View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1529_low_1 (Length: 854)

Name: NF1529_low_1
Description: NF1529
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1529_low_1
NF1529_low_1
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (32-835)||(45067692-45068495)
chr8 (221-835)||(15012531-15013146)
chr8 (32-832)||(1238360-1239168)
chr8 (38-835)||(16709943-16710747)
chr8 (29-835)||(36424994-36425809)
chr8 (235-835)||(11357672-11358272)
chr8 (218-835)||(36021261-36021878)
chr8 (235-835)||(7311492-7312091)
chr8 (350-838)||(26250186-26250673)
chr8 (235-835)||(36076110-36076709)
chr8 (255-835)||(6464076-6464655)
chr8 (235-835)||(36004962-36005561)
chr8 (255-835)||(8012820-8013399)
chr8 (658-835)||(41242018-41242195)
chr8 (666-826)||(31017538-31017698)
chr8 (685-835)||(12768887-12769037)
chr8 (380-827)||(7933551-7933997)
chr8 (395-773)||(24219912-24220288)
chr8 (283-622)||(29336591-29336930)
chr8 (380-622)||(14394054-14394295)
chr8 (14-143)||(12769742-12769871)
chr8 (441-505)||(3298970-3299034)
chr8 (115-192)||(11357522-11357599)
chr8 (115-194)||(6463914-6463993)
chr8 (115-194)||(7312152-7312231)
chr8 (115-194)||(36004822-36004901)
chr8 (441-505)||(9068096-9068161)
chr8 (441-505)||(11308916-11308981)
chr8 (441-505)||(16580253-16580318)
chr8 (441-505)||(28370261-28370326)
chr8 (115-212)||(36021086-36021183)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (28-835)||(10940577-10941383)
chr3 (28-835)||(43931727-43932523)
chr3 (28-835)||(43995220-43996022)
chr3 (228-835)||(23068608-23069217)
chr3 (37-835)||(32746513-32747318)
chr3 (218-835)||(27501429-27502046)
chr3 (29-835)||(24179217-24180030)
chr3 (255-835)||(4310986-4311565)
chr3 (255-835)||(6036409-6036990)
chr3 (255-835)||(9570047-9570627)
chr3 (255-835)||(9576549-9577129)
chr3 (255-834)||(20650624-20651203)
chr3 (255-683)||(47441096-47441524)
chr3 (274-818)||(2785865-2786408)
chr3 (589-834)||(25893380-25893625)
chr3 (115-475)||(25893729-25894099)
chr3 (629-835)||(13015129-13015335)
chr3 (406-586)||(41353963-41354143)
chr3 (380-688)||(17735634-17735940)
chr3 (380-688)||(19036903-19037209)
chr3 (380-827)||(4590946-4591392)
chr3 (405-688)||(24705101-24705382)
chr3 (495-802)||(20952493-20952800)
chr3 (380-688)||(25692267-25692578)
chr3 (28-265)||(47441548-47441784)
chr3 (361-622)||(461036-461295)
chr3 (528-773)||(9330910-9331155)
chr3 (397-585)||(4644104-4644291)
chr3 (51-164)||(2786532-2786645)
chr3 (363-430)||(6817168-6817235)
chr3 (380-457)||(20949814-20949890)
chr3 (37-194)||(23069282-23069439)
chr3 (547-732)||(27900777-27900960)
chr3 (723-827)||(4644316-4644420)
chr3 (441-505)||(9989564-9989628)
chr3 (115-194)||(6037073-6037152)
chr3 (52-170)||(20650357-20650475)
chr3 (441-519)||(36469351-36469429)
chr3 (115-216)||(9569871-9569972)
chr3 (6-45)||(10940436-10940475)
chr3 (547-622)||(25805261-25805338)
chr3 (441-505)||(3588568-3588633)
chr3 (441-505)||(8615671-8615736)
chr3 (115-216)||(9576373-9576474)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (28-823)||(2438955-2439745)
chr5 (26-835)||(12505039-12505844)
chr5 (51-834)||(4973707-4974502)
chr5 (218-835)||(2958002-2958619)
chr5 (218-835)||(2966471-2967088)
chr5 (112-835)||(22360107-22360838)
chr5 (254-835)||(40958116-40958696)
chr5 (112-835)||(22313973-22314704)
chr5 (245-835)||(42150962-42151551)
chr5 (29-835)||(25893912-25894728)
chr5 (228-835)||(5876361-5876967)
chr5 (255-835)||(29414168-29414748)
chr5 (219-835)||(29980602-29981221)
chr5 (255-835)||(34356788-34357367)
chr5 (255-835)||(34358579-34359158)
chr5 (417-835)||(30040905-30041323)
chr5 (380-827)||(12918575-12919021)
chr5 (380-802)||(3412915-3413336)
chr5 (219-422)||(29974514-29974718)
chr5 (219-422)||(30021924-30022128)
chr5 (396-827)||(30579830-30580261)
chr5 (379-683)||(42747381-42747683)
chr5 (380-827)||(9843500-9843946)
chr5 (380-802)||(2155745-2156166)
chr5 (380-688)||(34738430-34738736)
chr5 (380-688)||(19853153-19853459)
chr5 (362-417)||(17346799-17346854)
chr5 (363-430)||(37335695-37335762)
chr5 (28-170)||(2823074-2823216)
chr5 (112-211)||(29414014-29414113)
chr5 (640-827)||(33794243-33794430)
chr5 (112-190)||(5877015-5877093)
chr5 (441-505)||(11766923-11766987)
chr5 (441-505)||(31846148-31846212)
chr5 (441-505)||(33434771-33434835)
chr5 (115-194)||(34356603-34356682)
chr5 (369-417)||(40153906-40153954)
chr5 (115-211)||(40957965-40958061)
chr5 (115-194)||(34358394-34358473)
chr5 (441-505)||(11723205-11723270)
chr5 (441-505)||(16904538-16904603)
chr5 (441-505)||(24835903-24835968)
chr5 (441-506)||(27167026-27167091)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (143-835)||(45433729-45434420)
chr7 (228-835)||(33850111-33850722)
chr7 (28-835)||(39433050-39433856)
chr7 (29-835)||(15949302-15950105)
chr7 (112-835)||(15914781-15915502)
chr7 (254-835)||(3923592-3924172)
chr7 (115-835)||(8184741-8185471)
chr7 (30-835)||(19089951-19090751)
chr7 (254-835)||(23612532-23613112)
chr7 (218-835)||(48352942-48353559)
chr7 (255-835)||(26602055-26602634)
chr7 (115-835)||(8192301-8193031)
chr7 (218-835)||(48346558-48347175)
chr7 (235-835)||(6020343-6020943)
chr7 (245-835)||(1948123-1948712)
chr7 (222-835)||(14287858-14288472)
chr7 (222-835)||(14299043-14299657)
chr7 (254-835)||(36875688-36876268)
chr7 (115-835)||(9642265-9642995)
chr7 (255-835)||(5049412-5049991)
chr7 (255-835)||(6795581-6796160)
chr7 (235-835)||(21642661-21643262)
chr7 (255-835)||(1379090-1379669)
chr7 (255-835)||(2446789-2447368)
chr7 (230-835)||(8141921-8142525)
chr7 (28-611)||(22853479-22854061)
chr7 (685-827)||(13774059-13774201)
chr7 (699-835)||(5056250-5056386)
chr7 (700-835)||(37026191-37026326)
chr7 (380-827)||(21900814-21901259)
chr7 (28-384)||(37026324-37026675)
chr7 (380-622)||(10830750-10830991)
chr7 (380-622)||(11024542-11024783)
chr7 (496-819)||(7412658-7412980)
chr7 (380-585)||(8881037-8881227)
chr7 (280-400)||(7412531-7412652)
chr7 (28-87)||(33849903-33849962)
chr7 (547-662)||(43364566-43364680)
chr7 (115-211)||(21643294-21643390)
chr7 (29-211)||(14288496-14288677)
chr7 (29-211)||(14299681-14299862)
chr7 (547-804)||(28442628-28442883)
chr7 (115-212)||(36876330-36876427)
chr7 (126-194)||(3923456-3923524)
chr7 (115-211)||(6020202-6020298)
chr7 (115-211)||(23613164-23613260)
chr7 (115-194)||(1379752-1379831)
chr7 (115-194)||(2447453-2447532)
chr7 (115-194)||(5049250-5049329)
chr7 (115-194)||(6796243-6796322)
chr7 (547-622)||(27951205-27951280)
chr7 (547-622)||(27954442-27954517)
chr7 (115-194)||(48346432-48346511)
chr7 (115-194)||(48352816-48352895)
chr7 (547-622)||(20403843-20403920)
chr7 (112-190)||(26602783-26602861)
chr7 (11-45)||(39433959-39433993)
chr7 (441-505)||(10346234-10346299)
chr7 (441-506)||(31878768-31878833)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (28-835)||(11912535-11913341)
chr1 (134-835)||(44916481-44917181)
chr1 (29-835)||(9869248-9870054)
chr1 (28-835)||(32797866-32798681)
chr1 (28-835)||(1115256-1116064)
chr1 (30-835)||(26621613-26622417)
chr1 (32-835)||(44241500-44242311)
chr1 (30-835)||(1174749-1175550)
chr1 (32-835)||(4599672-4600483)
chr1 (255-835)||(31072461-31073042)
chr1 (235-835)||(23761816-23762415)
chr1 (30-835)||(41304795-41305593)
chr1 (112-835)||(29001874-29002598)
chr1 (230-835)||(6238798-6239403)
chr1 (255-835)||(43686772-43687353)
chr1 (235-835)||(39052818-39053417)
chr1 (235-835)||(39059190-39059789)
chr1 (255-835)||(45015924-45016503)
chr1 (255-835)||(42092039-42092618)
chr1 (51-773)||(35085214-35085937)
chr1 (450-835)||(41297660-41298045)
chr1 (112-622)||(28996371-28996882)
chr1 (30-511)||(45023002-45023491)
chr1 (612-835)||(41299044-41299267)
chr1 (272-820)||(47646828-47647375)
chr1 (35-265)||(31073062-31073292)
chr1 (380-827)||(23251503-23251949)
chr1 (379-681)||(31473556-31473857)
chr1 (380-773)||(5357372-5357764)
chr1 (283-688)||(13249008-13249409)
chr1 (380-827)||(45619769-45620215)
chr1 (380-748)||(38672402-38672769)
chr1 (380-773)||(28413298-28413690)
chr1 (380-802)||(13432025-13432447)
chr1 (28-203)||(23252129-23252304)
chr1 (380-682)||(2824445-2824746)
chr1 (380-802)||(39806233-39806654)
chr1 (380-688)||(30660131-30660437)
chr1 (165-302)||(5444634-5444770)
chr1 (28-193)||(44917185-44917349)
chr1 (51-194)||(43687424-43687567)
chr1 (461-688)||(7063371-7063601)
chr1 (787-835)||(27240161-27240209)
chr1 (536-688)||(13830549-13830701)
chr1 (547-622)||(21815176-21815250)
chr1 (115-194)||(39052656-39052735)
chr1 (115-194)||(39059028-39059107)
chr1 (37-194)||(23761623-23761779)
chr1 (441-505)||(432270-432334)
chr1 (441-505)||(9667625-9667689)
chr1 (6-45)||(9870067-9870106)
chr1 (115-194)||(45016586-45016665)
chr1 (441-505)||(12168145-12168210)
chr1 (441-505)||(38121861-38121926)
chr1 (441-505)||(39001110-39001175)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (28-835)||(15314-16118)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (60-834)||(30210841-30211614)
chr4 (31-835)||(36754072-36754870)
chr4 (32-835)||(16405485-16406300)
chr4 (30-835)||(13594251-13595064)
chr4 (218-835)||(27590448-27591065)
chr4 (115-835)||(17456998-17457728)
chr4 (222-835)||(37367780-37368393)
chr4 (30-835)||(8104025-8104837)
chr4 (254-835)||(55462271-55462851)
chr4 (255-835)||(5660048-5660628)
chr4 (255-835)||(41373130-41373709)
chr4 (456-835)||(16838059-16838438)
chr4 (218-643)||(37355811-37356236)
chr4 (254-625)||(30238582-30238952)
chr4 (112-567)||(7780737-7781200)
chr4 (303-688)||(49358862-49359247)
chr4 (655-835)||(30238403-30238583)
chr4 (684-835)||(7780550-7780701)
chr4 (380-688)||(52182792-52183099)
chr4 (380-748)||(13003431-13003798)
chr4 (496-827)||(2947996-2948327)
chr4 (28-170)||(5659795-5659937)
chr4 (32-194)||(37355602-37355764)
chr4 (30-194)||(55462038-55462201)
chr4 (29-211)||(27591087-27591268)
chr4 (29-211)||(37367575-37367756)
chr4 (115-211)||(30239002-30239098)
chr4 (441-506)||(21677595-21677661)
chr4 (441-505)||(323606-323671)
chr4 (441-505)||(4839065-4839130)
chr4 (441-506)||(19247756-19247821)
chr4 (441-506)||(52618671-52618736)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (32-835)||(13671081-13671896)
chr6 (235-835)||(4186828-4187429)
chr6 (32-834)||(9864028-9864838)
chr6 (32-835)||(21261839-21262653)
chr6 (218-835)||(7069164-7069781)
chr6 (218-835)||(34655394-34656011)
chr6 (218-835)||(4019697-4020314)
chr6 (218-835)||(4026123-4026740)
chr6 (218-835)||(34648943-34649560)
chr6 (218-818)||(7061978-7062578)
chr6 (235-835)||(31548038-31548638)
chr6 (219-835)||(32327956-32328572)
chr6 (255-835)||(1427923-1428502)
chr6 (246-788)||(29907049-29907591)
chr6 (255-835)||(34711055-34711636)
chr6 (386-827)||(27670245-27670686)
chr6 (255-801)||(1166978-1167525)
chr6 (463-835)||(4738030-4738402)
chr6 (489-788)||(30117032-30117331)
chr6 (115-554)||(31128637-31129088)
chr6 (658-835)||(11058052-11058229)
chr6 (255-462)||(4718040-4718246)
chr6 (29-407)||(4737644-4738030)
chr6 (380-820)||(9846679-9847119)
chr6 (396-773)||(10081203-10081579)
chr6 (379-688)||(22870530-22870838)
chr6 (317-450)||(30121098-30121231)
chr6 (395-622)||(11016444-11016670)
chr6 (37-345)||(27670682-27670991)
chr6 (28-168)||(1166752-1166892)
chr6 (115-210)||(7061853-7061948)
chr6 (115-210)||(7069039-7069134)
chr6 (368-430)||(14759219-14759281)
chr6 (368-418)||(20382818-20382868)
chr6 (26-211)||(31548683-31548867)
chr6 (547-674)||(18765994-18766120)
chr6 (115-194)||(34710907-34710986)
chr6 (115-212)||(32327831-32327928)
chr6 (547-619)||(14354724-14354796)
chr6 (115-194)||(1427761-1427840)
chr6 (115-194)||(4019573-4019652)
chr6 (115-194)||(4025999-4026078)
chr6 (115-194)||(4717878-4717957)
chr6 (710-820)||(11015419-11015529)
chr6 (116-194)||(34656056-34656134)
chr6 (441-505)||(3539215-3539280)
chr6 (441-505)||(9932734-9932799)
chr6 (441-505)||(26515357-26515422)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (255-835)||(2788-3369)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (219-835)||(45012126-45012742)
chr2 (30-835)||(16816602-16817409)
chr2 (30-835)||(16855759-16856566)
chr2 (30-835)||(15852693-15853506)
chr2 (228-835)||(2020919-2021527)
chr2 (115-835)||(43268002-43268732)
chr2 (255-835)||(36781682-36782263)
chr2 (219-835)||(34834275-34834891)
chr2 (219-835)||(34840719-34841335)
chr2 (219-835)||(2157755-2158370)
chr2 (219-835)||(2164171-2164786)
chr2 (259-835)||(21067460-21068037)
chr2 (27-713)||(21341201-21341883)
chr2 (356-835)||(21331594-21332073)
chr2 (219-835)||(13901419-13902036)
chr2 (254-835)||(42930876-42931451)
chr2 (235-835)||(12950939-12951540)
chr2 (115-680)||(29485193-29485767)
chr2 (275-820)||(11909470-11910014)
chr2 (280-819)||(13162978-13163515)
chr2 (380-802)||(36841964-36842385)
chr2 (380-688)||(37439159-37439465)
chr2 (380-802)||(41455782-41456203)
chr2 (727-835)||(29485070-29485178)
chr2 (536-827)||(17788871-17789162)
chr2 (400-622)||(24852672-24852892)
chr2 (379-601)||(34744913-34745136)
chr2 (753-835)||(21341879-21341961)
chr2 (380-507)||(17863954-17864080)
chr2 (754-835)||(45700642-45700723)
chr2 (547-688)||(28144776-28144917)
chr2 (30-265)||(21067192-21067426)
chr2 (51-211)||(2020733-2020892)
chr2 (30-194)||(36781448-36781611)
chr2 (30-211)||(42930646-42930825)
chr2 (718-764)||(45700590-45700636)
chr2 (115-194)||(2158416-2158495)
chr2 (115-194)||(2164832-2164911)
chr2 (115-194)||(34834150-34834229)
chr2 (115-194)||(34840594-34840673)
chr2 (115-194)||(45012788-45012867)
chr2 (363-400)||(22197696-22197733)
chr2 (441-505)||(29223882-29223947)
chr2 (441-505)||(29337181-29337246)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (257-835)||(2763-3343)
[»] scaffold0510 (3 HSPs)
scaffold0510 (30-835)||(8156-8960)
scaffold0510 (495-835)||(2300-2639)
scaffold0510 (30-379)||(1625-1980)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (255-835)||(49833-50412)
scaffold0053 (112-194)||(71231-71313)
scaffold0053 (115-194)||(50495-50574)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (255-835)||(4505-5084)
scaffold0043 (115-194)||(4343-4422)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (112-500)||(11491-11877)
scaffold0513 (584-835)||(12076-12327)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (573-748)||(24082-24257)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (547-622)||(17559-17633)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (112-164)||(6921-6973)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (547-622)||(1498-1572)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (441-505)||(8910-8975)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (441-506)||(12132-12197)
scaffold0298 (441-506)||(15902-15967)
[»] scaffold0295 (1 HSPs)
scaffold0295 (547-620)||(4554-4627)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (441-505)||(28828-28893)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (441-505)||(25579-25644)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 680; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 835
Target Start/End: Original strand, 45067692 - 45068495
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45067692 tcgccatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggcggcctaaacttctcaagggtgacgtggctcaaacttaatggtgaagaaacatcaactcg 45067791  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  45067792 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcgagttgatgtagattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggggatcttagtttttctcat 45067891  T
Q  232 agtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatca 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45067892 agtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggattgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttgagagatca 45067991  T
Q  332 caagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatct 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45067992 caagtttgtaatgaatcattctctttcaattcatttttgcaaggcttcaatgacaaggagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatct 45068091  T
Q  432 tagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaat 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45068092 tagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaat 45068191  T
Q  532 tgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtat 631  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45068192 tgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacattgaattgatgttttgataatcaccttttgtat 45068291  T
Q  632 ccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgat 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  45068292 ccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgaaacatcgactat 45068391  T
Q  732 tgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtca 831  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45068392 tgaatggtacaattgatctcacaatattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtca 45068491  T
Q  832 ttag 835  Q
    ||||    
T  45068492 ttag 45068495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 221 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 15013146 - 15012531
Alignment:
Q  221 gtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt- 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15013146 gtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttt 15013047  T
Q  320 gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013046 gttgagagatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 15012947  T
Q  420 ggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttat 519  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15012946 ggtacttgatcttagtttaacatgtaatcttttgatatagaaatatatggttctagcatttgatttaatattgatgttattcttgcactttaatgcttat 15012847  T
Q  520 gtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15012846 gtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctaaacatggaattgatgttttgataat 15012747  T
Q  620 caccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 719  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15012746 cactttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattaagaaatcatcaattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 15012647  T
Q  720 gacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15012646 gacatcgacgattgaatgatacaattgacttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatc 15012547  T
Q  820 catgtatggtcattag 835  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15012546 catgtatagtcattag 15012531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 832
Target Start/End: Complemental strand, 1239168 - 1238360
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||  ||| ||  |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  1239168 tcgccatggcgagtgaaagtactcgcgaggcgagttaaggcggtttaagcttttcactgatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacttcaactcg 1239069  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcat 231  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||| ||| ||  || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||| || |    
T  1239068 ccatggcgaatgaagaagctcgcgaggcgagtagacacagatttagaactctataaatagcccattcaatcatttctttgg-gagtt-agtttttatctt 1238971  T
Q  232 agtttttaa---------cttgtaatactttta-gagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgt 321  Q
    ||||||| |         ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  1238970 agtttttcatagttttcacttgtaatatttttaagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgt 1238871  T
Q  322 tgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagagg 421  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1238870 tgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttctatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagagg 1238772  T
Q  422 tacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatg 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  1238771 tacttgatcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgttattgatgttattcttgcactttaatgtttatc 1238672  T
Q  521 tttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1238671 tttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatc 1238572  T
Q  621 accttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgag 720  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238571 accttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatctattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgtg 1238472  T
Q  721 acatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238471 acatcgactattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc 1238372  T
Q  821 atgtatggtcat 832  Q
    ||||||||||||    
T  1238371 atgtatggtcat 1238360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 38 - 835
Target Start/End: Original strand, 16709943 - 16710747
Alignment:
Q  38 tggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatgg 137  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || || |||||||| ||||||||||||||    
T  16709943 tggcgagggaaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcattgctgacgtggcacaaacccaatggggaagaaacttcaactcgccatgg 16710042  T
Q  138 cgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttt---------tct 228  Q
    |||||| |||  |||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||    | |  ||||||||         |||    
T  16710043 cgaatgaagtagctcgcgaggcgagtgaatgcatactcagaattctataaatagcccactcaaccatttcaaa--aaaacttagttttatcttagtttct 16710140  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagata 328  Q
    | |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |    
T  16710141 cttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagatagtggattcttcatcttttgttgagaaa 16710240  T
Q  329 tcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttga 428  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16710241 tcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaagacttccatgacaatgagtagctaaatctcccttgttgggattagagatacttga 16710339  T
Q  429 tcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatt 527  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  16710340 tcatagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatt 16710439  T
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt 627  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  16710440 taattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgt 16710539  T
Q  628 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710540 gtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcga 16710639  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16710640 ccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatg 16710739  T
Q  828 gtcattag 835  Q
     |||||||    
T  16710740 atcattag 16710747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 835
Target Start/End: Original strand, 36424994 - 36425809
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  36424994 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 36425092  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg---agagttt------ 219  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    | |||||          
T  36425093 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgatatatagttttttact 36425192  T
Q  220 -agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |  ||    
T  36425193 tagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagaatgatagagagtggattcttcattctt 36425292  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36425293 tgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 36425392  T
Q  419 aggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctta 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  36425393 aggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttta 36425492  T
Q  519 tgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataa 618  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36425493 tctttggtttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataa 36425592  T
Q  619 tcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttg 718  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36425593 tcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcaagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttg 36425692  T
Q  719 agacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 818  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36425693 agacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 36425792  T
Q  819 ccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||| |||||||    
T  36425793 ccatgtatgatcattag 36425809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Original strand, 11357672 - 11358272
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  11357672 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgaaagagagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 11357771  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    |||   |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357772 gttgtaaatgaatttttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatcacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 11357871  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  11357872 cttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 11357971  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11357972 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatcca 11358071  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11358072 aacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattga 11358171  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11358172 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 11358271  T
Q  835 g 835  Q
    |    
T  11358272 g 11358272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 36021261 - 36021878
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    |||| |||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |    
T  36021261 ttagcttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcct 36021360  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021361 ttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 36021459  T
Q  418 gaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgct 516  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  36021460 gaggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctt 36021559  T
Q  517 tatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgat 616  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  36021560 tatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgctttgat 36021659  T
Q  617 aatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtt 716  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36021660 aatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtt 36021759  T
Q  717 tgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctaga 816  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36021760 tgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctaga 36021859  T
Q  817 atccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  36021860 atccatgtatgatcattag 36021878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 7312091 - 7311492
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  7312091 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaa 7311992  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7311991 gtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatag 7311893  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  7311892 tttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 7311793  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7311792 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatcca 7311693  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7311692 aacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattga 7311593  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7311592 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 7311493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 838
Target Start/End: Original strand, 26250186 - 26250673
Alignment:
Q  350 ttctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatct 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26250186 ttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatct 26250285  T
Q  450 tttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacactt 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26250286 tttgatctataaatatatggttctaacatt-gatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaatactt 26250384  T
Q  550 ttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttct 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26250385 ttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttaataatcaccttttgtatccaaactaaaagctttct 26250484  T
Q  650 tatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatt 749  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26250485 tatcattcaatagattgaaaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatt 26250584  T
Q  750 tcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattagatt 838  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26250585 tcacaatattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagatt 26250673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 36076709 - 36076110
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  36076709 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaa 36076610  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36076609 gtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatag 36076511  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  36076510 tttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 36076411  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36076410 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatcca 36076311  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36076310 aacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattga 36076211  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36076210 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 36076111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 6464076 - 6464655
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  6464076 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 6464174  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  6464175 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 6464274  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6464275 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 6464374  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6464375 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 6464474  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6464475 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 6464574  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6464575 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 6464655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Original strand, 36004962 - 36005561
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  36004962 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaa 36005061  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36005062 gtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatag 36005160  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  36005161 tttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 36005260  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36005261 gattgaaaaatacttttgaatcttggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatcca 36005360  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36005361 aacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattga 36005460  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36005461 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 36005560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 8012820 - 8013399
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  8012820 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 8012918  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  8012919 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 8013018  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8013019 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 8013118  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8013119 tctaggtttagaataaccatctgtcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 8013218  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8013219 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 8013318  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8013319 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 8013399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 658 - 835
Target Start/End: Original strand, 41242018 - 41242195
Alignment:
Q  658 aatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaata 757  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41242018 aatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaata 41242117  T
Q  758 ttgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41242118 ttgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 41242195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 666 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 31017698 - 31017538
Alignment:
Q  666 gagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttgg 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31017698 gagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgaactcacaatattttttgg 31017599  T
Q  766 acacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31017598 acacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtat 31017538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 685 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 12769037 - 12768887
Alignment:
Q  685 gataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcga 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  12769037 gataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtcttgtcga 12768938  T
Q  785 gggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  12768937 gggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattag 12768887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Original strand, 7933551 - 7933997
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  7933551 catgacaatgatgaactaaatctctttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaat 7933649  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaat-aatcatctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7933650 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataaattatctat 7933748  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  7933749 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcga 7933848  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    |||||  ||  || |||   ||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  | |    
T  7933849 ttaaactatccgatcgataattggattgttcaacagtttgagaaatcaactattgaacaatacaatggatttcacacgattatttggacacgaataatct 7933948  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  7933949 tgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 7933997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 395 - 773
Target Start/End: Original strand, 24219912 - 24220288
Alignment:
Q  395 ctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgat 494  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |  |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||||||||     
T  24219912 ctaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-taagttgataatgtaaacttttgatctttcaatatatgattctagcaatttacatgatattgaa 24220010  T
Q  495 gttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttcta 594  Q
    |||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||||    
T  24220011 gttattcttgcaattcatttcctatctttgatttaattgttatttaaaagtacttttgaatctatgtttagaatattcatctatcaaaacaatggttcta 24220110  T
Q  595 gacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccg 694  Q
    |||||  |||  ||||||||||||||| |     ||||   |||||||||||||  ||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||  | ||    
T  24220111 gacatgaaatcaatgttttgataatca-cacaaatatcgggacttaaagctttcagatcgtttaatagatggagaaatcctcgattaaacgatacaatcg 24220209  T
Q  695 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
    ||| ||| ||  || ||||||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24220210 actattggattgtttaatagtttgggaaatcaacgattcaacaatacaattgatttcacaagattatttggacacgaat 24220288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 283 - 622
Target Start/End: Original strand, 29336591 - 29336930
Alignment:
Q  283 agagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaa-tgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttcca 381  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |  |||||    ||| | |||||| | |  ||    
T  29336591 agagtgagagtgataggaggtggattcttcaagatttgttgagaaatcactagtttgtaaatgaatcttcatcttttccatcaatcttgcaaagtt--ca 29336688  T
Q  382 tgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttg 481  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  29336689 tgacaatgagtaactaattctcctttgttgggattagaggtacttgatc-aagcttagtatgtaatcttttgatcttcaaatatatggttctagcatttt 29336787  T
Q  482 atttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattt-aattgtgattgagaaacacttttgaatctagg--tttagaataatcatctat 578  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| || | || ||||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29336788 acttgatattgagattattcttgcaattca-tgtttatgtttgatttaaaatgttattgaaaaatacttttgaatctaggaatctagaataatcatctat 29336886  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||  | |||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  29336887 caaaacaagaattctagacataggatttgtattttgataatcac 29336930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 14394295 - 14394054
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | |||| |  |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  14394295 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgagattagaggtacttgtt-taagcttagaatgtaatcctttgatcttgaaatatatgattctagcaat 14394197  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14394196 ttaaatgatattgaagttattcttgcaattcatttcttatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtgtagaatattcatctatc 14394097  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    ||||||    |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  14394096 aaaacaatgattcttgacataggattaaggttttgataatcac 14394054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 12769871 - 12769742
Alignment:
Q  14 agatcacacgctaccaactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacgg 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||  |  ||||  | ||| |||||  ||||  || ||    
T  12769871 agattacacgccaccaactcgcaatggcgagtgaaagtactcgcgaggcgagttagggtggtttaggcctctcacagatgacgtggcacaaacccaatgg 12769772  T
Q  114 tgaagaaacatcaactcgccatggcgaatg 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12769771 tgaaggaacttcaactcgccatggcgaatg 12769742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 3298970 - 3299034
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  3298970 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 3299034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 11357522 - 11357599
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagc 192  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||    
T  11357522 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagtgaatgcagactcagaattctataaatagc 11357599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 6463914 - 6463993
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  6463914 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 6463993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7312231 - 7312152
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  7312231 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 7312152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 36004822 - 36004901
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  36004822 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 36004901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9068161 - 9068096
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9068161 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 9068096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11308981 - 11308916
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  11308981 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 11308916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 16580253 - 16580318
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  16580253 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 16580318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 28370261 - 28370326
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  28370261 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 28370326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 36021086 - 36021183
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg 212  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || |||||||||||    
T  36021086 gaaggaacctcaactcgccatggcaaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgg 36021183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 605; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 605; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Original strand, 10940577 - 10941383
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10940577 caactcgcaatggcgagtgaatttaatcgtgaggcgagttagggcggcctaaactcctcaaaggcgacgtggctcaaacttaatggtgaagaaacatcaa 10940676  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagtttagttttt 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||  |||||||||    
T  10940677 ctcgccatggcgaatagagttactcgcgaggcgagttgatgcagatcaagaattctataaatagcccatttaatcattacattaagggatcttagttttt 10940776  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
    |||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10940777 ctcatactcttca-cttgtaatacttttagagagagagataggtcttgttcta-atagagttaaagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttgaga 10940874  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10940875 gatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcatttgttgggattagaggtactt 10940974  T
Q  427 gatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10940975 gatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatgtttgat 10941074  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10941075 ttgattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagatatggaattgatgttttgataatcaccttt 10941174  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||      
T  10941175 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaaatattcaatagtttgagacattg 10941274  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  10941275 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatat 10941374  T
Q  827 ggtcattag 835  Q
    |||||||||    
T  10941375 ggtcattag 10941383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 43932523 - 43931727
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43932523 caactcgcaatggcgagtgaaattactcgtgaggcgagttagggcggcctaaactccttagaggtgacgtggctcaaacttaatggtgaagaaacatcaa 43932424  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||   || | | ||||||  ||||  | ||||||||    
T  43932423 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcgagttgatgcagatcaagaattctataaatagcctacttgaacttttcat--gagatctgagtttttc 43932326  T
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagat 327  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||     
T  43932325 --atagtttttaacttgtaatacttttagagagaacgatagggcttgttcttcatagcgtaagattgatagaatgtggattcttcctcaattgttgagaa 43932228  T
Q  328 atcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43932227 atcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactta 43932128  T
Q  428 atcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatt 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43932127 atcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatt 43932028  T
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt 627  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43932027 taattgtgattgagaaatacgtttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcacctttt 43931928  T
Q  628 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43931927 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattggcaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcga 43931828  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  43931827 cgattgaatgatacaattgatctcacaatattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgat-------aagaaaagctagaatccatgtatg 43931735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 43996022 - 43995220
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |  ||||||| ||| ||||    
