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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF15209_high_5 (Length: 252)
Name: NF15209_high_5
Description: NF15209
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15209_high_5 |
 |  |
|
| [»] scaffold0208 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0363 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0440 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0064 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1114 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0185 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0085 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0449 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10238599 - 10238840
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10238599 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatca |
10238698 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10238699 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
10238798 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10238799 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
10238840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49157452 - 49157212
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49157452 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa |
49157356 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49157355 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
49157256 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49157255 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
49157212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 11840112 - 11840349
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11840112 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
11840211 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11840212 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
11840311 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11840312 |
atctcctacttgggctacatatcttaataattatatca |
11840349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 42191607 - 42191844
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42191607 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
42191706 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42191707 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca |
42191806 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42191807 |
atctcctacttgggctacatatcttaataattatatca |
42191844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10761037 - 10761277
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10761037 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
10761133 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10761134 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
10761233 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10761234 |
caatcttccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
10761277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 38449450 - 38449690
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38449450 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
38449546 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38449547 |
tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataaaaaaatattccaa |
38449646 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38449647 |
caatccaccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
38449690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17056178 - 17056377
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17056178 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
17056277 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17056278 |
attaaggctcacaattgataaatagataatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
17056377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42197549 - 42197748
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42197549 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
42197648 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42197649 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca |
42197748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49151385 - 49151186
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49151385 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa |
49151289 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49151288 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
49151189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10244721 - 10244920
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10244721 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatca |
10244820 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10244821 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca |
10244920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10769356 - 10769554
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10769356 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
10769452 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10769453 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
10769552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26429804 - 26430003
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26429804 |
cggacatccactcatgttgagcccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
26429903 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26429904 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattagaatattattaaataataaaacattccaaca |
26430003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Original strand, 24643890 - 24644118
Alignment:
| Q |
16 |
gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccac |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
24643890 |
gttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagactcac |
24643988 |
T |
 |
| Q |
112 |
aattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttg |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24643989 |
aattgataaataactaatgtaattattgttaggatatttgcccacataataatattggaatataataaaataataaaatattccaacaatctcccactta |
24644088 |
T |
 |
| Q |
211 |
ggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24644089 |
gactacatatcttagtaattatatcagaat |
24644118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 55003788 - 55003988
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
55003788 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaataa |
55003887 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55003888 |
attaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
55003987 |
T |
 |
| Q |
199 |
a |
199 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
55003988 |
a |
55003988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 23138803 - 23139001
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23138803 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa |
23138899 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23138900 |
tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
23138999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 30051487 - 30051685
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Q |
| |
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||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cggacatccactc--gttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatatctttattacttaatttgatcactaa |
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T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30051584 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
30051683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38455937 - 38456135
Alignment:
| Q |
1 |
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96 |
Q |
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||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38456034 |
tcaactaacactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8331560 - 8331362
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| Q |
1 |
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96 |
Q |
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||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8331560 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatcttatatccttattacttaatttgatcactaa |
8331464 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tcaactaaggtccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
8331364 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28964653 - 28964468
Alignment:
| Q |
1 |
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96 |
Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaataactttattacttaatttgatcactaa |
28964557 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataata |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28964556 |
tcaactaaggctcacaatttataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataata |
28964468 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 17601920 - 17602120
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| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17601920 |
cggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaccactaatca |
17602019 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
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| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| | |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |
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| T |
17602020 |
attaaggctctaaattgataaataactaatataattattactatgatatttacgcacatagtgatatttgaatattattaaataataaaatatttcaaca |
17602119 |
T |
 |
| Q |
199 |
a |
199 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
17602120 |
a |
17602120 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071828
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3 |
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98 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
53071640 |
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53071736 |
T |
 |
| Q |
99 |
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198 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53071737 |
aactaaggctcacaattgataaataactaatataattattgttatgatatttgccc--------atattgaaatataataaataataaaatattccaaca |
53071828 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 11846363 - 11846562
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1 |
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95 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11846363 |
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11846459 |
T |
 |
| Q |
96 |
atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattcc |
194 |
Q |
| |
|
||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11846460 |
atccattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgata-tggaatattattaaataataaaatattcc |
11846558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 9586490 - 9586598
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| Q |
91 |
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190 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9586490 |
cactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaata |
9586589 |
T |
 |
| Q |
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ttccaacaa |
199 |
Q |
| |
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|
|
