View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15228_high_2 (Length: 635)

Name: NF15228_high_2
Description: NF15228
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15228_high_2
NF15228_high_2
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (7-616)||(38006087-38006701)
chr5 (36-214)||(35194014-35194192)
chr5 (63-315)||(12834490-12834752)
chr5 (7-279)||(4582975-4583256)
chr5 (63-310)||(12866472-12866729)
chr5 (13-235)||(8453376-8453598)
chr5 (7-219)||(35311679-35311891)
chr5 (13-165)||(3573087-3573239)
chr5 (7-316)||(4920682-4921000)
chr5 (24-206)||(12447255-12447437)
chr5 (7-180)||(30115340-30115513)
chr5 (7-276)||(2412681-2412958)
chr5 (7-236)||(22694903-22695134)
chr5 (36-216)||(42987502-42987683)
chr5 (24-177)||(27088414-27088566)
chr5 (47-279)||(5908640-5908881)
chr5 (7-209)||(17853322-17853524)
chr5 (13-278)||(6155873-6156145)
chr5 (36-219)||(18206903-18207087)
chr5 (7-215)||(40517662-40517871)
chr5 (57-219)||(15890113-15890275)
chr5 (13-207)||(1218619-1218812)
chr5 (13-207)||(2985010-2985204)
chr5 (94-279)||(29245903-29246096)
chr5 (57-219)||(30996502-30996665)
chr5 (7-316)||(13401919-13402235)
chr5 (36-198)||(6092559-6092722)
chr5 (7-226)||(28045511-28045731)
chr5 (24-149)||(42717722-42717847)
chr5 (94-219)||(27302755-27302880)
chr5 (43-138)||(33862285-33862380)
chr5 (7-137)||(3564830-3564960)
chr5 (45-209)||(20973526-20973680)
chr5 (154-219)||(28569041-28569106)
chr5 (135-219)||(12250955-12251039)
chr5 (77-165)||(33420405-33420492)
chr5 (153-219)||(12712577-12712643)
chr5 (153-219)||(23045011-23045077)
chr5 (169-216)||(33728024-33728071)
chr5 (125-219)||(12457492-12457586)
chr5 (153-219)||(12773841-12773907)
chr5 (226-279)||(6092481-6092534)
chr5 (94-219)||(6369640-6369764)
chr5 (153-226)||(38972925-38972998)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (355-616)||(26461477-26461726)
chr3 (7-291)||(53631761-53632053)
chr3 (36-269)||(830895-831129)
chr3 (13-223)||(22535856-22536067)
chr3 (13-233)||(42758237-42758459)
chr3 (7-207)||(31126826-31127026)
chr3 (7-236)||(4016044-4016275)
chr3 (7-236)||(4557305-4557536)
chr3 (7-279)||(34119515-34119793)
chr3 (23-219)||(54317017-54317213)
chr3 (7-226)||(19111592-19111810)
chr3 (47-316)||(39655187-39655465)
chr3 (45-291)||(44639168-44639423)
chr3 (7-216)||(44172482-44172692)
chr3 (7-216)||(44179182-44179392)
chr3 (45-223)||(44106807-44106986)
chr3 (36-316)||(10823616-10823896)
chr3 (7-322)||(39728527-39728851)
chr3 (45-219)||(48390836-48391010)
chr3 (36-307)||(17146077-17146353)
chr3 (7-226)||(29842164-29842384)
chr3 (36-226)||(52198039-52198231)
chr3 (7-316)||(52572465-52572783)
chr3 (47-316)||(29284232-29284510)
chr3 (47-240)||(44953431-44953627)
chr3 (36-236)||(49025566-49025768)
chr3 (7-279)||(49579920-49580201)
chr3 (47-323)||(7469685-7469970)
chr3 (24-175)||(30682695-30682846)
chr3 (47-209)||(44252643-44252806)
chr3 (7-219)||(34025810-34026023)
chr3 (45-223)||(23580722-23580900)
chr3 (151-279)||(23546899-23547029)
chr3 (45-186)||(20086903-20087044)
chr3 (45-219)||(34154312-34154483)
chr3 (47-129)||(23547081-23547164)
chr3 (57-209)||(23154093-23154245)
chr3 (94-198)||(6738434-6738538)
chr3 (7-163)||(41937077-41937233)
chr3 (153-223)||(48305656-48305726)
chr3 (97-145)||(23910337-23910385)
chr3 (154-219)||(30904835-30904899)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (36-268)||(14186210-14186434)
chr8 (36-316)||(17469141-17469417)
chr8 (7-205)||(1012474-1012674)
chr8 (24-226)||(43113638-43113840)
chr8 (24-219)||(20399465-20399661)
chr8 (84-310)||(11254935-11255161)
chr8 (24-219)||(24870043-24870238)
chr8 (13-291)||(29108761-29109048)
chr8 (7-270)||(34139304-34139574)
chr8 (7-219)||(45235921-45236134)
chr8 (36-290)||(34776951-34777208)
chr8 (24-219)||(27932286-27932482)
chr8 (47-209)||(32302956-32303120)
chr8 (7-226)||(24568796-24569014)
chr8 (47-209)||(24927845-24928008)
chr8 (24-120)||(35215378-35215474)
chr8 (24-226)||(1063380-1063583)
chr8 (13-237)||(36131916-36132141)
chr8 (13-219)||(34021341-34021545)
chr8 (7-165)||(2075907-2076066)
chr8 (151-226)||(27777210-27777285)
chr8 (156-291)||(39445515-39445658)
chr8 (133-270)||(14687382-14687527)
chr8 (13-134)||(17220579-17220701)
chr8 (126-219)||(30481440-30481533)
chr8 (156-207)||(2075864-2075915)
chr8 (7-165)||(4230792-4230951)
chr8 (153-233)||(37960965-37961047)
chr8 (126-219)||(8545368-8545461)
chr8 (36-113)||(29089595-29089672)
chr8 (226-310)||(4230650-4230734)
chr8 (190-279)||(5858603-5858700)
chr8 (47-129)||(28977223-28977306)
chr8 (158-220)||(41188738-41188800)
chr8 (190-236)||(9642351-9642399)
chr8 (169-226)||(35215555-35215612)
chr8 (151-233)||(40789590-40789674)
chr8 (133-177)||(28345474-28345518)
chr8 (61-120)||(39445686-39445746)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (13-284)||(19534324-19534597)
chr4 (47-321)||(5902530-5902807)
chr4 (36-321)||(47550263-47550557)
chr4 (7-236)||(1724311-1724542)
chr4 (24-236)||(6482036-6482251)
chr4 (36-233)||(12825465-12825664)
chr4 (13-279)||(37107280-37107553)
chr4 (7-219)||(48459343-48459556)
chr4 (7-316)||(26564694-26565011)
chr4 (13-186)||(37348992-37349165)
chr4 (36-316)||(11027963-11028253)
chr4 (47-216)||(6382295-6382466)
chr4 (24-219)||(7985145-7985337)
chr4 (45-219)||(32596204-32596378)
chr4 (24-219)||(32585367-32585564)
chr4 (7-223)||(39046815-39047031)
chr4 (45-219)||(47239405-47239580)
chr4 (36-138)||(425715-425817)
chr4 (7-176)||(13770518-13770687)
chr4 (24-196)||(39188395-39188565)
chr4 (47-321)||(43893130-43893412)
chr4 (47-209)||(44317436-44317600)
chr4 (47-209)||(7608872-7609035)
chr4 (13-219)||(31752324-31752531)
chr4 (47-223)||(21423763-21423940)
chr4 (23-123)||(9230163-9230265)
chr4 (47-209)||(11122899-11123062)
chr4 (153-279)||(15987214-15987348)
chr4 (47-209)||(31918588-31918752)
chr4 (23-186)||(28695195-28695358)
chr4 (7-137)||(42774623-42774754)
chr4 (57-206)||(55826656-55826807)
chr4 (135-219)||(14605945-14606029)
chr4 (45-200)||(42299691-42299846)
chr4 (7-113)||(29755456-29755562)
chr4 (126-181)||(42907868-42907923)
chr4 (125-219)||(9929187-9929281)
chr4 (153-236)||(47103747-47103832)
chr4 (153-279)||(29527821-29527943)
chr4 (47-114)||(39375182-39375249)
chr4 (108-198)||(53906346-53906436)
chr4 (153-226)||(21544588-21544661)
chr4 (153-226)||(25941147-25941220)
chr4 (190-226)||(3737822-3737858)
chr4 (94-137)||(13015353-13015396)
chr4 (153-219)||(45065258-45065324)
chr4 (167-219)||(15733546-15733598)
chr4 (135-219)||(30266350-30266434)
chr4 (135-219)||(30285754-30285838)
chr4 (125-165)||(37926540-37926580)
chr4 (190-226)||(43309529-43309565)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (7-279)||(27850283-27850556)
chr7 (13-236)||(3920406-3920631)
chr7 (7-236)||(18825872-18826103)
chr7 (7-216)||(16078875-16079084)
chr7 (5-233)||(5376945-5377175)
chr7 (7-279)||(12980238-12980519)
chr7 (38-219)||(26622844-26623025)
chr7 (7-226)||(45379967-45380188)
chr7 (7-207)||(2630604-2630805)
chr7 (36-207)||(26004505-26004674)
chr7 (36-223)||(30650521-30650709)
chr7 (13-219)||(24425249-24425454)
chr7 (47-209)||(21702560-21702723)
chr7 (24-229)||(46127192-46127394)
chr7 (45-209)||(17851753-17851918)
chr7 (36-316)||(7779898-7780187)
chr7 (7-216)||(16866030-16866240)
chr7 (94-219)||(3226965-3227090)
chr7 (59-226)||(18125240-18125408)
chr7 (45-207)||(17885364-17885527)
chr7 (7-216)||(45885787-45885997)
chr7 (47-214)||(35074370-35074539)
chr7 (43-214)||(25782931-25783102)
chr7 (7-217)||(37182136-37182346)
chr7 (47-223)||(25905529-25905706)
chr7 (59-316)||(24753088-24753342)
chr7 (94-219)||(38152836-38152961)
chr7 (7-215)||(44794051-44794259)
chr7 (94-279)||(41103605-41103792)
chr7 (7-216)||(45708887-45709094)
chr7 (13-196)||(37579130-37579313)
chr7 (13-219)||(44734376-44734583)
chr7 (7-223)||(38139807-38140025)
chr7 (36-176)||(23328500-23328641)
chr7 (94-219)||(39456034-39456157)
chr7 (108-219)||(10072429-10072540)
chr7 (57-186)||(44658501-44658631)
chr7 (94-219)||(25979936-25980061)
chr7 (7-84)||(26004675-26004752)
chr7 (102-219)||(43507402-43507519)
chr7 (60-316)||(16811644-16811895)
chr7 (7-178)||(37196058-37196230)
chr7 (57-219)||(39316906-39317069)
chr7 (153-226)||(32546200-32546273)
chr7 (7-219)||(41741469-41741681)
chr7 (24-137)||(5916171-5916280)
chr7 (7-130)||(44986007-44986130)
chr7 (153-219)||(18683982-18684048)
chr7 (153-219)||(3157091-3157157)
chr7 (153-236)||(22973396-22973481)
chr7 (140-279)||(23475226-23475361)
chr7 (125-235)||(4101522-4101634)
chr7 (226-279)||(44658418-44658471)
chr7 (156-233)||(10995837-10995916)
chr7 (153-234)||(31426016-31426099)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (13-236)||(24602856-24603081)
chr6 (45-243)||(27738666-27738867)
chr6 (7-271)||(14505943-14506203)
chr6 (13-226)||(11762308-11762521)
chr6 (36-316)||(12141270-12141559)
chr6 (36-219)||(12678113-12678296)
chr6 (7-216)||(2367182-2367392)
chr6 (7-316)||(32853700-32854018)
chr6 (7-307)||(7393822-7394118)
chr6 (7-173)||(14032413-14032579)
chr6 (36-321)||(10142427-10142721)
chr6 (47-291)||(24225594-24225853)
chr6 (59-316)||(27534592-27534858)
chr6 (36-219)||(5863402-5863586)
chr6 (84-219)||(12309506-12309641)
chr6 (13-112)||(14410959-14411058)
chr6 (94-270)||(32053032-32053210)
chr6 (47-209)||(3483952-3484115)
chr6 (7-316)||(10187994-10188305)
chr6 (24-209)||(30816131-30816319)
chr6 (143-291)||(14410807-14410950)
chr6 (125-243)||(13769047-13769167)
chr6 (108-219)||(32532498-32532609)
chr6 (36-114)||(14245133-14245211)
chr6 (56-209)||(14254864-14255017)
chr6 (161-279)||(9442441-9442566)
chr6 (154-236)||(28079696-28079780)
chr6 (151-237)||(29199884-29199972)
chr6 (226-316)||(31496518-31496608)
chr6 (226-316)||(31501904-31501994)
chr6 (126-219)||(256511-256604)
chr6 (154-219)||(20349068-20349133)
chr6 (153-233)||(18908896-18908978)
chr6 (131-223)||(19366990-19367082)
chr6 (190-243)||(20610975-20611030)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (24-236)||(33267-33481)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (24-279)||(6027852-6028104)
chr2 (47-316)||(24414046-24414324)
chr2 (36-316)||(37999369-37999652)
chr2 (7-214)||(31942210-31942417)
chr2 (47-216)||(8915959-8916129)
chr2 (45-219)||(13705380-13705555)
chr2 (45-223)||(10208445-10208624)
chr2 (36-291)||(45115444-45115710)
chr2 (7-219)||(7314667-7314880)
chr2 (13-219)||(14540649-14540851)
chr2 (7-310)||(13830593-13830904)
chr2 (47-316)||(30846842-30847121)
chr2 (47-316)||(36128020-36128299)
chr2 (7-219)||(37106556-37106762)
chr2 (7-215)||(42798011-42798221)
chr2 (47-321)||(9632283-9632566)
chr2 (7-226)||(12193839-12194059)
chr2 (13-316)||(19104751-19105066)
chr2 (24-219)||(45256697-45256893)
chr2 (36-188)||(10920531-10920684)
chr2 (36-114)||(16226851-16226929)
chr2 (153-271)||(3547170-3547290)
chr2 (134-235)||(35248386-35248489)
chr2 (153-268)||(14331531-14331648)
chr2 (7-113)||(37472854-37472961)
chr2 (125-209)||(4961480-4961564)
chr2 (157-316)||(37472673-37472840)
chr2 (127-214)||(25210355-25210442)
chr2 (189-236)||(15546784-15546833)
chr2 (157-219)||(24051643-24051705)
chr2 (153-219)||(38342538-38342604)
chr2 (158-236)||(6164473-6164553)
chr2 (125-185)||(35965311-35965371)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (13-321)||(16433088-16433386)
chr1 (13-236)||(34673282-34673507)
chr1 (13-278)||(29871237-29871510)
chr1 (13-223)||(9982905-9983115)
chr1 (7-316)||(5180902-5181214)
chr1 (7-219)||(44615494-44615707)
chr1 (7-219)||(44792862-44793075)
chr1 (7-216)||(29936273-29936483)
chr1 (24-219)||(17134821-17135017)
chr1 (13-284)||(35936775-35937042)
chr1 (7-226)||(12494868-12495087)
chr1 (7-216)||(42439692-42439902)
chr1 (94-316)||(19572426-19572656)
chr1 (36-321)||(36187129-36187423)
chr1 (7-279)||(49740977-49741238)
chr1 (24-219)||(44632160-44632350)
chr1 (7-219)||(18354099-18354312)
chr1 (36-243)||(24236754-24236964)
chr1 (36-226)||(51421744-51421935)
chr1 (5-209)||(28297788-28297994)
chr1 (45-223)||(16408841-16409016)
chr1 (47-279)||(49250724-49250965)
chr1 (7-217)||(40087484-40087695)
chr1 (7-219)||(45866204-45866417)
chr1 (7-219)||(3628004-3628219)
chr1 (94-209)||(23490800-23490915)
chr1 (45-206)||(17091991-17092153)
chr1 (7-219)||(50426680-50426887)
chr1 (7-137)||(42707931-42708062)
chr1 (47-226)||(34610970-34611150)
chr1 (7-137)||(34060121-34060251)
chr1 (94-186)||(13390358-13390450)
chr1 (7-195)||(23966729-23966919)
chr1 (7-279)||(24710715-24710985)
chr1 (125-235)||(39219234-39219346)
chr1 (50-137)||(2514668-2514756)
chr1 (126-279)||(48125646-48125795)
chr1 (153-223)||(10450074-10450144)
chr1 (131-226)||(34085217-34085312)
chr1 (153-219)||(23058470-23058536)
chr1 (190-226)||(10778579-10778615)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (36-271)||(90483-90720)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (84-310)||(10232-10458)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (36-226)||(197339-197529)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (13-203)||(14638-14828)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (23-123)||(36029-36131)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (24-138)||(6280-6394)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (45-219)||(4151-4327)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (135-219)||(211349-211433)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (158-223)||(4596-4661)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (153-212)||(105495-105554)
scaffold0013 (153-222)||(128137-128206)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (125-219)||(107410-107504)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (7-86)||(14297-14376)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (153-226)||(16970-17043)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (135-219)||(67734-67818)
scaffold0008 (135-219)||(75577-75661)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 38006701 - 38006087
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006701 tccaacaatatgctcgttttaacaattgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 38006602  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38006601 ataacatgacatattaacataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatatctgttacgcgtcccatacc 38006502  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  38006501 cgtattttgaaattggggaa----aacccaaacccagtcaaaatggagaaaacccgtcaaatcggatttggttagggcgggtaacaacaggtataggttt 38006406  T
Q  307 tgttaccatgactac---------ctttttcttattcttttagagatgattaatggaatcaaaacacaactaagatcctaattttcctccataacctacg 397  Q
    |||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006405 tgttgccatgactacacatgatacctttttcttattcttttagagacgattaatggaatcaaaacacaactaagatcctaattttcctccataacctacg 38006306  T
Q  398 ccttctctctcattattcattaccaccattacacaaaacaacacaaactcattcgttacaacgttgtctctctcatttcacaaacacaccaccctctctt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38006305 ccttctctctcattattcattaccaccattacacaaaacaacacaaactcattcgttacaacgttgtctctctcatttcacaaacacaccaccctctctt 38006206  T
Q  498 ccacacaatgtccgacgacgaagccaccgccaccacacccaccacctcagccgtcaccttcaccccaaactcctcagataaaatccagtctgcactccaa 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38006205 ccacacaatgtccgacgacgaagccaccgccaccacacccaccacctcagccgtcaccttcaccccaaactcctcagataaaatccaatttgcactccaa 38006106  T
Q  598 tccctttgcaccatcgtca 616  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38006105 tccctttgcaccatcgtca 38006087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35194192 - 35194014
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35194192 tagaccaattgatttagtttattctttaaatatcaatggtagtttttataacacagcaattatcaaacaaaataacatagcatattaacataaagtaatt 35194093  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 214  Q
    ||| |||||| ||| | ||||| ||||| | | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  35194092 ttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 35194014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12834752 - 12834490
Alignment:
Q  63 aaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatgg-catattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggt 160  Q
    |||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | || |||||    
T  12834752 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggt 12834653  T
Q  161 atgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg-gaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatga 252  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||       ||||| ||||||||| | ||||||||     
T  12834652 atgggttcggggtaggtacctatatacctgttacccgtcccatatccatgttttgaaattggagaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatgg 12834553  T
Q  253 agaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccat 315  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12834552 ggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgttaccat 12834490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 4582975 - 4583256
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  4582975 tccaacaatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4583074  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| | |||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  4583075 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatac 4583174  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--aaacccaaac------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||| ||      ||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  4583175 ccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatatccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtt 4583256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12866729 - 12866472
Alignment:
Q  63 aaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatgg-catattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggt 160  Q
    |||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||    
T  12866729 aaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggt 12866630  T
Q  161 atgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg-gaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatga 252  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||       ||||| ||||||||| | ||||||||     
T  12866629 atgggttcgcggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccatgttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatgg 12866530  T
Q  253 agaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgtt 310  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  12866529 ggaaaacccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacatgtatgggttttgtt 12866472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8453598 - 8453376
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||     
T  8453598 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgaatgatttagttactcctttaaatatcaatggtaatttttataacatgacaattattaaacaaaataac- 8453500  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggag-tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 211  Q
     | |||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| |||| |||||   | |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  8453499 -gacatattaacataaactaattttctacatttgggacgagttttgagtatgactttggggtgtgtacctatatatctgttacccatcccatacccgtgt 8453401  T
Q  212 tttgaaattgggaaa-cccaaaccc 235  Q
    |||||||| |||||| |||||||||    
T  8453400 tttgaaatcgggaaagcccaaaccc 8453376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 35311679 - 35311891
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  35311679 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 35311778  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35311779 aataacata-catatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggagtgggtacctatatatctgttacccgtcccatac 35311877  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||    
T  35311878 ccgtgttttgaaat 35311891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 3573087 - 3573239
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3573087 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttgaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacagaataaca 3573186  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 165  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3573187 tgacatatcaacataaaataattttctacattcgggaggggtttgagtatggg 3573239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 4920682 - 4921000
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  4920682 tccaataataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4920781  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  4920782 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatac 4920881  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--aaacccaaac------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||| |||||| || |||  ||||||| ||      ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |    
T  4920882 ccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggg 4920981  T
Q  298 tataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  4920982 tatgggttttgttgccatg 4921000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 206
Target Start/End: Original strand, 12447255 - 12447437
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12447255 tttaacatttgttagatcgattgatttaactgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 12447354  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||| || ||||| | |||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  12447355 cataaagtagttttctatatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattacctgtcccatacc 12447437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 180
Target Start/End: Original strand, 30115340 - 30115513
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  30115340 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgctcctttaaatataaatggtggtttttataacacggcaattatcaaacaaa 30115439  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacc 180  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||   ||||| ||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  30115440 ataacatagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtacc 30115513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2412958 - 2412681
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||| | ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| | || || |||||||||||||    
T  2412958 tccaacaatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaattgtagtttttatgacacaacaattatcaaacaaa 2412859  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||  ||| | ||| |||||||||||| || || || ||||||| | |||| | ||||    |||||||||    
T  2412858 ataacatgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatatacccgttatttatcccatacc 2412759  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttg 276  Q
    ||| |||||||||||||        ||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  2412758 cgtgttttgaaattgggaaaaattcaaacccatacccaaactcaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgaatttg 2412681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22695134 - 22694903
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || |||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  22695134 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatatagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 22695035  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||||    
T  22695034 aataacattacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctatacccgttagtcgtcccatac 22694935  T
Q  206 ccgtattttgaaat-tgggaaacccaaaccca 236  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||    
T  22694934 ccgtattttgagatcggggaaacccataccca 22694903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42987683 - 42987502
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  42987683 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 42987584  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 216  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42987583 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacacgtcccatacccgtgttttga 42987502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27088566 - 27088414
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  27088566 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacataacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaa 27088468  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggt 177  Q
    |||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||    
T  27088467 cataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtgggt 27088414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5908881 - 5908640
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  5908881 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacattt 5908782  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaa 237  Q
     ||| | ||||||||||||| | |||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||        | ||||| ||||||    
T  5908781 gggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaa 5908682  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  5908681 acccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggtt 5908640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17853524 - 17853322
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  17853524 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 17853425  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  17853424 aataacata-catatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatccgttacccgtcccatac 17853326  T
