View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15217_high_45 (Length: 264)

Name: NF15217_high_45
Description: NF15217
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15217_high_45
NF15217_high_45
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (1-213)||(31430606-31430816)
chr7 (1-213)||(41891317-41891527)
chr7 (4-202)||(7312667-7312863)
chr7 (1-202)||(32966046-32966245)
chr7 (1-213)||(33099821-33100029)
chr7 (1-202)||(18470354-18470553)
chr7 (1-213)||(32528314-32528524)
chr7 (1-199)||(29497534-29497730)
chr7 (1-210)||(22950807-22951014)
chr7 (3-202)||(36922288-36922486)
chr7 (3-185)||(44480156-44480336)
chr7 (1-201)||(12838076-12838274)
chr7 (1-213)||(33173854-33174064)
chr7 (1-213)||(41675173-41675382)
chr7 (3-213)||(5732059-5732267)
chr7 (7-213)||(29722291-29722494)
chr7 (36-213)||(8381908-8382083)
chr7 (1-163)||(20035095-20035255)
chr7 (1-163)||(20045506-20045666)
chr7 (1-164)||(26632215-26632376)
chr7 (14-213)||(8265011-8265206)
chr7 (1-199)||(31398932-31399127)
chr7 (1-199)||(7477198-7477394)
chr7 (1-153)||(17896569-17896719)
chr7 (1-213)||(33921760-33921970)
chr7 (1-203)||(3837909-3838109)
chr7 (1-202)||(26723971-26724171)
chr7 (1-209)||(36298164-36298370)
chr7 (1-213)||(10227303-10227513)
chr7 (18-213)||(38168774-38168968)
chr7 (1-216)||(33257928-33258141)
chr7 (1-202)||(35746642-35746840)
chr7 (1-202)||(42841863-42842062)
chr7 (1-202)||(31815066-31815264)
chr7 (1-194)||(36648011-36648201)
chr7 (70-213)||(47408227-47408370)
chr7 (1-214)||(30866721-30866932)
chr7 (1-198)||(35112476-35112671)
chr7 (5-213)||(28608646-28608851)
chr7 (26-213)||(37353855-37354041)
chr7 (1-199)||(36406798-36406997)
chr7 (1-202)||(18194211-18194410)
chr7 (3-144)||(41889372-41889511)
chr7 (3-215)||(3310265-3310464)
chr7 (7-202)||(43874080-43874272)
chr7 (1-120)||(22382153-22382268)
chr7 (22-185)||(45324092-45324250)
chr7 (1-115)||(6799170-6799283)
chr7 (135-213)||(17896477-17896555)
chr7 (3-198)||(44820608-44820791)
chr7 (1-202)||(24283629-24283825)
chr7 (1-202)||(9601890-9602089)
chr7 (1-202)||(9829461-9829660)
chr7 (1-213)||(3177977-3178187)
chr7 (1-99)||(22057510-22057612)
chr7 (1-189)||(46285855-46286041)
chr7 (1-202)||(35860014-35860211)
chr7 (31-213)||(8380578-8380758)
chr7 (1-120)||(17354105-17354222)
chr7 (1-202)||(34368657-34368855)
chr7 (4-117)||(1553565-1553674)
chr7 (8-102)||(42881021-42881113)
chr7 (125-213)||(6799588-6799676)
chr7 (5-202)||(19327788-19327977)
chr7 (17-117)||(30586758-30586856)
chr7 (1-202)||(8965897-8966096)
chr7 (1-97)||(46563225-46563319)
chr7 (1-213)||(48981365-48981575)
chr7 (156-207)||(46715304-46715355)
chr7 (152-202)||(41888991-41889041)
chr7 (1-41)||(41409766-41409806)
chr7 (67-215)||(41409852-41410000)
chr7 (4-213)||(47459694-47459895)
chr7 (3-97)||(26803532-26803624)
chr7 (156-202)||(22786079-22786125)
chr7 (1-82)||(33071953-33072032)
chr7 (63-117)||(35684260-35684314)
chr7 (153-203)||(36340583-36340633)
chr7 (125-207)||(42881118-42881199)
chr7 (155-215)||(41408776-41408836)
chr7 (1-31)||(2408827-2408857)
chr7 (1-117)||(32049460-32049574)
chr7 (1-117)||(46715384-46715498)
chr7 (152-188)||(17351669-17351705)
[»] chr4 (153 HSPs)
chr4 (1-213)||(13629177-13629387)
chr4 (1-213)||(16464766-16464976)
chr4 (1-213)||(44069081-44069291)
chr4 (4-213)||(44217759-44217966)
chr4 (1-213)||(44013897-44014107)
chr4 (1-214)||(8735439-8735650)
chr4 (1-202)||(46871971-46872170)
chr4 (1-213)||(39671375-39671585)
chr4 (1-198)||(35232297-35232492)
chr4 (1-213)||(38617293-38617501)
chr4 (1-193)||(16664291-16664481)
chr4 (1-213)||(21044732-21044941)
chr4 (1-213)||(53599770-53599980)
chr4 (1-199)||(5374348-5374544)
chr4 (3-213)||(39683698-39683906)
chr4 (1-198)||(48782250-48782444)
chr4 (1-202)||(35231740-35231939)
chr4 (1-198)||(29295404-29295599)
chr4 (1-213)||(22678293-22678503)
chr4 (1-213)||(56576088-56576297)
chr4 (1-199)||(36408773-36408969)
chr4 (1-199)||(36422939-36423135)
chr4 (1-198)||(3436066-3436261)
chr4 (1-202)||(19093148-19093347)
chr4 (1-202)||(23237677-23237879)
chr4 (1-202)||(26620346-26620545)
chr4 (1-213)||(42513009-42513220)
chr4 (1-198)||(50623464-50623658)
chr4 (1-213)||(354016-354226)
chr4 (1-213)||(6195074-6195284)
chr4 (1-213)||(22828385-22828595)
chr4 (23-218)||(33755010-33755201)
chr4 (1-202)||(38542271-38542470)
chr4 (1-198)||(42099758-42099953)
chr4 (1-213)||(55147044-55147255)
chr4 (1-195)||(53125240-53125432)
chr4 (1-198)||(26906388-26906583)
chr4 (1-213)||(12252150-12252352)
chr4 (1-202)||(31861981-31862180)
chr4 (1-202)||(33084528-33084722)
chr4 (12-213)||(52061619-52061818)
chr4 (3-211)||(54231590-54231797)
chr4 (1-202)||(19527215-19527402)
chr4 (1-199)||(8741617-8741818)
chr4 (1-213)||(47251463-47251673)
chr4 (1-202)||(47428579-47428768)
chr4 (1-215)||(52677148-52677339)
chr4 (1-202)||(55702970-55703169)
chr4 (5-202)||(34464331-34464526)
chr4 (1-213)||(40411993-40412203)
chr4 (1-199)||(35381417-35381609)
chr4 (4-196)||(47884988-47885179)
chr4 (1-213)||(36659411-36659621)
chr4 (8-197)||(37502079-37502266)
chr4 (3-213)||(32239452-32239660)
chr4 (1-213)||(30939205-30939415)
chr4 (1-158)||(47093862-47094017)
chr4 (1-197)||(44549693-44549887)
chr4 (1-195)||(18781529-18781721)
chr4 (4-213)||(23719768-23719975)
chr4 (3-200)||(26933769-26933963)
chr4 (80-213)||(31984136-31984269)
chr4 (1-213)||(52057436-52057645)
chr4 (1-213)||(55935157-55935367)
chr4 (1-140)||(4201375-4201512)
chr4 (1-199)||(52257789-52257985)
chr4 (1-210)||(33809137-33809344)
chr4 (5-199)||(18135048-18135240)
chr4 (71-199)||(42645379-42645507)
chr4 (5-199)||(49122258-49122450)
chr4 (1-218)||(9220020-9220235)
chr4 (1-199)||(56499610-56499808)
chr4 (64-214)||(47751641-47751791)
chr4 (1-213)||(19399584-19399793)
chr4 (7-199)||(44176587-44176777)
chr4 (3-122)||(29833001-29833118)
chr4 (3-108)||(9834316-9834419)
chr4 (1-198)||(42629367-42629562)
chr4 (4-198)||(30151725-30151917)
chr4 (1-202)||(43888033-43888230)
chr4 (3-213)||(45725588-45725796)
chr4 (1-202)||(41415057-41415256)
chr4 (140-213)||(9834467-9834540)
chr4 (1-213)||(48509854-48510063)
chr4 (1-91)||(23623601-23623689)
chr4 (1-102)||(27492409-27492509)
chr4 (4-213)||(31369854-31370061)
chr4 (2-183)||(36750600-36750779)
chr4 (1-199)||(42133087-42133283)
chr4 (1-173)||(53691678-53691848)
chr4 (7-183)||(36292672-36292846)
chr4 (1-202)||(1146041-1146243)
chr4 (1-202)||(14949079-14949278)
chr4 (1-198)||(18091292-18091487)
chr4 (1-202)||(47596608-47596807)
chr4 (1-69)||(33755205-33755276)
chr4 (1-208)||(38865954-38866156)
chr4 (3-213)||(39308983-39309190)
chr4 (1-213)||(6091337-6091547)
chr4 (3-95)||(41955776-41955866)
chr4 (1-202)||(3036435-3036632)
chr4 (4-103)||(36750230-36750327)
chr4 (1-174)||(34361106-34361276)
chr4 (1-202)||(8456906-8457105)
chr4 (1-214)||(34603674-34603885)
chr4 (1-213)||(38009750-38009960)
chr4 (1-220)||(55430284-55430497)
chr4 (87-144)||(23621905-23621962)
chr4 (1-97)||(37551765-37551859)
chr4 (1-119)||(7242289-7242405)
chr4 (1-95)||(14090290-14090382)
chr4 (1-95)||(48087748-48087840)
chr4 (1-202)||(1180896-1181095)
chr4 (1-199)||(1615053-1615247)
chr4 (124-202)||(29832355-29832433)
chr4 (152-202)||(33751338-33751388)
chr4 (1-67)||(38617866-38617932)
chr4 (1-67)||(51347312-51347378)
chr4 (1-117)||(34925422-34925536)
chr4 (1-213)||(51654857-51655066)
chr4 (1-97)||(54029148-54029242)
chr4 (1-69)||(1391297-1391365)
chr4 (1-202)||(6150744-6150943)
chr4 (107-213)||(29511197-29511303)
chr4 (1-97)||(3802210-3802304)
chr4 (44-120)||(19731449-19731523)
chr4 (157-202)||(48087902-48087947)
chr4 (152-213)||(49089105-49089166)
chr4 (134-202)||(17698643-17698711)
chr4 (1-69)||(17978119-17978186)
chr4 (1-83)||(7037047-7037127)
chr4 (13-83)||(8752202-8752270)
chr4 (1-56)||(37394298-37394353)
chr4 (152-198)||(52977928-52977974)
chr4 (1-58)||(7037176-7037233)
chr4 (152-213)||(38027559-38027620)
chr4 (65-102)||(52978321-52978358)
chr4 (152-199)||(7243005-7243053)
chr4 (157-213)||(14090444-14090500)
chr4 (1-92)||(30151934-30152023)
chr4 (159-202)||(1391166-1391209)
chr4 (141-213)||(23621577-23621641)
chr4 (1-99)||(27918652-27918747)
chr4 (170-213)||(36408969-36409012)
chr4 (170-213)||(36423135-36423178)
chr4 (1-97)||(43086455-43086547)
chr4 (63-101)||(13435257-13435295)
chr4 (1-35)||(41813692-41813726)
chr4 (65-99)||(53467650-53467684)
chr4 (161-198)||(4201329-4201366)
chr4 (166-199)||(34361703-34361736)
chr4 (3-102)||(20087228-20087325)
chr4 (19-102)||(25098342-25098423)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (1-213)||(26342627-26342837)
chr2 (1-213)||(14295743-14295953)
chr2 (1-215)||(15893564-15893776)
chr2 (4-213)||(15182987-15183194)
chr2 (1-213)||(10812246-10812456)
chr2 (1-213)||(3363631-3363841)
chr2 (1-202)||(30264599-30264798)
chr2 (1-213)||(34399249-34399459)
chr2 (1-213)||(41885672-41885882)
chr2 (1-213)||(478959-479169)
chr2 (1-200)||(37093497-37093693)
chr2 (7-213)||(19594403-19594607)
chr2 (1-213)||(11560033-11560243)
chr2 (1-213)||(11222302-11222512)
chr2 (1-213)||(34357225-34357435)
chr2 (1-213)||(36375618-36375830)
chr2 (1-197)||(38186054-38186248)
chr2 (1-199)||(14308442-14308636)
chr2 (1-202)||(28145568-28145768)
chr2 (1-202)||(10263803-10264002)
chr2 (1-202)||(14288478-14288675)
chr2 (4-213)||(38072218-38072419)
chr2 (1-213)||(4883650-4883860)
chr2 (1-213)||(44360481-44360690)
chr2 (1-213)||(25558172-25558379)
chr2 (1-197)||(15677298-15677487)
chr2 (3-211)||(13965656-13965862)
chr2 (2-213)||(4654767-4654976)
chr2 (3-202)||(9706836-9707033)
chr2 (1-202)||(14541378-14541577)
chr2 (1-203)||(36404837-36405038)
chr2 (1-202)||(13754002-13754201)
chr2 (67-202)||(3376274-3376409)
chr2 (4-213)||(13215443-13215650)
chr2 (1-214)||(9370021-9370232)
chr2 (1-213)||(13000897-13001107)
chr2 (1-216)||(43077339-43077552)
chr2 (7-213)||(35158337-35158541)
chr2 (1-213)||(13849701-13849911)
chr2 (1-202)||(31024937-31025136)
chr2 (1-202)||(32543784-32543983)
chr2 (1-216)||(32854765-32854976)
chr2 (1-180)||(6013522-6013699)
chr2 (115-213)||(14284243-14284340)
chr2 (1-213)||(8443738-8443935)
chr2 (100-213)||(1259615-1259728)
chr2 (1-213)||(1395612-1395820)
chr2 (8-218)||(31011699-31011905)
chr2 (1-122)||(2012908-2013027)
chr2 (3-190)||(34884547-34884732)
chr2 (1-201)||(838068-838266)
chr2 (1-69)||(14284175-14284243)
chr2 (64-155)||(36824499-36824590)
chr2 (1-213)||(25787384-25787584)
chr2 (1-117)||(32674258-32674376)
chr2 (1-176)||(29041997-29042167)
chr2 (1-216)||(37077217-37077430)
chr2 (1-202)||(7529701-7529901)
chr2 (106-213)||(34262808-34262915)
chr2 (1-95)||(42088941-42089033)
chr2 (64-202)||(4952693-4952831)
chr2 (4-100)||(34309149-34309243)
chr2 (1-175)||(28967255-28967427)
chr2 (1-202)||(37116600-37116789)
chr2 (1-97)||(38148137-38148231)
chr2 (1-208)||(45065119-45065324)
chr2 (1-95)||(33947533-33947625)
chr2 (64-139)||(34721570-34721645)
chr2 (1-98)||(30544567-30544662)
chr2 (1-85)||(25187241-25187323)
chr2 (17-198)||(928035-928211)
chr2 (1-69)||(2991858-2991925)
chr2 (127-202)||(25186827-25186902)
chr2 (1-83)||(42263619-42263699)
chr2 (161-198)||(36173264-36173301)
chr2 (1-69)||(36173115-36173183)
chr2 (1-95)||(37354036-37354128)
chr2 (63-97)||(37660844-37660878)
chr2 (156-196)||(29056212-29056252)
chr2 (157-213)||(37354190-37354246)
chr2 (157-197)||(42089088-42089128)
[»] chr8 (117 HSPs)
chr8 (1-215)||(23429956-23430168)
chr8 (1-213)||(38482775-38482985)
chr8 (1-213)||(35052100-35052310)
chr8 (1-213)||(34981876-34982086)
chr8 (1-200)||(34046898-34047095)
chr8 (4-212)||(26062758-26062963)
chr8 (3-198)||(14263593-14263786)
chr8 (1-202)||(4057335-4057534)
chr8 (1-202)||(33935054-33935253)
chr8 (1-213)||(9954696-9954906)
chr8 (4-221)||(39303490-39303706)
chr8 (1-203)||(40228342-40228542)
chr8 (1-220)||(14228298-14228514)
chr8 (7-213)||(38128530-38128734)
chr8 (1-213)||(23848539-23848749)
chr8 (1-213)||(25703561-25703770)
chr8 (1-213)||(25812732-25812941)
chr8 (1-199)||(16656748-16656943)
chr8 (3-199)||(1202441-1202635)
chr8 (1-202)||(45281372-45281570)
chr8 (1-202)||(43641983-43642182)
chr8 (1-210)||(12342600-12342807)
chr8 (1-198)||(32010082-32010277)
chr8 (1-202)||(36058280-36058478)
chr8 (1-202)||(11993940-11994127)
chr8 (1-213)||(18291511-18291720)
chr8 (3-199)||(21651743-21651937)
chr8 (1-202)||(1245359-1245558)
chr8 (1-213)||(15596391-15596601)
chr8 (1-178)||(40603869-40604044)
chr8 (1-199)||(10180417-10180613)
chr8 (1-207)||(33314591-33314795)
chr8 (1-162)||(9808008-9808167)
chr8 (3-213)||(8453219-8453425)
chr8 (3-202)||(26740131-26740328)
chr8 (1-216)||(43553086-43553299)
chr8 (1-157)||(3513404-3513558)
chr8 (1-213)||(14061132-14061342)
chr8 (4-214)||(12248752-12248960)
chr8 (1-213)||(6757453-6757663)
chr8 (1-203)||(2335480-2335680)
chr8 (1-213)||(167460-167670)
chr8 (5-213)||(18842581-18842786)
chr8 (3-202)||(13173978-13174175)
chr8 (1-213)||(23793254-23793468)
chr8 (1-199)||(2456112-2456303)
chr8 (4-211)||(7605885-7606087)
chr8 (5-202)||(8554010-8554204)
chr8 (5-202)||(17074576-17074770)
chr8 (5-202)||(17573500-17573694)
chr8 (1-174)||(17718550-17718721)
chr8 (1-218)||(19972326-19972541)
chr8 (1-218)||(21020292-21020507)
chr8 (1-214)||(27911654-27911865)
chr8 (1-214)||(27958073-27958284)
chr8 (5-213)||(2888451-2888656)
chr8 (1-176)||(12763481-12763654)
chr8 (1-143)||(15623664-15623804)
chr8 (1-143)||(15647452-15647592)
chr8 (1-213)||(8730812-8731020)
chr8 (1-213)||(23855605-23855814)
chr8 (7-198)||(14511428-14511617)
chr8 (74-213)||(41308013-41308153)
chr8 (1-115)||(13327826-13327938)
chr8 (1-198)||(27518711-27518900)
chr8 (1-202)||(3720727-3720926)
chr8 (1-214)||(35296091-35296302)
chr8 (31-213)||(36111926-36112104)
chr8 (1-213)||(7483791-7483999)
chr8 (1-122)||(11707559-11707678)
chr8 (3-176)||(35498090-35498261)
chr8 (107-216)||(13328121-13328230)
chr8 (1-122)||(6750662-6750781)
chr8 (3-202)||(31028703-31028899)
chr8 (3-213)||(41701465-41701673)
chr8 (3-100)||(16700989-16701084)
chr8 (1-216)||(13132098-13132309)
chr8 (6-214)||(39615435-39615639)
chr8 (4-121)||(35051896-35052011)
chr8 (1-202)||(38221859-38222058)
chr8 (1-202)||(9687508-9687703)
chr8 (3-102)||(17313126-17313223)
chr8 (1-101)||(40521337-40521437)
chr8 (1-202)||(11163313-11163512)
chr8 (1-203)||(6661000-6661200)
chr8 (1-203)||(6741402-6741602)
chr8 (3-202)||(10086150-10086346)
chr8 (64-202)||(8672602-8672740)
chr8 (1-214)||(11727630-11727840)
chr8 (3-208)||(42352788-42352989)
chr8 (4-121)||(43553318-43553433)
chr8 (96-213)||(17313282-17313399)
chr8 (1-213)||(29125949-29126158)
chr8 (1-117)||(38074323-38074437)
chr8 (64-215)||(35029655-35029805)
chr8 (1-202)||(45317699-45317898)
chr8 (125-202)||(31964738-31964815)
chr8 (4-102)||(43553544-43553641)
chr8 (44-202)||(15281469-15281625)
chr8 (44-202)||(15461838-15461994)
chr8 (1-67)||(30205507-30205573)
chr8 (1-117)||(8954778-8954892)
chr8 (1-41)||(8672349-8672389)
chr8 (111-199)||(11707451-11707539)
chr8 (3-67)||(41305693-41305757)
chr8 (152-198)||(29091083-29091129)
chr8 (44-198)||(41643488-41643640)
chr8 (66-202)||(9301537-9301673)
chr8 (1-97)||(41890569-41890663)
chr8 (214-249)||(36466164-36466199)
chr8 (152-202)||(1739889-1739939)
chr8 (3-41)||(35028655-35028693)
chr8 (157-197)||(30205657-30205697)
chr8 (4-78)||(13935194-13935266)
chr8 (1-83)||(37998224-37998303)
chr8 (1-199)||(40608082-40608281)
chr8 (169-202)||(17718909-17718942)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (1-213)||(8201-8411)
[»] chr1 (104 HSPs)
chr1 (3-213)||(43500555-43500763)
chr1 (1-213)||(19349359-19349569)
chr1 (1-213)||(30686458-30686668)
chr1 (1-213)||(1024603-1024813)
chr1 (1-213)||(35531275-35531485)
chr1 (1-213)||(13566723-13566936)
chr1 (1-213)||(38648504-38648714)
chr1 (1-213)||(20605604-20605814)
chr1 (1-213)||(37437033-37437243)
chr1 (1-213)||(45368135-45368345)
chr1 (1-213)||(35483761-35483969)
chr1 (1-202)||(37609295-37609491)
chr1 (1-202)||(12124691-12124890)
chr1 (17-213)||(12231051-12231245)
chr1 (3-202)||(1429333-1429530)
chr1 (1-202)||(21927689-21927886)
chr1 (1-213)||(13507817-13508027)
chr1 (1-213)||(13515005-13515215)
chr1 (14-201)||(1677258-1677443)
chr1 (1-199)||(45226571-45226767)
chr1 (4-202)||(49497202-49497398)
chr1 (29-213)||(29830828-29831010)
chr1 (1-199)||(32994463-32994659)
chr1 (1-213)||(18033806-18034016)
chr1 (1-206)||(28679068-28679271)
chr1 (1-216)||(50825550-50825762)
chr1 (1-202)||(7782998-7783196)
chr1 (1-202)||(13699221-13699420)
chr1 (1-202)||(19929457-19929656)
chr1 (1-198)||(31588735-31588929)
chr1 (47-202)||(8464248-8464401)
chr1 (1-209)||(35255533-35255739)
chr1 (1-202)||(44182807-44183004)
chr1 (1-198)||(52749064-52749257)
chr1 (3-199)||(49908173-49908370)
chr1 (1-213)||(10675949-10676159)
chr1 (1-213)||(51972261-51972471)
chr1 (27-214)||(2059791-2059976)
chr1 (4-202)||(9127717-9127915)
chr1 (1-216)||(32348025-32348237)
chr1 (1-147)||(44818501-44818645)
chr1 (1-204)||(30702279-30702480)
chr1 (1-195)||(43952835-43953017)
chr1 (26-202)||(39412502-39412676)
chr1 (1-220)||(12721487-12721704)
chr1 (1-213)||(32168292-32168502)
chr1 (4-202)||(51974162-51974358)
chr1 (1-213)||(35700355-35700565)
chr1 (1-213)||(38597638-38597848)
chr1 (1-213)||(51613458-51613668)
chr1 (1-202)||(9362020-9362219)
chr1 (1-202)||(10506860-10507057)
chr1 (1-183)||(19455410-19455589)
chr1 (5-202)||(31487770-31487964)
chr1 (1-202)||(52649720-52649919)
chr1 (1-220)||(36318400-36318616)
chr1 (1-200)||(15660634-15660831)
chr1 (3-213)||(4100889-4101097)
chr1 (9-121)||(24781806-24781916)
chr1 (7-215)||(18344379-18344585)
chr1 (44-202)||(5598145-5598291)
chr1 (7-202)||(46096599-46096792)
chr1 (1-202)||(1427726-1427925)
chr1 (7-213)||(42800160-42800363)
chr1 (1-213)||(37735119-37735329)
chr1 (5-199)||(48508185-48508376)
chr1 (1-213)||(40926733-40926933)
chr1 (1-202)||(43808945-43809150)
chr1 (19-199)||(33720582-33720760)
chr1 (4-202)||(31570628-31570824)
chr1 (1-116)||(1039445-1039557)
chr1 (1-116)||(1046351-1046463)
chr1 (4-213)||(17013472-17013683)
chr1 (3-202)||(48174664-48174860)
chr1 (1-55)||(8464585-8464639)
chr1 (1-202)||(2572018-2572216)
chr1 (80-202)||(35605722-35605844)
chr1 (1-120)||(1038130-1038248)
chr1 (1-120)||(1045036-1045154)
chr1 (7-122)||(38817996-38818109)
chr1 (5-138)||(48265091-48265221)
chr1 (1-198)||(52759075-52759270)
chr1 (1-97)||(11248828-11248922)
chr1 (3-122)||(8008240-8008357)
chr1 (70-213)||(1428519-1428662)
chr1 (1-216)||(8973429-8973641)
chr1 (1-53)||(19093315-19093367)
chr1 (1-144)||(42787335-42787476)
chr1 (1-97)||(50152480-50152574)
chr1 (1-102)||(1859142-1859239)
chr1 (1-80)||(52825324-52825401)
chr1 (156-207)||(45230717-45230768)
chr1 (152-198)||(1039067-1039113)
chr1 (152-198)||(1045973-1046019)
chr1 (1-51)||(35605505-35605555)
chr1 (132-202)||(36850813-36850883)
chr1 (159-213)||(48264756-48264810)
chr1 (159-202)||(41155477-41155520)
chr1 (161-203)||(15675327-15675369)
chr1 (157-202)||(22154628-22154674)
chr1 (4-58)||(37296858-37296912)
chr1 (152-202)||(42787144-42787194)
chr1 (2-51)||(5597871-5597920)
chr1 (165-198)||(52825479-52825512)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (1-210)||(27992287-27992494)
chr3 (1-199)||(47069860-47070056)
chr3 (1-202)||(54898086-54898285)
chr3 (1-213)||(54106310-54106520)
chr3 (1-213)||(34266429-34266637)
chr3 (1-213)||(43554437-43554646)
chr3 (1-202)||(790597-790796)
chr3 (1-202)||(19550293-19550492)
chr3 (1-202)||(53745282-53745480)
chr3 (1-215)||(29698038-29698250)
chr3 (3-213)||(45101347-45101555)
chr3 (1-194)||(51697571-51697763)
chr3 (3-213)||(27483777-27483983)
chr3 (1-213)||(29651715-29651925)
chr3 (18-213)||(43945443-43945636)
chr3 (1-198)||(24981337-24981532)
chr3 (1-198)||(52663489-52663684)
chr3 (1-199)||(51244671-51244867)
chr3 (3-213)||(42671879-42672087)
chr3 (1-213)||(13158428-13158638)
chr3 (1-213)||(43775379-43775589)
chr3 (3-202)||(52627238-52627434)
chr3 (1-213)||(3376293-3376507)
chr3 (1-199)||(46973470-46973666)
chr3 (1-214)||(33491127-33491338)
chr3 (1-202)||(35315179-35315378)
chr3 (3-199)||(6902327-6902521)
chr3 (1-213)||(32980687-32980897)
chr3 (3-198)||(28885727-28885919)
chr3 (1-202)||(36234414-36234610)
chr3 (1-198)||(41168808-41169000)
chr3 (1-213)||(49123570-49123779)
chr3 (3-199)||(39866852-39867046)
chr3 (1-213)||(45145176-45145385)
chr3 (1-202)||(13168064-13168251)
chr3 (1-213)||(41926724-41926937)
chr3 (1-213)||(51219082-51219283)
chr3 (1-198)||(17102801-17102996)
chr3 (1-207)||(25983658-25983861)
chr3 (7-178)||(40139858-40140027)
chr3 (21-214)||(29803727-29803906)
chr3 (3-144)||(45513673-45513812)
chr3 (1-213)||(3643185-3643394)
chr3 (1-213)||(50091992-50092202)
chr3 (1-199)||(54911305-54911500)
chr3 (1-138)||(7328502-7328637)
chr3 (1-202)||(11473449-11473648)
chr3 (1-213)||(27039595-27039805)
chr3 (1-201)||(51064930-51065128)
chr3 (4-213)||(24053-24260)
chr3 (1-221)||(20105239-20105438)
chr3 (5-202)||(33074278-33074472)
chr3 (1-214)||(40010652-40010863)
chr3 (1-213)||(5243925-5244134)
chr3 (1-202)||(47104155-47104354)
chr3 (5-215)||(41425681-41425888)
chr3 (1-213)||(30861533-30861741)
chr3 (1-213)||(33874535-33874745)
chr3 (1-202)||(48152032-48152231)
chr3 (1-183)||(32853967-32854147)
chr3 (1-198)||(45055234-45055429)
chr3 (1-202)||(52175767-52175965)
chr3 (1-213)||(20848713-20848918)
chr3 (16-214)||(32853348-32853542)
chr3 (4-213)||(41351183-41351390)
chr3 (1-202)||(42515174-42515371)
chr3 (64-198)||(29458207-29458341)
chr3 (1-174)||(55141504-55141675)
chr3 (5-213)||(40318917-40319122)
chr3 (1-213)||(48214114-48214312)
chr3 (1-213)||(27028004-27028214)
chr3 (1-213)||(35077434-35077644)
chr3 (1-202)||(54334183-54334382)
chr3 (1-202)||(52173794-52173991)
chr3 (30-213)||(28943523-28943704)
chr3 (3-183)||(49168413-49168591)
chr3 (1-122)||(53282026-53282145)
chr3 (1-213)||(34750702-34750911)
chr3 (1-69)||(44544300-44544368)
chr3 (140-218)||(45513302-45513380)
chr3 (140-213)||(7329008-7329081)
chr3 (1-213)||(26748400-26748609)
chr3 (152-215)||(2858564-2858627)
chr3 (1-202)||(23771334-23771533)
chr3 (1-213)||(35458493-35458703)
chr3 (1-95)||(28226474-28226564)
chr3 (74-138)||(44544091-44544155)
chr3 (64-202)||(8236895-8237033)
chr3 (3-48)||(44092181-44092226)
chr3 (7-138)||(42671477-42671605)
chr3 (4-121)||(22099905-22100020)
chr3 (160-202)||(28226620-28226662)
chr3 (1-67)||(43159893-43159959)
chr3 (64-169)||(36370861-36370966)
chr3 (152-199)||(44543734-44543781)
chr3 (1-95)||(53290868-53290960)
chr3 (1-35)||(2642757-2642791)
chr3 (4-121)||(22173921-22174036)
chr3 (1-41)||(2154198-2154238)
chr3 (72-207)||(3114385-3114520)
chr3 (157-213)||(47843832-47843888)
chr3 (61-97)||(53055336-53055372)
chr3 (1-138)||(24569597-24569732)
chr3 (1-67)||(47843971-47844037)
chr3 (5-54)||(29458865-29458914)
chr3 (157-202)||(53290761-53290806)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-213)||(3621637-3621847)
chr6 (1-202)||(24663426-24663625)
chr6 (1-210)||(17123972-17124177)
chr6 (4-214)||(1751414-1751622)
chr6 (1-197)||(373770-373964)
chr6 (1-213)||(17193205-17193415)
chr6 (1-213)||(23923697-23923907)
chr6 (1-213)||(364526-364737)
chr6 (1-202)||(12732223-12732421)
chr6 (1-202)||(17835940-17836139)
chr6 (1-202)||(26470718-26470917)
chr6 (1-213)||(22050096-22050305)
chr6 (1-202)||(8992595-8992795)
chr6 (1-202)||(9017042-9017242)
chr6 (1-213)||(32359424-32359629)
chr6 (1-198)||(1252212-1252408)
chr6 (1-202)||(7632032-7632231)
chr6 (44-214)||(3850408-3850578)
chr6 (1-217)||(8176483-8176694)
chr6 (4-202)||(23777346-23777542)
chr6 (1-213)||(30416059-30416269)
chr6 (1-215)||(9838104-9838316)
chr6 (1-214)||(17251238-17251450)
chr6 (1-136)||(30388768-30388901)
chr6 (1-219)||(7056118-7056334)
chr6 (3-213)||(34607147-34607355)
chr6 (1-216)||(11676596-11676807)
chr6 (1-202)||(22784663-22784862)
chr6 (1-211)||(11128878-11129086)
chr6 (66-213)||(26485669-26485816)
chr6 (1-202)||(31244744-31244943)
chr6 (3-202)||(1249588-1249785)
chr6 (1-171)||(27313547-27313718)
chr6 (1-213)||(34378906-34379116)
chr6 (1-210)||(11431144-11431351)
chr6 (1-215)||(33260747-33260964)
chr6 (1-199)||(24356052-24356248)
chr6 (1-196)||(24635755-24635948)
chr6 (122-213)||(30388932-30389023)
chr6 (3-213)||(34730609-34730816)
chr6 (1-199)||(32250950-32251144)
chr6 (5-209)||(17601121-17601329)
chr6 (1-122)||(31854564-31854685)
chr6 (1-144)||(7235487-7235628)
chr6 (10-202)||(1923907-1924098)
chr6 (3-127)||(52712-52834)
chr6 (1-121)||(30237025-30237143)
chr6 (4-213)||(22400548-22400755)
chr6 (1-198)||(11000809-11001003)
chr6 (1-202)||(7170199-7170398)
chr6 (1-200)||(13597457-13597652)
chr6 (1-207)||(15432718-15432921)
chr6 (74-198)||(19645721-19645847)
chr6 (1-202)||(19812003-19812202)
chr6 (104-213)||(24949255-24949364)
chr6 (124-199)||(53798-53874)
chr6 (1-110)||(24948290-24948397)
chr6 (1-41)||(3849112-3849152)
chr6 (5-215)||(1135163-1135369)
chr6 (1-144)||(2381062-2381203)
[»] chr5 (116 HSPs)
chr5 (4-213)||(8825089-8825296)
chr5 (1-213)||(39073073-39073283)
chr5 (1-213)||(4175460-4175670)
chr5 (1-213)||(34261341-34261551)
chr5 (1-213)||(2673958-2674168)
chr5 (1-215)||(9076100-9076312)
chr5 (1-215)||(25343989-25344201)
chr5 (1-202)||(18020759-18020958)
chr5 (1-213)||(1087913-1088123)
chr5 (4-213)||(7579647-7579855)
chr5 (1-199)||(10359229-10359425)
chr5 (1-221)||(18794812-18795030)
chr5 (2-202)||(26854086-26854283)
chr5 (3-213)||(38910305-38910512)
chr5 (1-202)||(12664887-12665086)
chr5 (1-198)||(38017272-38017467)
chr5 (1-202)||(38363220-38363417)
chr5 (1-213)||(1297717-1297928)
chr5 (1-213)||(6072481-6072691)
chr5 (1-202)||(7403881-7404080)
chr5 (1-202)||(42911579-42911778)
chr5 (1-213)||(14793770-14793980)
chr5 (4-202)||(38702173-38702369)
chr5 (1-198)||(12869894-12870089)
chr5 (1-212)||(28024240-28024449)
chr5 (1-202)||(6754170-6754369)
chr5 (3-199)||(4098362-4098556)
chr5 (1-213)||(16124240-16124450)
chr5 (1-217)||(4985151-4985365)
chr5 (1-202)||(6689628-6689827)
chr5 (4-217)||(8229780-8229990)
chr5 (1-198)||(24074833-24075028)
chr5 (1-198)||(40198817-40199012)
chr5 (1-200)||(2133901-2134096)
chr5 (3-213)||(4017445-4017653)
chr5 (8-213)||(22582508-22582710)
chr5 (1-198)||(36239487-36239682)
chr5 (1-199)||(28446979-28447174)
chr5 (1-216)||(4427382-4427596)
chr5 (1-210)||(18465730-18465933)
chr5 (3-213)||(9127331-9127539)
chr5 (1-202)||(37303098-37303297)
chr5 (1-213)||(12784423-12784632)
chr5 (9-213)||(18437303-18437505)
chr5 (1-183)||(4694793-4694973)
chr5 (1-198)||(4962183-4962376)
chr5 (3-213)||(12722939-12723147)
chr5 (1-196)||(32389015-32389208)
chr5 (1-213)||(38502784-38502990)
chr5 (1-202)||(5119207-5119406)
chr5 (1-218)||(37809788-37810003)
chr5 (1-213)||(28463365-28463575)
chr5 (3-122)||(4688869-4688986)
chr5 (3-202)||(39893800-39893997)
chr5 (1-213)||(6007912-6008124)
chr5 (1-202)||(7408360-7408559)
chr5 (1-213)||(38297596-38297806)
chr5 (4-198)||(24228980-24229172)
chr5 (3-213)||(37306679-37306887)
chr5 (1-213)||(31803353-31803563)
chr5 (1-201)||(37633705-37633903)
chr5 (1-175)||(19831560-19831730)
chr5 (10-202)||(13461048-13461238)
chr5 (1-188)||(32439917-32440102)
chr5 (1-202)||(13703126-13703325)
chr5 (1-208)||(26906520-26906724)
chr5 (74-192)||(31546000-31546118)
chr5 (1-202)||(1795108-1795307)
chr5 (1-201)||(7466211-7466409)
chr5 (20-220)||(38308099-38308297)
chr5 (1-144)||(31802817-31802958)
chr5 (8-198)||(3243832-3244020)
chr5 (3-213)||(24469617-24469825)
chr5 (1-183)||(5144008-5144188)
chr5 (1-202)||(5842984-5843183)
chr5 (1-213)||(425158-425362)
chr5 (3-199)||(3892843-3893036)
chr5 (74-199)||(25027569-25027694)
chr5 (11-122)||(38297873-38297982)
chr5 (3-200)||(12637940-12638128)
chr5 (1-176)||(21606275-21606448)
chr5 (1-202)||(40208965-40209158)
chr5 (80-206)||(6330927-6331053)
chr5 (84-198)||(30368130-30368244)
chr5 (74-213)||(3686790-3686929)
chr5 (144-215)||(10889166-10889237)
chr5 (1-202)||(18392962-18393161)
chr5 (1-207)||(40927182-40927385)
chr5 (1-118)||(7735158-7735273)
chr5 (1-207)||(8849124-8849329)
chr5 (124-202)||(38297516-38297594)
chr5 (10-213)||(18000377-18000571)
chr5 (1-97)||(18676511-18676605)
chr5 (1-97)||(25785936-25786030)
chr5 (1-69)||(25027846-25027914)
chr5 (1-199)||(31985044-31985240)
chr5 (1-117)||(38160321-38160432)
chr5 (76-203)||(42393738-42393865)
chr5 (69-198)||(17869297-17869427)
chr5 (1-217)||(21157662-21157876)
chr5 (1-97)||(21150521-21150615)
chr5 (1-198)||(9958878-9959067)
chr5 (1-202)||(4440118-4440317)
chr5 (3-42)||(10889243-10889282)
chr5 (1-175)||(11413548-11413720)
chr5 (1-67)||(36481104-36481170)
chr5 (1-97)||(4609053-4609147)
chr5 (28-180)||(23418602-23418752)
chr5 (152-199)||(4688815-4688862)
chr5 (155-202)||(31803118-31803165)
chr5 (1-79)||(42394242-42394318)
chr5 (106-199)||(7834059-7834155)
chr5 (157-198)||(13957155-13957196)
chr5 (140-202)||(7734775-7734837)
chr5 (5-54)||(3686427-3686476)
chr5 (157-202)||(36481258-36481303)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-213)||(69147-69356)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (3-213)||(26111-26319)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (1-202)||(49194-49392)
scaffold0024 (146-198)||(89360-89412)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-215)||(77135-77347)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-213)||(148350-148560)
scaffold0002 (1-202)||(138737-138924)
scaffold0002 (1-97)||(369452-369544)
scaffold0002 (1-83)||(492454-492534)
[»] scaffold0831 (1 HSPs)
scaffold0831 (1-202)||(2854-3055)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (1-163)||(1-161)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-215)||(419474-419686)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (1-212)||(4563-4770)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (43-198)||(195586-195738)
scaffold0014 (3-51)||(195882-195930)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-215)||(184109-184321)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-218)||(30671-30886)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (3-213)||(224-431)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-213)||(147111-147322)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-144)||(14774-14915)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-202)||(7471-7670)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (1-202)||(362-561)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (31-198)||(1818-1981)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-69)||(72073-72141)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-202)||(96056-96255)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-202)||(14245-14444)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (1-213)||(599-809)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-97)||(23183-23277)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (1-92)||(1080-1169)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-92)||(6460-6549)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-202)||(252641-252840)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-101)||(21019-21117)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (153-202)||(91867-91916)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31430606 - 31430816
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430606 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 31430703  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430704 aggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 31430803  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  31430804 aacagaggtagta 31430816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41891317 - 41891527
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41891317 tcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatattgtcctgagttatttattgcggaga--gagaaatatataaaatgatatattaaatgaata 41891414  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41891415 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 41891514  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
     | ||||||||||    
T  41891515 cacagaggtagta 41891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 7312667 - 7312863
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  7312667 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagg 7312764  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7312765 tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattacaaaggaa 7312863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32966245 - 32966046
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32966245 tcaaagttaaatgcaacattaaatgttggtttaccaatattgtccttagttatttattacagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 32966148  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32966147 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagg 32966048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33100029 - 33099821
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33100029 tcaaagttcaatgcaacattaaatcttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagata----aatatatgaaatgagatattaaatgaata 33099934  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  33099933 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaag 33099834  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  33099833 aacggaggtagta 33099821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 18470354 - 18470553
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18470354 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 18470451  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  18470452 aggtcgttatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatattaaaatgcgacaattaaaaagg 18470551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32528524 - 32528314
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32528524 tcaaagttcaatgaaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 32528427  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  32528426 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatg 32528327  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  32528326 aacggaggtagta 32528314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29497730 - 29497534
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29497730 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttcgttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 29497633  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29497632 aggtcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttgattgtcctggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 29497534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22951014 - 22950807
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22951014 tcaaaattcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattctccttagttatttattacagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 22950917  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22950916 atgtcattataataaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaagg 22950817  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    || |||||||    
T  22950816 aacagaggta 22950807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 36922288 - 36922486
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36922288 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataag 36922385  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaa-tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 201  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36922386 gtcattatagtaaaaacatagcttattgcatcaaaaagtaatatcaattgttgattgtcttgatttatttaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 36922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44480336 - 44480156
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480336 aaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgt-ga-agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 44480239  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatg 185  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480238 gtcattatagtaaaaatatagcttattgcataaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatg 44480156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12838274 - 12838076
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12838274 tcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaataaata 12838177  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12838176 aggttattatagtaaaggtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 12838077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 33173854 - 33174064
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33173854 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagag--agagaaatatatgaaatgagattttaaatgaata 33173951  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33173952 agatcattatattaaaagtacaacttattgtatcaaaagtagtaacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 33174051  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  33174052 aacggaggtagta 33174064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41675382 - 41675173
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  41675382 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcaaagaaata--aatatattaaataaaatattaaatgaata 41675285  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41675284 aggtcgttatagtaaaactatagcttattgcatcaaaaatag-atcaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 41675186  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  41675185 aacagaggtagta 41675173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732059
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5732267 aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagaga--aatatatgaaatgagattttaaatgaataag 5732170  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732169 gtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 5732070  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  5732069 cggaggtagta 5732059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29722494 - 29722291
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  29722494 ttcaatgcaatattaaatgttgttttactaatattgtccttaattatttattgcggagataga--aatatatgaaataagatattaaataaataag-tca 29722398  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29722397 ttatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcgattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgttaaaatgtgacaattataaaggaacaga 29722298  T
Q  207 ggtagta 213  Q
    |||||||    
T  29722297 ggtagta 29722291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 213
Target Start/End: Original strand, 8381908 - 8382083
Alignment:
Q  36 aatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8381908 aatattgtccttagttatttattgcggggaga--gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatca 8382005  T
Q  136 aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8382006 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 8382083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20035095 - 20035255
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20035095 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 20035192  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20035193 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaatatcaattgttgattgtcttg 20035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20045506 - 20045666
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045506 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 20045603  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20045604 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaatatcaattgttgattgtcttg 20045666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26632376 - 26632215
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26632376 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 26632279  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgg 164  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  26632278 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcatttgttatttgtcttgg 26632215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 8265011 - 8265206
Alignment:
Q  14 caacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  8265011 caacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgcggagagagaga----tatgtaatgagatattaaattaataaggttattatagt 8265106  T
Q  114 aaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  8265107 aaaaatatagtttattgcatcaaaaggagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 8265206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31399127 - 31398932
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31399127 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattg-ag-gagagataaatatatgaaatgagatat-aaatgaata 31399031  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31399030 aggtcattatagtaaaagtatagtttattatatcaaaagtagtatcaatttttaattgtcttggtttatgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaag 31398932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7477394 - 7477198
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7477394 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccgatattatccttagttatttattac-ga-agagagaaatatatgaaatgagatattaaattaata 7477297  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7477296 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaag 7477198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17896719 - 17896569
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17896719 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 17896622  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgtt 153  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17896621 aggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgtt 17896569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33921970 - 33921760
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33921970 tcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccgatattatccttaattatttattac-ga-agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 33921873  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||  |||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33921872 aggtcattatagtaaaaatataatttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagg 33921773  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  33921772 aacggaggtagta 33921760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 3837909 - 3838109
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3837909 tcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttattgcggaaagata--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 3838006  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3838007 aggtcattatagtaaaagtataacttatggcatcaaaagtaataacaattattgattgtcttgatttgcgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 3838106  T
Q  201 aat 203  Q
    |||    
T  3838107 aat 3838109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 26723971 - 26724171
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26723971 tcaaaattcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattacccttaattatttattgtggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 26724068  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc-aaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26724069 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaataatcattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaatgtgacaattaaaaag 26724168  T
Q  200 gaa 202  Q
    |||    
T  26724169 gaa 26724171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36298370 - 36298164
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36298370 tcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattacccttaattatttatttcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 36298273  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36298272 aagtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaag 36298173  T
Q  201 aatagaggt 209  Q
    || ||||||    
T  36298172 aagagaggt 36298164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 10227303 - 10227513
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  10227303 tcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattatcctttgttatttattgcggagggaga--aatatataaaatgagatgttaaattaata 10227400  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10227401 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaataattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 10227500  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  10227501 aacggaggtagta 10227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38168968 - 38168774
Alignment:
Q  18 attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38168968 attaagtgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaa 38168871  T
Q  118 gtatagcttattgcatcaaaaatagtatc-aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  38168870 gtataacttattgcatcaaaaatagtaacaaattaatgattgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38168774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 33257928 - 33258141
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33257928 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttggttatttatt--atggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaata 33258025  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33258026 aggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagg 33258125  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||  ||||||||||||    
T  33258126 aacggaggtagtacta 33258141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35746840 - 35746642
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35746840 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgc---gaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 35746744  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||  |||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35746743 aggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 35746644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42842062 - 42841863
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  42842062 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaaca 42841965  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42841964 aggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 42841866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31815264 - 31815066
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31815264 tcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 31815167  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||| |||||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  31815166 agaccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaac-attattgattatcttgatttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaagg 31815068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36648201 - 36648011
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |    
T  36648201 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaattaaca 36648104  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 194  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36648103 aggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaa-gtgacaatta 36648011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Original strand, 47408227 - 47408370
Alignment:
Q  70 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgt 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||    
T  47408227 gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgt 47408326  T
Q  170 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47408327 gtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 47408370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30866932 - 30866721
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  30866932 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttaccaacattacccttagttatttattacggagagaga--aatatataaaataagatattaaatgacta 30866835  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||  ||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  30866834 aggctattatagtaaacatataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaagg 30866735  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    ||  ||||||||||    
T  30866734 aacggaggtagtac 30866721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35112476 - 35112671
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35112476 tcaaagttcattgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagttatttattg--tggagagaaaaatatataaaatgagatattaaataaata 35112573  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |  | |||||||||||| |||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35112574 aagttattatagtaaaaatatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 35112671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 28608646 - 28608851
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |    
T  28608646 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggt 28608742  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaata 204  Q
     |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28608743 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaaca 28608842  T
Q  205 gaggtagta 213  Q
    || ||||||    
T  28608843 gatgtagta 28608851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37354041 - 37353855
Alignment:
Q  26 ttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagct 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||    
T  37354041 ttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaact 37353944  T
Q  126 tattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaa-ttaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||||||||| | || |||| |||||||| ||| |||||||||    
T  37353943 tattgcatcagaagtagtaacaattattgattgttttgattcatgtaaaatgtcaacaagtaacaacttaaaaagaaattgaggtagta 37353855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 36406798 - 36406997
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||   || |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  36406798 tcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgc--ggatagagaaatatattaaataagatattaaatgacta 36406895  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattg---tcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36406896 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaa 36406995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18194410 - 18194211
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18194410 tcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgttttaccaacattacccttatatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 18194313  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||| | |    |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  18194312 aggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatttgaaaaactgacaattaaaaagg 18194213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41889511 - 41889372
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41889511 aaagttcaatgcaactttaaatattgttttatcaatattattcttagttatttattgc-ga-agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 41889414  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    |  ||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||    
T  41889413 actattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 41889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 3310265 - 3310464
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  3310265 aaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattactcttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgatataaaatattaaatgaataag 3310362  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||||          |||||||||||| || ||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3310363 gtcattatagtaaa----------attgcatcaaaagtaata-atattattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaa 3310451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43874272 - 43874080
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  43874272 ttcaatgcaacattaaatgttattttgccaatattatcattacttatttattgcagata---agaaatacatgaaattagatattcaatgaataaggtta 43874176  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||  ||  || ||| ||||||| ||||| || || |||| ||| || ||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  43874175 ttatagtaaaagagtatattgttgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtatttgttcgtgtaaaatgtcaaaaagagaccattaaaaaggaa 43874080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22382268 - 22382153
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||| ||||||| ||| ||||||||| || |    
T  22382268 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattatccttagatatttattgcaga----gagaaacatatgaattgaaatattaaattaaca 22382173  T
Q  101 agatcattatagtaaaagta 120  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22382172 aggtcattatagtaaaagta 22382153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 185
Target Start/End: Original strand, 45324092 - 45324250
Alignment:
Q  22 aatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtat 121  Q
    |||| ||||||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  45324092 aatgatgttttatcaatattactcttaattatttattgcggaga--gagaaatatataaaataagatattaaataaataaaatcattataataaaagtat 45324189  T
Q  122 agcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatg 185  Q
    | |||||||||||||||||| |   |||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  45324190 aacttattgcatcaaaaataat---aataattgattgtattggtttgtgtaaaatgttaaaatg 45324250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 6799170 - 6799283
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagat-attaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  6799170 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttaattatttatt--acggagagagaaatatataaaatgatataattaaatgaat 6799267  T
Q  100 aagatcattatagtaa 115  Q
    |||| |||||||||||    
T  6799268 aagaccattatagtaa 6799283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17896555 - 17896477
Alignment:
Q  135 aaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17896555 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17896477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44820791 - 44820608