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ttccaacaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 198
Target Start/End: Original strand, 8474582 - 8474721
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| Q |
61 |
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159 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8474582 |
aaatctaataacattattacttaatttgatcactaatcaattaaaggcccacaattgattaaaagttaatataattattattacgatatttgttcacata |
8474681 |
T |
 |
| Q |
160 |
atgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8474682 |
atgatatcgaaatataattaaataataaaatattcaaaca |
8474721 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300012
Alignment:
| Q |
17 |
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112 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
34300197 |
ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-taaaaatttaatagtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcaca |
34300099 |
T |
 |
| Q |
113 |
attgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34300098 |
attgataaatagttaatataattattattatgatgtttgcccacgtaatgatatcgaaaaataataaaataataaaatatttcaaca |
34300012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Original strand, 12109054 - 12109246
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc |
98 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| || |||||| || ||| | |||| ||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
12109054 |
gacatcaactcatattgagtccatatcaattaatcaaatgtttaatcaattatctaat-tagaaa-cttataacattatcacttaattttatcactaatc |
12109151 |
T |
 |
| Q |
99 |
aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatatt |
192 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12109152 |
aattaaagatcacaattgataaataactaatacaattattattacgatatttactcacataataatattataatataataaaataataaaatatt |
12109246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 198
Target Start/End: Original strand, 2982634 - 2982812
Alignment:
| Q |
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120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
2982634 |
atatcaactaattaaatatttaattaatttttcaattagaaatctaaatatctttattatttaatttgatcactaatcaaataaggctcgctattgataa |
2982733 |
T |
 |
| Q |
121 |
atagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||| | |||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2982734 |
atagattatataattattattacaatatttgttcgcataatgatatcgaaatataattaaataataaaatataccaaca |
2982812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 46656453 - 46656353
Alignment:
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96 |
Q |
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|
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|
|
| T |
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cggacatccactcatc--gagtacatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaa |
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T |
 |
| Q |
97 |
tcaa |
100 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
46656356 |
tcaa |
46656353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 25381922 - 25382159
Alignment:
| Q |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25381922 |
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25382021 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25382022 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
25382121 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25382122 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
25382159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31057817 - 31057581
Alignment:
| Q |
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cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31057817 |
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31057721 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31057720 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
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T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31057620 |
caatctcccacttgagctacatatcttaataattatatca |
31057581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50305970 - 50305771
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50305970 |
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T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
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Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50305870 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1078017 - 1077818
Alignment:
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99 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1078017 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatca |
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T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
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Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1077917 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
1077818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31051317 - 31051119
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| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
31051317 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
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T |
 |
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| |
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|
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31051220 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
31051121 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 25275433 - 25275625
Alignment:
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1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25275433 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
25275532 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatat |
191 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25275533 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatat |
25275625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34739759 - 34739560
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34739759 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat |
34739662 |
T |
 |
| Q |
98 |
caactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34739661 |
caactaaggccctcaatttataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac |
34739562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 25387891 - 25388088
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25387891 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
25387988 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25387989 |
attaaggctcacaattgataaataaataatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaattaataaaatattccaaca |
25388088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8093232 - 8093431
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
8093232 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaacatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgattattaa |
8093328 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8093329 |
tcaactaagactcacaattgataaataactaatataattattgttacggcatttgcccggataatgatattggaatataattaaataataaaatattcca |
8093428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44409773 - 44409593
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
44409773 |
cggacatccactcat--tgagtccatattaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaacctaatagccttattacctaatttaatcactaa |
44409677 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaa |
180 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44409676 |
tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaa |
44409593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27954933 - 27954735
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27954933 |
acatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatc-aaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
27954835 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27954834 |
attaagcctcacaattgataaataactaatataattagtattacgatttttgcccacgtaatgatatcagaatataattaaataataaaatatttcaaca |
27954735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Original strand, 24927188 - 24927396
Alignment:
| Q |
33 |
taattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatat |
131 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24927188 |
taattaattaattaat-attctaaatagaaatcttataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaatagctaatat |
24927286 |
T |
 |
| Q |
132 |
aactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataatt |
230 |
Q |
| |
|
|| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24927287 |
aattattatagagatatttgcccacataatgtcattggaatataattaaatattaaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataatt |
24927386 |
T |
 |
| Q |
231 |
atatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
24927387 |
atataagaat |
24927396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 38152358 - 38152541
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca |
112 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38152358 |
ttgagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccaca |
38152456 |
T |
 |
| Q |
113 |
attgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38152457 |
attgataaataattaatataattattgttacaatatttgtcc-gataatgatattgaaatataataaagaataaaatatttcaaca |
38152541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 112 - 239
Target Start/End: Original strand, 12184095 - 12184223
Alignment:
| Q |
112 |
aattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttg |
210 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12184095 |
aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaacaatcttccacttg |
12184194 |
T |
 |
| Q |
211 |
ggctacatatcttaataattatatcagaa |
239 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12184195 |
ggctacatatcttaataattataccagaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 200
Target Start/End: Original strand, 33458354 - 33458494
Alignment:
| Q |
58 |
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157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
33458354 |
tagaaatctaatagcattattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataacta---ttatgatatttgtccaca |
33458450 |
T |
 |
| Q |
158 |
taatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaat |
200 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33458451 |
tactgatatcagaatataattaaataataaaatattccaacaat |
33458494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 24964108 - 24964289
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt |
115 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24964108 |
ttgagttcatatccattaattaattaattaat-attctaaatagaaatcttataagctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaatt |
24964206 |
T |
 |
| Q |
116 |
gataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24964207 |
gataaatagctaatataattattatagagatatttacccacataatatcattggaatataattaatattaaaacattccaaca |
24964289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Original strand, 4280169 - 4280254
Alignment:
| Q |
53 |
caaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactatt |
138 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
4280169 |
caaattagatatctaataatcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagttaatataattatt |
4280254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 12183998 - 12184069
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaat |
69 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12183998 |
cggacatctactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aaatagaaatctaat |
12184069 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 23253907 - 23253859
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatc |
52 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23253907 |
acatctactcatatcgagtccatatcaattaattaattaattaattatc |
23253859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28525772 - 28526012
Alignment:
| Q |
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cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28525772 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa |
28525868 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28525869 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
28525968 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28525969 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
28526012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 32094608 - 32094849
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32094608 |
cggacatacactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
32094707 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32094708 |
attaaggctcacaattgataaatagttaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
32094807 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32094808 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
32094849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 12686565 - 12686816
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12686565 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
12686664 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatat-----aataa------ataataaaa |
188 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12686665 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatataataaaa |
12686764 |
T |
 |
| Q |
189 |
tattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12686765 |
tattccaacaatctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat |
12686816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41297052 - 41296816
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41297052 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
41296956 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41296955 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgtaatataataaaatataaaatattccaa |
41296856 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41296855 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
41296816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 12692667 - 12692866
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12692667 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
12692766 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12692767 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
12692866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28531868 - 28532066
Alignment:
| Q |
1 |
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96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28531868 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaacagccttattacttaatttgatcactaa |
28531964 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28531965 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
28532064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 32097409 - 32097608
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1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
32097409 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagcttattatttaatttgatcactaaccaa |
32097508 |
T |
 |
| Q |
101 |
ctaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32097509 |
ttaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaacaa |
32097608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Original strand, 7389937 - 7390133
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7389937 |
acatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
7390033 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7390034 |
actaagactcacaattgataaatagctaatataattatcgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
7390133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30772053 - 30771818
Alignment:
| Q |
3 |
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98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30772053 |
gacatccactcatattgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatccaata-agaaactttatagccttattacttaatttgatcactaatc |
30771955 |
T |
 |
| Q |
99 |
aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaat--aataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30771954 |
aattaaggctcacaactgataa---gctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatatagtaaaacaaataaaatattccaa |
30771858 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30771857 |
caatctctcacttgggctacatatcttaataattatatca |
30771818 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 19060159 - 19060400
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta---tccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatc |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19060159 |
gacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatc |
19060258 |
T |
 |
| Q |
99 |
aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
|| |||| | | |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19060259 |
aattaagtctccaaattgacaaatagctaatataattattatggagatatttgcccacataatgtcattgaaatagaattaaatattaaaatatttcaac |
19060358 |
T |
 |
| Q |
198 |
aatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19060359 |
aa-ctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
19060400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20499909 - 20499712
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20499909 |
gacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatcttac-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaatc |
20499813 |
T |
 |
| Q |
99 |
aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
|| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20499812 |
aattaagactcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgtccatataatgatgttgaaatataattaaataataaaatattccaac |
20499713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609706
Alignment:
| Q |
19 |
gagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
14609888 |
gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttac-tagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaat |
14609790 |
T |
 |
| Q |
115 |
tgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14609789 |
tgataagtaactaatataattattattacgatatttgcacacataatgatattggaatat-ttaaataataaaatattccaacaa |
14609706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 198
Target Start/End: Original strand, 30384812 - 30384969
Alignment:
| Q |
41 |
taattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgt |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
30384812 |
taattaattatctaat-tagaaatccaatagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcacaactgataaatagctaatataattattat |
30384910 |
T |
 |
| Q |
141 |
tacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30384911 |
tacaatatttgtccacataatgatatcggaatataataaaataataaaatattccaaca |
30384969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26509589 - 26509397
Alignment:
| Q |
36 |
ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataac |
134 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26509589 |
ttaaataattaattatccaaa-tagaaatctaatcattcttgttacttaatttgatcactatt-----aaggctccaaattgataaatagttaatataat |
26509496 |
T |
 |
| Q |
135 |
tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaa-taataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattata |
233 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26509495 |
tattacaa-gatatttgcccacttaatgacaatggaatataataaaataataaaatattccaacaatctcctacttgtgctacttatcttaataattata |
26509397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 198
Target Start/End: Original strand, 19066516 - 19066693
Alignment:
| Q |
22 |
tccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |
|
|
| T |
19066516 |
tccatatccattaattaatcaattaat-attctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaaggctccagattgacaa |
19066614 |
T |
 |
| Q |
121 |
atagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19066615 |
ataattaatataattattatggagatatttgcccacataatattatgggaatataattaaatattaaaatattccaaca |
19066693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 143
Target Start/End: Original strand, 8706831 - 8706916
Alignment:
| Q |
58 |
tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttac |
143 |
Q |
| |
|
||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
8706831 |
tagaaatttaatcgtcttatcacttaatttgatcactaatcaattaagacccacagttgataaatagctaatataattattattac |
8706916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 197
Target Start/End: Original strand, 33753668 - 33753815
Alignment:
| Q |
57 |
atagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatc-----aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||| |
|
|
| T |
33753668 |
atagaaatctaatcaaacttattacttagtttgatcactaatctaatcaattaaagctccaaattgataaatagctaatataattatgataataatattt |
33753767 |
T |
 |
| Q |
151 |
tcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33753768 |
acccacataatgatattgaaatataattaaataataaaataatccaac |
33753815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Original strand, 25408435 - 25408539
Alignment:
| Q |
84 |
atttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaata |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||| |
|
|
| T |
25408435 |
atttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata---tatataattacttttacgatatttgtccacataatgatatcgaaatattattaaata |
25408531 |
T |
 |
| Q |
183 |
ataaaata |
190 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25408532 |
ataaaata |
25408539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 133
Target Start/End: Original strand, 26318684 - 26318762
Alignment:
| Q |
55 |
aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataa |
133 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | || |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
26318684 |
aaataaaaatctaatatctttattaattaatttaatcactaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataa |
26318762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 197
Target Start/End: Original strand, 33849297 - 33849446
Alignment:
| Q |
55 |
aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatc-----aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatat |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |
|
|
| T |
33849297 |
aaatagaaatctaatcaaacttattacttagtttgatcactaatctaatcaattaaagctccaaattaataaatagctaatataattatgataaaaatat |
33849396 |
T |
 |
| Q |
149 |
tttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33849397 |
ttacccatatagtgatattgaaatataattaaataataaaataatccaac |
33849446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 138
Target Start/End: Original strand, 22647928 - 22648012
Alignment:
| Q |
55 |
aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactatt |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| | | |||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22647928 |
aaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataattaatataattatt |
22648012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32896785 - 32896544
Alignment:
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1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32896785 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
32896686 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32896685 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca |
32896586 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32896585 |
atctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat |
32896544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14417731 - 14417498
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14417731 |
acatccactcat--tgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
14417635 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14417634 |
actaagactcacaattgataaataactaatataattattattacgatattttcccacataatgatattggtatataataaataataaaatattccaacaa |
14417535 |
T |
 |
| Q |
200 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14417534 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
14417498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 39727671 - 39727913
Alignment:
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1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39727671 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatttaatagccttattacttaatttgatcactaa |
39727767 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39727768 |
tcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
39727867 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctccca--cttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39727868 |
caatctcccacgcatgggctacatatcttaataattatatcagaat |
39727913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 22220114 - 22220349
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22220114 |
cggacatccattcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatacccttattacttaatttgatcactaa |
22220210 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22220211 |
tcaactaaggcttacgattgataaatagctaatataactattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataat-agtaataaaatattccaa |
22220309 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22220310 |
caatctcccacttgggctacacatcttaataattatatca |
22220349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36818745 - 36818546
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36818745 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattaaccttattacttaatttgatcactaatca |
36818646 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36818645 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
36818546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 32890661 - 32890460
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32890661 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
32890562 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
32890561 |
attaagggtcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca |
32890462 |
T |
 |
| Q |
199 |
at |
200 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
32890461 |
at |
32890460 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10705611 - 10705373
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10705611 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaat-tagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaa |
10705515 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
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|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
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|
| T |
10705514 |
tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattcgcccacaaaatgatattggaatataataaataacaaactattccaa |
10705415 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcaga |
238 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10705414 |
caatctcccacttggactacatatcttaataattataccaga |
10705373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42993386 - 42993585
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42993386 |
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42993485 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42993486 |
attaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccatataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca |
42993585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42033570 - 42033372
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42033570 |
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42033474 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42033473 |
tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttacccgcataatgatattgaaatataataaataataaaatattccaa |
42033374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 5542547 - 5542788
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5542547 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaa |
5542644 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5542645 |
tcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgata-tagaatattattaaataataaaatattcca |
5542743 |
T |
 |
| Q |
196 |
acaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
5542744 |
acaatctcccacttgggcgacatatcttaataattataccagaat |
5542788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10699802 - 10699604
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10699802 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagcctaattacttaatttgatcactaa |
10699706 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10699705 |
tcaattaaggctcacaattgataaataactagtataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataagctattccaa |
10699606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39735925 - 39736122
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39735925 |
cggacatccactgat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
39736021 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39736022 |
tcaactaatgctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataataata-tggaatataataaataataaaatattccaa |
39736120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9935056 - 9934857
Alignment:
| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9935056 |
cggatatccactcatgttgagtccatatcaataaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagctttattacttaatttgatcactaatca |
9934957 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9934956 |
attaagactcacaattgataaataactaatataattattattacaatatttacccacataatcatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca |
9934857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 1883229 - 1883424
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1883229 |
cggacatccactcatattgagtccatatccattaattaattaat-----attctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatca |
1883323 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1883324 |
agtaaggctccaaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccgcataatattattggaatataattaaataataaaatattccaaca |
1883423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17954278 - 17954060
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattactt----aatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17954278 |
acatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaattaattaaa-tagaaatctaataggcttattactttagtaatctgatcactaatca |
17954180 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||| | | |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||| || |
|
|
| T |
17954179 |
attaagtctccaaattgataaatagctaatataattattataaagatattttcccacaaaatgacattgaaatataattaaaaaataaaacattccatca |
17954080 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacat |
218 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17954079 |
atttcccacttgggttacat |
17954060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45365391 - 45365340
Alignment:
| Q |
183 |
ataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatat |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45365391 |
ataaaatattccaacaatctctcactttagttacatatctttataattatat |
45365340 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 30890535 - 30890593
Alignment:
| Q |
58 |
tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
30890535 |
tagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt |
30890593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35085066 - 35085307
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
35085165 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35085166 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca |
35085265 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35085266 |
atctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat |
35085307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13461813 - 13461576
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13461813 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
13461714 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13461713 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca |
13461614 |
T |
 |
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199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
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| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13461613 |
atctcctacttgggctacatatcttaataattatatca |
13461576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 28683331 - 28683567
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28683331 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
28683427 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28683428 |
tcaactaaggcccacaattgataaataactaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattaagatataataaataataaaatattccaa |
28683527 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28683528 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
28683567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 35439757 - 35439995
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35439757 |
cggacatccactcat--taagttcatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
35439853 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35439854 |
tcaatcaaggctcacaattgataaataacgaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
35439953 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcaga |
238 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35439954 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcaga |
35439995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13455872 - 13455672
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13455872 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
13455773 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13455772 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattctaaca |
13455673 |
T |
 |
| Q |
199 |
a |
199 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
13455672 |
a |
13455672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36750187 - 36749988
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36750187 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
36750088 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36750087 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
36749988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35091039 - 35091238