Q  206 ccgt 209  Q
    ||||    
T  17853325 ccgt 17853322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6156145 - 6155873
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataat-acgactattatcaaacaaaataac 111  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| || ||||||||||||| |||| |  ||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||    
T  6156145 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgctcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaataac 6156046  T
Q  112 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 211  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   || |  |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||||| |||| |||||||| |    
T  6156045 atgtcatataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacc--ttacctgtcctatacccgtgt 6155948  T
Q  212 tttgaaattggg--aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggt 278  Q
    |||||||| |||  ||||||||      ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  6155947 tttgaaatcggggaaaacccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaacccgttaaatttgatttggt 6155873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Original strand, 18206903 - 18207087
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgac-tattatcaaacaaaataacatggcatattaacata-aattaa 133  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  18206903 tagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattagtagtttttataacacggcaaattattaaacaaaataacatggcatatcaacatagaagtaa 18207002  T
Q  134 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||| |||||| ||| | |||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  18207003 ttttctacattcgggacgggtttgaatatgggttc-gggtgggtacctatatacctgttacctgtcccatacacgagttttgaaat 18207087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Original strand, 40517662 - 40517871
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  40517662 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 40517761  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  || ||  ||| | ||||| ||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||    
T  40517762 aataacataacatatcaacataaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatatacccgttacccatcccatac 40517861  T
Q  206 ccgtattttg 215  Q
    |||| |||||    
T  40517862 ccgtgttttg 40517871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Original strand, 15890113 - 15890275
Alignment:
Q  57 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 155  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||     
T  15890113 tccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggta 15890212  T
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15890213 tgggtatgggttcggg-tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 15890275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 1218619 - 1218812
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  1218619 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataaca 1218718  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    |  || || |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  1218719 t-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacctgtcccataccc 1218812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Original strand, 2985010 - 2985204
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  2985010 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaataaaataaca 2985109  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    || ||||| || ||||| |||||||| | ||||  ||    |||||||||||  ||||| || |||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  2985110 tgacatatcaatataaaataattttctatattcgagacagatttgggtatggtttcgggatgagtacctatatacccgttacccgtcccaaaccc 2985204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29246096 - 29245903
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||    
T  29246096 attatcaaacaaaataacatgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatatacatgtta 29245997  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaattgg-gaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
      |||||||||||||| ||||||||| || |||       ||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  29245996 ttcgtcccatacccgtgttttgaaatcggagaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggtt 29245903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Original strand, 30996502 - 30996665
Alignment:
Q  57 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 155  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||  ||| | |||    
T  30996502 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtt 30996601  T
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  30996602 tgggtgtgtgttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatactcgtgttttaaaat 30996665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13402235 - 13401919
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  13402235 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 13402136  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||    
T  13402135 aataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtacctaaatacccgttacccgttccatac 13402038  T
Q  206 ccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||| |||  |||| |||||        ||||| ||||||||||| |||||| | | |||| |||||||||||  ||||||| || || |||||  |  |    
T  13402037 ccgtgtttgaaaatcgggaaaaactcatacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccgcggg 13401938  T
Q  298 tataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  13401937 tatgggttttgttgccatg 13401919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6092722 - 6092559
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |   | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  6092722 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 6092623  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgt 198  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  6092622 tttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 6092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 28045511 - 28045731
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat--aatacgactattatcaaaca 104  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||  || |  || ||||| |||||    
T  28045511 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaaca 28045610  T
Q  105 aaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata 204  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  28045611 aaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-gggtgggtacctatatacccgttacccgtcccata 28045709  T
Q  205 cccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
      ||| ||||||| | ||||||    
T  28045710 ttcgtgttttgaattagggaaa 28045731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42717847 - 42717722
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatc-aaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |    
T  42717847 tttaacatttgttagaccggttgatttagtttctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatcaaaacaaaatatcatggcatgtca 42717748  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcagga 149  Q
    |||| || ||||||||  |||||||||    
T  42717747 acat-aagtaattttctgcattcagga 42717722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27302880 - 27302755
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || ||  ||| | || ||  |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27302880 attatcaaacaaaataacatgacatattaacataaagtaattttttacgtttgggacgtgtatgactatggattcggggtgggtacctatatatttgtta 27302781  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
     ||||| |||| |||| |||||||||    
T  27302780 tccgtctcatatccgtgttttgaaat 27302755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 33862380 - 33862285
Alignment:
Q  43 attgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttc 138  Q
    ||||||||||||  || ||||||||| ||| || ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  33862380 attgatttagttggtcatttaaatatcaatcgtagtttttacaacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaaatagttttc 33862285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3564960 - 3564830
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  3564960 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 3564861  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaatttt 137  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  3564860 aataacat-acatatcaacataaagtaatttt 3564830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20973680 - 20973526
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  20973680 tgatttagttgatactttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataccatgacatatcaacataaagtaattttttacat 20973581  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
    |           |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  20973580 t-----------tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgt 20973526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28569106 - 28569041
Alignment:
Q  154 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28569106 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccgcattttgaaat 28569041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 12250955 - 12251039
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||| || | |||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12250955 tttctacattcaggtagggtttgggtatgggttcagagtgggtacatatatctctgttacccgtccggtacccgtattttgaaat 12251039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33420492 - 33420405
Alignment:
Q  77 gtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 165  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  33420492 gtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacatatcaatataaaat-attttctacattcaagacgggtttgggtatggg 33420405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12712643 - 12712577
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12712643 gtttgggtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaat 12712577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23045077 - 23045011
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23045077 gttttggtatgggttcggggtgggtacatatatctccgttacccatcccgtacccgtattttgaaat 23045011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33728071 - 33728024
Alignment:
Q  169 ggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 216  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33728071 ggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 33728024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Original strand, 12457492 - 12457586
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||| ||| ||   | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12457492 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcggagtgagtgtttatatctatgttacctgtcccatacccgtattttgaaat 12457586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12773907 - 12773841
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12773907 gtttgagtatgggttcgaggtgggtacatatatctccgttatccgtcccgtacccgtattttgaaat 12773841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6092534 - 6092481
Alignment:
Q  226 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  6092534 acccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgttaaattgaatttggtt 6092481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Original strand, 6369640 - 6369764
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |  || |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||   ||||||| ||||||||||||| | ||||   ||||    
T  6369640 attatcaaacaaaataacacgacgcatcaacataaagtaattttttacattttggacgggttaaagtatgggttcggggtgggtacatatatacacgtta 6369739  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||    
T  6369740 ccc-tcccatactcgtattttgaaat 6369764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 38972925 - 38972998
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38972925 gtttgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttacctatcccatacccatgttttgaaatcgggaaa 38972998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 355 - 616
Target Start/End: Original strand, 26461477 - 26461726
Alignment:
Q  355 atcaaaacacaactaagatcctaattttcctccataacctacgccttctctctcattattcattaccaccattac--acaaaacaacacaaactcattcg 452  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||| || || ||    
T  26461477 atcaaaacacaattaagatcctaattttgctccataacttacgccttctctctcattattcattaccaccaccattgacaaaacaacacaa-ctgat-cg 26461574  T
Q  453 ttacaacgttgtctctctcatttcacaaacacaccaccctctcttccacacaatgtccgacgacgaagccaccgccaccacacccaccacctcagccgtc 552  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||            |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  26461575 ttacaacgttgcctctctcatttctcaaacacatcac------------acaatgtctgacgacgaagccaccgccaccacaaccactacctccgccgtc 26461662  T
Q  553 accttcaccccaaactcctcagataaaatccagtctgcactccaatccctttgcaccatcgtca 616  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  26461663 accttcaccccaaacaccttagataaaatccaatccgctctccaatccctttgcaccatcgtca 26461726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 291
Target Start/End: Original strand, 53631761 - 53632053
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  |||| || ||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  53631761 tccaacaatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaa 53631860  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||     
T  53631861 ataacatggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcataca 53631960  T
Q  207 cgtattttgaaatt--gggaaacccaaacccaaacct------aatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
    ||| |||| |||||  || |||| |||||||| ||||      | |||||| || |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  53631961 cgtgttttaaaatttgggaaaactcaaacccatacctatacccattcaaaacgaggaaaacccgtcaaattaagtttggttcgaacgagtaac 53632053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 269
Target Start/End: Original strand, 830895 - 831129
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  830895 tagaccaattgatttagtttctccttaaaatatcaatgatagtttttataagacggcaattatcaaacaaaataacatagcatattaacataaagtaatt 830994  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--acccaaac 233  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||  ||||   |||| ||||| ||||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||    
T  830995 ttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtacc-atatactcgttatccgtctcatacccgtgttttgaaaacgggaaatacccatac 831093  T
Q  234 ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaatt 269  Q
    ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  831094 ccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaatt 831129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22536067 - 22535856
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 111  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  22536067 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 22535968  T
Q  112 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 211  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| |    
T  22535967 atgacatatcaacataaaataattttttacatttaggacgagtatgtgtatgggttcggggtgggtgcctgtatacccgttacccgtcccatatccgtgt 22535868  T
Q  212 tttgaaattggg 223  Q
    ||||||||||||    
T  22535867 tttgaaattggg 22535856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 42758237 - 42758459
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  42758237 aatacgctcattttaacatttgttagaccggttgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataaca 42758336  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  | ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  42758337 tggcatatcaacataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatatacctgttacccgtcccatacctgtgtt 42758436  T
Q  213 ttgaaat--tgggaaacccaaac 233  Q
    |||||||   |||||||||||||    
T  42758437 ttgaaatcgggggaaacccaaac 42758459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31127026 - 31126826
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31127026 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataatacgacaattatcaaacaaa 31126927  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||||||||| |||| ||  || |||||  ||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  31126926 ataacatggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatatacatgttacccgtcccatacc 31126827  T
Q  207 c 207  Q
    |    
T  31126826 c 31126826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4016275 - 4016044
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||  || || |||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  4016275 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcgatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaa 4016176  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||  || |||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||    
T  4016175 ataacatgacatatcaacataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttatccgtcccatacc 4016076  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    | | ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  4016075 catgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 4016044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4557536 - 4557305
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  4557536 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaa 4557437  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  4557436 ataacatgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacc 4557337  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    | | ||||||||  |||  |||||||||||||    
T  4557336 catgttttgaaaacggggaaaacccaaaccca 4557305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 34119515 - 34119793
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34119515 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcatttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 34119614  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||  ||||||||| |||| ||| || |||||  ||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  34119615 ata--atggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacc 34119712  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||| |||| |||| |||        |||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||    
T  34119713 cgtgttttaaaatcgggaaaaactcaaactcatacccaaacccaatcaaaatggggaaaacccgtcaaattagatttggtt 34119793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 54317017 - 54317213
Alignment:
Q  23 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    |||||||| ||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54317017 ttttaacatttgttagacatgttgatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatca 54317116  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| ||||||||  | ||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  || |||||||||    
T  54317117 acataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcctatacttgtgttttgaaat 54317213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 19111592 - 19111810
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  19111592 tccaacaatatgatcactttaacatttgttataccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaacaaa 19111691  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||  | | | ||||||| ||||| |  |||||||||| | |||| | |||| || |||| ||||    
T  19111692 ataacatgacata-taacataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatatacccgttatccatcccgtacc 19111790  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  19111791 cgtgttttgaaatcgggaaa 19111810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39655465 - 39655187
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  39655465 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 39655366  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaa 237  Q
      || | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||        | ||||| ||||||    
T  39655365 gagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaa 39655266  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  39655265 acccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 39655187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 291
Target Start/End: Original strand, 44639168 - 44639423
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  44639168 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacat 44639267  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaa-------acccaaaccc 235  Q
    |  | | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||       ||||| ||||    
T  44639268 ttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatatgggaaaacccatacccataccc 44639367  T
Q  236 aaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||  ||| ||| ||||| |||||    
T  44639368 aaacccagtcaaaatggggaaaaccagtcaaattgggtttcgttcggacgggtaac 44639423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 44172482 - 44172692
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  44172482 tccaacaatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44172581  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  44172582 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatac 44172681  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||| ||||||    
T  44172682 ccgtgttttga 44172692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 44179182 - 44179392
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  44179182 tccaacaatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44179281  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  44179282 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatac 44179381  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||| ||||||    
T  44179382 ccgtgttttga 44179392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44106986 - 44106807
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  44106986 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacat 44106887  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |  ||| | ||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  44106886 ttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatccgttacgcgtcccatacccgtgttttaagattggg 44106807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10823896 - 10823616
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  10823896 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 10823797  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg--ggaaacccaaa 232  Q
    |||  |||||  ||||  ||||||||||||| ||||   |||||| | |||| | |||| |  || ||||||||| |||||| || |  | ||||||| |    
T  10823796 tttttacatttgggagaggtttgggtatgggttcgg---gggtacttatatacccgttatcaatctcatacccgtgttttgagatcggagaaaacccata 10823700  T
Q  233 cccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||  |||||||| |||||    
T  10823699 cccaaacctagtcaaaatggaaaaaactcgtcaaattgaatttggtttgggcgggtaacgacgggtatgagttttgttgccatg 10823616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 322
Target Start/End: Original strand, 39728527 - 39728851
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||| || |  || ||||||||||||    
T  39728527 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcttttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaa 39728626  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||    
T  39728627 aataacattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccatcccatac 39728726  T
Q  206 ccgtattttgaaattg-ggaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    ||||||||||| || | ||||       || || ||||||||| | |||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |    
T  39728727 ccgtattttgagatcgaggaaaacctatactcatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattggatttggttcggacgggtaaccacggg 39728826  T
Q  298 tataggttttgttaccatgactacc 322  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  39728827 tatgggttttgttgccatgcctacc 39728851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48391010 - 48390836
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacatt 144  Q
    ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  || ||    
T  48391010 tgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacgtt 48390911  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    | ||| | || |||||||||| || || ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48390910 cgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatattcccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 48390836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17146353 - 17146077
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  17146353 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 17146254  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg--gaaacccaaa 232  Q
    |||  |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||   ||||||| |    
T  17146253 tttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatataactgttacccgttccatacccatgttttgagattggaaaaaacccata 17146154  T
Q  233 cccaaacctaa---tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggtttt 307  Q
    |||| ||| ||   |||||| |  | ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||||||    
T  17146153 cccatacccaaatgtcaaaacg-gggaaacccgtcaaattggatttggtttggacgggtgaccacatatatgggtttt 17146077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 29842164 - 29842384