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    ||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44820791 aaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacatttagttatttatttcggagagaaa--aatatatgaaataaaatattaaatgaataag 44820694  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
     | |||||||||||          || ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44820693 gttattatagtaaa----------atggcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatatgacagttaaaaa 44820608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24283629 - 24283825
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||     |||||||| |||| || ||| ||||||||| || |    
T  24283629 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagatatttattgc----ggagagaaacatataaattgaaatattaaattaaca 24283724  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||| |  | |||  ||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  24283725 aagtcattatagtaaaagta-aaataattatatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttagtttgtgtaaaaggtaaaaaaatgacaattaaaaagg 24283823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9602089 - 9601890
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| | ||    
T  9602089 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagaga--gagaaatataagaaatatgatattaaataatta 9601992  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||   |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9601991 aggatattataagcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 9601892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9829660 - 9829461
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| | ||    
T  9829660 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagaga--gagaaatataagaaatatgatattaaataatta 9829563  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||   |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9829562 aggatattataagcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 9829463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 3177977 - 3178187
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |    
T  3177977 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgccgttattacccttggttatttattgc--agagagagaaatatatgaaaagatatattaaatgacga 3178074  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  |  |  |  |||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||    
T  3178075 aggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtcaaaaatctaaaagtgacaattaaaaagg 3178174  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||| ||||    
T  3178175 aacagagggagta 3178187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22057612 - 22057510
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga----gagaaatatatgaaatgagatattaaatg 96  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22057612 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagatattaaatg 22057513  T
Q  97 aat 99  Q
    |||    
T  22057512 aat 22057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46286041 - 46285855
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||    
T  46286041 tcaaagttcaatgcaagaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattgc--gtagagagaaatatatgaaataaaatattaaattacta 46285944  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgac 189  Q
    ||   | |||||||||||||||  ||| || || | ||| | || || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46285943 aggctaatatagtaaaagtataaattactgtataagaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgac 46285855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 35860014 - 35860211
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||||| |||||||||    ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||    
T  35860014 tcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttagtaatttattgc----agagagaaatataagaaatatgatattaaataatta 35860109  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  ||||||| ||||  |||  |||||||||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  35860110 agaatattatagaaaaaccataagttattgcatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtaacaattaaaaagg 35860209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8380758 - 8380578
Alignment:
Q  31 ttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg 130  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |  ||||||    
T  8380758 ttaccaacattacccttagttatttatt--acggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtaaaaattattg 8380661  T
Q  131 catcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
     || | |||  ||| || || |||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||  |||||||||    
T  8380660 tataagaaaaggtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaatggacagttaaaaaggaacggaggtagta 8380578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17354222 - 17354105
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17354222 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatattacccttagatatatattgc-ga-aaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 17354125  T
Q  101 agatcattatagtaaaagta 120  Q
    || ||||||||  |||||||    
T  17354124 aggtcattataagaaaagta 17354105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 34368855 - 34368657
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34368855 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgc-ga-agagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 34368758  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||  |||||||||| |    |||| ||||||| || ||   ||| || ||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34368757 aggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaata-atattattaattttcttaatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagg 34368659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 117
Target Start/End: Original strand, 1553565 - 1553674
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    ||| |||||| | ||  ||||||||||||||     
T  1553565 aagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacagagaga----aatgtatgaagttagtgattaaatgaataagg 1553660  T
Q  104 tcattatagtaaaa 117  Q
    | ||||||||||||    
T  1553661 ttattatagtaaaa 1553674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 42881021 - 42881113
Alignment:
Q  8 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||   ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  42881021 tcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttggttattgattgc--ggagagagaaatatataaaattagatgttaaatgaataag 42881113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 6799588 - 6799676
Alignment:
Q  125 ttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6799588 ttatcgcatcaaaaatagtaacaatcactgactgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 6799676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19327977 - 19327788
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||| ||||| | ||  ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  19327977 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactcttatttatt-actgtggagggaga--aatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 19327881  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
       |||| ||||| || |  |||||| ||||||| ||| |  | || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19327880 ---tata-taaaa-taaaaattattgtatcaaaagtagcaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaa 19327788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30586856 - 30586758
Alignment:
Q  17 cattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 116  Q
    |||||||||||| |||| | |||||  |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  30586856 cattaaatgttgatttatctatattacccttagatatttactgcagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaa 30586759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8966096 - 8965897
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  8966096 tcaaagttcaatgcaacattaaacattgttttacctttattacccttgattatttattg--tagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatga 8965999  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || ||| ||||||| |||||  || | ||  ||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8965998 aggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgcgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 8965900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 46563319 - 46563225
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||  || ||||  ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  46563319 tcaaagttcagtacaacattaaatattgttttgacattattacccttgattatttattgtagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatga 46563225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48981575 - 48981365
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  | |||||||||||  |    
T  48981575 tcaaagttcaatataacattaaatgttgttttgcctttattacccttagttatttattgcagaga-tga-aaatatatgaaaaaaaatattaaatgatga 48981478  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  |  |  |  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  48981477 aggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtcaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 48981379  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    ||| ||||| ||||    
T  48981378 gaacagaggaagta 48981365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46715355 - 46715304
Alignment:
Q  156 ttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagag 207  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46715355 ttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagag 46715304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41889041 - 41888991
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  41889041 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgataattaaaaaggaa 41888991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 41409806 - 41409766
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41409806 tcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41409766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41410000 - 41409852
Alignment:
Q  67 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtt 166  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |    |||| ||||||| || || || || || ||||||||| ||    
T  41410000 agagagatgtataaaatgaaatattaaattaataaggccattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaattaataacatttattaattgtcttgatt 41409901  T
Q  167 tgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtact 215  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||    
T  41409900 tgtgtaaaatgataaaaagtgacaattaagaatgaatggagatagtact 41409852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 47459694 - 47459895
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaat-gttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||  | ||||||||      ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  47459694 aagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatattatccttgctcatttattg----tggagagaaatatatcaaatgaaatattaaataaataag 47459789  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | |||||||||||| ||||  ||||||  ||||     | | || || |||| ||||||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  47459790 gttattatagtaaaaatatatattattg-ttcaa----tgcaacatttattgaatgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaa 47459884  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  47459885 cggaggtagta 47459895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26803624 - 26803532
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26803624 aaagttcaatacaacattaaatattgttttccccttattacccttgattatttat--cgtagagagagaaatatataaaatgagatattaaatga 26803532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Original strand, 22786079 - 22786125
Alignment:
Q  156 ttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22786079 ttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaagggaa 22786125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 33071953 - 33072032
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaa 82  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33071953 tcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttaataatttattgc--agagagagaaatatatgaaa 33072032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 117
Target Start/End: Original strand, 35684260 - 35684314
Alignment:
Q  63 agagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  35684260 agagagagaagtatatgaaatgagatattaaatgacgaagattattataggaaaa 35684314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 36340583 - 36340633
Alignment:
Q  153 tgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  36340583 tgattgtcttggtttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaaggaat 36340633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Original strand, 42881118 - 42881199
Alignment:
Q  125 ttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagag 207  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  42881118 ttattgcatcaaaagtagtaaaaattattaattgtcttggtttgtataaaatatcaaaa-ataacaattaaaaaggaacagag 42881199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41408836 - 41408776
Alignment:
Q  155 attgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtact 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  41408836 attgtcttgatttgtgtaaaatgataaaaagtgacaattaaaaatgaatggagatagtact 41408776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 2408857 - 2408827
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2408857 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 2408827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 32049460 - 32049574
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||   ||||  ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| ||    
T  32049460 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtgtctttacctatattactcttatatatttattgc--agagagataaatacatgaaatgaagtattaaatgatta 32049557  T
Q  101 agatcattatagtaaaa 117  Q
    |||  ||||||| ||||    
T  32049558 agaatattatagaaaaa 32049574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 46715498 - 46715384
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| |||||| | |||||  |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||| | ||    
T  46715498 tcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttatctatattacccttatatatttattgctgagagaga--aatatatggaataaaatattaaattatta 46715401  T
Q  101 agatcattatagtaaaa 117  Q
    || | ||||||| ||||    
T  46715400 aggttattataggaaaa 46715384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17351705 - 17351669
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtga 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17351705 ttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtga 17351669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 153)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13629387 - 13629177
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13629387 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 13629290  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13629289 aggttattatagtaaaagtatagcttattgcatgaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 13629190  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  13629189 aacagaggtagta 13629177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16464976 - 16464766
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16464976 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttagtgcagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 16464879  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16464878 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtctaggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaagg 16464779  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  16464778 aacggaggtagta 16464766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 44069081 - 44069291
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44069081 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgttcttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 44069178  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44069179 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaga 44069278  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  44069279 aacggaggtagta 44069291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 44217759 - 44217966
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44217759 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaagaagg 44217856  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44217857 tcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 44217956  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  44217957 ggaggtagta 44217966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44014107 - 44013897
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44014107 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagata--aatatatgaaatgagatattaaataaata 44014010  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014009 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtttcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 44013910  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  44013909 aacggaggtagta 44013897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 8735439 - 8735650
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8735439 tcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagaaa--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 8735536  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8735537 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 8735636  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    ||  ||||||||||    
T  8735637 aacggaggtagtac 8735650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 46871971 - 46872170
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46871971 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaata 46872068  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46872069 aggtcattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatttaaaagg 46872168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 39671375 - 39671585
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39671375 tcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttaattatttattgcagagaaaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 39671472  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  39671473 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataatgtgacaattaaatagg 39671572  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  39671573 aacggaggtagta 39671585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35232492 - 35232297
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35232492 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 35232395  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35232394 aggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagcagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 35232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38617501 - 38617293
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38617501 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 38617404  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38617403 aggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattg--ttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 38617306  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  38617305 aacggaggtagta 38617293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16664291 - 16664481
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16664291 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccagtattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16664388  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16664389 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 16664481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21044941 - 21044732
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21044941 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagaga--aatatatgcaatgagatattaaataaata 21044844  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21044843 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataa-taaaaagg 21044745  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  21044744 aacggaggtagta 21044732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53599980 - 53599770
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53599980 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgtgatattaaatgaata 53599883  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53599882 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagg 53599783  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  53599782 aacggaggtagta 53599770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5374544 - 5374348
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5374544 tcaaagctcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 5374447  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5374446 agatcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 5374348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39683906 - 39683698
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39683906 aaagttcaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtccttagttatttattacagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataag 39683809  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39683808 atcgttatactaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtgaaaatgtgataattaaaaaggaa 39683709  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  39683708 cggaggtagta 39683698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 48782250 - 48782444
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48782250 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaat-agatattaaatgaata 48782346  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48782347 aggtcattatagtaaaagtattgcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 48782444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 35231740 - 35231939
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35231740 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataaaatattaaatgaata 35231837  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35231838 aagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 35231937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 29295404 - 29295599
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29295404 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 29295501  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29295502 aggtcattatattaaaagtataacttattgcatcgaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgataattaaaaa 29295599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22678503 - 22678293
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22678503 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtaatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 22678406  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22678405 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaatagtagtatcaattgttgattatcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatg 22678306  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  22678305 aacggaggtagta 22678293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 56576297 - 56576088
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56576297 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaaa--aatatatgaaatg-gatattaaatgaata 56576201  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56576200 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaggtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 56576101  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  56576100 aacggaggtagta 56576088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 36408773 - 36408969
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36408773 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattctctttagttatttatagcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattgaattaata 36408870  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36408871 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36408969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 36422939 - 36423135
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36422939 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaacaatattctctttagttatttatagcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattgaattaata 36423036  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36423037 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36423135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3436261 - 3436066
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3436261 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagaga--aatatatgaaatgaaatattaaattaata 3436164  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3436163 aggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaa 3436066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19093347 - 19093148
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19093347 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagg--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 19093250  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19093249 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 19093150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 23237677 - 23237879
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagag-agaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23237677 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagatattaaatgaat 23237776  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23237777 aaggtcattatagtaaaagtatagcttatcgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttctagtttgtgtaaaatgttaaaatgtaacaattaaaaag 23237876  T
Q  200 gaa 202  Q
    |||    
T  23237877 gaa 23237879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26620545 - 26620346
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26620545 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggataaata--aatatatgaaatgagatattaaattaata 26620448  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26620447 aggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgtttgttttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 26620348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42513220 - 42513009
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42513220 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatataaaatgtgatattaaatgaata 42513123  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc-aaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  42513122 aggtcatgatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatttcaaaaatgtgacaattaaaaat 42513023  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  42513022 gaacggaggtagta 42513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 50623464 - 50623658
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50623464 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatat-aaatgaata 50623560  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50623561 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa 50623658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 354016 - 354226
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  354016 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 354113  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  354114 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaaatagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 354213  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  354214 aacggaggtagta 354226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6195074 - 6195284
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||| || |    
T  6195074 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatgttaaataaaca 6195171  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6195172 aggtcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattatggattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 6195271  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  6195272 aacagaggtagta 6195284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22828595 - 22828385
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22828595 tcaaagttcaatgcaacattacatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcagatagaga--aatatatgaaataatatattaaatgaata 22828498  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828497 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 22828398  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  22828397 aacggaggtagta 22828385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755010
Alignment:
Q  23 atgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtata 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33755201 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc----ggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata 33755106  T
Q  123 gcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtactata 218  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  33755105 gcttattgcattaaaaggagtatcaattgttgattgtcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaatata 33755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38542470 - 38542271
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38542470 tcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgc-ga-agagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaata 38542373  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38542372 agttcattatagtaaaagtctaacttattgcatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagg 38542273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42099758 - 42099953
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42099758 tcaaagttcaatgcaacattaaatggtgttttatcaatattacccttaattatttattgcggaaagag--aaatatatgaaataagatattaaatgaata 42099855  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42099856 aggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtttaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 42099953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55147255 - 55147044
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55147255 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 55147158  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt-caaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||     
T  55147157 aggtcattacagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaataacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtaaaaaaaatgacaattaaaaaa 55147058  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  55147057 gaacggaggtagta 55147044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 53125432 - 53125240
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  53125432 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagaaaga--aatgtatgaaataagatattaaatgaata 53125335  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53125334 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcataaaaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 53125240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26906583 - 26906388
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26906583 tcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaattaata 26906486  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26906485 aggtcattaaagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaatatcaattgttgattgttttagtttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaa 26906388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 12252150 - 12252352
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12252150 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatat----------gaaatatatgaaataagatattaaatgaata 12252239  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12252240 aagtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaagg 12252339  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  12252340 aacggaggtagta 12252352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31862180 - 31861981
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| || |||||||||||    
T  31862180 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgatatgttaaatgaata 31862083  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  31862082 aggtcattatagtaaaagtataattttttgcatcaaaagtagtaacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatttcaaaaaataacaattaaaaagg 31861983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 33084528 - 33084722
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33084528 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttgttgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatgttaaataaata 33084625  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||     ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33084626 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattga-----ttggtttctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 33084720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 52061619 - 52061818
Alignment:
Q  12 tgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattata 111  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  52061619 tgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaaa--aatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattata 52061716  T
Q  112 gtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtag 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  52061717 gtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatgattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtag 52061816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 54231590 - 54231797
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaaca-ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 101  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  54231590 aaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttatt--atggaaagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaataa 54231687  T
Q  102 gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 201  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54231688 ggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagga 54231787  T
Q  202 atagaggtag 211  Q
    |  |||||||    
T  54231788 acggaggtag 54231797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19527402 - 19527215
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||            |||    
T  19527402 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatga------------ata 19527317  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19527316 aggtcattatagtaaaattatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 19527217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8741818 - 8741617
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741818 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgtggagagtga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 8741721  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgt-----gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||      ||||||||||||||||| |||||||    
T  8741720 aggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttaattgtaatggtttgtataaaataaaatgtcaaaatgtgtcaattaa 8741621  T
Q  196 aaag 199  Q
    ||||    
T  8741620 aaag 8741617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 47251463 - 47251673
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47251463 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattattcttagctatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 47251560  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  47251561 aggtcattataataaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgattattttggtttatgtaaaatgataaaatgtgacaattaaaaaga 47251660  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  47251661 aacggaggtagta 47251673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 47428579 - 47428768
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47428579 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgc--ggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 47428676  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||           ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47428677 atgtcattatagtaaaagtattacttattgcatcaaaaata----------atgattatcttgatttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 47428766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 52677339 - 52677148
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52677339 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 52677242  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||                     ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52677241 aggtcattatagtaaaag---------------------tagcatcaattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 52677163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 55702970 - 55703169
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55702970 tcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattacccttaattatttattgcagag--agagaaatatatgaaataagataataaatgaata 55703067  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55703068 aggtcgttatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 55703167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 34464331 - 34464526
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  34464331 agttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattatcattagttatttattgt-ga-agagataaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggt 34464428  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34464429 cattatattaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattattgattgttttaatttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaa 34464526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 40411993 - 40412203
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40411993 tcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttatcaatattatccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaata 40412090  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  40412091 aggtcattatagtaaaaatataacttattacatcaaaaatagtaacaattattaattgtcttaatttatgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaatagg 40412190  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || | ||||||||    
T  40412191 aacataggtagta 40412203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35381609 - 35381417
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35381609 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 35381512  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||| |||||||| | ||||    ||||||| ||||| ||||  || | | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35381511 aggtcattataataaaagtacaactta----atcaaaagtagtaacaatcattaactatcttaatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 35381417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47885179 - 47884988
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa-taag 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47885179 aagtttaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattg--gagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataag 47885082  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
     ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| || ||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47885081 gtcattatagtaaaagtcaaacttattgcatcaaaagtaataataattattgattgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 47884988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36659621 - 36659411
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| || || |    
T  36659621 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttagataaaca 36659524  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  36659523 atgtcattatagtaaaagcataacttattgcattaaaaataaaaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaagaagg 36659424  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  36659423 aacggaggtagta 36659411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Original strand, 37502079 - 37502266
Alignment:
Q  8 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||    
T  37502079 tcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatt--atggagagataaatatatgaaatgtaatattaaatgaataaggttat 37502176  T
Q  108 tatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37502177 tatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaatcaaaa 37502266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 32239452 - 32239660
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  32239452 aaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattg--tggagaaagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaa 32239548  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtc----ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
     ||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||| ||||| |||||| ||||| | | |||||||||||    
T  32239549 gtc---atagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttgattgatttgtataaaatatcaaagtataacaattaaaaa 32239645  T
Q  199 ggaatagaggtagta 213  Q
     ||| | ||||||||    
T  32239646 tgaacaaaggtagta 32239660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 30939205 - 30939415
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  30939205 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttggatatttattgc--ggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaata 30939302  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| || || || || ||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  30939303 aggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtactaccatttattgaccgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaagg 30939402  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  30939403 aacggaggtagta 30939415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 47093862 - 47094017
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||    
T  47093862 tcaaagttcaatgcatcattatatgttgttttaccaatattatcctttgttatttattgc-ga-agagagaaatatataaaatgatatgttaaattaata 47093959  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  47093960 agatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattg 47094017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44549693 - 44549887
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44549693 tcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaatattattcttagttatttattgc-ga-agagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaata 44549790  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| || ||| ||| | |||||| |||||  |||| ||||||||    
T  44549791 aggtcattataataaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaataattattgatcgttttgatttatataaaatatcaaacagtgataattaaaa 44549887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 18781529 - 18781721
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18781529 tcaaatttcaatgcaatattaaatattcttttaccaatattatctttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaattgaata 18781626  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195  Q
    || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||  |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18781627 aggtaattataataaaagtatatcttattgcatcaaaagtaataataattattgattatcttaatttgtgtaaaatgtcgaaaaatgacaattaa 18781721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23719975 - 23719768
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  23719975 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttgctcatttattg--tggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaaatgaataagg 23719878  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || |||| |||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||     
T  23719877 ttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaac 23719778  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  23719777 ggaggtagta 23719768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26933963 - 26933769
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26933963 aaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttatcgcagaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaa-gaataag 26933867  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
       ||||||||||||||||   ||||||  |||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||    
T  26933866 gatattatagtaaaagtatcaattattgtgtcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacggttaaaaagg 26933769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31984269 - 31984136
Alignment:
Q  80 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31984269 aaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtgttggtttgtgtaaaatgtc 31984170  T
Q  180 aaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  31984169 aaaaagtgacaattaaaaagaaatggatgtagta 31984136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52057645 - 52057436
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  52057645 tcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattg--tggagagagaaatatataaaatgaaatattaaataaata 52057548  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  52057547 agattattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattggattggtttgtgtaaaatgtcaaatagt-acagttaaaaagg 52057449  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  52057448 aagggaggtagta 52057436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 55935157 - 55935367
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  55935157 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttatt--atggagagagaaatacatgaaataagatattaaatgacta 55935254  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  55935255 aggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaagg 55935354  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  55935355 aacggaggtagta 55935367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4201512 - 4201375
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4201512 tcaaagttcaattcaacattaaatgttgttttactaatattatccttaattatttattgcggagagata--aatatatgaaatgaaatattaaatgaata 4201415  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaat 140  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  4201414 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcataaaaaat 4201375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52257985 - 52257789
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  52257985 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatctttagttatttattgcggagagaaa--aatatatgaaataagatattaaatgacta 52257888  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||| | || || || |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  52257887 aggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaag 52257789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 33809137 - 33809344
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33809137 tcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgttttaccaatattacccctagatatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaata 33809234  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||  ||||||||| ||  || |    |||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33809235 aggccattatagtcaatataaaaacaattgcatcaaaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 33809334  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    || |||||||    
T  33809335 aacagaggta 33809344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18135240 - 18135048
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |    
T  18135240 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-att--atagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggt 18135144  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaa-tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |||||||||||| || |  |||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18135143 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 18135048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 199
Target Start/End: Original strand, 42645379 - 42645507
Alignment:
Q  71 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtg 170  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||| |||| || | ||    
T  42645379 aaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattatcttagtatatg 42645478  T
Q  171 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42645479 taaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 42645507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49122450 - 49122258
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |    
T  49122450 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-att--atagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggt 49122354  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaa-tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |||||||||||| || |  |||||| |||||||| |||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49122353 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 49122258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9220235 - 9220020
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| |  |    
T  9220235 tcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagaga--gagaaacatatgaattgaaatattaaattagca 9220138  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || |||||||||||||| |    |||| ||||||| |||||  | || || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  9220137 aggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaaga 9220038  T
Q  201 aatagaggtagtactata 218  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  9220037 aacggaggtagtattata 9220020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 56499808 - 56499610
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  56499808 tcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttcttatattacccttatttatttattgcagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgatta 56499709  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |   ||||||| ||||  |||  || ||| |||||||||||||  |  | ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  56499708 gggctattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaggtgacaattaaaaag 56499610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 47751641 - 47751791
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| || || |  ||| | |||    
T  47751641 gagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaatagtaacatttataaattattttg 47751740  T
Q  164 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtac 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47751741 gtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaactgaggtagtac 47751791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 19399584 - 19399793
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  19399584 tcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaattacta 19399680  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||| ||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||     
T  19399681 aggctattatattaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgaaagttaaaaaga 19399780  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  19399781 aacggaggtagta 19399793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176587
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |    
T  44176777 ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagtta 44176680  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || || | ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44176679 ttataataaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgttttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaag 44176587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29833118 - 29833001
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||     
T  29833118 aaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatgttatcgttggttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgctaaatgaataaa 29833021  T
Q  103 atcattatagtaaaagtata 122  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29833020 atcattatagtaaaagtata 29833001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Original strand, 9834316 - 9834419
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9834316 aaagttcaatgcaacattaaatcttattttacatatattgtccttagttatttattgc--ggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataag 9834413  T
Q  103 atcatt 108  Q
    ||||||    
T  9834414 atcatt 9834419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 42629367 - 42629562
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||  | |||||||||||| |    
T  42629367 tcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatattacccttaattatttaatgcggaga--gagaaatttatgaaacaaaatattaaatgaaaa 42629464  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||   ||| ||||| |||||||  ||| || | ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  42629465 aggctattttagtacaagtataaattactgtaccaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaa 42629562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 30151725 - 30151917
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||     
T  30151725 aagttcaacgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttacttatttattgc--gcatagagaaatatatgaaattaaatattgaatgaataagg 30151822  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
      |||||||||||||  ||  || ||| |||||||  |||| || || |||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  30151823 ctattatagtaaaagagtatattgttgtatcaaaagcagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagagacaattaaaaa 30151917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43888033 - 43888230
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||  || ||||||||||| ||||||||| || |    
