View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15278_high_9 (Length: 368)

Name: NF15278_high_9
Description: NF15278
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15278_high_9
NF15278_high_9
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-358)||(54635027-54635384)
chr3 (1-358)||(6716402-6716760)
chr3 (1-358)||(45282885-45283247)
chr3 (1-350)||(3617359-3617711)
chr3 (1-346)||(25637342-25637691)
chr3 (1-358)||(4600651-4601009)
chr3 (1-358)||(4598430-4598788)
chr3 (1-358)||(10211298-10211656)
chr3 (1-350)||(10056129-10056481)
chr3 (1-350)||(10058351-10058703)
chr3 (1-350)||(10060573-10060925)
chr3 (1-350)||(10062795-10063147)
chr3 (1-350)||(10065017-10065369)
chr3 (1-358)||(10209078-10209436)
chr3 (1-358)||(800993-801346)
chr3 (1-297)||(7779912-7780208)
chr3 (1-358)||(23200047-23200410)
chr3 (3-358)||(23197850-23198211)
chr3 (169-350)||(10067239-10067419)
chr3 (226-358)||(6718586-6718718)
chr3 (89-343)||(45095075-45095335)
chr3 (1-358)||(9636035-9636400)
chr3 (89-358)||(5258140-5258417)
chr3 (89-343)||(5260319-5260581)
chr3 (89-257)||(19683885-19684054)
chr3 (89-260)||(7762265-7762437)
chr3 (89-260)||(37408458-37408630)
chr3 (89-343)||(9581193-9581454)
chr3 (89-249)||(7764476-7764636)
chr3 (89-260)||(34491212-34491383)
chr3 (86-260)||(49199462-49199638)
chr3 (93-260)||(4569952-4570120)
chr3 (89-260)||(29196383-29196555)
chr3 (89-257)||(39153358-39153526)
chr3 (86-260)||(43401794-43401970)
chr3 (89-260)||(40734498-40734669)
chr3 (89-260)||(44331545-44331716)
chr3 (86-256)||(30236129-30236299)
chr3 (86-260)||(43403737-43403913)
chr3 (93-260)||(6095600-6095767)
chr3 (89-260)||(44700476-44700646)
chr3 (89-343)||(760757-761018)
chr3 (100-257)||(22835010-22835167)
chr3 (89-258)||(31314447-31314616)
chr3 (89-343)||(40735293-40735554)
chr3 (93-260)||(41819523-41819691)
chr3 (89-256)||(51398818-51398985)
chr3 (93-260)||(54593704-54593871)
chr3 (89-343)||(29682269-29682530)
chr3 (89-343)||(32744433-32744684)
chr3 (89-260)||(5236454-5236624)
chr3 (93-260)||(46860474-46860642)
chr3 (100-260)||(53921511-53921671)
chr3 (89-260)||(29813063-29813234)
chr3 (100-258)||(32891105-32891264)
chr3 (86-202)||(40913352-40913467)
chr3 (1-132)||(10067435-10067568)
chr3 (89-175)||(16499115-16499200)
chr3 (113-260)||(29810868-29811016)
chr3 (102-241)||(46173377-46173515)
chr3 (93-200)||(55301972-55302079)
chr3 (89-257)||(9666463-9666632)
chr3 (89-260)||(23391906-23392077)
chr3 (91-172)||(47304340-47304420)
chr3 (132-260)||(51352150-51352278)
chr3 (101-160)||(27305719-27305777)
chr3 (188-260)||(5433971-5434046)
chr3 (126-260)||(36018852-36018987)
chr3 (143-255)||(4055813-4055926)
chr3 (143-255)||(4075520-4075636)
chr3 (89-175)||(23410326-23410411)
chr3 (93-161)||(2075076-2075143)
chr3 (189-248)||(28253363-28253423)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-358)||(25689857-25690215)
chr8 (1-358)||(3439406-3439763)
chr8 (1-358)||(15290427-15290785)
chr8 (1-358)||(15470796-15471154)
chr8 (1-358)||(42575232-42575589)
chr8 (1-358)||(2627637-2627995)
chr8 (1-343)||(31218167-31218514)
chr8 (1-343)||(34254242-34254586)
chr8 (89-343)||(17982563-17982825)
chr8 (1-343)||(34256418-34256762)
chr8 (89-343)||(44303764-44304027)
chr8 (1-260)||(42498193-42498452)
chr8 (89-343)||(19945355-19945618)
chr8 (90-246)||(1746216-1746371)
chr8 (89-260)||(15212786-15212957)
chr8 (93-260)||(42434992-42435159)
chr8 (93-260)||(4283524-4283691)
chr8 (89-260)||(33352150-33352321)
chr8 (89-260)||(43036423-43036594)
chr8 (89-258)||(40321082-40321251)
chr8 (93-260)||(18655400-18655567)
chr8 (89-260)||(27811278-27811449)
chr8 (89-246)||(12702631-12702787)
chr8 (89-260)||(3303667-3303838)
chr8 (89-260)||(40221745-40221916)
chr8 (99-260)||(18141821-18141981)
chr8 (89-257)||(6598975-6599143)
chr8 (89-257)||(6674428-6674596)
chr8 (101-260)||(30291606-30291767)
chr8 (119-257)||(40328782-40328922)
chr8 (89-260)||(4731658-4731829)
chr8 (89-206)||(5689326-5689442)
chr8 (89-185)||(4743211-4743306)
chr8 (113-254)||(30143346-30143488)
chr8 (90-260)||(9765745-9765914)
chr8 (86-258)||(10930193-10930365)
chr8 (93-256)||(11383989-11384152)
chr8 (93-260)||(8965692-8965859)
chr8 (99-260)||(1292471-1292631)
chr8 (89-257)||(1345368-1345536)
chr8 (89-206)||(41366612-41366727)
chr8 (86-260)||(19491693-19491867)
chr8 (131-257)||(44353796-44353923)
chr8 (93-242)||(4162516-4162663)
chr8 (93-175)||(4733792-4733873)
chr8 (98-206)||(10015136-10015241)
chr8 (98-206)||(18106087-18106191)
chr8 (93-201)||(3073875-3073981)
chr8 (100-206)||(7597669-7597776)
chr8 (104-175)||(8153844-8153914)
chr8 (100-206)||(3772247-3772352)
chr8 (93-255)||(29796320-29796485)
chr8 (117-206)||(32902197-32902287)
chr8 (180-247)||(41266982-41267051)
chr8 (188-255)||(1822297-1822365)
chr8 (188-255)||(1856742-1856810)
chr8 (143-175)||(10929874-10929906)
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (1-358)||(20343799-20344156)
chr7 (1-350)||(18392103-18392453)
chr7 (1-350)||(18388667-18389017)
chr7 (1-349)||(32060229-32060582)
chr7 (1-350)||(6594465-6594815)
chr7 (1-350)||(6592247-6592597)
chr7 (39-358)||(24789743-24790063)
chr7 (1-358)||(39731271-39731628)
chr7 (2-358)||(43504063-43504421)
chr7 (190-350)||(1562103-1562261)
chr7 (1-343)||(35853825-35854173)
chr7 (86-358)||(25766953-25767227)
chr7 (1-183)||(1560572-1560757)
chr7 (89-343)||(29990965-29991225)
chr7 (86-358)||(48408697-48408979)
chr7 (89-260)||(34310712-34310884)
chr7 (89-260)||(23555039-23555212)
chr7 (89-330)||(25615785-25616025)
chr7 (89-343)||(19502088-19502350)
chr7 (1-343)||(4178685-4179030)
chr7 (89-260)||(14069830-14070001)
chr7 (89-260)||(14379858-14380029)
chr7 (93-260)||(22269973-22270140)
chr7 (89-260)||(41317431-41317602)
chr7 (89-260)||(30024729-30024900)
chr7 (93-260)||(8359316-8359485)
chr7 (89-260)||(27347817-27347988)
chr7 (95-260)||(29608737-29608902)
chr7 (97-260)||(6431971-6432134)
chr7 (93-206)||(32358055-32358167)
chr7 (89-257)||(41649008-41649175)
chr7 (93-260)||(3258995-3259162)
chr7 (89-260)||(8153342-8153513)
chr7 (89-260)||(18126644-18126815)
chr7 (113-260)||(48491579-48491727)
chr7 (93-260)||(48599335-48599502)
chr7 (86-242)||(2390301-2390456)
chr7 (93-260)||(4508707-4508874)
chr7 (89-260)||(31732966-31733137)
chr7 (89-260)||(48489431-48489602)
chr7 (98-260)||(2360978-2361140)
chr7 (93-260)||(4253529-4253697)
chr7 (101-330)||(47673953-47674189)
chr7 (89-260)||(4586161-4586332)
chr7 (89-260)||(36146405-36146576)
chr7 (89-260)||(47676133-47676304)
chr7 (86-260)||(26417316-26417489)
chr7 (89-343)||(38671219-38671480)
chr7 (91-260)||(43864244-43864413)
chr7 (89-257)||(495980-496148)
chr7 (100-241)||(23565069-23565210)
chr7 (93-257)||(31105394-31105558)
chr7 (89-257)||(1113660-1113828)
chr7 (90-235)||(2759195-2759339)
chr7 (93-206)||(4510549-4510661)
chr7 (93-206)||(4512391-4512503)
chr7 (98-255)||(22328395-22328556)
chr7 (86-206)||(6359946-6360065)
chr7 (103-260)||(23343975-23344130)
chr7 (93-195)||(18396384-18396486)
chr7 (89-175)||(24525499-24525584)
chr7 (89-260)||(12097864-12098027)
chr7 (91-167)||(30814530-30814605)
chr7 (100-175)||(31518988-31519063)
chr7 (189-260)||(24525992-24526065)
chr7 (93-260)||(36574517-36574683)
chr7 (258-343)||(24514934-24515018)
chr7 (93-170)||(5513668-5513743)
chr7 (151-260)||(31518795-31518905)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (1-358)||(22536199-22536553)
chr5 (1-358)||(29751068-29751426)
chr5 (1-358)||(29720266-29720623)
chr5 (1-358)||(29722426-29722783)
chr5 (1-346)||(10593172-10593519)
chr5 (1-350)||(25078030-25078382)
chr5 (1-350)||(25135999-25136351)
chr5 (1-350)||(40380002-40380352)
chr5 (1-350)||(40382213-40382563)
chr5 (55-350)||(16546541-16546837)
chr5 (55-350)||(16544319-16544615)
chr5 (1-358)||(16409377-16409736)
chr5 (1-358)||(9789132-9789490)
chr5 (1-358)||(26177785-26178143)
chr5 (1-358)||(18441552-18441914)
chr5 (1-358)||(26170676-26171023)
chr5 (89-343)||(25412672-25412932)
chr5 (1-343)||(30182499-30182845)
chr5 (89-343)||(13342971-13343232)
chr5 (89-343)||(36074039-36074302)
chr5 (91-330)||(13239674-13239921)
chr5 (89-241)||(37439161-37439313)
chr5 (93-260)||(213465-213633)
chr5 (1-260)||(32636824-32637081)
chr5 (93-260)||(40147261-40147428)
chr5 (91-260)||(28278316-28278485)
chr5 (89-260)||(42428427-42428598)
chr5 (89-260)||(13488203-13488374)
chr5 (93-260)||(5058047-5058212)
chr5 (89-260)||(533769-533940)
chr5 (93-330)||(16452003-16452247)
chr5 (100-343)||(30682930-30683178)
chr5 (72-343)||(33831590-33831866)
chr5 (89-257)||(8565943-8566111)
chr5 (89-257)||(39468546-39468714)
chr5 (116-260)||(13695713-13695859)
chr5 (95-260)||(27637615-27637781)
chr5 (89-260)||(28750652-28750823)
chr5 (93-343)||(31182883-31183138)
chr5 (89-260)||(42426232-42426403)
chr5 (89-257)||(538028-538196)
chr5 (93-246)||(16640941-16641091)
chr5 (89-170)||(19806454-19806534)
chr5 (104-257)||(9049354-9049506)
chr5 (93-260)||(27015531-27015690)
chr5 (89-256)||(38747009-38747176)
chr5 (91-254)||(316769-316933)
chr5 (93-257)||(3075659-3075823)
chr5 (91-206)||(33906028-33906144)
chr5 (89-206)||(42309932-42310048)
chr5 (98-158)||(4160702-4160762)
chr5 (144-206)||(10054867-10054929)
chr5 (92-137)||(38882340-38882384)
chr5 (93-137)||(18596881-18596924)
[»] chr1 (74 HSPs)
chr1 (1-346)||(9036331-9036677)
chr1 (1-358)||(40282279-40282636)
chr1 (1-358)||(21053860-21054217)
chr1 (1-350)||(44203543-44203893)
chr1 (1-358)||(9987104-9987461)
chr1 (1-346)||(20622146-20622492)
chr1 (1-358)||(51765290-51765656)
chr1 (89-261)||(13316348-13316521)
chr1 (1-257)||(8550695-8550952)
chr1 (89-343)||(20762582-20762844)
chr1 (89-260)||(3189330-3189502)
chr1 (89-260)||(3198147-3198319)
chr1 (89-260)||(3206986-3207158)
chr1 (93-260)||(37168297-37168465)
chr1 (93-260)||(13547090-13547257)
chr1 (86-260)||(42297968-42298143)
chr1 (93-260)||(13549001-13549168)
chr1 (89-260)||(28220223-28220394)
chr1 (89-260)||(28265551-28265722)
chr1 (93-260)||(29136247-29136415)
chr1 (93-260)||(47255340-47255508)
chr1 (89-257)||(834164-834332)
chr1 (89-343)||(3156776-3157036)
chr1 (93-260)||(11348698-11348865)
chr1 (89-260)||(44455160-44455331)
chr1 (93-260)||(7482231-7482399)
chr1 (89-260)||(37033068-37033241)
chr1 (89-260)||(4552634-4552805)
chr1 (93-260)||(31925708-31925875)
chr1 (89-260)||(49918350-49918521)
chr1 (93-260)||(47115171-47115340)
chr1 (89-260)||(28223418-28223589)
chr1 (89-260)||(37503554-37503722)
chr1 (89-260)||(45644351-45644523)
chr1 (93-260)||(193611-193778)
chr1 (91-260)||(19754494-19754664)
chr1 (89-260)||(31659238-31659409)
chr1 (89-260)||(50169207-50169378)
chr1 (97-260)||(34603576-34603740)
chr1 (113-260)||(23555286-23555433)
chr1 (89-260)||(50167172-50167343)
chr1 (89-260)||(37559864-37560037)
chr1 (116-260)||(1833522-1833667)
chr1 (89-257)||(3847118-3847286)
chr1 (89-257)||(13659333-13659501)
chr1 (89-257)||(46064921-46065089)
chr1 (93-175)||(28242391-28242472)
chr1 (89-343)||(196904-197166)
chr1 (86-260)||(41360914-41361088)
chr1 (89-260)||(19752685-19752857)
chr1 (117-255)||(22079322-22079461)
chr1 (113-242)||(15820326-15820455)
chr1 (89-206)||(13137973-13138089)
chr1 (89-260)||(30476443-30476614)
chr1 (93-175)||(37876767-37876848)
chr1 (89-257)||(40122193-40122363)
chr1 (93-239)||(927977-928123)
chr1 (113-175)||(36683766-36683828)
chr1 (132-206)||(16455676-16455750)
chr1 (121-206)||(5459961-5460046)
chr1 (156-255)||(12318585-12318685)
chr1 (119-206)||(6808507-6808595)
chr1 (89-206)||(10925278-10925397)
chr1 (187-260)||(37879005-37879079)
chr1 (188-257)||(8871143-8871213)
chr1 (102-246)||(37282701-37282846)
chr1 (143-246)||(3460710-3460815)
chr1 (104-161)||(8871074-8871130)
chr1 (92-137)||(15916626-15916671)
chr1 (92-137)||(31422862-31422906)
chr1 (174-238)||(48382441-48382505)
chr1 (81-157)||(2926613-2926688)
chr1 (179-242)||(32736952-32737015)
chr1 (179-242)||(35109493-35109556)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-346)||(16554783-16555131)
chr6 (1-346)||(16631339-16631687)
chr6 (1-346)||(16653026-16653374)
chr6 (1-346)||(16578424-16578772)
chr6 (1-346)||(16616608-16616956)
chr6 (1-358)||(27647765-27648113)
chr6 (1-350)||(25421215-25421567)
chr6 (1-350)||(6027158-6027507)
chr6 (1-350)||(34166990-34167341)
chr6 (1-350)||(34164768-34165120)
chr6 (1-358)||(412004-412362)
chr6 (55-350)||(33342067-33342363)
chr6 (3-358)||(3072670-3073026)
chr6 (1-280)||(13153893-13154176)
chr6 (5-358)||(6097362-6097707)
chr6 (1-358)||(2171438-2171804)
chr6 (89-343)||(31404671-31404932)
chr6 (1-343)||(5406111-5406456)
chr6 (1-343)||(5410436-5410781)
chr6 (89-339)||(16452325-16452583)
chr6 (89-343)||(30834532-30834794)
chr6 (1-343)||(5413306-5413650)
chr6 (93-260)||(21588931-21589098)
chr6 (93-260)||(21593664-21593831)
chr6 (89-260)||(33160348-33160521)
chr6 (86-260)||(3808701-3808877)
chr6 (93-257)||(17758026-17758191)
chr6 (93-260)||(2972940-2973107)
chr6 (89-260)||(9183028-9183199)
chr6 (93-260)||(17762990-17763158)
chr6 (89-343)||(16568953-16569193)
chr6 (1-189)||(5408981-5409164)
chr6 (93-258)||(26830124-26830289)
chr6 (93-260)||(28137409-28137576)
chr6 (93-257)||(5043630-5043795)
chr6 (93-260)||(22424826-22424995)
chr6 (89-257)||(26954283-26954450)
chr6 (89-260)||(33211182-33211353)
chr6 (86-206)||(603082-603201)
chr6 (116-260)||(3038926-3039071)
chr6 (93-206)||(26800642-26800755)
chr6 (143-260)||(4045423-4045542)
chr6 (93-137)||(19643894-19643938)
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (1-358)||(6266593-6266951)
chr2 (1-350)||(12647293-12647643)
chr2 (1-280)||(13655936-13656220)
chr2 (1-358)||(32289467-32289825)
chr2 (1-358)||(4484239-4484604)
chr2 (1-358)||(30833240-30833605)
chr2 (1-343)||(4503044-4503390)
chr2 (89-343)||(45099665-45099926)
chr2 (89-343)||(5723252-5723512)
chr2 (89-343)||(36205661-36205921)
chr2 (89-328)||(2334414-2334661)
chr2 (89-343)||(36988072-36988333)
chr2 (89-260)||(6595002-6595175)
chr2 (93-260)||(45726929-45727096)
chr2 (89-260)||(29867869-29868040)
chr2 (89-257)||(34139767-34139936)
chr2 (89-242)||(723741-723893)
chr2 (89-257)||(14633822-14633991)
chr2 (93-260)||(35446885-35447052)
chr2 (89-260)||(36773562-36773733)
chr2 (89-260)||(38312240-38312411)
chr2 (89-260)||(11151588-11151759)
chr2 (95-260)||(1631735-1631900)
chr2 (93-255)||(33648176-33648340)
chr2 (113-343)||(42362262-42362500)
chr2 (89-260)||(17057366-17057537)
chr2 (89-260)||(17085349-17085520)
chr2 (91-260)||(24398055-24398228)
chr2 (89-260)||(36318006-36318177)
chr2 (89-257)||(11690504-11690672)
chr2 (93-260)||(26353184-26353351)
chr2 (93-206)||(17490149-17490261)
chr2 (89-260)||(33162447-33162618)
chr2 (89-260)||(11067305-11067476)
chr2 (127-260)||(13121769-13121901)
chr2 (98-260)||(42288117-42288278)
chr2 (89-167)||(39284930-39285007)
chr2 (143-260)||(7815323-7815441)
chr2 (89-168)||(17450671-17450748)
chr2 (93-206)||(7451173-7451284)
chr2 (104-202)||(28671989-28672088)
chr2 (93-260)||(11049550-11049721)
chr2 (92-251)||(24197906-24198065)
chr2 (92-137)||(42064725-42064770)
chr2 (116-161)||(42412118-42412162)
chr2 (131-175)||(14202450-14202494)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-350)||(8395515-8395865)
chr4 (1-350)||(8393306-8393656)
chr4 (1-350)||(7124811-7125163)
chr4 (1-350)||(7122592-7122944)
chr4 (2-350)||(5138200-5138552)
chr4 (2-350)||(5135974-5136327)
chr4 (1-358)||(31495216-31495583)
chr4 (89-343)||(13992289-13992544)
chr4 (93-343)||(29999806-30000063)
chr4 (89-330)||(56178633-56178882)
chr4 (91-260)||(52095361-52095530)
chr4 (89-260)||(48143042-48143215)
chr4 (86-256)||(2209717-2209889)
chr4 (89-241)||(5370079-5370232)
chr4 (96-260)||(41964415-41964580)
chr4 (89-260)||(9927455-9927626)
chr4 (89-260)||(12739547-12739718)
chr4 (89-260)||(36463386-36463557)
chr4 (86-260)||(26364236-26364410)
chr4 (89-258)||(46147388-46147557)
chr4 (93-260)||(46703500-46703669)
chr4 (89-260)||(47038408-47038577)
chr4 (93-260)||(12073392-12073560)
chr4 (89-241)||(12743922-12744073)
chr4 (89-241)||(12745311-12745462)
chr4 (89-260)||(26175633-26175804)
chr4 (93-260)||(40632445-40632612)
chr4 (93-260)||(41639426-41639593)
chr4 (89-260)||(48893635-48893810)
chr4 (86-260)||(54883020-54883194)
chr4 (91-260)||(36994524-36994693)
chr4 (93-257)||(379383-379548)
chr4 (93-242)||(6655975-6656123)
chr4 (93-260)||(8648139-8648306)
chr4 (113-260)||(8665408-8665556)
chr4 (89-260)||(34570411-34570582)
chr4 (89-260)||(45687179-45687351)
chr4 (93-206)||(50673848-50673960)
chr4 (91-343)||(37740536-37740794)
chr4 (93-260)||(6542180-6542349)
chr4 (89-260)||(5429679-5429850)
chr4 (89-260)||(5871820-5871991)
chr4 (89-260)||(27416962-27417133)
chr4 (93-260)||(37229722-37229890)
chr4 (86-206)||(50262694-50262814)
chr4 (91-260)||(54199906-54200074)
chr4 (86-258)||(12119540-12119714)
chr4 (89-257)||(52467351-52467519)
chr4 (93-260)||(4587958-4588126)
chr4 (93-253)||(5207843-5208003)
chr4 (89-260)||(52082660-52082825)
chr4 (93-260)||(31474150-31474318)
chr4 (101-206)||(35662496-35662600)
chr4 (131-260)||(12747794-12747924)
chr4 (133-241)||(12744087-12744195)
chr4 (133-260)||(12745476-12745604)
chr4 (98-245)||(26699447-26699596)
chr4 (89-175)||(29254580-29254665)
chr4 (89-186)||(13009441-13009536)
chr4 (117-206)||(33989899-33989989)
chr4 (93-260)||(51337064-51337231)
chr4 (143-260)||(24969112-24969230)
chr4 (93-255)||(44967829-44967992)
chr4 (89-175)||(3913534-3913618)
chr4 (119-206)||(33089933-33090021)
chr4 (93-255)||(21703836-21703999)
chr4 (188-256)||(48142473-48142542)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (1-350)||(2511-2861)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (1-350)||(3633-3983)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (1-346)||(6188-6536)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-358)||(11070-11435)
scaffold0491 (1-262)||(8644-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-343)||(434443-434791)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (89-343)||(827-1087)
[»] scaffold0286 (2 HSPs)
scaffold0286 (37-260)||(11557-11779)
scaffold0286 (310-358)||(22239-22286)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (89-260)||(114602-114774)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (1-125)||(1-126)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (93-260)||(18004-18171)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (91-260)||(20414-20583)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (93-260)||(7327-7494)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (93-204)||(10546-10656)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (89-257)||(149094-149262)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (104-206)||(27453-27556)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (148-256)||(80338-80447)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 54635384 - 54635027
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635384 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 54635285  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635284 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 54635185  T
Q  201 tagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635184 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 54635085  T
Q  301 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  54635084 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 54635027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6716760 - 6716402
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaac-acaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716760 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 6716661  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716660 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 6716561  T
Q  200 ttagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716560 ttagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 6716461  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6716460 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttactccctttg 6716402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45283247 - 45282885
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45283247 cctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttca 45283149  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaa---gggatacaaaaggttaca 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  45283148 ctcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttaca 45283049  T
Q  195 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45283048 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgtttc 45282949  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45282948 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 45282885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3617711 - 3617359
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  3617711 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 3617613  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3617612 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 3617513  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617512 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 3617413  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617412 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 3617359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 25637691 - 25637342
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca--caatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25637691 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattggt 25637592  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25637591 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttaca 25637492  T
Q  195 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25637491 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 25637394  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637393 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 25637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 4600651 - 4601009
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |  | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  4600651 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaatca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtc 4600748  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4600749 acccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaa 4600848  T
Q  196 gaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4600849 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttc 4600946  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4600947 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 4601009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 4598430 - 4598788
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |  | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  4598430 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtc 4598527  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  4598528 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 4598627  T
Q  196 gaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  4598628 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacagggtgtttc 4598725  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4598726 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 4598788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10211656 - 10211298
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |  | ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  10211656 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac-aaagagattggtc 10211559  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  10211558 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 10211459  T
Q  196 gaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10211458 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10211361  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10211360 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 10211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10056481 - 10056129
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10056481 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 10056384  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10056383 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 10056284  T
Q  195 agaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10056283 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 10056186  T
Q  294 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10056185 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 10056129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10058703 - 10058351
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10058703 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 10058606  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10058605 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 10058506  T
Q  195 agaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10058505 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 10058408  T
Q  294 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10058407 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 10058351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10060925 - 10060573
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10060925 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 10060828  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10060827 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 10060728  T
Q  195 agaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10060727 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 10060630  T
Q  294 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10060629 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 10060573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10063147 - 10062795
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10063147 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 10063050  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10063049 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 10062950  T
Q  195 agaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10062949 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 10062852  T
Q  294 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10062851 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 10062795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10065369 - 10065017
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10065369 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 10065272  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10065271 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 10065172  T
Q  195 agaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10065171 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 10065074  T
Q  294 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10065073 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 10065017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10209436 - 10209078
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |  | ||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  10209436 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagca-acaatcacaagataaacaaggagagggaagatgaaaacaataaacac-aaagagattggtc 10209339  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  10209338 acccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggactacaagaggttacaa 10209239  T
Q  196 gaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10209238 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 10209141  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10209140 ccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 10209078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 801346 - 800993
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  801346 cctagatctaatctaggaaacaagtg-gaaaaacacaata----cacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacacc-aagagattgttcacc 801253  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  801252 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaa 801153  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  801152 attagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 801054  T
Q  298 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||    