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  || |||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  29842164 tccaacaatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 29842263  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||  |||||   || | || || ||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||    
T  29842264 aataacatgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttaccagtcccatac 29842363  T
Q  206 ccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||| |||| |||| ||||||    
T  29842364 ccgtgttttaaaatcgggaaa 29842384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 52198039 - 52198231
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataa-catggcatattaacataaattaa 133  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||    
T  52198039 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataaacatagcatatcaacgtaaagtaa 52198138  T
Q  134 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||  |||||  | | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||    
T  52198139 ttttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagatcgggaaa 52198231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 52572465 - 52572783
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  52572465 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatactttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 52572564  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||  ||| | | ||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  52572565 aataacataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatatacccgttacccgtcccatac 52572664  T
Q  206 ccgtattttgaaattg-ggaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||| |||||| || | ||||       ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| || ||  |||| ||  |    
T  52572665 ccgtgttttgagatcgaggaaaactcatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacctgtcaaattgagtttggttcgggcggataaccacggg 52572764  T
Q  298 tataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  52572765 tatgggttttgttgccatg 52572783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Original strand, 29284232 - 29284510
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  ||||      
T  29284232 atttagttgatcttttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatct 29284331  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaa 237  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||||        ||||| ||||||    
T  29284332 gggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaaaacccatacccatacccaa 29284431  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  ||||  |||||||| |||||    
T  29284432 acccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgagttttgttgccatg 29284510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44953627 - 44953431
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  44953627 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 44953528  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacc 240  Q
     ||| | ||||| ||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| |||||||||    
T  44953527 gggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccaaacc 44953431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Original strand, 49025566 - 49025768
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |  || ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||    
T  49025566 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacacaaagtaat 49025665  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 232  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| || || || |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||    
T  49025666 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttc-ggatgtgtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccaaa 49025764  T
Q  233 ccca 236  Q
    ||||    
T  49025765 ccca 49025768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 49579920 - 49580201
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| || |||||||||    
T  49579920 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaa 49580019  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| |||||||  |||||  ||| | ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  49580020 aataacataacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatac 49580119  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    |||| |||||| || |||        | ||||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49580120 ccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggtt 49580201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7469970 - 7469685
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || | ||  |||||     
T  7469970 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagtgttttacattt 7469871  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaa-------acccaaacccaa 237  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||       ||||| ||||||    
T  7469870 gggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcagggaaaacccatacccatacccaa 7469771  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactacct 323  Q
    ||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  7469770 acccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctacct 7469685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 175
Target Start/End: Original strand, 30682695 - 30682846
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||| | | ||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  30682695 tttaacatttgttagaacgaatgatttaattgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacatgaccattatcaaacaaaataacatgacatatcaa 30682794  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgg 175  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||    
T  30682795 cataaagtaattttctacattcaggacgggtttgagtataggttcgaggtgg 30682846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 44252643 - 44252806
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  | |||     
T  44252643 atttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttatattt 44252742  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44252743 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacacgtcccatacccgt 44252806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 34025810 - 34026023
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||   | ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  34025810 tccaacaatatgctccctttaacatttgatagatggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaa 34025909  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||| | |||||||||  |||| ||||   ||||||||||||||||    
T  34025910 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatatactcgttacccgtcccatac 34026009  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    | || |||||||||    
T  34026010 ctgtgttttgaaat 34026023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 23580722 - 23580900
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  23580722 tgatttagttgatcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacata-catatcaacataaaataattttttacat 23580820  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |  |||  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  23580821 ttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtttcatactcgtgttttgaaattggg 23580900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23547029 - 23546899
Alignment:
Q  151 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaa 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||| ||||||||| | |||||    
T  23547029 gagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccaaacccagtcaaa 23546930  T
Q  249 atgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    | |  |||||||||| ||||||  |||||||    
T  23546929 acggggaaaacccgttaaattgggtttggtt 23546899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 186
Target Start/End: Original strand, 20086903 - 20087044
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  20086903 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 20087002  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 186  Q
    |  ||| | || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  20087003 ttgggacgggtatgagta-gggttcggggtgggtacctatata 20087044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Original strand, 34154312 - 34154483
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaa-ttttcaaca 142  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||| ||| ||||  |||    
T  34154312 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataa-----catatcaacataaagtaatttttttaca 34154406  T
Q  143 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||  ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  34154407 tttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatattcttgttacccgtttcatacccatgttttgaaat 34154483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23547164 - 23547081
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 129  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  23547164 atttagttgatcctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaa 23547081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23154245 - 23154093
Alignment:
Q  57 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 155  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  |||   ||     
T  23154245 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggta 23154147  T
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
    || ||||||| |||| |||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||    
T  23154146 tgagtatgggttcggagtgggtacctatatactcgttacccgttccatacccgt 23154093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6738538 - 6738434
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||  | ||||||||||||| |||| | ||||    
T  6738538 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatatacccgtta 6738439  T
Q  194 cccgt 198  Q
    |||||    
T  6738438 cccgt 6738434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41937233 - 41937077
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| || ||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || ||| ||||| |||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41937233 tccaacaacatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcatttcaatatcaatgttagtctttataacacgacaattatcaaacaaa 41937134  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatg 163  Q
    |||| ||| ||| | |||| ||| || |||||  ||||   || |||||||||||||    
T  41937133 ataatatgacatgtcaacacaaagtagttttctgcatttgagacgagtttgggtatg 41937077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48305726 - 48305656
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||| | | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  48305726 gtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgatactcgttccatacccgtgttttgaaattggg 48305656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23910385 - 23910337
Alignment:
Q  97 atcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  23910385 atcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttctacattc 23910337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30904899 - 30904835
Alignment:
Q  154 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30904899 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccg-tacccgtcccgtacccgtgttttgaaat 30904835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Original strand, 14186210 - 14186434
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14186210 tagaccaattgatttagttactcctttaaatatcaatggtagttt----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 14186305  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaaccc 235  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||    |||| |    
T  14186306 ttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatccgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcgagaa----aaactc 14186401  T
Q  236 aaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaat 268  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  14186402 aaacccaatcaaaacggagaaaacccgtcaaat 14186434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Original strand, 17469141 - 17469417
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  17469141 tagacccattgatttagtttctcctttaaatatcaatggtagcttttataacaaggcaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtagtt 17469240  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaaccc 235  Q
    |||  || |  ||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    |||||    
T  17469241 ttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaa----aaccc 17469336  T
Q  236 aaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||  ||||||| ||  | ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  17469337 aaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaactacgggtatgggttttgttgccatg 17469417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 205
Target Start/End: Original strand, 1012474 - 1012674
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  1012474 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtactttttataacacagcaattatcaaacaaa 1012573  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaatta--attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata 204  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||   ||||   ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  1012574 ataacatggcatatcaacataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccata 1012673  T
Q  205 c 205  Q
    |    
T  1012674 c 1012674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43113840 - 43113638
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  43113840 tttaacatttgttataccgattgatttagttgctccttcaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatctaacaaaataacataacatatcaa 43113741  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    ||| || || |||||  |||||  || |  |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  43113740 catgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatgcccgtgttttgaaatcggg 43113641  T
Q  224 aaa 226  Q
    |||    
T  43113640 aaa 43113638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 20399465 - 20399661
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatc-aaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||| |||| |    
T  20399465 tttaacatttgttagaccgattgatttggttggtcctttaaatatcaatgctagtttttataacacgacaattatataaaaaaaataacatggtatatca 20399564  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| |||||||   ||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20399565 acataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 20399661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11255161 - 11254935
Alignment:
Q  84 taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgt 183  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||  |||||||||| |    
T  11255161 taatatgacaattatcaaacaaaataacata-catatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctat 11255063  T
Q  184 atatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa-cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttagg 282  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11255062 atacctgttatccgtcccatacccgtgtttggaaagcgggaaaacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgg 11254963  T
Q  283 acgagtaacaacatgtataggttttgtt 310  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||||||    
T  11254962 acaggtaaccgcatgtatgggttttgtt 11254935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24870238 - 24870043
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||  ||| | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  24870238 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgacatatcaa 24870139  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||| |||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24870138 cataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcacatacccgtgttttaaaat 24870043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29109048 - 29108761
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 111  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||     
T  29109048 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataat 29108949  T
Q  112 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 211  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| | |    
T  29108948 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccatgt 29108849  T
Q  212 tttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
    ||| |||| |||||        ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  29108848 tttaaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcggacgagtaac 29108761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 34139304 - 34139574
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34139304 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttgtttactcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 34139403  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaa-cattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    |||||||||  ||| |||||||| |||||||    ||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||  |||| |||     
T  34139404 ataacatggtctatcaacataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtatggt-tcggggtgggtacctatatacctgttacatgtcctatat 34139502  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg-------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattg 270  Q
    |||| |||| |||| |||       |||| || ||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  34139503 ccgtgtttttaaatcggggaaaaccaaacacatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaattg 34139574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 45235921 - 45236134
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  45235921 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 45236020  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||  ||| | || ||| |||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  45236021 aataacataacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatac 45236120  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||    
T  45236121 ccgtgttttgaaat 45236134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 36 - 290
Target Start/End: Original strand, 34776951 - 34777208
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || |   | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  34776951 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 34777050  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 232  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  34777051 tttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtacctaaatacctgttactcgttccatacccgtgttttgagatcgggaaaaacccata 34777150  T
Q  233 cccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaa 290  Q
    |||||||| | |||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  34777151 cccaaacccagtcaaaacgggaaaaacccgttaaattgggtttggttcggacgggtaa 34777208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 27932286 - 27932482
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27932286 tttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 27932385  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| |||||||  |||||  ||| |  | || ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27932386 acataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaat 27932482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 32302956 - 32303120
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  32302956 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatt 32303055  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  32303056 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 32303120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 24568796 - 24569014
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  24568796 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaa 24568895  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || |||||  ||||| ||| |  |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||    
T  24568896 ataac-tgacatatcaacataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccgctacctgtcccatacc 24568994  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    | | || |||||| ||||||    
T  24568995 catgttgtgaaatcgggaaa 24569014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 24927845 - 24928008
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||  |||||     
T  24927845 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacattt 24927944  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  24927945 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgt 24928008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 35215378 - 35215474
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 120  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35215378 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctccattaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatat 35215474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Original strand, 1063380 - 1063583
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  1063380 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 1063479  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 222  Q
    ||||||| |||||||  ||| |  ||| |  |||||||||| | ||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1063480 acataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttgaaatcgg 1063579  T
Q  223 gaaa 226  Q
    ||||    
T  1063580 gaaa 1063583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36132141 - 36131916
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | |||| ||| ||||| || || |||||||| | ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  36132141 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgattaatttaattgcttctttaaattttaatggtaatttttataacacggcaattatcaaacaaaataaca 36132042  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || |||| ||||||||| ||| ||||  ||||| ||| |  |||| ||||| | ||||||||| |||||||||  |  |||||| |||||||| ||| ||    
T  36132041 tgacata-taacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacctgtatgccctttacccatcccatactcgtgtt 36131943  T
Q  213 ttgaaattggg--aaacccaaacccaa 237  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||    
T  36131942 ttgaaataggggaaaactcaaacccaa 36131916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 34021341 - 34021545
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  34021341 aatatgctcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgctcctttaaatatcaatagtagtttttatataatgacaattatcaaacaaaataaca 34021440  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    |  ||||| |||||||| | ||||||  ||||||||| |||| || |||| || | |||||| |||||| |||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  34021441 t-acatatcaacataaa-tgattttctgcattcaggacgagtctgtgtattggtttggggtgtgtacctatattcctgttactcgttccatatccgtatt 34021538  T
Q  213 ttgaaat 219  Q
    || ||||    
T  34021539 ttaaaat 34021545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2076066 - 2075907
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  2076066 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 2075967  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 165  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||||||||||||    
T  2075966 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg 2075907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27777285 - 27777210
Alignment:
Q  151 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||    
T  27777285 gagtttgggtatgggttcggggtgggtacctgtatctctgttacctgtcccgtacctgtgttttgaaatcgggaaa 27777210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39445658 - 39445515
Alignment:
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaa 247  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||        ||||| ||||||||||| ||||    
T  39445658 tgggtatgagttcggggtgggtacctataaacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacctagtcaa 39445559  T
Q  248 aatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
    || |  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39445558 aacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggacgagtaac 39445515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 270
Target Start/End: Original strand, 14687382 - 14687527
Alignment:
Q  133 attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaaccca 230  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  ||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||    
T  14687382 attttccacattcaggacgagtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccctgtttctcgtcccatacctgtgttttgaaatcggggaaaaccca 14687481  T
Q  231 a------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattg 270  Q
    |      ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  14687482 aatccatacccaaacccaatcaaagtggggaaaacccgccaaattg 14687527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 17220579 - 17220701
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 111  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  17220579 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 17220678  T
Q  112 atggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||    
T  17220679 atgacatatcaacataaagtaat 17220701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30481533 - 30481440
Alignment:
Q  126 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  30481533 taaattaattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatcctcattactcgtctcatactcgtattttgaaat 30481440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 2075864 - 2075915
Alignment:
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  2075864 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccataccc 2075915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4230951 - 4230792
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  4230951 tccaacaataagctcacttttacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 4230852  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 165  Q
    ||||||||    ||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||||||||||||    
T  4230851 aataacataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg 4230792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37961047 - 37960965
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||||    
T  37961047 gtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatatacctgttacctgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaacccaaac 37960965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8545461 - 8545368
Alignment:
Q  126 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8545461 taaattgattttctacatttgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtatctatatccccgttactcgttccatacccgtgttttgaaat 8545368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 113
Target Start/End: Original strand, 29089595 - 29089672
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacat 113  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||    
T  29089595 tagacccattaatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttaataacacaataattatcaaacaaaataacat 29089672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4230734 - 4230650
Alignment:
Q  226 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgtt 310  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| |||||||| | |||||||    
T  4230734 acccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacatgtatggattttgtt 4230650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5858700 - 5858603
Alignment:
Q  190 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa--------cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||        |||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5858700 gttacccgtcccatacccgtgtttttaaatcgggaaaaacccaaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggtt 5858603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28977306 - 28977223
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaa 129  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  28977306 atttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaa 28977223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41188800 - 41188738
Alignment:
Q  158 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaatt 220  Q
    |||||||| ||||||| ||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41188800 ggtatgggttcggggttggtgcatatatctctgttactcgtcccatacccgtattttaaaatt 41188738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9642399 - 9642351
Alignment:
Q  190 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  9642399 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 9642351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 226
Target Start/End: Original strand, 35215555 - 35215612
Alignment:
Q  169 ggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35215555 ggggtgggtacctatatactcgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcgggaaa 35215612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Original strand, 40789590 - 40789674
Alignment:
Q  151 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| | |||  |||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||  ||||||||||    
T  40789590 gagtttgggtataggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtccagtacctatattatgaaattggggaaaacccaaac 40789674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 177
Target Start/End: Original strand, 28345474 - 28345518
Alignment:
Q  133 attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggt 177  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  28345474 attttctacattcaggacaagtttgggtatgggttcggggtgggt 28345518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39445746 - 39445686
Alignment:
Q  61 ttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 120  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39445746 ttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 39445686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Original strand, 19534324 - 19534597
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19534324 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttagatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 19534423  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  19534424 tgacatatcaacataaaataattttctacattcgtgacgggtttgggtatgagttcgaggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccagatt 19534523  T
Q  213 ttgaaattg--ggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggac 284  Q
    || |||| |  | |||| || ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19534524 ttaaaatcggagaaaactcatacccaaacccaatgaaaacggagaaaacccgtcaaattggatttggtttggac 19534597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5902807 - 5902530
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  5902807 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataagataacatatcaacataaagtagttttttacattt 5902708  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaa 243  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||| ||||||||| |     
T  5902707 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccaaacccag 5902608  T
Q  244 tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 321  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5902607 tcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtataggttttgttgccatgcctac 5902530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47550557 - 47550263
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  47550557 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 47550458  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 226  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  47550457 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcata 47550358  T
Q  227 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 321  Q
    || | ||||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  47550357 cctatacccaaacccagtcaaaatggggaaaatccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacatgtatgggttttgtttccatgcctac 47550263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1724542 - 1724311
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | |||||| ||||||    
T  1724542 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatctaacaaa 1724443  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  1724442 ataacatgacatatcaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatataaccgttacccgtcccatacc 1724343  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    | | ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  1724342 catgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 1724311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6482251 - 6482036
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6482251 tttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6482152  T
Q  124 cataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 222  Q
     ||||||||  ||||   ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  6482151 tataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatataccctttactcgtcccatacccgtgtttttaaattgg 6482052  T
Q  223 g--aaacccaaaccca 236  Q
    |  |||||||||||||    
T  6482051 ggaaaacccaaaccca 6482036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12825664 - 12825465
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  12825664 tagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaattttagtttttataacacgataattatcaaacaaaataacatgatatatcaacataaagtaatt 12825565  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    |||  || || |||   |||||||||| || || |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  12825564 ttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaac 12825465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 279
Target Start/End: Original strand, 37107280 - 37107553
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    ||||||||| |||||| | |||  ||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  37107280 aatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgcttctttaaataccaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataaca 37107379  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||    ||| |||||    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  37107380 tgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatatattttggtataaattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtt 37107479  T
Q  213 ttgaaattggg-aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||||||||||| ||||||||      || |||||| | ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  37107480 ttgaaattgggaaaacccaaactcatacacaaacccagtcaaaatgggaaaaacccgtcaaattaaatttggtt 37107553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 48459343 - 48459556
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  48459343 tccaacaatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 48459442  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48459443 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgttccatac 48459542  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    || | |||||||||    
T  48459543 ccatgttttgaaat 48459556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 26564694 - 26565011
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| | |||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  26564694 tccaacaatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgttccgttaaatatcaatgatagtttttataacacggcagttatcaaacaaa 26564793  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
     ||||||| ||||| |||||||| || |||||  ||||  ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  26564794 ctaacatgacatatcaacataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacc 26564893  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgt 298  Q
    ||  ||||||||| |||        |||| || ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||  ||    
T  26564894 cgcgttttgaaatcggggaaagctcaaactcatacccaaacccagtcaaaacgaagaaaatccgtcaaattggatttggttcgggtgggtaaccacgggt 26564993  T
Q  299 ataggttttgttaccatg 316  Q
    || ||||||||| |||||    
T  26564994 atgggttttgttgccatg 26565011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 37348992 - 37349165
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||| | ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  37348992 aatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgctcctttaaatatcaacggtagtttttataacgcgagaattatcaaacaaaataaca 37349091  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 186  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||    
T  37349092 tggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatata 37349165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Original strand, 11027963 - 11028253
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||    
T  11027963 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaatataaagtaat 11028062  T
Q  135 tttca-acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaa 231  Q
    |||   |||||  |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||     
T  11028063 ttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccat 11028162  T
Q  232 acccaaacctaa------tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||||| ||| ||      |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| ||  | ||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  11028163 acccatacccaaatccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggtgggtaaccacgtgtatgggttttgttgccatg 11028253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6382466 - 6382295
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  6382466 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatt 6382367  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 216  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6382366 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttga 6382295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7985337 - 7985145
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttt-ataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  7985337 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcatttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacttatca 7985238  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| || |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| || ||||    |||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  7985237 acataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgagtac----atacatgttatccgtcccatacccatgttttgaaat 7985145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32596378 - 32596204
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacatt 144  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  32596378 tgatttagttgttccttcaaatattaatgctagtttttataacatgacaattatcaaaccaaatgacatggtatatcaacataaaataattttctacatt 32596279  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |  ||  |||||||||||| | | | |||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32596278 cgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 32596204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 32585367 - 32585564
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtg-gtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatt 121  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  32585367 tttaacaattgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatata 32585466  T
Q  122 aacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||| ||| |||  |||||  ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32585467 aacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgtgttttgaaat 32585564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Original strand, 39046815 - 39047031
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  39046815 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagttaatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 39046914  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| | || |||||||||| |||| | |||||  |||||||||    
T  39046915 aataacata-catatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatatacccgttacatgtcccatac 39047013  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  39047014 ccgtgtttggaaattggg 39047031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47239580 - 47239405
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  47239580 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacat 47239481  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |  |||   || |||||||||| || ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47239480 ttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttaaaat 47239405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Original strand, 425715 - 425817
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  425715 tagaccgattgatttagttgttcttttaaatatcaatggtagtttttataacatgacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaatt 425814  T
Q  136 ttc 138  Q
    |||    
T  425815 ttc 425817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13770687 - 13770518
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||   |||||||||||||    
T  13770687 tccaacaatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgctccttcaaatattaatggtcgtttttataacacggtaattatcaaacaaa 13770588  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtggg 176  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||   ||||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||    
T  13770587 ataacatggcttattaacataaaatagttttatgcattcgggacgggtttgagtatgagttcggggtggg 13770518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 196
Target Start/End: Original strand, 39188395 - 39188565
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39188395 tttaacatttgttagaacgattgatttagttttttctttaaatataaatggtagttttt-taacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatcaa 39188493  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttaccc 196  Q
    ||||||  ||||||   ||||| ||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  39188494 cataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggt-ggtacctatatatccgttaccc 39188565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Original strand, 43893130 - 43893412
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  43893130 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 43893229  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg-------aaacccaaacccaaa 238  Q
     ||| | |||||||||||   ||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||       | ||||| |||||||    
T  43893230 gggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaacccatacccatacccaaa 43893329  T
Q  239 cctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 321  Q
    || | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||| | || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  43893330 cccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggctcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctac 43893412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 44317436 - 44317600
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  44317436 atttagttgatcctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 44317535  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  44317536 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 44317600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 7608872 - 7609035
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||   |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | || ||||  |||||     
T  7608872 atttagttgatcctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacatagagtagttttttacattt 7608971  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  7608972 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 7609035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 31752324 - 31752531
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 111  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||| | || | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  31752324 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataac 31752423  T
Q  112 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 211  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||||||||| |||| ||||   ||||| |||| ||||||||| |    
T  31752424 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatatactcgttactcgtctcatacccgtgt 31752523  T
Q  212 tttgaaat 219  Q
    ||||||||    
T  31752524 tttgaaat 31752531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 21423763 - 21423940
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  21423763 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagttttttacattt 21423862  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
     ||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  21423863 gggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgtttcgagattggg 21423940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 9230163 - 9230265
Alignment:
Q  23 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttct--cctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 120  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  9230163 ttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatat 9230262  T
Q  121 taa 123  Q
    |||    
T  9230263 taa 9230265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11123062 - 11122899
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  11123062 atttagttgatcctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaacatatcaacataaagtagttttttacattt 11122963  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11122962 gggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 11122899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15987348 - 15987214
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaa-------acccaaacccaaacctaat 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||       ||||| ||||||||| |||    
T  15987348 gtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccatcccatacccgtgttttaaaatctgggaaaactcatacccatacccaaacccaat 15987249  T
Q  245 caaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  15987248 caaaatggagaaaacccgtcaaattgggtttggtt 15987214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31918752 - 31918588
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaatta-attttcaacatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||  |||||    
T  31918752 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 31918653  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
      ||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |  |||| ||||||||||||||    
T  31918652 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtaactatatacccattactcgtcccatacccgt 31918588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28695358 - 28695195
Alignment:
Q  23 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    |||||||| ||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  28695358 ttttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgctcctttaaatattaatgatagtttttataacgtgacaattatcaaataaaataacattgcatatca 28695259  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 186  Q
    |||||||  ||||| | | |||   || ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  28695258 acataaagcaatttcctatatttgagacgagtttgggtatgagttcggggtgagtacctatata 28695195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Original strand, 42774623 - 42774754
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||| ||||   | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  42774623 tccaacaatatgttcattttaacatttgttagaaggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42774722  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaatttt 137  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42774723 aataacatgacatatcaacataaagtaatttt 42774754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 55826807 - 55826656
Alignment:
Q  57 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acattcaggaggagt 154  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||  ||| | ||    
T  55826807 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 55826708  T
Q  155 ttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  55826707 ttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacc 55826656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14606029 - 14605945
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14606029 tttctacattcaggtagagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaat 14605945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 200
Target Start/End: Original strand, 42299691 - 42299846
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||  || |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | ||    
T  42299691 tgatttagttgctcatttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtactttt-tatat 42299789  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcc 200  Q
    |  ||| | ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  42299790 ttgggacgtgtttgagtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcc 42299846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 29755562 - 29755456
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||| || ||||||| |||   |||||||||||||    
T  29755562 tccaacaatatactcattttaacatttgttagatcgattgatttagttacttctttaaatatcaatggtagtgtttataacacggtaattatcaaacaaa 29755463  T
Q  107 ataacat 113  Q
    |||||||    
T  29755462 ataacat 29755456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 181
Target Start/End: Original strand, 42907868 - 42907923
Alignment:
Q  126 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacct 181  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42907868 taaattgattttctacattcgggacgagtttgggtatgggctcggggtgggtacct 42907923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9929281 - 9929187
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| || |||||||| | | ||||||||||||||| |||   |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9929281 ataaattgattttctactttcaggacgattttgggtaagagttcggggtgggtacctatatccatgttacccgtactatacccgtattttgaaat 9929187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 236
Target Start/End: Original strand, 47103747 - 47103832
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47103747 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccgcgttacccgccccgtacccgtattttgaaattggggaaaacccaaaccca 47103832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 279
Target Start/End: Original strand, 29527821 - 29527943
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatga 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  | |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||  ||||||  |     
T  29527821 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcacgtacccgtattttgaaatcggggaa----aacccaaaccctatcaaagcgg 29527916  T