T  43888033 tcaaagttcaatacatcattaa-tgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggatagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaaca 43888129  T
Q  101 agatcattatagtaaaagta-tagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||  ||||| || || |||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43888130 aggtcattatagtaaaagtaatagca-attgtatcaaag-tagtaacatttattgattctcttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 43888227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 45725588 - 45725796
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||    
T  45725588 aaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaattatttattacagag--agagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgag 45725685  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | ||||| | ||||  |||  |||||| ||||||| ||||| || || |||| | | || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45725686 gttattattggaaaatgataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaa 45725785  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  45725786 cggaggtagta 45725796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 41415057 - 41415256
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  41415057 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagctatttatt--atggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 41415154  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  ||||||||||||||||   |||||  || | ||| |||| || || |||| ||||||  |||||||||||| | |||| || ||  |||||||||    
T  41415155 agactattatagtaaaagtatgaattattatataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttaatttgtgtaaaatattaaaaagtaaccgttaaaaagg 41415254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 9834467 - 9834540
Alignment:
Q  140 tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9834467 tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9834540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48510063 - 48509854
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||   ||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  48510063 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattactcttatatatttattgcatagagaga--aatatatgaaatgaagtattaaatgatta 48509966  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  |||  ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48509965 agaatattatagaaaaatgataaatttttgtatcaaaagtagtaaaaatatttg-ttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 48509867  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    |||||||| ||||    
T  48509866 aatagagggagta 48509854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23623689 - 23623601
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatatt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23623689 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaagtatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatatt 23623601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 27492409 - 27492509
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagt-tatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27492409 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatgcttagtcaatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaat 27492506  T
Q  100 aag 102  Q
    |||    
T  27492507 aag 27492509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 31369854 - 31370061
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||| | ||  ||||||  ||||||     
T  31369854 aagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttatt--acggagagagaaatgtatgaagttagtgattaaacaaataagg 31369951  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | ||||||||||||||||   || ||  ||||||| || || || || |||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||| ||     
T  31369952 ttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtaataacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaaaagaaac 31370051  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  31370052 ggaggtagta 31370061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Original strand, 36750600 - 36750779
Alignment:
Q  2 caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||    
T  36750600 caaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattgc--ggagagagaaatatataaaataatatattaaatgattaa 36750697  T
Q  102 gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    |   ||||||||| || ||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36750698 ggctattatagtacaaatataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtaaaaa 36750779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 42133087 - 42133283
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||   ||| |||||| ||||||  ||| || |||||| ||||    
T  42133087 tcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttatcaatattatccttagatatttattgc--ggagtgagaaacatatgatgtgaaat-ttaaatcaata 42133183  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||   |||||||||||||| | |    |||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  42133184 aggctattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatattgaaaagtgacaattaaaaag 42133283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 53691848 - 53691678
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||    || ||||||| ||||||||| | ||||||||| || |    
T  53691848 tcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaatattacccttaaatatttattg--tggaaagagaaacatatgaaataaaatattaaattaaca 53691751  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaa 173  Q
    || |||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  53691750 aggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaa 53691678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 36292672 - 36292846
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||||| |||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |    
T  36292672 ttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacttttagatatttaatgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagacaa 36292769  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    ||||| |||||||| |  | | || ||| ||| ||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36292770 ttataataaaagtaaaaataactgtatcgaaagtagtaacatttattgattgttttggttagtgtaaaatgtcaaaa 36292846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1146243 - 1146041
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1146243 tcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattgtagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgatga 1146146  T
Q  101 ag---atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
    ||   || ||||||| |||| |||   || ||||||||||| |||||  || | || ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  1146145 aggtaattattatagaaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttattatcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaa 1146047  T
Q  197 aaggaa 202  Q
    ||||||    
T  1146046 aaggaa 1146041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14949278 - 14949079
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| | ||    
T  14949278 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgcagaga--gagaaatataagaaatatgatattaaataatta 14949181  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |    || | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14949180 aggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtattggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtggcaattaaaaagg 14949081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 18091292 - 18091487
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  18091292 tcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaatttattgc--agagagagaaatatatgaaatatgatattaaataatta 18091389  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||   |||||| | |||  |||  |||||||||||||| ||||   |    || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18091390 aggatattataattaaaacataagttattgcatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaa 18091487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47596807 - 47596608
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||   |||| ||||||||| | |||| |||  ||||  |||||  | ||||||||||||||    
T  47596807 tcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaatattactcttaattatttattacggagacaga--aataattgaaacaatatattaaatgaata 47596710  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||| | ||||| |||  |||||| ||||||| ||||| || || |||| | | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47596709 aggttattattggaaaaggataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagg 47596610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33755276 - 33755205
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagt---tatttattgcagagagaga 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  33755276 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttattatttattgcagagagaga 33755205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 38865954 - 38866156
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||||  |||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  38865954 tcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-acctatattacccttggatatttgttgtagag--agagaaatatatgtaatgagatattaaatgatta 38866050  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||  ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38866051 aggttattatagaaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta--aaatatttgttgtcttaatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagg 38866148  T
Q  201 aatagagg 208  Q
    | ||||||    
T  38866149 attagagg 38866156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 39308983 - 39309190
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||    
T  39308983 aaagtacaatgtatcattaaatgtagttttacctatattatccttatatatttattgc--agagagagaaatatatgaaatgaagtattaaattattaag 39309080  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | ||||||| ||||  |||  |||||  || |||| | |||  || | ||  || |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39309081 gttattataggaaaaagataaattattatattaaaagtggta-aaagtatttgttatcttagtttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaa 39309179  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
    |||||| ||||    
T  39309180 tagagggagta 39309190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6091547 - 6091337
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |  ||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6091547 tcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattatttttagttatttattg--tgcagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 6091450  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||  | || |||| ||||||| ||||| | |||| ||||||    ||| |||||||||    
T  6091449 aagctattatagtaaaagtataaattattgtataaaaaataataagatttattgagtgtcttgatttgtatgaaatctcaaaaaacaacacttaaaaagg 6091350  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  6091349 aacggaggtagta 6091337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41955866 - 41955776
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41955866 aaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagaga--gagaaaaatatgaaatgaaatattaaat 41955776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 3036435 - 3036632
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3036435 tcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttatt----atagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaatg 3036530  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    | |  ||||| | |||   |||  | |||| ||||||| || || || || ||||||||  || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3036531 aaactattattggaaagagataaatcattgtatcaaaagtaataacatttattgattgttatgatttatgtaaaatgtaaaaatatgacaattaaaaagg 3036630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 36750230 - 36750327
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36750230 aagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattaatcttacttatttattg--tggagagacaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaga 36750327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 34361106 - 34361276
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatg--agatattaaatgaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||    
T  34361106 tcaaaattcaatgcaacattaaa---tgttttaccgatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaaaatattaaattaa 34361200  T
Q  99 taagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||| |  |    |||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  34361201 taagaccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaa 34361276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8457105 - 8456906
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| | |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  8457105 tcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttcttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagaga--aatatatgaaatatgatattaaataatta 8457008  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |    || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8457007 aggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 8456908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 34603674 - 34603885
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  34603674 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgc--agagagagaaatatatgaaatatgatattaaataatta 34603771  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||  |||  | |  |||||| ||||||  ||||   |    || | ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34603772 aggatattataggcaaaacacaagttattgtatcaaatgtagtgaaatacatttagtgtcttgatttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaagg 34603871  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    || ||||| |||||    
T  34603872 aacagagggagtac 34603885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38009960 - 38009750
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||  | ||||||| ||||||||  |||||||| || ||||||||||  |||||||||| |  |    
T  38009960 tcaaagttcaatgtaactttaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattg--gagagagaaaagtatatgaaatatgatattaaataatca 38009863  T
Q  101 a-gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    | ||| |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38009862 atgat-attataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaag 38009764  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  38009763 gaacggaggtagta 38009750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 55430497 - 55430284
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || ||||||  || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |     
T  55430497 tcaaagttcattgtatcattaaatgtggttttacctatattatccttagatacttattgt-ga-agagataaatatatgaaattaagtattaaatgattg 55430400  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||||||  |  | |||||     ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  55430399 aggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaataaaagtatttgtta----tcttggtttgtgtaaaaagtaaaaatgtgacaattaaaaagg 55430304  T
Q  201 aatagaggtagtactatatt 220  Q
    || ||||| |||| ||||||    
T  55430303 aaaagagggagtaatatatt 55430284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23621962 - 23621905
Alignment:
Q  87 atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23621962 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 23621905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 37551859 - 37551765
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37551859 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgtgcctttattacccttggttatttattgcagaga--gagaaacatatgaaatgaaatattaaatga 37551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 7242289 - 7242405
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||  |  |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7242289 tcaaagtttaatacaacattaaatattgttttatcaatattatctttagttatttatt--aatgagagaaatatatgtgaaatgagatattaaattaata 7242386  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt 119  Q
    ||   || |||||||||||    
T  7242387 aggctatcatagtaaaagt 7242405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 14090290 - 14090382
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14090290 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatacccttagtaatttattgc--agagagagaaatatatgaaatatgatattaaat 14090382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 48087748 - 48087840
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |  ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  48087748 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatacccttagtaatttattgc--agagagaaaaatatatgaaatatgatattaaat 48087840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1181095 - 1180896
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  || | ||  | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1181095 tcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcattcttacctttgattatttattgcagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgagaa 1180998  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  | |  || ||| ||||||| |||||  |    ||  ||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||    
T  1180997 aggttattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagtagtaaaatgcatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaacctaaaagtgacaattaaaaagg 1180898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1615247 - 1615053
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  | ||  ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  1615247 tcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttattg----tagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatga 1615152  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| |||| |||    | ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1615151 aggttattataggaaaaatatgaactgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 1615053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29832433 - 29832355
Alignment:
Q  124 cttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29832433 cttattgcatcaaaagttgtaacaattattgattgtcttggtataagtaaaatgtcaaaaggagacaattaaaaaggaa 29832355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33751388 - 33751338
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33751388 ttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaa 33751338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 38617866 - 38617932
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  38617866 tcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattatccttatatatttattgcagagaga 38617932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 51347312 - 51347378
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  51347312 tcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaga 51347378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 34925536 - 34925422
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | | || |||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |    
T  34925536 tcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattgcagaaagaga--aatatatgaaatgagatattaaattagga 34925439  T
Q  101 agatcattatagtaaaa 117  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  34925438 agattattatagaaaaa 34925422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51655066 - 51654857
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||| | |||||  |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  51655066 tcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttatctatattacccttatatatttattgctgagagaga--aatatatggaatgaactattaaattatta 51654969  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||| |||||||  |||  || ||| ||||||| ||| |  || | || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51654968 aggttattacagtaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagaaa-aagtatttattattttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacgattaaaaagg 51654870  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||| ||||    
T  51654869 aacagaggaagta 51654857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 54029148 - 54029242
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||  ||||||||||   ||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  54029148 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattg--tagagagataattatatgaaataagatattaaatga 54029242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1391365 - 1391297
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1391365 tcaaagttcaatgtaacactaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagaga 1391297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6150744 - 6150943
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |    
T  6150744 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaagtgagatattaaatgatga 6150841  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || ||||||||||| |||||  || | ||  ||||||| |||||| |||||  |  ||| |||| |||||||||||    
T  6150842 aggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttagtttgtataaaaaattcaaaagtgataattaaaaagg 6150941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 213
Target Start/End: Original strand, 29511197 - 29511303
Alignment:
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||| || || |  | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||    
T  29511197 ttatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaacatttatgaaatttcttggtttatgtaaaatgtcaaaaggtgacaattaaaaatgaacgga 29511296  T
Q  207 ggtagta 213  Q
    |||||||    
T  29511297 ggtagta 29511303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 3802210 - 3802304
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  3802210 tcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttacctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtatatgaaataaaatattaaatga 3802304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19731523 - 19731449
Alignment:
Q  44 ccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagta 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  || || |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19731523 ccttagatatttattgcggagagaga--aacatttgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagta 19731449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Original strand, 48087902 - 48087947
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  48087902 tgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 48087947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 49089105 - 49089166
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  49089105 ttgattgtcttggttcgagtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 49089166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 202
Target Start/End: Original strand, 17698643 - 17698711
Alignment:
Q  134 caaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17698643 caaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaa 17698711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 17978119 - 17978186
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  17978119 tcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagaga 17978186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7037127 - 7037047
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaat 83  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||  ||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  7037127 tcaaagttcaatacaatattaaatattgctttacctgtattgcccttagttatttatt--atagagaaagaaatatatgaaat 7037047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 8752202 - 8752270
Alignment:
Q  13 gcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaat 83  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  8752202 gcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttatt--aaggagagagaaatatatgaaat 8752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 37394353 - 37394298
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattta 56  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  37394353 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattattta 37394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52977974 - 52977928
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  52977974 ttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaggtaacaattaaaaa 52977928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7037233 - 7037176
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatt 58  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  7037233 tcaaagttcaatacaatattaaatattgttttacctatattgcccttaattatttatt 7037176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38027620 - 38027559
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38027620 ttgagtgttttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38027559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 52978358 - 52978321
Alignment:
Q  65 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52978358 agagagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataag 52978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Original strand, 7243005 - 7243053
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatg-tgacaattaaaaag 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7243005 ttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgttaacaattaaaaag 7243053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 14090444 - 14090500
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  14090444 tgtcttagtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaagaacagagggagta 14090500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 30152023 - 30151934
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatatta 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| || ||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30152023 tcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttattcctataatgcccttaataatttattgca--gagatagaaatatatgaaatatgatatta 30151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1391209 - 1391166
Alignment:
Q  159 tcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1391209 tcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaagtgacaaataaaaaggaa 1391166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23621641 - 23621577
Alignment:
Q  141 agtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23621641 agtattaattgttgattgtcttggtttgtg--------caaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 23621577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 27918652 - 27918747
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||  | |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27918652 tcaaagttcaatcaaatattaaatgttgttt-atcaatattaccattagttatatattgcaaagag--agaaatatatgaaacaagatataaaatgaat 27918747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Original strand, 36408969 - 36409012
Alignment:
Q  170 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  36408969 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 36409012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Original strand, 36423135 - 36423178
Alignment:
Q  170 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  36423135 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 36423178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 43086455 - 43086547
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||| |||    |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  43086455 tcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttattacccttgattatttactgc----agagagaaatatatgaaaagaaatattaaatga 43086547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13435295 - 13435257
Alignment:
Q  63 agagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13435295 agagaaagaaatatatgaaatgagatattaaattaataa 13435257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 41813692 - 41813726
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc 35  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41813692 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacc 41813726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53467684 - 53467650
Alignment:
Q  65 agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53467684 agagagaagtatatgaaatgagatattaaatgaat 53467650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4201366 - 4201329
Alignment:
Q  161 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4201366 ttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaa 4201329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 166 - 199
Target Start/End: Original strand, 34361703 - 34361736
Alignment:
Q  166 ttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34361703 ttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 34361736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 20087228 - 20087325
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||  ||| || | |||| |||||||||||   ||||||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||    
T  20087228 aaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgc--ggagagagaaatatagaaaataatatattaaatgagtaag 20087325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25098423 - 25098342
Alignment:
Q  19 ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25098423 ttaaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagaga--aatgtatgaaataagatattaaataaataag 25098342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26342627 - 26342837
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26342627 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 26342724  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26342725 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaagg 26342824  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  26342825 aacggaggtagta 26342837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14295953 - 14295743
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14295953 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgc-ga-agagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaata 14295856  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295855 aggtcattatagtaaaagtataccttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 14295756  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||| |||||||||    
T  14295755 aattgaggtagta 14295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15893776 - 15893564
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15893776 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 15893679  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15893678 aggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 15893579  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    ||  |||||||||||    
T  15893578 aacggaggtagtact 15893564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15183194 - 15182987
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15183194 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 15183097  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15183096 tcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaac 15182997  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  15182996 ggaggtagta 15182987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 10812246 - 10812456
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812246 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 10812343  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10812344 aggtcattatagtaaaagtatagcttatggcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 10812443  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  10812444 aacggaggtagta 10812456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 3363631 - 3363841
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3363631 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatcaata 3363728  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3363729 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaagg 3363828  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  3363829 aacggaggtagta 3363841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 30264798 - 30264599
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30264798 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaata 30264701  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30264700 aggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 30264601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34399249 - 34399459
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34399249 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 34399346  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34399347 aggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaatgtgataattaaaaagg 34399446  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  34399447 aacggaggtagta 34399459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41885672 - 41885882
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41885672 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 41885769  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41885770 aggtcattacagtaaaagtacagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatgaaaaagg 41885869  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  41885870 aacggaggtagta 41885882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 479169 - 478959
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  479169 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 479072  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  479071 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaag 478972  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || |||| |||||    
T  478971 aacagagatagta 478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 37093497 - 37093693
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37093497 tcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcagaaagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 37093594  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37093595 ag-tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 37093693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Original strand, 19594403 - 19594607
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19594403 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccatagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 19594500  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  19594501 ttatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattatctttgtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacgga 19594600  T
Q  207 ggtagta 213  Q
    |||||||    
T  19594601 ggtagta 19594607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11560243 - 11560033
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11560243 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgt-ga-agagagaaatatatgcaatgagatattaaatgaata 11560146  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  11560145 agataattatagtaaaagtacagcttattacatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaagt 11560046  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || |||| |||||    
T  11560045 aacagagatagta 11560033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11222512 - 11222302
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11222512 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 11222415  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11222414 aggtcattatattaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 11222315  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  11222314 aacggaggtagta 11222302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34357225 - 34357435
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34357225 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttactg--tggaaagagaaatatataaaatgagatattaaatgaata 34357322  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34357323 aggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaaatagtataaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcgaaatgtgacaattaaaaagg 34357422  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  34357423 aacggaggtagta 34357435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 36375618 - 36375830
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtc--cttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   ||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36375618 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagtattatcttggttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 36375715  T
Q  99 taagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36375716 taaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaggtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 36375815  T
Q  199 ggaatagaggtagta 213  Q
    ||||  |||||||||    
T  36375816 ggaacggaggtagta 36375830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38186248 - 38186054
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38186248 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaaaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 38186151  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38186150 aggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaaataatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaataaaaa 38186054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 14308442 - 14308636
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308442 tcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaat--tgtacttaattatttattg-ag-gagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 14308537  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14308538 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 14308636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28145768 - 28145568
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28145768 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgc--ggagagagaattatatgaaatgagatattaaatgaata 28145671  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt--aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28145670 atgtcattatagt-aaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttatataaaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaa 28145572  T
Q  199 ggaa 202  Q
    ||||    
T  28145571 ggaa 28145568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10263803 - 10264002
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt-atttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10263803 tcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 10263900  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10263901 aaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt-ttggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaatttaaaag 10263999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 14288478 - 14288675
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288478 tcaaagttcaatataacattaaatgttgttttatcaatattgtccttaattatttatcgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 14288575  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14288576 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtatcaattattgattgtctt--tttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 14288673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38072419 - 38072218
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38072419 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagt 38072322  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||     
T  38072321 tcattat------aatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatatgacaaataaaaaggaac 38072228  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  38072227 ggaggtagta 38072218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4883650 - 4883860
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4883650 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcagag--agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 4883747  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||  |||  | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4883748 aggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcattggctatattagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 4883847  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||| || ||||||    
T  4883848 aatggatgtagta 4883860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 44360481 - 44360690
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44360481 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatac-ccttaaatatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 44360577  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44360578 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 44360677  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  44360678 aacggaggtagta 44360690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25558379 - 25558172
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25558379 tcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgc----ggagagatatatatgaaatgagatattaaatgaata 25558285  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  25558284 aggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatcaaaagtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaatcaagaaag 25558185  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  25558184 aacggaggtagta 25558172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15677487 - 15677298
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15677487 tcaaagttcaatgcaacattaaatattattttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgtgatattaaatgaata 15677390  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15677389 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaa-tgttgattgtcttggtttgtg----atgtcaaaatgtgacaattaaaa 15677298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 13965656 - 13965862
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  13965656 aaagttcaatgcaacattaaatgttgatataccaatattatccttagttatttattgc--ggagagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaacaag 13965753  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13965754 gtcattatagtaaaagcataacttattggatcaaatgtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 13965853  T
Q  203 tagaggtag 211  Q
      |||||||    
T  13965854 cggaggtag 13965862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 4654767 - 4654976
Alignment:
Q  2 caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4654767 caaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttagttatttatagcggaga--gagaaatgtatgaaatgagatattaaatgaataa 4654864  T
Q  102 gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 201  Q
    | ||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4654865 ggtcattatagtaaaaacacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgagacaattaaaaagga 4654964  T
Q  202 atagaggtagta 213  Q
    |  |||||||||    
T  4654965 acggaggtagta 4654976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 9706836 - 9707033
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9706836 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt--atggagagataaatatataaaatgagatatcaaatgaataag 9706933  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | ||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9706934 gttattatagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 9707033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 14541378 - 14541577
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14541378 tcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattatccttagttatttattg--tggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaata 14541475  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||    ||| | ||||||| |||||  | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14541476 aggttattatagtaaaagtatgaagtatcgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 14541575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36405038 - 36404837
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36405038 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttatttacg-gatagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 36404940  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36404939 aggttattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggttcatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaatg 36404840  T
Q  201 aat 203  Q
    |||    
T  36404839 aat 36404837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13754002 - 13754201
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13754002 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgacatgaaatattaaatgaata 13754099  T
Q  101 agatcattatagtaaaagta-tagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||   ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13754100 aggctattatagtaaaagtagtaaattattgtatcaaaagtagtaacatttaatgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa-gtgacaattaaaaag 13754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3376409 - 3376274
Alignment:
Q  67 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtt 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3376409 agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttattatattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatt 3376310  T
Q  167 tgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3376309 tgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 3376274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 13215443 - 13215650
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||| |     
T  13215443 aagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattacggaga--gagaaatatatgaaattagattttaaattaataggg 13215540  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | |||||||||||| || |  | |||| ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  13215541 ttattatagtaaaaatacatatcattgtatcaaaagtagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaggaac 13215640  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  13215641 ggaggtagta 13215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 9370021 - 9370232
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9370021 tcaaagttcaatgcaatattaagtgttgttttatcaatattacccttaaatatttattgcggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 9370118  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || || || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  9370119 aggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattaatggtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaga 9370218  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    ||| || |||||||    
T  9370219 aattgatgtagtac 9370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13001107 - 13000897
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13001107 tcaaagttcaatgcaactttaaatcttgttttatcagtattacccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaataaata 13001010  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||| |||| |||   |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  13001009 aggctattatagcaaaaatattaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcacaaagtaacaattaaaaaag 13000910  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||| ||||||    
T  13000909 aacagatgtagta 13000897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43077339 - 43077552
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  43077339 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaata 43077436  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||  || |||||||||||| ||| |  |||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  43077437 aggccaatatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtaataacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaag 43077535  T
Q  200 gaatagaggtagtacta 216  Q
    |||  |||||| |||||    
T  43077536 gaacggaggtaatacta 43077552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35158541 - 35158337
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  35158541 ttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttactg--tggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaaatgaataaggtta 35158444  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || |||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||    
T  35158443 ttacagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacgga 35158344  T
Q  207 ggtagta 213  Q
    |||||||    
T  35158343 ggtagta 35158337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13849911 - 13849701
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| || |    
T  13849911 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacctttagatatttattgcagagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaaca 13849814  T
Q  101 agatcattatagtaaaagta-tagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| || ||  | || |||||||| ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  13849813 aggtcattatagtaaaagtaatagca-attgtatcaaaactaataatatttattgattgttttggtttatataaaatatcaaaaaatgacaattaaaaag 13849715  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  13849714 gaacggaggtagta 13849701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31025136 - 31024937
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31025136 tcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattacccttagttatttatt--atggagagataaatatatgaaataagatattaaatgacta 31025039  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  31025038 aggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagttacagttaaaaagg 31024939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32543983 - 32543784
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32543983 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacctttagttatttattacagagaaaaa--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 32543886  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    | |  |||||| |||||||||   |||||| || |||| |||||  | || |||||||| ||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  32543885 aaactattatattaaaagtatcaattattgtataaaaattagtaatatttattgattgttttggtttatgtaaaatgttataaaatgacaattaaaaagg 32543786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32854976 - 32854765
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32854976 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 32854879  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||  |||| ||||||||||| |    |||| ||||||| || || || || |||||| |||| |||  |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  32854878 aggccattgtagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacatttattgattatcttagtt--tgtaaaatgttaaaaagtgacagttaaaaagg 32854781  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||  ||||||||||||    
T  32854780 aacggaggtagtacta 32854765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 6013522 - 6013699
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6013522 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaagag--aaatatatgaaataagatattaaatgacta 6013619  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca 180  Q
    |||  |||||| ||||||||||  | |||| || | ||| |||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6013620 agactattataataaaagtataaatgattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttgatttgtgtaaaatgtca 6013699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 213
Target Start/End: Original strand, 14284243 - 14284340
Alignment:
Q  115 aaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  14284243 aaagtatagcttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaactgaggtagta 14284340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 8443738 - 8443935
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||  || | ||||||||| ||||||||| |||    
T  8443738 tcaaagttcaatgcaa-attaaatgttgtttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaga--aacaaatgaaatgaaatattaaattaat 8443834  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||| ||||||||||||||||| |            || ||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8443835 aaggtcattatagtaaaagtaaa------------aacaattgta-cacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 8443921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1259728 - 1259615
Alignment:
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1259728 aagatcattatggtaaaattatagtttattgcgtcaaaagtagtatcaattgttgattctcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaag 1259629  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
     ||  |||||||||    
T  1259628 aaacggaggtagta 1259615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 1395612 - 1395820
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||| || ||    
T  1395612 tcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-ttttaccaacattacccttagttaattattgcggaga--gagaaatatatgaaataaaatattaaaagacta 1395708  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  |||||||||||| ||||  |||||| || | ||| |||| || || || | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  1395709 agactattatagtaaaaatataaattattgtataagaaaaagtaacatttattaagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagt-acagttaaaaagg 1395807  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  1395808 aacggaggtagta 1395820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011699
Alignment:
Q  8 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcat 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | ||| ||| ||||||    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||| | ||    
T  31011905 tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttattta-ttattg--tggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttat 31011809  T
Q  108 tatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagag 207  Q
    |||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  31011808 tatagtaaaaataga-attattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggag 31011710  T
Q  208 gtagtactata 218  Q
    |||||| ||||    
T  31011709 gtagtattata 31011699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 2012908 - 2013027
