View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1526-2-Insertion-2 (Length: 497)

Name: NF1526-2-Insertion-2
Description: NF1526-2
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1526-2-Insertion-2
NF1526-2-Insertion-2
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (10-403)||(29518686-29519078)
chr6 (179-403)||(2378060-2378284)
chr6 (171-403)||(3409586-3409818)
chr6 (178-416)||(16454837-16455078)
chr6 (237-403)||(29518495-29518661)
chr6 (237-403)||(32741171-32741337)
chr6 (200-403)||(2578443-2578647)
chr6 (205-414)||(10074352-10074560)
chr6 (237-393)||(3409251-3409407)
chr6 (179-405)||(10073989-10074215)
chr6 (237-427)||(35210196-35210384)
chr6 (141-417)||(2579478-2579753)
chr6 (236-414)||(3415449-3415629)
chr6 (245-416)||(2579860-2580030)
chr6 (247-399)||(16107680-16107832)
chr6 (237-427)||(3058218-3058409)
chr6 (125-402)||(16107943-16108208)
chr6 (237-415)||(1127352-1127530)
chr6 (238-403)||(1846741-1846906)
chr6 (247-403)||(2377756-2377912)
chr6 (237-393)||(26544041-26544197)
chr6 (237-403)||(14748342-14748504)
chr6 (179-428)||(10073592-10073838)
chr6 (247-403)||(16454577-16454733)
chr6 (125-427)||(2579087-2579387)
chr6 (220-416)||(2578822-2579016)
chr6 (245-416)||(593694-593867)
chr6 (251-403)||(2843560-2843713)
chr6 (247-425)||(5832007-5832182)
chr6 (250-353)||(32460630-32460733)
chr6 (248-388)||(1950200-1950340)
chr6 (248-400)||(6999799-6999951)
chr6 (251-370)||(9062383-9062501)
chr6 (245-395)||(10911565-10911716)
chr6 (207-364)||(8481888-8482045)
chr6 (245-416)||(12071678-12071849)
chr6 (178-370)||(6071063-6071257)
chr6 (245-416)||(12085021-12085191)
chr6 (12-108)||(10074240-10074336)
chr6 (245-415)||(12092470-12092640)
chr6 (240-395)||(5958615-5958766)
chr6 (10-108)||(2377937-2378034)
chr6 (146-304)||(33605879-33606034)
chr6 (249-414)||(17135058-17135223)
chr6 (205-314)||(35210449-35210547)
chr6 (179-361)||(2975486-2975668)
chr6 (245-426)||(31714671-31714849)
chr6 (10-108)||(3409470-3409567)
chr6 (10-89)||(2579387-2579467)
chr6 (10-80)||(2578739-2578810)
chr6 (349-395)||(3409405-3409451)
chr6 (10-89)||(16107863-16107943)
chr6 (8-100)||(26544230-26544321)
chr6 (178-236)||(12092201-12092262)
chr6 (252-415)||(30618606-30618766)
chr6 (316-357)||(22605301-22605342)
chr6 (316-364)||(11637760-11637808)
chr6 (10-89)||(16454758-16454838)
chr6 (10-78)||(2579779-2579848)
chr6 (316-357)||(21130103-21130144)
chr6 (337-396)||(10902437-10902496)
chr6 (321-363)||(11638053-11638095)
chr6 (282-328)||(14789279-14789325)
chr6 (70-108)||(14789403-14789441)
chr6 (13-62)||(2579033-2579082)
[»] chr7 (86 HSPs)
chr7 (112-371)||(7553891-7554151)
chr7 (154-403)||(37533011-37533258)
chr7 (182-403)||(30244204-30244428)
chr7 (167-400)||(14681431-14681663)
chr7 (245-428)||(7517580-7517763)
chr7 (245-427)||(1085593-1085774)
chr7 (124-393)||(45434514-45434784)
chr7 (194-403)||(30245024-30245231)
chr7 (239-427)||(29157559-29157747)
chr7 (245-403)||(23377-23535)
chr7 (237-403)||(37533364-37533530)
chr7 (247-415)||(45433243-45433411)
chr7 (252-403)||(11845198-11845349)
chr7 (174-364)||(22566702-22566893)
chr7 (245-398)||(36939738-36939891)
chr7 (245-425)||(22567017-22567196)
chr7 (247-392)||(45754718-45754862)
chr7 (253-393)||(19122740-19122879)
chr7 (245-403)||(40094774-40094932)
chr7 (247-403)||(6054562-6054718)
chr7 (245-403)||(24177435-24177593)
chr7 (251-401)||(34218036-34218186)
chr7 (129-371)||(1085280-1085526)
chr7 (245-427)||(118277-118459)
chr7 (250-403)||(30032572-30032725)
chr7 (247-416)||(47129097-47129265)
chr7 (248-395)||(9901648-9901793)
chr7 (245-427)||(8128417-8128599)
chr7 (245-426)||(36622960-36623140)
chr7 (245-365)||(16569196-16569316)
chr7 (245-365)||(16596346-16596466)
chr7 (248-380)||(24838724-24838857)
chr7 (10-99)||(37532897-37532986)
chr7 (245-366)||(43241495-43241616)
chr7 (179-314)||(30244632-30244770)
chr7 (245-395)||(40230299-40230449)
chr7 (179-308)||(30245425-30245557)
chr7 (10-96)||(37533253-37533339)
chr7 (245-403)||(41854635-41854792)
chr7 (326-427)||(47129450-47129549)
chr7 (248-393)||(20599317-20599464)
chr7 (266-401)||(37167808-37167937)
chr7 (287-403)||(30253534-30253646)
chr7 (216-308)||(30255308-30255402)
chr7 (245-394)||(36534795-36534942)
chr7 (179-295)||(40094502-40094617)
chr7 (146-402)||(37345819-37346074)
chr7 (248-395)||(41910594-41910749)
chr7 (291-427)||(28300229-28300366)
chr7 (245-333)||(28301613-28301701)
chr7 (125-241)||(48243241-48243356)
chr7 (333-401)||(37532753-37532821)
chr7 (245-318)||(36109002-36109075)
chr7 (328-395)||(28300576-28300644)
chr7 (10-117)||(22566905-22567013)
chr7 (346-427)||(30244453-30244533)
chr7 (346-427)||(30253671-30253751)
chr7 (355-427)||(7517767-7517839)
chr7 (355-427)||(7518033-7518105)
chr7 (250-350)||(44361517-44361616)
chr7 (316-363)||(21416181-21416228)
chr7 (316-362)||(23569043-23569089)
chr7 (199-363)||(4124128-4124293)
chr7 (178-258)||(10342191-10342271)
chr7 (13-106)||(14681323-14681415)
chr7 (8-93)||(28300470-28300554)
chr7 (179-264)||(45697845-45697929)
chr7 (239-282)||(14681281-14681324)
chr7 (113-210)||(47129343-47129439)
chr7 (346-427)||(30245256-30245336)
chr7 (287-403)||(15902342-15902457)
chr7 (60-108)||(45697752-45697800)
chr7 (381-428)||(7517982-7518029)
chr7 (247-310)||(36967323-36967385)
chr7 (340-394)||(4719305-4719359)
chr7 (10-80)||(37345764-37345834)
chr7 (328-390)||(45755010-45755072)
chr7 (316-357)||(21619091-21619132)
chr7 (316-392)||(40094424-40094500)
chr7 (171-242)||(37532822-37532892)
chr7 (10-80)||(40094672-40094742)
chr7 (27-89)||(48243356-48243419)
chr7 (183-238)||(28300365-28300422)
chr7 (316-357)||(27391815-27391856)
chr7 (10-82)||(8128343-8128415)
chr7 (313-353)||(48071454-48071494)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (134-427)||(37990615-37990908)
chr3 (179-422)||(22304502-22304747)
chr3 (130-427)||(54017793-54018090)
chr3 (199-401)||(42342092-42342296)
chr3 (112-377)||(3135099-3135364)
chr3 (167-386)||(4823578-4823796)
chr3 (174-395)||(15773119-15773344)
chr3 (128-395)||(21832353-21832614)
chr3 (158-403)||(41359765-41360008)
chr3 (247-401)||(43346793-43346947)
chr3 (195-403)||(29644581-29644792)
chr3 (247-403)||(35946524-35946680)
chr3 (245-415)||(29644890-29645060)
chr3 (245-427)||(42342364-42342546)
chr3 (245-415)||(12114550-12114720)
chr3 (247-413)||(37990967-37991133)
chr3 (236-397)||(39934961-39935124)
chr3 (154-393)||(11661858-11662099)
chr3 (247-393)||(32462910-32463057)
chr3 (237-400)||(39389062-39389225)
chr3 (245-427)||(15772854-15773035)
chr3 (179-392)||(32462569-32462786)
chr3 (210-403)||(22303955-22304143)
chr3 (245-403)||(32589704-32589861)
chr3 (245-403)||(33803252-33803410)
chr3 (247-403)||(25755396-25755552)
chr3 (245-403)||(25739425-25739583)
chr3 (245-403)||(54018198-54018356)
chr3 (247-392)||(52634678-52634822)
chr3 (237-403)||(50612447-50612618)
chr3 (179-395)||(9240083-9240299)
chr3 (245-403)||(53577364-53577522)
chr3 (207-300)||(22304208-22304301)
chr3 (245-400)||(45395656-45395811)
chr3 (245-404)||(31190017-31190168)
chr3 (247-403)||(3135454-3135617)
chr3 (245-392)||(39914252-39914399)
chr3 (247-404)||(45901715-45901873)
chr3 (10-119)||(22303820-22303929)
chr3 (246-403)||(53117975-53118131)
chr3 (245-427)||(1634291-1634473)
chr3 (247-396)||(49336693-49336843)
chr3 (245-363)||(8327904-8328022)
chr3 (303-427)||(22303634-22303759)
chr3 (237-403)||(37726496-37726654)
chr3 (319-427)||(41359467-41359575)
chr3 (245-403)||(44160547-44160702)
chr3 (237-393)||(51886553-51886703)
chr3 (255-428)||(42584799-42584970)
chr3 (247-428)||(33175634-33175820)
chr3 (226-406)||(47964516-47964694)
chr3 (234-352)||(3384317-3384435)
chr3 (271-369)||(33362327-33362425)
chr3 (248-337)||(7767380-7767469)
chr3 (245-415)||(39336219-39336387)
chr3 (10-78)||(53577548-53577616)
chr3 (354-427)||(22304302-22304376)
chr3 (287-371)||(39336002-39336086)
chr3 (245-301)||(43346650-43346706)
chr3 (10-108)||(22304378-22304476)
chr3 (316-403)||(54017548-54017635)
chr3 (247-363)||(11661537-11661638)
chr3 (245-363)||(47964955-47965073)
chr3 (248-353)||(46546375-46546480)
chr3 (124-234)||(8328259-8328368)
chr3 (10-108)||(41360014-41360111)
chr3 (349-402)||(8328374-8328427)
chr3 (10-79)||(15773037-15773106)
chr3 (10-93)||(33803143-33803227)
chr3 (295-355)||(52634990-52635050)
chr3 (316-363)||(53596031-53596078)
chr3 (316-363)||(53596346-53596393)
chr3 (10-64)||(53577667-53577721)
chr3 (327-403)||(7766783-7766857)
chr3 (178-277)||(12747878-12747978)
chr3 (287-392)||(12749211-12749316)
chr3 (316-357)||(17731950-17731991)
chr3 (316-357)||(19033181-19033222)
chr3 (247-363)||(25991405-25991521)
chr3 (316-363)||(53596546-53596593)
chr3 (124-194)||(8328154-8328222)
chr3 (325-432)||(43978836-43978947)
chr3 (199-241)||(52634889-52634931)
chr3 (248-377)||(25317161-25317290)
chr3 (24-73)||(29644811-29644860)
chr3 (14-78)||(54018104-54018169)
chr3 (200-269)||(2299930-2300000)
chr3 (53-108)||(4823507-4823563)
chr3 (316-359)||(48127859-48127902)
chr3 (316-357)||(16869843-16869884)
chr3 (316-357)||(16871005-16871046)
chr3 (316-357)||(17735037-17735078)
chr3 (316-357)||(19036306-19036347)
chr3 (250-306)||(36986045-36986101)
chr3 (250-306)||(37011484-37011540)
chr3 (178-222)||(47964715-47964758)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (179-425)||(6500756-6501002)
chr5 (112-389)||(13415774-13416051)
chr5 (237-427)||(6500443-6500632)
chr5 (124-395)||(624077-624346)
chr5 (132-416)||(3295002-3295287)
chr5 (245-427)||(40296292-40296473)
chr5 (179-425)||(26074543-26074792)
chr5 (237-403)||(32487386-32487551)
chr5 (247-427)||(42405574-42405752)
chr5 (218-428)||(26074121-26074330)
chr5 (237-427)||(27502013-27502202)
chr5 (237-395)||(18603128-18603286)
chr5 (238-403)||(41170627-41170792)
chr5 (172-415)||(24489194-24489434)
chr5 (242-402)||(36492218-36492378)
chr5 (245-403)||(15370099-15370257)
chr5 (248-427)||(25327938-25328117)
chr5 (245-425)||(41632782-41632961)
chr5 (248-403)||(3295345-3295498)
chr5 (252-403)||(11416977-11417128)
chr5 (247-427)||(1028493-1028673)
chr5 (247-415)||(6224198-6224366)
chr5 (246-395)||(299490-299639)
chr5 (194-366)||(26074818-26074993)
chr5 (255-395)||(34753033-34753173)
chr5 (236-403)||(9498655-9498821)
chr5 (245-427)||(36568545-36568725)
chr5 (245-403)||(12662652-12662810)
chr5 (247-395)||(26075169-26075318)
chr5 (245-404)||(35150007-35150165)
chr5 (237-403)||(623810-623976)
chr5 (257-395)||(33747783-33747921)
chr5 (271-416)||(15370428-15370573)
chr5 (178-353)||(36521946-36522121)
chr5 (206-397)||(38427518-38427699)
chr5 (237-383)||(5723811-5723957)
chr5 (178-363)||(31509554-31509742)
chr5 (242-380)||(29549278-29549416)
chr5 (182-403)||(36522237-36522459)
chr5 (245-399)||(26590914-26591068)
chr5 (247-389)||(300961-301095)
chr5 (237-320)||(7768842-7768925)
chr5 (247-340)||(42508614-42508707)
chr5 (247-395)||(35167846-35167994)
chr5 (248-414)||(2411010-2411176)
chr5 (331-413)||(26900007-26900089)
chr5 (10-106)||(6500634-6500729)
chr5 (248-368)||(35914852-35914972)
chr5 (259-377)||(31509745-31509864)
chr5 (179-280)||(13785732-13785833)
chr5 (247-325)||(26074320-26074398)
chr5 (11-108)||(9498534-9498629)
chr5 (329-381)||(795254-795306)
chr5 (332-392)||(38427306-38427366)
chr5 (316-363)||(13042610-13042657)
chr5 (9-96)||(32487575-32487661)
chr5 (247-326)||(39309686-39309764)
chr5 (248-370)||(41635224-41635346)
chr5 (247-340)||(42524719-42524811)
chr5 (315-383)||(9498343-9498411)
chr5 (124-234)||(35150607-35150719)
chr5 (158-240)||(9498411-9498493)
chr5 (248-305)||(6225047-6225104)
chr5 (237-285)||(5660290-5660338)
chr5 (316-359)||(13112608-13112651)
chr5 (317-404)||(13785631-13785718)
chr5 (347-390)||(24489583-24489626)
chr5 (10-80)||(26075063-26075133)
chr5 (325-363)||(13042784-13042822)
chr5 (325-363)||(13112782-13112820)
chr5 (245-287)||(35150747-35150789)
chr5 (245-287)||(35151038-35151080)
chr5 (310-363)||(32445950-32446003)
chr5 (316-381)||(36527117-36527182)
chr5 (313-357)||(34103622-34103666)
chr5 (213-257)||(15370380-15370426)
chr5 (10-92)||(38427403-38427486)
chr5 (327-357)||(5963765-5963795)
chr5 (237-294)||(22298956-22299014)
chr5 (350-403)||(35150810-35150863)
chr5 (10-93)||(13416033-13416116)
chr5 (52-108)||(13785879-13785935)
chr5 (282-370)||(19275566-19275653)
chr5 (188-236)||(31865902-31865950)
chr5 (313-357)||(41340347-41340391)
[»] chr8 (89 HSPs)
chr8 (158-415)||(3669973-3670229)
chr8 (167-399)||(1013875-1014107)
chr8 (236-403)||(3669678-3669845)
chr8 (131-401)||(40518470-40518738)
chr8 (235-415)||(30441071-30441255)
chr8 (179-395)||(30359540-30359759)
chr8 (247-401)||(3038292-3038446)
chr8 (196-413)||(34835160-34835377)
chr8 (247-402)||(34834878-34835033)
chr8 (200-413)||(34835427-34835643)
chr8 (200-413)||(34835693-34835909)
chr8 (197-405)||(6731856-6732055)
chr8 (145-395)||(9482612-9482857)
chr8 (128-403)||(8918764-8919039)
chr8 (195-403)||(9309303-9309512)
chr8 (237-399)||(1014249-1014411)
chr8 (179-403)||(45122564-45122782)
chr8 (179-403)||(45122937-45123164)
chr8 (245-415)||(45121898-45122068)
chr8 (134-395)||(18371669-18371925)
chr8 (247-427)||(30359273-30359454)
chr8 (245-393)||(45122067-45122215)
chr8 (248-403)||(147454-147609)
chr8 (124-393)||(147712-147968)
chr8 (237-427)||(20870550-20870741)
chr8 (247-403)||(40518071-40518229)
chr8 (247-406)||(25561812-25561972)
chr8 (247-395)||(37544498-37544646)
chr8 (182-395)||(45121664-45121878)
chr8 (245-404)||(9608745-9608904)
chr8 (270-416)||(9483174-9483320)
chr8 (245-403)||(6876862-6877021)
chr8 (247-402)||(33113368-33113523)
chr8 (245-403)||(5915872-5916025)
chr8 (247-403)||(1513915-1514071)
chr8 (216-403)||(6651476-6651652)
chr8 (177-308)||(18372351-18372483)
chr8 (239-395)||(40579514-40579670)
chr8 (245-395)||(5420651-5420801)
chr8 (134-349)||(18372988-18373200)
chr8 (255-393)||(18372004-18372142)
chr8 (252-400)||(70277-70425)
chr8 (245-400)||(41972158-41972316)
chr8 (139-314)||(18372788-18372963)
chr8 (134-289)||(18372485-18372640)
chr8 (249-395)||(18380027-18380171)
chr8 (248-393)||(32640542-32640682)
chr8 (245-402)||(4154669-4154824)
chr8 (245-403)||(9308977-9309139)
chr8 (239-403)||(32305478-32305635)
chr8 (245-395)||(9507777-9507932)
chr8 (178-414)||(4154270-4154507)
chr8 (247-363)||(8794113-8794229)
chr8 (320-395)||(40579277-40579352)
chr8 (245-399)||(12283873-12284026)
chr8 (247-353)||(18372656-18372758)
chr8 (237-323)||(41416251-41416335)
chr8 (10-108)||(1014122-1014219)
chr8 (10-108)||(9309164-9309262)
chr8 (268-382)||(9609108-9609222)
chr8 (248-358)||(43274824-43274934)
chr8 (323-416)||(41129066-41129159)
chr8 (248-335)||(3037776-3037865)
chr8 (129-233)||(3038099-3038202)
chr8 (327-403)||(8919144-8919220)
chr8 (249-394)||(43398077-43398225)
chr8 (245-415)||(9620666-9620834)
chr8 (255-308)||(25561739-25561792)
chr8 (322-415)||(20995404-20995497)
chr8 (250-350)||(20130454-20130553)
chr8 (10-108)||(3669870-3669967)
chr8 (339-403)||(43274635-43274699)
chr8 (245-371)||(5274775-5274901)
chr8 (308-353)||(12156708-12156753)
chr8 (326-383)||(16524446-16524503)
chr8 (248-412)||(40991756-40991920)
chr8 (195-271)||(43274699-43274777)
chr8 (345-395)||(18372292-18372342)
chr8 (13-93)||(147637-147718)
chr8 (245-302)||(20995502-20995559)
chr8 (310-363)||(27856196-27856249)
chr8 (356-427)||(3037944-3038016)
chr8 (281-337)||(18373236-18373292)
chr8 (299-363)||(40417756-40417820)
chr8 (10-91)||(9608936-9609018)
chr8 (10-89)||(9482921-9483000)
chr8 (30-89)||(9483084-9483144)
chr8 (245-277)||(18645713-18645745)
chr8 (10-58)||(34835058-34835105)
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (179-403)||(44290458-44290683)
chr1 (179-425)||(48588465-48588713)
chr1 (235-427)||(44290800-44290993)
chr1 (139-404)||(34364818-34365084)
chr1 (125-394)||(37555990-37556260)
chr1 (124-414)||(41157254-41157545)
chr1 (154-403)||(26661522-26661773)
chr1 (179-414)||(22077484-22077718)
chr1 (167-324)||(3537226-3537384)
chr1 (237-414)||(3537589-3537765)
chr1 (245-403)||(41142372-41142531)
chr1 (237-395)||(3550712-3550867)
chr1 (218-403)||(11977251-11977438)
chr1 (237-403)||(41759475-41759641)
chr1 (246-427)||(40082408-40082588)
chr1 (245-427)||(34364507-34364688)
chr1 (247-400)||(17294579-17294733)
chr1 (245-427)||(41156991-41157175)
chr1 (245-403)||(29798199-29798357)
chr1 (247-403)||(34649440-34649596)
chr1 (253-403)||(14318875-14319025)
chr1 (245-427)||(31767138-31767319)
chr1 (239-372)||(32594747-32594880)
chr1 (249-415)||(9955911-9956079)
chr1 (237-427)||(32168674-32168853)
chr1 (245-427)||(45084382-45084557)
chr1 (236-427)||(45493951-45494146)
chr1 (142-392)||(66100-66349)
chr1 (242-388)||(38804370-38804516)
chr1 (245-401)||(3875333-3875489)
chr1 (179-412)||(22077101-22077345)
chr1 (245-416)||(37850588-37850758)
chr1 (245-403)||(5319965-5320123)
chr1 (237-395)||(50052032-50052189)
chr1 (247-400)||(26661901-26662054)
chr1 (245-395)||(24600322-24600472)
chr1 (248-394)||(37555733-37555878)
chr1 (194-393)||(30630648-30630846)
chr1 (245-395)||(66480-66630)
chr1 (255-427)||(5528730-5528902)
chr1 (245-393)||(39066210-39066358)
chr1 (251-427)||(5575110-5575284)
chr1 (245-427)||(41184383-41184583)
chr1 (245-425)||(19283434-19283613)
chr1 (236-365)||(44043810-44043944)
chr1 (179-277)||(50051777-50051876)
chr1 (245-392)||(24131999-24132143)
chr1 (247-427)||(45839629-45839813)
chr1 (245-414)||(22077818-22077986)
chr1 (312-403)||(11977011-11977102)
chr1 (246-387)||(22793279-22793421)
chr1 (428-497)||(6517096-6517165)
chr1 (22-105)||(11977141-11977224)
chr1 (13-108)||(48588739-48588833)
chr1 (10-108)||(50051902-50051999)
chr1 (178-394)||(24448211-24448426)
chr1 (179-297)||(47379891-47380008)
chr1 (10-117)||(26661766-26661873)
chr1 (129-230)||(41184198-41184298)
chr1 (245-363)||(1188628-1188746)
chr1 (245-393)||(44685456-44685605)
chr1 (10-108)||(48588364-48588461)
chr1 (179-304)||(50469180-50469303)
chr1 (312-427)||(47380143-47380258)
chr1 (245-326)||(21378118-21378199)
chr1 (164-230)||(3537495-3537562)
chr1 (316-403)||(50051689-50051775)
chr1 (10-80)||(44290729-44290798)
chr1 (436-497)||(6512705-6512766)
chr1 (272-405)||(4956218-4956353)
chr1 (10-93)||(34649622-34649705)
chr1 (344-427)||(21378036-21378118)
chr1 (245-292)||(35154150-35154197)
chr1 (14-88)||(22077392-22077466)
chr1 (245-306)||(4878803-4878864)
chr1 (287-363)||(10351202-10351278)
chr1 (13-80)||(66377-66444)
chr1 (428-467)||(6521900-6521939)
chr1 (10-80)||(34364690-34364761)
chr1 (245-363)||(1187404-1187522)
chr1 (179-241)||(1188392-1188453)
chr1 (428-497)||(6506790-6506859)
chr1 (344-403)||(4266798-4266855)
chr1 (327-363)||(12466365-12466401)
chr1 (237-308)||(4266877-4266948)
chr1 (199-263)||(47380258-47380323)
chr1 (318-364)||(9956212-9956258)
chr1 (14-92)||(22077722-22077800)
chr1 (294-339)||(41184152-41184197)
chr1 (10-50)||(3537454-3537494)
chr1 (254-313)||(30630912-30630972)
chr1 (327-363)||(31973375-31973411)
chr1 (300-360)||(35154046-35154106)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (112-394)||(5643-5931)
scaffold0734 (245-394)||(5396-5546)
[»] chr2 (88 HSPs)
chr2 (180-403)||(5542625-5542849)
chr2 (213-401)||(37106156-37106344)
chr2 (179-400)||(40679632-40679852)
chr2 (236-395)||(36178613-36178772)
chr2 (237-427)||(41283451-41283641)
chr2 (124-395)||(6421996-6422260)
chr2 (247-403)||(6421387-6421543)
chr2 (237-395)||(14745675-14745833)
chr2 (241-403)||(37105920-37106082)
chr2 (217-395)||(15880233-15880413)
chr2 (235-395)||(5543006-5543166)
chr2 (174-413)||(7598538-7598769)
chr2 (179-395)||(14745301-14745518)
chr2 (197-401)||(28531316-28531519)
chr2 (179-403)||(40733814-40734040)
chr2 (212-352)||(36178320-36178460)
chr2 (245-400)||(962598-962753)
chr2 (116-427)||(3672954-3673249)
chr2 (202-403)||(40733472-40733675)
chr2 (245-403)||(35580724-35580881)
chr2 (245-403)||(42514649-42514807)
chr2 (174-402)||(29676830-29677065)
chr2 (112-302)||(36785664-36785854)
chr2 (247-395)||(36005888-36006035)
chr2 (252-395)||(15511503-15511646)
chr2 (250-392)||(33731653-33731795)
chr2 (247-403)||(6712978-6713135)
chr2 (237-393)||(1769884-1770040)
chr2 (263-403)||(36178171-36178311)
chr2 (245-402)||(38796619-38796778)
chr2 (249-384)||(28254258-28254391)
chr2 (245-427)||(37632575-37632755)
chr2 (256-413)||(40163362-40163520)
chr2 (258-427)||(23346250-23346417)
chr2 (139-323)||(38796298-38796484)
chr2 (178-386)||(30313109-30313318)
chr2 (245-404)||(7598228-7598387)
chr2 (247-389)||(5367457-5367599)
chr2 (225-353)||(31468800-31468926)
chr2 (245-393)||(12529038-12529186)
chr2 (178-362)||(30323395-30323581)
chr2 (245-352)||(16542449-16542556)
chr2 (178-363)||(33561491-33561676)
chr2 (128-307)||(42514899-42515078)
chr2 (10-118)||(29676711-29676819)
chr2 (253-357)||(37895107-37895211)
chr2 (205-363)||(37894732-37894889)
chr2 (310-426)||(6421796-6421911)
chr2 (253-403)||(29676543-29676687)
chr2 (209-377)||(29873563-29873732)
chr2 (178-353)||(33953821-33953995)
chr2 (177-352)||(41678419-41678595)
chr2 (248-333)||(31899496-31899581)
chr2 (245-427)||(16590888-16591065)
chr2 (299-426)||(3672756-3672882)
chr2 (247-403)||(29874023-29874179)
chr2 (10-108)||(14745544-14745641)
chr2 (248-361)||(31259658-31259774)
chr2 (10-78)||(36178513-36178581)
chr2 (261-350)||(28254165-28254254)
chr2 (248-352)||(12910231-12910335)
chr2 (246-361)||(31385738-31385853)
chr2 (310-395)||(6421691-6421776)
chr2 (8-93)||(7598409-7598494)
chr2 (298-390)||(36784273-36784365)
chr2 (248-395)||(9231252-9231399)
chr2 (10-108)||(5542876-5542973)
chr2 (245-363)||(33954302-33954419)
chr2 (200-267)||(40734231-40734300)
chr2 (335-416)||(31899090-31899170)
chr2 (10-58)||(37106107-37106155)
chr2 (247-293)||(6421306-6421352)
chr2 (312-363)||(28226722-28226772)
chr2 (188-241)||(34481588-34481642)
chr2 (248-393)||(3594188-3594333)
chr2 (178-218)||(33954064-33954104)
chr2 (310-363)||(35580478-35580533)
chr2 (316-363)||(8904499-8904546)
chr2 (316-363)||(28226408-28226455)
chr2 (10-92)||(40734067-40734149)
chr2 (182-256)||(35580532-35580609)
chr2 (1-93)||(23346411-23346502)
chr2 (117-162)||(23346489-23346534)
chr2 (287-403)||(30312831-30312948)
chr2 (10-39)||(35580670-35580699)
chr2 (245-281)||(3672719-3672755)
chr2 (13-76)||(3672888-3672951)
chr2 (321-361)||(13792536-13792576)
[»] chr4 (116 HSPs)
chr4 (124-393)||(54108796-54109060)
chr4 (180-426)||(36629172-36629418)
chr4 (115-402)||(39404273-39404555)
chr4 (174-416)||(44620587-44620830)
chr4 (235-425)||(50630731-50630921)
chr4 (237-412)||(55933113-55933288)
chr4 (245-427)||(25483336-25483517)
chr4 (112-395)||(20826086-20826367)
chr4 (237-403)||(41370349-41370515)
chr4 (130-354)||(2740956-2741180)
chr4 (245-427)||(10245920-10246101)
chr4 (245-403)||(52884695-52884854)
chr4 (179-403)||(18932747-18932982)
chr4 (242-403)||(50002423-50002584)
chr4 (245-400)||(54017596-54017751)
chr4 (245-427)||(3340807-3340988)
chr4 (245-386)||(4955332-4955473)
chr4 (214-427)||(22027936-22028150)
chr4 (247-427)||(39404020-39404200)
chr4 (245-412)||(22183253-22183420)
chr4 (255-403)||(54343006-54343147)
chr4 (245-402)||(1731646-1731803)
chr4 (247-416)||(39792845-39793014)
chr4 (215-393)||(52884856-52885038)
chr4 (247-402)||(34646648-34646803)
chr4 (245-428)||(36608635-36608817)
chr4 (245-395)||(32941129-32941279)
chr4 (248-402)||(50459724-50459878)
chr4 (254-403)||(44621011-44621160)
chr4 (247-403)||(36572021-36572177)
chr4 (237-365)||(49880152-49880280)
chr4 (112-402)||(45489331-45489622)
chr4 (245-427)||(22028342-22028527)
chr4 (130-403)||(49076449-49076722)
chr4 (245-404)||(49076828-49076986)
chr4 (254-403)||(44620362-44620511)
chr4 (245-416)||(2740700-2740869)
chr4 (194-394)||(3244458-3244657)
chr4 (251-427)||(20825842-20826018)
chr4 (244-394)||(54108537-54108686)
chr4 (246-413)||(16888804-16888971)
chr4 (248-404)||(49302907-49303065)
chr4 (174-308)||(44621353-44621489)
chr4 (246-402)||(16889535-16889691)
chr4 (264-395)||(54936215-54936345)
chr4 (245-400)||(4390102-4390257)
chr4 (260-371)||(45496820-45496931)
chr4 (247-363)||(41707503-41707618)
chr4 (237-368)||(6975489-6975620)
chr4 (221-416)||(43174480-43174677)
chr4 (202-403)||(3341083-3341286)
chr4 (299-403)||(23817679-23817783)
chr4 (245-393)||(34004593-34004739)
chr4 (245-427)||(54741154-54741334)
chr4 (245-400)||(3700365-3700512)
chr4 (245-400)||(51768061-51768216)
chr4 (247-391)||(19504707-19504842)
chr4 (245-403)||(28034229-28034387)
chr4 (296-395)||(31691203-31691304)
chr4 (285-403)||(43827480-43827597)
chr4 (266-363)||(48111736-48111833)
chr4 (10-82)||(45496734-45496806)
chr4 (258-353)||(54017750-54017845)
chr4 (112-241)||(16889315-16889444)
chr4 (10-103)||(3340990-3341083)
chr4 (10-119)||(10246103-10246212)
chr4 (247-382)||(40067045-40067181)
chr4 (291-401)||(18879852-18879962)
chr4 (217-334)||(10246317-10246436)
chr4 (237-297)||(50788087-50788147)
chr4 (287-386)||(15841383-15841482)
chr4 (250-414)||(760194-760356)
chr4 (13-108)||(18933008-18933102)
chr4 (13-108)||(41370543-41370637)
chr4 (253-308)||(44620304-44620359)
chr4 (267-395)||(3271806-3271939)
chr4 (316-363)||(11197297-11197344)
chr4 (178-363)||(15841023-15841209)
chr4 (229-308)||(44620926-44621008)
chr4 (216-282)||(41370673-41370738)
chr4 (337-403)||(43174233-43174299)
chr4 (248-377)||(34544107-34544239)
chr4 (355-403)||(19895406-19895453)
chr4 (14-93)||(20826024-20826104)
chr4 (245-377)||(23556890-23557022)
chr4 (331-395)||(39698950-39699014)
chr4 (331-394)||(45489721-45489784)
chr4 (311-357)||(51681604-51681650)
chr4 (310-427)||(11783528-11783644)
chr4 (370-413)||(1731581-1731624)
chr4 (316-363)||(10396202-10396249)
chr4 (316-363)||(10396487-10396534)
chr4 (10-79)||(2740874-2740943)
chr4 (359-393)||(11702307-11702341)
chr4 (303-361)||(11706584-11706641)
chr4 (325-395)||(41370738-41370808)
chr4 (245-306)||(11348423-11348484)
chr4 (358-427)||(23817431-23817498)
chr4 (10-90)||(23817572-23817652)
chr4 (316-364)||(922489-922537)
chr4 (316-352)||(1868122-1868158)
chr4 (179-226)||(41707340-41707388)
chr4 (245-293)||(45050601-45050649)
chr4 (237-268)||(18933103-18933134)
chr4 (10-80)||(44621182-44621253)
chr4 (202-232)||(5882092-5882122)
chr4 (373-427)||(20695926-20695979)
chr4 (124-202)||(23817498-23817575)
chr4 (321-363)||(41707279-41707321)
chr4 (323-361)||(50788034-50788072)
chr4 (318-363)||(11197009-11197054)
chr4 (245-286)||(11706636-11706677)
chr4 (370-427)||(45496675-45496732)
chr4 (178-233)||(21504790-21504846)
chr4 (374-414)||(22027754-22027794)
chr4 (327-363)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0391 (6 HSPs)
scaffold0391 (112-427)||(1083-1398)
scaffold0391 (179-296)||(3092-3212)
scaffold0391 (292-363)||(1731-1802)
scaffold0391 (10-90)||(1383-1464)
scaffold0391 (129-239)||(1464-1575)
scaffold0391 (10-77)||(1591-1658)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (158-365)||(5268-5477)
scaffold0078 (245-395)||(4982-5132)
scaffold0078 (26-108)||(5181-5262)
[»] scaffold0702 (3 HSPs)
scaffold0702 (179-403)||(147-366)
scaffold0702 (247-403)||(514-670)