T  43996022 caactcgcactggtgagtgcatttactcgcgaggcgagttagggcggtctaaactcctcaaaggtgacgtggctcaaacccactggtgaagtaacctcaa 43995923  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagtttagttttt 226  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||| |||||||||||||  || ||| |||||||  || |  |||||||      
T  43995922 ctcgccattgcgagtgaagttactcgcgaggcgagttaatgcagaacatgaatcctataaatagcccacttgatcttttcatttagatatcttagttt-- 43995825  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43995824 ctcata--ttttaacttgtaatacttttagatagagagatagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaggtggattcttcctcatttgttgaga 43995728  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43995727 gatcacatagttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgtaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 43995628  T
Q  427 gatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43995627 gatcttagctaa-catgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgat 43995529  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  43995528 ttaattgtgattgagaaatacttttgaatctatgtttagaataatcatctatcaaaacataagttctggacatgaaattgatgttttgataat-accttt 43995430  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  43995429 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttggatcattcaatagtttgagacatcg 43995330  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatc-aaagaaaagctagaatccatgta 825  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43995329 acgattgaatgatacaattgatctcataatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgta 43995230  T
Q  826 tggtcattag 835  Q
    || |||||||    
T  43995229 tgatcattag 43995220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 23069217 - 23068608
Alignment:
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatacttttagagaga----gagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttg 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  23069217 tcatagtttttcacttgtaatatttctagagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttg 23069118  T
Q  324 agatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggta 423  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23069117 agaaatcacaag-ttgtaatgaatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggattagaggta 23069019  T
Q  424 cttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgttt 523  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23069018 cttgatcatagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatcttt 23068919  T
Q  524 gatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacc 623  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23068918 gatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcacc 23068819  T
Q  624 ttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagaca 723  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068818 ttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagaca 23068719  T
Q  724 tcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatg 823  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23068718 tcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatg 23068620  T
Q  824 tatggtcattag 835  Q
    |||| |||||||    
T  23068619 tatgatcattag 23068608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 32747318 - 32746513
Alignment:
Q  37 atggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatg 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||||||||||    
T  32747318 atggcgaatgaatttactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaactcgccatg 32747220  T
Q  137 gcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcatagttt 236  Q
    ||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||      |||||||| ||| ||||||    
T  32747219 gcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattgatatacttagtttt-ctcttagttt 32747121  T
Q  237 ttaa--cttgt--------aatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
    || |  ||| |        |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  32747120 ttcatacttttcattttacaatatttctagagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagagtgatagagaatggattcttcatcttttgttgaga 32747021  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32747020 aatcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggtactt 32746922  T
Q  427 gatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  32746921 gatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgat 32746822  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||     
T  32746821 ttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttg 32746722  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32746721 tgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcg 32746622  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746621 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 32746522  T
Q  827 ggtcattag 835  Q
    |||||||||    
T  32746521 ggtcattag 32746513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 27501429 - 27502046
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  27501429 ttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 27501528  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501529 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 27501628  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  27501629 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 27501728  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27501729 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 27501828  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27501829 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 27501928  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27501929 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 27502028  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  27502029 tccatgtatgatcattag 27502046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 24180030 - 24179217
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  24180030 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 24179932  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg---agagttt------ 219  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    | |||||          
T  24179931 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgagatatagttttttact 24179832  T
Q  220 -agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||    
T  24179831 tagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctt 24179734  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24179733 tgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 24179634  T
Q  419 aggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctta 518  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  24179633 gggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttta 24179534  T
Q  519 tgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataa 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24179533 tctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataa 24179434  T
Q  619 tcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttg 718  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24179433 tcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttg 24179334  T
Q  719 agacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 818  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24179333 agacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 24179234  T
Q  819 ccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24179233 ccatgtatgatcattag 24179217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 4310986 - 4311565
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  4310986 agagagagagatagggcttgttctttatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcctgctt 4311084  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4311085 ctttaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcctagcttaacatgtaatcttttga 4311184  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4311185 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 4311284  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4311285 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttatca 4311384  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4311385 ttcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 4311484  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311485 atattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 4311565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 6036990 - 6036409
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  6036990 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaattgatctttct 6036891  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6036890 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctctgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 6036791  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6036790 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 6036691  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6036690 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatc 6036591  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6036590 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 6036491  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6036490 aatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 6036409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 9570047 - 9570627
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  9570047 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 9570145  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttg 453  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9570146 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttg 9570245  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9570246 atttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgaggttattcttgcacttaatct-ttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 9570344  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataag-ttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttat 652  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9570345 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacaagagattctagacatggaatcgatgttttgataatcatcttttgtatccaaatttaacgctttcttat 9570444  T
Q  653 cattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttca 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||    
T  9570445 cattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatataagtgatctca 9570544  T
Q  753 caatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9570545 caatattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 9570627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 9576549 - 9577129
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  9576549 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagatagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 9576647  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttg 453  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9576648 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttg 9576747  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9576748 atttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgaggttattcttgcacttaatct-ttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 9576846  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataag-ttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttat 652  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9576847 atcttggtttagaataatcatctatcaaaacaagagattctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttttgtatccaaatttaacgctttcttat 9576946  T
Q  653 cattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttca 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||    
T  9576947 cattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatataagtgatctca 9577046  T
Q  753 caatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9577047 caatattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 9577129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 834
Target Start/End: Original strand, 20650624 - 20651203
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||  |||||    
T  20650624 agagagagagagagggcttgttcttcatagagtgagagtgtttgaaggtggattcttcctcatttgtggagagatcacaaagttgtaatgaattcttctc 20650723  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650724 tttcacttcattcttgcaaagcttccatgacaacaagtagctaaatctcctttgttaggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 20650823  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||    
T  20650824 tctataaatatatgattctagcatttgatttgatattgagattattcttgaactttattgtttatgtttgatttagttgtgattgaaaaatactcttgaa 20650923  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20650924 tctaggtttagaataatcctctatcacaacatgaattctagacatggaattaatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaacgccttcttatca 20651023  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20651024 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataaaaccgactcttggatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatctcaca 20651123  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||| |||  ||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  20651124 atattatttaaacacgaatgatattgtcaagggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcatta 20651203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 47441524 - 47441096
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||    
T  47441524 agagagagagatatggcatgttcttcatagagtgagagtgtttgaaggtggattcttcctcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatcttcctc 47441425  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47441424 tttcaattcactcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagagttacttgatcttagctaaacatgtaatttgttga 47441325  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47441324 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 47441225  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47441224 tctaggtttagaataatcctctatcaaaacataagttctagacatgaaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaaactttcttatca 47441125  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaa 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47441124 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaa 47441096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 274 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 2786408 - 2785865
Alignment:
Q  274 gttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgta-atgaatcattctctttcaattcattattgca 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| |||| |||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||| | |||||    
T  2786408 gttcttcatagagtgagagtgatagaaggtggattcttccatttttgtggagaaatcacaagtttgaatatgaatcttcatctttcaattcaatcttgca 2786309  T
Q  373 aggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttc 472  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||    
T  2786308 aagttatcatgacaatgagtagctaaatttccattgttgggattagaggtacttgatctaagctaaacatgtaatcttttaatc-cttaatatatgattc 2786210  T
Q  473 tagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatc 572  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  2786209 tagcatttgatttgatattgaggttattcttgcattttattgcttatgtttga--taactgttattgaaaaatactcttgaatctaggtttagaatcatc 2786112  T
Q  573 atctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaa-cttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaa 671  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||  ||| || ||| ||| ||||||    
T  2786111 atctatcaaaacatgaattctggacataggattgatgttctgataatcaccttttgtattcaaagcttcatgctttcggatcgtttaatcgatggagaaa 2786012  T
Q  672 tcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacga 771  Q
    || ||||||||| |||| |||||| | ||| ||| || | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |    
T  2786011 tcgtcgattaaacgatacgaccgaatattggatcgtttagtagtttgagaaatcaacgattaaacgatacaattgatttcacgagatcatttggacacaa 2785912  T
Q  772 atggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 818  Q
    ||| | ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  2785911 atgattttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaat 2785865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 25893625 - 25893380
Alignment:
Q  589 gttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25893625 gttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgata 25893526  T
Q  689 agaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgaggga 788  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||    
T  25893525 agatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgattgcacaatattgtttggacacgaatagtattgttgaggga 25893426  T
Q  789 tacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25893425 tacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 25893380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 25894099 - 25893729
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-ga 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||    
T  25894099 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattgtga 25894000  T
Q  214 gagtttagtttt---------tctcatagtttttaacttgt-aatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaat 303  Q
     | || ||||||         | ||||||||||| | |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  25893999 tactt-agttttctcttagtttttcatagtttttcagttgacaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagaatgatagagagt 25893901  T
Q  304 ggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctc 403  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893900 ggattcttcatcctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctc 25893801  T
Q  404 ctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctag 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893800 ctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctag 25893729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 629 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 13015335 - 13015129
Alignment:
Q  629 tatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaac 728  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015335 tatctaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgac 13015236  T
Q  729 gattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015235 gattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgg 13015136  T
Q  829 tcattag 835  Q
    |||||||    
T  13015135 tcattag 13015129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 406 - 586
Target Start/End: Original strand, 41353963 - 41354143
Alignment:
Q  406 ttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41353963 ttgttaggattagagttccttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 41354062  T
Q  506 actttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacat 586  Q
    || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41354063 accttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacat 41354143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 17735940 - 17735634
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||     
T  17735940 catgacaatgatcaactaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatca-agcttag-atgtaatcttttgatatctcaaatatatgattctagcaa 17735843  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || || |||||||||  |||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17735842 tttatgtgatattgagtttattctttcatttcatt-cttatgtttgatttaaatgtaattgagaaatgcttatgaatctaggtttagaatattcatctat 17735744  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||     |||||   |||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  17735743 caaaacaatgattctagacatagcgttgatgttttgataatcacacaaggtatcagtacttaaagctatcagatcgtttaatagattgagaaatcgtcga 17735644  T
Q  679 ttaaatgata 688  Q
    ||||| ||||    
T  17735643 ttaaacgata 17735634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 19037209 - 19036903
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||     
T  19037209 catgacaatgatcaactaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatca-agcttag-atgtaatcttttgatatctcaaatatatgattctagcaa 19037112  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || || |||||||||  |||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19037111 tttatgtgatattgagtttattctttcatttcatt-cttatgtttgatttaaatgtaattgagaaatgcttatgaatctaggtttagaatattcatctat 19037013  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||     |||||   |||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  19037012 caaaacaatgattctagacatagcgttgatgttttgataatcacacaaggtatcagtacttaaagctatcagatcgtttaatagattgagaaatcgtcga 19036913  T
Q  679 ttaaatgata 688  Q
    ||||| ||||    
T  19036912 ttaaacgata 19036903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 4591392 - 4590946
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | ||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  4591392 catgacaatgatgaactaaatctctttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaat 4591294  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaat-aatcatctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4591293 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataaattatctat 4591195  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||| ||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||     |||||   || || |||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  4591194 caaagcaataattctagacataggattgatgctttgataatcacacaaggtatcggtacatatagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcatcga 4591095  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    |||||  ||  || |||   ||| ||  ||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||  | |    
T  4591094 ttaaactatccgatcgataattggattgttcaacagtttgagaaatcaactgttgaataatacaatggatctcacacgattatttggacacgaataatct 4590995  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  4590994 tgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 4590946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 405 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 24705382 - 24705101
Alignment:
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgtt-attctt 503  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || ||  ||| |||| ||| ||||||    
T  24705382 tttgttgggattataggtacttgat-taagcttagaatgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagcaatttatgcgat-ttgaagtttattctt 24705285  T
Q  504 gcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaa 603  Q
    ||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||       
T  24705284 gcaattcatt-catatgtttgatttaattgttattgaaaaatacttttgaatctaagtttagaatattcatctatcaaaacaatgattctagacataagg 24705186  T
Q  604 ttgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
    |||||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24705185 ttgatgttttgataatcacacaaagtatcggaacttaaagctttcagatcgtttaatagattgagaaatcgtcgattaaacgata 24705101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 495 - 802
Target Start/End: Original strand, 20952493 - 20952800
Alignment:
Q  495 gttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttcta 594  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||  || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    |||||    
T  20952493 gttattcttgcaattcatttcttatctttgatttaattgctattgaaaagtacctttgaatctaggtttagaatattgacctatcaaaacaatgattcta 20952592  T
Q  595 gacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccg 694  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||    
T  20952593 gacataggattgatgttttgataatcacacaaagtatcggaacttaaagctttcggatcgttgaatagattaagaaatcgtcgattaaacgatacgatcg 20952692  T
Q  695 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatg 794  Q
    ||| ||| ||  || ||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||  | |||  ||| ||||| ||    
T  20952693 actattggattgtttaatagtttgggaaatcaacgactgaacaatacaattgatctcacaagattatttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtg 20952792  T
Q  795 ataatatc 802  Q
    ||||||||    
T  20952793 ataatatc 20952800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 25692578 - 25692267
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctata-aatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  || | ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||     
T  25692578 catgacaatgatcaactaaatcttcttagttgggattagaggtacttgatcaaacttaga-atgtaatcttttgatcttttgaatatatgattctagcaa 25692480  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || |   ||||||||  ||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25692479 tttacaagatattgagtttattcttgcattccatt-cttatttttgatttaaatgctattgagaaatacttttgaatctaggtttagaatattcatctat 25692381  T
Q  579 caaaaca---taag-ttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatca 674  Q
    |||||||    | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||  ||| || || ||||||||||||||    
T  25692380 caaaacaatgcatgattctagacatagggttgatgttttgataatcacacaaagtatccgaacttaaagctttcagatcttttaaaagattgagaaatca 25692281  T
Q  675 tcgattaaatgata 688  Q
    ||||||||| ||||    
T  25692280 tcgattaaacgata 25692267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47441784 - 47441548
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||| ||||  |  ||||||| ||| ||||    
T  47441784 caactcgcaatggcgagtgcatttactcacaaggcgagttagggcgacctaaattcctcaaagatgacgtggctcaaacccagtggtgaagtaacctcaa 47441685  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagtttagttttt 226  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||  || |||| ||||||| || |  ||| || ||    
T  47441684 ctcgccattgcgaatgaagttactcgcgaggcgagttgatgcagaacatgaattctataaatagcccacttgatcacttcattgagatatctta-ttatt 47441586  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga 265  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47441585 ctcata-tttttcacttgtaatacttttagagagagaga 47441548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 361 - 622
Target Start/End: Original strand, 461036 - 461295
Alignment:
Q  361 ttcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat- 459  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||| |     
T  461036 ttcattattgcaatgttgtcatgacaatgatcaactaaatcttctttgctgggattagaggtacttgatca-agcttag-atgtaatcttttgatctttg 461133  T
Q  460 aaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctag 559  Q
    ||||| | | ||||||||||| || |||||||||  ||||||||| | || ||| || |  |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  461134 aaatagacgattctagcattttatgtgatattgagtttattcttgaatttcatt-ctaaaatttgatttaaatgttattgaaaaatacttttgaatctag 461232  T
Q  560 gtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    | |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  461233 ggttagaataatcatctatcaaaataaagattctagacataggatttgtgttttgataatcac 461295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 528 - 773
Target Start/End: Original strand, 9330910 - 9331155
Alignment:
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt 627  Q
    ||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||         
T  9330910 taattgttattgaaaagtacttttgaatctatgtttagaatattcatctatcaaaacaatggttctagacatggaatcaatgttttgataatcacacaaa 9331009  T
Q  628 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    |||||   |||||||||||||  ||| || ||||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||| ||   | ||||||||| || |||||    
T  9331010 gtatcgggacttaaagctttcagatcgtttaatagatggagaaatcgtcgattaaacgatacgatcgactattggattgcttaatagtttgggaaatcaa 9331109  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  9331110 cgattgaacaatacaattgatttcacaagattatttgggcacgaat 9331155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 397 - 585
Target Start/End: Original strand, 4644104 - 4644291
Alignment:
Q  397 aaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgt 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |  |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| || |  ||||||||| ||    
T  4644104 aaatctcctttgttgggattagaggtacttgat-taagttgataatgtaaacttttgatctttcaatatatgattctagcaatttacatgatattgaagt 4644202  T
Q  497 tattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaaca 585  Q
    |||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4644203 tattcttgcaattcatttcctatctttgatttaattgttattgaaaagtaattttgaatctatgtttagaatattcatctatcaaaaca 4644291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2786645 - 2786532
Alignment:
Q  51 tactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttac 150  Q
    |||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2786645 tacttgcgaggcgagttagggcggctaaaactcctcaaagctgacgtggcagaaacccactggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatgcatttac 2786546  T
Q  151 tcgcgaggcaagtt 164  Q
    | ||||||| ||||    
T  2786545 ttgcgaggcgagtt 2786532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Original strand, 6817168 - 6817235
Alignment:
Q  363 cattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatc 430  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||||||    
T  6817168 catttttgcaaggctaccatgacaatgagtagctaaatctcactttttgggattagatgtaattgatc 6817235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 457
Target Start/End: Original strand, 20949814 - 20949890
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatct 457  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||    
T  20949814 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttgatct 20949890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23069439 - 23069282
Alignment:
Q  37 atggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatg 136  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | |||  ||| | ||||  || || |||||||| |||||||||||||    
T  23069439 atggcgagggaaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcattgctgacatggttcaaacccaatggggaagaaacttcaactcgccatg 23069340  T
Q  137 gcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    ||||||| |||  ||||| |||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  23069339 gcgaatgaagtagctcgcaaggcgagtgaatgcagactcagaattctataaatagccc 23069282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 547 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27900960 - 27900777
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctt 646  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||   |||   ||||||||||||    
T  27900960 cttttgaatctaggtt-agaataatcttct-tcaaagcatttgttctagacatggaatttaggttttgataatcactttgaatattggaacttaaagctt 27900863  T
Q  647 tcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgatt 732  Q
    |  ||||||| ||||| ||| ||||||| | ||  ||| |||| | ||||| ||| ||| || ||||||||| || ||| ||||||    
T  27900862 ttgtatcatttaatagtttgggaaatcaactatgcaataataaaatcgactattggatcgtttaatagtttgggaaatcgacgatt 27900777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 827
Target Start/End: Original strand, 4644316 - 4644420
Alignment:
Q  723 atcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccat 822  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||  ||  ||||| ||||||||||    ||| ||||||||||||    
T  4644316 atcaacgattgaacaatacaattgatttcacaagattatttggacacgaatagtcttgttgaacgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccat 4644415  T
Q  823 gtatg 827  Q
     ||||    
T  4644416 atatg 4644420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 9989564 - 9989628
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9989564 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 9989628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6037152 - 6037073
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  6037152 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagccc 6037073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Original strand, 20650357 - 20650475
Alignment:
Q  52 actcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttact 151  Q
    |||||||||||||||||||| |||  || |||||||  ||||| ||| |  ||||  |   |||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  20650357 actcgcgaggcgagttagggcggctaaatctcctcagaggtgacgtgtcacaaacccactagtgaagtaacctcaactcggcatggcgaatgaagctact 20650456  T
Q  152 cgcgaggcaagttgatgca 170  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20650457 cgcgaggcgagttgatgca 20650475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 36469429 - 36469351
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttat 519  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36469429 atgtaatctttagatcttttaatacatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgcattttattgtttat 36469351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 9569871 - 9569972
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggag 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||   |||||||||| ||||  | || | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  9569871 gaagaaacttcaactcgccatggcgaaggaaggagctcgcgaggcgagttagtacagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattggag 9569970  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  9569971 ag 9569972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Original strand, 10940436 - 10940475
Alignment:
Q  6 agcagcagagatcacacgctaccaactcgcaatggcgagt 45  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10940436 agcaacagagatcacacgccaccaactcgcaatggcgagt 10940475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Original strand, 25805261 - 25805338
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacat--aagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    
T  25805261 cttttgaatctaaagttagaataatcatctatcaatacgtcaaagttctagacatggaatttaggttttgattatcac 25805338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 3588568 - 3588633
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  3588568 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 3588633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 8615671 - 8615736
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  8615671 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 8615736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 216
Target Start/End: Original strand, 9576373 - 9576474
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggag 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || | ||   |||||||||| ||||  | || | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  9576373 gaagaaacttcaactcgccatggcaaaggaaggagctcgcgaggcgagttagtacagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattggag 9576472  T
Q  215 ag 216  Q
    ||    
T  9576473 ag 9576474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 560; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 823
Target Start/End: Complemental strand, 2439745 - 2438955
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2439745 caactcgcaatggcgagtgaaattactcgcgaggcaagttagggcgccctaaactcctcagaggtgacgtggctcaaacttaatggtgaagaaacatcaa 2439646  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttc 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||   || | | ||||||  ||||  |||||||||     
T  2439645 ctcaccatggcgaatggagttactcgcgaggcgagttgatgcaaatcaggaattctataaatagcctacttgaacttttcat--gagatcttagtttttt 2439548  T
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagat 327  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||     
T  2439547 --atagtttttaacttgtaatacttttagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaggtggattcttcctcaattgttgagaa 2439452  T
Q  328 atcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2439451 atcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattcttgcaaagcttccatgacattgagtagctaaatctcctttgttcggattagaggtacttg 2439352  T
Q  428 atcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatt 527  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2439351 atcttagcttaacatgtaatcttttaatctataaatatatggttctaacatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttttgtttgatt 2439252  T
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacc-ttt 626  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  2439251 taattgtgattgagaaatacttttgaatctagttttaaaataatcatctatcataacataagttctagacatggaattgatgtcttgataatcacctttt 2439152  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2439151 tttatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgaaaaatcatcgattaaatgataagaccggctcttgaatcattcaatagtttgagacatcg 2439052  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatg 823  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2439051 acgattgaatgatacaattgatctcacaatattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatg 2438955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 835
Target Start/End: Original strand, 12505039 - 12505844
Alignment:
Q  26 accaactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatc 125  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |  ||||||| ||| ||    
T  12505039 accaactcgcaatggcgaatgcatttactcgcgaggcgagttagggcggcctaaactcctcaaaggtgatgtggctcaaacccactggtgaagtaacctc 12505138  T
Q  126 aactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttt 225  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    |    | |    
T  12505139 a-ctcgccattgcgaatgaagttactcgcgaggcgagttgatgaataatgggaattctataaatagcccacttgatcatttcattggaatcatcttatat 12505237  T
Q  226 tctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgag 325  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12505238 tctcatactttat--cttgtaatagctttagaaatagagatagggcttgttctt-atagagtgagagtgatagaaggtggattcttcctcatttgttgag 12505334  T
Q  326 atatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtact 425  Q
    | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505335 agatcacaaagttgtaatgaatcgttctctttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggattagaggtact 12505434  T
Q  426 tgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttga 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505435 tgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctattaatatatggttctagcatttcctttgatattgagattattcttgcactttattgcttatgtttga 12505534  T
Q  526 tttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12505535 tttaatagtgattgaaaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacatagattctagacatggaattgatgttttgataatcacctt 12505634  T
Q  626 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  12505635 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttggaccattcaatattttgagacatc 12505734  T
Q  726 aacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 825  Q
     |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12505735 gacgattgaatgatacaattgatattacaatattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgta 12505834  T
Q  826 tggtcattag 835  Q
    |  |||||||    
T  12505835 taatcattag 12505844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 4974502 - 4973707
Alignment:
Q  51 tactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttac 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||   |    
T  4974502 tactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcactgatgacgtggcacaaacccaatggtaaaggaacttcaacttgccatggcgaatgaaggagc 4974403  T
Q  151 tcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt-ggag--agtttagtt----------tttctcatagtttt 237  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||  |||||  ||          ||| ||||||||||    
T  4974402 tcgcgaggcgagtggatacagatttagaattttataaatagcccattcaatcatttctttgggagttagttttttttaactcttagtttttcatagtttt 4974303  T
Q  238 taacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagt 336  Q
    | ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||    
T  4974302 tcacttgtaata--ttttgagagagagatagggtttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagt 4974205  T
Q  337 ttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct 436  Q
     ||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4974204 gtgtaatggatcttcctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct 4974105  T
Q  437 aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtga 536  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4974104 taacatgtaatcttttgatctacaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtga 4974005  T
Q  537 ttgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaa 636  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4974004 ttgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttaataatcaccttttgtatccaaa 4973905  T
Q  637 cttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaat 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4973904 cttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattagatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaat 4973805  T
Q  737 gatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4973804 gatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 4973707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 2958619 - 2958002
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  2958619 ttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagagtggattcttcgttct 2958520  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2958519 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 2958420  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  2958419 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 2958320  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2958319 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 2958220  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2958219 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 2958120  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2958119 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 2958020  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2958019 tccatgtatgatcattag 2958002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 2967088 - 2966471
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  2967088 ttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagagtggattcttcgttct 2966989  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2966988 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 2966889  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  2966888 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 2966789  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2966788 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 2966689  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2966688 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 2966589  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2966588 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 2966489  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2966488 tccatgtatgatcattag 2966471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22360838 - 22360107
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||| |  | || ||||||||||    
T  22360838 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatacagaatcagaattctataaatagctcactcaaccatttcattg 22360739  T
Q  212 g-agagtttagtttttctcatagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaa 301  Q
      | |||| |||| || || |||||||| |         ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360738 atatagtt-agttgttatcttagtttttcatagttttcacttgtaacattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaa 22360640  T
Q  302 atggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatc 401  Q
     |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360639 gtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatc 22360541  T
Q  402 tcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360540 tcctttgttgggattagaggtacttgaccttaacttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattc 22360441  T
Q  502 ttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatag 601  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22360440 ttgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtgtagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatgg 22360341  T
Q  602 aattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttg 701  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  22360340 aatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttg 22360241  T
Q  702 aatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatat 801  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  22360240 aatcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatat 22360141  T
Q  802 caaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360140 caaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 22360107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 835
Target Start/End: Original strand, 40958116 - 40958696