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  2012908 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattg--tggagagagaaatatatgaaataagatattaaattacta 2013005  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtata 122  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  2013006 aggttattatagtaaaagtata 2013027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34884732 - 34884547
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | |||||||| || ||| |  || ||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  34884732 aaagttcattgcaacattaaatgttgttttatcaatattacctttagatgtttattgcggaaagaaa--aacatatgaaataaaacattaaattaataag 34884635  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgaca 190  Q
     ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| |||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34884634 gtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaca 34884547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 838266 - 838068
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat- 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| | |     
T  838266 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctattatgtccttagtaatttattgcagaga--gagaaatatatgaaatatgatattaaataatta 838169  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||| |||||||  |||  |||  |||||||||||||| ||||   |    || | |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  838168 aagat-attataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagtgaaatgcatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgcgacaattaaaaag 838070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 14284175 - 14284243
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14284175 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagaga 14284243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 155
Target Start/End: Original strand, 36824499 - 36824590
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttga 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  36824499 gagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagatcattacagtaaaagtgcaacttattgcattaaaaatagtaacaattattga 36824590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 25787384 - 25787584
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||  |||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25787384 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcatagagaga--aatatatgaaatgaagtattaaatgatta 25787481  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||| ||||| |||  || ||| |||||||   ||||      ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25787482 aggatattataggaaaaggataaattgttgtatcaaaa---gtat------ttg-ttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 25787571  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||| ||||    
T  25787572 aacagagggagta 25787584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 32674258 - 32674376
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgaga----tattaaatg 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    |||||||||    
T  32674258 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccgtagttatttattgc--ggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtattaaatg 32674355  T
Q  97 aataagatcattatagtaaaa 117  Q
    ||||||   ||||||||||||    
T  32674356 aataaggctattatagtaaaa 32674376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 29041997 - 29042167
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||    ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  29041997 tcaaagtccaatgcaacattagatattgttttaccaatattacccgtagatatttattgc----agagagaaacatatgaaatga-aaattaaattaata 29042091  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaat 176  Q
    |  ||||||| ||||||||| |    |||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||    
T  29042092 acgtcattattgtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacatttactgattgtctcgatttgtgtaaaat 29042167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 37077217 - 37077430
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||  | || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  37077217 tcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcattattaccattggttatttattgcagatagag--aaatatatgaaatgagatattaaattatga 37077314  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa-tgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  |||  |||||| || |||| |||||  |  | ||  || |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  37077315 aggttattatagaaaaaagataaattattgtataaaaagtagtaaaatgtatttgttatcttggtttgtgtaaaagactcaaaa-gtgacaattaaaaag 37077413  T
Q  200 gaatagaggtagtacta 216  Q
    |||| |||| |||||||    
T  37077414 gaatggagggagtacta 37077430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7529901 - 7529701
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatg-agatattaaatgaat 99  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||      
T  7529901 tcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattgcagaga--gagaaatatatgaaatgaaaatattaaatgatg 7529804  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||   ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  | || ||  |||||||  ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||    
T  7529803 aaggctattataggaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtcttcatttgtgtaaaaagacaaaaaatgacaattaaaaag 7529704  T
Q  200 gaa 202  Q
    |||    
T  7529703 gaa 7529701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34262915 - 34262808
Alignment:
Q  106 attatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatag 205  Q
    |||||||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||  |    
T  34262915 attatagtaaaaatatatattattatatcaaaagtagtaacaattattgaatgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaattgacaattaaaaaggaacgg 34262816  T
Q  206 aggtagta 213  Q
    ||||||||    
T  34262815 aggtagta 34262808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 42088941 - 42089033
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  42088941 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgc--agagagagaaatataagaaatatgatattaaat 42089033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4952831 - 4952693
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |    || | || |||| ||||| || || |||||  | |||    
T  4952831 gagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccgttatagtaaaagtaaaaacaatagtattaaaagtagtaacatttattgatcattttg 4952732  T
Q  164 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4952731 gtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 4952693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 34309243 - 34309149
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||| ||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34309243 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatgttatcattgcttattcattg--tggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaata 34309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28967427 - 28967255
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||  |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  28967427 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttat--cgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgataa 28967330  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa 175  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || |||||||||||||||||  || | ||  |||| |||||||||||||||    
T  28967329 aggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaaatagtaaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaa 28967255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37116789 - 37116600
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||| || ||||| | |||||| |  || | | ||||| | ||||||||| ||||    
T  37116789 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaa--aacacaagaaataaaatattaaataaata 37116692  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||| ||    |||||||  |      |||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  37116691 agacca----agtaaaaaca------attgtatcaaaaatagtaacatttattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcagagaatgacaattaaaaagg 37116602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38148231 - 38148137
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||  |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  38148231 tcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttgattatttattgtagagagaga--agtatatgaaatgagatattaaatga 38148137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 45065119 - 45065324
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||   | |||||||| || ||||||| |||||||||||||  |    
T  45065119 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattg--taaagagagaagtaaatgaaataagatattaaatgatga 45065216  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  | ||||||| ||||  ||   || ||||||||||| |||||  || | ||  ||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||| |    
T  45065217 atgttattatagaaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaaatatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaattcaaaagtgacaattaaaaaag 45065316  T
Q  201 aatagagg 208  Q
    ||| ||||    
T  45065317 aatggagg 45065324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 33947625 - 33947533
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  33947625 tcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgtccttagtaatttattg--tagagagagaaatatataaaatatgatattaaat 33947533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 139
Target Start/End: Original strand, 34721570 - 34721645
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaa 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  34721570 gagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataaaaaa 34721645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 30544567 - 30544662
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||||| ||   |||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  30544567 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttactg--tagagggataagtatatgaaataagatattaaatgaa 30544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25187323 - 25187241
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatga 85  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  25187323 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatga 25187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 928211 - 928035
Alignment:
Q  17 cattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||     |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  928211 cattaaatgttgttttacatatattattcttaaatatttattg----tagagagaaatatattaaatgaagtattaaatgattaaggttattataggaaa 928116  T
Q  117 agtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |  |||  || || ||||||||||||||  || | ||  || |||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  928115 aagataaattgttacatcaaaaatagta-aaagtatttgttatcttagtttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaa 928035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 2991858 - 2991925
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||    
T  2991858 tcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagaga 2991925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25186902 - 25186827
Alignment:
Q  127 attgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25186902 attgtatcaaaagtagtaacatatattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaa 25186827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 42263699 - 42263619
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaat 83  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42263699 tcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgca--gagatagaaatatatgaaat 42263619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 198
Target Start/End: Original strand, 36173264 - 36173301
Alignment:
Q  161 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36173264 ttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaa 36173301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 36173115 - 36173183
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36173115 tcaaagttcaatataacattaaatgttgttttttctataatgaccttagtaatttattgcagggagaga 36173183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 37354036 - 37354128
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||  | ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  37354036 tcaaagttcaacgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttatt--agagagagaaaaatatataaaatatgatattaaat 37354128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 97
Target Start/End: Original strand, 37660844 - 37660878
Alignment:
Q  63 agagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37660844 agagagagaaacatatgaaatgagatattaaatga 37660878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 196
Target Start/End: Original strand, 29056212 - 29056252
Alignment:
Q  156 ttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29056212 ttgtcttggtttgtgtagaaagtcaaaaagtgacaattaaa 29056252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 37354190 - 37354246
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  37354190 tgtcttgatttgtgtaaaaaattaaaatgtgacaattaaaatggaacggaggtagta 37354246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Original strand, 42089088 - 42089128
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  42089088 tgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgagacaattaaaa 42089128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 117)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 23429956 - 23430168
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23429956 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagag--agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 23430053  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23430054 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacgattaaaaagg 23430153  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    ||| |||||||||||    
T  23430154 aatggaggtagtact 23430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38482985 - 38482775
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38482985 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 38482888  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38482887 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 38482788  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  38482787 aacggaggtagta 38482775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 35052100 - 35052310
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35052100 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttatttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaataaata 35052197  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35052198 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 35052297  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  35052298 aacggaggtagta 35052310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34981876 - 34982086
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34981876 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatacatgaaatgagatattaaatgaata 34981973  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34981974 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtattaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 34982073  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  34982074 aacggaggtagta 34982086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 34046898 - 34047095
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34046898 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 34046995  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34046996 aggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgatattcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 34047095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 26062758 - 26062963
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26062758 aagttcaatgcaacattaa-tgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 26062854  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26062855 tcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 26062954  T
Q  204 agaggtagt 212  Q
     ||||||||    
T  26062955 ggaggtagt 26062963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 14263593 - 14263786
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263593 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 14263690  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14263691 gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 14263786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4057335 - 4057534
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4057335 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaattaata 4057432  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4057433 agatcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 4057532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33935253 - 33935054
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33935253 tcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 33935156  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33935155 aggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 33935056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 9954696 - 9954906
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9954696 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 9954793  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9954794 aggtcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatatgacaattaaaaagg 9954893  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    |||  ||||||||    
T  9954894 aatgaaggtagta 9954906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39303706 - 39303490
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  39303706 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttttttattgcggagagaga--aatatatgatataagatattaaatgaataagg 39303609  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgac-aattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39303608 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaattaaaaaggaa 39303509  T
Q  203 tagaggtagtactatatta 221  Q
      ||||||||| |||||||    
T  39303508 cggaggtagtattatatta 39303490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 40228342 - 40228542
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40228342 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgacatattaaatgaata 40228439  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40228440 aggtcattatagtaaaagtacagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 40228539  T
Q  201 aat 203  Q
    |||    
T  40228540 aat 40228542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14228514 - 14228298
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14228514 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt-gttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaata 14228418  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14228417 aggtcattatagtaaaagtatagcttatgacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatg 14228318  T
Q  201 aatagaggtagtactatatt 220  Q
    ||  |||||||||| |||||    
T  14228317 aacggaggtagtacaatatt 14228298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38128734 - 38128530
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38128734 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttact--acggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtca 38128637  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  38128636 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacgga 38128537  T
Q  207 ggtagta 213  Q
    |||||||    
T  38128536 ggtagta 38128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23848749 - 23848539
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23848749 tcaaaatttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttggttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 23848652  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23848651 aggtcattataataaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtcaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 23848552  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  23848551 aacagaggtagta 23848539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25703770 - 25703561
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25703770 tcaaagttcaatgcagcattaaatgttattttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatga-atattaaatgaata 25703674  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25703673 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaga 25703574  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  25703573 aacggaggtagta 25703561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25812941 - 25812732
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25812941 tcaaagttcaatgcagcattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatga-atattaaatgaata 25812845  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25812844 agttcattatagtaaaagtatagcttattgcataaaaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaga 25812745  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  25812744 aacggaggtagta 25812732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16656748 - 16656943
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16656748 tcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttagcaatattattcttagttatt-attgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16656844  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16656845 agttcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaattgttgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 16656943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1202635 - 1202441
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1202635 aaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagaga--aatatataaaataagatattaaatgaataag 1202538  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1202537 gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaag 1202441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45281570 - 45281372
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45281570 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtggagaggga--aatatatgaaatg-gatattaaatgaata 45281474  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  45281473 aggtgattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaggg 45281374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43642182 - 43641983
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  43642182 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagaga--aatatatgaaattagatgttaaaagaata 43642085  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43642084 aggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 43641985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12342807 - 12342600
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12342807 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatctttaactatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 12342710  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12342709 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 12342610  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    || |||||||    
T  12342609 aacagaggta 12342600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32010277 - 32010082
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32010277 tcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaaca 32010180  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32010179 aggtcattatagtaaaagtataaattattgcatcaaaagtagtagcaattattgattgtcttggtttgtgaaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaa 32010082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36058280 - 36058478
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36058280 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac-aatattatccttagttatttattgctgaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 36058376  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | | ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36058377 agatcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactattttaatttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaagg 36058476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11993940 - 11994127
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||           |||   ||||||||||||||    
T  11993940 tcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatagcggagagaga-----------aat---atattaaatgaata 11994025  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11994026 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgtttattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 11994125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 18291511 - 18291720
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18291511 tcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttacca-tattatccttagttatttattacggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaata 18291607  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18291608 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttgatttttgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 18291707  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  18291708 aacggaggtagta 18291720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21651937 - 21651743
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651937 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaaagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataag 21651840  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||  |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651839 gtcattatagtaaaagtacaagttattgcatcaaaagtagtaacgatcattggctatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 21651743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1245359 - 1245558
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1245359 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattg--tggagtgaaaaatatatgaaatgagaatttaaatgaata 1245456  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1245457 aggtcattatagtaaaagtataacttattgaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 1245556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15596391 - 15596601
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||  | ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15596391 tcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 15596488  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15596489 aggttattatagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaataacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 15596588  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  15596589 aacggaggtagta 15596601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40604044 - 40603869
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40604044 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgcggagagata--aatatatgaaatgaaatattaaatgaata 40603947  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 178  Q
    || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40603946 aggtcatcatagtaaaagtttagtttattacatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgt 40603869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 10180417 - 10180613
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10180417 tcaaagtttaatgcaacattaaacgttattttaccaatattatctttagttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 10180514  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10180515 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 10180613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 33314591 - 33314795
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314591 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtatgatccttaattatttattacggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 33314688  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| ||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33314689 aagtcattatagtaaaaggacaacttattgcataaaaaatagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaagg 33314788  T
Q  201 aatagag 207  Q
    || ||||    
T  33314789 aaaagag 33314795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9808167 - 9808008
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9808167 tcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 9808070  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtctt 162  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||    
T  9808069 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtattaattgttaattatctt 9808008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8453425 - 8453219
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||   ||||||||||  |||| |    |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8453425 aaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaccctcgattatttattgtggagata----aatatatgaaataagatattaaatgaataat 8453330  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8453329 gtcattataataaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 8453230  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  8453229 cggaggtagta 8453219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26740328 - 26740131
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26740328 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaataag 26740231  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
       ||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26740230 gctattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 26740131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43553086 - 43553299
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43553086 tcaaagttcaatgcaactttaaacgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaata 43553183  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||     
T  43553184 aggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcacaaagcgacaattaaaaaga 43553283  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||  ||||| ||||||    
T  43553284 aacggaggtggtacta 43553299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 3513404 - 3513558
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3513404 tcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 3513501  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgatt 157  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||    
T  3513502 aggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgatt 3513558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14061342 - 14061132
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||  ||||||||||| ||    
T  14061342 tcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgttttatcaatattgcccttagttatttattacagagagaga--aataaataaaatgtaatattaaatgacta 14061245  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14061244 aagctattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 14061145  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  14061144 aacggaggtagta 14061132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12248960 - 12248752
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  12248960 aagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttattgtggagaaaga--aatatataaaatgaaatattaaatgaataagg 12248863  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || |||| |||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||     
T  12248862 ttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcgtgtaaaatgtcaaaaactgtcaattaaaaaggaac 12248763  T
Q  204 agaggtagtac 214  Q
     ||||||||||    
T  12248762 ggaggtagtac 12248752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6757453 - 6757663
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6757453 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 6757550  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||  || | ||| |||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  6757551 agactattatagtaaaagtataaattattatataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtaaaaaagg 6757650  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  6757651 aacggaggtagta 6757663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2335480 - 2335680
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  2335480 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 2335577  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||| || | ||| || |  | || |||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  2335578 agactattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaaagaaatatttattgagtatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaagg 2335677  T
Q  201 aat 203  Q
    |||    
T  2335678 aat 2335680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 167670 - 167460
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  167670 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg--tggagagataaatatataaaatgagatattaaattaata 167573  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatg-tcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | |||||||||||||| |    ||||| ||||||| |||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||    
T  167572 aggttattatagtaaaagt-tgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattatattggtttgtgtgaaatgttaaaaaagtgacaattaaaaag 167474  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    ||| ||||||||||    
T  167473 gaacagaggtagta 167460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 18842581 - 18842786
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  18842581 agttcaatgcaatattaaatgttattttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 18842677  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaata 204  Q
     |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  18842678 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 18842777  T
Q  205 gaggtagta 213  Q
    |||||||||    
T  18842778 gaggtagta 18842786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 13173978 - 13174175
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13173978 aaagttcaatgcaacaataaatgttgttttactaacattacccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaag 13174075  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
       |||||||||||||||    |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13174076 gctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaa 13174175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23793468 - 23793254
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |  |||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  23793468 tcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatattatccttagatatttatt--acggagagaaaaacatataaaatgaaatattaaattaata 23793371  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta----tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
    || ||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||    | | || || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23793370 aggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaacatttatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaa 23793271  T
Q  197 aaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||| ||||||||||    
T  23793270 aaggaacagaggtagta 23793254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2456303 - 2456112
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||   ||||| ||||||    ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  2456303 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttaatta---attgcggagaga----aatatataaaataaaatattaaatgaata 2456211  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2456210 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaag 2456112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7606087 - 7605885
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    |  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  7606087 aagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttat----ggtagagagaaatatatgaaattagatgttaaataaataaga 7605992  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||     
T  7605991 tcattatagtaaaagtataacttattgcattaaaagtaataatgattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaa-ataacaattaaaaaggaag 7605893  T
Q  204 agaggtag 211  Q
     |||||||    
T  7605892 tgaggtag 7605885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8554204 - 8554010
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |    
T  8554204 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatgttaaataaataaggt 8554108  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8554107 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaa 8554010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17074770 - 17074576
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||| ||||||    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  17074770 agttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttattta-ttattg--tggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 17074674  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17074673 tattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaa 17074576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 17573500 - 17573694
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||| ||||||    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  17573500 agttcaatgcaacattaaatgtaattttactaatattatccttattta-ttattg--tggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 17573596  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||| || |  |||||||||||||| ||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17573597 tattatagtaaaaataaaaattattgcatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaa 17573694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17718550 - 17718721
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17718550 tcaaagttcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacccttagatatttattgc--ggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 17718647  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaa 174  Q
    ||  |||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17718648 aggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaa 17718721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19972326 - 19972541
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||| || ||    
T  19972326 tcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagag--agagaaatatattaaataagatattaaacgacta 19972423  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| || | |||  ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  19972424 aggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaagg 19972523  T
Q  201 aatagaggtagtactata 218  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  19972524 aacggaggtagtattata 19972541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21020507 - 21020292
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| || ||    
T  21020507 tcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacagagagaga--aatatattaaataagatattaaacgacta 21020410  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| || | |||  ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  21020409 aggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaagg 21020310  T
Q  201 aatagaggtagtactata 218  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  21020309 aacggaggtagtattata 21020292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27911865 - 27911654
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27911865 tcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgc--ggagagagaaacatataaaatgaaatattaaattaata 27911768  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||  |||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  27911767 aggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacacttaaaaagg 27911668  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
     |  ||||||||||    
T  27911667 tacggaggtagtac 27911654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27958284 - 27958073
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27958284 tcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgc--ggagagagaaacatataaaatgaaatattaaattaata 27958187  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||  |||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  27958186 aggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacacttaaaaagg 27958087  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
     |  ||||||||||    
T  27958086 tacggaggtagtac 27958073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2888656 - 2888451
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  2888656 agttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 2888560  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaata 204  Q
     |||| ||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  2888559 tattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 2888460  T
Q  205 gaggtagta 213  Q
    |||||||||    
T  2888459 gaggtagta 2888451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12763481 - 12763654
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12763481 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 12763578  T
Q  101 a-gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaat 176  Q
    | ||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||| || || |||||||||||  |||||| |||||    
T  12763579 atgat-attatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaacagtaacatttattgattgtcttaatttgtgcaaaat 12763654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15623804 - 15623664
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15623804 tcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 15623707  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15623706 atgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15623664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15647592 - 15647452
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15647592 tcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 15647495  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15647494 atgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaaatagt 15647452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8731020 - 8730812
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||| ||    
T  8731020 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagt-atttattgcggagagaga--aatatatgaa-taagataataaatgatta 8730925  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  8730924 aggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtggcacttaaaaagg 8730825  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||| |||||||||    
T  8730824 aatggaggtagta 8730812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 23855605 - 23855814
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23855605 tcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt-atcaatattacccttagttatttattgtggagagata--aatatataaaatgagatattaaataaata 23855701  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  23855702 aggttattatagtaaaagtatgacgtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacgattaaaaagg 23855801  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  23855802 aacggaggtagta 23855814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14511617 - 14511428
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||||   |||||  |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  14511617 ttcaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagatatttattgcggagagagaagcatata--aaatgaaatattaaattaataaggtca 14511520  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||||| |    |||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14511519 ttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaa 14511428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308153
Alignment:
Q  74 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgc-atcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgta 172  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| | ||||    
T  41308013 tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcaatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtatatgta 41308112  T
Q  173 aaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  41308113 aaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtagta 41308153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 13327826 - 13327938
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13327826 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatctttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaata 13327923  T
Q  101 agatcattatagtaa 115  Q
    || ||||||||||||    
T  13327924 aggtcattatagtaa 13327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27518900 - 27518711
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||      || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27518900 tcaaagttcaatacaacattaaatgttatttta------ttatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaataaata 27518809  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||| ||||  |||| | | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27518808 aagtcattatagtaacagtacaacttattgcataaaaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaactattaaaaa 27518711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 3720727 - 3720926
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3720727 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactctaagatatttattgc--agagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 3720824  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||| |    |||| |||||||  |||   | || |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3720825 aggctattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagcagtcaaacttattgattgttttagtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 3720924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 35296091 - 35296302
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||  | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35296091 tcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccgacattacctttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgatta 35296188  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||    |||||| || | ||| | || || || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35296189 aggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaagg 35296288  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    ||  ||||||||||    
T  35296289 aacggaggtagtac 35296302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36112104 - 36111926
Alignment:
Q  31 ttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg 130  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  36112104 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattg 36112007  T
Q  131 catcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
     || | ||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  36112006 tataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa--gtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 36111926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 7483791 - 7483999
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  7483791 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttatt----atggagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 7483886  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||| || | ||| |||| || || || | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  7483887 aggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttatttagtgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaagg 7483986  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  7483987 aacggaggtagta 7483999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11707678 - 11707559
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11707678 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 11707581  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtata 122  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  11707580 aagtcattatagtaaaagtata 11707559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35498261 - 35498090
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  35498261 aaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagataga--aatatatgatatgtgatattgaataaataag 35498164  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaat 176  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||    
T  35498163 actattatagtaaaagtataaattattatatcaaaagtagtaacatttatgaattgtcttggtttgtgtaaaat 35498090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 13328121 - 13328230
Alignment:
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13328121 ttatagtaaaagtataacttattgtattaaaagtagtatcaatttttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 13328220  T
Q  207 ggtagtacta 216  Q
    | ||||||||    
T  13328221 gatagtacta 13328230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 6750662 - 6750781
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6750662 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttatt--acggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 6750759  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtata 122  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  6750760 agactattatagtaaaagtata 6750781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 31028703 - 31028899
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  31028703 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataag 31028800  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||| |    |||| ||  |||||| || ||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  31028801 gtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtat-taaaataataacatatattgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaa 31028899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41701673 - 41701465
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  41701673 aaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagaga--aatatatgaaataaaatattaaatgactaag 41701576  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |  |||||||||||| ||||  |||||| |  | ||| ||||  | || |||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  41701575 actattatagtaaaaatataaattattgtacaagaaaaagtaatatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatattaaaaagtgacagttaaaaaggaa 41701476  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  41701475 cggaggtagta 41701465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16701084 - 16700989
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16701084 aaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16700989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13132309 - 13132098
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||| | ||    
T  13132309 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgcagaga--gagaaatataggaaatatgatattaaataatta 13132212  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||  |||  |||  |||||||||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13132211 aggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaa--tgacaattaaaaagg 13132114  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    || ||||| |||||||    
T  13132113 aacagagggagtacta 13132098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39615639 - 39615435
Alignment:
Q  6 gttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||  || |  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |     
T  39615639 gttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgt-gaaat-gagaaatatatataatgagatattaaataaataaggtt 39615543  T
Q  106 attatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatag 205  Q
    |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||  | || || || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  39615542 attatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaaca-ttattaattgtcttggtttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacag 39615444  T
Q  206 aggtagtac 214  Q
    |||| ||||    
T  39615443 aggttgtac 39615435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Original strand, 35051896 - 35052011
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||     
T  35051896 aagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttatt--acggagagagaaatgtatgaaattagtgattaaatgaataagg 35051993  T
Q  104 tcattatagtaaaagtat 121  Q
    | ||||||||||||||||    
T  35051994 ttattatagtaaaagtat 35052011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38221859 - 38222058
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||  ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38221859 tcaaagttcaatataacaataaatgttgttttacaaacattacccttaattatttat--catggagaaagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 38221956  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||  || | ||| | || || || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  38221957 aggctattatagtaaaagtataaattattatataagaaaaaataacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaaagtgaccgttaaaaagg 38222056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9687703 - 9687508
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  | ||| |||||   ||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9687703 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacaataccattatttattg--tg----gagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 9687610  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||  | ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  9687609 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgcgtatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgatagttaacaagg 9687510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313223
