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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
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Alignment Overview

Query: NF15209_high_5 (Length: 252)

Name: NF15209_high_5
Description: NF15209
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15209_high_5
NF15209_high_5
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (1-240)||(10238599-10238840)
chr3 (1-240)||(49157212-49157452)
chr3 (1-236)||(11840112-11840349)
chr3 (1-236)||(42191607-42191844)
chr3 (1-240)||(10761037-10761277)
chr3 (1-240)||(38449450-38449690)
chr3 (1-198)||(17056178-17056377)
chr3 (1-198)||(42197549-42197748)
chr3 (1-199)||(49151186-49151385)
chr3 (1-198)||(10244721-10244920)
chr3 (1-198)||(10769356-10769554)
chr3 (1-198)||(26429804-26430003)
chr3 (16-240)||(24643890-24644118)
chr3 (1-199)||(55003788-55003988)
chr3 (1-198)||(23138803-23139001)
chr3 (1-198)||(30051487-30051685)
chr3 (1-198)||(38455937-38456135)
chr3 (1-198)||(8331362-8331560)
chr3 (1-185)||(28964468-28964653)
chr3 (1-199)||(17601920-17602120)
chr3 (3-198)||(53071640-53071828)
chr3 (1-198)||(11846363-11846562)
chr3 (91-199)||(9586490-9586598)
chr3 (61-198)||(8474582-8474721)
chr3 (17-198)||(34300012-34300197)
chr3 (3-192)||(12109054-12109246)
chr3 (25-198)||(2982634-2982812)
chr3 (1-100)||(46656353-46656453)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (1-236)||(25381922-25382159)
chr1 (1-236)||(31057581-31057817)
chr1 (1-198)||(50305771-50305970)
chr1 (1-198)||(1077818-1078017)
chr1 (1-198)||(31051119-31051317)
chr1 (1-191)||(25275433-25275625)
chr1 (1-199)||(34739560-34739759)
chr1 (1-198)||(25387891-25388088)
chr1 (1-198)||(8093232-8093431)
chr1 (1-180)||(44409593-44409773)
chr1 (4-198)||(27954735-27954933)
chr1 (33-240)||(24927188-24927396)
chr1 (17-198)||(38152358-38152541)
chr1 (112-239)||(12184095-12184223)
chr1 (58-200)||(33458354-33458494)
chr1 (17-198)||(24964108-24964289)
chr1 (53-138)||(4280169-4280254)
chr1 (1-69)||(12183998-12184069)
chr1 (4-52)||(23253859-23253907)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (1-240)||(28525772-28526012)
chr5 (1-240)||(32094608-32094849)
chr5 (1-240)||(12686565-12686816)
chr5 (1-236)||(41296816-41297052)
chr5 (1-198)||(12692667-12692866)
chr5 (1-198)||(28531868-28532066)
chr5 (1-199)||(32097409-32097608)
chr5 (4-199)||(7389937-7390133)
chr5 (3-236)||(30771818-30772053)
chr5 (3-240)||(19060159-19060400)
chr5 (3-198)||(20499712-20499909)
chr5 (19-199)||(14609706-14609888)
chr5 (41-198)||(30384812-30384969)
chr5 (36-233)||(26509397-26509589)
chr5 (22-198)||(19066516-19066693)
chr5 (58-143)||(8706831-8706916)
chr5 (57-197)||(33753668-33753815)
chr5 (84-190)||(25408435-25408539)
chr5 (55-133)||(26318684-26318762)
chr5 (55-197)||(33849297-33849446)
chr5 (55-138)||(22647928-22648012)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (1-240)||(32896544-32896785)
chr8 (4-236)||(14417498-14417731)
chr8 (1-240)||(39727671-39727913)
chr8 (1-236)||(22220114-22220349)
chr8 (1-198)||(36818546-36818745)
chr8 (1-200)||(32890460-32890661)
chr8 (1-238)||(10705373-10705611)
chr8 (1-198)||(42993386-42993585)
chr8 (1-198)||(42033372-42033570)
chr8 (1-240)||(5542547-5542788)
chr8 (1-198)||(10699604-10699802)
chr8 (1-198)||(39735925-39736122)
chr8 (1-198)||(9934857-9935056)
chr8 (1-199)||(1883229-1883424)
chr8 (4-218)||(17954060-17954278)
chr8 (183-234)||(45365340-45365391)
chr8 (58-115)||(30890535-30890593)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (1-240)||(35085066-35085307)
chr2 (1-236)||(13461576-13461813)
chr2 (1-236)||(28683331-28683567)
chr2 (1-238)||(35439757-35439995)
chr2 (1-199)||(13455672-13455872)
chr2 (1-198)||(36749988-36750187)
chr2 (1-198)||(35091039-35091238)
chr2 (1-198)||(31001951-31002149)
chr2 (1-200)||(30964900-30965100)
chr2 (4-198)||(13150079-13150274)
chr2 (1-198)||(44717192-44717390)
chr2 (1-183)||(35442219-35442402)
chr2 (17-196)||(19879170-19879353)
chr2 (1-142)||(31007985-31008127)
chr2 (41-204)||(23343132-23343296)
chr2 (26-149)||(7771596-7771722)
chr2 (62-194)||(23283821-23283955)
chr2 (135-198)||(11049014-11049078)
chr2 (144-247)||(25759612-25759716)
chr2 (155-234)||(8342727-8342806)
chr2 (17-100)||(29832878-29832964)
chr2 (177-234)||(29479309-29479366)
chr2 (162-198)||(7771717-7771753)
chr2 (17-50)||(11048955-11048988)
chr2 (4-107)||(28765248-28765352)
chr2 (17-69)||(16361738-16361789)
chr2 (135-198)||(28765174-28765238)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (4-240)||(48166711-48166948)
chr4 (1-234)||(26957190-26957424)
chr4 (1-236)||(10733736-10733972)
chr4 (1-236)||(10947505-10947741)
chr4 (4-198)||(48160534-48160729)
chr4 (1-198)||(24287561-24287760)
chr4 (5-233)||(50168134-50168364)
chr4 (3-198)||(26971943-26972139)
chr4 (1-199)||(10739723-10739922)
chr4 (1-199)||(10953492-10953691)
chr4 (1-198)||(6257591-6257789)
chr4 (60-233)||(17627221-17627395)
chr4 (96-198)||(33461797-33461899)
chr4 (96-198)||(33458672-33458774)
chr4 (1-150)||(44832001-44832151)
chr4 (3-200)||(49976174-49976371)
chr4 (3-150)||(35177413-35177567)
chr4 (61-138)||(50426882-50426959)
chr4 (129-198)||(532100-532170)
chr4 (20-133)||(4632015-4632128)
chr4 (73-129)||(19686777-19686833)
chr4 (116-196)||(19686851-19686936)
chr4 (3-69)||(28704237-28704303)
chr4 (19-77)||(50155657-50155718)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (1-240)||(3811555-3811797)
chr7 (1-236)||(351324-351560)
chr7 (1-240)||(35148395-35148636)
chr7 (1-191)||(28421345-28421537)
chr7 (1-198)||(3817697-3817895)
chr7 (1-200)||(35152915-35153115)
chr7 (1-228)||(26383212-26383442)
chr7 (1-199)||(338955-339154)
chr7 (4-198)||(5849106-5849300)
chr7 (4-198)||(5979565-5979762)
chr7 (1-192)||(22742316-22742508)
chr7 (72-198)||(43539567-43539696)
chr7 (42-130)||(26380751-26380838)
chr7 (35-186)||(8824397-8824547)
chr7 (17-132)||(18666883-18667006)
chr7 (3-97)||(18657039-18657132)
chr7 (58-123)||(30219519-30219584)
chr7 (135-198)||(18667726-18667790)
chr7 (109-192)||(7608022-7608112)
chr7 (3-42)||(24690652-24690691)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (1-240)||(8651190-8651430)
chr6 (1-236)||(21770951-21771187)
chr6 (1-198)||(4580708-4580907)
chr6 (4-198)||(25343201-25343395)
chr6 (24-236)||(17581140-17581356)
chr6 (1-186)||(25353799-25353984)
chr6 (4-240)||(21191259-21191497)
chr6 (20-196)||(6096887-6097067)
chr6 (19-198)||(30905983-30906166)
chr6 (1-200)||(21783712-21783912)
chr6 (1-198)||(31756605-31756796)
chr6 (1-199)||(21197427-21197627)
chr6 (161-240)||(32030014-32030093)
chr6 (3-198)||(12801928-12802124)
chr6 (159-236)||(13007211-13007289)
chr6 (61-161)||(1105925-1106025)
chr6 (166-198)||(32044505-32044537)
chr6 (112-198)||(30392921-30393008)
chr6 (1-50)||(21789935-21789982)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (1-240)||(11917-12168)
scaffold0208 (1-198)||(6096-6295)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (4-236)||(988-1221)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-198)||(1574-1772)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-233)||(13812-14046)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-198)||(173276-173475)
[»] scaffold1114 (1 HSPs)
scaffold1114 (61-198)||(637-775)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (4-198)||(5541-5739)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (3-198)||(38002-38198)
[»] scaffold0449 (1 HSPs)
scaffold0449 (116-166)||(1281-1331)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10238599 - 10238840
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
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10238599 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatca 10238698  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
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10238699 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 10238798  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
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10238799 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 10238840  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49157452 - 49157212
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
49157452 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa 49157356  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49157355 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 49157256  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49157255 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 49157212  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 11840112 - 11840349
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11840112 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 11840211  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
11840212 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 11840311  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
11840312 atctcctacttgggctacatatcttaataattatatca 11840349  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 42191607 - 42191844
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
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42191607 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 42191706  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
42191707 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca 42191806  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
42191807 atctcctacttgggctacatatcttaataattatatca 42191844  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10761037 - 10761277
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10761037 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 10761133  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10761134 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 10761233  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10761234 caatcttccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 10761277  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 38449450 - 38449690
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38449450 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 38449546  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
38449547 tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataaaaaaatattccaa 38449646  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38449647 caatccaccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 38449690  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17056178 - 17056377
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17056178 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 17056277  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
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17056278 attaaggctcacaattgataaatagataatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 17056377  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42197549 - 42197748
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
42197549 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 42197648  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
42197649 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca 42197748  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49151385 - 49151186
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