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  40958116 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttct 40958214  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40958215 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacagtgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 40958314  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40958315 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 40958414  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40958415 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatc 40958514  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40958515 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatggtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 40958614  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958615 aatattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 40958696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 22314704 - 22313973
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  22314704 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggtgagttgatacaaaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 22314605  T
Q  212 gagagtttagtttttctcatagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaa 302  Q
          ||||||||| || |||||||| |         ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22314604 atatacttagtttttatcttagtttttcatagttttcacttgtaacattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaag 22314505  T
Q  303 tggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 402  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22314504 tggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaacct 22314406  T
Q  403 cctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattct 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22314405 cctttgttgggattagaggtacttgaccttagcttaacttgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattct 22314306  T
Q  503 tgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacataga 602  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  22314305 tgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttttagacatgga 22314206  T
Q  603 attgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttga 702  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  22314205 atcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaattatcgattgaacgataagatcgactcttga 22314106  T
Q  703 atcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22314105 atcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatc 22314006  T
Q  803 aaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22314005 aaagaaaagctagaatccatgtacggtcattag 22313973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 245 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 42151551 - 42150962
Alignment:
Q  245 taatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatg 344  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  42151551 taatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatg 42151453  T
Q  345 aatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgt 444  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42151452 aatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttcattgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgt 42151353  T
Q  445 aatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42151352 aatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaa 42151253  T
Q  545 cacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagc 644  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42151252 tacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagc 42151153  T
Q  645 tttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaat 744  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  42151152 tttcttaccattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaat 42151053  T
Q  745 tgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42151052 tgatttcacaatcttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattag 42150962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 835
Target Start/End: Original strand, 25893912 - 25894728
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  25893912 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 25894010  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg---agagttt------ 219  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    | |||||          
T  25894011 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgatatatagtttttactt 25894110  T
Q  220 agtttttctcatagttttta--acttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||  |||||||   |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  25894111 agtttttctctgagtttttttcacttgtaatgtttctagagagatagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 25894210  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894211 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 25894310  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  25894311 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 25894410  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25894411 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 25894510  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25894511 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 25894610  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25894611 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 25894710  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    || ||||||| |||||||    
T  25894711 tcgatgtatgatcattag 25894728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 5876967 - 5876361
Alignment:
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagat 327  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||     
T  5876967 tcatagtttttcacttgtaatattcttggagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagaatgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaa 5876868  T
Q  328 atcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 427  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876867 atcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcatttttgcaaagcttccatgataatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 5876769  T
Q  428 atcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatt 527  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  5876768 atcctagcttaacatgtaaacttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatt 5876669  T
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt 627  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || |    
T  5876668 taattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttatagacatggaatcgatgttttgataatcactttgt 5876569  T
Q  628 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5876568 gtatccaaacctaaagttttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcga 5876469  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5876468 caattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatg 5876369  T
Q  828 gtcattag 835  Q
    ||||||||    
T  5876368 gtcattag 5876361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 29414168 - 29414748
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  29414168 agagagagagatagggcctgtgcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttctt 29414266  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttg 453  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29414267 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaaacatgtaatcttttg 29414366  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29414367 atctataaatatatggttctaacatttgatttgatattgatgttattctttcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 29414466  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  29414467 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaccctaaagctttcttatc 29414566  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  29414567 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgataattgaatgatacaattgatttcac 29414666  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414667 aatattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 29414748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 29981221 - 29980602
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagaga----gagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcct 314  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  29981221 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatattcttagagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcat 29981122  T
Q  315 catttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggga 414  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29981121 cctttgttgagacatcacaag-ttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggga 29981023  T
Q  415 ttagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattg 514  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  29981022 ttagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatc 29980923  T
Q  515 cttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttg 614  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  29980922 tttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttg 29980823  T
Q  615 ataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatag 714  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29980822 ataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatag 29980723  T
Q  715 tttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcta 814  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29980722 tttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagcta 29980623  T
Q  815 gaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  29980622 gaatccatgtatgatcattag 29980602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 34356788 - 34357367
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  34356788 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagaatgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 34356886  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  34356887 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 34356986  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34356987 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 34357086  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34357087 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 34357186  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34357187 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 34357286  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34357287 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 34357367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 34358579 - 34359158
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  34358579 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagaatgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 34358677  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  34358678 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcatttga 34358777  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34358778 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 34358877  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  34358878 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 34358977  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34358978 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 34359077  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34359078 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 34359158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 417 - 835
Target Start/End: Original strand, 30040905 - 30041323
Alignment:
Q  417 agaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgct 516  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |    
T  30040905 agaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctt 30041004  T
Q  517 tatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgat 616  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  30041005 tatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgat 30041104  T
Q  617 aatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtt 716  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30041105 aatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtt 30041204  T
Q  717 tgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctaga 816  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30041205 tgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctaga 30041304  T
Q  817 atccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  30041305 atccatgtatgatcattag 30041323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Original strand, 12918575 - 12919021
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |  |||||| |||||||||| | |||||||| ||||| || |    
T  12918575 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-taagttgataatgtaaacttttgatctttcaatatatgattctaacaat 12918673  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12918674 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttcctatctttgatttaattgttattaaaaagtacttttgaatctatgtttagaatattcatctatc 12918773  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||     ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12918774 aaaacaatggttctagacatggaatcaatgttttgatagtcacacaaagtatcaagacttaaagctttcggatcattcaatagatggagaaatcgtcgat 12918873  T
Q  680 taaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgtt 779  Q
    |||| |||| || ||||  ||| ||  || ||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||    
T  12918874 taaacgatacgatcgacaattggattgtttaatagtttgggaaatcaacgattgaacaacacaattgatttcacaagattatttggacacgaatagtctt 12918973  T
Q  780 ggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  12918974 gttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 12919021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 380 - 802
Target Start/End: Original strand, 3412915 - 3413336
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |  |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |    
T  3412915 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-taagttgataatgtaaacttttgatctttcaatatatgattctagcaat 3413013  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  3413014 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttcctatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctatgtttaaaatattcatctatc 3413113  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||     |||||   |||||||||||||  ||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  3413114 aaaacaatggttctagacatggaatcaatgttttggtaatcacacaaagtatcaggacttaaagctttcggatcgtttaatagatggagaaatcgtcgat 3413213  T
Q  680 taaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgtt 779  Q
    |||| |||| || || || ||| ||  || ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||    
T  3413214 taaacgatacgatcggctattggattgtttaatagtttgggaaatcaacgattgaacaatacaattgatttcacaagattatttggacacgaataatctt 3413313  T
Q  780 ggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    |  ||| ||||||||||||||||    
T  3413314 gttgagcgatacatgataatatc 3413336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 219 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 29974718 - 29974514
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca 316  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  29974718 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcc 29974619  T
Q  317 tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatt 416  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29974618 tttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatt 29974520  T
Q  417 agaggt 422  Q
    ||||||    
T  29974519 agaggt 29974514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 219 - 422
Target Start/End: Original strand, 30021924 - 30022128
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca 316  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  30021924 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcc 30022023  T
Q  317 tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatt 416  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30022024 tttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatt 30022122  T
Q  417 agaggt 422  Q
    ||||||    
T  30022123 agaggt 30022128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 396 - 827
Target Start/End: Original strand, 30579830 - 30580261
Alignment:
Q  396 taaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcatttgatttgatattgat 494  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | || | |  |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  30579830 taaatctccttagtttggattagaggtactttat-taagttgataatgtaatcttttgatcttgcaaatatatgattctagcaatttacatgatattgat 30579928  T
Q  495 gttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttcta 594  Q
    | |||||||| | || ||| ||||| |||||||||  ||  ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    |||||    
T  30579929 gatattcttgtatttcattccttatctttgatttagatgctatttagaaatacttttgaatctgggtttagaatatttatctatcaaaacaatgattcta 30580028  T
Q  595 gacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccg 694  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |     
T  30580029 gacataggattgatgttttgataatcacacaaagtatcgaaacttaaagctttcatatcatttaatagattgagaaatcatcgattaaacgatacgatca 30580128  T
Q  695 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatg 794  Q
    | | ||| ||  || ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||||||  | |||| ||  |||||||||||||| ||| | |||  ||||| ||    
T  30580129 aatattggattgtttaatagtttgggaaatcaacgattaaaaaacacaattgaacttacaagatcatttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtg 30580228  T
Q  795 ataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    |||||||| |  ||| |||||||||||| ||||    
T  30580229 ataatatcgataaaacgctagaatccatatatg 30580261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 379 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 42747683 - 42747381
Alignment:
Q  379 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||      
T  42747683 ccatgagaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagacgtacttgatca-agcctagtatgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagctc 42747585  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaat-tgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatcta 577  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||  || || | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42747584 tttatttgatattgagattattcttgcgattcat-gtttatgtttgatttaaaatgttattgaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatcta 42747486  T
Q  578 tcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt--gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcat 675  Q
    ||||||| | | ||||||||||||  ||  ||||||||||||   |||||  ||||| |||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  42747485 tcaaaacttgaattctagacatagggtttgtgttttgataat---cttttaagtatcgaaacttaatgttatcggatcatttaatagattgagaaatcgt 42747389  T
Q  676 cgattaaa 683  Q
    ||||||||    
T  42747388 cgattaaa 42747381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 9843946 - 9843500
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  9843946 catgacaatgatgaactaaatctctgtagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaat 9843848  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9843847 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataaattatctat 9843749  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  9843748 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcga 9843649  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    |||||  ||  || |||   ||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||  || |||| |||||||||  | | |||||||||||||  | |    
T  9843648 ttaaactatccgatcgataattggattgttcaacagtttgagaaatcaactattgaacaatgcaatggatttcacacgagtatttggacacgaataatct 9843549  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  9843548 tgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 9843500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 802
Target Start/End: Original strand, 2155745 - 2156166
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||| |||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  2155745 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatattttaatcttgtaatatatgattctagcaat 2155843  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  ||||||| | |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  2155844 ttacatgatattaaagttattcttgcaattcatt-tttatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttaggataatttatctat 2155942  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||    
T  2155943 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcagatcgttgaatagattgagaaattgtcga 2156042  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||  || ||||  | | ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  | |    
T  2156043 ttaaacgatccgatcgacaatgggattgtttaatagtttgggaaatcaactattgaacaatacaattgatctcacacaattatttggacacgaataatct 2156142  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    
T  2156143 tgttgagcgatacgtgataatatc 2156166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 34738736 - 34738430
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||     
T  34738736 catgacaatgatcaactaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatca-agcttag-atgtaatcttttgatctttcaaatatatgattctagcaa 34738639  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || || ||||||| |  ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34738638 tttatgtgatattaagtttattcttgcatttcatt-cttatgtttgatttaaatgctattgagaaatacttttgaatctagggttagaatattcatctat 34738540  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    ||||| |    |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |   |||||  ||||||| ||| |   ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  34738539 caaaaaaatgattctagacataggattggtgttttgacattcacataaagtatcggaacttaacgctattggatcgtttaatagattgagaaatcgtcga 34738440  T
Q  679 ttaaatgata 688  Q
    ||||| ||||    
T  34738439 ttaaacgata 34738430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Original strand, 19853153 - 19853459
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |  |||||||||||||||||   |||||||  |||||||| |    
T  19853153 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagagatacttgat-taagcttagaatgtaatcttttgatcttgtaatatattattctagcaat 19853251  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  || |||||| |||||||||||| || ||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19853252 ttacatggtattgaagttattcttgcaattcatcccttatctttgatttaaatgctattgacaaatacttttgaatctagctttagaatattcatctatc 19853351  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
     ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||  | ||||||| ||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19853352 taaaca-atgatctagacataggattgatgttttgataatcacgcaaagtatcatatcttaaagttttcggatcgtttaattgattgagaaatcatcgat 19853450  T
Q  680 taaatgata 688  Q
    |||| ||||    
T  19853451 taaacgata 19853459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17346854 - 17346799
Alignment:
Q  362 tcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17346854 tcatttttgcaaggctaccatgacaatgagtagctaaatctcatttgttgggatta 17346799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 37335762 - 37335695
Alignment:
Q  363 cattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatc 430  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37335762 catttttgcaaagctacaatgacaatgagtagctaaatctcatttgttgggattagatgtacttgatc 37335695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2823216 - 2823074
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||| |  | |   |  ||||||||||  ||||    
T  2823216 caactcgcaatggcgagtggatttactcacaaggcgagttagggcggctaaaactcctcagaggtgacgtgtcacagatccactggtgaagaaatctcaa 2823117  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgca 170  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||    
T  2823116 ctcgccatggcgaatgaagttattcgcaagacgagttgatgca 2823074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 211
Target Start/End: Original strand, 29414014 - 29414113
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  29414014 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtggatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 29414113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 640 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 33794430 - 33794243
Alignment:
Q  640 aaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgat 739  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||  ||| ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  ||    
T  33794430 aaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcaattaaacgatacgatcgacaattggattgtttaatagtttgggaaatcaactattgaacaat 33794331  T
Q  740 acaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||  | |||  ||| ||||| |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||    
T  33794330 acaattgatctcacatgattatttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatg 33794243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5877093 - 5877015
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaata 190  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  5877093 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatgcagaatcagaattctataaata 5877015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 11766923 - 11766987
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  11766923 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 11766987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 31846148 - 31846212
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  31846148 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 31846212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 33434771 - 33434835
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  33434771 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 33434835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 34356603 - 34356682
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| | ||| | | ||||| |||||||||||||    
T  34356603 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagttaaggcagactcagaatcctataaatagccc 34356682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40153954 - 40153906
Alignment:
Q  369 tgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40153954 tgcaaggttaccatgacaatgagtagttaaatctcatttgttgggatta 40153906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Original strand, 40957965 - 40958061
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | | |||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  40957965 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcaaaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 40958061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 34358394 - 34358473
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||| |||| | ||| | | ||||| |||||||||||||    
T  34358394 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagcccgcgaggcgagttaaggcagactcagaatcctataaatagccc 34358473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11723270 - 11723205
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  11723270 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 11723205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 16904603 - 16904538
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  16904603 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcctatttattcaatattgttgttattcttgc 16904538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 24835903 - 24835968
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  24835903 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 24835968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 27167091 - 27167026
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||    
T  27167091 atgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgca 27167026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 553; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 553; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 45434420 - 45433729
Alignment:
Q  143 ggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcatagtttttaact 242  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  45434420 ggagttactcgcgaggcgagtttatgcagattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattagggatctttgtttttctcatagtttttaact 45434321  T
Q  243 tgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaa 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  45434320 tgtaatacttttagagagagatatagggcttgttcttcatagactgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttgtttagagatcataagtttgtaa 45434221  T
Q  343 tgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacat 442  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45434220 tgaatccttctttttcaattcattcttgcaaggcttccatggcaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactcgattttagctaaacat 45434121  T
Q  443 gtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgaga 542  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45434120 gtaatattttgatctataaa-atatggttctagcaattgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgaga 45434022  T
Q  543 aacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaa 642  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45434021 aatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaa 45433922  T
Q  643 gctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgataca 742  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  45433921 gctttcttatcattcaataaattgagaaatcattgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgactattgaatggtaca 45433822  T
Q  743 attgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45433821 attgatctcacaatactgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattag 45433729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 835
Target Start/End: Original strand, 33850111 - 33850722
Alignment:
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgata----gaaaatggattcttcctcattt-gtt 322  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||    
T  33850111 tcatagtttttcacgtgtaatacttttagagagagaaatagggcttgttcta-atatagtgagagtgatatatagaaagtggattcttcctcattttgtt 33850209  T
Q  323 gagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 422  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33850210 gagagatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggattagaggt 33850309  T
Q  423 acttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtt 522  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33850310 acttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctagaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtt 33850409  T
Q  523 tgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33850410 tgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttataataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcac 33850509  T
Q  623 cttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagac 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33850510 cttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagac 33850609  T
Q  723 atcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccat 822  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33850610 atcgacgattgaatgatacaattgattttacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacat 33850709  T
Q  823 gtatggtcattag 835  Q
    |||| ||||||||    
T  33850710 gtatagtcattag 33850722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 39433856 - 39433050
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  | ||| |||||  |||| ||| ||||||| ||| | |     
T  39433856 caactcgccatggctagggaatgtactcgcgaggcgagttagggcggcttaggcttctcacagctgacgtggcacaaacctaatggtgaaggaacttta- 39433758  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagttttt 226  Q
    |||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||||||| || | | |||| |||||| ||||| | || ||||||||||||   || | |||||||||    
T  39433757 ctcgccttggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatacagaattagaagtctatatatagctcattcaatcatttcattaaggactcttagttttt 39433658  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttgag 325  Q
    ||  ||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  39433657 ct--tagttttcattttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgag 39433560  T
Q  326 atatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtact 425  Q
    | ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39433559 agatcacaagtgtgcaatggatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcttttgttaggattagaggtact 39433460  T
Q  426 tgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttga 525  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39433459 tgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatctggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttga 39433360  T
Q  526 tttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39433359 tttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgataatcacttt 39433260  T
Q  626 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 725  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39433259 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgaaaagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 39433160  T
Q  726 aacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 825  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39433159 gacgattgacagatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgta 39433060  T
Q  826 tggtcattag 835  Q
    || |||||||    
T  39433059 tgatcattag 39433050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 15950105 - 15949302
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||  | |||||||||  ||||  || ||||||| ||| |||||    
T  15950105 aactcgccatggcgaatgtgtctactcgcgaggcgagttagggcggtttaa-ctcttcatagatgatgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaac 15950007  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttca-ttggagagt-ttagttttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||| | | | |||||||||||||||||||  | || ||| ||| ||   | || |||||||||    
T  15950006 tcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatgtagagtcagaattctataaatagcccactcaaccatctcagtttttgggtattagttttt 15949907  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
    |  ||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  15949906 c--atagtttttcacttgtaatattcttggagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgaga 15949809  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949808 aatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctagatctcctttgttgggattagaggtactt 15949710  T
Q  427 gatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  15949709 gatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatg-ttatctttgat 15949611  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||     
T  15949610 ttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgtttggataaccaccttg 15949511  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15949510 tgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcg 15949411  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949410 accattgaatgatacaattgatttcataatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 15949311  T
Q  827 ggtcattag 835  Q
    |||||||||    
T  15949310 ggtcattag 15949302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 15915502 - 15914781
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttca-tt 210  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||    
T  15915502 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagcttgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagcccactcaatcatctcagtt 15915403  T
Q  211 ggagagt-ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattc 309  Q
       | || ||||||||||  ||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15915402 tttgggtattagtttttc--atagtttttcaattgtaatattcttggagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattc 15915305  T
Q  310 ttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgt 409  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15915304 ttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtattgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctagatctcctttgt 15915206  T
Q  410 tgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15915205 tgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactt 15915106  T
Q  510 tattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatg 609  Q
    || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15915105 taatg-ttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatg 15915007  T
Q  610 ttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattc 709  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  15915006 ttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttgttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattc 15914907  T
Q  710 aatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaa 809  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  15914906 aatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaa 15914807  T
Q  810 agctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15914806 agctagaatccatgtatggtcattag 15914781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 835
Target Start/End: Original strand, 3923592 - 3924172
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  3923592 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttct 3923690  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3923691 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatcacctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcctttg 3923790  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3923791 atctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 3923890  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3923891 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttatc 3923990  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3923991 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 3924090  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3924091 aatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 3924172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 835
Target Start/End: Original strand, 8184741 - 8185471
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg-- 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||       
T  8184741 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgata 8184840  T
Q  213 -agagttt-------agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatg 304  Q
     | |||||       ||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  8184841 tatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagagtg 8184940  T
Q  305 gattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 404  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8184941 gattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 8185040  T
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8185041 tttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 8185140  T
Q  505 cactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaat 604  Q
    ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8185141 cactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaat 8185240  T
Q  605 tgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaat 704  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  8185241 cgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaat 8185340  T
Q  705 cattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8185341 cattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaa 8185440  T
Q  805 agaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8185441 agaaaagctagaatccatgtatgatcattag 8185471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 19090751 - 19089951
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||  | |||| ||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  19090751 actcgccatggcgagtggatgtacttgcgaggcgagttagggcagtctaa-ctcttcacagatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 19090653  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctc 229  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||   ||  ||||||||||      
T  19090652 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttcatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattaaggatcttagtttttc-- 19090555  T
Q  230 atagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatat 329  Q
    ||| |||| |  || ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||    
T  19090554 atacttttcatgttataatatttctagagagaga--taggg-ttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatattttgttgagaaat 19090458  T
Q  330 cacaagtttgtaatgaatcattct-ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttga 428  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19090457 cacaagtt-gtaatgaatctttcttctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcttttgttgggattagaggtacttga 19090359  T
Q  429 tcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatt 527  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||    
T  19090358 tcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttaatt 19090259  T
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt 627  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  19090258 taattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgt 19090159  T
Q  628 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19090158 gtatccaaacctaaagttttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcga 19090059  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19090058 caattgagtgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatg 19089959  T
Q  828 gtcattag 835  Q
    ||||||||    
T  19089958 gtcattag 19089951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 23613112 - 23612532
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  23613112 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttct 23613014  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23613013 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 23612914  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23612913 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattaagaaatacttttga 23612814  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23612813 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatc 23612714  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23612713 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgatacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 23612614  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23612613 aatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23612532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 48352942 - 48353559
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  48352942 ttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagagtggattcttcattct 48353041  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48353042 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 48353141  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  48353142 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 48353241  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48353242 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 48353341  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48353342 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 48353441  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48353442 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 48353541  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  48353542 tccatgtatgatcattag 48353559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 26602634 - 26602055
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  26602634 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 26602536  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26602535 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttga 26602436  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26602435 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 26602336  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26602335 tctaggtttaaaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttatca 26602236  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26602235 ttcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaattgatctcaca 26602136  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26602135 atattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattag 26602055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 835
Target Start/End: Original strand, 8192301 - 8193031
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg-- 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||       
T  8192301 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgata 8192400  T
Q  213 -agagttt-------agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatg 304  Q
     | |||||       ||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  8192401 tatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagaggtagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagagtg 8192500  T
