View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15245_low_1 (Length: 698)

Name: NF15245_low_1
Description: NF15245
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15245_low_1
NF15245_low_1
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-680)||(4678271-4678949)
chr1 (80-592)||(34466585-34467089)
chr1 (83-631)||(15594859-15595414)
chr1 (545-610)||(52549269-52549334)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (6-680)||(8659139-8659813)
chr7 (11-680)||(1301236-1301909)
chr7 (83-672)||(8654234-8654823)
chr7 (6-645)||(13333174-13333813)
chr7 (80-680)||(10494166-10494766)
chr7 (6-610)||(8667265-8667869)
chr7 (6-646)||(8646687-8647327)
chr7 (6-645)||(8585424-8586063)
chr7 (75-628)||(3147092-3147653)
chr7 (93-637)||(17267758-17268302)
chr7 (93-637)||(17260060-17260604)
chr7 (83-379)||(8628609-8628905)
chr7 (110-630)||(27830697-27831217)
chr7 (83-631)||(6789337-6789885)
chr7 (6-264)||(8671348-8671606)
chr7 (9-429)||(8636064-8636484)
chr7 (75-489)||(29581628-29582042)
chr7 (246-631)||(8545458-8545843)
chr7 (75-489)||(8576293-8576707)
chr7 (75-381)||(8590713-8591019)
chr7 (75-631)||(8570136-8570692)
chr7 (75-393)||(8602037-8602355)
chr7 (89-489)||(8382677-8383077)
chr7 (245-489)||(29577629-29577873)
chr7 (75-427)||(7877520-7877872)
chr7 (80-166)||(8640339-8640425)
chr7 (373-645)||(8616492-8616764)
chr7 (561-646)||(8673894-8673979)
chr7 (80-224)||(39985878-39986022)
chr7 (75-393)||(8581763-8582081)
chr7 (101-210)||(8538282-8538391)
chr7 (113-394)||(8559395-8559676)
chr7 (500-632)||(8664159-8664289)
chr7 (95-214)||(8610159-8610278)
chr7 (258-393)||(39985709-39985844)
chr7 (75-207)||(8017200-8017332)
chr7 (80-149)||(8102974-8103043)
chr7 (332-412)||(8609961-8610041)
chr7 (110-213)||(29577491-29577594)
chr7 (550-646)||(8537846-8537942)
chr7 (545-597)||(8664919-8664971)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (6-680)||(16657235-16657909)
chr2 (80-637)||(43625231-43625788)
chr2 (83-646)||(16661787-16662350)
chr2 (75-610)||(7542072-7542607)
chr2 (38-646)||(14703218-14703826)
chr2 (80-646)||(12234499-12235065)
chr2 (80-580)||(12245198-12245698)
chr2 (80-405)||(12258373-12258698)
chr2 (80-221)||(17716485-17716626)
chr2 (509-632)||(12258802-12258925)
chr2 (82-221)||(17717748-17717887)
chr2 (80-580)||(11999283-11999770)
chr2 (258-288)||(17716657-17716687)
chr2 (258-288)||(17717918-17717948)
chr2 (82-171)||(17703843-17703932)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (6-680)||(9335609-9336283)
chr4 (95-643)||(30775065-30775613)
chr4 (75-610)||(35132303-35132829)
chr4 (80-224)||(23596377-23596521)
chr4 (80-224)||(23587525-23587669)
chr4 (77-150)||(54396729-54396802)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (329-630)||(28219744-28220045)
chr5 (75-308)||(28220099-28220332)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (336-646)||(43744626-43744936)
chr8 (75-308)||(43744997-43745228)
chr8 (260-489)||(12528471-12528700)
chr8 (75-213)||(12528747-12528885)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (80-388)||(28910650-28910958)
chr6 (162-211)||(11314610-11314659)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 632; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 632; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 680
Target Start/End: Original strand, 4678271 - 4678949
Alignment:
Q  1 agttagtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtg 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4678271 agttagtgttgaggaaatatcatcgatgatccttacaaagatgagagaagttgccgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgtcgttgttactgtg 4678370  T
Q  101 cctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4678371 cctgcatacttcaatgattctcaacgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgttgcag 4678470  T
Q  201 ctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678471 ctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgattgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaa 4678570  T
Q  301 aatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678571 aatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacactcacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggag 4678670  T
Q  401 ttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcct 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678671 ttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttaaggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcct 4678770  T
Q  501 ttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaa 600  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678771 ttgtcaccactgttga-gtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaa 4678869  T
Q  601 cgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgttcttgtgg 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4678870 cgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtaatattgatgatgttgttcttgtgg 4678949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 80 - 592
Target Start/End: Original strand, 34466585 - 34467089
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||| ||||||||  | |||||||    
T  34466585 aagaatgcagttatcaccgtgcctgcttattttaatgattctcagcgaaaagctactgtggatgctggtactattgctggccttaatgttttgcaaataa 34466684  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgta-aacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggta 278  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||   || | | | || ||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  34466685 tcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggacttgacaagagagctgactttg-tggaagaaggaaatattttcgtctttgaccttggtggtggga 34466783  T
Q  279 cttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaat 378  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||| |  |||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  34466784 cttttgatgtgtctctccttacaattaaggataatgtctttgaagttaaggccacttctggtaacactcacctcggacgagaggactttgataatagaat 34466883  T
Q  379 ggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggca 478  Q
    || |||| |||||| | |||||||||| | |||| |||||  ||| ||||||   ||| | | | | ||  |||||||||||||||| |||||||  |||    
T  34466884 ggcgaaccactttgcaaaggagttcaagaggaagcataataaggatattagtggaaaccctagagctttgaggaggttgagaactgcgtgcgagaatgca 34466983  T
Q  479 aagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgagg 578  Q
    |||||||||||||        |||||| | ||||||||  |||||||||||| | ||| ||| |||||   ||| || || |||||||||||||||||||    
T  34466984 aagaggacactct--------tttgtcgctactgttgaaatagattctttatatgaggtaattgacttccattcgtcaatcactcgtgccaagtttgagg 34467075  T
Q  579 aaattaatatggac 592  Q
    |||| |||||||||    
T  34467076 aaatcaatatggac 34467089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 15595414 - 15594859
Alignment:
Q  83 aatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatca 182  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |   ||||||    
T  15595414 aatgcagttgttaccgtgcctgcttatctcaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcaggtgccattgctggccttaatgttatacgggtaatca 15595315  T
Q  183 acgaacctactgctg-------cagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtg 275  Q
    | ||||| || ||||       ||||||||||||||||  |||||||||| | | |  ||| | |  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15595314 atgaaccgacagctgacagctgcagctattgcatatggccttgacaagaggattaactgtgttggagaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtg 15595215  T
Q  276 gtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacag 375  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| ||||     |||||  |||| || ||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15595214 gcacttttgatgtgtctatcctaacaattaaggacaaggtcttccaagttaaggccacaggcggaaacactcaccttggaggagaggactttgataacag 15595115  T
Q  376 aatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagg 475  Q
    |||||| ||||||||||   |||| ||||| | |||||| || ||||| |||| |  |||| |||   ||||  |||| ||||||||||| ||||| |||    
T  15595114 aatggtcaactactttgcgcaggaattcaagacgaagaacaaagtggatattactgggaacccaagggccttgaggagattgagaactgcgtgcgaaagg 15595015  T
Q  476 gcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttg 575  Q
    ||||| |||  |||||||||  |   |||||| ||  |||||||||||| ||||||| | || || ||||| | ||||||  |||||||| |||||||||    
T  15595014 gcaaaaagggtactctcttttactactgtcactaccattgaggtagattgtttatttaacggtattgacttcttttcatcggttactcgttccaagtttg 15594915  T
Q  576 aggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtctt 631  Q
    | ||||| || |||||| |||| || || |||||| | |  ||| |||||||||||    
T  15594914 aagaaatcaacatggacttttttaaggattgtatgaagatagttgagagttgtctt 15594859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 610
Target Start/End: Original strand, 52549269 - 52549334
Alignment:
Q  545 ttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatg 610  Q
    ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  52549269 ttttcttcatcgatcaatagggccaagtttgaggaaatgaatatggacctttttaaggagtgtatg 52549334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8659813 - 8659139
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||  | |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8659813 gtgcggaggaaatatcatctatggtacttacaaaaatgcgagaagttgcagagacatatctaatgtcacctgtgaagaatgctgttgttacagtgcctgc 8659714  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8659713 atagttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagattccggtgccattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctactgctgcagctatt 8659614  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatca 305  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8659613 gcatatggttttgacaagagaggtgactgtgatggtaaacaaaatattttggtctttgatcttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttacaatga 8659514  T
Q  306 agggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659513 agggtgatgtctttgaagtaaaagccacttctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatagcagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 8659414  T
Q  406 aaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtc 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8659413 aaagaagaataaagtggacattagtggtaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaagaggacactctcttttgcttttgtc 8659314  T
Q  506 accactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagt 605  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  8659313 accactgttgaggtcgattctttatttcagggaatagacttctgttcattaatcactcgtgccaggtttgaggaaatgaatatggatctttttaatgagt 8659214  T
Q  606 gtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgttcttgtgg 680  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || |    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8659213 gtatgaaaactgttgagagttgtcttagcgattcaaaaatacagatgagtgatattgacgatattgttcttgtgg 8659139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1301909 - 1301236
Alignment:
Q  11 gaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatact 110  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||  ||  | ||||  ||||| |||||||||||||||||| | |    