49151385 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa 49151289  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49151288 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 49151189  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10244721 - 10244920
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
10244721 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatca 10244820  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
10244821 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca 10244920  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10769356 - 10769554
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10769356 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 10769452  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10769453 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 10769552  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26429804 - 26430003
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
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26429804 cggacatccactcatgttgagcccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 26429903  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
26429904 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattagaatattattaaataataaaacattccaaca 26430003  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 24643890 - 24644118
Alignment:
16 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac 111  Q
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24643890 gttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagactcac 24643988  T
112 aattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttg 210  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
24643989 aattgataaataactaatgtaattattgttaggatatttgcccacataataatattggaatataataaaataataaaatattccaacaatctcccactta 24644088  T
211 ggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||    
24644089 gactacatatcttagtaattatatcagaat 24644118  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 55003788 - 55003988
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
55003788 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaataa 55003887  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
55003888 attaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 55003987  T
199 a 199  Q
    |    
55003988 a 55003988  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 23138803 - 23139001
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
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23138803 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa 23138899  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23138900 tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 23138999  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30051487 - 30051685
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
30051487 cggacatccactc--gttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatatctttattacttaatttgatcactaa 30051583  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30051584 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 30051683  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38455937 - 38456135
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
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38455937 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 38456033  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38456034 tcaactaacactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 38456133  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8331560 - 8331362
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
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8331560 cggacatccactcat--taagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatcttatatccttattacttaatttgatcactaa 8331464  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8331463 tcaactaaggtccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 8331364  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28964653 - 28964468
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
28964653 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaataactttattacttaatttgatcactaa 28964557  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataata 185  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28964556 tcaactaaggctcacaatttataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataata 28964468  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 17601920 - 17602120
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
17601920 cggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaccactaatca 17602019  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||  || ||||||| | |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||    
17602020 attaaggctctaaattgataaataactaatataattattactatgatatttacgcacatagtgatatttgaatattattaaataataaaatatttcaaca 17602119  T
199 a 199  Q
    |    
17602120 a 17602120  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071828
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
53071640 gacatccactcat--tgagttcatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 53071736  T
99 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
53071737 aactaaggctcacaattgataaataactaatataattattgttatgatatttgccc--------atattgaaatataataaataataaaatattccaaca 53071828  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11846363 - 11846562
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcacta 95  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
11846363 cggacatccactcat--tgactcaatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaattagccttattacttaatttgatcacta 11846459  T
96 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattcc 194  Q
    ||| | |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
11846460 atccattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgata-tggaatattattaaataataaaatattcc 11846558  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 9586490 - 9586598
Alignment:
91 cactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaata 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
9586490 cactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaata 9586589  T
191 ttccaacaa 199  Q
    |||||||||    
9586590 ttccaacaa 9586598  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 8474582 - 8474721
Alignment:
61 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaa-ggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacata 159  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||   ||||||    
8474582 aaatctaataacattattacttaatttgatcactaatcaattaaaggcccacaattgattaaaagttaatataattattattacgatatttgttcacata 8474681  T
160 atgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
8474682 atgatatcgaaatataattaaataataaaatattcaaaca 8474721  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300012
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 112  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    |||||||||||||  || |||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||  | ||||    
34300197 ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-taaaaatttaatagtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcaca 34300099  T
113 attgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||    
34300098 attgataaatagttaatataattattattatgatgtttgcccacgtaatgatatcgaaaaataataaaataataaaatatttcaaca 34300012  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Original strand, 12109054 - 12109246
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||    ||| ||||||| ||  |||||| || ||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
12109054 gacatcaactcatattgagtccatatcaattaatcaaatgtttaatcaattatctaat-tagaaa-cttataacattatcacttaattttatcactaatc 12109151  T
99 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatatt 192  Q
    || ||| |  ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||    
12109152 aattaaagatcacaattgataaataactaatacaattattattacgatatttactcacataataatattataatataataaaataataaaatatt 12109246  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Original strand, 2982634 - 2982812
Alignment:
25 atatcaactaattaaataattaatta---tccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataa 120  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |   || ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||    
2982634 atatcaactaattaaatatttaattaatttttcaattagaaatctaaatatctttattatttaatttgatcactaatcaaataaggctcgctattgataa 2982733  T
121 atagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||| | |||||| |||| |||| ||||||   | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
2982734 atagattatataattattattacaatatttgttcgcataatgatatcgaaatataattaaataataaaatataccaaca 2982812  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 46656453 - 46656353
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
46656453 cggacatccactcatc--gagtacatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaa 46656357  T
97 tcaa 100  Q
    ||||    
46656356 tcaa 46656353  T

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Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 25381922 - 25382159
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25381922 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 25382021  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
25382022 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 25382121  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25382122 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 25382159  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31057817 - 31057581
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31057817 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 31057721  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31057720 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 31057621  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
31057620 caatctcccacttgagctacatatcttaataattatatca 31057581  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50305970 - 50305771
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
50305970 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 50305871  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
50305870 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 50305771  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1078017 - 1077818
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
1078017 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatca 1077918  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
1077917 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 1077818  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31051317 - 31051119
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31051317 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 31051221  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31051220 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 31051121  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 25275433 - 25275625
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25275433 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 25275532  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatat 191  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
25275533 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatat 25275625  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34739759 - 34739560
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 97  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34739759 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 34739662  T