Q  305 gattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 404  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192501 gattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 8192600  T
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192601 tttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 8192700  T
Q  505 cactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaat 604  Q
    ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8192701 cactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaat 8192800  T
Q  605 tgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaat 704  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  8192801 cgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaat 8192900  T
Q  705 cattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8192901 cattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaa 8193000  T
Q  805 agaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8193001 agaaaagctagaatccatgtatgatcattag 8193031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 48346558 - 48347175
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  48346558 ttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagggtgagagtgatagagagtggattcttcattct 48346657  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48346658 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgataatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 48346757  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  48346758 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 48346857  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48346858 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 48346957  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48346958 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 48347057  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48347058 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 48347157  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  48347158 tccatgtatgatcattag 48347175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Original strand, 6020343 - 6020943
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  6020343 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 6020442  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020443 gtcgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 6020542  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  6020543 cttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 6020642  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6020643 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatcca 6020742  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6020743 aacctaaagctttcttatcattttatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattga 6020842  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6020843 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 6020942  T
Q  835 g 835  Q
    |    
T  6020943 g 6020943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 245 - 835
Target Start/End: Original strand, 1948123 - 1948712
Alignment:
Q  245 taatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatg 344  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  1948123 taatatttctagagagagagatagggcttgttcttcataaagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaatcataagtt-gtaatg 1948221  T
Q  345 aatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgt 444  Q
    |||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1948222 aatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatggcaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgt 1948321  T
Q  445 aatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1948322 aatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatataattgtgattgagaaa 1948421  T
Q  545 cacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagc 644  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1948422 tacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagc 1948521  T
Q  645 tttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaat 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1948522 tttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaat 1948621  T
Q  745 tgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1948622 tgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattag 1948712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 222 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 14288472 - 14287858
Alignment:
Q  222 tttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttg 320  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||    
T  14288472 tttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagataggtcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagtgaattctacatcactttg 14288373  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288372 ttgagagatcacaagtgtgtaatggacctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 14288273  T
Q  421 gtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatg 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  14288272 gtacttgatcttagcttaacatgtaatcctttgatctataaatatatgattctagcatttgaattgatattgatgttattcttgcactttattgttcatc 14288173  T
Q  521 tttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14288172 tttgatttaattgtgattgagaaatacttttaaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatc 14288073  T
Q  621 accttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgag 720  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288072 accttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgag 14287973  T
Q  721 acatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287972 acatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc 14287873  T
Q  821 atgtatggtcattag 835  Q
    ||||||| |||||||    
T  14287872 atgtatgatcattag 14287858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 222 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 14299657 - 14299043
Alignment:
Q  222 tttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttg 320  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||    
T  14299657 tttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagtgaattctacatcactttg 14299558  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14299557 ttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttaggattagag 14299458  T
Q  421 gtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatg 520  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  14299457 gtacttgatcttagcttaacatgtaatcctttgatctataaatatatgattctagcatttgaattgatattgatgttattcttgcactttattgttcatc 14299358  T
Q  521 tttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14299357 tttgatttaattgtgattaagaaatacttttaaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatc 14299258  T
Q  621 accttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgag 720  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299257 accttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgag 14299158  T
Q  721 acatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299157 acatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc 14299058  T
Q  821 atgtatggtcattag 835  Q
    ||||||| |||||||    
T  14299057 atgtatgatcattag 14299043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 36876268 - 36875688
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  36876268 tagagagaaagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttct 36876170  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
      ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36876169 tcttcaattcattctttcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcttttgttgggattagaggtacttgatcatagcttaacatgtaatcttttg 36876070  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  36876069 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatgcttaatttaattgtgattgagaaatacttttaa 36875970  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36875969 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagattctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 36875870  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36875869 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacaataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 36875770  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36875769 aatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattag 36875688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 835
Target Start/End: Original strand, 9642265 - 9642995
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggag 214  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||       
T  9642265 gaaggaacctcaactcgccctggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattgata 9642364  T
Q  215 agtttagtttttctcatagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatgg 305  Q
       ||||||||||||  ||||||| |         ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||     
T  9642365 tacttagtttttctctgagtttttcatacttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctgtatagagtgggagtgatagaaattga 9642464  T
Q  306 attcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 404  Q
    ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9642465 attctacatcactttgttgagtgatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 9642564  T
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9642565 tttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcttttgatctataattatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 9642664  T
Q  505 cactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaat 604  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9642665 cactttaatgcttatgcttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaat 9642764  T
Q  605 tgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaat 704  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9642765 cgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagcttccttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaatgataagatcgactcttgaat 9642864  T
Q  705 cattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9642865 cattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaa 9642964  T
Q  805 agaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9642965 agaaaagctagaatccatgtatgatcattag 9642995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 5049412 - 5049991
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  5049412 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 5049510  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  5049511 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 5049610  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5049611 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 5049710  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5049711 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 5049810  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5049811 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 5049910  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5049911 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 5049991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 6796160 - 6795581
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  6796160 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 6796062  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  6796061 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 6795962  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6795961 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 6795862  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6795861 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 6795762  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6795761 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 6795662  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6795661 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 6795581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 21643262 - 21642661
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcaca 333  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| || |||    
T  21643262 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaagtgaattctacatcactttgttgagagataaca 21643163  T
Q  334 agtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatctta 433  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21643162 agtgtgtaatggatctttctctttcacttcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggcattagaggtacttgatctta 21643063  T
Q  434 gctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattg 533  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  21643062 gcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattg 21642963  T
Q  534 tgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcc 633  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21642962 tgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcgaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatcc 21642863  T
Q  634 aaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattg 733  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21642862 aaacctaaagctttcttatcattcaatagatttagaaatcatcgattgtacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattg 21642763  T
Q  734 aatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatt 833  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  21642762 aatgatataattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcatt 21642663  T
Q  834 ag 835  Q
    ||    
T  21642662 ag 21642661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 1379669 - 1379090
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  1379669 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 1379571  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  1379570 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 1379471  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1379470 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 1379371  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1379370 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 1379271  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1379270 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 1379171  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1379170 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattag 1379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 2447368 - 2446789
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  2447368 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 2447270  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  2447269 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 2447170  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2447169 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcgctttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 2447070  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2447069 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 2446970  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  2446969 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 2446870  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2446869 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 2446789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 230 - 835
Target Start/End: Original strand, 8141921 - 8142525
Alignment:
Q  230 atagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatat 329  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||    
T  8141921 atagtttttcacttgtaatatttctagagagaga--tagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacat 8142018  T
Q  330 cacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgat 429  Q
    |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8142019 cacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgat 8142117  T
Q  430 cttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattt 528  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  8142118 catagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgattt 8142217  T
Q  529 aattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttg 628  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |    
T  8142218 aattgtgattgagaaatacttttgaatttaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgacgttttgataatcaccttgag 8142317  T
Q  629 tatccaaacttaaagctttcttatca-ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8142318 tatccaaacctaaagctttcttatcatttaaatagattgagaaatcatcaattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 8142417  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8142418 ccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatg 8142517  T
Q  828 gtcattag 835  Q
     |||||||    
T  8142518 ctcattag 8142525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 28 - 611
Target Start/End: Original strand, 22853479 - 22854061
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| |||     
T  22853479 caactcaccatggcgagggaatgtactcgcgaggcgagttagggcggcttaggcttctcacagctgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacttca- 22853577  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgca-aattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt--ggagagtttagttt 224  Q
    |||||| ||||||||| ||   |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| | || ||||||||||||  ||| | |  |||||    
T  22853578 ctcgccctggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatgcagaattaa-aattttataaatagctcattcaatcatttcatttaggacactg-agttt 22853675  T
Q  225 ttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttg 323  Q
    |||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||||    
T  22853676 ttc--atagtttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattatacatcattttgttg 22853773  T
Q  324 agatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggta 423  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22853774 agagatcacaagtgtgtaatggatccttccctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggta 22853873  T
Q  424 cttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgttt 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22853874 cttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgttt 22853973  T
Q  524 gatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgtt 611  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22853974 gatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgtt 22854061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 685 - 827
Target Start/End: Original strand, 13774059 - 13774201
Alignment:
Q  685 gataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcga 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13774059 gataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatgatgttgtcga 13774158  T
Q  785 gggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774159 gggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 13774201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 699 - 835
Target Start/End: Original strand, 5056250 - 5056386
Alignment:
Q  699 ttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataa 798  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5056250 ttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa 5056349  T
Q  799 tatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5056350 tatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 5056386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 700 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 37026326 - 37026191
Alignment:
Q  700 tgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataat 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37026326 tgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataat 37026227  T
Q  800 atcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  37026226 atcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattag 37026191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Original strand, 21900814 - 21901259
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||| |||||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  21900814 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgta-tcttttaatcttgtaatatatgattctagcaat 21900911  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21900912 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcattt-ttatctttgatttaattgttattgaaaagtgcttttgaatctaggtttagaataatttatctat 21901010  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  21901011 caaaacaataattttagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcatcga 21901110  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||  || ||||  ||| ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  | |    
T  21901111 ttaaacgattcgatcgacaattggattgtttaatagtttgggaaatcaactattgaacaatacaattgatttcacacgattatttggacacgaataatct 21901210  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  21901211 tgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 21901259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 37026675 - 37026324
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| |||  ||     
T  37026675 caactcgccatggcgagggaatgtactcgcgaggcgagttagggcggcttaggcttctcacagctgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaactgca- 37026577  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaatt-ctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagtttt 225  Q
    |||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||||||| || | | |||||| ||||||||||| | || ||||||||||||   || | ||||||||    
T  37026576 ctcgccctggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatacagaattagaatttctataaatagctcattcaatcatttcattaaggactcttagtttt 37026477  T
Q  226 tctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttga 324  Q
    ||  |||||||| |  |||||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  37026476 tc--atagttttcattttgtaat-----tagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttga 37026384  T
Q  325 gatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatga 384  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37026383 gagatcacaagtgtgtaatggatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttccatga 37026324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 622
Target Start/End: Original strand, 10830750 - 10830991
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||  |||||||| |    
T  10830750 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatattattctagcaat 10830848  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  |||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10830849 ttacatgatattgatgttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataatttatctat 10830947  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10830948 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcac 10830991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 622
Target Start/End: Original strand, 11024542 - 11024783
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||  |||||||| |    
T  11024542 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatattattctagcaat 11024640  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  |||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11024641 ttacatgatattgatgttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataatttatctat 11024739  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11024740 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcac 11024783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 496 - 819
Target Start/End: Original strand, 7412658 - 7412980
Alignment:
Q  496 ttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctag 595  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||    
T  7412658 ttattcttgcaatttat-gcttatgtttgatctaatttctattgaaaaatactcttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacaggaatt-tag 7412755  T
Q  596 acatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccga 695  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||| || ||| | ||||||  ||| || | |||| ||||||||| || ||||||  ||| || |||    
T  7412756 acatgggatttatgttttgataatcactttgagtatctaagcttcatgctttcggatcgtttagtagactgagaaatcgtcaattaaacaatacgatcga 7412855  T
Q  696 ctcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattg-atttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatg 794  Q
     | ||| ||  || |||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7412856 atattggattgtttaatagtttgagaaatcaacgattaaaagatacgattgaacttcacaatatcatttagacatgaatgatgttgtcgagggatacatg 7412955  T
Q  795 ataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    ||||||||    |||||||||||||    
T  7412956 ataatatcgcttaaaagctagaatc 7412980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 585
Target Start/End: Original strand, 8881037 - 8881227
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatc-tataaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||    
T  8881037 catgacaatgatcaactaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatc-aagcttaa-atgtaatcttttgatcttttaaataaatgattctagcat 8881134  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || || |||||||||  |||||||||||              |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8881135 tttatgtgatattgagtttattcttgca--------------tttgatttaaatgttattgagaaatacttttgaaactaggtttagaatattcatctat 8881220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 280 - 400
Target Start/End: Original strand, 7412531 - 7412652
Alignment:
Q  280 catagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgta-atgaatcattctctttcaattcattattgcaaggctt 378  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| | |||| | |||||| | |     
T  7412531 catagagttagagtgatagaaggtggattcttccatatttgttgagaaatcacaagtttgtatatgaatcttcatcttttacttcaatcttgcaaagtta 7412630  T
Q  379 ccatgacaatgagtagctaaat 400  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  7412631 tcatgacaatgagtagctaaat 7412652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Original strand, 33849903 - 33849962
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctca 87  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33849903 caactcgccatggcgagtgcatgtactcgcgaggcgagttagggcggcctagactcctca 33849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 547 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 43364680 - 43364566
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctt 646  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||   |||   ||||||||||||    
T  43364680 cttttgaatctaggtt-agaataatcttctatcaaagcttttgttctagacatggaatttaggttttgataatcactttgaatattggaacttaaagctt 43364582  T
Q  647 tcttatcattcaatag 662  Q
    |  |||||||||||||    
T  43364581 ttgtatcattcaatag 43364566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21643390 - 21643294
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  21643390 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 21643294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14288677 - 14288496
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  14288677 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 14288579  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  14288578 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattg 14288496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14299862 - 14299681
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  14299862 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 14299764  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  14299763 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattg 14299681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 547 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 28442883 - 28442628
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctt 646  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||   |||   ||||||||||||    
T  28442883 cttttgaatttaggtt-agaataatcttctatcaaatctcttgttctagacatggaatt-aggttttggtaatcactttgactattggaacttaaagctt 28442786  T
Q  647 tcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattg 746  Q
    |   |||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || ||||  | |||||  || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||  |||| |    
T  28442785 ttgcatcattgaatagtttgggaaatcaactatacaacgatacaatcgactagtggatcgttcagtagtttgggaaatcaacgattgaacgactcaatag 28442686  T
Q  747 atttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaa 804  Q
    | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||  ||||||||||||    
T  28442685 aattcacgacattatttggacacgaatgatgttgttgagcgatatgtgataatatcaa 28442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36876427 - 36876330
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || |||||||||||    
T  36876427 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgg 36876330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 194
Target Start/End: Original strand, 3923456 - 3923524
Alignment:
Q  126 aactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  3923456 aactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagccc 3923524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Original strand, 6020202 - 6020298
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  6020202 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattg 6020298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23613260 - 23613164
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  23613260 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcggaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 23613164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1379831 - 1379752
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  1379831 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 1379752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2447532 - 2447453
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  2447532 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 2447453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 5049250 - 5049329
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  5049250 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 5049329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6796322 - 6796243
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  6796322 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 6796243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 27951280 - 27951205
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||    
T  27951280 cttttgaatctagggttagaataataatctaacaaaactttaattctagacatggaatttaggttctgagaatcac 27951205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 27954517 - 27954442
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | || ||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  27954517 cttttgaatctagggttagaataataatctagcaaaactttaattgtagacatggaatttaggttctgataatcac 27954442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 48346432 - 48346511
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  48346432 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 48346511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 48352816 - 48352895
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  48352816 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 48352895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Original strand, 20403843 - 20403920
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacat--aagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  20403843 cttttgaatctaaggttagaataatcatatatcaatacgtcaaagttctagacatggaatttagattttgataatcac 20403920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26602861 - 26602783
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaata 190  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||   |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  26602861 ggtgaaggaacctcaactcaccatggcgaattaaggagctcgcgaggcgagttgatgcagaatcagaattctataaata 26602783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 39433993 - 39433959
Alignment:
Q  11 cagagatcacacgctaccaactcgcaatggcgagt 45  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39433993 cagagatcacacgccaccaactcgcaatggcgagt 39433959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 10346299 - 10346234
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  10346299 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 10346234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Original strand, 31878768 - 31878833
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||    
T  31878768 atgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgca 31878833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Original strand, 11912535 - 11913341
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  11912535 caactcgcaatggcgagtgaaattactcgtgaggcgagttagggtggcctaaactcctcagaggtgacgtggctcaaatttaatggtgaagaaacttcaa 11912634  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagtttagttttt 226  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  || |  ||||||||     
T  11912635 ctcgccaaggcgaatggtgttactcgcgaggcgagttgaggcagaacaagaat-ctagaaatagcccatttaatcatttcattaagacatcttagtttt- 11912732  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttga 324  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||    
T  11912733 ctcata-ttttcaacttgtgatacttttagagagagagagatagggcttgttcta-atagagtgagagtgataataggtggattctttctcatttgttga 11912830  T
Q  325 gatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtac 424  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11912831 gagatcacaaagttgtaatgaatccttctctttcaattcatttttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgagattagaggtac 11912930  T
Q  425 ttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11912931 ttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatttataaatatatgattctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttg 11913030  T
Q  525 atttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacct 624  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11913031 atttaattgtgattgagaaatacttttgaatttaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaatttatgttttgataatcacct 11913130  T
Q  625 tttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacat 724  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11913131 tttgtatcaaaacttaaagctttcttatcattcaatagactgagaaatcttcaattaaatgataagaccgactcttggatcattcaatagtttgaaacat 11913230  T
Q  725 caacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgt 824  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913231 cgacgattgaatgatacaattgatctcgcaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgt 11913330  T
Q  825 atggtcattag 835  Q
    |||||||||||    
T  11913331 atggtcattag 11913341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 44917181 - 44916481
Alignment:
Q  134 atggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagtttttctcata 232  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||| |||||||||||||| ||| | |||||||||   | | | |||||||||||||||    
T  44917181 atggagaatgaagttactcgcgaggcgagttgaggcagaacaagacttctataaatagccatttga-tcatttcataaaaaaatcttagtttttctcata 44917083  T
Q  233 gtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcac 332  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44917082 -tttttatcttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtagattcttccttatttgttgagagatcac 44916984  T
Q  333 aagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatctt 432  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44916983 aaagttgtaatgaatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttcaatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagagatacttgatctt 44916884  T
Q  433 agctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaatt 532  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44916883 agctaaacatgtaatattttgatctataaatatatggttctaacatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaatt 44916784  T
Q  533 gtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatc 632  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44916783 gtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagatatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatc 44916684  T
Q  633 caaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgatt 732  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44916683 caaacttaaagttttcttatcgttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttggatcattcaatagtttgagacatcgacgatt 44916584  T
Q  733 gaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcat 832  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44916583 gaatgatacaattgatctcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcat 44916484  T
Q  833 tag 835  Q
    |||    
T  44916483 tag 44916481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 520; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 9870054 - 9869248
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||  || |||||| |  ||| | |||||  |||   || ||||||||||| |||||    
T  9870054 aactcgccatggcgaatgaatgtactcgcaaggcgagttagggcggtttagactccttagaggttacgtggcacaaaaccaatggtgaagaaacttcaac 9869955  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttct 228  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| |   |||||| |||||||||||| |||| ||| |||||  || |  ||| ||||| |    
T  9869954 tcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaacgagaattttataaatagcccatttactcaattcataaga-atcttacttttttt 9869856  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagat 327  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||     
T  9869855 catagttttcattttgtaatacttttagagagagagattgggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagaggattctacatcaatttgttgagag 9869756  T
Q  328 atcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 427  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869755 atcacaagtgtgtaatggatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 9869656  T
Q  428 atcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatt 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9869655 atcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatt 9869556  T
Q  528 taattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctttt 627  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9869555 taattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgataatcacctttt 9869456  T
Q  628 gtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaa 727  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9869455 gtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcaattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcga 9869356  T
Q  728 cgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869355 tgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 9869256  T
Q  828 gtcattag 835  Q
     |||||||    
T  9869255 atcattag 9869248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 32798681 - 32797866
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||  ||||  ||  |||||| ||| |||     
T  32798681 caactcgccatggcgagtgcatgtactcgcgaggcgagttagggcggcctaaactcctcacagatgacgtggcacaaacccaatcgtgaaggaacttca- 32798583  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtt--------- 218  Q
    || ||||| ||||||| ||   |||||||||| |||||| ||| || |  | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |             
T  32798582 cttgccatagcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgaagcagatcagaagttctataaatagccctt--aatcatttcaatcgagagatagtttttta 32798485  T
Q  219 ---tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctc 315  Q
       |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32798484 tcttagtttttctcaaa-tttttcacttgtactacttttagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattctttctc 32798388  T
Q  316 attt-gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggga 414  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32798387 attttgttgagagatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggga 32798288  T
Q  415 ttagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattg 514  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32798287 ttagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatgtagaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatg 32798188  T
Q  515 cttatgtttgatttaattgtgattgagaaac-acttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgtttt 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32798187 cttatgtttgatttaattgtgattgagaaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgtttt 32798088  T
Q  614 gataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaata 713  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32798087 gataatcacattttgtatccaaacttaaagttttcttatcattcgatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaata 32797988  T
Q  714 gtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagct 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32797987 gtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagct 32797888  T
Q  814 agaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32797887 agaatccatgtatggtcattag 32797866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Original strand, 1115256 - 1116064
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||  ||||  |   |||||| ||| | ||    
T  1115256 caactcgccatggcgagtgcatgtactcgcgaggcgagttagggcggcctagactcctcacagatgacgtggcacaaacccactagtgaaggaacttaaa 1115355  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttc 227  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| ||| || |  | || |||||||||||| |   ||||||||| | |||||   ||||||      
T  1115356 ctcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgaagcagatcagaatttatataaatagcccatg--atcatttcaattgagaggagagttttga 1115453  T
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttgaga 326  Q
    |   ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1115454 tttgagtttttcactggtaatacttttagagagagaaatagggtttgttcta-atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcattttgttgaga 1115552  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115553 gatcacaagtttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 1115652  T
Q  427 gatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1115653 gatcttagcttaacatgtaatcttttgatctagaaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgat 1115752  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1115753 ttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttt 1115852  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1115853 tgtatccaaacttaaagctttattatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacattg 1115952  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatg---gtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatg 823  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1115953 acgatagaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatg 1116052  T
Q  824 tatggtcattag 835  Q
    ||| ||||||||    
T  1116053 tatagtcattag 1116064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 26622417 - 26621613
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  26622417 actcgccatggcgaatggatgtactcgcgaggtgagttagggcggtctaa-ctcttcacagatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 26622319  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctc 229  Q
    | |||||||||||| ||   |||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||| |    |  ||||||||||      
T  26622318 caccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttcatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcagtttttatcttagtttttc-- 26622221  T
Q  230 atagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagat 327  Q
    ||| |||| |  || ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||     
T  26622220 atacttttcattttataatatttatagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaa 26622121  T
Q  328 atcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 427  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26622120 atcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttg 26622022  T
Q  428 atcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  26622021 atcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgat 26621922  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26621921 ttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttt 26621822  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26621821 tgtatccaaacttaaagttttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcg 26621722  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26621721 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 26621622  T
Q  827 ggtcattag 835  Q
    | |||||||    
T  26621621 gatcattag 26621613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 44242311 - 44241500