scaffold0702 (10-108)||(392-489)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (198-361)||(17496-17663)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (245-403)||(47360-47518)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (178-370)||(39770-39963)
scaffold0113 (247-377)||(39459-39588)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (247-322)||(10192-10267)
[»] scaffold0341 (2 HSPs)
scaffold0341 (428-497)||(815-884)
scaffold0341 (428-497)||(8468-8537)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 403
Target Start/End: Original strand, 29518686 - 29519078
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29518686 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgta 29518785  T
Q  110 cggcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatga 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518786 cggcaacggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaa-gagcttccgcttgagggggagcacgatga 29518884  T
Q  210 attgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaa 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29518885 attgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 29518984  T
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29518985 aggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Original strand, 2378060 - 2378284
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378060 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 2378158  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  2378159 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttg 2378258  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  2378259 ttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 171 - 403
Target Start/End: Original strand, 3409586 - 3409818
Alignment:
Q  171 gcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca 270  Q
    ||||||| || |||||| |||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3409586 gcaaagtcaaaagcttcggctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccaca 3409685  T
Q  271 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409686 tcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 3409785  T
Q  371 gcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3409786 gcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 178 - 416
Target Start/End: Original strand, 16454837 - 16455078
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgg 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  16454837 aaagagcttccgcttgaagggggagcatgctgaattgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcag 16454936  T
Q  275 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454937 ataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcgg 16455036  T
Q  375 ttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  16455037 ttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2578647 - 2578443
Alignment:
Q  200 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 297  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2578647 agcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacac 2578549  T
Q  298 cttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 397  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2578548 tttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 2578449  T
Q  398 gtcccc 403  Q
    ||||||    
T  2578448 gtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 205 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 10074560 - 10074352
Alignment:
Q  205 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10074560 gatgaattgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataa 10074462  T
Q  305 gtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10074461 gtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtccccc 10074362  T
Q  405 aggctcccct 414  Q
    ||||||||||    
T  10074361 aggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 179 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 10074215 - 10073989
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10074215 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtgagttatatatcccacatcggata 10074117  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  10074116 gaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttg 10074017  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtccccta 405  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10074016 ttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210384
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaaca 35210384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 141 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2579753 - 2579478
Alignment:
Q  141 tttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt 239  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| |||  |||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  2579753 tttgcggagaaaccaacaacagagatacaaacaaagtaa-gagctttcgcttgaagggggaccatgatgaatagacggactcacacttgagggagagtgt 2579655  T
Q  240 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttt 339  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2579654 tg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttt 2579556  T
Q  340 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcac 417  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  2579555 tgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctcac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 414
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415629
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  336 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt--tctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579860
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca 2579860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 247 - 399
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107832
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgggtggt 16107832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||  || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 125 - 402
Target Start/End: Original strand, 16107943 - 16108208
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcaca 224  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| ||  || | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16107943 aagcagtgtcggtctgtttgcgaagaaaccagcaacggcgatgcaag-aaagt-aagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcaca 16108040  T
Q  225 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16108041 cttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 16108140  T
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  16108141 ccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 415
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  238 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggt 337  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  338 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377912
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2377912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10073838 - 10073592
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10073838 aagaccttccgcttgaagggggaacatgatgaattgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggaga 10073740  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||    
T  10073739 aaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttg 10073642  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaacac 428  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||  |||||||||||    
T  10073641 ttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctc-gtgacccaacac 10073592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454733
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 16454733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2579387 - 2579087
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgag-ggggagcac---gatgaattgatggact 220  Q
    |||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||| || |||  ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    ||||||| ||||||||    
T  2579387 aagcggtgtcggtctgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacaaacaa-gtaa-gagcttccgcttgaaaggggagcaacatgatgaatagatggact 2579290  T
Q  221 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcat 318  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    ||||  |||    
T  2579289 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccat 2579194  T
Q  319 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcact 418  Q
    ||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |    
T  2579193 aaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctcccctca-t 2579096  T
Q  419 gacccaaca 427  Q
    |||||||||    
T  2579095 gacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 220 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578822
Alignment:
Q  220 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcata 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||  ||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  320 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  345 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    || |||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 251 - 403
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  251 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  350 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  350 tgtg 353  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 388  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 248 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 251 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  251 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  351 gtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911716
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttggg 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtgga 10911716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 364
Target Start/End: Original strand, 8481888 - 8482045
Alignment:
Q  207 tgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  8481888 tgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataa 8481985  T
Q  305 gtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 364  Q
     | | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481986 atgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071678
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca 12071678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Original strand, 6071063 - 6071257
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 274  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6071063 aaagagcttccgtttaaggggtgagcatgatgaattgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattga 6071161  T
Q  275 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    ||| || |||  ||||||||||| |||||||| | | ||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6071162 atagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgt 6071257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085021
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | | |||| |||| ||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10074336 - 10074240
Alignment:
Q  12 gtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10074336 gtatcagagccccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcattgt 10074240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092470
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958615
Alignment:
Q  240 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttt 339  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  340 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    || | |||||||| ||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctctcttg----tgtgattgttctaacctcgatgtgga 5958615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 2377937 - 2378034
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2377937 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtc-gttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgt 2378034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 304
Target Start/End: Original strand, 33605879 - 33606034
Alignment:
Q  146 ggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggttt 245  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||||| || |  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  33605879 ggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgt 33605975  T
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 304  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| ||||||    
T  33605976 gcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  249 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| || |||| |||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  349 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    |||||  | |||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 314
Target Start/End: Original strand, 35210449 - 35210547
Alignment:
Q  205 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 304  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  35210449 gatggattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaag-----------tgccccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaa 35210537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 361
Target Start/End: Original strand, 2975486 - 2975668
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||||||||  |    
T  2975486 aagagcttccgcttaaagggggaacatgatgaatagatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacatcaaa 2975582  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 361  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975583 tagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 426
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714849
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaac 426  Q
    |||||||||| || | | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||| |||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 3409470 - 3409567
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  3409470 tggtatcagagccccggttcgacgaagtatatgaccgaggcagccggtc-gttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaagtagcaagtggctccttgt 3409567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 2579467 - 2579387
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggt-cagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2579467 tggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 2579387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2578810 - 2578739
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2578810 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacg 2578739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 395
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409451
Alignment:
Q  349 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 3409451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 16107863 - 16107943
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggt-cagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16107863 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaa 16107943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Original strand, 26544230 - 26544321
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtgg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||   |||||| ||||||||||    
T  26544230 actggtattagagccccggttcgatgaagggtgcgaccgaggcagccggt-atttgcgtagaaagccgcaacgctggtacaaacagcaagtgg 26544321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12092262 - 12092201
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgaggggg---agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 236  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12092262 aaagagcttccgctagaggggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggag 12092201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618606
Alignment:
Q  252 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 351  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgac-cataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  352 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc 30618606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22605342 - 22605301
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605342 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11637808 - 11637760
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 364  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637808 cataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 16454758 - 16454838
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaa 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||   |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16454758 tggtatcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccgaggtaaccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaa 16454838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2579848 - 2579779
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgcc-ggtcagttgcgcagaaagcagcaa 78  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  2579848 tggtatcagagccccggttccacgaagggtacgaccgaggcagccagttcgtttgcgcagaaagcagcaa 2579779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21130144 - 21130103
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130144 cataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902437
Alignment:
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||| |||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtggat 10902437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  321 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  282 agtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattg 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14789441 - 14789403
Alignment:
Q  70 aagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14789441 aagcagcaacgacggtaaaagcagcaagtggctccttgt 14789403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2579082 - 2579033
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt 62  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  2579082 tatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccagtcagtt 2579033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 86)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 112 - 371
Target Start/End: Original strand, 7553891 - 7554151
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaat 211  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7553891 gcaatggcggtgcaagcagtgttggtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgacacatgcaaagtaa-gagcttccgcttgagggggagcacgatgaat 7553989  T
Q  212 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7553990 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 7554089  T
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 371  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554090 aggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 7554151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 154 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37533258 - 37533011
Alignment:
Q  154 cagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 253  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533258 cagcaacggcgatacagacaaagtaaaaagcttccgctctaggggaa-cacgttaaagtgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 37533160  T
Q  254 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37533159 gagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtg 37533061  T
Q  354 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  37533060 gtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 182 - 403
Target Start/End: Original strand, 30244204 - 30244428
Alignment:
Q  182 agcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244204 agcttccgcttgaagagggagcatgatgactagatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 30244303  T
Q  279 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 378  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30244304 aagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgt 30244403  T
Q  379 tctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  30244404 tcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 400
Target Start/End: Original strand, 14681431 - 14681663
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaaagagcttccgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681431 acatgcaaagtaa-gagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaagttatatgt 14681529  T
Q  265 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 364  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14681530 cccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc-- 14681627  T
Q  365 gcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
     |  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14681628 acaagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 245 - 428
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517763
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaacac 428  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaacac 7517763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 393
Target Start/End: Original strand, 45434514 - 45434784
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactca 222  Q
    |||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||   ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45434514 caagtagtgtcggtctgtttgcggagaaactagcaacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactca 45434613  T
Q  223 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    |||||| ||||| ||  | || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45434614 cacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 45434713  T
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45434714 ttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtg 45434784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 194 - 403
Target Start/End: Original strand, 30245024 - 30245231
Alignment:
Q  194 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 291  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30245024 agggggagcatgatgattagatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggtt 30245123  T
Q  292 gaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 391  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||    
T  30245124 gaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatg 30245219  T
Q  392 tggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||    
T  30245220 tggatggtcccc 30245231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 239 - 427
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157747
Alignment:
Q  239 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  339 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| || |||||||| |||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaaca 29157747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533364
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37533364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 403
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845349
Alignment:
Q  252 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  352 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccc 11845349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22566893 - 22566702
Alignment:
Q  174 aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22566893 aagtaaaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcccacat 22566794  T
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566793 cggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939738
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatgg 398  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggatgg 36939738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567017
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaa 22567017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 392
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 393
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  253 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  353 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  251 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  351 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 129 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1085526 - 1085280
Alignment:
Q  129 agtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggac--tcacac 225  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||| |||| |||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  1085526 agtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccccttgaaggggtagcatgatgaaaagatggacactcacac 1085429  T
Q  226 ttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  1085428 ttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaac 1085329  T
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 371  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085328 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118277
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  345 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 403
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  350 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129265
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca 47129265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 248 - 395
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901793
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgtaga-ggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtgga 9901793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128417
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||| |  ||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaaca 8128417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 426
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaac 426  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||| |||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 365
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttg 365  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttg 365  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa-aaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 380  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 37532986 - 37532897
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37532986 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagcagcaagtg 37532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 366
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgc 366  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 314
Target Start/End: Original strand, 30244632 - 30244770
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30244632 aagagcttccgcttcaaggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgga 30244731  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggac 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30244732 taaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggac 30244770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230299
