View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1526R-Insertion-6 (Length: 524)

Name: NF1526R-Insertion-6
Description: NF1526R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1526R-Insertion-6
NF1526R-Insertion-6
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (9-364)||(5202736-5203091)
chr5 (9-125)||(3386575-3386691)
chr5 (9-133)||(24105760-24105884)
chr5 (9-122)||(9008146-9008259)
chr5 (9-128)||(31883144-31883263)
chr5 (9-122)||(27679258-27679371)
chr5 (9-122)||(1579042-1579155)
chr5 (9-122)||(1605660-1605773)
chr5 (9-122)||(3921587-3921700)
chr5 (9-122)||(16069359-16069472)
chr5 (9-122)||(35782733-35782846)
chr5 (11-122)||(33491287-33491398)
chr5 (9-122)||(16737536-16737649)
chr5 (9-122)||(20992235-20992348)
chr5 (9-122)||(27420864-27420977)
chr5 (9-124)||(20992370-20992489)
chr5 (9-122)||(8374427-8374540)
chr5 (9-122)||(19358532-19358645)
chr5 (9-122)||(33991146-33991259)
chr5 (9-121)||(1165690-1165802)
chr5 (9-122)||(4120943-4121056)
chr5 (9-122)||(38598539-38598652)
chr5 (9-120)||(33284664-33284775)
chr5 (9-90)||(26603031-26603112)
chr5 (382-460)||(5202570-5202648)
chr5 (9-122)||(31410482-31410595)
chr5 (9-83)||(27025001-27025075)
chr5 (259-322)||(35257319-35257382)
chr5 (9-78)||(19516059-19516128)
chr5 (9-62)||(41818552-41818605)
chr5 (258-310)||(10373576-10373628)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (9-130)||(41575510-41575631)
chr8 (9-122)||(18594542-18594655)
chr8 (9-122)||(39206591-39206704)
chr8 (9-131)||(14422699-14422821)
chr8 (9-122)||(10836844-10836957)
chr8 (9-122)||(34842454-34842567)
chr8 (9-122)||(35118120-35118233)
chr8 (9-124)||(34679546-34679661)
chr8 (9-122)||(2042613-2042726)
chr8 (9-122)||(13110409-13110522)
chr8 (9-122)||(22260719-22260832)
chr8 (9-122)||(26783822-26783935)
chr8 (9-122)||(29938066-29938179)
chr8 (9-122)||(33278405-33278518)
chr8 (9-134)||(38167244-38167369)
chr8 (9-122)||(40117941-40118054)
chr8 (9-133)||(144388-144512)
chr8 (9-122)||(7774769-7774882)
chr8 (9-122)||(7791416-7791529)
chr8 (9-122)||(8021724-8021837)
chr8 (9-121)||(44805033-44805145)
chr8 (9-119)||(34998985-34999095)
chr8 (9-122)||(24113255-24113368)
chr8 (9-122)||(33287114-33287227)
chr8 (9-122)||(39218782-39218895)
chr8 (9-122)||(4035852-4035965)
chr8 (9-122)||(6144362-6144475)
chr8 (9-122)||(42571599-42571711)
chr8 (9-122)||(7812000-7812113)
chr8 (9-122)||(66269-66382)
chr8 (9-122)||(5320569-5320682)
chr8 (18-121)||(36491163-36491266)
chr8 (9-124)||(5005169-5005284)
chr8 (9-122)||(2322101-2322214)
chr8 (9-122)||(28639283-28639400)
chr8 (12-122)||(39220261-39220371)
chr8 (40-122)||(9806878-9806960)
chr8 (9-48)||(9807339-9807378)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (9-122)||(30181103-30181216)
chr7 (9-121)||(42965075-42965187)
chr7 (9-122)||(4477400-4477513)
chr7 (9-122)||(7164188-7164301)
chr7 (9-122)||(33846603-33846716)
chr7 (9-121)||(12101257-12101369)
chr7 (9-131)||(33359169-33359291)
chr7 (9-122)||(1803030-1803143)
chr7 (9-122)||(20346492-20346605)
chr7 (9-122)||(32041546-32041659)
chr7 (9-121)||(43156718-43156830)
chr7 (9-124)||(933287-933402)
chr7 (9-131)||(22649773-22649895)
chr7 (9-122)||(42204158-42204272)
chr7 (9-122)||(3511327-3511440)
chr7 (9-122)||(5280864-5280977)
chr7 (9-122)||(6394755-6394868)
chr7 (9-122)||(19828274-19828387)
chr7 (9-122)||(24792411-24792524)
chr7 (9-122)||(25748491-25748604)
chr7 (9-122)||(43068052-43068165)
chr7 (9-122)||(4347277-4347390)
chr7 (9-122)||(15655916-15656029)
chr7 (9-122)||(36890909-36891021)
chr7 (9-121)||(43021655-43021767)
chr7 (9-122)||(38866548-38866661)
chr7 (14-122)||(9452594-9452702)
chr7 (9-122)||(8630670-8630783)
chr7 (17-122)||(43405024-43405129)
chr7 (9-121)||(12097669-12097781)
chr7 (31-122)||(37704984-37705075)
chr7 (9-122)||(46891418-46891532)
chr7 (9-122)||(17753604-17753717)
chr7 (9-127)||(42673464-42673578)
chr7 (14-122)||(46134388-46134496)
chr7 (9-128)||(37005890-37006009)
chr7 (9-90)||(16894586-16894667)
chr7 (9-90)||(48865666-48865750)
chr7 (37-121)||(27691433-27691517)
chr7 (32-122)||(15655514-15655604)
chr7 (259-326)||(22787808-22787875)
chr7 (9-122)||(36849616-36849729)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (9-122)||(54412631-54412744)
chr4 (9-122)||(23776536-23776649)
chr4 (9-124)||(48909847-48909962)
chr4 (9-122)||(6611437-6611550)
chr4 (9-122)||(20877050-20877163)
chr4 (9-122)||(50055178-50055291)
chr4 (9-122)||(19165048-19165162)
chr4 (9-122)||(14987795-14987908)
chr4 (9-122)||(16700784-16700897)
chr4 (9-122)||(19913707-19913820)
chr4 (9-122)||(30423641-30423754)
chr4 (9-122)||(50053446-50053559)
chr4 (9-122)||(54189548-54189661)
chr4 (9-117)||(37968834-37968942)
chr4 (9-124)||(28032789-28032904)
chr4 (9-128)||(28360427-28360546)
chr4 (9-131)||(38055151-38055273)
chr4 (9-135)||(45424611-45424737)
chr4 (9-122)||(1756841-1756954)
chr4 (9-122)||(27488725-27488838)
chr4 (9-122)||(40428797-40428910)
chr4 (9-122)||(50353804-50353917)
chr4 (9-122)||(53717541-53717654)
chr4 (11-122)||(1617087-1617198)
chr4 (9-122)||(2481485-2481598)
chr4 (9-122)||(8932255-8932368)
chr4 (9-122)||(11639655-11639768)
chr4 (9-122)||(15241105-15241218)
chr4 (9-122)||(15669186-15669299)
chr4 (9-122)||(35490850-35490963)
chr4 (9-122)||(44784994-44785107)
chr4 (9-122)||(52139206-52139319)
chr4 (9-122)||(53875660-53875773)
chr4 (9-121)||(27583709-27583821)
chr4 (9-121)||(40680115-40680227)
chr4 (9-122)||(53353058-53353175)
chr4 (9-124)||(23704286-23704401)
chr4 (9-128)||(43290037-43290156)
chr4 (9-122)||(47632037-47632151)
chr4 (9-122)||(30171583-30171696)
chr4 (9-122)||(37464724-37464837)
chr4 (22-122)||(6688711-6688811)
chr4 (9-116)||(38071397-38071504)
chr4 (9-110)||(31969696-31969797)
chr4 (9-124)||(44379264-44379379)
chr4 (9-115)||(8591169-8591275)
chr4 (9-116)||(33703850-33703957)
chr4 (9-103)||(16703843-16703937)
chr4 (40-122)||(23265865-23265947)
chr4 (9-122)||(27536181-27536290)
chr4 (30-122)||(55344923-55345015)
chr4 (9-122)||(44375848-44375961)
chr4 (30-111)||(44548239-44548320)
chr4 (9-59)||(51780795-51780845)
chr4 (9-48)||(23269123-23269162)
chr4 (9-123)||(17493335-17493449)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (9-122)||(26323275-26323388)
chr2 (9-144)||(39635433-39635568)
chr2 (9-122)||(30420256-30420369)
chr2 (9-134)||(33906136-33906261)
chr2 (9-131)||(31517304-31517426)
chr2 (9-122)||(3873333-3873446)
chr2 (9-122)||(4232231-4232344)
chr2 (9-122)||(18806973-18807086)
chr2 (9-122)||(28329926-28330039)
chr2 (9-114)||(1108290-1108395)
chr2 (9-122)||(6174917-6175030)
chr2 (9-128)||(42937716-42937835)
chr2 (9-122)||(2178858-2178971)
chr2 (9-122)||(4016042-4016155)
chr2 (9-121)||(16066383-16066495)
chr2 (9-128)||(16588865-16588984)
chr2 (9-122)||(19901227-19901339)
chr2 (9-117)||(5733407-5733515)
chr2 (9-122)||(1482992-1483104)
chr2 (9-122)||(30270768-30270881)
chr2 (9-122)||(851000-851113)
chr2 (9-129)||(429812-429932)
chr2 (9-121)||(44947631-44947743)
chr2 (17-111)||(19384032-19384126)
chr2 (9-122)||(42446658-42446771)
chr2 (9-89)||(22101236-22101316)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (9-122)||(1168506-1168619)
chr1 (9-124)||(29078517-29078632)
chr1 (9-122)||(26663261-26663374)
chr1 (11-128)||(38829066-38829183)
chr1 (9-133)||(49146164-49146288)
chr1 (9-124)||(12682821-12682936)
chr1 (9-122)||(33510487-33510600)
chr1 (9-128)||(43905651-43905770)
chr1 (9-128)||(46409432-46409551)
chr1 (9-122)||(8079798-8079911)
chr1 (9-122)||(8120872-8120985)
chr1 (9-122)||(20089474-20089587)
chr1 (9-122)||(25897377-25897490)
chr1 (9-122)||(26580359-26580472)
chr1 (9-122)||(29288152-29288265)
chr1 (9-122)||(32671582-32671695)
chr1 (9-122)||(39260435-39260548)
chr1 (9-122)||(41928584-41928697)
chr1 (9-122)||(52753236-52753349)
chr1 (9-124)||(40092492-40092607)
chr1 (9-122)||(1170533-1170646)
chr1 (17-122)||(1940844-1940949)
chr1 (9-122)||(16052099-16052212)
chr1 (9-122)||(19715250-19715363)
chr1 (9-122)||(52696794-52696907)
chr1 (9-122)||(970613-970728)
chr1 (9-124)||(29695676-29695792)
chr1 (9-124)||(13996812-13996927)
chr1 (11-122)||(42370886-42370997)
chr1 (9-122)||(2347659-2347772)
chr1 (9-122)||(2473725-2473838)
chr1 (9-122)||(5215388-5215501)
chr1 (9-122)||(17591694-17591804)
chr1 (9-134)||(38171823-38171948)
chr1 (9-133)||(15203104-15203228)
chr1 (9-131)||(23498454-23498576)
chr1 (9-122)||(46760969-46761082)
chr1 (9-122)||(15717788-15717900)
chr1 (9-122)||(51359306-51359418)
chr1 (9-109)||(17587594-17587694)
chr1 (35-122)||(15554259-15554346)
chr1 (9-124)||(52086268-52086383)
chr1 (9-122)||(7145210-7145323)
chr1 (9-122)||(6765462-6765575)
chr1 (9-90)||(40149498-40149579)
chr1 (9-112)||(23322929-23323032)
chr1 (54-122)||(5675108-5675176)
chr1 (259-310)||(42947853-42947904)
chr1 (239-297)||(12387851-12387909)
chr1 (269-307)||(51920931-51920969)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (9-122)||(30691856-30691969)
chr6 (9-122)||(3347612-3347725)
chr6 (9-122)||(6086688-6086801)
chr6 (9-122)||(26946965-26947078)
chr6 (12-122)||(2837550-2837660)
chr6 (9-122)||(3955855-3955968)
chr6 (9-122)||(16307097-16307210)
chr6 (9-122)||(52841-52954)
chr6 (9-122)||(17261162-17261275)
chr6 (9-122)||(18613543-18613656)
chr6 (9-122)||(26704428-26704541)
chr6 (9-122)||(34887381-34887494)
chr6 (9-122)||(35198289-35198401)
chr6 (9-117)||(1153603-1153711)
chr6 (9-122)||(9459568-9459681)
chr6 (9-122)||(11167245-11167358)
chr6 (9-110)||(21893472-21893573)
chr6 (9-133)||(20726785-20726905)
chr6 (9-122)||(28199596-28199711)
chr6 (9-122)||(30699018-30699131)
chr6 (49-122)||(33463706-33463779)
chr6 (9-57)||(33464399-33464447)
chr6 (10-125)||(12835050-12835165)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (9-122)||(37698218-37698331)
chr3 (9-124)||(50529848-50529963)
chr3 (9-131)||(25999379-25999501)
chr3 (9-134)||(25494360-25494485)
chr3 (9-122)||(42307980-42308093)
chr3 (9-124)||(21581040-21581155)
chr3 (9-122)||(26122814-26122927)
chr3 (9-122)||(32244120-32244233)
chr3 (9-122)||(38856093-38856206)
chr3 (9-124)||(44609408-44609523)
chr3 (9-122)||(12117733-12117846)
chr3 (9-122)||(15520217-15520330)
chr3 (9-122)||(22175065-22175178)
chr3 (9-122)||(24835774-24835887)
chr3 (9-122)||(35643217-35643330)
chr3 (9-122)||(38933946-38934058)
chr3 (9-122)||(50528929-50529042)
chr3 (9-122)||(20699149-20699262)
chr3 (9-122)||(20842423-20842536)
chr3 (9-122)||(29445488-29445601)
chr3 (9-122)||(54534402-54534514)
chr3 (9-122)||(54870249-54870362)
chr3 (9-124)||(35226445-35226560)
chr3 (9-122)||(8042607-8042720)
chr3 (9-122)||(15520636-15520749)
chr3 (9-118)||(42105046-42105155)
chr3 (9-122)||(46452237-46452350)
chr3 (9-122)||(32359259-32359372)
chr3 (9-122)||(34700341-34700454)
chr3 (9-122)||(49128049-49128162)
chr3 (9-121)||(2895186-2895298)
chr3 (9-89)||(44688794-44688874)
chr3 (12-89)||(16354379-16354456)
chr3 (9-124)||(53028223-53028330)
chr3 (9-79)||(12915949-12916019)
chr3 (9-123)||(48925078-48925190)
chr3 (73-121)||(24366093-24366141)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (9-122)||(36708-36821)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (9-122)||(23040-23153)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (9-122)||(145334-145447)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (9-122)||(384-497)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (9-122)||(3713-3826)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (9-122)||(95-208)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (9-122)||(94-209)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (9-122)||(10241-10354)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5203091 - 5202736
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5203091 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaat 5202992  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagtagcaaaacaatgttcgaatatcgactaagagagctatctatatttagtgttcacacgcctcatataggattgttc 208  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5202991 aagtcaatccaaacggggccatagtagcaaaacaatgttcgaatatcgactaagagagctatctatatttagtgttcacacgcctcatataggattattc 5202892  T
Q  209 taaagtgaacaattaattcatctaaaagaataaaataaacaataacaattgttgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaatc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5202891 taaagtgaacaattaattcatctaaaagaataaaataaacaataacaaccattgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaatt 5202792  T
Q  309 ataggtggttaaaatatctattattaatttgtttactttattactcatatctatta 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5202791 ataggtggttaaaatatctattattaatttgtttactttattactcatatttatta 5202736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Original strand, 3386575 - 3386691
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3386575 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaat 3386674  T
Q  109 aagccaatccaaacaga 125  Q
    |||||||||||||||||    
T  3386675 aagccaatccaaacaga 3386691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 24105760 - 24105884
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24105760 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 24105859  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagt 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24105860 aagccaatccaaacggagccttagt 24105884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 9008146 - 9008259
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9008146 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 9008245  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  9008246 aagccaatccaaac 9008259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31883263 - 31883144