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17313126 aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgc--ggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataag 17313223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40521437 - 40521337
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40521437 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcggagagagaaacatatatgaaatgaaatattaaattaata 40521338  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  40521337 a 40521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11163313 - 11163512
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  11163313 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatga 11163410  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11163411 aggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctcaaaa-gtgacaattaaaaag 11163509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 6661000 - 6661200
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat- 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||  |||||||||| | |     
T  6661000 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgc--agagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataatta 6661097  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||| |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |  | || | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6661098 aagat-attataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaag 6661196  T
Q  200 gaat 203  Q
    ||||    
T  6661197 gaat 6661200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 6741402 - 6741602
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat- 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||  |||||||||| | |     
T  6741402 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataatgtccttagtaatttattgc--agagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataatta 6741499  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||| |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |  | || | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6741500 aagat-attataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaag 6741598  T
Q  200 gaat 203  Q
    ||||    
T  6741599 gaat 6741602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10086346 - 10086150
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| | ||||    
T  10086346 aaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatccttaattatttattgcagaga--gagaaatatatgaaataatatattaaataactaag 10086249  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |  |||||| | ||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||  ||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  10086248 actattataat-aaagtataaattattgtataagaaaaagtagcatttattgaatgtcttaatttatgtaaaatataaaaaagtgacaatttaaaaggaa 10086150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Original strand, 8672602 - 8672740
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |    |||| |||||||||| || || || |||||| | |||    
T  8672602 gagagagaaacataaaaaatgaaatagtaaataaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataataacatttattgattattttg 8672701  T
Q  164 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  8672702 gtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaa 8672740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 11727630 - 11727840
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| | |||||  |||||  |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  11727630 tcaaagttcaatgtatcatcaaatgtggctttacttatattacccttatatatttattgctgagagaga--aatatatggaatgaagtattaaattatta 11727727  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||| ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  | |  ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  11727728 agattattatagaaaaaagataaatttttgtatcaaaagtagtagaagtatttg-ttgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgcgacaattaaaaagg 11727826  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    || ||||| |||||    
T  11727827 aacagaggaagtac 11727840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 208
Target Start/End: Original strand, 42352788 - 42352989
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42352788 aaagttcattacatcattaaatgttgttttacta-tattacccttagatatttattgcagaatgata--aatatatgaaatgaggtattaaatgaataag 42352884  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | ||||||  ||||  |||  || ||||||||||| |||||  || | ||  |||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  42352885 gttattatatgaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta-aaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaacatgacaattaaaaagaaa 42352983  T
Q  203 tagagg 208  Q
     |||||    
T  42352984 cagagg 42352989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43553433 - 43553318
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||| | ||   |||||||||||||     
T  43553433 aagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttacttatttatt--acggagagagaaatgtatgaagttagtgcttaaatgaataagg 43553336  T
Q  104 tcattatagtaaaagtat 121  Q
    | ||||||||||||||||    
T  43553335 ttattatagtaaaagtat 43553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 213
Target Start/End: Original strand, 17313282 - 17313399
Alignment:
Q  96 gaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||  |||| | |||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17313282 gaataaggtcattatagtaaaagtagaacttattgcatcaaaagtaataacaataattgactatcttcgtttatgtaagatgtcaaaatgtaacaattaa 17313381  T
Q  196 aaaggaatagaggtagta 213  Q
    || ||||  |||||||||    
T  17313382 aagggaacggaggtagta 17313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 29125949 - 29126158
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||   ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  29125949 tcaaagtccaatgcattattaaatgtggttttacctatattacgcttatatatttattgc--agagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgatta 29126046  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | || |||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  || | ||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||    
T  29126047 aggttatcataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagctaaaatgtgacagtgaaaaagg 29126145  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||| ||||    
T  29126146 aacagagggagta 29126158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 38074323 - 38074437
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||||  ||||  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  38074323 tcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacattattacccttgattatttattgcagagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgagca 38074420  T
Q  101 agatcattatagtaaaa 117  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  38074421 agattattataggaaaa 38074437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 35029655 - 35029805
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||| ||||||| ||||   | || | |||| | |||    
T  35029655 gagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtgatatttatggattatattg 35029753  T
Q  164 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtact 215  Q
     ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  35029754 atttgtataaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtact 35029805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 45317699 - 45317898
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |  |    
T  45317699 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataaagcccttaataatttattg--gagagagaaaaatatatgaaatatgataataaataatca 45317796  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45317797 aggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 45317896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 202
Target Start/End: Original strand, 31964738 - 31964815
Alignment:
Q  125 ttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  31964738 ttattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaagaggaa 31964815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 43553641 - 43553544
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtta-tttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43553641 aagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatatcatccttacttattttattgc--ggagagaaaaatatatgaaattagatattgaatgaataag 43553544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Original strand, 15281469 - 15281625
Alignment:
Q  44 ccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||| ||||  |||||| || |||| |||     
T  15281469 ccttagttatttattgtagaaagag--aaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagtagc 15281566  T
Q  144 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    | || || |||||  ||||||||| || || |||||||||  | |||||||||||||||    
T  15281567 aacatttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaa 15281625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Original strand, 15461838 - 15461994
Alignment:
Q  44 ccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||| ||||  |||||| || |||| |||     
T  15461838 ccttagttatttattgtagaaagag--aaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagtagc 15461935  T
Q  144 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    | || || |||||  ||||||||| || || |||||||||  | |||||||||||||||    
T  15461936 aacatttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaa 15461994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 30205507 - 30205573
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30205507 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtctttagtaatttattgcagagaga 30205573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 8954892 - 8954778
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||| |||||  ||||||||||   ||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |    
T  8954892 tcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatctttattatccttgattatttattg--tagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatga 8954795  T
Q  101 agatcattatagtaaaa 117  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  8954794 agattattataggaaaa 8954778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 8672349 - 8672389
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672349 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 8672389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11707539 - 11707451
Alignment:
Q  111 agtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| |||||  |||| |||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11707539 agtaaaagtataacttaatacatcaaaagtagtaataattattgattgtcttaatttatgtaaaatgtaaaaatatgacaattaaaaag 11707451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 41305693 - 41305757
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  41305693 aaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagaga 41305757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29091129 - 29091083
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29091129 ttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 29091083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41643640 - 41643488
Alignment:
Q  44 ccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| || | ||||| | ||||| |||  |||||  ||||||| ||||    
T  41643640 ccttagttatttattac-ga-agagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaaggataatttattatatcaaaagtagt 41643543  T
Q  144 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    | || || |||| | | |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  41643542 aacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaattacaattaaaaa 41643488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9301673 - 9301537
Alignment:
Q  66 gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||| |||   || ||||||||||| |||||  || | ||   | |||||||    
T  9301673 gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaaatatttgatatcttggt 9301574  T
Q  166 ttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9301573 ttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaaggaa 9301537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 41890569 - 41890663
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   |||  |||||| |||   ||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  41890569 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacacttgattatttcttg--tagagagataagtatatgaaataagatattaaatga 41890663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 249
Target Start/End: Original strand, 36466164 - 36466199
Alignment:
Q  214 ctatattactcgacacatattcttacattttgatat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36466164 ctatattactcgacacatattcttacattttgatat 36466199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Original strand, 1739889 - 1739939
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1739889 ttgattgtgttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 1739939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 41
Target Start/End: Original strand, 35028655 - 35028693
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35028655 aaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatatt 35028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 197
Target Start/End: Original strand, 30205657 - 30205697
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30205657 tgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaa 30205697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13935266 - 13935194
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatat 78  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||  |  |||||||||||||||    
T  13935266 aagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattatccctacttatttatt--atggagagagaaatatat 13935194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 37998303 - 37998224
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaat 83  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| || || ||| | | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37998303 tcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtctt-cctataatattcttagtaatttattgcagagagaga--aatatatgaaat 37998224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 40608082 - 40608281
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaata-tatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| || |||| || ||||||||||||||| || | | | ||||||||  |||||||||| | |    
T  40608082 tcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttcttcctataatgcccttggtaatttattgcagagagggaaatacaatatgaaatatgatattaaataatt 40608181  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||   |||||||  |||  |||  |||||| ||||||||||||   |    || | | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40608182 aaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaaatagtgaaatacatttagtatattggtttgtgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaag 40608281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 202
Target Start/End: Original strand, 17718909 - 17718942
Alignment:
Q  169 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17718909 tgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 17718942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 8201 - 8411
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagttatttattgcagagaaaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 8298  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299 agatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 8398  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  8399 aacggaggtagta 8411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 104)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 43500555 - 43500763
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43500555 aaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagag--agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 43500652  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43500653 gtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 43500752  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  43500753 cggaggtagta 43500763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19349569 - 19349359
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349569 tcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 19349472  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19349471 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcagaatgtgacaattaaaaagg 19349372  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || || |||||||    
T  19349371 aacagtggtagta 19349359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 30686458 - 30686668
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30686458 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 30686555  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30686556 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaacgtgacaattaaaaagg 30686655  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  30686656 aacggaggtagta 30686668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 1024603 - 1024813
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1024603 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattgtcgttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 1024700  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1024701 agatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 1024800  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  1024801 aacggaggtagta 1024813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35531485 - 35531275
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  35531485 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagata--aatatatgaaataggatatcaaatgaata 35531388  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35531387 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 35531288  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  35531287 aacggaggtagta 35531275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13566723 - 13566936
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatt---tattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566723 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatga 13566820  T
Q  98 ataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566821 ataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 13566920  T
Q  198 aggaatagaggtagta 213  Q
    |||||  |||||||||    
T  13566921 aggaacggaggtagta 13566936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 38648504 - 38648714
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38648504 tcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgagatatcaaatgaata 38648601  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38648602 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaga 38648701  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  38648702 aacggaggtagta 38648714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20605814 - 20605604
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20605814 tcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattggttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 20605717  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20605716 aggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatg 20605617  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||| |||||||||    
T  20605616 aatggaggtagta 20605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37437243 - 37437033
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37437243 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagataaa--aatatattaaatgagatattaaatgaata 37437146  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37437145 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtggtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 37437046  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  37437045 aacagaggtagta 37437033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 45368135 - 45368345
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368135 tcaaagttcaatgaaacattgaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 45368232  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45368233 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaag 45368332  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  45368333 aactgaggtagta 45368345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35483969 - 35483761
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35483969 tcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagaga----aatatatgaaatgagatattaaatgaata 35483874  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35483873 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaataatatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaag 35483774  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  35483773 aacggaggtagta 35483761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37609491 - 37609295
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609491 tcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 37609394  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609393 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa---agtatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 37609297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12124691 - 12124890
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12124691 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 12124788  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12124789 agattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatggcaaaatgtgacaattaaaaagg 12124888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12231245 - 12231051
Alignment:
Q  17 cattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12231245 cattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaa 12231148  T
Q  117 agtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12231147 agtacagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 12231051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 1429333 - 1429530
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1429333 aaagttcattgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatacaaaatgagatattaaatgaataag 1429430  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1429431 gtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcatttgtagattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 1429530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21927886 - 21927689
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21927886 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatataaaatgaaatattaaatgaata 21927789  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21927788 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtc--aatgtgacaattaaaaagg 21927691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13507817 - 13508027
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13507817 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaattaata 13507914  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13507915 aagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaagg 13508014  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  13508015 aacggaggtagta 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13515005 - 13515215
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13515005 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaattaata 13515102  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13515103 aagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaagg 13515202  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  13515203 aacggaggtagta 13515215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 1677258 - 1677443
Alignment:
Q  14 caacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1677258 caacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagt 1677355  T
Q  114 aaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1677356 aaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 1677443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45226767 - 45226571
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45226767 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattg--tggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 45226670  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45226669 aagtcattataataaaagtatagcttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 45226571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 49497202 - 49497398
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  49497202 aagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgtgatattaaatgaataagg 49497299  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  49497300 tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaataatatcaattgttaattgtcttagtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaa 49497398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 29830828 - 29831010
Alignment:
Q  29 ttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttat 128  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29830828 ttttaccaatattggtcttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat 29830925  T
Q  129 tgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29830926 tgcatcaaaagtaatatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29831010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32994659 - 32994463
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32994659 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 32994562  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  32994561 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaaagacaattaaaaag 32994463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18034016 - 18033806
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034016 tcaaagttcaatccaacattaaatattgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 18033919  T
Q  101 agatcattatagt-aaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18033918 aggtcattatagtaaaaaatatagcttattgcatcaaaatgagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatg-aaaaatgtgacaattaaaaag 18033820  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  18033819 gaacggaggtagta 18033806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 28679068 - 28679271
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28679068 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtctttagttatttattgcggaga--gagaaatatatcaaatgagatattaaatgaata 28679165  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28679166 aggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtataaattgttaattgtcttaatttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaga 28679265  T
Q  201 aataga 206  Q
    ||||||    
T  28679266 aataga 28679271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50825762 - 50825550
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50825762 tcaaagtttaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 50825665  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||      
T  50825664 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaa-tgttgattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaaa 50825566  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||  ||||||||||||    
T  50825565 aacggaggtagtacta 50825550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7782998 - 7783196
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||    
T  7782998 tcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattgttcttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaataa-atgttaaatgaata 7783094  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7783095 aggtcattatagtaaaagtatagttaattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 7783194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13699221 - 13699420
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699221 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatactatccttagttatttattacggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 13699318  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13699319 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatggcaattaaaaagg 13699418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19929656 - 19929457
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19929656 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttaccaatattattctttgttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaattaata 19929559  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  19929558 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaagg 19929459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31588929 - 31588735
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31588929 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgc-ga-agagataaatatatgaaatgagatat-aaatgaata 31588833  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31588832 aggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtattaatttttgattatcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaa 31588735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464248
Alignment:
Q  47 tagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatc 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8464401 tagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatc 8464304  T
Q  147 aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464303 aattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 8464248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 35255533 - 35255739
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35255533 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgc-ga-agagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaaca 35255630  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  35255631 aggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagt 35255730  T
Q  201 aatagaggt 209  Q
    || ||||||    
T  35255731 aacagaggt 35255739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 44182807 - 44183004
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44182807 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc--ggagagataaatatatgaaatgagata-taaataaata 44182903  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44182904 aggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc-aaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaagg 44183002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 52749064 - 52749257
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52749064 tcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttatatcaatattatccttagttatttattg----tggagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 52749159  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  52749160 agattattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgattcgtgtaaaatgtcaaaatataacgattaaaaa 52749257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49908370 - 49908173
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  49908370 aaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatatcgaattaataag 49908273  T
Q  103 atcattatagtaaaagtata---gcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49908272 gtcattatagtaaaaatataatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagttcgtataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 49908173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 10675949 - 10676159
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10675949 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctaagttatttattgcggaga--gagaaatatataaaatgagatattaaataaata 10676046  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||  |||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10676047 aggttattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtaataacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaagg 10676146  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  10676147 aacagaggtagta 10676159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51972471 - 51972261
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51972471 tcaaaattcaatgcaacatgaaatattattttaccaatattatcattagctatttattgcagagagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 51972374  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||      
T  51972373 atatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaat 51972274  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  51972273 aacagaggtagta 51972261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2059976 - 2059791
Alignment:
Q  27 tgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagctt 126  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  2059976 tgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaa--aatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataactt 2059879  T
Q  127 attgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtac 214  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2059878 attgcatcaaatgtagtaacaattattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagtac 2059791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 9127717 - 9127915
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  9127717 aagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagtattatccttgctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatattaaatgaataagg 9127816  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9127817 ttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 9127915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 32348025 - 32348237
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32348025 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattg--tggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatgaata 32348122  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||| ||||||||||||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32348123 aggttattctagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaa-gtgacaattaaaaagg 32348221  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||  ||||||||||||    
T  32348222 aacggaggtagtacta 32348237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 44818501 - 44818645
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44818501 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcatagag--agaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 44818598  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatca 147  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44818599 aggtcattacagtaaaactatagcttattgcatcaaaagtagtatca 44818645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30702480 - 30702279
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |  ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  30702480 tcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtagagaaaaa--aatatataaaatgagataataaataaata 30702383  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  | |||||||||||||||||   ||||| ||||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30702382 atgttattatagtaaaagtataaaatattgtatcaaaagtggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 30702283  T
Q  201 aata 204  Q
    ||||    
T  30702282 aata 30702279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 43952835 - 43953017
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43952835 tcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaatattatctttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgcgatgttaaatgaata 43952932  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43952933 aggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtag----------tgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 43953017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39412676 - 39412502
Alignment:
Q  26 ttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagct 125  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  39412676 ttgttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataact 39412579  T
Q  126 tattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39412578 tattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgttttggtttgtataaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaa 39412502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 12721487 - 12721704
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  12721487 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatttcccttagatatttattgc--agagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaata 12721584  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||| ||| |    |||| ||||||| |||||  | || || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12721585 aggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttatttattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 12721684  T
Q  201 aatagaggtagtactatatt 220  Q
    || |||||||||| ||||||    
T  12721685 aacagaggtagtagtatatt 12721704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32168502 - 32168292
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  32168502 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaaca 32168405  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32168404 aggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 32168306  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  32168305 gaacggaggtagta 32168292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51974358 - 51974162
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  51974358 aagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatattatccttgcttatttattgt-ga-agagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataagg 51974261  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51974260 ttattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 51974162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35700565 - 35700355
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35700565 tcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 35700468  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  35700467 aggctattatagtaaaagtatcaattattatatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaagg 35700368  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  35700367 aacggaggtagta 35700355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 38597638 - 38597848
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38597638 tcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttatt--atggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 38597735  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38597736 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagg 38597835  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || |||| |||||    
T  38597836 aacagagatagta 38597848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 51613458 - 51613668
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||   || ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  51613458 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattactcttagatatttattgc--ggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaaca 51613555  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  51613556 aggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaagtgacaattaaaaag 51613654  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  51613655 gaacggaggtagta 51613668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9362020 - 9362219
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9362020 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattac-ga-agagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 9362117  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| ||||  | || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9362118 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaaaatttattgagtgtcttgatttgtataaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagg 9362217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 10506860 - 10507057
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506860 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcgatattacccttagttatttattgc----ggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 10506955  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  10506956 aggctattatagtacaagtatcaattattgcatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaagg 10507055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19455589 - 19455410
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||    ||||||||||||||    
T  19455589 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttaattatttattgc--ggagagagaaatctatgaaacataatattaaatgaata 19455492  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    |||  ||| ||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455491 agactattttagtaaaggtataaattattgtatcaaaagtagtaac-attattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 19455410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31487964 - 31487770
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  31487964 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-attgtagaaagaaa--aatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 31487868  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487867 tattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 31487770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52649919 - 52649720
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||     
T  52649919 tcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattacagagagtga--aatatatgaaacaagatattaaatgaatg 52649822  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||| | ||||| |||  |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52649821 aggctattattggaaaaggatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgattagtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 52649722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 36318400 - 36318616
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||   |||  |||||||||| | ||||||  ||||    
T  36318400 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttatttatttattacaaagaga---aaaattatgaaatgacacattaaacaaata 36318496  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36318497 aggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatcaaaagtagtgacatttattgaatgtattggtttgtgtaaattgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 36318596  T
Q  201 aatagaggtagtactatatt 220  Q
    ||  ||||||||| ||||||    
T  36318597 aacggaggtagtaatatatt 36318616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 15660634 - 15660831
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  15660634 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattacggaga--gagaaatatatgaaataaaatattaaatgacta 15660731  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||| || | ||| | || || || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  15660732 agactattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgatagttaaaaagg 15660831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4101097 - 4100889
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||| |  || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4101097 aaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagaaa--aacatatgaaatgaaatattaaattaataag 4101000  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||||||||||||| |    |||| ||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||    
T  4100999 atcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtaataattaaaaaggaa 4100900  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  4100899 cggaggtagta 4100889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781806
Alignment:
Q  9 caatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24781916 caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcatt 24781819  T
Q  109 atagtaaaagtat 121  Q
    |||||||||||||    
T  24781818 atagtaaaagtat 24781806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 18344379 - 18344585
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |    
T  18344379 ttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattg--tgcagagagaaatatatgaaatgagataataaacaaataaggtta 18344476  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||| | |||  | || || ||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  ||    
T  18344477 ttatagtaaaagtataaagtattgtatcaaaagtggtaatatttattaattatattgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaatgaacgga 18344576  T
Q  207 ggtagtact 215  Q
    |||||||||    
T  18344577 ggtagtact 18344585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Original strand, 5598145 - 5598291
Alignment:
Q  44 ccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||          ||||||||||| ||||    
T  5598145 ccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa----------ttgcatcaaaagtagt 5598232  T
Q  144 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5598233 aataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaa 5598291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 46096599 - 46096792
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||  |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  46096599 ttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaatt--atggggagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataagatta 46096696  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    || ||||||||||||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| ||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  46096697 ttgtagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatgtgtataaaatatcaaaaagtgacaattaagaaggaa 46096792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1427726 - 1427925
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1427726 tcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatccttagttatttattgc--aaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 1427823  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |    ||||||||||||||| |  |||||| || | ||| |||| || || | |  | |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  1427824 atgctattatagtaaaagtaaaaattattgtataagaaaaagtaacatttatagtgtatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgataattaaaaagg 1427923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 213
Target Start/End: Original strand, 42800160 - 42800363
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||   ||    
T  42800160 ttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattatccttatatatttattg----gagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataatgcca 42800255  T
Q  107 ttatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatag 205  Q
    || |||||||||| | |    |||| ||||| | ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  42800256 ttttagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaagagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaatga 42800355  T
Q  206 aggtagta 213  Q
    ||||||||    
T  42800356 aggtagta 42800363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37735329 - 37735119
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37735329 tcaaagttcaatgcaaaattaaatattgttttaccaacattacccttatatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 37735232  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||  | |    |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  37735231 aggctattatagtaaaatcaaaaacaattgtatcaaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatttgaaaaagtgataattaaaaagg 37735132  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  37735131 aacggaggtagta 37735119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Original strand, 48508185 - 48508376
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  48508185 agttcaatgcaacattaaaagttattttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 48508281  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||  | || || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508282 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaacatttattgattattttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 48508376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40926933 - 40926733
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||   |||| |||||||| || ||||||||  ||||||||||| || ||||         |    
T  40926933 tcaaagttcaatgcaacaataaacgatgttttatcaatattactctta-ttatttatggcggagagaga--aatatatgaaacgaaatat---------a 40926846  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40926845 aggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaag 40926746  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  40926745 aacggaggtagta 40926733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 43808945 - 43809150
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgaga-----tattaaa 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |     |||||||    
T  43808945 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattacccttagatatttattgc--agagagagaaacatatgaaatgaaatactgtattaaa 43809042  T
Q  95 tgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 194  Q
    | ||||||   ||||||||||||||| |  | |||| |||||||  |||| || || |||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  43809043 ttaataaggctattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagcagtaacacttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaatta 43809142  T
Q  195 aaaaggaa 202  Q
    ||||||||    
T  43809143 aaaaggaa 43809150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 33720582 - 33720760
Alignment:
Q  19 ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||||| |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33720582 ttaaatgttgttttaccaatattacccttaaatatt-attgcggagagagaaaaacat--gaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaag 33720678  T
Q  119 tatagctta-ttgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |    | ||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33720679 taaaaaacaattgtatcaaaaatagtatcatttattgataatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaag 33720760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31570824 - 31570628
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||  ||| ||||||| |||||| | ||  ||||||||||||||     
T  31570824 aagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttacttatttat--cacggagtgagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataagg 31570727  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    | ||||||||||||||||   || ||  ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||||    
T  31570726 ttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgccttaaagtgacacttaaaaaggaa 31570628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1039557 - 1039445
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1039557 tcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacacttagatatttattgca---agagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 1039461  T
Q  101 agatcattatagtaaa 116  Q
    || |||||||||||||    
T  1039460 aggtcattatagtaaa 1039445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1046463 - 1046351
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||||   ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1046463 tcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaagattacacttagatatttattgca---agagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 1046367  T
Q  101 agatcattatagtaaa 116  Q
    || |||||||||||||    
T  1046366 aggtcattatagtaaa 1046351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 17013472 - 17013683
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgag---at-attaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||  |  ||||||||||| |||||| | ||   || |||||||||||    
T  17013472 aagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatctttacttatttatt--acggagagagaaatgtatgaagttagtgaatgattaaatgaat 17013569  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||| | ||||||||||||||||   || ||  ||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||   ||  ||||| ||||||||    
T  17013570 aaggttattatagtaaaagtatgcgttgttctatcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgttttaaattgacacttaaaaag 17013669  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  17013670 gaacggaggtagta 17013683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48174860 - 48174664
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||   ||||||| | |||||  ||||||  |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| || |||||| || |||    
T  48174860 aaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaatattacccttaaatatttattgcggagagaga--aacatatgaaatgaaatgttaaattaacaag 48174763  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||||||||      |||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  48174762 gtcattatagtaaaagtaattacaattgtatcaaaa-tagtatcatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgataattaaaaaggaa 48174664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 8464639 - 8464585
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8464639 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttattt 8464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 2572018 - 2572216
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||  | |||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  2572018 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtga--aatatatgaaatgaaatattaaataatta 2572115  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  |||||  ||||||| |||||  |||  || ||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2572116 aggttattatagaaaaaagataatttattatatcaaaagtagtaaaaatattt-attatcttgatatgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaagg 2572214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605844
Alignment:
Q  80 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc 179  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||  ||||||| || ||  | || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  35605722 aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaattaataatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtc 35605821  T