T  1301909 gaggaaatatcatctatggtccttacgaagatgcgagaaattgcagagacatatctaatgtcaccagtgacaaatgctgttgttactgtgcctgcacatt 1301810  T
Q  111 tcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaaccta----ctgctgcagctattg 206  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    |||||||||||||||    
T  1301809 tcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgccggtgcaattgctggccttaatgtcattcagataattaatgaacctagctactgctgcagctattg 1301710  T
Q  207 catatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaa 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1301709 cgtatggttttgacaagagaagtgactgtgatggtaaacggaatattttggtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttaccatcaa 1301610  T
Q  307 gggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaa 406  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1301609 gggcgatgtctttgaagtaaaagccactggtggaaatactcaccttggaggagaggactttgataatagaatggtgagctactttgtagaggagttcaga 1301510  T
Q  407 aagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtca 506  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||   ||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||    
T  1301509 aagaagaataaagtggacattagtggtaaccagaaatccttaaggaggttgagaattgcgtgtgagagggcaaaaaggacactctcttttgctttagtca 1301410  T
Q  507 ccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtg 606  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  1301409 ccaccgttgaggtcgattctttatttcagggaatcgacttctgttcattaatcactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggatctttttaatgagtg 1301310  T
Q  607 tatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgttcttgtgg 680  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1301309 tacaaaaaccgttgagagttgtcttagcgattcaaaaatatgcatgagtgatatcgatgatattgttcttgtgg 1301236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 83 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 8654823 - 8654234
Alignment:
Q  83 aatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatca 182  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||    
T  8654823 aatgtcgttgttactgtgccggcatacttcaatgactctcagcgaaaagcaaccatagatgctggtgccattgctggacttaacgtcattcggatactca 8654724  T
Q  183 acgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttt 282  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |   |||| ||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||    
T  8654723 atgaacctactgccgcagctattgcatatggccttgacaagcgaagtaactatgatggtaaacggaatattttggtatttgatcttggtggtggtacttt 8654624  T
Q  283 tgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtg 382  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8654623 tgatgtgtctatactcacaattaagggtgatgtctttgacgtaaaagccactgctggaaacacgcacctagggggagaagactttgataacagaatggtg 8654524  T
Q  383 aactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaaga 482  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8654523 tactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataaagtggaaattagcggtaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaa 8654424  T
Q  483 ggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaat 582  Q
    ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  8654423 ggatactctcttttacttttgtcaccactgttgaggtagatgctttatttatgggaatcgacttttcttcatcaatcactcgtgctaaatttgaggaaat 8654324  T
Q  583 taatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgt 672  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  | | |||| | |||||||| || |||||||||||   |  || ||||||||||||||||||    
T  8654323 taatatggactttttcaatgagtgtatcaatattgttgacagttgtctcagagattcaaagatatacaagaatgatattgatgatgttgt 8654234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 6 - 645
Target Start/End: Original strand, 13333174 - 13333813
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||| |    ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13333174 gtgccgaggaaatatcatctatggtccttacaaagatgcgagaggttgcagaggcatatatggggtcaccagtcaagaatgccgttgttactgtgccggc 13333273  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13333274 ttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtgctattgctggccttaatatcattcgaataatcaatgaacctactgctgcagctatt 13333373  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatca 305  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13333374 gcatatggccttgacaagagacgtgattgtgatggtaagcgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtacttttgatgtgtctatccttacaatta 13333473  T
Q  306 agggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13333474 tgggtgatgtctttgaagtaaaagccaccgcaggaaacactcaccttgggggagaagacttcgataacagaatggtgaactattttgttgaggagttcaa 13333573  T
Q  406 aaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtc 505  Q
    |||||||||||| || || || |||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||  | ||||||    
T  13333574 aaagaagaataacgtcgatatcagtgggaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggaaaaaaggatactctccttttcttttgtc 13333673  T
Q  506 accactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagt 605  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  13333674 accactgttgaagtagatgctttatttatgggaatcgacttttcttcatcaatcactcgtgccaaatttgaggaaattaatatagactttttcatcgagt 13333773  T
Q  606 gtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagat 645  Q
    ||||| | | |||| | |||||||| || |||||||||||    
T  13333774 gtatgaatattgttgacagttgtctcagggattcaaagat 13333813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 80 - 680
Target Start/End: Original strand, 10494166 - 10494766
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||    
T  10494166 aagaatgctgttgttactgtgccggcttacttcaacgattctcaacgaaaggctactattgatgctggtgctattgctggccttaatgtcattcggataa 10494265  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtac 279  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||  |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  10494266 tcaatgaacctactgctgcagctattgcatatggccttgacaagagaagtgattgtgagggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggtggtac 10494365  T
Q  280 ttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  10494366 ttttgatgtgtctatcctcacaattaagggtgatgtctttgaagtaaaagccactgcaggtaacactcaccttgggggagaggacttcgataacagaatg 10494465  T
Q  380 gtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaa 479  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10494466 gtgaattattttgttgaggagttcaaaaagaagaataacgtggacatcagtgggaatccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaa 10494565  T
Q  480 agaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgagga 579  Q
    | |||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10494566 aaaggatactctctttttcttttgtcaccaccgttgaggtcgatgctttatttatgggaatcgacttttcttcatcaatcactcgtgccaaatttgagga 10494665  T
Q  580 aattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgttcttgtg 679  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||| | | |||| | |||||||| || |||||||||||   |  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10494666 aattaatatagactttttcatcgagtgtatgaatattgttgacagttgtctcagggattcaaagatatacaagaatgatattgatgatattgttcttgtg 10494765  T
Q  680 g 680  Q
    |    
T  10494766 g 10494766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 8667869 - 8667265
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||    ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8667869 gtgctgaggaaatatcttctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgcggaggcatatctggggtcgccggtcaagaatgccgttgttactgtgccagc 8667770  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8667769 ttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgcggcagctatt 8667670  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatca 305  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  ||||| |||  |||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  8667669 gcatatggccttgacaagagaaatgactgtgatggtagccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcgggacttttgatgtgtctatcctcacaatta 8667570  T
Q  306 agggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  8667569 agggtgatgtctttgaagtgaaagccactgcaggaaacactcaccttgggggcgaggacttcgataacagaatggtgaactattttgttgaggagttaaa 8667470  T
Q  406 aaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtc 505  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||     
T  8667469 aaagaagaataaagtggacatcagtcagaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatactctcttttgcttttgtt 8667370  T
Q  506 accactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagt 605  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  8667369 accactgttgaggtagatgctttatttacgggaatcgacttttgttcatcaattactcgtgctaaatttgaggaacttaacatggactttttcaatgagt 8667270  T
Q  606 gtatg 610  Q
    |||||    
T  8667269 gtatg 8667265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8647327 - 8646687
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || | |||| |||  ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8647327 gtgctgaggaaatatcatcgatgatcctcacaaagatgcgagaggttgcagagaaatatttaatgtcccctgtaaagaatgcagttgttactgtgcctgc 8647228  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |  |||||||| ||||| || ||||| ||| |     
T  8647227 atacttcaatgattatcagcgaaaagccactatagatgccggggccattgctggccttaatatcatccggataatcaatgaaccaacagctgctgctctc 8647128  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatca 305  Q
    ||||||||  ||||||||||||   |  ||| |    |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  8647127 gcatatggccttgacaagagaacaaattgtgctgaagaacgaaatatattcatcttcgaccttggtggtggaacttttgatgtgtctctccttacaatta 8647028  T
Q  306 agggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
    ||| |   |||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| | | || || ||    
T  8647027 aggataaggtctttcatgttaaagccaccgctggaaacactcacctcggaggagaggactttgatagtagaatggtggaccactttgcacaagaatttaa 8646928  T
Q  406 aaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtc 505  Q
     |||||||| || |||||||||| |   ||| ||| | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || | |  |    
T  8646927 caagaagaacaaggtggacattactggaaactcaagagccttaaggaggttgagaacggcatgcgagagagcaaaaaggacactatcttttgcttcttgc 8646828  T
Q  506 accactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagt 605  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||| | || || ||||||  |||||| || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || |||| ||| |    
T  8646827 accaccattgaattagattctttatttaatggcattgactttatttcatcaatcactcgtgccaaatttgacgcaatcaatatggatctgttcatcgaat 8646728  T
Q  606 gtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatg 646  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||||    
T  8646727 gtttggaaactgttgagagttgtcataatgatgccaagatg 8646687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 645
Target Start/End: Original strand, 8585424 - 8586063
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaag-ttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctg 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||| || |||||| | |  ||  ||||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  8585424 gtgctgaggaaatatcatctatcatcctcacaaacatga-agaagattgcagagacatatttgaaatcacctgttcaaaatgcagttgtgactgtgcctg 8585522  T
