View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1529_high_30 (Length: 293)

Name: NF1529_high_30
Description: NF1529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1529_high_30
NF1529_high_30
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (20-274)||(37610216-37610470)
chr8 (41-274)||(20480518-20480754)
chr8 (35-274)||(19994222-19994461)
chr8 (25-274)||(41245512-41245758)
chr8 (25-274)||(25121391-25121640)
chr8 (28-265)||(22322498-22322736)
chr8 (25-274)||(3432639-3432886)
chr8 (70-274)||(21680052-21680258)
chr8 (25-274)||(20568326-20568576)
chr8 (25-274)||(20574519-20574769)
chr8 (25-274)||(16042096-16042346)
chr8 (33-259)||(18611377-18611601)
chr8 (25-274)||(43374647-43374893)
chr8 (25-274)||(21696411-21696661)
chr8 (33-274)||(13663556-13663799)
chr8 (94-270)||(16417114-16417291)
chr8 (33-274)||(13722091-13722334)
chr8 (25-259)||(16040313-16040548)
chr8 (33-260)||(24930073-24930303)
chr8 (69-259)||(24107582-24107774)
chr8 (113-274)||(29759140-29759300)
chr8 (33-271)||(22007555-22007792)
chr8 (25-272)||(20655083-20655332)
chr8 (33-259)||(22908446-22908672)
chr8 (79-259)||(28836563-28836745)
chr8 (69-272)||(20648541-20648747)
chr8 (96-274)||(24386838-24387019)
chr8 (78-274)||(24718530-24718727)
chr8 (96-274)||(16874069-16874249)
chr8 (113-274)||(38532508-38532672)
chr8 (25-192)||(16406127-16406295)
chr8 (113-236)||(28556874-28556998)
chr8 (118-274)||(17730615-17730774)
chr8 (165-271)||(270581-270687)
chr8 (165-271)||(645233-645339)
chr8 (165-271)||(830968-831074)
chr8 (166-274)||(24548067-24548174)
chr8 (79-199)||(22144136-22144255)
chr8 (159-259)||(6775319-6775419)
chr8 (160-274)||(24107782-24107897)
chr8 (216-274)||(16040612-16040670)
chr8 (216-274)||(13722424-13722482)
chr8 (216-274)||(13722572-13722630)
chr8 (216-274)||(13722720-13722778)
chr8 (216-274)||(13722868-13722926)
chr8 (216-274)||(13723016-13723074)
chr8 (216-274)||(24930366-24930424)
chr8 (33-270)||(5237045-5237286)
chr8 (33-270)||(24662312-24662553)
chr8 (160-274)||(28836440-28836555)
chr8 (216-274)||(13663889-13663946)
chr8 (216-274)||(13723164-13723221)
chr8 (160-269)||(17151451-17151561)
chr8 (209-274)||(16194983-16195047)
chr8 (160-274)||(6775427-6775542)
chr8 (216-274)||(272458-272516)
chr8 (216-274)||(643333-643391)
chr8 (216-274)||(829139-829197)
chr8 (109-191)||(16194904-16194986)
chr8 (223-274)||(700834-700884)
chr8 (233-274)||(224430-224471)
chr8 (233-274)||(738053-738094)
chr8 (233-274)||(861948-861989)
chr8 (216-259)||(17151401-17151443)
chr8 (227-274)||(22908748-22908795)
chr8 (216-270)||(43684504-43684558)
chr8 (41-121)||(273501-273582)
chr8 (41-121)||(642267-642348)
chr8 (41-121)||(828073-828154)
chr8 (25-154)||(15932327-15932458)
chr8 (227-259)||(18618028-18618060)
chr8 (33-186)||(43684589-43684745)
chr8 (25-57)||(38532727-38532759)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (34-274)||(5675677-5675918)
chr1 (25-259)||(20826184-20826418)
chr1 (28-274)||(2422041-2422288)
chr1 (41-274)||(35053686-35053922)
chr1 (25-274)||(22407262-22407512)
chr1 (25-274)||(18506202-18506451)
chr1 (25-272)||(21717051-21717298)
chr1 (35-272)||(41210894-41211131)
chr1 (34-274)||(49966495-49966735)
chr1 (38-274)||(15862514-15862750)
chr1 (118-274)||(22353121-22353276)
chr1 (35-271)||(9785328-9785555)
chr1 (113-274)||(44036058-44036217)
chr1 (106-274)||(27330921-27331087)
chr1 (25-274)||(35523486-35523738)
chr1 (25-274)||(20894765-20895010)
chr1 (33-272)||(22250031-22250268)
chr1 (33-263)||(41218312-41218542)
chr1 (113-274)||(51657467-51657631)
chr1 (25-259)||(20956038-20956276)
chr1 (96-274)||(17147626-17147806)
chr1 (33-274)||(22365601-22365844)
chr1 (162-274)||(21858402-21858513)
chr1 (166-274)||(45050528-45050635)
chr1 (164-274)||(7641803-7641912)
chr1 (216-274)||(18060869-18060926)
chr1 (216-274)||(22352974-22353031)
chr1 (209-274)||(20526964-20527028)
chr1 (33-148)||(20253384-20253500)
chr1 (109-191)||(37845640-37845722)
chr1 (209-274)||(20444592-20444656)
chr1 (209-274)||(20530357-20530421)
chr1 (209-274)||(37845719-37845783)
chr1 (109-193)||(20930380-20930464)
chr1 (216-274)||(17003666-17003724)
chr1 (109-191)||(20444653-20444735)
chr1 (109-191)||(20530418-20530500)
chr1 (38-274)||(27673696-27673936)
chr1 (33-186)||(51451546-51451702)
chr1 (160-274)||(20826426-20826541)
chr1 (109-191)||(20527025-20527106)
chr1 (227-274)||(41393296-41393343)
chr1 (197-274)||(22836478-22836555)
chr1 (222-270)||(51451461-51451509)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (25-274)||(16521635-16521885)
chr4 (25-259)||(15273714-15273948)
chr4 (24-274)||(33739112-33739362)
chr4 (25-274)||(12900831-12901083)
chr4 (25-274)||(45460018-45460267)
chr4 (25-274)||(21960630-21960879)
chr4 (38-274)||(44054769-44055006)
chr4 (25-252)||(7133403-7133631)
chr4 (25-271)||(54119334-54119580)
chr4 (33-274)||(5683823-5684064)
chr4 (44-274)||(44345675-44345905)
chr4 (25-274)||(821175-821423)
chr4 (25-259)||(9294493-9294729)
chr4 (28-274)||(23270991-23271235)
chr4 (33-259)||(19698433-19698657)
chr4 (33-259)||(19709018-19709242)
chr4 (33-259)||(18247156-18247382)
chr4 (33-251)||(55377654-55377873)
chr4 (33-274)||(18294086-18294330)
chr4 (26-274)||(10643034-10643279)
chr4 (25-274)||(19999372-19999623)
chr4 (69-274)||(13245297-13245502)
chr4 (32-274)||(30233611-30233854)
chr4 (38-255)||(26679007-26679226)
chr4 (113-266)||(25120273-25120425)
chr4 (33-252)||(18167766-18167986)
chr4 (33-247)||(18251016-18251232)
chr4 (33-255)||(22355525-22355749)
chr4 (35-274)||(53705882-53706101)
chr4 (76-274)||(18109813-18110014)
chr4 (38-186)||(8873622-8873771)
chr4 (150-259)||(15212415-15212523)
chr4 (77-274)||(14995042-14995241)
chr4 (25-272)||(13810678-13810929)
chr4 (160-274)||(18495602-18495717)
chr4 (35-191)||(53908881-53909031)
chr4 (167-255)||(15288106-15288193)
chr4 (167-255)||(15295216-15295303)
chr4 (33-179)||(19019506-19019653)
chr4 (160-274)||(9294370-9294485)
chr4 (216-274)||(5684155-5684213)
chr4 (216-274)||(18294420-18294478)
chr4 (215-272)||(8044108-8044165)
chr4 (160-274)||(8373200-8373315)
chr4 (160-274)||(18247033-18247148)
chr4 (223-274)||(34393901-34393952)
chr4 (216-274)||(7133702-7133760)
chr4 (216-274)||(14950865-14950923)
chr4 (165-259)||(15212312-15212404)
chr4 (160-273)||(34394045-34394158)
chr4 (69-152)||(9794311-9794395)
chr4 (33-270)||(10487520-10487761)
chr4 (33-270)||(16328990-16329231)
chr4 (216-274)||(18167637-18167695)
chr4 (123-186)||(110393-110456)
chr4 (160-274)||(15212189-15212304)
chr4 (150-204)||(15212557-15212611)
chr4 (221-274)||(110327-110380)
chr4 (160-274)||(15273956-15274071)
chr4 (223-274)||(47356173-47356223)
chr4 (216-270)||(22355817-22355871)
chr4 (216-274)||(26678880-26678938)
chr4 (227-274)||(15288274-15288321)
chr4 (227-274)||(15295384-15295431)
chr4 (227-259)||(8373323-8373355)
chr4 (33-148)||(8373569-8373684)
chr4 (239-274)||(8873770-8873805)
chr4 (240-274)||(53909047-53909081)
chr4 (165-274)||(15043789-15043898)
chr4 (165-274)||(15110526-15110635)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (25-274)||(13256-13506)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (25-274)||(369737-369987)
chr7 (24-274)||(142478-142731)
chr7 (25-274)||(3893943-3894195)
chr7 (24-274)||(47288625-47288875)
chr7 (25-259)||(2027530-2027764)
chr7 (41-274)||(112375-112611)
chr7 (25-274)||(12753731-12753980)
chr7 (25-259)||(14252255-14252490)
chr7 (25-274)||(12544777-12545026)
chr7 (33-274)||(15851176-15851417)
chr7 (25-274)||(15823469-15823720)
chr7 (68-274)||(39047798-39048005)
chr7 (28-274)||(11286063-11286311)
chr7 (25-274)||(12249175-12249426)
chr7 (25-274)||(13867136-13867388)
chr7 (68-271)||(44864096-44864299)
chr7 (25-274)||(36051513-36051759)
chr7 (33-259)||(7291826-7292052)
chr7 (25-274)||(45453322-45453570)
chr7 (33-259)||(32495518-32495746)
chr7 (121-274)||(26071427-26071580)
chr7 (121-274)||(26095214-26095367)
chr7 (33-252)||(15952061-15952280)
chr7 (33-259)||(16417437-16417663)
chr7 (25-274)||(2191609-2191860)
chr7 (113-274)||(125676-125836)
chr7 (28-274)||(13273603-13273852)
chr7 (25-259)||(7285270-7285508)
chr7 (33-255)||(13912076-13912300)
chr7 (25-274)||(15629631-15629882)
chr7 (27-274)||(49048856-49049106)
chr7 (33-259)||(11515200-11515428)
chr7 (25-274)||(16571153-16571403)
chr7 (25-274)||(16594259-16594509)
chr7 (98-274)||(18981041-18981221)
chr7 (25-274)||(15926214-15926466)
chr7 (96-274)||(13757428-13757608)
chr7 (162-274)||(1937975-1938085)
chr7 (25-274)||(10861905-10862157)
chr7 (150-250)||(7285504-7285603)
chr7 (35-153)||(35093783-35093902)
chr7 (209-274)||(13038355-13038420)
chr7 (69-274)||(11581972-11582156)
chr7 (77-274)||(16210629-16210806)
chr7 (159-252)||(16480027-16480120)
chr7 (77-184)||(13038243-13038351)
chr7 (33-270)||(15442628-15442869)
chr7 (216-274)||(32495810-32495868)
chr7 (33-186)||(30263193-30263349)
chr7 (160-274)||(7291703-7291818)
chr7 (160-274)||(15952295-15952410)
chr7 (160-274)||(16417314-16417429)
chr7 (216-274)||(7821770-7821828)
chr7 (216-274)||(7829081-7829139)
chr7 (216-274)||(27102806-27102864)
chr7 (216-274)||(27110154-27110212)
chr7 (216-274)||(27175462-27175520)
chr7 (216-274)||(38784898-38784956)
chr7 (160-274)||(16480135-16480250)
chr7 (123-185)||(3058964-3059026)
chr7 (216-274)||(13912369-13912427)
chr7 (96-160)||(3048691-3048756)
chr7 (221-274)||(3058897-3058950)
chr7 (28-259)||(9057702-9057937)
chr7 (227-259)||(11515094-11515126)
chr7 (227-274)||(2027407-2027454)
chr7 (227-274)||(15761636-15761683)
chr7 (227-274)||(26010458-26010505)
chr7 (25-241)||(9610157-9610377)
chr7 (25-241)||(9837729-9837949)
chr7 (216-274)||(11514971-11515029)
chr7 (216-274)||(30263380-30263438)
chr7 (25-62)||(16920981-16921018)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (24-274)||(12803-13053)
scaffold0359 (25-274)||(174-422)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (25-259)||(21275481-21275715)
chr2 (25-259)||(12642979-12643213)
chr2 (27-274)||(6878291-6878541)
chr2 (25-259)||(42179320-42179554)
chr2 (25-255)||(3799960-3800190)
chr2 (25-274)||(8942494-8942745)
chr2 (25-274)||(12637225-12637476)
chr2 (33-259)||(21140844-21141070)
chr2 (41-274)||(36891788-36892022)
chr2 (25-274)||(4449290-4449542)
chr2 (33-274)||(16900213-16900456)
chr2 (33-274)||(16993604-16993847)
chr2 (33-259)||(19887742-19887968)
chr2 (25-236)||(25211866-25212078)
chr2 (28-269)||(27260414-27260656)
chr2 (28-272)||(22580996-22581242)
chr2 (113-274)||(22273733-22273893)
chr2 (25-274)||(8886988-8887233)
chr2 (25-274)||(22862335-22862581)
chr2 (113-274)||(22282966-22283126)
chr2 (25-241)||(270035-270253)
chr2 (96-271)||(9653978-9654144)
chr2 (25-272)||(24572450-24572700)
chr2 (33-259)||(34823167-34823391)
chr2 (77-259)||(12727128-12727309)
chr2 (25-272)||(28972890-28973140)
chr2 (160-274)||(7320337-7320452)
chr2 (28-274)||(22787089-22787338)
chr2 (69-186)||(20628525-20628643)
chr2 (93-274)||(25600809-25600993)
chr2 (164-274)||(12726899-12727010)
chr2 (160-274)||(24827765-24827880)
chr2 (33-270)||(20013972-20014210)
chr2 (160-274)||(19887976-19888091)
chr2 (160-274)||(34823044-34823159)
chr2 (181-274)||(22691171-22691264)
chr2 (181-274)||(22695818-22695911)
chr2 (33-270)||(14907504-14907745)
chr2 (33-270)||(23819029-23819270)
chr2 (209-274)||(461584-461649)
chr2 (213-274)||(20628649-20628709)
chr2 (38-274)||(24088439-24088679)
chr2 (93-191)||(461646-461745)
chr2 (40-274)||(721330-721566)
chr2 (160-274)||(21275723-21275838)
chr2 (216-274)||(11232507-11232565)
chr2 (216-274)||(22514354-22514412)
chr2 (216-274)||(28776955-28777013)
chr2 (106-191)||(43644141-43644226)
chr2 (209-274)||(43644223-43644287)
chr2 (160-259)||(12727022-12727120)
chr2 (160-274)||(12643221-12643336)
chr2 (160-274)||(21140721-21140836)
chr2 (218-274)||(5889552-5889608)
chr2 (227-274)||(25877214-25877262)
chr2 (66-105)||(22691122-22691161)
chr2 (66-105)||(22695769-22695808)
chr2 (216-274)||(3800366-3800424)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (25-259)||(14820-15054)
scaffold0251 (160-274)||(15062-15177)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (28-274)||(70462-70709)
scaffold0037 (25-274)||(93545-93797)
scaffold0037 (25-274)||(25787-26037)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (25-259)||(16230556-16230790)
chr6 (41-274)||(18776061-18776297)
chr6 (69-274)||(18569439-18569647)
chr6 (35-274)||(25745403-25745643)
chr6 (25-252)||(18003926-18004154)
chr6 (25-259)||(4989871-4990106)
chr6 (69-274)||(22431101-22431307)
chr6 (38-274)||(25645902-25646138)
chr6 (25-259)||(13622067-13622301)
chr6 (25-259)||(18824610-18824845)
chr6 (25-274)||(32897576-32897826)
chr6 (33-274)||(35016751-35016992)
chr6 (66-274)||(18431486-18431693)
chr6 (25-259)||(18582152-18582389)
chr6 (25-274)||(16105412-16105660)
chr6 (25-259)||(18840465-18840700)
chr6 (69-274)||(23152112-23152318)
chr6 (33-259)||(25174528-25174754)
chr6 (25-252)||(15736133-15736362)
chr6 (33-256)||(27655064-27655287)
chr6 (113-274)||(19984356-19984516)
chr6 (25-274)||(16084934-16085180)
chr6 (25-274)||(23976420-23976671)
chr6 (33-255)||(33315545-33315767)
chr6 (69-259)||(16826872-16827064)
chr6 (69-259)||(19628302-19628490)
chr6 (113-252)||(14627652-14627791)
chr6 (98-274)||(18087843-18088023)
chr6 (159-274)||(1658908-1659022)
chr6 (33-274)||(25368414-25368659)
chr6 (150-259)||(18824841-18824949)
chr6 (150-259)||(18840696-18840804)
chr6 (28-270)||(18397784-18398028)
chr6 (167-255)||(19609355-19609442)
chr6 (69-257)||(13015910-13016080)
chr6 (113-274)||(28195924-28196089)
chr6 (166-274)||(1651155-1651262)
chr6 (25-257)||(22867026-22867260)
chr6 (96-204)||(26088787-26088898)
chr6 (160-274)||(4989748-4989863)
chr6 (180-251)||(16301107-16301178)
chr6 (160-274)||(18824957-18825072)
chr6 (160-245)||(21776785-21776870)
chr6 (160-272)||(18843017-18843130)
chr6 (33-173)||(25903975-25904116)
chr6 (160-274)||(25174405-25174520)
chr6 (160-274)||(27655283-27655398)
chr6 (221-274)||(16827134-16827187)
chr6 (216-272)||(15861582-15861640)
chr6 (160-274)||(18004169-18004284)
chr6 (216-274)||(10487728-10487786)
chr6 (216-274)||(16377541-16377599)
chr6 (216-274)||(16384865-16384923)
chr6 (180-272)||(16239220-16239311)
chr6 (160-274)||(15736377-15736492)
chr6 (160-274)||(16230433-16230548)
chr6 (227-274)||(14627874-14627921)
chr6 (227-274)||(1554692-1554739)
chr6 (160-273)||(13622309-13622423)
chr6 (216-274)||(33315835-33315893)
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (25-259)||(9731740-9731974)
chr5 (33-274)||(17472809-17473051)
chr5 (25-273)||(28258451-28258699)
chr5 (26-274)||(20710986-20711235)
chr5 (33-274)||(1169583-1169824)
chr5 (35-274)||(4864117-4864355)
chr5 (33-274)||(16535155-16535396)
chr5 (25-274)||(19404431-19404680)
chr5 (25-274)||(24184273-24184524)
chr5 (25-259)||(110055-110290)
chr5 (29-259)||(11582847-11583078)
chr5 (44-274)||(21393038-21393268)
chr5 (36-274)||(21652472-21652713)
chr5 (33-259)||(11319-11545)
chr5 (33-259)||(10779261-10779487)
chr5 (33-259)||(29191702-29191928)
chr5 (33-259)||(23513768-23513996)
chr5 (33-259)||(27184794-27185022)
chr5 (33-259)||(1220811-1221039)
chr5 (33-259)||(18779072-18779300)
chr5 (96-274)||(21649679-21649860)
chr5 (33-255)||(4201045-4201269)
chr5 (35-271)||(24474439-24474666)
chr5 (33-274)||(22884372-22884611)
chr5 (33-259)||(11341607-11341831)
chr5 (120-274)||(11338021-11338177)
chr5 (84-274)||(23510837-23511028)
chr5 (68-259)||(25425590-25425784)
chr5 (28-269)||(23453806-23454051)
chr5 (28-269)||(23465311-23465556)
chr5 (118-259)||(22367650-22367792)
chr5 (33-186)||(23505665-23505821)
chr5 (167-255)||(7424653-7424740)
chr5 (74-274)||(35792230-35792432)
chr5 (160-274)||(11341484-11341599)
chr5 (33-259)||(25901405-25901633)
chr5 (160-257)||(19498764-19498861)
chr5 (216-274)||(27185086-27185144)
chr5 (33-270)||(21234591-21234832)
chr5 (160-274)||(11196-11311)
chr5 (160-274)||(110298-110413)
chr5 (216-274)||(1169914-1169972)
chr5 (160-274)||(25425467-25425582)
chr5 (216-274)||(21933535-21933593)
chr5 (216-274)||(21939705-21939763)
chr5 (216-274)||(35581099-35581157)
chr5 (216-274)||(37010539-37010597)
chr5 (221-274)||(11212980-11213033)
chr5 (216-272)||(23513648-23513704)
chr5 (160-274)||(1221047-1221162)
chr5 (160-274)||(9731982-9732097)
chr5 (160-274)||(10779495-10779610)
chr5 (160-274)||(21074805-21074920)
chr5 (160-274)||(22367800-22367915)
chr5 (160-274)||(29191936-29192051)
chr5 (216-274)||(4201338-4201396)
chr5 (216-274)||(43445126-43445183)
chr5 (69-186)||(20615549-20615669)
chr5 (33-149)||(37051960-37052077)
chr5 (227-274)||(7424525-7424572)
chr5 (227-274)||(11582724-11582771)
chr5 (227-274)||(18779377-18779424)
chr5 (237-274)||(25192390-25192427)
chr5 (165-274)||(5452007-5452117)
chr5 (216-274)||(20615460-20615518)
chr5 (216-274)||(25901698-25901756)
chr5 (28-65)||(19861291-19861328)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (25-259)||(18909657-18909891)
chr3 (25-259)||(53769628-53769862)
chr3 (35-274)||(318683-318924)
chr3 (25-274)||(22145335-22145585)
chr3 (28-274)||(12350907-12351155)
chr3 (25-274)||(50113197-50113443)
chr3 (35-274)||(16183081-16183320)
chr3 (25-274)||(8630694-8630942)
chr3 (25-274)||(11062096-11062347)
chr3 (33-253)||(13837733-13837952)
chr3 (25-274)||(13816360-13816608)
chr3 (69-274)||(15860253-15860458)
chr3 (33-274)||(15469538-15469779)
chr3 (25-274)||(11198630-11198882)
chr3 (25-274)||(12562536-12562788)
chr3 (38-256)||(17957301-17957520)
chr3 (26-274)||(14297346-14297595)
chr3 (26-274)||(14302973-14303222)
chr3 (85-274)||(19571893-19572082)
chr3 (25-259)||(7852778-7853015)
chr3 (25-274)||(35122534-35122785)
chr3 (33-259)||(22274012-22274238)
chr3 (33-259)||(2450291-2450517)
chr3 (25-274)||(16260038-16260283)
chr3 (69-259)||(51159475-51159667)
chr3 (35-259)||(33340813-33341037)
chr3 (122-274)||(47786041-47786194)
chr3 (25-274)||(53899581-53899833)
chr3 (38-274)||(6147918-6148152)
chr3 (32-274)||(17099562-17099804)
chr3 (33-252)||(16819882-16820102)
chr3 (113-274)||(17937344-17937505)
chr3 (25-274)||(19945474-19945727)
chr3 (96-274)||(23491353-23491535)
chr3 (33-274)||(14294277-14294519)
chr3 (33-274)||(14299904-14300146)
chr3 (33-252)||(49231189-49231409)
chr3 (25-255)||(17138342-17138575)
chr3 (26-272)||(40938581-40938829)
chr3 (25-187)||(17523530-17523694)
chr3 (33-274)||(25057694-25057939)
chr3 (28-274)||(39654761-39655012)
chr3 (106-195)||(54423001-54423090)
chr3 (166-274)||(15574888-15574995)
chr3 (166-274)||(15613907-15614014)
chr3 (160-274)||(33340690-33340805)
chr3 (216-274)||(8269657-8269714)
chr3 (216-274)||(8276768-8276825)
chr3 (162-251)||(10737388-10737476)
chr3 (216-274)||(16819753-16819811)
chr3 (216-274)||(51159731-51159789)
chr3 (160-274)||(2450525-2450640)
chr3 (160-274)||(22273889-22274004)
chr3 (164-274)||(44228274-44228383)
chr3 (109-191)||(12031151-12031233)
chr3 (33-154)||(54039595-54039717)
chr3 (209-274)||(2048908-2048972)
chr3 (113-274)||(11883403-11883567)
chr3 (158-219)||(14522483-14522544)
chr3 (209-274)||(19230907-19230971)
chr3 (160-274)||(17957531-17957646)
chr3 (160-274)||(49231061-49231174)
chr3 (216-274)||(1468908-1468966)
chr3 (117-191)||(2048969-2049043)
chr3 (109-191)||(19230968-19231050)
chr3 (96-160)||(38167010-38167075)
chr3 (160-274)||(7852655-7852770)
chr3 (160-274)||(15516594-15516709)
chr3 (160-274)||(18909534-18909649)
chr3 (160-274)||(53769505-53769620)
chr3 (229-274)||(12031249-12031294)
chr3 (216-274)||(16745424-16745481)
chr3 (113-154)||(54652855-54652896)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (24-274)||(237031-237284)
scaffold0009 (216-274)||(270971-271029)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (35-274)||(13048-13287)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (39-274)||(46975-47211)
scaffold0068 (39-274)||(60423-60659)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (28-274)||(1906-2152)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (25-274)||(44648-44897)
scaffold0034 (25-259)||(39180-39414)
scaffold0034 (150-274)||(39061-39184)
scaffold0034 (33-274)||(78401-78645)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (41-274)||(3472-3708)
scaffold0447 (41-105)||(8258-8322)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (41-274)||(6080-6316)
scaffold0383 (33-274)||(1360-1601)
scaffold0383 (216-274)||(1213-1271)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (27-274)||(255973-256221)
scaffold0011 (27-274)||(262579-262827)
scaffold0011 (69-274)||(75800-76005)
scaffold0011 (79-274)||(124409-124604)
scaffold0011 (69-186)||(193519-193637)
scaffold0011 (221-274)||(193461-193514)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (25-259)||(1431-1665)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (25-274)||(6396-6642)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (25-274)||(137875-138124)
scaffold0021 (25-274)||(87288-87526)
scaffold0021 (26-272)||(10517-10767)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (27-274)||(6425-6672)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (66-274)||(17503-17712)
scaffold0244 (35-274)||(23891-24131)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (33-274)||(95318-95559)
scaffold0044 (216-274)||(95170-95228)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (58-274)||(5704-5922)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (25-259)||(129355-129590)
scaffold0028 (80-259)||(89894-90074)
scaffold0028 (162-274)||(129232-129345)
scaffold0028 (160-274)||(90082-90197)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (41-274)||(145526-145763)
scaffold0025 (216-274)||(145379-145436)
scaffold0025 (109-193)||(147698-147782)
scaffold0025 (221-258)||(147655-147692)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (25-274)||(8282-8532)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (33-274)||(28881-29123)
scaffold0116 (216-274)||(28733-28791)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (68-274)||(23922-24128)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (28-274)||(7643-7891)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (33-274)||(188-432)
scaffold1734 (160-274)||(39-154)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (25-274)||(758-1009)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (41-274)||(18504-18743)
scaffold0234 (227-274)||(18843-18890)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (27-274)||(43023-43270)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (66-271)||(113662-113867)
scaffold0022 (25-274)||(108510-108761)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (38-274)||(52352-52587)
scaffold0018 (38-274)||(56304-56539)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (28-274)||(20240-20483)
scaffold0195 (28-274)||(18156-18399)
scaffold0195 (25-274)||(7716-7966)
scaffold0195 (25-274)||(13105-13355)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (33-259)||(155319-155545)
scaffold0023 (160-274)||(155553-155668)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (69-274)||(20403-20608)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (26-274)||(71515-71764)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (106-274)||(2937-3105)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (25-274)||(14328-14577)
scaffold0138 (160-274)||(28347-28462)
scaffold0138 (160-274)||(40343-40458)
scaffold0138 (160-273)||(28497-28610)
scaffold0138 (160-273)||(40493-40606)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (25-274)||(248604-248852)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (38-274)||(145775-146014)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (106-274)||(3509-3676)
[»] scaffold0269 (3 HSPs)
scaffold0269 (33-259)||(936-1164)
scaffold0269 (33-259)||(15192-15420)
scaffold0269 (33-154)||(12021-12143)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (106-274)||(32338-32504)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (106-274)||(40340-40506)
scaffold0078 (69-259)||(38329-38521)
scaffold0078 (160-274)||(38529-38644)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (96-271)||(54482-54658)
scaffold0032 (33-152)||(14503-14623)
scaffold0032 (163-274)||(109282-109394)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (33-259)||(6149-6375)
scaffold0003 (160-274)||(6026-6141)
scaffold0003 (209-274)||(216997-217061)
scaffold0003 (123-191)||(216932-217000)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (29-193)||(18263-18428)
scaffold0120 (188-270)||(30041-30123)
scaffold0120 (30-98)||(30144-30212)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (33-272)||(27873-28111)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (96-256)||(2157-2319)
scaffold0597 (216-274)||(2386-2444)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (25-179)||(53462-53614)
scaffold0066 (216-274)||(53154-53212)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (27-274)||(2520-2770)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (96-274)||(11057-11238)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (25-274)||(6742-6995)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (69-259)||(17619-17811)
scaffold0315 (221-274)||(17496-17549)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (114-259)||(2735-2881)
scaffold0761 (216-272)||(2945-3001)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (66-274)||(21508-21696)
scaffold0008 (109-193)||(129367-129451)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (25-274)||(2278-2531)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (190-270)||(14533-14613)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (25-274)||(475-707)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (162-259)||(1575-1671)
scaffold0310 (25-138)||(1322-1437)
scaffold0310 (160-259)||(1465-1565)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (33-274)||(310-554)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (25-154)||(5487-5617)
scaffold0750 (197-274)||(6577-6653)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (69-274)||(2680-2889)
scaffold0124 (197-274)||(22940-23016)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (158-274)||(32432-32549)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (171-274)||(59572-59675)
scaffold0051 (122-151)||(59673-59702)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (209-274)||(6397-6462)
scaffold0218 (123-186)||(6332-6395)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (215-274)||(34419-34478)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (209-274)||(27760-27825)
scaffold0162 (123-191)||(27696-27763)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (25-151)||(1752-1879)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (69-186)||(2089-2207)
scaffold1140 (221-274)||(2031-2084)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (216-274)||(41556-41614)
scaffold0132 (199-259)||(41678-41737)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (109-193)||(7890-7974)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (216-274)||(38132-38190)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (25-153)||(2202-2333)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (28-241)||(30010-30226)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (160-274)||(20558-20672)
scaffold0150 (160-274)||(27387-27501)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (230-272)||(4692-4734)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (109-193)||(4765-4849)
scaffold0266 (221-253)||(4855-4887)
[»] scaffold0141 (3 HSPs)
scaffold0141 (33-148)||(21623-21739)
scaffold0141 (69-270)||(25753-25958)
scaffold0141 (216-270)||(21498-21552)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (160-274)||(442-556)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (227-273)||(17356-17402)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (113-154)||(330958-330999)
scaffold0004 (28-65)||(188281-188318)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (232-272)||(406-446)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (160-274)||(23661-23776)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (209-251)||(40464-40505)
scaffold0106 (109-183)||(40510-40583)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (32-105)||(4860-4935)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37610470 - 37610216
Alignment:
Q  20 gtccggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattgtggtgacta 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610470 gtccggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattgtggtgacta 37610371  T
Q  120 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610370 ttcgtatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 37610271  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610270 cttgaatcggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 37610216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20480754 - 20480518
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20480754 atgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaa 20480655  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20480654 gttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatttgtgaaatta 20480555  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20480554 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 20480518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 19994222 - 19994461
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19994222 ttgtcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataacta 19994321  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  19994322 agtgaagttgtatgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaa-tggtgaa 19994420  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19994421 actatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 19994461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41245758 - 41245512
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  41245758 gtcttggga-ttgtcaaagttggccgtttgccactggacacg--ttttggctggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttt 41245662  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  41245661 tatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttg 41245562  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41245561 aa-tggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 41245512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25121640 - 25121391
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| |||||    
T  25121640 gtcttggga-ttgtcaatgttggtcgtttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattc 25121542  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25121541 ttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaatgtaagaaatgctt 25121442  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25121441 gaa-tggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaccttgttgattat 25121391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 22322498 - 22322736
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    |||||| ||||||||||||| || |  || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  22322498 ttgggatttgtcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattttta 22322597  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  22322598 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaa 22322697  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22322698 -tggtgaaaccacatgtgatagttgatgttgaatgacatt 22322736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 3432639 - 3432886
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3432639 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 3432738  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| | |  | |||||| | || | || |||||||    
T  3432739 tatatggctaagtgaa--tgtatgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatgag-aatgctt 3432835  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3432836 gaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 3432886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 70 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21680258 - 21680052
Alignment:
Q  70 tttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--gga 166  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||    
T  21680258 tttggtcggaaatgtttcttaaaccgattgtcttatgaattatcgagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttgga 21680159  T
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 266  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21680158 tatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 21680060  T
Q  267 ttgattat 274  Q
    ||||||||    
T  21680059 ttgattat 21680052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 20568326 - 20568576
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||    
T  20568326 gtcttgggatttgtcaatgttggccgtttaccacttgacacggtttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattct 20568425  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  20568426 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatg-t 20568523  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20568524 tgaaatggtgagactacatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattat 20568576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 20574519 - 20574769
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||    
T  20574519 gtcttgggatttgtcaatgttggccgtttaccacttgacacggtttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattct 20574618  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  20574619 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattaatatgatg-atatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatg-t 20574716  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  20574717 tgaaatggtgagactacatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattat 20574769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 16042096 - 16042346
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16042096 gtcttgggaattgtcaatgttggctgtttgccacttgacacgg-tcttggtcggaaatgtttcttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattct 16042194  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||| |||||||||||||  ||| | | || |||||| | |  || |||||||    
T  16042195 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaa--tatgaaatgc 16042292  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16042293 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 16042346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18611601 - 18611377
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  18611601 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgac 18611502  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  18611501 taagtgaagttgaatgagtgatta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaa-tggtg 18611405  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611404 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 18611377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 43374647 - 43374893
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||       
T  43374647 gtcttgggatttgttaatgttggccggtagccacttgacatggtttttagtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgta 43374746  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  43374747 tatataactaagtgaagatgt-tgaatggtta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 43374843  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43374844 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 43374893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21696661 - 21696411
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttga-gccaattgtcttataattgtggtgactattct 123  Q
    |||||| || || |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||| | | ||||||||||||  |  | |||||||||||    
T  21696661 gtcttgagagttatcaaggttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgttcatcgtgactattct 21696564  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  21696563 tacatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgct 21696464  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21696463 tgaaatggtgaaactatataaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 21696411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 13663556 - 13663799
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  13663556 aattatcaatgttggtcgtttgccgcatgatttggatttttgttggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 13663655  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  13663656 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaattgg 13663755  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13663756 tg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13663799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16417291 - 16417114
Alignment:
Q  94 caattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  16417291 caattgtcttatgaattatggagactattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcat 16417192  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16417191 gctaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgttga 16417114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 13722091 - 13722334
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | | || | | || ||||||||||||||    
T  13722091 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttatatgac 13722190  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |    
T  13722191 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaattag 13722290  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13722291 tg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13722334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 16040313 - 16040548
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16040313 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgg-tcttggtcggaaatgtttcttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattct 16040411  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||| |||||||||||||  ||| | | || |||||| | |  || |||||||    
T  16040412 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaa--tatgaaatgc 16040509  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040510 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 16040548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 260
Target Start/End: Original strand, 24930073 - 24930303
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  24930073 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttttcgaaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 24930172  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  24930173 taagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatccttgaaatgg 24930272  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaata 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930273 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaata 24930303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 24107582 - 24107774
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttgg 165  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  24107582 tttttgtcggaaatgtttcctttgaaccaatttccttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattgg 24107681  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107682 atatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 24107774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29759300 - 29759140
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  29759300 gtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatata 29759202  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29759201 aggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattat 29759140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 271
Target Start/End: Original strand, 22007555 - 22007792
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  22007555 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 22007654  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | || | || ||||||||||| ||||    
T  22007655 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaataggtg 22007753  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007754 -aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 22007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 20655083 - 20655332
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||  |||||    