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31883263 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaat 31883164  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  31883163 aagtcaatccaaacggagcc 31883144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 27679258 - 27679371
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27679258 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 27679357  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  27679358 aagccaatccaaac 27679371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1579155 - 1579042
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  1579155 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 1579056  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  1579055 aagccaatccaaac 1579042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 1605660 - 1605773
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  1605660 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 1605759  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  1605760 aagccaatccaaac 1605773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3921700 - 3921587
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||    
T  3921700 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaat 3921601  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||  ||||||||||    
T  3921600 aaatcaatccaaac 3921587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16069472 - 16069359
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16069472 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaat 16069373  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  16069372 aagtcaatccaaac 16069359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 35782733 - 35782846
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35782733 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaat 35782832  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  35782833 aaggcaatccaaac 35782846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 33491287 - 33491398
Alignment:
Q  11 aagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataa 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33491287 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataa 33491386  T
Q  111 gccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||    
T  33491387 gccaatccaaac 33491398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 16737536 - 16737649
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  16737536 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 16737635  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  16737636 aagccaattcaaac 16737649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 20992235 - 20992348
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20992235 ataatcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaat 20992334  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  20992335 aagccaattcaaac 20992348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 27420977 - 27420864
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  27420977 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 27420878  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  27420877 aagccaatccaaac 27420864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 20992370 - 20992489
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataag----tcaacataagctca 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |  |||||||||||    
T  20992370 ataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatgtacataagctca 20992469  T
Q  105 aaataagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20992470 aaataagccaatccaaacag 20992489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 8374427 - 8374540
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  8374427 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaat 8374526  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  8374527 aaggcaatccaaac 8374540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19358645 - 19358532
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19358645 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaat 19358546  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  19358545 aaggcaatccaaac 19358532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33991259 - 33991146
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33991259 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaat 33991160  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| |||| |||||    
T  33991159 aagtcaattcaaac 33991146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 1165690 - 1165802
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  1165690 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaat 1165789  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    ||| |||||||||    
T  1165790 aagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4121056 - 4120943
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  4121056 ataagcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 4120957  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||| |||||||    
T  4120956 aagccattccaaac 4120943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 38598539 - 38598652
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |    
T  38598539 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagt 38598638  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  38598639 aagccaatccaaac 38598652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 120
Target Start/End: Original strand, 33284664 - 33284775
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  33284664 ataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 33284763  T
Q  109 aagccaatccaa 120  Q
    ||| ||||||||    
T  33284764 aagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 26603031 - 26603112
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataag 90  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26603031 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataag 26603112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 5202648 - 5202570
Alignment:
Q  382 actaaccaaattttttaagagataaaattaatgaaaaaataattctctaattttgacgtctgtaacaaagttaaagaca 460  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5202648 actaaccaaattttttaagaaataaaattaatgaataaataaatctctgattttgacgtctgtaacaaagttaaagaca 5202570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31410595 - 31410482
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | |||| ||||||||    
T  31410595 ataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaat 31410496  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||  ||||||||||    
T  31410495 aaatcaatccaaac 31410482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 27025075 - 27025001
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagt 83  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||    
T  27025075 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35257382 - 35257319
Alignment:
Q  259 gttgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaatcataggtggttaaaa 322  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  35257382 gttgataaccaaatcaatagttgatattatatgcacatgcataacaaatcgtgagtggttaaaa 35257319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Original strand, 19516059 - 19516128
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatg 78  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  19516059 ataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatg 19516128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 62
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacc 62  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 310
Target Start/End: Original strand, 10373576 - 10373628
Alignment:
Q  258 tgttgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaatcat 310  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  10373576 tgttgataaacaaatcaatggttgatattatatacacatgaataccaaatcat 10373628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41575631 - 41575510
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41575631 ataagcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaat 41575532  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccat 130  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  41575531 aagccaatccaaacggagccat 41575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18594655 - 18594542
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18594655 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 18594556  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  18594555 aagccaatccaaac 18594542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39206704 - 39206591
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39206704 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 39206605  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  39206604 aagccaatccaaac 39206591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14422821 - 14422699
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14422821 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 14422722  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    || ||||||||||| | ||||||    
T  14422721 aaaccaatccaaacggggccata 14422699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 10836844 - 10836957
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10836844 ataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 10836943  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  10836944 aagccaatccaaac 10836957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 34842454 - 34842567
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34842454 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 34842553  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  34842554 aagccaatccaaac 34842567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 35118120 - 35118233
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35118120 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 35118219  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  35118220 aagccaatccaaac 35118233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 34679546 - 34679661
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  34679546 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 34679645  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  34679646 aagccaatccaaacag 34679661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 2042613 - 2042726
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2042613 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 2042712  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  2042713 aagccaatccaaac 2042726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13110522 - 13110409
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13110522 ataagcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 13110423  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  13110422 aagccaatccaaac 13110409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 22260719 - 22260832
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  22260719 ataagcagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaat 22260818  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  22260819 aagccaatccaaac 22260832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 26783822 - 26783935
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26783822 ataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 26783921  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  26783922 aagccaatccaaac 26783935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29938179 - 29938066
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  29938179 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaat 29938080  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  29938079 aagccaatccaaac 29938066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33278518 - 33278405
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33278518 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaat 33278419  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  33278418 aagccaatccaaac 33278405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 38167244 - 38167369
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  38167244 ataagcagcttatgaaactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaat 38167343  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagta 134  Q
    | |||||||||||||| |||||||||    
T  38167344 aggccaatccaaacagggccatagta 38167369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 40117941 - 40118054
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  40117941 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 40118040  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  40118041 aagccaatccaaac 40118054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 144512 - 144388
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  144512 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaat 144413  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagt 133  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  144412 aagtcaatccaaacggagtcatagt 144388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7774882 - 7774769
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  7774882 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaat 7774783  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||| ||||    