Q  253 agaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29527917 ggaaaacccgtcaaatcgaagttggtt 29527943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 114
Target Start/End: Original strand, 39375182 - 39375249
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatg 114  Q
    ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  39375182 atttagttgttcctttaaatattagtggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatg 39375249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53906436 - 53906346
Alignment:
Q  108 taacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgt 198  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||  ||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  53906436 taacatgacatatcaacatgaagtaattttttacatttgggacgagtttagatatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgt 53906346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 21544588 - 21544661
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21544588 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacctgtcccgtacccgtattttgaaatcgggaaa 21544661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 25941147 - 25941220
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |  | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  25941147 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctatcttcccgttacctgtcccgtacccgtgttttgaaatcgggaaa 25941220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Original strand, 3737822 - 3737858
Alignment:
Q  190 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3737822 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaattgggaaa 3737858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 13015396 - 13015353
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatttt 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  13015396 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataatttt 13015353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Original strand, 45065258 - 45065324
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45065258 gtttgggtatgcgttcgggatgggtacatatatccctgttactcgtcccgtacccgtattttgaaat 45065324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15733598 - 15733546
Alignment:
Q  167 tcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15733598 tcggggtgggtacatatatctccgttacccgtctcgtacccgtattttgaaat 15733546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30266434 - 30266350
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  | |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30266434 tttctacattcaggtagggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaat 30266350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 30285754 - 30285838
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||  | |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30285754 tttctacattcaggtagggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatccccgttacccgtcctgtacccgtattatgaaat 30285838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 165
Target Start/End: Original strand, 37926540 - 37926580
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatggg 165  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  37926540 ataaattaatttactacattcaggatgagtttgggtatggg 37926580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Original strand, 43309529 - 43309565
Alignment:
Q  190 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43309529 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaa 43309565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27850556 - 27850283
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27850556 tccaacaatatgctcattt-aacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgaaagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 27850458  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| ||||| | | |||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  27850457 ataacatgacatatcatcgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatacacccgttacccgtcccatacc 27850358  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||  |||||||    
T  27850357 cgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccaaacccaatcaaaacggggaaaaaccgtcaaattgggtttggtt 27850283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 3920406 - 3920631
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||||||    
T  3920406 aatacgctcattttaacatttgttagaccgattcatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataaca 3920505  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || ||    
T  3920506 tggcatatcaacataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtcccataccagtgtt 3920605  T
Q  213 ttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||    
T  3920606 ttgaaatcggggaaaacccaaaccca 3920631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18826103 - 18825872
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18826103 tccaataatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcttttatatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 18826004  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||   |||  ||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  18826003 ataacatggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacc 18825904  T
Q  207 cgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    ||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  18825903 cgtgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 18825872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 16078875 - 16079084
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16078875 tccaacaatatgttcactttaacattttttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 16078974  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||   ||||| || |||||||||||| || | |||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16078975 ataacatggcatatcaacgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatatacccgttacccgtcccatacc 16079074  T
Q  207 cgtattttga 216  Q
    ||| ||||||    
T  16079075 cgtgttttga 16079084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 5376945 - 5377175
Alignment:
Q  5 tgtccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaaca 104  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5376945 tgtccaacaatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcattggtagtttttataacacgacaattatcaaaca 5377044  T
Q  105 aaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata 204  Q
    |||| |||||  |||| |||||||| ||||||||  ||||| |||    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  5377045 aaattacatgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatataccctttacccgtcccata 5377144  T
Q  205 cccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    || || ||||||||| |||  ||||||||||    
T  5377145 cctgtgttttgaaatcggggaaaacccaaac 5377175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 12980238 - 12980519
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12980238 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgaaaattatcaaacaaa 12980337  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||   ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||||||||||||    
T  12980338 ataacatggcatatcaacataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccgtcccatac 12980437  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    |||| ||||||||| |||        ||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||    
T  12980438 ccgtgttttgaaatcggggaaaaccaaaacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgttaaattgagtttggtt 12980519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 219
Target Start/End: Original strand, 26622844 - 26623025
Alignment:
Q  38 gaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatttt 137  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26622844 gaccaattgatttaattgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaaataatttt 26622943  T
Q  138 caacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
       |||||   | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26622944 ttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccatcccatacccgtgttttgaaat 26623025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 45379967 - 45380188
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  45379967 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacgaactgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 45380066  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttca-acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata 204  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| |||||||   |||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  45380067 aataacatgacatgtcaacataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccata 45380166  T
Q  205 cccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  45380167 cccgtattttgaaatcgggaaa 45380188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2630805 - 2630604
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2630805 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagaccgattgatttagttgctcatttaaatatcaatggtagtttttataatacggcaattatcaaacaaa 2630706  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||   ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| | || |||||||||||||    
T  2630705 ataacatggcatatcaacataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgtcacccgtcccatac 2630606  T
Q  206 cc 207  Q
    ||    
T  2630605 cc 2630604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26004674 - 26004505
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26004674 tagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatgatagtttttataagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaatt 26004575  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    |||  ||||| ||  |||||  |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  26004574 ttctgcattcggggcgagtt--ggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcccataccc 26004505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 223
Target Start/End: Original strand, 30650521 - 30650709
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  30650521 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 30650620  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30650621 tttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagattggg 30650709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 24425249 - 24425454
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  24425249 aatatgctcactttaacatttgttagaccggttgattta-tttgtcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgataattatcaaacagaataaca 24425347  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    |||||||| |||||| | |||||||   ||||  | | | ||||||  ||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  24425348 tggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtt 24425447  T
Q  213 ttgaaat 219  Q
    |||||||    
T  24425448 ttgaaat 24425454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Original strand, 21702560 - 21702723
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  21702560 atttagttgatcctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 21702659  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
     ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  21702660 gggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 21702723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46127394 - 46127192
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||       
T  46127394 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagttattataacacgacaatgatcaaacaaaataacatgacatat--- 46127298  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||||| ||||||||  ||||  ||| | ||||| ||||| | |||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  46127297 cataaaataattttctgcatttgggacgggtttgagtatgagatcggtgtgggtacctatacacctgttatccgtcccatacccgtgattttaaatcggg 46127198  T
Q  224 aaaccc 229  Q
    ||||||    
T  46127197 aaaccc 46127192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 17851753 - 17851918
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  ||||    
T  17851753 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacat 17851852  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
    |  ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17851853 ttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgt 17851918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Original strand, 7779898 - 7780187
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||     
T  7779898 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataaa 7779997  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 226  Q
    |||  |||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  7779998 tttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattatccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 7780097  T
Q  227 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  7780098 cccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 7780187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 16866030 - 16866240
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||| || | | | ||||||||||||    
T  16866030 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatcatttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 16866129  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  16866130 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatac 16866229  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||| ||||||    
T  16866230 ccgtgttttga 16866240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3227090 - 3226965
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||    
T  3227090 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggatgtgtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcctgtta 3226991  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  3226990 cccgtcccatacccgtgttttgaaat 3226965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18125408 - 18125240
Alignment:
Q  59 ctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttg 157  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||  ||| | |||||    
T  18125408 ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttg 18125309  T
Q  158 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  18125308 ggtatgcgttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcgggaaa 18125240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 207
Target Start/End: Original strand, 17885364 - 17885527
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttata-atacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  17885364 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacat 17885463  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    |  ||| | || |||||||||| ||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17885464 ttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatatacccgttacccgtcccataccc 17885527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45885997 - 45885787
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | | | ||||||||||||    
T  45885997 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgattaagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 45885898  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  45885897 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatatacttgttacccgtcccatac 45885798  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||| ||||||    
T  45885797 ccgtgttttga 45885787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 35074370 - 35074539
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||    
T  35074370 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 35074469  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 214  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  35074470 tgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 35074539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25783102 - 25782931
Alignment:
Q  43 attgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaaca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  25783102 attgatttagttgctcctttaaatattgatgatagtttttataacactgcaattatcaaacaaaataatatgagatattaacataaagtaattttctgca 25783003  T
Q  143 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 214  Q
    ||| ||| |  ||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |  ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  25783002 ttcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatatacccattatccgtctcatacccgtgtttt 25782931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Original strand, 37182136 - 37182346
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  37182136 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacacaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37182235  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| || || || |||||| |||| | | ||||||||||||||    
T  37182236 aataacatgacatatcaacataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttc-ggatgagtacctatatacccgctacccgtcccatac 37182334  T
Q  206 ccgtattttgaa 217  Q
    |||| |||||||    
T  37182335 ccgtgttttgaa 37182346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 25905529 - 25905706
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  25905529 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 25905628  T
Q  146 aggagga-gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
     ||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  25905629 gggacgatgtttgggtatgagttcggggt-ggtacctatgtacccgttacccgtcccatacctgtgttttgagattggg 25905706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 316
Target Start/End: Original strand, 24753088 - 24753342
Alignment:
Q  59 ctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttg 157  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||||    
T  24753088 ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttg 24753187  T
Q  158 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaat 250  Q
    ||||           ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||       ||||| | ||||||| | ||||||     
T  24753188 ggta-----------tgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaaacccatacccatatccaaacccagtcaaaac 24753276  T
Q  251 gaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  24753277 ggagaaaatccgtcaaattgaatttggttcggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 24753342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Original strand, 38152836 - 38152961
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  38152836 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatagccgtta 38152935  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
     |||| |||||||| | |||||||||    
T  38152936 tccgttccatacccatgttttgaaat 38152961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 44794259 - 44794051
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  44794259 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaa 44794160  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||    
T  44794159 aataacataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct-tatactcgttacccgtctcatac 44794061  T
Q  206 ccgtattttg 215  Q
    |||| |||||    
T  44794060 ccgtgttttg 44794051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 41103605 - 41103792
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||  ||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||    
T  41103605 attatcaaacaaaataacaagagatatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta 41103704  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||| | |||||| |   |||| ||||||||| | ||||||||    
T  41103705 accgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccacacccagtcaaaacgggaaaaatccgtcaaatcggatttggtt 41103792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45709094 - 45708887
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  45709094 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaa 45708995  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||| ||  ||||| |||||||| || |||   |||||  ||| | |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  45708994 aataatataacatatcaacataaagtatttt---acattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccaatac 45708898  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||| ||||||    
T  45708897 ccgtgttttga 45708887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 37579130 - 37579313
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||   |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  37579130 aatatgctcactttaacatttgttagatggattgatttagttgctcatttaaatatcaatgataatttttataacatgacaattatcaaacaaaataaca 37579229  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttaccc 196  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||  ||||   ||    ||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  37579230 tggcatagcaacataaagtaattttctgcatttgagacagctttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccgttaccc 37579313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44734583 - 44734376
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataac 111  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||  | ||||||| ||  ||||| |||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||    
T  44734583 aatatgctcgctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgatccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaataac 44734484  T
Q  112 atggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtat 211  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  | || ||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||| |    
T  44734483 atgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccattaccggtcccatacccgtgt 44734384  T
Q  212 tttgaaat 219  Q
    ||||||||    
T  44734383 tttgaaat 44734376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38140025 - 38139807
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  38140025 tccaacaatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 38139926  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaa-ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata 204  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||  |||||   || | |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||    
T  38139925 aataacatgacatatcaatataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatatactcattacccgtcccata 38139826  T
Q  205 cccgtattttgaaattggg 223  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  38139825 ctcgtgttttgaaattggg 38139807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 176
Target Start/End: Original strand, 23328500 - 23328641
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacat-aaattaat 134  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||| ||| ||||    
T  23328500 tagaccgattgatttagttattcctttaaatatcaatgataatttttatagcacgacaattatcaaacaaaataacaagacatgtcaacataaaaataat 23328599  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtggg 176  Q
    ||||  ||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  23328600 tttctccattcgggacgggtttgggtataggatcggggtggg 23328641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39456157 - 39456034
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||  ||| | || || ||||||  ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  39456157 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttta-catttgggacgggtatgagtatggt-tcggggtgggtacctatatacccgtta 39456060  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  39456059 cccgtcccatacccatgttttgaaat 39456034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 219
Target Start/End: Original strand, 10072429 - 10072540
Alignment:
Q  108 taacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  | |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  10072429 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggttatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgttccataccc 10072528  T
Q  208 gtattttgaaat 219  Q
    || |||||||||    
T  10072529 gtgttttgaaat 10072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 44658631 - 44658501
Alignment:
Q  57 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 155  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||  | | | |||    
T  44658631 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaatatttttttacatttggtacgggtt 44658532  T
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 186  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  44658531 tgggtatgggttcgggataggtacctatata 44658501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25980061 - 25979936
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||  |||||  | | |  |||||||||| | | ||||||||||| | |||||| ||||    
T  25980061 attatcaaacaaaataacatgacatttcaacataaaataattttttacatttggaaaggatttgggtatgagtttggggtgggtacatatatatccgtta 25979962  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||| |||||| || |||||||||    
T  25979961 cccgtctcatacctgtgttttgaaat 25979936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26004752 - 26004675
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat 84  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  26004752 tccaacaatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgctcctttaaatatcaatggtagtttttat 26004675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Original strand, 43507402 - 43507519
Alignment:
Q  102 acaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtccc 201  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |||| | |||||||| || |||||||| ||| |||| | |||||||||| |    
T  43507402 acaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtataggtatgggttcagggtgggtgcctatatacccgttacccgtctc 43507501  T
Q  202 atacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||| | |||||||||    
T  43507502 atacccatgttttgaaat 43507519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 316
Target Start/End: Original strand, 16811644 - 16811895
Alignment:
Q  60 tttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgg 158  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |  |||||    
T  16811644 tttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggctttgg 16811743  T
Q  159 gtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaa 258  Q
    ||||||| || ||||||||| || |||| |  ||| ||||| ||||||||| |||||| || ||| |    ||| ||||||  | |||||||| ||||||    
T  16811744 gtatgggttc-gggtgggtatctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttgagatcgggga----aaatccaaactcagtcaaaatggagaaaa 16811838  T
Q  259 cccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    || |||||||||| || |||| || |||||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  16811839 cctgtcaaattgagttaggttcgggcgagtaaccacgagtat-ggttttgttgccatg 16811895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37196230 - 37196058
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || |||| |||| |||||| |||||||| || | |||  |||||||||||    
T  37196230 tccaataatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaa 37196131  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggta 178  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||| | || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37196130 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttatgacgggtttgggtatggattcggggtgggta 37196058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Original strand, 39316906 - 39317069
Alignment:
Q  57 tcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 155  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||   || |  |     
T  39316906 tccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgagacggata 39317005  T
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||| | || || ||| ||| | |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39317006 tgggtatgagttcaggatggatacatatatacccgctacccgtcccatacccgtgttttgaaat 39317069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 32546200 - 32546273
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  32546200 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgttccgtacccgtattttgaaatcgggaaa 32546273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41741681 - 41741469
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||| ||  ||| |||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  41741681 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgatccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 41741582  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||  |||||  ||| | || ||  |||||| || ||||||||||||  ||| | |||| ||||| |||||    
T  41741581 aataacatgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatgggttc-gggtgggtacctacatacccgttatccgtctcatac 41741483  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||    
T  41741482 ccgtgttttgaaat 41741469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5916280 - 5916171
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    ||||||| |    
T  5916280 tttaacatttgttagaccgattgattgatttactcctttaaatatcaatggtagttttgataacacagcaattatcaaacaaaataa----gcatattga 5916185  T
Q  124 cataaattaatttt 137  Q
    |||||| |||||||    
T  5916184 cataaaataatttt 5916171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44986130 - 44986007
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  44986130 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 44986031  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaat 130  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||    
T  44986030 aataacat-acatatcaacataaat 44986007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Original strand, 18683982 - 18684048
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18683982 gtttgggtatgggttcgaggtggatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaat 18684048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Original strand, 3157091 - 3157157
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3157091 gtttgggtataggttcggtgtgggtacctatatccccgttatccgtcccatacccatattttgaaat 3157157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 236
Target Start/End: Original strand, 22973396 - 22973481
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat--tgggaaacccaaaccca 236  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||   |||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22973396 gtttgggtatgggttcgaggtgggtacagatatccccattacccgtcccgtacccgtattttgaaatcgtggaaaacccaaaccca 22973481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23475361 - 23475226
Alignment:
Q  140 acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaac 239  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| |||  |||||||| | |||  |  |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    |||||||||    
T  23475361 acattcgggacgggtttgggtatgggttcgaagtgggtacatatatccccattacccatcccaaacccgtgttttgaaatcgggaaa----aacccaaac 23475266  T
Q  240 ctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    | | |||||  |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  23475265 ccagtcaaagcggggaaaacccgtcaaattgagtttggtt 23475226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 4101522 - 4101634
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat--tgg 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || || ||||||| | |||  |||| |||| |||  |||| || |||||||||  |||    
T  4101522 ataaattgattttcaacattcaggacgggttagggtatgggttcaggatgggtacatatatccctgtaacccatcctgtacctgtgttttgaaatcatgg 4101621  T
Q  223 gaaacccaaaccc 235  Q
     ||||||||||||    
T  4101622 aaaacccaaaccc 4101634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 44658471 - 44658418
Alignment:
Q  226 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44658471 acccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaattggatttggtt 44658418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10995916 - 10995837
Alignment:
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | ||   |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||||    
T  10995916 tgggtatgggttcggggtgggtatatataaccctgttacccgtcccatacccgtgtcttgaaatcggggaaaacccaaac 10995837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 31426016 - 31426099
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacc 234  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||| | |||  | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  31426016 gtttgggtatgcgttcggggtggatacatatatccccgttacccgtctcatacccgtatttttaaatcggggaaaacccaaacc 31426099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24603081 - 24602856
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  24603081 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgtcaattatcaaacaaaataaca 24602982  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||  || | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||| | ||    
T  24602981 tggcacatcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcacatacccatgtt 24602882  T
Q  213 ttgaaat-tggg-aaacccaaaccca 236  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||    
T  24602881 ttgaaatctgggaaaacccaaaccca 24602856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 27738666 - 27738867
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  27738666 tgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttacat 27738765  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacct 241  Q
    |  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||    
T  27738766 ttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatacccatacct 27738865  T
Q  242 aa 243  Q
    ||    
T  27738866 aa 27738867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 271
Target Start/End: Original strand, 14505943 - 14506203
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14505943 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 14506042  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    ||||| || ||||| |||| ||| || |||||  ||||  ||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  14506043 ataacgtgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtacctaaatacttgttacccgtcccatacc 14506142  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattga 271  Q
     || ||||||||| ||| |    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14506143 tgtgttttgaaatcgggga----aaacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattga 14506203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 11762308 - 11762521
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    ||||||||  ||||||||| || |||| | | | |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  11762308 aatatgcttattttaacaaatgttagatccaataatttagttgctcctataaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatataacaaaataaca 11762407  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | ||||||||||| | |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||| | ||    
T  11762408 tggcatatcaacataaagtaattttctacatttgggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatatacccgttacccgtcccatacccttgtt 11762507  T
Q  213 ttgaaattgggaaa 226  Q
    | ||||| ||||||    
T  11762508 tagaaatcgggaaa 11762521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Original strand, 12141270 - 12141559
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  12141270 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataacgtatcaacataaaataat 12141369  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaaccca-- 230  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||      
T  12141370 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtcacccgtcccatatccgtgttttgagattggggaaaacccata 12141469  T
Q  231 ----aacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
         ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| | | |||| ||||||||| |||||    
T  12141470 cccgtacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccataggtatgggttttgttgccatg 12141559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12678296 - 12678113
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  12678296 tagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgataatttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaatataaaataatt 12678197  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||   |||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| || | |||||||    
T  12678196 ttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtgtcttgaaat 12678113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 2367182 - 2367392
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  2367182 tccaacaataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagtttatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 2367281  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2367282 aataacataacatatccacataaagtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatac 2367381  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||| ||||||    
T  2367382 ccgtgttttga 2367392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 32853700 - 32854018
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||    
T  32853700 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaa 32853799  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  32853800 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatac 32853899  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--aaacccaaac------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||| |||||| || |||  ||||||| ||      ||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||  |    
T  32853900 ccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccataaccaaacccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgggtttggttcggtcggataaccacggg 32853999  T
Q  298 tataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  32854000 tatgggttttgttgccatg 32854018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7394118 - 7393822
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| |||   |||||||||||||    
T  7394118 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatgttagtttttataacacggtaattatcaaacaaa 7394019  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||| |||  |||  |||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |  ||| ||||| | |||     
T  7394018 ataatatgatataccaacataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccattatccgtctcttact 7393919  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttt 306  Q
    ||| ||||||||| ||| |    ||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||| |||||    
T  7393918 cgtgttttgaaatcgggga----aaatccaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattggatttgattcggacgtgtaaccaaatgtatgggttt 7393823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 14032413 - 14032579
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| || || |||||||||||||    
T  14032413 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaacaaa 14032512  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggt 173  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||   ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  14032513 ataacatgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10142721 - 10142427
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  10142721 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 10142622  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 226  Q
    |||  |||||  |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  10142621 tttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgttttttgagatcggggaaaacccata 10142522  T
Q  227 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 321  Q
    |||| ||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||  |||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  10142521 cccatacccaaacccagtcaaaacgaggaaaacccgccaaattgagtttggttcgagcggataaccacaagtatgggttttgttgccatgcctac 10142427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 291
Target Start/End: Original strand, 24225594 - 24225853
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  24225594 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 24225693  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------------aaacccaa 231  Q
     ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||| || |||              | ||||||    
T  24225694 gggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatatccgtgttttgagatcggggaaaatccatacccatacccaa 24225793  T
Q  232 acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
    ||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24225794 acccaaacccaatcaaaacggggaaaacctgtcaaattgaatttggttcggacgggtaac 24225853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 316
Target Start/End: Original strand, 27534592 - 27534858
Alignment:
Q  59 ctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttg 157  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||  ||| | |||||    
T  27534592 ctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttg 27534691  T
Q  158 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaa 249  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||        | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  27534692 ggtatggattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaactcatacccatacccaaacccaatcaaaa 27534791  T
Q  250 tgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
     |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  27534792 cggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcggacggttaaccacgggtatgggttttgttgccatg 27534858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5863586 - 5863402
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |    
T  5863586 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaatatt 5863487  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5863486 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 5863402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Original strand, 12309506 - 12309641
Alignment:
Q  84 taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgt 183  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||| | |    
T  12309506 taatatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatat 12309605  T
Q  184 atatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12309606 atacctgttacccgttccatacccgtgttttgaaat 12309641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14411058 - 14410959
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14411058 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaatgatggtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 14410959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 270
Target Start/End: Original strand, 32053032 - 32053210
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||  ||| | ||||||||||||| | ||||||||||| | |||| | ||||    
T  32053032 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacatatatacccgtta 32053131  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattg 270  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||  ||||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  32053132 cccgtcccatatccatgttttgaaatcggggaaaacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattg 32053210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3484115 - 3483952
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||  |||||     
T  3484115 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaataacataacatatccacataaagtagttttttacattt 3484016  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  3484015 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccatcccatacccgt 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 10188305 - 10187994
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||| |||||    
T  10188305 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaa 10188206  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||       ||||||||||||||    
T  10188205 aataacataatatatcaacataaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctata-------tacccgtcccatac 10188113  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||| |||||| || |||        | ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |    
T  10188112 ccgtgttttgagatcggggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggg 10188013  T
Q  298 tataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  10188012 tatgggttttgttgccatg 10187994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 30816131 - 30816319
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  30816131 tttaacatttgttagaccgattgatttaggtgctcctttaaatgtcaatggtagtttttataacacggcaattatccaacaaaataacatcacatatcaa 30816230  T
Q  124 cataaatta---attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
    |||||| ||    ||||   ||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  30816231 cataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgggttcctatatacccattacccatcccatacccgt 30816319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14410950 - 14410807
Alignment:
Q  143 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat-tgggaaacccaaacccaaacct 241  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     |||| |||||||    
T  14410950 ttcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatctggga-----aaactcaaacct 14410856  T
Q  242 aatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
    | |||||| |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  14410855 agtcaaaacg-ggaaaatccgtcaaattagatttggtttggacgggtaac 14410807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Original strand, 13769047 - 13769167
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg- 223  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||| | |||     
T  13769047 ataaattgattttctacattcaggacgggtttggatatgggttctgggtgggtacctatatgtccgttacccgtcccatacccatgttttgaagtcgggg 13769146  T
Q  224 -aaacccaaacccaaacctaa 243  Q
     ||||| ||||||| ||||||    
T  13769147 aaaaccgaaacccatacctaa 13769167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 219
Target Start/End: Original strand, 32532498 - 32532609
Alignment:
Q  108 taacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccataccc 207  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  32532498 taacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccataccc 32532597  T
Q  208 gtattttgaaat 219  Q
    || |||||||||    
T  32532598 gtgttttgaaat 32532609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 114
Target Start/End: Original strand, 14245133 - 14245211
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatg 114  Q
    |||||| | |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14245133 tagaccgaatgatttagtcgctcctttaaatattaatggtagtttttataacacgacaattttcaaacaaaataacatg 14245211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 209
Target Start/End: Original strand, 14254864 - 14255017
Alignment:
Q  56 ctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtt 155  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  | | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |   ||||  ||| || ||    
T  14254864 ctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacatcaaatttcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagttattatttgcatttgggacgaatt 14254963  T
Q  156 tgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14254964 tgggtatgggttcatggtgggtacctatatttccgttacacgtcccatacccgt 14255017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 279
Target Start/End: Original strand, 9442441 - 9442566
Alignment:
Q  161 atgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa--cccaaacccaaacctaa-----tcaaaatgaa 253  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| ||     |||||| |      
T  9442441 atgggttcggagtgggtacctctatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaatcccatacccatacccaaaccagtcaaaacggg 9442540  T
Q  254 gaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  9442541 gaaaacccgtcaaattgagtttggtt 9442566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28079780 - 28079696
Alignment:
Q  154 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||||| ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  28079780 tttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtcccgtacccatgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 28079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29199972 - 29199884
Alignment:
Q  151 gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaa 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  29199972 gagtttgggtatgggttcggggtagatacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggggaaaatccaaacccaa 29199884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 316
Target Start/End: Original strand, 31496518 - 31496608
Alignment:
Q  226 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  31496518 acccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 31496608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 316
Target Start/End: Original strand, 31501904 - 31501994
Alignment:
Q  226 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  31501904 acccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgagtttggtttggacgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 31501994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 256604 - 256511
Alignment:
Q  126 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |  ||||||||| | ||||| | |||||||||    
T  256604 taaattgattttctacatttaggaggggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatgcccattacccgtctcgtacccatgttttgaaat 256511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 20349068 - 20349133
Alignment:
Q  154 tttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20349068 tttgggtatgagttcggggtgggtacctatatccccgttactcgtcccatacccgtgttttgaaat 20349133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Original strand, 18908896 - 18908978
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18908896 gtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccttgttacccgtcccatatccgtattttgaaatcggggaaaacccaaac 18908978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 19366990 - 19367082
Alignment:
Q  131 taattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| | | |||||| | || |||   ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  19366990 taattttctacattcaagaagggtttgggtatgggtttgaggtgggcaactatattcatgttacccgtctcatacccgtgttttaaaattggg 19367082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20611030 - 20610975
Alignment:
Q  190 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||    
T  20611030 gttacccgtcccctacccgtattttgaaatcggggaaaccccaaacccatacctaa 20610975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Original strand, 33267 - 33481
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  33267 tttaacaattgttagaccgattgatttagttgttcctttaaatatcaatcgtagtttttataacacaacaattaccaaacaaaataacatggcatgtcaa 33366  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||||| || |||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33367 cataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggg 33466  T
