View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1526_high_13 (Length: 250)

Name: NF1526_high_13
Description: NF1526
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1526_high_13
NF1526_high_13
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (1-234)||(5202858-5203091)
chr5 (118-234)||(3386575-3386691)
chr5 (110-234)||(24105760-24105884)
chr5 (121-234)||(9008146-9008259)
chr5 (115-234)||(31883144-31883263)
chr5 (121-234)||(27679258-27679371)
chr5 (121-234)||(1579042-1579155)
chr5 (121-234)||(1605660-1605773)
chr5 (121-234)||(3921587-3921700)
chr5 (121-234)||(16069359-16069472)
chr5 (121-234)||(35782733-35782846)
chr5 (121-232)||(33491287-33491398)
chr5 (121-234)||(16737536-16737649)
chr5 (121-234)||(20992235-20992348)
chr5 (121-234)||(27420864-27420977)
chr5 (119-234)||(20992370-20992489)
chr5 (121-234)||(8374427-8374540)
chr5 (121-234)||(19358532-19358645)
chr5 (121-234)||(33991146-33991259)
chr5 (122-234)||(1165690-1165802)
chr5 (121-234)||(4120943-4121056)
chr5 (121-234)||(38598539-38598652)
chr5 (123-234)||(33284664-33284775)
chr5 (153-234)||(26603031-26603112)
chr5 (121-234)||(31410482-31410595)
chr5 (160-234)||(27025001-27025075)
chr5 (165-234)||(19516059-19516128)
chr5 (181-234)||(41818552-41818605)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (113-234)||(41575510-41575631)
chr8 (121-234)||(18594542-18594655)
chr8 (121-234)||(39206591-39206704)
chr8 (112-234)||(14422699-14422821)
chr8 (121-234)||(10836844-10836957)
chr8 (121-234)||(34842454-34842567)
chr8 (121-234)||(35118120-35118233)
chr8 (119-234)||(34679546-34679661)
chr8 (121-234)||(2042613-2042726)
chr8 (121-234)||(13110409-13110522)
chr8 (121-234)||(22260719-22260832)
chr8 (121-234)||(26783822-26783935)
chr8 (121-234)||(29938066-29938179)
chr8 (121-234)||(33278405-33278518)
chr8 (109-234)||(38167244-38167369)
chr8 (121-234)||(40117941-40118054)
chr8 (110-234)||(144388-144512)
chr8 (121-234)||(7774769-7774882)
chr8 (121-234)||(7791416-7791529)
chr8 (121-234)||(8021724-8021837)
chr8 (122-234)||(44805033-44805145)
chr8 (124-234)||(34998985-34999095)
chr8 (121-234)||(24113255-24113368)
chr8 (121-234)||(33287114-33287227)
chr8 (121-234)||(39218782-39218895)
chr8 (121-234)||(4035852-4035965)
chr8 (121-234)||(6144362-6144475)
chr8 (121-234)||(42571599-42571711)
chr8 (121-234)||(7812000-7812113)
chr8 (121-234)||(66269-66382)
chr8 (121-234)||(5320569-5320682)
chr8 (122-225)||(36491163-36491266)
chr8 (119-234)||(5005169-5005284)
chr8 (121-234)||(2322101-2322214)
chr8 (121-234)||(28639283-28639400)
chr8 (121-231)||(39220261-39220371)
chr8 (121-203)||(9806878-9806960)
chr8 (195-234)||(9807339-9807378)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (121-234)||(30181103-30181216)
chr7 (122-234)||(42965075-42965187)
chr7 (121-234)||(4477400-4477513)
chr7 (121-234)||(7164188-7164301)
chr7 (121-234)||(33846603-33846716)
chr7 (122-234)||(12101257-12101369)
chr7 (112-234)||(33359169-33359291)
chr7 (121-234)||(1803030-1803143)
chr7 (121-234)||(20346492-20346605)
chr7 (121-234)||(32041546-32041659)
chr7 (122-234)||(43156718-43156830)
chr7 (119-234)||(933287-933402)
chr7 (112-234)||(22649773-22649895)
chr7 (121-234)||(42204158-42204272)
chr7 (121-234)||(3511327-3511440)
chr7 (121-234)||(5280864-5280977)
chr7 (121-234)||(6394755-6394868)
chr7 (121-234)||(19828274-19828387)
chr7 (121-234)||(24792411-24792524)
chr7 (121-234)||(25748491-25748604)
chr7 (121-234)||(43068052-43068165)
chr7 (121-234)||(4347277-4347390)
chr7 (121-234)||(15655916-15656029)
chr7 (121-234)||(36890909-36891021)
chr7 (122-234)||(43021655-43021767)
chr7 (121-234)||(38866548-38866661)
chr7 (121-229)||(9452594-9452702)
chr7 (121-234)||(8630670-8630783)
chr7 (121-226)||(43405024-43405129)
chr7 (122-234)||(12097669-12097781)
chr7 (121-212)||(37704984-37705075)
chr7 (121-234)||(46891418-46891532)
chr7 (121-234)||(17753604-17753717)
chr7 (116-234)||(42673464-42673578)
chr7 (121-229)||(46134388-46134496)
chr7 (115-234)||(37005890-37006009)
chr7 (153-234)||(16894586-16894667)
chr7 (153-234)||(48865666-48865750)
chr7 (122-206)||(27691433-27691517)
chr7 (121-211)||(15655514-15655604)
chr7 (121-234)||(36849616-36849729)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (121-234)||(54412631-54412744)
chr4 (121-234)||(23776536-23776649)
chr4 (119-234)||(48909847-48909962)
chr4 (121-234)||(6611437-6611550)
chr4 (121-234)||(20877050-20877163)
chr4 (121-234)||(50055178-50055291)
chr4 (121-234)||(19165048-19165162)
chr4 (121-234)||(14987795-14987908)
chr4 (121-234)||(16700784-16700897)
chr4 (121-234)||(19913707-19913820)
chr4 (121-234)||(30423641-30423754)
chr4 (121-234)||(50053446-50053559)
chr4 (121-234)||(54189548-54189661)
chr4 (126-234)||(37968834-37968942)
chr4 (119-234)||(28032789-28032904)
chr4 (115-234)||(28360427-28360546)
chr4 (112-234)||(38055151-38055273)
chr4 (108-234)||(45424611-45424737)
chr4 (121-234)||(1756841-1756954)
chr4 (121-234)||(27488725-27488838)
chr4 (121-234)||(40428797-40428910)
chr4 (121-234)||(50353804-50353917)
chr4 (121-234)||(53717541-53717654)
chr4 (121-232)||(1617087-1617198)
chr4 (121-234)||(2481485-2481598)
chr4 (121-234)||(8932255-8932368)
chr4 (121-234)||(11639655-11639768)
chr4 (121-234)||(15241105-15241218)
chr4 (121-234)||(15669186-15669299)
chr4 (121-234)||(35490850-35490963)
chr4 (121-234)||(44784994-44785107)
chr4 (121-234)||(52139206-52139319)
chr4 (121-234)||(53875660-53875773)
chr4 (122-234)||(27583709-27583821)
chr4 (122-234)||(40680115-40680227)
chr4 (121-234)||(53353058-53353175)
chr4 (119-234)||(23704286-23704401)
chr4 (115-234)||(43290037-43290156)
chr4 (121-234)||(47632037-47632151)
chr4 (121-234)||(30171583-30171696)
chr4 (121-234)||(37464724-37464837)
chr4 (121-221)||(6688711-6688811)
chr4 (127-234)||(38071397-38071504)
chr4 (133-234)||(31969696-31969797)
chr4 (119-234)||(44379264-44379379)
chr4 (128-234)||(8591169-8591275)
chr4 (127-234)||(33703850-33703957)
chr4 (140-234)||(16703843-16703937)
chr4 (121-203)||(23265865-23265947)
chr4 (121-234)||(27536181-27536290)
chr4 (121-213)||(55344923-55345015)
chr4 (121-234)||(44375848-44375961)
chr4 (132-213)||(44548239-44548320)
chr4 (184-234)||(51780795-51780845)
chr4 (195-234)||(23269123-23269162)
chr4 (120-234)||(17493335-17493449)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (121-234)||(26323275-26323388)
chr2 (99-234)||(39635433-39635568)
chr2 (121-234)||(30420256-30420369)
chr2 (109-234)||(33906136-33906261)
chr2 (112-234)||(31517304-31517426)
chr2 (121-234)||(3873333-3873446)
chr2 (121-234)||(4232231-4232344)
chr2 (121-234)||(18806973-18807086)
chr2 (121-234)||(28329926-28330039)
chr2 (129-234)||(1108290-1108395)
chr2 (121-234)||(6174917-6175030)
chr2 (115-234)||(42937716-42937835)
chr2 (121-234)||(2178858-2178971)
chr2 (121-234)||(4016042-4016155)
chr2 (122-234)||(16066383-16066495)
chr2 (115-234)||(16588865-16588984)
chr2 (121-234)||(19901227-19901339)
chr2 (126-234)||(5733407-5733515)
chr2 (121-234)||(1482992-1483104)
chr2 (121-234)||(30270768-30270881)
chr2 (121-234)||(851000-851113)
chr2 (114-234)||(429812-429932)
chr2 (122-234)||(44947631-44947743)
chr2 (132-226)||(19384032-19384126)
chr2 (121-234)||(42446658-42446771)
chr2 (154-234)||(22101236-22101316)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (121-234)||(1168506-1168619)
chr1 (119-234)||(29078517-29078632)
chr1 (121-234)||(26663261-26663374)
chr1 (115-232)||(38829066-38829183)
chr1 (110-234)||(49146164-49146288)
chr1 (119-234)||(12682821-12682936)
chr1 (121-234)||(33510487-33510600)
chr1 (115-234)||(43905651-43905770)
chr1 (115-234)||(46409432-46409551)
chr1 (121-234)||(8079798-8079911)
chr1 (121-234)||(8120872-8120985)
chr1 (121-234)||(20089474-20089587)
chr1 (121-234)||(25897377-25897490)
chr1 (121-234)||(26580359-26580472)
chr1 (121-234)||(29288152-29288265)
chr1 (121-234)||(32671582-32671695)
chr1 (121-234)||(39260435-39260548)
chr1 (121-234)||(41928584-41928697)
chr1 (121-234)||(52753236-52753349)
chr1 (119-234)||(40092492-40092607)
chr1 (121-234)||(1170533-1170646)
chr1 (121-226)||(1940844-1940949)
chr1 (121-234)||(16052099-16052212)
chr1 (121-234)||(19715250-19715363)
chr1 (121-234)||(52696794-52696907)
chr1 (121-234)||(970613-970728)
chr1 (119-234)||(29695676-29695792)
chr1 (119-234)||(13996812-13996927)
chr1 (121-232)||(42370886-42370997)
chr1 (121-234)||(2347659-2347772)
chr1 (121-234)||(2473725-2473838)
chr1 (121-234)||(5215388-5215501)
chr1 (121-234)||(17591694-17591804)
chr1 (109-234)||(38171823-38171948)
chr1 (110-234)||(15203104-15203228)
chr1 (112-234)||(23498454-23498576)
chr1 (121-234)||(46760969-46761082)
chr1 (121-234)||(15717788-15717900)
chr1 (121-234)||(51359306-51359418)
chr1 (134-234)||(17587594-17587694)
chr1 (121-208)||(15554259-15554346)
chr1 (119-234)||(52086268-52086383)
chr1 (121-234)||(7145210-7145323)
chr1 (121-234)||(6765462-6765575)
chr1 (153-234)||(40149498-40149579)
chr1 (131-234)||(23322929-23323032)
chr1 (121-189)||(5675108-5675176)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (121-234)||(30691856-30691969)
chr6 (121-234)||(3347612-3347725)
chr6 (121-234)||(6086688-6086801)
chr6 (121-234)||(26946965-26947078)
chr6 (121-231)||(2837550-2837660)
chr6 (121-234)||(3955855-3955968)
chr6 (121-234)||(16307097-16307210)
chr6 (121-234)||(52841-52954)
chr6 (121-234)||(17261162-17261275)
chr6 (121-234)||(18613543-18613656)
chr6 (121-234)||(26704428-26704541)
chr6 (121-234)||(34887381-34887494)
chr6 (121-234)||(35198289-35198401)
chr6 (126-234)||(1153603-1153711)
chr6 (121-234)||(9459568-9459681)
chr6 (121-234)||(11167245-11167358)
chr6 (133-234)||(21893472-21893573)
chr6 (110-234)||(20726785-20726905)
chr6 (121-234)||(28199596-28199711)
chr6 (121-234)||(30699018-30699131)
chr6 (121-194)||(33463706-33463779)
chr6 (186-234)||(33464399-33464447)
chr6 (118-233)||(12835050-12835165)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (121-234)||(37698218-37698331)
chr3 (119-234)||(50529848-50529963)
chr3 (112-234)||(25999379-25999501)
chr3 (109-234)||(25494360-25494485)
chr3 (121-234)||(42307980-42308093)
chr3 (119-234)||(21581040-21581155)
chr3 (121-234)||(26122814-26122927)
chr3 (121-234)||(32244120-32244233)
chr3 (121-234)||(38856093-38856206)
chr3 (119-234)||(44609408-44609523)
chr3 (121-234)||(12117733-12117846)
chr3 (121-234)||(15520217-15520330)
chr3 (121-234)||(22175065-22175178)
chr3 (121-234)||(24835774-24835887)
chr3 (121-234)||(35643217-35643330)
chr3 (121-234)||(38933946-38934058)
chr3 (121-234)||(50528929-50529042)
chr3 (121-234)||(20699149-20699262)
chr3 (121-234)||(20842423-20842536)
chr3 (121-234)||(29445488-29445601)
chr3 (121-234)||(54534402-54534514)
chr3 (121-234)||(54870249-54870362)
chr3 (119-234)||(35226445-35226560)
chr3 (121-234)||(8042607-8042720)
chr3 (121-234)||(15520636-15520749)
chr3 (125-234)||(42105046-42105155)
chr3 (121-234)||(46452237-46452350)
chr3 (121-234)||(32359259-32359372)
chr3 (121-234)||(34700341-34700454)
chr3 (121-234)||(49128049-49128162)
chr3 (122-234)||(2895186-2895298)
chr3 (154-234)||(44688794-44688874)
chr3 (154-231)||(16354379-16354456)
chr3 (119-234)||(53028223-53028330)
chr3 (164-234)||(12915949-12916019)
chr3 (120-234)||(48925078-48925190)
chr3 (122-170)||(24366093-24366141)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (121-234)||(36708-36821)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (121-234)||(23040-23153)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (121-234)||(145334-145447)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (121-234)||(384-497)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (121-234)||(3713-3826)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (121-234)||(95-208)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (121-234)||(94-209)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (121-234)||(10241-10354)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 5202858 - 5203091
Alignment:
Q  1 tttattcttttagatgaattaattgttcactttagaataatcctatatgaggcgtgtgaacactaaatatagatagctctcttagtcgatattcgaacat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5202858 tttattcttttagatgaattaattgttcactttagaataatcctatatgaggcgtgtgaacactaaatatagatagctctcttagtcgatattcgaacat 5202957  T
Q  101 tgttttgctactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaata 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5202958 tgttttgctactatggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaata 5203057  T
Q  201 aaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5203058 aaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 5203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3386691 - 3386575
Alignment:
Q  118 tctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3386691 tctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 3386592  T
Q  218 tttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  3386591 tttcataagctgcttat 3386575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24105884 - 24105760
Alignment:
Q  110 actatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24105884 actaaggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 24105785  T
Q  210 tatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  24105784 tatcatagtttcataagctgcttat 24105760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9008259 - 9008146
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9008259 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 9008160  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  9008159 cataagctgcttat 9008146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 31883144 - 31883263
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  31883144 ggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 31883243  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31883244 tagtttcataagctgcttat 31883263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27679371 - 27679258
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27679371 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 27679272  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  27679271 cataagctgcttat 27679258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 1579042 - 1579155
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1579042 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 1579141  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1579142 cataagctgcttat 1579155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1605773 - 1605660
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1605773 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 1605674  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1605673 cataagctgcttat 1605660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 3921587 - 3921700
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3921587 gtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 3921686  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  3921687 cataagctgcttat 3921700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 16069359 - 16069472
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16069359 gtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16069458  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  16069459 cataagctgcttat 16069472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35782846 - 35782733
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35782846 gtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 35782747  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  35782746 cataagctgcttat 35782733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33491398 - 33491287
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33491398 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33491299  T
Q  221 cataagctgctt 232  Q
    ||||||||||||    
T  33491298 cataagctgctt 33491287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16737649 - 16737536
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16737649 gtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16737550  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  16737549 cataagctgcttat 16737536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20992348 - 20992235
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20992348 gtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcatagttt 20992249  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  20992248 cataagctgattat 20992235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 27420864 - 27420977
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27420864 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 27420963  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  27420964 cataagctgcttat 27420977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20992489 - 20992370
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttga----cttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  20992489 ctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatca 20992390  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20992389 tagtttcataagctgcttat 20992370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8374540 - 8374427
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8374540 gtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 8374441  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  8374440 cataagctgcttat 8374427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 19358532 - 19358645
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19358532 gtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 19358631  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  19358632 cataagctgcttat 19358645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 33991146 - 33991259
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33991146 gtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33991245  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  33991246 cataagttgcttat 33991259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165690
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    ||||| |||||||    
T  1165702 ataagttgcttat 1165690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 4120943 - 4121056
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  4120943 gtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcatagttt 4121042  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  4121043 cataagctgcttat 4121056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38598652 - 38598539
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  38598652 gtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagttt 38598553  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  38598552 cataagctgcttat 38598539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284664
Alignment:
Q  123 ttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttca 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  223 taagctgcttat 234  Q
    ||| ||||||||    
T  33284675 taaactgcttat 33284664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26603112 - 26603031
Alignment:
Q  153 cttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26603112 cttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttat 26603031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 31410482 - 31410595
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  31410482 gtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagttt 31410581  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
     |||||||||||||    
T  31410582 tataagctgcttat 31410595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025075
Alignment:
Q  160 actcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 27025075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19516128 - 19516059
Alignment:
Q  165 cataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  19516128 cataagtctttttaacggcgtttggacaaagtaataaaaatagcttatatcaatttcataaactgcttat 19516059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  181 ggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 113 - 234
Target Start/End: Original strand, 41575510 - 41575631
Alignment:
Q  113 atggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttat 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41575510 atggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttat 41575609  T
Q  213 cttagtttcataagctgcttat 234  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  41575610 catagtttcataagctgcttat 41575631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 18594542 - 18594655
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18594542 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 18594641  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  18594642 cataagctgcttat 18594655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 39206591 - 39206704
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39206591 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 39206690  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  39206691 cataagctgcttat 39206704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Original strand, 14422699 - 14422821
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14422699 tatggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 14422798  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  14422799 tcatagtttcataagctgcttat 14422821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10836957 - 10836844
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10836957 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 10836858  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  10836857 cataaactgcttat 10836844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34842567 - 34842454
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34842567 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 34842468  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  34842467 cataagctgcttat 34842454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35118233 - 35118120
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35118233 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 35118134  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  35118133 cataagctgcttat 35118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34679661 - 34679546
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34679661 ctgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagt 34679562  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  34679561 ttcataagctgcttat 34679546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2042726 - 2042613
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2042726 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 2042627  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  2042626 cataagctgcttat 2042613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 13110409 - 13110522
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13110409 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 13110508  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
     |||||||||||||    
T  13110509 aataagctgcttat 13110522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22260832 - 22260719
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22260832 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcctagttt 22260733  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  22260732 cataagctgcttat 22260719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26783935 - 26783822
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26783935 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagttt 26783836  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26783835 cataagctgcttat 26783822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 29938066 - 29938179
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29938066 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagttt 29938165  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  29938166 cataagctgcttat 29938179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 33278405 - 33278518
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33278405 gtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagttt 33278504  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  33278505 cataagctgcttat 33278518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38167369 - 38167244
Alignment:
Q  109 tactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  38167369 tactatggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagt 38167270  T
Q  209 ttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38167269 ttatcatagtttcataagctgcttat 38167244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40118054 - 40117941
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40118054 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 40117955  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  40117954 cataagctgcttat 40117941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 144388 - 144512
Alignment:
Q  110 actatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 209  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  144388 actatgactccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtt 144487  T
Q  210 tatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  144488 tatcatagtttcataagctgcttat 144512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 7774769 - 7774882
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7774769 gtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 7774868  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  7774869 cataagctgcttat 7774882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 7791416 - 7791529
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7791416 gtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 7791515  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  7791516 cataagctgcttat 7791529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 8021724 - 8021837