Q  105 catacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctat 204  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8585523 cttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatcaatgaacccactgctgcagctat 8585622  T
Q  205 tgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatc 304  Q
    |||||||||  ||||||| | | || |  ||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||     
T  8585623 tgcatatggccttgacaacaaaggtaactgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctctcctcacaatt 8585722  T
Q  305 aagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttca 404  Q
    || |||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |    
T  8585723 aaaggtgatgtctttgaagttaaagcaaccgctggaaatactcaccttgggggaggggactttgataacagaatgttgaactactttgttgaggaattta 8585822  T
Q  405 aaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgt 504  Q
    | |  ||||| |||||||| |||| ||||||| ||| | | ||  || |||| ||||| || || || | |||||| |||||||| ||||||   || ||    
T  8585823 agagaaagaacaatgtggatattactaagaacccaagagctttgaggcggttaagaacggcatgtgaaaaggcaaaaaggacactttctttcaaattggt 8585922  T
Q  505 caccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgag 604  Q
    ||| ||| ||||  | |||| ||||| | ||||  | || || |||||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8585923 cactactattgaaattgattatttatgtgagggcgtcgatttctcttcatcaatcacgcgtgtcaagtttgaggaaatcaatatggacctttttaatgag 8586022  T
Q  605 tgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagat 645  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  8586023 tgtataaatactgttgagagttgtcttaccgattctaagat 8586063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 3147653 - 3147092
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||| | || |     
T  3147653 ctgtcaagaatgcagttgttaccgtacctgcttatttcaatgatgctcagcggaaagcgacaatagatgctggtgttattgctggccttaatattatgcg 3147554  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtg--atcgtaaa------cgaaatatatttgtctttgacc 266  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| | |  |||  || ||  |      || ||||| ||| ||||||||     
T  3147553 gataatcaatgaacctactgctgcagctattgcgtatggactggacaagagaactaattgtgtaattgtgtagaggagcgtaatatttttatctttgact 3147454  T
Q  267 ttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactt 366  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |   |||||| |||| || ||||  || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3147453 tgggtggtgggacttttgatgtgtctcttcttacaattaaggataaggtctttcaagttaaggccatcgcaggaaacacccaccttgggggagaggactt 3147354  T
Q  367 tgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcc 466  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |  |||||| || |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| ||     
T  3147353 tgataataggatggtgaactactttgcacgggagtttaagaagaagaacaaggtagacattagtgagaactcaagagccttaaggaggttgaaaacggcg 3147254  T
Q  467 tgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtg 566  Q
    || || || |||||  | | ||| ||||| ||  |  |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| || |||||||    
T  3147253 tgtgaaagagcaaaacgaatactatcttttgctgtcatcaccaccattgagatagattctttatttcagggatttgacttattttcatcaatcactcgtg 3147154  T
Q  567 ccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgt 628  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3147153 ccaagtttgaggaaatcaatatggatcttttcactgagtgtttggaaactgttaagagttgt 3147092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 93 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17268302 - 17267758
Alignment:
Q  93 ttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaa-taatcaacgaaccta 191  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||  ||||||| ||||| |    
T  17268302 ttactgtcccggcttacttcaacgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgtcattgctggccttaatgt-attgaaggtaatcaatgaaccaa 17268204  T
Q  192 ctgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |  ||| |    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17268203 ctgctgcagctattgcatatggccttggcaagagaactaactgtgttgaagaacggaatatttttgtctttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtc 17268104  T
Q  292 tatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactacttt 391  Q
    | || ||| ||| |||| |   ||||| ||||| || ||||| | |||| |||| || || || || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  17268103 tctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggtatactatttt 17268004  T
Q  392 gtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactct 491  Q
    || |||||  |||||| ||| || ||  || | |||  |  |||| ||||| || |  |||||||||||||||| || || |  ||||| |||||||| |    
T  17268003 gttgaggaaatcaaaaggaaaaaaaaattgaaaattgttgggaacccaaaagccatgaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaaaggacacttt 17267904  T
Q  492 ctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatgga 591  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||  | || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17267903 ctttcgcctctgtgaccaatgttgaggtagacgctttatttaagggtgttgatttttcttcgtcaatcactcgtgccaagtttgaggaaatcaatatgga 17267804  T
Q  592 ccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgat 637  Q
    ||||||  | ||||| ||||| | |||| |||  ||||||||||||    
T  17267803 cctttttgatgagtgcatggagattgttgagaagtgtcttagtgat 17267758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 93 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 17260604 - 17260060
Alignment:
Q  93 ttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctac 192  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||  |  |  |||| || |||||||     
T  17260604 ttactgttcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgctggtgttattgctggcctttatgttttgaagttaattaatgaacctat 17260505  T
Q  193 tgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtct 292  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | |  ||| |     ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17260504 tgctgcagctattgcatatggccttgtcaagagaactaattgtgtttaagtacggaatatttttgtctttgaccttggtggggggacttttgatgtgtct 17260405  T
Q  293 atccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttg 392  Q
     || ||| ||| |||| |   ||||| ||||| || ||||| | |||| |||| || || || || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  17260404 ctcgttacaattaaggataaggtcttcgaagttaaggccaccggtggagacactcatcttgggggtgaggactttgataatagaatggtgtactattttg 17260305  T
Q  393 tagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctc 492  Q
    |||||||| ||||||  | ||| ||  ||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || || |  ||||| |||||||| ||    
T  17260304 tagaggagatcaaaagaacgaaaaaattggacattattgggaacccaaaagccttaaggaggttgagaactgcatgtgaaaaagcaaaaaggacactttc 17260205  T
Q  493 tttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggac 592  Q
    ||| |||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||  |  | |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17260204 ttttgcctctgtgaccaatgttgaggtagacgctttatttaagggtgttaatttttcttcgtcaatcactcgtgccaagtttgaagaaatcaatatggac 17260105  T
Q  593 cttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgat 637  Q
    |||||  | ||||| ||||| | |||| |||  ||||||||||||    
T  17260104 cttttttatgagtgcatggagattgttgagaagtgtcttagtgat 17260060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 8628905 - 8628609
Alignment:
Q  83 aatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatca 182  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||    
T  8628905 aatgcagttgtcaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccatgaatgctggtgccattgctggccttaatgttatgaggataatca 8628806  T
Q  183 acgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttt 282  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||    ||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  8628805 atgaccccactgctgcagctattgcatatggccttgacaacaaaggtaggtgtgatggtgaacgaaatatttttgtgtttgatcttggtggtgggacttt 8628706  T
Q  283 tgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    |||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8628705 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccactgctggaaatactcaccttggtggagaggactttgataacagaatg 8628609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 630
Target Start/End: Original strand, 27830697 - 27831217
Alignment:
Q  110 ttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctattgcat 209  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |||||||| || |  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27830697 ttcaatgactctcaacgaaaagccactgtagattccggtgccattgctggccttaatgttatgcggataataagcgagcctactgctgcagctattgcat 27830796  T
Q  210 atggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaaggg 309  Q
    ||||  |||||| | |||   ||  |  | |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||     
T  27830797 atggccttgacacgggaacaaaatatactggagaacggaatatttttgtgtttgaccttggtggtgggacttttgatgtgtctcttgttacaattaagga 27830896  T
Q  310 tggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaag 409  Q
    |   |||||  |||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  27830897 taaggtcttccaagttaaggcaactgctggaaacactcaccttggtggagaggactttgataataggatggtgaactattttgtggaggtgttcaagaag 27830996  T
Q  410 aagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcacca 509  Q
    ||||| |  ||||||||||||  |||| ||| | ||||  ||||| |||||||    || |||| |||||| ||||||||||||||  |  ||| ||| |    
T  27830997 aagaaaagagtggacattagtgggaacccaagagccttgaggaggctgagaacctaatgtgagaaggcaaaaaggacactctctttttctgttgacacta 27831096  T
Q  510 ctgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtat 609  Q
    || ||||| ||||| | |||||| |||| || ||||| | ||||   || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  27831097 ctattgagatagatgccttatttgagggcattgacttcttttcaatgatcactcgtgcaaagtttgaggaaatcaatatggaccttttcaatgaatgtat 27831196  T
Q  610 ggaaactgttaagagttgtct 630  Q
    ||| |||||| ||||||||||    
T  27831197 ggagactgttgagagttgtct 27831217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 83 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 6789885 - 6789337
Alignment:
Q  83 aatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatca 182  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||    
T  6789885 aatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattctcaacggaaagccactttagatgctggtgccattgctggtcttaatgttatacgaataatca 6789786  T
Q  183 acgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttt 282  Q
    | ||||| || ||||| ||| ||||||||||  |||| ||||||| | |    | | |  ||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6789785 atgaaccaacagctgctgctcttgcatatggccttgataagagaactaattacggtggagaaaaaaatattttcgtcttcgaccttggtggtggcacttt 6789686  T
Q  283 tgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtg 382  Q
     |||||||||||| | | |||||| | |   |||||  |||| || ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||     
T  6789685 cgatgtgtctatcttaacaatcaaagataaggtcttccaagttaaggccaccggtggaaacactcacctcggaggagaggactttgataaccgattggta 6789586  T