Q  180 aaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  35605822 aaatagtgacaattaaaaaggaa 35605844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 1038130 - 1038248
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| | ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  1038130 tcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatccttgaatatttattacggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaat 1038227  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagta 120  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  1038228 aaaatcattataataaaagta 1038248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 1045036 - 1045154
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||| | ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||    
T  1045036 tcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatattatccttgaatatttattacggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaat 1045133  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagta 120  Q
    || ||||||||| ||||||||    
T  1045134 aaaatcattataataaaagta 1045154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38818109 - 38817996
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||        
T  38818109 ttcaatgcaacaataaatgttgttttagcaacattacccttagttatttatt--acggagagagaaatatgtgaaataatatattaaatgaataaggctg 38818012  T
Q  107 ttatagtaaaagtata 122  Q
    ||||||||||||||||    
T  38818011 ttatagtaaaagtata 38817996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 48265221 - 48265091
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| |||||  |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |    
T  48265221 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttattta-ttatt--atggagagagaaatatatgtaatgagacattaaataaataaggt 48265125  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaa 138  Q
     |||||||||||| || |  |||||| |||||||    
T  48265124 tattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaa 48265091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 52759075 - 52759270
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  52759075 tcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctataatgcccttagtaatttattgc--agagagagaaatatatgaaatatgatattaaataatta 52759172  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||   |||||| | |||  |||  |||||| || |||| ||||   |    || | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  52759173 aggatattataattaaaacataagttattgtataaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaa 52759270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 11248828 - 11248922
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||  ||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11248828 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttgattatttatttc--agagagagaaatatatgaaatgagatattacatga 11248922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8008357 - 8008240
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||  ||||||||  | |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  8008357 aaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattactcttaattatttattgtggagagaga--agtatatgaaagaagatattaaattaataag 8008260  T
Q  103 atcattatagtaaaagtata 122  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  8008259 atcattatggtaaaattata 8008240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 213
Target Start/End: Original strand, 1428519 - 1428662
Alignment:
Q  70 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgt 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||| | || || || ||   | |||| ||||||    
T  1428519 gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattaggtatcttagtttgt 1428618  T
Q  170 gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  1428619 gtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaaggaacagatgtagta 1428662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8973641 - 8973429
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||  |||||  |||||||||   || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |     
T  8973641 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatattacccttatatatttattg--tagggagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattg 8973544  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  | ||||||| ||||  |||  || ||| || |||| |||||  || | ||  |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8973543 atgttattataggaaaaagataaattgttgtataaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagg 8973445  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||  |||| |||||||    
T  8973444 aactgaggaagtacta 8973429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 19093315 - 19093367
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttat 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  19093315 tcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttagttat 19093367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42787476 - 42787335
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||| || | |  ||||||||||||||||    
T  42787476 tcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagaga--aatacattatacaagatattaaatgaata 42787379  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    || | ||||| |  |||| |||  |||||| ||||||| |||||    
T  42787378 aggttattattgagaaaggataaattattgtatcaaaagtagta 42787335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 50152480 - 50152574
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||   ||| | | || |||||||||| |||||||||||||    
T  50152480 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattg--tagaaatataattatatgaaataagatattaaatga 50152574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 1859142 - 1859239
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  1859142 tcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttatatatttatt----atagagagaagtatatgaaatgagatattagatgatta 1859237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 52825324 - 52825401
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatga 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  52825324 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagag--agagaaatatatga 52825401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 45230717 - 45230768
Alignment:
Q  156 ttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagag 207  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45230717 ttgtcttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacagag 45230768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1039113 - 1039067
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1039113 ttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaa 1039067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1046019 - 1045973
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1046019 ttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaa 1045973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 35605505 - 35605555
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt 51  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35605505 tcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 35605555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Original strand, 36850813 - 36850883
Alignment:
Q  132 atcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||| ||||| || || |||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  36850813 atcaaaagtagtaacatttattgactgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaa 36850883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48264810 - 48264756
Alignment:
Q  159 tcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  48264810 tcttggtttgtataaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 48264756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Original strand, 41155477 - 41155520
Alignment:
Q  159 tcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41155477 tcttgatttgtgtaaaatgtcaaaataagacaattaaaaaggaa 41155520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15675369 - 15675327
Alignment:
Q  161 ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15675369 ttggtttgtaaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaat 15675327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22154674 - 22154628
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaat-gtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22154674 tgtcttagtttgtgtaaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 22154628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 37296912 - 37296858
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttatt 58  Q
    |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37296912 aagttcaacgcaacattgaatattattttaccaatattatccttacttatttatt 37296858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42787194 - 42787144
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42787194 ttgattgtcttgatttaggtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaa 42787144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Original strand, 5597871 - 5597920
Alignment:
Q  2 caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||    
T  5597871 caaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacccttagtt 5597920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 198
Target Start/End: Original strand, 52825479 - 52825512
Alignment:
Q  165 tttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52825479 tttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaa 52825512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 27992287 - 27992494
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27992287 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaata 27992384  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27992385 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtattgggttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 27992484  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    || |||||||    
T  27992485 aacagaggta 27992494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 47070056 - 47069860
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47070056 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 47069959  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47069958 aaattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 47069860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54898285 - 54898086
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54898285 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 54898188  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54898187 aggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 54898088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 54106310 - 54106520
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54106310 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcatagag--agaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 54106407  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54106408 aggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaagg 54106507  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  54106508 aacggaggtagta 54106520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34266637 - 34266429
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34266637 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgc----tgcgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 34266542  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34266541 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaagg 34266442  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  34266441 aacggaggtagta 34266429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 43554437 - 43554646
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43554437 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaaagaga--aatatatgaaatga-atattaaatgaata 43554533  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43554534 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagt 43554633  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  43554634 aacggaggtagta 43554646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 790597 - 790796
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||    
T  790597 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--attatatgaactgggatattaaatgaata 790694  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  790695 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgatcattaaaaagg 790794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19550293 - 19550492
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19550293 tcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttatcaatattgttcttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 19550390  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19550391 aggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 19550490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53745480 - 53745282
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53745480 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttcttgtggagagaga--aatatatgaaatg-gatattaaatgaata 53745384  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53745383 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 53745284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 29698038 - 29698250
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29698038 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaa-tgagatattaaatgaata 29698134  T
Q  101 -agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29698135 gaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 29698234  T
Q  200 gaatagaggtagtact 215  Q
    |||  |||||| ||||    
T  29698235 gaacggaggtattact 29698250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45101555 - 45101347
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45101555 aaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataag 45101458  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45101457 gtcattataggaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcagctgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 45101358  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  45101357 cggaggtagta 45101347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51697763 - 51697571
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51697763 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtccttagttatttattgcggggagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 51697666  T
Q  101 agatcattatagtaaaa-gtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 194  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51697665 aggtcattatagtaaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaatta 51697571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27483983 - 27483777
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27483983 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgc----ggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 27483888  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27483887 gtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcctgatttgtataaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaa 27483788  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
     ||||||||||    
T  27483787 cagaggtagta 27483777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 29651715 - 29651925
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29651715 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 29651812  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29651813 aagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaactgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaag 29651912  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  29651913 aacggaggtagta 29651925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 43945443 - 43945636
Alignment:
Q  18 attaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43945443 attaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgc-ga-agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaa 43945540  T
Q  118 gtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  43945541 gtatagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 43945636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24981337 - 24981532
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24981337 tcaaagttcgatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtctttagttatttattgcagag--agagaaatatatgaaatgatatattaaatgaata 24981434  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24981435 aggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttagtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 24981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 52663489 - 52663684
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52663489 tcaaagttcaaagcaatattaaacgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 52663586  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  52663587 aggtcattatagcaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtgaaatgtcaaaatatgacaattaaaaa 52663684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 51244671 - 51244867
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51244671 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 51244768  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  51244769 agatcattataataaaaatatggcttattgcatcaaaactagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatattacaagtaaaaag 51244867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42672087 - 42671879
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42672087 aaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagaaagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaataag 42671990  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42671989 gttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaa 42671890  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  42671889 cggaggtagta 42671879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13158638 - 13158428
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13158638 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggagagaga--aatataagaaatgatatattaaatgaata 13158541  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13158540 aggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaagg 13158441  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  13158440 aacggaggtagta 13158428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43775589 - 43775379
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43775589 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagctatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 43775492  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43775491 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaaaattaaaaagg 43775392  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  43775391 aacggaggtagta 43775379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52627434 - 52627238
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  52627434 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatg-gatattaaatgaataaa 52627338  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52627337 gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaatatcaatcgttaattatcttggtatgaggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 52627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3376507 - 3376293
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaa--tatatgaaatgagatattaaatgaa 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3376507 tcaaagtccaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 3376408  T
Q  99 taagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||| |||||||||||||| || | |||||| ||| |||||||||| ||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3376407 taaggtcattatagtaaaaatacaacttattacataaaaaatagtaacaatcattgattatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacagataaaaa 3376308  T
Q  199 ggaatagaggtagta 213  Q
    ||||| |||||||||    
T  3376307 ggaattgaggtagta 3376293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 46973470 - 46973666
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46973470 tcaaagttcaatacaacatcaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgatatattaaatgaata 46973567  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46973568 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgctttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaag 46973666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33491338 - 33491127
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33491338 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttaattatttattacggagagtga--aatatatgaaatgagatattaaataaata 33491241  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491240 aggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 33491141  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    ||  ||||||||||    
T  33491140 aacggaggtagtac 33491127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 35315179 - 35315378
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35315179 tcaaagttcaatacaaccttaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatgttaaatgaaca 35315276  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35315277 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagg 35315376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 6902327 - 6902521
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6902327 aaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagag--agagaaatatatgaaatgaaatattaaataaataag 6902424  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6902425 gtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaatgtagtatcaattgttgatggtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacagttaaaaag 6902521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 32980687 - 32980897
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32980687 tcaaaattcaatacaacattaaataatgttttatcaatattacccttagttatttattgtagag--agagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 32980784  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32980785 aggtcagtataataaaagtataacttattgcatcaaaagtattaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 32980884  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||| ||||||    
T  32980885 aacagatgtagta 32980897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 28885727 - 28885919
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885727 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 28885824  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
     |||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28885825 gtcattatagt-aaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaataattgactatcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa 28885919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 36234414 - 36234610
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36234414 tcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttattttttgcggaga--gagaaatatatgaaataggatattaaatgaata 36234511  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36234512 agatcattacagtaaaagtatagcttattgtatcaaa---agtatcactttttgattgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 36234608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 41168808 - 41169000
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41168808 tcaaacttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 41168905  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa---aatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    || |||||||      |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41168906 aggtcattat------agtatagcttattgcatcaaaagtagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 41168999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 49123570 - 49123779
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49123570 tcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 49123667  T
Q  101 agatcattatagtaaaa--gtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49123668 aggtcattatagtaaaagtgtatagtttattgcatcaaatgtagtatcaa---ttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgactattaaaaa 49123764  T
Q  199 ggaatagaggtagta 213  Q
    ||||  |||||||||    
T  49123765 ggaacggaggtagta 49123779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39867046 - 39866852
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  39867046 aaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattattcttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaattaacaag 39866949  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39866948 gtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 39866852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 45145176 - 45145385
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45145176 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcggaaagagata--tatatgaaatgagatgttaaatgaata 45145272  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  45145273 agatcattatagtaaaagtataacttattgcagcaaaagtaataataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaagg 45145372  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  45145373 aaaggaggtagta 45145385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13168064 - 13168251
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13168064 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt--acagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 13168161  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | || |||||||||||||| ||||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13168162 agctaatcatagtaaaagtataacttattgc------------atcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaagg 13168249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41926724 - 41926937
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41926724 tcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcgttagttatttattgcggagataaaaaaa-atatgaaatgagatgttaaatgaata 41926822  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaa---aatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41926823 agatcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt-aaaaagtgacaattaaaa 41926921  T
Q  198 aggaatagaggtagta 213  Q
    ||||| ||||||||||    
T  41926922 aggaacagaggtagta 41926937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 51219283 - 51219082
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||            |||    
T  51219283 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatga------------ata 51219198  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaatt---gttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51219197 agatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaatatgtgacaattaaaa 51219098  T
Q  198 aggaatagaggtagta 213  Q
    |||||  |||||||||    
T  51219097 aggaacggaggtagta 51219082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17102801 - 17102996
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17102801 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaaagag--aaatatatgaaatgagatgttaaatgaata 17102898  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17102899 aggtcattataataaaagtataaattattgcatcaaaagtagtaacaattattaattgttttaatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaa 17102996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25983861 - 25983658
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  25983861 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc-ga-agagataaatatataaaatgagaagttaaatgaaca 25983764  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  25983763 aagtcattatagtaaaagtataacttatt-catcaaaaatagtaacaattgtagattatcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaactgacaattaaaaaag 25983665  T
Q  201 aatagag 207  Q
    || ||||    
T  25983664 aacagag 25983658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40140027 - 40139858
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  40140027 ttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattacccttaattatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaataaggtca 40139930  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40139929 ttatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 40139858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803906
Alignment:
Q  21 aaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagta 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||           |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29803727 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga-----------aat---atattaaatgaataagatcattatagtaaaagta 29803812  T
Q  121 tagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtac 214  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29803813 taacttattgcatcaataatagtatcaattgttgattgtcttggttcgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtac 29803906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45513812 - 45513673
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513812 aaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataag 45513715  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  45513714 gtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagta 45513673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3643394 - 3643185
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3643394 tcaaagttcaatgcaac-ttaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattgcggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 3643298  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3643297 aggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttcttgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacacttaaaaagg 3643198  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||| |||||||||    
T  3643197 aatggaggtagta 3643185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 50091992 - 50092202
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50091992 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattttccttagttatttatt--acggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 50092089  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| | || || || || | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  50092090 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttatttagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacagttaaaaagg 50092189  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  50092190 aacggaggtagta 50092202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54911500 - 54911305
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  | ||| ||||||||||  ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54911500 tcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttatcaatattacctttaattatttattgtggagtgaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 54911403  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54911402 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtctt-atatatgtaaaattttaaaatgtgacaattaaaaag 54911305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 7328502 - 7328637
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7328502 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaata 7328599  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaa 138  Q
    || |||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7328600 aggtcattataatgaaagtataacttattgcatcaaaa 7328637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 11473449 - 11473648
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11473449 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggaaagaga--agtatatgaaataagatattaaatgacta 11473546  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11473547 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacaattaaaaagg 11473646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27039805 - 27039595
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27039805 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttgattatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 27039708  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||    |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  27039707 aggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaagg 27039608  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  27039607 aacagaggtagta 27039595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 51064930 - 51065128
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51064930 tcaaagttcaatacaatattaaatgttattataccaatattatccttagatatttattgcggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 51065027  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||||||| |||||| |    |||| ||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  51065028 agatcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgataattaaaaagg 51065127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24260 - 24053
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||   |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24260 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaataagg 24163  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | || || | ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  24162 ttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacacttaaaaaggaat 24063  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
    ||||| ||||    
T  24062 agagggagta 24053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 20105239 - 20105438
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20105239 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattg--tggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaata 20105336  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||           |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||||||||||||||    
T  20105337 aggtc-----------agtacatcttattgcatcaaaagtggtatcaattgttgattgtcttgatttatgt--------aaaatgtgacaattaaaaagg 20105417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33074472 - 33074278
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||| ||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  33074472 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattactcttattta-ttattgc--ggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 33074376  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33074375 tattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtagcagcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaataaaaaggaa 33074278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40010863 - 40010652
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40010863 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattacccttagttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 40010766  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||    |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  40010765 aggttattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacacttaaaaagg 40010666  T
Q  201 aatagaggtagtac 214  Q
    ||  ||||||||||    
T  40010665 aacggaggtagtac 40010652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5244134 - 5243925
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  5244134 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcagaga--gagaaatatatggaataagatattaaatgacta 5244037  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  | |||| || | ||| |||| || || |||| |||| || ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  5244036 aggttattatagtaaaagtataaatgattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcctgatttatgtaaaatgtcaaaa-atgacagttaaaaagg 5243938  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  5243937 aacagaggtagta 5243925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47104354 - 47104155
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47104354 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcattagatatttattg-tga-agagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 47104257  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||| |    |||  ||||||||||||| || || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  47104256 aagtcattatagtaaaagtaaaatcaattatatcaaaaatagtaacatttattgattgttttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtggcaattaaaaagg 47104157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Original strand, 41425681 - 41425888
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  41425681 agttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 41425777  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaata 204  Q
     |||| ||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  41425778 tattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 41425877  T
Q  205 gaggtagtact 215  Q
    |||||||||||    
T  41425878 gaggtagtact 41425888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30861741 - 30861533
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30861741 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagctatttattgc--ggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 30861644  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||||| || | ||| | || || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||    
T  30861643 agactattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttgttg--tgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgaacgttaaaaagg 30861546  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  30861545 aacggaggtagta 30861533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33874745 - 33874535
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  33874745 tcaaagttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaata 33874648  T
Q  101 agatcattatagtaaaa-gtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||  ||||||||||||| ||| | |  |||| ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33874647 aggccattatagtaaaaggtaaaac-aattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaag 33874549  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  33874548 gaacggaggtagta 33874535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 48152032 - 48152231
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48152032 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattg--ttgaaagagaaatatataaaatgagatatcaaatgaata 48152129  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||    ||||| ||||||| || ||  | || |||||||| ||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  48152130 aggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtaataatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatataaaaaaatgacaattaaaaagg 48152229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32854147 - 32853967
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  32854147 tcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttatcaacattacccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataaaatattaaatgacta 32854050  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32854049 aggttattatagtaaaagtatacattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 32853967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 45055234 - 45055429
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45055234 tcaaagtttaatgcatcattaaatgttgttttactaatattatcttttattatttattgcggaga--gagaaatataagaaatgagatgttaaattaata 45055331  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |  |||| |||||||||||| ||| |||||||| | ||||  |||||||||||||    
T  45055332 atgtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttgatttatgtaaaatattaaaaattgacaattaaaaa 45055429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 52175767 - 52175965
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||   |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  52175767 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttgaatatttattgc--ggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 52175864  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  |||||| |||||||||| |    |||| ||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52175865 aagtcattacagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataac-attgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtcataattaaaaagg 52175963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20848918 - 20848713
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |     |||| || |||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20848918 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattactcttagat-----ttgcggaaagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 20848826  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||  |||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20848825 aggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacagttaaaaagg 20848726  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  20848725 aacggaggtagta 20848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32853542 - 32853348
Alignment:
Q  16 acattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||| | ||    ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||    
T  32853542 acattaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaaacat----gaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaa 32853447  T
Q  116 aagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtac 214  Q
    ||||| |    |||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32853446 aagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagttacaattaaaaaggaatggagatagtac 32853348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41351390 - 41351183
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||  |  |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  41351390 aagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatctttgttcgtttattgt-ga-agagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataagg 41351293  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | |||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| || |  |||| ||||||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||     
T  41351292 ttattatagtaaaagtatatattattatatcaaaagtagtaacattaattgaatgtcttgatttatgtaaaatatcagaaagtgacaattaaaaaggaac 41351193  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  41351192 ggaggtagta 41351183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 42515371 - 42515174
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||| ||||  |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42515371 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattattacctttagatatctatt--acggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 42515274  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||| |    |||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  42515273 aggcgattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagta--acttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagttacaattaaaaagg 42515176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29458341 - 29458207
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || ||||||||||||    
T  29458341 gagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttg 29458242  T
Q  164 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29458241 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaa 29458207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 55141675 - 55141504
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55141675 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattg--ttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaata 55141578  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaa 174  Q
    || | ||||||||||||||||    ||||  |||||||||||||  | || |||||||| ||| |||| |||||    
T  55141577 aggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaaatagtaatatttattgattgtattgatttgcgtaaa 55141504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40319122 - 40318917
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  40319122 agttcaatgcaacattaaatgttactttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatctaatgagatattaaataaataaggt 40319026  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaata 204  Q
     |||| ||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  40319025 tattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaatgaacg 40318926  T
Q  205 gaggtagta 213  Q
    |||||||||    
T  40318925 gaggtagta 40318917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 48214114 - 48214312
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| | |||||              |||||||||    
T  48214114 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattgtggagagagaaatatata--------------aaatgaata 48214199  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  ||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48214200 agactattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattggtgtgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 48214299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27028214 - 27028004
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27028214 tcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 27028117  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||  |||||| ||||||||    || ||| || | ||| |||| || || || | ||| ||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  27028116 agactattataataaaagtactaatttttgtataagaaaaagtaacatttatttaatgtattggtatgtgtaaaatgtcaaaaaatgacggttaaaaagg 27028017  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  27028016 aacggaggtagta 27028004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 35077434 - 35077644
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||    
T  35077434 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgc--agagagagaaatataggaaatatgatattaaataatta 35077531  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||  |||  |||  |||||||||||||| ||||   |    || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35077532 aggatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagg 35077631  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||| ||||    
T  35077632 aacagagggagta 35077644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 54334382 - 54334183
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || |||||| |  ||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  54334382 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttatttatttatcgcggagagaaa--aatatatgacataagatattaaataacta 54334285  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||| ||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  54334284 aggctattataataaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgagttaaatgtcaaaaagtgatagttaaaaagg 54334185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 52173794 - 52173991
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||   ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  52173794 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgc--agagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaactaata 52173891  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||  |||||||||| |    |||  ||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52173892 aggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattatatcaaaagtaataac-attattaattgtcttggtttgtgt-aaatatcaaaaagtgacaattaaaaagg 52173989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943523
Alignment:
Q  30 tttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttatt 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  28943704 tttaccaatattatccttagttatttattacggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattatt 28943607  T
Q  130 gcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtc-ttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    | || | ||| |||| || || |||| || | ||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||  |||||||||    
T  28943606 gtataagaaaaagtaacatttattgagtgcctttgatttgtgtaaaatgttaaaa-gtgaccgttaaaaaagaacggaggtagta 28943523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 183
Target Start/End: Original strand, 49168413 - 49168591
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||| | ||||||||||| ||||    
T  49168413 aaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattactcttagttatttattg-ag-gagagaaaaatatttgaaataatatattaaatgactaag 49168510  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    || |||||| ||||| ||||  |||||| || | ||| |||| || || || | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  49168511 attattataataaaaatataaattattgtattagaaaaagtaacatttattaagtatcttggtttgtttaaaatgtcaaaa 49168591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 53282026 - 53282145
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53282026 tcaaggttcaatgcagcaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttattacggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgacta 53282123  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtata 122  Q
    |||  |||||||||||| ||||    
T  53282124 agactattatagtaaaaatata 53282145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34750702 - 34750911
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | ||| || |||||  |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||| | ||    
T  34750702 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttgcctatattacccttatatatttattgcagagagaga--aatatatgaaatgaagcattaaataatta 34750799  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  | |  ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  34750800 aggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaagtagtaaaagtatttg-ttgtcttgatttgtgtaaaaagacaaaatgagacaattaaaaagg 34750898  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    |||||||| ||||    
T  34750899 aatagagggagta 34750911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 44544368 - 44544300
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44544368 tcaaaattcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 44544300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45513380 - 45513302
Alignment:
Q  140 tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtactata 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  45513380 tagtatcaattgttgattgttttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggatgtagtactata 45513302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 7329008 - 7329081
Alignment:
Q  140 tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7329008 tagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaatggaggtagta 7329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 26748400 - 26748609
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  26748400 tcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgctgagagaga--aatatatggaatgaagtattaaattatta 26748497  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  |    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26748498 aggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaagcatttg-ttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 26748596  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
     | ||||| ||||    
T  26748597 gacagagggagta 26748609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2858627 - 2858564
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtact 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2858627 ttgattgtcttggtctgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtact 2858564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 23771334 - 23771533
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |    
T  23771334 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttacctttattacccttgattatttattg--tagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatga 23771431  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  || | |   ||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  23771432 aggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatatgttgtcttggtttgcgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 23771530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35458703 - 35458493
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||  | ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  35458703 tcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttatt--agagagagaaaaatatatgaaatatgatattaaataatta 35458606  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt---at-caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
    ||   |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||||   || |||||    | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35458605 aggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacaatt----agtgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgtgacaattaaa 35458510  T
Q  197 aaggaatagaggtagta 213  Q
    ||| ||  |||||||||    
T  35458509 aagaaacggaggtagta 35458493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 28226474 - 28226564
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28226474 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttagtaatttattgc----agagagaaatatatgaaatatgatattaaat 28226564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544091
Alignment:
Q  74 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44544155 tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaa 44544091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 8237033 - 8236895
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||  | ||||| ||||  || || | || | | |||    
T  8237033 gagagaaaaatatatgaaattagatattaaatgaacaaggttattatagtaaaagtataaattattataacaaaagtagttacatttatggacttttttg 8236934  T
Q  164 gtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8236933 atttatataaaatgtcaaaatgtgtcagttaaaaaggaa 8236895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 44092226 - 44092181
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44092226 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctta 44092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 42671605 - 42671477