T  801053 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttcttcctttg 800993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 7779912 - 7780208
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaa-cacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  7779912 cctagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcac 7780010  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7780011 ccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaaa 7780110  T
Q  200 ttag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780111 ttagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 23200047 - 23200410
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  23200047 cctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcataagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 23200144  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  23200145 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaa 23200243  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtg 290  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| || ||   |||||||    
T  23200244 attagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtg 23200342  T
Q  291 tttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  23200343 tttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 23200410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 358
Target Start/End: Original strand, 23197850 - 23198211
Alignment:
Q  3 tagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  23197850 tagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcaccc 23197947  T
Q  102 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23197948 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaat 23198046  T
Q  201 tagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 292  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| || ||   |||||||||    
T  23198047 tagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtt 23198145  T
Q  293 tcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    | | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  23198146 tacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 23198211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 169 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10067419 - 10067239
Alignment:
Q  169 ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactc 267  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10067419 ttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactc 10067320  T
Q  268 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10067319 aatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 10067239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 226 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718586
Alignment:
Q  226 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  326 aaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagagttactccctttg 6718586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45095335 - 45095075
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  45095335 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 45095237  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  45095236 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 45095138  T
Q  280 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095137 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 9636035 - 9636400
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | | ||||| ||||||||| ||||| || | |||   |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  9636035 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaatcacaagcacaagataaaaggg-agagcagagagaaacaaacacaccaa-gagattgttcac 9636132  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  9636133 ccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaagggttacaagaa 9636231  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctctttacaagg 288  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  9636232 attagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttcactcaccaagg 9636330  T
Q  289 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  9636331 tgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttcttcctttg 9636400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 358
Target Start/End: Original strand, 5258140 - 5258417
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  5258140 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaag 5258238  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  5258239 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 5258337  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  5258338 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaaccctaaagtttctccctttg 5258417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 5260319 - 5260581
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  5260319 agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaag 5260417  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||    
T  5260418 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaagacactcaatgattttc 5260516  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260517 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 19683885 - 19684054
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  19683885 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 19683983  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19683984 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 7762339  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7762338 agttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37408630 - 37408458
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  37408630 agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 37408532  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37408531 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581193
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 9581356  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 279  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| || |    
T  9581355 ggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttcac 9581257  T
Q  280 t-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581256 tcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7764636 - 7764476
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  7764636 agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 7764538  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttccc 249  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7764537 agttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34491383 - 34491212
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  34491383 agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 34491286  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34491285 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 49199462 - 49199638
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49199462 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 49199560  T
Q  186 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49199561 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4570120 - 4569952
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  4570120 tgttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4570022  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4570021 acaagaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 29196383 - 29196555
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  29196383 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 29196480  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196481 ggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagggatacaaatg 39153455  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39153456 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 43401794 - 43401970
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  43401794 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaa 43401892  T
Q  186 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43401893 aatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 40734572  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40734571 tgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |    
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatg 44331619  T
Q  189 g-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44331618 gcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236129
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 30236202  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 256  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30236201 ataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 43403737 - 43403913
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||    
T  43403737 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaa 43403835  T
Q  186 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |   |||||||||||| |||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43403836 catgagttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaac-aagcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43403913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 6095600 - 6095767
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  6095600 tgttcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 6095697  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| || | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6095698 acaagaaattaacttcaagaagtttacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 6095767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaata 44700572  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44700573 ggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 761018 - 760757
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  761018 agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 760921  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  760920 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttca 760822  T
Q  279 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||  | ||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  760821 ctcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 760757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 257
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaa 22835107  T
Q  199 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22835108 attagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31314616 - 31314447
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      
T  31314616 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa-agatacaaatg 31314519  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 258  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  31314518 ggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40735554 - 40735293
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  40735554 agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaact 40735457  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  40735456 ggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 40735358  T
Q  279 c-tttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    | ||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  40735357 cttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaacccta 40735293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 41819523 - 41819691
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  41819523 tgttcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 41819620  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41819621 tacaagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51398985 - 51398818
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  51398985 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 51398888  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 256  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51398887 agttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 51398818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54593871 - 54593704
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  54593871 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 54593774  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  54593773 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctgcacattttcccaatctcaccaa 54593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682269
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 29682433  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  29682432 ggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttca 29682334  T
Q  279 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682333 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 32744433 - 32744684
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  32744433 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 32744530  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttaca 285  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||   ||    
T  32744531 agttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactcaatgattttcactcacca 32744627  T
Q  286 aggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    | |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32744628 atgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 32744684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 5236454 - 5236624
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  5236454 agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 5236550  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5236551 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46860642 - 46860474
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||||    
T  46860642 tgttcatccaattcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgggtt 46860544  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46860543 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 260
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaagaa 53921608  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||| || ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  53921609 attagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813063
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| ||||      
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatgcaaatg 29813137  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29813136 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctatttttccaatctcaccaa 29813063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaa 32891167  T
Q  199 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 258  Q
    ||||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32891166 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40913467 - 40913352
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  40913467 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaagagatacaa 40913370  T
Q  186 aag-gttacaagaaatta 202  Q
    | | ||||||||||||||    
T  40913369 atgagttacaagaaatta 40913352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10067568 - 10067435
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  10067568 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 10067471  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067470 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16499200 - 16499115
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16499200 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 16499115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810868
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 29810918  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  29810917 agttcacaaagaac-aactctaatttctacatattttcctaatctcaccaa 29810868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173377
Alignment:
Q  102 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaat 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  46173515 agttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaat 46173418  T
Q  201 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 241  Q
    ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173417 tagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Original strand, 55301972 - 55302079
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  55301972 tgttcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttac-aaagagatacaaataggtt 55302070  T
Q  192 acaagaaat 200  Q
    |||||||||    
T  55302071 acaagaaat 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 9666463 - 9666632
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||| |    
T  9666463 agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagagg-tataaatg 9666560  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9666561 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctacccatttttccaatctcac 9666632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 23391906 - 23392077
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||      
T  23391906 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgatacaaatg 23392003  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23392004 ggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctactcattttcccaaactcaccaa 23392077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47304420 - 47304340
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 172  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47304420 attgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac 47304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 260
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352278
Alignment:
Q  132 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccc 230  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||| ||||||||||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaa-gaaatacaaatggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  231 taatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  51352249 taacttctatcattttcctaatctcaccaa 51352278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 160
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 260
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  188 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018852
Alignment:
Q  126 ctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatga 222  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| |||  ||||| |||| | ||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaaga 36018890  T
Q  223 acaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36018889 ac-aaccctaatttcaacccattttcccaatttcaccaa 36018852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Original strand, 4055813 - 4055926
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagagtt-cttacaaaagggatacaaaag--gttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttct 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| | | ||||||  ||||||||||    
T  4055813 ctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaa-gagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttct 4055909  T
Q  239 acccttttcccaatctc 255  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4055910 acccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 255
Target Start/End: Original strand, 4075520 - 4075636
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagag-ttcttacaaaagggatacaaa--aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaac-cctaatttc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||  |   |||||||    
T  4075520 ctctccaatccactatcaaagagtttcttac-aaagtgatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctctaagaacagcctaataatttc 4075618  T
Q  238 tacccttttcccaatctc 255  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  4075619 tacccatttcccaatctc 4075636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 23410326 - 23410411
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23410326 agattgttgacccaattcgttccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatccattatctaagagttcttacaaa 23410411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Original strand, 2075076 - 2075143
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 161  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075076 tgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 248
Target Start/End: Original strand, 28253363 - 28253423
Alignment:
Q  189 gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcc 248  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28253363 gttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacgaaccctaatttctaccattttcc 28253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25690215 - 25689857
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  25690215 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacactcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgttcac 25690116  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690115 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 25690016  T
Q  200 ttagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690015 ttagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 25689916  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689915 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 25689857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3439763 - 3439406
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3439763 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcatc 3439664  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439663 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 3439564  T
Q  201 tagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 300  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3439563 tagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcccatgt 3439464  T
Q  301 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3439463 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 3439406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15290785 - 15290427
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||    
T  15290785 cctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggaca 15290687  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15290686 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 15290587  T
Q  197 aaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15290586 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 15290489  T
Q  296 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15290488 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 15290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15471154 - 15470796
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||    
T  15471154 cctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggaca 15471056  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15471055 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 15470956  T
Q  197 aaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15470955 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 15470858  T
Q  296 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15470857 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 15470796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 42575232 - 42575589
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  42575232 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaac-caaacacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtca 42575329  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42575330 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 42575429  T
Q  197 aaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42575430 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 42575527  T
Q  296 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42575528 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt-tccctttg 42575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2627995 - 2627637
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  2627995 cctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattattcacc 2627897  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||   ||| ||||||    
T  2627896 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaagaa 2627797  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  2627796 attagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 2627698  T
Q  298 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  2627697 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 2627637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31218514 - 31218167
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| || ||||||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||    
T  31218514 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacataagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcac 31218419  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  31218418 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaagggttacaagaa 31218320  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaagg 288  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  31218319 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 31218221  T
Q  289 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218220 tgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 34254242 - 34254586
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaa--cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| || |||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  34254242 cctagatctaatctaggaatcaaa-gagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 34254336  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  34254337 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 34254435  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    ||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  34254436 aattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 34254534  T
Q  290 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254535 gtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17982825 - 17982563
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  17982825 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaag 17982727  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  17982726 ggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 17982628  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982627 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 34256418 - 34256762
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaa--cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| || |||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  34256418 cctagatctaatctaggaatcaaa-gagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 34256512  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  34256513 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 34256611  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    ||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || |    ||||||    
T  34256612 aattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcacacaccaaggt 34256710  T
Q  290 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256711 gtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44304027 - 44303764
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  44304027 agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaag 44303929  T
Q  189 g-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 276  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  44303928 gattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 44303830  T
Q  277 ctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    | ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303829 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42498452 - 42498193
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaac-acaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||| |||  |||| | |||||||  |||||||||  |||||||    
T  42498452 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagggaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 42498357  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  42498356 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaaagggttacaaga 42498258  T
