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatacaatatttaga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 36711990 - 36711955
Alignment:
| Q |
303 |
aaaatgagacatttcacttttccccacattcttttc |
338 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36711990 |
aaaacgagacatttcacttttccccacattcttttc |
36711955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 25544010 - 25544188
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25544010 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcgatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
25544109 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25544110 |
tttttcataacgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
25544188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 23 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4050752 - 4050586
Alignment:
| Q |
23 |
aataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttctt |
121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4050752 |
aataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttctt |
4050653 |
T |
 |
| Q |
122 |
atcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4050652 |
atcgaatttaaattataaacacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
4050586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43448434 - 43448256
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
43448434 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttaaatttttcaaaatatatacaaaattaagattatatt |
43448335 |
T |
 |
| Q |
115 |
-ttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43448334 |
gttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgatcaaa |
43448256 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 30313331 - 30313201
Alignment:
| Q |
20 |
acaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt-tttt |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30313331 |
acaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttt |
30313232 |
T |
 |
| Q |
119 |
cttatcgaatttaaattataaccacaattat |
149 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30313231 |
cttatcaaatttaaattataaccacaattat |
30313201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10024085 - 10023966
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10024085 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
10023986 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10023985 |
tttttcatatcgaatttaaa |
10023966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 24631067 - 24631186
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24631067 |
atactataaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
24631166 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24631167 |
tttttcatatcgaatttaaa |
24631186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26792764 - 26792645
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26792764 |
atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
26792665 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26792664 |
tttttcatatcgaatttaaa |
26792645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 8429845 - 8429961
Alignment:
| Q |
18 |
ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gtttt |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
8429845 |
ctacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatgaagatgatattttt |
8429944 |
T |
 |
| Q |
117 |
ttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8429945 |
ttcatatcgaatttaaa |
8429961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6088170 - 6087993
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6088170 |
atactacaaataattagtataagtataa--attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaactatatacaaaattaagatgatatt |
6088073 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt---cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
6088072 |
ttttttccatattaaatttaaattataaccacatttataactttaa-ataacataatataaaatctatatatttgatcaaa |
6087993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 30347747 - 30347866
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30347747 |
atactataaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
30347846 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30347847 |
tttttcatatcgaatttaaa |
30347866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 15033850 - 15034023
Alignment:
| Q |
19 |
tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15033850 |
tacaaataattaatataagtataa--atccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatattcaaaattaagatgaaatttttt |
15033947 |
T |
 |
| Q |
119 |
ct--tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15033948 |
tcaatatcaaatttaaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
15034023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18115708 - 18115583
Alignment:
| Q |
68 |
tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacata |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18115708 |
tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttccatgtcaaatttaaattaaaaccacacttataactttaagataacata |
18115609 |
T |
 |
| Q |
167 |
atataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18115608 |
atataaaatctatacacttgatcaaa |
18115583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Original strand, 43525174 - 43525323
Alignment:
| Q |
44 |
aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataacca |
142 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43525174 |
aatccaaatactttaatcattatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttccatgacaaatttaaattaaaacca |
43525273 |
T |
 |
| Q |
143 |
caattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43525274 |
cacttataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaa |
43525323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27880040 - 27879920
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccata-tatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-g |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27880040 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaaatatttttatcgttatatggaatttttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat |
27879941 |
T |
 |
| Q |
113 |
ttttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27879940 |
ttttttcatatcgaatttaaa |
27879920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 14194139 - 14194323
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14194139 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa |
14194236 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatga----tgttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14194237 |
gatgatcttttttttttcatatcaaatttaaattataactacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgat |
14194323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 2262258 - 2262443
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata---------caaaattaa |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2262258 |
atactacaaataatttagttaagtataa--attcaaatactttaatcgttatctgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaacaaaattaa |
2262355 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2262356 |
gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
2262443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3688899 - 3688820
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatata |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3688899 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata |
3688820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 3877886 - 3877965
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatata |
94 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3877886 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata |
3877965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 17872167 - 17872355
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17872167 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaacaaaattaa |
17872264 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgat--gttttttcttatcgaatttaaattataaccacaat--tataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17872265 |
gatgatacttttttccatatcaaattcaaattataaccatacttatataactttaagataacataatataaaatctatacacttgatcaaa |
17872355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 39882137 - 39882072
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga |
80 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39882137 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga |
39882072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37260271 - 37260185