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35091039 |
cggacatccactcatgttgagtctatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
35091138 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35091139 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttacccacataatgatattggaatattattaaataataaaacattccaaca |
35091238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31002149 - 31001951
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31002149 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
31002053 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31002052 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
31001953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30965100 - 30964900
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30965100 |
cggacatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa |
30965004 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30965003 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
30964904 |
T |
 |
| Q |
197 |
caat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
30964903 |
caat |
30964900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 13150079 - 13150274
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13150079 |
acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcaataatca |
13150175 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13150176 |
actaatgcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattgaaatataataaataataaaatattccaaca |
13150274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 44717192 - 44717390
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44717192 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattatatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
44717288 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44717289 |
tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatgtgcccacataatgatattggaatataataaatcataaaatattccaa |
44717388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 35442219 - 35442402
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35442219 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
35442315 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataa |
183 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35442316 |
tcaatcaaggctcacaattgataaatagcgaatataattattgttacgatatttacccacataatgatattggaatataataaataa |
35442402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19879353 - 19879170
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaa |
113 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19879353 |
ttgagtcaatatcaattaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaa |
19879254 |
T |
 |
| Q |
114 |
ttgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19879253 |
ttaataaatagctaatatagttattattacgatattttcccacataatgatattggaatataataaaatattaaaatattccaa |
19879170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31008127 - 31007985
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31008127 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
31008031 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgtta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31008030 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgtta |
31007985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23343296 - 23343132
Alignment:
| Q |
41 |
taattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattg |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
23343296 |
taattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattgataaatagttaatataattatta |
23343197 |
T |
 |
| Q |
140 |
ttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcc |
204 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23343196 |
ttatgatatttgtccacataatgatattagaatataataaaataataaaatattcc-acaatctcc |
23343132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 149
Target Start/End: Original strand, 7771596 - 7771722
Alignment:
| Q |
26 |
tatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaa |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
7771596 |
tatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaa |
7771694 |
T |
 |
| Q |
122 |
tagctaatataactattgttacgatatt |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7771695 |
tagctaatataattattgttacgatatt |
7771722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23283955 - 23283821
Alignment:
| Q |
62 |
aatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataa |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23283955 |
aatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccacataa |
23283856 |
T |
 |
| Q |
161 |
tgatattggaatataat-aaataataaaatattcc |
194 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23283855 |
tgatattgaaatataataaaataataaaatattcc |
23283821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Original strand, 11049014 - 11049078
Alignment:
| Q |
135 |
tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11049014 |
tattattacgatatttgcccacataataatattggaatataattaaataataaaatattccaaca |
11049078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 247
Target Start/End: Original strand, 25759612 - 25759716
Alignment:
| Q |
144 |
gatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaataa |
242 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | | |
|
|
| T |
25759612 |
gatatttttccacataataacattgaaatataattaaataataaatcattccggcaatctcccacttggactacatatcataacaattatatcagagtta |
25759711 |
T |
 |
| Q |
243 |
tctag |
247 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
25759712 |
tctag |
25759716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 234
Target Start/End: Original strand, 8342727 - 8342806
Alignment:
| Q |
155 |
acataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatat |
234 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8342727 |
acataataatattgaaatataatatttaataaaatattccaacaatctcccacttgagaaacatatcttgctaattatat |
8342806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29832964 - 29832878
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29832964 |
ttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-taaaagtctaatagtcttattacttaattttatcactaatcaa |
29832878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 234
Target Start/End: Original strand, 29479309 - 29479366
Alignment:
| Q |
177 |
taaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatat |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
29479309 |
taaataataaatcattccagcaatctcccacttggactacatatcgtaacaattatat |
29479366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 198
Target Start/End: Original strand, 7771717 - 7771753
Alignment:
| Q |
162 |
gatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7771717 |
gatattggaatataataaatagtaaaatattccaaca |
7771753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 11048955 - 11048988
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaataattaatta |
50 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11048955 |
ttgagtccatatcaactaattaaatatttaatta |
11048988 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28765352 - 28765248
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataa-ttaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaac |
101 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | |||| |||||||| || ||| || | ||||||||||||| || |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28765352 |
acattcactcatatcgagttcatatcaattatttatattagttaattatccaaa-taaaaatataattagccttatcatttaatttgatcactaatcaat |
28765254 |
T |
 |
| Q |
102 |
taaggc |
107 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
28765253 |
taaggc |
28765248 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16361789 - 16361738
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat |
69 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16361789 |
ttgagttcatatcaattaattatataattaattat-ctaaatagaaatctaat |
16361738 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28765238 - 28765174
Alignment:
| Q |
135 |
tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28765238 |
tattattactatatttacccatataatgatatcagaatataattaaataatcaaatattccaaca |
28765174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48166948 - 48166711
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48166948 |
acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
48166852 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48166851 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
48166752 |
T |
 |
| Q |
200 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48166751 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
48166711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 26957190 - 26957424
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26957190 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa |
26957286 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26957287 |
ttaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
26957386 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatat |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26957387 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatat |
26957424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10733736 - 10733972
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10733736 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
10733832 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10733833 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa |
10733932 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10733933 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
10733972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 10947505 - 10947741
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10947505 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
10947601 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10947602 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa |
10947701 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10947702 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
10947741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48160729 - 48160534
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160729 |
acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
48160633 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48160632 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
48160534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24287760 - 24287561
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24287760 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
24287661 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24287660 |
attaaggctcacaatttataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca |
24287561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50168364 - 50168134
Alignment:
| Q |
5 |
catccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50168364 |
catccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttgttacttgatttgaccactaatcaa |
50168268 |
T |
 |
| Q |
101 |
ctaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50168267 |
ttaagactcacaattgataaatagctaatataattattattacgatattttccgacgtaatgttattggaatataattaaataataaaatattccaacaa |
50168168 |
T |
 |
| Q |
200 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattata |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50168167 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattata |
50168134 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 26971943 - 26972139
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26971943 |
gacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatatccttatcacttaatttgatcactaatc |
26972039 |
T |
 |
| Q |
99 |
aactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26972040 |
aattaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacaatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
26972139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 10739723 - 10739922
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10739723 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatc-agaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
10739819 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10739820 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa |
10739919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 10953492 - 10953691
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10953492 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatc-agaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
10953588 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10953589 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa |
10953688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6257591 - 6257789
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6257591 |
cggatatccactcat--tgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagctttattacttaatttgatcactaa |
6257687 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6257688 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaaatataaaatattccaa |
6257787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 60 - 233
Target Start/End: Original strand, 17627221 - 17627395
Alignment:
| Q |
60 |
gaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacata |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17627221 |
gaaatctaataggcttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgataaatagctaatataattattattacgatattttcccacata |
17627320 |
T |
 |
| Q |
160 |
atgatattggaata-taataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattata |
233 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17627321 |
atgatatcgaaatattattaaataataaaatatttcaacaatctcccacttggactccatatcttaataattata |
17627395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 33461797 - 33461899
Alignment:
| Q |
96 |
atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33461797 |
atcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgataattgcccacataaagatattggaatataataaataataaaatattcca |
33461896 |
T |
 |
| Q |
196 |
aca |
198 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
33461897 |
aca |
33461899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 96 - 198
Target Start/End: Original strand, 33458672 - 33458774
Alignment:
| Q |
96 |
atcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33458672 |
atcaactaaggctcacaattgataaatagttaatataattattgttacgataattgcccacataaggatattggaatataataaataataaaatattcca |
33458771 |
T |
 |
| Q |
196 |
aca |
198 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
33458772 |
aca |
33458774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 44832001 - 44832151
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44832001 |
cggacatgcactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatctaat-taaaaatcttataaccttattacttaatttgatcactaa |
44832097 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattt |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44832098 |
tcaactaagatctataattgataaataactaatataattattgttacaatattt |
44832151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49976371 - 49976174
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaata-gccttattacttaatttgatcactaatcaac |
101 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49976371 |
gacatccacccatattgaatccatatccattaattaattaattaat-attctaaacaaaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaat |
49976273 |
T |
 |
| Q |
102 |
taaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
49976272 |
taaggctccaaattaataaatagctaatataattattatagagata-ttgcccacataatgtcattgaaatataattaaatattaaaatattcaaacaat |
49976174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35177567 - 35177413
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaa----ttatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatc |
98 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35177567 |
gacatacactcgtattgagtccatgtcaacaaattaaatatttaaataattatctaat-tagaaaactaacagccttattacttaatttgatcactaatc |
35177469 |
T |
 |
| Q |
99 |
aactaaggc----ccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattt |
150 |
Q |
| |
|
|| ||| || || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35177468 |
aattaatgctcgttcataattgataaatatctaatataattattattacgatattt |
35177413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 50426959 - 50426882
Alignment:
| Q |
61 |
aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactatt |
138 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
50426959 |
aaatttaataactttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataattatt |
50426882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 198
Target Start/End: Original strand, 532100 - 532170
Alignment:
| Q |
129 |
tataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
532100 |
tataattattattacgatatttgcctacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
532170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4632128 - 4632015
Alignment:
| Q |
20 |
agtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaatag-ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgat |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
4632128 |
agtccatatccactaattaattaattaatactctaag-tagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaattaagacttcaaattgat |
4632030 |
T |
 |
| Q |
119 |
aaatagctaatataa |
133 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4632029 |
aaataactaatataa |
4632015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 19686777 - 19686833
Alignment:
| Q |
73 |
cttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaat |
129 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19686777 |
cttattatttaatttgatcactaatcaattaagacacacaatcgataaatagctaat |
19686833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 19686851 - 19686936
Alignment:
| Q |
116 |
gataaatagctaat---ataactattgttacgatattttcccac-ataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19686851 |
gataaatagctaattatataattattattacgatatttgcccacaataatgatatcgaaatataattaaataataaaatactccaa |
19686936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 28704303 - 28704237
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaat |
69 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28704303 |
gacatccactcatattgagttcatatcagttaattaaaataattaattatcc-aaataaaaatctaat |
28704237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 50155718 - 50155657
Alignment:
| Q |
19 |
gagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaatagccttat |
77 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50155718 |
gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattaaaaatctaatagccttat |
50155657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 3811555 - 3811797
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3811555 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
3811651 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatg--atattggaatataataaataataaaatattcc |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3811652 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatattggaatataataaataataaaatattcc |
3811751 |
T |
 |
| Q |
195 |
aacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3811752 |
aacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
3811797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 351560 - 351324
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
351560 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat |
351463 |
T |
 |
| Q |
98 |
caactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
351462 |
caactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac |
351363 |
T |
 |
| Q |
198 |
aatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
351362 |
aatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
351324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35148395 - 35148636
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35148395 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatccaatagccttattacttaatttgatcactaa |
35148491 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttccc-acataatgatattggaatataataaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35148492 |
tcaactaaggctcataattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgccccacataatgatattagaatataataaataataaaatattcca |
35148591 |
T |
 |
| Q |
196 |
acaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
35148592 |
acaatctcccacttgggctacatatcttaataattatataagaat |
35148636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 28421345 - 28421537
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28421345 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
28421444 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatat |
191 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28421445 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatat |
28421537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 3817697 - 3817895
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3817697 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttcatcactaa |
3817793 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3817794 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcctacataatgatattgaaatataataaataataaaatattccaa |
3817893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 35152915 - 35153115
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35152915 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatcgaatagccttattacttaatttgatcactaa |
35153011 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35153012 |
tcaactaaggctcacaattgataaatatctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgacattggaatataataaataataaaatattccaa |
35153111 |
T |
 |
| Q |
197 |
caat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
35153112 |
caat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26383442 - 26383212
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26383442 |
cggacatccactcat--tgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
26383346 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat--aaataataaaatattcc |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26383345 |
tcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattatgatatttgcccacaaaatgatattgaaatataattaaaataataaaatattcc |
26383246 |
T |
 |
| Q |
195 |
aacaatctcccacttgggctacatatcttaataa |
228 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26383245 |
aacaatctcccacttgggctacatatctcaataa |
26383212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 339154 - 338955
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
339154 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaat |
339057 |
T |
 |
| Q |
98 |
caactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaac |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
339056 |
caactaaggctgacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccacataatgatattgaaatataagaaataataaaatattccaac |
338957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5849300 - 5849106
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| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5849300 |
acatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
5849204 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5849203 |
actaaggctcacaattgataaataactaatataattattgttacgatatttacccacataatgatattagaatataat-aataataaaatattccaaca |
5849106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 5979565 - 5979762
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4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaact |
102 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5979565 |
acatccatccatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaatt |
5979664 |
T |
 |
| Q |
103 |
aa-ggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
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|| ||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5979665 |
aagggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatattattaaataataaaatattccaaca |
5979762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 22742316 - 22742508
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22742316 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactacttatatatttaattaattatctaat-tagaaatctaatagccttattacttaattttatcactaa |
22742412 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatatt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22742413 |
tcaactaaggctcacagttgataaataactaatataattattgttacggtatttgcctacataataatattggaatataataaataataaaatatt |
22742508 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 43539696 - 43539567
Alignment:
| Q |
72 |
ccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaa |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43539696 |
ccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaaatgataaataattaatataattatttttacgatatttgcacacataatgatattggaa |
43539597 |
T |
 |
| Q |
172 |
tataa---taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43539596 |
tataaaattaaataataaaacattccaaca |
43539567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26380838 - 26380751
Alignment:
| Q |
42 |
aattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaata |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26380838 |
aattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaata |
26380751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8824547 - 8824397
Alignment:
| Q |
35 |
attaaataattaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataac |
134 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8824547 |
attaattaattaattatctaaaa--gaaatctaatatccttattacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataat |
8824450 |
T |
 |
| Q |
135 |
tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataa |
186 |
Q |
| |
|
|||| | | ||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8824449 |
tattataaagatatttgcctacataatgacattaaaatataattaaataataa |
8824397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Original strand, 18666883 - 18667006
Alignment:
| Q |
17 |
ttgagtccatatcaactaattaaa----taattaat---tatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaa--ctaaggc |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
18666883 |
ttgagtccatatcaactaattaaaaatttaattaataactatacaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcacttatcaattataaggc |
18666981 |
T |
 |
| Q |
108 |
ccacaattgataaatagctaatata |
132 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18666982 |
tcacggttgataaataactaatata |
18667006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Original strand, 18657039 - 18657132
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18657039 |
gacatccactcata--gagtccatattaattaatttaaataattaattatccaaa-taaaaatctaattagccttattacttaatgtgatcactaat |
18657132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 123
Target Start/End: Original strand, 30219519 - 30219584
Alignment:
| Q |
58 |
tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaata |
123 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30219519 |
tagaaatctaataactttataacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaata |
30219584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 198
Target Start/End: Original strand, 18667726 - 18667790
Alignment:
| Q |
135 |
tattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18667726 |
tattattacgatatttgcacacacaatgatattggaatataattaaataataaaatattccaaca |
18667790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7608112 - 7608022
Alignment:
| Q |
109 |
cacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataat------gatattggaatataa-taaataataaaatatt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
7608112 |
cacaattgataaataactgatataattattattatgatatttgcccatataataataatgatattggaatataattaaataataaaatatt |
7608022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 24690691 - 24690652
Alignment:
| Q |
3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata |
42 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24690691 |
gacatccactcatattgagtccatattaactaattaaata |
24690652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 8651190 - 8651430
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8651190 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagtcttattacttaatttgatcactaa |
8651286 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8651287 |
tcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
8651386 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8651387 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
8651430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21770951 - 21771187
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21770951 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaat-tagaaatctaatagttttattacttaatttgatcactaa |
21771047 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21771048 |
tcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
21771147 |
T |
 |
| Q |
197 |
caatctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21771148 |
caatctctcacttgggctacatatcttaataattatatca |
21771187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4580708 - 4580907
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4580708 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
4580807 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4580808 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaattaataaaatattccaaca |
4580907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25343395 - 25343201
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaact |
102 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
25343395 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata--aatctaattagccttattacttaatttaatcactaatcaatt |
25343298 |
T |
 |
| Q |
103 |
aaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25343297 |
aaggttcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
25343201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17581356 - 17581140
Alignment:
| Q |
24 |
catatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgata |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17581356 |
catatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaccataatagtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgata |
17581258 |
T |
 |
| Q |
120 |
aatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacat |
218 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17581257 |
aatagttaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatataattaaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacat |
17581158 |
T |
 |
| Q |
219 |
atcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17581157 |
atcttaataattatatca |
17581140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25353984 - 25353799
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25353984 |
cggatatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaata--aatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
25353887 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataa |
186 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
25353886 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataa |
25353799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Original strand, 21191259 - 21191497
Alignment:
| Q |
4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatca |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21191259 |
acatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccatattacttaatttgatcactaatca |
21191356 |
T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21191357 |
attaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgata-tggaatattattaaataataaaatattccaaca |
21191455 |
T |
 |
| Q |
199 |
atctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21191456 |
atcttccacttgggctacatatcttaataattataccagaat |
21191497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096887
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| Q |
20 |
agtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaatt |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
6097067 |
agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaatagccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaatt |
6096968 |
T |
 |
| Q |
116 |
gataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6096967 |
gacaaataagtaatataattattgttactatatttgcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
6096887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Original strand, 30905983 - 30906166
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| Q |
19 |
gagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaat |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30905983 |
gagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattactttatttggttactaatcaactaaggctcacaat |
30906081 |
T |
 |
| Q |
115 |
tgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30906082 |
tgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattgaaatataataaaataataaaatattccaaca |
30906166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21783712 - 21783912
Alignment:
| Q |
1 |
cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21783712 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatttaatagttttattacttaatttgatcactaa |
21783808 |
T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
21783809 |
tccactaagactcacaattgataaatagttaatataattattattacgatatttacccacataataatattagaatataataaataattaaatattctaa |
21783908 |
T |
 |
| Q |
197 |
caat |
200 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
21783909 |
caat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 31756605 - 31756796
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Q |
| |
|
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|
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| T |
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T |
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| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31756702 |
tcaactaagacccacaattgata-------aatataattattgttacaatatttatccacataataatattgaaatataataaataataaaatattcgaa |
31756794 |
T |
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Target: chr6; HSP #12
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1 |