Q  198 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42498257 aattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 19945355 - 19945618
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  19945355 agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaag 19945453  T
Q  188 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 276  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  19945454 tggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 19945552  T
Q  277 ctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    | ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19945553 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagaga-actctaatcaaag-actctaaacccta 19945618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 1746216 - 1746371
Alignment:
Q  90 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-g 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| |    
T  1746216 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagg 1746313  T
Q  189 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  1746314 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttt 1746371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15212957 - 15212786
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  15212957 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 15212860  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15212859 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 42434992 - 42435159
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  42434992 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 42435089  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42435090 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4283691 - 4283524
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4283691 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4283594  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283593 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 33352224  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33352223 ggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43036594 - 43036423
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  43036594 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 43036497  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
      |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43036496 aattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaa 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||      
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagtttttac-aaagagatactaatg 40321154  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 258  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40321153 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18655567 - 18655400
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  18655567 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 18655470  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18655469 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||      
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatg 27811352  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27811351 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 246
Target Start/End: Original strand, 12702631 - 12702787
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||     
T  12702631 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagacacaaaag 12702728  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 246  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12702729 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt 12702787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 3303667 - 3303838
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  3303667 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 3303764  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3303765 agttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40221916 - 40221745
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  40221916 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatg 40221819  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40221818 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 197  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaaga 18141884  T
Q  198 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18141883 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6598975
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6599046  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6599045 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6598975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674428
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-gtatacaaatg 6674499  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6674498 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaa-cttaatttctacccattttcccaatctcac 6674428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291606
Alignment:
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttac-aaagtgatacaaatgagttacaagaa 30291670  T
Q  199 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30291669 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  119 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctc 40328824  T
Q  216 actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40328823 acaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4731829 - 4731658
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  4731829 agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 4731732  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4731731 ggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689326
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 5689345  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5689344 ggttacaagaaattagctt 5689326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 185
Target Start/End: Original strand, 4743211 - 4743306
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  4743211 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaatgggttacaa 4743306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143346
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 30143390  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatct 254  Q
    || |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30143389 agctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765745
Alignment:
Q  90 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgta-ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatat-gacctaatctgggggagaga--gcagctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9765819  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9765818 ggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Original strand, 10930193 - 10930365
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||    
T  10930193 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatataa 10930290  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcacc 258  Q
    |  |||||||||||||||||||  || || |||| | || | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10930291 atgggttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagagc-aaccctaatttctatccattttcccaatctcacc 10930365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11384152 - 11383989
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  11384152 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttac-aaagagatacaaatgagtt 11384055  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 256  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11384054 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctca 11383989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 8965692 - 8965859
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||    
T  8965692 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaatgagttcttacaaa-gagatataaaagggtt 8965789  T
Q  192 acaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | ||||||||| ||| | |||  |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8965790 ataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 260
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaaga 1292567  T
Q  198 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1292568 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 1345368 - 1345536
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaa 187  Q
    |||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| |      
T  1345368 agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacatatg 1345465  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  | ||  |||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1345466 ggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttcccaatctcac 1345536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 41366612 - 41366727
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |    
T  41366612 agattgttgtcccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagggatacaaata 41366708  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt 206  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  41366709 ggttaaaagaaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 19491693 - 19491867
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  19491693 aagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 19491790  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19491791 atgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 19491867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  131 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaac 228  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aac 44353826  T
Q  229 cctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353825 cctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4162663 - 4162516
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  4162663 tgtttacccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 4162567  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162566 acaagaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4733873 - 4733792
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4733873 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10015241 - 10015136
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||    
T  10015241 acccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaatgagttcct--aaaagagatacaaatgagttacaag 10015146  T
Q  197 aaattagctt 206  Q
    ||||||||||    
T  10015145 aaattagctt 10015136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 206
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106191
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaaa--gatacaaatgagttacaag 18106181  T
Q  197 aaattagctt 206  Q
    ||||||||||    
T  18106182 aaattagctt 18106191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 3073875 - 3073981
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaaggtt 191  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||| |||| |||    
T  3073875 tgtttacccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgtt 3073971  T
Q  192 acaagaaatt 201  Q
    ||||||||||    
T  3073972 acaagaaatt 3073981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597669
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaa 198  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||   |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaa 7597677  T
Q  199 attagctt 206  Q
    ||||||||    
T  7597676 attagctt 7597669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  104 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772247
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||    
T  3772352 ccagtttggtccaa-cttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttac-aaagatatacaaatgagttacaagaa 3772255  T
Q  199 attagctt 206  Q
    ||||||||    
T  3772254 attagctt 3772247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 29796320 - 29796485
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt--acaaaagggatacaaaag-g 189  Q
    |||| ||| ||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || ||||| ||  |||||  || |||||||  |    
T  29796320 tgtttaccaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtttttttacaaatagg-tacaaaaatg 29796418  T
Q  190 ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  29796419 ttacaagaaatcagcttcaacaagttctccaagaacaaaccttgatttctactcttttcccaatctc 29796485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902287
Alignment:
Q  117 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| || |||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagctt 32902287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41267051 - 41266982
Alignment:
Q  180 atacaaaag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttc 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41267051 atacaaaagagttacaagaaattagtctcaacaagttctctaagaacaaaacctaatttctaccattttc 41266982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1822365 - 1822297
Alignment:
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1822365 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1822297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1856810 - 1856742
Alignment:
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  1856810 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccataatttctatcctttttgcaatctc 1856742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10929906 - 10929874
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10929906 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 10929874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 20344156 - 20343799
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344156 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 20344057  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20344056 cagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 20343958  T
Q  200 ttagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343957 ttagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 20343858  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20343857 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 20343799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 18392103 - 18392453
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  18392103 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 18392201  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18392202 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 18392301  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18392302 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 18392399  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392400 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 18392453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 18388667 - 18389017
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  18388667 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaagagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 18388765  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18388766 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 18388865  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18388866 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 18388963  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388964 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 18389017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 32060229 - 32060582
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  32060229 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 32060327  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaa--gggatacaaaaggttaca 194  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  32060328 ccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatacaagaggttaca 32060427  T
Q  195 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060428 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 32060527  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060528 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctt 32060582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 6594465 - 6594815
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6594465 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 6594563  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6594564 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 6594663  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6594664 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 6594761  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594762 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 6594815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 6592247 - 6592597
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||| | |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6592247 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 6592345  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6592346 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 6592445  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6592446 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 6592543  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592544 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 6592597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 39 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24790063 - 24789743
Alignment:
Q  39 cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790063 cacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 24789965  T
Q  138 ttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaattt 236  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24789964 tagtactctccaatccactatcaaagagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaattt 24789865  T
Q  237 ctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 336  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789864 ttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaacccta 24789765  T
Q  337 aaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  24789764 aaccctagagttgctccctttg 24789743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 39731628 - 39731271
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  39731628 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 39731531  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39731530 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 39731431  T
Q  199 attagct-tgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    ||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | |    
T  39731430 attagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaa 39731332  T
Q  298 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  39731331 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttg 39731271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 358
Target Start/End: Original strand, 43504063 - 43504421
Alignment:
Q  2 ctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  43504063 ctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacc 43504161  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  43504162 cagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaa 43504261  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  43504262 attagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttccca 43504360  T
Q  298 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||  ||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  43504361 tgtttcccaagccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttg 43504421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562261
Alignment:
Q  190 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  290 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 1562261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35854173 - 35853825
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| ||||| || |||||   |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  35854173 cctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggg-agagaagagagaaacaaacacaccaa-gagattgttcac 35854076  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  35854075 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaa 35853977  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  35853976 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 35853878  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853877 gtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 358
Target Start/End: Original strand, 25766953 - 25767227
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  25766953 aagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaaagagatacaa 25767051  T
Q  186 aagg--ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttc-ccaatctcac----caagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||| ||    
T  25767052 aaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagacactcaatgattttc 25767150  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
     ||   |||||||||| | |||||| | |   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  25767151 actcaccaaggtgtttacaatgtttccca---aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttg 25767227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 1560572 - 1560757
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |     
T  1560572 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtt 1560670  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1560671 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29991225 - 29990965
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||     
T  29991225 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttatta-gaaagagatacaaaag 29991127  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  29991126 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 29991028  T
Q  280 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991027 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 86 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48408979 - 48408697
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  48408979 aagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaa 48408880  T
Q  186 aa--ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgatt 274  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||    
T  48408879 aaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatt 48408781  T
Q  275 ctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
     || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  48408780 ttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 48408697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 34310810  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34310811 tgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23555212 - 23555039
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||    
T  23555212 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaggtacaaaag 23555114  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  23555113 tgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25616025 - 25615785
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||      
T  25616025 agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaa-tgatacaaatg 25615927  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct-ttac 284  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||    |    
T  25615926 ggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacactcaatgattttctctcaccc 25615831  T
Q  285 aaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 330  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615830 aaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19502350 - 19502088
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  19502350 agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 19502252  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  19502251 agttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaagacactcaatgattctc 19502153  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19502152 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 19502088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4179030 - 4178685
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||| || || ||| ||  |||| |||||   |||||||  ||||||  |||||||||||    
T  4179030 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaccacaagcaaaatataaaa--ggagagaagagagaaacaaacacaccaa--agattgttcac 4178935  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| |||||||||||    
T  4178934 ctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagggttacaagaa 4178837  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    |||||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  4178836 attagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 4178738  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178737 gtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 14069830 - 14070001
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  14069830 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14069927  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14069928 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 14379858 - 14380029
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  14379858 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 14379955  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14379956 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22270140 - 22269973
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  22270140 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 22270043  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270042 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 41317431 - 41317602
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  41317431 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41317528  T
Q  189 g-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41317529 gattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 30024729 - 30024900
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  30024729 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 30024826  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30024827 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 8359316 - 8359485
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  8359316 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 8359414  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8359415 tacaagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27347988 - 27347817
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  27347988 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 27347891  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27347890 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29608902 - 29608737
Alignment:
Q  95 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttac 193  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  29608902 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  194 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaa 195  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 6432037  T
Q  196 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6432036 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 32358055 - 32358167
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  32358055 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 32358152  T
Q  192 acaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||    
T  32358153 acaagaaattagctt 32358167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 41649008 - 41649175
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  41649008 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 41649105  T
Q  188 ggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 257  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  41649106 ggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccaatttttccaatctcac 41649175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3259162 - 3258995
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  3259162 tgttcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaatgagtt 3259065  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3259064 acaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |    