Q  383 aactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaaga 482  Q
    |||||||||| ||||||||| || | |||||| || ||||| |||| |   ||| |||   ||||| | |||||||||||||| || || ||||| || |    
T  6789585 aactactttgcagaggagtttaagaggaagaacaaagtggatattactggaaactcaagggccttaagaaggttgagaactgcgtgtgaaagggccaaaa 6789486  T
Q  483 ggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaat 582  Q
    ||  ||||||||| |   | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  6789485 gggtactctcttttgttgtcgtcactactattgaggtagactctttatttcagggcatcgacttcatttcatcacttactcgggccaagtttgaggaaat 6789386  T
Q  583 taatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtctt 631  Q
     ||||||||  |||| || ||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  6789385 caatatggatatttttaatgagtgtatgaagaccgttgagagttgtctt 6789337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 8671348 - 8671606
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    |||||||||||||||| || ||  | |||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||    ||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8671348 gtgctgaggaaatatcttctatggtgcttacaaagatgcgagaggttgcggaggcatatctggagtcaccggtcaagaatgccgttgttaccgtgccagc 8671447  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
     ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8671448 ttacttcaatgattctcagcgaacggccaccattgatgctggtactattgctggacttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctatt 8671547  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttga 264  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  ||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  8671548 gcatatggccttgacaagagaaatgaccgtgaaggtaaccgaaatatttttgtctttga 8671606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 429
Target Start/End: Original strand, 8636064 - 8636484
Alignment:
Q  9 ctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcata 108  Q
    ||||||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||  |||||||  |||||||    || ||||| |||||||| ||  |||||||||| || ||    
T  8636064 ctgaggaaatatcgtctatggtcctgacaaagatgcgagagattgctgaggcatatctggaatcatctgtcaagaatgcagtcattactgtgcccgctta 8636163  T
Q  109 cttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctattgca 208  Q
     ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||     
T  8636164 tttcaatgattctcagcgtaaatccaccaaagatgctggtgccattgccggccttaatgtaattcggataatcaatgaaccaactgctgcagcttttgcg 8636263  T
Q  209 tatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagg 308  Q
    |||||  || | |||||| || |  ||| |    |  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||||| || |    
T  8636264 tatggacttcaaaagagaggtaactgtgttaaagagagaaacattttcgtatttgatcttggtggtggtacattcgacgtgtctatactcaaaattaaag 8636363  T
Q  309 gtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaa 408  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||| |     
T  8636364 gtgaagtctttgaagttaaagccactgccggagacacacaccttggaggagaggactttgataacagaatggtggaatattttgtagaggaaatcaagag 8636463  T
Q  409 gaagaataatgtggacattag 429  Q
    |||||| || || ||||||||    
T  8636464 gaagaacaaggtagacattag 8636484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 489
Target Start/End: Original strand, 29581628 - 29582042
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    || ||||| || ||||| ||       
T  29581628 ctgtaaagaatgcagtgattaccgtgcctgcttatttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgctggcattatagctggcctcaatgtaatgag 29581727  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| || | ||| || || |   || | | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  29581728 gataatcaacgaaccaactgctgctgcacttgcatatggtattcaaaagggaggtaattttgttggaaaacgaaatatattcatctttgatcttggtggt 29581827  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||||||| | || | | |||||| || |   |||||||| || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||     
T  29581828 ggcacttttgatgtgtctcttctcacactcaaggatgataagtttgaagtgaaggccactgctggcgatactcacctaggaggagaggactttgataacc 29581927  T
Q  375 gaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagag 474  Q
    |||||||||| |||||||   | ||||| || | |||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| | ||| ||| | ||||||| || || |||||    
T  29581928 gaatggtgaattactttgcgaatgagttgaagaggaagaacaatttggacattagtgggaacccaaaagctttaaggaagctgagaacagcttgtgagag 29582027  T
Q  475 ggcaaagaggacact 489  Q
    |||||||||||||||    
T  29582028 ggcaaagaggacact 29582042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 246 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 8545843 - 8545458
Alignment:
Q  246 gaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacac 345  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   |   |||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  8545843 gaaatatttttatctttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctattcttacaattaaaaataaggtctttgatgtcaaggccactgctggagacac 8545744  T
Q  346 ccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaaccc 445  Q
      ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||  |||| || || ||    
T  8545743 ttacctaggcggtgaagactttgataacagaatggtgaattactttgtgaaggagttcaagaggaagaacaatgaggatattagtcggaacccagaagcc 8545644  T
Q  446 ttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagact 545  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || | || |  ||   ||||  ||||  ||||| |||||| ||| || || ||||    
T  8545643 ttgaggaggttgagaactgcctgtgagaaggcaaaaaggacactttcatacgacactgaggccacaattgacctagatgctttatatcaaggtattgact 8545544  T
Q  546 tttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtctt 631  Q
    ||| |||||  || ||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||  |  |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  8545543 tttgttcatgcatcactcgggccaagtttgagcaattgaatatggacctctttgaaaagtgtatggacactgttaattgttgtctt 8545458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 8576707 - 8576293
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||  || |||||||||| || || |||||||| || |||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  8576707 ctgttaagaatgcagtgatttctgtgcctgcttattttaatgattcccaacgaagagccactaaagatgcaggtgcaattgctggtctcaatgtcatgca 8576608  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||  || | ||||||  | |  ||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  8576607 gataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcgtatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataaaagaaatatttttatctttgaccttggcggt 8576508  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||||||||| || | | | |||     |||||| ||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| ||  | |||||||||||||    
T  8576507 ggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaacaatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcacctaggaggccaagactttgataaca 8576408  T
Q  375 gaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagag 474  Q
     ||||||| |  |||||||  |||||||||  || ||| | || | ||| |||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || || |     
T  8576407 taatggtggatcactttgttaaggagttcaggaacaagtacaaagaggatattagtgagaattcaaaagccttaaggaggttgagaactgcttgtgaaaa 8576308  T
Q  475 ggcaaagaggacact 489  Q
    |||||| ||||||||    
T  8576307 ggcaaaaaggacact 8576293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8591019 - 8590713
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||  | ||||| || |     
T  8591019 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccagcttattttaatgattctcagaggaaagctaccaaagatgctggtgtcattgctggcttgaatgtaatgcg 8590920  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtga--tcgtaaa-cgaaatatatttgtctttgaccttggt 271  Q
     ||||| || ||||| ||||| || |   ||||||||||  || | ||||||   |||||| |  ||| ||| |||||| | ||  ||||||| ||||||    
T  8590919 gataattaatgaaccaactgccgctggccttgcatatggccttcaaaagaga---gaaagtaacatcggaaaacgaaatgtgttcatctttgatcttggt 8590823  T
Q  272 ggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgata 371  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || | | |||| |||| |  |||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8590822 ggtggcacttttgatgtgtctcttctcacactcaaaggtgatagctttgatgtaaaagccacttccggagatacccacctaggaggagaggactttgata 8590723  T
Q  372 acagaatggt 381  Q
    ||||||||||    
T  8590722 acagaatggt 8590713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 8570692 - 8570136
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||| || |||| ||| || | |||||| ||||  |||||||| || ||||| || |     
T  8570692 ctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgctggtctcaatgtaatgcg 8570593  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||  || | ||||||  | |   || |  |||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  8570592 gataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattttgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggcggt 8570493  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||||||||| || | | | |||| |     || |||||| || |||||||||||| |||| ||||| || || || || ||||||||||    
T  8570492 ggaacttttgatgtgtctattctcacagttaaggataacaactatgaagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggtgaagattttgataaca 8570393  T
Q  375 gaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagag 474  Q
    ||||| |||   |||||||  || ||||||| |||||||| || | ||| ||||||| |||| ||||| ||||  ||||||| ||||| || || |||||    
T  8570392 gaatgttgactcactttgtgaagaagttcaagaagaagaacaacgaggatattagtaggaacccaaaagccttgaggaggttaagaacagcttgtgagag 8570293  T
Q  475 ggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagttt 574  Q
    |||||| |||||||| || |  |    ||   ||||  ||||| ||||| || ||| | ||||||| |||||   |||||| || || || |||||||||    
T  8570292 ggcaaaaaggacactttcatatgatactgaggccacaattgagctagatgctatatataagggaattgacttcagttcatcaataacccgggccaagttt 8570193  T
Q  575 gaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtctt 631  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8570192 gaggaaatgaatatgaacctctttgaaaagtgtatggaaactgttaatagttgtctt 8570136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8602355 - 8602037
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||| || |     
T  8602355 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttattttaatgattctcagcgaaaagccacaaaagatgctggtgccattgctggtctcaatgtaatgcg 8602256  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
     |||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |  ||| |    |  ||||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  8602255 gataatcaatgagccaactgcagctgctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgaagagagaaatattttcatatttgatcttggtggt 8602156  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||| ||| | || | ||| |||  |  | |||||||||| || |||||| | ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||     
T  8602155 ggaacttttgatgtttctcttctcacaattaagaataatctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacaccttggaggagaggactttgataacc 8602056  T
Q  375 gaatggtgaactactttgt 393  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  8602055 gaatggtgaaccactttgt 8602037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 489