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8021724 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 8021823  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  8021824 cataagctgcttat 8021837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44805033
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttat 44805033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34999095 - 34998985
Alignment:
Q  124 tggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34999095 tggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagtttcat 34998996  T
Q  224 aagctgcttat 234  Q
    |||||||||||    
T  34998995 aagctgcttat 34998985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24113368 - 24113255
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24113368 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcatagttt 24113269  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  24113268 cataagctgcttat 24113255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33287227 - 33287114
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33287227 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagttt 33287128  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  33287127 cataagctgcttat 33287114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 39218782 - 39218895
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  39218782 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcatagctt 39218881  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  39218882 cataagctgcttat 39218895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 4035852 - 4035965
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4035852 gtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagttt 4035951  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  4035952 cataagctgcttat 4035965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6144475 - 6144362
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6144475 gtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 6144376  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  6144375 cataagctgcttat 6144362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 42571599 - 42571711
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42571599 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagttt 42571697  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  42571698 cataagctgcttat 42571711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 7812000 - 7812113
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7812000 gttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 7812099  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  7812100 cataagctgcttat 7812113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 66382 - 66269
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  66382 gtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagttt 66283  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  66282 cataagctgcttat 66269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 5320569 - 5320682
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  5320569 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcatagttt 5320668  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  5320669 cataagttgcttat 5320682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 36491163 - 36491266
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  36491163 tttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttc 36491262  T
Q  222 ataa 225  Q
    ||||    
T  36491263 ataa 36491266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 5005169 - 5005284
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || |    
T  5005169 ctgtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctact 5005268  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
     |||||| ||||||||    
T  5005269 ctcataaactgcttat 5005284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2322214 - 2322101
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||    
T  2322214 gtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcacaattt 2322115  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  2322114 cataagctgcttat 2322101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 28639283 - 28639400
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccata----agtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatctta 216  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||    ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28639283 gtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatcata 28639382  T
Q  217 gtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28639383 gtttcataagctgcttat 28639400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 39220261 - 39220371
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||   | |||    
T  39220261 gtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaattt 39220360  T
Q  221 cataagctgct 231  Q
    |||||||||||    
T  39220361 cataagctgct 39220371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Original strand, 9806878 - 9806960
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaa 203  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |   |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9806878 gtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807378
Alignment:
Q  195 taaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttat 9807378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30181216 - 30181103
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30181216 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 30181117  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  30181116 cataagctgcttat 30181103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42965187 - 42965075
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42965187 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 42965088  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  42965087 ataagctgcttat 42965075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4477513 - 4477400
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4477513 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggttt 4477414  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  4477413 cataagctgcttat 4477400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 7164188 - 7164301
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7164188 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 7164287  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  7164288 cataagctgcttat 7164301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33846716 - 33846603
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33846716 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33846617  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  33846616 cataaactgcttat 33846603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12101369 - 12101257
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12101369 tttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 12101270  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  12101269 ataagctgcttat 12101257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33359291 - 33359169
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33359291 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 33359192  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  33359191 tcatagtttcataagctgcttat 33359169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 1803030 - 1803143
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1803030 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 1803129  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1803130 cataagctgcttat 1803143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 20346492 - 20346605
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20346492 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 20346591  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  20346592 cataagctgcttat 20346605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 32041546 - 32041659
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32041546 gtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 32041645  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  32041646 cataagctgcttat 32041659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156830
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||| ||||    
T  43156818 ataagctgtttat 43156830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 933287 - 933402
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  933287 ctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 933386  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  933387 ttcataagctgcttat 933402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22649895 - 22649773
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22649895 tatggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 22649796  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  22649795 tcataatttcataagctgcttat 22649773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 42204158 - 42204272
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttt-taaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42204158 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtt 42204257  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  42204258 tcataagctgcttat 42204272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 3511327 - 3511440
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3511327 gtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagttt 3511426  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  3511427 cataagctgcttat 3511440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 5280864 - 5280977
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5280864 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 5280963  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  5280964 cataagctgcttat 5280977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 6394755 - 6394868
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  6394755 gtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatggttt 6394854  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  6394855 cataagctgcttat 6394868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 19828274 - 19828387
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19828274 gtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcatagttt 19828373  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||  |||||||    
T  19828374 cataaattgcttat 19828387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24792524 - 24792411
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24792524 gtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 24792425  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  24792424 cataagctgcttat 24792411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 25748491 - 25748604
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25748491 gtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 25748590  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  25748591 cataagctgcttat 25748604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43068165 - 43068052
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43068165 gtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 43068066  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||||| |||||    
T  43068065 cataagcttcttat 43068052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 4347277 - 4347390
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4347277 gtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccatagttt 4347376  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  4347377 cataagctgcttat 4347390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 15655916 - 15656029
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15655916 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagttt 15656015  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  15656016 cataagctgcttat 15656029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36891021 - 36890909
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36891021 gtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 36890923  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  36890922 cataagttgcttat 36890909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43021767 - 43021655
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  43021767 tttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttc 43021668  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  43021667 ataagctgcttat 43021655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 38866548 - 38866661
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38866548 gtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 38866647  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  38866648 cataagctgtttat 38866661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Original strand, 9452594 - 9452702