98 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac 197  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
34739661 caactaaggccctcaatttataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac 34739562  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25387891 - 25388088
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25387891 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 25387988  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
25387989 attaaggctcacaattgataaataaataatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaattaataaaatattccaaca 25388088  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8093232 - 8093431
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
8093232 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaacatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgattattaa 8093328  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattcca 195  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
8093329 tcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattgttacggcatttgcccggataatgatattggaatataattaaataataaaatattcca 8093428  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44409773 - 44409593
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
44409773 cggacatccactcat--tgagtccatattaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaacctaatagccttattacctaatttaatcactaa 44409677  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaa 180  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
44409676 tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaa 44409593  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27954933 - 27954735
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27954933 acatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatc-aaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 27954835  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||    
27954834 attaagcctcacaattgataaataactaatataattagtattacgatttttgcccacgtaatgatatcagaatataattaaataataaaatatttcaaca 27954735  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Original strand, 24927188 - 24927396
Alignment:
33 taattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatat 131  Q
    ||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||    
24927188 taattaattaattaat-attctaaatagaaatcttataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaatagctaatat 24927286  T
132 aactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataatt 230  Q
    || |||| |   ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24927287 aattattatagagatatttgcccacataatgtcattggaatataattaaatattaaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataatt 24927386  T
231 atatcagaat 240  Q
    |||| |||||    
24927387 atataagaat 24927396  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 38152358 - 38152541
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
38152358 ttgagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca 38152456  T
113 attgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
38152457 attgataaataattaatataattattgttacaatatttgtcc-gataatgatattgaaatataataaagaataaaatatttcaaca 38152541  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 239
Target Start/End: Original strand, 12184095 - 12184223
Alignment:
112 aattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttg 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
12184095 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaacaatcttccacttg 12184194  T
211 ggctacatatcttaataattatatcagaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
12184195 ggctacatatcttaataattataccagaa 12184223  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 200
Target Start/End: Original strand, 33458354 - 33458494
Alignment:
58 tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccaca 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||   ||| |||||||  |||||    
33458354 tagaaatctaatagcattattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataacta---ttatgatatttgtccaca 33458450  T
158 taatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaat 200  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
33458451 tactgatatcagaatataattaaataataaaatattccaacaat 33458494  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 24964108 - 24964289
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 115  Q
    |||||| |||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||    
24964108 ttgagttcatatccattaattaattaattaat-attctaaatagaaatcttataagctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaatt 24964206  T
116 gataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| |||| |   ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
24964207 gataaatagctaatataattattatagagatatttacccacataatatcattggaatataattaatattaaaacattccaaca 24964289  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Original strand, 4280169 - 4280254
Alignment:
53 caaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactatt 138  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
4280169 caaattagatatctaataatcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagttaatataattatt 4280254  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 12183998 - 12184069
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaat 69  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
12183998 cggacatctactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aaatagaaatctaat 12184069  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23253907 - 23253859
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatc 52  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
23253907 acatctactcatatcgagtccatatcaattaattaattaattaattatc 23253859  T

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Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28525772 - 28526012
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
28525772 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa 28525868  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28525869 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 28525968  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28525969 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 28526012  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 32094608 - 32094849
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
32094608 cggacatacactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 32094707  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
32094708 attaaggctcacaattgataaatagttaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 32094807  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32094808 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 32094849  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12686565 - 12686816
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12686565 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 12686664  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatat-----aataa------ataataaaa 188  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||      |||||||||    
12686665 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatataataaaa 12686764  T
189 tattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
12686765 tattccaacaatctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat 12686816  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41297052 - 41296816
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
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41297052 cggacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 41296956  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
41296955 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgtaatataataaaatataaaatattccaa 41296856  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41296855 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 41296816  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 12692667 - 12692866
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12692667 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 12692766  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
12692767 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 12692866  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28531868 - 28532066
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
28531868 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa 28531964  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28531965 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 28532064  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 32097409 - 32097608
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||    
32097409 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagcttattatttaatttgatcactaaccaa 32097508  T
101 ctaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaacaa 199  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
32097509 ttaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaacaa 32097608  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Original strand, 7389937 - 7390133
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7389937 acatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 7390033  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7390034 actaagactcacaattgataaatagctaatataattatcgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 7390133  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30772053 - 30771818
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
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30772053 gacatccactcatattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaata-agaaactttatagccttattacttaatttgatcactaatc 30771955  T
99 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaat--aataaaatattccaa 196  Q
    || |||||| ||||| ||||||   |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||    
30771954 aattaaggctcacaactgataa---gctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatatagtaaaacaaataaaatattccaa 30771858  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
30771857 caatctctcacttgggctacatatcttaataattatatca 30771818  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 19060159 - 19060400
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta---tccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
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19060159 gacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatc 19060258  T
99 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac 197  Q
    || |||| | |  |||||| ||||||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||||||  |||| |||| || |||||| ||||||||| ||||    
19060259 aattaagtctccaaattgacaaatagctaatataattattatggagatatttgcccacataatgtcattgaaatagaattaaatattaaaatatttcaac 19060358  T
198 aatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19060359 aa-ctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 19060400  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20499909 - 20499712
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
20499909 gacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatcttac-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatc 20499813  T
99 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac 197  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