Target Start/End: Original strand, 8382677 - 8383077
Alignment:
Q  89 gttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaac 188  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| || |  |||||||| || |    
T  8382677 gttgttaccgtgcctgcatatttcaatgattctcaacggaaagccacaaaagatgctggtgcgattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgagc 8382776  T
Q  189 ctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 288  Q
    | ||||| || ||| ||||||||||  || | ||||||  | |  ||  |    |  ||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8382777 caactgccgctgctcttgcatatggccttcagaagagagctaattgtcttgaagagagaaatattttcatctttgatcttggtggtggaacttttgatgt 8382876  T
Q  289 gtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactac 388  Q
    |||| |||| | ||| |||  |  ||||||||  || || |||||||| ||| |||| || ||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8382877 gtctctcctcacaattaagaataatgtctttgttgtgaaggccactgccggagacactcatctaggaggtgaagacttagataacagaatcgtgaagtac 8382976  T
Q  389 tttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaa-acccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggaca 487  Q
    ||||| || |||||||| | |||| |||||  ||||||||||  |||| ||||  | |||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  8382977 tttgttgacgagttcaagaggaagcataataaggacattagtgggaacccaaaggctctta-gaaggttaagaacggcttgcgagagggcaaaaaggaca 8383075  T
Q  488 ct 489  Q
    ||    
T  8383076 ct 8383077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 489
Target Start/End: Original strand, 29577629 - 29577873
Alignment:
Q  245 cgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaaca 344  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | || | | | |||| || |   ||||||||||| |||||||||||  | |    
T  29577629 cgaaatgtattcatctttgatcttggtggtggcacctttgatgtgtctcttctcacacttaaggatgatagttttgaagtaaaggccactgctggtgata 29577728  T
Q  345 cccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacc 444  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||  | ||||| || | |||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |    
T  29577729 ctcacctaggaggagaggacttcgataataaaatggtgagccactttgtgaatgagttgaagaggaagaacaatgtggacattagtttgaacccaaaagc 29577828  T
Q  445 cttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacact 489  Q
     ||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  29577829 tttaaggaagctgagaactgcttgtgagagggcaaagagggcact 29577873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 427
Target Start/End: Original strand, 7877520 - 7877872
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||  |||| || || ||||| || |     
T  7877520 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattctcaacgaaaagccacaaaagatgctggtgcagttgccggcctcaatgttatgcg 7877619  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatc-gtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtgg 273  Q
     ||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||  || | ||||||| | ||    ||| | ||||||||| | ||  || |||| ||||||||    
T  7877620 gataattaatgaaccaactgctgctgcccttgcatatggccttcaaaagagaa-taaataacatcggaaaacgaaatgtgttcatcattgatcttggtgg 7877718  T
Q  274 tggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataac 373  Q
    ||| ||||| ||||||||| | || | | | || | || |  |||||| |||| ||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7877719 tggcactttcgatgtgtctcttctcacactaaaagatgatagctttgatgtaatagctactgccggagatactcacctaggtggagaggactttgataac 7877818  T
Q  374 agaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacatt 427  Q
    |||||| ||||| | || ||   |||||| || | ||||||||| |||||||||    
T  7877819 agaatgttgaaccatttagtgatggagtttaagaggaagaataaagtggacatt 7877872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Original strand, 8640339 - 8640425
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaat 166  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  8640339 aagaatgcagttgttactatgcctgcttacttcaatgattatcagcaaaaagccaccatagatgccggggccattgctggccttaat 8640425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 373 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 8616764 - 8616492
Alignment:
Q  373 cagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgag 472  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || || | |||||| |||||||| |||| || |||| ||| | | ||  || |||||| |||||| |||||     
T  8616764 cagaatgttgaactactttgttgaggattttaagaggaagaacaatgtggatattactaggaacccaagatcgttgaggcggttgaaaactgcatgcgaa 8616665  T
Q  473 agggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagt 572  Q
    | ||| ||  |||  || || |||   || ||||| ||| ||||| | |||| ||||| | |||| || || || |||||||| || |||||||  ||||    
T  8616664 aaggcgaaacggatgctttcattcaaattggtcactactattgagattgattatttatgtgagggcatcgatttctcttcatcaatcactcgtgttaagt 8616565  T
Q  573 ttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagat 645  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||| ||| |||||| |||||    
T  8616564 ttgaggaaatcaatatggacctttttaacgagtgtataaagactgttgagagttgttttaatgattctaagat 8616492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 646
Target Start/End: Original strand, 8673894 - 8673979
Alignment:
Q  561 ctcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatg 646  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||    
T  8673894 ctcgtgccaagtttgaggaaatcaatatcaatcttttcaacgagtgtttggaaactgttgagaattgtcttattgatgccaagatg 8673979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39986022 - 39985878
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||||||||  |||||||| |  ||||| || ||||||||||| | ||| |    
T  39986022 aagaatgctgttgttactgtccctgcttactttaatgactcccagcgtcaagctaccaaggatgctggagttattgccggtcttaatgtcatgcgaatta 39985923  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaaga 224  Q
    |||| || || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||    
T  39985922 tcaatgagcccactgctgctgccattgcttatggtcttgacaaga 39985878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 8582081 - 8581763
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||| ||||| || || |||||||| || |||| ||| || | |||||| ||||  ||||| || || ||||| || |     
T  8582081 ctgttaagaatgcagtgattactgtacctgcttattttaatgattcacaacgaagagccactaaagatgcaggtgaaattgcaggtctcaatgtaatgcg 8581982  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||  || | ||||||  | |  ||| |  |||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  8581981 gataatcaatgaaccgactgcggcagctcttgcatatggccttcaaaagagagctaattgtgttgataagagaaatatttttatctttgaccttggaggt 8581882  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||||||||| || | | | |||  |   | || |||||| || |||||||||||| |||| ||||| || || || || ||||||||||    
T  8581881 ggaacttttgatgtgtctattctcacagttaagaataacgactatgaagtcaaggccactgctggagacactcacctgggaggggaagattttgataaca 8581782  T
Q  375 gaatggtgaactactttgt 393  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  8581781 gaatggtgaatcactttgt 8581763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8538391 - 8538282
Alignment:
Q  101 cctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcag 200  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||| |    
T  8538391 cctgcttatttcaatgattcacagcgaagagccaccaaagatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaacctacagctgctg 8538292  T
Q  201 ctattgcata 210  Q
    || |||||||    
T  8538291 ctcttgcata 8538282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8559676 - 8559395
Alignment:
Q  113 aatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatg 212  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| |||||| ||||  |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  8559676 aatgattctcaaagaagagccaccaaagatgcaggtgaaattgctggtcttaatgtaatgcagataatcaatgaaccaactgcagctgctcttgcatatg 8559577  T
Q  213 gttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtgg 312  Q
    |  || | ||||||  | |  ||| |    |  ||||||| ||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || | ||| |||  |      
T  8559576 gacttcaaaagagatctaattgtgttaaagagagaaatattttcatctttgatctcggtggtggaacttttgatgtttctcttctcacaattaagaataa 8559477  T
Q  313 tgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgta 394  Q
    | |||||||||| || |||||| | ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8559476 tctctttgaagtcaaggccacttccggagacacacacctcggaggagaggactttgataacagaatggtgaaacactttgta 8559395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 8664289 - 8664159
Alignment:
Q  500 tttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttca 599  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  || |||| | || |||  |  |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  8664289 tttgtcaccactattaaggtagattctttgtttcagcgcttaaacttctttttatccttcgctcgtgccaagtatgatgaaatcaatatggatcttttca 8664190  T
Q  600 acgagtgtatggaaactgttaagagttgtctta 632  Q
    ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8664189 ac--gtgtttggaaactgttgagagttgtctta 8664159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8610278 - 8610159
Alignment:
Q  95 actgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactg 194  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||| |||| |||||||| || |  || ||||| ||||| || |    
T  8610278 actgtgcctgcttattttaatgattctcagcggaaagccacaaaagatgctggtgtcatttctggccttaatgtaatccggattatcaatgaaccaacgg 8610179  T
Q  195 ctgcagctattgcatatggt 214  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  8610178 ctgcggctcttgcatatggt 8610159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39985844 - 39985709
Alignment:
Q  258 tctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |  ||  | |  ||| ||||||| || |||||||| || ||| ||||||| || || ||    
T  39985844 tctttgaccttggtggtggtacttttgatgtctctttgctaactattgaagagggtatctttgaggtgaaagccacagccggagacacccatcttggagg 39985745  T
Q  358 agaggactttgataacagaatggtgaactactttgt 393  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39985744 tgaggattttgacaacagaatggtgaaccactttgt 39985709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 207
Target Start/End: Original strand, 8017200 - 8017332
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||  |||| || |  ||||| |||| |||||| ||||| |||||  |       
T  8017200 ctgtgaagaatgccgttgttacagttccagcttacttcaatgattcgcagcgtcaagccacaaaggatgccggtgtcattgcaggactcaatgttttgag 8017299  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgc 207  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  8017300 aattatcaacgagccaacagctgcagctattgc 8017332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8103043 - 8102974
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtg 149  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||    
T  8103043 aagaatgccgtcgtcactgtccctgcttacttcaatgattctcagcgtcaagcaactaaagatgctggtg 8102974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 8610041 - 8609961
Alignment:
Q  332 actgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaag 412  Q
    ||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||  |||||||||||| ||||    