T  20655083 gtcttgggatttatcaatgttgaccgtttaccacttgatacggttttggct-gaaaatgtttcttaagccgattgtcttatgaattattgtgatcattct 20655181  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20655182 tgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtatcttacttagaatgtaaggaatgct 20655281  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  20655282 tgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattgttgatt 20655332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 22908446 - 22908672
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||   || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||    
T  22908446 aattatcaatgttggccatttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt--tgagccaattgtcttgtgagttatggtgaccgttcttgtatgac 22908543  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  22908544 tacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaa-tgg 22908642  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22908643 tgaaactatatgtgatagttgatggtgaat 22908672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 79 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28836745 - 28836563
Alignment:
Q  79 aaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtg--ttggatatgatgtt 175  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | | || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |   ||||||||||||||    
T  28836745 aaatgtttctttagccaaatgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtt 28836646  T
Q  176 tatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836645 tatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 28836563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 272
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648747
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttg--g 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |    
T  20648541 ttttggccggaaatgtttcttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtatttttg 20648640  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  20648641 atatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacatt 20648740  T
Q  266 gttgatt 272  Q
    |||||||    
T  20648741 gttgatt 20648747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 24386838 - 24387019
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  || ||||||  |||||||||||  |||||    
T  24386838 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtat 24386937  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24386938 gctatcttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 24387019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Original strand, 24718530 - 24718727
Alignment:
Q  78 gaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgttt 176  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | | || | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24718530 gaaatgtttcttgagcaaattatcttgtgagttattgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatattt 24718629  T
Q  177 atcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24718630 gtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 24718727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 16874069 - 16874249
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16874069 attgtcttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtat 16874168  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| |||||| | || | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16874169 gctatattacttggaatatgag-aatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16874249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38532672 - 38532508
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||  ||    
T  38532672 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttataat 38532573  T
Q  210 gtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38532572 gtaataaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 38532508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 16406127 - 16406295
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| | ||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||  |    
T  16406127 gtcttgggttttgtcaatgttggccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtt 16406226  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16406227 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556874
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatg 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaatg 28556900  T
Q  211 taagaaatgcttgaattggtgaaact 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28556899 taagaaatgcttgaaatggtgaaact 28556874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 274
Target Start/End: Original strand, 17730615 - 17730774
Alignment:
Q  118 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaag 214  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  17730615 tattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaag 17730714  T
Q  215 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| ||||| | || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17730715 aaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattat 17730774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 270687 - 270581
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| || |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270687 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 270588  T
Q  265 tgttgat 271  Q
    |||||||    
T  270587 tgttgat 270581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Original strand, 645233 - 645339
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| || |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645233 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 645332  T
Q  265 tgttgat 271  Q
    |||||||    
T  645333 tgttgat 645339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Original strand, 830968 - 831074
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| || |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830968 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 831067  T
Q  265 tgttgat 271  Q
    |||||||    
T  831068 tgttgat 831074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24548174 - 24548067
Alignment:
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24548174 atatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacatt 24548076  T
Q  266 gttgattat 274  Q
    | |||||||    
T  24548075 gatgattat 24548067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22144255 - 22144136
Alignment:
Q  79 aaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgttta 177  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||  | | ||||||||||||||||    
T  22144255 aaatgtttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttgaatgagtgatta--tattttggatatgatgttta 22144158  T
Q  178 tcatgagatatgtatgctatct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22144157 tcatgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 259
Target Start/End: Original strand, 6775319 - 6775419
Alignment:
Q  159 gtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6775319 gtgttgaatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtgaaactatatgtgatagttgattttga 6775417  T
Q  258 at 259  Q
    ||    
T  6775418 at 6775419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 24107782 - 24107897
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107782 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 24107881  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  24107882 tgacattgttgattat 24107897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 16040612 - 16040670
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16040612 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 16040670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13722424 - 13722482
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13722424 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13722482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13722572 - 13722630
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13722572 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13722630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13722720 - 13722778
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13722720 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13722778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13722868 - 13722926
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13722868 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13722926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13723016 - 13723074
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13723016 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13723074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 24930366 - 24930424
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24930366 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 24930424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5237286 - 5237045
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  5237286 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 5237187  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  5237186 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 5237088  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  5237087 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 5237045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 24662312 - 24662553
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  24662312 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 24662411  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  24662412 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 24662510  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  24662511 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 24662553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28836555 - 28836440
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28836555 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 28836456  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  28836455 tgacattgttgattat 28836440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13663889 - 13663946
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13663889 aatgcttgaactggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 13663946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13723164 - 13723221
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723164 aatgcttgaactggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 13723221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 17151451 - 17151561
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151451 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 17151550  T
Q  259 taacattgttg 269  Q
    | |||||||||    
T  17151551 tgacattgttg 17151561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 16194983 - 16195047
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16194983 tgtaagaaatg-ttgaataggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattat 16195047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 6775427 - 6775542
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6775427 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggtatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 6775526  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  6775527 tgacattgttgattat 6775542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 272458 - 272516
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  272458 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 272516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 643391 - 643333
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  643391 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 643333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 829197 - 829139
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  829197 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 829139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 16194904 - 16194986
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  16194904 tgtggtggccatgcttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 700834 - 700884
Alignment:
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  700834 gaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattat 700884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Original strand, 224430 - 224471
Alignment:
Q  233 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  224430 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattat 224471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Original strand, 738053 - 738094
Alignment:
Q  233 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  738053 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattat 738094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Original strand, 861948 - 861989
Alignment:
Q  233 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  861948 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattat 861989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 259
Target Start/End: Original strand, 17151401 - 17151443
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151401 aatgcttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 17151443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 22908748 - 22908795
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22908748 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 22908795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43684558 - 43684504
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  43684558 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 43684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 273582 - 273501
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctt-ataattgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  273582 atgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatt 273501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Original strand, 642267 - 642348
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctt-ataattgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  642267 atgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatt 642348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 121
Target Start/End: Original strand, 828073 - 828154
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctt-ataattgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  828073 atgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatt 828154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15932458 - 15932327
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||  ||||||||| |||  || |||||||| |||||| || | | |||||||      
T  15932458 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatggatttt-atcggaaatgattcttttaagccaattatcttatgatatttcgtgactagc 15932360  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 154  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  15932359 cttatatgactaaacgaagatgtgtgaatgaat 15932327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18618060 - 18618028
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618060 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43684745 - 43684589
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  43684745 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 43684646  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat 186  Q
    ||||||| |||| ||||   | | ||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  43684645 taagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 43684589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38532759 - 38532727
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcct 57  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38532759 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgcct 38532727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Original strand, 5675677 - 5675918
Alignment:
Q  34 attgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgact 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  5675677 attgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataact 5675776  T
Q  133 aagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675777 aagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtga 5675876  T
Q  233 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675877 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 5675918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 20826184 - 20826418
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20826184 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 20826283  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20826284 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 20826383  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826384 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 20826418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 2422041 - 2422288
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttat 126  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  2422041 ttgggaaatgtcaatattggtcgtttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttat 2422140  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2422141 atgactaagtgaagttgtatgactgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttactcaggatgtaagaaatgcttgtat 2422240  T
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2422241 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgtcgattat 2422288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35053922 - 35053686
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    ||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  35053922 atgttggtcgatggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaa 35053823  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35053822 gttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaatta 35053723  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35053722 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 35053686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 22407262 - 22407512
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| |||||    
T  22407262 gtcttgggatttatcaatgttggtcggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattc 22407361  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22407362 ttatatgactaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgctt 22407461  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22407462 gaa-tggtgaaactaaatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 22407512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18506451 - 18506202
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||| || || ||||||||||  | | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  18506451 gtcttgagatttatcaatgttggttggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttt 18506352  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18506351 tatatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgctt- 18506253  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18506252 aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 18506202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21717298 - 21717051
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  21717298 gtcttgggatttatcaatgttggttgtttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttttttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattct 21717200  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21717199 tatatgacgaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 21717100  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    || || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21717099 aaatgttgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgatt 21717051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41211131 - 41210894
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||  |||||| ||||    
T  41211131 ttgtcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttttttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataacta 41211032  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41211031 agtgaagttgtatgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttgggatgtaagaaatgcttgaattggtg-a 41210933  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  41210932 actatatgtgatagttggcgttgaatgacattgttgatt 41210894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49966735 - 49966495
Alignment:
Q  34 attgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| |||||  ||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  49966735 attgtcaatgttggtcgtttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgac 49966636  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  49966635 taagtgaagttgtatgaatga-tgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 49966538  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49966537 aaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 49966495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15862514 - 15862750
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | | || | | || |||||||  ||||||||||    
T  15862514 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgcatgactaagt 15862613  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaact 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15862614 gaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaact 15862712  T
Q  237 atatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15862713 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 15862750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22353276 - 22353121
Alignment:
Q  118 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaa 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22353276 tattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 22353177  T
Q  218 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22353176 tgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgttgattat 22353121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 271
Target Start/End: Original strand, 9785328 - 9785555
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9785328 ttgtcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataacta 9785427  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    |||| ||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  9785428 agtgtagttgtatgaatgaat----------gatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaa 9785517  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9785518 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 9785555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Original strand, 44036058 - 44036217
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  44036058 gtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatata 44036156  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44036157 aggaatg-ttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 44036217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Original strand, 27330921 - 27331087
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 205  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||  |||    
T  27330921 aattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgcta--ttgatta 27331018  T
Q  206 ggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27331019 gaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 27331087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 35523486 - 35523738
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||| | || | ||||  |||||    
T  35523486 gtcttgggatttatcagtgttggccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgtttcttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattct 35523585  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    
T  35523586 tgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtt 35523685  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||  | ||||||||||||||    
T  35523686 tgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgggtgacattgttgattat 35523738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 20894765 - 20895010
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||| || ||||||| |||| ||| || |||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||       
T  20894765 gtcttgggatttgtcaatgtttgccggtagccacttgccatggtttttcgtcgaaaacgtctctttaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgta 20894864  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||    
T  20894865 tatataactaagtgaagttgtatgaatga----ttgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttacttaaaatgtaagaaatgtttg 20894960  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20894961 aattcgtgaaactatatgtgatagttgatg-tgaatgatattgttgattat 20895010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Original strand, 22250031 - 22250268
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  22250031 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt-ctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 22250129  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||    
T  22250130 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaattggtg 22250228  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22250229 -aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatt 22250268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41218542 - 41218312
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || | || || || ||| ||||      
T  41218542 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtcaccatacttgtatgga 41218443  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 41218344  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataaca 263  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41218343 aaactatatgtgattgttgatgtagaataaca 41218312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Original strand, 51657467 - 51657631
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggat 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| ||    
T  51657467 gtgactgttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaat 51657566  T
Q  210 gtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51657567 gtaaccaatgcttgaaatggtgaaaatatatgaggtggttgatgttgaatgacattgttgattat 51657631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 20956038 - 20956276
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttataat-tgtggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| || ||||  | | | ||||||||||    
T  20956038 gtcttgggaattatcgatgttggccgtttgccacttgatacggtatttg-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgttttatgttctatcgtgactattc 20956136  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| |||| ||||||     
T  20956137 ttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaata 20956236  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20956237 cttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaat 20956276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17147806 - 17147626
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17147806 attgtcttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtat 17147707  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| |||||| | || | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17147706 gctatattacttggaatatgag-aatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 17147626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22365844 - 22365601
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||| ||    
T  22365844 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgaatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtattac 22365745  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||| | || | |  |||||||| | || | |||| |||||||||||    
T  22365744 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaattg 22365646  T
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22365645 gtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 22365601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21858513 - 21858402
Alignment:
Q  162 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataa 261  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21858513 ttggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgttagaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 21858415  T
Q  262 cattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||    
T  21858414 cattgttgattat 21858402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45050635 - 45050528
Alignment:
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45050635 atatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacatt 45050537  T
Q  266 gttgattat 274  Q
    | |||||||    
T  45050536 gatgattat 45050528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Original strand, 7641803 - 7641912
Alignment:
Q  164 ggatatgatgtttatcatgagatatgtat-gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataac 262  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | | | |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641803 ggatgtgatgattatcatgagatgtattttgctatcttacttggaatgtgagaa-tgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 7641900  T
Q  263 attgttgattat 274  Q
    ||||||||||||    
T  7641901 attgttgattat 7641912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 18060869 - 18060926
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18060869 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 18060926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22353031 - 22352974
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22353031 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 22352974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20527028 - 20526964
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20527028 tgtaagaaatg-ttgaataggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 20526964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20253500 - 20253384
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||    
T  20253500 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagctatggtgactattcttatatgac 20253401  T
Q  132 taagtgaagttgtatga 148  Q
    |||| ||||||| ||||    
T  20253400 taagcgaagttgaatga 20253384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 37845640 - 37845722
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37845640 tgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20444656 - 20444592
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20444656 tgtaagaaatg-ttgaataggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattat 20444592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20530421 - 20530357
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20530421 tgtaagaaatg-ttgaataggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattat 20530357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 37845719 - 37845783
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37845719 tgtaagaaatg-ttgaataggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 37845783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20930464 - 20930380
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatg 193  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20930464 tgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17003724 - 17003666
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17003724 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 17003666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20444735 - 20444653
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20444735 tgtggtgactatgtttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20530500 - 20530418
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20530500 tgtggtgactatgtttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27673936 - 27673696
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgactaa 134  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||||   |||||||| |||||| || | | |||||||  ||| |||||||||    
T  27673936 tcaaagttggtcgtttgccacttgatacggtttta--tcggaaatggttcttttaagccaattatcttatgatctttcgtgactagccttgtatgactaa 27673839  T
Q  135 gtgaagttgtatgaatgaataatt--gtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
     || || ||| |||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| | |||||||| | || | ||||||| ||| | || ||    
T  27673838 atggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgtcgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgattggagtgatg 27673739  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  27673738 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatatggttgattat 27673696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 51451702 - 51451546
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  51451702 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 51451603  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat 186  Q
     ||||||||||||||||| || | ||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  51451602 caagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 51451546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 20826426 - 20826541
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20826426 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 20826525  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  20826526 tgacattgttgattat 20826541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20527106 - 20527025
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20527106 tgtggcgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41393343 - 41393296
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41393343 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 41393296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 22836478 - 22836555
Alignment:
Q  197 tcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22836478 tcttacttagaatgtgagaaacacttgaaatggaaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattat 22836555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 51451509 - 51451461
Alignment:
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  51451509 tgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 51451461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16521885 - 16521635
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16521885 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 16521786  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16521785 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 16521686  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16521685 aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16521635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 15273714 - 15273948
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15273714 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 15273813  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15273814 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 15273913  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15273914 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15273948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33739362 - 33739112
Alignment:
Q  24 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||     
T  33739362 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatatttcttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccattt 33739263  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33739262 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgctt 33739163  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33739162 gaa-tggtgaagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 33739112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 12900831 - 12901083
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataatt-gtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||     
T  12900831 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattca 12900930  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12900931 tgtatgactaattgaagttgtataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 12901030  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  12901031 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatgatattgttgattat 12901083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 45460018 - 45460267
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  45460018 gtcttgggatttatcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattct 45460117  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45460118 tatatgactaagtgaagttgtatgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 45460217  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45460218 aa-tggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 45460267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 21960630 - 21960879
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||| |    
T  21960630 gtcttgagaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttt 21960729  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  21960730 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaatgtatggaatgcttg 21960829  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21960830 aa-tggtgaaactatatgtaatagttgatgttaaatgacattgttgattat 21960879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44055006 - 44054769
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaag 135  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  44055006 tcaatgttggccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaag 44054907  T
Q  136 tgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaac 235  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  44054906 tgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaa-tggtgaagc 44054808  T
Q  236 tatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44054807 taaatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 44054769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 7133403 - 7133631
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||  |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7133403 gtcttgggaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaacatttcttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattct 7133502  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7133503 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctt 7133602  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7133603 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 7133631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 271
Target Start/End: Original strand, 54119334 - 54119580
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | | || ||||||| |||||    
T  54119334 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatatttcttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattct 54119433  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  54119434 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttg 54119532  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54119533 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaatgacattgttgat 54119580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 5683823 - 5684064
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  5683823 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 5683922  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  5683923 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 5684021  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5684022 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 5684064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44345905 - 44345675
Alignment:
Q  44 ttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagtt 142  Q
    ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  44345905 ttggccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtt 44345806  T
Q  143 gtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 242  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||||    
T  44345805 gtatgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaa-tgttgaaactatatgt 44345707  T
Q  243 gatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44345706 gatagttgatgttgaatgacattgttgattat 44345675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 821175 - 821423