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  9452594 gtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagttt 9452693  T
Q  221 cataagctg 229  Q
    |||||||||    
T  9452694 cataagctg 9452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 8630670 - 8630783
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8630670 gtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 8630769  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  8630770 cataagctgcttat 8630783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 43405024 - 43405129
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  43405024 gtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgtaattt 43405123  T
Q  221 cataag 226  Q
    ||||||    
T  43405124 cataag 43405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12097781 - 12097669
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12097781 tttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtttc 12097682  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    ||||||| |||||    
T  12097681 ataagctacttat 12097669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 212
Target Start/End: Original strand, 37704984 - 37705075
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttat 212  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37704984 gtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46891532 - 46891418
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtcttttt-aaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||    
T  46891532 gtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatagtt 46891433  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    | |||||||||||||    
T  46891432 ttataagctgcttat 46891418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 17753604 - 17753717
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17753604 gtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagttt 17753703  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  17753704 cataagctgcttat 17753717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Original strand, 42673464 - 42673578
Alignment:
Q  116 gctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatctt 215  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     |||||||||| |||||||| |    
T  42673464 gctccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgg----gtaaataaaaacagcttatcat 42673559  T
Q  216 agtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42673560 agtttcataagctgcttat 42673578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 46134496 - 46134388
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  46134496 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattatagttt 46134397  T
Q  221 cataagctg 229  Q
    |||||||||    
T  46134396 cataagctg 46134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37006009 - 37005890
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||     
T  37006009 ggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcg 37005910  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    || |||||||||||||||||    
T  37005909 taatttcataagctgcttat 37005890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16894667 - 16894586
Alignment:
Q  153 cttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16894667 cttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 16894586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 48865666 - 48865750
Alignment:
Q  153 cttatctactcccataagtctttt---taaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48865666 cttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 48865750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaata 206  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15655604 - 15655514
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||   ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15655604 gtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagctta 15655514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36849729 - 36849616
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||| |  || ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  | |||    
T  36849729 gtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcacaattt 36849630  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||| ||||    
T  36849629 cataaactgtttat 36849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 54412631 - 54412744
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54412631 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 54412730  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  54412731 cataagctgcttat 54412744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23776649 - 23776536
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23776649 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 23776550  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  23776549 cataagctgcttat 23776536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 48909847 - 48909962
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48909847 ctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 48909946  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  48909947 ttcataagctgcttat 48909962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6611550 - 6611437
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6611550 gtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 6611451  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  6611450 cataagctgtttat 6611437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 20877050 - 20877163
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20877050 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 20877149  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  20877150 cataagctgcttat 20877163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50055291 - 50055178
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  50055291 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatggttt 50055192  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  50055191 cataagctgcttat 50055178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19165162 - 19165048
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtcttttt-aaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19165162 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 19165063  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  19165062 tcataagctgcttat 19165048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 14987795 - 14987908
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14987795 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 14987894  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  14987895 cataagctgcttat 14987908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 16700784 - 16700897
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16700784 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 16700883  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  16700884 cataagctgcttat 16700897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19913820 - 19913707
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  19913820 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcatagttt 19913721  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  19913720 cataagctgcttat 19913707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30423754 - 30423641
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30423754 gtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 30423655  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  30423654 cataagctgcttat 30423641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 50053446 - 50053559
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50053446 gtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50053545  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  50053546 cataagctgcttat 50053559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 54189548 - 54189661
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54189548 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 54189647  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  54189648 cataagctgcttat 54189661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37968942 - 37968834
Alignment:
Q  126 gattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataa 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37968942 gattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 37968843  T
Q  226 gctgcttat 234  Q
    |||||||||    
T  37968842 gctgcttat 37968834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28032904 - 28032789
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28032904 ctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 28032805  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
     |||||||||||||||    
T  28032804 atcataagctgcttat 28032789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 28360427 - 28360546
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  28360427 ggctctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 28360526  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  28360527 tagttttataagctgcttat 28360546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Original strand, 38055151 - 38055273
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  38055151 tatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttta 38055250  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  38055251 tcatagtttcataagctgcttat 38055273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45424737 - 45424611
Alignment:
Q  108 ctactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatag 207  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45424737 ctactaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 45424638  T
Q  208 cttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45424637 tttatcatagtttcataagctgcttat 45424611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1756954 - 1756841
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1756954 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 1756855  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1756854 cataagctgcttat 1756841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27488838 - 27488725
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27488838 gtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 27488739  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  27488738 cataagctgcttat 27488725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40428910 - 40428797
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40428910 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 40428811  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  40428810 cataagctgcttat 40428797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 50353804 - 50353917
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  50353804 gtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgatagttt 50353903  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  50353904 cataagctgcttat 50353917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53717654 - 53717541
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53717654 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 53717555  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  53717554 cataagctgcttat 53717541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Original strand, 1617087 - 1617198
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1617087 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 1617186  T
Q  221 cataagctgctt 232  Q
    ||||||||||||    
T  1617187 cataagctgctt 1617198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2481598 - 2481485
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  2481598 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagttt 2481499  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  2481498 cataagctgcttat 2481485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8932368 - 8932255
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8932368 gtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgtagttt 8932269  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  8932268 cataagctgcttat 8932255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11639768 - 11639655
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11639768 gtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 11639669  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  11639668 cataagctgcttat 11639655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15241218 - 15241105
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  15241218 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagttt 15241119  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  15241118 cataagctgcttat 15241105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 15669186 - 15669299