T  8610041 actgctggagatactcaccttggaggagaggactttgatcacagaatggttaatcactttgtgaaggagttcaaaaggaag 8609961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 29577491 - 29577594
Alignment:
Q  110 ttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctattgcat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    |||||||| || ||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||    
T  29577491 ttcaatgattctcagcgaaaagccaccaaagatgccggcattattgctggcctcaatgtaatgcggataatcaatgaaccaactgctgctgcacttgcat 29577590  T
Q  210 atgg 213  Q
    ||||    
T  29577591 atgg 29577594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 550 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8537942 - 8537846
Alignment:
Q  550 ttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatg 646  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| || | || |||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  8537942 ttcatcaatcactcgggccaagtttgagcaactcaacatggacctctttgaaaagtgtatgaaaactgttaagagttgttttaatgatgctaagatg 8537846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 8664971 - 8664919
Alignment:
Q  545 ttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggacctttt 597  Q
    |||| |||||| || |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8664971 ttttgttcatcaataactcgtgcgaggtttgaggaaatcaatatggacctttt 8664919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 680
Target Start/End: Original strand, 16657235 - 16657909
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |    ||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  16657235 gtgctgaggaaatatcatctatgatccttacaaagatgcgagaagttgctgaggcatttatggagtcgcctgtcaagaatgctgttgttactgtgccagc 16657334  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16657335 ttacttcaatgattcgcagcgaaaagccaccatagatgctggtgccatcgctggccttaatgtcattcgaattatcaatgaacctactgctgcagctatt 16657434  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatca 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16657435 gcatatggtcttgacaagagaagtgattgtgatggtaaacggaatatttttgtctttgaccttggcggtggtacttttgatgtgtctatccttacaatta 16657534  T
Q  306 agggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  16657535 agggtgatgtttttgaggtaaaagccactgccggaaacactcaccttgggggagaggactttgataacagaacggtgaactactttgtagaggagtttca 16657634  T
Q  406 aaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtc 505  Q
    |||||||||||| |||||||| |||  |||| ||| | ||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16657635 aaagaagaataaggtggacataagtgggaactcaagagccttgaggaggttgagaactgcatgtgagagggcaaagaggacactctcttttgcttttgtc 16657734  T
Q  506 accactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagt 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16657735 accactgttgaggtagattctttatttcagggaattgacttttcttcatcaatcacccgtgccaagtttgaggaaattaatatggatcttttcaatgagt 16657834  T
Q  606 gtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgttcttgtgg 680  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16657835 gtatgaaaactgttgagaattgtcttcgtgattcaaagatgcacattggtgatattgatgacgttgttcttgtgg 16657909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 80 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 43625788 - 43625231
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  || ||||||||  | | | |||    
T  43625788 aagaatgcagttgttaccgtgcctgcttacttcaatgattctcagcgaaaagccaccatagatgttggtgtcattgtcggccttaatgttttacgagtaa 43625689  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtac 279  Q
    |||| ||||| || ||||| ||| | ||||| ||  || ||||||||| | |  ||| | |  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  43625688 tcaatgaaccaacagctgctgctctagcatacggccttaacaagagaattaattgtgttggagaacgaaatattttcatctttgaccttggtggtggtac 43625589  T
Q  280 ttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||     |||||    || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  43625588 ttttgatgtgtctatacttacaattaaggacaaggtcttccgtgttaaagccactgctggaaacactcaccttggaggagaggactttgatgatagaatg 43625489  T
Q  380 gtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaa 479  Q
    ||||||||||||| ||| || ||  | |||||||| |||||||| |||| |   ||| ||| | || || | ||||||||||| || |||||||| | ||    
T  43625488 gtgaactactttgcagaagaatttgagaagaagaacaatgtggatattattggaaactcaagagccataagaaggttgagaacggcatgcgagagaggaa 43625389  T
Q  480 agaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgagga 579  Q
    | |||||||| ||||| || |   ||| |||| ||||||||||||||||||| |  || || ||||| | |||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  43625388 aaaggacactgtcttttgcttcgttcagcactattgaggtagattctttattccgtggtattgacttcttttcatcaatcactcgtgccaaatttgatga 43625289  T
Q  580 aattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgat 637  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43625288 aataaatatggatcttttcaacgagtgtttgaaaactgttaagagttgtcttattgat 43625231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 646
Target Start/End: Original strand, 16661787 - 16662350
Alignment:
Q  83 aatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatca 182  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |    |||||||    
T  16661787 aatgcagttgtcactgttcctgcttattttaacgattctcagcgaaaagccaccatggatgctggtgccattgctggccttaacgttgtgaggataatca 16661886  T
Q  183 acgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttt 282  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |  ||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16661887 atgaacccactgcagcagctattgcatatggccttgacaaaagaagtaattgtgatggtgaaagaaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttt 16661986  T
Q  283 tgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtg 382  Q
    |||||||||| |||| | ||| || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16661987 tgatgtgtctctcctcacaattaaaggtgatgtctttgaagttaaagccacttctggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatgttg 16662086  T
Q  383 aactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaaga 482  Q
    |||||||||||  | || || || | |||||| || ||||| || | || |||  ||| | ||||  |||||||||||||| | || || | ||| || |    
T  16662087 aactactttgtgaaagaatttaataggaagaacaaagtggatatcactaggaatccaagagccttgaggaggttgagaacttcttgtgaaaaggcgaaaa 16662186  T
Q  483 ggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaat 582  Q
    ||||||||||||||   || |||||| || ||||| | |||| |||||   |||  || ||||| ||| ||||  | ||||||| ||||||||| |||||    
T  16662187 ggacactctctttcaaattggtcaccgctattgagattgattatttatacgaggacattgacttctctacatcactcactcgtgtcaagtttgaagaaat 16662286  T
Q  583 taatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatg 646  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||| | | |||| |||||||| ||   ||||||||||||    
T  16662287 caatatgggcctttttaacgagtgtatgaagattgttgagagttgttttgtggattcaaagatg 16662350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7542607 - 7542072
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||       
T  7542607 ctgtgacgaatgcagttgttactgtacctgcttattttaatgattctcaacgaaaagccactatagatgcgggtgccattgctggcctcaatgttatgag 7542508  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
       ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||   |||| |  | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  7542507 ggcaatgaatgaacctactgccgcagctgttgcatatggccttgacaagagaactgattatgatggagagcgaaatatttttgtttttgatcttggcggt 7542408  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||||||| | || |  || |||||      |||  |||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  7542407 ggcacttttgatgtgtctttactaacgattaagggcaacaacttccaagttaaggccactgctggcaacactcaccttggtggagaagactttgataata 7542308  T
Q  375 gaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagag 474  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||| |  ||||| || ||||||||||||  |||  ||||| ||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  7542307 gaatggcgaactactttgtacaagagttcaagagaaagaacaaagtggacattagtgggaatccaaaagccttgaggaggttgagaactgcttgtgagag 7542208  T
Q  475 ggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagttt 574  Q
    |||||| ||  |||| ||||||    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || | | | |||||||||    
T  7542207 ggcaaaaagatcactttctttccttgttgttgccactattgaggtagattctttatttcaaggcattgacttttcttcatcgatcaatagggccaagttt 7542108  T
Q  575 gaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatg 610  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7542107 gaggagatgaatatggatctttttaacgagtgtatg 7542072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 14703826 - 14703218
Alignment:
Q  38 aagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctacca 137  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||| ||   ||  |||| |||||||| |||||||| |||||||| || || | |||||||||  ||||||| || |    
T  14703826 aagatgcgagaaattgctgagacatatttagagtcaactgttaagaatgcagttgttacggtgcctgcttattttagtgattctcaaagaaaagccacta 14703727  T
Q  138 tagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtga 237  Q
    | ||||||||||  ||||| || || ||||| ||     |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||     
T  14703726 tggatgctggtgttattgccggcctcaatgttatgagggtaatgaatgaacctacagctgcagctattgcatatggccttgacaagagaactgattatgg 14703627  T
Q  238 tcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgct 337  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| |||||    |||||  || | || || ||||||    
T  14703626 tggagaacgtaatatatttgtctttgatcttggtggtggtacttttgacgtgtctctcctaacaattaagggcaccgtcttccaaattaaggctactgct 14703527  T
Q  338 ggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacg 437  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |  || || |   |||||||||||   ||      
T  14703526 ggaaacactcacctcgggggagaggacttcgataacagaatggtgaactactttgttcaagagttcaagagaaaaaacagattggacattagtggaaatc 14703427  T
Q  438 caaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcaggg 537  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  14703426 caaaagccttaaggagcttgagaaccgcttgcgagagggcaaaaagaacactttctttccaagttgtcgccactattgaggtagatgctttatttcaatg 14703327  T
Q  538 aatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgat 637  Q
     || |||||||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || |||||| || | | |||| |||||||||||| ||||    
T  14703326 cattgacttttcttcatcgatcaatagggccaagtttgaagaaatgaatatggacttttttaatgagtgtgtgaagattgttgagagttgtcttattgat 14703227  T
Q  638 tcaaagatg 646  Q
     | ||||||    
T  14703226 gctaagatg 14703218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 80 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 12235065 - 12234499
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||     |||    
T  12235065 aagaatgcagttgttaccgtgcctgcttatttcaatgattctcaacgaaaagcaactatagatgctggtgtcattgctggcctcaatgttatgagggtaa 12234966  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtac 279  Q
    | |||||||| |  || || ||| ||||||||||| |||||||||||| |||  ||| | |  |||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||    
T  12234965 tgaacgaacccatggcagccgctgttgcatatggtcttgacaagagaactgattgtgttggagaacgaaatatttttgtttttgatctcggcggtggcac 12234866  T