Q  224 --aaacccaaaccca 236  Q
      |||||||||||||    
T  33467 gaaaacccaaaccca 33481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6028104 - 6027852
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttt-ataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6028104 tttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatggcttatca 6028005  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 222  Q
    ||||||| || |||||  ||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||    
T  6028004 acataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccatgttttaaaatcgg 6027905  T
Q  223 gaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    | |    ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||  |||||||    
T  6027904 gga----aaacccaaacccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggtt 6027852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24414324 - 24414046
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  24414324 atttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 24414225  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg--------gaaacccaaacccaa 237  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||        || ||||| ||||||    
T  24414224 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaaccgatacccatacccaa 24414125  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  24414124 acccaatcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacaggtatgggttttgttgccatg 24414046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 316
Target Start/End: Original strand, 37999369 - 37999652
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  37999369 tagacaaaatgatttagttgattctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 37999468  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 232  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||| | ||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  37999469 tttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 37999568  T
Q  233 cccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    |||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||   ||| ||||||||| |||||    
T  37999569 cccatacccagtcaaaatgggggaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgactaaccacggatatgggttttgttgccatg 37999652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31942417 - 31942210
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31942417 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgactgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 31942318  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||||||||| | |||||| || |||||  ||||   ||   |||||| |||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  31942317 ataacatggcatatcagcataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatatacctgttacccgtctcatacc 31942218  T
Q  207 cgtatttt 214  Q
    ||| ||||    
T  31942217 cgtgtttt 31942210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8916129 - 8915959
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  8916129 atttagttaatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacattt 8916030  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttga 216  Q
     ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8916029 gggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttga 8915959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13705555 - 13705380
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  13705555 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaatttttcacat 13705456  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  13705455 ttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtctcatacccgtgttttgaaat 13705380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10208624 - 10208445
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  10208624 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatattaacataaagtaattttttacat 10208525  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |  |||   ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  10208524 ttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatccattacccgtcccatacccgtgttttaagattggg 10208445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 291
Target Start/End: Original strand, 45115444 - 45115710
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||| ||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  45115444 tagacaaaatgatttaattgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataatgtaat 45115543  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattg-ggaa-------- 225  Q
    |||  |||||  ||| | ||||   |||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||            
T  45115544 tttttacatttgggatgggtttaactatgggttcgggatgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccgtgttttgaaatcgaggaaaactcata 45115643  T
Q  226 -acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaac 291  Q
     ||||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  45115644 tacccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattggatttggttcggacaagtaac 45115710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7314880 - 7314667
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||   |||||||||||    
T  7314880 tccaacaatatgcccactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaa 7314781  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7314780 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatac 7314681  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
     |||||||| ||||    
T  7314680 tcgtattttaaaat 7314667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Original strand, 14540649 - 14540851
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||     || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14540649 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgctcctttaaatatc----gtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataaca 14540744  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||| |  |||| ||||||  || | |||||| ||| |||| | |||||| ||| ||||||||| ||    
T  14540745 tgacatatcaacataaagtaattttctacgttcgggacggatttgagtatggattccgagtgggtgcctatatacccgttacctgtctcatacccgtgtt 14540844  T
Q  213 ttgaaat 219  Q
    |||||||    
T  14540845 ttgaaat 14540851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 310
Target Start/End: Original strand, 13830593 - 13830904
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttata-atacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||| ||||||||||||    
T  13830593 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaa 13830692  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  |||   ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||    
T  13830693 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta-ccgtcccatac 13830791  T
Q  206 ccgtattttgaaattg-ggaa-------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||| |||||| || | ||||       ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |    
T  13830792 ccgtgttttgagatcgaggaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacggg 13830891  T
Q  298 tataggttttgtt 310  Q
    ||| |||||||||    
T  13830892 tatgggttttgtt 13830904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Original strand, 30846842 - 30847121
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   ||| |    
T  30846842 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacaat 30846941  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaaccca 236  Q
      ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| || || |||        | ||||| |||||    
T  30846942 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccataccca 30847041  T
Q  237 aacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    |||| | |||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  30847042 aacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgggtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 30847121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36128299 - 36128020
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaatta-attttcaacatt 144  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||  |||||    
T  36128299 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatt 36128200  T
Q  145 caggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaaccca 236  Q
      ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| || || |||        | ||||| |||||    
T  36128199 tgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacccgttacccatcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaccacatacccataccca 36128100  T
Q  237 aacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    |||| | |||||| |  ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||    
T  36128099 aacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattaggtttggttcggacgagtaaccacgggtatgggttttgttgccatg 36128020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 37106556 - 37106762
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  37106556 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37106655  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |||||||  |||||  |||       ||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  37106656 aataacat-atatatcaacataaagtaattttttacatttggga------cgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtcccatac 37106748  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||    
T  37106749 ccgtgttttgaaat 37106762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42798221 - 42798011
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  42798221 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42798122  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaa-ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata 204  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||  |||||  |||   ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||| ||||    
T  42798121 aataacataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcata 42798022  T
Q  205 cccgtattttg 215  Q
    ||||| |||||    
T  42798021 cccgtgttttg 42798011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 321
Target Start/End: Original strand, 9632283 - 9632566
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  9632283 atttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaataacataacatatcaacataaagtagttttttacattt 9632382  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacc------caa 237  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||| || || |||  ||||||| |||      |||    
T  9632383 gggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgtttcgagatcggggaaaacccatacccatactcaa 9632482  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 321  Q
    ||| | |||||| |   ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9632483 acccattcaaaacgggaaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaaccacgggtatgggttttgttgccatgcctac 9632566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12194059 - 12193839
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | |||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  12194059 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatgtagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 12193960  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || ||| |||||  ||| |||||||| || |||| |  |||||||||||||||    
T  12193959 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatatacccattacccgtcccatac 12193860  T
Q  206 ccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||| || |||||| ||||||    
T  12193859 ccgtgttctgaaatcgggaaa 12193839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19105066 - 19104751
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||  || || |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  19105066 aatatgctcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctcttttaaatatcgatagtagtttttataacacggcaattattaaacaaaataaca 19104967  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccata----cccg 208  Q
    || ||  | |||||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||||  ||| ||||| ||||| |||| | ||||| | |||||||    ||||    
T  19104966 tgacacgtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatatacccgttacacatcccatacaggcccg 19104867  T
Q  209 tattttgaaattggg--aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtat 300  Q
    | ||| ||||| |||  ||||||||      ||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||  |||| || |||   ||||| ||||||||    
T  19104866 tgtttggaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaacccaatcaaaacggaaaaaacccatcaaattgggtttgattcggattggtaaccacatgtat 19104767  T
Q  301 aggttttgttaccatg 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  19104766 aggttttgttgccatg 19104751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 45256697 - 45256893
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| ||||||  ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  45256697 tttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagacatatca 45256796  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    | ||||| |||||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||| | |||| |  ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  45256797 aaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattaaccgtctcatacccgtgttttgaaat 45256893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 188
Target Start/End: Original strand, 10920531 - 10920684
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  10920531 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtaat 10920630  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatc 188  Q
    |||  |||||  ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  10920631 tttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatatatc 10920684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16226929 - 16226851
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatg 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16226929 tagaccaattgatttagttgctaatttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatg 16226851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Original strand, 3547170 - 3547290
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg--gaaacccaaacccaaacctaatcaaaat 250  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||| |||  |||||| |    
T  3547170 gtttggatatgggttcggggtgggtacatatatctccgttacccgtcccgtacccgtattttgaaatcggtaaaaacccaaatccatacccgatcaaatt 3547269  T
Q  251 gaagaaaacccgtcaaattga 271  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  3547270 gaggaaaatccgtcaaattga 3547290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35248489 - 35248386
Alignment:
Q  134 ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat--tgggaaacccaa 231  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||    
T  35248489 ttttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctttatcccctttacccgtcccatacccgtgttttgtaatcgtggaaaacccaa 35248390  T
Q  232 accc 235  Q
    ||||    
T  35248389 accc 35248386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 268
Target Start/End: Original strand, 14331531 - 14331648
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaatcaaaat 250  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | |||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||      
T  14331531 gtttgggtatgggttcggagtgggtacatatatccccgttacccgtcccatacctgtatttttaaataggggaaaacccatacccaaacctagtcaaacc 14331630  T
Q  251 gaagaaaacccgtcaaat 268  Q
    |  |||||||||||||||    
T  14331631 ggggaaaacccgtcaaat 14331648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37472961 - 37472854
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  37472961 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 37472862  T
Q  106 aataacat 113  Q
    ||||||||    
T  37472861 aataacat 37472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4961564 - 4961480
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgt 209  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4961564 ataaattcattttctatattcgggacgagtttgggtatgggttcgaggtgtgtacctatatccctgttacacgtcccatacccgt 4961480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37472840 - 37472673
Alignment:
Q  157 gggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaaacctaatcaaa 248  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||        | || || ||||||||| | |||||    
T  37472840 gggtatgggttcgaagtgggtacctaaatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaatccatactcatacccaaacccagtcaaa 37472741  T
Q  249 atgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||  |  |||| |||||||||||||||    
T  37472740 acggggaaaacccgtcaaattgagtttggttcgggcgggtaactgcgggtatgggttttgttaccatg 37472673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 214
Target Start/End: Original strand, 25210355 - 25210442
Alignment:
Q  127 aaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatttt 214  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||| | |||    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25210355 aaattgattttctacattcgggaggggttttggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccatacccgtgtttt 25210442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 236
Target Start/End: Original strand, 15546784 - 15546833
Alignment:
Q  189 tgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||    
T  15546784 tgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccaaaccca 15546833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24051705 - 24051643
Alignment:
Q  157 gggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24051705 gggtatgggttcggggtaggtacatatatccctgttacccgtcccatactcgtattttaaaat 24051643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38342604 - 38342538
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  | |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  38342604 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccgttacccgtcccgtatccgtattttaaaat 38342538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6164553 - 6164473
Alignment:
Q  158 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    |||||| | ||||||||||||| | |||  | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6164553 ggtatgagttcggggtgggtacatatatcaccgttacccgtcccgtacccaaattttgaaattggggaaaacccaaaccca 6164473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 185
Target Start/End: Original strand, 35965311 - 35965371
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtat 185  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  35965311 ataaattgattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcggagtgggtacatgtat 35965371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16433386 - 16433088
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  16433386 aatatgctcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataat---acaattatcaaacaaaataaca 16433290  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||  ||||  ||  | ||||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16433289 tgacatatcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtgtt 16433193  T
Q  213 ttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttac 312  Q
    ||||||| ||  |    |||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||| ||   |||||||||| || |    
T  16433192 ttgaaatcggaga----aaactcaaacccaatcaaaatggggaaaatccgtcaaattgagtttggttcggatgggtaaccacggatataggttttattgc 16433097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34673507 - 34673282
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  34673507 aatacgctcattttaacatttgttagaccggttgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataaca 34673408  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    |||||||| |||||||| || |||||  | ||| | |   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||||||| ||    
T  34673407 tggcatatcaacataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttaccagtctcatacccgtgtt 34673308  T
Q  213 ttgaaattggg--aaacccaaaccca 236  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  34673307 ttgaaattgggaaaaacccaaaccca 34673282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29871510 - 29871237
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    ||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |   |||||||||||||||||||    
T  29871510 aatatgctcattttaatatttgttagaccgattgatgtagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgggaattatcaaacaaaataaca 29871411  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | || |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| | ||    
T  29871410 tgacatatcaacataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatataccagttacctgtcccatacccatgtt 29871311  T
Q  213 ttgaaattg--ggaaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggt 278  Q
    ||||||| |  | ||||||||      |||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  29871310 ttgaaatcggagaaaacccaaactcatacccaaacttagtcaaaacgaggaaaacccgtcaaattgagtttggt 29871237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9983115 - 9982905
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  9983115 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgctcctttgaatatcaatggtagttttgataacatgagaattatcaaacaaaataaca 9983016  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||| ||    
T  9983015 tgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccatcccattcccgtgtt 9982916  T
Q  213 ttgaaattggg 223  Q
    |||||||||||    
T  9982915 ttgaaattggg 9982905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 5180902 - 5181214
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||| | ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  5180902 tccaacaatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 5181001  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  | |       ||||||||| | ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  5181002 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttggaa------cgggtatgggtttggggtgggtgcctatatacccgttacccgtcccatac 5181095  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--aaacccaaacccaaacctaa------tcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatg 297  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |  |    
T  5181096 ccgtattttgaaatcggggaaaacccatacccatacctaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattgaatttggttcgggcgggtaaccgcggg 5181195  T
Q  298 tataggttttgttaccatg 316  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  5181196 tatgggttttgttgccatg 5181214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44615707 - 44615494
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44615707 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 44615608  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  ||||    |||  ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44615607 ataacatggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatac 44615508  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||| ||||    
T  44615507 ccgtgtttttaaat 44615494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Original strand, 44792862 - 44793075
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44792862 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttctcctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaa 44792961  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaatta-attttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  ||||    |||  ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  44792962 ataacatggcatatcaagataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatac 44793061  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||| ||||    
T  44793062 ccgtgtttttaaat 44793075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Original strand, 29936273 - 29936483
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||| ||| ||    
T  29936273 tccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaa 29936372  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  29936373 aataacattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatac 29936472  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    |||||||||||    
T  29936473 ccgtattttga 29936483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 17134821 - 17135017
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatta 122  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17134821 tttaacatttgttagacgaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatca 17134920  T
Q  123 acataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||| |||||||  ||||   ||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17134921 acataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttgaaat 17135017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 35937042 - 35936775
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||   |||||||||||||||||||    
T  35937042 aatatgctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttgtaacacggaaattatcaaacaaaataaca 35936943  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | ||||            ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||  |    
T  35936942 tgacatatcaacataaagtaattttctacattcatgacgggttt------------ggggtgggtacctatatacccgttatccgtcccatactcgtgat 35936855  T
Q  213 ttgaaattggg--aaacccaa------acccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggac 284  Q