T  7774782 aagccaatctaaac 7774769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7791529 - 7791416
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||    
T  7791529 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaat 7791430  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  7791429 aagccaatccaaac 7791416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8021837 - 8021724
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  8021837 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 8021738  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  8021737 aagccaatccaaac 8021724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 44805033 - 44805145
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  44805033 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaat 44805132  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||| ||||    
T  44805133 aagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 119
Target Start/End: Original strand, 34998985 - 34999095
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |   |||||||||||||    
T  34998985 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaat 34999084  T
Q  109 aagccaatcca 119  Q
    |||||||||||    
T  34999085 aagccaatcca 34999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 24113255 - 24113368
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24113255 ataagcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 24113354  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  24113355 aagtcaatccaaac 24113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 33287114 - 33287227
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  33287114 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 33287213  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  33287214 aagtcaatccaaac 33287227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39218895 - 39218782
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39218895 ataagcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 39218796  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  39218795 aagccaatccaaac 39218782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4035965 - 4035852
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  4035965 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaat 4035866  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  4035865 aaaccaatccaaac 4035852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 6144362 - 6144475
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  6144362 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 6144461  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  6144462 aagtcaatccaaac 6144475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42571711 - 42571599
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  42571711 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaat 42571613  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  42571612 aagccaatccaaac 42571599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7812113 - 7812000
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    |||||| ||||||||    
T  7812113 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaat 7812014  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||| ||||    
T  7812013 aagccaatcaaaac 7812000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 66269 - 66382
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| || ||||||||    
T  66269 ataagcagcttatgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaat 66368  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||| ||||    
T  66369 aagccaatctaaac 66382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5320682 - 5320569
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  5320682 ataagcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaat 5320583  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  5320582 aagccaatccaaac 5320569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 36491266 - 36491163
Alignment:
Q  18 ttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatc 117  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  36491266 ttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatc 36491167  T
Q  118 caaa 121  Q
    ||||    
T  36491166 caaa 36491163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5005284 - 5005169
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||    
T  5005284 ataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataagcttaagat 5005185  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  5005184 aagccaatccaaacag 5005169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 2322101 - 2322214
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| || | ||||||||  |||    
T  2322101 ataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgttagtagataaatccatataagctccgaat 2322200  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  2322201 aagccaatccaaac 2322214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28639400 - 28639283
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagact----tatgggagtagataagtcaacataagctca 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||    ||| ||||||||||||   ||||||||| |    
T  28639400 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagctta 28639301  T
Q  105 aaataagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28639300 aaataagccaattcaaac 28639283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39220371 - 39220261
Alignment:
Q  12 agcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataag 111  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39220371 agcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacatatggatgtagataagttcatataagctcaaaataag 39220272  T
Q  112 ccaatccaaac 122  Q
     |||| |||||    
T  39220271 tcaattcaaac 39220261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806878
Alignment:
Q  40 ttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||   | |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaac 9806878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 9807378 - 9807339
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttattta 48  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9807378 ataagcagcttatgaagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 30181103 - 30181216
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30181103 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 30181202  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  30181203 aagccaatccaaac 30181216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 42965075 - 42965187
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42965075 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 42965174  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||||||||    
T  42965175 aagccaatccaaa 42965187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 4477400 - 4477513
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4477400 ataagcagcttatgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 4477499  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  4477500 aagccaatccaaac 4477513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7164301 - 7164188
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  7164301 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 7164202  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  7164201 aagccaatccaaac 7164188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 33846603 - 33846716
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33846603 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 33846702  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  33846703 aagccaatccaaac 33846716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 12101257 - 12101369
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  12101257 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 12101356  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||||||||    
T  12101357 aagccaatccaaa 12101369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 33359169 - 33359291
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  33359169 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaat 33359268  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  33359269 aagccaatccaaacggggccata 33359291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1803143 - 1803030
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1803143 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 1803044  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  1803043 aagtcaatccaaac 1803030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20346605 - 20346492
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20346605 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 20346506  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  20346505 aagccaatccaaac 20346492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32041659 - 32041546
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  32041659 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaat 32041560  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  32041559 aagccaatccaaac 32041546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 43156830 - 43156718
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  43156830 ataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 43156731  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||||||||    
T  43156730 aagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 933402 - 933287
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  933402 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaat 933303  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    |||||||| |||||||    
T  933302 aagccaattcaaacag 933287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 22649773 - 22649895
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22649773 ataagcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 22649872  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    |||||||| ||||| | ||||||    
T  22649873 aagccaattcaaacggggccata 22649895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42204272 - 42204158
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacaccttta-aaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42204272 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaa 42204173  T
Q  108 taagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||||||    
T  42204172 taagccaatccaaac 42204158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3511440 - 3511327
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  3511440 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaat 3511341  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  3511340 aagacaatccaaac 3511327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5280977 - 5280864
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||    
T  5280977 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaat 5280878  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  5280877 aagccaatccaaac 5280864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6394868 - 6394755
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  6394868 ataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 6394769  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||| ||||    
T  6394768 aagccaatctaaac 6394755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19828387 - 19828274
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19828387 ataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccaacataaactcaaaat 19828288  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  19828287 aagccaattcaaac 19828274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 24792411 - 24792524
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||  |    
T  24792411 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaactt 24792510  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  24792511 aagccaatccaaac 24792524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25748604 - 25748491
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||  |    
T  25748604 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaactt 25748505  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  25748504 aagccaatccaaac 25748491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 43068052 - 43068165
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43068052 ataagaagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 43068151  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  43068152 aagtcaatccaaac 43068165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4347390 - 4347277
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4347390 ataagcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaat 4347291  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  4347290 aagtcaatccaaac 4347277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15656029 - 15655916
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  15656029 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaat 15655930  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  15655929 aagccaatccaaac 15655916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 36890909 - 36891021
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  36890909 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaat 36891007  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  36891008 aagtcaatccaaac 36891021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 43021655 - 43021767