Q  280 ttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| |||  ||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12234865 ttttgatgtgtctctcctaacaatcaaaggtaatgtcttccaagttaaagccacagccggaaacactcacctcgggggagaggactttgataacagaatg 12234766  T
Q  380 gtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaa 479  Q
    || |||||| |||   | |||||||| |  ||||| || |||||||| |||   ||  ||||| ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12234765 gtaaactaccttgctcaagagttcaatagaaagaaaaaagtggacatgagtggaaatccaaaagccttgaggaggttaagaactgcttgtgagagggcaa 12234666  T
Q  480 agaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgagga 579  Q
    | ||  || | ||||||    ||||  | ||  |||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||| || | | | ||||||||||||||    
T  12234665 aaagatcattgtctttccttgttgttgcaaccattgaggtagattctttatttgaaggcattgatttttcttcatcgatcaatagggccaagtttgagga 12234566  T
Q  580 aattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatg 646  Q
    ||| |||||||| ||| | |  ||||||||| | | |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12234565 aatgaatatggatcttcttattgagtgtatgaagattgttgagagttgtcttagtgatgctaagatg 12234499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 580
Target Start/End: Original strand, 12245198 - 12245698
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||     |||    
T  12245198 aagaatgctgttgttactgtacctgcttattttagtgattctcagcgaaaagcaacgatagatgctggctcaattgctggtctcaatgttatgagggtaa 12245297  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtac 279  Q
    | || ||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||  |||  ||| | |  || |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  12245298 tgaatgaacccactgctgcagctgttgcatatggccttgaaaagagagctgattgtgttggagaaagaaacatttttgtgtttgatcttggtggtggcac 12245397  T
Q  280 ttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    |||||| || |||||||| |  || |||| |    ||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  12245398 ttttgacgtttctatcctaactattaaggataacatcttccaagttaaggccactgctggaaacactcaccttggaggagaggattttgataatagaatg 12245497  T
Q  380 gtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaa 479  Q
    || |||||||||| | |||||||||| |  ||||| ||  |||| ||||||   |   ||||| ||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  12245498 gtaaactactttgcacaggagttcaagagaaagaacaaattggatattagtgcaagttcaaaagccttgaggagattgagaactgcttgtgagagggcaa 12245597  T
Q  480 agaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgagga 579  Q
    | || | ||| || ||     ||||  | ||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || | ||| || |||||||||||    
T  12245598 aaagaatactttcgtttcttgttgttgcaactattgaggtagattctttatttcaaggcattgatttttcttcatccatcaatcgggcaaagtttgagga 12245697  T
Q  580 a 580  Q
    |    
T  12245698 a 12245698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 405
Target Start/End: Original strand, 12258373 - 12258698
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||  | ||||| || |||||||  |||   |||| ||| || ||||| ||  | |||     
T  12258373 aagaatgcagttgttactgtgcctgcatattttagtgattcacaaaggaaagccactatagatgtgggtaatattgttggcctgaatgttatgaagatat 12258472  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaa-cgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggta 278  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| | |  ||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  12258473 taaatgaacctactgctgcagcttttgcatatggccttgacaaaagaattaattgtg-tcgaaaaacggaatatttttgtctttgatcttggtggtggca 12258571  T
Q  279 cttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaat 378  Q
    |||||||||||||| | || |  || |||| |  ||||||| |||| || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  12258572 cttttgatgtgtctctactaaccattaaggataatgtctttcaagttaaggctacagctggaaacacgcaccttggaggagaggactttgataatagaat 12258671  T
Q  379 ggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12258672 ggtgagttactttgtagaagagttcaa 12258698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Original strand, 17716485 - 17716626
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||| || ||||||| |   |||||||||| |||||||| |||||| ||||   ||| |    
T  17716485 aagaatgccgttgttactgtccctgcttactttaatttttctcagagacaagctactaagcatgctggtgctattgctggtcttaatttcatgagaatta 17716584  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgaca 221  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17716585 ttaatgagcccactgctgcagccattgcttatggttttgaca 17716626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 509 - 632
Target Start/End: Original strand, 12258802 - 12258925
Alignment:
Q  509 actgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgta 608  Q
    ||| ||||| |||||||||||| | | || || || |||||| |||| || | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || || |    
T  12258802 actattgagatagattctttatgtgatggcattgatttttctgcatcaatcaatcgtgccaagtttgaggaaataaatttggaacttttcaatgaatgca 12258901  T
Q  609 tggaaactgttaagagttgtctta 632  Q
    || | |||||| ||||||||||||    
T  12258902 tgaagactgttgagagttgtctta 12258925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 17717748 - 17717887
Alignment:
Q  82 gaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatc 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  | ||| ||| |  ||||| | |    ||||||| |||||||||||  |||| |||    
T  17717748 gaatgccgttgttactgtccctgcttactttaatgattctcagatacaagttactaaggatgccgctctttttgctggtcttaatgtcatggaaattatc 17717847  T
Q  182 aacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgaca 221  Q
     | || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17717848 gatgagcccactgctgcagccattgcttatggttttgaca 17717887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 11999770 - 11999283
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||  ||||||||||| || || || || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||     |||    
T  11999770 aagaatgttgttgttactgtaccagcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgccggtgcaattgctggcatcaatgttataagggtaa 11999671  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtac 279  Q
    | || ||||| ||||||||| || ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| | |  || |||| || || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  11999670 tgaatgaacccactgctgcaactgttgcatatggccttgacaagagagctgattgtgttggagaaagaaacattttagtctttgatcttggcggtggcac 11999571  T
Q  280 ttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    ||||||| ||||||| || | ||| ||||    ||||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||           
T  11999570 ttttgatttgtctatactaacaattaaggacaatgtcttccaagttaaggccacagctggaaacactcacttcggaggagaggattttgataa------- 11999478  T
Q  380 gtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaa 479  Q
          ||||||||| | |||||||| |  |||||  | ||||| ||||||   |   ||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11999477 ------tactttgtacaagagttcaagataaagaacgaagtggatattagtggaagttcaaaagccttgaggaggttgagaactgcttgtgagagggcaa 11999384  T
Q  480 agaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgagga 579  Q
    | || | ||| || ||     ||||  | ||| |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || | ||| || |||||||||||    
T  11999383 aaagaatactatcatttcttgttgttgcaactattgaggtagattctttatttcaaggcattgatttttcttcatccatcaatcgggcaaagtttgagga 11999284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 288
Target Start/End: Original strand, 17716657 - 17716687
Alignment:
Q  258 tctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17716657 tctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 17716687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 288
Target Start/End: Original strand, 17717918 - 17717948
Alignment:
Q  258 tctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17717918 tctttgaccttggtggtggtacttttgatgt 17717948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 171
Target Start/End: Original strand, 17703843 - 17703932
Alignment:
Q  82 gaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcat 171  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||| |  ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  17703843 gaatgctgttgttactgtccctgtttactttaataattctcagagacaagctactaaggatgctgctgttattgctgaacttaatgtcat 17703932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 680
Target Start/End: Original strand, 9335609 - 9336283
Alignment:
Q  6 gtgctgaggaaatatcatcgataatccttacaaagatgagagaagttgctgaaacatatctaacttcgtctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgc 105  Q
    |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |    ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9335609 gtgctgaggaaatatcttctatgttgcttacaaagatgagagaggttgcggaggcatatttggggtcgccggtcaagaatgccgttgttaccgtgccagc 9335708  T
Q  106 atacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctatt 205  Q
     ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9335709 ttacttcaatgattctcagcgaaaggccaccatagatgctggtactattgctggccttaatgtcattcggataatcaatgaacctactgctgcagctatt 9335808  T
Q  206 gcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatca 305  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  9335809 gcatatggccttgataagagaaatgactgtgatggtaaccgaaatatttttgtctttgatctgggtggcggtacttttgatgtgtctatcctcacaatta 9335908  T
Q  306 agggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaa 405  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||    
T  9335909 agggtgatctatttgaagtaaaagccaccgcaggaaacacgcaccttggaggcgaggactttgataacagaatggttaactattttgtggaagagttaaa 9336008  T
Q  406 aaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtc 505  Q
    |||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||     
T  9336009 aaagaagaataaagtggacatcaagcagaacccaaaatccttaaggaggttgagaactgcctgtgagagggcaaaaaggatactgtcttttgcttttgtt 9336108  T
Q  506 accactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagt 605  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||    
T  9336109 accactgttgaggtagatgctttatttatgggaatcgacttttcttcatcaatcactcgtgccaaatttgaggaacttaacatggactttttcaatgagt 9336208  T
Q  606 gtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaagatgcgcgggagtgatattgatgatgttgttcttgtgg 680  Q
    ||||| | | |||| | |  ||||| || |||||||||||   |  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9336209 gtatgaatattgttgacacctgtctcagggattcaaagatatacaagagtaatattgatgatattgttcttgtgg 9336283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 30775613 - 30775065
Alignment:
Q  95 actgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactg 194  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||| || || || ||||    
T  30775613 actgtgcctgcttatttcaatgatgcacagcgaaaagccactatggatgctggtgccattgctggtcttaatgttatgagaataattaatgagcccactg 30775514  T
Q  195 ctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctat 294  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||||| ||    |||||  | |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30775513 cagcagctattgcatatggacttgagaagagaggtaggtgtgatgctgagaggaatatttttgtctttgatcttggtggtgggacttttgatgtgtctct 30775414  T
Q  295 ccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgta 394  Q