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||| |||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtgga 40230299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 308
Target Start/End: Original strand, 30245425 - 30245557
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30245425 aagagcttccgcttgagggggagcatgatgaaaaagacggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaga 30245524  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30245525 taaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaa 30245557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 37533339 - 37533253
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37533339 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa 37533253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 326 - 427
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129549
Alignment:
Q  326 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599464
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta-- 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtg 20599464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 266 - 401
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  266 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 365  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       ||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  366 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 386  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  387 cgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 216 - 308
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255402
Alignment:
Q  216 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaa 30255402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||||||||| |||||||   |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40094617 - 40094502
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40094617 aagagcttccgcttgagggagagcgtgatgaatagatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataa 40094519  T
Q  279 aatagtaaaggttgaac 295  Q
    || ||||||||||||||    
T  40094518 aagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 402
Target Start/End: Original strand, 37345819 - 37346074
Alignment:
Q  146 ggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtt 244  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  37345819 ggagaaagcagcaacggcgatacaagcaa-gtaaa-agcttccacttgacgggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tg 37345915  T
Q  245 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgg 342  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| | | ||| |||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  343 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||| | |||| |||  ||| |||||||||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctctcacttgtacagttgctct-tcctggatgtggatggtccc 37346074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910594
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaa--------ggttt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  340 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 41910594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  291 tgaacaccttataagtaaaaggactc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 389  Q
    |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  390 tgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||| ||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctta 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48243356 - 48243241
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcac 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| |||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48243356 aagcagtgtcggttcgttggcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaa-gaacttccacttgaagggggagcatgatgaattgatggattcac 48243259  T
Q  224 acttgagggggagtgttg 241  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48243258 acttgagggggagtgttg 48243241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 333 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  333 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109002
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcat 318  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggattcat 36109002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300576
Alignment:
Q  328 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtgga 28300576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 22567013 - 22566905
Alignment:
Q  10 tggtatcagagcccc-ggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22567013 tggtatcagagcccccggtccgacgaagggtacgaccaaggccaccggttagttgtgcagaaaacagcaaagacggtacaagaagcaagtggctccttgt 22566914  T
Q  109 acggcaacg 117  Q
     | ||||||    
T  22566913 gcagcaacg 22566905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 427
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 427
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21416228 - 21416181
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416228 cataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23569089 - 23569043
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569089 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4124293 - 4124128
Alignment:
Q  199 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt-tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 297  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  ||||    
T  4124293 gagcatgatgaattgatgggctcacacttgatgtgaagtttgttgtgtgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacac 4124194  T
Q  298 cttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
     |||||||| | |||||  |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4124193 tttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggataaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 258
Target Start/End: Original strand, 10342191 - 10342271
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtt 258  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10342191 aaagagcttccacttgagggggcagcatgatgaattggcggactcatacttgagggggagtg-tggtgtgcaagtgtgagtt 10342271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 14681323 - 14681415
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctcctt 106  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||  | |||||| |||||| |||||||||    
T  14681323 tatcagagccccggttggatgaagggtgcgaccgaggcagccggt-tgttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaaacagcaaatggctcctt 14681415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28300554 - 28300470
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28300554 actggtatcagagcct-gattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 28300470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 264
Target Start/End: Original strand, 45697845 - 45697929
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  45697845 aagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaatagataaactcacacttgaggaggagtgtt-gtgtgcaagtgtcatttatatgt 45697929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 282
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  239 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Original strand, 47129343 - 47129439
Alignment:
Q  113 caacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47129343 caacggcggtgcaagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacaagc-aagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaa 47129439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 427
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245336
Alignment:
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaaca 30245336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 386  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  387 cgatgtggatggtcccc 403  Q
     ||||||| ||||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 45697752 - 45697800
Alignment:
Q  60 gttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  45697752 gttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagaagcaagtggctccttgt 45697800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 428
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518029
Alignment:
Q  381 tagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaacac 428  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaacac 7518029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967323
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaa 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaaca-cttataaataaaa 36967323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  340 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 37345764 - 37345834
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||    
T  37345764 tggtatcagagccccggttcagtgaagggtacaatcgaggcagccgatccgttgcggagaaagcagcaacg 37345834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 390
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  328 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 390  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21619132 - 21619091
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619132 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40094500 - 40094424
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40094500 cataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37532892 - 37532822
Alignment:
Q  171 gcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgg 242  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37532892 gcaaagtaaaaagcttccgctataggggaa-cacgttaaagtgaaggactcacacttgagggggagtgttgg 37532822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 40094742 - 40094672
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  40094742 tggtatcagagccctg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagtagcaacg 40094672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243356
Alignment:
Q  27 ttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaa 89  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 48243356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28300422 - 28300365
Alignment:
Q  183 gcttccgcttga--gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtg 238  Q
    ||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28300422 gcttccgcttgaaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtg 28300365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27391856 - 27391815
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391856 cataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8128415 - 8128343
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgac 82  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| | | ||| || |||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  8128415 tggtatcaaagccctggttcgacgaagggtacgatcgaagcagccgttccgttgcggagaaaccagcaacgac 8128343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 353
Target Start/End: Original strand, 48071454 - 48071494
Alignment:
Q  313 actcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48071454 actcataaacctattgtcttaaggttttggataagagtgtg 48071494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 134 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37990908 - 37990615
Alignment:
Q  134 cggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg 233  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37990908 cggttcgtttgcgcagaaaccagcaacggcgatacatgcaaagtaaa-agcttccgcttgaggggg-gcatgatgaattgatggactcacagttgagggg 37990811  T
Q  234 gagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcct 331  Q
    |||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37990810 gagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgcct 37990711  T
Q  332 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990710 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 179 - 422
Target Start/End: Original strand, 22304502 - 22304747
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304502 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggata 22304601  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304602 aaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 22304701  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggt-cccctaggctcccctcactgacc 422  Q
    |||||| |||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304702 ttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 130 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 54018090 - 54017793
Alignment:
Q  130 gtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttga 229  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| |||| | || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54018090 gtgtcagtccgtttgcggagaaaccaacaacagtgatacaagcaa-gtaaagagcttccgcttgagggggaacatgatgaaaagatggactcacacttga 54017992  T
Q  230 gggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccatt 327  Q
    |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  54017991 gggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaac 54017892  T
Q  328 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  54017891 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc-cagtgacccaaca 54017793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42342296 - 42342092
Alignment:
Q  199 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||      
T  42342296 gagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatg 42342197  T
Q  297 ccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42342196 ccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 42342097  T
Q  397 ggtcc 401  Q
    |||||    
T  42342096 ggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 112 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3135364 - 3135099
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagag-cttccgcttgagggggagcacgatgaa 210  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  || |||  ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3135364 gcaacggcggtacaaacagtgtcggtctgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaaacaa-gtaaagtggcttccgctagagggggagcacgatgaa 3135266  T
Q  211 ttgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaa 309  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3135265 ttgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaa 3135167  T
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    || || |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135166 agaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 167 - 386
Target Start/End: Original strand, 4823578 - 4823796
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4823578 acatgcaaagtaaaaagcttccgctctagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtct 4823676  T
Q  267 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4823677 cacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgc 4823776  T
Q  367 ttgtgcggttgttctagcct 386  Q
    || ||||| |||||||||||    
T  4823777 ttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 395
Target Start/End: Original strand, 15773119 - 15773344
Alignment:
Q  174 aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15773119 aagtaaaaagcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 15773218  T
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct--cttgcttg 369  Q
    || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15773219 cgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgatgtctcttgcttgcttg 15773318  T
Q  370 tgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    || |||||||||| ||||||||||||    
T  15773319 tgtggttgttctaacctcgatgtgga 15773344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 128 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21832614 - 21832353
Alignment:
Q  128 cagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacactt 227  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||  || ||| |||| |||  ||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21832614 cagtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtat-gagcttccatttgatggggagcatgatgaatagatggactcacactt 21832518  T
Q  228 gagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccatt 327  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  21832517 gaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcata 21832419  T
Q  328 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21832418 gccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtgga 21832353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41360008 - 41359765
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtg 254  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  41360008 aacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtg 41359910  T
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41359909 agttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtgg 41359814  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41359813 cgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 41359765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 247 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29644792 - 29644581
Alignment:
Q  195 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 291  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29644792 gggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggtt 29644693  T
Q  292 gaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 391  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  29644692 gaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatg 29644593  T
Q  392 tggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||    
T  29644592 tggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342364
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaaca 42342364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990967
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccc 413  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccc 37990967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934961
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctta 333  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  334 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 397  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatg 39934961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 393
Target Start/End: Original strand, 11661858 - 11662099
Alignment:
Q  154 cagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagt 251  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||    
T  11661858 cagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttgttgtatgtaagt 11661957  T
Q  252 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagt 350  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11661958 gtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaagagt 11662057  T
Q  351 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    | |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11662058 gaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtg 11662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 247 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462910
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 32462910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 400
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389225
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgggtggtc 39389225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773035
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaaca 15773035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 179 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32462786 - 32462569
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32462786 aagagctttcgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaa 32462687  T
Q  276 taaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 374  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  32462686 tgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtggga 32462587  T
Q  375 ttgttctagcctcgatgt 392  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  32462586 ttgttttagcctcgatgt 32462569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22304143 - 22303955
Alignment:
Q  210 attgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||    
T  22304143 attgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagta 22304051  T
Q  308 aaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22304050 agcggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtcccc 22303955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 247 - 392
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634822
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgt 52634822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcata-----aacccattgcct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  332 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| |||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 179 - 395
Target Start/End: Original strand, 9240083 - 9240299
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9240083 aagagtttccgcttgaggggagagcataacgaatggatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggata 9240181  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
     |  |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||||||||     
T  9240182 gagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggtta 9240281  T
Q  378 ttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9240282 ttctagcctcgatgtgga 9240299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||  |||  |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 22304208 - 22304301
Alignment:
Q  207 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304208 tgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 404
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaaaaggactc--ataaacccattgccttaaggttt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  340 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 404
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 22303929 - 22303820
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  22303929 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggcttcttgtg 22303830  T
Q  110 cggcaacggc 119  Q
    | ||||||||    
T  22303829 cagcaacggc 22303820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 246 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634291
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttggg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336693
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  347 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtggat 49336693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328022
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||| || || |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctct 8328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 303 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  303 aagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc-c 401  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  402 cctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 319 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  319 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcact 418  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  419 gacccaaca 427  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886703
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| | ||||||||  |||||||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtg 51886703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584799
Alignment:
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaacac 428  Q
    |||  ||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||| ||  |||  | ||| ||||| |||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaacac 42584799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175634
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggac---tcataaacccattgccttaaggttttggg 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||   | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  344 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaacac 428  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||   ||||||   |||||||||| || ||||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaacac 33175634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964516
Alignment:
Q  226 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaaccca 325  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| | ||||| |||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  326 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctag 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| || | ||| ||||||| |||||| ||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctcca-ccttgatgtgggtggtccactag 47964516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  234 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctta 333  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  334 aggttttgggtaagagtgt 352  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  271 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggt 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336219
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| | ||||  ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt-cccctaggctcccctc 415  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 53577548 - 53577616
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53577548 tggtatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 53577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 427
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304376
Alignment:
Q  354 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaaca 22304376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336002
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 371  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 39336002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 301
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 22304378 - 22304476
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagc-agcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  | ||||||| || ||||||||||||||    
T  22304378 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagcaagcaacagctgtacaagtagtaagtggctccttgt 22304476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54017635 - 54017548
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  54017635 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtcccc 54017548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 363
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  347 gagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964955