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||    
T  43021655 ataagcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaat 43021754  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||||||||    
T  43021755 aagccaatccaaa 43021767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38866661 - 38866548
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38866661 ataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 38866562  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| | ||||||||    
T  38866561 aagtcgatccaaac 38866548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9452702 - 9452594
Alignment:
Q  14 cagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagcc 113  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  9452702 cagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtc 9452603  T
Q  114 aatccaaac 122  Q
    |||||||||    
T  9452602 aatccaaac 9452594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8630783 - 8630670
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||    
T  8630783 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaat 8630684  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || | |||||||||    
T  8630683 aaacaaatccaaac 8630670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43405129 - 43405024
Alignment:
Q  17 cttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaat 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  43405129 cttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T
Q  117 ccaaac 122  Q
     |||||    
T  43405029 tcaaac 43405024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 12097669 - 12097781
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   | ||||||||||  |    
T  12097669 ataagtagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaactt 12097768  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||||||||    
T  12097769 aagccaatccaaa 12097781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704984
Alignment:
Q  31 ataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaac 37704984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 46891418 - 46891532
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacaccttt-aaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaa 107  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  46891418 ataagcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaa 46891517  T
Q  108 taagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||||||    
T  46891518 taagccaatccaaac 46891532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17753717 - 17753604
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||     |||||||||||||    
T  17753717 ataagcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaat 17753618  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||| |||||||||    
T  17753617 aagctaatccaaac 17753604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 42673578 - 42673464
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  42673578 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttac----ccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaat 42673483  T
Q  109 aagccaatccaaacagagc 127  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  42673482 aagtcaatccaaacggagc 42673464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 46134388 - 46134496
Alignment:
Q  14 cagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagcc 113  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    |||||||||||||||||| |    
T  46134388 cagcttatgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtc 46134487  T
Q  114 aatccaaac 122  Q
    |||||||||    
T  46134488 aatccaaac 46134496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 37005890 - 37006009
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||| | |||||||||    ||||||||| |||||    
T  37005890 ataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaacttatagaagtagataaactcacataagcttaaaat 37005989  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  37005990 aagccaatccaaacggagcc 37006009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Original strand, 16894586 - 16894667
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataag 90  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16894586 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 16894667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 48865750 - 48865666
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacaccttta---aaaagacttatgggagtagataag 90  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||    
T  48865750 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataag 48865666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 121
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  37 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 122
Target Start/End: Original strand, 15655514 - 15655604
Alignment:
Q  32 taagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||| |||   ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15655514 taagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagacttatgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaac 15655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22787875 - 22787808
Alignment:
Q  259 gttgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaatcataggtggttaaaatatc 326  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22787875 gttgataaacgaatcaatagttgatattatatgcacatacataacagatcatagatgtttaaaatatc 22787808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 36849616 - 36849729
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||  | |||||||||   |||    
T  36849616 ataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttagtagacaaacccacataagcttcgaat 36849715  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  36849716 aagtcaatccaaac 36849729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54412744 - 54412631
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54412744 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 54412645  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  54412644 aagccaatccaaac 54412631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 23776536 - 23776649
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23776536 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 23776635  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  23776636 aagccaatccaaac 23776649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48909962 - 48909847
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  48909962 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 48909863  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  48909862 aagccaatccaaacag 48909847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 6611437 - 6611550
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6611437 ataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaat 6611536  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  6611537 aaaccaatccaaac 6611550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20877163 - 20877050
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20877163 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 20877064  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  20877063 aagccaatccaaac 20877050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 50055178 - 50055291
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50055178 ataagcagcttatgaaaccatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 50055277  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  50055278 aagccaatccaaac 50055291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 19165048 - 19165162
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacaccttt-aaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19165048 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaa 19165147  T
Q  108 taagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||||||    
T  19165148 taagccaatccaaac 19165162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 14987908 - 14987795
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  14987908 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaat 14987809  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  14987808 aagccaatccaaac 14987795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16700897 - 16700784
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16700897 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 16700798  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  16700797 aagccaatccaaac 16700784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 19913707 - 19913820
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19913707 ataagcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 19913806  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  19913807 aagccaatccaaac 19913820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 30423641 - 30423754
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30423641 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaat 30423740  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  30423741 aagccaatccaaac 30423754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50053559 - 50053446
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50053559 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataagtccatataagctcaaaat 50053460  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  50053459 aagccaatccaaac 50053446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 54189661 - 54189548
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  54189661 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaat 54189562  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  54189561 aagccaatccaaac 54189548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Original strand, 37968834 - 37968942
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37968834 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 37968933  T
Q  109 aagccaatc 117  Q
    || ||||||    
T  37968934 aaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 28032789 - 28032904
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28032789 ataagcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 28032888  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  28032889 aagtcaatctaaacag 28032904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 28360546 - 28360427
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28360546 ataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaat 28360447  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  28360446 aagtcaatccaaacagagcc 28360427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38055273 - 38055151
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38055273 ataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 38055174  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    ||| |||||||||| | ||||||    
T  38055173 aagtcaatccaaacggggccata 38055151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Original strand, 45424611 - 45424737
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45424611 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaat 45424710  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagtag 135  Q
    ||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  45424711 aagtcaatccaaacggggccttagtag 45424737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 1756841 - 1756954
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  1756841 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 1756940  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  1756941 aagccaatccaaac 1756954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 27488725 - 27488838
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||  |    
T  27488725 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaactt 27488824  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  27488825 aagccaatccaaac 27488838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 40428797 - 40428910
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  40428797 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 40428896  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  40428897 aagccaattcaaac 40428910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50353917 - 50353804
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  50353917 ataagcagcttatgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaat 50353818  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  50353817 aagccaatccaaac 50353804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 53717541 - 53717654
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  53717541 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaat 53717640  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  53717641 aagccaatccaaac 53717654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1617198 - 1617087
Alignment:
Q  11 aagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataa 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  1617198 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataa 1617099  T
Q  111 gccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||    
T  1617098 gccaatccaaac 1617087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 2481485 - 2481598
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2481485 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaat 2481584  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  2481585 aagccaatccaaac 2481598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 8932255 - 8932368