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  44242311 tcgccatggcgagtgcaagtactcgtgaggcgagttagggcggtttaagcttctcactgatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacttcaactcg 44242212  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagttt----------a 220  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||| || |  |||||          |    
T  44242211 ccatggcgaatgaagaagctcgcgaggcgagtggatgcatatttagaattctataaatagctcactcaatcatttcaatgagttagttttttgactctta 44242112  T
Q  221 gtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt- 319  Q
    ||||||   |||||||| |  |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  44242111 gtttttt--atagttttcattttgtaatattcttagagagtgagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcatttt 44242014  T
Q  320 gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44242013 gttgagagatcacaagtgtgtaatggatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggattaga 44241914  T
Q  420 ggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttat 519  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44241913 ggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt--atttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttat 44241816  T
Q  520 gtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44241815 gtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacatagattctagacatgaaattgatgttttgataat 44241716  T
Q  620 caccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 719  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44241715 cactttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagactgactcttgaatcattcaatagtttga 44241616  T
Q  720 gacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44241615 cacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatc 44241516  T
Q  820 catgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| |||||||    
T  44241515 catgtatgatcattag 44241500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 1175550 - 1174749
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  1175550 actcgccatggcgaatggatgtacttgcgaggcgagttagggcggtctaa-ctcttcacagatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 1175452  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttca-ttggagagtttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||| |  ||||||||||     
T  1175451 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttcatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcagttgga-atcttagtttttc- 1175354  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagata 328  Q
     |||  ||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |    
T  1175353 -atacatttcatgttataatatttctagagagagagatagggcttgttcttcacagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaa 1175255  T
Q  329 tcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttga 428  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1175254 tcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttga 1175156  T
Q  429 tcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattt 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  1175155 tcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgattt 1175056  T
Q  529 aattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttg 628  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  1175055 aattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgatttgataatcaccttgtg 1174956  T
Q  629 tatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaac 728  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1174955 tatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgagcgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgac 1174856  T
Q  729 gattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgg 828  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1174855 aattgaatgatacaattgatctcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga 1174756  T
Q  829 tcattag 835  Q
    |||||||    
T  1174755 tcattag 1174749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 4600483 - 4599672
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | |||  ||||  ||||  || | ||||| ||| ||||||||    
T  4600483 tcgccatggcgagtgcaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcactgatgacatggcacaaacccaatgatgaaggaacttcaactcg 4600384  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcat 231  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| ||| |||| | ||| | ||||||||||||||| |  | ||||| |||| ||   |||| ||||||| || |    
T  4600383 ccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagtggatgtagatttataattctataaatagctcactcaatcagttcaatg---agtt-agtttttatctt 4600288  T
Q  232 agtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt- 319  Q
    ||||||| |         ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||     
T  4600287 agtttttcatagttttcacttgtaatattcttagagagagagagatagggcttgtgcttgatagaatgagagtgatagaaattggattctacatcatttt 4600188  T
Q  320 gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 419  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600187 gttgagagatcacaagtgtataatggatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 4600088  T
Q  420 ggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttat 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600087 ggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttat 4599988  T
Q  520 gtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4599987 gtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatcaaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttatagacatggaattgatgttttggtaat 4599888  T
Q  620 caccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 719  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4599887 cactttttgtatccaaacttaaagctttcttatgattcaatagattgagaaatcattgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 4599788  T
Q  720 gacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599787 gacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacagtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatc 4599688  T
Q  820 catgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| |||||||    
T  4599687 catgtatgatcattag 4599672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 31073042 - 31072461
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaa-tcattct 353  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  31073042 agagagagagagagggtttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattctttctcatttgttgagagatcacaagtttgtaatgaaatccttct 31072943  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31072942 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaacgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 31072843  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |    
T  31072842 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatgtttgatttgattatgattgagaaatacttttaa 31072743  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31072742 atcaaggtttagaataatcatctatgaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 31072643  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | | ||||||||||||||||    
T  31072642 attcaatagattgagaaatcattgattttatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatctattatttatttatacaattgatttcac 31072543  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31072542 aatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattag 31072461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Original strand, 23761816 - 23762415
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23761816 ttttcacttgtaacattcttggagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcatttgttgagaaatcacaa 23761915  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23761916 gtt-gtaatgaatcttacttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcctag 23762014  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  23762015 cttaacatgtaatcttttaatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatttaattgt 23762114  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  23762115 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaattgattttttgataatcactttgtgtatcca 23762214  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23762215 aacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacaattga 23762314  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762315 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 23762414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Original strand, 41304795 - 41305593
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||  | |||||||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  41304795 actcgccatggagaatggatgtactcgcgaggggagttagggcggtttaa-ctcttcacagatgatgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 41304893  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt-ggagagtttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||  | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||| | || ||||||||     
T  41304894 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgatttgatgctgaatcagaattctataaatagcccagtcaagcatttcattaggatactt-agtttttc- 41304991  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
     ||| |||| |  || ||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  41304992 -atacttttcatgttataatatttccagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttggttgaga 41305090  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305091 aatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgataatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 41305189  T
Q  427 gatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttga 525  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  41305190 gatcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcattttaatgcttatgtt-ga 41305288  T
Q  526 tttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41305289 tttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcacctt 41305388  T
Q  626 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305389 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattagat-----gaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 41305483  T
Q  726 aacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 825  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305484 gacgttcgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 41305583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 112 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 29002598 - 29001874
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  29002598 ggtgaaggaactccaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 29002499  T
Q  212 gagagtttagtttttct--------catagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaat 303  Q
     | | || |||||||||        |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  29002498 aatactt-agtttttctgagtttttcata-tttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaagt 29002401  T
Q  304 ggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 402  Q
    | ||||| | ||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29002400 gaattctacatcactttgttgagagatcacaaatgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 29002301  T
Q  403 cctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattct 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||    
T  29002300 cctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattg------ttct 29002207  T
Q  503 tgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacataga 602  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  29002206 tgcattttaatgcttatgcttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatgga 29002107  T
Q  603 attgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttga 702  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  29002106 atcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttattattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttga 29002007  T
Q  703 atcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29002006 atcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaattgatttcacaatattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatc 29001907  T
Q  803 aaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29001906 aaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 29001874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 230 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 6239403 - 6238798
Alignment:
Q  230 atagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatat 329  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||    
T  6239403 atagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacat 6239304  T
Q  330 cacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgat 429  Q
    |||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6239303 cacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggactagaggtacttgat 6239205  T
Q  430 cttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattt 528  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||    
T  6239204 catagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgattt 6239105  T
Q  529 aattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttg 628  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  6239104 aattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgag 6239005  T
Q  629 tatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaac 728  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6239004 tatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcgttcaatagtttgagacatcgac 6238905  T
Q  729 gattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgg 828  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6238904 cattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga 6238805  T
Q  829 tcattag 835  Q
    |||||||    
T  6238804 tcattag 6238798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 43687353 - 43686772
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  43687353 agagagagagatagggcttgtgctgtatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaatagatctttct 43687254  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  43687253 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctagatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcttttg 43687154  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43687153 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 43687054  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  43687053 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatc 43686954  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43686953 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcac 43686854  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43686853 aatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 43686772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Original strand, 39052818 - 39053417
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  39052818 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgataaagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaa 39052917  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39052918 gtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatag 39053016  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  39053017 tttaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 39053116  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39053117 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatcca 39053216  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39053217 aacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattga 39053316  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39053317 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 39053416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Original strand, 39059190 - 39059789
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  39059190 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgataaagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaa 39059289  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39059290 gtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatag 39059388  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  39059389 tttaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 39059488  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39059489 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatcca 39059588  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39059589 aacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattga 39059688  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39059689 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcatta 39059788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 45016503 - 45015924
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  45016503 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 45016405  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  45016404 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 45016305  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45016304 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 45016205  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45016204 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 45016105  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45016104 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 45016005  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45016004 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 45015924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 42092618 - 42092039
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  42092618 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 42092520  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  42092519 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatttcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 42092420  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42092419 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 42092320  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42092319 tctaggtttagaataaccatctgtcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 42092220  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  42092219 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 42092120  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42092119 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 42092039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 35085937 - 35085214
Alignment:
Q  51 tactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttac 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||   |    
T  35085937 tactcgcgaggcgagttagggtggtttaagcttctcactgatgacgtggcacaaactcaatggtgaaggaactccaactcgccatggcgaatgaaggagc 35085838  T
Q  151 tcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagttt----agtt--tttctcatagtttttaactt 243  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||| || |  |||||    | ||  ||| |||||||||| |  ||    
T  35085837 tcgcgaggcgagtggatgcagatttagaattctataaatagctcactcaatcatttcaatgagttagtttttacacttagtttttcatagttttcatttt 35085738  T
Q  244 gtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttgagatatcacaagtttgtaa 342  Q
    |||||| | ||||||||| |||    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  35085737 gtaatattcttagagagataga----gcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcacaagtgtgtaa 35085642  T
Q  343 tgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacat 442  Q
    || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35085641 tggatatttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtacctaaatctcctttgttaggattaaaggtacttgatcttagcttaacat 35085542  T
Q  443 gtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgaga 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085541 gtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgaga 35085442  T
Q  543 aacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaa 642  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35085441 aatacctttgaatctaggcttagaataatcatctatcaaaacatagattctagacatggaattgatgttttgataatcactttttgtatccaaacttaaa 35085342  T
Q  643 gctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgataca 742  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35085341 gctttcttatcattcaataggttgagaaatcatcgattaaatgat---actgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgataca 35085245  T
Q  743 attgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085244 attgatttcacaatattgtttggacacgaat 35085214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 450 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 41298045 - 41297660
Alignment:
Q  450 tttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacactt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41298045 tttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatactt 41297946  T
Q  550 ttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttct 649  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  41297945 ttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttct 41297846  T
Q  650 tatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatt 749  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41297845 tatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatagaattgatt 41297746  T
Q  750 tcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41297745 tcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 41297660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 112 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 28996882 - 28996371
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  28996882 ggtgaaggaacttcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 28996783  T
Q  212 gagagtttagtttttct--------catagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaat 303  Q
     | | || |||||||||        |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  28996782 aatactt-agtttttctgagtttttcata-tttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgggagtgatagaaagt 28996685  T
Q  304 ggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 402  Q
    | ||||| | ||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28996684 gaattctacatcactttgttgagagatcacaaatgtgtaatggatctttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 28996585  T
Q  403 cctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattct 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||    
T  28996584 cctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgat------gttattct 28996491  T
Q  503 tgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacataga 602  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28996490 tgcattttaatgcttatgcttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatgga 28996391  T
Q  603 attgatgttttgataatcac 622  Q
    || |||||||||||||||||    
T  28996390 atcgatgttttgataatcac 28996371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 45023491 - 45023002
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  45023491 actcgccatggcgaatgattttactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 45023393  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||  |||   |||||||||||    
T  45023392 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattc-agatacttagtttttct 45023294  T
Q  229 catagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt 319  Q
    |  ||||||| |         ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||    
T  45023293 ctgagtttttcatacttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattcttt 45023194  T
Q  320 gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 419  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45023193 gttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 45023094  T
Q  420 ggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcacttta 511  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45023093 ggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcacttta 45023002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 612 - 835
Target Start/End: Original strand, 41299044 - 41299267
Alignment:
Q  612 ttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaa 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41299044 ttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcattgattagatgataagaccgactcttgaatcattcaa 41299143  T
Q  712 tagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaag 811  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41299144 tagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaag 41299243  T
Q  812 ctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    || ||||||||| |||||||||||    
T  41299244 cttgaatccatgaatggtcattag 41299267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 272 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 47647375 - 47646828
Alignment:
Q  272 ttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgta-atgaatcattctctttcaattcattattg 370  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||| | |||    
T  47647375 ttgttcttcagagagtgagagtgatagaaggtggattcttccatatttgttgagaaatcacaagtttgcatatgaatcttcatcttttacttcaatcttg 47647276  T
Q  371 caaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggt 470  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||  | ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  47647275 caaagttaccatgacaatgagtagctaaatctccattgttaggattataggtgctttatca-acctaaacatgtaatcttttgatatttaa-tatatgat 47647178  T
Q  471 tctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa 570  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  47647177 tctagcatttgatttgatattgagattattcttgcaattcat-gcttatgtttgatttaatttttattggcaaatactctagaatctaggtttagaataa 47647079  T
Q  571 tcatctatcaaaacat-aagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgaga 669  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||| | ||||||  ||| || |||||| ||| |    
T  47647078 tcatctatcaaaacatgaaattctagacatgggattgatgttttgataatcactttgagtatctaagcttcatgctttcagatcgtttaatagactgaaa 47646979  T
Q  670 aatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacac 769  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| || | ||| ||| || ||||| |||||| |||||||||| || || || ||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  47646978 aatcgtcgattaaacgatacgactgaatattggatcgtttaatagattgagaaatcaacgattaaacgacacgattgacttcacaatatcatttagacat 47646879  T
Q  770 gaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||    
T  47646878 gaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatcc 47646828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31073292 - 31073062
Alignment:
Q  35 caatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgcca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31073292 caatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggcggcctaaactcctcaagggtgacgtggctcaaacttaatggtgaagaaacatcaactcgcca 31073193  T
Q  135 tggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcatagt 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  || ||||||||||||||    
T  31073192 tggcgaatggagttactcgtgaggcgagttgatgcagattaagaaatctataaatagcccttttaatcatttcatgggggatcttggtttttctcatagt 31073093  T
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagaga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31073092 ttttaacttgtaatacttttagagagagaga 31073062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 23251949 - 23251503
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||| |  |||||||||||||||||   | |||||| |||||| | |    
T  23251949 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgtt-tgagcttagaatgtaatcttttgatcttgtattatatgattctagtaat 23251851  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23251850 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttcttatctttgatttaattgctattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaatattcatctatc 23251751  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23251750 aaaacaatgattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaagtatcggaacttaaagctttcggatcattgaatagattgagaaatcgtcgat 23251651  T
Q  680 taaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgtt 779  Q
    |||| |||| || ||||| ||| ||  || ||||||||| || ||||| ||||  |  ||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||  | ||    
T  23251650 taaacgatacgatcgactattggattgtttaatagtttgggaaatcaaagattatacaatacaattgatctcacaagattacttggacacgaataatctt 23251551  T
Q  780 ggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  23251550 gttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 23251503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 379 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 31473857 - 31473556
Alignment:
Q  379 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |    
T  31473857 ccatgataatgagtagctaaatctactttgttgggattagaggtacttgatca-agcctagcatgtaatcttttgatccttaaatatatgattctagctt 31473759  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaat-tgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatcta 577  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31473758 tttatttgatattgagattattcttgcaattcat-gtttatgtttgatttaaaatgttattgaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatcta 31473660  T
Q  578 tcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcg 677  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | ||  ||| || |||||||||||||||| |||    
T  31473659 tcaaaacaagaattctagacataggattagtgttttgataatcaccttaagtatcaaagcttaatgatatcggatcgtttaatagattgagaaatcgtcg 31473560  T
Q  678 atta 681  Q
    ||||    
T  31473559 atta 31473556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 380 - 773
Target Start/End: Original strand, 5357372 - 5357764
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | | |||| |  |||||||| ||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  5357372 catgacaatgatgaactaattctccttagttggggttagaggtacttgtt-taagcttagaatgtaatcctttgatcttgtaatatatgattctagcaat 5357470  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5357471 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttcttatctttgatttaattgctattgaaaagtaattttgaatccaggtttagaatattcatctatc 5357570  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||   ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||    
T  5357571 aaaacaatgattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaagtattggaacttaaagctttcggatcgttgaatagattgagaaattgtcgat 5357670  T
Q  680 taaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
    |||| |||| |  ||||| ||||||  || ||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  5357671 taaacgatacggtcgactattgaattgtttaatagtttgggaaatcaacaattgaacaatacaattgatctcacaaaattatttggacacgaat 5357764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 283 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 13249409 - 13249008
Alignment:
Q  283 agagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccat 382  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||   |||| | |||||||| |  |||    
T  13249409 agagtgagagtgataggaagtggattcttcaatatttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaattctcatcttttccttcaatcttgcaaggttatcat 13249310  T
Q  383 gacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttga 482  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||  || |    
T  13249309 gataatgagtaactaaatctcctttgttag-attagaggtacttgatca-agcctagtatgtaatcttttgttcttttaatatatgattctagctcttta 13249212  T
Q  483 tttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaat-tgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaa 581  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || || | |||| ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13249211 tttgatattgagattattcttgtaattcat-gtttatatttgatttaaaatgttattgaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatctatcaa 13249113  T
Q  582 aacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgatta 681  Q
    ||||  | ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |   ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  13249112 aacaagaattctagac--aggattaatgttttgataatcaccttaagtatcgaagcttaatgctattagatcgtttaatagattgagaaatcgtcgatta 13249015  T
Q  682 aatgata 688  Q
    || ||||    
T  13249014 aacgata 13249008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 380 - 827
Target Start/End: Original strand, 45619769 - 45620215
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | | | || |  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |    
T  45619769 catgacaatgatgaactaaatctccttagtttggattagaggtacttgtt-taaacttagaatgtaatcttttgatcttgtaatatatgattctagcaat 45619867  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||||| |||| | ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  45619868 ttacatgatattgaagttaattttgcaattcatttcttatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatataggtttaaaatattcatctatc 45619967  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | |||    
T  45619968 aaaacaatgattctagacataggatcaatgttttgataatcacacaaagtatcggaacttaaagctttcggatcgtttaatagattgagaaatcgttgat 45620067  T
Q  680 taaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgtt 779  Q
    |||| ||||  |  |||| ||| ||  || |||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  | ||    
T  45620068 taaacgatacaatggactattggattgtttaatagtctgggaaatcaacgattgaacaatacaattgatctcacaagattatttggacacgaataatctt 45620167  T
Q  780 ggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    | |||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  45620168 gtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 45620215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 380 - 748
Target Start/End: Original strand, 38672402 - 38672769
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  38672402 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgagattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttataatatatgattctagcaat 38672500  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataat-catctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| |  || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38672501 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttcc-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataattcatctat 38672599  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| || |    
T  38672600 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcaa 38672699  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgat 748  Q
    ||||| |||| || ||||  ||| ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||||    
T  38672700 ttaaacgatacgatcgacaattggattgtttaatagtttgggaaatcaactattgaacaatacaattgat 38672769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 380 - 773
Target Start/End: Original strand, 28413298 - 28413690
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||| | |    
T  28413298 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagattagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagtaat 28413396  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28413397 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataatttatctat 28413495  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||    || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  28413496 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtattggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcga 28413595  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
    ||||| |||  ||  |||  ||| ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  28413596 ttaaacgatctgattgacaattggattgtttaatagtttgggaaatcaactattgaacaatacaattgatctcacacgattatttggacacgaat 28413690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 13432447 - 13432025
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || | |  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||     
T  13432447 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattacaggtacttgat-taagttgataatgtaatcttttgatctttcaaatatatgattctagcaa 13432349  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || |  ||||||||||| || ||||| | || ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  13432348 tttacatgatattgatgatactcttgtatttcattccttatctttgatttaaatgctattgagaaatacttttgaatctaggttaagaatatttatctat 13432249  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
     ||||||    |||||||||||| | | ||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  13432248 aaaaacaatgattctagacataggactaatgttttgataatcacacaaagtatcggaacttaaagctttcagatcgtttaatagattgagaaatcgtcga 13432149  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||| || ||| | ||| ||  || | |||||||||| |||||| ||| ||  ||| ||||||  | |||| ||  |||||||| || |||| |    
T  13432148 ttaaacgatacgatcgaatattggattgtttattagtttgagaaatcaacaattaaacaataaaattgacctgacaagatcatttggacatgagtggtat 13432049  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    || |||| ||||| ||||||||||    
T  13432048 tgtcgagcgatacgtgataatatc 13432025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23252304 - 23252129
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  23252304 caactcgcaaaggcgagtgatattactcgcgaggcgagttagggcggcctaaactccttagaggtgacgtggctcaaaattaatggtgaagaaacttcaa 23252205  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatca 203  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23252204 ctcgccaaggcgaatggtgttactcgcgagacgagttgaggcagaacaagaattctataaatagcccatttaatca 23252129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 682
Target Start/End: Original strand, 2824445 - 2824746
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| |    
T  2824445 catgacaatgatgaactaaatctccttagctgggattagaggcacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaat 2824543  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatc-atctat 578  Q
    | |  ||||||||| |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  2824544 ttacatgatattgaagttattcttgcaattcattt-ttatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttaggataatttatctat 2824642  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  2824643 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcga 2824742  T
Q  679 ttaa 682  Q
    ||||    
T  2824743 ttaa 2824746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 39806654 - 39806233
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| ||||| || |    
T  39806654 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctaccaat 39806556  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctat 578  Q
    | |  ||||||| | |||||||||||| || |||  | || |||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39806555 ttacatgatattaaagttattcttgcaattcatt-ttcatctttgatttaatttttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataatttatctat 39806457  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| || |||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || ||| |||||||||||| || |    
T  39806456 caaaacaataattctagacataggatcgatgttttgataatcacacaaggtatcagtacataaagctttcggatcgttgaatggattgagaaatcgtcta 39806357  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||| || ||||  ||| ||  ||  |||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  | |    
T  39806356 ttaaacgatatgatcgacaattggattgtttgatagtttgggaaatcaactattgaacaatacaattgatctcacacgattatttggacacgaataatct 39806257  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    
T  39806256 tgttgagcgatacgtgataatatc 39806233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 30660437 - 30660131
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||  |   |||||||||||||||  | |||||||| |||||||  |    
T  30660437 catgagaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaaagatacttgatca-agcctattgtgtaatcttttgatcctttaatatatgattctagctct 30660339  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattta-attgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||  | || | |||||||| ||||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  30660338 ttatttgatattgagattattcttgcaaatcat-gtttatgttt-atttagaatgttattgaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatcaac 30660241  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | ||  ||| || |||||||| ||||||| | ||    
T  30660240 caaaacaagaattctacacataggattagtgttttgataatcaccttaagtatcgaagcttaatgatatcagatcgtttaatagattaagaaatcgttga 30660141  T
Q  679 ttaaatgata 688  Q
    ||||| ||||    
T  30660140 ttaaaagata 30660131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 302
Target Start/End: Original strand, 5444634 - 5444770
Alignment:
Q  165 gatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagag 264  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||| | ||  ||| || |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||     
T  5444634 gatgcagatttagaattctataaatagctcactcaatcatttcattagggatcttaattattctcataatttttcacctgtaat-cttttagagagagaa 5444732  T
Q  265 atagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaa 302  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5444733 atagagcttgttcttcatagagtgagagtgatacaaaa 5444770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44917349 - 44917185
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||  || |  |  ||||||| ||| ||||    
T  44917349 caactcgcaatggcgagtgatattacccgcgaggtgagttagggcggc-taaactccttagaggtgatgtggcacaatcccactggtgaagtaacctcaa 44917251  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcc 193  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |  || | ||||||||||||||    
T  44917250 ctcgccatggagaatgaagttactcgcgaggcgagttgaggcagaacaatacttctataaatagcc 44917185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 43687567 - 43687424
Alignment:
Q  51 tactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttac 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  43687567 tactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcactgctgacgtggcacaaacccaatggggaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagc 43687468  T
Q  151 tcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    ||||||||| |||  ||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  43687467 tcgcgaggcgagtgaatgtagattcagaattctataaatagccc 43687424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 461 - 688
Target Start/End: Original strand, 7063371 - 7063601
Alignment:
Q  461 aatatatggttctagca--tttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattt-aattgtgattgagaaacacttttgaatct 557  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||| |||||| || ||  ||||| ||| |||||| |||||    
T  7063371 aatatttggttctagcaattttgacttgatattgatattattcttgtgttttat-gcttatgtatgatttgaaatgatattgaaaaatacttttaaatct 7063469  T
Q  558 aggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca-aacttaaagctttcttatcatt 656  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||| |   ||||||||||||  || | ||||||| |||||| ||   |||| | ||||||| ||| |   ||| ||    
T  7063470 agggttagtataatcatttatcaaaacttttattctagacatagggtttaagttttgacaatcactttaaatatcaagaacttaatgctattggatcgtt 7063569  T
Q  657 caatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7063570 taatagattgagaaatcgtcgattaaacgata 7063601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 787 - 835
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240209
Alignment:
Q  787 gatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 27240209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 688
Target Start/End: Original strand, 13830549 - 13830701
Alignment:
Q  536 attgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaa 635  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||   |   ||||||| || | ||| | ||||||||||||||  ||||||  |||    
T  13830549 attgaaaaatacttttgggtctagggttagaataataatctatcaaagttttgattctagagattggatttaagttttgataatcac--tttgtaatcaa 13830646  T
Q  636 --acttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
      |||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13830647 gaacttaaggctatcgtatcatttaatagattgagacatcatcgattaaatgata 13830701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21815250 - 21815176
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  21815250 cttttgaatctaggtt-agaataatcttctatcaaagcttttgttctagacatggaatttaggttttgataatcac 21815176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 39052656 - 39052735
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| | ||| | | ||||| |||||||||||||    
T  39052656 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagttaaggcagactcagaatcctataaatagccc 39052735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 39059028 - 39059107
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| | ||| | | ||||| |||||||||||||    
T  39059028 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagttaaggcagactcagaatcctataaatagccc 39059107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Original strand, 23761623 - 23761779
Alignment:
Q  37 atggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatg 136  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23761623 atggcgaatggatttactcgcgaggcgagttagggcggtcttaag-cttcatagttgacgtggcacaaacccaatggtgaagtaacctcaactcgccatg 23761721  T