20499812 aattaagactcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgtccatataatgatgttgaaatataattaaataataaaatattccaac 20499713  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609706
Alignment:
19 gagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 114  Q
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14609888 gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttac-tagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaat 14609790  T
115 tgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 199  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
14609789 tgataagtaactaatataattattattacgatatttgcacacataatgatattggaatat-ttaaataataaaatattccaacaa 14609706  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 198
Target Start/End: Original strand, 30384812 - 30384969
Alignment:
41 taattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgt 140  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |    
30384812 taattaattatctaat-tagaaatccaatagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcacaactgataaatagctaatataattattat 30384910  T
141 tacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
30384911 tacaatatttgtccacataatgatatcggaatataataaaataataaaatattccaaca 30384969  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26509589 - 26509397
Alignment:
36 ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataac 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| |     ||||| |  ||||||||||||| ||||||||     
26509589 ttaaataattaattatccaaa-tagaaatctaatcattcttgttacttaatttgatcactatt-----aaggctccaaattgataaatagttaatataat 26509496  T
135 tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaa-taataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattata 233  Q
    ||||   | ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
26509495 tattacaa-gatatttgcccacttaatgacaatggaatataataaaataataaaatattccaacaatctcctacttgtgctacttatcttaataattata 26509397  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 19066516 - 19066693
Alignment:
22 tccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataa 120  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| || | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||| ||    
19066516 tccatatccattaattaatcaattaat-attctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaaggctccagattgacaa 19066614  T
121 atagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||  |||||||| |||| |   ||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
19066615 ataattaatataattattatggagatatttgcccacataatattatgggaatataattaaatattaaaatattccaaca 19066693  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 143
Target Start/End: Original strand, 8706831 - 8706916
Alignment:
58 tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttac 143  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
8706831 tagaaatttaatcgtcttatcacttaatttgatcactaatcaattaagacccacagttgataaatagctaatataattattattac 8706916  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 197
Target Start/End: Original strand, 33753668 - 33753815
Alignment:
57 atagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatc-----aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattt 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||     || ||| || |  |||||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||    
33753668 atagaaatctaatcaaacttattacttagtttgatcactaatctaatcaattaaagctccaaattgataaatagctaatataattatgataataatattt 33753767  T
151 tcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac 197  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
33753768 acccacataatgatattgaaatataattaaataataaaataatccaac 33753815  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Original strand, 25408435 - 25408539
Alignment:
84 atttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaata 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    |||||| || | |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||||    
25408435 atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata---tatataattacttttacgatatttgtccacataatgatatcgaaatattattaaata 25408531  T
183 ataaaata 190  Q
    ||||||||    
25408532 ataaaata 25408539  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 133
Target Start/End: Original strand, 26318684 - 26318762
Alignment:
55 aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa 133  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| ||| |||||||||    
26318684 aaataaaaatctaatatctttattaattaatttaatcactaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataa 26318762  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 197
Target Start/End: Original strand, 33849297 - 33849446
Alignment:
55 aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatc-----aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatat 148  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||     || ||| || |  |||| ||||||||||||||||| |||  | |  ||||    
33849297 aaatagaaatctaatcaaacttattacttagtttgatcactaatctaatcaattaaagctccaaattaataaatagctaatataattatgataaaaatat 33849396  T
149 tttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac 197  Q
    || |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
33849397 ttacccatatagtgatattgaaatataattaaataataaaataatccaac 33849446  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 22647928 - 22648012
Alignment:
55 aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactatt 138  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| | |  |||| |||||||  |||||||| ||||    
22647928 aaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataattaatataattatt 22648012  T

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Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32896785 - 32896544
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
32896785 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 32896686  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
32896685 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca 32896586  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
32896585 atctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat 32896544  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14417731 - 14417498
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14417731 acatccactcat--tgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 14417635  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
14417634 actaagactcacaattgataaataactaatataattattattacgatattttcccacataatgatattggtatataataaataataaaatattccaacaa 14417535  T
200 tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14417534 tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 14417498  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39727671 - 39727913
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
39727671 cggacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatttaatagccttattacttaatttgatcactaa 39727767  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39727768 tcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 39727867  T
197 caatctccca--cttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
39727868 caatctcccacgcatgggctacatatcttaataattatatcagaat 39727913  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22220114 - 22220349
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
22220114 cggacatccattcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatacccttattacttaatttgatcactaa 22220210  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
22220211 tcaactaaggcttacgattgataaatagctaatataactattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataat-agtaataaaatattccaa 22220309  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22220310 caatctcccacttgggctacacatcttaataattatatca 22220349  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36818745 - 36818546
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
36818745 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattaaccttattacttaatttgatcactaatca 36818646  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
36818645 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 36818546  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32890661 - 32890460
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
32890661 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 32890562  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
32890561 attaagggtcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca 32890462  T
199 at 200  Q
    ||    
32890461 at 32890460  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10705611 - 10705373
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
10705611 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaat-tagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaa 10705515  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
10705514 tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattcgcccacaaaatgatattggaatataataaataacaaactattccaa 10705415  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcaga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
10705414 caatctcccacttggactacatatcttaataattataccaga 10705373  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42993386 - 42993585
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
42993386 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 42993485  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
42993486 attaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccatataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca 42993585  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42033570 - 42033372
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
42033570 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaat-tagaaatctaataaccttattacttaatttgatcactaa 42033474  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
42033473 tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttacccgcataatgatattgaaatataataaataataaaatattccaa 42033374  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5542547 - 5542788
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
5542547 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaa 5542644  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattcca 195  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
5542645 tcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgata-tagaatattattaaataataaaatattcca 5542743  T
196 acaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
5542744 acaatctcccacttgggcgacatatcttaataattataccagaat 5542788  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10699802 - 10699604
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
10699802 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagcctaattacttaatttgatcactaa 10699706  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
10699705 tcaattaaggctcacaattgataaataactagtataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataagctattccaa 10699606  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39735925 - 39736122
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39735925 cggacatccactgat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 39736021  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
39736022 tcaactaatgctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataataata-tggaatataataaataataaaatattccaa 39736120  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9935056 - 9934857
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
9935056 cggatatccactcatgttgagtccatatcaataaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagctttattacttaatttgatcactaatca 9934957  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