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctct 47964955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  348 agtgtg 353  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 8328259 - 8328368
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactca 222  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8328259 caagcagtgtcgatcagtttgcggagaaaccaacaacggtgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttgaagggggagatcgatgcattgatggactca 8328356  T
Q  223 cacttgaggggg 234  Q
    ||||||||||||    
T  8328357 cacttgaggggg 8328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41360111 - 41360014
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagc--agcaagtggctccttg 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | ||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  41360111 tggtatcagagcgccggttcgacgaagagtacgaccg--gcagccggtc-gttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagagcaagtggctccttg 41360015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 402
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  349 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Original strand, 15773037 - 15773106
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaac 79  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15773037 tggtatcagagccctgattcgacgaagggtacgatcgaggccgccggtcagttatgcagaaagcagcaac 15773106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 33803227 - 33803143
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33803227 tggtatcagagcctcgattcgacgaagggtacgactgaggcagccagtccgtttgcgcataaagcagcaacgacagtacaagcag 33803143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 355
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  295 caccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 355  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 53596031 - 53596078
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596031 cataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 53596346 - 53596393
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596346 cataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Original strand, 53577667 - 53577721
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgc 64  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53577667 tggtatcagagtcccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgc 53577721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  327 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12747978 - 12747878
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||  | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747978 aaagagctttcgtttgaggggtgagcatgatgaatttacggactcacgcttgagaggatattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 12747880  T
Q  276 ta 277  Q
    ||    
T  12747879 ta 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 392
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 386  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| || ||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  387 cgatgt 392  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17731991 - 17731950
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17731991 cataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19033222 - 19033181
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033222 cataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 363
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| | || ||  ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  347 gagtgtggtgtctctct 363  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 53596546 - 53596593
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596546 cataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 194
Target Start/End: Original strand, 8328154 - 8328222
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga 194  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  8328154 caagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagc-aagt-aagagcttccgcttga 8328222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978836
Alignment:
Q  325 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactga 420  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||   |||||| | | |||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctccctttagtga 43978848  T
Q  421 cccaacacactg 432  Q
    ||||||| ||||    
T  43978847 cccaacaaactg 43978836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 52634889 - 52634931
Alignment:
Q  199 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  52634889 gagcacgatgaattgattgactcacacttgagggagagtgttg 52634931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 377
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | | ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||| |||| |||||  |||||| |||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29644860 - 29644811
Alignment:
Q  24 cggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagc 73  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29644860 cggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccgttcaattgcgcagaaagc 29644811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 54018169 - 54018104
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaa 78  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  54018169 atcagagctccggttcaacgaagggtgcgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaa 54018104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Original strand, 2299930 - 2300000
Alignment:
Q  200 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 269  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299930 agcatgataaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 108
Target Start/End: Original strand, 4823507 - 4823563
Alignment:
Q  53 ccggtcagttgcgcagaaagc-agcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  4823507 ccggtcagttgcgcagaaagcaagcaacggtggtacaagcaacaagtggctccttgt 4823563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48127902 - 48127859
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 359  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127902 cataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16871046 - 16871005
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871046 cataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17735078 - 17735037
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735078 cataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19036347 - 19036306
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036347 cataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986045
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || ||||||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagt 36986045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 250 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011484
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || ||||||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagt 37011484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47964758 - 47964715
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactca 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47964758 aaagagtttccgcttgagggggagc-caatgaattgatggactca 47964715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 179 - 425
Target Start/End: Original strand, 6500756 - 6501002
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6500756 aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggata 6500854  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6500855 aaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggtta 6500954  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6500955 ttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaa 6501002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 112 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13416051 - 13415774
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaa 210  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| | || ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  13416051 gcaacggcggtgcaagcagtctcggtccgtttgcggagaaaccatcaacagcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttgaagggggagcatgctgaa 13415954  T
Q  211 ttgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415953 tagatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaa 13415855  T
Q  309 aaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 389  Q
     ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415854 gaggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500632
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaaca 6500632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 395
Target Start/End: Original strand, 624077 - 624346
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcac 223  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||     ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  624077 caagtagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaacggcgatacaaagcgagtaa-gagcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcac 624174  T
Q  224 acttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacc 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||    
T  624175 acttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacc 624274  T
Q  324 cattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  624275 catagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtgga 624346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3295287 - 3295002
Alignment:
Q  132 gtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagg 231  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  3295287 gtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagg 3295190  T
Q  232 gggagtgttg----gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccatt 327  Q
    ||||||||||    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3295189 gggagtgttgttgtgtgtgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccatt 3295091  T
Q  328 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||   ||||||||||    
T  3295090 gccttgaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 179 - 425
Target Start/End: Original strand, 26074543 - 26074792
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||| ||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26074543 aagagcttccacttgaaggagtagcatgatcaattgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcgga 26074642  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggt 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  26074643 taaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggt 26074742  T
Q  376 tgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    || |||| ||||||||||| || ||||  | ||||||||| |||||||||    
T  26074743 tgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagctcccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405574
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074121
Alignment:
Q  218 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  318 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcac 417  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| |    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctc 26074132  T
Q  418 tgacccaacac 428  Q
    |||||||||||    
T  26074131 tgacccaacac 26074121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603128
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtgga 18603128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 238 - 403
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  238 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggt 337  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  338 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24489434 - 24489194
Alignment:
Q  172 caaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  24489434 caaagtaaaaagcttctggttgaggggtagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacat 24489336  T
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 371  Q
    | |||| || || ||||||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||    
T  24489335 cagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtg 24489238  T
Q  372 cggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  24489237 cggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcccctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  242 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  342 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 248 - 427
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328117
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaaca 25328117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 425
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 248 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  252 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  352 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028493
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaaca 1028493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299639
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtgga 299639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 194 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 26074993 - 26074818
Alignment:
Q  194 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt 291  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26074993 agggggagcttgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtt 26074894  T
Q  292 gaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgc 366  Q
    ||||||  ||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26074893 gaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgc 26074818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 255 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753033
Alignment:
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 34753033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  336 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | || ||||||||| ||||||| |||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568545
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  || |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075169
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt-a 345  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtgga 26075169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 404
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623976
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||  |||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 623976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 257 - 395
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747921
Alignment:
Q  257 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  357 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtgga 33747921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 271 - 416
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  271 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  371 gcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 178 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 36522121 - 36521946
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36522121 aaagagcttccgcttgaggtgggataacgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagat 36522023  T
Q  277 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    | || |||  |||||||||||  | ||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522022 agaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 397
Target Start/End: Original strand, 38427518 - 38427699
Alignment:
Q  206 atgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  38427518 atgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataag 38427608  T
Q  306 taaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatg 397  Q
    || | |||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38427609 taga-ggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtggatg 38427699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 237 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| || || ||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 383  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 178 - 363
Target Start/End: Original strand, 31509554 - 31509742
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31509554 aaagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgg 31509652  T
Q  275 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||| || |||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509653 atagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  242 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  342 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttc 380  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36522459 - 36522237
Alignment:
Q  182 agcttccgcttgagggg--gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 279  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  36522459 agcttccgcttgaggggaggaacacgatgaattgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggataga 36522361  T
Q  280 atagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgtt 379  Q
    | | |  | ||||||||  |||||||| | |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  36522360 aaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggctgct 36522261  T
Q  380 ctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     | ||||  |||||| ||||||||    
T  36522260 ttggcctgaatgtgggtggtcccc 36522237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590914
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtggatggt 26590914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 389
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301095
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcga 301095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 320
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataa 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtttt 340  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167846
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtgga 35167846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 414
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    ||||| || ||||| || ||||   | |||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 331 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  331 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 6500634 - 6500729
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctcctt 106  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  6500634 tggtatcagagttccggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagtc-gttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagcagcaagtggctcctt 6500729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 368
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35914972
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||| | |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgctt 368  Q
    | |||||| ||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgctt 35914972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 377
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509864
Alignment:
Q  259 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  358 ctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    |||||| |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgtacggttg 31509864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13785833 - 13785732
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggag-cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13785833 aagagcttccgcttgaaggggaaacatgatgaatagatagactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggata 13785735  T
Q  278 aaa 280  Q
    |||    
T  13785734 aaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 325
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaaccca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9498629 - 9498534
Alignment:
Q  11 ggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  9498629 ggtatcagagccccg-ttcgacaaagggtacgaccgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagctgcaacggcgctacaagcagcaagtggctccttgt 9498534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  329 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 381  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 332 - 392
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427366
Alignment:
Q  332 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgt 38427366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 13042610 - 13042657
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042610 cataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 96
Target Start/End: Original strand, 32487575 - 32487661
Alignment:
Q  9 ctggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaa 96  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  32487575 ctggtatcagagccccgattcgacgaagggtgcgactgaggcagccgatc-gttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaa 32487661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 326
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccat 326  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagaggac-cataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635224
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    ||||| || ||||| || |||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgt 41635224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtttt 340  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 9498411 - 9498343
Alignment:
Q  315 tcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 383  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  9498411 tcataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Original strand, 35150607 - 35150719
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacac-atgcaaagtaaagagcttccgc-ttgagggggagcacgatgaattgatggactc 221  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || | ||||   ||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35150607 caagcagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaacggtgatacaaagcaagtaaaaaagcttccgctttgggggtgagcatgatgaattgatggactc 35150706  T
Q  222 acacttgaggggg 234  Q
    ||||||| |||||    
T  35150707 acacttggggggg 35150719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9498493 - 9498411
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtt 240  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9498493 aacggtgatacaggcaaagtaa-gagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggtgtgtt 9498411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 305  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 359
Target Start/End: Original strand, 13112608 - 13112651
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112608 cataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13785718 - 13785631
Alignment:
Q  317 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | ||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  13785718 ataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 390
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489626
Alignment:
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgat 24489626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26075133 - 26075063
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26075133 tggtatcagagcctcg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacg 26075063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 363
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  325 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 363
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  325 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 287
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Original strand, 32445950 - 32446003
Alignment:
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445950 aggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36527182 - 36527117
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 381  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||    
T  36527182 cataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 357
Target Start/End: Original strand, 34103622 - 34103666
Alignment:
Q  313 actcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103622 actcataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 257
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  213 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 38427403 - 38427486
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagca 92  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38427403 tggtattagagccccggttcgacgaagggtgtgaccaagacagccagtctgtttgcgcagaaaccagcaacgacgatacaagca 38427486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 357
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  327 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 294  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 403
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  350 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||  || ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 13416116 - 13416033
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | || |||||||    
T  13416116 tggtatcagagtcccg-ttcgtcgaagggtacgaccgaggcaaccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaagcag 13416033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13785935 - 13785879
Alignment:
Q  52 gccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  13785935 gccggtctgttgcgcagaaaacaacaacgacggtacatgtagcaagtggctctttgt 13785879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 282 - 370
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  282 agtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31865950 - 31865902
Alignment:
Q  188 cgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 236  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31865950 cgcttgaggaggagcacaataaattgatggactcacatttgaggaggag 31865902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 313 - 357
Target Start/End: Original strand, 41340347 - 41340391
Alignment:
Q  313 actcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41340347 actcatacactcattgccttaagattttggataagagtgtggtgt 41340391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 89)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 158 - 415
Target Start/End: Original strand, 3669973 - 3670229
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 256  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3669973 aacggcgatacatgcaaagtaa-gagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgag 3670071  T
Q  257 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670072 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 3670171  T
Q  357 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  3670172 tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 167 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1014107 - 1013875