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15669186 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 15669285  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  15669286 cataagctgcttat 15669299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35490963 - 35490850
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35490963 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 35490864  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  35490863 cataagttgcttat 35490850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44785107 - 44784994
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  44785107 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcatagttt 44785008  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  44785007 cataagttgcttat 44784994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 52139206 - 52139319
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52139206 gtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 52139305  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  52139306 cataagctgcttat 52139319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 53875660 - 53875773
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53875660 gtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 53875759  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
     |||||||||||||    
T  53875760 tataagctgcttat 53875773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583709
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  27583721 ataagctgcttat 27583709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680115
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttat 40680115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 53353058 - 53353175
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagctta----tgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatctta 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  53353058 gtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 53353157  T
Q  217 gtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||    
T  53353158 gtttcataagctgcttat 53353175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23704401 - 23704286
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23704401 ctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 23704302  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  23704301 ttcataagctgcttat 23704286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43290156 - 43290037
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  43290156 ggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatca 43290057  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43290056 tagtttcataagctgcttat 43290037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 47632037 - 47632151
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaa-ggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  47632037 gtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcatagtt 47632136  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  47632137 tcataagctgcttat 47632151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 30171583 - 30171696
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30171583 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagttt 30171682  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  30171683 cataagctgcttat 30171696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 37464724 - 37464837
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  37464724 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagttt 37464823  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  37464824 cataagctgcttat 37464837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6688811 - 6688711
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6688811 gtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 6688712  T
Q  221 c 221  Q
    |    
T  6688711 c 6688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071397
Alignment:
Q  127 attggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataag 226  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  227 ctgcttat 234  Q
    ||||||||    
T  38071404 ctgcttat 38071397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 31969696 - 31969797
Alignment:
Q  133 ttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgctt 232  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31969696 ttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 31969795  T
Q  233 at 234  Q
    ||    
T  31969796 at 31969797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44379379 - 44379264
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44379379 ctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 44379280  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||| |||||||    
T  44379279 ttcataagttgcttat 44379264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8591275 - 8591169
Alignment:
Q  128 ttggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagc 227  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8591275 ttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagc 8591176  T
Q  228 tgcttat 234  Q
    |||||||    
T  8591175 tgcttat 8591169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 234
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33703957
Alignment:
Q  127 attggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataag 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  227 ctgcttat 234  Q
    ||||||||    
T  33703950 ctgcttat 33703957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 234
Target Start/End: Original strand, 16703843 - 16703937
Alignment:
Q  140 gagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16703843 gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 16703937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23265947 - 23265865
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23265947 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27536290 - 27536181
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | ||||    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27536290 gtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 27536195  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  27536194 cataaactgcttat 27536181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55345015 - 55344923
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55345015 gtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 55344923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 44375848 - 44375961
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44375848 gtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 44375947  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  44375948 cataaactgcttat 44375961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44548320 - 44548239
Alignment:
Q  132 cttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 213  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  44548320 cttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatc 44548239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780795
Alignment:
Q  184 gtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttat 51780795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269123
Alignment:
Q  195 taaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 23269123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 234
Target Start/End: Original strand, 17493335 - 17493449
Alignment:
Q  120 tgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    |||| |||||| ||||||||||  |||| |  || |||||||||| |||||  ||||||| || |||||  ||||| |||||||||| |||||  || ||    
T  17493335 tgttaggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaatt 17493434  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    | |||||||||||||    
T  17493435 ttataagctgcttat 17493449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26323388 - 26323275
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26323388 gtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26323289  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26323288 cataagctgcttat 26323275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 234
Target Start/End: Original strand, 39635433 - 39635568
Alignment:
Q  99 attgttttgctactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaa 198  Q
    ||||||||| ||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39635433 attgttttgttacttaggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa 39635532  T
Q  199 taaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39635533 taaatatagcttatcatagtttcataagctgcttat 39635568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30420369 - 30420256
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  30420369 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataggtt 30420270  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  30420269 cataagctgcttat 30420256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33906261 - 33906136
Alignment:
Q  109 tactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33906261 tactaaggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 33906162  T
Q  209 ttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33906161 ttatcatagtttcataagctgcttat 33906136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31517426 - 31517304
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31517426 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 31517327  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  31517326 tcatagtttcataaactgcttat 31517304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3873446 - 3873333
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3873446 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagttt 3873347  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  3873346 cataagctgcttat 3873333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4232344 - 4232231
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4232344 gtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 4232245  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  4232244 cataagctgcttat 4232231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18807086 - 18806973
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18807086 gtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 18806987  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  18806986 cataagctgcttat 18806973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28330039 - 28329926
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28330039 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 28329940  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  28329939 cataaactgcttat 28329926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 234
Target Start/End: Original strand, 1108290 - 1108395
Alignment:
Q  129 tggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  1108290 tggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagtt 1108389  T
Q  229 gcttat 234  Q
    ||||||    
T  1108390 gcttat 1108395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6175030 - 6174917
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  6175030 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 6174931  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  6174930 cataagctgcttat 6174917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 42937716 - 42937835
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  42937716 ggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 42937815  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42937816 tagtttcataagctgcttat 42937835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2178971 - 2178858
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2178971 gtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 2178872  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  2178871 cataagctgcttat 2178858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 4016042 - 4016155
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  4016042 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatagttt 4016141  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  4016142 cataagctgcttat 4016155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066383
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttat 16066383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16588984 - 16588865
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  16588984 ggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttatta 16588885  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16588884 tagtttcataagctgcttat 16588865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19901339 - 19901227
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19901339 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagttt 19901241  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  19901240 cataaactgcttat 19901227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 5733407 - 5733515