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    |||||| || || |||||||| |||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| |||||    
T  821175 gtcttgagatttatcaatgttcgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattc 821272  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  821273 ttatatgaccaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatactt 821372  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  821373 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 821423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9294729 - 9294493
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt--gagccaattgt-cttataat-tgtggtgactat 120  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||  || |||||| | ||||| || | | ||||||||    
T  9294729 gtcttggaaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaatttttcttatgatctatcgtgactat 9294631  T
Q  121 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  9294630 ccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgc 9294531  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9294530 ttgaa-tggtgaaactatatgtgataattgatgttgaat 9294493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 23270991 - 23271235
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttat 126  Q
    |||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  23270991 ttggaaattatcaaagttggtcgtttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt-cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttat 23271088  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||     
T  23271089 atggctaagtgaagttgtatgaatggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaaa 23271187  T
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23271188 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattat 23271235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 19698433 - 19698657
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19698433 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgac 19698532  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  19698533 taagtgaagttgaatgagtgatta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaa-tggtg 19698629  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698630 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 19698657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 19709018 - 19709242
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19709018 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgac 19709117  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||    
T  19709118 taagtgaagttgaatgagtgatta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaa-tggtg 19709214  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709215 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 19709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18247382 - 18247156
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  18247382 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 18247283  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  18247282 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 18247184  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247183 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 18247156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 251
Target Start/End: Original strand, 55377654 - 55377873
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| || |||||||||| | | || | ||||| |||||||||||||    
T  55377654 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgac 55377753  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55377754 taagtgaagttgtaaaattgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtg 55377853  T
Q  232 aaactatatgtgatagttga 251  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  55377854 aaactatacgtgatagttga 55377873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 18294086 - 18294330
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||| ||    
T  18294086 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataac 18294185  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttg--gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |    
T  18294186 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatcg 18294285  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18294286 tgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattat 18294330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10643279 - 10643034
Alignment:
Q  26 tcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||| || |||| ||| ||| || | ||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
T  10643279 tcttgggatttgttaatgttggccggtagccactagacatggtatttagtggaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgttt 10643180  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttga 224  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||   ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10643179 atataactaagtgaagatgt-tgaatcgtta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttga 10643083  T
Q  225 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10643082 a-tggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 10643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19999623 - 19999372
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||  |||  |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19999623 gtcttgggaattgccaatgttggtcgtttgccacttgacacgatctttggtcaaaaacatttcttgaactaactgtcttatgaattgtggtgactattct 19999524  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||| | || | |||| || ||    
T  19999523 tatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgttt 19999424  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19999423 ggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 19999372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13245502 - 13245297
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||||  |||  |||||| ||||||||||  |||||||||| || ||| | ||||||    
T  13245502 ttttagtcggaaatgtttctcgaaccaattgtcttaagaattatggtggttatgtttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggat 13245403  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  13245402 atgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgt 13245304  T
Q  268 tgattat 274  Q
    |||||||    
T  13245303 tgattat 13245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Original strand, 30233611 - 30233854
Alignment:
Q  32 gaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatat 128  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||   || |||||  ||||| |||||| |||  || ||||||||    
T  30233611 gaattatcaacgtcggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatat 30233708  T
Q  129 gactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattg 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||    
T  30233709 gactaagtaaatttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatg 30233808  T
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30233809 gcgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 30233854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26679226 - 26679007
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| |||||||||||    
T  26679226 tcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagt 26679127  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaa 234  Q
    |||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  26679126 gaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtgaaa 26679028  T
Q  235 ctatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26679027 ctatatgtgatagttgatgtt 26679007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 25120273 - 25120425
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25120273 gtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaatgattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgta 25120371  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 266  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25120372 aggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattg 25120425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18167986 - 18167766
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| |||| |    
T  18167986 aattatcaatgttggccgtttgccatatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatggc 18167887  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  18167886 taagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggt 18167788  T
Q  231 gaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18167787 gaaactatatgtgatagttgat 18167766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 18251016 - 18251232
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  18251016 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 18251115  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| | |    
T  18251116 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaa-tag 18251214  T
Q  230 tgaaactatatgtgatag 247  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  18251215 tgaaattatatgtgatag 18251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 255
Target Start/End: Original strand, 22355525 - 22355749
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |  ||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | || | |||| ||||||| |||||     
T  22355525 aattatcaatgttggccgtttgccacaggatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgccttgtgagttattgtgattattcttgtatgat 22355624  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||    
T  22355625 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctt-agatgg 22355723  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22355724 tgaaactatatgtgatagttgatgtt 22355749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 53705882 - 53706101
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||| | ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  53705882 ttgtcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttttagtcggaaatgtttctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataacta 53705981  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |                     |||||||||| |||||||||||||    
T  53705982 agtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgt---------------------gtaagaaatgtttgaattggtgaa 53706060  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53706061 actatatgtgatagttggtgttgaatgacattgttgattat 53706101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 274
Target Start/End: Original strand, 18109813 - 18110014
Alignment:
Q  76 cggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgat 172  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||    
T  18109813 cggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgat 18109912  T
Q  173 gtttatcatgagata-tgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
     ||||| |||||||| ||| | |  | |||||| | || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18109913 atttataatgagatattgttttccctattacttggaatatga-taatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgat 18110011  T
Q  272 tat 274  Q
    |||    
T  18110012 tat 18110014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 8873622 - 8873771
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    ||||||||||||| | |||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||||||    
T  8873622 tcaatgttggccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagt 8873721  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat 186  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8873722 gaagttatatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagat 8873771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212415
Alignment:
Q  150 tgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 249  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 15212425  T
Q  250 gatgttgaat 259  Q
    ||||||||||    
T  15212424 gatgttgaat 15212415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14995241 - 14995042
Alignment:
Q  77 ggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatg 173  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||     
T  14995241 ggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgata 14995142  T
Q  174 tttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    ||||||||||||| | || | |  |||||||| | || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995141 tttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 14995044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 13810678 - 13810929
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataattg-tggtgactatt 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||   || |||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13810678 gtcttggggattatcaatgttggtcgtttgtcacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactatt 13810775  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  13810776 cttatatgactaagtgaagttgtatggatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttcttttacttagaatgtaagaaat 13810875  T
Q  219 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    ||||||| || | ||| ||| |  | |||| |||||||||| || |||||||||    
T  13810876 gcttgaaatgataaaattatctcaggtagtggatgttgaatgacgttgttgatt 13810929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 18495602 - 18495717
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18495602 tgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaa 18495701  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  18495702 tgacattgttgattat 18495717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 191
Target Start/End: Original strand, 53908881 - 53909031
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattgtggtgactattcttatatgactaa 134  Q
    ||||||||||||| || | | | ||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||      ||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  53908881 ttgtcaatgttggtcggtggtcacttgatatgatttttggtcggaaaggtttcttgaaccaattgt------attgtggtggctatgtttatataactaa 53908974  T
Q  135 gtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53908975 gtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288193
Alignment:
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtgaaactatatttgatagttgatgtt 15288193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295303
Alignment:
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 15295303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19019653 - 19019506
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacgg-tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19019653 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttttgtcggaaatgtttctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatga 19019554  T
Q  131 ctaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  19019553 ctaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9294485 - 9294370
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9294485 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatattagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 9294386  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  9294385 taacattgttgattat 9294370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 5684155 - 5684213
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5684155 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 5684213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 18294420 - 18294478
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18294420 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 18294478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8044165 - 8044108
Alignment:
Q  215 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8044165 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 8044108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8373315 - 8373200
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373315 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 8373216  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||| ||||    
T  8373215 tgacattgttggttat 8373200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18247148 - 18247033
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18247148 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttaggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 18247049  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  18247048 tgacattgttgattat 18247033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34393952 - 34393901
Alignment:
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393952 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 34393901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 7133702 - 7133760
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7133702 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 7133760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14950923 - 14950865
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14950923 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 14950865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15212404 - 15212312
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212404 gatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctaaga-acttagaatgtaaggaatgcttgaatag-tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15212312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34394158 - 34394045
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||| | || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34394158 tgttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaa 34394060  T
Q  259 taacattgttgatta 273  Q
    | |||||||||||||    
T  34394059 tgacattgttgatta 34394045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9794395 - 9794311
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 152  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9794395 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtaagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 9794311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10487761 - 10487520
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  10487761 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 10487662  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  10487661 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 10487563  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  10487562 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 10487520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16328990 - 16329231
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  16328990 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 16329089  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  16329090 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 16329188  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  16329189 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 16329231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18167695 - 18167637
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18167695 aatggttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 18167637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110393
Alignment:
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagat 110393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15212304 - 15212189
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | | ||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15212304 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgataaatgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 15212205  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  15212204 tgacattgttgattat 15212189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212557
Alignment:
Q  150 tgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactt 204  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactt 15212557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 110380 - 110327
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  110380 ttgaatagatgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 110327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 15273956 - 15274071
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15273956 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 15274055  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  15274056 tgacattgttgattat 15274071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47356223 - 47356173
Alignment:
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47356223 gaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattat 47356173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Original strand, 22355817 - 22355871
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22355817 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttga 22355871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26678938 - 26678880
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26678938 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattat 26678880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 15288274 - 15288321
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15288274 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 15288321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 15295384 - 15295431
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15295384 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 15295431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8373355 - 8373323
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373355 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 8373323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8373684 - 8373569
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  8373684 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcgaagatgttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgac 8373586  T
Q  132 taagtgaagttgtatga 148  Q
    |||| | ||||| ||||    
T  8373585 taagcggagttgaatga 8373569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 274
Target Start/End: Original strand, 8873770 - 8873805
Alignment:
Q  239 atgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8873770 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 8873805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 274
Target Start/End: Original strand, 53909047 - 53909081
Alignment:
Q  240 tgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53909047 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 53909081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15043898 - 15043789
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||| | || | ||||||  ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||    
T  15043898 gatatgatatttatcataagatgtttatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatat 15043799  T
Q  265 tgttgattat 274  Q
    || |||||||    
T  15043798 tgatgattat 15043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Original strand, 15110526 - 15110635
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    |||||||| |||||||| |||| | |||| | |||||||| | || | ||||||  ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||    
T  15110526 gatatgatatttatcataagatgtttatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatat 15110625  T
Q  265 tgttgattat 274  Q
    || |||||||    
T  15110626 tgatgattat 15110635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13506
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  13256 gtcttgggaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgtttcttgagccaattgttttatgaattgtggagactattct 13355  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13356 tatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 13455  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13456 aattggtgaaactaaatgtgatagttgatgtggaataacattgttgattat 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 369987 - 369737
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  369987 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 369888  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  369887 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 369788  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  369787 aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaaggacattgttgattat 369737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 142731 - 142478
Alignment:
Q  24 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||    
T  142731 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattc 142632  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  142631 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgt 142532  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142531 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 142478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3894195 - 3893943
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || || |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3894195 gtcttgggatttatccatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattct 3894096  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3894095 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 3893996  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3893995 tgaagtggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 3893943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47288875 - 47288625
Alignment:
Q  24 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||| |||     
T  47288875 ggtcttgggagttgtcaatgtttgccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttttttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccattt 47288776  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  47288775 ttatataaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgctt 47288676  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47288675 gaa-tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 47288625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2027764 - 2027530
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2027764 gtcttggaaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 2027665  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  2027664 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaatgtaagaaatg-ttg 2027566  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027565 agttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 2027530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 112375 - 112611
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  112375 atgttggccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaa 112474  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  112475 gttgtacgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgatttggtgaaacta 112574  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  112575 tatgtgatagttgatgttgaatgacactgttgattat 112611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12753980 - 12753731
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataatt-gtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||  |||||    
T  12753980 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgtttcttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattct 12753882  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12753881 tatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaatgtaaataatgcttg 12753782  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12753781 aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattat 12753731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 14252255 - 14252490
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||  |||||||||| ||||      
T  14252255 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgt 14252354  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14252355 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgctt 14252454  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14252455 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 14252490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 12544777 - 12545026
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||| || || |||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  12544777 gtcttgagatttatcaatgttggtcggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattct 12544876  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  12544877 tatatgactaggtgaagttgtattattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttac-tagaatgtaatgaatgcttg 12544975  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12544976 aaatggtgaaactatatttgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 12545026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15851417 - 15851176
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  15851417 aattatcaatgttggctgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 15851318  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  15851317 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 15851219  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15851218 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 15851176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 15823469 - 15823720
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggt-ttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactatt 121  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||| || ||||  | | | |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||| |||||||||    
T  15823469 gtcttgggatttattaatgttggccgttttccacttggtatgttgttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactatt 15823568  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15823569 cttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataagatatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 15823668  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15823669 tgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattat 15823720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 274
Target Start/End: Original strand, 39047798 - 39048005
Alignment:
Q  68 tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttgga 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39047798 tttttagtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttgga 39047897  T
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 266  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39047898 tatgatatttatcatgagatgtgtatgctattatacttataaagtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatggcattg 39047997  T
Q  267 ttgattat 274  Q
    ||||||||    
T  39047998 ttgattat 39048005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11286311 - 11286063
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||  || |||||| |||||   || |||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  11286311 ttgggaattgtcaatgttggtcggttgccacttgacacggacttta-tcagaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgactattctt 11286213  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  11286212 atatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatataaggaatgattga 11286113  T
Q  225 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11286112 aatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattat 11286063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 12249175 - 12249426
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||| |||| || ||||  | | | |||||||||||    
T  12249175 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacg-ttttgggttggaaatgtaccttgagtcaatggttttatgttctatcgtgactattct 12249273  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
     |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12249274 catatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgct 12249373  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12249374 tgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 12249426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 13867136 - 13867388
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttat-aattgtggtgactatt 121  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| |||| | |||| ||||    
T  13867136 gtcttgggatttatcaatgttggtcgtttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattatt 13867235  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||     
T  13867236 cttatatgaccaa-tgaagttgtatgaatgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaatgtaaggaatt 13867334  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13867335 cttgaa-tgatgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattat 13867388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44864299 - 44864096
Alignment:
Q  68 tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttgga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |  ||    
T  44864299 tttttggtcggaaatgtttcttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatgaaagaatgattgtatgcga 44864200  T
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44864199 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatacttgaa-tggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 44864101  T
Q  267 ttgat 271  Q
    |||||    
T  44864100 ttgat 44864096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36051759 - 36051513
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||       
T  36051759 gtcttgggatttgttaatgttggccggtagccacttgacatggtttttagtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgta 36051660  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36051659 tatataactaagtgaagatgt-tgaatggtta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 36051563  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36051562 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 36051513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7292052 - 7291826
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| | | || |||||||  ||||| ||||||    
T  7292052 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt--tgagccaattgtcttgtgagttatggtgaccgttcttgtatgac 7291955  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  7291954 tacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tgg 7291856  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7291855 tgaaactatatgtgttagttgatgttgaat 7291826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 45453322 - 45453570
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataatt-gtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  45453322 gtcttgggatttatcaatgttggtcggttgccacttgatacggtttttggtcggaa-tgtt-cttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattct 45453419  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt-ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | || |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  45453420 tatatgactaagtaaagttgtatgaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaatgtaaggaatgctt 45453519  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45453520 gaa-tgggaaaattatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 45453570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 32495518 - 32495746
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  32495518 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 32495617  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  32495618 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgga-tgg 32495716  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32495717 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 32495746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Original strand, 26071427 - 26071580
Alignment:
Q  121 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  26071427 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgc 26071526  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26071527 ttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 26071580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Original strand, 26095214 - 26095367
Alignment:
Q  121 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  26095214 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgc 26095313  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26095314 ttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 26095367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 252
Target Start/End: Original strand, 15952061 - 15952280
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  15952061 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 15952160  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  15952161 taagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 15952259  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgat 252  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15952260 aaactatatgtgatagttgat 15952280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16417663 - 16417437
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |   || | | || ||||||| ||||||    
T  16417663 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaagttgtcttgtgggttattgagattattcttgtatgac 16417564  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  16417563 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 16417465  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417464 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 16417437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 2191609 - 2191860
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2191609 gtcttgggaattgtcaatgttggccgcttgtcacttgacacggtctt-ggtcagaaatgtttcttgatctaattgtcttatgaattgtggtgaccattct 2191707  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagata-tgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |  | |||||| | || | |  |||||    
T  2191708 tttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatgagatattgttttccctattacttggaatatga-taatgc 2191806  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2191807 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattat 2191860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 125836 - 125676
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  125836 gtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgta 125738  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  125737 aggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattat 125676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13273852 - 13273603
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||| ||| | | ||||   ||||| |||| | |||||||||||||    
T  13273852 ttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattctta 13273755  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  13273754 tatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgctt 13273655  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13273654 gaaatggtaaaactatatgagttagttgatgttgaattacattgttgattat 13273603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 7285270 - 7285508
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaa-ttgtcttataat-tgtggtgactat 120  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||  |||| |||| || |||||| || | | ||||||||    
T  7285270 gtcttggaaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacagtttttg-tcagaaatgtttcctttgaaccaaattttcttatgatctatcgtgactat 7285368  T
Q  121 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaat 218  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || | ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7285369 ccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaat 7285468  T
Q  219 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285469 gcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 7285508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 255
Target Start/End: Original strand, 13912076 - 13912300
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  13912076 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 13912175  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  13912176 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tag 13912274  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13912275 tgaaactatatgtgatagttgatgtt 13912300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15629882 - 15629631
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttataattg-tggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||| ||| |||  | ||||| |||  | ||||||||||    