Q  137 gcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    ||||||| |    |||||||||| ||| |||||| | | | |||||||||||||||||    
T  23761722 gcgaatgaatgagctcgcgaggcgagtggatgcagagtcaaaattctataaatagccc 23761779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 432334 - 432270
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  432334 atgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 432270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9667689 - 9667625
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9667689 atgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagcaatttattcaatattgttgttattcttgc 9667625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 9870106 - 9870067
Alignment:
Q  6 agcagcagagatcacacgctaccaactcgcaatggcgagt 45  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9870106 agcaacagagatcacacgccaccaactcgcaatggcgagt 9870067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45016665 - 45016586
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  45016665 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 45016586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 12168210 - 12168145
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  12168210 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 12168145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 38121926 - 38121861
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  38121926 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 38121861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39001175 - 39001110
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  39001175 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 39001110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 534; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 16118 - 15314
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | ||| |||||  ||||  |  ||||||| ||| ||||    
T  16118 caactcgccatggcgagtgcatgtactcgcgaggcgagttagggcggcctagactccttacagatgacgtggcacaaacccactggtgaaggaacttcaa 16019  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagttttt- 226  Q
    |||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| |||  | || | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||  | |||||||     
T  16018 ctcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgaagcagctcaaaatttctataaatagccctt--aatcatttcaatggggatctaagtttttt 15921  T
Q  227 ctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15920 ctcataattttca-cttgtaatacttttagagagagaggtagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaactggattcttcctcatttgttgaga 15823  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15822 gattacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattcttgaaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggattaaaggtactt 15723  T
Q  427 gatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgat 526  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15722 gatcttagcttaacatgtattcttttgatctataaatatatggttttagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatgtttgat 15623  T
Q  527 ttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttt 626  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15622 ttgattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacattgaattgatgttttgataatcaccttt 15523  T
Q  627 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatca 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15522 tgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgattcttgaatcattcaatagtgtgagacatca 15423  T
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15422 acgattgaatgatacaattgatctcacattattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 15323  T
Q  827 ggtcattag 835  Q
    | |||||||    
T  15322 gatcattag 15314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 500; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 834
Target Start/End: Original strand, 30210841 - 30211614
Alignment:
Q  60 ggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggc 159  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||  |||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  30210841 ggcgagttagggcggcctagactcctcacagatgacgtggcacaaacctactggtgaaggaacttaaactcgccatggcgaatgaaggaactcgcgaggc 30210940  T
Q  160 aagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagaga 259  Q
     |||||| ||| || |  | || |||| |||||||||  |||||||||| | || |    ||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||    
T  30210941 gagttgaagcagatcataatttttatagatagccctt--aatcatttcaattgatatagaagtttttctcatacttttca-ctagtaatacttttagaga 30211037  T
Q  260 gagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctcttt 357  Q
    ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30211038 gagagagatagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcatttgttgagagatcacaagtttgtaatgaatccttctcttt 30211136  T
Q  358 -caattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatc 456  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30211137 tcaattcattcttgcaaggcttccatgacaataagtagctaaatctcctttgtttggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatc 30211236  T
Q  457 tataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatc 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30211237 tataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttgattgtgattgagaaatacttttgaatc 30211336  T
Q  557 taggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcatt 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30211337 taggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagatatgaaatggatgttttgataatcactttttgtatccaaacttaaagctttcttatcatt 30211436  T
Q  657 caatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaat 756  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30211437 caatagattgagaaatcaccgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaat 30211536  T
Q  757 attgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30211537 attttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcatta 30211614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 835
Target Start/End: Original strand, 36754072 - 36754870
Alignment:
Q  31 ctcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactc 130  Q
    |||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||  |  ||||||| ||| |||||||    
T  36754072 ctcgcagtggcgagtgatattacccacgaggcgagttagagcggc-tatactcctcagaggtgacgtggcacaaacccactggtgaagtaacctcaactc 36754170  T
Q  131 gccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagtttagtttttctc 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||   |  |  |||||||| |||    
T  36754171 gccatggcgaatgaagttactcacgaggcgagttgaggcagaacaggaattctataaatagccacttgac-catttcataaagttatcttagtttt-ctc 36754268  T
Q  230 atagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatat 329  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  36754269 ata-ttttcatcttgtaatacttttagagagaga--taaggcttgttcta-atagagtgagagtgatcaaaggtggattcttcctcatttgttgagagat 36754364  T
Q  330 cacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgat 429  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36754365 cacaaagttgtaatgaatccttctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggtacttgaa 36754464  T
Q  430 cttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattta 529  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36754465 cttagctaaacatgtattcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatgta 36754564  T
Q  530 attgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgt 629  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36754565 attgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgt 36754664  T
Q  630 atccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacg 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36754665 atccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaatgataagaccgactcttggatcattcaatagtttgagacatcgacg 36754764  T
Q  730 attgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggt 829  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36754765 attgaatgatacaattgatctcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggt 36754864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 16406300 - 16405485
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  16406300 tcgccatggcgagtgcaagtactcacgaggcgagttagggcggtttaagcttctcactgatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacttcaactcg 16406201  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagtttag----tt--t 224  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||| || |  ||||| |    ||  |    
T  16406200 ccatggcgaatgaagaagctcgcgaggcgagtggatgcaaatttagaattctataaatagctcactcaatcatttcaatgagttagttttgactcttagt 16406101  T
Q  225 ttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttg 323  Q
    || |||||||||| |  | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  16406100 ttttcatagttttcatttggtaatattcttagagagtgagatagggcttgttcttgatagagtgagagtggtagaaagtggattctacatcattttgttg 16406001  T
Q  324 agatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggta 423  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16406000 agagatcacaagtgtgtaatgaatcattctctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggta 16405901  T
Q  424 cttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgttt 523  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16405900 cttgatcttagcttaacatgtaatcttttaatctataaatatatggttttatcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgttt 16405801  T
Q  524 gatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacc 623  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  16405800 gatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacatagattctagacatggaattgatgatttgataatcact 16405701  T
Q  624 ttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagaca 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405700 ttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagaca 16405601  T
Q  724 tcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgata----atatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||    
T  16405600 ttgacaattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatc 16405501  T
Q  820 catgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| |||||||    
T  16405500 catgtatgatcattag 16405485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 13595064 - 13594251
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  13595064 actcgccatggcgaatgattttactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 13594966  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||| |||   |||||||||||    
T  13594965 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg-agatacttagtttttct 13594867  T
Q  229 catagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt 319  Q
    |  ||||||| |         ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||    
T  13594866 ctgagtttttcatacttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattcttt 13594767  T
Q  320 gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 419  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594766 gttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattaga 13594667  T
Q  420 ggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttat 519  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  13594666 ggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttat 13594567  T
Q  520 gtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataat 619  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13594566 ctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataat 13594467  T
Q  620 caccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 719  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13594466 cactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttga 13594367  T
Q  720 gacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13594366 gacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatc 13594267  T
Q  820 catgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| |||||||    
T  13594266 catgtatgatcattag 13594251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 27591065 - 27590448
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  27591065 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 27590966  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590965 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 27590866  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  27590865 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 27590766  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27590765 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 27590666  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27590665 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 27590566  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27590565 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 27590466  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  27590465 tccatgtatgatcattag 27590448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 17457728 - 17456998
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggag 214  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || |||||||||| |     
T  17457728 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgaaa 17457629  T
Q  215 ---agttt-------agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatg 304  Q
       |||||       ||||||||||  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17457628 tatagttttttacttagtttttctctgagtttttcacttggaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtg 17457529  T
Q  305 gattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 404  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457528 gattcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 17457429  T
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457428 tttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttg 17457329  T
Q  505 cactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaat 604  Q
    ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17457328 cactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaat 17457229  T
Q  605 tgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaat 704  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  17457228 cgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaat 17457129  T
Q  705 cattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaa 804  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17457128 cattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaa 17457029  T
Q  805 agaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17457028 agaaaagctagaatccatgtatgatcattag 17456998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 222 - 835
Target Start/End: Original strand, 37367780 - 37368393
Alignment:
Q  222 tttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttg 320  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||    
T  37367780 tttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagtgaattctacatcactttg 37367879  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37367880 ttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 37367979  T
Q  421 gtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatg 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  37367980 gtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatc 37368079  T
Q  521 tttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37368080 tttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatc 37368179  T
Q  621 accttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgag 720  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368180 accttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgag 37368279  T
Q  721 acatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368280 acatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaa-attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc 37368378  T
Q  821 atgtatggtcattag 835  Q
    ||||||| |||||||    
T  37368379 atgtatgatcattag 37368393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 8104837 - 8104025
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  8104837 actcgccatggcgaatgattttactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 8104739  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctc 229  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||| ||||       ||||||||||||    
T  8104738 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccattacattcatatacttagtttttctc 8104639  T
Q  230 atagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttg 320  Q
      ||||||| |         ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  8104638 tgagtttttcatacttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcattctttg 8104539  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104538 ttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 8104439  T
Q  421 gtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatg 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||     
T  8104438 gtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattaatgttattcttgcactttaatctttatc 8104339  T
Q  521 tttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8104338 tttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatc 8104239  T
Q  621 accttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgag 720  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104238 actttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattctatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgag 8104139  T
Q  721 acatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104138 acatcgacaattgaa-gatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc 8104040  T
Q  821 atgtatggtcattag 835  Q
    |||| || |||||||    
T  8104039 atgtgtgatcattag 8104025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 835
Target Start/End: Original strand, 55462271 - 55462851
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  55462271 tagagagagtgatagggcttgttcttcatagagtgagagtgacagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcaaaagtt-gtaatgaatctttct 55462369  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55462370 tcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacctgatcttagcttaacatgtaatcttttg 55462469  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55462470 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattaatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 55462569  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55462570 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatc 55462669  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55462670 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 55462769  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55462770 aatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 55462851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 5660048 - 5660628
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||    
T  5660048 agagagagagagagggtttgttcttcatagagtgagagtgtttaaaggtggattcttcctcatttgttgagagatcacaaagttgtaaggaatccttctc 5660147  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660148 tttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 5660247  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  5660248 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgagattattcttgcactttattgtttatgtttgatttaattgtgatcgaaaaatactcttgaa 5660347  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5660348 tctaggtttaaaataatcatctatcacaacatgaattctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaacgctttcttagca 5660447  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5660448 tttaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagactgactcttggatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatctcaca 5660547  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||    
T  5660548 atattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattag 5660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 41373709 - 41373130
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  41373709 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 41373611  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  41373610 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 41373511  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41373510 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 41373411  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||    
T  41373410 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaagcctaaagctttcttatca 41373311  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41373310 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 41373211  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41373210 atattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 41373130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 456 - 835
Target Start/End: Original strand, 16838059 - 16838438
Alignment:
Q  456 ctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16838059 ctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcattttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaat 16838158  T
Q  556 ctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcat 655  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16838159 ctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgataatcactttttttatccaaacttaaagctttcttatcat 16838258  T
Q  656 tcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaa 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16838259 tcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagaccgactcttgaatcatttaatagtctgagacatcgacgattggatgatacaattgatttcacaa 16838358  T
Q  756 tattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattag 16838438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 218 - 643
Target Start/End: Original strand, 37355811 - 37356236
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  37355811 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 37355910  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355911 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 37356010  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  37356011 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttgatcttt 37356110  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37356111 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 37356210  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaag 643  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||    
T  37356211 atcactttgtgtatccaaacctaaag 37356236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 254 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 30238952 - 30238582
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  30238952 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttct 30238854  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30238853 tcttcaattcattcttgcaaggcctccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 30238754  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  30238753 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcaatttaatctttatctttgatttaattttgattgagaaatacttttga 30238654  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30238653 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacagagattctagacatggaatgaatgttttgataatcacctt 30238582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 112 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 7781200 - 7780737
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaat-agcccttttaatcatttcat- 209  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||| |||||  |||| ||||||||     
T  7781200 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgtgaggcgagttgatgcagaatcagaattctataaataagcccacttaaccatttcata 7781101  T
Q  210 --tggagagtttagttt---ttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatg 304  Q
      |    ||||||| ||   || ||||| | || |  || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7781100 gatacttagtttagcttagattttcatactgttcattttataatatttctagagagagagatagggcttgctcttcatagagtgagagtgatagaaagtg 7781001  T
Q  305 gattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 404  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781000 gattcttcatcatttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 7780901  T
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagc-taaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattctt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780900 tttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattctt 7780801  T
Q  504 gcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaa 567  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7780800 gcactttaatgtttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaa 7780737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 303 - 688
Target Start/End: Original strand, 49358862 - 49359247
Alignment:
Q  303 tggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgta-atgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatc 401  Q
    ||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |  ||||| | |||| | |||||| | | |||||| ||||||||||||||||    
T  49358862 tggattctttcatatttgttgagaactcacaagtttgtatatgaatcttcatcttttacttcaatcttgcaaagttaccatgaaaatgagtagctaaatc 49358961  T
Q  402 tcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattc 501  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49358962 tccattgttgggattagaggtacttgatca-agctaaacatgtaatcttttgatctttaa-tatatgattctagcatttgatttgatattgatattattc 49359059  T
Q  502 ttgcactttattgcttatgt--ttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacat 599  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  49359060 ttgcaatttat-gcttatgtgtttgatttaattgctattgaaaaatactcttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacaggaaatctagacat 49359158  T
Q  600 agaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
    || ||| |||||||||||||||| || |||||  || ||| | |||||   ||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  49359159 aggatttatgttttgataatcactttgtgtatataagcttcacgcttttagatcgtttaatagactgagaaatcgtcgattaaacgata 49359247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 655 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 30238583 - 30238403
Alignment:
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30238583 ttcaatagattgagaaatcaacgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcaca 30238484  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30238483 atattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattag 30238403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 684 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 7780701 - 7780550
Alignment:
Q  684 tgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcg 783  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7780701 tgataagactgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcgtaatattgtttggacacgaatgatgttgtcg 7780602  T
Q  784 agggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7780601 agggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 7780550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Original strand, 52182792 - 52183099
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |  ||||||||||||||||  | |||||||| |||||| | |    
T  52182792 catgacaatgatcaactaaatctcctttgttgggattagaggtacttgattaaggcttagaatgtaatcttttgatccttgaatatatgattctagtaat 52182891  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||| |  ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52182892 ttagatgatattaagtttattcttgcatttcatt-cttatctttgatttaattgctattgacaaatacttttgaatctaggtttaaaatattcatctatc 52182990  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||     ||||| || ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||| || ||    
T  52182991 aaaacaatgattctagacataaaattgatgttttgataatcacacaaagtatcaaatcttaaagctttcagatcgtatgatagattgagaaatcgtcaat 52183090  T
Q  680 taaatgata 688  Q
    |||| ||||    
T  52183091 taaacgata 52183099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 748
Target Start/End: Original strand, 13003431 - 13003798
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga-tctataaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| | |||   |||||||| ||||||||     
T  13003431 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaaatcttgtaatatatgattctagcaa 13003529  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatc-atcta 577  Q
    || |  ||||||||| |||||||||||| || ||| |  || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||| ||||||||  |||||    
T  13003530 tttacatgatattgaagttattcttgcaattcatttcc-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctgggtt-agaataatttatcta 13003627  T
Q  578 tcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcg 677  Q
    ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     | ||    || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||     
T  13003628 tcaaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggaataagtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtca 13003727  T
Q  678 attaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgat 748  Q
    |||||| |||| || ||||  ||| ||  || |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  13003728 attaaacgatacgatcgacaattggattgtttaatagtttgagaaatcaactattgaacaatacaattgat 13003798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 496 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 2948327 - 2947996
Alignment:
Q  496 ttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctatcaaaacataagttcta 594  Q
    ||||||||||| || ||| || || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||    
T  2948327 ttattcttgcaattcatttct-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataaattatctatcaaaacaataattcta 2948229  T
Q  595 gacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccg 694  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||  ||  || ||    
T  2948228 gacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcgattaaactatccgatcg 2948129  T
Q  695 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatg 794  Q
    |   ||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||  | |||  ||| ||||| ||    
T  2948128 ataattggattgttcaacagtttgagaaatcaactattgaacaatacaatggatttcacacgattatttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtg 2948029  T
Q  795 ataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    ||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  2948028 ataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 2947996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 5659795 - 5659937
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||  |||| ||  ||||||| ||| | ||    
T  5659795 caactcgcaatggcaaatgcatttactcgcgaggcgagttagggtggccaaaactcctcaaaagtgacgtggcacaaacctactggtgaaggaaccttaa 5659894  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgca 170  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5659895 ctcgccaaggcaaatgaagttactcgcgaggcgagttgatgca 5659937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Original strand, 37355602 - 37355764
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | |||  ||||  ||||  || || |||||||| ||||||||    
T  37355602 tcgccatggcgagggaaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcattgctgacatggcgcaaacccaatggggaagaaacttcaactcg 37355701  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  37355702 ccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagtgaatgcagactcagaattctataaatagccc 37355764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 55462038 - 55462201
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  55462038 actcgccatggcaaatgattttactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 55462136  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  55462137 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagccc 55462201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27591268 - 27591087
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  27591268 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 27591170  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  27591169 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattg 27591087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 211
Target Start/End: Original strand, 37367575 - 37367756
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  37367575 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 37367673  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  37367674 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattg 37367756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30239098 - 30239002
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  30239098 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcggaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 30239002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 21677661 - 21677595
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| |||||||||||||    
T  21677661 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgca 21677595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 323606 - 323671
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  323606 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 323671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 4839130 - 4839065
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  4839130 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 4839065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 19247821 - 19247756
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||    
T  19247821 atgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgca 19247756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Original strand, 52618671 - 52618736
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||    
T  52618671 atgtaatcttttgatcatttaatatatggttctagctatttattcaatattgttgttattcttgca 52618736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 835
Target Start/End: Original strand, 13671081 - 13671896
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  13671081 tcgccatggcgagtgcaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcagtgatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacttcaactcg 13671180  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-gagagttt---------ag 221  Q
    ||||| |||||| ||   |||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||| || |  |||||         ||    
T  13671181 ccatgacgaatgaaggagctcgggaggcgagtggatgcagatttagaattctataaatagctcactcaatcatttcaatgagttagtttttgactcttag 13671280  T
Q  222 tttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-g 320  Q
    ||||||  |||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  13671281 tttttc--atagttttcattttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttg 13671378  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671379 ttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctctcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 13671478  T
Q  421 gtact---tgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13671479 gtactacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgctt 13671578  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13671579 atgtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgata 13671678  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13671679 atcactttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 13671778  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13671779 gagacatcgacgattgaatgatacagttgatttcacaatattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 13671878  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  13671879 tccatgtatgatcattag 13671896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 4187429 - 4186828
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  4187429 ttttcacttgtaacattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgagaaattacaa 4187330  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4187329 gtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttggaattagaggtacttgatcatag 4187230  T
Q  435 ct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattg 533  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  4187229 cttaaacatgtaatcctttgatttataaatatatggttctagcatttgatttggtattgatgttattcttgcacttcaatgtttatctttgatttaattg 4187130  T
Q  534 tgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcc 633  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4187129 tgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagattctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttttgtatcc 4187030  T
Q  634 aaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattg 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4187029 aaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattg 4186930  T
Q  734 aatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4186929 aatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcatt 4186830  T
Q  834 ag 835  Q
    ||    
T  4186829 ag 4186828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 834
Target Start/End: Original strand, 9864028 - 9864838
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||  | ||| |||||  ||||  || || |||||||| ||||||||    
T  9864028 tcgccatggcgagggaaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaagcttctcactgctgacgtggcacaaacccaatggggaagaaacttcaactcg 9864127  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctca- 230  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||      ||||||||||| |     
T  9864128 ccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattgatatacttagtttttcttag 9864227  T
Q  231 -------tagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttg 323  Q
           ||||||| |  ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  9864228 ttttttatagttttcattttacaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttg 9864327  T
Q  324 agatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggta 423  Q
    ||| |||| |||||   |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864328 agaaatcaaaagttgtaaatgaatatttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagataaatctcctttgttgggattagaggta 9864427  T
Q  424 cttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgttt 523  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9864428 cttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgttt 9864527  T
Q  524 gatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacc 623  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9864528 gatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatatctcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcacc 9864627  T
Q  624 ttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagaca 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864628 ttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaacagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagaca 9864727  T
Q  724 tcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatg 823  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864728 tcgacgattgaatgatacaattgattgcacaatattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg 9864827  T
Q  824 tatggtcatta 834  Q
    |||| ||||||    
T  9864828 tatgatcatta 9864838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 835
Target Start/End: Original strand, 21261839 - 21262653
Alignment:
Q  32 tcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcg 131  Q
    |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||  | ||| ||||| |||||  || ||||||| ||| |||  |||    
T  21261839 tcgccatggcgagtggaagtactcgcgaggcgagttagggcggtttaaacttctcactgatgacgtggcataaacccaatggtgaaggaacttcatttcg 21261938  T
Q  132 ccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggag--agtttagtt-----t 224  Q
    |||||||||||| ||   ||||||||||  || ||| || ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||| | |     |    
T  21261939 ccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgggtggatacagatttagaaatctataaatagcccattcaatcatttctttggagttagttttgatcttagt 21262038  T
Q  225 ttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga----tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttg 320  Q
    || ||||| |||| |  || ||||| || ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  21262039 ttttcatacttttcattttataatatttatagagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttg 21262138  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21262139 ttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggtttccatgaaaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 21262237  T
Q  421 gtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttat 519  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  21262238 gtacttgatcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttat 21262337  T
Q  520 gtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataat 619  Q
     |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21262338 ctttgatttaattgtaattgagaaatacatttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgataat 21262437  T
Q  620 caccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttga 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21262438 caccttttgtatccaaacttaaagctcttttatcattctatagattgagaaatcatccattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaaaagtttga 21262537  T
Q  720 gacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21262538 gacatcgacgattgaatgatacaattgatctcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatc 21262637  T
Q  820 catgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| |||||||    
T  21262638 catgtatgatcattag 21262653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 7069164 - 7069781
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  7069164 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 7069263  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069264 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 7069363  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  7069364 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 7069463  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7069464 atctttgatttaattgtgattgagaaatactcttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 7069563  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7069564 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactgttgaatcattcaatagttt 7069663  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069664 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 7069763  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  7069764 tccatgtatgatcattag 7069781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 34656011 - 34655394
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  34656011 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 34655912  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34655911 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 34655812  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  34655811 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 34655712  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34655711 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 34655612  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34655611 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 34655512  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34655511 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 34655412  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  34655411 tccatgtatgatcattag 34655394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 4019697 - 4020314
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  4019697 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 4019796  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4019797 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 4019896  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  4019897 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 4019996  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4019997 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaaaaaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 4020096  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4020097 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 4020196  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4020197 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 4020296  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  4020297 tccatgtatgatcattag 4020314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Original strand, 4026123 - 4026740