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtc 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1014107 acatgcaaagtaa-gagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtt 1014009  T
Q  266 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  1014008 ccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtgttgtctctttta 1013909  T
Q  366 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013908 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 1013875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669845
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  336 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 3669845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 40518470 - 40518738
Alignment:
Q  131 tgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttga 229  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40518470 tgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaa-gagcttccacttgaggggggagcatgatgaattgatggactcacacttga 40518567  T
Q  230 gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgc 329  Q
    |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||     
T  40518568 gggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatga 40518666  T
Q  330 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  40518667 cttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 415
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441255
Alignment:
Q  235 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaaaaggactcataaacccattgcc 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  331 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc 30441255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 179 - 395
Target Start/End: Original strand, 30359540 - 30359759
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30359540 aagagcttccgcttgaagggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcaga 30359639  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggt 375  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30359640 taaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggt 30359739  T
Q  376 tgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||| | ||||||||||    
T  30359740 tgttctaacttcgatgtgga 30359759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 247 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 196 - 413
Target Start/End: Original strand, 34835160 - 34835377
Alignment:
Q  196 ggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 293  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34835160 ggggggcatgatgaattgatggactcac--ttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttga 34835257  T
Q  294 acaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  34835258 acaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgta 34835357  T
Q  394 gatggtcccctaggctcccc 413  Q
    || |||||||  ||||||||    
T  34835358 gacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 247 - 402
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835033
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatccc 34835033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 413
Target Start/End: Original strand, 34835427 - 34835643
Alignment:
Q  200 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835427 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835526  T
Q  297 ccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  34835527 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835626  T
Q  397 ggtcccctaggctcccc 413  Q
    |||||||  ||||||||    
T  34835627 ggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 413
Target Start/End: Original strand, 34835693 - 34835909
Alignment:
Q  200 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaaca 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34835693 agcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaaca 34835792  T
Q  297 ccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  34835793 ccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagac 34835892  T
Q  397 ggtcccctaggctcccc 413  Q
    |||||||  ||||||||    
T  34835893 ggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 405
Target Start/End: Original strand, 6731856 - 6732055
Alignment:
Q  197 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 296  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  6731856 gggagcatgatgaatagatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga--- 6731952  T
Q  297 ccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
          |||||| || || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6731953 ------aagtaagagaacccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggat 6732046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9482857 - 9482612
Alignment:
Q  145 tggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtt 244  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |     
T  9482857 tggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttgaagggg-gcacagtgaattgttggactcac--ttgagggggagtgttgttg 9482763  T
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    || |   ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||  |    
T  9482762 tgtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtat 9482663  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482662 aagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 9482612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8919039 - 8918764
Alignment:
Q  128 cagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacactt 227  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||| ||||  ||  |||||||||||| | ||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  8919039 cagtgtcggtccgtttgcgaagaaatcagcaacggcgatacaagcaagtta--gagcttccgcttaaagggggacatgatgaatagatggactcacactt 8918942  T
Q  228 gagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaaccca 325  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |    
T  8918941 gagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaaccta 8918842  T
Q  326 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  8918841 ttgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Original strand, 9309303 - 9309512
Alignment:
Q  195 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 292  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9309303 gggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttg 9309402  T
Q  293 aacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |   | || ||||||||||||||||||||    
T  9309403 aacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgt 9309501  T
Q  393 ggatggtcccc 403  Q
    ||| |||||||    
T  9309502 ggacggtcccc 9309512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 237 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014249
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 1014249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Original strand, 45122564 - 45122782
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||||||    
T  45122564 aagagcttccgctggaagggggagcatgatgaatagaagaactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggata 45122656  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45122657 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttg 45122756  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122757 ttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Original strand, 45122937 - 45123164
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122937 aagagcttccgcttgaagggggaacatgatgaatagatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 45123036  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||| | ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  45123037 taaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggg 45123134  T
Q  374 gttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  45123135 gttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18371925 - 18371669
Alignment:
Q  134 cggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18371925 cggttcgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaaacaaa-taaagagcttccgcttgaagggggggcacgataaagtgatggactcacacttgaggg 18371827  T
Q  233 ggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctt 332  Q
    |||||| || | || |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  18371826 ggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgcctt 18371732  T
Q  333 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18371731 aaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359454
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctag-gctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaaca 30359454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 248 - 403
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 124 - 393
Target Start/End: Original strand, 147712 - 147968
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactca 222  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  || |||     ||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  147712 caagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccaacaacgacgataca-----agtaa-gagcttccgcttaaagggggagct-gatgaattgatggactca 147804  T
Q  223 cacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataa 320  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||         || |||||    
T  147805 cacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatata---------acccataa 147895  T
Q  321 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  147896 acctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  335 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 247 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtttt-gggta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctag 406  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544498
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 37544498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 45121878 - 45121664
Alignment:
Q  182 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 279  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45121878 agcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaa 45121780  T
Q  280 atagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgtt 379  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||    
T  45121779 agagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggttgtt 45121680  T
Q  380 ctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||    
T  45121679 ctagcctcgatgtgga 45121664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 404
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 270 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  270 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  370 tgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttggg 343  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| || ||||| |||||||    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaagttt-aacactttataag----aggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 216 - 403
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651652
Alignment:
Q  216 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggact 315  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         ||| || ||     
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18372483 - 18372351
Alignment:
Q  177 taaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18372483 taaagagcttccccttgaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcgga 18372384  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372383 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 18372351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 239 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579514
Alignment:
Q  239 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtt 338  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  339 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtgga 40579514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420801
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||  ||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgga 5420801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18373200 - 18372988
Alignment:
Q  134 cggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggg 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || || |||  |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||      
T  18373200 cggttcgtttgcggagaaaccagcag-ggcgatacaaacaaa-tgaagagcttccccttgatgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagat 18373103  T
Q  233 ggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcct 331  Q
    ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||     
T  18373102 ggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc- 18373004  T
Q  332 taaggttttgggtaagag 349  Q
      ||||||||||||||||    
T  18373003 --aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18372004
Alignment:
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtg 18372004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  252 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  352 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtt---ttg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  342 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18372963 - 18372788
Alignment:
Q  139 cgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttg--agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag 236  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || |||  |||| |||||||||||| | |   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||    
T  18372963 cgtttgcggagaaaccagcagcggcgatacaaacaaa-taaagagcttcccccttcaagggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-ag 18372866  T
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggac 314  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18372865 tgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 18372788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18372640 - 18372485
Alignment:
Q  134 cggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgaggg 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||  ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18372640 cggtccgtttgcggagaaaccagcagcggcgattcaaacaaa-taaagagcttccccttgaaggggaagcacgataaagtgatggactcacacttgaggg 18372542  T
Q  233 ggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 289  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372541 ggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 249 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380027
Alignment:
Q  249 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  349 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||   |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtgga 18380027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||| | ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154669
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtgagtggtccc 4154669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309139
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  343 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 9309139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 239 - 403
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  239 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  339 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507932
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttt 339  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  340 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtgga 9507932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4154507 - 4154270
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 274  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  4154507 aaagagcttctgcttgaggggtgagcatgaagttttgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcag 4154409  T
Q  275 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 374  Q
    ||| || |||  ||||||||||| |||||||| | || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||  ||    
T  4154408 atagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttgg 4154310  T
Q  375 ttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    ||| ||| |||| ||||||| |||||||| || |||||||    
T  4154309 ttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagactcccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 363
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  347 gagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 320 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579277
Alignment:
Q  320 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 40579277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 399
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284026
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||| ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgggtggt 12284026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  347 gagtgtg 353  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacc 323  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1014219 - 1014122
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1014219 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgt 1014122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 9309164 - 9309262
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9309164 tggtatcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagcagcaagtggctccttgt 9309262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 268 - 382
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  268 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 367  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  368 tgtgcggttgttcta 382  Q
     ||| ||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  348 agtgtggtgtc 358  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 323 - 416
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag 335  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3038202 - 3038099
Alignment:
Q  129 agtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 228  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3038202 agtgtcggtccgtttgaggagaaaccagcaacggcgatacaaagcaagt-aagagcttccgcttgagggggagctcgatgaattgatggactcacacttt 3038104  T
Q  229 agggg 233  Q
    |||||    
T  3038103 agggg 3038099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  327 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  249 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---aaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620666
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||  |||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561739
Alignment:
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaa 25561739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 322 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  322 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||| ||| |||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 3669870 - 3669967
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  3669870 tggtatcagagccccccttcaatgaagggtacgatcgaggcagccggtc-gttgcgcagaaagccgcaacaacggtacaagcaacaagtggctccttgt 3669967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  339 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 371
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274901
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |   | ||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 371  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtg 5274901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12156753 - 12156708
Alignment:
Q  308 aaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156753 aaagaactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 383
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  326 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 383  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 412
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 346  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctccc 412  Q
    || |||||||||   ||  | |||| ||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43274777 - 43274699
Alignment:
Q  195 gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274777 gggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372292
Alignment:
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtgga 18372292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 93
Target Start/End: Original strand, 147637 - 147718
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  147637 tatcagagccccggttcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaagcag 147718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Original strand, 27856196 - 27856249
Alignment:
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  27856196 aggactcataaacccactgccttaagattttggataaaagtgttgtgtctctct 27856249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037944
Alignment:
Q  356 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggct-cccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| ||||||| ||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaaca 3037944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 281 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  281 tagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417756
Alignment:
Q  299 ttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctct 40417756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 91
Target Start/End: Original strand, 9608936 - 9609018
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagc 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||   |||||| | ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  9608936 tggtatcagtgccccggttcgacaaagggtacgaccgaggaaaccggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggtacaagc 9609018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9483000 - 9482921
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaa 89  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||| | |||| ||||||  ||||||||| ||||||    
T  9483000 tggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccgtttgcacagaaaaaagcaacgacggtacaa 9482921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9483144 - 9483084
Alignment:
Q  30 gacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaa 89  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  9483144 gacgaagggtacaaccgaggcagtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 9483084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 34835058 - 34835105
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtc 58  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  34835058 tggtatcagagccc-ggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 34835105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44290683 - 44290458
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290683 aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 44290584  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  44290583 aaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttg 44290484  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  44290483 ttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 179 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 48588713 - 48588465
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48588713 aagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggata 48588614  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48588613 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttg 48588514  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtc-ccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  48588513 ttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaa 48588465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 235 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290800
Alignment:
Q  235 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  335 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaaca 44290800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 139 - 404
Target Start/End: Original strand, 34364818 - 34365084
Alignment:
Q  139 cgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggagt 237  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  34364818 cgtttgcggaaaaaccagcaacagcgacacaagcaa-gtaa-gagcttccgattgagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggagt 34364915  T
Q  238 gttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag 335  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34364916 gttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaag 34365015  T
Q  336 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34365016 gttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 125 - 394
Target Start/End: Original strand, 37555990 - 37556260
Alignment:
Q  125 aagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaattgatggactcac 223  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | | || |||| ||||||||  ||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||    
T  37555990 aagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatagaagc-aagt-aagagctttagcttgaagggggggcaggataaagtgatggactcac 37556087  T
Q  224 acttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataa 320  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  37556088 acttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggac-cataa 37556186  T
Q  321 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37556187 acccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 414
Target Start/End: Original strand, 41157254 - 41157545
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcac 223  Q
    |||| |||||| || |||||| |||||||||| |||||  || |||  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41157254 caagtagtgtcagtccgtttgcggagaaaccaacaacgacgatacaaacaa-gtagagagcttccgctct-gggggagcacgataaattgatggactcac 41157351  T
Q  224 acttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaa 321  Q
    |||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41157352 acttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaa 41157451  T
Q  322 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc-ctaggctcccct 414  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  41157452 cccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26661773 - 26661522
Alignment:
Q  154 cagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caag 250  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||    
T  26661773 cagcaacgacgatacatgcaaagtaa-gagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaag 26661675  T
Q  251 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26661674 tgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagt 26661575  T
Q  351 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  26661574 gtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 179 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22077718 - 22077484