9934956 attaagactcacaattgataaataactaatataattattattacaatatttacccacataatcatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca 9934857  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 1883229 - 1883424
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||     || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1883229 cggacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaat-----attctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatca 1883323  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
1883324 agtaaggctccaaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccgcataatattattggaatataattaaataataaaatattccaaca 1883423  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17954278 - 17954060
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattactt----aatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||    ||| |||||||||||||    
17954278 acatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaattaattaaa-tagaaatctaataggcttattactttagtaatctgatcactaatca 17954180  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||| | |  |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||    
17954179 attaagtctccaaattgataaatagctaatataattattataaagatattttcccacaaaatgacattgaaatataattaaaaaataaaacattccatca 17954080  T
199 atctcccacttgggctacat 218  Q
    || ||||||||||| |||||    
17954079 atttcccacttgggttacat 17954060  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45365391 - 45365340
Alignment:
183 ataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatat 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||||    
45365391 ataaaatattccaacaatctctcactttagttacatatctttataattatat 45365340  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 30890535 - 30890593
Alignment:
58 tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 115  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
30890535 tagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt 30890593  T

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Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35085066 - 35085307
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35085066 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 35085165  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
35085166 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca 35085265  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
35085266 atctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat 35085307  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13461813 - 13461576
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
13461813 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 13461714  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
13461713 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca 13461614  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
13461613 atctcctacttgggctacatatcttaataattatatca 13461576  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 28683331 - 28683567
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28683331 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 28683427  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
28683428 tcaactaaggcccacaattgataaataactaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattaagatataataaataataaaatattccaa 28683527  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28683528 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 28683567  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 35439757 - 35439995
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35439757 cggacatccactcat--taagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 35439853  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35439854 tcaatcaaggctcacaattgataaataacgaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 35439953  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcaga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35439954 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcaga 35439995  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13455872 - 13455672
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
13455872 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 13455773  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
13455772 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca 13455673  T
199 a 199  Q
    |    
13455672 a 13455672  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36750187 - 36749988
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
36750187 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 36750088  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
36750087 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 36749988  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35091039 - 35091238
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35091039 cggacatccactcatgttgagtctatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 35091138  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
35091139 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttacccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca 35091238  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31002149 - 31001951
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31002149 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 31002053  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31002052 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 31001953  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30965100 - 30964900
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
30965100 cggacatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa 30965004  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30965003 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 30964904  T
197 caat 200  Q
    ||||    
30964903 caat 30964900  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 13150079 - 13150274
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13150079 acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcaataatca 13150175  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
13150176 actaatgcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattgaaatataataaataataaaatattccaaca 13150274  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44717192 - 44717390
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
44717192 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattatatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 44717288  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
44717289 tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatgtgcccacataatgatattggaatataataaatcataaaatattccaa 44717388  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 35442219 - 35442402
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35442219 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 35442315  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataa 183  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
35442316 tcaatcaaggctcacaattgataaatagcgaatataattattgttacgatatttacccacataatgatattggaatataataaataa 35442402  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19879353 - 19879170
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa 113  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
19879353 ttgagtcaatatcaattaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaa 19879254  T
114 ttgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaa 196  Q
    || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
19879253 ttaataaatagctaatatagttattattacgatattttcccacataatgatattggaatataataaaatattaaaatattccaa 19879170  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31008127 - 31007985
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31008127 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 31008031  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgtta 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31008030 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta 31007985  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23343296 - 23343132
Alignment:
41 taattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattg 139  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||     
23343296 taattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattgataaatagttaatataattatta 23343197  T
140 ttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcc 204  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
23343196 ttatgatatttgtccacataatgatattagaatataataaaataataaaatattcc-acaatctcc 23343132  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 7771596 - 7771722
Alignment:
26 tatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaa 121  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||    
7771596 tatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaa 7771694  T
122 tagctaatataactattgttacgatatt 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
7771695 tagctaatataattattgttacgatatt 7771722  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23283955 - 23283821
Alignment:
62 aatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataa 160  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||    
23283955 aatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccacataa 23283856  T
161 tgatattggaatataat-aaataataaaatattcc 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
23283855 tgatattgaaatataataaaataataaaatattcc 23283821  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Original strand, 11049014 - 11049078
Alignment:
135 tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
11049014 tattattacgatatttgcccacataataatattggaatataattaaataataaaatattccaaca 11049078  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 247
Target Start/End: Original strand, 25759612 - 25759716
Alignment:
144 gatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaataa 242  Q
    |||||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | |    
25759612 gatatttttccacataataacattgaaatataattaaataataaatcattccggcaatctcccacttggactacatatcataacaattatatcagagtta 25759711  T
243 tctag 247  Q
    |||||    
25759712 tctag 25759716  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Original strand, 8342727 - 8342806
Alignment:
155 acataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatat 234  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||    
8342727 acataataatattgaaatataatatttaataaaatattccaacaatctcccacttgagaaacatatcttgctaattatat 8342806  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29832964 - 29832878
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
29832964 ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-taaaagtctaatagtcttattacttaattttatcactaatcaa 29832878  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 29479309 - 29479366
Alignment:
177 taaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatat 234  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
29479309 taaataataaatcattccagcaatctcccacttggactacatatcgtaacaattatat 29479366  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 7771717 - 7771753
Alignment:
162 gatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
7771717 gatattggaatataataaatagtaaaatattccaaca 7771753  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 11048955 - 11048988
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