Alignment:
Q  7 ttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatca 106  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |    
T  42671605 ttcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaagtta 42671509  T
Q  107 ttatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaa 138  Q
    |||||||| || ||||  |||||| |||||||    
T  42671508 ttatagtacaaatataaattattgtatcaaaa 42671477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22100020 - 22099905
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||||  |  || |||||||| || ||| |  |  |||||||||||||||    
T  22100020 aagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatccttacttatttatt--atggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataaga 22099923  T
Q  104 tcattatagtaaaagtat 121  Q
    | ||||||||||||||||    
T  22099922 ttattatagtaaaagtat 22099905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 202
Target Start/End: Original strand, 28226620 - 28226662
Alignment:
Q  160 cttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28226620 cttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 28226662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43159959 - 43159893
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  43159959 tcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattacccttaaatatttattgcagagaga 43159893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36370966 - 36370861
Alignment:
Q  64 gagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || ||||||||||||    
T  36370966 gagagaaaaatatatgttatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttg 36370867  T
Q  164 gtttgt 169  Q
    ||||||    
T  36370866 gtttgt 36370861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44543781 - 44543734
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44543781 ttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaag 44543734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 53290960 - 53290868
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaat 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | ||| || ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||    
T  53290960 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttttctataatgcccttaataatttattgcagaga--gagaaatataagaaatatgatattaaat 53290868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 2642757 - 2642791
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2642757 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacc 2642791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22174036 - 22173921
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||| |||||||||  |  || |||||||| || ||| |  |  |||||||||||||||    
T  22174036 aagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatctttacttatttatt--atggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataaga 22173939  T
Q  104 tcattatagtaaaagtat 121  Q
    | ||||||||||||||||    
T  22173938 ttattatagtaaaagtat 22173921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 2154238 - 2154198
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2154238 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatatt 2154198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3114520 - 3114385
Alignment:
Q  72 aatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtg 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||  |||| | | |  |||||| || |||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| |    
T  3114520 aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggctgttatatgaaaaatgaaaaattattgtattaaaagtagtaacatttactgattgt-ttggtttgag 3114422  T
Q  171 taaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagag 207  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3114421 taaaatattaaaaagtgacaattaaaaaggaatagag 3114385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47843888 - 47843832
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47843888 tgtcttgatttatgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagagggagta 47843832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 97
Target Start/End: Original strand, 53055336 - 53055372
Alignment:
Q  61 agagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53055336 agagagagataaatatatgaaatgagatattaaatga 53055372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 24569597 - 24569732
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||| ||  |||| | |||||||||  ||||| | |||||||||||||  |||||||||| | ||    
T  24569597 tcaaagttcaatgtaatattaaatgttatttttcctataatgctcttaataatttattgc--agagacaaaaatatatgaaatatgatattaaataatta 24569694  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaa 138  Q
    |||  |||||||  |||  ||| ||||||| |||||||    
T  24569695 agaatattataggcaaaacataacttattgtatcaaaa 24569732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 47844037 - 47843971
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| |  | ||||| ||||||||||||||||    
T  47844037 tcaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttttcctataataccgttagtaatttattgcagagaga 47843971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29458914 - 29458865
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||    
T  29458914 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt 29458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53290806 - 53290761
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  53290806 tgtcatggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaaggaa 53290761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 3621637 - 3621847
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3621637 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatattatccttagttatttattgcagag--agagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 3621734  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3621735 atgtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 3621834  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  3621835 aacagaggtagta 3621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24663426 - 24663625
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24663426 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 24663523  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24663524 atgtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 24663623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17124177 - 17123972
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17124177 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc----ggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 17124082  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17124081 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 17123982  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    ||| ||||||    
T  17123981 aatggaggta 17123972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1751622 - 1751414
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1751622 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcagagaaaga--aatatatgaaaagagatattaaatgaataagg 1751525  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1751524 tcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaac 1751425  T
Q  204 agaggtagtac 214  Q
     ||||||||||    
T  1751424 ggaggtagtac 1751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 373770 - 373964
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  373770 tcaaagttcaatgcaattttaaatgttgttttaccaatattgtcattatttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 373867  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  373868 agatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgctgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 373964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 17193205 - 17193415
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17193205 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagata--tatatgaaatgagatattaaatgaata 17193302  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17193303 aggtcattatagtaaaataataacttattgcatcaaaagtaggatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaagg 17193402  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  17193403 aacggaggtagta 17193415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23923907 - 23923697
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23923907 tcaaagttcaatacaacgttaaatgctgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaa--aatatatgaaatgagatattaactgaata 23923810  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23923809 aggtcattatagtaaaagtatagcttattacattaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 23923710  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||| || ||||||    
T  23923709 aatggatgtagta 23923697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 364737 - 364526
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||     
T  364737 tcaaaattcaatgcaacattaaatgttgtttttaccaatattgtcattaattatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgaaatattaaatgaag 364640  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  364639 aaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaagatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaag 364540  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
     ||  |||||||||    
T  364539 aaacggaggtagta 364526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12732223 - 12732421
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12732223 tcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccactattatcct-agttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaata 12732319  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12732320 atatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagg 12732419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 17835940 - 17836139
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17835940 tcaaattttaatgcaacattaaatgtttttttaccaatattatccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgatatattaaatgaata 17836037  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17836038 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagaatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaatatgtgacaattaaaaagg 17836137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26470917 - 26470718
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26470917 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaaca 26470820  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26470819 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 26470720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 22050096 - 22050305
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22050096 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatatac-ccttaaatatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 22050192  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050193 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 22050292  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  22050293 aacggaggtagta 22050305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 8992595 - 8992795
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8992595 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattacggagagata--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 8992692  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatc-aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8992693 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaag 8992792  T
Q  200 gaa 202  Q
    |||    
T  8992793 gaa 8992795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 9017042 - 9017242
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9017042 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattatccttagttatttattacggagagata--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 9017139  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatc-aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9017140 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaag 9017239  T
Q  200 gaa 202  Q
    |||    
T  9017240 gaa 9017242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32359629 - 32359424
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  32359629 tcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgttttaccaat--tatccttagttatttattgcggagagaga----tatatgaaatgagatatttaatgaata 32359537  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32359536 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagaagtgtcaattattaattgtcttggtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagg 32359437  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  32359436 aacggaggtagta 32359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1252212 - 1252408
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt-atttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1252212 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttgttttatt--acggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaat 1252309  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1252310 aaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaa 1252408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7632231 - 7632032
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7632231 tcaaagttcaaagcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgc-ga-agagataaatatatgaaatgagatgttaaataaata 7632134  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  7632133 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataattattgattgtcttgatttatataaaatgtcaaaaagtgattattaaaaagg 7632034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 3850408 - 3850578
Alignment:
Q  44 ccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 143  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||    
T  3850408 ccttagttatttattacggagggagatatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttgtggcatcaaaagtagt 3850507  T
Q  144 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  3850508 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagtac 3850578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 8176483 - 8176694
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| || || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  8176483 tcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---ttaccaatattatcttttgttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgatatgttaaattaata 8176577  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  8176578 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaag 8176677  T
Q  201 aatagaggtagtactat 217  Q
    || |||| |||||||||    
T  8176678 aacagagatagtactat 8176694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 23777346 - 23777542
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23777346 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttgctcatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataagg 23777443  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23777444 ttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttatttaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 23777542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30416269 - 30416059
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||    ||||||||||||||    
T  30416269 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagaga--aatatatgaaacagaatattaaatgaata 30416172  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  30416171 aggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatatgataattaaaaagg 30416072  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  30416071 aacggaggtagta 30416059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9838316 - 9838104
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9838316 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagaggga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 9838219  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  9838218 aggctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaagg 9838119  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    || ||||||||||||    
T  9838118 aacagaggtagtact 9838104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17251450 - 17251238
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17251450 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgc--aaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 17251353  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaatt-gttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17251352 aggtcattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagtagtaacacttaattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaag 17251253  T
Q  200 gaatagaggtagtac 214  Q
    |||  ||||||||||    
T  17251252 gaacggaggtagtac 17251238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 30388768 - 30388901
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30388768 tcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatgcttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 30388865  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388866 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaa 30388901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7056334 - 7056118
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7056334 tcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgacca 7056237  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7056236 aggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 7056137  T
Q  201 aatagaggtagtactatat 219  Q
     |  ||||||||| |||||    
T  7056136 tacggaggtagtaatatat 7056118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 34607147 - 34607355
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  34607147 aaagttcaatgtaatattaaatggtgttttaccaatattatccttacttatttattgcagagagagaca--tatatgaaattagatattaaacgaataag 34607244  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    || |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  34607245 attattatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaattaacaattaaaaaggaa 34607344  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  34607345 cggaggtagta 34607355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11676807 - 11676596
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11676807 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattactcttagatatttattgcaga----gagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 11676712  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  11676711 aggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaatg 11676612  T
Q  201 aatagaggtagtacta 216  Q
    ||| ||||||||||||    
T  11676611 aatggaggtagtacta 11676596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22784862 - 22784663
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |  ||||||| |||| |  |||||||||||||    
T  22784862 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttacttatttattgtggagagaaa--aatatattaaataaattattaaatgaata 22784765  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| || |||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22784764 aggctattatagtaaaagtatacattattgtatcaaaagtagtatcatttattgaatatcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 22784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 11128878 - 11129086
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||| ||||||||| ||||    
T  11128878 tcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatat--gaattgaaatattaaattaata 11128975  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| || |    |||| ||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11128976 aggtcattatagtaaaaataaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagg 11129075  T
Q  201 aatagaggtag 211  Q
    || ||||||||    
T  11129076 aacagaggtag 11129086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26485816 - 26485669
Alignment:
Q  66 gagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggt 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || || |||| |||||||||    
T  26485816 gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggt 26485717  T
Q  166 ttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26485716 ttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 26485669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31244943 - 31244744
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31244943 tcaaagttcaatgcaacattaattcttgttttatcaatattattcttagatatttattgtggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 31244846  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31244845 aggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtactaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaagg 31244746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 1249588 - 1249785
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1249588 aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgag 1249685  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |  |||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  1249686 acaattatagtaaaaatatcaattattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttatataaaatatcataaagtgacaattaaaaaggaa 1249785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 27313547 - 27313718
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagaga-aatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||     
T  27313547 tcaaagttcattgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatagtatatgaaatgagatgttaaatgaac 27313646  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt 171  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  27313647 aagataattatagaaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattatcttggttggtgt 27313718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34378906 - 34379116
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34378906 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttatt--atggagagtgaaatatatgaaataagatattaaatgacta 34379003  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||    |||||||||||||||   |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  34379004 aggcttttatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaagg 34379103  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  34379104 aacggaggtagta 34379116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11431351 - 11431144
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  11431351 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattg--tcgagagataaatataggaaataagatattaaattagta 11431254  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  | ||||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  |  | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |     
T  11431253 aagttattatcgtaaaagtataagttattgtatcaaaagtaggaatagctattgattgtcttgatttgtgtaacatgtaaaaatgtgacaattaaaacga 11431154  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    || |||||||    
T  11431153 aacagaggta 11431144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 33260747 - 33260964
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  33260747 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatgtttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaata 33260844  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatc-----aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaa 195  Q
    || |||||||||| |||||| |    |||| ||||||| ||||| |     | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  33260845 aggtcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacattatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttat 33260944  T
Q  196 aaaggaatagaggtagtact 215  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  33260945 aaaggaacggaggtagtact 33260964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24356248 - 24356052
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |    
T  24356248 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattcc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatcaaca 24356151  T
Q  101 agatcattatagtaaaagta-tagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24356150 aggtcattatagtaaaagtattagc-aatggtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttggataaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 24356052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 24635755 - 24635948
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||    
T  24635755 tcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcagag--agagaaatatgtgatataagatattaaatgacta 24635852  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
    ||   ||||||||||| |||||  |||||| || | ||| |||| || || |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  24635853 aggctattatagtaaatgtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacatttaaa 24635948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 213
Target Start/End: Original strand, 30388932 - 30389023
Alignment:
Q  122 agcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  30388932 agcttattgcatcaaaaatagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 30389023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 34730609 - 34730816
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34730609 aaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatccttacttatttattgcaaagagata--aatatatgaaattagatattgaatgaataag 34730706  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | |||||||||||| ||||  || ||| ||||||| ||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  34730707 gttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatcaaaa-atgataattaaaaaggaa 34730805  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  34730806 cggaggtagta 34730816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32251144 - 32250950
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  32251144 tcaaagtccaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttagatatt-attgcagagagaga--aatatatgaaatgaggtattaaatgatta 32251048  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32251047 aggttattataggaaaaagataaattcttgcatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgataattaaaaag 32250950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17601329 - 17601121
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  17601329 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttattta-ttattg--tggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggt 17601233  T
Q  105 cattatagta-------aaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 197  Q
     |||||||||       ||| ||||  |||||| ||||||| ||| | || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17601232 tattatagtaaaaatagaaaatataaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaa 17601133  T
Q  198 aggaatagaggt 209  Q
    || || ||||||    
T  17601132 agaaacagaggt 17601121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31854685 - 31854564
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31854685 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttattttaccaacattacccttagttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatattaaatgacta 31854586  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtata 122  Q
    ||   ||||||||||| |||||    
T  31854585 aggctattatagtaaaggtata 31854564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 7235487 - 7235628
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7235487 tcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagttatttattgtggagagaggga--tatatgaaatgagatattaaatgaata 7235584  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    || | |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||    
T  7235585 aggttattatagtaaaagtatattgtattgtatcaaaagtagta 7235628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 1923907 - 1924098
Alignment:
Q  10 aatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatt 108  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||    
T  1923907 aatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagata--aatatatgaaatgagatattaaatgaataatactgtt 1924004  T
Q  109 atagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| || || || || |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  1924005 atagtaaaagtataaattatttcatcaaaattaataacatttattgattatcttggtttatataaaatgtgaaaaagtgacaattaaagaggaa 1924098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 52712 - 52834
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52712 aaagttcaatgcaacattaaattatgttttatcaatattacccttaattatttattgtggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaataag 52809  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagctta 127  Q
     |||||||| |||||||||| ||||    
T  52810 gtcattataataaaagtataactta 52834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 30237025 - 30237143
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30237025 tcaaaattcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacccttagttatttattg--ttgaaagagaaatatataaaatgagatattaaattaata 30237122  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtat 121  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  30237123 aggttattatagtaaaagtat 30237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22400755 - 22400548
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||      
T  22400755 aagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttatt-atgag-gagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataatg 22400658  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    | ||||||||||||||||   || ||  ||||||| ||||| || || |||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||||| | |||     
T  22400657 ttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaacaagaac 22400558  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  22400557 ggaggtagta 22400548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11001003 - 11000809
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  11001003 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattgc--atagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgatta 11000906  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||   ||||||| ||||  |||  || ||| |||||||||||||  || | ||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  11000905 aggatattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagta-aaagtatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaa 11000809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7170199 - 7170398
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||  |||    
T  7170199 tcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgc--ggagagagaaacatataaaatgaaatattaaatttata 7170296  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||| |||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||  ||||||||||||   ||||  || ||||||||||||    
T  7170297 aggttattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaatactaaaaaatggcaattaaaaagg 7170396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 13597457 - 13597652
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  13597457 tcaaagtttaatgtaaaattaa-tgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaaga--aatttatgaaatgagatattaaatgtaaa 13597553  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||| || || | |||||||||  ||||| |||||||  |||| || ||| |||||||||    
T  13597554 aggttattatagtaaaaatataaattattatatcaaaagtagtaacatttatcgattgtctt-atttgtataaaatgctaaaaagtaacagttaaaaagg 13597652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15432718 - 15432921
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||| | |||||| |  |||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  15432718 tcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacccttatatatttattactgagagata--aatatatgaaatgaaatattaaattatta 15432815  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  || | ||  ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  15432816 aggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttagtttgtgtagaaagtcaaaatatgacaattaaaaagg 15432914  T
Q  201 aatagag 207  Q
    || ||||    
T  15432915 aacagag 15432921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19645847 - 19645721
Alignment:
Q  74 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcat--caaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt 171  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||   |||||||||||||||||   ||||| ||  ||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  19645847 tatatgaaatgtaatattaaatgaacaaggctattatagtaaaagtataaagtattgtatatcaaaagtagtaacatctattgattgtcttagtttgtgt 19645748  T
Q  172 aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19645747 aaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 19645721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 19812003 - 19812202
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  19812003 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttaattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatga 19812100  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||  ||||  ||   || ||||||||||| |||||  || | ||  |||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19812101 aggttattataagaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 19812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Original strand, 24949255 - 24949364
Alignment:
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    ||||||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||     
T  24949255 tcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaac 24949354  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  24949355 ggaggtagta 24949364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 53798 - 53874
Alignment:
Q  124 cttattgca-tcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53798 cttattgcaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaag 53874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 24948290 - 24948397
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| | ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  24948290 tcaaaattcaatgcaacattaaatagtgttttactaatattacccttggatatttattgc--ggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaata 24948387  T
Q  101 agatcattat 110  Q
    || |||||||    
T  24948388 aggtcattat 24948397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 3849112 - 3849152
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3849112 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt 3849152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1135369 - 1135163
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagat 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| | |||||||| ||||   ||| ||||| |||||  |||||  |||||||||||||||| | |    
T  1135369 agttcaatgcaatattaaatgtt---ttatcaatattattcttagttaattatat-agatagagaaaaataattgaaacaagatattaaatgaatatggt 1135274  T
Q  105 cattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaata 204  Q
     ||| | | ||||| |||  |||||  ||||||| || || || || |||| | | | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  1135273 tatttttggaaaaggataatttattatatcaaaagtaataacatttattgagtttatcggtctctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacg 1135174  T
Q  205 gaggtagtact 215  Q
     ||||||||||    
T  1135173 aaggtagtact 1135163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 2381203 - 2381062
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||| | |||||| |||||  |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||||| | ||    
T  2381203 tcaaagttcaatgtattattaaatgtggctttacctatattacccttatatatttattgc--aaagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataatta 2381106  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    || | ||||||| ||||  |||  || ||| |||||||||||||    
T  2381105 aggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaaatagta 2381062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 116)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 8825089 - 8825296
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8825089 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 8825186  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8825187 tcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaac 8825286  T
Q  204 agaggtagta 213  Q
     |||||||||    
T  8825287 ggaggtagta 8825296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 39073073 - 39073283
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39073073 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgc-ga-agtgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 39073170  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39073171 aggttattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 39073270  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  39073271 aacggaggtagta 39073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4175670 - 4175460
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175670 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 4175573  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175572 aggttattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattgtttattgtcttgctttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 4175473  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  4175472 aacggaggtagta 4175460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 34261341 - 34261551
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34261341 tcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 34261438  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34261439 aggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtctaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 34261538  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  34261539 aacagaggtagta 34261551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2674168 - 2673958
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2674168 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctcagttatttactgc-ga-agagagaaatatatgaaattagatattaaatgaata 2674071  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2674070 aaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 2673971  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  2673970 aacggaggtagta 2673958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 9076100 - 9076312
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9076100 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 9076197  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9076198 aggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattatgacaattaaaaagg 9076297  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    ||   ||||||||||    
T  9076298 aacgaaggtagtact 9076312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 25343989 - 25344201
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343989 tcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 25344086  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25344087 aggttattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaggatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgacaaaatgtgacaattaaaaagg 25344186  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    ||  |||||||||||    
T  25344187 aacggaggtagtact 25344201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18020958 - 18020759
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18020958 tcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatatcaaatgaata 18020861  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18020860 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtctgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 18020761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1088123 - 1087913
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1088123 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 1088026  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1088025 aagtcgttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaga 1087926  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  1087925 aacggaggtagta 1087913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7579855 - 7579647
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7579855 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaaagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 7579758  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaa-tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7579757 tcattatagtaaaagtatagtttattgcaacaaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 7579658  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  7579657 cggaggtagta 7579647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10359425 - 10359229
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10359425 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagaaaaa--aatatatgaaatgatatattaaatgaata 10359328  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359327 aggtcatcatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 10359229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 18794812 - 18795030
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18794812 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 18794909  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18794910 aggtcattatagtaaaagtatagcttattacatcaaaagtatgatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaagtgtgaaaattaaaaagg 18795009  T
Q  201 aatagaggtagtactatatta 221  Q
    ||  ||||||||| |||||||    
T  18795010 aacggaggtagtattatatta 18795030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 26854283 - 26854086
Alignment:
Q  2 caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26854283 caaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatg-gatattaaatgaataa 26854187  T
Q  102 gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26854186 ggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 26854087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 38910305 - 38910512
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  38910305 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt--atggagagataaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaa 38910401  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38910402 gtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 38910501  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  38910502 cggaggtagta 38910512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12664887 - 12665086
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12664887 tcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattgtccttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 12664984  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12664985 aggtcattatagtaaaagtacatcatattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 12665084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38017467 - 38017272
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38017467 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgtgatattaaatgaata 38017370  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38017369 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttcgtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa 38017272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 38363220 - 38363417
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38363220 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatt--ccttagttattaattgc-ga-agagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 38363315  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38363316 aagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattgtgacaattaaaaagg 38363415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1297928 - 1297717
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1297928 tcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattgtccttagttatttattgc-ga-agagataaatatatgaaatgagatattaaatgaata 1297831  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatca-aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1297830 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaaatagtattaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaag 1297731  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||| |||||||||    
T  1297730 gaatggaggtagta 1297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6072481 - 6072691
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6072481 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattacggaga--gagaaatatattaaatgagatattaaatgaata 6072578  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  6072579 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtttaaatgtgataattaaaaagg 6072678  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  6072679 aacggaggtagta 6072691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7403881 - 7404080
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7403881 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaata--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 7403978  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7403979 aggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattatcttggtttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 7404078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 42911579 - 42911778
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42911579 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 42911676  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42911677 tgatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagg 42911776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14793980 - 14793770
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14793980 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggaaagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 14793883  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793882 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtaataattattgattatattggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 14793783  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  14793782 aagggaggtagta 14793770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 38702173 - 38702369
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  38702173 aagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaataaataagg 38702270  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  38702271 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatattaaaatatgacaattaaaaaggaa 38702369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12870089 - 12869894
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12870089 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttcttagttatttattgcggagagaga--aatatataaaatgaaatattaaatgaata 12869992  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12869991 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaa 12869894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28024449 - 28024240
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28024449 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatataaaatgagatgttaaatgaata 28024352  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28024351 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggttggtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 28024252  T
Q  201 aatagaggtagt 212  Q
    ||  ||||||||    
T  28024251 aacggaggtagt 28024240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6754369 - 6754170
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6754369 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaatatcatttttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 6754272  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754271 aggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtatgatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 6754172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 4098362 - 4098556
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4098362 aaagttcagtacaacattaaatgttgttttgccaatattatcctttgttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 4098459  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4098460 gtcattatagtaaaggtataacttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 4098556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16124450 - 16124240
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124450 tcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 16124353  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124352 aggtcattatagtaaaaatacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 16124253  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  16124252 aacggaggtagta 16124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4985365 - 4985151
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4985365 tcaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacccttaattatttattg-ag-gagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 4985268  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4985267 aggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttggtatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 4985168  T
Q  201 aatagaggtagtactat 217  Q
    ||  |||||||||||||    
T  4985167 aacggaggtagtactat 4985151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 6689628 - 6689827
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6689628 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttaattatttattgcggaga--gagaaatatataaaatgagatgttaaatgaata 6689725  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||    
T  6689726 agatcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaaatagtaacaattattaattgttttgatttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaagg 6689825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8229990 - 8229780
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8229990 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattccggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaataagg 8229893  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  8229892 tcactatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtattaacaattattgattgtcttaatttgtgtaagatgtcaaaa-gtgacaattaaaaaggaac 8229794  T
Q  204 agaggtagtactat 217  Q
      ||||||||||||    
T  8229793 gaaggtagtactat 8229780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24075028 - 24074833
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24075028 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatattttatcaatattactcttaattatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgaata 24074931  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24074930 agttcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 24074833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 40198817 - 40199012
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40198817 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattatccgtagttatttattgcggaga--gagaaataaatgaaatgagatgttaaatgaata 40198914  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  40198915 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattgttgattgtcttgatctgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaa 40199012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2134096 - 2133901
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2134096 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaattaata 2133999  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2133998 aggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc-aaaatagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaa-atgataattaaaaagg 2133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 4017445 - 4017653
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4017445 aaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcggaaagag--aaatatatgaaatgagatgttaaatgaataag 4017542  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4017543 gttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaattattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 4017642  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
    | || ||||||    
T  4017643 tggatgtagta 4017653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 213
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582710
Alignment:
Q  8 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcat 107  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22582508 tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaa--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcat 22582605  T
Q  108 tatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagag 207  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  22582606 tatagtacaagtatagtttattgcatcaaaagtagtataaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatgtga-tattaaaaaggaacggag 22582704  T
Q  208 gtagta 213  Q
    ||||||    
T  22582705 gtagta 22582710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 36239487 - 36239682
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36239487 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaattaata 36239584  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36239585 aggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaactattgattgtcttgatatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 36239682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28447174 - 28446979
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28447174 tcaaagttaaatgcaacattaaatgttattttataaatattatccttagt-atttattg-agaaa-agagatatatatgaaatgagatgttaaatgaata 28447078  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28447077 aggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 28446979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4427596 - 4427382
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  4427596 tcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt--acggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgagtg 4427499  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatag-tatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || ||||  ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4427498 aggtcattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagcaataaattactgattgtcttgattcgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 4427399  T