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  4026123 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 4026222  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4026223 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 4026322  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  4026323 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 4026422  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4026423 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaaaaaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 4026522  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4026523 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 4026622  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4026623 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 4026722  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  4026723 tccatgtatgatcattag 4026740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 34649560 - 34648943
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  34649560 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 34649461  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34649460 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttaggatta 34649361  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  34649360 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 34649261  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34649260 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 34649161  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34649160 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 34649061  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34649060 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 34648961  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  34648960 tccatgtatgatcattag 34648943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 218 - 818
Target Start/End: Original strand, 7061978 - 7062578
Alignment:
Q  218 ttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcat 317  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  |    
T  7061978 ttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattct 7062077  T
Q  318 ttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7062078 ttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatta 7062177  T
Q  418 gaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  7062178 gaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 7062277  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7062278 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgata 7062377  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7062378 atcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 7062477  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7062478 gagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 7062577  T
Q  818 t 818  Q
    |    
T  7062578 t 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 31548638 - 31548038
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaa 334  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  31548638 ttttcacttgtaatattcttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgaaagagagtggattcttcattctttgttgagaaatcacaa 31548539  T
Q  335 gtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 434  Q
    |||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31548538 gttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttag 31548439  T
Q  435 ctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgt 534  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  31548438 cttaacatgtaatcttttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgt 31548339  T
Q  535 gattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatcca 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31548338 gattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatcca 31548239  T
Q  635 aacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattga 734  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31548238 aacctaaagctttcttatcattctatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattga 31548139  T
Q  735 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatta 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31548138 atgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcatta 31548039  T
Q  835 g 835  Q
    |    
T  31548038 g 31548038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Original strand, 32327956 - 32328572
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  32327956 tagtttttctctgagtttttcacctgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctt 32328055  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32328056 tgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctatgttgggattag 32328154  T
Q  419 aggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||    
T  32328155 aggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttatttttgcactttaatcttt 32328254  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  32328255 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgctttgata 32328354  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32328355 atcaccttgagtatccaaacctaaacctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagttt 32328454  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32328455 gagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 32328554  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  32328555 tccatgtatgatcattag 32328572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 1427923 - 1428502
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  1427923 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 1428021  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  1428022 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 1428121  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1428122 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 1428221  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  1428222 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 1428321  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1428322 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 1428421  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1428422 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 1428502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 246 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 29907591 - 29907049
Alignment:
Q  246 aatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttgagatatcacaagtttgtaatg 344  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||    
T  29907591 aatatttttagagagagaaatagggcttgttcta-atagagtgagagtgatagaaagtggattcttcctcattttgttgagagatcacaagttattaatg 29907493  T
Q  345 aatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgt 444  Q
     ||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29907492 cattcttctctttcaattatttcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcctagcttaacatgt 29907393  T
Q  445 aatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaa 544  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907392 aatcttttgatctataaatatatgattctagcatttgatttgaaattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaa 29907293  T
Q  545 cacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagc 644  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907292 tacttttgaatctctgtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagc 29907193  T
Q  645 tttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaat 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  29907192 tttcttatcattcaatagattgagaaatcatttattgaacgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattaaataatacaat 29907093  T
Q  745 tgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgaggga 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29907092 tgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgaggga 29907049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 34711055 - 34711636
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || || | ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  34711055 agagagagagatagggcttgtgcttcatagagtgagagtgatagaag-tgaatcctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtcatggatctttct 34711153  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatctttt 452  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34711154 ctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtatttgatcatagcttaaacatgtaatctttt 34711253  T
Q  453 gatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttg 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34711254 gatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttg 34711353  T
Q  553 aatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttat 652  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  34711354 aatctaggtttagaataaccatctatcaaagcatagattctagacatggaatcgatgctttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttat 34711453  T
Q  653 cattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttca 752  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34711454 cattcaatggattgagaaatcattgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttca 34711553  T
Q  753 caatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34711554 caatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 34711636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 386 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 27670686 - 27670245
Alignment:
Q  386 aatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgattt 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27670686 aatgagtagctaaatctcctttgttcggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttaattt 27670587  T
Q  486 gatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaaca 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27670586 gatattgatgttattcttgcactttaatacttatgtttgatttaattgtgattgataaatacttttgaatctaagtttagaataatcatctatcaaaaca 27670487  T
Q  586 taagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatg 685  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27670486 tgggttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaattgattgagaaatcatcgattaaatg 27670387  T
Q  686 ataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27670386 ataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatgatgttgtcgag 27670287  T
Q  786 ggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27670286 ggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatg 27670245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 801
Target Start/End: Original strand, 1166978 - 1167525
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||    
T  1166978 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtaatagaaggtggattcttcgtcatttgttgagagatcacaaagttgtaatgaatccttctc 1167077  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167078 tttcaattcattcttgcaaagcttccatgacaatgagtagctaaatctccattgctgggattagaggtatttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 1167177  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||     
T  1167178 tctttaaatgtatggttctagcatttggtttgatattgagactattcttgcactttattgtttatgtttgatttaattgtgattgaaaaatattcttgat 1167277  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167278 tctaggtttagaataatagtctatcaaaacataaattctagatatggaattgatgttttgataatcactctttgtatccaaacttaaagctttcttatca 1167377  T
Q  655 -ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  1167378 ttttaatagattgagaaatcgtcgattaaatcataagatcgactcttggatcgtttaatagtttgagacatcaacgataaaacgatacaattgaattcac 1167477  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatat 801  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||  |||||||||||||||||||    
T  1167478 aatattatttggacacgaacgatattgttgagggatacatgataatat 1167525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 463 - 835
Target Start/End: Original strand, 4738030 - 4738402
Alignment:
Q  463 tatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4738030 tatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtt 4738129  T
Q  563 tagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatag 662  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4738130 tagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatag 4738229  T
Q  663 attgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtt 762  Q
    ||  ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738230 atcaagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtt 4738329  T
Q  763 tggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4738330 tggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 4738402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 489 - 788
Target Start/End: Original strand, 30117032 - 30117331
Alignment:
Q  489 attgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataa 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30117032 attgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctctgtttagaataatcatctatcaaaacataa 30117131  T
Q  589 gttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||    
T  30117132 gttctagacatggaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatttattgaacgata 30117231  T
Q  689 agaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgaggga 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30117232 agaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattaaataatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgaggga 30117331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 115 - 554
Target Start/End: Original strand, 31128637 - 31129088
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg-ga 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||  ||    
T  31128637 gaagaaacttcaactcgccatggcgaaggaagtagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattaaga 31128736  T
Q  214 gagttt----------agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaat 303  Q
     |||||          ||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31128737 tagttttatatactttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagaaagt 31128836  T
Q  304 ggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 402  Q
    | ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128837 gaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttctctttcaattcatccttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatct 31128936  T
Q  403 cctttgttgggattagaggtacttgatcttagc-taaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128937 cctttgttgggattagaggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcttttgatttataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattc 31129036  T
Q  502 ttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31129037 ttgcac-ttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 31129088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 658 - 835
Target Start/End: Original strand, 11058052 - 11058229
Alignment:
Q  658 aatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaata 757  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058052 aatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaata 11058151  T
Q  758 ttgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11058152 ttgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 11058229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 255 - 462
Target Start/End: Original strand, 4718040 - 4718246
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  4718040 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 4718138  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  4718139 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 4718238  T
Q  455 tctataaa 462  Q
    ||||||||    
T  4718239 tctataaa 4718246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 407
Target Start/End: Original strand, 4737644 - 4738030
Alignment:
Q  29 aactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaac 128  Q
    ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| |||||    
T  4737644 aactcgccatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaac 4737742  T
Q  129 tcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg-agagttt-------- 219  Q
    ||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || |||||||| |  | |||||            
T  4737743 tcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattatataaatagcccactcaaccatttcatggatatagtttttttactt 4737842  T
Q  220 agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt 319  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||    
T  4737843 agtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagaatgagagtgatagagagtggattcttcattcttt 4737942  T
Q  320 gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 407  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4737943 gttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctccttt 4738030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 380 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 9847119 - 9846679
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |  |||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||     
T  9847119 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-taagttcagaatgtaatcttttgatcttgcaaatatatgattctagcaa 9847021  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    || |  ||||||||||| |||||||| | || ||| | ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  9847020 tttacatgatattgatgatattcttgtatttcatttcctatctttgatttaaatgctattgagaaatacttttgaatctaggtttaaaatatttatctat 9846921  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||     |||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | ||    
T  9846920 caaaacaatgattcttaacataggattgatgttttgataatcacacaaagtatcagaacttaaagctttcagatcgtttaatagattgagaaatcgtgga 9846821  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||| || ||| | ||| ||  || ||||||||| || |||||||||| ||  | ||||||||  |||||| ||  |||| ||||||||| |||    
T  9846820 ttaaacgatacgatcgaatattggattgtttaatagtttgggaaatcaacgattaaacaacacaattgaactcacaagatcatttgaacacgaatgatgt 9846721  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    || |||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||    
T  9846720 tgtcgagcgatacgtgataatatcgataaaatgctagaatcc 9846679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 396 - 773
Target Start/End: Original strand, 10081203 - 10081579
Alignment:
Q  396 taaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatg 495  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||| |||||||| || |  ||||||||| |    
T  10081203 taaatctctttagttgggattaaaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatatgattctagcaatttacatgatattgaag 10081301  T
Q  496 ttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataa-tcatctatcaaaacataagttcta 594  Q
    ||||||||||| || ||| |  || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  10081302 ttattcttgcaattcatttcc-atctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaataattcatctatcaaaacaatgattcta 10081400  T
Q  595 gacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccg 694  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     ||||| | || |||||||||   ||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||    
T  10081401 gacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcgatacgtaaagcttttggatcgttgaatatattgagaaatcgtcgattaaacgatacgatcg 10081500  T
Q  695 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
    ||  ||| ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  10081501 acaattggattttttaatagtttgggaaatcaactattgaacaatacaattgatctcacaagattatttggacacgaat 10081579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 379 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 22870838 - 22870530
Alignment:
Q  379 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||      
T  22870838 ccatgagaatgattagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatca-agcgtagtatgtaatattttgatcctttaatatatgattctagctc 22870740  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaat-tgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatcta 577  Q
    || || |||| ||||  ||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||    
T  22870739 tttatgtgattttgagattattcttgcaattcat-gtttatgtttgatttaaaatgttattgaaaaatacttttgagtttagtgttagaataatcatcta 22870641  T
Q  578 tcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcg 677  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||| ||  |||| ||  || |||| || |||||||||||||||| |||    
T  22870640 tcaaaacaagaattctagacataggattagtgttttgataatcaccttaagtatcgaaggttaatgccatcatatcgtttaatagattgagaaatcgtcg 22870541  T
Q  678 attaaatgata 688  Q
    |||||| ||||    
T  22870540 attaaacgata 22870530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 317 - 450
Target Start/End: Original strand, 30121098 - 30121231
Alignment:
Q  317 tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggatt 416  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||    
T  30121098 tttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaattgttctctttcaattctttcttgcaaggcttccatgataatgagtagttgaatctcctttgttaagatt 30121197  T
Q  417 agaggtacttgatcttagctaaacatgtaatctt 450  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30121198 agaggtacttgatcttagcttaacatgtaatctt 30121231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11016670 - 11016444
Alignment:
Q  395 ctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgat 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||||||||     
T  11016670 ctaaatctcctttgttgggattagaggtatttgatca-agcttagaatgtaatcttttgatctttcaatatatgattctagcaatttacatgatattgaa 11016572  T
Q  495 gtt-attcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttct 593  Q
    ||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    || |    
T  11016571 gtttattcttgcatatcatt-cttatgtttgatttaaatgttattaaaaaatacttttgaatctaggtttagaattttcatctatcaaaacaatgatttt 11016473  T
Q  594 agacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11016472 agacatagggttgatgttttgataatcac 11016444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 27670991 - 27670682
Alignment:
Q  37 atggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatg 136  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||| || ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  27670991 atggcgagggaatgtactcgcgaggcgagttagggcggcttaggcttctcacggctgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacttca-ctcgccctg 27670893  T
Q  137 gcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagtttttctcatagtt 235  Q
    ||||||| ||   |||||||| | | |||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||||||||||||   ||   ||| ||||||  ||||||    
T  27670892 gcgaatgaaggagctcgcgagacgatttgatgcagaattagaattctataaatagctcattcaatcatttcattaaggatccttaatttttc--atagtt 27670795  T
Q  236 tttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcac 332  Q
    || |  |||||||| |  ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  27670794 ttcattttgtaatattcatagagagagagagatagggattgttcttgatagagtgagagtgatagaaagtggattctacatcattttgttgagagatcac 27670695  T
Q  333 aagtttgtaatga 345  Q
    |||| ||||||||    
T  27670694 aagtgtgtaatga 27670682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 168
Target Start/End: Original strand, 1166752 - 1166892
Alignment:
Q  28 caactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaa 127  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||| |  ||||  |  ||||||||||| ||||    
T  1166752 caactcgcaatggtgagtgcatttactcgcgaggcgagttagggcggctaaaactcctcagaggtgacgtgtcacaaacccactggtgaagaaacctcaa 1166851  T
Q  128 ctcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatg 168  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  1166852 ctcgccaaggtgaatgaagctactcgcgaggcgagttgatg 1166892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 7061853 - 7061948
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7061853 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagcccactcaatcatttcatt 7061948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 210
Target Start/End: Original strand, 7069039 - 7069134
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7069039 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagtagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagcccactcaatcatttcatt 7069134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 430
Target Start/End: Original strand, 14759219 - 14759281
Alignment:
Q  368 ttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatc 430  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14759219 ttgcaaggctaccatgataatgagtagttaaatctcatttgttgggattaaaggtatttgatc 14759281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 418
Target Start/End: Original strand, 20382818 - 20382868
Alignment:
Q  368 ttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20382818 ttgcaaggctaccatgataatgagtagctaaatctcatttgttgggattag 20382868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31548867 - 31548683
Alignment:
Q  26 accaactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||  ||  || ||||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||    
T  31548867 accaactcgcaatggcgagtggaatgactcgcgaggcgagttagggcggtttagcct-ctcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctc 31548769  T
Q  126 aactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||||||||||||||||| |    | |||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  31548768 aactcgccatggcgaatgaatgagcccgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattg 31548683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 18766120 - 18765994
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctt 646  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||   |||   ||||||||||||    
T  18766120 cttttgaatcttggtt-agaataatcttctatcaaagcttttgttctagacatggaatttaggttttgataatcactttgaatattggaacttaaagctt 18766022  T
Q  647 tcttatcattcaatagattgagaaatca 674  Q
    |  ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18766021 ttgtatcatttaatagtttgggaaatca 18765994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 34710907 - 34710986
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  34710907 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattctataaatagccc 34710986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 212
Target Start/End: Original strand, 32327831 - 32327928
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || |||||||||||    
T  32327831 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgg 32327928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 547 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 14354796 - 14354724
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataat 619  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  14354796 cttttaaatctagggttagaataataatctagcaaaactttaattctagacatggaatttaggttttgataat 14354724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 1427761 - 1427840
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  1427761 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 1427840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 4019573 - 4019652
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  4019573 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 4019652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 4025999 - 4026078
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  4025999 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 4026078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 4717878 - 4717957
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  4717878 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 4717957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 710 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 11015529 - 11015419
Alignment:
Q  710 aatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaa 809  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| || ||||| || ||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||   |||    
T  11015529 aatagattgagaaatcgtcgattaaacgatacgatcgatctcacaatattatttagacatgaatgatgtcgttgagtgatacatgataatatcagtaaaa 11015430  T
Q  810 agctagaatcc 820  Q
    |||||||||||    
T  11015429 agctagaatcc 11015419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34656134 - 34656056
Alignment:
Q  116 aagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  34656134 aagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 34656056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 3539215 - 3539280
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  3539215 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 3539280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9932799 - 9932734
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  9932799 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 9932734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 26515422 - 26515357
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  26515422 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 26515357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 470; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 3369 - 2788
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  3369 agagagagagatagggcttgttcttgatagagtgaaagtgatagaaagtggattctacatcattttgttaagagatcacaagtgtgtaatggatccttct 3270  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3269 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagttaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 3170  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3169 atctaaaaatatatggttctagtatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 3070  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3069 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttttgataatcactttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 2970  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2969 attcaatagattgagaaatcatcgatttaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 2870  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2869 aatattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattag 2788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 45012742 - 45012126
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||    
T  45012742 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctt 45012643  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45012642 tgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 45012543  T
Q  419 aggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctta 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  45012542 aggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttta 45012443  T
Q  519 tgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataa 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45012442 tctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataa 45012343  T
Q  619 tcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttg 718  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45012342 tcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgattggacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttg 45012243  T
Q  719 agacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 818  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45012242 agacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 45012143  T
Q  819 ccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45012142 ccatgtatgatcattag 45012126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Original strand, 16816602 - 16817409
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  16816602 actcgccatggcgaatggatgtacttgcgaggcgagttagggcggtctaa-ctcttcacagatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 16816700  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttca-ttggagagtttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   ||| |||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||| |  ||||||||||     
T  16816701 cgccatggcgaatgaaggagctcacgaggcgagttcatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcagttgga-atcttagtttttc- 16816798  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga------tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgtt 322  Q
     ||| |||| |  || ||||| || ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  16816799 -atacttttcatgttataatatttctagagagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgtt 16816897  T
Q  323 gagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 422  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16816898 gagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 16816996  T
Q  423 acttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtt 522  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  16816997 acttgatcttagcttaacatgtaactttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctt 16817096  T
Q  523 tgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16817097 tgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacattggttctagacatggaatcgatgttttgataatcac 16817196  T
Q  623 cttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagac 722  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817197 cttgtgcatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagac 16817296  T
Q  723 atcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccat 822  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817297 atcgacaattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 16817396  T
Q  823 gtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||    
T  16817397 gtatggtcattag 16817409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Original strand, 16855759 - 16856566
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  16855759 actcgccatggcgaatggatgtacttgcgaggcgagttagggcggtctaa-ctcttcacagatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 16855857  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttca-ttggagagtttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   ||| |||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||| |  ||||||||||     
T  16855858 cgccatggcgaatgaaggagctcacgaggcgagttcatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcagttgga-atcttagtttttc- 16855955  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga------tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgtt 322  Q
     ||| |||| |  || ||||| || ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  16855956 -atacttttcatgttataatatttctagagagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgtt 16856054  T
Q  323 gagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 422  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856055 gagaaatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggt 16856153  T
Q  423 acttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtt 522  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  16856154 acttgatcttagcttaacatgtaactttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctt 16856253  T
Q  523 tgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16856254 tgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacattggttctagacatggaatcgatgttttgataatcac 16856353  T
Q  623 cttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagac 722  Q
    ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856354 cttgtgcatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagac 16856453  T
Q  723 atcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccat 822  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856454 atcgacaattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 16856553  T
Q  823 gtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||    
T  16856554 gtatggtcattag 16856566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 15853506 - 15852693
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  15853506 actcgccatggtgaatgattttactcgcgaggcgagttagggcggtttagcctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 15853408  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctc 229  Q
    |||| ||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||      ||||||||||||    
T  15853407 cgccctggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattgacatacttagtttttctc 15853308  T
Q  230 atagtttttaa---------cttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttg 320  Q
      ||||||| |         ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||    
T  15853307 tgagtttttcatacttttcacttgtaatattcttagagagagagatagagcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtggattcttcattctttg 15853208  T
Q  321 ttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 420  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15853207 ttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagag 15853108  T
Q  421 gtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatg 520  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||     
T  15853107 gtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatc 15853008  T
Q  521 tttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15853007 tttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatc 15852908  T
Q  621 accttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgag 720  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15852907 actttgtgtatccaaacctaaagctttcttatcattctatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgag 15852808  T
Q  721 acatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15852807 acatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc 15852708  T
Q  821 atgtatggtcattag 835  Q
    |||| || |||||||    
T  15852707 atgtgtgatcattag 15852693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 835
Target Start/End: Original strand, 2020919 - 2021527
Alignment:
Q  228 tcatagtttttaacttgtaatactttt--agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgag 325  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  2020919 tcatagtttttcacttgtaatattcttggagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagggtgatagaaagtggattcttcatcttttgttgag 2021018  T
Q  326 atatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtact 425  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021019 aaatcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtact 2021117  T
Q  426 tgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttga 525  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  2021118 tgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttatagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatatttatctttga 2021217  T
Q  526 tttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2021218 tttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaagtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatgaaatcgatgttttgataatcacctt 2021317  T
Q  626 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 725  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2021318 gtgtatccaaacctaaaactttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatt 2021417  T
Q  726 aacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 825  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021418 gacaattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 2021517  T
Q  826 tggtcattag 835  Q
    ||||||||||    
T  2021518 tggtcattag 2021527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 43268732 - 43268002
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg-- 212  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || |||||||||||      
T  43268732 gaaggaacctcaactcgccatggcgattgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattggga 43268633  T
Q  213 -agagttt-------agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatg 304  Q
     | |||||       ||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  43268632 tatagttttatacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtg 43268533  T
Q  305 gattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 404  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43268532 gattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcc 43268434  T
Q  405 tttgttgggattagaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattctt 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43268433 tttgttgggattagaggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattctt 43268334  T
Q  504 gcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaa 603  Q
    |||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43268333 gcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaa 43268234  T
Q  604 ttgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaa 703  Q
    | |||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  43268233 tcgatgctttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgaaaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaa 43268134  T
Q  704 tcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatca 803  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43268133 tcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatca 43268034  T
Q  804 aagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43268033 aagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 43268002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 36781682 - 36782263
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctca-tttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  36781682 agagagagagatagggcttgtgctgtatagagtgggagtgatagaaattgaattctacatcactttgttgagagatcacaagtgtgtaatggatctttct 36781781  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  36781782 ctttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcttttg 36781881  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36781882 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgcttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 36781981  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  36781982 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatc 36782081  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36782082 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcac 36782181  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36782182 aatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 36782263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Original strand, 34834275 - 34834891
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  34834275 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctt 34834374  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34834375 tgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggactag 34834473  T
Q  419 aggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  34834474 aggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 34834573  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34834574 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgata 34834673  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34834674 atcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcgttcaatagttt 34834773  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834774 gagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 34834873  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  34834874 tccatgtatgatcattag 34834891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Original strand, 34840719 - 34841335
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  34840719 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctt 34840818  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34840819 tgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggactag 34840917  T
Q  419 aggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  34840918 aggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatcttt 34841017  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34841018 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgata 34841117  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagttt 717  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34841118 atcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcgttcaatagttt 34841217  T
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaa 817  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34841218 gagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaa 34841317  T
Q  818 tccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||| |||||||    
T  34841318 tccatgtatgatcattag 34841335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 2158370 - 2157755
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  2158370 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctt 2158271  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158270 tgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 2158172  T
Q  419 aggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctta 518  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  2158171 aggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatcttta 2158072  T