T  15629882 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattc 15629785  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat-tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||||||  || | ||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  15629784 ttatatgactaagtgaagtggtatgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgc 15629685  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15629684 ttgaaatgataaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattat 15629631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 49048856 - 49049106
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtt-tcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  ||| |||||||| | |||||  |   |  |||| |||| | ||||||||||||    
T  49048856 cttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggattt--gtcagaaatgttcttttgaggaatccggattatgaattatcgtgactattctt 49048953  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataatt--gtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  49048954 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgct 49049053  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  49049054 tgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattgttaattat 49049106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11515428 - 11515200
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | | || ||||||| ||||||    
T  11515428 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgagattattcttgtatgac 11515329  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  11515328 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tag 11515230  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515229 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 11515200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 16571153 - 16571403
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| || ||||||| | ||  | | | || | ||||||    
T  16571153 gtcttggaaattatcaatgttggcagtttgccacttgatacggtttt-ggtcgggaatgttcctttagtcaattgtttcatgttctatagtaaatattct 16571251  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  16571252 tatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaa-tgct 16571350  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16571351 tgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 16571403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16594509 - 16594259
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| || ||||||| | ||  | | | || | ||||||    
T  16594509 gtcttggaaattatcaatgttggcagtttgccacttgatacggtttt-ggtcgggaatgttcctttagtcaattgtttcatgttctatagtaaatattct 16594411  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  16594410 tatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaa-tgct 16594312  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16594311 tgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 16594259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 18981041 - 18981221
Alignment:
Q  98 tgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgc 194  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  18981041 tgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgc 18981140  T
Q  195 tatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaataacattgttgattat 274  Q
     |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18981141 catcttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattat 18981221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15926466 - 15926214
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15926466 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacatggtctttggtcgaaaatgtttcttgaactaattgtcttacaatttgtggtgactattct 15926367  T
Q  124 tatatgactaagtga-agttg--tatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagata-tgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    |||||| ||| |||| |||||  ||||||||  ||  | ||||||||||| |  || |||||||||| |||||| | |||||| | | || | |||| ||    
T  15926366 tatatggctatgtgatagttgattatgaatggtta--tatgttggatatgttaattttcatgagatattgtatgttctcttacatggaatatgagaattg 15926269  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15926268 tttggagtggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 15926214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13757608 - 13757428
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13757608 attgtcttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtat 13757509  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| |||||| | || | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13757508 gctatattacttggaatatgag-aatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13757428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Original strand, 1937975 - 1938085
Alignment:
Q  162 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1937975 ttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 1938072  T
Q  262 cattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||    
T  1938073 cattgttgattat 1938085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 10861905 - 10862157
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc-ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || | | |||||||| |    
T  10861905 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtactt-gtcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatcc 10862003  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | | ||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||| |||| ||||||     
T  10862004 ttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtgagaaata 10862103  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10862104 cttgaaatggtaaaactatatg-aatagttgatgttgaatgatattgttgattat 10862157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 250
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285603
Alignment:
Q  150 tgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 249  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 7285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35093902 - 35093783
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  35093902 ttgtcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataacta 35093803  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaa 153  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35093802 agtgaagttgtatgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 13038355 - 13038420
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13038355 tgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13038420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 11581972 - 11582156
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  11581972 ttttagtcgggattgtttctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggat 11582071  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    || ||||||||||||| || |                     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11582072 ataatgtttatcatgaaatgt---------------------gtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 11582149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16210806 - 16210629
Alignment:
Q  77 ggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtt 175  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||  || ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  16210806 ggaaatatttctcgaaccaattgtcttaagaaatgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatt 16210707  T
Q  176 tatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||                     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16210706 tatcatgagatgtgt---------------------aagaaatgtttgaattggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Original strand, 16480027 - 16480120
Alignment:
Q  159 gtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16480027 gtgttgaatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctcgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 16480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 184
Target Start/End: Original strand, 13038243 - 13038351
Alignment:
Q  77 ggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtt 175  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||  || ||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  13038243 ggaaatatttctcgaaccaattgtcttaagaaatgtggtggctatgtttgtataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtt 13038342  T
Q  176 tatcatgag 184  Q
    |||||||||    
T  13038343 tatcatgag 13038351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 15442628 - 15442869
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  15442628 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 15442727  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  15442728 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 15442826  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  15442827 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 15442869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 32495810 - 32495868
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32495810 aatgcttaaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 32495868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 30263193 - 30263349
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  30263193 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 30263292  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat 186  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  30263293 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 30263349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7291818 - 7291703
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7291818 tgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 7291719  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  7291718 tgacattgttgattat 7291703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 15952295 - 15952410
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15952295 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 15952394  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  15952395 tgacattgttgattat 15952410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16417429 - 16417314
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16417429 tgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 16417330  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  16417329 tgacattgttgattat 16417314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7821828 - 7821770
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7821828 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 7821770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7829139 - 7829081
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7829139 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 7829081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 27102806 - 27102864
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27102806 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 27102864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 27110154 - 27110212
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27110154 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 27110212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27175520 - 27175462
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27175520 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 27175462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 38784898 - 38784956
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38784898 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 38784956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 16480135 - 16480250
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16480135 tgttggatatgatatttgtcatgtgatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 16480234  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  16480235 tgacattgttgattat 16480250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058964
Alignment:
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgaga 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgaga 3058964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 13912369 - 13912427
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13912369 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattat 13912427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3048756 - 3048691
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt 160  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3048756 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgt 3048691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3058950 - 3058897
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  3058950 ttgaatagatgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatactgttgattat 3058897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 9057702 - 9057937
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattctt 124  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||  ||||||||| |||  || |||||||| |||||| || | | |||||||  |||    
T  9057702 ttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatggatttt-atcggaaatgattctgttaagccaattatcttatgatctttcgtgactagcctt 9057800  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgt-tggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||  || | | | ||||||||  ||||||| ||||  |||||| | |||||||| | || | ||||||  ||    
T  9057801 atatgactaaatgaaaatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatacttatcataagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaataatt 9057900  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    | | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  9057901 ggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaat 9057937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11515126 - 11515094
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515126 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 11515094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2027454 - 2027407
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2027454 tggtgaaactatatgatatagttgatgttcaatgacattgttgattat 2027407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 15761636 - 15761683
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  15761636 tggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgggtaaaattgttgattat 15761683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 26010458 - 26010505
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26010458 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgtggattat 26010505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9610377 - 9610157
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| | || ||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||||| || | |  ||||||      
T  9610377 gtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccaattgatatggatttt-atcggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgatctttcttgactagc 9610279  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgt-tggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || | | | |||||||| ||||||||  |||  |||||| | |||||||| | |||| ||||||     
T  9610278 cttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatatttatcatatgatgttgtatgttctcttacttggaatgtgagaaata 9610179  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatg 241  Q
     ||| | |||||||||||||||    
T  9610178 tttggactggtgaaactatatg 9610157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9837949 - 9837729
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| | || ||||  ||||||||| |||  || ||||||||||||||| || | |  ||||||      
T  9837949 gtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccaattgatatggatttt-atcggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgatctttcttgactagc 9837851  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgt-tggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || | | | |||||||| ||||||||  |||  |||||| | |||||||| | |||| ||||||     
T  9837850 cttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgatatgatatttatcatatgatgttgtatgttctcttacttggaatgtgagaaata 9837751  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatg 241  Q
     ||| | |||||||||||||||    
T  9837750 tttggactggtgaaactatatg 9837729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11515029 - 11514971
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  11515029 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattat 11514971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 30263380 - 30263438
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30263380 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattat 30263438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 16920981 - 16921018
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttga 62  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16920981 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttga 16921018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Original strand, 12803 - 13053
Alignment:
Q  24 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| |||     
T  12803 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccattt 12902  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  12903 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgctt 13002  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13003 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 422 - 174
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  422 gtcttgggatttatcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgttttttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattct 323  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| |||    
T  322 tatgtgactaagtgaatttgtatgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttac-tagaatgtaatgaatg-ttg 225  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  224 aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 21275481 - 21275715
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21275481 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 21275580  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21275581 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 21275680  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275681 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 21275715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 12642979 - 12643213
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12642979 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 12643078  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12643079 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 12643178  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643179 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 12643213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6878541 - 6878291
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |  || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6878541 cttgggatttgtcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttttggtcggaaatatttcttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattctta 6878442  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878441 tataactaagtgaagttgtgtgaacgaataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 6878342  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878341 aattgttgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 6878291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 42179320 - 42179554
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||  |    
T  42179320 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtt 42179419  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42179420 tatataactaagtggagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 42179519  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42179520 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 42179554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Original strand, 3799960 - 3800190
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||  |||  |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3799960 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacatagtgtttggtcaaaaacatttcttgaactaattgtcttatgaattttggtgactattct 3800059  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3800060 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 3800159  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3800160 aa-tagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 3800190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8942745 - 8942494
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8942745 gtcttgggaattgtcaatgttgaccgttttccacttgacacgttctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 8942646  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| | |||||||| | || | |||| || ||    
T  8942645 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgttt 8942546  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8942545 ggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattat 8942494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 12637225 - 12637476
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12637225 gtcttgggaattgtcaatgttgaccgttttccacttgacacgttctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 12637324  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| | |||||||| | || | |||| || ||    
T  12637325 tatatggttaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgttt 12637424  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12637425 ggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 12637476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21141070 - 21140844
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  21141070 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattttcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 21140971  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  21140970 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 21140872  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140871 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 21140844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 36891788 - 36892022
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  36891788 atgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaa 36891887  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgttggatatgat-gtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactat 238  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36891888 gttgtatgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactat 36891986  T
Q  239 atgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36891987 atgtgatagtcgatgttgaatgacattgttgattat 36892022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 4449290 - 4449542
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||  |||||    
T  4449290 gtcttggaacttatcaatgttggccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgtttcttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattct 4449389  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4449390 tgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgct 4449489  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||| ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4449490 tgaaatggtgaaaccataggagataaatgatgttgaatgacattgttgattat 4449542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16900456 - 16900213
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattctta-tatga 130  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | |||   | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | | || | |||| || ||||  |||||    
T  16900456 aattatcaaagttggccgtttgccacatgatttgtttttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcgtttgagttattgtgattactctttgtatga 16900357  T
Q  131 ctaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  16900356 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggt 16900257  T
Q  231 gaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16900256 gaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattat 16900213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16993847 - 16993604
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattctta-tatga 130  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | |||   | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | | || | |||| || ||||  |||||    
T  16993847 aattatcaaagttggccgtttgccacatgatttgtttttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcgtttgagttattgtgattactctttgtatga 16993748  T
Q  131 ctaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  16993747 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggt 16993648  T
Q  231 gaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  16993647 gaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattat 16993604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 19887742 - 19887968
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  19887742 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 19887841  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  19887842 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 19887940  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887941 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 19887968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25212078 - 25211866
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | | ||||||||     
T  25212078 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgtcgcttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatc 25211980  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25211979 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 25211880  T
Q  222 tgaattggtgaaact 236  Q
    |||| ||||||||||    
T  25211879 tgaa-tggtgaaact 25211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27260656 - 27260414
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||  ||||||||| |||||   || |||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27260656 ttgggaattgtcaatgttggccgattgccacttgacacagacttta-tcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgactattctt 27260558  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||||||    
T  27260557 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcatac-tagaatgcaagggatgcttga 27260459  T
Q  225 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttg 269  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27260458 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttg 27260414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Original strand, 22580996 - 22581242
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagc-caattgtcttataattg-tggtgactattctta 125  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||  |||| |   ||||||||||||  ||  |  |||||||| ||     
T  22580996 ttggggattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggatctttaaatcaattgtcttatgttttatcctgactatttttc 22581093  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttg 22581193  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22581194 aattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgatt 22581242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22273893 - 22273733
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22273893 gtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgta 22273795  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22273794 aggaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgttgaatgacattgatgattat 22273733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8887233 - 8886988
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||| | ||  ||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  |    
T  8887233 gtcttgggatttgtcaatgttggtcggtagccacttgacatggttttag-tcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtt 8887135  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||  ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  8887134 tatataactaagtgaaggtgt-tggatggtta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaaaatgtaagaaata-ttg 8887039  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8887038 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 8886988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22862581 - 22862335
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||||||||  |    
T  22862581 gtcttgggatttgtaaatgttggccggtagccacttgacatggtttttagtcgaaaatgtttcttgaaccaattatcctaggaattgtggtgactatgtt 22862482  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||  | | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22862481 tatataactaagtgaaggtgt-tgaatggtta--tattttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttg 22862386  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22862385 aattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatgaaattgttgattat 22862335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22283126 - 22282966
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22283126 gtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgta 22283028  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22283027 aggaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgttgaatgacattgatgattat 22282966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 270253 - 270035
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||  |||||    
T  270253 gtcttgggatttatcaatgttggtcgtttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttcttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattct 270155  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  270154 tgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagagtgtaaggaatgct 270055  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatg 241  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  270054 tgaaatggtgaaaccatatg 270035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Original strand, 9653978 - 9654144
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgc 194  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||||| | |||||    
T  9653978 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaat----------gatatgatatttatcatgagatgtatatgc 9654067  T
Q  195 tatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9654068 tatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 9654144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Original strand, 24572450 - 24572700
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataattg-tggtgactatt 121  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || || ||  |||||||||| ||||||  || |||| | ||||| |||| | | || ||||    
T  24572450 gtcttggggattatcaatgttggtcgtttgccacttgatactgtatt--gtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgattgattgagaatatt 24572547  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||| |||| || ||||    
T  24572548 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtgaggaatg 24572647  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
     ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  24572648 tttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattgttgatt 24572700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34823391 - 34823167
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   ||  |||| || |||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  34823391 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggactttg-tcagaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 34823293  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||    
T  34823292 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaattggtg 34823194  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
     | |||||||||||||||||||||||||    
T  34823193 -agctatatgtgatagttgatgttgaat 34823167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12727309 - 12727128
Alignment:
Q  77 ggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtt 175  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  12727309 ggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtt 12727210  T
Q  176 tatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12727209 tatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaat 12727128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28973140 - 28972890
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctt-ataattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || | ||||  ||| |    
T  28973140 gtcttggaatttatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttt 28973041  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaat----aattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaat 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||   |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  28973040 tatatgactaagtgaagttgtatgaacgaatggccaa--atgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtgatcttacctaggatgtaaggaat 28972943  T
Q  219 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||| || |||| ||||||| || | |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  28972942 gctt-aaatggtaaaactatgtgaggtgtttgatgttgaatgacattgttgatt 28972890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7320452 - 7320337
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  7320452 tgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaa 7320353  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  7320352 tgacattgttgattat 7320337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 22787089 - 22787338
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttat 126  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  |||| |||||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  22787089 ttggaaattatcaatgttggccgtttgccagttgatacggtaattg-tcggaaatgttccttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttat 22787187  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||  |  | ||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||| | ||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  22787188 atgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttaattagaatgtgagaaatacttg 22787287  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || | || |||| ||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  22787288 aaattgtaaaaccatatgaggtagttgatgttgaatgatattgtggattat 22787338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Original strand, 20628525 - 20628643
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| ||||||| | ||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20628525 ttttagtcggaattatttctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggat 20628624  T
Q  168 atgatgtttatcatgagat 186  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20628625 atgatgtttatcatgagat 20628643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 93 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25600993 - 25600809
Alignment:
Q  93 ccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgt--tggatatgatgtttatcatgagatat- 188  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||||||| || || ||| |||||||||  || |||  |||||||||| |||||||| ||||||     
T  25600993 ccaattgtcttatgatctttcgtgactagtcttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgctggatatgatatttatcataagatatt 25600894  T
Q  189 gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| | |||||||| | || | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25600893 gtatgttctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 25600809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12727010 - 12726899
Alignment:
Q  164 ggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataac 262  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  12727010 ggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgac 12726911  T
Q  263 attgttgattat 274  Q
    ||||||||||||    
T  12726910 attgttgattat 12726899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 24827765 - 24827880
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | ||   |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24827765 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaataggagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 24827864  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  24827865 taacattgttgattat 24827880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20014210 - 20013972
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| | || | |||| ||||||| ||||||    
T  20014210 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttatgagttattgtgattattcttgtatgac 20014111  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| | | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |||    
T  20014110 taagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgt-ttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatgg 20014013  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  20014012 tgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 20013972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 19887976 - 19888091
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19887976 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatgtgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 19888075  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  19888076 tgacattgttgattat 19888091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34823159 - 34823044
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |  ||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34823159 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttcgcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 34823060  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  34823059 tgacattgttgattat 34823044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 22691171 - 22691264
Alignment:
Q  181 tgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  22691171 tgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattat 22691264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 22695818 - 22695911
Alignment:
Q  181 tgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  22695818 tgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattat 22695911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 14907504 - 14907745
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  14907504 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 14907603  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  14907604 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 14907702  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  14907703 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 14907745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23819270 - 23819029
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  23819270 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 23819171  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  23819170 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 23819072  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  23819071 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 23819029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 461649 - 461584
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  461649 tgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatctgatagctgatgttgaatgaaattgttgattat 461584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Original strand, 20628649 - 20628709
Alignment:
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20628649 agaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattat 20628709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 24088439 - 24088679
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgactaa 134  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||||   |||||||| |||||| || | | |||||||  ||| |||||||||    
T  24088439 tcaaagttggccgtttgccacttgatacggtttta--tcggaaatggttcttttaagccaattatcttatgatctttagtgactagccttgtatgactaa 24088536  T
Q  135 gtgaagttgtatgaatgaataatt--gtgttggatatgatgtttatcatgagatatg-tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
     || || |||  ||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||| || ||||   |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||     
T  24088537 atggagatgtgagaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgtggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggta 24088636  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | |||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  24088637 agactatatgaggtagttgatgttaaatgatattgttgattat 24088679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 461745 - 461646