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22077718 aagagcttccgcttgatggggagcatgatgaatacatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatag 22077620  T
Q  279 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 378  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  22077619 aaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgt 22077520  T
Q  379 tctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    || ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  22077519 tcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3537384 - 3537226
Alignment:
Q  167 acatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtc 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537384 acatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtc 3537285  T
Q  266 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaaccc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3537284 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 237 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  345 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550867
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtgga 3550867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 218 - 403
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977438
Alignment:
Q  218 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggact 315  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 246 - 427
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082588
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||| || ||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggatagtcctccgagctccccccagtgacccaaca 40082588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364688
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaaca 34364688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgc-ggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157175
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaaca 41157175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| | || |||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 403
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  253 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  353 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767138
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594747
Alignment:
Q  239 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  339 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgc 32594747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956079
Alignment:
Q  249 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctc 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc 9956079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168674
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      | ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataac------gtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493951
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata----agtaaaaggactcataaacccattgcc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||| | ||  |||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  331 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaaca 45493951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 66349 - 66100
Alignment:
Q  142 ttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtt 240  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  66349 ttgtggagaagccagcaacggcgatacaagcaagataa-gagcttccgcttgatgggggaacatgatgaatagatggactcacacttgaggggaagtgtt 66251  T
Q  241 ggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtt 338  Q
    | | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  66250 g-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggtt 66152  T
Q  339 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    |||||||||||||||| | |||||   |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  66151 ttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 242 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  242 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttg 341  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  342 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 388  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 179 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22077345 - 22077101
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata- 277  Q
    |||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22077345 aagagctttcgcttgatagcgagcatgatgaatagatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 22077247  T
Q  278 -aaat----------agtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 366  Q
     ||||          ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |    
T  22077246 aaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcac 22077147  T
Q  367 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctccc 412  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22077146 ttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850588
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052032
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctaacctcgatgtgga 50052032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661901
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtc 26661901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600322
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtgga 24600322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 248 - 394
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| | |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggac-cttaaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 194 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30630846 - 30630648
Alignment:
Q  194 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||      
T  30630846 agggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttg 30630748  T
Q  294 acaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  30630747 acactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66480
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtgga 66480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 255 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528730
Alignment:
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
     |||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  | |||||||  |||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatgaccccccggactccccttcctgacccaaca 5528730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066210
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgtg 39066210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 427
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575284
Alignment:
Q  251 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 350  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  351 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaaca 5575284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184383
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag--------- 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  336 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 426  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  427 a 427  Q
    |    
T  41184383 a 41184383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  330 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 365  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50051876 - 50051777
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051876 aagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131999
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    |  ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgt 24131999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839813
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttg 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||| | ||| ||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  342 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc-ctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgt-gatagtccctcttggctcccctcaataacccaaca 45839813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcct-aaggtttggggt 22077888  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 312 - 403
Target Start/End: Original strand, 11977011 - 11977102
Alignment:
Q  312 gactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11977011 gactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 387
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793421
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctc 387  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctc 22793421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 428 - 497
Target Start/End: Original strand, 6517096 - 6517165
Alignment:
Q  428 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaattatccaacaaatttttccgcactttatcgaattcatc 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6517096 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaattatccaacaaatttttccgcactttatcaaattcatc 6517165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 11977141 - 11977224
Alignment:
Q  22 cccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctcct 105  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11977141 cccggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcct 11977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48588833 - 48588739
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48588833 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggcagccggtca-ttgtgcagaaagctgcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 48588739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 50051999 - 50051902
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051999 tggtatcagagccccggttcgacaaagggcgcgaccgaggcagccggtg-gttgggcagaaagccgcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 50051902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 394
Target Start/End: Original strand, 24448211 - 24448426
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | |    
T  24448211 aaagagctttcgcttgagggaaagcacgatgaattgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaa 24448309  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
     || |||  | ||||||||  |||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || |||||    
T  24448310 gaaaagtggaagttgaacattttataagtgagagggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttg 24448409  T
Q  378 ttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||  |||| |||||||    
T  24448410 ttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47380008 - 47379891
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47380008 aagaacttccgcttgaggggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttg--atgcaagtgtgagttatatatcccacatcggata 47379911  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacac 297  Q
     || |||  |||||||||||    
T  47379910 gaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 26661873 - 26661766
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||| ||| || || ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  26661873 tggtattagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggctccttgtg 26661774  T
Q  110 cggcaacg 117  Q
    | ||||||    
T  26661773 cagcaacg 26661766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41184298 - 41184198
Alignment:
Q  129 agtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttg 228  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41184298 agtgtcggtccgtttgcggaaaaaccagcaacgacgatacaaac-aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttg 41184200  T
Q  229 ag 230  Q
    ||    
T  41184199 ag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188628
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctct 363  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctct 1188628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttggg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 48588461 - 48588364
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  48588461 tggtatcagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagccggt-tgttgcgcagaaagccgcaacgacgatacaaacaacaagtggctccttgt 48588364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 50469303 - 50469180
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50469303 aagagcttctgcttgaggaggagtatgatgaatagataaactgacact-gagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataa 50469206  T
Q  279 aatagtaaaggttgaacaccttataa 304  Q
     | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469205 taaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 47380258 - 47380143
Alignment:
Q  312 gactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcc 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  |||||  ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  47380258 gactcataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactcc 47380159  T
Q  412 cctcactgacccaaca 427  Q
    ||| | ||||||||||    
T  47380158 cctaattgacccaaca 47380143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378118
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccat 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3537562 - 3537495
Alignment:
Q  164 gacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgag 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3537562 gacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50051775 - 50051689
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50051775 cataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 44290798 - 44290729
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  44290798 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggt-tgttgcgcagaaagccgcaacg 44290729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 497
Target Start/End: Original strand, 6512705 - 6512766
Alignment:
Q  436 cctgatgcagctctatttcttaaattatccaacaaatttttccgcactttatcgaattcatc 497  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  6512705 cctgatgaagctctatttcttaaattatccaataaatttttcagtactttatcaaattcatc 6512766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 405
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956353
Alignment:
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 369  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  370 tgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccta 405  Q
    |||| ||| | || ||||||||| | |||| |||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgtaggtggttcccta 4956353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Original strand, 34649622 - 34649705
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34649622 tggtatcagagccccg-ttcgatgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaagcag 34649705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 21378118 - 21378036
Alignment:
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  21378118 taagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaaca 21378036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22077466 - 22077392
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtaca 88  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  22077466 atcagagcccaggttcgacgaagggtacgaccaaggcagccggtccgttgcggagaaaccagcaacgacggtaca 22077392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878864
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 306  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagt 4878864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 363
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||||| |||||||| | || || ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 66444 - 66377
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  66444 tatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgttgcggagaaaccaacaacg 66377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 428 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6521939 - 6521900
Alignment:
Q  428 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaattatccaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6521939 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaactatccaa 6521900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 34364690 - 34364761
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || | ||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  34364690 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgacccagacagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacg 34364761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187404
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| | | ||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctct 363  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1188453 - 1188392
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 241  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1188453 aagagcttccacttgaaggg-agcatgatgaattgatggactcacacttgaggatgagtgttg 1188392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 428 - 497
Target Start/End: Original strand, 6506790 - 6506859
Alignment:
Q  428 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaattatccaacaaatttttccgcactttatcgaattcatc 497  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  6506790 cactttcccccgatgcagctaaattttttaaattatacaacaaatttttcagccctttatcaaattcatc 6506859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 363
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  327 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266877
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaa 4266877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47380323 - 47380258
Alignment:
Q  199 gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg--gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg 263  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| || |||||||||||||||||||    
T  47380323 gagcatgatgaattgatggattcacacttgaggggaagattgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatg 47380258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  318 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 364  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22077800 - 22077722
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagca 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  22077800 atcagagcccaggttcgacgaagggtatgaccaaggcagccggtccgttgcggagaaaccagtaacgacgatacaagca 22077722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  294 acaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttt 339  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 3537494 - 3537454
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggc 50  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  3537494 tggtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccgaggc 3537454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  254 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaaaagga 313  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  327 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  300 tataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 360  Q
    ||||||||| ||| | |||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 112 - 394
Target Start/End: Original strand, 5643 - 5931
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaat 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5643 gcaacggcggtgcaagcagtgtcggtccgtttgcagagaaaccagtaacggcgacacatgcaaagtaa-gagcttccgcttgagggggagcaagatgaat 5741  T
Q  212 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaa 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5742 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 5841  T
Q  310 aggactcataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5842 aggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctt-aaggttttggg 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 88)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 180 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5542849 - 5542625
Alignment:
Q  180 agagcttccgcttgaggggga-gcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5542849 agagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataa 5542750  T
Q  279 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542749 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 5542650  T
Q  379 tctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    || || ||||||||||| |||||||    
T  5542649 tcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 213 - 401
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  213 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaagg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  313 actcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 401  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 179 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40679852 - 40679632
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  40679852 aagagcttccgcttgagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatag 40679754  T
Q  279 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 378  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  40679753 aaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgt 40679654  T
Q  379 tctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  40679653 tctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178613
Alignment:
Q  236 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaag 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  336 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtgga 36178613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 237 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283451
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaaca 41283451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 395
Target Start/End: Original strand, 6421996 - 6422260
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactca 222  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||| || | ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6421996 caagtagtgtcggttcgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacaagcta-gtaaaaaacttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactca 6422094  T
Q  223 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  6422095 cacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaac 6422187  T
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6422188 ccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 6422260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421543
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccc 6421543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745675
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 14745675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 241 - 403
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  241 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtttt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  341 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 395
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880413
Alignment:
Q  217 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggac 314  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  315 tcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgga 15880413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 235 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543006
Alignment:
Q  235 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  335 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgga 5543006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 174 - 413
Target Start/End: Original strand, 7598538 - 7598769
Alignment:
Q  174 aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcg 273  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  7598538 aagtaaagagcttccgcttgaaggggggcatgatgaatagatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatca 7598637  T
Q  274 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcg 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  7598638 gataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtg 7598729  T
Q  374 gttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccc 413  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || || || ||||||||    
T  7598730 gttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctcccc 7598769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14745518 - 14745301
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14745518 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaata 14745420  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gcggtt 376  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || | ||||    
T  14745419 aaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggtt 14745320  T
Q  377 gttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14745319 gttctagcctcgatgtgga 14745301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28531519 - 28531316
Alignment:
Q  197 gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 296  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  28531519 gggagcatgatgaactgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaaca 28531421  T
Q  297 ccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggat 396  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28531420 ccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggat 28531321  T
Q  397 ggtcc 401  Q
    |||||    
T  28531320 ggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Original strand, 40733814 - 40734040
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40733814 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaa 40733913  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggt 375  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  40733914 taaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcat-aacctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggt 40734012  T
Q  376 tgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  40734013 tgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 212 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36178460 - 36178320
Alignment:
Q  212 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  36178460 tgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggg 36178361  T
Q  312 gactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178360 gactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 116 - 427
Target Start/End: Original strand, 3672954 - 3673249
Alignment:
Q  116 cggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttg-agggggagcacgatgaattga 214  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  3672954 cggcggtgcaagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacatgcaaagtaaa-agcttccgcttgaagagggagcatgatgaattga 3673052  T