     || |  || |  | || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  30775413 tctcaccattagagatgatgtgtttgaagttaaagcaactgctggaaacactcacatcgggggagaggactttgataacagaatgttgaattactttgta 30775314  T
Q  395 gaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctt 494  Q
    ||||| || || | |||||| || ||||||||||    |||  ||| | | ||  |   |||||||||||| || || | |||||| ||||||||||| |    
T  30775313 gaggaatttaagacgaagaacaacgtggacattaccgggaatccaagagctttgagacagttgagaactgcatgtgaaaaggcaaaaaggacactctcct 30775214  T
Q  495 tcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggacct 594  Q
    ||   ||| ||||   ||||||| |||||  ||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30775213 tcaagtttctcacatttgttgagatagataatttatttcaagacattgacttttcttcatcaatcactcgtgtcaagtttgaggaaatcaatatggacct 30775114  T
Q  595 tttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtgattcaaag 643  Q
    ||| || ||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30775113 ttttaatgagtgtatacagactgttgagagttgtcttactgattcaaag 30775065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35132829 - 35132303
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||       
T  35132829 ctgttaagaatgcagttgttactgtgcctgcttattttagtgattctcaacgaaaagccactatagatgctggtgctattgctggtcccaatgttatgag 35132730  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
    | |||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| | |  ||| |||||| |||||||| || |||||||||    
T  35132729 agtaatgaatgaacctactgccgcagcggttgcatatggccttgacaagagatctgattgtgctggagaacaaaatatttttgtcttcgatcttggtggt 35132630  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataaca 374  Q
    || ||||||||||| || || ||||  || |||| |  ||||||  |||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  35132629 ggcacttttgatgtttcaatacttactattaaggataatgtcttccaagttaaggccactgccggaaacactcatctcggtggagaggactttgataaca 35132530  T
Q  375 gaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagag 474  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||| || || |||||||||  |||  ||||| ||         ||||||||||||||| ||||    
T  35132529 gaatggtgaactactttgtacaagagttcaagagaaagaacaaagtagacattagtgggaattcaaaagcc---------ttgagaactgcctgctagag 35132439  T
Q  475 ggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagttt 574  Q
    |||||||||  |||| ||||||    ||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  35132438 ggcaaagagatcactttctttccttgttgttgccaatattgaagtagattctttatttcaaggcattgatttttcttcatcaatcaatcgcgccaagttt 35132339  T
Q  575 gaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatg 610  Q
    |||||||| |||   |||||||| || |||||||||    
T  35132338 gaggaaatgaatgcagacctttttaatgagtgtatg 35132303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Original strand, 23596377 - 23596521
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||||| |  |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||   ||| |    
T  23596377 aagaatgccgttgtaaccgtgcctgcatacttcaacgattcacaacgtcaagctactaaggatgctggtgtcatttctggactcaatgtgatgagaatta 23596476  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaaga 224  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  23596477 ttaacgagcccactgctgccgctattgcttatggtcttgataaga 23596521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 224
Target Start/End: Original strand, 23587525 - 23587669
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||| | |||||| |||| |||| ||||||| |||||  |   ||| |    
T  23587525 aagaatgccgttgtaactgtgcctgcttacttcaacgattcacaacgtcaagctacaaaagatgccggtgtcatttctggactcaatgtgttgagaatta 23587624  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaaga 224  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  23587625 ttaatgaacctaccgctgctgctattgcttatggtcttgataaga 23587669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 54396802 - 54396729
Alignment:
Q  77 gtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgc 150  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||    
T  54396802 gtgaagaatgctgttgttactgttcctgcttatttcaatgattctcaacgtcaagctacgaaagatgctggtgc 54396729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 329 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 28220045 - 28219744
Alignment:
Q  329 gccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacatta 428  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  28220045 gccaccgctggaaacactcacctcgggggagaggactttgatagtaggatggtgaactacttcgcagaggagtttaagaagaagaacaaggtggacatta 28219946  T
Q  429 gtaagaacgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattcttt 528  Q
     |   ||| ||| | ||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  28219945 ctggaaactcaagagccttaaggaggttgagaacagcgtgcaagagagcaaaaaggacactatcttttgctgttgtcgccaccattgaggtagattcttt 28219846  T
Q  529 atttcagggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgt 628  Q
    |||| | || || || || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||    
T  28219845 atttgaaggcattgatttcttttcatcaattactcgtgctaagtttgaggaaatcaatatggatcttttcaatgagtgtttgaaaactgttgagaggtgt 28219746  T
Q  629 ct 630  Q
    ||    
T  28219745 ct 28219744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28220332 - 28220099
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||||  |       
T  28220332 ctgtcaagaatgcagttattactgtgcctgcttatttcaatgattatcagcggaaagccaccatagatgcaggtaccattgctggtctaaatgttctaag 28220233  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtg-atcgta-aacgaaatatatttgtctttgaccttggtg 272  Q
     ||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| |  || || || | | |||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  28220232 gatagtcaatgaacccactgctgctgctattgcatatggattggacaaaagaact--aactgcatgggagaacgaaatattttcatctttgacctgggtg 28220135  T
Q  273 gtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagg 308  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  28220134 gtgggacttttgatgtgtctctccttagaataaagg 28220099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 336 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 43744936 - 43744626
Alignment:
Q  336 ctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaa 435  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| || |||||||||| |   ||    
T  43744936 ctggaaacactcacctcggaggagaggattttgataataggatggtgaactacttcgcagaggagtttaagaagaagaacaaggtggacattactggaaa 43744837  T
Q  436 cgcaaaacccttatggaggttgagaactgcctgcgagagggcaaagaggacactctctttcgcctttgtcaccactgttgaggtagattctttatttcag 535  Q
    | ||| | | ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43744836 cccaagagcattaaggaggttgagaacagcatgcgaaagagcaaaaaggacattatcttttgctgttgtcaccactattgaggtagattctttatttgag 43744737  T
Q  536 ggaatagacttttcttcatctattactcgtgccaagtttgaggaaattaatatggaccttttcaacgagtgtatggaaactgttaagagttgtcttagtg 635  Q
    || || || || | | || | || |||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||| ||    
T  43744736 ggcattgatttctttacaacaatcactcgtactaagtttgaggaaatcaatatggatctcttcaacgagtgtttgaaaattgttgagagttgtcttactg 43744637  T
Q  636 attcaaagatg 646  Q
    || | ||||||    
T  43744636 atgccaagatg 43744626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43745228 - 43744997
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |    
T  43745228 ctgtcaagaatgcagttgttactgtgccggcttatttcaatgattatcagcggaaagccac--tagatgctggtgccattgctgggcttgatgttatgaa 43745131  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggt 274  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| | |   ||  ||   | ||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  43745130 gataatcaatgaacccactgctgcagctattgcatatggtctggaaaagagaactaactctgtgcgaggaagaaatattttcatctttgacctgggtggt 43745031  T
Q  275 ggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagg 308  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  43745030 gggacttttgatgtgtctctccttacaattaagg 43744997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12528700 - 12528471
Alignment:
Q  260 tttgaccttggtggtggtacttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggag 359  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| | | |||  |  |||||| ||||| || |||||||| ||| |||| ||||| || ||||    
T  12528700 tttgaccttggcggtggaacttttgatgtgtctcttcttacagtaaagaataatgtcttcgaagtcaaggccactgccggagacactcaccttggaggag 12528601  T
Q  360 aggactttgataacagaatggtgaactactttgtagaggagttcaaaaagaagaataatgtggacattagtaagaacgcaaaacccttatggaggttgag 459  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||  | ||||| || | |||||| || || ||||||| |  |||| ||||| || || |||| |||||    
T  12528600 aggactttgataatcgaatggtgaatcactttgtgaaagagtttaagaggaagaacaaagttgacattattgggaactcaaaagccctaaggagattgag 12528501  T
Q  460 aactgcctgcgagagggcaaagaggacact 489  Q
    ||||  |||||||| ||| || ||||||||    
T  12528500 aactaactgcgagaaggcgaaaaggacact 12528471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12528885 - 12528747
Alignment:
Q  75 ctgtgaagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattca 174  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||| || || ||||||||||| ||||||  ||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||| || |     
T  12528885 ctgttaagaatgcagtgattacggtgccagcgtatttcaatgattcgcagcgacgagccaccaaggatgctggtgtcattgctggcctcaatgtaatacg 12528786  T
Q  175 aataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatatgg 213  Q
     |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  12528785 gataatcaacgaaccaactgcagctgctcttgcatatgg 12528747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28910958 - 28910650
Alignment:
Q  80 aagaatgccgttgttactgtgcctgcatacttcaatgattctcagcgaaaagctaccatagatgctggtgccattgctggacttaatgtcattcaaataa 179  Q
    ||||||||  |||||||| || |||  || |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| || |  ||||    
T  28910958 aagaatgcaattgttactttgactggttatttcaatgattcttagaggaaagccaccatagatgctggtgccattgtcaggcttaatgttatgcggataa 28910859  T
Q  180 tcaacgaacctactgctgcagctattgcatatggttttgacaagagaagtgaaagtgatcgtaaacgaaatatatttgtctttgaccttggtggtggtac 279  Q
    |||| || |  ||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||  |||  ||| | |  |||||||||  ||  |||| ||||| ||| |||| ||    
T  28910858 tcaatgagctcactgctgtagctatttcatatggcctcgacaagagagctgagtgtgctggagaacgaaatactttcatcttcgacctgggtagtgggac 28910759  T
Q  280 ttttgatgtgtctatccttaaaatcaagggtggtgtctttgaagtaaaagccactgctggaaacacccacctaggtggagaggactttgataacagaatg 379  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||  ||| |   |||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |  |||||| ||||||| || |||    
T  28910758 ttttgatgtttctctccttacaattcaggataaggtcttccaagttaaggccaccgctggaaacactcacctcggggtcgaggacattgataataggatg 28910659  T
Q  380 gtgaactac 388  Q
    |||||||||    
T  28910658 gtgaactac 28910650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Original strand, 11314610 - 11314659
Alignment:
Q  162 ttaatgtcattcaaataatcaacgaacctactgctgcagctattgcatat 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  11314610 ttaatgtcatgcaaataatcaatgaacctagtgctgcagccattgcatat 11314659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University