    ||||||| |||  ||||||||      ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  35936854 ttgaaatcggggaaaacccaaactcatacccaaaccaagtcaaaatgagaaaaacccgtcagattgaatttggttcggac 35936775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Original strand, 12494868 - 12495087
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  12494868 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgataaatttagttgctcctttaaatatcagtggtagtttttataacacgccaattataaaacaaa 12494967  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||| ||| | |||||| | || ||||| |||||  ||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |    
T  12494968 ataacatgtcatgtcaacatatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatatacccgttacacgtcccatatc 12495067  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  12495068 cgtgttttgaaatcgggaaa 12495087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42439902 - 42439692
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  42439902 tccaacaataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42439803  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  42439802 aataacataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatac 42439703  T
Q  206 ccgtattttga 216  Q
    || | ||||||    
T  42439702 ccatgttttga 42439692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19572656 - 19572426
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  19572656 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 19572557  T
Q  194 cccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa--------acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacg 285  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||||        ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||| || ||    
T  19572556 cctgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccatacccatacccaaacccagtcaaaatggggaaaacccgtcaaattaggtttggttcgggcg 19572457  T
Q  286 agtaacaacatgtataggttttgttaccatg 316  Q
     ||||| ||| |||| ||||||||| |||||    
T  19572456 ggtaaccacaagtatgggttttgttgccatg 19572426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36187423 - 36187129
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||     
T  36187423 tagacaaaatgatttagttgatcatttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataac 36187324  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaa 226  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| || |||        | |    
T  36187323 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 36187224  T
Q  227 cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttaggacgagtaacaacatgtataggttttgttaccatgactac 321  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||| ||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  36187223 cccatacccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgccaaattgagtttggttcgggcgggtaacgacgggtatgggttttgttgccatgcctac 36187129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49741238 - 49740977
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaa 106  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  49741238 tccaacaatatgttcactttaacatttgttaaaccgatttatttagttgctcctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaa 49741139  T
Q  107 ataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||       ||||||||||||| |    
T  49741138 ataacataacatattaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctata-------tacccgtcccatatc 49741046  T
Q  207 cgtattttgaaattgggaaacccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    | | ||||||||||||| |    ||||| ||||| | |||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  49741045 catgttttgaaattgggga----aaacctaaacccagtcaaaaaggggaaaatccgtcaaattgagtttggtt 49740977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44632350 - 44632160
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  44632350 tttaacatttgttagacctattgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattgtcaaacaaaataatatggcatatcaa 44632251  T
Q  124 cataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |      |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||  ||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44632250 c-----gtaattttcgacatttaggacgagtttggatatggattcacggtggatacccatacacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaat 44632160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18354312 - 18354099
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  18354312 tccaacaatatgttcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 18354213  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| |||| ||||||| || |||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||    
T  18354212 aataacatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatatacccgttacccgtcccatac 18354113  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    || | |||||||||    
T  18354112 ccatgttttgaaat 18354099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24236964 - 24236754
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  24236964 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataat 24236865  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaa 232  Q
    |||  |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| || |||  ||||||| |    
T  24236864 tttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttccccgttccatacccgtgttttgagatcggggaaaacccata 24236765  T
Q  233 cccaaacctaa 243  Q
    |||| ||||||    
T  24236764 cccatacctaa 24236754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Original strand, 51421744 - 51421935
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaat 134  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||| || | | | ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | ||||    
T  51421744 tagacaaaatgatttagttgatcctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacatagagtaat 51421843  T
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||  |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  51421844 tttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacatgttacccgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaa 51421935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 28297788 - 28297994
Alignment:
Q  5 tgtccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaac 103  Q
    ||||||| |||| ||||  ||| ||| ||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||    
T  28297788 tgtccaacaataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaac 28297887  T
Q  104 aaaataacatggcatattaacataaattaattttca-acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtccca 202  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| || ||||   |||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  28297888 aaaataacataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccca 28297987  T
Q  203 tacccgt 209  Q
    |||||||    
T  28297988 tacccgt 28297994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 16408841 - 16409016
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||    |||||| |||||||  ||||    
T  16408841 tgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacata----cataaagtaattttttacat 16408936  T
Q  144 tcaggag-gagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |  |||| | |||| | |||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408937 tt-ggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattggg 16409016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49250965 - 49250724
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||| || | ||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || ||||  |||||     
T  49250965 atttagttgatcttttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaatagcataacatatcaacataaagtagttttttacattt 49250866  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--------aaacccaaacccaa 237  Q
     ||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||| |||||| || |||        | ||||| ||||||    
T  49250865 gggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgtgttttgagatcggggaaaactcatacccatacccaa 49250766  T
Q  238 acctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    ||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49250765 acccagtcaaaacggagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 49250724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40087695 - 40087484
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  40087695 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 40087596  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || || ||||| | ||||||||||||||| |||  | ||||| | ||||||||    
T  40087595 aataacatgatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatgagttcggggtgggtacctatattcccgttactcatcccatac 40087496  T
Q  206 ccgtattttgaa 217  Q
    | || |||||||    
T  40087495 ctgtgttttgaa 40087484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45866417 - 45866204
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  45866417 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagacagaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 45866318  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||| | | ||||||||||||| ||||    ||||| ||| |||||    
T  45866317 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatatactcattacctgtctcatac 45866218  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||    
T  45866217 ccgtgttttgaaat 45866204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3628219 - 3628004
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||    
T  3628219 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttgatccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaa 3628120  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaa--ttttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccat 203  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||  |||||  |||   |  || ||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  3628119 aataacatgacatatcaacataaagtaattttttttacatttgggactggaatgagtatgggttcggggtgggtacctacatacccgttacccgtcccat 3628020  T
Q  204 acccgtattttgaaat 219  Q
    |||||| |||||||||    
T  3628019 acccgtgttttgaaat 3628004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23490915 - 23490800
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgtta 193  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||  |||||  ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||    
T  23490915 attatcaaacaaaataacataacatatccacataaattagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 23490816  T
Q  194 cccgtcccatacccgt 209  Q
    ||||||||||||||||    
T  23490815 cccgtcccatacccgt 23490800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17092153 - 17091991
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacat 143  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  17092153 tgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacat 17092054  T
Q  144 tcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacc 206  Q
    |  ||| | || |||| ||||| |||||||| || ||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  17092053 ttgggacgggtatgggcatgggttcggggtgagtgcctatatacccgttacgcgtcccatacc 17091991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50426887 - 50426680
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||  ||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  50426887 tccaacaatatgctcactttaacatttgtaagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 50426788  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||  |||||  |||       ||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||    
T  50426787 aataacatgacatatcaacataaagtaaatttttacatttggga------cgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttatccgtctcatac 50426694  T
Q  206 ccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||    
T  50426693 ccgtgttttgaaat 50426680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42708062 - 42707931
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  |||||||  || |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  42708062 tccaacaatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 42707963  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaatttt 137  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  42707962 aataacatgacatatcaacataaaataatttt 42707931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Original strand, 34610970 - 34611150
Alignment:
Q  47 atttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattc 145  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| || | ||  |||||     
T  34610970 atttagttgatcttttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataacatatcaacataaagtagtattttacattt 34611069  T
Q  146 aggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
     ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||   |||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  34611070 gggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacacgttacatgtcccatacccgtgttttgagatcgggaaa 34611150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 34060251 - 34060121
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| |||||  | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  34060251 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgatcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaa 34060152  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaatttt 137  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  34060151 aataacat-acatatcaacataaagtaatttt 34060121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 13390358 - 13390450
Alignment:
Q  94 attatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtata 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  13390358 attatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatata 13390450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 23966729 - 23966919
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataat-acgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||| ||||   | ||||||||||  | |||||||||| ||| || ||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  23966729 tccaacaatatgctcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgatactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaa 23966828  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttca-acattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacc 195  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||   |||||  ||| | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  23966829 aataacataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacc 23966919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 24710715 - 24710985
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggttttta-taatacgactattatcaaacaa 105  Q
    ||||| |||| |||| |||| ||| ||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  24710715 tccaacaataagctcattttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaa 24710814  T
Q  106 aataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatac 205  Q
    ||||||||    ||| |||||||| |||||||  |||||  ||| | ||||| |||           ||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  24710815 aataacataatgtatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagta-----------tgggtacctatatacccgttacccgtcccatac 24710903  T
Q  206 ccgtattttgaaattggg--aaacccaaac------ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
    |||| |||||| || |||  ||||||| ||      ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24710904 ccgtgttttgagatcggggaaaacccatactcatatccaaacccagtcaaaacggggaaaacccgtcaaattgaatttggtt 24710985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 39219234 - 39219346
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg- 223  Q
    |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||  || || ||||||| |||| |||| |||     
T  39219234 ataaattaattttctacatttagaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatgtatccccgttacttgttccgtacccgtgttttaaaatcgggg 39219333  T
Q  224 -aaacccaaaccc 235  Q
     ||||||||||||    
T  39219334 aaaacccaaaccc 39219346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Original strand, 2514668 - 2514756
Alignment:
Q  50 tagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatatt-aacataaattaatttt 137  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  2514668 tagttactactttaaatatcaatggtagtttttattacacggcaattatcaaacaaaataacatgacatgttcaacataaaataatttt 2514756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48125795 - 48125646
Alignment:
Q  126 taaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaa 225  Q
    |||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    |||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||    
T  48125795 taaattgattttctacattcgcgacgagtttgggtatgggttcggggtggatacctatatcctcgttacccgtcccgtacccgtgttttaaaatcaggaa 48125696  T
Q  226 acccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggtt 279  Q
        ||| ||||||  | |||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  48125695 ----aaatccaaactcagtcaaaacgaagaaaacctgttaaattaaatttggtt 48125646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10450144 - 10450074
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | |||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10450144 gtttgggtatgagttcggggtgggtacatatatccctgttacccgccccgtacccgtattttaaaattggg 10450074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 34085217 - 34085312
Alignment:
Q  131 taattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | ||   | ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  34085217 taattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatactcgtgttttgaaatcgggaaa 34085312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 219
Target Start/End: Original strand, 23058470 - 23058536
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  23058470 gtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatccccgttacccgtctcgtactcgcattttgaaat 23058536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10778615 - 10778579
Alignment:
Q  190 gttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10778615 gttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcgggaaa 10778579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 90483 - 90720
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  90483 tagaccgattgatttatttgctcctttaaatatcaatggttgttttaataacacatcaattattaaacaaaataacatggcatatcaacataaaataatt 90582  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg--aaacccaaac 233  Q
    |||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||  |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||    
T  90583 ttctgcattcaggacgaatttgtgtatgggttcggggagggtaccaatatacccgttaaccgtctcatacccgtgttttgaaatcggggaaaacccatac 90682  T
Q  234 ccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattga 271  Q
    ||||||| | |||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  90683 ccaaacccagtcaaaacggggaaaatccgtcaaattga 90720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 84 - 310
Target Start/End: Original strand, 10232 - 10458
Alignment:
Q  84 taatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgt 183  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||  |||||  ||| | || |||||||||| |||  |||||||||| |    
T  10232 taatatgacaattatcaaacaaaataacata-catatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctat 10330  T
Q  184 atatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa-cccaaacccaaacctaatcaaaatgaagaaaacccgtcaaattgaatttggttagg 282  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10331 atacctgttatccgtcccatacccgtgtttggaaagcgggaaaacccatacccaaacctagtcaaaacggaaaaaacccgtcaaattggatttggttcgg 10430  T
Q  283 acgagtaacaacatgtataggttttgtt 310  Q
    ||  |||||  ||||||| |||||||||    
T  10431 acaggtaaccgcatgtatgggttttgtt 10458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 71; Significance: 8e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 197529 - 197339
Alignment:
Q  36 tagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaattaatt 135  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  197529 tagaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttataacaaggtaattatcaaacaaaataacatggcatatcaacataaagtaatt 197430  T
Q  136 ttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||  ||||| ||| | |||||||||| |  ||||  ||||||||| |||  |||||||  ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  197429 ttctgcattcgggacgggtttgggtatagattcggtttgggtacctatatgcctgttacttgtctcatatccgtgttttgaaatagggaaa 197339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 14638 - 14828
Alignment:
Q  13 aatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataaca 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || || |  ||||||||||||||||| |    
T  14638 aatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgctcctttaaatatcaatggtagtttttacaacacaataattatcaaacaaaataata 14737  T
Q  113 tggcatattaacataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccat 203  Q
    |  ||||| ||||| || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||| |  ||| |||||||||    
T  14738 tatcatatcaacattaaataattttctacatttgggacgagtttgggtatgtgttcaaggtgggtacctatatacccattatccgtcccat 14828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 36029 - 36131
Alignment:
Q  23 ttttaacaattggtagaccaattgatttagtttct--cctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatat 120  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  36029 ttttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatat 36128  T
Q  121 taa 123  Q
    |||    
T  36129 taa 36131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 6280 - 6394
Alignment:
Q  24 tttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaa 123  Q
    ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6280 tttaacatttgttagatcgattgatttagttgctcctttaaatttcaatggtaatttttatagcacgacaactatcaaacaaaataacatggcatatcaa 6379  T
Q  124 cataaattaattttc 138  Q
    |||||| ||| ||||    
T  6380 cataaagtaactttc 6394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 219
Target Start/End: Original strand, 4151 - 4327
Alignment:
Q  45 tgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttat-aatacgactattatcaaacaaaataacatggcatattaacataaatta-attttcaaca 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||    
T  4151 tgatttagttgctcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtattttttttaca 4250  T
Q  143 ttcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||  ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||   ||||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  4251 tttgggacgagtttgggtatgggtttgaagtgggtacaaatatactcgttaccagtctcatacccgtgttttgaaat 4327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 211349 - 211433
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  211349 tttctacattcaggtagagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtctcgtacccgtattttgaaat 211433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4661 - 4596
Alignment:
Q  158 ggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattggg 223  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4661 ggtatgggttcgtggtgggtagctatatccctgttacctgtcccatacccgtattttgaaattggg 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 105554 - 105495
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtatt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  105554 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccctgttacccgtcccgtacccgtatt 105495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 128206 - 128137
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||  |  ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  128206 gtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatccccattacccgtcccgtacccgtattatgaaattgg 128137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 107504 - 107410
Alignment:
Q  125 ataaattaattttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||||||  |||| | ||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  107504 ataaagtaattttcaacattcggaacgagtttgaatatgagttcggggtgggtacttatatctatgctacccgtcccatacctgtgttttgaaat 107410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 14376 - 14297
Alignment:
Q  7 tccaagaatatgctcgttttaacaattggtagaccaattgatttagtttctcctttaaatataaatggtggtttttataa 86  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14376 tccaacaatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttaattgttcctttaaatatcaatggtagtttttataa 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 16970 - 17043
Alignment:
Q  153 gtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaattgggaaa 226  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| | |||  | || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16970 gtttggatatgagttcggggtgggtacatatatccccgtcacccgtcccatacacgtattttgaaatcgggaaa 17043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 67734 - 67818
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| | |||  | |||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  67734 tttctacattcaggtagggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaat 67818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 75577 - 75661
Alignment:
Q  135 tttcaacattcaggaggagtttgggtatgggctcggggtgggtacctgtatatctgttacccgtcccatacccgtattttgaaat 219  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| | |||  | |||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  75577 tttctacattcaggtagggtttgggtataggctcggggtgggtacatatatccccgttatccgtcccgtatccgtattttaaaat 75661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University