Alignment:
Q  126 gattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataa 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  5733407 gattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataa 5733506  T
Q  226 gctgcttat 234  Q
    |||||||||    
T  5733507 gctgcttat 5733515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1483104 - 1482992
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  1483104 gttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgttt 1483006  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1483005 cataagctgcttat 1482992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30270881 - 30270768
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  30270881 gtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcatagttt 30270782  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  30270781 cataagctgcttat 30270768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 851000 - 851113
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||    
T  851000 gtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataattt 851099  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
     |||||||||||||    
T  851100 tataagctgcttat 851113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 234
Target Start/End: Original strand, 429812 - 429932
Alignment:
Q  114 tggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 213  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  429812 tggctccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 429911  T
Q  214 ttagtttcataagctgcttat 234  Q
     || ||||||||| |||||||    
T  429912 ataatttcataagttgcttat 429932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44947743 - 44947631
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    ||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44947743 tttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttc 44947644  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  44947643 ataagctgcttat 44947631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19384032
Alignment:
Q  132 cttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataag 226  Q
    ||||||||||| |||| |   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 19384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42446771 - 42446658
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||  | |||    
T  42446771 gtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcacaattt 42446672  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  42446671 cataagctgcttat 42446658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22101316 - 22101236
Alignment:
Q  154 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22101316 ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttat 22101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 1168506 - 1168619
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1168506 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 1168605  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1168606 cataagctgcttat 1168619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 29078517 - 29078632
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29078517 ctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 29078616  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  29078617 ttcataagctgcttat 29078632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 26663261 - 26663374
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663261 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26663360  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  26663361 cataagctgtttat 26663374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 115 - 232
Target Start/End: Original strand, 38829066 - 38829183
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  38829066 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 38829165  T
Q  215 tagtttcataagctgctt 232  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38829166 tagtttcataagctgctt 38829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 49146164 - 49146288
Alignment:
Q  110 actatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146164 actaaggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 49146263  T
Q  210 tatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  49146264 tatcatagtttcataagctgcttat 49146288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 12682821 - 12682936
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12682821 ctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 12682920  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  12682921 ttcataagctgcttat 12682936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 33510487 - 33510600
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33510487 gtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagttt 33510586  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  33510587 cataagctgcttat 33510600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 43905651 - 43905770
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43905651 ggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 43905750  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43905751 tagtttcataagctgcttat 43905770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 234
Target Start/End: Original strand, 46409432 - 46409551
Alignment:
Q  115 ggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatct 214  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  46409432 ggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 46409531  T
Q  215 tagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46409532 tagtttcataagctgcttat 46409551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8079911 - 8079798
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8079911 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 8079812  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||||| |||||    
T  8079811 cataagctacttat 8079798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 8120872 - 8120985
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8120872 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagttt 8120971  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  8120972 cataagctgcttat 8120985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 20089474 - 20089587
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20089474 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 20089573  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  20089574 cataagctgcttat 20089587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 25897377 - 25897490
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25897377 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 25897476  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  25897477 cataagctgcttat 25897490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26580472 - 26580359
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26580472 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcatagttt 26580373  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26580372 cataagctgcttat 26580359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 29288152 - 29288265
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29288152 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 29288251  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  29288252 cataagctgcttat 29288265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 32671582 - 32671695
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32671582 gtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 32671681  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||||| |||||    
T  32671682 cataagctacttat 32671695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39260548 - 39260435
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39260548 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 39260449  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  39260448 cataagttgcttat 39260435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41928697 - 41928584
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41928697 gtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 41928598  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  41928597 cataagctgcttat 41928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52753349 - 52753236
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52753349 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 52753250  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||||| |||||    
T  52753249 cataagctacttat 52753236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 40092492 - 40092607
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40092492 ctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagt 40092591  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  40092592 ttcataagctgcttat 40092607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1170646 - 1170533
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1170646 gtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 1170547  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  1170546 cataagctgcttat 1170533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1940949 - 1940844
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1940949 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 1940850  T
Q  221 cataag 226  Q
    ||||||    
T  1940849 cataag 1940844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 16052099 - 16052212
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16052099 gtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16052198  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  16052199 cataagctgcttat 16052212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19715363 - 19715250
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19715363 gtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgttt 19715264  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  19715263 cataagctgcttat 19715250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 52696794 - 52696907
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  52696794 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagttt 52696893  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  52696894 cataagctgcttat 52696907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 970728 - 970613
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc--ttagt 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  970728 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatatagt 970629  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  970628 ttcataagctgcttat 970613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 29695676 - 29695792
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttt-taaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttag 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  29695676 ctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatag 29695775  T
Q  218 tttcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||||    
T  29695776 tttcataagctgcttat 29695792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13996927 - 13996812
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  13996927 ctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggt 13996828  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  13996827 ttcataagctgcttat 13996812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42370997 - 42370886
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  42370997 gtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcatagttt 42370898  T
Q  221 cataagctgctt 232  Q
    ||||||||||||    
T  42370897 cataagctgctt 42370886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 2347659 - 2347772
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2347659 gtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 2347758  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  2347759 cataagctgcttat 2347772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 2473725 - 2473838
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2473725 gtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagttt 2473824  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  2473825 cataagctgcttat 2473838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 5215388 - 5215501
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5215388 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagttt 5215487  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  5215488 cataagttgcttat 5215501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 17591694 - 17591804
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17591694 gtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 17591790  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  17591791 cataagctgcttat 17591804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Original strand, 38171823 - 38171948