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatg 8153416  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  8153415 agttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18126815 - 18126644
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  18126815 agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 18126718  T
Q  188 ggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  18126717 ggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 48491629  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48491628 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 48599335 - 48599502
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||||| | |||    
T  48599335 tgttcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagtt 48599432  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  48599433 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2390456 - 2390301
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||    
T  2390456 aagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattac-aaagagatacaa 2390359  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390358 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 4508707 - 4508874
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  4508707 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 4508804  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  4508805 acaagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733137
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 31733063  T
Q  188 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  31733064 ggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcagtctcaccaa 31733137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48489602 - 48489431
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| || | |||| ||||||||      
T  48489602 agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttattgc-aaagagatacaaatg 48489505  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48489504 ggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 260
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 196  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaag 2361075  T
Q  197 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2361076 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 4253529 - 4253697
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 191  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  4253529 tgtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggtt 4253627  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  4253628 acatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 101 - 330
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaa 47674049  T
Q  200 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggt 289  Q
    |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    ||||||    
T  47674050 ttagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggt 47674148  T
Q  290 gtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 330  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674149 gtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4586332 - 4586161
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  4586332 agattgtcgacccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagataaaaatg 4586235  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4586234 ggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36146405 - 36146576
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  36146405 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36146502  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146503 ggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 47676133 - 47676304
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||      
T  47676133 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatcattgagttcttac-aaagagatacaaatg 47676230  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47676231 ggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26417489 - 26417316
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  26417489 aagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 26417393  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26417392 atgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 38671219 - 38671480
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  38671219 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagtgatacaaatg 38671316  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  38671317 tgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcg 38671415  T
Q  279 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38671416 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 38671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43864413 - 43864244
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  43864413 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatcaattagtttttac-aaagagatacaaatggg 43864316  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  43864315 ttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 495980 - 496148
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||      
T  495980 agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatg 496077  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  496078 ggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 241
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaa 23565166  T
Q  199 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 241  Q
    ||||| ||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565167 attagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 257
Target Start/End: Original strand, 31105394 - 31105558
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  31105394 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggtt 31105491  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31105492 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaatctaatttctacccattttcccaatctcac 31105558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1113828 - 1113660
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  1113828 agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 1113731  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 257  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1113730 ggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttctcaatctcac 1113660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Original strand, 2759195 - 2759339
Alignment:
Q  90 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag- 188  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| |     
T  2759195 gattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatga 2759292  T
Q  189 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatt 235  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  2759293 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 4510549 - 4510661
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4510549 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4510646  T
Q  192 acaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||    
T  4510647 acaagaaattagctt 4510661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 4512391 - 4512503
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  4512391 tgttcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctta-taaagagatacaaatgggtt 4512488  T
Q  192 acaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||    
T  4512489 acaagaaattagctt 4512503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 255
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328556
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 196  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||| || || ||| |   |||| |||||||||| ||||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaag 22328494  T
Q  197 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctc 255  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22328495 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Original strand, 6359946 - 6360065
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  6359946 aagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 6360043  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt 206  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  6360044 atgggttacaagaaattagctt 6360065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23344130 - 23343975
Alignment:
Q  103 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaatt 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  23344130 gttcggtccaa-cttgacctactctgg--gagagattaatttctccaatctattatcaatgagttctcacaaa-gatatactaaagggttacaagaaatt 23344035  T
Q  202 agcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344034 agcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18396486 - 18396384
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 192  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||   |||| ||||||||| ||||    
T  18396486 tgtttacccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaaatgtta 18396387  T
Q  193 caa 195  Q
    |||    
T  18396386 caa 18396384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Original strand, 24525499 - 24525584
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24525499 agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 12097864 - 12098027
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||        || ||||||||      
T  12097864 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt--------agagatacaaatg 12097953  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12097954 ggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 12098027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30814605 - 30814530
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 167  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  30814605 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 30814530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518988
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 260
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  189 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 36574517 - 36574683
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 191  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||   |||| |||| |||||| ||    
T  36574517 tgtttacccagtttggtccaaa-ttgacctactctag-ggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagttctttacaaagagatataaaagggtt 36574614  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36574615 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaatcttaatttcta-cctttccccaatctctccaa 36574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515018
Alignment:
Q  258 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 24515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 170
Target Start/End: Original strand, 5513668 - 5513743
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt 170  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| || | |||| ||||||||    
T  5513668 tgtttacccagttcagtccaaa-ttgacctactctggaggtgagattg-attctccaattcagtgtcaatgagttctt 5513743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518795
Alignment:
Q  151 tccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgac-aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttc 247  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| |||||| |  ||| |||| | ||||||||| |||||||||||  |||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacc-taatttctacctattttc 31518808  T
Q  248 ccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||    
T  31518807 ccaatctcaccaa 31518795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 22536199 - 22536553
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22536199 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaacacaatcacaagataaaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacc 22536297  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536298 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 22536397  T
Q  201 tagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  22536398 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcccatgt 22536495  T
Q  301 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536496 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 22536553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 29751068 - 29751426
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29751068 cctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacacc-aagagattgttcac 29751166  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751167 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 29751266  T
Q  200 ttag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 298  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29751267 ttagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 29751366  T
Q  299 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29751367 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 29751426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29720623 - 29720266
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  29720623 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacc 29720525  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720524 cagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 29720425  T
Q  201 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29720424 tagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 29720325  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29720324 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 29720266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29722783 - 29722426
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  29722783 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacc 29722685  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722684 cagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 29722585  T
Q  201 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29722584 tagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 29722485  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29722484 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 29722426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 10593519 - 10593172
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  10593519 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagtagaaaacaaatacaccaa-gagattgttca 10593421  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593420 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 10593321  T
Q  198 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593320 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 10593221  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593220 tgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 10593172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25078382 - 25078030
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  25078382 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 25078284  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25078283 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 25078184  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078183 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 25078084  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078083 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25078030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25136351 - 25135999
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  25136351 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 25136253  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25136252 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 25136153  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136152 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 25136053  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136052 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25135999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40380352 - 40380002
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  40380352 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 40380254  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40380253 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 40380154  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40380153 aaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 40380056  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380055 atgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 40380002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40382563 - 40382213
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  40382563 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 40382465  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40382464 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 40382365  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40382364 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 40382267  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382266 atgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 40382213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16546837 - 16546541
Alignment:
Q  55 aaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatcc 153  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16546837 aaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatcc 16546739  T
Q  154 actatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttccca 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16546738 actatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccta 16546639  T
Q  251 atctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546638 atctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 16546541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16544615 - 16544319
Alignment:
Q  55 aaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatcc 153  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16544615 aaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatcc 16544517  T
Q  154 actatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttccca 250  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16544516 actatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccca 16544417  T
Q  251 atctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544416 atctcaccaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 16544319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 16409736 - 16409377
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16409736 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcac 16409637  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16409636 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 16409537  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||    
T  16409536 attagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacca 16409438  T
Q  298 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  16409437 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 16409377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 9789132 - 9789490
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9789132 cctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacc 9789231  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  9789232 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaa 9789331  T
Q  200 ttag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 298  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  9789332 ttagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttcccat 9789430  T
Q  299 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  9789431 gtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 9789490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26178143 - 26177785
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26178143 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcac 26178044  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26178043 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 26177944  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||    
T  26177943 attagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacca 26177846  T
Q  298 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  26177845 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 26177785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 18441552 - 18441914
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacaca----acacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||| | |||    |||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  18441552 cctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgtt 18441651  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18441652 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaa 18441751  T
Q  196 gaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    ||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||    
T  18441752 gaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttc 18441850  T
Q  295 ccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  18441851 ccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 18441914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 26171023 - 26170676
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26171023 cctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcac 26170924  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||    
T  26170923 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaa 26170834  T
Q  200 ttag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 298  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||    
T  26170833 ttagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccat 26170736  T
Q  299 gttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||  ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  26170735 gtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 26170676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25412932 - 25412672
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  25412932 agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 25412834  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  25412833 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 25412735  T
Q  280 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412734 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30182845 - 30182499
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||     
T  30182845 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcat 30182750  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||    
T  30182749 ccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatagaaaagggttacaagaa 30182651  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  30182650 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 30182552  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182551 gtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13342971
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaag 13343135  T
Q  189 g-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  13343134 gattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 13343036  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343035 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 36074039 - 36074302
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  36074039 agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaag 36074136  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattc 275  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||       |||||||||||||||||     
T  36074137 agttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattt 36074235  T
Q  276 tctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074236 tcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13239921 - 13239674
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-g 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |    
T  13239921 attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagag 13239823  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 280  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    
T  13239822 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcact 13239724  T
Q  281 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 330  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239723 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 37439313 - 37439161
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37439313 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 37439215  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 241  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439214 agttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 213633 - 213465
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  213633 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 213535  T
Q  192 acaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  213534 acaagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32637081 - 32636824
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaa-cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| |||| || || ||||| ||||||||| |  |||||||||||   |||||||  |||||||||  ||||| |    
T  32637081 cctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaa--gggagggaagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttga 32636986  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||    
T  32636985 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 32636888  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32636887 aattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40147428 - 40147261
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  40147428 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 40147331  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147330 acaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 28278485 - 28278316
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  28278485 attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatggg 28278388  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28278387 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42428524  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42428525 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13488374 - 13488203
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  13488374 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 13488277  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13488276 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5058212 - 5058047
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  || |    
T  5058212 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggat 5058115  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058114 acaagaaaatagcttcaacaagctcac--agaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 533940 - 533769
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  533940 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 533843  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  533842 ggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16452247 - 16452003
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  16452247 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 16452150  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctcttt 282  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||  | ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||       | ||||||||||||||||| || |||     
T  16452149 acaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaagacactcaatgattgtcactta 16452051  T
Q  283 acaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 330  Q
     |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452050 ccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 16452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 343
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683178
Alignment:
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagag--ttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaag 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaag 30683027  T