Alignment:
Q  93 ccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||||||||  || ||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  461745 ccaattgtcttaagaaatgtggtggctatgtttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 721566 - 721330
Alignment:
Q  40 aatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgactaagtga 138  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | || || ||| |||||||||||| || | |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  721566 aatgttggtcgtttgccacttgatacggtatttg-tcggaatttttcctagagacaattgtcttatgatctatcatgactattcttatataactaagtga 721468  T
Q  139 agttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaac 235  Q
    | | ||  ||||||||  || |  |||| || |||| ||| |||| |||| | |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  721467 aat-gtgggaatgaatggttatatgttgaatgtgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaac 721369  T
Q  236 tatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  721368 tatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattat 721330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 21275723 - 21275838
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21275723 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 21275822  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  21275823 tgacattgttgattat 21275838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 11232507 - 11232565
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11232507 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 11232565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 22514354 - 22514412
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22514354 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 22514412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 28776955 - 28777013
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28776955 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 28777013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 191
Target Start/End: Original strand, 43644141 - 43644226
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43644141 aattgtggtggctatgtttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 43644223 - 43644287
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43644223 tgtaagaaatg-ttgaatagatgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattat 43644287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12727120 - 12727022
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12727120 tgttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaattggtgag-ctatatgtgatagttgatgttgaa 12727023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 12643221 - 12643336
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12643221 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 12643320  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  12643321 tgacattgttgattat 12643336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21140836 - 21140721
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| |  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21140836 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 21140737  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  21140736 tgacattgttgattat 21140721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Original strand, 5889552 - 5889608
Alignment:
Q  218 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5889552 tgcttgaaatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattgttgattat 5889608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 25877214 - 25877262
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt-gttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25877214 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattcgttgattat 25877262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 105
Target Start/End: Original strand, 22691122 - 22691161
Alignment:
Q  66 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22691122 ggtttttggtcggaaatgtttcttaagccaattgtcttat 22691161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 105
Target Start/End: Original strand, 22695769 - 22695808
Alignment:
Q  66 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22695769 ggtttttggtcggaaatgtttcttaagccaattgtcttat 22695808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 3800366 - 3800424
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  3800366 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacatggttgattat 3800424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 14820 - 15054
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14820 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 14919  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14920 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 15019  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15020 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 15062 - 15177
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15062 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 15161  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  15162 tgacattgttgattat 15177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 70462 - 70709
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttat 126  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  70462 ttgggaaatgtcaatgttgccagtttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtatcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttat 70561  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70562 atgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 70661  T
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70662 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 70709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 93797 - 93545
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactat--t 121  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |    
T  93797 gtcttgcgaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgtttcctgaaccaattgtcttttgaattgtggtgactatatt 93698  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  93697 cttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgct 93598  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  93597 tgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaataactttgttgattat 93545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 25787 - 26037
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||| || || ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25787 gtcttgagatttatcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattct 25886  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatga-tgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25887 tatatgactaagtgatgttgtatgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgctt 25986  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25987 gaa-tggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 26037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16230790 - 16230556
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16230790 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 16230691  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16230690 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 16230591  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230590 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 16230556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18776297 - 18776061
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18776297 atgttggccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaa 18776198  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776197 gttgtatgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 18776098  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18776097 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 18776061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18569647 - 18569439
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--gg 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  18569647 ttttggtcggaaatctttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttgg 18569548  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569547 atatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 18569448  T
Q  266 gttgattat 274  Q
    |||||||||    
T  18569447 gttgattat 18569439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 25745403 - 25745643
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||    
T  25745403 ttgtcaatgttggccgatggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataacta 25745502  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  25745503 agtgaagttgtatgaacgaatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaattagtaaa 25745602  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25745603 actatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 25745643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 18003926 - 18004154
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18003926 gtcttgggaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaacatttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 18004025  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18004026 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctt 18004125  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18004126 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 18004154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4990106 - 4989871
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | | ||||||||     
T  4990106 gtcttgggaattatcaatgttggccttttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatc 4990008  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4990007 cttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 4989908  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989907 tgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 4989871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22431307 - 22431101
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | || |    
T  22431307 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtatggggt 22431208  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    |||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22431207 atgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgatgtagaataacattgt 22431108  T
Q  268 tgattat 274  Q
    |||||||    
T  22431107 tgattat 22431101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 25645902 - 25646138
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||    
T  25645902 tcaatgttggccagtggccacttgatatggtgtttggtcggaaatgtttctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagt 25646001  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaact 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25646002 gaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaact 25646100  T
Q  237 atatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25646101 atatgtgataattgatgttgaatgacattattgattat 25646138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 13622067 - 13622301
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||  |||||| |||||    
T  13622067 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-ttgagccaattgtcttgtgagttacggtgaccattct 13622164  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13622165 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 13622264  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622265 tgaa-tagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 13622301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 18824610 - 18824845
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | | ||||||||     
T  18824610 gtcttggaaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatc 18824708  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18824709 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 18824808  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824809 tgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18824845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32897826 - 32897576
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    |||||| || || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| ||  ||| |||||    
T  32897826 gtcttgagatttatcaatgttggtcggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattc 32897727  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32897726 ttatatgactaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 32897627  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32897626 gaa-tggtgaaactaaatgtaataattgatgttgaatgacattgttgattat 32897576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 35016751 - 35016992
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||   || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | | || | |||| ||||||||||||||    
T  35016751 aattatcaatgttggccatttgccacatgatttggatttttgttggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgac 35016850  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || | || |||||||||| ||||     
T  35016851 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtt 35016949  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35016950 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 35016992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18431693 - 18431486
Alignment:
Q  66 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||     
T  18431693 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatgaaagaatgattgcatta 18431594  T
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18431593 aatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 18431496  T
Q  265 tgttgattat 274  Q
    ||||||||||    
T  18431495 tgttgattat 18431486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18582389 - 18582152
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||||| || | | ||||||||     
T  18582389 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatggttttt-gtcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatc 18582291  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18582290 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatg 18582191  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18582190 cttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18582152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16105660 - 16105412
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||  ||| |    
T  16105660 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgtttcttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttt 16105562  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||   |  ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16105561 tatatgactaagtgaagttgtacgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 16105462  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16105461 aa-tggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 18840465 - 18840700
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    ||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||   |||| | |||| ||||||||| | | ||||||||     
T  18840465 gtcttggaatttatcaatgttggtcgtttgccacttgatacggtttttg-tcgaaaatgttttctttgaactaattttcttataatctatcgtgactatc 18840563  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18840564 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 18840663  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840664 tgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18840700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23152112
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttggat 23152219  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23152218 aagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacctaggatgtaagaaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 23152119  T
Q  268 tgattat 274  Q
    |||||||    
T  23152118 tgattat 23152112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25174754 - 25174528
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  25174754 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 25174655  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  25174654 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 25174556  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174555 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 25174528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Original strand, 15736133 - 15736362
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||| ||||      
T  15736133 gtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgt 15736232  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15736233 ttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgct 15736332  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15736333 tgaa-tggtaaaactatatgtgatagttgat 15736362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 256
Target Start/End: Original strand, 27655064 - 27655287
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  27655064 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 27655163  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  27655164 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 27655262  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27655263 aaactatatgtgatagttgatgttg 27655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Original strand, 19984356 - 19984516
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  19984356 gtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgta 19984454  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19984455 aggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattat 19984516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16085180 - 16084934
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||  ||| |    
T  16085180 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacatgatatggattt-ggtcgaaaatgtttcttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttt 16085082  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16085081 tatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 16084984  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16084983 aa-gggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16084934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23976671 - 23976420
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23976671 gtcttgggaattgccaatgttggtcgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaacatttattgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 23976572  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||| | || | |||| || ||    
T  23976571 tatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgttt 23976472  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23976471 ggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 23976420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 255
Target Start/End: Original strand, 33315545 - 33315767
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  33315545 aattatcaatgttagccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 33315644  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||    
T  33315645 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtg 33315743  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33315744 aaactatatgtgatagttgatgtt 33315767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827064
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttgg 165  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||    
T  16826872 tttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttgg 16826971  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16826972 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgga-tggtgaaactatatgtgatagttgattttgaat 16827064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628302
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||  | | ||| ||    
T  19628490 tttttgtcggaaatgttttttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttgaatgagtgatta--tattttgaat 19628393  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628392 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 19628302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 252
Target Start/End: Original strand, 14627652 - 14627791
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgt 211  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  14627652 gtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgt 14627751  T
Q  212 aagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14627752 aagaaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 14627791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 98 - 274
Target Start/End: Original strand, 18087843 - 18088023
Alignment:
Q  98 tgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgc 194  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  18087843 tgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgc 18087942  T
Q  195 tatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaataacattgttgattat 274  Q
     |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18087943 catcttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattat 18088023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 274
Target Start/End: Original strand, 1658908 - 1659022
Alignment:
Q  159 gtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1658908 gtgttgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaatgcaaggaatgcttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 1659006  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  1659007 taacattgttgattat 1659022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 25368414 - 25368659
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatga 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||| ||| ||| |||| | ||||| |||  | |||||| |||||||||||    
T  25368414 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatga 25368512  T
Q  131 ctaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||  | || ||||||||||||| |    
T  25368513 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttacttaaaaggtgagaaatgcttgaaat 25368612  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| |||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25368613 ggtaaaactatatgaggtagtttatgttgaatgatattgttgattat 25368659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 259
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824949
Alignment:
Q  150 tgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 249  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 18824939  T
Q  250 gatgttgaat 259  Q
    ||||||||||    
T  18824940 gatgttgaat 18824949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 259
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840804
Alignment:
Q  150 tgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 249  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 18840794  T
Q  250 gatgttgaat 259  Q
    ||||||||||    
T  18840795 gatgttgaat 18840804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18398028 - 18397784
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatg-tttcttga-gccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||||||||| |||||| | | |||||||||||| || | | |||| |||||||    
T  18398028 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacgaacttta-tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattctt 18397930  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||    
T  18397929 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatatgatg-atatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtgagacatg-tt 18397832  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||| ||| ||| ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18397831 gaaatggggaagctacatgagatagtgaatgttgaatgacattgttga 18397784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609355
Alignment:
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 19609355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 257
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016080
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  13015910 ttttggtcggaaatgtttcttaaaccaattgtcttatgaattgttatga-tattcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg-- 13016006  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 257  Q
                    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  13016007 ----------------gatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaaccacatgtggtaattgatgttga 13016080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28196089
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgt--tggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| | |  |||| ||||||||||||||| | | | ||||| | |||||||||||||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctcttacttaggat 28196023  T
Q  210 gtaagaaatgcttg-aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28196024 gtaagaaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaataatattgttgattat 28196089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Original strand, 1651155 - 1651262
Alignment:
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1651155 atatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacatt 1651253  T
Q  266 gttgattat 274  Q
    | |||||||    
T  1651254 gatgattat 1651262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22867260 - 22867026
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg--tggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| ||   ||   | | |||||||     
T  22867260 gtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacg-tttttggttggaaatgttccttgagtcaatagtcatactttttatttgggactattt 22867162  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||  ||||||||||| || ||| | ||||| |||| | ||||  ||||     
T  22867161 ttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaacgtaaagaatgt 22867062  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 257  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  22867061 ttgaa-tgatgaaactatatgagatagtaaatgttga 22867026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26088898 - 26088787
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||  |||||||||||  |||||    
T  26088898 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtat 26088799  T
Q  193 gctatcttactt 204  Q
    ||||||||||||    
T  26088798 gctatcttactt 26088787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4989863 - 4989748
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4989863 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgga 4989764  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  4989763 tgacattgttgattat 4989748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 251
Target Start/End: Original strand, 16301107 - 16301178
Alignment:
Q  180 atgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 251  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16301107 atgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttga 16301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 18824957 - 18825072
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824957 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 18825056  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||    
T  18825057 tgaaattgttgattat 18825072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 245
Target Start/End: Original strand, 21776785 - 21776870
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgat 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21776785 tgttgaatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgat 21776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Original strand, 18843017 - 18843130
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18843017 tgttggatatgatatttgtcatgatatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 18843116  T
Q  259 taacattgttgatt 272  Q
    ||| ||||||||||    
T  18843117 taaaattgttgatt 18843130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25904116 - 25903975
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   |  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  25904116 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgaatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 25904017  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  25904016 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25174520 - 25174405
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25174520 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 25174421  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  25174420 tgacattgttgattat 25174405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 27655283 - 27655398
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27655283 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 27655382  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  27655383 tgacattgttgattat 27655398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Original strand, 16827134 - 16827187
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16827134 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16827187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15861640 - 15861582
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttga--ataacattgttgatt 272  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15861640 aatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatataacattgttgatt 15861582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 18004169 - 18004284
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18004169 tgttggatatgatatttgtcatgagattttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 18004268  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  18004269 tgacattgttgattat 18004284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10487786 - 10487728
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10487786 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 10487728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 16377541 - 16377599
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16377541 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 16377599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 16384865 - 16384923
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16384865 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 16384923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16239311 - 16239220
Alignment:
Q  180 atgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||  | ||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16239311 atgagatgtatatgctatcttacttatgatgtagtagatg-ttggatagatgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgatt 16239220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 15736377 - 15736492
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||  | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15736377 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgttttgaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 15736476  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  15736477 tgacattgttgattat 15736492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16230548 - 16230433
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16230548 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 16230449  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  16230448 tgacattgttgattat 16230433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 14627874 - 14627921
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14627874 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 14627921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1554739 - 1554692
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  1554739 tggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgggtaaaattgttgattat 1554692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Original strand, 13622309 - 13622423
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  13622309 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaa 13622408  T
Q  259 taacattgttgatta 273  Q
    | |  ||||||||||    
T  13622409 tgatgttgttgatta 13622423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 33315835 - 33315893
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  33315835 aatggttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacatggttgattat 33315893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 9731740 - 9731974
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9731740 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 9731839  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9731840 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 9731939  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9731940 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 9731974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 17472809 - 17473051
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || | ||||| |||||||||||||    
T  17472809 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgac 17472908  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17472909 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtg 17473008  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17473009 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 17473051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28258699 - 28258451
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |  || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  28258699 gtcttgggatttgtcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttcttgagccaattgtattataaactgtggtgactattct 28258601  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  28258600 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttgagatgtaaggaatgattg 28258501  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaca-ttgttgatta 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28258500 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatttgttgatta 28258451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20711235 - 20710986
Alignment:
Q  26 tcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  20711235 tcttgggatttatcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattctt 20711136  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatga-tgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||    
T  20711135 atatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttac-tagaatgtaatgaatgcttg 20711037  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20711036 aaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattat 20710986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 1169583 - 1169824
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataatt-gtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||    
T  1169583 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgac 1169682  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  1169683 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 1169781  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1169782 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 1169824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4864355 - 4864117
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttata-attgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||  |||||| ||||    
T  4864355 ttgtcaaagttggccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt-cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataacta 4864258  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4864257 agtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaa 4864158  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4864157 actatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 4864117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16535396 - 16535155
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  16535396 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 16535297  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16535296 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgctt-aaatggtg 16535198  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16535197 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16535155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19404680 - 19404431
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||  |||| |||||||||||| | || |||||||||| |||| | | |||||||||    
T  19404680 gtcttggga-ttatcaatgtgggccgtttgccacttgatatagtttg-ggtcagaaatgtttcttaaaccgattgtcttatgaattatcgagactattct 19404583  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19404582 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgct 19404484  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19404483 tgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 19404431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 24184273 - 24184524
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||    
T  24184273 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgcttcttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattct 24184371  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24184372 tgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 24184471  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24184472 tgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattat 24184524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 110055 - 110290
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | | ||||||||     
T  110055 gtcttgggaattatcaatgttggccatttgccacttgatacggcttttg-tcggaaatgtttcatttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatc 110153  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  110154 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 110253  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  110254 tgaa-tggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaat 110290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11583078 - 11582847
Alignment:
Q  29 tgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattctta 125  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  |||| |||||| |||||| || | | |||||||| ||||    
T  11583078 tgggaattatcaatattggtcgtttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatcctta 11582980  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11582979 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 11582880  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582879 -tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 11582847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21393268 - 21393038
Alignment:
Q  44 ttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagtt 142  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21393268 ttggccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgtttcttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgtt 21393169  T
Q  143 gtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 242  Q
    ||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  21393168 gtatgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaatgtaaggagtacttgaa-tggtgaaactatatgt 21393070  T
Q  243 gatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21393069 gatagttgatgttgaatgacattgttgattat 21393038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Original strand, 21652472 - 21652713
Alignment:
Q  36 tgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaa 134  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  21652472 tgtcaatgttggtcggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttccttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaa 21652571  T
Q  135 gtgaagttgtatgaatgaataattgtg--ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtga 232  Q
      |||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21652572 aagaagttgtatgaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtga 21652671  T
Q  233 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21652672 aactatacgtgatagttaatgttgaatgacattgttgattat 21652713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11545 - 11319
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  11545 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 11446  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  11445 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 11347  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 11319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 10779261 - 10779487