Alignment:
Q  109 tactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 208  Q
    ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  38171823 tactaaggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagt 38171922  T
Q  209 ttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38171923 ttatcatagtttcataagctgcttat 38171948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 15203104 - 15203228
Alignment:
Q  110 actatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 209  Q
    |||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15203104 actatggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagct 15203203  T
Q  210 tatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||    
T  15203204 tatcatagtttcataagctgtttat 15203228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Original strand, 23498454 - 23498576
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  23498454 tatggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttca 23498553  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || |||||||||||| |||||||    
T  23498554 tcatagtttcataagttgcttat 23498576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 46760969 - 46761082
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |   ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46760969 gtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 46761068  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  46761069 cataaactgcttat 46761082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 15717788 - 15717900
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |  |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15717788 gtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagttt 15717886  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  15717887 cataagctgcttat 15717900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51359418 - 51359306
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51359418 gtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcatagttt 51359320  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  51359319 cataaggtgcttat 51359306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587594
Alignment:
Q  134 tattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgctta 233  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  234 t 234  Q
    |    
T  17587594 t 17587594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15554346 - 15554259
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15554346 gtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 15554259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 52086268 - 52086383
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| || |    
T  52086268 ctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataat 52086367  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  52086368 ttcataagctgcttat 52086383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 7145210 - 7145323
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttatttt-gagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7145210 gtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgttggg-taaataaacaaaaatagtttatcatagtt 7145308  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  7145309 tcataagctgcttat 7145323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 6765462 - 6765575
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  6765462 gtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatatttt 6765561  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||| ||||||||||    
T  6765562 catgagctgcttat 6765575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 234
Target Start/End: Original strand, 40149498 - 40149579
Alignment:
Q  153 cttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||    
T  40149498 cttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttat 40149579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322929
Alignment:
Q  131 gcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgc 230  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||   ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  231 ttat 234  Q
    ||||    
T  23322932 ttat 23322929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Original strand, 5675108 - 5675176
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgg 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||    
T  5675108 gtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 30691856 - 30691969
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30691856 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 30691955  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  30691956 cataagctgcttat 30691969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3347725 - 3347612
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3347725 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagttt 3347626  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  3347625 cataagctgcttat 3347612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6086801 - 6086688
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6086801 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 6086702  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  6086701 cataagctgcttat 6086688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26947078 - 26946965
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26947078 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 26946979  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26946978 cataagctgcttat 26946965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 2837550 - 2837660
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2837550 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 2837649  T
Q  221 cataagctgct 231  Q
    ||| |||||||    
T  2837650 catgagctgct 2837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3955968 - 3955855
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3955968 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3955869  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  3955868 cataaactgcttat 3955855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16307210 - 16307097
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16307210 gtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcatagttt 16307111  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  16307110 cataagctgcttat 16307097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 52841 - 52954
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52841 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 52940  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  52941 cataagctgcttat 52954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17261275 - 17261162
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||    
T  17261275 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatatttt 17261176  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  17261175 cataagctgcttat 17261162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 18613543 - 18613656
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  18613543 gtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttc 18613642  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  18613643 cataagctgcttat 18613656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26704541 - 26704428
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26704541 gtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 26704442  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26704441 cataagctgcttat 26704428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34887494 - 34887381
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34887494 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 34887395  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  34887394 cataagctgtttat 34887381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 35198289 - 35198401
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35198289 gtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataag-ctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 35198387  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  35198388 cataagctgcttat 35198401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 126 - 234
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153711
Alignment:
Q  126 gattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataa 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  226 gctgcttat 234  Q
    |||||||||    
T  1153703 gctgcttat 1153711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 9459568 - 9459681
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9459568 gtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 9459667  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  9459668 cataagctgcttat 9459681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 11167245 - 11167358
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11167245 gtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 11167344  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  11167345 cataagctgcttat 11167358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Original strand, 21893472 - 21893573
Alignment:
Q  133 ttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgctt 232  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21893472 ttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 21893571  T
Q  233 at 234  Q
    ||    
T  21893572 at 21893573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 234
Target Start/End: Original strand, 20726785 - 20726905
Alignment:
Q  110 actatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagct 209  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||| ||    
T  20726785 actatggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgg----gtaaataaaaataact 20726880  T
Q  210 tatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  20726881 tatcatagtttcataagctgcttat 20726905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28199711 - 28199596
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatc---tactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttag 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  28199711 gtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28199613  T
Q  218 tttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28199612 tttcatatgctgcttat 28199596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30699131 - 30699018
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||| || | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30699131 gtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 30699032  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
     || ||||||||||    
T  30699031 tattagctgcttat 30699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Original strand, 33463706 - 33463779
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33463706 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 234
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464447
Alignment:
Q  186 ttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttat 33464447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Original strand, 12835050 - 12835165
Alignment:
Q  118 tctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaag-gtgtttggataaataaataaaaatagcttatctta 216  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||  ||||||  ||| ||||  ||||||||||| || ||| |||| | |||||  ||    
T  12835050 tctgattggattggcttattta-agcttatgtaaacttatctactaacataagcttttgtaaaaagtgtttggatacattaatcaaaagaacttatacta 12835148  T
Q  217 gtttcataagctgctta 233  Q
     ||||||||||||||||    
T  12835149 atttcataagctgctta 12835165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37698331 - 37698218
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37698331 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 37698232  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  37698231 cataagctgcttat 37698218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50529963 - 50529848
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50529963 ctgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 50529864  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  50529863 ttcataagctgcttat 50529848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Original strand, 25999379 - 25999501
Alignment:
Q  112 tatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 211  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25999379 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25999478  T
Q  212 tcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  25999479 tcatagtttcataagctgcttat 25999501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25494485 - 25494360
Alignment:
Q  109 tactatggctctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 208  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25494485 tactatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 25494386  T
Q  209 ttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25494385 ttatcatagtttcataagctgcttat 25494360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42308093 - 42307980
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42308093 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 42307994  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  42307993 cataagctgcttat 42307980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 21581040 - 21581155
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21581040 ctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagt 21581139  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  21581140 ttcataagctgcttat 21581155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 26122814 - 26122927
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26122814 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26122913  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  26122914 cataagctgcttat 26122927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 32244120 - 32244233
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32244120 gtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 32244219  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  32244220 cataagctgcttat 32244233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 38856093 - 38856206
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38856093 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38856192  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  38856193 cataagctgcttat 38856206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44609523 - 44609408
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44609523 ctgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 44609424  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  44609423 ttcataagctgcttat 44609408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12117846 - 12117733
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12117846 gtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagttt 12117747  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  12117746 cataagttgcttat 12117733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15520330 - 15520217
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  15520330 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatcgttt 15520231  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||| ||||||||    
T  15520230 cataaactgcttat 15520217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22175178 - 22175065
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22175178 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 22175079  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  22175078 cataagctgcttat 22175065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24835887 - 24835774
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  24835887 gtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattatagttt 24835788  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  24835787 cataagctgcttat 24835774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 35643217 - 35643330
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35643217 gtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 35643316  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  35643317 cataagctgcttat 35643330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 38933946 - 38934058
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38933946 gtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 38934044  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  38934045 cataagctgcttat 38934058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 50528929 - 50529042
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50528929 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 50529028  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  50529029 cataagctgcttat 50529042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 20699149 - 20699262
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20699149 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagttt 20699248  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  20699249 cataagctgcttat 20699262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20842536 - 20842423
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  20842536 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagttt 20842437  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  20842436 cataagctgcttat 20842423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 29445488 - 29445601
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29445488 gtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29445587  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||    
T  29445588 cataagctgtttat 29445601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54534514 - 54534402
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  54534514 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggttt 54534415  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
     |||||||||||||    
T  54534414 -ataagctgcttat 54534402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54870362 - 54870249
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  54870362 gtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatcgttt 54870263  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  54870262 cataagctgcttat 54870249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 35226445 - 35226560
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||    
T  35226445 ctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagt 35226544  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  35226545 ttcataagctgcttat 35226560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 8042607 - 8042720
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  8042607 gtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagttt 8042706  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  8042707 cataagctgcttat 8042720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 15520636 - 15520749
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  15520636 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagttt 15520735  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  15520736 cataagctgcttat 15520749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42105046
Alignment:
Q  125 ggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcata 224  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  225 agctgcttat 234  Q
    ||||||||||    
T  42105055 agctgcttat 42105046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46452350 - 46452237
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46452350 gtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 46452251  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    |||||| |||||||    
T  46452250 cataagttgcttat 46452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 32359259 - 32359372
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32359259 gtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 32359358  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  32359359 cataagctgcttat 32359372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 34700341 - 34700454
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34700341 gtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 34700440  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  34700441 cataagctgcttat 34700454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 49128049 - 49128162
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||    
T  49128049 gtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgtaattt 49128148  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  49128149 cataagctgcttat 49128162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Original strand, 2895186 - 2895298
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttc 221  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  2895186 tttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttc 2895285  T
Q  222 ataagctgcttat 234  Q
    |||||||||||||    
T  2895286 ataagctgcttat 2895298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 234
Target Start/End: Original strand, 44688794 - 44688874
Alignment:
Q  154 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44688794 ttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 44688874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 231
Target Start/End: Original strand, 16354379 - 16354456
Alignment:
Q  154 ttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgct 231  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16354379 ttatctacactcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgct 16354456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 234
Target Start/End: Original strand, 53028223 - 53028330
Alignment:
Q  119 ctgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagt 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||| || |    
T  53028223 ctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagagg--------taaataaataaaaatagcttatcatatt 53028314  T
Q  219 ttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||| ||||||||    
T  53028315 ttcataaactgcttat 53028330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 12915949 - 12916019
Alignment:
Q  164 ccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtttcataagctgcttat 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  12915949 ccataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttat 12916019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48925190 - 48925078
Alignment:
Q  120 tgtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagtt 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| | |  ||||||||| |||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  48925190 tgtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 48925093  T
Q  220 tcataagctgcttat 234  Q
    |||||||||| ||||    
T  48925092 tcataagctgtttat 48925078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 170
Target Start/End: Original strand, 24366093 - 24366141
Alignment:
Q  122 tttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataag 170  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  24366093 tttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataag 24366141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 36708 - 36821
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36708 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 36807  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  36808 cataagctgcttat 36821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23153 - 23040
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23153 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 23054  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  23053 cataagctgcttat 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 145447 - 145334
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  145447 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 145348  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  145347 cataagctgcttat 145334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 384
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  497 gtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagttt 398  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  397 cataagctgcttat 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 3713 - 3826
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3713 gtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3812  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  3813 cataagctgcttat 3826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 95
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  208 gtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 109  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  108 cataagctgcttat 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 94
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatc---tactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttag 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  209 gtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 111  T
Q  218 tttcataagctgcttat 234  Q
    ||||||| |||||||||    
T  110 tttcatatgctgcttat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 10241 - 10354
Alignment:
Q  121 gtttggattggcttattttgagcttatgttgacttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcttagttt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10241 gtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 10340  T
Q  221 cataagctgcttat 234  Q
    ||||||||||||||    
T  10341 cataagctgcttat 10354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University