Q  197 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaag 287  Q
    ||||||||||  ||||||||||    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||    
T  30683028 aaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaag 30683123  T
Q  288 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683124 gtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831590
Alignment:
Q  72 aaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctta 171  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaaaga--ttgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttctta 33831770  T
Q  172 caaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caag 261  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||        |||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataag 33831672  T
Q  262 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831671 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 8565943 - 8566111
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||      
T  8565943 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-agagggatacaaatg 8566040  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  8566041 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctacccattttctcaatctcac 8566111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 39468643  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39468644 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 260
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  116 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagc 13695812  T
Q  214 tcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13695813 tcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 27637615 - 27637781
Alignment:
Q  95 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggtta 192  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||||    
T  27637615 ttcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  193 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 28750652 - 28750823
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||      
T  28750652 agattattgacccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 28750749  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||| ||||||| |||  |||| ||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28750750 ggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 28750823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31183138 - 31182883
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 192  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31183138 tgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatggtta 31183041  T
Q  193 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttac 284  Q
    |||||||||| |||  ||||  |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |    
T  31183040 caagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacc 31182942  T
Q  285 -aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182941 taaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 42426232 - 42426403
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  42426232 agattgttgacctagttcagtccaa-cttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 42426329  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42426330 ggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 538196 - 538028
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  538196 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 538099  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | || | |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  538098 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 246
Target Start/End: Original strand, 16640941 - 16641091
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  16640941 tgtttacccagttcggcccta-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttac-aaagagatacaaaagagtt 16641035  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 246  Q
    |  |||||| |||||  ||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16641036 atcagaaatcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctaccatttt 16641091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806454
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt 170  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaggagttctt 19806454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 104 - 257
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049506
Alignment:
Q  104 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 202  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatta 9049451  T
Q  203 gctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 257  Q
    ||||  ||||| |||| |  ||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  9049452 gcttcaacaagctcac-aaaaacaaacactaatttctatcattttcccaaactcac 9049506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27015690 - 27015531
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || |     
T  27015690 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggt- 27015594  T
Q  193 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
          ||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27015593 ------attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 27015531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38747176 - 38747009
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||||||||      
T  38747176 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtt-tttccaaagagatacaaatg 38747079  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 256  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38747078 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 38747009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 316933 - 316769
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 189  Q
    |||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  | |||| ||||| |||||| ||||||||   |||| |||||||||||     
T  316933 attgtttaccaagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 316834  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatct 254  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  316833 ttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaa-cctaatttctacctttttctcaatct 316769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 257
Target Start/End: Original strand, 3075659 - 3075823
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||    
T  3075659 tgttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacgaattcttacaaaa-agatacaaatgggtt 3075756  T
Q  192 acaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||| || | |||| |||| | ||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  3075757 acaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacctattttctcaatctcac 3075823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 206
Target Start/End: Original strand, 33906028 - 33906144
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg- 189  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| | | ||||||||  || ||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||     
T  33906028 attgtttacccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagga 33906127  T
Q  190 ttacaagaaattagctt 206  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33906128 ttacaagaagttagctt 33906144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 42309932 - 42310048
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  42309932 agattgtttatccaattcggtc-aaacttaatctactatgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaaag 42310029  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt 206  Q
     ||||||||||||||||||    
T  42310030 agttacaagaaattagctt 42310048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 158  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 206
Target Start/End: Original strand, 10054867 - 10054929
Alignment:
Q  144 tctccaatccactatcaaagagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 206  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10054867 tctccaatacactatcaatgagttcattacaaa-gagatacaaaaggttataagaaattagctt 10054929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38882384 - 38882340
Alignment:
Q  92 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38882384 ttgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 38882340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 18596924 - 18596881
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18596924 tgttgacccagttcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 18596881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 74)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 9036677 - 9036331
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  9036677 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgttca 9036579  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036578 cccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaa 9036479  T
Q  199 attagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036478 attagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 9036379  T
Q  299 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036378 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9036331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40282636 - 40282279
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  40282636 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacc 40282538  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282537 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 40282438  T
Q  201 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40282437 tagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatg 40282338  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40282337 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 40282279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 21054217 - 21053860
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  21054217 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacc 21054119  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21054118 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaagaaat 21054019  T
Q  201 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  21054018 tagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttcccatg 21053919  T
Q  300 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21053918 ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 21053860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44203893 - 44203543
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  44203893 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 44203795  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44203794 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 44203695  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44203694 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 44203597  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203596 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 44203543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9987461 - 9987104
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9987461 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa-gagattgttcac 9987363  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9987362 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgcaagaaa 9987263  T
Q  200 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 298  Q
    |||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9987262 ttagattagacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 9987164  T
Q  299 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9987163 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 9987104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 20622146 - 20622492
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  20622146 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaatacacaatcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaa-gagattgttcacc 20622244  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaa--gggatacaaaaggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20622245 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaa 20622344  T
Q  199 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  20622345 attagatttgacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttccca 20622443  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622444 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 51765656 - 51765290
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  51765656 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 51765559  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  51765558 ccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggggttacaaga 51765459  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaagg 288  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||      |||||||||||||||||  | ||   |||||    
T  51765458 aattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaagg 51765359  T
Q  289 tgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  51765358 tgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttg 51765290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 261
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316521
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaag 13316446  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaag 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13316447 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 8550695 - 8550952
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaa-cacaatcacaagatacaaggggagggaaga-agaaaacaaaagcaccaaagagattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||| ||||||||| |  | || | |||| ||||||||||  |||||||||  ||||||    
T  8550695 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaagagagaag-aagagagaaaacaaacacaccaaaga--ttgttc 8550791  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  8550792 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaag 8550890  T
Q  197 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8550891 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20762844 - 20762582
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||     
T  20762844 agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-gaagagatacaaaag 20762746  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||| ||||||||||| ||    
T  20762745 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaagatactcaatgattttc 20762647  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762646 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3189502 - 3189330
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3189502 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaag 3189404  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3189403 agttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3198319 - 3198147
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3198319 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaag 3198221  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3198220 agttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3207158 - 3206986
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3207158 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaaag 3207060  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  3207059 agttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37168465 - 37168297
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  37168465 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 37168368  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168367 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 13547090 - 13547257
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13547090 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13547187  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547188 acaagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 42297968 - 42298143
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  42297968 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 42298066  T
Q  186 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42298067 atgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 13549001 - 13549168
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13549001 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 13549098  T
Q  192 acaagaaatta-gcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||| ||||||| | || ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549099 acatgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 28220223 - 28220394
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  28220223 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28220320  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28220321 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 28265551 - 28265722
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  28265551 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 28265648  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  28265649 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcgccaa 28265722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29136415 - 29136247
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  29136415 tgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 29136317  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29136316 ccaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 47255340 - 47255508
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  47255340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 47255438  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  47255439 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 834164 - 834332
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  834164 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 834261  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  834262 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3157036 - 3156776
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  3157036 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 3156939  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  3156938 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 3156840  T
Q  279 ctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||   || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3156839 ctcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 3156776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11348865 - 11348698
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  11348865 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-gaaagagatacaaatgggtt 11348768  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11348767 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44455331 - 44455160
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |    
T  44455331 agatcgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaa-agatacaaatg 44455234  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44455233 agttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 7482231 - 7482399
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  7482231 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 7482328  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482329 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||     
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatgcaaaat 37033166  T
Q  188 -ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37033167 ggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 4552634 - 4552805
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  4552634 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttcttac-aaagggatacaaagg 4552731  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4552732 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 31925708 - 31925875
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  31925708 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 31925805  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  31925806 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctacccatttttccactctcaccaa 31925875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49918521 - 49918350
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  49918521 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 49918424  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  49918423 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47115340 - 47115171
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||  |||    
T  47115340 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggt 47115242  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47115241 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 28223418 - 28223589
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  28223418 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 28223515  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  | || | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28223516 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 37503554 - 37503722
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |||    
T  37503554 agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatac--aag 37503649  T
Q  189 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37503650 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 45644448  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  45644449 agttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 193778 - 193611
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  193778 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgagtt 193681  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |  | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  193680 acaagaaattagcttcaacaagctaataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 193611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19754664 - 19754494
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  19754664 attgttgacccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatcgg 19754567  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19754566 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659238
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||      
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaataagttcttac-aaagagatacaaatg 31659312  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31659311 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 50169207 - 50169378
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |    
T  50169207 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagtacttac-aaagagatacaaatg 50169304  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  50169305 agttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603576
Alignment:
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttaca 194  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttaca 34603643  T
Q  195 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34603642 agaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttttcaatctcaccaa 34603576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||| ||  |||    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaaca 23555383  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23555384 agttcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 50167172 - 50167343
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  50167172 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 50167269  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  50167270 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 37559864 - 37560037
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactct-ggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa- 186  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||     
T  37559864 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctagggggagagattgatctctccaattcactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaat 37559961  T
Q  187 aggttacaagaaattagctt--gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||||||||||||||||   |||||||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37559962 gggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 37560037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  116 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagcttgacaag-t 213  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||| |  || |    
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagat 1833569  T
Q  214 tcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1833568 tcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 3847118 - 3847286
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  3847118 agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 3847215  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||| || |||||||  ||||  |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3847216 ggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 3847286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 13659333 - 13659501
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  13659333 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 13659430  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 257  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13659431 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 13659501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46065089 - 46064921
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| | |    
T  46065089 agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttcttac-aaagagatacacatg 46064992  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 257  Q
     ||||||||||||||||||  || || |||| | ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  46064991 agttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaa-cctaatttttatccattttcccaatctcac 46064921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28242472 - 28242391
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28242472 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 196904 - 197166
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa 187  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  196904 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaat 197001  T
Q  188 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  197002 gagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttctcaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttc 197100  T
Q  278 tct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  197101 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 197166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41361088 - 41360914
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  41361088 aagatattgttgacctagttcggtccaatat-gacctactatgggggagatattgatctctttaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 41360991  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41360990 atgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatc 19752760  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  19752759 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  117 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagc-ttgacaagtt 214  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  215 cactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    ||| | ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaaca 15820357  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    || |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  15820356 agctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138089
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||      
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatcaatgtgttcttac-aaagagatgcaaatg 13138070  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13138071 ggttacaagaaattagctt 13138089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 30476443 - 30476614
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  | ||| | ||||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  30476443 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaatccagtatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 30476540  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||| |||||| |||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30476541 ggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 30476614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Original strand, 37876767 - 37876848