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatat-ttcaaaatatatacaaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37260271 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcattatatgcaatgtttagatatatacaaaatatatacaaa |
37260185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37371824 - 37371747
Alignment:
| Q |
58 |
tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatg--atgttttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37371824 |
tatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttcatatcgaatttaaa |
37371747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 26831589 - 26831498
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26831589 |
atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
26831498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 246
Target Start/End: Original strand, 3877963 - 3878049
Alignment:
| Q |
159 |
ataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgtgctggaacaggtcactatactagttagtagtaa |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3877963 |
ataacataatataaaatctatacatatgatcaaaaaagttttttattt-ccccgtgctggcacgggtcactatactagttaatagtaa |
3878049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3688822 - 3688789
Alignment:
| Q |
159 |
ataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3688822 |
ataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
3688789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 37371880 - 37371842
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatata |
53 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37371880 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaata |
37371842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 45122623 - 45122792
Alignment:
| Q |
19 |
tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttttt |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45122623 |
tacaaataattagtacaagtataataattcaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt |
45122722 |
T |
 |
| Q |
119 |
cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45122723 |
catatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatctatacatatgat |
45122792 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 191
Target Start/End: Original strand, 21071319 - 21071499
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21071319 |
atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttgtgtacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat |
21071418 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaa |
191 |
Q |
| |
|
||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
21071419 |
tttttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgatcaa |
21071499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7035658 - 7035539
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7035658 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgaaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
7035559 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7035558 |
tttttcatatcgaatttaaa |
7035539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42231108 - 42230989
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
42231108 |
atactaaaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
42231009 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42231008 |
tttttcatatcgaatttaaa |
42230989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 9002388 - 9002509
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat--- |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9002388 |
atactacaaaaaattagtacaagtataataattcaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatata |
9002487 |
T |
 |
| Q |
112 |
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133 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9002488 |
tttttttcatatcgaatttaaa |
9002509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 12787249 - 12787352
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12787249 |
atactacaaataataaatacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
12787348 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt |
118 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
12787349 |
tttt |
12787352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 5829799 - 5829987
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa-------- |
105 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5829799 |
atacgacaaataattagtataagtatagtaaatcaaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatttacaaaattaacaaaatta |
5829898 |
T |
 |
| Q |
106 |
-gatgatgttttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatca |
190 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5829899 |
agatgatattttttttccatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatca |
5829987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22843491 - 22843403
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22843491 |
atactacaaataattagtataaatataa--atccaaatactttagtcgttatgtgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa |
22843403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10037596 - 10037418
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10037596 |
atactacaaataattagtacaagtatagtaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
10037497 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10037496 |
tttttaatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
10037418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 41764633 - 41764812
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41764633 |
atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
41764732 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41764733 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
41764812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11361210 - 11361032
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11361210 |
atactacaaataattagtacaaatataataatccaaatacttttatggttatatgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatatt |
11361111 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11361110 |
tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
11361032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11367599 - 11367421
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11367599 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaataatttaatcgatatatgcaaagtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
11367500 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11367499 |
tttttcatatcgaatttaaattataacgacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
11367421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23092496 - 23092321
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
23092496 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatatttcaaaatatatacaaaaataagattatata |
23092397 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataac-ataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23092396 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaaatataaaatctatacatatgat |
23092321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 15329833 - 15330010
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
15329833 |
atactacaaataattagtacaagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatt |
15329932 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15329933 |
tttttcacatcgaatttaaattataa-cacaattataattttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
15330010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9999373 - 9999193
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9999373 |
atactacaaataattagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat |
9999274 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9999273 |
ttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaa |
9999193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 37803021 - 37803186
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37803021 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatctcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
37803118 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata |
180 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37803119 |
tttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctata |
37803186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10108932 - 10108813
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10108932 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
10108833 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10108832 |
tttttcatatcgaatttaaa |
10108813 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10230171 - 10230052
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
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| T |
10230171 |