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8932255 ataagcagcttatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaat 8932354  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  8932355 aagccaatccaaac 8932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 11639655 - 11639768
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  11639655 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaat 11639754  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  11639755 aaaccaatccaaac 11639768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 15241105 - 15241218
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||    
T  15241105 ataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaat 15241204  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  15241205 aagccaatccaaac 15241218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15669299 - 15669186
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||   |||||||||||||||    
T  15669299 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaat 15669200  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  15669199 aagccaatccaaac 15669186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 35490850 - 35490963
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| | | |||||||||||||    
T  35490850 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaat 35490949  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  35490950 aagccaatccaaac 35490963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 44784994 - 44785107
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44784994 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 44785093  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  44785094 aagccaatccaaac 44785107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52139319 - 52139206
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||  | ||||||| |||||||    
T  52139319 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaat 52139220  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  52139219 aagccaatccaaac 52139206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 53875773 - 53875660
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  53875773 ataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaat 53875674  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  53875673 aagccaatccaaac 53875660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 27583709 - 27583821
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27583709 ataagcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaat 27583808  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    ||| |||||||||    
T  27583809 aagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 40680115 - 40680227
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||  |||||||    
T  40680115 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaat 40680214  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    ||| |||||||||    
T  40680215 aagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 53353175 - 53353058
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaaca----taagctca 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |    ||||||||    
T  53353175 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctca 53353076  T
Q  105 aaataagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53353075 aaataagccaatccaaac 53353058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 23704286 - 23704401
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||   | |||||||||||||    
T  23704286 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaat 23704385  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  23704386 aagccaatccaaacag 23704401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 43290037 - 43290156
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   | | |||||||||||    
T  43290037 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaat 43290136  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  43290137 aagccaatccaaacggagcc 43290156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 47632151 - 47632037
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacc-tttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  47632151 ataagcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaa 47632052  T
Q  108 taagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||||||    
T  47632051 taagccaatccaaac 47632037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30171696 - 30171583
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||   |||||||||||||||    
T  30171696 ataagcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaat 30171597  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  30171596 aagccaatccaaac 30171583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37464837 - 37464724
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||||    
T  37464837 ataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaat 37464738  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  37464737 aagccaattcaaac 37464724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Original strand, 6688711 - 6688811
Alignment:
Q  22 gaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaa 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6688711 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaa 6688810  T
Q  122 c 122  Q
    |    
T  6688811 c 6688811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Original strand, 38071397 - 38071504
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38071397 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 38071496  T
Q  109 aagccaat 116  Q
    ||| ||||    
T  38071497 aagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 31969797 - 31969696
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  31969797 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 31969698  T
Q  109 aa 110  Q
    ||    
T  31969697 aa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 44379264 - 44379379
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||| ||||||||    
T  44379264 ataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaat 44379363  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  44379364 aagtcaatccaaacag 44379379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 115
Target Start/End: Original strand, 8591169 - 8591275
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||  | |||||| ||||||||    
T  8591169 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaat 8591268  T
Q  109 aagccaa 115  Q
    |||||||    
T  8591269 aagccaa 8591275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 33703957 - 33703850
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    |||||||||||||||    
T  33703957 ataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaat 33703858  T
Q  109 aagccaat 116  Q
    ||| ||||    
T  33703857 aagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16703937 - 16703843
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16703937 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 122
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265947
Alignment:
Q  40 ttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 23265947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 27536181 - 27536290
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||| |   |||||||||||||    
T  27536181 ataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaat 27536276  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  27536277 aagccaatccaaac 27536290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Original strand, 55344923 - 55345015
Alignment:
Q  30 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  55344923 gataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaac 55345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44375961 - 44375848
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    ||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||    
T  44375961 ataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaat 44375862  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  44375861 aagccaatccaaac 44375848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 44548239 - 44548320
Alignment:
Q  30 gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataag 111  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  44548239 gataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctccaaataag 44548320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 59
Target Start/End: Original strand, 51780795 - 51780845
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaac 59  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51780795 ataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 48
Target Start/End: Original strand, 23269123 - 23269162
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttattta 48  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23269123 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17493449 - 17493335
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||||  ||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||  | ||||  |||||||    
T  17493449 ataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgcttataggagtagatatgttcatataaattcaaaat 17493350  T
Q  109 aagccaatccaaaca 123  Q
    ||| |||||| ||||    
T  17493349 aagtcaatcctaaca 17493335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 26323275 - 26323388
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26323275 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaat 26323374  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  26323375 aaaccaatccaaac 26323388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39635568 - 39635433
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39635568 ataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaat 39635469  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagtagcaaaacaat 144  Q
    |||| ||||||||| | |||  |||| |||||||||    
T  39635468 aagctaatccaaacggggcctaagtaacaaaacaat 39635433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 30420256 - 30420369
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30420256 ataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 30420355  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  30420356 aagccaatccaaac 30420369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 33906136 - 33906261
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  33906136 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaat 33906235  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagta 134  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33906236 aagtcaatccaaacagggccttagta 33906261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Original strand, 31517304 - 31517426
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  31517304 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaat 31517403  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  31517404 aagccaatccaaacggggccata 31517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 3873333 - 3873446
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3873333 ataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 3873432  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  3873433 aagccaatccaaac 3873446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 4232231 - 4232344
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||    
T  4232231 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaat 4232330  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  4232331 aagccaatccaaac 4232344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 18806973 - 18807086
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   | |||||||||||||    
T  18806973 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaat 18807072  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  18807073 aagccaatccaaac 18807086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 28329926 - 28330039
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  28329926 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaat 28330025  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  28330026 aagtcaatccaaac 28330039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1108395 - 1108290
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1108395 ataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 1108296  T
Q  109 aagcca 114  Q
    ||||||    
T  1108295 aagcca 1108290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 6174917 - 6175030
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||    
T  6174917 ataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaat 6175016  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  6175017 aagccaatccaaac 6175030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42937835 - 42937716
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    |||||||||||||||    
T  42937835 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaat 42937736  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  42937735 aagccaatccaaacggagcc 42937716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 2178858 - 2178971
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || |||||    
T  2178858 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaat 2178957  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||  ||||||||||    
T  2178958 aaatcaatccaaac 2178971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4016155 - 4016042