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  10779261 aattatcaatgttggcagtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 10779360  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  10779361 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 10779459  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779460 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 10779487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 29191702 - 29191928
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  29191702 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 29191801  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  29191802 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaacgcttgaa-tggtg 29191900  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191901 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 29191928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23513996 - 23513768
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| ||||| |||||| ||||||    
T  23513996 aattatcaatgttgaccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgac 23513897  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtg--ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |   |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  23513896 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tgg 23513798  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513797 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 23513768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 27184794 - 27185022
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   |  |||| |||||||||||||||| || |||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  27184794 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgaatttttgtcggaaatgtttctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 27184893  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||    
T  27184894 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaa-tgg 27184992  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184993 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 27185022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 1220811 - 1221039
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  1220811 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattttcttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 1220910  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  |||    
T  1220911 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgctt-agatgg 1221009  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221010 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 18779072 - 18779300
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || || |||| ||||||    
T  18779072 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattactcttgtatgac 18779171  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||    
T  18779172 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatggttgaa-tgg 18779270  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18779271 tgaaactatatgtggaagttgatgttgaat 18779300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21649860 - 21649679
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  |||||||||||  |||||    
T  21649860 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtat 21649761  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21649760 gctatcttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatcgttgattat 21649679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 255
Target Start/End: Original strand, 4201045 - 4201269
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  4201045 aattatcaatgttgaccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 4201144  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  4201145 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tag 4201243  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4201244 tgaaactatatgtgatagttgatgtt 4201269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24474666 - 24474439
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    ||||||| |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  24474666 ttgtcaaggttggccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataacta 24474567  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||    
T  24474566 agtgaagttgtatgaatgaat----------gatatgatatttatcattagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaa 24474477  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24474476 actatatgtgatagttgttgttgaataacattgttgat 24474439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 22884372 - 22884611
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   ||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  22884372 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggactttg-tcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 22884470  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||||    
T  22884471 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttggaatatgag-aatgcttgaattggtg 22884569  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22884570 -aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgtggattat 22884611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11341831 - 11341607
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  11341831 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggattttg-tcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 11341733  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||    
T  11341732 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaattggtg 11341634  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
     | |||||||||||||||||||||||||    
T  11341633 -agctatatgtgatagttgatgttgaat 11341607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 120 - 274
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338177
Alignment:
Q  120 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtg--ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaaggtaagaaa 11338120  T
Q  218 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  11338121 tgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgaccttgttgattat 11338177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 84 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23511028 - 23510837
Alignment:
Q  84 tttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatg 182  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  23511028 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattggatatgatgtttatcatg 23510929  T
Q  183 agatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23510928 agatgtgtatgttatattac-tagaatgtaaggaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatgattgaatagcattgttgattat 23510837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25425784 - 25425590
Alignment:
Q  68 tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtg--ttg 164  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| | | || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |   |||    
T  25425784 ttttttgtcgaaaatgtttctttagccaaatgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttg 25425685  T
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425684 gatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 25425590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23454051 - 23453806
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataattg-tggtgactattctt 124  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||  || |||| | ||||| |||  | | || |||||||    
T  23454051 ttggaaattatcaaggttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattctt 23453954  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  23453953 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtt 23453854  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttg 269  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  23453853 tgaaatggtaaaactatatgaggtagttgattttgaatgacattgttg 23453806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23465556 - 23465311
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataattg-tggtgactattctt 124  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||  || |||| | ||||| |||  | | || |||||||    
T  23465556 ttggaaattatcaaggttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattctt 23465459  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||  || | ||||| | ||||||||||||||||||||||| |    
T  23465458 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtt 23465359  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttg 269  Q
    |||| |||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  23465358 tgaaatggtaaaactatatgaggtagttgattttgaatgacattgttg 23465311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Original strand, 22367650 - 22367792
Alignment:
Q  118 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaaga 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  22367650 tattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaagg 22367749  T
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367750 aatg-tttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 22367792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23505821 - 23505665
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  23505821 aattatcaatgttggacgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgac 23505722  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||| ||||||||||||    
T  23505721 taagtgaagttgtatgaatgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagat 23505665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424653
Alignment:
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 7424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 274
Target Start/End: Original strand, 35792230 - 35792432
Alignment:
Q  74 gtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatg 170  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | | || |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||  |||||||    
T  35792230 gtcggaaatatttctt-agccaattgtcttgtgagttattctgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatg 35792328  T
Q  171 atgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttg 269  Q
    || ||||||||||||||| || | |  | |||||| | || | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35792329 atatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatatgataa-tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttg 35792427  T
Q  270 attat 274  Q
    |||||    
T  35792428 attat 35792432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11341599 - 11341484
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11341599 tgttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 11341500  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  11341499 tgacattgttgattat 11341484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 25901405 - 25901633
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| | |||||||||||||| ||| |||||| || | | || | | || ||||||| ||||||    
T  25901405 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttggcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgagattattcttgtatgac 25901504  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||| | || | || ||| |||||| ||    
T  25901505 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgag-aatccttgaa-tg 25901602  T
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901603 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 25901633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19498861 - 19498764
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498861 tgttgaatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaat-ggtgaaactatatgtgacagttgatgttga 19498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 27185086 - 27185144
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27185086 aatgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 27185144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 21234591 - 21234832
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  21234591 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 21234690  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat--gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatt 227  Q
    |||||||||||||||||| || | ||  | | ||||||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | || |||||||||| |    
T  21234691 taagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaat 21234789  T
Q  228 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  21234790 ggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 21234832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11311 - 11196
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11311 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 11212  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  11211 tgacattgttgattat 11196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 110298 - 110413
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||| ||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  110298 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttccttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgga 110397  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  110398 tgacattgttgattat 110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 1169914 - 1169972
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1169914 aatgcttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 1169972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25425582 - 25425467
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||| | || | |||| |  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25425582 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 25425483  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  25425482 tgacattgttgattat 25425467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 21933535 - 21933593
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21933535 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 21933593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 21939705 - 21939763
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21939705 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 21939763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35581157 - 35581099
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  35581157 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 35581099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 37010539 - 37010597
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37010539 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 37010597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Original strand, 11212980 - 11213033
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11212980 ttgaattggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattgttgattat 11213033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23513704 - 23513648
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23513704 aatgtttgaattggtaaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatt 23513648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 1221047 - 1221162
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatatg-tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  1221047 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttatatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 1221146  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  1221147 tgacattgttgattat 1221162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 9731982 - 9732097
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9731982 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 9732081  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  9732082 tgacattgttgattat 9732097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 10779495 - 10779610
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| |  ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10779495 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 10779594  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  10779595 tgacattgttgattat 10779610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 21074805 - 21074920
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21074805 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 21074904  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
      ||||||||||||||    
T  21074905 cgacattgttgattat 21074920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 22367800 - 22367915
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22367800 tgttggatatgatatttgtcatgagctgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 22367899  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  22367900 tgacattgttgattat 22367915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 29191936 - 29192051
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||| | | |||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29191936 tgttggatatgatatttgtcacgagatgttgtatgttcttttacttgggatatgagaattgtttggagtggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 29192035  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  29192036 tgacattgttgattat 29192051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 4201338 - 4201396
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4201338 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattat 4201396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 43445126 - 43445183
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43445126 aatgctcgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaatatcattgtggattat 43445183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20615669 - 20615549
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttgg 165  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||  | | ||||    
T  20615669 tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttgg 20615570  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagat 186  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  20615569 atatgatgtttctcatgagat 20615549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37052077 - 37051960
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  37052077 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 37051978  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaa 149  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37051977 taagtgaagttgtatgaa 37051960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7424572 - 7424525
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7424572 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 7424525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11582771 - 11582724
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11582771 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 11582724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 18779377 - 18779424
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18779377 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattat 18779424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 274
Target Start/End: Original strand, 25192390 - 25192427
Alignment:
Q  237 atatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25192390 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 25192427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 274
Target Start/End: Original strand, 5452007 - 5452117
Alignment:
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaca 263  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||| | |    
T  5452007 gatatgatatttatcatgtgatgttgtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatacaaggtagttgatgttgaatgata 5452106  T
Q  264 ttgttgattat 274  Q
     ||||||||||    
T  5452107 ctgttgattat 5452117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20615518 - 20615460
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  20615518 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgatacatgacattgttgattat 20615460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 25901698 - 25901756
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  25901698 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattat 25901756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19861328 - 19861291
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacac 65  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19861328 ttggaaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacac 19861291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18909891 - 18909657
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18909891 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 18909792  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18909791 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 18909692  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18909691 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18909657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 53769862 - 53769628
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53769862 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgtttcttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattct 53769763  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53769762 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 53769663  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53769662 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 53769628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 318683 - 318924
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  318683 ttgtcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgtttcttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgacta 318782  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  318783 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttacttaaggtgtaagaaatgcttgaattggtgaa 318882  T
Q  234 actatatgtg-atagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  318883 actatatgtgaatagttgatgttgaatgacattgttgattat 318924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 22145335 - 22145585
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  22145335 gtcttgggaattgtcaatgttggctgtttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgtttcttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccatttt 22145434  T
Q  124 t-atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22145435 ttatatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaagatgtaaggaatgctt 22145534  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145535 gga-tgatgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 22145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 12350907 - 12351155
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttgg-tcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    |||||| ||||||||||||| || |  || || || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  12350907 ttgggatttgtcaatgttggtcggtgaccactcgatatggtttttgggtcggatatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattctta 12351006  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351007 tatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 12351106  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12351107 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgttgattat 12351155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 50113197 - 50113443
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||  |    
T  50113197 gtcttggga-ttgtcaaagttggccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtt 50113293  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  50113294 tatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttg 50113393  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50113394 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 50113443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 16183081 - 16183320
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16183081 ttgtcaatgttgtccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataacta 16183180  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||    
T  16183181 agtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaa-tgatgaa 16183279  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16183280 actatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16183320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8630942 - 8630694
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8630942 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattct 8630843  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |  |||||  |||||||||||| |||||||||||||  |  | ||||||| |||| |||    
T  8630842 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtttgaggcatgat-attatcatgagatgtgtatgctatcttgttcggaatgtaaggaatgtttg 8630744  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  8630743 aa-tggtgaaactatatgtgataattgacgttgaatgactttgttgattat 8630694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 11062096 - 11062347
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  | |   |||||||||||    
T  11062096 gtcttgagaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacgttttttgtt-ggaaatgttccttgagccaattgttttatgttctaacgtgactattct 11062194  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062195 catatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 11062294  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11062295 tgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 11062347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13837952 - 13837733
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13837952 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt-cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgac 13837854  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  13837853 taagtgaagttgtatgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 13837755  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13837754 aaactatatgtgatagttgatg 13837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13816608 - 13816360
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |  || ||||| | |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  |    
T  13816608 gtcttgggatttgtcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttt-ggtcgaaaatgtta-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtt 13816511  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13816510 tatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgtttg 13816411  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13816410 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 13816360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 15860253 - 15860458
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15860253 ttttagtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatctttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggat 15860352  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15860353 atgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattgt 15860451  T
Q  268 tgattat 274  Q
    |||||||    
T  15860452 tgattat 15860458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Original strand, 15469538 - 15469779
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | | || | ||||| |||| | ||||||    
T  15469538 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgac 15469637  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  15469638 taagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtg 15469736  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15469737 aaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattat 15469779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 11198630 - 11198882
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattct 123  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||  |||  | |||||||||||    
T  11198630 gtcttgggaattatcaatgttgaccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttccttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattct 11198729  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |    
T  11198730 tatatgactaagtgaggttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgtt 11198829  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11198830 tgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 11198882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 12562536 - 12562788
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattct 123  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||   | | | ||||| |||||    
T  12562536 gtcttggggattatcaacgttggccatttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttccttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattct 12562635  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  12562636 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaaggaatgct 12562735  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12562736 tgaattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 12562788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 256
Target Start/End: Original strand, 17957301 - 17957520
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | | || | |||| ||||||| |||||||||||    
T  17957301 tcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgaacaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagt 17957400  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaact 236  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17957401 gaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatgggtgaaact 17957500  T
Q  237 atatgtgatagttgatgttg 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17957501 atatgtgatagttgatgttg 17957520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14297595 - 14297346
Alignment:
Q  26 tcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||    
T  14297595 tcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattctt 14297496  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat-tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  14297495 atatgactaa-tgaagttgtatgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattg 14297397  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14297396 aaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattat 14297346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14303222 - 14302973
Alignment:
Q  26 tcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||||    
T  14303222 tcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattctt 14303123  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat-tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || |   |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  14303122 atatgactaa-tgaagttgtatgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattg 14303024  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14303023 aaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattat 14302973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 274
Target Start/End: Original strand, 19571893 - 19572082
Alignment:
Q  85 ttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatga 183  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19571893 ttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatga 19571992  T
Q  184 gatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19571993 gatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtg-tagttgatgttgaatgacattgttgattat 19572082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7853015 - 7852778
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| || | | | ||||||     
T  7853015 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatc 7852917  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  7852916 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaatgtaaggaatg 7852817  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852816 cttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 7852778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35122785 - 35122534
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || | ||||  |||||    
T  35122785 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgtttcttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattct 35122687  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35122686 tgtatgactaagtgaaattgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 35122587  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35122586 tgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattat 35122534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22274238 - 22274012
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  22274238 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcagaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 22274139  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  22274138 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 22274040  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274039 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 22274012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 2450291 - 2450517
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  2450291 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 2450390  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  2450391 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 2450489  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450490 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 2450517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16260283 - 16260038
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctta-taattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16260283 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgtttcttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattct 16260184  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagata-tgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |     ||||||| |||||||||||||| ||| | |  | |||||| | || | |  |||||||    
T  16260183 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattat-----atatgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatatga-taatgctt 16260090  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16260089 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattat 16260038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159667
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--gg 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  ||    
T  51159475 tttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttgg 51159574  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51159575 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatatgatagttgatgttgaat 51159667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33341037 - 33340813
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctt-ataattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| | |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||| ||||    
T  33341037 ttgtcaatgttggtcggttaccacttgatatggttttag-tcgggaatgtttcttgaaccaattgtcttgagaattgtggtggctatgtttatataacta 33340939  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33340938 agtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaattggtgaa 33340839  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||   | |||||||||||||    
T  33340838 actatatgatgtggttgatgttgaat 33340813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 274
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786194
Alignment:
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaaga-aatgc 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaatgtaagagaatgc 47786140  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  47786141 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattat 47786194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 53899581 - 53899833
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||  || |||||||||| || ||||| ||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||    
T  53899581 gtcttgggttttatcaatgttggtcggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgtttcttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattct 53899680  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53899681 tgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 53899780  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || | ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||    
T  53899781 tggaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgatattgttgattat 53899833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 6147918 - 6148152
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtt-tcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaag 135  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |   |||||||| ||||    
T  6147918 tcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataag 6148014  T
Q  136 tgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaac 235  Q
    |||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6148015 tgaagtggtatgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatacttgaa-tggtgaaac 6148113  T
Q  236 tatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6148114 tatatatgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 6148152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17099804 - 17099562
Alignment:
Q  32 gaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt--gagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatat 128  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||   || |||||  ||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  17099804 gaattatcaacgtcggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatat 17099707  T
Q  129 gactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  17099706 gactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaatgtaagaaatgcttgaaatg 17099608  T
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17099607 gtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 17099562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16820102 - 16819882
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| |||| |    
T  16820102 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatggc 16820003  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||    
T  16820002 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctt-aaatggt 16819904  T
Q  231 gaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16819903 gaaactatatgtgatagttgat 16819882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17937505 - 17937344
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgta 212  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||    
T  17937505 gtgaccatttttgtatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttacataggatgta 17937406  T
Q  213 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17937405 agaaatgctagtattggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 17937344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19945727 - 19945474
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||| || | | ||||||||     
T  19945727 gtcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacggttttt-gtcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatc 19945629  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | |||| |||||||||||||||||||||||| || | |  | |||||| | || | || |||    
T  19945628 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgttttccctattacttggaatatgag-aat 19945530  T
Q  219 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945529 gcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 19945474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23491535 - 23491353
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  |||||||||||  |||||    
T  23491535 attgtcttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtat 23491436  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  23491435 gctatcttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacatcgttgattat 23491353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14294519 - 14294277
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||   | |||||||| |||  | | | || ||||||||||||||||    