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10230072 |
T |
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114 |
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133 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10230071 |
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10230052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10234385 - 10234204
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt |
113 |
Q |
| |
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| T |
10234385 |
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10234286 |
T |
 |
| Q |
114 |
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192 |
Q |
| |
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||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
10234285 |
tttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaa |
10234204 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27273358 - 27273239
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
27273358 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatatt |
27273259 |
T |
 |
| Q |
114 |
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133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
27273258 |
tttttcatatcgaatttaaa |
27273239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31764 - 31646
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
31764 |
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31666 |
T |
 |
| Q |
114 |
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133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31665 |
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31646 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10233766 - 10233647
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
10233766 |
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10233667 |
T |
 |
| Q |
114 |
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133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10233666 |
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10233647 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10230792 - 10230612
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
10230792 |
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10230694 |
T |
 |
| Q |
114 |
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192 |
Q |
| |
|
||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10230693 |
tttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatggtataaaatctatacatttgatcaaa |
10230612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 50409121 - 50408935
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaa---------aattaa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
50409121 |
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50409024 |
T |
 |
| Q |
106 |
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192 |
Q |
| |
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| T |
50409023 |
gatgatattttttttcatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatatatacatttgatcaaa |
50408935 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10109563 - 10109373
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa-------- |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10109563 |
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10109464 |
T |
 |
| Q |
106 |
-gatgatgttttttct---tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
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|||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
10109463 |
agatgatattttttttccatatcaaatgtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgatcaaa |
10109373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10041000 - 10040851
Alignment:
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44 |
aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga--tatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttcttatcg---aatttaaattata |
138 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |
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|
| T |
10041000 |
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10040901 |
T |
 |
| Q |
139 |
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188 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10040900 |
accacacttataattgtaagataacataatataaaatctatacatttgat |
10040851 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 10970167 - 10970340
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaat---------taa |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10970167 |
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10970264 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata |
180 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10970265 |
gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctata |
10970340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46912232 - 46912134
Alignment:
| Q |
96 |
acaaaattaagatgatgttttttct--tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |
|
|
| T |
46912232 |
acaaaattaagatgatattttttcccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatatatacattttatcaaa |
46912134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 52916836 - 52916744
Alignment:
| Q |
98 |
aaaattaagatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
52916836 |
aaaattaagatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataaatttaagataacataatataaaatctatacatttgat |
52916744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41221157 - 41220976
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41221157 |
atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatatttatgtgcaatgtttaggtatttcaaaatatatacaaaattaataaaattaa |
41221061 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
41221060 |
gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccgcacttataactttaatataacataatataaaatttatacatttgat |
41220976 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 47691988 - 47691894
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| || || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47691988 |
atactacaaataattaatataagtataa--attcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgat |
47691894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 52917708 - 52917633
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaata |
92 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52917708 |
atactacaaataattagtataagtataac--tccaaatactttaatcgttatgtccaatgtttagatattttaaaata |
52917633 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 24270217 - 24270391
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
24270217 |
atactacaaataattagtacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatata |
24270316 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24270317 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat |
24270391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21394318 - 21394143
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
21394318 |
atactacaaataattagtacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatattttaaaatatatacaaaaataagattatata |
21394219 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataac-ataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21394218 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaaatataaaatctatacatatgat |
21394143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35608823 - 35608673
Alignment:
| Q |
44 |
aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgttttttct--tatcgaatttaaattataacc |
141 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35608823 |
aatccagatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatcttttttttcatatgaaatttaaattataacc |
35608724 |
T |
 |
| Q |
142 |
acaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35608723 |
acacttataactttaagataacataatataaaatttatacatttgatcaaa |
35608673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 36047961 - 36048080
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
36047961 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
36048060 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36048061 |
tttttcatatcgaatttaaa |
36048080 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 26955189 - 26955308
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26955189 |
atactacaaataattagtacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
26955288 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26955289 |
tttttcatatcgaatttaaa |
26955308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 39441936 - 39442055
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39441936 |
atactacatataattagtacaagtataatgatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