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  4016155 ataagcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaat 4016056  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  4016055 aagccaatccaaac 4016042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 16066383 - 16066495
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||    
T  16066383 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaat 16066482  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||| ||||    
T  16066483 aagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 16588865 - 16588984
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||| | ||||||    
T  16588865 ataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaat 16588964  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16588965 aagccaatccaaacggagcc 16588984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 19901227 - 19901339
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19901227 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaat 19901325  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  19901326 aagccaatccaaac 19901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 5733515 - 5733407
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5733515 ataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 5733416  T
Q  109 aagccaatc 117  Q
    || ||||||    
T  5733415 aaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 1482992 - 1483104
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1482992 ataagcagcttatgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaat 1483090  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||| ||||    
T  1483091 aagccaatcaaaac 1483104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 30270768 - 30270881
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    | ||||||| |||||    
T  30270768 ataagcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaat 30270867  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  30270868 aagccaatccaaac 30270881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 851113 - 851000
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  851113 ataagcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaat 851014  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||| |||||||||    
T  851013 aagcaaatccaaac 851000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 429932 - 429812
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||  |||||||    
T  429932 ataagcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaat 429833  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcca 129  Q
    |||  ||| ||||| ||||||    
T  429832 aagggaattcaaacggagcca 429812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Original strand, 44947631 - 44947743
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||    ||||||| |||||||    
T  44947631 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaat 44947730  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    |||||||| ||||    
T  44947731 aagccaatacaaa 44947743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Original strand, 19384032 - 19384126
Alignment:
Q  17 cttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataag 111  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   | |||| |||||||||||    
T  19384032 cttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 42446658 - 42446771
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||   ||||| |||  |||    
T  42446658 ataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagttcgcataaactccgaat 42446757  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  42446758 aagccaatccaaac 42446771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Original strand, 22101236 - 22101316
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataa 89  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22101236 ataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttagtagataa 22101316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1168619 - 1168506
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1168619 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 1168520  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  1168519 aagccaatccaaac 1168506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29078632 - 29078517
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29078632 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 29078533  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  29078532 aagccaatccaaacag 29078517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26663374 - 26663261
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26663374 ataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 26663275  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  26663274 aagccaatccaaac 26663261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 38829183 - 38829066
Alignment:
Q  11 aagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataa 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38829183 aagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataa 38829084  T
Q  111 gccaatccaaacagagcc 128  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38829083 gccaatccaaacagagcc 38829066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 49146288 - 49146164
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  49146288 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaat 49146189  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagt 133  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||    
T  49146188 aaaccaatccaaacggagccttagt 49146164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12682936 - 12682821
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12682936 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaat 12682837  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  12682836 aagtcaatccaaacag 12682821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33510600 - 33510487
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  33510600 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaat 33510501  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  33510500 aagccaatccaaac 33510487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 43905770 - 43905651
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43905770 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaat 43905671  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  43905670 aagccaatccaaacggagcc 43905651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 46409551 - 46409432
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  46409551 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaat 46409452  T
Q  109 aagccaatccaaacagagcc 128  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  46409451 aagtcaatccaaacggagcc 46409432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 8079798 - 8079911
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8079798 ataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaat 8079897  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  8079898 aagccaatccaaac 8079911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8120985 - 8120872
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8120985 ataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaat 8120886  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  8120885 aagccaatccaaac 8120872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20089587 - 20089474
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20089587 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 20089488  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  20089487 aagccaatccaaac 20089474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25897490 - 25897377
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  25897490 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaat 25897391  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  25897390 aagtcaatccaaac 25897377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 26580359 - 26580472
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  26580359 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 26580458  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  26580459 aagccaatccaaac 26580472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29288265 - 29288152
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29288265 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 29288166  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  29288165 aagtcaatccaaac 29288152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32671695 - 32671582
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32671695 ataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaat 32671596  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  32671595 aagccaatccaaac 32671582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 39260435 - 39260548
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39260435 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 39260534  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  39260535 aagccaatccaaac 39260548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 41928584 - 41928697
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41928584 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaat 41928683  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  41928684 aagccaatccaaac 41928697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 52753236 - 52753349
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52753236 ataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 52753335  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  52753336 aagccaatccaaac 52753349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40092607 - 40092492
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  40092607 ataagcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaat 40092508  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40092507 aagtcaatccaaacag 40092492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 1170533 - 1170646
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  1170533 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaat 1170632  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  1170633 aagccaatccaaac 1170646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Original strand, 1940844 - 1940949
Alignment:
Q  17 cttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaat 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  1940844 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 1940943  T
Q  117 ccaaac 122  Q
    ||||||    
T  1940944 ccaaac 1940949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16052212 - 16052099
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16052212 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaat 16052113  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  16052112 aagccaatccaaac 16052099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 19715250 - 19715363
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  19715250 ataagcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaat 19715349  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  19715350 aaaccaatccaaac 19715363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52696907 - 52696794
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  52696907 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaat 52696808  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  52696807 aagccaatccaaac 52696794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 970613 - 970728
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaa--gataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  970613 ataagcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaa 970712  T
Q  107 ataagccaatccaaac 122  Q
    ||||| ||||||||||    
T  970713 ataagtcaatccaaac 970728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29695792 - 29695676
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacaccttta-aaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  29695792 ataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaa 29695693  T
Q  108 taagccaatccaaacag 124  Q
    |||||||||||||||||    
T  29695692 taagccaatccaaacag 29695676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 13996812 - 13996927
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||    
T  13996812 ataagcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaat 13996911  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  13996912 aagccaatccaaacag 13996927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 42370886 - 42370997
Alignment:
Q  11 aagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataa 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42370886 aagcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataa 42370985  T
Q  111 gccaatccaaac 122  Q
    | ||||||||||    
T  42370986 gtcaatccaaac 42370997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2347772 - 2347659
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  2347772 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaat 2347673  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || | |||||||||    
T  2347672 aaacaaatccaaac 2347659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2473838 - 2473725
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  2473838 ataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaat 2473739  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || || ||||||||    