Q  519 tgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataa 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2158071 tctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataa 2157972  T
Q  619 tcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttg 718  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2157971 tcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttg 2157872  T
Q  719 agacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 818  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2157871 agacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaat 2157772  T
Q  819 ccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||| |||||||    
T  2157771 ccatgtatgatcattag 2157755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 2164786 - 2164171
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  2164786 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctt 2164687  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164686 tgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 2164588  T
Q  419 aggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctta 518  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  2164587 aggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatcttta 2164488  T
Q  519 tgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataa 618  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2164487 tctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataa 2164388  T
Q  619 tcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttg 718  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2164387 tcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttg 2164288  T
Q  719 agacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 818  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2164287 agacatcgaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 2164188  T
Q  819 ccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||  |||||||    
T  2164187 ccatgtataatcattag 2164171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 259 - 835
Target Start/End: Original strand, 21067460 - 21068037
Alignment:
Q  259 agagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttc 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||    
T  21067460 agagagttagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattctttatcttttgttgagaaatcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttc 21067558  T
Q  359 aattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatct 457  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21067559 aattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtatttgatcttagcttaaacatgtaatattttgatct 21067658  T
Q  458 ataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatct 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21067659 ataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatatttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatct 21067758  T
Q  558 aggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagc-tttcttatcatt 656  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21067759 aggtttagaataaccatcgatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttttttatcatt 21067858  T
Q  657 caatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaat 756  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21067859 caatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgtctcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacaattgaatgatacaattgatttcacaat 21067958  T
Q  757 attgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21067959 attgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 21068037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 713
Target Start/End: Original strand, 21341201 - 21341883
Alignment:
Q  27 ccaactcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatca 126  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||  | ||| |||||  |||   || ||||||| ||| |||    
T  21341201 ccaactcgccatggcgaatgattgtactcgcgaggcgagttagggcgacttagactcctcacagctgacgtggcacaaaaccaatggtgaaggaacctca 21341300  T
Q  127 actcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagt-ttagtttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||  ||| | ||||||||    
T  21341301 actcgccatggcgaatgaagaagctcgcgaggcgaattgatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcatta-agaatcttagtttt 21341399  T
Q  226 tctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgag 325  Q
    ||  |||||||| | ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  21341400 tc--atagttttca-cttgtaatatttctagagggagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcctttgttgag 21341496  T
Q  326 atatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtact 425  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21341497 aaatcacaagtt-gtaatgaatctttcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatatcctttgttgggattagaggtact 21341595  T
Q  426 tgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttga 525  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21341596 tgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttga 21341695  T
Q  526 tttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21341696 tttaattatgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttctgataatcacctt 21341795  T
Q  626 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaata 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341796 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaata 21341883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 356 - 835
Target Start/End: Original strand, 21331594 - 21332073
Alignment:
Q  356 ttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgat 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21331594 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatatcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgat 21331693  T
Q  456 ctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21331694 ctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattatgattgagaaatacttttgaat 21331793  T
Q  556 ctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcat 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21331794 ctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttctagacatggaattgatgttctgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcat 21331893  T
Q  656 tcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaa 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21331894 tcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgacacaattgatttcacaa 21331993  T
Q  756 tattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 21332073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 219 - 835
Target Start/End: Original strand, 13901419 - 13902036
Alignment:
Q  219 tagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatt 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||    
T  13901419 tagtttttctcttagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctt 13901518  T
Q  319 tgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 418  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13901519 tgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcgattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattag 13901617  T
Q  419 aggtacttgatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgctt 517  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||    
T  13901618 aggtacttgatcatagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctatcatttgatttgatattaatgttattcttgcactttaatcttt 13901717  T
Q  518 atgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgata 617  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  13901718 atctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgacgttttgata 13901817  T
Q  618 atcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca-ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtt 716  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13901818 atcaccttaggtatccaaacctaaagctttcttatcatttaaatagattgagaaatcatcaattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtt 13901917  T
Q  717 tgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctaga 816  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13901918 tgagacatcaaccattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctaga 13902017  T
Q  817 atccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  13902018 atccatgtatgctcattag 13902036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 254 - 835
Target Start/End: Original strand, 42930876 - 42931451
Alignment:
Q  254 tagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattct 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||| |||||   |||||||  ||||    
T  42930876 tagagagagagatagggcttgttctttatagag------tgatagagagtggattcttcatcctttgttgagaaatcataagttgtaaatgaatttttct 42930969  T
Q  354 ctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42930970 ccttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttg 42931069  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42931070 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 42931169  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42931170 atctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttatc 42931269  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42931270 attcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcac 42931369  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42931370 aatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 42931451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 12951540 - 12950939
Alignment:
Q  235 ttttaacttgtaatacttttaga--gagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcac 332  Q
    |||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  12951540 ttttcacttgtaatattcttagaaagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcac 12951441  T
Q  333 aagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatctt 432  Q
    ||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12951440 aagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcat 12951342  T
Q  433 agctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaatt 532  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||    
T  12951341 agtttaacatgtaatcgtttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaatt 12951242  T
Q  533 gtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatc 632  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  12951241 gtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctgtcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatc 12951142  T
Q  633 caaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgatt 732  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12951141 caaacctaaagctttcttatcatttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccatt 12951042  T
Q  733 gaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcat 832  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12951041 gaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcat 12950942  T
Q  833 tag 835  Q
    |||    
T  12950941 tag 12950939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 29485767 - 29485193
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattgg-a 213  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||||  |    
T  29485767 gaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagttgatgcagagtcagaattgtataaatagcccactcaaccatttcattgata 29485668  T
Q  214 gagttt--------agtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatgg 305  Q
     |||||        ||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29485667 tagtttttttacttagtttttctctgagtttttcacttgtaatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagagagtgg 29485568  T
Q  306 attcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 405  Q
    ||||||| |  |||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485567 attcttcattctttgttgagaaatcacaagttgtaaatgaatctttctccttaaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcct 29485468  T
Q  406 ttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485467 ttgttgggattagaggtacttgatcttagcttaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgc 29485368  T
Q  506 actttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaatt 605  Q
    |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  29485367 actttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatc 29485268  T
Q  606 gatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgatt 680  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29485267 gatgttttgataatcactttgtgtatccaaacctaaagctttcttagcattcaatagatcgagaaatcatcgatt 29485193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 275 - 820
Target Start/End: Original strand, 11909470 - 11910014
Alignment:
Q  275 ttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgta-atgaatcattctctttcaattcattattgcaa 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |   |||| | |||| | ||||||    
T  11909470 ttcttcatagggtgagagtgatagaaggtggattcttccatatttgtggagaaatcacaagtttgtatatgaatcttcaccttttagttcaatcttgcaa 11909569  T
Q  374 ggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttct 473  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||    
T  11909570 agttaccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggatcggaggtacttgatct-agctaaacatttaatcttttaatctttaa-tatatgattct 11909667  T
Q  474 agcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatca 573  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11909668 agcatttgatttgatattgaggttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgttattgaaaagtactcttgaatctaggtttagaataatca 11909767  T
Q  574 tctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatc 673  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||   ||| || |||||| |||||||||    
T  11909768 tctatcaaaacatgaattttagacatagaattgatgttttgataatcacttcttgtatctaaacttcatgcttttgaatcgtttaatagactgagaaatc 11909867  T
Q  674 atcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaat 773  Q
     ||||||||| |||| || ||| | ||| ||| ||   |||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11909868 gtcgattaaacgatacgatcgaatattggatcgtttggtagtttgagaaatcaatgattaaacgagacaattgatttcacaatattatttggacacgaat 11909967  T
Q  774 ggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatcc 820  Q
      | ||| |||  ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||    
T  11909968 aatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaaagctagaatcc 11910014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 280 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 13163515 - 13162978
Alignment:
Q  280 catagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgta-atgaatcattctctttcaattcattattgcaaggctt 378  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||| | |||| | |||||| | |     
T  13163515 catagagtgagtgtgatagaaggtggattcttccatatttgttgagaaatcacaagtttgtatatgaatcttcatcttttacttcaatcttgcaaagtta 13163416  T
Q  379 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13163415 ccatgacaatgagtagctaaatctccattgttgggattagaggtacttgatca-agcaaaacatgtaatcttttgatctataa-tatatgattgtagcat 13163318  T
Q  479 ttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctat 578  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13163317 ttgatttgatattgagattattcttgcaatttat-gcttatgtttgatttaattgctattgaaaaatacttttgaatctaggtctagaataatcatttat 13163219  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||  ||||| || ||| | | ||||  ||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  13163218 caaaacaggaattctagacatgggatttacgttttgataatcaccttgagtatctaagcttcatggtttcagatcgtttaatagagtgagaaatcgtcga 13163119  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||| || ||| | ||| ||| || ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||    
T  13163118 ttaaacgatacgatcgaatgttggatcgtttaatagtttgggaaatcaacgattaaacgatacaattgatttcacaatatcatttagacatgaatgatgt 13163019  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatc 819  Q
    || |||||||||| |||||||||  |  |||||||||||||    
T  13163018 tgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatc 13162978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 380 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 36842385 - 36841964
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||   | |||||| |||||||| |    
T  36842385 catgacaatgatgaactaaatctccttagttgggattagaggtacttgat-tgagcttaaaatgtaatcttttgatcttgtattatatgattctagcaat 36842287  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  ||||||| | |||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36842286 ttacatgatattaaagttattcttgcaattcatttcctatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaatattcatctatc 36842187  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||  ||| || |||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  36842186 aaaacaatgattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcggaacgtagagctttcagatcgttgaatagattgagaaatcgtcgat 36842087  T
Q  680 taaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgtt 779  Q
    |||| |||| || ||| | ||| ||  || ||||||||| || |||||| ||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||  | ||    
T  36842086 taaacgatacgatcgattattggattgtttaatagtttgggaaatcaactattgaacaatacagttgatctcacaagattatttggacacgaataatctt 36841987  T
Q  780 ggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||    
T  36841986 gttgagcgatacgtgataatatc 36841964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 380 - 688
Target Start/End: Original strand, 37439159 - 37439465
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |    
T  37439159 catgacaatgatcaactaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatc-aagcttagaatgtaatcttttgatctttgaatatatgattctagcaat 37439257  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatc 579  Q
    | |  |||||||||  ||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  37439258 ttacatgatattgagtttattcttgcatttcatt-tttatctttgatttaattgctattgaaaaatacttttgaatctagttttagaatatttatctatc 37439356  T
Q  580 aaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgat 679  Q
    ||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||  | ||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | |||    
T  37439357 aaaacaatgattctagacataggattgatgttttgataatcacataaagtatcggatcttaaagctttcagatcgtttaatagattgagaaatcgttgat 37439456  T
Q  680 taaatgata 688  Q
    |||||||||    
T  37439457 taaatgata 37439465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 380 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 41456203 - 41455782
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |  |||||||||||| ||||   |||||||  |||||||| |    
T  41456203 catgacaatgatgaactaaatctccttcgttgggattagaggtacttgat-tgagcttagaatgtaatcttttaatcttgtaatatataattctagcaat 41456105  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatc-atctat 578  Q
    | |  |||||||||  ||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  41456104 ttacatgatattgaaattattcttgcaattcattt-ttatctttgatttaattgttattgaaaagtacttttgaatctaggtttagaatagtttatctat 41456006  T
Q  579 caaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcga 678  Q
    |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     |||||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||    
T  41456005 caaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggtatcagtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaatcgtcga 41455906  T
Q  679 ttaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgt 778  Q
    ||||| |||  || ||||  ||| ||  || ||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||  | |    
T  41455905 ttaaacgatccgatcgacaattggattgtttaatagtttgggaattcaactattgaacaatacaattgatctcacacgattatttggacacgaataatct 41455806  T
Q  779 tggcgagggatacatgataatatc 802  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||    
T  41455805 tgttgagtgatacgtgataatatc 41455782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 727 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 29485178 - 29485070
Alignment:
Q  727 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485178 acgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat 29485079  T
Q  827 ggtcattag 835  Q
    | |||||||    
T  29485078 gatcattag 29485070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 536 - 827
Target Start/End: Original strand, 17788871 - 17789162
Alignment:
Q  536 attgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaa 635  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    |||||||||||| ||||||||||||||||||||      | ||  |    
T  17788871 attgagaaatacttttgaatctaggtttagaatatttatctatcaaaaaaatgattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaattgtcaga 17788970  T
Q  636 acttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaa 735  Q
    |||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||| ||   | |||||||||||| |||||| ||| ||    
T  17788971 acttaaagctttcggatcgtttgatagattgagaaatcgtcgattaaacgatacgatcgactattggattgcttaatagtttgagaaatcaacaattaaa 17789070  T
Q  736 tgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg 827  Q
      ||||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||    ||| |||||||||||| ||||    
T  17789071 caatacaattgaactcacaagatcatttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatg 17789162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 400 - 622
Target Start/End: Original strand, 24852672 - 24852892
Alignment:
Q  400 tctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctat-aaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgtta 498  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || || |||||||||  |||    
T  24852672 tctcctttgttggaattacaggtacttgatca-agcttag-atgtaatcttttgatcttttaaatatatgattctagctatttatgtgatattgagttta 24852769  T
Q  499 ttcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagaca 598  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| | ||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||    
T  24852770 ttcttgcaattcatt-cttatgtttgatttgaatgatattgaaaaatacttttgaatctagggttagaataatcatctatcaaaacaaggattctagaca 24852868  T
Q  599 tagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||    
T  24852869 taggattggtgtttagataatcac 24852892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 379 - 601
Target Start/End: Original strand, 34744913 - 34745136
Alignment:
Q  379 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaat-cttttgatctataaatatatggttctagca 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |  ||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||      
T  34744913 ccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagatgtacttgatca-agcatagtatgtatttcttttgatccttaaatatatgattctagtc 34745011  T
Q  478 tttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgattt-aattgtgattgagaaacactttt-gaatctaggtttagaataatcatc 575  Q
    ||| | ||||||||||| |||| |||||| || || | ||||||||||||| || ||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34745012 ttttacttgatattgatattatccttgcatttcat-gtttatgtttgatttgaaatgatattgaaaaatactttttgaatctaggtttataataatcatc 34745110  T
Q  576 tatcaaaacataagttctagacatag 601  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||    
T  34745111 tatcaaaacttgaattctagacatag 34745136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 753 - 835
Target Start/End: Original strand, 21341879 - 21341961
Alignment:
Q  753 caatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21341879 caatattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 21341961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 17864080 - 17863954
Alignment:
Q  380 catgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatt 479  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |    
T  17864080 catgacaatgatcagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgat-taagcttagaatgtaatcttttgttctttaaatatatgattctagcaat 17863982  T
Q  480 tgatttgatattgatgttattcttgcac 507  Q
    | || |||||||||  ||||||||||||    
T  17863981 ttatgtgatattgagtttattcttgcac 17863954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 754 - 835
Target Start/End: Original strand, 45700642 - 45700723
Alignment:
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45700642 aatattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattag 45700723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 547 - 688
Target Start/End: Original strand, 28144776 - 28144917
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctt 646  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||  |||| ||||||| |||||||     |||||  ||||||||||||    
T  28144776 cttttgaatctaagtttagaatattcatctatcaaaacaatgattctagacataagattggtgttttggtaatcacacaaagtatcggaacttaaagctt 28144875  T
Q  647 tcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgata 688  Q
    ||  ||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  28144876 tcagatcgtttaatagattgagaaatcgtcaattaaacgata 28144917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 21067192 - 21067426
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| || || | |||||||||||||||| || || |||||||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| |||  |||||    
T  21067192 actcgccatggcgaatggatgtgctcgcgaggcgagttatggcggtctaaactcttcacagctgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaaccgcaact 21067291  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggaga-gtttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||| || | | |||||| ||||||||||||  | || ||||||||   | |  |||||||||  |    
T  21067292 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagttgatacagagtcagaattttataaatagcccactcaaccatttcataaaaaatctttagtttt--t 21067389  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga 265  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||    
T  21067390 catagtttttcacttgtaatattcttatagagagaga 21067426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 211
Target Start/End: Original strand, 2020733 - 2020892
Alignment:
Q  51 tactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttac 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||  | ||| |||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |    |    
T  2020733 tactcgcgaggcgagttagggcggtttaa-ctcttcacagatgacgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaactcgccatgacgaatgaaagagc 2020831  T
Q  151 tcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  2020832 tcgcgaggcaagttaatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 2020892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 36781448 - 36781611
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| |||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  36781448 actcgccatggcgaatgattttactcgcgaggcgagttagggcggtttaccctc-tcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 36781546  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||| ||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||    
T  36781547 cgccctggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagccc 36781611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 211
Target Start/End: Original strand, 42930646 - 42930825
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  | | |  ||||  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  42930646 actcgccatggcgaatgattttactcgcgaggcgagttagggcgg--ttagcctctcacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 42930743  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattg 211  Q
    |||| ||||||||| ||   |||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||    
T  42930744 cgccctggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtagatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattg 42930825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 718 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 45700636 - 45700590
Alignment:
Q  718 gagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttg 764  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45700636 gagacatagacgattgaatgatacaattgatctcacaatattgtttg 45700590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2158495 - 2158416
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  2158495 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 2158416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2164911 - 2164832
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  2164911 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 2164832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 34834150 - 34834229
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  34834150 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 34834229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 34840594 - 34840673
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  34840594 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 34840673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45012867 - 45012788
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  45012867 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 45012788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 400
Target Start/End: Original strand, 22197696 - 22197733
Alignment:
Q  363 cattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaat 400  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22197696 catttttgcaaggtttccatgacaatgagtagctaaat 22197733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 29223882 - 29223947
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  29223882 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 29223947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 29337181 - 29337246
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  29337181 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 29337246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 257 - 835
Target Start/End: Original strand, 2763 - 3343
Alignment:
Q  257 agagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcattt-gttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctct 355  Q
    ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2763 agagagaaatatggcttgtt-ttaatagagtgagagtgatagaaagtggattcctcctcattttgttgagaaatcacaagtttgtaatgaatccttctct 2861  T
Q  356 ttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt--gatcttagctaaacatgtaatcttttg 453  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2862 ttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgtgattagaggtacttatgatcttagcttaacatgtaatcttttg 2961  T
Q  454 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttga 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2962 atctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgtcattcttgcactttaatgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaatacttttga 3061  T
Q  554 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatc 653  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3062 atctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatggaattcatgttttgataatcatcttgtgtatccaaacttaaagctttcttatc 3161  T
Q  654 attcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcac 753  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3162 aatcaatagattgagaaatcatcgattgaacggtaagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacaattgaatgatacaattgatttcac 3261  T
Q  754 aatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3262 aatattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattag 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 835
Target Start/End: Original strand, 8156 - 8960
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| |||| || || || ||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||| |||  | |||||||||  ||||  || ||||||| ||| ||||||    
T  8156 actcgccatggagaatggatgtactcgcgaggggagttagggcggtttaa-ctcttcacagatgatgtggcacaaacccaatggtgaaggaacctcaact 8254  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt-ggagagtttagtttttct 228  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||| | |||||||  | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||| ||| | || ||||||||     
T  8255 cgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgatttgatgctgaatcagaattctataaatagcccagtcaagcatttcattaggatactt-agtttttc- 8352  T
Q  229 catagtttttaacttgtaatacttttagagagagaga--tagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgaga 326  Q
     ||| |||| |  || ||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  8353 -atacttttcatgttataatatttccagagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatctttggttgaga 8451  T
Q  327 tatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 426  Q
     |||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8452 aatcacaagtt-gtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtactt 8550  T
Q  427 gatcttagct-aaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttga 525  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  8551 gatcatagcttaaacatgtaatcctttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttaatgtttatctttga 8650  T
Q  526 tttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcacctt 625  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8651 tttaattgtgattgagaaatacttttgaatctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcacctt 8750  T
Q  626 ttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 725  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8751 gagtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatc 8850  T
Q  726 aacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 825  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8851 gaccattgaatgatagaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta 8950  T
Q  826 tggtcattag 835  Q
    || |||||||    
T  8951 tgatcattag 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 495 - 835
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2639
Alignment:
Q  495 gttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttcta 594  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2300 gttattcttgcattttaatgcttatgtt-gatttaattgtgattgagaaatatttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataggttcta 2398  T
Q  595 gacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccg 694  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2399 aacatggaatcgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcattgattagatgataagaccg 2498  T
Q  695 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatg 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2499 actcttgaatcattcaatagtttgagacatcgacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatg 2598  T
Q  795 ataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  2599 ataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattag 2639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1980 - 1625
Alignment:
Q  30 actcgcaatggcgagtgaatttactcgcgaggcgagttagggtggcctaaactcctcaagggtgatgtggcttaaacttaacggtgaagaaacatcaact 129  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||  ||  ||| | |  | ||| |||||  ||||  || || |||| ||| ||||||    
T  1980 actcgccatggcgaatgaatttactcgcgaggcgagttaaggcggtttagtctc-taacagctgacgtggcacaaacccaatggcgaaggaacctcaact 1882  T
Q  130 cgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcattggagagtttagtttttctc 229  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||| |||| ||||| | | |||||||||||||||||||  | || ||||||||||      |||||||||||     
T  1881 cgccatggcgaatgaatgagctcgcgaggcgagtttatgcagagtcagaattctataaatagcccactcaaccatttcattgatatacttagtttttctg 1782  T
Q  230 a--------tagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgt 321  Q
    |        |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  1781 agtttttgatagtttttcacttgtaatatttctagagagagagataggacttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattcttcatcttttgt 1682  T
Q  322 tgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttc 379  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  1681 tgagaaatcacaag-ttgtaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttc 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 50412 - 49833
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  50412 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 50314  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  50313 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 50214  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50213 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 50114  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50113 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgtgtatccaaacctaaagctttcttatca 50014  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  50013 ttcaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 49914  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49913 atattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattag 49833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 71313 - 71231
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  ||||| | | |||||||||||||||||||    
T  71313 ggtgaaggaacctcaactcgccatggcgaatgaaggagctcgcgaggcgagtgcatgcagaatcagaattctataaatagccc 71231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50574 - 50495
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  50574 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 50495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 835
Target Start/End: Original strand, 4505 - 5084
Alignment:
Q  255 agagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattcttcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctc 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||     
T  4505 agagagagagatagggcttgtgctttatagagtgagagtgatagagagtggattcttcatcctttgttgagacatcacaagtt-gtaatgaatcttgctt 4603  T
Q  355 tttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcttagctaaacatgtaatcttttga 454  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  4604 cttcaattcattcttgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgttgggattagaggtacttgatcatagtttaacatgtaatcgtttga 4703  T
Q  455 tctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgcactttattgcttatgtttgatttaattgtgattgagaaacacttttgaa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4704 tctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgaggttattcttgcactttaatctttatctttgatttaattgtgattgagaaatacttttgaa 4803  T
Q  555 tctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatca 654  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4804 tctaggtttagaataaccatctatcaaaacatagtttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatca 4903  T
Q  655 ttcaatagattgagaaatcatcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcaca 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4904 tttaatagattgagaaatcatcgattgaacgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatacaattgatttcaca 5003  T
Q  755 atattgtttggacacgaatggtgttggcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5004 atattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 5084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 194
Target Start/End: Original strand, 4343 - 4422
Alignment:
Q  115 gaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagccc 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||  | ||| | | |||||||||||||||||||    
T  4343 gaagaaacttcaactcgccatggcgaatgaagcagctcgcgaggcgagtgaaggcagactcagaattctataaatagccc 4422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 112 - 500
Target Start/End: Original strand, 11491 - 11877
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagttgatgcaaattaagaattctataaatagcccttttaatcatttcatt- 210  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||    | | ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||     
T  11491 ggtgaaggaaccacaactcgccatggcgaatgaaggagtttgtgaggcgagttgatgcagaatcagaattctataaatagcccactcaaccatttcatta 11590  T
Q  211 ggagagtttagtttttctcatagtttttaacttgtaatacttttagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaaatggattct 310  Q
    ||| | || ||||||||  ||| |||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11591 ggatactt-agtttttc--atacttttcatgttataatatttctagagagagagatagggcttgttcttcatagagtgagagtgatagaaagtggattct 11687  T
Q  311 tcctcatttgttgagatatcacaagtttgtaatgaatcattctctttcaattcattattgcaaggcttccatgacaatgagtagctaaatctcctttgtt 410  Q
    || || |||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 tcatcttttgttgagaaatcacaagtt-gaaatgaatcttgcttcttcaattcattcttgcaaggcttccatgtcaatgagtagctaaatctcctttgtt 11786  T
Q  411 gggattagaggtacttgatcttagc-taaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttatt 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11787 gggattagaggtacttgatcttagcttaaacatgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgaattgatattgatgttatt 11877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 584 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 12327 - 12076
Alignment:
Q  584 cataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattaaa 683  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12327 cataggttctagacatggaatcgatgttttgataatcaccttgagtatccaaacctaaagctttcttatcattcaatagattgagaaatcatcgattgaa 12228  T
Q  684 tgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttggcg 783  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12227 cgataagatcgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcgaccattgaatgatagaattgatttcacaatattgtttggacacgaatggtgttgtcg 12128  T
Q  784 agggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 835  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12127 agggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattag 12076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 748
Target Start/End: Original strand, 24082 - 24257
Alignment:
Q  573 atctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcaccttttgtatccaaacttaaagctttcttatcattcaatagattgagaaat 672  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||     | |||   || ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  24082 atctatcaaaacaataattctagacataggattgatgttttgataatcacacaaggcatcagtacataaagctttcggatcgttgaatagattgagaaat 24181  T
Q  673 catcgattaaatgataagaccgactcttgaatcattcaatagtttgagacatcaacgattgaatgatacaattgat 748  Q
    | || |||||| |||| || ||||  ||| ||  || |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  24182 cgtcaattaaacgatacgatcgacaattggattgtttaatagtttgagaaatcaactattgaacaatacaattgat 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Original strand, 17559 - 17633
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  17559 cttttgaatctaggtt-agaataatcttctatcaaagcttttgttctagacatggaatttaggttttgataatcac 17633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6973 - 6921
Alignment:
Q  112 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgaatggagttactcgcgaggcaagtt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||    
T  6973 ggtgaagaaacatcaactcgccatggcgagtgcatctactcgcgaggcgagtt 6921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 622
Target Start/End: Original strand, 1498 - 1572
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatcac 622  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1498 cttttgaaactaggtt-agaataatcttctatcaaagcttttgttctagacatggaatttaggttttgataatcac 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Original strand, 8910 - 8975
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  8910 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 8975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12197 - 12132
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || |||  |||||| |||||||||||||    
T  12197 atgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgttattcttgca 12132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 15967 - 15902
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcatttgatttgatattgatgttattcttgca 506  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  || |||  |||||| |||||||||||||    
T  15967 atgtaatcttttgatcttttaatatatggtactagctatttattcaatattgttgttattcttgca 15902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 547 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 4627 - 4554
Alignment:
Q  547 cttttgaatctaggtttagaataatcatctatcaaaacataagttctagacatagaattgatgttttgataatc 620  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |  ||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  4627 cttttgaatctaggattagaataatcttctatcaaagtttttgttctagacatggaatttaggtttcgataatc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 28893 - 28828
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  28893 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 28828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 441 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25644 - 25579
Alignment:
Q  441 atgtaatcttttgatctataaatatatggttctagcat-ttgatttgatattgatgttattcttgc 505  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || |||  |||||| ||||||||||||    
T  25644 atgtaatcttttgatcttttaatatatggttctagcttatttattcaatattgttgttattcttgc 25579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University