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96 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21197427 |
cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaa |
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T |
 |
| Q |
97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaata-taataaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21197525 |
tcagttaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttacccacataatgata-tggaatattattaaataaaaaaatattcca |
21197623 |
T |
 |
| Q |
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acaa |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
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21197624 |
acaa |
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T |
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Target: chr6; HSP #13
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Target Start/End: Original strand, 32030014 - 32030093
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240 |
Q |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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tgatattggaatataataaataataaaatattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
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T |
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Target: chr6; HSP #14
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3 |
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101 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12801928 |
gacatccactcatattgagtccaaatccattaaataattaattaat-attctaaatagaaatctaataagctttattacttaaattgatcactaatcaat |
12802026 |
T |
 |
| Q |
102 |
taaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12802027 |
taaggctccaaattgacaaatagctaatataattattatagagatatttgcccacgtaatgtcattggaatataattaaatattaaaatattccaaca |
12802124 |
T |
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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 13007289 - 13007211
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236 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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aatgacattggaatataatgaaataataaaatattttaacaatctctcacttgggctacatatcttaataattacatca |
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T |
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Target: chr6; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 61 - 161
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160 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1106025 |
aaatttaatagccttatcatttaatttgaacactaatcaaataaaacttacaattgataaatatcaaatataattattactaccatatttgcccacataa |
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T |
 |
| Q |
161 |
t |
161 |
Q |
| |
|
| |
|
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t |
1105925 |
T |
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166 |
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198 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32044505 |
ttggaatataataaataataaaatattccaaca |
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T |
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Target: chr6; HSP #18
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112 |
aattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
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30393008 |
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T |
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Target: chr6; HSP #19
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Q |
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|
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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21789935 |
cggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaatta |
21789982 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0208 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:
Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
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T |
 |
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actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatat-----aataa------ataataaaa |
188 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12068 |
attaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatataataaaa |
11969 |
T |
 |
| Q |
189 |
tattccaacaatctcccacttgggctacatatcttaataattatatcagaat |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11968 |
tattccaacaatctcccacttgggttacatatcttaataattatatcagaat |
11917 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6295 - 6096
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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cggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatca |
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T |
 |
| Q |
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198 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
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attaaggctttaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatattggaatattattaaataataaaatattccaaca |
6096 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0363 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:
Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 236
Target Start/End: Original strand, 988 - 1221
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99 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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988 |
acatccactcat--tgagcccatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
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T |
 |
| Q |
100 |
actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaacaa |
199 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1085 |
actaagactcacaattgataaataactaatataattattattacgatattttcccacataatgatattggtatataataaataataaaatattccaacaa |
1184 |
T |
 |
| Q |
200 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
236 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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1185 |
tctcccacttgggctacatatcttaataattatatca |
1221 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0440 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:
Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1574 - 1772
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Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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cggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaa |
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T |
 |
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tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataataaataataaaatattccaa |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
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tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttacccacataataatattgaaatataataaataataaaatatttcaa |
1770 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0064 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:
Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14046 - 13812
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Q |
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|
||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14046 |
cggacatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tacaaatctaatagaattattacttaatttgatcactag |
13950 |
T |
 |
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tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13949 |
tcaattaaggctcacgattgataaatagctaatataattattattactatattttcccacataatgatattggaatataattaaataataaaatattcca |
13850 |
T |
 |
| Q |
196 |
acaatctcccacttgggctacatatcttaataattata |
233 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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acaatcccccacttgggctacatatcttaataattata |
13812 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 173276 - 173475
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Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
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97 |
tcaactaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataat-aaataataaaatattcca |
195 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
173373 |
tcaactaagacccacaattgataaatcgctaatataattattattacgatatttgcccacataataatattggaatataataaaataataaaatattcca |
173472 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1114 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1114
Description:
Target: scaffold1114; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
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aaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaataactaatataattattattatgatattttcccacataa |
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T |
 |
| Q |
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tgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgatattggaatataattaaataataaaatattccaaca |
637 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0185 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:
Target: scaffold0185; HSP #1
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4 |
acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaatagccttattacttaatttgatcactaatca |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5739 |
acatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcgaat-tagaaatctaatagtcatattacttaatttgatcactaatca |
5641 |
T |
 |
| Q |
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actaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatataa-taaataataaaatattccaaca |
198 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| || ||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5640 |
attaaggctcacaattgataaataactaatataattattatagcgatatttgcctacaaaatgatttcggaatataattaaataattaaatattccaaca |
5541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0085 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:
Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
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3 |
gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaa--tagccttattacttaatttgatcactaatcaa |
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Q |
| |
|
||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38198 |
gacatccac-catattaagtccatatcaattaattaaataattaattattc-gaatagaaatctaaattaaccttgttacttaatttgatcactattcaa |
38101 |
T |
 |
| Q |
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ctaaggcccacaattgataaatagctaatataactattgttacgatattttcccacataatgatattggaatat-aataaataataaaatattccaaca |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||| || |||| ||| ||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38100 |
ttaaggtttcaaattgataaataactaataaaattattattatgattttcgctcacataatgacattggaatatgtttaaataataaaatatttcaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0449 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
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Target: scaffold0449; HSP #1
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Q |
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|
|
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gataaatagctaatataattattattacgatatttgtccatataatgatat |
1331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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