T  14294519 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttt-ggtctggaatgttcctctcgtcaattgtcctatgttctatagtaactattcttatatgac 14294421  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  14294420 taagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaa-tgcttgaaatgg 14294322  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14294321 taaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 14294277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14300146 - 14299904
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||   | |||||||| |||  | | | || ||||||||||||||||    
T  14300146 aattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttt-ggtctggaatgttcctctcgtcaattgtcctatgttctatagtaactattcttatatgac 14300048  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  14300047 taagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaa-tgcttgaaatgg 14299949  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14299948 taaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 14299904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 49231409 - 49231189
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   |  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  49231409 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgaatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 49231310  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  49231309 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggt 49231211  T
Q  231 gaaactatatgtgatagttgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49231210 gaaactatatgtgatagttgat 49231189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17138575 - 17138342
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtt-tcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||    
T  17138575 gtcttgggaattatcaaagttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattc 17138478  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |  |||||| ||||||||||||| | ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17138477 ttatatgattaagtgaagttatatgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttgcatgttctcttacttaggatgtaagaaatg 17138378  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 255  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  17138377 cttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgttgtt 17138342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 40938829 - 40938581
Alignment:
Q  26 tcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctta----taattgtggtgactatt 121  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||    | |||  ||  ||||||    
T  40938829 tcttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatacg-tttttggttggaaatgttccttgagtcaatagtcttactttttatttagg--actatt 40938733  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||  ||  ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||  ||||    
T  40938732 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttataatgtaaagaatg 40938633  T
Q  220 cttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  40938632 cttgaa-tggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgatt 40938581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 17523530 - 17523694
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || | |||||||||||    
T  17523530 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatgcttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattct 17523629  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagata 187  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17523630 tatatgactaa-tgacgttgcatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagata 17523694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25057939 - 25057694
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| || ||||||||||||| ||  ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  25057939 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgttggaaatgtttctttagtaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 25057840  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |    
T  25057839 taagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttacttaagatgtaaagaatgtttgaatttg 25057740  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaataacattgttgattat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  25057739 cgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattgttgattat 25057694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39655012 - 39654761
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataat-tgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||  ||||||||| |||||   || |||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  39655012 ttgggaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacacagacttta-tcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattctt 39654914  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  |  | ||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||   |||||||||| |||| |||||| ||    
T  39654913 atatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatact 39654814  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  39654813 tgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattgttgattat 39654761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54423090 - 54423001
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgct 195  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  54423090 aattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15574995 - 15574888
Alignment:
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15574995 atatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacatt 15574897  T
Q  266 gttgattat 274  Q
    | |||||||    
T  15574896 gatgattat 15574888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15614014 - 15613907
Alignment:
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacatt 265  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15614014 atatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacatt 15613916  T
Q  266 gttgattat 274  Q
    | |||||||    
T  15613915 gatgattat 15613907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33340805 - 33340690
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33340805 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 33340706  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  33340705 tgacattgttgattat 33340690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 8269657 - 8269714
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8269657 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 8269714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 8276768 - 8276825
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276768 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 8276825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737388
Alignment:
Q  162 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaaga-aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttactt-gga-gtatgagaatgcctgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 10737388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16819811 - 16819753
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16819811 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 16819753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 51159731 - 51159789
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51159731 aatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 51159789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 2450525 - 2450640
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2450525 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 2450624  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  2450625 tgacattgttgattat 2450640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22274004 - 22273889
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22274004 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 22273905  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  22273904 tgacattgttgattat 22273889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44228383 - 44228274
Alignment:
Q  164 ggatatgatgtttatcatgagatatgtat-gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataac 262  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| | | |||||||||||| | || | |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44228383 ggatgtgatgatgatcatgagatatattttgctatcttacttggaatatgagaa-tgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 44228286  T
Q  263 attgttgattat 274  Q
    ||||||||||||    
T  44228285 attgttgattat 44228274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Original strand, 12031151 - 12031233
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12031151 tgtggtggccatgcttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Original strand, 54039595 - 54039717
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  54039595 aattatcaatgttggccgtttgccacatgaattggatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 54039694  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaat 154  Q
    ||||||||| ||| |||||||||    
T  54039695 taagtgaagatgtgtgaatgaat 54039717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2048972 - 2048908
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2048972 tgtaagaaatg-ttgaatatgtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 2048908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 274
Target Start/End: Original strand, 11883403 - 11883567
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  || |  ||||||||||   ||| ||||  ||||| |||||   |||||||||| ||    
T  11883403 gtgactattcttatatgactaggtgaaaatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatggaatttgtcataggatattgtatgtcctcttacttagaat 11883502  T
Q  210 gtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11883503 gtgagaaattctcgaaatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattgttgattat 11883567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Original strand, 14522483 - 14522544
Alignment:
Q  158 tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatg 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14522483 tgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg 14522544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19230971 - 19230907
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19230971 tgtaagaaatg-ttgaataggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacgttgttgattat 19230907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 17957531 - 17957646
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17957531 tgttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 17957630  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    |  |||||||||||||    
T  17957631 tgtcattgttgattat 17957646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49231174 - 49231061
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || | | || |||||| | || | |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49231174 tgttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatgagaa-tgcttgaattggtgaa-ctatatgtgacagttgatgttgaa 49231077  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||| ||||||    
T  49231076 taacattgtggattat 49231061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 1468908 - 1468966
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1468908 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 1468966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2049043 - 2048969
Alignment:
Q  117 ctattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2049043 ctatgcttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19231050 - 19230968
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  19231050 tgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38167075 - 38167010
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt 160  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38167075 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt 38167010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7852770 - 7852655
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7852770 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatagtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 7852671  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  7852670 tgacattgttgattat 7852655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15516709 - 15516594
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatatg-tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||   |||||||||| |||| |||||| |||||| |||| | |||||||| | |||||| |||||||    
T  15516709 tgttggatatgatatttgtcataagatatggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgctgttgaa 15516610  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||    
T  15516609 tgatattgttgattat 15516594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18909649 - 18909534
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18909649 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 18909550  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  18909549 tgacattgttgattat 18909534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53769620 - 53769505
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  53769620 tgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 53769521  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  53769520 tgacattgttgattat 53769505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 274
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031294
Alignment:
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattat 12031294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 16745424 - 16745481
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16745424 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgac-ttgttgattat 16745481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Original strand, 54652855 - 54652896
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54652855 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaat 54652896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 237284 - 237031
Alignment:
Q  24 ggtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattc 122  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||     
T  237284 ggtcttgggaattatcaatgttagccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccattt 237185  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237184 ttacataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 237085  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  237084 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 237031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 271029 - 270971
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271029 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 270971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13287 - 13048
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattgtggtgactattcttatatgactaa 134  Q
    ||||| |||||||||| | ||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13287 ttgtctatgttggccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgtttctcgagccaattgtcttataattgtggtgactattcttatatggctaa 13188  T
Q  135 gtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaa 234  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13187 gtgaatttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacctaggatgtaggaaatgcttgaattggtgaaa 13088  T
Q  235 ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13087 ctatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattat 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47211 - 46975
Alignment:
Q  39 caatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtg 137  Q
    ||||||||| || | ||| ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211 caatgttggtcggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgtttattgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtg 47112  T
Q  138 aagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47111 aagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 47012  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47011 tatgcgatagttgatgttgaatgacattgttaattat 46975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 60659 - 60423
Alignment:
Q  39 caatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtg 137  Q
    ||||||||| || | ||| ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60659 caatgttggtcggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgtttattgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtg 60560  T
Q  138 aagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60559 aagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 60460  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  60459 tatgcgatagttgatgttgaatgacattgttaattat 60423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 1906 - 2152
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttat 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||    
T  1906 ttgggagttgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttat 2005  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||     
T  2006 ataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaa- 2104  T
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2105 tgataaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 2152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44897 - 44648
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| ||    
T  44897 gtcttgggatttgtcaatgttggccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgtttcttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgct 44799  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt-ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44798 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgctt 44699  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  44698 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgttgattat 44648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39414 - 39180
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  39414 gtcttcggatttgtcaatgttggccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgtttcttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattct 39316  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt-ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39315 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgctt 39216  T
Q  223 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39215 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 39180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 39061
Alignment:
Q  150 tgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 249  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 39086  T
Q  250 gatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  39085 gatgttgaatgacattgttgattat 39061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 78645 - 78401
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |   || | ||||| |||||| |||||     
T  78645 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagccaattttcttgtgggttattgtgaccattcttgtatgaa 78546  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||  |||||||||| |||||||||||| | || | |  | |||||| | || | |||| |||||||| ||    
T  78545 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatg 78447  T
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  78446 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattat 78401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3708 - 3472
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||| | | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3708 atgttggctggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaa 3609  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3608 gttgtatgaataaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 3509  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3508 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 3472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8322 - 8258
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat 105  Q
    |||||||| | | ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322 atgttggctggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat 8258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6316 - 6080
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||| | | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6316 atgttggctggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaa 6217  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6216 gttgtatgaataaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 6117  T
Q  238 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6116 tatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1601 - 1360
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  1601 aattatcaatgttggctgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttaacaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 1502  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  1501 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 1403  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1402 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 1360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 1213
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1271 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 1213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 255973 - 256221
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    ||||||| || |||||||||| || |  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  255973 cttgggatttttcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattttta 256072  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256073 tatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaa 256172  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaca-ttgttgattat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  256173 -tggtgaaactatatgtgatagttgaagttgaatgacatttgttgattat 256221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 262579 - 262827
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    ||||||| || |||||||||| || |  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  262579 cttgggatttttcaatgttggtcggtgaccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccattttta 262678  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  262679 tatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaa 262778  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaca-ttgttgattat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  262779 -tggtgaaactatatgtgatagttgaagttgaatgacatttgttgattat 262827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 75800 - 76005
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||| |||||||| || |||||||||| || ||| | ||||||    
T  75800 ttttagtcggaaatgtttctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggat 75899  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  75900 atgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgt 75998  T
Q  268 tgattat 274  Q
    |||||||    
T  75999 tgattat 76005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 274
Target Start/End: Original strand, 124409 - 124604
Alignment:
Q  79 aaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgttta 177  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||    
T  124409 aaatgtttctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatattta 124508  T
Q  178 tcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  124509 tcatgagattggtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgattttgttgattat 124604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 193637 - 193519
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||  |||| |||||  |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  193637 ttttagtcggatatgtttctcaaaccaattgtcttaagaattatggtggttatgtttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggat 193538  T
Q  168 atgatgtttatcatgagat 186  Q
    |||||||||||||||||||    
T  193537 atgatgtttatcatgagat 193519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 193514 - 193461
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  193514 ttgaactggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 193461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1665
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||  |||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1431 gtcttgagaattgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaacatttcttgaactaactgtcttatgaattgtggtgactattct 1530  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||    
T  1531 tatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaacttacttataatgtaaggaatggttg 1630  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6642 - 6396
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  6642 gtcttggga-ttgtcaaagttggccgtttgccatttgacacg--tttcggccggaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttt 6546  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  6545 tatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttg 6446  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6445 aa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 6396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 137875 - 138124
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||  || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  137875 gtcttgggatttatcaatgttggccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatct 137974  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||    
T  137975 tatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttac-taaaatgtaatgaatgcttg 138073  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  138074 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 138124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 87526 - 87288
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||| || || ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||            ||||| ||||||    
T  87526 gtcttgagatttatcaatgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttcttgagccaattgtt-----------gtgaccattctt 87438  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatga-tgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  87437 atatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttg 87338  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  87337 aa-tggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 87288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10767 - 10517
Alignment:
Q  26 tcttgggaattg-tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctta-taattgtggtgactattct 123  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | |||| |||| |    
T  10767 tcttgggaatttatcaatgttggtcatttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttt 10668  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||  |||||||||||| |||||||||   || | |||||   |||||||||| ||||||| ||||     
T  10667 tatatgactaagtgaagttgtataaacgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcatagaatgtggtatgtgctcttacttagaatgtaaggaatga 10568  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    ||||| |||| ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10567 ttgaa-tggtaaaactatgtgaggtagttgatattgaatgacattgttgatt 10517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 6425 - 6672
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |  || ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  6425 cttgggatttgtcaatgttggtcggtaaccacttgatatggtttttggtcggaaatggttcttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattttta 6524  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6525 tataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaa 6624  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6625 -tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 6672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Original strand, 17503 - 17712
Alignment:
Q  66 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |      
T  17503 ggtttttggtcggaaatgtttcctgaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatga 17602  T
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17603 gatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataactt 17702  T
Q  265 tgttgattat 274  Q
    ||||||||||    
T  17703 tgttgattat 17712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 274
Target Start/End: Original strand, 23891 - 24131
Alignment:
Q  35 ttgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgacta 133  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  23891 ttgtcattgttggccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcctgaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggcta 23990  T
Q  134 agtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23991 agtgaagttgtatgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 24090  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24091 actatatgtgataattgatattgaataactttgttgattat 24131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 95559 - 95318
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  95559 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 95460  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  95459 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 95361  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  95360 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 95318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 95228 - 95170
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  95228 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgaaagttgatgttaaatgacattgttgattat 95170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 58 - 274
Target Start/End: Original strand, 5704 - 5922
Alignment:
Q  58 cttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctta-taattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataa 156  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5704 cttgacatggtttttggtctaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaataattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatga 5803  T
Q  157 ttgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatg-tt 255  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5804 ttgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaaggtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgatt 5903  T
Q  256 gaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  5904 gaatgacattgttgattat 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 129590 - 129355
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| | | ||||||||     
T  129590 gtcttgggaactatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatc 129492  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  129491 cttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaatgtaaggaatgct 129392  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  129391 tgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 129355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Original strand, 89894 - 90074
Alignment:
Q  80 aatgtttcttgagccaattgtctt-ataattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttat 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  89894 aatgtttcttgaaccaattgtcttgagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttat 89993  T
Q  179 catgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  89994 catgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaat 90074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 129345 - 129232
Alignment:
Q  162 ttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaata 260  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  129345 ttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 129246  T
Q  261 acattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||    
T  129245 acattgttgattat 129232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 90082 - 90197
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  90082 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 90181  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  90182 tgacattgttgattat 90197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 145763 - 145526
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaa 139  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  145763 atgttggccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaa 145664  T
Q  140 gttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaacta 237  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  145663 gttgtatgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaacta 145564  T
Q  238 ta-tgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  145563 tattgtgatagttgatgttaaatgaccttgttgattat 145526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 145436 - 145379
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  145436 aatgcttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattat 145379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 147782 - 147698
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatg 193  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  147782 tgtggtggctatgcttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 147692 - 147655
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  147692 ttgaataggtgaaactatatgtgattgttgatgttgaa 147655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8532 - 8282
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | ||| || |||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||  |    
T  8532 gtcttgggatttgtcaatgttggctggtcgccactggacatggtttttagtcgaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattatggtgactatgtt 8433  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  8432 taaataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacctaggatgtaagatatgtttg 8333  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8332 aattggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29123 - 28881
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||  |||||| ||||||    
T  29123 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgac 29024  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  29023 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatggtg 28924  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28923 aaactatctgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 28881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28791 - 28733
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28791 aatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 28733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 68 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23922
Alignment:
Q  68 tttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttata-attgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttgga 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  24128 tttttggtcggaaatgtt-cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattgaa 24030  T
Q  167 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 266  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24029 tatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacattg 23930  T
Q  267 ttgattat 274  Q
    ||||||||    
T  23929 ttgattat 23922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7891 - 7643
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  |||  ||||||||| |||||   || |||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  7891 ttgggaattgtcaatgttggtcggttgccacttgacacagacttta-tcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgactattctt 7793  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttga 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  7792 atatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaatgaatgcttga 7693  T
Q  225 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7692 aatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattgttgattat 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 188
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   |  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  432 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgcatttttgtcgaaaatgtttcttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 333  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  332 taagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatccttgaaatgg 233  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  232 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 154 - 39
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | || | |  |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatgaaagaaatgcatgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 55  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  54 taacattgttgattat 39  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1009 - 758
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattct 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  1009 gtcttgggaattatcaatgttggctggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattct 911  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgt--tggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||  | ||| ||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||||||    
T  910 tatacgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttagactgtaagaaatgct 811  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  810 tgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 274
Target Start/End: Original strand, 18504 - 18743
Alignment:
Q  41 atgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtga-ctattcttatatgactaagtga 138  Q
    |||||||||| | ||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  18504 atgttggccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtga 18603  T
Q  139 agttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatc-ttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaac 235  Q
    |||||||||||||||| ||  | | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  18604 agttgtatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctttacttaggatgtaagaaatgtttgaatggatgaaac 18703  T
Q  236 tata-tgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18704 tatattgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 18743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 274
Target Start/End: Original strand, 18843 - 18890
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18843 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattat 18890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 43023 - 43270
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctta 125  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |  || ||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||  |||    
T  43023 cttgggatttgtcaatgatggtcggtgaccacttgatatgatttttggtcgaaaatgtttcttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgttta 43122  T
Q  126 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaa 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43123 tataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 43222  T
Q  226 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43223 -tggtgaaatcatatgtgatagttgatgtttaatgacattgttgattat 43270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 271
Target Start/End: Original strand, 113662 - 113867
Alignment:
Q  66 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttg 164  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  113662 ggtttttggtcggaagtgttccttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattg 113761  T
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  113762 aatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacat 113860  T
Q  265 tgttgat 271  Q
    |||||||    
T  113861 tgttgat 113867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 108761 - 108510
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttataattg-tggtgactattc 122  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||  | ||||||||||    
T  108761 gtcttgggaatcttcattgttggccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattc 108664  T
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  108663 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgc 108564  T
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| || | |||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  108563 ttgaagtgataaaactatataaggtagttgatgttgaagaacattgttgattat 108510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 52352 - 52587