Q  200 gaatagaggtagtacta 216  Q
    |||  ||||||||||||    
T  4427398 gaacggaggtagtacta 4427382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18465730 - 18465933
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||    ||||||||| |    
T  18465730 tcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatga----ttaaatgaaca 18465823  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  18465824 aaattattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttctgaaaaatatcaaaatatgataattaaaaagg 18465923  T
Q  201 aatagaggta 210  Q
    ||| ||||||    
T  18465924 aatggaggta 18465933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9127539 - 9127331
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9127539 aaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatctttaattatttattacggagagaga--aatatataaaataagatattaaatgaataag 9127442  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  || ||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9127441 gtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtgataacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 9127342  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  9127341 cggaggtagta 9127331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37303297 - 37303098
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37303297 tcaaaattcaatacaacattaaatgttgtttcaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatgaata 37303200  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||  |||  | || |  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37303199 agatcattatagtaaaaatacaacttattacatcaaaagtagtaataatcatcgactaccttagtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagg 37303100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12784632 - 12784423
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12784632 tcaaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 12784535  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||| ||||||||||| | |  |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12784534 agatcattttagtaaaagtaaaaca-attgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaagg 12784436  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  12784435 aacagaggtagta 12784423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18437505 - 18437303
Alignment:
Q  9 caatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  18437505 caatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttatt--atggagagagaaatatatgaaatgagataataaataaataaggttatt 18437408  T
Q  109 atagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagagg 208  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  18437407 atagtaaaagtataaagtattgtatcaaaaatggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagg 18437308  T
Q  209 tagta 213  Q
    |||||    
T  18437307 tagta 18437303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 4694793 - 4694973
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4694793 tcaaagttcaatgcaacattagatgttattttactaatattatccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaaca 4694890  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  4694891 aggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagtattagcaattattgattatcttggtttgtgaaaaatgtaaaaa 4694973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4962376 - 4962183
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4962376 tcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatctttagttatttattgcggagaaaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 4962279  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |  || |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4962278 aaatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtgataacggttattgattatcttggtttatgtaaaatgtcaaaa--tgacaattaaaaa 4962183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12723147 - 12722939
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12723147 aaagttcaatgcaacactaattgttgttttaccaatattacccttatatatttattgcggagagaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaataag 12723050  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||| ||||||||||| |    |||| ||||||| |||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12723049 atcattttagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaaggaa 12722950  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
     ||||||||||    
T  12722949 cagaggtagta 12722939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 32389015 - 32389208
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||| |||  || ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32389015 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaaga--aacatatgaaatgaaatattaaattaata 32389112  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 196  Q
    ||  |||||||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32389113 aggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaa 32389208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38502990 - 38502784
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||       
T  38502990 tcaaaattcaatgcaacattaaatattattttaccaatattatccttaactatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatattaaatga--- 38502896  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
     | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||  |||| | | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  38502895 -ggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcattgactattttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtaacaattaaaaaga 38502797  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    || ||||||||||    
T  38502796 aacagaggtagta 38502784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 5119207 - 5119406
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5119207 tcaaagttcaatgcatcattaaatattgttttaccaatattatcctttgttatttattactgagagaaa--aatatatgaaatgagatgttaaattaata 5119304  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||  ||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  5119305 aggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtattaatttgtataaaatattaaaaaatgacaattaaaaagg 5119404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 37809788 - 37810003
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||  || ||||||| | | ||||||||| || |    
T  37809788 tcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttatatatttattgcagagagaga--aacatatgaattaaaatattaaattaaca 37809885  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37809886 agatcattatagtaaaagtaaaaacaattgcatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagg 37809985  T
Q  201 aatagaggtagtactata 218  Q
    |   ||||||||| ||||    
T  37809986 atcggaggtagtagtata 37810003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28463575 - 28463365
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28463575 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgacta 28463478  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||     
T  28463477 aggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagcgatagttaaaaaga 28463378  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  28463377 aacggaggtagta 28463365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4688986 - 4688869
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4688986 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcaga--gagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 4688889  T
Q  103 atcattatagtaaaagtata 122  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  4688888 gtcattaaagtaaaagtata 4688869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39893997 - 39893800
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39893997 aaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataag 39893900  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     ||||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39893899 gtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattattttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaa 39893800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6007912 - 6008124
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  6007912 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatattgtctttagttatatatt--acagagagagaaatatatgaaatgtggtattaaattaata 6008009  T
Q  101 agatcattatag-taaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc-aaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||   ||||||| ||||| ||||  | |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6008010 aggctattatagttaaaaatataaatcattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaaagtgacaattaaaaa 6008109  T
Q  199 ggaatagaggtagta 213  Q
    ||||  |||||||||    
T  6008110 ggaacggaggtagta 6008124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7408360 - 7408559
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7408360 tcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttatt--atggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 7408457  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||    || |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7408458 aggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtattaatgtttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaagatgacaattaaaaagg 7408557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38297806 - 38297596
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  38297806 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaataagatattacatgatta 38297709  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  38297708 aggcgattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaagg 38297609  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  38297608 aactgaggtagta 38297596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 24228980 - 24229172
Alignment:
Q  4 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  24228980 aagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttacttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaattagatattgaatgaataagg 24229077  T
Q  104 tcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    | |||||||||||||| ||  || ||| ||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||    
T  24229078 ttattatagtaaaagtgtatattgttgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatatcagaaaaagacaattaaaaa 24229172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37306887 - 37306679
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||| ||||||||| || |||    
T  37306887 aaagttcaatgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcaga--gagaaaaacatatgaattgaaatattaaattaacaag 37306790  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||||||||||||      |||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  37306789 gtcattatagtaaaagtaagaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagaaa 37306690  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  37306689 atgaggtagta 37306679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 31803353 - 31803563
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||| ||| ||||||||| || |    
T  31803353 tcaaagttcaatgcaacattaaacgatgttttactaatattatccttagatatttattgcggagagaga--aacatatgaattgaaatattaaattaaca 31803450  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || || ||||||||||| |  | |||| ||||||| ||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31803451 aggtcgttttagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaag 31803550  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  31803551 aacggaggtagta 31803563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 37633705 - 37633903
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||  || ||||||| | | ||||||||| || |    
T  37633705 tcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttatatatttattgcagaaagaga--aacatatgaattaaaatattaaattaaca 37633802  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||| |    |||| ||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37633803 agatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagg 37633902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19831730 - 19831560
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  || ||||| |    ||| |||||||||||||||||||||    
T  19831730 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttaactatttattgtggaaagagaaa----tattaaatgagatattaaatgaata 19831635  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa 175  Q
    || |||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||    
T  19831634 aggtcattatagtaaacatataaattattgtatcaaaaatattaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaa 19831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 13461048 - 13461238
Alignment:
Q  10 aatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatta 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13461048 aatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggaga--gagaaatatataaaataagatattaaatgaaaaagattatta 13461145  T
Q  110 tagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    || ||||| ||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13461146 taataaaaatataaattattgtataacaaaaagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaa 13461238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32440102 - 32439917
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  32440102 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacctttagttatttattgcagaga--gagaaatacatgaaataagatattaaatgacta 32440005  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtga 188  Q
    ||   |||||| ||||||||    |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32440004 aggctattataataaaagtactaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 32439917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 13703126 - 13703325
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||    
T  13703126 tcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattacctttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaata 13703222  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||  |||||||||||||| | |    |||| |||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13703223 agactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaaatagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 13703322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 26906520 - 26906724
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt-accaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26906520 tcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcacccttagttatttattacagag----agaaatatatgaaacaagatattaaatgaat 26906615  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     |  | ||||| | ||||| |||  |||||| ||||||| |||||  | || |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26906616 gatgttattattggaaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaagatttattgaatgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 26906715  T
Q  200 gaatagagg 208  Q
    ||| |||||    
T  26906716 gaacagagg 26906724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31546118 - 31546000
Alignment:
Q  74 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaa 173  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31546118 tatatgaaatgtgttattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaa 31546019  T
Q  174 aatgtcaaaatgtgacaat 192  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31546018 aatgtcaaaaggtgacaat 31546000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1795307 - 1795108
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  1795307 tcaaagttcaatgttacaataaatgttgttttaccaacattacccttatttatttattgc-ga-agagagaaatatacgaaataagatattaaatgacta 1795210  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |    |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  1795209 aagctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaagg 1795110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 7466211 - 7466409
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7466211 tcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 7466308  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||| ||||||| |  | |||| || |||| || || || || || ||||||||| ||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  7466309 aggtcattatagcaaaagtaaaaataattgtattaaaagtaataacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaagg 7466408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38308297 - 38308099
Alignment:
Q  20 taaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagt 119  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||| | ||||||| |  || ||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  38308297 taaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagaca--tacatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagt 38308200  T
Q  120 atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtactatat 219  Q
    ||   |||||| || ||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  38308199 atgaattattgtataaaaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagtactttat 38308100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 31802817 - 31802958
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    |||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  31802817 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagttatttattg--tggagagaaaattatatgaaagaagatattaaattaata 31802914  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    || |||||||  ||||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  31802915 aggtcattatgataaaagtataaattattgtatcaaaagtagta 31802958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 198
Target Start/End: Original strand, 3243832 - 3244020
Alignment:
Q  8 tcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcat 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||  |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||   ||    
T  3243832 tcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaa--aatatataaaatgagatattaaatgaataaggctat 3243929  T
Q  108 tatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||||| ||||  | |  |||||| || |||||||||| || || || ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3243930 tataggaaaaacaaaaattattgtataaaaaatagtaacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaa 3244020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24469825 - 24469617
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  24469825 aaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattatccttaattatttattgcagagag-ga-aaatttattaaataagatattaaatgactaag 24469728  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | |||||||||||| ||||  | |||| || | ||| |||| || || | |  |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  24469727 gttattatagtaaaaatataaatcattgtataagaaaaagtaacatttatagtgtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaattgacagtcaaaaaggaa 24469628  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  24469627 cggaggtagta 24469617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5144188 - 5144008
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5144188 tcaaagttcaatgcaacaataaatcttgttttaccaacattacccttaattatttattacggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgacta 5144091  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    ||   |||||| ||||||||||  |||||| || || || |||| || || |||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  5144090 aggctattataataaaagtataaattattgtataaataaaagtaacatttattgagtgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaa 5144008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5843183 - 5842984
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||   | |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| || |||||| ||||    
T  5843183 tcaaagttcaatgcaatattaaatgtagttttatcaatatcacctttagatatttattgcagagtgaga--aacatatgaagtgaaat-ttaaatcaata 5843087  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagctta-ttgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||  ||||||||||||||| |    | ||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5843086 agactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattaaaaag 5842987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 425158 - 425362
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        
T  425158 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatttctcttagttatttattgc--ggagagagaaataaatgaaataagatattaaatg---- 425251  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
     | | |||||||||||| ||||  |||| |  | | ||| |||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  425252 -ggttattatagtaaaaatatacattatagtctaagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaa-atgacagttaaaaagg 425349  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  425350 aacggaggtagta 425362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 3892843 - 3893036
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||  |||||||||| |||||||| | ||||||  ||| | ||||||||| ||||||    
T  3892843 aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatat--aataaaatattaaattaataag 3892940  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
     ||||||||||||||||| |    |||| |||||||||| ||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3892941 gtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataata-atattattgattgacttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaag 3893036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027569
Alignment:
Q  74 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaa 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  25027694 tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttatgtaa 25027595  T
Q  174 aatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||||| || |||||||||||||||    
T  25027594 aatgtcacaaagtgacaattaaaaag 25027569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38297982 - 38297873
Alignment:
Q  11 atgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattat 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||||    
T  38297982 atgcatcattaaatgttgttttaccaatattatcctttgttatttattgc--ggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggttattat 38297885  T
Q  111 agtaaaagtata 122  Q
    | ||||||||||    
T  38297884 actaaaagtata 38297873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12638128 - 12637940
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  | |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||          
T  12638128 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaaaattacctttagatatttattgc--agaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaatg------ 12638037  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
     |||||||||||||  || |    |||| ||||||| |||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12638036 -tcattatagtaaagataaaaacaattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21606448 - 21606275
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  |  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21606448 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttaattatttatt--acggagaaagaaatatatgaaataaaatattaaatgaata 21606351  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaat 176  Q
    ||   |||||||||||| ||||  |||||| || | ||| ||||  | || || | |||||| |||||||||||||    
T  21606350 aggatattatagtaaaaatataaattattgtataagaaaaagtaatatttattaagtgtcttagtttgtgtaaaat 21606275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40209158 - 40208965
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    || ||||||||||| |||||  |||||||||||| |     
T  40209158 tcaaaattcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattg--tggatagagaaatataggaaatatgatattaaatgact- 40209062  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
         |||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||  | || |||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  40209061 -----attatagtaaaagtataaattattgcataagaaaaagtaatatttattgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaactgacggttaaaaagg 40208967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 6330927 - 6331053
Alignment:
Q  80 aaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||  | || ||||||||||  |||| |||||||||||    
T  6330927 aaatgagatattacatgaataagattattatagtaaaaatataaattattttatcaaaagtagtaatatttattgattgtctaagtttatgtaaaatgtc 6331026  T
Q  180 aaaatgtgacaattaaaaaggaataga 206  Q
    |||| | || |||||||||||||||||    
T  6331027 aaaaagagataattaaaaaggaataga 6331053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30368244 - 30368130
Alignment:
Q  84 gagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaa 183  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |  |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30368244 gagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattatatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaa 30368145  T
Q  184 tgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||| |||||||||||    
T  30368144 tgtaacaattaaaaa 30368130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 213
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686929
Alignment:
Q  74 tatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaa 173  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |  |||||| ||||||| ||| | || || |||||||| ||||||| | |||    
T  3686790 tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgttttggtttatataa 3686889  T
Q  174 aatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagta 213  Q
    || |||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  3686890 aacgtcaaaatgtgataattaaaaataaatggaggtagta 3686929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10889237 - 10889166
Alignment:
Q  144 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggtagtact 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  10889237 atcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagtact 10889166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18393161 - 18392962
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  18393161 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatga 18393064  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18393063 aggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttatgtaaaaatctcaaaa-gtgacaattaaaaag 18392965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 40927182 - 40927385
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  40927182 tcaaaattcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattactcttatatatttattgcagagagagc--aatatataaaatgaagtattaaatgatta 40927279  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||| ||||||| ||||  |||  || ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  40927280 agattattataggaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcttaatttgtgtaaaaaatcaaaacgtgacaattaaaaagg 40927378  T
Q  201 aatagag 207  Q
    || ||||    
T  40927379 aacagag 40927385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7735273 - 7735158
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7735273 tcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatccttatatatttattgc--ggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 7735176  T
Q  101 agatcattatagtaaaag 118  Q
    ||   |||||||||||||    
T  7735175 aggctattatagtaaaag 7735158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8849329 - 8849124
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgaga--tattaaatgaa 98  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||   |||||| |||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||     
T  8849329 tcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatatttattgcagaga--gagaaatgtatgaaatgagaagtattaaatgat 8849232  T
Q  99 taagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||| | ||||||| ||||  |||  || ||| ||||||| |||||  || | ||  ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8849231 taaggttattatagaaaaaagataattttttgtatcaaaagtagta-aaagtatttgttgtcatgatttgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaa 8849133  T
Q  199 ggaatagag 207  Q
    |||| ||||    
T  8849132 ggaacagag 8849124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38297594 - 38297516
Alignment:
Q  124 cttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38297594 cttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaa 38297516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Original strand, 18000377 - 18000571
Alignment:
Q  10 aatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcatta 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||||  || ||||| | ||| ||||||||| || ||| |||| |    
T  18000377 aatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaaccttagatatttattgtggagagaga--aacatatgtattgaaatattaaattaacaaggtcataa 18000474  T
Q  110 tagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatagaggt 209  Q
     ||||||| ||      |||  ||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  18000475 aagtaaaaata------attctatcaaaagtagtaaca-ttattaattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaggtaacaattaaaaaggaacggaggt 18000567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18676605 - 18676511
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||||||   |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18676605 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattatccttgattatttattg--tagagagagaagtatatgaaataggatattaaatga 18676511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25785936 - 25786030
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||  ||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25785936 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttggcattattacccttgattatttattgtagag--agagaaatatatgaaatgagatattaaatga 25786030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 25027914 - 25027846
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25027914 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccttagttatttattgcggagagaga 25027846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31985240 - 31985044
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||  |    | | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  31985240 tcaaagttcaatgcaacattaaaagttattttaccgatattacccttaattatttat--cttgaacaaagaaatatataaaacgagacattaaatgaata 31985143  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||  ||| |||||||| ||||  |||||  || |||| || |  || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  31985142 agactattctagtaaaaatataaattattatattaaaagtaatgacatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattagaaag 31985044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 38160321 - 38160432
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||    | ||||||| ||| || |||||| ||||    
T  38160321 tcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttattacggagagag----acatatgaagtgaaat-ttaaatcaata 38160415  T
Q  101 agatcattatagtaaaa 117  Q
    |||| ||||||||||||    
T  38160416 agattattatagtaaaa 38160432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42393865 - 42393738
Alignment:
Q  76 tatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa 175  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||| | || || || |||||| |||||||||||||||||    
T  42393865 tatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgattatcttggtttgtgtaaaa 42393766  T
Q  176 tgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaat 203  Q
    |||||||| | |||| ||||||| ||||    
T  42393765 tgtcaaaaagcgacagttaaaaaagaat 42393738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17869427 - 17869297
Alignment:
Q  69 agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttg 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| || |  |||||  ||||||| ||| | || || ||||  ||||| |||||    
T  17869427 agaaatatatgtaatgagatattaaataaataagattattataataaaaatagaaattattatatcaaaagtagcaacatttattgaccgtcttagtttg 17869328  T
Q  169 t-gtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17869327 tggaaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 17869297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 21157662 - 21157876
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||   ||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |    
T  21157662 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattg--tagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatga 21157759  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |  |||||| ||||  ||   || ||| ||||||| |||||  |  | ||  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  21157760 aggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 21157858  T
Q  200 gaatagaggtagtactat 217  Q
    |||  |||| ||||||||    
T  21157859 gaacggagggagtactat 21157876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 21150521 - 21150615
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||  ||||||||||   ||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  21150521 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattacccttgattatttattg--tagagagataagtatatgaaataagatattaaatga 21150615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9959067 - 9958878
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||||   |||  ||||    || | | ||||  ||||    
T  9959067 tcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgttttaccaatattatccttacctatttattacaaagaga---aaaattatg----gaca-aataaacaaata 9958976  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  9958975 agattattatagtaaaagtgtaaattattgtatcaaaagtagtgacatttattgaatgtattgatttgtgtaaattgtcaaaaaatgacaattaaaaa 9958878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4440118 - 4440317
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| || ||||||| ||||||||  ||||  || |||||||| ||||  |||||||||| | ||    
T  4440118 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttatttttcctataatgcccttagtaatttattg--gagactgaaaaatatataaaatatgatattaaataatta 4440215  T
Q  101 a-gatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    | ||| |||||||  |||  |||  |||||| ||||||| |||||  |    || | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  4440216 aagat-attataggcaaaacataaattattgtatcaaaagtagtaaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatatgacaattaaaaag 4440314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 10889282 - 10889243
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattg 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10889282 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattg 10889243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11413720 - 11413548
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  | ||  |||||||||  | |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |    
T  11413720 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacctttgattatttatt--atagagagagaagtatgtgaaattagatattaaatgatga 11413623  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa 175  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || ||| ||||||| |||||  || | ||  ||||||||||||||||||||    
T  11413622 aggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 11413548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 36481104 - 36481170
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagaga 67  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  36481104 tcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcttataatgcccttagtaatttattgcagagaga 36481170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 4609053 - 4609147
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  | ||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4609053 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacctttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatga 4609147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 23418602 - 23418752
Alignment:
Q  28 gttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagctta 127  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   ||||    ||||| |||  |||    
T  23418602 gttttaccaatattatggttagttatttatt--agagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaatgaggctattaataaaaaaggataaatta 23418699  T
Q  128 ttgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca 180  Q
    ||| ||||||  || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23418700 ttgtatcaaaggtaataacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtca 23418752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4688862 - 4688815
Alignment:
Q  152 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4688862 ttgattgtcttgatttatggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 4688815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 202
Target Start/End: Original strand, 31803118 - 31803165
Alignment:
Q  155 attgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31803118 attgtcttggtatgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaaggaa 31803165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 42394318 - 42394242
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatg 79  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||  | ||||||||||||||||    
T  42394318 tcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttatgaacattacccttaggtatttattg--gggagagagaaatatatg 42394242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7834155 - 7834059
Alignment:
Q  106 attatagtaaaagtatag---cttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||  |  |||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7834155 attatagtaaaagaatagtaacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattattttgatttgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaag 7834059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13957196 - 13957155
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13957196 tgtcttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaa 13957155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7734837 - 7734775
Alignment:
Q  140 tagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  7734837 tagtatcatttattgattgtcttgatttatgtaaaatttgaaaaaatgacaattaaaaaggaa 7734775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 3686427 - 3686476
Alignment:
Q  5 agttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatt 54  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||    
T  3686427 agttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt 3686476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Original strand, 36481258 - 36481303
Alignment:
Q  157 tgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  36481258 tgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatatgataattaaaaaggaa 36481303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 69147 - 69356
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  69147 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 69244  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  69245 agttcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtat-aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaagg 69343  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  69344 aacggaggtagta 69356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26319 - 26111
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26319 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaattgaatattaaatgaataag 26222  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  26221 gtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaacgaa 26122  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
     ||||||||||    
T  26121 cagaggtagta 26111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 49194 - 49392
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  49194 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagaga--aatatatgaaatgaaa-attaaatgaata 49290  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49291 aggtcattataataaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 49390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Original strand, 89360 - 89412
Alignment:
Q  146 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89360 caattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 89412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 77135 - 77347
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77135 tcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggaga--gagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 77232  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  77233 aggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaagaagg 77332  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    ||  |||||||||||    
T  77333 aacggaggtagtact 77347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 148350 - 148560
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  148350 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatataatccttagttatttattgcggaga--gagaaatataagaaatgatatattaaatgaata 148447  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  148448 aggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagtagtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaagg 148547  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  148548 aacggaggtagta 148560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 138924 - 138737
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138924 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt--acagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 138827  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || | || |||||||||||||| ||||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  138826 agctaatcatagtaaaagtataacttattgc------------atcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaagg 138739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 369452 - 369544
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  369452 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggttatttattgc----agagagaaatatatgaaatgaaatattaaatga 369544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 492534 - 492454
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaat 83  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  492534 tcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgca--gagatagaaatatatgaaat 492454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 2854 - 3055
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2854 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttatt--acggagagagaaatatatgaaatgagttgttaaatgaata 2951  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatc-aattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgt-caaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  2952 aggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaaattactgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaaagtgacaattaaaaa 3051  T
Q  199 ggaa 202  Q
    ||||    
T  3052 ggaa 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 161 - 1
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  161 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga--aatatatgaaatgagatgttaaatgaata 64  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttg 163  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  63 aggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 419686 - 419474
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  419686 tcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagaga--aatatatgaaatgagatattaaataaata 419589  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||     
T  419588 agattattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaga 419489  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    || ||||||||||||    
T  419488 aacagaggtagtact 419474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 4563 - 4770
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||   ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4563 tcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatatac-ccttagttatttattgtggaga--gagaaatatatgaaataagatattaaataaata 4659  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4660 aggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaat-accaaatgtgacaattaaaaagg 4758  T
Q  201 aatagaggtagt 212  Q
    ||  ||||||||    
T  4759 aacggaggtagt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 195738 - 195586
Alignment:
Q  43 tccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatag 142  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  195738 tccttagttatttattgtggagagaaa--aatatatgaaatg-gatattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatcaaacatag 195642  T
Q  143 tatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195641 tatcaattgtcgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 195586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 195930 - 195882
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagtt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  195930 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagtt 195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 184321 - 184109
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  184321 tcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagata--aatatatgaaataagatattaaatgacta 184224  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   |||||||||||||||||  |||||| || | ||| |||| || || |||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |    
T  184223 aggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacacttaaaaaag 184124  T
Q  201 aatagaggtagtact 215  Q
    ||  |||||| ||||    
T  184123 aaaggaggtaatact 184109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30886 - 30671
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||| |  |    
T  30886 tcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcagaga--gagaaacatatgaattgaaatattaaattagca 30789  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    || || |||||||||||||| |    |||| ||||||| |||||  | || || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  30788 aggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaaga 30689  T
Q  201 aatagaggtagtactata 218  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  30688 aacggaggtagtattata 30671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 431 - 224
Alignment:
Q  3 aaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 102  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  431 aaagttcaacgtaacattaaatggtgttttatcaatattatccttacttatttattgcaaagagata--aatatatgaaattagatattgaatgaataag 334  T
Q  103 atcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
     | |||||||||||| ||||  || ||| ||||||| ||||| || |  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||    
T  333 gttattatagtaaaaatatacattgttgtatcaaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatcaaaa-atgataattaaaaaggaa 235  T
Q  203 tagaggtagta 213  Q
      |||||||||    
T  234 cggaggtagta 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 147322 - 147111
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaat-gagatattaaatgaat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||    
T  147322 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattacccttagatatttattg-tga-agagagaaacatatgaaataaaaatattaaattaat 147225  T
Q  100 aagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    |||  ||||||||||||| |  |    |||| ||||||| ||||| || || || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  147224 aaggccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 147125  T
Q  200 gaatagaggtagta 213  Q
    |||  |||||||||    
T  147124 gaacggaggtagta 147111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14915 - 14774
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14915 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacccctagttatttattgcggagagaga--aatatatgacatgagatattaaatgaata 14818  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagta 144  Q
    ||   ||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||    
T  14817 agtctattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagta 14774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 7471 - 7670
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||   | |||||||| ||| ||||||| || |||||| || |    
T  7471 tcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattacccttagatatttattgc--ggggagagaaacatacgaaatgaaatcttaaattaaca 7568  T
Q  101 agatcattatagtaaaagt-atagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || |||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7569 aggtcattatagtaaaagtaataac-aattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaag 7667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 362 - 561
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  362 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaaaattacttttagatatttattgc--agagagggaaacatatgaaatgaaatattaaattaata 459  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||| |||||||||||| ||| |    |||| ||||||| || ||  | || ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  460 agaccattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtaataatatttattgattgtcttagtttacgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaagg 559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1981 - 1818
Alignment:
Q  31 ttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattg 130  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1981 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagaga--aatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattg 1884  T
Q  131 catcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 198  Q
     || | ||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  1883 tataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaa--gtgacagttaaaaa 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 72141 - 72073
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagaga 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  72141 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatattatccttagttatttattgcggagagaga 72073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 96255 - 96056
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  96255 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatga 96158  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || ||||||||||| |||||  || | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  96157 aggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctcaaaa-gtgacaattaaaaag 96059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14444 - 14245
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  14444 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatga 14347  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaa-tgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  |||  |||||||||||||| |||||  |||| ||  |||||||| ||| |||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  14346 aggttattataggaaaaaaataaattattgcatcaaaagtagtaaaaattatttgttgtcttgatttctgtaaaagactcaaaa-gtgacaattaaaaag 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 599 - 809
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||  | |||||||||||||     
T  599 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttatt--acaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaatg 696  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 200  Q
    ||   ||||| | |||   |||  |||||| |||| || ||||   | || |||||||| ||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  697 aggctattattggaaattgataaattattgtatcagaagtagttatatttattgattgtattgatttatgtaaaatgttaaaaagtgaaaattaaaaagg 796  T
Q  201 aatagaggtagta 213  Q
    ||  |||||||||    
T  797 aacggaggtagta 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 23183 - 23277
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatga 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23183 tcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttggttatttattgc--cgagagaaaaatatataaaatgagatattaaatga 23277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 1080 - 1169
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatatta 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1080 tcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttatt--acagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6549 - 6460
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatatta 92  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6549 tcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttatt--acagaaagataaatatatgaaatgaaatatta 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 252641 - 252840
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |  ||||  ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |    
T  252641 tcaaagttcaatacaacattaaatattgttttgtctttattacccttgattatttattg--tagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatga 252738  T
Q  101 agatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgt-aaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 199  Q
    || | ||||||| ||||  ||   || |||||| |||| |||||  || | ||  |||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  252739 aggttattataggaaaaagatgaattgttgcataaaaagtagtaaaaagtatttcttgtcttggtttgtgtaaaaaactcaaaa-gtgacaattaaaaag 252837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 21019 - 21117
Alignment:
Q  1 tcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcagagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||| ||||||  |  ||| |||||||||||   || ||||||| |||||||||    
T  21019 tcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttactaatactattcttagtcatttat--cctagatagagaaatataaataacgagatatcaaatgaata 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 91867 - 91916
Alignment:
Q  153 tgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaa 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  91867 tgattgtcttggtttgtttaaaatgttaaaatgtgataattaaaatggaa 91916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University