11048955 ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 11048988  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28765352 - 28765248
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataa-ttaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaac 101  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||| || | ||||||||||||| || |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||     
28765352 acattcactcatatcgagttcatatcaattatttatattagttaattatccaaa-taaaaatataattagccttatcatttaatttgatcactaatcaat 28765254  T
102 taaggc 107  Q
    ||||||    
28765253 taaggc 28765248  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16361789 - 16361738
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat 69  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
16361789 ttgagttcatatcaattaattatataattaattat-ctaaatagaaatctaat 16361738  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28765238 - 28765174
Alignment:
135 tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
28765238 tattattactatatttacccatataatgatatcagaatataattaaataatcaaatattccaaca 28765174  T

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Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48166948 - 48166711
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48166948 acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 48166852  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48166851 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 48166752  T
200 tctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48166751 tctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 48166711  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 26957190 - 26957424
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
26957190 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa 26957286  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26957287 ttaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 26957386  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26957387 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatat 26957424  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10733736 - 10733972
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10733736 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 10733832  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
10733833 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa 10733932  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10733933 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 10733972  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10947505 - 10947741
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10947505 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 10947601  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
10947602 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa 10947701  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10947702 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 10947741  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48160729 - 48160534
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48160729 acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 48160633  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
48160632 actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 48160534  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24287760 - 24287561
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
24287760 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 24287661  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
24287660 attaaggctcacaatttataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca 24287561  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50168364 - 50168134
Alignment:
5 catccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa 100  Q
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50168364 catccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttgttacttgatttgaccactaatcaa 50168268  T
101 ctaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaa 199  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
50168267 ttaagactcacaattgataaatagctaatataattattattacgatattttccgacgtaatgttattggaatataattaaataataaaatattccaacaa 50168168  T
200 tctcccacttgggctacatatcttaataattata 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
50168167 tctcccacttgggctacatatcttaataattata 50168134  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 26971943 - 26972139
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
26971943 gacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatatccttatcacttaatttgatcactaatc 26972039  T
99 aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26972040 aattaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacaatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 26972139  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 10739723 - 10739922
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10739723 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatc-agaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 10739819  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
10739820 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa 10739919  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 10953492 - 10953691
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10953492 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatc-agaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 10953588  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
10953589 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa 10953688  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6257591 - 6257789
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
6257591 cggatatccactcat--tgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaa 6257687  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
6257688 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa 6257787  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 17627221 - 17627395
Alignment:
60 gaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacata 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
17627221 gaaatctaataggcttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgataaatagctaatataattattattacgatattttcccacata 17627320  T
160 atgatattggaata-taataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattata 233  Q
    ||||||| | |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
17627321 atgatatcgaaatattattaaataataaaatatttcaacaatctcccacttggactccatatcttaataattata 17627395  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 33461797 - 33461899
Alignment:
96 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattcca 195  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33461797 atcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgataattgcccacataaagatattggaatataataaataataaaatattcca 33461896  T
196 aca 198  Q
    |||    
33461897 aca 33461899  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 33458672 - 33458774
Alignment:
96 atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattcca 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
33458672 atcaactaaggctcacaattgataaatagttaatataattattgttacgataattgcccacataaggatattggaatataataaataataaaatattcca 33458771  T
196 aca 198  Q
    |||    
33458772 aca 33458774  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 44832001 - 44832151
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||  || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
44832001 cggacatgcactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaat-taaaaatcttataaccttattacttaatttgatcactaa 44832097  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattt 150  Q
    |||||||||  | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
44832098 tcaactaagatctataattgataaataactaatataattattgttacaatattt 44832151  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49976371 - 49976174
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaac 101  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
49976371 gacatccacccatattgaatccatatccattaattaattaattaat-attctaaacaaaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaat 49976273  T
102 taaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaat 200  Q
    |||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||| |   |||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
49976272 taaggctccaaattaataaatagctaatataattattatagagata-ttgcccacataatgtcattgaaatataattaaatattaaaatattcaaacaat 49976174  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35177567 - 35177413
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaa----ttatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc 98  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||    ||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
35177567 gacatacactcgtattgagtccatgtcaacaaattaaatatttaaataattatctaat-tagaaaactaacagccttattacttaatttgatcactaatc 35177469  T
99 aactaaggc----ccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattt 150  Q
    || ||| ||     || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
35177468 aattaatgctcgttcataattgataaatatctaatataattattattacgatattt 35177413  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50426959 - 50426882
Alignment:
61 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactatt 138  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
50426959 aaatttaataactttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataattatt 50426882  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 532100 - 532170
Alignment:
129 tataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
532100 tataattattattacgatatttgcctacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 532170  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4632128 - 4632015
Alignment:
20 agtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaatag-ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat 118  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    |||||||    
4632128 agtccatatccactaattaattaattaatactctaag-tagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaattaagacttcaaattgat 4632030  T
119 aaatagctaatataa 133  Q
    ||||| |||||||||    
4632029 aaataactaatataa 4632015  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 19686777 - 19686833
Alignment:
73 cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaat 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||    
19686777 cttattatttaatttgatcactaatcaattaagacacacaatcgataaatagctaat 19686833  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 19686851 - 19686936
Alignment:
116 gataaatagctaat---ataactattgttacgatattttcccac-ataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||    
19686851 gataaatagctaattatataattattattacgatatttgcccacaataatgatatcgaaatataattaaataataaaatactccaa 19686936  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28704303 - 28704237
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaat 69  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
28704303 gacatccactcatattgagttcatatcagttaattaaaataattaattatcc-aaataaaaatctaat 28704237  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 50155718 - 50155657
Alignment:
19 gagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaatagccttat 77  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