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||    
T  52352 tcaatgttggccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggt 52450  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaact 236  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  52451 gaagttatatgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaact 52549  T
Q  237 atatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52550 gtatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 52587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 56304 - 56539
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagt 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||    
T  56304 tcaatgttggccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggt 56402  T
Q  137 gaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaact 236  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  56403 gaagttatatgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaact 56501  T
Q  237 atatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  56502 gtatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 56539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20483 - 20240
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttat 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||| || ||||||||| | | |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||    
T  20483 ttgggatttgtcaatgttgtccggtagccacttgacatgggttttggtcgaatacgttttttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttat 20384  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 226  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||  ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20383 ataactaagtgaagatgt-tgaatggtta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaat 20288  T
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20287 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 20240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18399 - 18156
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttat 126  Q
    |||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||| || ||||||||| | | |||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||    
T  18399 ttgggatttgtcaatgttgtccggtagccacttgacatgggttttggtcgaatacgttttttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttat 18300  T
Q  127 atgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaat 226  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||  ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  18299 ataactaagtgaagatgt-tgaatggtta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaatgtaagaaatg-ttgaat 18204  T
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18203 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 18156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 7716 - 7966
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt--gagccaattgtcttat-aattgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||| |||||| |||||  ||| |||||  | ||| |||||| |||||||||    
T  7716 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatgcggtatt--gtcagaaatggttctttcgagtcaattaccgtatgaattgttgtgactatt 7813  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||     
T  7814 cttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgca 7913  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7914 tgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattat 7966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 13105 - 13355
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt--gagccaattgtcttat-aattgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||| |||||| |||||  ||| |||||  | ||| |||||| |||||||||    
T  13105 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatgcggtatt--gtcagaaatggttctttcgagtcaattaccgtatgaattgttgtgactatt 13202  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||     
T  13203 cttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgca 13302  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13303 tgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattat 13355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 155319 - 155545
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  155319 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatatttctttagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 155418  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  155419 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 155517  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  155518 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 155545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 155553 - 155668
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| | |||||||| | || | |||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  155553 tgttggatatgatatttgtcatgacatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgcttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 155652  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  155653 tgacattgttgattat 155668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 20403 - 20608
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | | || | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20403 tttttgtcggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 20502  T
Q  168 atgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgt 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20503 atgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaa-aaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 20601  T
Q  268 tgattat 274  Q
    |||||||    
T  20602 tgattat 20608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 274
Target Start/End: Original strand, 71515 - 71764
Alignment:
Q  26 tcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttataattg-tggtgactattct 123  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| | || | || | ||||||    
T  71515 tcttgggatttgtcaatgttgggtggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattct 71614  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71615 tatatgactaagttaagttatatgaatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttg 71714  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  71715 aa-tggtgaaactaaatgtaatagttcatgttgaatgacattgttgattat 71764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Original strand, 2937 - 3105
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2937 aattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatgctatcttactta 3036  T
Q  206 ggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3037 gaatgtaaggaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattat 3105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 14328 - 14577
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || | || |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||  |    
T  14328 gtcttgggatttcttaaagttggccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgtttcttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtt 14427  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14428 tatataactaagtgaagtggtatgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttg 14526  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  14527 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgaggagtgtcattgttgattat 14577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28462 - 28347
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | || | |  |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28462 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatgaaagaaatgcatgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 28363  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  28362 taacattgttgattat 28347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40458 - 40343
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | || | |  |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40458 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatgaaagaaatgcatgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 40359  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||    
T  40358 taacattgttgattat 40343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28610 - 28497
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||| | || | |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28610 tgttggatatgatgtttatcatgagatattgttttccctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaattatatgtgataattgatgttgaa 28512  T
Q  259 taacattgttgatta 273  Q
    | |||||||||||||    
T  28511 tgacattgttgatta 28497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40493
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||| | || | |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  40606 tgttggatatgatgtttatcatgagatattgttttccctcttacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaattatatgtgatatttgattttgaa 40508  T
Q  259 taacattgttgatta 273  Q
    | |||||||||||||    
T  40507 tgacattgttgatta 40493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 248604 - 248852
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagc--caattgtcttat-aattgtggtgactatt 121  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||| || ||  |||||||| ||||||     
T  248604 gtcttgggatttgtaaatgttggccggttgccacttggcatggtttttagtcgaaaatgtttcttgaacaccaattatcctaggaattgtggagactatg 248703  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
     |||||| || |||||||| ||| ||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  248704 attatataaccaagtgaaggtgt-tgaatgatta--tattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-t 248799  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  248800 tgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 146014 - 145775
Alignment:
Q  38 tcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttgg-tcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactattcttatatgactaag 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| || ||| ||||| ||||||  | | | |||||||||||||||||||||||    
T  146014 tcaatgttggccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttcctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaag 145915  T
Q  136 tgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  145914 tgaagttgtataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaattcttgaattggtaaa 145815  T
Q  234 actatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  145814 actatatgagatagtggatg-tgaatgacattgttgattat 145775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3676 - 3509
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 205  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  3676 aattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgatatcttac-ta 3578  T
Q  206 ggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3577 taatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattgttgattat 3509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1164 - 936
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  1164 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgaattggatttttgtcggaaatgtttcttttgccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 1065  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  1064 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgga-tgg 966  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  965 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15420 - 15192
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | | || | ||||| |||||| ||||||    
T  15420 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgaattggatttttgtcggaaatgtttcttttgccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgac 15321  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  15320 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaatgtaaggaatgcttgga-tgg 15222  T
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15221 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 15192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12143 - 12021
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || | ||||| |||||| ||||||    
T  12143 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttcttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgac 12044  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  12043 taagtgaagttgtatgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Original strand, 32338 - 32504
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 205  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32338 aattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-ta 32436  T
Q  206 ggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32437 gaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgctgattat 32504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 40506 - 40340
Alignment:
Q  106 aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttactta 205  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40506 aattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttac-ta 40408  T
Q  206 ggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40407 gaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgctgattat 40340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 38329 - 38521
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttgg 165  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||| | | || | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||  | | ||||    
T  38329 tttttgtcggaaatgtttttttagcaaattgccttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttgg 38428  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38429 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaat 38521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 38529 - 38644
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38529 tgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 38628  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  38629 tgacattgttgattat 38644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54658 - 54482
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  54658 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtat 54559  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 271  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54558 gctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 54482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 152
Target Start/End: Original strand, 14503 - 14623
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||   || |||  ||||||||||||||||   ||||||||||| ||| || | ||||| |||||| ||||||    
T  14503 aattatcaatgttgaccgtttgccacatgatttggatttatgtcggaaatgtttctttcaccaattgtcttgtaagttattgtgaccattcttgtatgac 14602  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatga 152  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14603 taagtgaagttgtatgaatga 14623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 274
Target Start/End: Original strand, 109282 - 109394
Alignment:
Q  163 tggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataa 261  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  109282 tggntatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatga 109381  T
Q  262 cattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||    
T  109382 cattgttgattat 109394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6375 - 6149
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||    || |||| || ||||||||||||| ||| | ||||||| |   || | | || ||||||| ||||||    
T  6375 aattgtcaatgttggccgtttgccacatgttttggatttttgttggaaatgtttcttaagcaagttgtcttgtgggttattgagattattcttgtatgac 6276  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  6275 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtg 6177  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6176 aaactatatgtgatagttgatgttgaat 6149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6141 - 6026
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||||||||||  || ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6141 tgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaa 6042  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | ||||||||||||||    
T  6041 tgacattgttgattat 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 216997 - 217061
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  216997 tgtaagaaatg-ttgaatatgtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgttgattat 217061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18428 - 18263
Alignment:
Q  29 tgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttata 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  18428 tgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttata 18329  T
Q  128 tgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatg 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18328 tgactaactgaagttgtatgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30123 - 30041
Alignment:
Q  188 tgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30123 tgtatgctatcttacttaggatgcaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga 30041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 30212 - 30144
Alignment:
Q  30 gggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaatt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30212 gggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatatggtttttgttcggaaatgtttattgagccaatt 30144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28111 - 27873
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||   || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||    
T  28111 aattatcaatgttggtcgtttgccacatgatttggatttttgttggaaatgtttcttgagcaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgac 28012  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || | || ||||||||||||||||    
T  28011 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttacttggaatatgag-aatgcttgaattggtg 27913  T
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27912 -aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatt 27873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Original strand, 2157 - 2319
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2157 attgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtat 2256  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 256  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2257 gctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 2319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 2386 - 2444
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2386 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53614 - 53462
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  53614 gtcttggga-ttgtcaatgttggccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgtttcttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattct 53517  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||||    
T  53516 tatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53212 - 53154
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53212 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattat 53154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 274
Target Start/End: Original strand, 2520 - 2770
Alignment:
Q  27 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt-gagccaattgtcttat-aattgtggtgactattctt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||| ||| ||| |||| | ||||| |||| |  |||||||||||    
T  2520 cttgggaattgtcaatgttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattctt 2617  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgct 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||  | ||| |||||| |||||| ||||| |    
T  2618 atatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctctaacttagaatgtaaaaaatgtt 2717  T
Q  222 tgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2718 tgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 2770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 11057 - 11238
Alignment:
Q  96 attgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--ggatatgatgtttatcatgagatatgtat 192  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||| |  |||||||||||  |||||    
T  11057 attgtcttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtat 11156  T
Q  193 gctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11157 gctatcttacttgagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 11238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6995 - 6742
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataattg-tggtgactatt 121  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||  || |||| | ||||| |||  | |||||||||    
T  6995 gtcttgggagttatcaatgttggccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttatcgtgactatt 6898  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaat 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  ||  |||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  6897 catatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaacgtaagaaat 6798  T
Q  219 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| || | | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6797 gcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 6742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17811 - 17619
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttgg 165  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| | | || | | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  | | ||||    
T  17811 tttttgtcggaaatgtttctttagaaaattgtcttgtgagttattgagattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttgg 17712  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17711 atatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagactgtaaggaatgcttgga-tggtgaaactatatgtgatagttgattttgaat 17619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17549 - 17496
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17549 ttgaaatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 259
Target Start/End: Original strand, 2735 - 2881
Alignment:
Q  114 tgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtg--ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgt 211  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |   ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2735 tgaccattcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaatgt 2834  T
Q  212 aagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2835 aaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 2881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 272
Target Start/End: Original strand, 2945 - 3001
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2945 aatgtttgactttgtgaaactaaatgtgatagtttatgttgaatgacattgttgatt 3001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21508
Alignment:
Q  66 ggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataatt-gtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttg 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg 21597  T
Q  165 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    ||||||                    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21596 gatatg--------------------atgctatcttacttagaatgtaaggaatgctttaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 129367 - 129451
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatg 193  Q
    |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  129367 tgtggtgattatgtttgtataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2531 - 2278
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttg--agccaattgtcttataattg-tggtgactatt 121  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||  || |||| | ||||| |||  | |||||||||    
T  2531 gtcttgggagttatcaatgttgaccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttgtaagtcaataggcttatgatttatcgtgactatt 2434  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataat--tgtgttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaat 218  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  ||  |||| | | |||||||||| | |||||||||    
T  2433 catatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaacgtaagaaat 2334  T
Q  219 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||| || | | |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2333 gcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattat 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14613 - 14533
Alignment:
Q  190 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14613 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga 14533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Original strand, 475 - 707
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttata-attgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |  || ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| |||| ||||||    
T  475 gtcttgggatttgtcaatattggtcggtgaccacttgatatcgttttaggtcggaaatgcttcttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattct 574  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 223  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||                  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  575 tatatgactaaacgaagttgtatgaatgaatgattgtattg------------------agatgagtatactatcttacttaggatgtaagaaatgcttg 656  T
Q  224 aattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  657 aattggtgaaactatatgtgatagttaacgttgaatgacattgttgattat 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1671
Alignment:
Q  162 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttgcatagaatgtaaggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 1322 - 1437
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttataat-tgtggtgactatt 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| |||||| || | | ||||||||     
T  1322 gtcttgggaattatcaatgttggccgtttgccacttgatacggttttt-gtcagaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatc 1420  T
Q  122 cttatatgactaagtga 138  Q
    |||||||||||||||||    
T  1421 cttatatgactaagtga 1437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 259
Target Start/End: Original strand, 1465 - 1565
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||| | || | |||| || ||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  1465 tgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaa 1564  T
Q  259 t 259  Q
    |    
T  1565 t 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 554 - 310
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||   |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || |  |||| |||||| ||||||    
T  554 aattatcaatgttggccgtttgccacatgatttgtatttttgtcggaaatgtttctttagccaattgtcttgtgagttattatgaccattcttgtatgac 455  T
Q  132 taagtgaagttgtatgaatgaataattg--tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattg 228  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||   | ||||||||||||||||||||||||| | || |    | |||||| | || |  ||| |||||||| ||    
T  454 taagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttcctattacttggaatatgggaa-tgcttgaaatg 356  T
Q  229 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  355 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 154
Target Start/End: Original strand, 5487 - 5617
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtctta-taattgtggtgactattct 123  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || | | || ||||||    
T  5487 gtcttgggatttatcaatgttggccgtatgccacttgatacagtttttggtcagaaatgtttcttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattct 5586  T
Q  124 tatatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5587 tatatgactaagtgaagttgtatgaacgaat 5617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6653
Alignment:
Q  197 tcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6577 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattgttgattat 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 274
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2889
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttgg 165  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  || |  |||||    
T  2680 tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttgg 2779  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 264  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||| | |||| || ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  2780 atatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacat 2879  T
Q  265 tgttgattat 274  Q
    ||||||||||    
T  2880 tgttgattat 2889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 274
Target Start/End: Original strand, 22940 - 23016
Alignment:
Q  197 tcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22940 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatg-tgaatgacattgttgattat 23016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 158 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32549 - 32432
Alignment:
Q  158 tgtgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 256  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32549 tgtgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttg 32450  T
Q  257 aataacattgttgattat 274  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  32449 aatgacattgtcgattat 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59572
Alignment:
Q  171 atgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||     
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattgttgg 59576  T
Q  271 ttat 274  Q
    ||||    
T  59575 ttat 59572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 59702 - 59673
Alignment:
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59702 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatg 59673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 6397 - 6462
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6397 tgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 6462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6395
Alignment:
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtt-tatcatgagat 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatg-tggatatgatgttctatcatgagat 6395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34478 - 34419
Alignment:
Q  215 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34478 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattgttgattat 34419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 27760 - 27825
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27760 tgtaagaaatgtttgaattgttgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattgttgattat 27825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 191
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  123 ttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgta 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattatg-tggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 151
Target Start/End: Original strand, 1752 - 1879
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt--gagccaattgtcttat-aattgtggtgactatt 121  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||  |||| ||  |||||||||| |||||  ||| |||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  1752 gtcttgggatttatcaatgttggccgtttgccaattgattcggtatt--gtcggaaatggttctttcgagtcaattaccttatgaattgttgtgactatt 1849  T
Q  122 cttatatgactaagtgaagttgtatgaatg 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850 cttatatgactaagtaaagttgtatgaatg 1879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2207 - 2089
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggat 167  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||  |||| |||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  2207 ttttagtcggatatgtttctcgaaccaattgttttaagaattatggtggttatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcat 2108  T
Q  168 atgatgtttatcatgagat 186  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2107 atgatgtttatcatgagat 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 2031
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2084 ttgaagtggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 2031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 41614 - 41556
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  41614 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattat 41556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41737 - 41678
Alignment:
Q  199 ttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 259  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41737 ttacttagaatgtaaggaatgcttggat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 41678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7974 - 7890
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatg 193  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7974 tgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38190 - 38132
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  38190 aatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattat 38132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2333 - 2202
Alignment:
Q  25 gtcttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaat-gtttctt--gagccaattgtcttataat-tgtggtgactat 120  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||||||  || |||||| |||| |||| | | ||||||||    
T  2333 gtcttgggaatcatcaatgatggccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaaaagtttcttttgaaccaattttcttgtaatctatcgtgactat 2235  T
Q  121 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaa 153  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2234 ccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaa 2202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30226 - 30010
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttctt--gagccaattgtcttataat-tgtggtgactattctt 124  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || |||  |||||||||| |||||  ||||||||| |||||| || | | |||||||  |||    
T  30226 ttgggaattatcaatgttggtcgtttgccacttgatatggattt--gtcggaaatgattcttttgagccaattatcttatgatctttcgtgactaacctt 30129  T
Q  125 atatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgt-gttggatatgatgtttatcatgagat-atgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgctt 222  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||  || | | | |||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| | || | ||||||  ||    
T  30128 atatgactaaatgaagatgtatgagtgaattgttatagcttgatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaataatt 30029  T
Q  223 gaattggtgaaactatatg 241  Q
    | | |||||||||||||||    
T  30028 ggagtggtgaaactatatg 30010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20672 - 20558
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  | |||||||||   ||| ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  20672 tgttggatatgatgtttaacat-agatattgtattttctcttacttaaattgtgagaaatgcttgaaattgtaaaactatatgaggtagttgatgttgaa 20574  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||    
T  20573 tgatattgttgattat 20558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27501 - 27387
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  | |||||||||   ||| ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  27501 tgttggatatgatgtttaacat-agatattgtattttctcttacttaaattgtgagaaatgcttgaaattgtaaaactatatgaggtagttgatgttgaa 27403  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||    
T  27402 tgatattgttgattat 27387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4692
Alignment:
Q  230 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatt 4692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Original strand, 4765 - 4849
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatg 193  Q
    ||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4765 tgtggtggctatgtttacataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 253
Target Start/End: Original strand, 4855 - 4887
Alignment:
Q  221 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatg 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4855 ttgaataggtgaaactatatgtgatagttgatg 4887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21739 - 21623
Alignment:
Q  33 aattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgac 131  Q
    |||| |||||||||||||||| || | |||   || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| ||||||    
T  21739 aattatcaatgttggccgtttaccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgac 21640  T
Q  132 taagtgaagttgtatga 148  Q
    |||||||||||||||||    
T  21639 taagtgaagttgtatga 21623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25958 - 25753
Alignment:
Q  69 ttttggtcggaaatgtttcttgagccaattgtcttataa-ttgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgtt--gg 165  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | | || | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||   | | ||| | ||  ||    
T  25958 tttttgtcggaaatgtttctttagcaaattgttttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttgg 25859  T
Q  166 atatgatgtttatcatgagatatg--tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaca 263  Q
    ||||||||||||||||||||| |   | | |  | |||||| | || | |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||    
T  25858 atatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgaca 25760  T
Q  264 ttgttga 270  Q
    |||||||    
T  25759 ttgttga 25753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21552 - 21498
Alignment:
Q  216 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||    
T  21552 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttga 21498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 556 - 442
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| ||||  | |||||||||   ||| ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  556 tgttggatatgatgtttaacat-atatattgtattttctcttacttaaagtgtgagaaatgcttgaaattgttaaactatatgaggtagttgatgttgaa 458  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | | ||||||||||||    
T  457 tgatattgttgattat 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Original strand, 17356 - 17402
Alignment:
Q  227 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatta 273  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17356 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgatta 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Original strand, 330958 - 330999
Alignment:
Q  113 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 154  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  330958 gtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 330999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 188281 - 188318
Alignment:
Q  28 ttgggaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacac 65  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  188281 ttgggaattgtcaatgttggtcgtttgccacttgacac 188318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 406
Alignment:
Q  232 aaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgatt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgatt 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 274
Target Start/End: Original strand, 23661 - 23776
Alignment:
Q  160 tgttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | ||||| | |||||||| | || | ||||||  ||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  23661 tgttggatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaataattgaagtggtgaaactatctgatgtagttgatgttgaa 23760  T
Q  259 taacattgttgattat 274  Q
    | | |||| |||||||    
T  23761 tgatattgatgattat 23776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40505 - 40464
Alignment:
Q  209 tgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 251  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40505 tgtaagaaatg-ttgaatgggtgaaactatatgtgatagttga 40464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40583 - 40510
Alignment:
Q  109 tgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatga 183  Q
    ||||||| ||||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  40583 tgtggtggctatgtttatataacta-gtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatga 40510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4935 - 4860
Alignment:
Q  32 gaattgtcaatgttggccgtttgcctcttgacacggtttttggtcggaaatgtttc--ttgagccaattgtcttat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||| | || |||| |||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  4935 gaattatcaatgttggccgtttgccacatgatatggatttttgtcggaaatgattcttttaagccaattgtcttat 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University