39442035 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39442036 |
tttttcatatcgaatttaaa |
39442055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 41921443 - 41921559
Alignment:
| Q |
18 |
ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtttt |
116 |
Q |
| |
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| T |
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41921542 |
T |
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| Q |
117 |
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133 |
Q |
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| T |
41921543 |
ttcatatcgaatttaaa |
41921559 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 17687621 - 17687779
Alignment:
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19 |
tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa---gatgatgttt |
115 |
Q |
| |
|
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| T |
17687621 |
tacaaataattagtataagtataa--atcca-atactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgatattt |
17687717 |
T |
 |
| Q |
116 |
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175 |
Q |
| |
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| T |
17687718 |
ttttccatatcaaatttaaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat |
17687779 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24244823 - 24244642
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15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa------gat |
108 |
Q |
| |
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| T |
24244823 |
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24244726 |
T |
 |
| Q |
109 |
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192 |
Q |
| |
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|||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
24244725 |
gatgatatttccatatcaaatttaaattataaccacacttataa-tttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
24244642 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27508333 - 27508149
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------g |
106 |
Q |
| |
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| T |
27508333 |
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27508236 |
T |
 |
| Q |
107 |
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192 |
Q |
| |
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||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
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| T |
27508235 |
atgatattttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaa-ataacataatataaaatatatacatttgatcaaa |
27508149 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 28667446 - 28667563
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115 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
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| T |
28667446 |
ctacaaataatcagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt |
28667545 |
T |
 |
| Q |
116 |
tttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
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| T |
28667546 |
tttcatatcgaatttaaa |
28667563 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 37826280 - 37826397
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| Q |
18 |
ctacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttt-tatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttt |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |
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| T |
37826280 |
ctacaaataatcagtacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgatatttt |
37826379 |
T |
 |
| Q |
116 |
tttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37826380 |
tttcatatcgaatttaaa |
37826397 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3642020 - 3641835
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| Q |
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
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| T |
3642020 |
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3641923 |
T |
 |
| Q |
106 |
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192 |
Q |
| |
|
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| T |
3641922 |
gatgatattttttccttatcatatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatctatacatttaatcaaa |
3641835 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Original strand, 2881740 - 2881911
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
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| T |
2881740 |
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2881837 |
T |
 |
| Q |
106 |
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177 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2881838 |
gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatct |
2881911 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 40488956 - 40489146
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaatta |
104 |
Q |
| |
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| T |
40488956 |
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40489055 |
T |
 |
| Q |
105 |
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192 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
40489056 |
agatgatatgtttttccatatcaaatttaaattataataacacttataactttataattaacatagtataaaatctatatatttgatcaaa |
40489146 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0073 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:
Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23543 - 23373
Alignment:
| Q |
19 |
tacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttt |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23543 |
tacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt |
23444 |
T |
 |
| Q |
118 |
tcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23443 |
tcatatcgagtttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
23373 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18412 - 18188
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| Q |
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
18412 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatatt |
18313 |
T |
 |
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
|
|||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
18312 |
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18214 |
T |
 |
| Q |
214 |
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239 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18213 |
gctggcacgggtcactatactagtta |
18188 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:
Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 133133 - 133307
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
133133 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatata |
133232 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
133233 |
tttttcatatggaatttaaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat |
133307 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 164480 - 164302
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
164480 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatatt |
164381 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
164380 |
tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatatgatcaaa |
164302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 172595 - 172417
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
172595 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatatt |
172496 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
172495 |
tttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatatgatcaaa |
172417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 37915303 - 37915478
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| Q |
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37915303 |
atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
37915402 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataac-tttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37915403 |
tttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
37915478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 21114941 - 21115116
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatac-aaaattaagatgatgt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
21114941 |
atactacaaataattagtataggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaaattaagattatat |
21115040 |
T |
 |
| Q |
114 |
-tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21115041 |
atttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat |
21115116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14764580 - 14764406
Alignment:
| Q |
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14764580 |
atactacaaataatt---acaagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatatt |
14764484 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14764483 |
tttttcacatcgaatttaaattataa-cacaattataattttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
14764406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Original strand, 31979790 - 31980014
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
31979790 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatatt |
31979889 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaannnnnnnnnnatttcccccgt |
213 |
Q |
| |
|
|||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
31979890 |
tttttcatttcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatctatatatataatcaaaaaagctttttattt-ccccgt |
31979988 |
T |
 |
| Q |
214 |
gctggaacaggtcactatactagtta |
239 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 25219835 - 25219954
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Q |
| |
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25219835 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
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T |
 |
| Q |
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tttttcttatcgaatttaaa |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25219935 |
tttttcatatcgaatttaaa |
25219954 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
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Target Start/End: Complemental strand, 7780698 - 7780602
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7780698 |
atactacaaataattagtaaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
7780602 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 15 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7820788 - 7820692
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| Q |
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7820788 |
atactacaaataattagtaaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
7820692 |
T |
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Target: chr8; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 13424584 - 13424402
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15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13424584 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa |
13424487 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13424486 |
gatgatgcttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttttaactttaagataacataatataaaatctatacatttgat |
13424402 |
T |
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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 188
Target Start/End: Original strand, 33863079 - 33863182
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| Q |
87 |
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184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33863079 |
aaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcatatcgaatttaaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatctatacata |
33863178 |
T |
 |
| Q |
185 |
tgat |
188 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
33863179 |
tgat |
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T |
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Target: chr8; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 14713206 - 14713047
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44 |
aatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa---------gatgatgtttttt--cttatcgaatttaa |
132 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||| |
|
|
| T |
14713206 |
aatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatgatatttttttccatatcaaatttaa |
14713107 |
T |
 |
| Q |
133 |
attataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14713106 |
attataaccatacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
14713047 |
T |
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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
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Target Start/End: Complemental strand, 30306085 - 30305978
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26 |
aatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gttttttcttatc |
124 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
30306085 |
aattagtacaagtataa-aatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttcatatc |
30305987 |
T |
 |
| Q |
125 |
gaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
30305986 |
gaatttaaa |
30305978 |
T |
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Target: chr8; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 15 - 88
Target Start/End: Original strand, 33862651 - 33862724
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaa |
88 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33862651 |
atacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttcaa |
33862724 |
T |
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Target: scaffold0002 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
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Target Start/End: Original strand, 310961 - 311135
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
310961 |
atactacaaataattagtacatgtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatata |
311060 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
311061 |
tttttcatatggaatttaaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatctatacatatgat |
311135 |
T |
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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Original strand, 331413 - 331509
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90 |
atatatacaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatat |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
331413 |
atatatacaaaattaagatgatatttttttcatatcaaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatatatat |
331509 |
T |
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Target: scaffold0888 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:
Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 992 - 1164
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
992 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
1089 |
T |
 |
| Q |
115 |
tttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1090 |
ttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgat |
1164 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17965 - 17790
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atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-g |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17965 |
atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatat |
17866 |
T |
 |
| Q |
113 |
ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17865 |
ttttttcatatcaaattaaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgat |
17790 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0636 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0636
Description:
Target: scaffold0636; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
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Target Start/End: Original strand, 28 - 147
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
127 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
128 |
tttttcatatcgaatttaaa |
147 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1370 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1370
Description:
Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
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Target Start/End: Original strand, 1435 - 1612
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatat--ttcaaaatatatacaaaattaagatgatg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || |||||||| ||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1435 |
atactacaaatatattttataagtataa--atccaaatactttaatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
1532 |
T |
 |
| Q |
113 |
ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
|
||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
1533 |
ttttttcatgtcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatatatttgatcaaa |
1612 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0582 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:
Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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Target Start/End: Complemental strand, 10373 - 10254
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10373 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