Q  215 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaagg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||                 |||||||||| |||    
T  3673053 tggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagagg 3673135  T
Q  313 actcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctccc 412  Q
    |  ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  3673136 atccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctccc 3673235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 202 - 403
Target Start/End: Original strand, 40733472 - 40733675
Alignment:
Q  202 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  40733472 cacgatgaattgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacacct 40733571  T
Q  300 tataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||    
T  40733572 tataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggt 40733671  T
Q  400 cccc 403  Q
    ||||    
T  40733672 cccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggac-cataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514807
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 42514807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 402
Target Start/End: Original strand, 29676830 - 29677065
Alignment:
Q  174 aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    ||||||| |||||||| |   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29676830 aagtaaaaagcttccggtctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacat 29676929  T
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaag-----gactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 366  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||     ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||      
T  29676930 cggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaa 29677029  T
Q  367 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29677030 ttgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 36785854 - 36785664
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaat 211  Q
    |||||||| || |||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||  || |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36785854 gcaacggcggtacaagcagtatcgatccgtttgcagagaaaccagcaacgacgatacaaccaa-gtaa-gagcttccgcttgagggggagcatgatgaat 36785757  T
Q  212 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785756 tgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005888
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtgga 36005888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511503
Alignment:
Q  252 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 351  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  352 tggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtgga 15511503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 392
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731795
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  350 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgt 392  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgt 33731795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713135
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg-ttttgggta 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6713135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 237 - 393
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 263 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  263 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  363 ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  345 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  249 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  349 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagc 384  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632575
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  256 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccc 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 258 - 427
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  258 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  358 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 139 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 38796484 - 38796298
Alignment:
Q  139 cgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaatt-gatggactcacacttgagggggag 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  38796484 cgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaa-gatcttccgcttgaagggggagcatgatgaaaaagatggactcacacttgagggggag 38796387  T
Q  237 tgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacc 323  Q
    |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  38796386 tgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 178 - 386
Target Start/End: Original strand, 30313109 - 30313318
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  30313109 aaagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgttggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcgg 30313207  T
Q  275 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 374  Q
    ||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||    
T  30313208 atagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgg 30313306  T
Q  375 ttgttctagcct 386  Q
    ||| ||| ||||    
T  30313307 ttgctctggcct 30313318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 404
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 389
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  225 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    ||||| |||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatcttataag----aggacccataaac 31468831  T
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 362
Target Start/End: Original strand, 30323395 - 30323581
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 274  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  30323395 aaagagcatccgcttgagggatgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcag 30323493  T
Q  275 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 362  Q
    ||| || | |  ||||||||||| ||| |||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323494 atagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 352
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  345 aagagtgt 352  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33561676 - 33561491
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgaggggg-agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 276  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  33561676 aaagaacttccccttgaggggggagtgcgatgaattgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagat 33561578  T
Q  277 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    | || |||  ||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561577 agaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 307
Target Start/End: Original strand, 42514899 - 42515078
Alignment:
Q  128 cagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacactt 227  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| | || ||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  42514899 cagtgtcggtccgtt-gcggagaaaccagcaacagcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttgagagggagcatgatgaatagatggactcacattt 42514995  T
Q  228 gagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtta----tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 307  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514996 gagggggagtgtt-gtgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Original strand, 29676711 - 29676819
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29676711 tggtatcagagccccggttcaacgaagggtatgactgaggccgccgatcagttgcgcagaaagcaacaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtg 29676810  T
Q  110 cggcaacgg 118  Q
    | |||||||    
T  29676811 cagcaacgg 29676819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  253 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  353 ggtgt 357  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 205 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37894889 - 37894732
Alignment:
Q  205 gatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 304  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || |||||||||    
T  37894889 gatgaatagatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataa 37894791  T
Q  305 gtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894790 gtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 426
Target Start/End: Original strand, 6421796 - 6421911
Alignment:
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggct 409  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||    
T  6421796 aggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccgagct 6421895  T
Q  410 cccctcactgacccaac 426  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6421896 cccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 403
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  253 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  353 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 209 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29873732 - 29873563
Alignment:
Q  209 aattgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  29873732 aattgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagt 29873634  T
Q  307 aaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
       ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||    
T  29873633 gggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 33953995 - 33953821
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||   |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33953995 aaagagcttcctcttgagggggagcacgatgaattaacatactcaattttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagata 33953897  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
     || |||  |||||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953896 gaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 177 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41678595 - 41678419
Alignment:
Q  177 taaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagt--tatatgtcccacatcg 273  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||||||     
T  41678595 taaagagcttccgcttgaggagagagcattatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtt-gtgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatca 41678497  T
Q  274 gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678496 gatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgcctta 333  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591065
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttggg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 426
Target Start/End: Original strand, 3672756 - 3672882
Alignment:
Q  299 ttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatgg 398  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3672756 ttataagtaaaagatct-ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgg 3672854  T
Q  399 tcccctaggctcccctcactgacccaac 426  Q
    | |||  ||||||||  | |||||||||    
T  3672855 ttcccctggctccccctagtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||| |||| ||   |||||||||||| | | |||| |||||||  |||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14745641 - 14745544
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14745641 tggtatcagagccccggttcgatgaagggtgcgaccaaggcagccgatc-gttacgcagaaagccgcaacgacagtacaagcaacaagtggctccttgt 14745544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  345 aagagtgtggtgtctct 361  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 36178581 - 36178513
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36178581 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccaaggccaccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 36178513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  261 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 350  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 352
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  348 agtgt 352  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385853
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  346 agagtgtggtgtctct 361  Q
      ||||||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctct 31385853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 395
Target Start/End: Original strand, 6421691 - 6421776
Alignment:
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  6421691 aggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtgga 6421776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 7598409 - 7598494
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7598409 actggtatcaaagcccaggttcgacgaagggtacgactgaggtagccggtccgttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcag 7598494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  298 cttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 390  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 395
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231399
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||| || |||||||  ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtgga 9231399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 5542973 - 5542876
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  5542973 tggtatcagagcttcggttcgacgacgaatgcaaccgaggcagtcggtc-gttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcaacaagtggctccttgt 5542876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954302
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | ||| |||||||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctct 33954302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 40734231 - 40734300
Alignment:
Q  200 agcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734231 agcacgatgaattgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 335 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  335 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 37106107 - 37106155
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtc 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37106107 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggccgccggtc 37106155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 293
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 363
Target Start/End: Original strand, 28226722 - 28226772
Alignment:
Q  312 gactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226722 gactcataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 34481588 - 34481642
Alignment:
Q  188 cgcttgagg-gggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg 241  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34481588 cgcttgaggcgggagcgtgatgaattgatggactcacacttgagggagagtgttg 34481642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594188
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | ||||  ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||| | |||||| | || ||| | || ||||| ||||||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtg 3594188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33954104 - 33954064
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatgga 218  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33954104 aaagagcttccgtttcagggggagcacgatgaattgatgga 33954064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 35580533 - 35580478
Alignment:
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  35580533 aggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctct 35580478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 8904499 - 8904546
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904499 cataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 28226408 - 28226455
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226408 cataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 40734067 - 40734149
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaagca 92  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| | |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40734067 tggtatcagagccccg-ttcgtcaaagggtacgaccgaggcagccggttcgtttgcgcagaaagcagcaacaacggtacaagca 40734149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35580609 - 35580532
Alignment:
Q  182 agcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgag 256  Q
    ||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||    
T  35580609 agcttccccttgaaggaggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggagagtgctgttgtgtgcaagtgtgag 35580532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 23346411 - 23346502
Alignment:
Q  1 cccaacaactggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagt-tgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  23346411 cccaacaa-tggtatcagagccc-ggtttgacgtagggtacgaccgaggtagccggtctgtctgcgcagaaagcaacaatggcagtacaagcag 23346502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 162
Target Start/End: Original strand, 23346489 - 23346534
Alignment:
Q  117 ggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacgg 162  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23346489 ggcagtacaagcagtgtcggtctgtttgcggagaaaccagcaacgg 23346534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312948
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct-tgcttgtgcggttgttctagcc 385  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    ||||||||||| ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  386 tcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |  |||||| ||||||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccc 30312948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 35580699 - 35580670
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580699 tggtatcagagccccggttcgacgaagggt 35580670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Original strand, 3672888 - 3672951
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagc 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  3672888 tatcagagccccg-ttcgacgaagggtgtgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagc 3672951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13792576 - 13792536
Alignment:
Q  321 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 361  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792576 acccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 116)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 124 - 393
Target Start/End: Original strand, 54108796 - 54109060
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactca 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  54108796 caagtagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaatagactca 54108893  T
Q  223 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  54108894 cacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 54108990  T
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54108991 ccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 180 - 426
Target Start/End: Original strand, 36629172 - 36629418
Alignment:
Q  180 agagcttccgcttgaggg-ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataa 278  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36629172 agagcttccgcttgaaggtggagcatgatgaattgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatag 36629270  T
Q  279 aatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgt 378  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36629271 aaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt 36629370  T
Q  379 tctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaac 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  36629371 tctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Original strand, 39404273 - 39404555
Alignment:
Q  115 acggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39404273 acggcagtgcaagcagtgtcggtccgtttgcggagaaaccatcaacggcgataca-----agtaa-gagcttccgcttgagggagagcacgatgaattga 39404366  T
Q  215 tggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaagg 312  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39404367 tggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagagg 39404465  T
Q  313 actcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39404466 acccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 174 - 416
Target Start/End: Original strand, 44620587 - 44620830
Alignment:
Q  174 aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44620587 aagtaaagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacat 44620686  T
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 371  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44620687 cggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacc-ataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtg 44620785  T
Q  372 cggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  44620786 cggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 235 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630731
Alignment:
Q  235 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaa 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  335 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgccta-gctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 237 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctccc 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483517
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| || ||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaaca 25483517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 395
Target Start/End: Original strand, 20826086 - 20826367
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaa 210  Q
    |||||||| || |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  20826086 gcaacggcggtacaagcagtgttgatccgtttgcggagaaaccagcaacggcgatacaagcaa-gtaat-agcgtccgcttgaagggggagcatgatgaa 20826183  T
Q  211 ttgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaa 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20826184 tagatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaaga 20826282  T
Q  311 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    | || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20826283 gaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtgga 20826367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 354
Target Start/End: Original strand, 2740956 - 2741180
Alignment:
Q  130 gtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggag--cacgatgaattgatggactcacactt 227  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  2740956 gtgtcggtccgtttgcagagaaaccagcaacggcgatacgagcaaagtaa-gagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacactt 2741054  T
Q  228 gagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccatt 327  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||    
T  2741055 gaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccatt 2741153  T
Q  328 gccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2741154 gccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246101
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac-cataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaaca 10246101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884854
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggtttt-ggg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  344 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtgcgtggtcccc 52884854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18932982 - 18932747
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg--- 274  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  18932982 aagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtcc 18932884  T
Q  275 --------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc 366  Q
            |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18932883 tacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttac 18932784  T
Q  367 ttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18932783 ttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  242 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  342 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340988
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| || ||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaaca 3340988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 386  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027936
Alignment:
Q  214 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaag 311  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  312 gactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcc 411  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||  |||||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcc 22027951  T
Q  412 cctcactgacccaaca 427  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22027950 cctca-tgacccaaca 22027936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 427
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404200
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| | ||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaaca 39404200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctccc 412  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 255 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac-------cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 247 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 393
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  215 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaagg 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  313 actcataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 247 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608635
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaacac 428  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc-gtgacccaacac 36608635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941129
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 32941129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 402
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaag 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  348 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  254 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  354 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 237 - 365
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880280
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 365  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttg 49880280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45489622 - 45489331
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaat 211  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||  | || ||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||     
T  45489622 gcaacggcggtacaagaagtgtcggtccgtttgcggagaacccagcaatagcgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgcttgaagaggagcatgatgaaa 45489525  T