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37876767 tgttcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 40122193 - 40122363
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 186  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40122193 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaagagttcttac-aaagtgatacaaa 40122290  T
Q  187 ag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
     | |||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  40122291 tgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttcgacccatttttccaatctcac 40122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 927977 - 928123
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 191  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  927977 tgtttacccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaatgagtttttacaaa-gagatccaaaagggtt 928074  T
Q  192 acaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 239  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928075 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36683828 - 36683766
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36683828 aacttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatcaatgagttcttacaaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16455750 - 16455676
Alignment:
Q  132 gagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16455750 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-acagagatacaaatgggttacaagaaattagctt 16455676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5460046 - 5459961
Alignment:
Q  121 ctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagctt 206  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5460046 ctactctagatgagagattgatctctccaatctactatcaatgagttctttacaaagaaatataaaatgttacaagaaattagctt 5459961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 255
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318685
Alignment:
Q  156 tatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 253  Q
    |||||| ||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatc 12318683  T
Q  254 tc 255  Q
    ||    
T  12318684 tc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808507
Alignment:
Q  119 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt 206  Q
    ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagctt 6808507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10925397 - 10925278
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt---acaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||   ||||| | |||||||    
T  10925397 agattgttgacccagttcgatccaa-ctttacctaatctaggggagagattgatttctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaa-gagatacaa 10925300  T
Q  186 aag-gttacaagaaattagctt 206  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  10925299 atgagttacaagaaattagctt 10925278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 260
Target Start/End: Original strand, 37879005 - 37879079
Alignment:
Q  187 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37879005 aggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 37879079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 257
Target Start/End: Original strand, 8871143 - 8871213
Alignment:
Q  188 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 257  Q
    ||||||||||||||||||| | | |  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8871143 ggttacaagaaattagcttcaacgaactcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttccaaatctcac 8871213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282846
Alignment:
Q  102 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaat 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   |||||||||||||||  || ||||||||   |||| ||| ||||| |||||| | ||||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaat 37282799  T
Q  201 tagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt 246  Q
    ||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||    
T  37282800 tagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttataccatttt 37282846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3460815 - 3460710
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctac 240  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||   ||||  |||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||||| |||||||||||    
T  3460815 ctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctac 3460716  T
Q  241 cctttt 246  Q
    ||||||    
T  3460715 cctttt 3460710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 161
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  104 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 161  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15916671 - 15916626
Alignment:
Q  92 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  15916671 ttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagaga 15916626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Original strand, 31422862 - 31422906
Alignment:
Q  92 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31422862 ttgttcacccagctcggtccaaa-ttgacctagtctggaggagaga 31422906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48382505 - 48382441
Alignment:
Q  174 aaagggatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttct 238  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  48382505 aaagtgatacaaataggttacaagaaattaactt-acaagttcacaaagatcaaaccctaatttct 48382441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2926688 - 2926613
Alignment:
Q  81 caccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 157  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||   |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||    
T  2926688 caccaaaga-attgtttacctagttcggtgcaacaatgacctactctgcagaagagattgatctctccaatccacta 2926613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 32737015 - 32736952
Alignment:
Q  179 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737015 gatacaaagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 35109556 - 35109493
Alignment:
Q  179 gatacaaa-aggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  35109556 gatacaaataggttacaagaaattagctt-aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccc 35109493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16555131 - 16554783
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16555131 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16555032  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555031 cccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16554932  T
Q  198 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554931 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 16554832  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554831 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16554783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16631687 - 16631339
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16631687 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16631588  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631587 cccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16631488  T
Q  198 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631487 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 16631388  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631387 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16631339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16653374 - 16653026
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16653374 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16653275  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653274 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16653175  T
Q  198 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653174 aattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 16653075  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653074 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16653026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 16578424 - 16578772
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16578424 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16578523  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578524 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16578623  T
Q  198 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16578624 aattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttccca 16578723  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578724 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16578772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16616956 - 16616608
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16616956 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttca 16616857  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616856 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 16616757  T
Q  198 aattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16616756 aattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttccca 16616657  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616656 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 16616608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27648113 - 27647765
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27648113 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaatacacaa------gataaaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaa-gagattgttcacc 27648021  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27648020 cagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaat 27647921  T
Q  201 tagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgt 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  27647920 tagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacatggtgtttcccatgt 27647823  T
Q  301 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27647822 tttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagtttctccctttg 27647765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25421567 - 25421215
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  25421567 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 25421469  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25421468 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 25421369  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421368 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 25421269  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421268 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25421215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6027507 - 6027158
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6027507 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaatgg-agggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 6027410  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6027409 cccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 6027310  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6027309 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 6027212  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027211 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 6027158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34167341 - 34166990
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  34167341 cctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 34167243  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34167242 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 34167143  T
Q  197 aaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34167142 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcc 34167045  T
Q  296 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34167044 catgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 34166990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34165120 - 34164768
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |    
T  34165120 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacaaagcaactaaa-cacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggt 34165023  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  34165022 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttaca 34164923  T
Q  195 agaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34164922 agaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgttt 34164825  T
Q  294 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34164824 cccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttc 34164768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 412362 - 412004
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  412362 cctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgttcacc 412263  T
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  412262 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaa 412163  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  412162 attagatttgataagttcacaatgaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 412064  T
Q  298 tgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  412063 tgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 412004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Original strand, 33342067 - 33342363
Alignment:
Q  55 aaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatcc 153  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33342067 aaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatcc 33342165  T
Q  154 actatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttccca 250  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33342166 actatcaaatgagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccca 33342265  T
Q  251 atctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342266 atctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 33342363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 358
Target Start/End: Original strand, 3072670 - 3073026
Alignment:
Q  3 tagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcaccca 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3072670 tagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gagattgttcaccca 3072768  T
Q  103 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttacaagaaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  3072769 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaat 3072868  T
Q  201 tag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg 299  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  3072869 tagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatg 3072967  T
Q  300 ttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  3072968 tttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagtttctccctttg 3073026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13154176 - 13153893
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  13154176 cctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtca 13154078  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13154077 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 13153978  T
Q  197 aaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 280  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153977 aaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 358
Target Start/End: Original strand, 6097362 - 6097707
Alignment:
Q  5 gatctaatctaggaaacaaatg-agaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccag 103  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6097362 gatctaatctaggtaacaagtggaaaaacacaatacacaatcacaagatacaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccag 6097461  T
Q  104 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||           |||||||||||||||    
T  6097462 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattag 6097551  T
Q  204 -cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt 302  Q
      ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||    
T  6097552 atttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgttt 6097650  T
Q  303 -tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6097651 cccaaccaaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 6097707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 2171438 - 2171804
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaa---cacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||   || | ||||||| ||||||||| ||||| || |||||   |||||||  |||||| |||||||||    
T  2171438 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaaggg-agagaagagataaacaaatacaccaa-gagattgtt 2171535  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  2171536 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaagggttacaag 2171634  T
Q  197 aaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaag 287  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||    
T  2171635 aaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaag 2171733  T
Q  288 gtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  2171734 gtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagagttgctccctttg 2171804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 31404671 - 31404932
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  31404671 agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 31404769  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  31404770 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaagacactcaatgattttcac 31404868  T
Q  280 tttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404869 tcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 5406111 - 5406456
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaa--cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| || |||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  5406111 cctagatctaatctaggaatcaaa-gagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 5406205  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5406206 cccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 5406304  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  5406305 aattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 5406403  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406404 gtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 5410436 - 5410781
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaa--cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| || |||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  5410436 cctagatctaatctaggaatcaaa-gagaaaagcacaaaccacaaacaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 5410530  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5410531 cccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 5410629  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  5410630 aattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaaggt 5410728  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410729 gtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 339
Target Start/End: Original strand, 16452325 - 16452583
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggata-caaaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  |||     
T  16452325 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatatgaaag 16452423  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  16452424 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 16452522  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 339  Q
     ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452523 actcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 30834532 - 30834794
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||     
T  30834532 agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt-ccaaagagatacaaaag 30834630  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  30834631 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 30834729  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834730 actcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 5413306 - 5413650
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaa--cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| || |||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  5413306 cctagatctaatctaggaatcaaa-gagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 5413400  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaaga 197  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5413401 cc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaaga 5413498  T
Q  198 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    ||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   ||| ||    
T  5413499 aattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaatgt 5413597  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5413598 gtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5413650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21589098 - 21588931
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21589098 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21589001  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589000 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21593831 - 21593664
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  21593831 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 21593734  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593733 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 33160348 - 33160521
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  33160348 agattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 33160446  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  33160447 agttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Original strand, 3808701 - 3808877
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  3808701 aagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 3808799  T
Q  186 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3808800 aatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17758191 - 17758026
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  17758191 tgttcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 17758093  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17758092 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 2972940 - 2973107
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  2972940 tgttcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 2973037  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2973038 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 9183028 - 9183199
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  9183028 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9183125  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9183126 ggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17763158 - 17762990
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | |||    
T  17763158 tgttcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagtt 17763060  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17763059 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16569193 - 16568953
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||            ||||    
T  16569193 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac------------aaag 16569107  T
Q  189 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctt-taca 285  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||| || |||   ||    
T  16569106 gttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaatgattttcacttaccca 16569010  T
Q  286 aggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569009 aggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 5408981 - 5409164
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaa--cacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||  ||||| || |||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  |||||||    
T  5408981 cctagatctaatctaggaatcaaa-gagaaaagcacaaaccacaagcaaaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttca 5409075  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg 189  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  5409076 cc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 5409164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Original strand, 26830124 - 26830289
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 191  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  26830124 tgttcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggatt 26830221  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 258  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26830222 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 28137409 - 28137576
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  28137409 tgttcacacaattcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggtt 28137506  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28137507 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5043795 - 5043630
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  5043795 tgttcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 5043697  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  5043696 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctactcattttctcaatctcac 5043630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 22424826 - 22424995
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa---gg 189  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  22424826 tgttcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatggg 22424923  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22424924 ttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | |    
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacagatg 26954380  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac 257  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954381 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211353
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||| |    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 33211279  T
Q  189 -gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
     | |||||||||||| ||| | |||| |||| | |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33211280 agctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaac-aaccataatttctaccaattttcccaatctcaccaa 33211353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Original strand, 603082 - 603201
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  603082 aagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaa 603179  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt 206  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  603180 atgggttacaagaaattagctt 603201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 260
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  116 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagt 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  | |||     
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaagagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagc 3039024  T
Q  214 tcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3039025 tcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26800755 - 26800642
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||   ||    
T  26800755 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttac-aaagagatacaaaattagt 26800658  T
Q  191 tacaagaaattagctt 206  Q
    ||||||||||||||||    
T  26800657 tacaagaaattagctt 26800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4045542 - 4045423
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctac 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | |||| |||  | ||||||||||||||||||||    
T  4045542 ctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctac 4045443  T
Q  241 ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  4045442 cattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19643938 - 19643894
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19643938 tgtttaccaagttcggtccaaatttgacctactctgaaggagaga 19643894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 6266951 - 6266593