10274 |
T |
 |
| Q |
115 |
ttttct-tatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
10273 |
ttttttatatcgaatttaaa |
10254 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0550 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:
Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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Target Start/End: Original strand, 4795 - 4914
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| Q |
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
4795 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgttttgatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
4894 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4895 |
tttttcatatcgaatttaaa |
4914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
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Target Start/End: Original strand, 50206 - 50325
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
50206 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaagatgatatt |
50305 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50306 |
tttttcatatcgaatttaaa |
50325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0472 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:
Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13417 - 13298
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat-gt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13417 |
atactacaaataattagtacaagtataataatttaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
13318 |
T |
 |
| Q |
114 |
tttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13317 |
tttttcatatcgaatttaaa |
13298 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0134 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:
Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 6497 - 6681
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| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata---------caaaatta |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6497 |
atactacaaataattagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaacaaaatta |
6596 |
T |
 |
| Q |
105 |
agatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6597 |
agatgatatttttttcatatcaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatctatacatttgat |
6681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0499 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:
Target: scaffold0499; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9998
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15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10099 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatactttcatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
10000 |
T |
 |
| Q |
115 |
tt |
116 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9999 |
tt |
9998 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 98087 - 98267
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atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
98087 |
atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaa |
98183 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgttttttct-tatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
98184 |
gatgatattttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgat |
98267 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13446 - 13271
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15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatgt- |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
13446 |
atactacaaataattagtataagtataa--atccaaatattttaatcgttacgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatt |
13349 |
T |
 |
| Q |
114 |
-tttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
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| T |
13348 |
gttttccatatcaaatttaaattataacgacacttataactt--agataacataatcccaaatctattcatttgatcaaa |
13271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44960 - 44783
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatat--ttcaaaatatatacaaaattaagatgatg |
112 |
Q |
| |
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|
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| T |
44960 |
atactacaaatatattttataagtataa--atccaaatactttaatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
44863 |
T |
 |
| Q |
113 |
ttttttcttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
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| T |
44862 |
tttttttatgtcaaatttaaattataatcagacttataactttaagataacataatataaaatcaatatatttgatcaaa |
44783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0118 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:
Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 29832 - 29954
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttat---atgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
111 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29832 |
atactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcattattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagataat |
29931 |
T |
 |
| Q |
112 |
-gttttttcttatcgaatttaaa |
133 |
Q |
| |
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| T |
29932 |
atttttttcatatcgaatttaaa |
29954 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 185523 - 185339
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa-------- |
105 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
185523 |
atactacaaataattagtataagtataataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaacaaaataa |
185424 |
T |
 |
| Q |
106 |
-gatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgat |
188 |
Q |
| |
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|
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| T |
185423 |
agatgatatttttttcatatcaaatttaaattataacaacacttataattttaagataacataatataaaatctatacatttgat |
185339 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 125178 - 124993
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
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|
|
| T |
125178 |
atactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatattgcaaaatatatacaaaattaacaagattaa |
125082 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgtttttt--cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
| |
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|
|
| T |
125081 |
gatgatatttttttccatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacatttgatcaaa |
124993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0532 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0532
Description:
Target: scaffold0532; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Original strand, 3583 - 3768
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa--------- |
105 |
Q |
| |
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|
| T |
3583 |
atactacaaataattattataagtataa--atccaaagactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacagaattaa |
3680 |
T |
 |
| Q |
106 |
gatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacatatgatcaaa |
192 |
Q |
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| T |
3681 |
gataatatttttttcatatcaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctacacattcgatcaaa |
3768 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0196 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:
Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23265 - 23177
Alignment:
| Q |
96 |
acaaaattaagatgatgtttttt-cttatcgaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctatacat |
183 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23265 |
acaaaattaagatgatatttttttcatatgaaatttaaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctatacat |
23177 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1424 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:
Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 642 - 459
Alignment:
| Q |
15 |
atactacaaataatttgtacaagtataataa-tccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaa---------tta |
104 |
Q |
| |
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| T |
642 |
atactacaaataattagtataagtataataaattcaaatacttcaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaatta |
543 |
T |
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| Q |
105 |
agatg--atgttttttcttatc------gaatttaaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatctata |
180 |
Q |
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| T |
542 |
agatgatatgtttttccatatcaaatttaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatctata |
459 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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