T  2473738 aaaccgatccaaac 2473725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5215501 - 5215388
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  5215501 ataagcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaat 5215402  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  5215401 aagccaatccaaac 5215388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17591804 - 17591694
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
T  17591804 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aat 17591708  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  17591707 aagccaatccaaac 17591694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38171948 - 38171823
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  38171948 ataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaat 38171849  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagta 134  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  38171848 aagtcaatgcaaacggagccttagta 38171823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 15203228 - 15203104
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||    
T  15203228 ataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaat 15203129  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagt 133  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||    
T  15203128 aagtcaattcaaacggggccatagt 15203104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23498576 - 23498454
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23498576 ataagcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaat 23498477  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  23498476 aagccaattcaaacagggccata 23498454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 46761082 - 46760969
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||   | ||||| |||||||    
T  46761082 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaat 46760983  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  46760982 aagtcaatccaaac 46760969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15717900 - 15717788
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  | |||||| | |||||||| ||||||||    
T  15717900 ataagcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaat 15717802  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  15717801 aagtcaatccaaac 15717788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 51359306 - 51359418
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  51359306 ataagcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaat 51359404  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  51359405 aagccaatccaaac 51359418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 17587594 - 17587694
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||   |||||||||||||||    
T  17587594 ataagcagcttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaat 17587693  T
Q  109 a 109  Q
    |    
T  17587694 a 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 15554259 - 15554346
Alignment:
Q  35 gctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||    
T  15554259 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaac 15554346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52086383 - 52086268
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||    
T  52086383 ataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccacataagcttaaaat 52086284  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  52086283 aagtcaatccaaacag 52086268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7145323 - 7145210
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctc-aaaa 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||    
T  7145323 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttattta-cccaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaa 7145225  T
Q  108 taagccaatccaaac 122  Q
    |||| ||||||||||    
T  7145224 taagtcaatccaaac 7145210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6765575 - 6765462
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  6765575 ataagcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaat 6765476  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  6765475 aagccaatccaaac 6765462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 40149579 - 40149498
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataag 90  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40149579 ataagcagcttataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataag 40149498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 23322929 - 23323032
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  23322929 ataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagtttatgggagtagataagcctatataagctcaaaat 23323028  T
Q  109 aagc 112  Q
    ||||    
T  23323029 aagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675108
Alignment:
Q  54 ccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    ||||||| |||| ||||  ||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaac 5675108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42947904 - 42947853
Alignment:
Q  259 gttgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaatcat 310  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42947904 gttgataaacaaatcaatggttgatattatatgcaaatgtaaaacaaatcat 42947853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 297
Target Start/End: Original strand, 12387851 - 12387909
Alignment:
Q  239 taaaataaacaataacaattgttgataaacaaatcaatagatcatattatatgcacatg 297  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||    
T  12387851 taaaataaataatatcaatcgttgataaacaaatcaacggtttatattatatgcacatg 12387909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 307
Target Start/End: Original strand, 51920931 - 51920969
Alignment:
Q  269 aaatcaatagatcatattatatgcacatgtataacaaat 307  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51920931 aaatcaatagttaatattatatgcacatgtataacaaat 51920969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30691969 - 30691856
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30691969 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 30691870  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  30691869 aagccaatccaaac 30691856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 3347612 - 3347725
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  3347612 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaat 3347711  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  3347712 aagccaatccaaac 3347725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 6086688 - 6086801
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6086688 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 6086787  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  6086788 aagccaatccaaac 6086801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 26946965 - 26947078
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  26946965 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 26947064  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  26947065 aagccaatccaaac 26947078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2837660 - 2837550
Alignment:
Q  12 agcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataag 111  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2837660 agcagctcatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataag 2837561  T
Q  112 ccaatccaaac 122  Q
    |||||||||||    
T  2837560 ccaatccaaac 2837550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 3955855 - 3955968
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  3955855 ataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 3955954  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  3955955 aagccaatccaaac 3955968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 16307097 - 16307210
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16307097 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaat 16307196  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  16307197 aagtcaatccaaac 16307210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 52954 - 52841
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  52954 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaat 52855  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  52854 aagccaatccaaac 52841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 17261162 - 17261275
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17261162 ataagcagcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 17261261  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  17261262 aagccaatccaaac 17261275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18613656 - 18613543
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18613656 ataagcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaat 18613557  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  18613556 aagtcaatccaaac 18613543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 26704428 - 26704541
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  26704428 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaat 26704527  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  26704528 aaaccaatccaaac 26704541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 34887381 - 34887494
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  34887381 ataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaat 34887480  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  34887481 aagtcaatccaaac 34887494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35198401 - 35198289
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  35198401 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaag-cttatggaagtagataagcccacataagttcaaaat 35198303  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  35198302 aagccaattcaaac 35198289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1153711 - 1153603
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1153711 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaat 1153612  T
Q  109 aagccaatc 117  Q
    |||||||||    
T  1153611 aagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9459681 - 9459568
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||   |||||| ||||||||    
T  9459681 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaat 9459582  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  9459581 aagccaatccaaac 9459568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 11167358 - 11167245
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | || |||||   |||||||||||||||    
T  11167358 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaat 11167259  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  11167258 aagccaatccaaac 11167245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 21893573 - 21893472
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  21893573 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaat 21893474  T
Q  109 aa 110  Q
    ||    
T  21893473 aa 21893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20726905 - 20726785
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  20726905 ataagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttac----ccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 20726810  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagt 133  Q
    |||||||||||||| | ||||||||    
T  20726809 aagccaatccaaacggggccatagt 20726785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 28199596 - 28199711
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagta---gataagtcaacataagctcaa 105  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  28199596 ataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaa 28199694  T
Q  106 aataagccaatccaaac 122  Q
    |||||| ||||||||||    
T  28199695 aataagtcaatccaaac 28199711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 30699018 - 30699131
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||||   |||||| |||| |||    
T  30699018 ataagcagctaataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataat 30699117  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  30699118 aagtcaatccaaac 30699131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463706
Alignment:
Q  49 tttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaac 122  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaac 33463706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 33464447 - 33464399
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaa 57  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33464447 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12835165 - 12835050
Alignment:
Q  10 taagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacac-ctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| | |||| ||| || |||||||||||  |||| |||  ||||||  |||||||||||  |||||||||  ||||    
T  12835165 taagcagcttatgaaattagtataagttcttttgattaatgtatccaaacactttttacaaaagcttatgttagtagataagtttacataagct-taaat 12835067  T
Q  109 aagccaatccaaacaga 125  Q
    |||||||||||| ||||    
T  12835066 aagccaatccaatcaga 12835050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 37698218 - 37698331
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37698218 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 37698317  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  37698318 aagccaatccaaac 37698331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 50529848 - 50529963