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaag-caccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6266951 cctagatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaatacacaagcacaagataaacggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaa-gagattgttcac 6266853  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266852 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaa 6266753  T
Q  200 ttag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccat 298  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6266752 ttagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccat 6266653  T
Q  299 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6266652 gttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgctccctttg 6266593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 12647293 - 12647643
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  12647293 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 12647391  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12647392 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 12647491  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12647492 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 12647589  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647590 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 12647643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 13655936 - 13656220
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgtt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  13655936 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattggt 13656035  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13656036 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaagaggttacaa 13656135  T
Q  196 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656136 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32289825 - 32289467
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  32289825 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttcac 32289726  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32289725 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 32289626  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 297  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |||    
T  32289625 attagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttt-ccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacca 32289528  T
Q  298 tgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||| | |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  32289527 tgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagagttactccctttg 32289467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 4484239 - 4484604
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || | | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  4484239 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 4484336  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4484337 ccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaa 4484436  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||      |||||||||||||||||  | ||   ||||||    
T  4484437 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggt 4484535  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  4484536 gtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagagttactccctttg 4484604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30833605 - 30833240
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  30833605 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 30833508  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30833507 ccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaa 30833408  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    |||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | ||   ||| ||    
T  30833407 attaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaagt 30833309  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||| | ||||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30833308 gtttacaatgtttcccaacccaagataagctctaatcaaa-aaccctaaaccctagagttactccctttg 30833240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 4503044 - 4503390
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| |||| |||  ||||   |||||||  |||||||||  ||||||||    
T  4503044 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggagag--aagagagaaacaaacacaccaaaga--ttgttcac 4503139  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||    
T  4503140 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaagagttacaagaa 4503237  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctc-------accaagacactcaatgattctctctttacaagg 288  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||       | ||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  4503238 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 4503336  T
Q  289 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503337 tgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45099926 - 45099665
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  45099926 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctt--caaagagatacaaaag 45099829  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 277  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  45099828 agttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttc 45099730  T
Q  278 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099729 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 5723252 - 5723512
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac-aaaa 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  5723252 agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaaa 5723350  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  5723351 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 5723449  T
Q  280 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723450 tcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 36205661 - 36205921
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||||||||   |||| ||||||||||    
T  36205661 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtcaatgagttctt--caaagagatacaaaag 36205758  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  36205759 agttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 36205857  T
Q  279 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205858 ctcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Original strand, 2334414 - 2334661
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  2334414 agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 2334512  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
     ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  2334513 agttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 2334611  T
Q  279 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaa 328  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2334612 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa 2334661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 36988072 - 36988333
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  36988072 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 36988170  T
Q  189 -gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
     |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||       ||||||||||||||||| ||     
T  36988171 agttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaagacactcaatgattttca 36988269  T
Q  279 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36988270 ctcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 36988333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 6595002 - 6595175
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||     
T  6595002 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagattcaaaag 6595100  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  6595101 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcctaatctcaccaa 6595175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 45727096 - 45726929
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  45727096 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 45726999  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45726998 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29868040 - 29867869
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  29868040 agattattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 29867943  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29867942 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 34139767 - 34139936
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggataca-aaa 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      
T  34139767 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatg 34139865  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34139866 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcac 34139936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 242
Target Start/End: Original strand, 723741 - 723893
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||      
T  723741 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatg 723838  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723839 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 14633822 - 14633991
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      
T  14633822 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatctatgagttcttacaaaagggatacaaatg 14633920  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14633921 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttaccaatctcac 14633991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 35446885 - 35447052
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  35446885 tgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 35446982  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35446983 acaagaaattagattcaacaagatcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttaccaatctcaccaa 35447052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36773733 - 36773562
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  36773733 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36773636  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  36773635 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312240
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||      
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagatcttac-aaagagatacaaatg 38312314  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38312313 ggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 11151588 - 11151759
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||      
T  11151588 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaagagttcttac-aaagtgatacaaatg 11151685  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11151686 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 260
Target Start/End: Original strand, 1631735 - 1631900
Alignment:
Q  95 ttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttac 193  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||    
T  1631735 ttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 1631832  T
Q  194 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1631833 aagatattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 1631900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33648340 - 33648176
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||| ||||    
T  33648340 tgtttacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggtt 33648241  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33648240 acaggaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362262
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaaca 42362402  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtt 301  Q
    || |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | |||||    
T  42362401 agctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgtt 42362303  T
Q  302 t-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362302 tcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 17057366 - 17057537
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  17057366 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 17057463  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |  | | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17057464 agttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17057537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 17085349 - 17085520
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |    
T  17085349 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 17085446  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||| ||||||||||  ||||| |  | | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17085447 agttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 17085520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24398228 - 24398055
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-gg 189  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||    
T  24398228 attgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggg 24398129  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctt--ttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24398128 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36318006 - 36318177
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  36318006 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 36318103  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36318104 ggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 36318177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11690672 - 11690504
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||      
T  11690672 agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttac-aaagggatacaaatg 11690575  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11690574 ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26353351 - 26353184
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  26353351 tgtttacccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgtt 26353254  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  26353253 acaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 17490149 - 17490261
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||    
T  17490149 tgtttacccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaatgagttcttac-aaagagttacaaaagagtt 17490246  T
Q  192 acaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||    
T  17490247 acaagaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 33162447 - 33162618
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||      
T  33162447 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttac-agagagatacaaatg 33162544  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  33162545 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcctaatttcaccaa 33162618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11067476 - 11067305
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||      
T  11067476 agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattataaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 11067379  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  11067378 ggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctacccatttttccaatttcaccaa 11067305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  127 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaaca 225  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| |||| | |||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagtttctacaaa-gagatacaaa-ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaaca 13121804  T
Q  226 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13121803 aaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 260
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288278
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||||||  ||||||||     
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttac-aaagaaatacaaatgggttacaat 42288213  T
Q  197 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42288214 aaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 42288278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284930
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 240  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| ||    
T  7815323 ctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaac 7815421  T
Q  241 ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  7815422 ctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450671
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttc 168  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttc 17450671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7451284 - 7451173
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |  ||    
T  7451284 tgttcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattac-aaagagatacaaatgaatt 7451188  T
Q  192 acaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||    
T  7451187 acaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28671989
Alignment:
Q  104 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaatta 202  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||   |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaaacggtaacaagaaatta 28671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11049721 - 11049550
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatac--aaaaggt 190  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||||||||  || | ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||  ||| |||    
T  11049721 tgtttacccagttcagtccaat-ttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctactatcaatgagttcttac-aaagagatactaaaagggt 11049624  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcac---tatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    || |||||||||||||  ||||| ||||   |  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  11049623 tataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttataccattttcctaatctcaccaa 11049550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24198065 - 24197906
Alignment:
Q  92 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagtt-cttacaaaagggatacaaaagg 189  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |  |  |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||  ||    
T  24198065 ttgtttacccagttcggcccaaacgtgacctacgtctggagaagata--gatctctccaatccattatcaaagagtttcttgcaaa-gagatacaag-gg 24197970  T
Q  190 ttacaagaaattagcttg--acaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaa 251  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| | | ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  24197969 ttacaagaaattagccttcaacaagttctccaagaaaaaactttaatttctacccttttcccaa 24197906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 42064770 - 42064725
Alignment:
Q  92 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  42064770 ttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagaga 42064725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  116 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 175
Target Start/End: Original strand, 14202450 - 14202494
Alignment:
Q  131 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14202450 ggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaa 14202494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8395865 - 8395515
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggg-gagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  8395865 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttc 8395767  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395766 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 8395667  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8395666 aaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 8395569  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395568 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 8395515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8393656 - 8393306
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggg-gagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  8393656 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaatggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttc 8393558  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393557 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 8393458  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8393457 aaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 8393360  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8393359 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttc 8393306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7125163 - 7124811
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  7125163 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattgttca 7125065  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7125064 cccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 7124965  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124964 aaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 7124865  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124864 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 7124811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7122944 - 7122592
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | || ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||    
T  7122944 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagggaagaagaaaacaataaacac-aaagaaattgttca 7122846  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    ||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7122845 cccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 7122746  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122745 aaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 7122646  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122645 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 7122592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5138552 - 5138200
Alignment:
Q  2 ctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  5138552 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtc 5138454  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  5138453 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 5138354  T
Q  196 gaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  5138353 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtatttc 5138256  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138255 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 5138200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5136327 - 5135974
Alignment:
Q  2 ctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacaca-caacacaatcacaagata--caaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttc 97  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||  || |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  5136327 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacaaagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtc 5136229  T
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttc-ttacaaaagggatacaaaaggttacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  5136228 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaa 5136129  T
Q  196 gaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  5136128 gaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtatttc 5136031  T
Q  295 ccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136030 ccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 5135974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 31495216 - 31495583
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggg--------gagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagaga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || || | ||||||| ||||||||| ||||         ||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  31495216 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaacacaagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaa-gaga 31495314  T
Q  92 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--gg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||   |    
T  31495315 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagag 31495414  T
Q  190 ttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaagg 288  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  31495415 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaagg 31495513  T
Q  289 tgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||    
T  31495514 tgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actataaaccctagagttactccctttg 31495583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Original strand, 13992289 - 13992544
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  13992289 agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac--aagagatacaaaag 13992386  T
Q  189 -gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttac 284  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |    
T  13992387 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcacc 13992485  T
Q  285 aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992486 aaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 343
Target Start/End: Original strand, 29999806 - 30000063
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  29999806 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagtt 29999905  T
Q  192 acaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctcttta 283  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||| || ||       
T  29999906 acaagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcac 30000004  T
Q  284 caaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000005 caaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 330
Target Start/End: Original strand, 56178633 - 56178882
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  56178633 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 56178731  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 278  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  56178732 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 56178830  T
Q  279 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 330  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178831 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Original strand, 52095361 - 52095530
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||    
T  52095361 attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaagatttcttac-aaagagatacaaatggg 52095458  T
Q  190 ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52095459 ttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48143215 - 48143042
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||     
T  48143215 agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctta-tgaagagatacaaaag 48143117  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  48143116 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2209889 - 2209717
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  2209889 aagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 2209791  T
Q  186 aa--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctca 256  Q
    ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2209790 aatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Original strand, 5370079 - 5370232
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||     
T  5370079 agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 5370177  T
Q  188 ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 241  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  5370178 ggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 5370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  96 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggttac 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggttac 41964483  T
Q  194 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    || ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41964482 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 9927455 - 9927626