Q  212 t-gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 307  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  45489524 acgatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagta 45489425  T
Q  308 aaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    | || |||| |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45489424 agagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028342
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgg 342  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  343 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaaca 22028342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 130 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 49076722 - 49076449
Alignment:
Q  130 gtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaat--tgatggactcacact 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||    
T  49076722 gtgtcggtccgtttgtggagaaaccagcaacgacaatacaagcaa-gtaa-gagtttccgcttgaagggggaacatgatgaaaagtgatggactcacact 49076625  T
Q  227 tgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaaccc 324  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  49076624 tgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaaccc 49076525  T
Q  325 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49076524 attgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076828
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccct 49076828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  254 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  354 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcacttgt--ggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 194 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3244657 - 3244458
Alignment:
Q  194 agggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 293  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3244657 agggggaacatgatgaatagatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttga 3244559  T
Q  294 acaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  3244558 acatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtg 3244459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 427
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826018
Alignment:
Q  251 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  351 gtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| ||| ||| ||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaaca 20826018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 394
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108686
Alignment:
Q  244 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacc-cattgccttaaggttttgg 342  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  343 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg 54108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccc 413  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 404
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccct 404  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 308
Target Start/End: Original strand, 44621353 - 44621489
Alignment:
Q  174 aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 271  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44621353 aagtaaagagcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacat 44621452  T
Q  272 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44621453 gggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaa 44621489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  246 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccc 402  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 264 - 395
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936345
Alignment:
Q  264 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  364 tgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
      | | || |||||||||||||||||||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtgga 54936345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 260 - 371
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496931
Alignment:
Q  260 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 359  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  360 ctcttgcttgtg 371  Q
    ||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtg 45496931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  347 gagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg 336  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 416
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174677
Alignment:
Q  221 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactca 317  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  318 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctca 416  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || |  ||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 403
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341286
Alignment:
Q  202 cacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 299  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  300 tataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggt 399  Q
    ||||||||| ||||| |||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||| || || ||||||||| || |||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  400 cccc 403  Q
    ||||    
T  3341283 cccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 299 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  299 ttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatgg 398  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  399 tcccc 403  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004593
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 34004593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741154
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||  ||||||||||||||  ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaaca 54741154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaaggact--------cattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    |||||| || |||||||||   ||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtc 400  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 391
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         || ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatg 391  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| | || || |||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 395
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691304
Alignment:
Q  296 accttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  394 ga 395  Q
    ||    
T  31691303 ga 31691304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  285 aaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagc 384  Q
    |||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  385 ctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111736
Alignment:
Q  266 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctct 48111736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 45496734 - 45496806
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45496734 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgac 45496806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 258 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  258 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16889444 - 16889315
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagcacga-tgaa 210  Q
    |||||||| || |||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16889444 gcaacggcggtacaagtagtgtccgtccgtttgaggagaaaccagcaacgacgatacaaac-aagtaaagagcttccgcttgagggggagcacgattaaa 16889346  T
Q  211 ttgatggactcacacttgagggggagtgttg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889345 gtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Original strand, 3340990 - 3341083
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  3340990 tggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaaacaacaagtggctc 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 10246103 - 10246212
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgta 109  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  10246103 tggtatcagaaccccggttcgatgaagggtacgactgaggccgcctgtcagttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggcttcttgtg 10246202  T
Q  110 cggcaacggc 119  Q
    | ||||||||    
T  10246203 cagcaacggc 10246212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 382
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggta 345  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  346 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcta 382  Q
    | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 401
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  291 tgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgat 390  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  391 gtggatggtcc 401  Q
    ||||| |||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Original strand, 10246317 - 10246436
Alignment:
Q  217 gactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggac 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  10246317 gactcacgcttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggac 10246416  T
Q  315 tcataaacccattgccttaa 334  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  10246417 ccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  287 aggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcct 386  Q
    ||||||||||| || ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 414
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  250 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  350 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||| |||   || ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18933102 - 18933008
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18933102 tatcagagccccggttcgacgaagtgtgcgaccgaggcagccggt-ggttgtgcagaaagtcgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgt 18933008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 41370543 - 41370637
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  41370543 tatcagagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtc-gttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtagctccttgt 41370637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 308
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620359
Alignment:
Q  253 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 44620359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 395
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271939
Alignment:
Q  267 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 362  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  363 -ttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
     ||  || || |||||||||||||||||||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtgga 3271939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 11197297 - 11197344
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197297 cataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15841209 - 15841023
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggag-tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||| | |||| |  | || | ||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  15841209 aaagagcttccgcttgagtggtgagaatgatgaattgatggagtcacacttgacgaggagatcgttgtgtacaaatgtgaattatatgtcccatatcaga 15841110  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    || || |||  ||| ||||||  |||||||| | ||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15841109 tagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagtgtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 308
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621008
Alignment:
Q  229 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaa 44621008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  216 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 337 - 403
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  337 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 377
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544239
Alignment:
Q  248 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg-ttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | | ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctctcacttgtacggttg 34544239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 403
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895453
Alignment:
Q  355 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg-tggtcccc 19895453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 20826024 - 20826104
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggt-cagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcag 93  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20826024 atcagagccccaattcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcag 20826104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| ||| || |  ||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 331 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 39699014 - 39698950
Alignment:
Q  331 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  39699014 ttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgcttgtgcggttattctagtctcgatgtgga 39698950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45489784 - 45489721
Alignment:
Q  331 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 394  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  45489784 ttaaggttttgggtaatagtgtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtgg 45489721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 357
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  311 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11783644 - 11783528
Alignment:
Q  310 aggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggct 409  Q
    ||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||   |||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||     
T  11783644 aggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctggca 11783545  T
Q  410 cccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11783544 cccctca-tgacccaaca 11783528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 370 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1731624 - 1731581
Alignment:
Q  370 tgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccc 413  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1731624 tgcggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 10396202 - 10396249
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396202 cataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 363
Target Start/End: Original strand, 10396487 - 10396534
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396487 cataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Original strand, 2740874 - 2740943
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaac 79  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||    
T  2740874 tggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaac 2740943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702307
Alignment:
Q  359 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 11702307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  303 aagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 361  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 395
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370808
Alignment:
Q  325 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtgga 41370808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348423
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagt 306  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagt 11348423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 358 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817431
Alignment:
Q  358 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 23817431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 23817652 - 23817572
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagcaacgacagtacaag 90  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||| | | |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23817652 tggtatcatagcccca-ttcgacgaagggtacgatcgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 23817572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 922489 - 922537
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 364  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922489 cataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 352
Target Start/End: Original strand, 1868122 - 1868158
Alignment:
Q  316 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868122 cataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41707388 - 41707340
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacact 226  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41707388 aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaattgatggactcacact 41707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 293
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  237 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Original strand, 44621182 - 44621253
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacg 80  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||    
T  44621182 tggtatcagagccctggtttgacgaagggtacgaccgagacagccggtccgttttcgcagaaagcagcaacg 44621253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 232
Target Start/End: Original strand, 5882092 - 5882122
Alignment:
Q  202 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882092 cacgatgaattgatggactcacacttgaggg 5882122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 427
Target Start/End: Original strand, 20695926 - 20695979
Alignment:
Q  373 ggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  20695926 ggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagct-ccctcactgacccaaca 20695979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23817575 - 23817498
Alignment:
Q  124 caagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttgagggggagc 202  Q
    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23817575 caagtagtgtcggtctgtttctggagaaaccagcaacaacgatacaaacaa-gtaaagagcttccgcttgagggggagc 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  321 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50788034
Alignment:
Q  323 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 361  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctct 50788034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 363
Target Start/End: Original strand, 11197009 - 11197054
Alignment:
Q  318 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197009 taaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 286  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 427
Target Start/End: Original strand, 45496675 - 45496732
Alignment:
Q  370 tgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||| ||||||||||||    
T  45496675 tgcggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaaca 45496732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21504846 - 21504790
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggg 233  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21504846 aaagaacttccacttgaggggtgagcatgatgaatcgatggactcacatttgagggg 21504790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22027794 - 22027754
Alignment:
Q  374 gttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggctcccct 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22027794 gttgttttagcctcgatgtggatggtccctcaggctcccct 22027754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  327 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 6)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 112 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1398 - 1083
Alignment:
Q  112 gcaacggcagtgcaagcagtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaa 210  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  1398 gcaacggcggtacaagtagtgtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gtaa-gagcttccgctcgaagggggagcatgatcaa 1301  T
Q  211 ttgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 308  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1300 aagatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaa 1201  T
Q  309 aaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccctaggc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||    
T  1200 aaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagc 1101  T
Q  409 tcccctcactgacccaaca 427  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  1100 tcccc-cagtgacccaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3212 - 3092
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 275  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3212 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgagttgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcgga 3113  T
Q  276 taaaatagtaaaggttgaaca 296  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  3112 taaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  292 gaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 363  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1464 - 1383
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcag-ttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaag 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  1464 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaag 1383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1575 - 1464
Alignment:
Q  129 agtgtcggttcgtttgtggagaaaccagcaacg--gagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacac 225  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  | || ||| |||| ||||| ||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1575 agtgtaggtccgtttgcggagaaaccagcaacgttgtgatacaagcaa-gtaaa-agctttcgctggaagggggagcatgatgaatcgattgactcacac 1478  T
Q  226 ttgagggggagtgt 239  Q
    ||||||||||||||    
T  1477 ttgagggggagtgt 1464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1658 - 1591
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagtt-gcgcagaaagcagca 77  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||    
T  1658 tggtatcagagcctcg-ttcgacaaagggtacaaccgaggcagctggtccgtttgcgcagaaagcagca 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 365
Target Start/End: Original strand, 5268 - 5477
Alignment:
Q  158 aacggagacacatgcaaagtaaagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtg 254  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  || ||||||||||    
T  5268 aacggcgatacaggcaaagtaa-gagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtg 5366  T
Q  255 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 354  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5367 agttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtgg 5466  T
Q  355 tgtctctcttg 365  Q
    |||||||||||    
T  5467 tgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 395
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5132
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 395  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtgga 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5262
Alignment:
Q  26 gttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5181 gttcgacgaaaggtacgatcgaggcagctggtc-gttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgt 5262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 179 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 366 - 147
Alignment:
Q  179 aagagcttccgcttga-gggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  366 aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 268  T
Q  278 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  267 aaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac-cataaa-ccat--actttagg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttg 173  T
Q  378 ttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  172 ttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 514
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  347 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccc 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 392
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  489 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtc-gttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgt 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 106; Significance: 8e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 198 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17663 - 17496
Alignment:
Q  198 ggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 295  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17663 ggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaac 17564  T
Q  296 accttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 361  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17563 accttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  245 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 344  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  345 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 403  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Original strand, 39770 - 39963
Alignment:
Q  178 aaagagcttccgcttgagggg-gagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39770 aaagagcttccgcttgaggggtgagcatgatgaattgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 39869  T
Q  277 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 370  Q
    | || |||   ||||| || | |||||||| | | ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39870 agaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 377
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 346  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| | ||||   ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaa-gttttgggtaa 39556  T
Q  347 gagtg-tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 377  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  247 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaac 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 428 - 497
Target Start/End: Original strand, 815 - 884
Alignment:
Q  428 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaattatccaacaaatttttccgcactttatcgaattcatc 497  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  815 cactttcccccgatgcagctaaattttttaaattatacaacaaatttttcagccctttatcaaattcatc 884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 428 - 497
Target Start/End: Original strand, 8468 - 8537
Alignment:
Q  428 cactgtcccctgatgcagctctatttcttaaattatccaacaaatttttccgcactttatcgaattcatc 497  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  8468 cactttcccccgatgcagctaaattttttaaattatacaacaaatttttcagccctttatcaaattcatc 8537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University