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  50529848 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaat 50529947  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  50529948 aagtcaatccaaacag 50529963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25999501 - 25999379
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  25999501 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaat 25999402  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccata 131  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  25999401 aagccaatccaaacggggccata 25999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 25494360 - 25494485
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  25494360 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaat 25494459  T
Q  109 aagccaatccaaacagagccatagta 134  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||    
T  25494460 aagtcaatccaaacggggccatagta 25494485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 42307980 - 42308093
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42307980 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 42308079  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  42308080 aagccaatccaaac 42308093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21581155 - 21581040
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21581155 ataagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 21581056  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  21581055 aagtcaatccaaacag 21581040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26122927 - 26122814
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  26122927 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaat 26122828  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  26122827 aagccaatccaaac 26122814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32244233 - 32244120
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  32244233 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaat 32244134  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  32244133 aagccaatccaaac 32244120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38856206 - 38856093
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  38856206 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaat 38856107  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  38856106 aagccaatccaaac 38856093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 44609408 - 44609523
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609408 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaat 44609507  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||||||||||||||||    
T  44609508 aagccaatccaaacag 44609523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 12117733 - 12117846
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  12117733 ataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 12117832  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  12117833 aagccaattcaaac 12117846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 15520217 - 15520330
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15520217 ataagcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 15520316  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  15520317 aagccaatccaaac 15520330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 22175065 - 22175178
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22175065 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaat 22175164  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  22175165 aagccaatccaaac 22175178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 24835774 - 24835887
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  24835774 ataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaat 24835873  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||  ||||||||||    
T  24835874 aaatcaatccaaac 24835887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35643330 - 35643217
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  35643330 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaaggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaat 35643231  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  35643230 aagtcaatccaaac 35643217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38934058 - 38933946
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38934058 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaat 38933960  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  38933959 aagccaatccaaac 38933946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50529042 - 50528929
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50529042 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaat 50528943  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  50528942 aagccaatccaaac 50528929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20699262 - 20699149
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20699262 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaat 20699163  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  20699162 aagccaatccaaac 20699149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 20842423 - 20842536
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  20842423 ataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaat 20842522  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  20842523 aagccaatccaaac 20842536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29445601 - 29445488
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  29445601 ataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaat 29445502  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  29445501 aagccaatccaaac 29445488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 54534402 - 54534514
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54534402 ataagcagcttat-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 54534500  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  54534501 aagccaatccaaac 54534514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 54870249 - 54870362
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||    
T  54870249 ataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaat 54870348  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  54870349 aagccaatccaaac 54870362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35226560 - 35226445
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  35226560 ataagcagcttatgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaat 35226461  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    | ||||||||||||||    
T  35226460 aggccaatccaaacag 35226445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8042720 - 8042607
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  8042720 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaat 8042621  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||| ||||||||    
T  8042620 aagcccatccaaac 8042607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15520749 - 15520636
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  15520749 ataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaat 15520650  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  15520649 aagccaatccaaac 15520636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Original strand, 42105046 - 42105155
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42105046 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 42105145  T
Q  109 aagccaatcc 118  Q
    ||| ||||||    
T  42105146 aagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 46452237 - 46452350
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||  |    
T  46452237 ataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaactt 46452336  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  46452337 aagccaatccaaac 46452350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32359372 - 32359259
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  32359372 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaat 32359273  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  32359272 aagccaatccaaac 32359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34700454 - 34700341
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||||||||||    
T  34700454 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaat 34700355  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||| ||||    
T  34700354 aaaccaatctaaac 34700341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 49128162 - 49128049
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||    
T  49128162 ataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagcccacataagtttaaaat 49128063  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  49128062 aagtcaatccaaac 49128049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2895298 - 2895186
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  2895298 ataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaat 2895199  T
Q  109 aagccaatccaaa 121  Q
    ||| |||| ||||    
T  2895198 aagtcaattcaaa 2895186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44688874 - 44688794
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataa 89  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44688874 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataa 44688794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 16354456 - 16354379
Alignment:
Q  12 agcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataa 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16354456 agcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataa 16354379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 53028330 - 53028223
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  53028330 ataagcagtttatgaaaatatgataagctatttttatttattta--------cctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 53028239  T
Q  109 aagccaatccaaacag 124  Q
    ||| ||||||||||||    
T  53028238 aagtcaatccaaacag 53028223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12916019 - 12915949
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgg 79  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12916019 ataagcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatgg 12915949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 48925078 - 48925190
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||  ||||||| |||||||||  | | |||| ||| ||||    
T  48925078 ataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaat 48925175  T
Q  109 aagccaatccaaaca 123  Q
    |||||||||||||||    
T  48925176 aagccaatccaaaca 48925190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 24366141 - 24366093
Alignment:
Q  73 cttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaataagccaatccaaa 121  Q
    |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24366141 cttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 24366093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 36821 - 36708
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36821 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 36722  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  36721 aagccaatccaaac 36708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 23040 - 23153
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||    
T  23040 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaat 23139  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  23140 aagccaatccaaac 23153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 145334 - 145447
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  145334 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaat 145433  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  145434 aagtcaatccaaac 145447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 384 - 497
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||    
T  384 ataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaat 483  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||||||||||||||    
T  484 aagccaatccaaac 497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3826 - 3713
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  3826 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaat 3727  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    || |||||||||||    
T  3726 aaaccaatccaaac 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 95 - 208
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||  |    
T  95 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaactt 194  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    |||||||| |||||    
T  195 aagccaatacaaac 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Original strand, 94 - 209
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagta---gataagtcaacataagctcaa 105  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||    
T  94 ataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaa 192  T
Q  106 aataagccaatccaaac 122  Q
    |||||| ||||||||||    
T  193 aataagtcaatccaaac 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10354 - 10241
Alignment:
Q  9 ataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagtcaacataagctcaaaat 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||    
T  10354 ataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaat 10255  T
Q  109 aagccaatccaaac 122  Q
    ||| ||||||||||    
T  10254 aagtcaatccaaac 10241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University