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  9927455 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 9927552  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9927553 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 12739547 - 12739718
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||      
T  12739547 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatg 12739644  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12739645 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||      
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 36463483  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36463484 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26364410 - 26364236
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||    
T  26364410 aagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttac-aaagagatacaa 26364313  T
Q  186 aag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364312 atgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 258
Target Start/End: Original strand, 46147388 - 46147557
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  46147388 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 46147485  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcacc 258  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  46147486 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46703669 - 46703500
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa--ggt 190  Q
    |||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||    
T  46703669 tgttcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttac-aaagagatacaaaatgggt 46703571  T
Q  191 tacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  46703570 tacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 47038408 - 47038577
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||||| |    
T  47038408 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtccttac-aaacagatacaaatg 47038505  T
Q  189 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038506 attacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12073560 - 12073392
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  12073560 tgttcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 12073462  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12073461 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Original strand, 12743922 - 12744073
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  12743922 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12744019  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744020 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Original strand, 12745311 - 12745462
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  12745311 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 12745408  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745409 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 26175633 - 26175804
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||      
T  26175633 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatg 26175730  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26175731 ggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 40632612 - 40632445
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  40632612 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaataggtt 40632515  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632514 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41639593 - 41639426
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||  ||||    
T  41639593 tgttcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttac-aaatagatacaaatgggtt 41639496  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41639495 acaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 48893635 - 48893810
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  48893635 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatg 48893732  T
Q  189 -gttacaagaaattagctt-gacaagttc----actatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     ||||||||||||||||||  ||||| ||    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48893733 agttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 48893810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 54883194 - 54883020
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  54883194 aagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 54883097  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54883096 atgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36994693 - 36994524
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||    
T  36994693 attgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaatggg 36994596  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36994595 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 379548 - 379383
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  379548 tgttcatccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagcgatacaaatgggtt 379450  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  379449 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcac 379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6656123 - 6655975
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  6656123 tgttcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 6656026  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 242  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656025 acaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8648306 - 8648139
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  8648306 tgttcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 8648209  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8648208 ataagaaattagcttcaacaaactcacaatgaac-aaccctaatttctatccattttcccattctcaccaa 8648139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  113 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaca 8665458  T
Q  211 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    || || | | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8665457 agctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 34570411 - 34570582
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa-aa 187  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||       
T  34570411 agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaattg 34570508  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570509 ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 45687179 - 45687351
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |    
T  45687179 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 45687276  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45687277 agttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 50673848 - 50673960
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  50673848 tgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 50673945  T
Q  192 acaagaaattagctt 206  Q
    |||||||||||||||    
T  50673946 acaagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37740794 - 37740536
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  37740794 attgttgacacagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 37740697  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct 280  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||       ||||||||||| ||||| || ||    
T  37740696 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcact 37740598  T
Q  281 ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
       |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37740597 caccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 37740536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 6542180 - 6542349
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-tt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |     
T  6542180 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaaggcta 6542277  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  6542278 acaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctaccattttttcccaatctccccaa 6542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429679
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||      
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaatagatacaaatg 5429753  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5429752 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaa-taaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 5429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5871991 - 5871820
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||      
T  5871991 agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaagagttcttgc-aaagtgataaaaatg 5871894  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5871893 ggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 5871820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 27416962 - 27417133
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  27416962 agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 27417059  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  27417060 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 37229722 - 37229890
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 191  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||| ||||    
T  37229722 tgtttacctagttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggtt 37229820  T
Q  192 acaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||| ||||| || || ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37229821 acaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Original strand, 50262694 - 50262814
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  50262694 aagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaa 50262792  T
Q  186 a-aggttacaagaaattagctt 206  Q
    |  |||||||||||||||||||    
T  50262793 atgggttacaagaaattagctt 50262814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Original strand, 54199906 - 54200074
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  54199906 attgttgacccagttcg-tccaa-cttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatggg 54200002  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54200003 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119540
Alignment:
Q  86 aagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaa 185  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||   |||| |||||||    
T  12119714 aagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaa 12119616  T
Q  186 aa-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcacc 258  Q
    || |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12119615 aagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctactcttttttccaatctcacc 12119540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 52467351 - 52467519
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||      
T  52467351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaaaagttattac-aaagtgatacaaatg 52467448  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcac 257  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  52467449 ggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaacctcac 52467519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4588126 - 4587958
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 191  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  4588126 tgtttacccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggtt 4588029  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| | || | ||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  4588028 acaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttttttcccaatttcaccaa 4587958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Original strand, 5207843 - 5208003
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa-agggatacaaaaggtt 191  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || ||||    
T  5207843 tgtttacccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatac-aagggtt 5207940  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatc 253  Q
     ||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5207941 gcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Original strand, 52082660 - 52082825
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||       |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||      
T  52082660 agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc-------cactatcaaagatttcttac-aaagagatacaaatg 52082751  T
Q  188 ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52082752 ggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31474318 - 31474150
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||    
T  31474318 tgtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagtt 31474221  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||  | ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31474220 acaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 31474150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662496
Alignment:
Q  101 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaa 35662503  T
Q  200 ttagctt 206  Q
    |||||||    
T  35662502 ttagctt 35662496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 260
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  131 ggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaac 228  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatac-aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aac 12747891  T
Q  229 cctaatttcta-cccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  133 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccc 230  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12744184  T
Q  231 taatttctacc 241  Q
    |||||||||||    
T  12744185 taatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 260
Target Start/End: Original strand, 12745476 - 12745604
Alignment:
Q  133 agagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccc 230  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||    
T  12745476 agagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccc 12745573  T
Q  231 taatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12745574 taatttctacccattttcctaatctcgccaa 12745604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 98 - 245
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699596
Alignment:
Q  98 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaag 196  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| || ||||||||   |||| |||||||||| ||||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  197 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt 245  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||| | ||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatctatacccttt 26699596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29254665 - 29254580
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29254665 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaa 29254580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 186
Target Start/End: Original strand, 13009441 - 13009536
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa 186  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13009441 agattgttgacacagttcggtctaa-cttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagggatacaaa 13009536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989899
Alignment:
Q  117 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaagg-ttacaagaaattagctt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctt 33989899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 51337231 - 51337064
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  51337231 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatgtgtgggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttctta-aaaagagatacaaaagggtt 51337134  T
Q  192 acaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaa-ccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    | || |||||| ||| | ||| |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51337133 ataataaattatctt-aaaagctcacaaagaacaaatccgtaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 51337064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24969230 - 24969112
Alignment:
Q  143 ctctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 240  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||    
T  24969230 ctctccaatccactatcaattagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctac 24969133  T
Q  241 cc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  24969132 ccatttttccaatctcaccaa 24969112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 44967829 - 44967992
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 192  Q
    |||| |||||| |||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  | ||| |||| ||| |||| ||||| ||   |||| |||||||| |||||    
T  44967829 tgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatctactctcaacgagttttttacaaagagatacaaatggtta 44967928  T
Q  193 caagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    ||||||||| |||| | |||| || | | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44967929 caagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttctaccattttcccaatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3913618 - 3913534
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaa 175  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||| || |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3913618 agattgttgacccagttcgatacaa-ctttacatactctag-ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089933
Alignment:
Q  119 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaaattagctt 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||   | || ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagctt 33089933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 21703836 - 21703999
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttctt-acaaaagggatacaaaa-ggt 190  Q
    |||| ||||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||| ||||||   ||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||| ||     
T  21703836 tgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactatgg-ggatagattgatatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaag-atacaaaaaggg 21703933  T
Q  191 tacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctc 255  Q
    |||||||||| | ||| | |||| |  ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21703934 tacaagaaatcatcttcaacaagctttctaagaacaaaacctaatttctacctttttctcaatctc 21703999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 48142473 - 48142542
Alignment:
Q  188 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctca 256  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  48142473 ggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctatcatgttcccaatctca 48142542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 2511 - 2861
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||    
T  2511 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaaa-agattgttca 2609  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2610 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaag 2709  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2710 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 2807  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 3633 - 3983
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  3633 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtca 3731  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttacaag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  3732 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaag 3831  T
Q  197 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3832 aaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttccc 3929  T
Q  297 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3930 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 3983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6536 - 6188
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagata---caaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |    
T  6536 cctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagagggaagaagaaaacaataacac-aaagagattggt 6438  T
Q  97 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttctt-acaaaagggatacaaaaggttaca 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||    
T  6437 cacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatacaagggcttaca 6338  T
Q  195 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6337 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttc 6240  T
Q  295 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6239 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 11070 - 11435
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  11070 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 11167  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11168 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaa 11267  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcac------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 289  Q
    |||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||||||  | ||   ||||||    
T  11268 attagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgatttacactcaccaaggt 11366  T
Q  290 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11367 gtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagagttactccctttg 11435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 8644 - 8907
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  8644 cctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga--ttgttcac 8741  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8742 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaa 8841  T
Q  199 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttt--tcccaatctcaccaaga 262  Q
    |||||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8842 attagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 136; Significance: 7e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 434791 - 434443
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaa-tgagaaacacacaacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcac 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| || |||||   |||||||  ||||||| |  ||||||||    
T  434791 cctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaacacaagcacaagataaaaggg-agagaagagagaaacaaacacaccaaata--ttgttcac 434695  T
Q  100 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggttacaagaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  434694 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaagaa 434596  T
Q  199 attagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccctttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaagg 288  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||||    
T  434595 attagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaagg 434497  T
Q  289 tgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434496 tatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 827
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa- 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| |||||||||     
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt--caaagagatacaaaag 990  T
Q  188 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ttttcccaatctcac------caagacactcaatgattctct 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||     
T  989 ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttca 891  T
Q  279 ctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 343  Q
    ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  890 ctcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11779 - 11557
Alignment:
Q  37 aacacaatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagag 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| || |||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11779 aacacaagcacaagataaaaggg-agagaagagataaacaaatacaccaa-gagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagag 11682  T
Q  137 attgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  11681 attgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaat 11584  T
Q  235 ttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  11583 ttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 22286 - 22239
Alignment:
Q  310 aagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttctccctttg 358  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  22286 aagagaaactctaatcaaaga-ccctaaaccctagagttgctccctttg 22239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag 188  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaaag 114676  T
Q  189 -gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  114675 cgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  1 cctagatctaatctaggaaacaaatgagaaacacacaaca-caatcacaagatacaaggggagggaagaagaaaacaa-aagcaccaaagagattgttca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  126 cctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagatacaaggagagggaagaagaaaacaataaacac-aaagagattggtca 28  T
Q  99 cccagttcggtccaaacttgacctact 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27 cccagttcggtccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 18004 - 18171
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gtt 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| | |||    
T  18004 tgttcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagtt 18101  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  18102 acaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccactctcaccaa 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 260
Target Start/End: Original strand, 20414 - 20583
Alignment:
Q  91 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-agg 189  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||    
T  20414 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaagagttcttac-aaagagatacaaatggg 20511  T
Q  190 ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20512 ttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7494 - 7327
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  7494 tgttcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatacaaatgggtt 7397  T
Q  192 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctcaccaa 260  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7396 acaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10656 - 10546
Alignment:
Q  93 tgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaa-ggtt 191  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10656 tgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttac-aaagagatacaaaatggtt 10559  T
Q  192 acaagaaattagc 204  Q
    |||| ||||||||    
T  10558 acaataaattagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 149094 - 149262
Alignment:
Q  89 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 187  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||      
T  149094 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttac-aaagagatataaatg 149191  T
Q  188 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccttttcccaatctcac 257  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||| | || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  149192 ggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaac-aaccctaatttctatccgttttcccaatctcac 149262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 206
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27556
Alignment:
Q  104 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaaag-gttacaagaaatta 202  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||   |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 27552  T
Q  203 gctt 206  Q
    ||||    
T  27553 gctt 27556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 256
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80447
Alignment:
Q  148 caatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-tt 244  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaa-agatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt 80435  T
Q  245 ttcccaatctca 256  Q
    ||||||||||||    
T  80436 ttcccaatctca 80447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University