50155718 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattaaaaatctaatagccttat 50155657  T

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Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3811555 - 3811797
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3811555 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 3811651  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatg--atattggaatataataaataataaaatattcc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
3811652 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatattggaatataataaataataaaatattcc 3811751  T
195 aacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3811752 aacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 3811797  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 351560 - 351324
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 97  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
351560 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 351463  T
98 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac 197  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
351462 caactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac 351363  T
198 aatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
351362 aatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 351324  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35148395 - 35148636
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35148395 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatccaatagccttattacttaatttgatcactaa 35148491  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttccc-acataatgatattggaatataataaataataaaatattcca 195  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
35148492 tcaactaaggctcataattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgccccacataatgatattagaatataataaataataaaatattcca 35148591  T
196 acaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
35148592 acaatctcccacttgggctacatatcttaataattatataagaat 35148636  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28421345 - 28421537
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
28421345 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 28421444  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatat 191  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
28421445 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatat 28421537  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3817697 - 3817895
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3817697 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttcatcactaa 3817793  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
3817794 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcctacataatgatattgaaatataataaataataaaatattccaa 3817893  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 35152915 - 35153115
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35152915 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatcgaatagccttattacttaatttgatcactaa 35153011  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
35153012 tcaactaaggctcacaattgataaatatctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgacattggaatataataaataataaaatattccaa 35153111  T
197 caat 200  Q
    ||||    
35153112 caat 35153115  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26383442 - 26383212
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26383442 cggacatccactcat--tgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 26383346  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat--aaataataaaatattcc 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
26383345 tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattatgatatttgcccacaaaatgatattgaaatataattaaaataataaaatattcc 26383246  T
195 aacaatctcccacttgggctacatatcttaataa 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
26383245 aacaatctcccacttgggctacatatctcaataa 26383212  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 339154 - 338955
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 97  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
339154 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat 339057  T
98 caactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac 197  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
339056 caactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccacataatgatattgaaatataagaaataataaaatattccaac 338957  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5849300 - 5849106
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5849300 acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 5849204  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
5849203 actaaggctcacaattgataaataactaatataattattgttacgatatttacccacataatgatattagaatataat-aataataaaatattccaaca 5849106  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 5979565 - 5979762
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaact 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5979565 acatccatccatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaatt 5979664  T
103 aa-ggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    || ||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
5979665 aagggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca 5979762  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 22742316 - 22742508
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
22742316 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactacttatatatttaattaattatctaat-tagaaatctaatagccttattacttaattttatcactaa 22742412  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatatt 192  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22742413 tcaactaaggctcacagttgataaataactaatataattattgttacggtatttgcctacataataatattggaatataataaataataaaatatt 22742508  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43539696 - 43539567
Alignment:
72 ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaa 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
43539696 ccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaaatgataaataattaatataattatttttacgatatttgcacacataatgatattggaa 43539597  T
172 tataa---taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||   |||||||||||| |||||||||    
43539596 tataaaattaaataataaaacattccaaca 43539567  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26380838 - 26380751
Alignment:
42 aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata 130  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
26380838 aattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaata 26380751  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8824547 - 8824397
Alignment:
35 attaaataattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataac 134  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||     
8824547 attaattaattaattatctaaaa--gaaatctaatatccttattacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataat 8824450  T
135 tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataa 186  Q
    |||| | | ||||||| || ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
8824449 tattataaagatatttgcctacataatgacattaaaatataattaaataataa 8824397  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Original strand, 18666883 - 18667006
Alignment:
17 ttgagtccatatcaactaattaaa----taattaat---tatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa--ctaaggc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||   ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||    
18666883 ttgagtccatatcaactaattaaaaatttaattaataactatacaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacttatcaattataaggc 18666981  T
108 ccacaattgataaatagctaatata 132  Q
     |||  |||||||||| ||||||||    
18666982 tcacggttgataaataactaatata 18667006  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 18657039 - 18657132
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat 97  Q
    |||||||||||||   |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
18657039 gacatccactcata--gagtccatattaattaatttaaataattaattatccaaa-taaaaatctaattagccttattacttaatgtgatcactaat 18657132  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 123
Target Start/End: Original strand, 30219519 - 30219584
Alignment:
58 tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaata 123  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
30219519 tagaaatctaataactttataacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaata 30219584  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Original strand, 18667726 - 18667790
Alignment:
135 tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
18667726 tattattacgatatttgcacacacaatgatattggaatataattaaataataaaatattccaaca 18667790  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7608112 - 7608022
Alignment:
109 cacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataat------gatattggaatataa-taaataataaaatatt 192  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
7608112 cacaattgataaataactgatataattattattatgatatttgcccatataataataatgatattggaatataattaaataataaaatatt 7608022  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 24690691 - 24690652
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 42  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
24690691 gacatccactcatattgagtccatattaactaattaaata 24690652  T

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Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 8651190 - 8651430
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
8651190 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa 8651286  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8651287 tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 8651386  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8651387 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 8651430  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21770951 - 21771187
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
21770951 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaat-tagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaa 21771047  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21771048 tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 21771147  T
197 caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21771148 caatctctcacttgggctacatatcttaataattatatca 21771187  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4580708 - 4580907
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
4580708 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 4580807  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
4580808 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaattaataaaatattccaaca 4580907  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25343395 - 25343201
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaact 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
25343395 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata--aatctaattagccttattacttaatttaatcactaatcaatt 25343298  T
103 aaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
25343297 aaggttcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 25343201  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17581356 - 17581140
Alignment:
24 catatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgata 119  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
17581356 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaccataatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgata 17581258  T
120 aatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacat 218  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17581257 aatagttaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataattaaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacat 17581158  T
219 atcttaataattatatca 236  Q
    ||||||||||||||||||    
17581157 atcttaataattatatca 17581140  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25353984 - 25353799
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
25353984 cggatatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata--aatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 25353887  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataa 186  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
25353886 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataa 25353799  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 21191259 - 21191497
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
21191259 acatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccatattacttaatttgatcactaatca 21191356  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
21191357 attaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgata-tggaatattattaaataataaaatattccaaca 21191455  T
199 atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21191456 atcttccacttgggctacatatcttaataattataccagaat 21191497  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096887
Alignment:
20 agtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||    
6097067 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaatagccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaatt 6096968  T
116 gataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    || |||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6096967 gacaaataagtaatataattattgttactatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 6096887  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 30905983 - 30906166
Alignment:
19 gagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
30905983 gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattactttatttggttactaatcaactaaggctcacaat 30906081  T
115 tgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
30906082 tgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatataataaaataataaaatattccaaca 30906166  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21783712 - 21783912
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
21783712 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatttaatagttttattacttaatttgatcactaa 21783808  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    || |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
21783809 tccactaagactcacaattgataaatagttaatataattattattacgatatttacccacataataatattagaatataataaataattaaatattctaa 21783908  T
197 caat 200  Q
    ||||    
21783909 caat 21783912  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 31756605 - 31756796
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31756605 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 31756701  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||       ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
31756702 tcaactaagacccacaattgata-------aatataattattgttacaatatttatccacataataatattgaaatataataaataataaaatattcgaa 31756794  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 21197427 - 21197627
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
21197427 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa 21197524  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattcca 195  Q
    |||  |||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||    
21197525 tcagttaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttacccacataatgata-tggaatattattaaataaaaaaatattcca 21197623  T
196 acaa 199  Q
    ||||    
21197624 acaa 21197627  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 240
Target Start/End: Original strand, 32030014 - 32030093
Alignment:
161 tgatattggaatataataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32030014 tgatattggaatataataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 32030093  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 12801928 - 12802124
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaac 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||     
12801928 gacatccactcatattgagtccaaatccattaaataattaattaat-attctaaatagaaatctaataagctttattacttaaattgatcactaatcaat 12802026  T
102 taaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||| |   ||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
12802027 taaggctccaaattgacaaatagctaatataattattatagagatatttgcccacgtaatgtcattggaatataattaaatattaaaatattccaaca 12802124  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 159 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13007289 - 13007211
Alignment:
159 aatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
13007289 aatgacattggaatataatgaaataataaaatattttaacaatctctcacttgggctacatatcttaataattacatca 13007211  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1106025 - 1105925
Alignment:
61 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataa 160  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |  |||||||||||||| | ||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||    
1106025 aaatttaatagccttatcatttaatttgaacactaatcaaataaaacttacaattgataaatatcaaatataattattactaccatatttgcccacataa 1105926  T
161 t 161  Q
    |    
1105925 t 1105925  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 198
Target Start/End: Original strand, 32044505 - 32044537
Alignment:
166 ttggaatataataaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
32044505 ttggaatataataaataataaaatattccaaca 32044537  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30393008 - 30392921
Alignment:
112 aattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca 198  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||    |  |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
30393008 aattgataaatagttaatataattatgagaaatatattttctcacataatgacattgaaatataattaaataacaaaatattccaaca 30392921  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 21789935 - 21789982
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 50  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
21789935 cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaatta 21789982  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12168 - 11917
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12168 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 12069  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatat-----aataa------ataataaaa 188  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||      |||||||||    
12068 attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatataataaaa 11969  T
189 tattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
11968 tattccaacaatctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat 11917  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6295 - 6096
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
6295 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca 6196  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca 198  Q
    | ||||||    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
6195 attaaggctttaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca 6096  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 988 - 1221
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
988 acatccactcat--tgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 1084  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
1085 actaagactcacaattgataaataactaatataattattattacgatattttcccacataatgatattggtatataataaataataaaatattccaacaa 1184  T
200 tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1185 tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca 1221  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1574 - 1772
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1574 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 1670  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
1671 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttacccacataataatattgaaatataataaataataaaatatttcaa 1770  T

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Target: scaffold0064 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14046 - 13812
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
14046 cggacatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tacaaatctaatagaattattacttaatttgatcactag 13950  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattcca 195  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13949 tcaattaaggctcacgattgataaatagctaatataattattattactatattttcccacataatgatattggaatataattaaataataaaatattcca 13850  T
196 acaatctcccacttgggctacatatcttaataattata 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
13849 acaatcccccacttgggctacatatcttaataattata 13812  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 173276 - 173475
Alignment:
1 cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 96  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
173276 cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa 173372  T
97 tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattcca 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
173373 tcaactaagacccacaattgataaatcgctaatataattattattacgatatttgcccacataataatattggaatataataaaataataaaatattcca 173472  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 637
Alignment:
61 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
775 aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaataactaatataattattattatgatattttcccacataa 676  T
161 tgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
675 tgatattggaatataattaaataataaaatattccaaca 637  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5541
Alignment:
4 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
5739 acatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcgaat-tagaaatctaatagtcatattacttaatttgatcactaatca 5641  T
100 actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca 198  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||| || ||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
5640 attaaggctcacaattgataaataactaatataattattatagcgatatttgcctacaaaatgatttcggaatataattaaataattaaatattccaaca 5541  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38198 - 38002
Alignment:
3 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa--tagccttattacttaatttgatcactaatcaa 100  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||| ||||    
38198 gacatccac-catattaagtccatatcaattaattaaataattaattattc-gaatagaaatctaaattaaccttgttacttaatttgatcactattcaa 38101  T
101 ctaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatat-aataaataataaaatattccaaca 198  Q
     |||||     |||||||||||| |||||| || |||| ||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
38100 ttaaggtttcaaattgataaataactaataaaattattattatgattttcgctcacataatgacattggaatatgtttaaataataaaatatttcaaca 38002  T

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Target: scaffold0449 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:

Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 166
Target Start/End: Original strand, 1281 - 1331
Alignment:
116 gataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatat 166  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
1281 gataaatagctaatataattattattacgatatttgtccatataatgatat 1331  T

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